Result of FASTA (ccds) for pF1KB0049
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB0049, 1823 aa
  1>>>pF1KB0049 1823 - 1823 aa - 1823 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.7993+/-0.00178; mu= 8.1786+/- 0.105
 mean_var=263.7806+/-50.369, 0's: 0 Z-trim(103.9): 119  B-trim: 2 in 1/51
 Lambda= 0.078968
 statistics sampled from 7518 (7619) to 7518 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.575), E-opt: 0.2 (0.234), width:  16
 Scan time:  5.710

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS43491.1 LAMA4 gene_id:3910|Hs108|chr6          (1823) 12143 1399.6       0
CCDS34514.1 LAMA4 gene_id:3910|Hs108|chr6          (1816) 12066 1390.8       0
CCDS59307.1 LAMA3 gene_id:3909|Hs108|chr18         (1668)  948 124.1 4.4e-27
CCDS11880.1 LAMA3 gene_id:3909|Hs108|chr18         (1724)  948 124.1 4.5e-27
CCDS45838.1 LAMA3 gene_id:3909|Hs108|chr18         (3277)  948 124.4   7e-27
CCDS42419.1 LAMA3 gene_id:3909|Hs108|chr18         (3333)  948 124.4   7e-27
CCDS33502.1 LAMA5 gene_id:3911|Hs108|chr20         (3695)  850 113.3 1.7e-23
CCDS5138.1 LAMA2 gene_id:3908|Hs108|chr6           (3122)  622 87.2   1e-15
CCDS5750.1 LAMB1 gene_id:3912|Hs108|chr7           (1786)  610 85.6 1.8e-15
CCDS34732.1 LAMB4 gene_id:22798|Hs108|chr7         (1761)  605 85.0 2.6e-15
CCDS2789.1 LAMB2 gene_id:3913|Hs108|chr3           (1798)  600 84.5 3.9e-15
CCDS1351.1 LAMC1 gene_id:3915|Hs108|chr1           (1609)  583 82.5 1.4e-14
CCDS6938.1 LAMC3 gene_id:10319|Hs108|chr9          (1575)  545 78.2 2.8e-13
CCDS32787.1 LAMA1 gene_id:284217|Hs108|chr18       (3075)  546 78.6 4.1e-13
CCDS48010.2 MEGF9 gene_id:1955|Hs108|chr9          ( 602)  484 70.8 1.8e-11
CCDS43492.1 LAMA4 gene_id:3910|Hs108|chr6          ( 120)  451 66.3 7.7e-11


>>CCDS43491.1 LAMA4 gene_id:3910|Hs108|chr6               (1823 aa)
 initn: 12143 init1: 12143 opt: 12143  Z-score: 7492.2  bits: 1399.6 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 12143; 100.0% identity (100.0% similar) in 1823 aa overlap (1-1823:1-1823)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB0 MALSSAWRSVLPLWLLWSAACSRAASGDDNAFPFDIEGSSAVGRQDPPETSEPRVALGRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MALSSAWRSVLPLWLLWSAACSRAASGDDNAFPFDIEGSSAVGRQDPPETSEPRVALGRL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB0 PPAAEKCNAGFFHTLSGECVPCDCNGNSNECLDGSGYCVHCQRNTTGEHCEKCLDGYIGD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PPAAEKCNAGFFHTLSGECVPCDCNGNSNECLDGSGYCVHCQRNTTGEHCEKCLDGYIGD
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB0 SIRGAPQFCQPCPCPLPHLANFAESCYRKNGAVRCICNENYAGPNCERCAPGYYGNPLLI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SIRGAPQFCQPCPCPLPHLANFAESCYRKNGAVRCICNENYAGPNCERCAPGYYGNPLLI
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB0 GSTCKKCDCSGNSDPNLIFEDCDEVTGQCRNCLRNTTGFKCERCAPGYYGDARIAKNCAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GSTCKKCDCSGNSDPNLIFEDCDEVTGQCRNCLRNTTGFKCERCAPGYYGDARIAKNCAV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB0 CNCGGGPCDSVTGECLEEGFEPPTGMDCPTISCDKCVWDLTDDLRLAALSIEEGKSGVLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 CNCGGGPCDSVTGECLEEGFEPPTGMDCPTISCDKCVWDLTDDLRLAALSIEEGKSGVLS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB0 VSSGAAAHRHVNEINATIYLLKTKLSERENQYALRKIQINNAENTMKSLLSDVEELVEKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VSSGAAAHRHVNEINATIYLLKTKLSERENQYALRKIQINNAENTMKSLLSDVEELVEKE
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB0 NQASRKGQLVQKESMDTINHASQLVEQAHDMRDKIQEINNKMLYYGEEHELSPKEISEKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NQASRKGQLVQKESMDTINHASQLVEQAHDMRDKIQEINNKMLYYGEEHELSPKEISEKL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB0 VLAQKMLEEIRSRQPFFTQRELVDEEADEAYELLSQAESWQRLHNETRTLFPVVLEQLDD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VLAQKMLEEIRSRQPFFTQRELVDEEADEAYELLSQAESWQRLHNETRTLFPVVLEQLDD
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB0 YNAKLSDLQEALDQALNYVRDAEDMNRATAARQRDHEKQQERVREQMEVVNMSLSTSADS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 YNAKLSDLQEALDQALNYVRDAEDMNRATAARQRDHEKQQERVREQMEVVNMSLSTSADS
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB0 LTTPRLTLSELDDIIKNASGIYAEIDGAKSELQVKLSNLSNLSHDLVQEAIDHAQDLQQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LTTPRLTLSELDDIIKNASGIYAEIDGAKSELQVKLSNLSNLSHDLVQEAIDHAQDLQQE
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB0 ANELSRKLHSSDMNGLVQKALDASNVYENIVNYVSEANETAEFALNTTDRIYDAVSGIDT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ANELSRKLHSSDMNGLVQKALDASNVYENIVNYVSEANETAEFALNTTDRIYDAVSGIDT
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB0 QIIYHKDESENLLNQARELQAKAESSSDEAVADTSRRVGGALARKSALKTRLSDAVKQLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QIIYHKDESENLLNQARELQAKAESSSDEAVADTSRRVGGALARKSALKTRLSDAVKQLQ
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB0 AAERGDAQQRLGQSRLITEEANRTTMEVQQATAPMANNLTNWSQNLQHFDSSAYNTAVNS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 AAERGDAQQRLGQSRLITEEANRTTMEVQQATAPMANNLTNWSQNLQHFDSSAYNTAVNS
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB0 ARDAVRNLTEVVPQLLDQLRTVEQKRPASNVSASIQRIRELIAQTRSVASKIQVSMMFDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ARDAVRNLTEVVPQLLDQLRTVEQKRPASNVSASIQRIRELIAQTRSVASKIQVSMMFDG
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB0 QSAVEVHSRTSMDDLKAFTSLSLYMKPPVKRPELTETADQFILYLGSKNAKKEYMGLAIK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QSAVEVHSRTSMDDLKAFTSLSLYMKPPVKRPELTETADQFILYLGSKNAKKEYMGLAIK
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB0 NDNLVYVYNLGTKDVEIPLDSKPVSSWPAYFSIVKIERVGKHGKVFLTVPSLSSTAEEKF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NDNLVYVYNLGTKDVEIPLDSKPVSSWPAYFSIVKIERVGKHGKVFLTVPSLSSTAEEKF
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KB0 IKKGEFSGDDSLLDLDPEDTVFYVGGVPSNFKLPTSLNLPGFVGCLELATLNNDVISLYN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 IKKGEFSGDDSLLDLDPEDTVFYVGGVPSNFKLPTSLNLPGFVGCLELATLNNDVISLYN
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KB0 FKHIYNMDPSTSVPCARDKLAFTQSRAASYFFDGSGYAVVRDITRRGKFGQVTRFDIEVR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 FKHIYNMDPSTSVPCARDKLAFTQSRAASYFFDGSGYAVVRDITRRGKFGQVTRFDIEVR
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KB0 TPADNGLILLMVNGSMFFRLEMRNGYLHVFYDFGFSGGPVHLEDTLKKAQINDAKYHEIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TPADNGLILLMVNGSMFFRLEMRNGYLHVFYDFGFSGGPVHLEDTLKKAQINDAKYHEIS
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KB0 IIYHNDKKMILVVDRRHVKSMDNEKMKIPFTDIYIGGAPPEILQSRALRAHLPLDINFRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 IIYHNDKKMILVVDRRHVKSMDNEKMKIPFTDIYIGGAPPEILQSRALRAHLPLDINFRG
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KB0 CMKGFQFQKKDFNLLEQTETLGVGYGCPEDSLISRRAYFNGQSFIASIQKISFFDGFEGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 CMKGFQFQKKDFNLLEQTETLGVGYGCPEDSLISRRAYFNGQSFIASIQKISFFDGFEGG
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KB0 FNFRTLQPNGLLFYYASGSDVFSISLDNGTVIMDVKGIKVQSVDKQYNDGLSHFVISSVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 FNFRTLQPNGLLFYYASGSDVFSISLDNGTVIMDVKGIKVQSVDKQYNDGLSHFVISSVS
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KB0 PTRYELIVDKSRVGSKNPTKGKIEQTQASEKKFYFGGSPISAQYANFTGCISNAYFTRVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PTRYELIVDKSRVGSKNPTKGKIEQTQASEKKFYFGGSPISAQYANFTGCISNAYFTRVD
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KB0 RDVEVEDFQRYTEKVHTSLYECPIESSPLFLLHKKGKNLSKPKASQNKKGGKSKDAPSWD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RDVEVEDFQRYTEKVHTSLYECPIESSPLFLLHKKGKNLSKPKASQNKKGGKSKDAPSWD
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KB0 PVALKLPERNTPRNSHCHLSNSPRAIEHAYQYGGTANSRQEFEHLKGDFGAKSQFSIRLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PVALKLPERNTPRNSHCHLSNSPRAIEHAYQYGGTANSRQEFEHLKGDFGAKSQFSIRLR
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1510      1520      1530      1540      1550      1560
pF1KB0 TRSSHGMIFYVSDQEENDFMTLFLAHGRLVYMFNVGHKKLKIRSQEKYNDGLWHDVIFIR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TRSSHGMIFYVSDQEENDFMTLFLAHGRLVYMFNVGHKKLKIRSQEKYNDGLWHDVIFIR
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

             1570      1580      1590      1600      1610      1620
pF1KB0 ERSSGRLVIDGLRVLEESLPPTEATWKIKGPIYLGGVAPGKAVKNVQINSIYSFSGCLSN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ERSSGRLVIDGLRVLEESLPPTEATWKIKGPIYLGGVAPGKAVKNVQINSIYSFSGCLSN
             1570      1580      1590      1600      1610      1620

             1630      1640      1650      1660      1670      1680
pF1KB0 LQLNGASITSASQTFSVTPCFEGPMETGTYFSTEGGYVVLDESFNIGLKFEIAFEVRPRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LQLNGASITSASQTFSVTPCFEGPMETGTYFSTEGGYVVLDESFNIGLKFEIAFEVRPRS
             1630      1640      1650      1660      1670      1680

             1690      1700      1710      1720      1730      1740
pF1KB0 SSGTLVHGHSVNGEYLNVHMKNGQVIVKVNNGIRDFSTSVTPKQSLCDGRWHRITVIRDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SSGTLVHGHSVNGEYLNVHMKNGQVIVKVNNGIRDFSTSVTPKQSLCDGRWHRITVIRDS
             1690      1700      1710      1720      1730      1740

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pF1KB0 NVVQLDVDSEVNHVVGPLNPKPIDHREPVFVGGVPESLLTPRLAPSKPFTGCIRHFVIDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NVVQLDVDSEVNHVVGPLNPKPIDHREPVFVGGVPESLLTPRLAPSKPFTGCIRHFVIDG
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             1810      1820   
pF1KB0 HPVSFSKAALVSGAVSINSCPAA
       :::::::::::::::::::::::
CCDS43 HPVSFSKAALVSGAVSINSCPAA
             1810      1820   

>>CCDS34514.1 LAMA4 gene_id:3910|Hs108|chr6               (1816 aa)
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Smith-Waterman score: 12066; 99.6% identity (99.6% similar) in 1823 aa overlap (1-1823:1-1816)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB0 MALSSAWRSVLPLWLLWSAACSRAASGDDNAFPFDIEGSSAVGRQDPPETSEPRVALGRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MALSSAWRSVLPLWLLWSAACSRAASGDDNAFPFDIEGSSAVGRQDPPETSEPRVALGRL
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PPAAEKCNAGFFHTLSGECVPCDCNGNSNECLDGSGYCVHCQRNTTGEHCEKCLDGYIGD
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SIRGAPQFCQPCPCPLPHLANFAESCYRKNGAVRCICNENYAGPNCERCAPGYYGNPLLI
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GSTCKKCDCSGNSDPNLIFEDCDEVTGQCRNCLRNTTGFKCERCAPGYYGDARIAKNCAV
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       :::::::::::::::::::::::::       ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 CNCGGGPCDSVTGECLEEGFEPPTG-------CDKCVWDLTDDLRLAALSIEEGKSGVLS
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VSSGAAAHRHVNEINATIYLLKTKLSERENQYALRKIQINNAENTMKSLLSDVEELVEKE
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NQASRKGQLVQKESMDTINHASQLVEQAHDMRDKIQEINNKMLYYGEEHELSPKEISEKL
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VLAQKMLEEIRSRQPFFTQRELVDEEADEAYELLSQAESWQRLHNETRTLFPVVLEQLDD
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 YNAKLSDLQEALDQALNYVRDAEDMNRATAARQRDHEKQQERVREQMEVVNMSLSTSADS
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LTTPRLTLSELDDIIKNASGIYAEIDGAKSELQVKLSNLSNLSHDLVQEAIDHAQDLQQE
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pF1KB0 ANELSRKLHSSDMNGLVQKALDASNVYENIVNYVSEANETAEFALNTTDRIYDAVSGIDT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ANELSRKLHSSDMNGLVQKALDASNVYENIVNYVSEANETAEFALNTTDRIYDAVSGIDT
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pF1KB0 QIIYHKDESENLLNQARELQAKAESSSDEAVADTSRRVGGALARKSALKTRLSDAVKQLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QIIYHKDESENLLNQARELQAKAESSSDEAVADTSRRVGGALARKSALKTRLSDAVKQLQ
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AAERGDAQQRLGQSRLITEEANRTTMEVQQATAPMANNLTNWSQNLQHFDSSAYNTAVNS
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ARDAVRNLTEVVPQLLDQLRTVEQKRPASNVSASIQRIRELIAQTRSVASKIQVSMMFDG
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QSAVEVHSRTSMDDLKAFTSLSLYMKPPVKRPELTETADQFILYLGSKNAKKEYMGLAIK
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NDNLVYVYNLGTKDVEIPLDSKPVSSWPAYFSIVKIERVGKHGKVFLTVPSLSSTAEEKF
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 FKHIYNMDPSTSVPCARDKLAFTQSRAASYFFDGSGYAVVRDITRRGKFGQVTRFDIEVR
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TPADNGLILLMVNGSMFFRLEMRNGYLHVFYDFGFSGGPVHLEDTLKKAQINDAKYHEIS
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 IIYHNDKKMILVVDRRHVKSMDNEKMKIPFTDIYIGGAPPEILQSRALRAHLPLDINFRG
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 CMKGFQFQKKDFNLLEQTETLGVGYGCPEDSLISRRAYFNGQSFIASIQKISFFDGFEGG
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 FNFRTLQPNGLLFYYASGSDVFSISLDNGTVIMDVKGIKVQSVDKQYNDGLSHFVISSVS
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PTRYELIVDKSRVGSKNPTKGKIEQTQASEKKFYFGGSPISAQYANFTGCISNAYFTRVD
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RDVEVEDFQRYTEKVHTSLYECPIESSPLFLLHKKGKNLSKPKASQNKKGGKSKDAPSWD
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PVALKLPERNTPRNSHCHLSNSPRAIEHAYQYGGTANSRQEFEHLKGDFGAKSQFSIRLR
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TRSSHGMIFYVSDQEENDFMTLFLAHGRLVYMFNVGHKKLKIRSQEKYNDGLWHDVIFIR
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ERSSGRLVIDGLRVLEESLPPTEATWKIKGPIYLGGVAPGKAVKNVQINSIYSFSGCLSN
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pF1KB0 LQLNGASITSASQTFSVTPCFEGPMETGTYFSTEGGYVVLDESFNIGLKFEIAFEVRPRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LQLNGASITSASQTFSVTPCFEGPMETGTYFSTEGGYVVLDESFNIGLKFEIAFEVRPRS
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pF1KB0 SSGTLVHGHSVNGEYLNVHMKNGQVIVKVNNGIRDFSTSVTPKQSLCDGRWHRITVIRDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SSGTLVHGHSVNGEYLNVHMKNGQVIVKVNNGIRDFSTSVTPKQSLCDGRWHRITVIRDS
          1680      1690      1700      1710      1720      1730   

             1750      1760      1770      1780      1790      1800
pF1KB0 NVVQLDVDSEVNHVVGPLNPKPIDHREPVFVGGVPESLLTPRLAPSKPFTGCIRHFVIDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NVVQLDVDSEVNHVVGPLNPKPIDHREPVFVGGVPESLLTPRLAPSKPFTGCIRHFVIDG
          1740      1750      1760      1770      1780      1790   

             1810      1820   
pF1KB0 HPVSFSKAALVSGAVSINSCPAA
       :::::::::::::::::::::::
CCDS34 HPVSFSKAALVSGAVSINSCPAA
          1800      1810      

>>CCDS59307.1 LAMA3 gene_id:3909|Hs108|chr18              (1668 aa)
 initn: 1864 init1: 610 opt: 948  Z-score: 599.8  bits: 124.1 E(32554): 4.4e-27
Smith-Waterman score: 2849; 31.2% identity (62.8% similar) in 1797 aa overlap (47-1821:40-1666)

         20        30        40        50        60        70      
pF1KB0 WSAACSRAASGDDNAFPFDIEGSSAVGRQDPPETSEPRVALGRLPPAAEKCNAGFFHT--
                                     ::  :. ...  .. :. . :. :...   
CCDS59 CSMGWLWIFGAALGQCLGYSSQQQRVPFLQPPGQSQLQASYVEFRPS-QGCSPGYYRDHK
      10        20        30        40        50         60        

             80        90       100       110       120       130  
pF1KB0 --LSGECVPCDCNGNSNECLDGSGYCVHCQRNTTGEHCEKCLDGYIGDSIRGAPQFCQPC
          .:.::::.:::.::.: :::: ::.::.::.:::::.: .:: :....:.   :. :
CCDS59 GLYTGRCVPCNCNGHSNQCQDGSGICVNCQHNTAGEHCERCQEGYYGNAVHGS---CRAC
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       :::  :  .:: .:  ..: ::: :. .:.: .::::::::.:::  .:..:. :.:..:
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       ..    . .:  .::.: :                                   : ::  
CCDS59 GQ----LGSCHPLTGDCIN---------------------------------QEPKDSSP
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       .:            .:   .::.::  : .::   . ...  :: . ..:..:.  ... 
CCDS59 AE------------ECD--DCDSCVMTLLNDLATMGEQLRLVKSQLQGLSASAGLLEQMR
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       ....    :...: . ..  . .  .:.. :  . .: .. : : :: .  :::.: .. 
CCDS59 HMETQAKDLRNQLLNYRSAISNHGSKIEGLERELTDLNQEFETLQEKAQVNSRKAQTLN-
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          ...:.:.:   .:...  ::...  ..      :                ::..::.
CCDS59 ---NNVNRATQ---SAKELDVKIKNVIRNV------H----------------MLNRIRT
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       :..:   ...:. .:    :: .: ::    : ...   .   .  :.:. .::    ..
CCDS59 LQEAAAQAKQANGLNQENERALGAIQR----QVKEINSLQSDFTKYLTTADSSLLQTNIA
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CCDS59 LQLMEKSQKEYEKLAASLNEARQELSDKVRELSRSAGKTSLVEEAEKHARSLQELAKQLE
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       .  .... . ::. :.::...::::.: .. :...:. : ....   ..:   :   .  
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         ...:..:::.:.  : : ..  . :. . .. .. . ..: .. : :.     :.. .
CCDS59 TLSSNSDKLLNEAKMTQKKLKQEVSPALNNLQQTLNIVTVQKEVIDTNLTTLRDGLHGIQ
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CCDS59 RGDIDAMISSAKSMVRKANDITDEVLDGLNPIQTDVERIKDTYGRTQNEDFKKALTDADN
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CCDS59 SVNKLTNKLPDLWRKIESINQQLLPLGNISDNMDRIRELIQQARDAASKVAVPMRFNGKS
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CCDS59 GVEVRLPNDLEDLKGYTSLSLFLQRPNSR-ENGGTENMFVMYLGNKDASRDYIGMAVVDG
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       .:. ::::: ...:. .:.  ..:    : .. ::..:. . ...  :  . ::  :   
CCDS59 QLTCVYNLGDREAELQVDQILTKSETKEAVMDRVKFQRIYQFARLNYTKGATSSKPETPG
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CCDS59 FKKTFNLNTTEVEPCRRRK-----EESDKNYFEGTGYARV----PTQPHAPIPTFGQTIQ
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       :.:  .: ..:. .      . :    . .: . : :.:   .:.  :.  .  .  .::
CCDS59 DTPVASPRSVKVWQ------DACSPLPKTQANHGALQFGDIPTSHLLFKLPQELLKPRSQ
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CCDS59 TVVFGHDGEKGRLVVDGLRAREGSLPGN-STISIRAPVYLGSPPSGKP-KSLPTN---SF
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CCDS59 VGCLKNFQLDSKPLYTPSSSFGVSSCLGGPLEKGIYFSEEGGHVVLAHSVLLGPEFKLVF
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CCDS59 SIRPRSLTGILIHIGSQPGKHLCVYLEAGKVTASMDSGAGGTSTSVTPKQSLCDGQWHSV
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pF1KB0 TVIRDSNVVQLDVDSEVNHVVGPLNPKPIDHREPVFVGGVPESLLTPRLAPSKPFTGCIR
       .:   .....:..:.. ....: .   : . .::. .::.: .: : :.   : : ::.:
CCDS59 AVTIKQHILHLELDTDSSYTAGQIPFPPASTQEPLHLGGAPANLTTLRIPVWKSFFGCLR
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CCDS59 NIHVNHIPVPVTEALEVQGPVSLNGCPDQ
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>>CCDS11880.1 LAMA3 gene_id:3909|Hs108|chr18              (1724 aa)
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CCDS11 CSMGWLWIFGAALGQCLGYSSQQQRVPFLQPPGQSQLQASYVEFRPS-QGCSPGYYRDHK
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CCDS11 GLYTGRCVPCNCNGHSNQCQDGSGICVNCQHNTAGEHCERCQEGYYGNAVHGS---CRAC
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CCDS11 PCP--HTNSFATGCVVNGGDVRCSCKAGYTGTQCERCAPGYFGNPQKFGGSCQPCSCNSN
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pF1KB0 SDPNLIFEDCDEVTGQCRNCLRNTTGFKCERCAPGYYGDARIAKNCAVCNCGGGPCDSVT
       ..    . .:  .::.: :                                   : ::  
CCDS11 GQ----LGSCHPLTGDCIN---------------------------------QEPKDSSP
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pF1KB0 GECLEEGFEPPTGMDCPTISCDKCVWDLTDDLRLAALSIEEGKSGVLSVSSGAAAHRHVN
       .:            .:   .::.::  : .::   . ...  :: . ..:..:.  ... 
CCDS11 AE------------ECD--DCDSCVMTLLNDLATMGEQLRLVKSQLQGLSASAGLLEQMR
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pF1KB0 EINATIYLLKTKLSERENQYALRKIQINNAENTMKSLLSDVEELVEKENQASRKGQLVQK
       ....    :...: . ..  . .  .:.. :  . .: .. : : :: .  :::.: .. 
CCDS11 HMETQAKDLRNQLLNYRSAISNHGSKIEGLERELTDLNQEFETLQEKAQVNSRKAQTLN-
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          ...:.:.:   .:...  ::...  : ..:        :: ...   ..:.. . ::
CCDS11 ---NNVNRATQ---SAKELDVKIKNVIRNVHILLKQISGTDGEGNNVPSGDFSREWAEAQ
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pF1KB0 KMLEEIRSRQPFFTQRELVDEEAD--EAYELLSQAESWQRLHN-ETRTLFPVVLEQLDDY
       .:..:.:.:. :   ..: . :::  :.  ::.. ..::. :. :.  :   . ..:..:
CCDS11 RMMRELRNRN-F--GKHLREAEADKRESQLLLNRIRTWQKTHQGENNGLANSIRDSLNEY
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pF1KB0 NAKLSDLQEALDQALNYVRDAEDMN----RATAARQRDHEKQQERVREQMEVVNMSLSTS
       .::::::.  :..:   ...:. .:    :: .: ::    : ...   .   .  :.:.
CCDS11 EAKLSDLRARLQEAAAQAKQANGLNQENERALGAIQR----QVKEINSLQSDFTKYLTTA
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pF1KB0 ADSLTTPRLTLSELDDIIKNASGIYAEIDGAKSELQVKLSNLSNLSH--DLVQEAIDHAQ
        .::    ..:. ..   :.   . : .. :..::. :. .::  .   .::.::  ::.
CCDS11 DSSLLQTNIALQLMEKSQKEYEKLAASLNEARQELSDKVRELSRSAGKTSLVEEAEKHAR
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pF1KB0 DLQQEANELSRKLHSSDMNGLVQKALDASNVYENIVNYVSEANETAEFALNTTDRIYDAV
       .::. :..: .  .... . ::. :.::...::::.: .. :...:. : ....   ..:
CCDS11 SLQELAKQLEEIKRNASGDELVRCAVDAATAYENILNAIKAAEDAANRAASASESALQTV
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pF1KB0 SGIDT--QIIYHKDESENLLNQARELQAKAESSSDEAVADTSRRVGGALARKSALKTRLS
          :   .    ...:..:::.:.  : : ..  . :. . .. .. . ..: .. : :.
CCDS11 IKEDLPRKAKTLSSNSDKLLNEAKMTQKKLKQEVSPALNNLQQTLNIVTVQKEVIDTNLT
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            :.. .::: .  ..... ....::  : :: ..  :. ...   ...  . ..  
CCDS11 TLRDGLHGIQRGDIDAMISSAKSMVRKANDITDEVLDGLNPIQTDVERIKDTYGRTQNED
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pF1KB0 YNTAVNSARDAVRNLTEVVPQLLDQLRTVEQKR-PASNVSASIQRIRELIAQTRSVASKI
       .. :...: ..: .::. .:.:  ......:.  : .:.: ...:::::: :.:..:::.
CCDS11 FKKALTDADNSVNKLTNKLPDLWRKIESINQQLLPLGNISDNMDRIRELIQQARDAASKV
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CCDS11 AVPMRFNGKSGVEVRLPNDLEDLKGYTSLSLFLQRPNSR-ENGGTENMFVMYLGNKDASR
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       .:.:.:. . .:. ::::: ...:. .:.  ..:    : .. ::..:. . ...  :  
CCDS11 DYIGMAVVDGQLTCVYNLGDREAELQVDQILTKSETKEAVMDRVKFQRIYQFARLNYTKG
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       . ::  :   .   .  ....::.::::..:::::: : .::::. :..: . ::.::  
CCDS11 ATSSKPETPGVYDMDGRNSNTLLNLDPENVVFYVGGYPPDFKLPSRLSFPPYKGCIELDD
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       ::..:.::::::. .:.. .   :: : :      .. . .:.:.::: :         .
CCDS11 LNENVLSLYNFKKTFNLNTTEVEPCRRRK-----EESDKNYFEGTGYARV----PTQPHA
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        .  :   ..: .: ::...  ::. :. :....: : : : .. :  :   :  .  : 
CCDS11 PIPTFGQTIQTTVDRGLLFFAENGDRFISLNIEDGKLMVRYKLN-SELPK--ERGVGDA-
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       ::... : :.: : . .:.: . :: ...  .:.: .   :.  :.:: :  : .   . 
CCDS11 INNGRDHSIQIKIGKLQKRMWINVDVQNTI-IDGEVF--DFSTYYLGGIPIAIRER--FN
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CCDS11 ISTP---AFRGCMKNL---KKTSGVVRLNDTVGVTKKCSEDWKLVRSASFSRGGQLSFTD
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pF1KB0 QKISFFDGFEGGFNFRTLQPNGLLFYYASGSDVFSISLDNGTVIMDVK--GIKVQSVDKQ
         .   : ....:.:.:.::.:.:. . . .  ....:..: . ....  :  . .  . 
CCDS11 LGLPPTDHLQASFGFQTFQPSGILLDHQTWTRNLQVTLEDGYIELSTSDSGGPIFKSPQT
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pF1KB0 YNDGLSHFV--ISSVSPTRYELIVDKSRVGSKNPTKGKIEQTQASEKKFYFGGSPISAQY
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CCDS11 YMDGLLHYVSVISDNSGLRL-LIDDQLLRNSK-----RLKHISSSRQSLRLGGS------
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pF1KB0 ANFTGCISNAYFTRVDRDVEVEDFQRYTEKVHTSLYECPIESSPLFLLHKKGKNLSKPKA
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CCDS11 -NFEGCISNVFVQRLSLSPEVLDLTSNSLKRDVSLGGCSLNKPPFLMLLKGSTRFNKTKT
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pF1KB0 SQNKKGGKSKDAPSWDPVALKLPERNTPRNSHCHLSNSPRAIEHAYQYGGTANSRQEFEH
        . ..    .:.:  .: ..:. .      . :    . .: . : :.:   .:.  :. 
CCDS11 FRINQ--LLQDTPVASPRSVKVWQ------DACSPLPKTQANHGALQFGDIPTSHLLFKL
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pF1KB0 LKGDFGAKSQFSIRLRTRSSHGMIFYVSDQEENDFMTLFLAHGRLVYMFNVGHKKLKIRS
        .  .  .:::.. ..: ::.:..:... .  :.::.:.:..::::. ...  :::.:.:
CCDS11 PQELLKPRSQFAVDMQTTSSRGLVFHTGTK--NSFMALYLSKGRLVFALGTDGKKLRIKS
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       .:: ::: :: :.: ..  .::::.::::. : ::: . .: .:..:.:::.   ::  :
CCDS11 KEKCNDGKWHTVVFGHDGEKGRLVVDGLRAREGSLPGN-STISIRAPVYLGSPPSGKP-K
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       ..  :   :: :::.:.::..  . . :..:.:. :. ::.: : ::: :::.::: .: 
CCDS11 SLPTN---SFVGCLKNFQLDSKPLYTPSSSFGVSSCLGGPLEKGIYFSEEGGHVVLAHSV
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CCDS11 LLGPEFKLVFSIRPRSLTGILIHIGSQPGKHLCVYLEAGKVTASMDSGAGGTSTSVTPKQ
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CCDS45 GDSCQGCSPGYYRDHKGLYTGRCVPCNCNGHSNQCQDGSGICVNCQHNTAGEHCERCQEG
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CCDS45 YYGNAVHGS---CRACPC--PHTNSFATGCVVNGGDVRCSCKAGYTGTQCERCAPGYFGN
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pF1KB0 NCAVCNCGGGPCDSVTGECL-EEGFEPPTGMDCPTISCDKCVWDLTDDLRLAALSIEEGK
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CCDS42 ---------GSCHPLTGDCINQEPKDSSPAEECD--DCDSCVMTLLNDLATMGEQLRLVK
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pF1KB0 SGVLSVSSGAAAHRHVNEINATIYLLKTKLSERENQYALRKIQINNAENTMKSLLSDVEE
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CCDS42 SQLQGLSASAGLLEQMRHMETQAKDLRNQLLNYRSAISNHGSKIEGLERELTDLNQEFET
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pF1KB0 LVEKENQASRKGQLVQKESMDTINHASQLVEQAHDMRDKIQEI--NNKMLYY------GE
       : :: .  :::.: ..    ...:.:.:   .:...  ::...  : ..:        ::
CCDS42 LQEKAQVNSRKAQTLN----NNVNRATQ---SAKELDVKIKNVIRNVHILLKQISGTDGE
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pF1KB0 EHELSPKEISEKLVLAQKMLEEIRSRQPFFTQRELVDEEAD--EAYELLSQAESWQRLHN
        ...   ..:.. . ::.:..:.:.:. :   ..: . :::  :.  ::.. ..::. :.
CCDS42 GNNVPSGDFSREWAEAQRMMRELRNRN-F--GKHLREAEADKRESQLLLNRIRTWQKTHQ
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pF1KB0 -ETRTLFPVVLEQLDDYNAKLSDLQEALDQALNYVRDAEDMN----RATAARQRDHEKQQ
        :.  :   . ..:..:.::::::.  :..:   ...:. .:    :: .: ::    : 
CCDS42 GENNGLANSIRDSLNEYEAKLSDLRARLQEAAAQAKQANGLNQENERALGAIQR----QV
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pF1KB0 ERVREQMEVVNMSLSTSADSLTTPRLTLSELDDIIKNASGIYAEIDGAKSELQVKLSNLS
       ...   .   .  :.:. .::    ..:. ..   :.   . : .. :..::. :. .::
CCDS42 KEINSLQSDFTKYLTTADSSLLQTNIALQLMEKSQKEYEKLAASLNEARQELSDKVRELS
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         .   .::.::  ::..::. :..: .  .... . ::. :.::...::::.: .. :.
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       ..:. : ....   ..:   :   .    ...:..:::.:.  : : ..  . :. . ..
CCDS42 DAANRAASASESALQTVIKEDLPRKAKTLSSNSDKLLNEAKMTQKKLKQEVSPALNNLQQ
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pF1KB0 NNLTNWSQNLQHFDSSAYNTAVNSARDAVRNLTEVVPQLLDQLRTVEQKR-PASNVSASI
       ...   ...  . ..  .. :...: ..: .::. .:.:  ......:.  : .:.: ..
CCDS42 TDVERIKDTYGRTQNEDFKKALTDADNSVNKLTNKLPDLWRKIESINQQLLPLGNISDNM
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pF1KB0 QRIRELIAQTRSVASKIQVSMMFDGQSAVEVHSRTSMDDLKAFTSLSLYMKPPVKRPELT
       .:::::: :.:..:::. : : :.:.:.:::.  ....:::..:::::... : .: :  
CCDS42 DRIRELIQQARDAASKVAVPMRFNGKSGVEVRLPNDLEDLKGYTSLSLFLQRPNSR-ENG
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pF1KB0 ETADQFILYLGSKNAKKEYMGLAIKNDNLVYVYNLGTKDVEIPLDSKPVSSWP--AYFSI
        : ..:..:::.:.:...:.:.:. . .:. ::::: ...:. .:.  ..:    : .. 
CCDS42 GTENMFVMYLGNKDASRDYIGMAVVDGQLTCVYNLGDREAELQVDQILTKSETKEAVMDR
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pF1KB0 VKIERVGKHGKVFLTVPSLSSTAEEKFIKKGEFSGDDSLLDLDPEDTVFYVGGVPSNFKL
       ::..:. . ...  :  . ::  :   .   .  ....::.::::..:::::: : .:::
CCDS42 VKFQRIYQFARLNYTKGATSSKPETPGVYDMDGRNSNTLLNLDPENVVFYVGGYPPDFKL
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pF1KB0 PTSLNLPGFVGCLELATLNNDVISLYNFKHIYNMDPSTSVPCARDKLAFTQSRAASYFFD
       :. :..: . ::.::  ::..:.::::::. .:.. .   :: : :      .. . .:.
CCDS42 PSRLSFPPYKGCIELDDLNENVLSLYNFKKTFNLNTTEVEPCRRRK-----EESDKNYFE
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       :.::: :    .    . .  :   ..: .: ::...  ::. :. :....: : : : .
CCDS42 GTGYARVPTQPH----APIPTFGQTIQTTVDRGLLFFAENGDRFISLNIEDGKLMVRYKL
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       .   . .  :  .  : ::... : :.: : . .:.: . :: ...  .:.: .   :. 
CCDS42 N---SELPKERGVGDA-INNGRDHSIQIKIGKLQKRMWINVDVQNTI-IDGEVF--DFST
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pF1KB0 IYIGGAPPEILQSRALRAHLPLDI-NFRGCMKGFQFQKKDFNLLEQTETLGVGYGCPEDS
        :.:: :       :.: .. ..   ::::::..   ::  .... ..:.::   : :: 
CCDS42 YYLGGIPI------AIRERFNISTPAFRGCMKNL---KKTSGVVRLNDTVGVTKKCSEDW
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CCDS42 KLVRSASFSRGGQLSFTDLG-LPPTDHLQASFGFQTFQPSGILLDHQTWTRNLQVTLEDG
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pF1KB0 TVIMDVK--GIKVQSVDKQYNDGLSHFV--ISSVSPTRYELIVDKSRVGSKNPTKGKIEQ
        . ....  :  . .  . : ::: :.:  ::. :  :  :: :.   .::     ....
CCDS42 YIELSTSDSGGPIFKSPQTYMDGLLHYVSVISDNSGLRL-LIDDQLLRNSK-----RLKH
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CCDS42 ISSSRQSLRLGGS-------NFEGCISNVFVQRLSLSPEVLDLTSNSLKRDVSLGGCSLN
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       . :...: : .  ..: :. . ..    .:.:  .: ..:. .      . :    . .:
CCDS42 KPPFLMLLKGSTRFNKTKTFRINQ--LLQDTPVASPRSVKVWQ------DACSPLPKTQA
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        . : :.:   .:.  :.  .  .  .:::.. ..: ::.:..:... .  :.::.:.:.
CCDS42 NHGALQFGDIPTSHLLFKLPQELLKPRSQFAVDMQTTSSRGLVFHTGTK--NSFMALYLS
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pF1KB0 HGRLVYMFNVGHKKLKIRSQEKYNDGLWHDVIFIRERSSGRLVIDGLRVLEESLPPTEAT
       .::::. ...  :::.:.:.:: ::: :: :.: ..  .::::.::::. : ::: . .:
CCDS42 KGRLVFALGTDGKKLRIKSKEKCNDGKWHTVVFGHDGEKGRLVVDGLRAREGSLPGN-ST
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        .:..:.:::.   ::  :..  ::   : :::.:.::..  . . :..:.:. :. ::.
CCDS42 ISIRAPVYLGSPPSGKP-KSLPTNS---FVGCLKNFQLDSKPLYTPSSSFGVSSCLGGPL
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       : : ::: :::.::: .:  .: .:...: .:::: .: :.:  :  :..: :... :.:
CCDS42 EKGIYFSEEGGHVVLAHSVLLGPEFKLVFSIRPRSLTGILIHIGSQPGKHLCVYLEAGKV
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pF1KB0 IVKVNNGIRDFSTSVTPKQSLCDGRWHRITVIRDSNVVQLDVDSEVNHVVGPLNPKPIDH
        .....:    :::::::::::::.:: ..:   .....:..:.. ....: .   : . 
CCDS42 TASMDSGAGGTSTSVTPKQSLCDGQWHSVAVTIKQHILHLELDTDSSYTAGQIPFPPAST
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pF1KB0 REPVFVGGVPESLLTPRLAPSKPFTGCIRHFVIDGHPVSFSKAALVSGAVSINSCPAA
       .::. .::.: .: : :.   : : ::.:.. ..  ::  ..:  :.: ::.:.::  
CCDS42 QEPLHLGGAPANLTTLRIPVWKSFFGCLRNIHVNHIPVPVTEALEVQGPVSLNGCPDQ
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CCDS33 LEVASPAGQGALASNVELCLCPASYRGDSCQECAPGFYRDVKGLFLGRCVPCQCHGHSDR
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CCDS33 LRGGRTQCLCKPGYAGASCERCAPGFFGNPLVLGSSCQPCDCSGNGDPNLLFSDCDPLTG
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CCDS33 ACRGCLRHTTGPRCEICAPGFYGNALLPGNCTRCDCTPCGTEACDPHSGHCLCKAGVTGR
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                 ::.                                               
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CCDS33 PEQGCRRCQCPGGRCDPHTGRCNCPPGLSGERCDTCSQQHQVPVPGGPVGHSIHCEVCDH
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pF1KB0 CVWDLTDDL-RLAAL--SIEEGKSGVLSVSSGAAAHRHVNEINATIYLLKTKLSERENQY
       ::  : ::: : .::  .:.:   :. ..:: : :. :  ..::.:  :...:    .  
CCDS33 CVVLLLDDLERAGALLPAIHEQLRGI-NASSMAWARLH--RLNASIADLQSQLRSPLGPR
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            :..  :.   :: .:...:    :  ..:::   ::.   .  :..::. :.   
CCDS33 HETAQQLEVLEQQSTSLGQDARRLGGQAVGTRDQAS---QLLAG-TEATLGHAKTLLAAI
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       . .   ..:. ..  . :  .  .:  ... . :. ....: :.:.:. . . .  .. :
CCDS33 RAVDRTLSELMSQTGHLGLANASAPSGEQLLRTLAEVERLLWEMRARD-LGAPQAAAEAE
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          : .::... :. . : .:...:   . ..: ...: : ::.:::..:.. .:.:...
CCDS33 LAAAQRLLARVQEQLSSLWEENQALATQTRDRLAQHEAGLMDLREALNRAVDATREAQEL
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pF1KB0 NRATAARQRDHEKQQERVREQMEVVNMSLSTSADSLTTPRLTLSELDDIIKNASGIYAEI
       :  .  : ..  ...... ..  ... .: .. :.:..    :  ::.  ..   . : .
CCDS33 NSRNQERLEEALQRKQELSRDNATLQATLHAARDTLASVFRLLHSLDQAKEELERLAASL
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       :::.. :  .....:  .  :  :. :  :::.: : : .::  . . ... :.:.:..:
CCDS33 DGARTPLLQRMQTFSPAGSKLRLVEAAEAHAQQLGQLALNLSSIILDVNQDRLTQRAIEA
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       ::.:  :.. :. :...:  ::. .:. . .:              ..:...:..: :..
CCDS33 SNAYSRILQAVQAAEDAAGQALQQADHTWATVV------------RQGLVDRAQQLLANS
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pF1KB0 ESSSDEAVADTSRRVGGALARKSALKTRLSD-------------AVKQLQAAERGDAQQR
        .. .::. . ..:.: . :  .. .:.: :             :.. . : .  .....
CCDS33 -TALEEAMLQEQQRLGLVWAALQGARTQLRDVRAKKDQLEAHIQAAQAMLAMDTDETSKK
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pF1KB0 LGQSRLITEEANRTTMEVQQATAPMANNLTNWSQNLQHFDSSAYNTAVNSARDAVRNLTE
       ..... .. ::. :. .::.    : .:.  :. . . . ..  . :: .:  .: .: .
CCDS33 IAHAKAVAAEAQDTATRVQSQLQAMQENVERWQGQYEGLRGQDLGQAVLDAGHSVSTLEK
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       ..:::: .:  .:..  . ::  .:::: :.::::::.:..:::..: : :.:.:.:...
CCDS33 TLPQLLAKLSILENRGVHNASLALSASIGRVRELIAQARGAASKVKVPMKFNGRSGVQLR
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       .  .. :: :.:.:..:.. :  .:    : :.:..:.::..:  .:::..... .. .:
CCDS33 TPRDLADLAAYTALKFYLQGPEPEPG-QGTEDRFVMYMGSRQATGDYMGVSLRDKKVHWV
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       :.::     .   .. ..     :. :...:. . :.       .: :.:...:.  ::.
CCDS33 YQLGEAGPAVLSIDEDIGEQ---FAAVSLDRTLQFGH-------MSVTVERQMIQETKGD
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pF1KB0 F--SGDDSLLDLDPEDTVFYVGGVPSNFKLPTSLNLPGFVGCLELATLNNDVISLYNFKH
           : ..::.: :.: :::::: ::.:  :  : .::. ::.:. :::..:.:::::..
CCDS33 TVAPGAEGLLNLRPDDFVFYVGGYPSTFTPPPLLRFPGYRGCIEMDTLNEEVVSLYNFER
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        ...: ... ::::.: .     . . ..::.:.:    :.  .... . ::. :.:  .
CCDS33 TFQLDTAVDRPCARSKSTGDPWLTDGSYLDGTGFA---RISFDSQISTTKRFEQELRLVS
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        .:..... . :.:. : ...: : ..:::: .   . :..    : .:    .:  .. 
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       ..  . :.... :.:  : :.....  . ..: : .::.::. :   .::  .:   . :
CCDS33 LLGGSRKRVLVRVERATVYSVEQDN-DLELADAYYLGGVPPDQLPP-SLRRLFPTGGSVR
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       ::.::..   :  .: .. .: ::. ::  : :..:   :.:..:.  ...... . :  
CCDS33 GCVKGIKALGKYVDL-KRLNTTGVSAGCTADLLVGRAMTFHGHGFLRLALSNVAPLTGNV
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         . :   : :: ... . .: .:   . : . .   .. .:: : :.   ::.:::::.
CCDS33 YSNATGVWLYVD-DQLQQMKPHRGPPPELQPQPEGPPRLLLGGLPESGTIYNFSGCISNV
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CCDS33 FVQRLLGPQRVFDLQQNLGSVNVSTGCAPALQAQTPGLGPRGLQATARKASR-----RSR
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       . :.  :. .  :.  : :.:              ::.::. .:. ::  . .      .
CCDS33 Q-PARHPACMLPPHLRTTRDS--------------YQFGGSLSSHLEFVGILARHRNWPS
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pF1KB0 FSIRLRTRSSHGMIFYVSDQEEND-FMTLFLAHGRLVYMFNVGHKKLKIRSQEKYNDGLW
       .:...  :::.:......  . ..  ..:::..:..: ...    .:. .:...   : :
CCDS33 LSMHVLPRSSRGLLLFTARLRPGSPSLALFLSNGHFVAQMEGLGTRLRAQSRQRSRPGRW
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pF1KB0 HDVIFIRERSSGRLVIDGLRVLEESLPPTE---ATWKIKGPIYLGGVAPGKAVKNVQINS
       : :    :..   :: :: :.  .  :  .   :       ...::. :... .. ..  
CCDS33 HKVSVRWEKNRILLVTDGARAWSQEGPHRQHQGAEHPQPHTLFVGGL-PASS-HSSKLPV
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pF1KB0 IYSFSGCLSNLQLNGASITSASQTFSVTPCFEGPMETGTYFSTEGGYVVLDESFNIGLKF
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CCDS33 TVGFSGCVKRLRLHGRPLGAPTRMAGVTPCILGPLEAGLFFPGSGGVITLDLPGATLPDV
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pF1KB0 EIAFEVRPRSSSGTLVH-GHSVNGEYLNVHMKNGQVIVKVNNGIRDFSTSVTPKQSLCDG
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CCDS33 GLELEVRPLAVTGLIFHLGQARTPPYLQLQVTEKQVLLRADDGAGEFSTSVTRPSVLCDG
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CCDS33 QWHRLAVMKSGNVLRLEVDAQSNHTVGPLLAAAAGAPAPLYLGGLPEPMAVQPWPPAYCG
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>>CCDS5138.1 LAMA2 gene_id:3908|Hs108|chr6                (3122 aa)
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       :   .: :. ::  ..    ::  : ..: :  :::::::: :.:   :..:..:.:   
CCDS51 LISSSNNFSPSCVAEGLDDYRCTACPRGYEGQYCERCAPGYTGSPGNPGGSCQECEC---
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CCDS51 -DPYGSLPVPCDPVTGFC-TCRPGATGRKCDGCK---HWHAREGWECVFCG---------
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pF1KB0 TGECLEEGFEPPTGMDCPTISCDKCVWDLTDDL-RLAALSIEEGKSGVLSVSSGAAAHRH
                             :.:.  :  :: ::  . .  . .: :      : .. 
CCDS51 ----------------------DECTGLLLGDLARLEQMVMSINLTGPLP-----APYKM
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pF1KB0 VNEINATIYLLKTKLSERENQYALRKIQINNAENTMKSLLSDVEELVEKENQASRKGQLV
       .  ..     ::  :: ..     : ::.  ::.....:.....::. . ....  :. .
CCDS51 LYGLENMTQELKHLLSPQRAPE--RLIQL--AEGNLNTLVTEMNELLTRATKVTADGEQT
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pF1KB0 QKESMDTINHASQLVEQAHDMRDKIQEINNKMLYYGEEHELSPKEISEKLVLAQK----M
        ...  : ..:..: :  ...    . .:.: .  .:      . . ..:   ::    :
CCDS51 GQDAERTNTRAKSLGEFIKELARDAEAVNEKAIKLNETLGTRDEAFERNLEGLQKEIDQM
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pF1KB0 LEEIRSRQPFFTQRELVDEEADEAYELLSQAES-WQRLHNETRTLFPVVLEQLDDYNAKL
       ..:.: :. . ::.:....:   :  ::..... . . ..:.. .   . :.: ::. :.
CCDS51 IKELR-RKNLETQKEIAEDELVAAEALLKKVKKLFGESRGENEEMEKDLREKLADYKNKV
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pF1KB0 SDLQEALDQALNYVRDAEDMNRATAARQRDH---EKQQERVREQMEVVNMSLSTSADSLT
       .:  . : .: . .:.:   ::  :. :..    ::..: :.   . .. .:. . : : 
CCDS51 DDAWDLLREATDKIREA---NRLFAVNQKNMTALEKKKEAVESGKRQIENTLKEGNDILD
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pF1KB0 TPRLTLSELDDIIKNASGIYAEIDGAKSELQVKLSNLSNLSHDL-VQEAIDHAQDLQQEA
             .:...::  .  : ...   . ::. :...::.  .:  . : ...:..   . 
CCDS51 EANRLADEINSIIDYVEDIQTKLPPMSEELNDKIDDLSQEIKDRKLAEKVSQAESHAAQL
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pF1KB0 NELSRKLHS--SDMNGLVQKALDASNVYENIVNYVSEANETAEFALNTTDRIYDAVSGID
       :. :  : .  .. ...  .:  : ..: :: .:..::...:. : . . .    ..:  
CCDS51 NDSSAVLDGILDEAKNISFNATAAFKAYSNIKDYIDEAEKVAKEAKDLAHEATKLATG--
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pF1KB0 TQIIYHKD------ESENLLNQARELQAKAESSSDEAVADTSRRVGGALARKSALKTRLS
        . . ..:      .:  .::.:..:   .. . :. .   . :. .: ::.. :   :.
CCDS51 PRGLLKEDAKGCLQKSFRILNEAKKLANDVKENEDH-LNGLKTRIENADARNGDLLRTLN
     1960      1970      1980      1990       2000      2010       

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pF1KB0 DAVKQLQAAERGDAQQRLGQSRLITEEANRTTMEVQQATAPMANNLTNWSQNLQHF-DSS
       :.. .:.:   .:.  .:   .  ...:: :. .:    . . .:: . ..: ... :: 
CCDS51 DTLGKLSAIP-NDTAAKLQAVKDKARQANDTAKDVLAQITELHQNLDGLKKNYNKLADSV
      2020       2030      2040      2050      2060      2070      

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pF1KB0 AYNTAV----------NSARDAVRNLTEVVPQLLDQLRTVEQKRPASNVSASIQRIRELI
       : ..::           .:  .:.:: . . .:.:.:. .  :.  .:.. .:..:.:::
CCDS51 AKTNAVVKDPSKNKIIADADATVKNLEQEADRLIDKLKPI--KELEDNLKKNISEIKELI
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pF1KB0 AQTRSVASKIQVSMMFDGQSAVEVHSRTSMDDLKAFTSLSLYMKPPVKRPELTETADQFI
        :.:. :..:.::.   :.       ::   ..:  .  .. ..  ::    : .::...
CCDS51 NQARKQANSIKVSVSSGGDCI-----RTYKPEIKKGSYNNIVVN--VK----TAVADNLL
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pF1KB0 LYLGSKNAK-KEYMGLAIKNDNLVYVYNLGTK--DVEIPLDSKPVSSWPAYFSIVKIERV
       .::::  ::  ..... ... .. .....:.    :: :  .   : :   . ::   :.
CCDS51 FYLGS--AKFIDFLAIEMRKGKVSFLWDVGSGVGRVEYPDLTIDDSYW---YRIVA-SRT
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pF1KB0 GKHGKVFLTVPSLSSTAEEKFIKKGEFSGDD---SLLDLDPEDTVFYVGGVPSNFKLPTS
       :..: .  .: .:..  . ... . . : .    ..::.:  .....:::. ...:   .
CCDS51 GRNGTI--SVRALDGP-KASIVPSTHHSTSPPGYTILDVDA-NAMLFVGGLTGKLKKADA
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pF1KB0 LNLPGFVGCLELATLNNDVISLYNFKHIYNMDPSTSV-PCARDKLAFTQSRAASYFFDGS
       . .  :.::.  . ..:  :.:.::..  .   . .: : ..:. .  :       ::: 
CCDS51 VRVITFTGCMGETYFDNKPIGLWNFREKEGDCKGCTVSPQVEDSEGTIQ-------FDGE
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pF1KB0 GYAVVRDITRRGKFGQVTRFDIEVRTPADNGLILLMVNGSM--FFRLEMRNGYLHVFYDF
       :::.:    :   . ...   .. :: ....:.. ... ..  :. .:. .:...: ::.
CCDS51 GYALVSRPIRW--YPNISTVMFKFRTFSSSALLMYLATRDLRDFMSVELTDGHIKVSYDL
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pF1KB0 GFSGGPVHLEDTLKKAQINDAKYHEISIIYHNDKKMILVVD-----RRHV---KSMDNEK
       : ::    . ..... . ::.:.. ...   . .  : .::     ....   .: .:  
CCDS51 G-SG----MASVVSNQNHNDGKWKSFTLSRIQKQANISIVDIDTNQEENIATSSSGNNFG
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pF1KB0 MKIPFTD-IYIGGAPPEILQSRALRAHLPLDIN-FRGCMKGFQFQKKDFNLLEQTETLGV
       . .   : ::.:: :   :.. ...:.  .... . ::.: .....  .:.: . . .::
CCDS51 LDLKADDKIYFGGLPT--LRNLSMKARPEVNLKKYSGCLKDIEISRTPYNILSSPDYVGV
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pF1KB0 GYGCPEDSLISRRAYFNGQSFIASIQKISFFDGFEGGFNFRTLQPNGLLFYYASGSDVFS
         ::  ... .                                                 
CCDS51 TKGCSLENVYTVSFPKPGFVELSPVPIDVGTEINLSFSTKNESGIILLGSGGTPAPPRRK
      2520      2530      2540      2550      2560      2570       

>--
 initn: 688 init1: 263 opt: 622  Z-score: 395.7  bits: 87.2 E(32554): 1e-15
Smith-Waterman score: 622; 40.6% identity (61.6% similar) in 224 aa overlap (62-276:740-951)

              40        50        60        70        80        90 
pF1KB0 FPFDIEGSSAVGRQDPPETSEPRVALGRLPPAAEKCNAGFFHTLSGECVPCDCNGNSNEC
                                     :  .. :. .:   .: : ::.: :... :
CCDS51 SYPTDGSIAAAVEVCQCPPGYTGSSCESCWPRHRRVNGTIF---GGICEPCQCFGHAESC
     710       720       730       740       750          760      

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pF1KB0 LDGSGYCVHCQRNTTGEHCEKCLDGYIGDSIRGAPQFCQPCPCPL--PHLANFAESCY--
        : .: :..:. .: : .:.::: :. :.  .:. . :::: :::  :   ::. .:.  
CCDS51 DDVTGECLNCKDHTGGPYCDKCLPGFYGEPTKGTSEDCQPCACPLNIPS-NNFSPTCHLD
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pF1KB0 RKNGAVRCICNENYAGPNCERCAPGYYGNPLLIGSTCKKCDCSGNSDPNLIFEDCDEVTG
       :. : .   :  .:.:: ::::: ::.:.: . :..:. :.:. : : . :  .:: ..:
CCDS51 RSLGLICDGCPVGYTGPRCERCAEGYFGQPSVPGGSCQPCQCNDNLDFS-IPGSCDSLSG
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pF1KB0 QCRNCLRNTTGFKCERCAPGYYGDARIAKNCAVCNCGGGP-----CDSVTGECLEEGFEP
       .:  :  .:::  :: :: ::.:::  ::::  : :..:      : : ::.:  :    
CCDS51 SCLICKPGTTGRYCELCADGYFGDAVDAKNCQPCRCNAGGSFSEVCHSQTGQC--ECRAN
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            270       280       290       300       310       320  
pF1KB0 PTGMDCPTISCDKCVWDLTDDLRLAALSIEEGKSGVLSVSSGAAAHRHVNEINATIYLLK
         :.      ::::                                              
CCDS51 VQGQ-----RCDKCKAGTFGLQSARGCVPCNCNSFGSKSFDCEESGQCWCQPGVTGKKCD
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>--
 initn: 273 init1: 175 opt: 558  Z-score: 356.3  bits: 79.9 E(32554): 1.6e-13
Smith-Waterman score: 599; 27.3% identity (55.3% similar) in 564 aa overlap (1284-1822:2597-3121)

          1260      1270      1280      1290      1300      1310   
pF1KB0 FDGFEGGFNFRTLQPNGLLFYYASGSDVFSISLDNGTVIMDVKGIKVQSVDKQYNDGLSH
                                     . :..:.  :  . : ..   . ..::  :
CCDS51 SGGTPAPPRRKRRQTGQAYYAILLNRGRLEVHLSTGARTM--RKIVIRPEPNLFHDGREH
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pF1KB0 FVISSVSPTR--YELIVDKSRVGSKNPTKGKIEQTQASEKKFYFGGSPISAQYAN-----
        :   :  ::  . . ::..:   .: :   .::     ::.. ::.:   : .      
CCDS51 SV--HVERTRGIFTVQVDENRRYMQNLT---VEQP-IEVKKLFVGGAPPEFQPSPLRNIP
           2630      2640      2650          2660      2670        

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pF1KB0 -FTGCISNAYFTRVDRDVEVEDFQRYTEKVHTSLYECPIESSPLFLLHKKGKNLSKPKAS
        : ::: :  .. :  :     : : .   .... .:          :.: .. ..  :.
CCDS51 PFEGCIWNLVINSVPMD-----FARPVSFKNADIGRCA---------HQKLRE-DEDGAA
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pF1KB0 QNKKGGKSKDAPSWDPVALKLPERNTPRNSH--CHLSNSPRAIEHAYQYGGTANSRQEFE
         .   . . .:.  : :.  :   ::  .:  :   . :  .  . :.: . ::.  . 
CCDS51 PAEIVIQPEPVPT--P-AFPTP---TPVLTHGPCAAESEPALLIGSKQFGLSRNSHIAIA
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pF1KB0 HLKGDFGAKSQFSIRL--RTRSSHGMIFYVSDQEENDFMTLFLAHGRLVYMFNVGHKKLK
           :  .:....:.:  ::..  :..::..  .. :: :. : .:   . ...:    .
CCDS51 F--DDTKVKNRLTIELEVRTEAESGLLFYMARINHADFATVQLRNGLPYFSYDLGSGDTH
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pF1KB0 IRSQEKYNDGLWHDVIFIRERSSGRLVIDGLRVLEESLPPTEAT-WKIKGPIYLGGVAPG
            : ::: :: . ..: .. : : .::    .... : .:    . : .:.::.  .
CCDS51 TMIPTKINDGQWHKIKIMRSKQEGILYVDGAS--NRTISPKKADILDVVGMLYVGGLPIN
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pF1KB0 KAVKNVQINSIYSFSGCLSNLQLN--GASITSASQTFSVTPCFEGPMETGTYFSTEGGYV
        ... .   . ::..::. ::..    :.. . ...: :  :: .  . ::::.  : ..
CCDS51 YTTRRIGPVT-YSIDGCVRNLHMAEAPADLEQPTSSFHVGTCFANA-QRGTYFDGTG-FA
          2900       2910      2920      2930       2940       2950

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pF1KB0 VLDESFNIGLKFEIAFEVRPRSSSGTLVHGHSVNGEYLNVHMKNGQVIVKVNNGIRDFST
           .:..:: . . :: :  ...:.:.   : . . ....: . ... .:.::   :..
CCDS51 KAVGGFKVGLDLLVEFEFRTTTTTGVLLGISSQKMDGMGIEMIDEKLMFHVDNGAGRFTA
             2960      2970      2980      2990      3000      3010

     1720         1730      1740      1750      1760        1770   
pF1KB0 SV---TPKQSLCDGRWHRITVIRDSNVVQLDVDSEVNHVVGPLNPKPI--DHREPVFVGG
            .: . ::::.::..:. . .. ..: ::..  .. .: ::     :  .::::::
CCDS51 VYDAGVPGH-LCDGQWHKVTANKIKHRIELTVDGNQVEAQSP-NPASTSADTNDPVFVGG
              3020      3030      3040      3050       3060        

          1780      1790         1800        1810      1820   
pF1KB0 VPESLLTPRLAPSKPFTGCIRHFVID---GHP--VSFSKAALVSGAVSINSCPAA
        :..:    :. : :: :::: . .    :.:  :.:.::  . :.  . :::: 
CCDS51 FPDDLKQFGLTTSIPFRGCIRSLKLTKGTGKPLEVNFAKALELRGVQPV-SCPAN
     3070      3080      3090      3100      3110       3120  

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                         10        20             30        40     
pF1KB0           MALSSAWRSVLPLWLLWSAACSRAASGD-----DNAFPFDIEGSSAVGRQ
                                     :.: : :      ..  : . . ...:.  
CCDS57 CECDPQGSLSSVCDPNGGQCQCRPNVVGRTCNRCAPGTFGFGPSGCKPCECHLQGSVNAF
            780       790       800       810       820       830  

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pF1KB0 DPPETSEPRVALGRLPPAAEKCNAGFFHTLSGECVPCDCNGNSNECLDGSGYCVHCQRNT
         : :.. .   :      ..:  : .   :  : ::.:::....:   .: :..::  :
CCDS57 CNPVTGQCHCFQGVYARQCDRCLPGHWGFPS--CQPCQCNGHADDCDPVTGECLNCQDYT
            840       850       860         870       880       890

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pF1KB0 TGEHCEKCLDGYIGDSIRGAPQFCQPCPCPL-PHLA-NFAESCYRKNGAVR--CICNENY
        :..::.:: :: :: : :. . :.:::::  :  . .::.:::.   ...  :.:. .:
CCDS57 MGHNCERCLAGYYGDPIIGSGDHCRPCPCPDGPDSGRQFARSCYQDPVTLQLACVCDPGY
              900       910       920       930       940       950

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pF1KB0 AGPNCERCAPGYYGNPLLIGSTCKKCDCSGN---SDPNLIFEDCDEVTGQCRNCLRNTTG
        :  :. :: ::.:::  .:..:. :.: .:   .::    : ::. ::.: .:: .: :
CCDS57 IGSRCDDCASGYFGNPSEVGGSCQPCQCHNNIDTTDP----EACDKETGRCLKCLYHTEG
              960       970       980           990      1000      

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pF1KB0 FKCERCAPGYYGDARIAKNC--AVCN--------CGGGPC--DSVTGECLEEGFEPPTGM
        .:. :  :::::: . ..:   :::        :.:. :  :..::.::   .    :.
CCDS57 EHCQFCRFGYYGDA-LQQDCRKCVCNYLGTVQEHCNGSDCQCDKATGQCLC--LPNVIGQ
       1010      1020       1030      1040      1050        1060   

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pF1KB0 DCPTISCDKCVWDLTDDLRLAALSIEEGKS---------GVLSVSSGAAAHRHVNEINAT
       .:    :   .:.:..       . . ..:         :  .   : .. :  .: .  
CCDS57 NCDR--CAPNTWQLASGTGCDPCNCNAAHSFGPSCNEFTGQCQCMPGFGG-RTCSECQE-
            1070      1080      1090      1100      1110           

       320       330       340       350         360       370     
pF1KB0 IYLLKTKLSERENQYALRKIQINNAENTMKSLLSDVEELVE--KENQASRKGQLVQKESM
       ..     .  :  .   : :.  . ...  . .    : ::  . .. .:  . :  .  
CCDS57 LFWGDPDVECRACDCDPRGIETPQCDQSTGQCVC--VEGVEGPRCDKCTRGYSGVFPDCT
    1120      1130      1140      1150        1160      1170       

                  380       390         400       410        420   
pF1KB0 ---------DTINHASQLVEQAHDMRDKIQ--EINNKMLYYGEEHELSPKEISE-KLVLA
                :.:   ..:....: . .: .  .:.. .  : :  .   ...:: : .::
CCDS57 PCHQCFALWDVI--IAELTNRTHRFLEKAKALKISGVIGPYRETVDSVERKVSEIKDILA
      1180        1190      1200      1210      1220      1230     

            430       440       450               460           470
pF1KB0 QK-MLEEIRSRQPFFTQRELVDEEADEAY--------ELLSQAESWQR----LHNETRTL
       :.   : ...   .: . : . ... : .        .  ::..:  .    :..:...:
CCDS57 QSPAAEPLKNIGNLFEEAEKLIKDVTEMMAQVEVKLSDTTSQSNSTAKELDSLQTEAESL
        1240      1250      1260      1270      1280      1290     

              480        490       500          510       520      
pF1KB0 FPVVLEQLDDYN-AKLSDLQEALDQALNYVR---DAEDMNRATAARQRDHEKQQERVREQ
         .: :  .. .  : ::.. :::.  .: .   .::.   :....  .  .:.  .:..
CCDS57 DNTVKELAEQLEFIKNSDIRGALDSITKYFQMSLEAEERVNASTTEPNSTVEQSALMRDR
        1300      1310      1320      1330      1340      1350     

        530       540       550       560        570       580     
pF1KB0 MEVVNMSLSTSADSLTTPRLTLSELDDIIKNASGIYAEID-GAKSELQVKLSNLSNLSHD
       .: : :   ..       .  :  ::..    .:    .: .: .:.       .. :  
CCDS57 VEDVMMERESQFKEKQEEQARL--LDEL----AGKLQSLDLSAAAEMTCGTPPGASCS--
        1360      1370        1380          1390      1400         

         590       600       610              620              630 
pF1KB0 LVQEAIDHAQDLQQEANELSRKLHSSDMNGLV-------QKALD-------ASNVYENIV
          :.   . . . . .:  ::  .   .:::       :::.:       :    :.. 
CCDS57 ---ETECGGPNCRTDEGE--RKCGGPGCGGLVTVAHNAWQKAMDLDQDVLSALAEVEQLS
         1410      1420        1430      1440      1450      1460  

             640       650       660       670         680         
pF1KB0 NYVSEANETAEFALNTTDRIYDAVSGIDTQIIYHKDESENLLNQAREL--QAKAESSSDE
       ..::::.  :. : .... :   ...   ..   ..: .::..: :..  : .:. .: :
CCDS57 KMVSEAKLRADEAKQSAEDILLKTNATKEKMDKSNEELRNLIKQIRNFLTQDSADLDSIE
           1470      1480      1490      1500      1510      1520  

     690       700       710       720       730          740      
pF1KB0 AVADTSRRVGGALARKSALKTRLSDAVKQLQAAERGDAQQR---LGQSRLITEEAN----
       :::.             .:: .. .. .:::   . : ..:   :.: ..: ...     
CCDS57 AVANE------------VLKMEMPSTPQQLQNLTE-DIRERVESLSQVEVILQHSAADIA
                       1530      1540       1550      1560         

            750         760       770       780       790       800
pF1KB0 RTTMEVQQA--TAPMANNLTNWSQNLQHFDSSAYNTAVNSARDAVRNLTEVVPQLLDQLR
       :. : ...:  ..  :...   .. ...    : .. : .:. :...  : .    . : 
CCDS57 RAEMLLEEAKRASKSATDVKVTADMVKEALEEAEKAQV-AAEKAIKQADEDIQGTQNLLT
    1570      1580      1590      1600       1610      1620        

              810          820       830       840       850       
pF1KB0 TVEQKRPASN---VSASIQRIRELIAQTRSVASKIQVSMMFDGQSAVEVHSRTSMDDLKA
       ..:..  ::.    .:: ::: ::                                    
CCDS57 SIESETAASEETLFNAS-QRISELERNVEELKRKAAQNSGEAEYIEKVVYTVKQSAEDVK
     1630      1640       1650      1660      1670      1680       

>>CCDS34732.1 LAMB4 gene_id:22798|Hs108|chr7              (1761 aa)
 initn: 348 init1: 215 opt: 605  Z-score: 388.3  bits: 85.0 E(32554): 2.6e-15
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           40        50        60        70        80        90    
pF1KB0 DIEGSSAVGRQDPPETSEPRVALGRLPPAAEKCNAGFFHTLSGECVPCDCNGNSNECLDG
                                     ..: ::.:   :  : :: ::  .. :   
CCDS34 HCHPQGSKDTVCDQVTGQCPCHGEVSGRRCDRCLAGYFGFPS--CHPCPCNRFAELCDPE
       820       830       840       850         860       870     

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pF1KB0 SGYCVHCQRNTTGEHCEKCLDGYIGDSIRGAPQFCQPCPCPLPHLAN--FAESCYRK--N
       .: : .:   :::..::.:.::: :.   : :  :.:: ::    .:  ::.:::..  .
CCDS34 TGSCFNCGGFTTGRNCERCIDGYYGNPSSGQP--CRPCLCPDDPSSNQYFAHSCYQNLWS
         880       890       900         910       920       930   

              160       170       180       190          200       
pF1KB0 GAVRCICNENYAGPNCERCAPGYYGNPLLIGSTCKKCDCSGN---SDPNLIFEDCDEVTG
       . : : : ..:.: .: .:. :.:::: . :. :. : :..:   .::    :.:..:::
CCDS34 SDVICNCLQGYTGTQCGECSTGFYGNPRISGAPCQPCACNNNIDVTDP----ESCSRVTG
           940       950       960       970       980             

       210       220       230       240            250       260  
pF1KB0 QCRNCLRNTTGFKCERCAPGYYGDARIAKNCAVCNC---GGGP--CDSVTGECLEEGFEP
       .:  ::.:: : .:. : ::.::.: . ..:  :.:   : .:  :    : ::    .:
CCDS34 ECLRCLHNTQGANCQLCKPGHYGSA-LNQTCRRCSCHASGVSPMECPPGGGACL---CDP
     990      1000      1010       1020      1030      1040        

            270                280       290       300       310   
pF1KB0 PTGMDCPTI------SCDKCV---WDLTDDLRLAALSIEEGKSGVLSVSSGAAAHRHVNE
        ::  :: .      .::.:.   :.:.      . . .        .:...   . ...
CCDS34 VTGA-CPCLPNVTGLACDRCADGYWNLVPGRGCQSCDCDP------RTSQSSHCDQLTGQ
         1050      1060      1070      1080            1090        

           320        330          340       350       360         
pF1KB0 INATIYLLKTKLSE-RENQYAL---RKIQINNAENTMKSLLSDVEELVEKENQASRKGQL
           .     . :: .:: :.    : :  .  .   .. . : .  . .     :.:  
CCDS34 CPCKLGYGGKRCSECQENYYGDPPGRCIPCDCNRAGTQKPICDPDTGMCR----CREGVS
     1100      1110      1120      1130      1140          1150    

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pF1KB0 VQKESMDTINHASQLVE--QAHDMRDKIQEINNKMLYYGEEHELSPKEISEKLVLAQKML
        :. .  . .:....    : :   :. ..  ...           : ..  . :: .: 
CCDS34 GQRCDRCARGHSQEFPTCLQCHLCFDQWDHTISSL----------SKAVQGLMRLAANM-
         1160      1170      1180                1190      1200    

       430       440       450       460       470        480      
pF1KB0 EEIRSRQPFFTQRELVDEEADEAYELLSQAESWQRLHNETRTLFPV-VLEQLDDYNAKLS
       :. :   :          :::   .: ...   .:. ..   .::   . .. ::. .. 
CCDS34 EDKRETLPVC--------EADFK-DLRGNVSEIERILKHP--VFPSGKFLKVKDYHDSVR
          1210               1220      1230        1240      1250  

        490       500       510            520       530       540 
pF1KB0 DLQEALDQALNYVRDAEDMNRATAARQRDH-----EKQQERVREQMEVVNMSLSTSADSL
            :.. :. : . .:. . :  : ...     :  ::..  :  :.: :.. :....
CCDS34 RQIMQLNEQLKAVYEFQDL-KDTIERAKNEADLLLEDLQEEIDLQSSVLNASIADSSENI
           1260      1270       1280      1290      1300      1310 

             550       560       570       580           590       
pF1KB0 TTPRLTLSELDDIIKNASGIYAEIDGAKSELQVKLSNLS---NLSHD-LVQEAIDHAQDL
              :  .  :...:.      .....: . :..:.   ::: . : :  :   : :
CCDS34 KKYYHISSSAEKKINETSSTINTSANTRNDLLTILDTLTSKGNLSLERLKQIKIPDIQIL
            1320      1330      1340      1350      1360      1370 

       600                        610                   620        
pF1KB0 QQE-----------------ANELSRKLHSS------------DMNGLVQKALDASNVYE
       ...                 :   .:: : .            . :.: ::: .:... .
CCDS34 NEKVCGDPGNVPCVPLPCGGALCTGRKGHRKCRGPGCHGSLTLSTNAL-QKAQEAKSIIR
            1380      1390      1400      1410       1420      1430

      630              640       650       660       670       680 
pF1KB0 NI-------VNYVSEANETAEFALNTTDRIYDAVSGIDTQIIYHKDESENLLNQARELQA
       :.        : .   .: :: . :.. .. . ...: .:    ..:. ::. .  .   
CCDS34 NLDKQVRGLKNQIESISEQAEVSKNNALQLREKLGNIRNQS-DSEEENINLFIKKVKNFL
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