Result of FASTA (ccds) for pF1KB0044
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB0044, 1258 aa
  1>>>pF1KB0044 1258 - 1258 aa - 1258 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7520+/-0.00108; mu= 22.1054+/- 0.066
 mean_var=95.8050+/-18.750, 0's: 0 Z-trim(105.7): 18  B-trim: 0 in 0/50
 Lambda= 0.131033
 statistics sampled from 8581 (8594) to 8581 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.608), E-opt: 0.2 (0.264), width:  16
 Scan time:  4.540

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS3090.1 STAG1 gene_id:10274|Hs108|chr3          (1258) 8287 1578.0       0
CCDS14607.1 STAG2 gene_id:10735|Hs108|chrX         (1231) 5509 1052.8       0
CCDS43990.1 STAG2 gene_id:10735|Hs108|chrX         (1268) 5506 1052.3       0
CCDS34703.1 STAG3 gene_id:10734|Hs108|chr7         (1225) 3660 703.3 9.8e-202
CCDS75642.1 STAG3 gene_id:10734|Hs108|chr7         (1226) 3660 703.3 9.8e-202
CCDS64730.1 STAG3 gene_id:10734|Hs108|chr7         (1167) 3331 641.1  5e-183


>>CCDS3090.1 STAG1 gene_id:10274|Hs108|chr3               (1258 aa)
 initn: 8287 init1: 8287 opt: 8287  Z-score: 8462.3  bits: 1578.0 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 8287; 100.0% identity (100.0% similar) in 1258 aa overlap (1-1258:1-1258)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB0 MITSELPVLQDSTNETTAHSDAGSELEETEVKGKRKRGRPGRPPSTNKKPRKSPGEKSRI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MITSELPVLQDSTNETTAHSDAGSELEETEVKGKRKRGRPGRPPSTNKKPRKSPGEKSRI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB0 EAGIRGAGRGRANGHPQQNGEGEPVTLFEVVKLGKSAMQSVVDDWIESYKQDRDIALLDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 EAGIRGAGRGRANGHPQQNGEGEPVTLFEVVKLGKSAMQSVVDDWIESYKQDRDIALLDL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB0 INFFIQCSGCRGTVRIEMFRNMQNAEIIRKMTEEFDEDSGDYPLTMPGPQWKKFRSNFCE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 INFFIQCSGCRGTVRIEMFRNMQNAEIIRKMTEEFDEDSGDYPLTMPGPQWKKFRSNFCE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB0 FIGVLIRQCQYSIIYDEYMMDTVISLLTGLSDSQVRAFRHTSTLAAMKLMTALVNVALNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 FIGVLIRQCQYSIIYDEYMMDTVISLLTGLSDSQVRAFRHTSTLAAMKLMTALVNVALNL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB0 SIHQDNTQRQYEAERNKMIGKRANERLELLLQKRKELQENQDEIENMMNSIFKGIFVHRY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 SIHQDNTQRQYEAERNKMIGKRANERLELLLQKRKELQENQDEIENMMNSIFKGIFVHRY
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB0 RDAIAEIRAICIEEIGVWMKMYSDAFLNDSYLKYVGWTLHDRQGEVRLKCLKALQSLYTN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 RDAIAEIRAICIEEIGVWMKMYSDAFLNDSYLKYVGWTLHDRQGEVRLKCLKALQSLYTN
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB0 RELFPKLELFTNRFKDRIVSMTLDKEYDVAVEAIRLVTLILHGSEEALSNEDCENVYHLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 RELFPKLELFTNRFKDRIVSMTLDKEYDVAVEAIRLVTLILHGSEEALSNEDCENVYHLV
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB0 YSAHRPVAVAAGEFLHKKLFSRHDPQAEEALAKRRGRNSPNGNLIRMLVLFFLESELHEH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 YSAHRPVAVAAGEFLHKKLFSRHDPQAEEALAKRRGRNSPNGNLIRMLVLFFLESELHEH
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB0 AAYLVDSLWESSQELLKDWECMTELLLEEPVQGEEAMSDRQESALIELMVCTIRQAAEAH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 AAYLVDSLWESSQELLKDWECMTELLLEEPVQGEEAMSDRQESALIELMVCTIRQAAEAH
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB0 PPVGRGTGKRVLTAKERKTQIDDRNKLTEHFIITLPMLLSKYSADAEKVANLLQIPQYFD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 PPVGRGTGKRVLTAKERKTQIDDRNKLTEHFIITLPMLLSKYSADAEKVANLLQIPQYFD
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB0 LEIYSTGRMEKHLDALLKQIKFVVEKHVESDVLEACSKTYSILCSEEYTIQNRVDIARSQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LEIYSTGRMEKHLDALLKQIKFVVEKHVESDVLEACSKTYSILCSEEYTIQNRVDIARSQ
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB0 LIDEFVDRFNHSVEDLLQEGEEADDDDIYNVLSTLKRLTSFHNAHDLTKWDLFGNCYRLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LIDEFVDRFNHSVEDLLQEGEEADDDDIYNVLSTLKRLTSFHNAHDLTKWDLFGNCYRLL
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB0 KTGIEHGAMPEQIVVQALQCSHYSILWQLVKITDGSPSKEDLLVLRKTVKSFLAVCQQCL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 KTGIEHGAMPEQIVVQALQCSHYSILWQLVKITDGSPSKEDLLVLRKTVKSFLAVCQQCL
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB0 SNVNTPVKEQAFMLLCDLLMIFSHQLMTGGREGLQPLVFNPDTGLQSELLSFVMDHVFID
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 SNVNTPVKEQAFMLLCDLLMIFSHQLMTGGREGLQPLVFNPDTGLQSELLSFVMDHVFID
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB0 QDEENQSMEGDEEDEANKIEALHKRRNLLAAFSKLIIYDIVDMHAAADIFKHYMKYYNDY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 QDEENQSMEGDEEDEANKIEALHKRRNLLAAFSKLIIYDIVDMHAAADIFKHYMKYYNDY
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB0 GDIIKETLSKTRQIDKIQCAKTLILSLQQLFNELVQEQGPNLDRTSAHVSGIKELARRFA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 GDIIKETLSKTRQIDKIQCAKTLILSLQQLFNELVQEQGPNLDRTSAHVSGIKELARRFA
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KB0 LTFGLDQIKTREAVATLHKDGIEFAFKYQNQKGQEYPPPNLAFLEVLSEFSSKLLRQDKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LTFGLDQIKTREAVATLHKDGIEFAFKYQNQKGQEYPPPNLAFLEVLSEFSSKLLRQDKK
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KB0 TVHSYLEKFLTEQMMERREDVWLPLISYRNSLVTGGEDDRMSVNSGSSSSKTSSVRNKKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 TVHSYLEKFLTEQMMERREDVWLPLISYRNSLVTGGEDDRMSVNSGSSSSKTSSVRNKKG
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KB0 RPPLHKKRVEDESLDNTWLNRTDTMIQTPGPLPAPQLTSTVLRENSRPMGDQIQEPESEH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 RPPLHKKRVEDESLDNTWLNRTDTMIQTPGPLPAPQLTSTVLRENSRPMGDQIQEPESEH
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KB0 GSEPDFLHNPQMQISWLGQPKLEDLNRKDRTGMNYMKVRTGVRHAVRGLMEEDAEPIFED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 GSEPDFLHNPQMQISWLGQPKLEDLNRKDRTGMNYMKVRTGVRHAVRGLMEEDAEPIFED
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250        
pF1KB0 VMMSSRSQLEDMNEEFEDTMVIDLPPSRNRRERAELRPDFFDSAAIIEDDSGFGMPMF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 VMMSSRSQLEDMNEEFEDTMVIDLPPSRNRRERAELRPDFFDSAAIIEDDSGFGMPMF
             1210      1220      1230      1240      1250        

>>CCDS14607.1 STAG2 gene_id:10735|Hs108|chrX              (1231 aa)
 initn: 5622 init1: 3147 opt: 5509  Z-score: 5624.3  bits: 1052.8 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5782; 70.0% identity (86.7% similar) in 1275 aa overlap (1-1258:1-1231)

                10        20        30        40        50         
pF1KB0 MITS-ELPVLQDSTNETTAHSDAGSELEETEVKGKRKRGRPGRPPSTNKKPRKSPGEKSR
       ::.. :.:.  .  .:. .: .. ...:. : :.. :.:. :.   : :: .:.:.::..
CCDS14 MIAAPEIPTDFNLLQESETHFSSDTDFEDIEGKNQ-KQGK-GK---TCKKGKKGPAEKGK
               10        20        30          40           50     

      60             70        80        90       100       110    
pF1KB0 IEAGIRGAGR-----GRANGHPQQNGEGEPVTLFEVVKLGKSAMQSVVDDWIESYKQDRD
          :  :.:.     .: ::: ::::  : . ::::::.:::::::::::::::::.:::
CCDS14 ---GGNGGGKPPSGPNRMNGHHQQNGV-ENMMLFEVVKMGKSAMQSVVDDWIESYKHDRD
             60        70         80        90       100       110 

          120       130       140       150       160       170    
pF1KB0 IALLDLINFFIQCSGCRGTVRIEMFRNMQNAEIIRKMTEEFDEDSGDYPLTMPGPQWKKF
       ::::::::::::::::.:.:  ::::.:::.::::::::::::::::::::: :::::::
CCDS14 IALLDLINFFIQCSGCKGVVTAEMFRHMQNSEIIRKMTEEFDEDSGDYPLTMAGPQWKKF
             120       130       140       150       160       170 

          180       190       200       210       220       230    
pF1KB0 RSNFCEFIGVLIRQCQYSIIYDEYMMDTVISLLTGLSDSQVRAFRHTSTLAAMKLMTALV
       .:.::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KSSFCEFIGVLVRQCQYSIIYDEYMMDTVISLLTGLSDSQVRAFRHTSTLAAMKLMTALV
             180       190       200       210       220       230 

          240       250       260       270       280       290    
pF1KB0 NVALNLSIHQDNTQRQYEAERNKMIGKRANERLELLLQKRKELQENQDEIENMMNSIFKG
       ::::::::..:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS14 NVALNLSINMDNTQRQYEAERNKMIGKRANERLELLLQKRKELQENQDEIENMMNAIFKG
             240       250       260       270       280       290 

          300       310       320       330       340       350    
pF1KB0 IFVHRYRDAIAEIRAICIEEIGVWMKMYSDAFLNDSYLKYVGWTLHDRQGEVRLKCLKAL
       .:::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::.::.::::::::: ::
CCDS14 VFVHRYRDAIAEIRAICIEEIGIWMKMYSDAFLNDSYLKYVGWTMHDKQGEVRLKCLTAL
             300       310       320       330       340       350 

          360       370       380       390       400       410    
pF1KB0 QSLYTNRELFPKLELFTNRFKDRIVSMTLDKEYDVAVEAIRLVTLILHGSEEALSNEDCE
       :.:: :.::  ::::::.:::::::::::::::::::.::.:.::.:..:::.:. ::::
CCDS14 QGLYYNKELNSKLELFTSRFKDRIVSMTLDKEYDVAVQAIKLLTLVLQSSEEVLTAEDCE
             360       370       380       390       400       410 

          420       430       440       450       460       470    
pF1KB0 NVYHLVYSAHRPVAVAAGEFLHKKLFSRHDPQAEEALAKRRGRNSPNGNLIRMLVLFFLE
       :::::::::::::::::::::.::::::.::. :... :::::..::.::.. ::.::::
CCDS14 NVYHLVYSAHRPVAVAAGEFLYKKLFSRRDPE-EDGMMKRRGRQGPNANLVKTLVFFFLE
             420       430       440        450       460       470

          480       490       500       510       520       530    
pF1KB0 SELHEHAAYLVDSLWESSQELLKDWECMTELLLEEPVQGEEAMSDRQESALIELMVCTIR
       :::::::::::::.:. . :::::::::. ::::::..::::..:::::::::.:.::::
CCDS14 SELHEHAAYLVDSMWDCATELLKDWECMNSLLLEEPLSGEEALTDRQESALIEIMLCTIR
              480       490       500       510       520       530

          540       550       560       570       580       590    
pF1KB0 QAAEAHPPVGRGTGKRVLTAKERKTQIDDRNKLTEHFIITLPMLLSKYSADAEKVANLLQ
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CCDS14 QAAECHPPVGRGTGKRVLTAKEKKTQLDDRTKITELFAVALPQLLAKYSVDAEKVTNLLQ
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       .:::::::::.:::.::::::::.::. .::::...::::::::::  ::.::.:: :::
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       ::.:::::::..:.::. .::.:::::: :.:: :.:::::::.:.:::::::.:::::.
CCDS14 DISRSQLIDELADKFNRLLEDFLQEGEEPDEDDAYQVLSTLKRITAFHNAHDLSKWDLFA
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         :.:::::::.: ::::::..::::.:: :::::.:::..: .::::: :.: .. :  
CCDS14 CNYKLLKTGIENGDMPEQIVIHALQCTHYVILWQLAKITESSSTKEDLLRLKKQMRVFCQ
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       .::. :.:::: :::::: .:::.:::::::.:.:::. :.:::..::..::::::::..
CCDS14 ICQHYLTNVNTTVKEQAFTILCDILMIFSHQIMSGGRDMLEPLVYTPDSSLQSELLSFIL
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       :::::.::..:.: .:..::::.::::::::::::::: :::.: .:.:..::::::.::
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       :::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::..::.: :.::.:.  :::::
CCDS14 KYYNDYGDIIKETMSKTRQIDKIQCAKTLILSLQQLFNEMIQENGYNFDRSSSTFSGIKE
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       :::::::::::::.:::::.: :::::::::::  : .:. .:: :::::..::::::::
CCDS14 LARRFALTFGLDQLKTREAIAMLHKDGIEFAFKEPNPQGESHPPLNLAFLDILSEFSSKL
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       :::::.::. :::::.: ::  :::::::::.::::::..::.:: ::: :: :: . :.
CCDS14 LRQDKRTVYVYLEKFMTFQMSLRREDVWLPLMSYRNSLLAGGDDDTMSVISGISS-RGST
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       ::.::..:   :..:          :. : :. ::.: .:. .::  . .::::::..::
CCDS14 VRSKKSKPSTGKRKVVEGMQLSLTEESSSSDSMWLSREQTL-HTPVMMQTPQLTSTIMRE
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        .:       .::.      .:.    ::      :   : ::.  .             
CCDS14 PKR------LRPED------SFMSVYPMQTEHHQTPL--DYNRRGTS-------------
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           :::.: ::: :::::::....::.:: .. ::: ::::::.:::::.::.::::: 
CCDS14 ----LMEDDEEPIVEDVMMSSEGRIEDLNEGMDFDTMDIDLPPSKNRRERTELKPDFFDP
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CCDS14 ASIM-DESVLGVSMF
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CCDS43 IALLDLINFFIQCSGCKGVVTAEMFRHMQNSEIIRKMTEEFDEDSGDYPLTMAGPQWKKF
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       .:.::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::..:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
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       .:::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::.::.::::::::: ::
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       :.:: :.::  ::::::.:::::::::::::::::::.::.:.::.:..:::.:. ::::
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CCDS43 ICQHYLTNVNTTVKEQAFTILCDILMIFSHQIMSGGRDMLEPLVYTPDSSLQSELLSFIL
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CCDS43 KYYNDYGDIIKETMSKTRQIDKIQCAKTLILSLQQLFNEMIQENGYNFDRSSSTFSGIKE
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pF1KB0 VRNKKGRPPLHKKRV----------EDESLDNTWLNRTDTMIQTPGPLPAPQLTSTVLRE
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pF1KB0 NSR--PMGD--QIQEPESEHGSEP-DFLHNPQMQISW-LGQPKLEDL-NRKDRTGMNYMK
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CCDS43 PKRLRPEDSFMSVYPMQTEHHQTPLDY----NTQVTWMLAQRQQEEARQQQERAAMSYVK
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pF1KB0 VRTGVRHAVR---GLMEEDAEPIFEDVMMSSRSQLEDMNEEFE-DTMVIDLPPSRNRRER
       .::...::.:   .:::.: ::: :::::::....::.:: .. ::: ::::::.:::::
CCDS43 LRTNLQHAIRRGTSLMEDDEEPIVEDVMMSSEGRIEDLNEGMDFDTMDIDLPPSKNRRER
         1190      1200      1210      1220      1230      1240    

          1240      1250        
pF1KB0 AELRPDFFDSAAIIEDDSGFGMPMF
       .::.::::: :.:. :.: .:. ::
CCDS43 TELKPDFFDPASIM-DESVLGVSMF
         1250       1260        

>>CCDS34703.1 STAG3 gene_id:10734|Hs108|chr7              (1225 aa)
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Smith-Waterman score: 3753; 48.9% identity (75.5% similar) in 1263 aa overlap (3-1249:23-1224)

                                   10        20              30    
pF1KB0                     MITSELPVLQDSTNETTAHS------DAGSELEETEVKGK
                             .. ::  . ..:.:.  .      :  ...:..  .. 
CCDS34 MSSPLQRAVGDTKRALSASSSSSASLPFDDRDSNHTSEGNGDSLLADEDTDFEDSLNRNV
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pF1KB0 RKRGRPGRPPSTNKKPRKSPGEKSRIEAGIRGAGRGRANGHPQQNGEGEPVTLFEVVKLG
       .::.   :::.:.    : : . ::.           .. : ....:     ::..:: .
CCDS34 KKRAAK-RPPKTTPVA-KHPKKGSRV-----------VHRHSRKQSEPPANDLFNAVKAA
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pF1KB0 KSAMQSVVDDWIESYKQDRDIALLDLINFFIQCSGCRGTVRIEMFRNMQNAEIIRKMTEE
       :: :::.::.:..:::::.: ..:.:.:::::  ::.: :  :::..:.:.:::...::.
CCDS34 KSDMQSLVDEWLDSYKQDQDAGFLELVNFFIQSCGCKGIVTPEMFKKMSNSEIIQHLTEQ
       110       120       130       140       150       160       

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pF1KB0 FDEDSGDYPLTMPGPQWKKFRSNFCEFIGVLIRQCQYSIIYDEYMMDTVISLLTGLSDSQ
       :.::::::::  :::.::::...::::. .:. :::::..:: . :: .:::::::::::
CCDS34 FNEDSGDYPLIAPGPSWKKFQGSFCEFVRTLVCQCQYSLLYDGFPMDDLISLLTGLSDSQ
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          220       230       240       250       260       270    
pF1KB0 VRAFRHTSTLAAMKLMTALVNVALNLSIHQDNTQRQYEAERNKMIGKRANERLELLLQKR
       :::::::::::::::::.::.:::.::.::::.::::::::::  :.:: :::: ::.::
CCDS34 VRAFRHTSTLAAMKLMTSLVKVALQLSVHQDNNQRQYEAERNKGPGQRAPERLESLLEKR
       230       240       250       260       270       280       

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pF1KB0 KELQENQDEIENMMNSIFKGIFVHRYRDAIAEIRAICIEEIGVWMKMYSDAFLNDSYLKY
       :::::.:.:::.:::..:.:.:::::::.. ::::::::::: ::. :: .::.::::::
CCDS34 KELQEHQEEIEGMMNALFRGVFVHRYRDVLPEIRAICIEEIGCWMQSYSTSFLTDSYLKY
       290       300       310       320       330       340       

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pF1KB0 VGWTLHDRQGEVRLKCLKALQSLYTNRELFPKLELFTNRFKDRIVSMTLDKEYDVAVEAI
       .::::::.. ::::::.:::..:: ::.:  .:::::.:::::.:::..:.::::::::.
CCDS34 IGWTLHDKHREVRLKCVKALKGLYGNRDLTTRLELFTSRFKDRMVSMVMDREYDVAVEAV
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pF1KB0 RLVTLILHGSEEALSNEDCENVYHLVYSAHRPVAVAAGEFLHKKLFSRHDPQAE-EALAK
       ::. :::.. : .:.. :::.:: .::..:: .: ::::::. :::    :. : . .. 
CCDS34 RLLILILKNMEGVLTDADCESVYPVVYASHRGLASAAGEFLYWKLFY---PECEIRMMGG
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pF1KB0 RRGRNSPNGN--LIRMLVLFFLESELHEHAAYLVDSLWESSQELLKDWECMTELLLEEPV
       :. :.::...  ....:. ::.:::::.::::::::::. .   ::::: .: ::::.  
CCDS34 REQRQSPGAQRTFFQLLLSFFVESELHDHAAYLVDSLWDCAGARLKDWEGLTSLLLEK--
          470       480       490       500       510       520    

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pF1KB0 QGEEAMSDRQESALIELMVCTIRQAAEAHPPVGRGTGKRVLTAKERKTQIDDRNKLTEHF
         .. ..: :::.:::..: . :::.:.:::::: ::.. ::.:::::: ::: :::::.
CCDS34 --DQNLGDVQESTLIEILVSSARQASEGHPPVGRVTGRKGLTSKERKTQADDRVKLTEHL
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pF1KB0 IITLPMLLSKYSADAEKVANLLQIPQYFDLEIYSTGRMEKHLDALLKQIKFVVEKHVESD
       :  ::.::.:.:::::::. :::. . :::.:: :::.::::. .:.:.. :: ::.:  
CCDS34 IPLLPQLLAKFSADAEKVTPLLQLLSCFDLHIYCTGRLEKHLELFLQQLQEVVVKHAEPA
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pF1KB0 VLEACSKTYSILCSEEYTIQNRVDIARSQLIDEFVDRFNHSVEDLLQEGEEADDDDIYNV
       :::: ...  .::. :.:. .:.:.:::::.: ..:::.. .:.::: .   :.:..::.
CCDS34 VLEAGAHALYLLCNPEFTFFSRADFARSQLVDLLTDRFQQELEELLQSSF-LDEDEVYNL
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pF1KB0 LSTLKRLTSFHNAHDLTKWDLFGNCYRLLKTGIEHGAMPEQIVVQALQCSHYSILWQLVK
        .:::::..:.:.::::.:.:.  : .::. ... : .:.:... ::   ..:::: :..
CCDS34 AATLKRLSAFYNTHDLTRWELYEPCCQLLQKAVDTGEVPHQVILPALTLVYFSILWTLTH
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pF1KB0 ITDGSPSKEDLLVLRKTVKSFLAVCQQCLSNVNTPVKEQAFMLLCDLLMIFSHQLMTGGR
       :. .. :...:  ::  . .:  .::.:::.:.: ..::::.:: :::.::: :...:::
CCDS34 ISKSDASQKQLSSLRDRMVAFCELCQSCLSDVDTEIQEQAFVLLSDLLLIFSPQMIVGGR
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pF1KB0 EGLQPLVFNPDTGLQSELLSFVMDHVFIDQDEENQSMEGDEEDEANKIEALHKRRNLLAA
       . :.:::: :.. ::::: ::.::::::.  . ..   :: ...  .:: ::.:: :::.
CCDS34 DFLRPLVFFPEATLQSELASFLMDHVFIQPGDLGS---GDSQEDHLQIERLHQRRRLLAG
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pF1KB0 FSKLIIYDIVDMHAAADIFKHYMKYYNDYGDIIKETLSKTRQIDKIQCAKTLILSLQQLF
       : ::..: ...: ::.:.:::: :.::::::::::::...::::. .:.. :.:::.::.
CCDS34 FCKLLLYGVLEMDAASDVFKHYNKFYNDYGDIIKETLTRARQIDRSHCSRILLLSLKQLY
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pF1KB0 NELVQEQGPN-LDRTSAHVSGIKELARRFALTFGLDQIKTREAVATLHKDGIEFAFKYQN
       .::.::.::. :..  : .  ...:::::::.:: .:...:. :. :::.::.:...   
CCDS34 TELLQEHGPQGLNELPAFIE-MRDLARRFALSFGPQQLQNRDLVVMLHKEGIQFSLSELP
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pF1KB0 QKGQEYPPPNLAFLEVLSEFSSKLLRQDKKTVHSYLEKFLTEQMMERREDVWLPLISYRN
         :.   ::::::::.::::: .:..:::. . ::::: : ... .     : :. .: .
CCDS34 PAGSSNQPPNLAFLELLSEFSPRLFHQDKQLLLSYLEKCL-QHVSQAPGHPWGPVTTYCH
        1000      1010      1020      1030       1040      1050    

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pF1KB0 SLVTGGEDDRMSVNSGSSSSKT-SSVRNKKGRPPLHKKRVEDESLDNTWLNRTDTMIQTP
       ::           :.. .: ..  : . .. . : . .: :: :      .  .  .:  
CCDS34 SLSP-------VENTAETSPQVLPSSKRRRVEGPAKPNR-EDVS------SSQEESLQLN
                1060      1070      1080       1090            1100

    1110      1120      1130      1140      1150          1160     
pF1KB0 GPLPAPQLTSTVLRENSRPMGDQIQEPESEHGSEPDFLHNPQMQIS----WLGQPKLEDL
       .  :.: ::::... . .:.   ..: : : ::: :: ..  .  .    .::   ..  
CCDS34 SIPPTPTLTSTAVK-SRQPLWG-LKEMEEEDGSELDFAQGQPVAGTERSRFLGPQYFQTP
             1110       1120       1130      1140      1150        

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pF1KB0 NRKDRTGMNYMKVRTGVRHAVRGLMEEDAEPIFEDVMMSSRSQLEDMNEEFEDTMVIDLP
       .  .  :.. . .: .       ::::: :   :.. ....:     ::: .::   :. 
CCDS34 HNPSGPGLGNQLMRLS-------LMEEDEE---EELEIQDES-----NEERQDT---DMQ
     1160      1170             1180         1190              1200

        1230      1240       1250        
pF1KB0 PSRNRRERAELRPDFFDSAAI-IEDDSGFGMPMF
        : .    .:   :..::. . :::         
CCDS34 AS-SYSSTSERGLDLLDSTELDIEDF        
              1210      1220             

>>CCDS75642.1 STAG3 gene_id:10734|Hs108|chr7              (1226 aa)
 initn: 3052 init1: 1837 opt: 3660  Z-score: 3735.3  bits: 703.3 E(32554): 9.8e-202
Smith-Waterman score: 3756; 48.9% identity (75.5% similar) in 1264 aa overlap (3-1249:23-1225)

                                   10        20              30    
pF1KB0                     MITSELPVLQDSTNETTAHS------DAGSELEETEVKGK
                             .. ::  . ..:.:.  .      :  ...:..  .. 
CCDS75 MSSPLQRAVGDTKRALSASSSSSASLPFDDRDSNHTSEGNGDSLLADEDTDFEDSLNRNV
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pF1KB0 RKRGRPGRPPSTNKKPRKSPGEKSRIEAGIRGAGRGRANGHPQQNGEGEPVTLFEVVKLG
       .::.   :::.:.    : : . ::.           .. : ....:     ::..:: .
CCDS75 KKRAAK-RPPKTTPVA-KHPKKGSRV-----------VHRHSRKQSEPPANDLFNAVKAA
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pF1KB0 KSAMQSVVDDWIESYKQDRDIALLDLINFFIQCSGCRGTVRIEMFRNMQNAEIIRKMTEE
       :: :::.::.:..:::::.: ..:.:.:::::  ::.: :  :::..:.:.:::...::.
CCDS75 KSDMQSLVDEWLDSYKQDQDAGFLELVNFFIQSCGCKGIVTPEMFKKMSNSEIIQHLTEQ
       110       120       130       140       150       160       

          160       170       180       190       200       210    
pF1KB0 FDEDSGDYPLTMPGPQWKKFRSNFCEFIGVLIRQCQYSIIYDEYMMDTVISLLTGLSDSQ
       :.::::::::  :::.::::...::::. .:. :::::..:: . :: .:::::::::::
CCDS75 FNEDSGDYPLIAPGPSWKKFQGSFCEFVRTLVCQCQYSLLYDGFPMDDLISLLTGLSDSQ
       170       180       190       200       210       220       

          220       230       240       250       260       270    
pF1KB0 VRAFRHTSTLAAMKLMTALVNVALNLSIHQDNTQRQYEAERNKMIGKRANERLELLLQKR
       :::::::::::::::::.::.:::.::.::::.::::::::::  :.:: :::: ::.::
CCDS75 VRAFRHTSTLAAMKLMTSLVKVALQLSVHQDNNQRQYEAERNKGPGQRAPERLESLLEKR
       230       240       250       260       270       280       

          280       290       300       310       320       330    
pF1KB0 KELQENQDEIENMMNSIFKGIFVHRYRDAIAEIRAICIEEIGVWMKMYSDAFLNDSYLKY
       :::::.:.:::.:::..:.:.:::::::.. ::::::::::: ::. :: .::.::::::
CCDS75 KELQEHQEEIEGMMNALFRGVFVHRYRDVLPEIRAICIEEIGCWMQSYSTSFLTDSYLKY
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pF1KB0 VGWTLHDRQGEVRLKCLKALQSLYTNRELFPKLELFTNRFKDRIVSMTLDKEYDVAVEAI
       .::::::.. ::::::.:::..:: ::.:  .:::::.:::::.:::..:.::::::::.
CCDS75 IGWTLHDKHREVRLKCVKALKGLYGNRDLTTRLELFTSRFKDRMVSMVMDREYDVAVEAV
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pF1KB0 RLVTLILHGSEEALSNEDCENVYHLVYSAHRPVAVAAGEFLHKKLFSRHDPQAE-EALAK
       ::. :::.. : .:.. :::.:: .::..:: .: ::::::. :::    :. : . .. 
CCDS75 RLLILILKNMEGVLTDADCESVYPVVYASHRGLASAAGEFLYWKLFY---PECEIRMMGG
       410       420       430       440       450          460    

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pF1KB0 RRGRNSPNGN--LIRMLVLFFLESELHEHAAYLVDSLWESSQELLKDWECMTELLLEEPV
       :. :.::...  ....:. ::.:::::.::::::::::. .   ::::: .: ::::.  
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         .. ..: :::.:::..: . :::.:.:::::: ::.. ::.:::::: ::: :::::.
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       :  ::.::.:.:::::::. :::. . :::.:: :::.::::. .:.:.. :: ::.:  
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       :::: ...  .::. :.:. .:.:.:::::.: ..:::.. .:.::: .   :.:..::.
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        .:::::..:.:.::::.:.:.  : .::. ... : .:.:... ::   ..:::: :..
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       : ::..: ...: ::.:.:::: :.::::::::::::...::::. .:.. :.:::.::.
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       .::.::.::. :..  : .  ...:::::::.:: .:...:. :. :::.::.:...   
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         :.   ::::::::.::::: .:..:::. . ::::: : ... .     : :. .: .
CCDS75 PAGSSNQPPNLAFLELLSEFSPRLFHQDKQLLLSYLEKCL-QHVSQAPGHPWGPVTTYCH
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pF1KB0 SLVTGGEDDRMSVNSGSSSSKT-SSVRNKKGRPPLHKKRVEDESLDNTWLNRTDTMIQTP
       ::           :.. .: ..  : . .. . : . .: :: :      .  .  .:  
CCDS75 SLSP-------VENTAETSPQVLPSSKRRRVEGPAKPNR-EDVS------SSQEESLQLN
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       .  :.: ::::... . .:.   ..: : : ::: :: .. :      .  .::   .. 
CCDS75 SIPPTPTLTSTAVK-SRQPLWG-LKEMEEEDGSELDFAQGSQPVAGTERSRFLGPQYFQT
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CCDS75 QAS-SYSSTSERGLDLLDSTELDIEDF        
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CCDS64 DTEIQEQAFVLLSDLLLIFSPQMIVGGRDFLRPLVFFPEATLQSELASFLMDHVFIQPGD
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CCDS64 IKETLTRARQIDRSHCSRILLLSLKQLYTELLQEHGPQGLNELPAFIE-MRDLARRFALS
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CCDS64 FGPQQLQNRDLVVMLHKEGIQFSLSELPPAGSSNQPPNLAFLELLSEFSPRLFHQDKQLL
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CCDS64 LSYLEKCL-QHVSQAPGHPWGPVTTYCHSLSP------VENTAETSPQVLPSSKRRRVEG
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CCDS64 PAKPNR-EDVS------SSQEESLQLNSIPPTPTLTSTAVK-SRQPLWG-LKEMEEEDGS
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pF1KB0 EPDFLHNPQMQIS----WLGQPKLEDLNRKDRTGMNYMKVRTGVRHAVRGLMEEDAEPIF
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CCDS64 ELDFAQGQPVAGTERSRFLGPQYFQTPHNPSGPGLGNQLMRLS-------LMEEDEE---
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pF1KB0 EDVMMSSRSQLEDMNEEFEDTMVIDLPPSRNRRERAELRPDFFDSAAI-IEDDSGFGMPM
       :.. ....:     ::: .::   :.  : .    .:   :..::. . :::        
CCDS64 EELEIQDES-----NEERQDT---DMQAS-SYSSTSERGLDLLDSTELDIEDF       
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pF1KB0 F




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