Result of FASTA (ccds) for pF1KB0019
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB0019, 2843 aa
  1>>>pF1KB0019 2843 - 2843 aa - 2843 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.4876+/-0.00124; mu= -6.0622+/- 0.075
 mean_var=341.0481+/-69.820, 0's: 0 Z-trim(111.2): 27  B-trim: 0 in 0/54
 Lambda= 0.069449
 statistics sampled from 12183 (12194) to 12183 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.672), E-opt: 0.2 (0.375), width:  16
 Scan time: 10.730

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS4107.1 APC gene_id:324|Hs108|chr5              (2843) 18537 1873.1       0
CCDS12068.1 APC2 gene_id:10297|Hs108|chr19         (2303) 2327 249.0 2.4e-64


>>CCDS4107.1 APC gene_id:324|Hs108|chr5                   (2843 aa)
 initn: 18537 init1: 18537 opt: 18537  Z-score: 10044.8  bits: 1873.1 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 18537; 100.0% identity (100.0% similar) in 2843 aa overlap (1-2843:1-2843)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB0 MAAASYDQLLKQVEALKMENSNLRQELEDNSNHLTKLETEASNMKEVLKQLQGSIEDEAM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MAAASYDQLLKQVEALKMENSNLRQELEDNSNHLTKLETEASNMKEVLKQLQGSIEDEAM
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB0 ASSGQIDLLERLKELNLDSSNFPGVKLRSKMSLRSYGSREGSVSSRSGECSPVPMGSFPR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ASSGQIDLLERLKELNLDSSNFPGVKLRSKMSLRSYGSREGSVSSRSGECSPVPMGSFPR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB0 RGFVNGSRESTGYLEELEKERSLLLADLDKEEKEKDWYYAQLQNLTKRIDSLPLTENFSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 RGFVNGSRESTGYLEELEKERSLLLADLDKEEKEKDWYYAQLQNLTKRIDSLPLTENFSL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB0 QTDMTRRQLEYEARQIRVAMEEQLGTCQDMEKRAQRRIARIQQIEKDILRIRQLLQSQAT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 QTDMTRRQLEYEARQIRVAMEEQLGTCQDMEKRAQRRIARIQQIEKDILRIRQLLQSQAT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB0 EAERSSQNKHETGSHDAERQNEGQGVGEINMATSGNGQGSTTRMDHETASVLSSSSTHSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EAERSSQNKHETGSHDAERQNEGQGVGEINMATSGNGQGSTTRMDHETASVLSSSSTHSA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB0 PRRLTSHLGTKVEMVYSLLSMLGTHDKDDMSRTLLAMSSSQDSCISMRQSGCLPLLIQLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PRRLTSHLGTKVEMVYSLLSMLGTHDKDDMSRTLLAMSSSQDSCISMRQSGCLPLLIQLL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB0 HGNDKDSVLLGNSRGSKEARARASAALHNIIHSQPDDKRGRREIRVLHLLEQIRAYCETC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 HGNDKDSVLLGNSRGSKEARARASAALHNIIHSQPDDKRGRREIRVLHLLEQIRAYCETC
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB0 WEWQEAHEPGMDQDKNPMPAPVEHQICPAVCVLMKLSFDEEHRHAMNELGGLQAIAELLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 WEWQEAHEPGMDQDKNPMPAPVEHQICPAVCVLMKLSFDEEHRHAMNELGGLQAIAELLQ
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB0 VDCEMYGLTNDHYSITLRRYAGMALTNLTFGDVANKATLCSMKGCMRALVAQLKSESEDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 VDCEMYGLTNDHYSITLRRYAGMALTNLTFGDVANKATLCSMKGCMRALVAQLKSESEDL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB0 QQVIASVLRNLSWRADVNSKKTLREVGSVKALMECALEVKKESTLKSVLSALWNLSAHCT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 QQVIASVLRNLSWRADVNSKKTLREVGSVKALMECALEVKKESTLKSVLSALWNLSAHCT
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB0 ENKADICAVDGALAFLVGTLTYRSQTNTLAIIESGGGILRNVSSLIATNEDHRQILRENN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ENKADICAVDGALAFLVGTLTYRSQTNTLAIIESGGGILRNVSSLIATNEDHRQILRENN
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB0 CLQTLLQHLKSHSLTIVSNACGTLWNLSARNPKDQEALWDMGAVSMLKNLIHSKHKMIAM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 CLQTLLQHLKSHSLTIVSNACGTLWNLSARNPKDQEALWDMGAVSMLKNLIHSKHKMIAM
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB0 GSAAALRNLMANRPAKYKDANIMSPGSSLPSLHVRKQKALEAELDAQHLSETFDNIDNLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GSAAALRNLMANRPAKYKDANIMSPGSSLPSLHVRKQKALEAELDAQHLSETFDNIDNLS
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB0 PKASHRSKQRHKQSLYGDYVFDTNRHDDNRSDNFNTGNMTVLSPYLNTTVLPSSSSSRGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PKASHRSKQRHKQSLYGDYVFDTNRHDDNRSDNFNTGNMTVLSPYLNTTVLPSSSSSRGS
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB0 LDSSRSEKDRSLERERGIGLGNYHPATENPGTSSKRGLQISTTAAQIAKVMEEVSAIHTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LDSSRSEKDRSLERERGIGLGNYHPATENPGTSSKRGLQISTTAAQIAKVMEEVSAIHTS
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB0 QEDRSSGSTTELHCVTDERNALRRSSAAHTHSNTYNFTKSENSNRTCSMPYAKLEYKRSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 QEDRSSGSTTELHCVTDERNALRRSSAAHTHSNTYNFTKSENSNRTCSMPYAKLEYKRSS
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KB0 NDSLNSVSSSDGYGKRGQMKPSIESYSEDDESKFCSYGQYPADLAHKIHSANHMDDNDGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 NDSLNSVSSSDGYGKRGQMKPSIESYSEDDESKFCSYGQYPADLAHKIHSANHMDDNDGE
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KB0 LDTPINYSLKYSDEQLNSGRQSPSQNERWARPKHIIEDEIKQSEQRQSRNQSTTYPVYTE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LDTPINYSLKYSDEQLNSGRQSPSQNERWARPKHIIEDEIKQSEQRQSRNQSTTYPVYTE
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KB0 STDDKHLKFQPHFGQQECVSPYRSRGANGSETNRVGSNHGINQNVSQSLCQEDDYEDDKP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 STDDKHLKFQPHFGQQECVSPYRSRGANGSETNRVGSNHGINQNVSQSLCQEDDYEDDKP
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KB0 TNYSERYSEEEQHEEEERPTNYSIKYNEEKRHVDQPIDYSLKYATDIPSSQKQSFSFSKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 TNYSERYSEEEQHEEEERPTNYSIKYNEEKRHVDQPIDYSLKYATDIPSSQKQSFSFSKS
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KB0 SSGQSSKTEHMSSSSENTSTPSSNAKRQNQLHPSSAQSRSGQPQKAATCKVSSINQETIQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SSGQSSKTEHMSSSSENTSTPSSNAKRQNQLHPSSAQSRSGQPQKAATCKVSSINQETIQ
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KB0 TYCVEDTPICFSRCSSLSSLSSAEDEIGCNQTTQEADSANTLQIAEIKEKIGTRSAEDPV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 TYCVEDTPICFSRCSSLSSLSSAEDEIGCNQTTQEADSANTLQIAEIKEKIGTRSAEDPV
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KB0 SEVPAVSQHPRTKSSRLQGSSLSSESARHKAVEFSSGAKSPSKSGAQTPKSPPEHYVQET
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SEVPAVSQHPRTKSSRLQGSSLSSESARHKAVEFSSGAKSPSKSGAQTPKSPPEHYVQET
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KB0 PLMFSRCTSVSSLDSFESRSIASSVQSEPCSGMVSGIISPSDLPDSPGQTMPPSRSKTPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PLMFSRCTSVSSLDSFESRSIASSVQSEPCSGMVSGIISPSDLPDSPGQTMPPSRSKTPP
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KB0 PPPQTAQTKREVPKNKAPTAEKRESGPKQAAVNAAVQRVQVLPDADTLLHFATESTPDGF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PPPQTAQTKREVPKNKAPTAEKRESGPKQAAVNAAVQRVQVLPDADTLLHFATESTPDGF
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1510      1520      1530      1540      1550      1560
pF1KB0 SCSSSLSALSLDEPFIQKDVELRIMPPVQENDNGNETESEQPKESNENQEKEAEKTIDSE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SCSSSLSALSLDEPFIQKDVELRIMPPVQENDNGNETESEQPKESNENQEKEAEKTIDSE
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

             1570      1580      1590      1600      1610      1620
pF1KB0 KDLLDDSDDDDIEILEECIISAMPTKSSRKAKKPAQTASKLPPPVARKPSQLPVYKLLPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 KDLLDDSDDDDIEILEECIISAMPTKSSRKAKKPAQTASKLPPPVARKPSQLPVYKLLPS
             1570      1580      1590      1600      1610      1620

             1630      1640      1650      1660      1670      1680
pF1KB0 QNRLQPQKHVSFTPGDDMPRVYCVEGTPINFSTATSLSDLTIESPPNELAAGEGVRGGAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 QNRLQPQKHVSFTPGDDMPRVYCVEGTPINFSTATSLSDLTIESPPNELAAGEGVRGGAQ
             1630      1640      1650      1660      1670      1680

             1690      1700      1710      1720      1730      1740
pF1KB0 SGEFEKRDTIPTEGRSTDEAQGGKTSSVTIPELDDNKAEEGDILAECINSAMPKGKSHKP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SGEFEKRDTIPTEGRSTDEAQGGKTSSVTIPELDDNKAEEGDILAECINSAMPKGKSHKP
             1690      1700      1710      1720      1730      1740

             1750      1760      1770      1780      1790      1800
pF1KB0 FRVKKIMDQVQQASASSSAPNKNQLDGKKKKPTSPVKPIPQNTEYRTRVRKNADSKNNLN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 FRVKKIMDQVQQASASSSAPNKNQLDGKKKKPTSPVKPIPQNTEYRTRVRKNADSKNNLN
             1750      1760      1770      1780      1790      1800

             1810      1820      1830      1840      1850      1860
pF1KB0 AERVFSDNKDSKKQNLKNNSKVFNDKLPNNEDRVRGSFAFDSPHHYTPIEGTPYCFSRND
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 AERVFSDNKDSKKQNLKNNSKVFNDKLPNNEDRVRGSFAFDSPHHYTPIEGTPYCFSRND
             1810      1820      1830      1840      1850      1860

             1870      1880      1890      1900      1910      1920
pF1KB0 SLSSLDFDDDDVDLSREKAELRKAKENKESEAKVTSHTELTSNQQSANKTQAIAKQPINR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SLSSLDFDDDDVDLSREKAELRKAKENKESEAKVTSHTELTSNQQSANKTQAIAKQPINR
             1870      1880      1890      1900      1910      1920

             1930      1940      1950      1960      1970      1980
pF1KB0 GQPKPILQKQSTFPQSSKDIPDRGAATDEKLQNFAIENTPVCFSHNSSLSSLSDIDQENN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GQPKPILQKQSTFPQSSKDIPDRGAATDEKLQNFAIENTPVCFSHNSSLSSLSDIDQENN
             1930      1940      1950      1960      1970      1980

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CCDS41 NKENEPIKETEPPDSQGEPSKPQASGYAPKSFHVEDTPVCFSRNSSLSSLSIDSEDDLLQ
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CCDS41 SNKGPRILKPGEKSTLETKKIESESKGIKGGKKVYKSLITGKVRSNSEISGQMKQPLQAN
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CCDS41 MPSISRGRTMIHIPGVRNSSSSTSPVSKKGPPLKTPASKSPSEGQTATTSPRGAKPSVKS
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CCDS41 KLSQLPRTSSPSTASTKSSGSGKMSYTSPGRQMSQQNLTKQTGLSKNASSIPRSESASKG
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LNQMNNGNGANKKVELSRMSSTKSSGSESDRSERPVLVRQSTFIKEAPSPTLRRKLEESA
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CCDS41 SFESLSPSSRPASPTRSQAQTPVLSPSLPDMSLSTHSSVQAGGWRKLPPNLSPTIEYNDG
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CCDS41 RPAKRHDIARSHSESPSRLPINRSGTWKREHSKHSSSLPRVSTWRRTGSSSSILSASSES
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CCDS41 SEKAKSEDEKHVNSISGTKQSKENQVSAKGTWRKIKENEFSPTNSTSQTVSSGATNGAES
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 KTLIYQMAPAVSKTEDVWVRIEDCPINNPRSGRSPTGNTPPVIDSVSEKANPNIKDSKDN
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 QAKQNVGNGSVPMRTVGLENRLNSFIQVDAPDQKGTEIKPGQNNPVPVSETNESSIVERT
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PFSSSSSSKHSSPSGTVAARVTPFNYNPSPRKSSADSTSARPSQIPTPVNNNTKKRDSKT
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       :::::::::::::::::::::::
CCDS41 DSTESSGTQSPKRHSGSYLVTSV
             2830      2840   

>>CCDS12068.1 APC2 gene_id:10297|Hs108|chr19              (2303 aa)
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pF1KB0   MAAASYDQLLKQVEALKMENSNLRQELEDNSNHLTKLETEASNMKEVLKQLQGSIEDE
          ..: :.::..:::::: :::.:::::.:::.::.:::::.:.::::::.:::..:.:
CCDS12 MASSVAPYEQLVRQVEALKAENSHLRQELRDNSSHLSKLETETSGMKEVLKHLQGKLEQE
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       :  ..:::: ..::.:: :..: ... ..:..      . : .    ..:. : :::  :
CCDS12 ARVLVSSGQTEVLEQLKALQMDITSLYNLKFQPP----TLGPEP---AARTPEGSPV-HG
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       : : . .: . :: .   ::::..:: .:: ...:::::: :::.:::.:.::.: :: .
CCDS12 SGPSKDSFGELSRATIRLLEELDRERCFLLNEIEKEEKEKLWYYSQLQGLSKRLDELPHV
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       :. ::.: :. :.:::.::..::  :::..:: ..: .::: : .:..::.:..:     
CCDS12 ETQFSMQMDLIRQQLEFEAQHIRSLMEERFGTSDEMVQRAQIRASRLEQIDKELL-----
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pF1KB0 LQSQATEAERSSQNKHETGSHDAERQNEGQGVGEINMATSGNGQGSTTRMDHETASVLSS
             ::.            :  .:.: :..  ..          .. .:..  . . .
CCDS12 ------EAQ------------DRVQQTEPQALLAVK----------SVPVDEDPETEVPT
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           ..:.  .:    :::.:. :::::.:.:..: .::::::::: .::..::.:::::
CCDS12 HPEDGTPQPGNS----KVEVVFWLLSMLATRDQEDTARTLLAMSSSPESCVAMRRSGCLP
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pF1KB0 LLIQLLHGNDKDS---VLLGNSRGSKEARARASAALHNIIHSQPDDKRGRREIRVLHLLE
       ::.:.:::..  .   .   .. :.:.:: ::.::::::. ::::.  .:.:.::::.::
CCDS12 LLLQILHGTEAAAGGRAGAPGAPGAKDARMRANAALHNIVFSQPDQGLARKEMRVLHVLE
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pF1KB0 QIRAYCETCWEWQEAHEPGMDQD-KNPMPAPVEHQICPAVCVLMKLSFDEEHRHAMNELG
       ::::::::::.: .:.. : .    .  : :.: ::: :.:..::::::::.:.::::::
CCDS12 QIRAYCETCWDWLQARDGGPEGGGAGSAPIPIEPQICQATCAVMKLSFDEEYRRAMNELG
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       ::::.::::::: ::. .: :  ...:::::::.::::::::::::::::. .:::.:.:
CCDS12 GLQAVAELLQVDYEMHKMTRDPLNLALRRYAGMTLTNLTFGDVANKATLCARRGCMEAIV
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       ::: :.::.:.::..:.:::::::::.::::.:::.::: ::..:.:.. ::::::::::
CCDS12 AQLASDSEELHQVVSSILRNLSWRADINSKKVLREAGSVTALVQCVLRATKESTLKSVLS
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pF1KB0 ALWNLSAHCTENKADICAVDGALAFLVGTLTYRSQTNTLAIIESGGGILRNVSSLIATNE
       :::::::: ::::: :: :::::.:::.::::. :.:.:::::::::::::::::.:: :
CCDS12 ALWNLSAHSTENKAAICQVDGALGFLVSTLTYKCQSNSLAIIESGGGILRNVSSLVATRE
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pF1KB0 DHRQILRENNCLQTLLQHLKSHSLTIVSNACGTLWNLSARNPKDQEALWDMGAVSMLKNL
       :.::.::..:::::::::: ::::::::::::::::::::. .::: :::.:::.::.::
CCDS12 DYRQVLRDHNCLQTLLQHLTSHSLTIVSNACGTLWNLSARSARDQELLWDLGAVGMLRNL
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pF1KB0 IHSKHKMIAMGSAAALRNLMANRPAKYKDA-NIMSPGSSLPSLHVRKQKALEAELDAQHL
       .::::::::::::::::::.:.::::.. : . .:::: .:::.::::.::::::::.::
CCDS12 VHSKHKMIAMGSAAALRNLLAHRPAKHQAAATAVSPGSCVPSLYVRKQRALEAELDARHL
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pF1KB0 SETFDNIDNLSPKASHRSKQ------RHKQSLYGDYVFDTNRHDDNRSDNFNTGNMTVLS
       ......... .: :.. . .      :: ..:  ::. :..  ::. . .    .... .
CCDS12 AQALEHLEKQGPPAAEAATKKPLPPLRHLDGLAQDYASDSGCFDDDDAPS----SLAAAA
         740       750       760       770       780           790 

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pF1KB0 PYLNTTVLPSSSSSRGSLDSSRSEKDRSLERERGIGLGNYHPATENPG---TSSKRGLQI
           .:  :.: .. . . .:   . ..: :      :. .   .. :   ...:   ..
CCDS12 ----ATGEPASPAALSLFLGSPFLQGQALARTPPTRRGGKEAEKDTSGEAAVAAKAKAKL
                 800       810       820       830       840       

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pF1KB0 STTAAQIAKVMEEVSAIHTSQEDRSSGSTTELHCVTDERNALRRSSAAHTHSNTYNFT--
       . ..:.: ...:..::.:::..:  : :.       :  .   : . :.. :   .    
CCDS12 ALAVARIDQLVEDISALHTSSDDSFSLSSG------DPGQEAPREGRAQSCSPCRGPEGG
       850       860       870             880       890       900 

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pF1KB0 KSENSNRTCSMPYAKLEYKRSSNDSLNSVSSSDGYGKRGQMKPSIESYSEDDESKFCSYG
       . : ..:.  .   :  .   ::::::: :.::::  : .: :             :   
CCDS12 RREAGSRAHPLLRLKAAHASLSNDSLNSGSASDGYCPREHMLP-------------C---
             910       920       930       940                     

     1000      1010      1020      1030      1040      1050        
pF1KB0 QYPADLAHKIHSANHMDDNDGELDTPINYSLKYSDEQLNSGRQSPSQNERWARPKHIIED
                                :.          : : :..:               
CCDS12 -------------------------PLA--------ALASRREDP---------------
                                          950                      

     1060      1070      1080      1090      1100      1110        
pF1KB0 EIKQSEQRQSRNQSTTYPVYTESTDDKHLKFQPHFGQQECVSPYRSRGANGSETNRVGSN
                                             .: .:  ::             
CCDS12 --------------------------------------RCGQPRPSR-------------
                                             960                   

     1120      1130      1140      1150      1160      1170        
pF1KB0 HGINQNVSQSLCQEDDYEDDKPTNYSERYSEEEQHEEEERPTNYSIKYNEEKRHVDQPID
            ...   :: .      :.       :  . . . :    .:: .   .::  :. 
CCDS12 ----LDLDLPGCQAE-----PPAR------EATSADARVR----TIKLSPTYQHV--PL-
            970            980             990          1000       

     1180      1190      1200      1210      1220        1230      
pF1KB0 YSLKYATDIPSSQKQSFSFSKSSSGQSSKTEHMSSSSENTSTP--SSNAKRQNQLHPSSA
         :. :               : .:           .:  . :  : .:..:  : :.. 
CCDS12 --LEGA---------------SRAG-----------AEPLAGPGISPGARKQAWL-PADH
                          1010                 1020      1030      

       1240      1250      1260      1270      1280      1290      
pF1KB0 QSRSGQPQKAATCKVSSINQETIQTYCVEDTPICFSRCSSLSSLSSAEDEIGCNQTTQEA
        :.   :.: :.  .: . ....:   ... :. .::::::::::::  . : ..  .  
CCDS12 LSKV--PEKLAAAPLS-VASKALQKLAAQEGPLSLSRCSSLSSLSSA-GRPGPSEGGDLD
          1040       1050      1060      1070       1080      1090 

       1300      1310       1320      1330        1340      1350   
pF1KB0 DSANTLQIAEIKEKIGTRSAE-DPVSEVPAVSQHPRTKSS--RLQGSSLSSESARHKAVE
       :: ..:   :  :. :   :: : . ..:.... : .  .  : .: .:. :.:      
CCDS12 DSDSSL---EGLEEAGPSEAELDSTWRAPGATSLPVAIPAPRRNRGRGLGVEDA------
               1100      1110      1120      1130      1140        

          1360      1370      1380      1390      1400      1410   
pF1KB0 FSSGAKSPSKSGAQTPKSPPEHYVQETPLMFSRCTSVSSLDSFESRSIASSVQSEPCSGM
                     ::.:  :.:::::::..:::.::::: :::: :::::. ::::::.
CCDS12 --------------TPSSSSENYVQETPLVLSRCSSVSSLGSFESPSIASSIPSEPCSGQ
                         1150      1160      1170      1180        

          1420      1430      1440        1450      1460      1470 
pF1KB0 VSGIISPSDLPDSPGQTMPPSRSKTPP--PPPQTAQTKREVPKNKAPTAEKRESGPKQAA
        :: ::::.::::::::::::::::::  : ::        : . .  . . ::  :.  
CCDS12 GSGTISPSELPDSPGQTMPPSRSKTPPLAPAPQG-------PPEATQFSLQWESYVKRFL
     1190      1200      1210      1220             1230      1240 

            1480         1490      1500      1510      1520        
pF1KB0 VNAAVQRVQVLP---DADTLLHFATESTPDGFSCSSSLSALSLDEPFIQKDVELRIMPPV
         :  ..   ::   :: .. .:..:.  ..:::.::::::.: : ..:.:::::..: .
CCDS12 DIADCRERCRLPSELDAGSV-RFTVEKPDENFSCASSLSALALHEHYVQQDVELRLLPSA
            1250      1260       1270      1280      1290      1300

     1530      1540      1550      1560      1570      1580        
pF1KB0 QENDNGNETESEQPKESNENQEKEAEKTIDSEKDLLDDSDDDDIEILEECIISAMPTKSS
         . .:.   .     ... .:.    : .  .     . :...:.:.::. .:.:..  
CCDS12 CPERGGGAGGAGLHFAGHRRREEGPAPTGSRPRG----AADQELELLRECLGAAVPARL-
             1310      1320      1330          1340      1350      

     1590      1600      1610      1620      1630      1640        
pF1KB0 RKAKKPAQTASKLPPPVARKPSQLPVYKLLPSQNRLQPQKHVSFTPGDDMPRVYCVEGTP
       ::      .:: : :  .:.   .::: :.:.    :          .:   .  .::::
CCDS12 RK------VASALVP--GRRALPVPVYMLVPAPAPAQ----------EDDSCTDSAEGTP
              1360        1370      1380                1390       

     1650      1660      1670      1680      1690      1700        
pF1KB0 INFSTATSLSDLTIESPPNELAAGEGVRGGAQSGEFEKRDTIPTEGRSTDEAQGGKTSSV
       .:::.:.:::: :...:: .  .: .   : :          :: :: :.  :       
CCDS12 VNFSSAASLSDETLQGPPRDQPGGPA---GRQR---------PT-GRPTSARQ-------
      1400      1410      1420                   1430              

     1710      1720      1730      1740      1750      1760        
pF1KB0 TIPELDDNKAEEGDILAECINSAMPKGKSHKPFRVKKIMDQVQQASASSSAPNKNQLDGK
                             ::  :. ::   . .  .: . :.      :.  :.  
CCDS12 ----------------------AM--GHRHKAGGAGRSAEQSRGAGK-----NRAGLELP
                              1440      1450      1460             

     1770      1780      1790      1800      1810      1820        
pF1KB0 KKKPTSPVKPIPQNTEYRTRVRKNADSKNNLNAERVFSDNKDSKKQNLKNNSKVFNDKLP
         .:  :  :              ::              ::..:              :
CCDS12 LGRP--PSAP--------------AD--------------KDGSK--------------P
     1470                                    1480                  

     1830      1840      1850      1860      1870      1880        
pF1KB0 NNEDRVRGSFAFDSPHHYTPIEGTPYCFSRNDSLSSLDFDDDDVDLSREKAELRKAKENK
       .   :.::. :..:    :: : . :::  :::                        :. 
CCDS12 G---RTRGDGALQSLCLTTPTEEAVYCFYGNDS-----------------------DEEP
            1490      1500      1510                               

     1890      1900      1910      1920      1930      1940        
pF1KB0 ESEAKVTSHTELTSNQQSANKTQAIAKQPINRGQPKPILQKQSTFPQSSKDIPDRGAATD
        . : . .:           .:.:: .  ..: .:    : ..  :  ::  :  .:   
CCDS12 PAAAPTPTHR----------RTSAIPRA-FTRERP----QGRKEAPAPSKAAP--AAPPP
     1520                1530       1540          1550        1560 

     1950       1960      1970      1980      1990      2000       
pF1KB0 EKLQ-NFAIENTPVCFSHNSSLSSLSDIDQENNNKENEPIKETEPPDSQGEPSKPQASGY
        . : ..  ..:: :.: .:: ::::         : ::   .:::  . .  .: ..  
CCDS12 ARTQPSLIADETPPCYSLSSSASSLS---------EPEP---SEPPAVHPRGREPAVT--
            1570      1580               1590         1600         

      2010      2020      2030      2040      2050       2060      
pF1KB0 APKSFHVEDTPVCFSRNSSLSSLSIDSEDDLLQECISSAMPKKKKP-SRLKGDNEKHSPR
              .:     .:.:: :     . ..:::.:::::.:... : : :.    ...::
CCDS12 -------KDPGPGGGRDSSPSP---RAAEELLQRCISSALPRRRPPVSGLR----RRKPR
             1610      1620         1630      1640          1650   

       2070      2080      2090      2100      2110      2120      
pF1KB0 NMGGILGEDLTLDLKDIQRPDSEHGLSPDSENFDWKAIQEGANSIVSSLHQAAAAACLSR
            : :  .   ..  .  .    . : .. .:.::::::::::. :::::::   .:
CCDS12 ATR--LDERPAEGSRERGEEAAGSDRASDLDSVEWRAIQEGANSIVTWLHQAAAA---TR
            1660      1670      1680      1690      1700           

       2130      2140      2150      2160      2170      2180      
pF1KB0 QASSDSDSILSLKSGISLGSPFHLTPDQEEKPFTSNKGPRILKPGEKSTLETKKIESESK
       .:::.::::::. ::.:.::   : : ...:             :...  :  . .   :
CCDS12 EASSESDSILSFVSGLSVGST--LQPPKHRK-------------GRQAEGEMGSARRPEK
     1710      1720        1730                   1740      1750   

       2190      2200       2210      2220      2230        2240   
pF1KB0 GIKGGKKVYKSLITGKVRSNS-EISGQMKQPLQANMPSISRGRTMIHIPGV--RNSSSST
         .:. .:  :   :. :: .   . .  :    ..:.. ::::.:..:.   : . ..:
CCDS12 --RGAASVKTS---GSPRSPAGPEKPRGTQKTTPGVPAVLRGRTVIYVPSPAPRAQPKGT
            1760         1770      1780      1790      1800        

              2250         2260      2270       2280      2290     
pF1KB0 -SPVS---KKGPP-LKTPAS--KSPSEGQTATTS-PRGAKPSVKSELSPVARQTSQIGGS
        .: .   : .:: :  ::.  : :: ::  . :  : :: :  . ::   :...  .  
CCDS12 PGPRATPRKVAPPCLAQPAAPAKVPSPGQQRSRSLHRPAKTSELATLSQPPRSATPPARL
     1810      1820      1830      1840      1850      1860        

        2300      2310      2320      2330      2340      2350     
pF1KB0 SKAPSRSGSRDSTPSRPAQQPLSRPIQSPGRNSISPGRNGISPPNKLSQLPRTSSPSTAS
       .:.:: :.:. :    ::.::: :      :  .. . ...  :.  : .:.: . .  .
CCDS12 AKTPSSSSSQTS----PASQPLPRK-----RPPVTQAAGALPGPGA-SPVPKTPARTLLA
     1870      1880               1890      1900       1910        

        2360      2370      2380      2390      2400      2410     
pF1KB0 TKSSGSGKMSYTSPGRQMSQQNLTKQTGLSKNASSIPRSESASKGLNQMNNGNGA-NKKV
        . .     .  :: :   .:  ... :    : ..:  : . .:    . : :: . ..
CCDS12 KQHK-----TQRSPVRIPFMQRPARR-GPPPLARAVP--EPGPRGRAGTEAGPGARGGRL
     1920           1930       1940        1950      1960      1970

         2420      2430      2440      2450      2460      2470    
pF1KB0 ELSRMSSTKSSGSESDRSERPVLVRQSTFIKEAPSPTLRRKLEESASFESLSPSSRPASP
        : :..:. ::::::  :.:  . :: :::::  :: :::.  : .: :: . . . :::
CCDS12 GLVRVASALSSGSES--SDRSGFRRQLTFIKE--SPGLRRRRSELSSAESAASAPQGASP
             1980        1990      2000        2010      2020      

         2480       2490      2500      2510      2520      2530   
pF1KB0 TRSQAQTP-VLSPSLPDMSLSTHSSVQAGGWRKLPPNLSPTIEYNDGRPAKRHDIARSHS
        :..   : :.  :     : .      .  :. ::   :.      :::.:     . :
CCDS12 RRGRPALPAVFLCSSRCEELRAAPRQGPAPARQRPPAARPS---PGERPARR-----TTS
       2030      2040      2050      2060         2070             

          2540      2550      2560      2570      2580      2590   
pF1KB0 ESPSRLPINRSGTWKREHSKHSSSLPRVSTWRRTGSSSSILSASSESSEKAKSEDEKHVN
       :::::::. :. . . :  :. .:::..:. ::  ..     ::......... . . . 
CCDS12 ESPSRLPV-RAPAARPETVKRYASLPHISVARRPDGAVPAAPASADAARRSSDGEPRPL-
     2080       2090      2100      2110      2120      2130       

          2600      2610       2620      2630      2640      2650  
pF1KB0 SISGTKQSKENQVSAKGT-WRKIKENEFSPTNSTSQTVSSGATNGAESKTLIYQMAPAVS
                  .:.: :: ::.:....      ..  ...    :.  .      .:   
CCDS12 ----------PRVAAPGTTWRRIRDEDVPHILRSTLPATALPLRGSTPEDA--PAGPPPR
                 2140      2150      2160      2170        2180    

           2660      2670      2680      2690      2700      2710  
pF1KB0 KTEDVWVRIEDCPINNPRSGRSPTGNTPPVIDSVSEKANPNIKDSKDNQAKQNVGNGSVP
       :: :. :. :.  .  :... :    : : ...    . :              ..:.. 
CCDS12 KTSDAVVQTEE--VAAPKTNSS----TSPSLETREPPGAP--------------AGGQLS
         2190        2200          2210                    2220    

           2720      2730      2740      2750      2760      2770  
pF1KB0 MRTVGLENRLNSFIQVDAPDQKGTEIKPGQNNPVPVSETNESSIVERTPFSSSSSSKHSS
       .        :.:  .::.:.          . :. .  ..:.  :    : .   :.:.:
CCDS12 L--------LGS--DVDGPSLA--------KAPISAPFVHEGLGVAVGGFPA---SRHGS
                   2230              2240      2250         2260   

           2780      2790      2800      2810      2820      2830  
pF1KB0 PSGTVAARVTPFNYNPSPRKSSADSTSARPSQIPTPVNNNTKKRDSKTDSTESSGTQSPK
       :: .  ::: :::: :::   .: . ::                                
CCDS12 PSRS--ARVPPFNYVPSPMVVAATTDSAAEKAPATASATLLE                  
            2270      2280      2290      2300                     




2843 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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