Result of FASTA (omim) for pF1KA1973
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA1973, 1115 aa
  1>>>pF1KA1973 1115 - 1115 aa - 1115 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7084+/-0.000412; mu= 16.4395+/- 0.026
 mean_var=125.4483+/-24.936, 0's: 0 Z-trim(115.6): 129  B-trim: 126 in 1/51
 Lambda= 0.114510
 statistics sampled from 25957 (26086) to 25957 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.657), E-opt: 0.2 (0.306), width:  16
 Scan time: 15.350

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_597702 (OMIM: 606650) glutamate receptor ionotr (1115) 7535 1257.1       0
XP_011516513 (OMIM: 606650) PREDICTED: glutamate r ( 925) 6288 1051.0       0
NP_619635 (OMIM: 606651) glutamate receptor ionotr (1043) 3051 516.3 3.7e-145
XP_016881732 (OMIM: 606651) PREDICTED: glutamate r ( 582) 1926 330.3 2.1e-89
NP_000823 (OMIM: 138249,614254) glutamate receptor ( 885)  929 165.7 1.1e-39
NP_001172020 (OMIM: 138249,614254) glutamate recep ( 906)  929 165.7 1.1e-39
XP_011516885 (OMIM: 138249,614254) PREDICTED: glut ( 892)  928 165.5 1.3e-39
NP_067544 (OMIM: 138249,614254) glutamate receptor ( 901)  928 165.5 1.3e-39
XP_005266128 (OMIM: 138249,614254) PREDICTED: glut ( 922)  928 165.5 1.3e-39
XP_005266129 (OMIM: 138249,614254) PREDICTED: glut ( 922)  928 165.5 1.3e-39
NP_015566 (OMIM: 138249,614254) glutamate receptor ( 938)  928 165.5 1.3e-39
NP_001172019 (OMIM: 138249,614254) glutamate recep ( 943)  928 165.5 1.3e-39
XP_005266130 (OMIM: 138249,614254) PREDICTED: glut ( 959)  928 165.6 1.3e-39
XP_011525174 (OMIM: 602717,617162) PREDICTED: glut (1336)  919 164.2 4.8e-39
NP_000827 (OMIM: 602717,617162) glutamate receptor (1336)  919 164.2 4.8e-39
XP_011520763 (OMIM: 138253,245570) PREDICTED: glut (1281)  914 163.3 8.2e-39
NP_001127880 (OMIM: 138253,245570) glutamate recep (1281)  914 163.3 8.2e-39
XP_011520760 (OMIM: 138253,245570) PREDICTED: glut (1307)  914 163.3 8.4e-39
XP_016878662 (OMIM: 138253,245570) PREDICTED: glut (1333)  914 163.4 8.5e-39
NP_001127879 (OMIM: 138253,245570) glutamate recep (1464)  914 163.4 9.1e-39
NP_000824 (OMIM: 138253,245570) glutamate receptor (1464)  914 163.4 9.1e-39
XP_016878661 (OMIM: 138253,245570) PREDICTED: glut (1516)  914 163.4 9.4e-39
NP_000825 (OMIM: 138252,613970,616139) glutamate r (1484)  891 159.6 1.3e-37
XP_011518930 (OMIM: 138252,613970,616139) PREDICTE (1484)  891 159.6 1.3e-37
XP_011518931 (OMIM: 138252,613970,616139) PREDICTE (1484)  891 159.6 1.3e-37
XP_016874708 (OMIM: 138252,613970,616139) PREDICTE (1484)  891 159.6 1.3e-37
NP_001265482 (OMIM: 138254) glutamate receptor ion ( 873)  864 154.9 1.9e-36
NP_000826 (OMIM: 138254) glutamate receptor ionotr (1233)  865 155.2 2.2e-36
XP_006721908 (OMIM: 138254) PREDICTED: glutamate r (1308)  865 155.2 2.3e-36
XP_006721909 (OMIM: 138254) PREDICTED: glutamate r (1307)  864 155.1 2.6e-36
XP_011522990 (OMIM: 138254) PREDICTED: glutamate r (1316)  631 116.6   1e-24
NP_001317922 (OMIM: 138245) glutamate receptor ion ( 934)  620 114.7 2.7e-24
NP_001317923 (OMIM: 138245) glutamate receptor ion ( 949)  620 114.7 2.7e-24
NP_001307550 (OMIM: 138245) glutamate receptor ion ( 763)  605 112.1 1.3e-23
XP_005261001 (OMIM: 138245) PREDICTED: glutamate r ( 903)  605 112.2 1.5e-23
NP_783300 (OMIM: 138245) glutamate receptor ionotr ( 905)  605 112.2 1.5e-23
NP_000821 (OMIM: 138245) glutamate receptor ionotr ( 918)  605 112.2 1.5e-23
NP_001307545 (OMIM: 138245) glutamate receptor ion ( 920)  605 112.2 1.5e-23
NP_000822 (OMIM: 138243) glutamate receptor ionotr ( 919)  590 109.7 8.3e-23
NP_786944 (OMIM: 138244,611092) glutamate receptor ( 869)  585 108.9 1.4e-22
XP_011534080 (OMIM: 138244,611092) PREDICTED: glut ( 869)  585 108.9 1.4e-22
XP_005267003 (OMIM: 138244,611092) PREDICTED: glut ( 859)  582 108.4   2e-22
XP_011534079 (OMIM: 138244,611092) PREDICTED: glut ( 892)  582 108.4   2e-22
NP_001159719 (OMIM: 138244,611092) glutamate recep ( 892)  582 108.4   2e-22
XP_005267002 (OMIM: 138244,611092) PREDICTED: glut ( 908)  582 108.4 2.1e-22
NP_068775 (OMIM: 138244,611092) glutamate receptor ( 908)  582 108.4 2.1e-22
XP_011522994 (OMIM: 138254) PREDICTED: glutamate r ( 879)  541 101.6 2.2e-20
XP_005258878 (OMIM: 600283) PREDICTED: glutamate r ( 980)  541 101.6 2.4e-20
NP_002079 (OMIM: 600283) glutamate receptor ionotr ( 980)  541 101.6 2.4e-20
XP_011522991 (OMIM: 138254) PREDICTED: glutamate r (1262)  541 101.7 2.9e-20


>>NP_597702 (OMIM: 606650) glutamate receptor ionotropic  (1115 aa)
 initn: 7535 init1: 7535 opt: 7535  Z-score: 6730.0  bits: 1257.1 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 7535; 99.9% identity (100.0% similar) in 1115 aa overlap (1-1115:1-1115)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MRRLSLWWLLSRVCLLLPPPCALVLAGVPSSSSHPQPCQILKRIGHAVRVGAVHLQPWTT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_597 MRRLSLWWLLSRVCLLLPPPCALVLAGVPSSSSHPQPCQILKRIGHAVRVGAVHLQPWTT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 APRAASRAPDDSRAGAQRDEPEPGTRRSPAPSPGARWLGSTLHGRGPPGSRKPGEGARAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_597 APRAASRAPDDSRAGAQRDEPEPGTRRSPAPSPGARWLGSTLHGRGPPGSRKPGEGARAE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA1 ALWPRDALLFAVDNLNRVEGLLPYNLSLEVVMAIEAGLGDLPLLPFSSPSSPWSSDPFSF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_597 ALWPRDALLFAVDNLNRVEGLLPYNLSLEVVMAIEAGLGDLPLLPFSSPSSPWSSDPFSF
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA1 LQSVCHTVVVQGVSALLAFPQSQGEMMELDLVSLVLHIPVISIVRHEFPRESQNPLHLQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_597 LQSVCHTVVVQGVSALLAFPQSQGEMMELDLVSLVLHIPVISIVRHEFPRESQNPLHLQL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA1 SLENSLSSDADVTVSILTMNNWYNFSLLLCQEDWNITDFLLLTQNNSKFHLGSIINITAN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_597 SLENSLSSDADVTVSILTMNNWYNFSLLLCQEDWNITDFLLLTQNNSKFHLGSIINITAN
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA1 LPSTQDLLSFLQIQLESIKNSTPTVVMFGCDMESIRRIFEITTQFGVMPPELRWVLGDSQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_597 LPSTQDLLSFLQIQLESIKNSTPTVVMFGCDMESIRRIFEITTQFGVMPPELRWVLGDSQ
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA1 NVEELRTEGLPLGLIAHGKTTQSVFEHYVQDAMELVARAVATATMIQPELALIPSTMNCM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_597 NVEELRTEGLPLGLIAHGKTTQSVFEHYVQDAMELVARAVATATMIQPELALIPSTMNCM
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA1 EVETTNLTSGQYLSRFLANTTFRGLSGSIRVKGSTIVSSENNFFIWNLQHDPMGKPMWTR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_597 EVETTNLTSGQYLSRFLANTTFRGLSGSIRVKGSTIVSSENNFFIWNLQHDPMGKPMWTR
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA1 LGSWQGGKIVMDYGIWPEQAQRHKTHFQHPSKLHLRVVTLIEHPFVFTREVDDEGLCPAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_597 LGSWQGGKIVMDYGIWPEQAQRHKTHFQHPSKLHLRVVTLIEHPFVFTREVDDEGLCPAG
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA1 QLCLDPMTNDSSTLDSLFSSLHSSNDTVPIKFKKCCYGYCIDLLEKIAEDMNFDFDLYIV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_597 QLCLDPMTNDSSTLDSLFSSLHSSNDTVPIKFKKCCYGYCIDLLEKIAEDMNFDFDLYIV
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA1 GDGKYGAWKNGHWTGLVGDLLRGTAHMAVTSFSINTARSQVIDFTSPFFSTSLGILVRTR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_597 GDGKYGAWKNGHWTGLVGDLLRGTAHMAVTSFSINTARSQVIDFTSPFFSTSLGILVRTR
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA1 DTAAPIGAFMWPLHWTMWLGIFVALHITAVFLTLYEWKSPFGLTPKGRNRSKVFSFSSAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_597 DTAAPIGAFMWPLHWTMWLGIFVALHITAVFLTLYEWKSPFGLTPKGRNRSKVFSFSSAL
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KA1 NICYALLFGRTVAIKPPKCWTGRFLMNLWAIFCMFCLSTYTANLAAVMVGEKIYEELSGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_597 NICYALLFGRTVAIKPPKCWTGRFLMNLWAIFCMFCLSTYTANLAAVMVGEKIYEELSGI
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KA1 HDPKLHHPSQGFRFGTVRESSAEDYVRQSFPEMHEYMRRYNVPATPDGVEYLKNDPEKLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_597 HDPKLHHPSQGFRFGTVRESSAEDYVRQSFPEMHEYMRRYNVPATPDGVEYLKNDPEKLD
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KA1 AFIMDKALLDYEVSIDADCKLLTVGKPFAIEGYGIGLPPNSPLTANISELISQYKSHGFM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_597 AFIMDKALLDYEVSIDADCKLLTVGKPFAIEGYGIGLPPNSPLTANISELISQYKSHGFM
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KA1 DMLHDKWYRVVPCGKRSFAVTETLQMGIKHFSGLFVLLCIGFGLSILTTIGEHIVYRLLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_597 DMLHDKWYRVVPCGKRSFAVTETLQMGIKHFSGLFVLLCIGFGLSILTTIGEHIVYRLLL
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KA1 PRIKNKSKLQYWLHTSQRLHRAINTSFIEEKQQHFKTKRVEKRSNVGPRQLTVWNTSNLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_597 PRIKNKSKLQYWLHTSQRLHRAINTSFIEEKQQHFKTKRVEKRSNVGPRQLTVWNTSNLS
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KA1 HDNRRKYIFSDEEGQNQLGIQIHQDIPLPPRRRELPALRTTNGKADSLNVSRNSVMQELS
       ::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_597 HDNRRKYIFSDEEGQNQLGIRIHQDIPLPPRRRELPALRTTNGKADSLNVSRNSVMQELS
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110     
pF1KA1 ELEKQIQVIRQELQLAVSRKTELEEYQRTSRTCES
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_597 ELEKQIQVIRQELQLAVSRKTELEEYQRTSRTCES
             1090      1100      1110     

>>XP_011516513 (OMIM: 606650) PREDICTED: glutamate recep  (925 aa)
 initn: 6288 init1: 6288 opt: 6288  Z-score: 5617.8  bits: 1051.0 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 6288; 99.8% identity (99.9% similar) in 924 aa overlap (1-924:1-924)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MRRLSLWWLLSRVCLLLPPPCALVLAGVPSSSSHPQPCQILKRIGHAVRVGAVHLQPWTT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MRRLSLWWLLSRVCLLLPPPCALVLAGVPSSSSHPQPCQILKRIGHAVRVGAVHLQPWTT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 APRAASRAPDDSRAGAQRDEPEPGTRRSPAPSPGARWLGSTLHGRGPPGSRKPGEGARAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 APRAASRAPDDSRAGAQRDEPEPGTRRSPAPSPGARWLGSTLHGRGPPGSRKPGEGARAE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA1 ALWPRDALLFAVDNLNRVEGLLPYNLSLEVVMAIEAGLGDLPLLPFSSPSSPWSSDPFSF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ALWPRDALLFAVDNLNRVEGLLPYNLSLEVVMAIEAGLGDLPLLPFSSPSSPWSSDPFSF
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA1 LQSVCHTVVVQGVSALLAFPQSQGEMMELDLVSLVLHIPVISIVRHEFPRESQNPLHLQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LQSVCHTVVVQGVSALLAFPQSQGEMMELDLVSLVLHIPVISIVRHEFPRESQNPLHLQL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA1 SLENSLSSDADVTVSILTMNNWYNFSLLLCQEDWNITDFLLLTQNNSKFHLGSIINITAN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SLENSLSSDADVTVSILTMNNWYNFSLLLCQEDWNITDFLLLTQNNSKFHLGSIINITAN
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA1 LPSTQDLLSFLQIQLESIKNSTPTVVMFGCDMESIRRIFEITTQFGVMPPELRWVLGDSQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LPSTQDLLSFLQIQLESIKNSTPTVVMFGCDMESIRRIFEITTQFGVMPPELRWVLGDSQ
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA1 NVEELRTEGLPLGLIAHGKTTQSVFEHYVQDAMELVARAVATATMIQPELALIPSTMNCM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NVEELRTEGLPLGLIAHGKTTQSVFEHYVQDAMELVARAVATATMIQPELALIPSTMNCM
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA1 EVETTNLTSGQYLSRFLANTTFRGLSGSIRVKGSTIVSSENNFFIWNLQHDPMGKPMWTR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EVETTNLTSGQYLSRFLANTTFRGLSGSIRVKGSTIVSSENNFFIWNLQHDPMGKPMWTR
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA1 LGSWQGGKIVMDYGIWPEQAQRHKTHFQHPSKLHLRVVTLIEHPFVFTREVDDEGLCPAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LGSWQGGKIVMDYGIWPEQAQRHKTHFQHPSKLHLRVVTLIEHPFVFTREVDDEGLCPAG
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA1 QLCLDPMTNDSSTLDSLFSSLHSSNDTVPIKFKKCCYGYCIDLLEKIAEDMNFDFDLYIV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QLCLDPMTNDSSTLDSLFSSLHSSNDTVPIKFKKCCYGYCIDLLEKIAEDMNFDFDLYIV
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA1 GDGKYGAWKNGHWTGLVGDLLRGTAHMAVTSFSINTARSQVIDFTSPFFSTSLGILVRTR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GDGKYGAWKNGHWTGLVGDLLRGTAHMAVTSFSINTARSQVIDFTSPFFSTSLGILVRTR
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA1 DTAAPIGAFMWPLHWTMWLGIFVALHITAVFLTLYEWKSPFGLTPKGRNRSKVFSFSSAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DTAAPIGAFMWPLHWTMWLGIFVALHITAVFLTLYEWKSPFGLTPKGRNRSKVFSFSSAL
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KA1 NICYALLFGRTVAIKPPKCWTGRFLMNLWAIFCMFCLSTYTANLAAVMVGEKIYEELSGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NICYALLFGRTVAIKPPKCWTGRFLMNLWAIFCMFCLSTYTANLAAVMVGEKIYEELSGI
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KA1 HDPKLHHPSQGFRFGTVRESSAEDYVRQSFPEMHEYMRRYNVPATPDGVEYLKNDPEKLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HDPKLHHPSQGFRFGTVRESSAEDYVRQSFPEMHEYMRRYNVPATPDGVEYLKNDPEKLD
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KA1 AFIMDKALLDYEVSIDADCKLLTVGKPFAIEGYGIGLPPNSPLTANISELISQYKSHGFM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AFIMDKALLDYEVSIDADCKLLTVGKPFAIEGYGIGLPPNSPLTANISELISQYKSHGFM
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KA1 DMLHDKWYRVVPCGKRSFAVTETLQMGIKHFSGLFVLLCIGFGLSILTTIGEHIVYRLLL
       :::::::::::::::::::::: .                                    
XP_011 DMLHDKWYRVVPCGKRSFAVTERII                                   
              910       920                                        

>>NP_619635 (OMIM: 606651) glutamate receptor ionotropic  (1043 aa)
 initn: 3248 init1: 2282 opt: 3051  Z-score: 2727.0  bits: 516.3 E(85289): 3.7e-145
Smith-Waterman score: 3246; 49.8% identity (72.8% similar) in 1035 aa overlap (95-1103:6-1007)

           70        80        90       100        110             
pF1KA1 ASRAPDDSRAGAQRDEPEPGTRRSPAPSPGARWLGSTLH-GRGPPGSR-KP-------GE
                                     : ::: .:  : :  :.. .:       : 
NP_619                          MEFVRALWLGLALALGPGSAGGHPQPCGVLARLGG
                                        10        20        30     

         120       130           140       150       160       170 
pF1KA1 GARAEALWPRDALLFAVDN--LNR--VEGLLPYNLSLEVVMAIEAGLGDLPLLPFSSPSS
       ..:  :: ::  :  :     : :  .   ::.:::::.:.:                 .
NP_619 SVRLGALLPRAPLARARARAALARAALAPRLPHNLSLELVVA-----------------A
          40        50        60        70                         

             180       190       200       210       220           
pF1KA1 PWSSDPFSFLQSVCHTVVVQGVSALLAFPQSQGEMMELDLVSLVLHIPVISIVRHEF--P
       : . :: :. ...:...:  ::.::::::... :...: ... . . ::.:..:.:   :
NP_619 PPARDPASLTRGLCQALVPPGVAALLAFPEARPELLQLHFLAAATETPVLSLLRREARAP
       80        90       100       110       120       130        

     230       240       250       260       270        280        
pF1KA1 RESQNPLHLQLSLENSLSSDADVTVSILTMNNWYNFSLLLCQ-EDWNITDFLLLTQNNSK
         . ::.::::   . : .  :: :..:  . : . .: ::. .: .    :  .. .  
NP_619 LGAPNPFHLQLHWASPLETLLDVLVAVLQAHAWEDVGLALCRTQDPGGLVALWTSRAGRP
      140       150       160       170       180       190        

      290       300       310         320       330       340      
pF1KA1 FHLGSIINITANLPSTQDLLSFLQIQLESI--KNSTPTVVMFGCDMESIRRIFEITTQFG
        .:  .....    .   : . :  .   .  .  .:..:..:::.   ::..:      
NP_619 PQL--VLDLSRRDTGDAGLRARLAPMAAPVGGEAPVPAAVLLGCDIARARRVLE------
      200         210       220       230       240       250      

        350       360       370       380       390       400      
pF1KA1 VMPPELRWVLGDSQNVEELRTEGLPLGLIAHGKTTQSVFEHYVQDAMELVARAVATATMI
       ..::  .:.::     . : : ::: ::.: :....  .:  ..: ..:::::...:...
NP_619 AVPPGPHWLLGTPLPPKALPTAGLPPGLLALGEVARPPLEAAIHDIVQLVARALGSAAQV
              260       270       280       290       300       310

        410       420        430       440       450       460     
pF1KA1 QPELALIPSTMNCMEVETTNLTS-GQYLSRFLANTTFRGLSGSIRVKGSTIVSSENNFFI
       ::. ::.:. .:: ... ..  : :..:.::::::.:.: .: . : ::. :    .: .
NP_619 QPKRALLPAPVNCGDLQPAGPESPGRFLARFLANTSFQGRTGPVWVTGSSQVHMSRHFKV
              320       330       340       350       360       370

         470       480       490       500       510       520     
pF1KA1 WNLQHDPMGKPMWTRLGSWQGGKIVMDYGIWPEQAQRHKTHFQHPSKLHLRVVTLIEHPF
       :.:..:: : : :. .:::. :.. .. :    .    .     :.   ::::::.::::
NP_619 WSLRRDPRGAPAWATVGSWRDGQLDLEPGGASARPPPPQGAQVWPK---LRVVTLLEHPF
              380       390       400       410          420       

         530       540       550       560       570       580     
pF1KA1 VFTREVDDEGLCPAGQLCLDPMTNDSSTLDSLFSSLHSSNDTVPIKFKKCCYGYCIDLLE
       ::.:. :..: :::::::::: ::::.:::.::..:  .: ..:  ..::::::::::::
NP_619 VFARDPDEDGQCPAGQLCLDPGTNDSATLDALFAAL--ANGSAPRALRKCCYGYCIDLLE
       430       440       450       460         470       480     

         590       600       610       620       630       640     
pF1KA1 KIAEDMNFDFDLYIVGDGKYGAWKNGHWTGLVGDLLRGTAHMAVTSFSINTARSQVIDFT
       ..:::  :::.::.:::::::: ..:.::::::::: : :::::::::::.:::::.:::
NP_619 RLAEDTPFDFELYLVGDGKYGALRDGRWTGLVGDLLAGRAHMAVTSFSINSARSQVVDFT
         490       500       510       520       530       540     

         650       660       670       680       690       700     
pF1KA1 SPFFSTSLGILVRTRDTAAPIGAFMWPLHWTMWLGIFVALHITAVFLTLYEWKSPFGLTP
       ::::::::::.::.::::.:::::::::::. :::.:.:::.::.:::.:::.::.::::
NP_619 SPFFSTSLGIMVRARDTASPIGAFMWPLHWSTWLGVFAALHLTALFLTVYEWRSPYGLTP
         550       560       570       580       590       600     

         710       720       730       740       750       760     
pF1KA1 KGRNRSKVFSFSSALNICYALLFGRTVAIKPPKCWTGRFLMNLWAIFCMFCLSTYTANLA
       .::::: :::.:::::.:::.:: :::. : ::: :::.:::::::::.. ::.::::::
NP_619 RGRNRSTVFSYSSALNLCYAILFRRTVSSKTPKCPTGRLLMNLWAIFCLLVLSSYTANLA
         610       620       630       640       650       660     

         770       780       790       800       810       820     
pF1KA1 AVMVGEKIYEELSGIHDPKLHHPSQGFRFGTVRESSAEDYVRQSFPEMHEYMRRYNVPAT
       :::::.: .::::::::::::::.:::::::: ::::: :...:::.:: .:::...:.:
NP_619 AVMVGDKTFEELSGIHDPKLHHPAQGFRFGTVWESSAEAYIKKSFPDMHAHMRRHSAPTT
         670       680       690       700       710       720     

         830       840       850       860       870       880     
pF1KA1 PDGVEYLKNDPEKLDAFIMDKALLDYEVSIDADCKLLTVGKPFAIEGYGIGLPPNSPLTA
       : :: .: .:: ::.::::::.::::::::::::::::::::::::::::::: :::::.
NP_619 PRGVAMLTSDPPKLNAFIMDKSLLDYEVSIDADCKLLTVGKPFAIEGYGIGLPQNSPLTS
         730       740       750       760       770       780     

         890       900       910       920       930       940     
pF1KA1 NISELISQYKSHGFMDMLHDKWYRVVPCGKRSFAVTETLQMGIKHFSGLFVLLCIGFGLS
       :.::.::.::: ::.:.::::::..:::::: :::::::::.: ::.:::::::.:.: .
NP_619 NLSEFISRYKSSGFIDLLHDKWYKMVPCGKRVFAVTETLQMSIYHFAGLFVLLCLGLGSA
         790       800       810       820       830       840     

         950       960       970       980            990      1000
pF1KA1 ILTTIGEHIVYRLLLPRIKNKSKLQYWLHTSQRLHRAINT-----SFIEEKQQHFKTKRV
       .:...:::  .:: ::::.. :.:::::::::..:::.::     :  :  . . .  .:
NP_619 LLSSLGEHAFFRLALPRIRKGSRLQYWLHTSQKIHRALNTEPPEGSKEETAEAEPSGPEV
         850       860       870       880       890       900     

               1010      1020      1030      1040      1050        
pF1KA1 EKRSNVG--PRQLTVWNTSNLSHDNRRKYIFSDEEGQNQLGIQIHQDIPLPPRRRELPAL
       :....    :     :. .  . :..:.  :  : .   . .  . :       :: :. 
NP_619 EQQQQQQDQPTAPEGWKRARRAVDKERRVRFLLEPA---VVVAPEADAEAEAAPREGPVW
         910       920       930       940          950       960  

     1060      1070      1080      1090      1100      1110        
pF1KA1 RTTNGKADSLNVSRNSVMQELSELEKQIQVIRQELQLAVSRKTELEEYQRTSRTCES   
         . :.  .   .      ::.:::..:.: :..:. :. :. .:               
NP_619 LCSYGRPPAARPTGAPQPGELQELERRIEVARERLRQALVRRGQLLAQLGDSARHRPRRL
            970       980       990      1000      1010      1020  

NP_619 LQARAAPAEAPPHSGRPGSQE
           1030      1040   

>>XP_016881732 (OMIM: 606651) PREDICTED: glutamate recep  (582 aa)
 initn: 1956 init1: 1926 opt: 1926  Z-score: 1726.0  bits: 330.3 E(85289): 2.1e-89
Smith-Waterman score: 1926; 76.4% identity (93.2% similar) in 351 aa overlap (627-977:1-351)

        600       610       620       630       640       650      
pF1KA1 LYIVGDGKYGAWKNGHWTGLVGDLLRGTAHMAVTSFSINTARSQVIDFTSPFFSTSLGIL
                                     :::::::::.:::::.:::::::::::::.
XP_016                               MAVTSFSINSARSQVVDFTSPFFSTSLGIM
                                             10        20        30

        660       670       680       690       700       710      
pF1KA1 VRTRDTAAPIGAFMWPLHWTMWLGIFVALHITAVFLTLYEWKSPFGLTPKGRNRSKVFSF
       ::.::::.:::::::::::. :::.:.:::.::.:::.:::.::.::::.::::: :::.
XP_016 VRARDTASPIGAFMWPLHWSTWLGVFAALHLTALFLTVYEWRSPYGLTPRGRNRSTVFSY
               40        50        60        70        80        90

        720       730       740       750       760       770      
pF1KA1 SSALNICYALLFGRTVAIKPPKCWTGRFLMNLWAIFCMFCLSTYTANLAAVMVGEKIYEE
       :::::.:::.:: :::. : ::: :::.:::::::::.. ::.:::::::::::.: .::
XP_016 SSALNLCYAILFRRTVSSKTPKCPTGRLLMNLWAIFCLLVLSSYTANLAAVMVGDKTFEE
              100       110       120       130       140       150

        780       790       800       810       820       830      
pF1KA1 LSGIHDPKLHHPSQGFRFGTVRESSAEDYVRQSFPEMHEYMRRYNVPATPDGVEYLKNDP
       ::::::::::::.:::::::: ::::: :...:::.:: .:::...:.:: :: .: .::
XP_016 LSGIHDPKLHHPAQGFRFGTVWESSAEAYIKKSFPDMHAHMRRHSAPTTPRGVAMLTSDP
              160       170       180       190       200       210

        840       850       860       870       880       890      
pF1KA1 EKLDAFIMDKALLDYEVSIDADCKLLTVGKPFAIEGYGIGLPPNSPLTANISELISQYKS
        ::.::::::.::::::::::::::::::::::::::::::: :::::.:.::.::.:::
XP_016 PKLNAFIMDKSLLDYEVSIDADCKLLTVGKPFAIEGYGIGLPQNSPLTSNLSEFISRYKS
              220       230       240       250       260       270

        900       910       920       930       940       950      
pF1KA1 HGFMDMLHDKWYRVVPCGKRSFAVTETLQMGIKHFSGLFVLLCIGFGLSILTTIGEHIVY
        ::.:.::::::..:::::: :::::::::.: ::.:::::::.:.: ..:...:::  .
XP_016 SGFIDLLHDKWYKMVPCGKRVFAVTETLQMSIYHFAGLFVLLCLGLGSALLSSLGEHAFF
              280       290       300       310       320       330

        960       970       980       990      1000      1010      
pF1KA1 RLLLPRIKNKSKLQYWLHTSQRLHRAINTSFIEEKQQHFKTKRVEKRSNVGPRQLTVWNT
       :: ::::.. :.:::::::::                                       
XP_016 RLALPRIRKGSRLQYWLHTSQVGSGWAAGGPTPPASSPTGSVWGLRKSTAPSTRSHQRGR
              340       350       360       370       380       390

>>NP_000823 (OMIM: 138249,614254) glutamate receptor ion  (885 aa)
 initn: 660 init1: 244 opt: 929  Z-score: 833.4  bits: 165.7 E(85289): 1.1e-39
Smith-Waterman score: 976; 27.5% identity (61.2% similar) in 833 aa overlap (183-980:77-866)

            160       170       180       190        200       210 
pF1KA1 AIEAGLGDLPLLPFSSPSSPWSSDPFSFLQSVCHTVVVQGVSALL-AFPQSQGEMMELDL
                                     :::. .. . : :.: . : . .. .    
NP_000 NQANKRHGSWKIQLNATSVTHKPNAIQMALSVCEDLISSQVYAILVSHPPTPNDHFTPTP
         50        60        70        80        90       100      

                220       230        240       250       260       
pF1KA1 VSLV---LHIPVISIVRHEFPRESQNPLHLQ-LSLENSLSSDADVTVSILTMNNWYNFSL
       :: .    .:::.... . .   :.. .::. :      : ...:   .. . .: .. :
NP_000 VSYTAGFYRIPVLGLTTR-MSIYSDKSIHLSFLRTVPPYSHQSSVWFEMMRVYSWNHIIL
        110       120        130       140       150       160     

       270         280         290       300       310       320   
pF1KA1 LLC--QEDWNITDFL--LLTQNNSKFHLGSIINITANLPSTQDLLSFLQIQLESIKNSTP
       :.   .:       :  :: . .:: .  .....    :.:... ..:   .:. :.   
NP_000 LVSDDHEGRAAQKRLETLLEERESKAE--KVLQFD---PGTKNVTALL---MEA-KELEA
         170       180       190            200          210       

           330       340       350          360       370          
pF1KA1 TVVMFGCDMESIRRIFEITTQFGVMPPELRWVLGD---SQNVEELRTEGLPLGL-IAHGK
        :.... . ..   ... ......      :..:.   : :. .   .:. ::: . .::
NP_000 RVIILSASEDDAATVYRAAAMLNMTGSGYVWLVGEREISGNALRYAPDGI-LGLQLINGK
        220       230       240       250       260        270     

     380       390       400       410       420        430        
pF1KA1 TTQSVFEHYVQDAMELVARAVATATMIQPELALIPSTMNCMEVETTNL-TSGQYLSRFLA
       . ..    ...::. .::.::    ... :    :   .:  : .::.  .:  ..: : 
NP_000 NESA----HISDAVGVVAQAVHE--LLEKENITDPPR-GC--VGNTNIWKTGPLFKRVLM
             280       290         300          310       320      

      440        450       460       470       480       490       
pF1KA1 NTTFR-GLSGSIRVKGSTIVSSENNFFIWNLQHDPMGKPMWTRLGSWQGGKIVMDYG--I
       .. .  :..: .. . .    .  :. : :::.  .     ...: ..: ... .    :
NP_000 SSKYADGVTGRVEFNEDGD-RKFANYSIMNLQNRKL-----VQVGIYNGTHVIPNDRKII
        330       340        350       360            370       380

         500       510       520       530       540        550    
pF1KA1 WPEQAQRHKTHFQHPSKLHLRVVTLIEHPFVFTREVDDEGLCPAG-QLCLDPMTNDSSTL
       ::    ..   .:  ..:  ..::. ..:::... . ..: :     .  ::. .   : 
NP_000 WPGGETEKPRGYQMSTRL--KIVTIHQEPFVYVKPTLSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTG
              390         400       410       420       430        

          560       570       580       590       600          610 
pF1KA1 DSLFSSLHSSNDTVPIKFKKCCYGYCIDLLEKIAEDMNFDFDLYIVGDGKYGAWK---NG
        .  .:  :   :::    .::::.::::: :.:. ::: .....:.:::.:. .   :.
NP_000 PND-TSPGSPRHTVP----QCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVNNS
      440        450           460       470       480       490   

                620       630       640       650       660        
pF1KA1 H---WTGLVGDLLRGTAHMAVTSFSINTARSQVIDFTSPFFSTSLGILVRTRDTAAPIGA
       .   :.:..:.:: : : : :. ..::. :.: :.:..::   .: :::. .   . . .
NP_000 NKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKEIPRSTLDS
           500       510       520       530       540       550   

      670       680       690       700       710         720      
pF1KA1 FMWPLHWTMWLGIFVALHITAVFLTLYEWKSPFGLTPKGRNRSK--VFSFSSALNICYAL
       :: :.. :.:: . ...:..::.: : .  ::::    . .. .  ....:::. . ...
NP_000 FMQPFQSTLWLLVGLSVHVVAVMLYLLDRFSPFGRFKVNSEEEEEDALTLSSAMWFSWGV
           560       570       580       590       600       610   

        730       740       750       760       770       780      
pF1KA1 LFGRTVAIKPPKCWTGRFLMNLWAIFCMFCLSTYTANLAAVMVGEKIYEELSGIHDPKLH
       :..  ..   :. ...:.:  .:: : :. ...::::::: .: ..  :...::.::.:.
NP_000 LLNSGIGEGAPRSFSARILGMVWAGFAMIIVASYTANLAAFLVLDRPEERITGINDPRLR
           620       630       640       650       660       670   

        790       800         810       820       830       840    
pF1KA1 HPSQGFRFGTVRESSAEDYVRQS--FPEMHEYMRRYNVPATPDGVEYLKNDPEKLDAFIM
       .::. : ..::..::.. : :..  .  :...:...:  .. .... ....  :: ::: 
NP_000 NPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDN--KLHAFIW
           680       690       700       710       720         730 

          850       860       870       880       890         900  
pF1KA1 DKALLDYEVSIDADCKLLTVGKPFAIEGYGIGLPPNSPLTANISELISQYKSH--GFMDM
       :.:.:..:.:    : :.:.:. :   :.:::.  .::   :.:  .:  :::  :::. 
NP_000 DSAVLEFEAS--QKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVS--LSILKSHENGFMED
             740         750       760       770         780       

            910       920       930       940       950       960  
pF1KA1 LHDKWYRVVPCGKRSFAVTETLQMGIKHFSGLFVLLCIGFGLSILTTIGEHIVYRLLLPR
       :   : :   : .:: :      . .....:.:.:.  :.  .:.  . : :.:.     
NP_000 LDKTWVRYQECDSRSNA---PATLTFENMAGVFMLVAGGIVAGIFLIFIE-IAYKRHKDA
       790       800          810       820       830        840   

            970            980       990      1000      1010       
pF1KA1 IKNKSKLQY-----WLHTSQRLHRAINTSFIEEKQQHFKTKRVEKRSNVGPRQLTVWNTS
        ... .: .     : .. :. :                                     
NP_000 RRKQMQLAFAAVNVWRKNLQQYHPTDITGPLNLSDPSVSTVV                  
           850       860       870       880                       

>>NP_001172020 (OMIM: 138249,614254) glutamate receptor   (906 aa)
 initn: 660 init1: 244 opt: 929  Z-score: 833.2  bits: 165.7 E(85289): 1.1e-39
Smith-Waterman score: 966; 27.1% identity (60.2% similar) in 846 aa overlap (183-980:77-887)

            160       170       180       190        200       210 
pF1KA1 AIEAGLGDLPLLPFSSPSSPWSSDPFSFLQSVCHTVVVQGVSALL-AFPQSQGEMMELDL
                                     :::. .. . : :.: . : . .. .    
NP_001 NQANKRHGSWKIQLNATSVTHKPNAIQMALSVCEDLISSQVYAILVSHPPTPNDHFTPTP
         50        60        70        80        90       100      

                220       230        240       250       260       
pF1KA1 VSLV---LHIPVISIVRHEFPRESQNPLHLQ-LSLENSLSSDADVTVSILTMNNWYNFSL
       :: .    .:::.... . .   :.. .::. :      : ...:   .. . .: :  .
NP_001 VSYTAGFYRIPVLGLTTR-MSIYSDKSIHLSFLRTVPPYSHQSSVWFEMMRVYSW-NHII
        110       120        130       140       150       160     

       270              280           290       300       310      
pF1KA1 LLCQEDWN-------ITDFLLLTQNNSK----FHLGSIINITANLPSTQDLLSF------
       :: ..: .       .  .:   ...::     .: ..   .   :... .:.:      
NP_001 LLVSDDHEGRAAQKRLETLLEERESKSKKRNYENLDQLSYDNKRGPKAEKVLQFDPGTKN
          170       180       190       200       210       220    

              320       330       340       350          360       
pF1KA1 LQIQLESIKNSTPTVVMFGCDMESIRRIFEITTQFGVMPPELRWVLGD---SQNVEELRT
       .   :   :.    :.... . ..   ... ......      :..:.   : :. .   
NP_001 VTALLMEAKELEARVIILSASEDDAATVYRAAAMLNMTGSGYVWLVGEREISGNALRYAP
          230       240       250       260       270       280    

       370        380       390       400       410       420      
pF1KA1 EGLPLGL-IAHGKTTQSVFEHYVQDAMELVARAVATATMIQPELALIPSTMNCMEVETTN
       .:. ::: . .::. ..    ...::. .::.::    ... :    :   .:  : .::
NP_001 DGI-LGLQLINGKNESA----HISDAVGVVAQAVHE--LLEKENITDPPR-GC--VGNTN
           290       300           310         320          330    

         430       440        450       460       470       480    
pF1KA1 L-TSGQYLSRFLANTTFR-GLSGSIRVKGSTIVSSENNFFIWNLQHDPMGKPMWTRLGSW
       .  .:  ..: : .. .  :..: .. . .    .  :. : :::.  .     ...: .
NP_001 IWKTGPLFKRVLMSSKYADGVTGRVEFNEDGD-RKFANYSIMNLQNRKL-----VQVGIY
          340       350       360        370       380             

          490         500       510       520       530       540  
pF1KA1 QGGKIVMDYG--IWPEQAQRHKTHFQHPSKLHLRVVTLIEHPFVFTREVDDEGLCPAG-Q
       .: ... .    :::    ..   .:  ..:  ..::. ..:::... . ..: :     
NP_001 NGTHVIPNDRKIIWPGGETEKPRGYQMSTRL--KIVTIHQEPFVYVKPTLSDGTCKEEFT
      390       400       410         420       430       440      

             550       560       570       580       590       600 
pF1KA1 LCLDPMTNDSSTLDSLFSSLHSSNDTVPIKFKKCCYGYCIDLLEKIAEDMNFDFDLYIVG
       .  ::. .   :  .  .:  :   :::    .::::.::::: :.:. ::: .....:.
NP_001 VNGDPVKKVICTGPND-TSPGSPRHTVP----QCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVA
        450       460        470           480       490       500 

                610          620       630       640       650     
pF1KA1 DGKYGAWK---NGH---WTGLVGDLLRGTAHMAVTSFSINTARSQVIDFTSPFFSTSLGI
       :::.:. .   :..   :.:..:.:: : : : :. ..::. :.: :.:..::   .: :
NP_001 DGKFGTQERVNNSNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTI
             510       520       530       540       550       560 

         660       670       680       690       700       710     
pF1KA1 LVRTRDTAAPIGAFMWPLHWTMWLGIFVALHITAVFLTLYEWKSPFGLTPKGRNRSK--V
       ::. .   . . .:: :.. :.:: . ...:..::.: : .  ::::    . .. .  .
NP_001 LVKKEIPRSTLDSFMQPFQSTLWLLVGLSVHVVAVMLYLLDRFSPFGRFKVNSEEEEEDA
             570       580       590       600       610       620 

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pF1KA1 FSFSSALNICYALLFGRTVAIKPPKCWTGRFLMNLWAIFCMFCLSTYTANLAAVMVGEKI
       ...:::. . ...:..  ..   :. ...:.:  .:: : :. ...::::::: .: .. 
NP_001 LTLSSAMWFSWGVLLNSGIGEGAPRSFSARILGMVWAGFAMIIVASYTANLAAFLVLDRP
             630       640       650       660       670       680 

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pF1KA1 YEELSGIHDPKLHHPSQGFRFGTVRESSAEDYVRQS--FPEMHEYMRRYNVPATPDGVEY
        :...::.::.:..::. : ..::..::.. : :..  .  :...:...:  .. .... 
NP_001 EERITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQA
             690       700       710       720       730       740 

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pF1KA1 LKNDPEKLDAFIMDKALLDYEVSIDADCKLLTVGKPFAIEGYGIGLPPNSPLTANISELI
       ....  :: ::: :.:.:..:.:    : :.:.:. :   :.:::.  .::   :.:  .
NP_001 VRDN--KLHAFIWDSAVLEFEAS--QKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVS--L
               750       760         770       780       790       

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pF1KA1 SQYKSH--GFMDMLHDKWYRVVPCGKRSFAVTETLQMGIKHFSGLFVLLCIGFGLSILTT
       :  :::  :::. :   : :   : .:: :      . .....:.:.:.  :.  .:.  
NP_001 SILKSHENGFMEDLDKTWVRYQECDSRSNA---PATLTFENMAGVFMLVAGGIVAGIFLI
         800       810       820          830       840       850  

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pF1KA1 IGEHIVYRLLLPRIKNKSKLQY-----WLHTSQRLHRAINTSFIEEKQQHFKTKRVEKRS
       . : :.:.      ... .: .     : .. :. :                        
NP_001 FIE-IAYKRHKDARRKQMQLAFAAVNVWRKNLQQYHPTDITGPLNLSDPSVSTVV     
             860       870       880       890       900           

         1010      1020      1030      1040      1050      1060    
pF1KA1 NVGPRQLTVWNTSNLSHDNRRKYIFSDEEGQNQLGIQIHQDIPLPPRRRELPALRTTNGK

>>XP_011516885 (OMIM: 138249,614254) PREDICTED: glutamat  (892 aa)
 initn: 660 init1: 244 opt: 928  Z-score: 832.4  bits: 165.5 E(85289): 1.3e-39
Smith-Waterman score: 965; 27.5% identity (60.4% similar) in 834 aa overlap (183-973:77-871)

            160       170       180       190        200       210 
pF1KA1 AIEAGLGDLPLLPFSSPSSPWSSDPFSFLQSVCHTVVVQGVSALL-AFPQSQGEMMELDL
                                     :::. .. . : :.: . : . .. .    
XP_011 NQANKRHGSWKIQLNATSVTHKPNAIQMALSVCEDLISSQVYAILVSHPPTPNDHFTPTP
         50        60        70        80        90       100      

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pF1KA1 VSLV---LHIPVISIVRHEFPRESQNPLHLQ-LSLENSLSSDADVTVSILTMNNWYNFSL
       :: .    .:::.... . .   :.. .::. :      : ...:   .. . .: :  .
XP_011 VSYTAGFYRIPVLGLTTR-MSIYSDKSIHLSFLRTVPPYSHQSSVWFEMMRVYSW-NHII
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pF1KA1 LLCQEDWN-------ITDFLLLTQNNSK----FHLGSIINITANLPSTQDLLSF------
       :: ..: .       .  .:   ...::     .: ..   .   :... .:.:      
XP_011 LLVSDDHEGRAAQKRLETLLEERESKSKKRNYENLDQLSYDNKRGPKAEKVLQFDPGTKN
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pF1KA1 LQIQLESIKNSTPTVVMFGCDMESIRRIFEITTQFGVMPPELRWVLGD---SQNVEELRT
       .   :   :.    :.... . ..   ... ......      :..:.   : :. .   
XP_011 VTALLMEAKELEARVIILSASEDDAATVYRAAAMLNMTGSGYVWLVGEREISGNALRYAP
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pF1KA1 EGLPLGL-IAHGKTTQSVFEHYVQDAMELVARAVATATMIQPELALIPSTMNCMEVETTN
       .:. ::: . .::. ..    ...::. .::.::    ... :    :   .:  : .::
XP_011 DGI-LGLQLINGKNESA----HISDAVGVVAQAVH--ELLEKENITDPPR-GC--VGNTN
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pF1KA1 L-TSGQYLSRFLANTTFR-GLSGSIRVKGSTIVSSENNFFIWNLQHDPMGKPMWTRLGSW
       .  .:  ..: : .. .  :..: .. . .    .  :. : :::.  .     ...: .
XP_011 IWKTGPLFKRVLMSSKYADGVTGRVEFNEDGD-RKFANYSIMNLQNRKL-----VQVGIY
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pF1KA1 QGGKIVMDYG--IWPEQAQRHKTHFQHPSKLHLRVVTLIEHPFVFTREVDDEGLCPAG-Q
       .: ... .    :::    ..   .:  ..  :..::. ..:::... . ..: :     
XP_011 NGTHVIPNDRKIIWPGGETEKPRGYQMSTR--LKIVTIHQEPFVYVKPTLSDGTCKEEFT
      390       400       410         420       430       440      

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pF1KA1 LCLDPMTNDSSTLDSLFSSLHSSNDTVPIKFKKCCYGYCIDLLEKIAEDMNFDFDLYIVG
       .  ::. .   :  .  .:  :   :::    .::::.::::: :.:. ::: .....:.
XP_011 VNGDPVKKVICTGPND-TSPGSPRHTVP----QCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVA
        450       460        470           480       490       500 

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pF1KA1 DGKYGAWK---NGH---WTGLVGDLLRGTAHMAVTSFSINTARSQVIDFTSPFFSTSLGI
       :::.:. .   :..   :.:..:.:: : : : :. ..::. :.: :.:..::   .: :
XP_011 DGKFGTQERVNNSNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTI
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pF1KA1 LVRTRDTAAPIGAFMWPLHWTMWLGIFVALHITAVFLTLYEWKSPFGLTPKGRNRSK--V
       ::. .   . . .:: :.. :.:: . ...:..::.: : .  ::::    . .. .  .
XP_011 LVKKEIPRSTLDSFMQPFQSTLWLLVGLSVHVVAVMLYLLDRFSPFGRFKVNSEEEEEDA
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pF1KA1 FSFSSALNICYALLFGRTVAIKPPKCWTGRFLMNLWAIFCMFCLSTYTANLAAVMVGEKI
       ...:::. . ...:..  ..   :. ...:.:  .:: : :. ...::::::: .: .. 
XP_011 LTLSSAMWFSWGVLLNSGIGEGAPRSFSARILGMVWAGFAMIIVASYTANLAAFLVLDRP
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pF1KA1 YEELSGIHDPKLHHPSQGFRFGTVRESSAEDYVRQS--FPEMHEYMRRYNVPATPDGVEY
        :...::.::.:..::. : ..::..::.. : :..  .  :...:...:  .. .... 
XP_011 EERITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQA
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pF1KA1 LKNDPEKLDAFIMDKALLDYEVSIDADCKLLTVGKPFAIEGYGIGLPPNSPLTANISELI
       ....  :: ::: :.:.:..:.:    : :.:.:. :   :.:::.  .::   :.:  .
XP_011 VRDN--KLHAFIWDSAVLEFEAS--QKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVS--L
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pF1KA1 SQYKSH--GFMDMLHDKWYRVVPCGKRSFAVTETLQMGIKHFSGLFVLLCIGFGLSILTT
       :  :::  :::. :   : :   : .:: :      . .....:.:.:.  :.  .:.  
XP_011 SILKSHENGFMEDLDKTWVRYQECDSRSNA---PATLTFENMAGVFMLVAGGIVAGIFLI
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     950       960       970       980       990      1000         
pF1KA1 IGEHIVYRLLLPRIKNKSKLQYWLHTSQRLHRAINTSFIEEKQQHFKTKRVEKRSNVGPR
       . : :.:.    : :.  . :. :                                    
XP_011 FIE-IAYK----RHKDARRKQMQLAFAAVNVWRKNLQSRPPVPIP               
                 860       870       880       890                 

>>NP_067544 (OMIM: 138249,614254) glutamate receptor ion  (901 aa)
 initn: 605 init1: 244 opt: 928  Z-score: 832.4  bits: 165.5 E(85289): 1.3e-39
Smith-Waterman score: 975; 27.9% identity (61.5% similar) in 821 aa overlap (183-973:77-850)

            160       170       180       190        200       210 
pF1KA1 AIEAGLGDLPLLPFSSPSSPWSSDPFSFLQSVCHTVVVQGVSALL-AFPQSQGEMMELDL
                                     :::. .. . : :.: . : . .. .    
NP_067 NQANKRHGSWKIQLNATSVTHKPNAIQMALSVCEDLISSQVYAILVSHPPTPNDHFTPTP
         50        60        70        80        90       100      

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pF1KA1 VSLV---LHIPVISIVRHEFPRESQNPLHLQ-LSLENSLSSDADVTVSILTMNNWYNFSL
       :: .    .:::.... . .   :.. .::. :      : ...:   .. . .: .. :
NP_067 VSYTAGFYRIPVLGLTTR-MSIYSDKSIHLSFLRTVPPYSHQSSVWFEMMRVYSWNHIIL
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pF1KA1 LLC--QEDWNITDFL--LLTQNNSKFHLGSIINITANLPSTQDLLSFLQIQLESIKNSTP
       :.   .:       :  :: . .:: .  .....    :.:... ..:   .:. :.   
NP_067 LVSDDHEGRAAQKRLETLLEERESKAE--KVLQFD---PGTKNVTALL---MEA-KELEA
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pF1KA1 TVVMFGCDMESIRRIFEITTQFGVMPPELRWVLGD---SQNVEELRTEGLPLGL-IAHGK
        :.... . ..   ... ......      :..:.   : :. .   .:. ::: . .::
NP_067 RVIILSASEDDAATVYRAAAMLNMTGSGYVWLVGEREISGNALRYAPDGI-LGLQLINGK
        220       230       240       250       260        270     

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pF1KA1 TTQSVFEHYVQDAMELVARAVATATMIQPELALIPSTMNCMEVETTNL-TSGQYLSRFLA
       . ..    ...::. .::.::    ... :    :   .:  : .::.  .:  ..: : 
NP_067 NESA----HISDAVGVVAQAVH--ELLEKENITDPPR-GC--VGNTNIWKTGPLFKRVLM
             280       290         300          310       320      

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pF1KA1 NTTFR-GLSGSIRVKGSTIVSSENNFFIWNLQHDPMGKPMWTRLGSWQGGKIVMDYG--I
       .. .  :..: .. . .    .  :. : :::.  .     ...: ..: ... .    :
NP_067 SSKYADGVTGRVEFNEDGD-RKFANYSIMNLQNRKL-----VQVGIYNGTHVIPNDRKII
        330       340        350       360            370       380

         500       510       520       530       540        550    
pF1KA1 WPEQAQRHKTHFQHPSKLHLRVVTLIEHPFVFTREVDDEGLCPAG-QLCLDPMTNDSSTL
       ::    ..   .:  ..  :..::. ..:::... . ..: :     .  ::. .   : 
NP_067 WPGGETEKPRGYQMSTR--LKIVTIHQEPFVYVKPTLSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTG
              390         400       410       420       430        

          560       570       580       590       600          610 
pF1KA1 DSLFSSLHSSNDTVPIKFKKCCYGYCIDLLEKIAEDMNFDFDLYIVGDGKYGAWK---NG
        .  .:  :   :::    .::::.::::: :.:. ::: .....:.:::.:. .   :.
NP_067 PND-TSPGSPRHTVP----QCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVNNS
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pF1KA1 H---WTGLVGDLLRGTAHMAVTSFSINTARSQVIDFTSPFFSTSLGILVRTRDTAAPIGA
       .   :.:..:.:: : : : :. ..::. :.: :.:..::   .: :::. .   . . .
NP_067 NKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKEIPRSTLDS
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pF1KA1 FMWPLHWTMWLGIFVALHITAVFLTLYEWKSPFGLTPKGRNRSK--VFSFSSALNICYAL
       :: :.. :.:: . ...:..::.: : .  ::::    . .. .  ....:::. . ...
NP_067 FMQPFQSTLWLLVGLSVHVVAVMLYLLDRFSPFGRFKVNSEEEEEDALTLSSAMWFSWGV
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pF1KA1 LFGRTVAIKPPKCWTGRFLMNLWAIFCMFCLSTYTANLAAVMVGEKIYEELSGIHDPKLH
       :..  ..   :. ...:.:  .:: : :. ...::::::: .: ..  :...::.::.:.
NP_067 LLNSGIGEGAPRSFSARILGMVWAGFAMIIVASYTANLAAFLVLDRPEERITGINDPRLR
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pF1KA1 HPSQGFRFGTVRESSAEDYVRQS--FPEMHEYMRRYNVPATPDGVEYLKNDPEKLDAFIM
       .::. : ..::..::.. : :..  .  :...:...:  .. .... ....  :: ::: 
NP_067 NPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDN--KLHAFIW
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pF1KA1 DKALLDYEVSIDADCKLLTVGKPFAIEGYGIGLPPNSPLTANISELISQYKSH--GFMDM
       :.:.:..:.:    : :.:.:. :   :.:::.  .::   :.:  .:  :::  :::. 
NP_067 DSAVLEFEAS--QKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVS--LSILKSHENGFMED
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pF1KA1 LHDKWYRVVPCGKRSFAVTETLQMGIKHFSGLFVLLCIGFGLSILTTIGEHIVYRLLLPR
       :   : :   : .:: :      . .....:.:.:.  :.  .:.  . : :.:.    :
NP_067 LDKTWVRYQECDSRSNA---PATLTFENMAGVFMLVAGGIVAGIFLIFIE-IAYK----R
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pF1KA1 IKNKSKLQYWLHTSQRLHRAINTSFIEEKQQHFKTKRVEKRSNVGPRQLTVWNTSNLSHD
        :.  . :. :                                                 
NP_067 HKDARRKQMQLAFAAVNVWRKNLQSTGGGRGALQNQKDTVLPRRAIEREEGQLQLCSRHR
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XP_005 NQANKRHGSWKIQLNATSVTHKPNAIQMALSVCEDLISSQVYAILVSHPPTPNDHFTPTP
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pF1KA1 VSLV---LHIPVISIVRHEFPRESQNPLHLQ-LSLENSLSSDADVTVSILTMNNWYNFSL
       :: .    .:::.... . .   :.. .::. :      : ...:   .. . .: .. :
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pF1KA1 LLC--QEDWNITDFL--LLTQNNSKFHLGSIINITANLPSTQDLLSFLQIQLESIKNSTP
       :.   .:       :  :: . .:: .  .....    :.:... ..:   .:. :.   
XP_005 LVSDDHEGRAAQKRLETLLEERESKAE--KVLQFD---PGTKNVTALL---MEA-KELEA
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pF1KA1 TVVMFGCDMESIRRIFEITTQFGVMPPELRWVLGD---SQNVEELRTEGLPLGL-IAHGK
        :.... . ..   ... ......      :..:.   : :. .   .:. ::: . .::
XP_005 RVIILSASEDDAATVYRAAAMLNMTGSGYVWLVGEREISGNALRYAPDGI-LGLQLINGK
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pF1KA1 TTQSVFEHYVQDAMELVARAVATATMIQPELALIPSTMNCMEVETTNL-TSGQYLSRFLA
       . ..    ...::. .::.::    ... :    :   .:  : .::.  .:  ..: : 
XP_005 NESA----HISDAVGVVAQAVH--ELLEKENITDPPR-GC--VGNTNIWKTGPLFKRVLM
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pF1KA1 NTTFR-GLSGSIRVKGSTIVSSENNFFIWNLQHDPMGKPMWTRLGSWQGGKIVMDYG--I
       .. .  :..: .. . .    .  :. : :::.  .     ...: ..: ... .    :
XP_005 SSKYADGVTGRVEFNEDGD-RKFANYSIMNLQNRKL-----VQVGIYNGTHVIPNDRKII
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pF1KA1 WPEQAQRHKTHFQHPSKLHLRVVTLIEHPFVFTREVDDEGLCPAG-QLCLDPMTNDSSTL
       ::    ..   .:  ..:  ..::. ..:::... . ..: :     .  ::. .   : 
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pF1KA1 DSLFSSLHSSNDTVPIKFKKCCYGYCIDLLEKIAEDMNFDFDLYIVGDGKYGAWK---NG
        .  .:  :   :::    .::::.::::: :.:. ::: .....:.:::.:. .   :.
XP_005 PND-TSPGSPRHTVP----QCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVNNS
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pF1KA1 H---WTGLVGDLLRGTAHMAVTSFSINTARSQVIDFTSPFFSTSLGILVRTRDTAAPIGA
       .   :.:..:.:: : : : :. ..::. :.: :.:..::   .: :::. .   . . .
XP_005 NKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKEIPRSTLDS
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pF1KA1 FMWPLHWTMWLGIFVALHITAVFLTLYEWKSPFGLTPKGRNRSK--VFSFSSALNICYAL
       :: :.. :.:: . ...:..::.: : .  ::::    . .. .  ....:::. . ...
XP_005 FMQPFQSTLWLLVGLSVHVVAVMLYLLDRFSPFGRFKVNSEEEEEDALTLSSAMWFSWGV
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XP_005 LLNSGIGEGAPRSFSARILGMVWAGFAMIIVASYTANLAAFLVLDRPEERITGINDPRLR
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pF1KA1 HPSQGFRFGTVRESSAEDYVRQS--FPEMHEYMRRYNVPATPDGVEYLKNDPEKLDAFIM
       .::. : ..::..::.. : :..  .  :...:...:  .. .... ....  :: ::: 
XP_005 NPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDN--KLHAFIW
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pF1KA1 DKALLDYEVSIDADCKLLTVGKPFAIEGYGIGLPPNSPLTANISELISQYKSH--GFMDM
       :.:.:..:.:    : :.:.:. :   :.:::.  .::   :.:  .:  :::  :::. 
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pF1KA1 LHDKWYRVVPCGKRSFAVTETLQMGIKHFSGLFVLLCIGFGLSILTTIGEHIVYRLLLPR
       :   : :   : .:: :   :: .  ....:.:.:.  :.  .:.  . : :.:.    :
XP_005 LDKTWVRYQECDSRSNA-PATLTF--ENMAGVFMLVAGGIVAGIFLIFIE-IAYK----R
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pF1KA1 IKNKSKLQYWLHTSQRLHRAINTSFIEEKQQHFKTKRVEKRSNVGPRQLTVWN--TSNLS
        :.  . :. :  .     :.:.   ... :  :. :.:      :.. ...   ::.:.
XP_005 HKDARRKQMQLAFA-----AVNV--WRKNLQDRKSGRAEP----DPKKKATFRAITSTLA
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pF1KA1 HDNRRKYIFSDEEGQNQLGIQIHQDIPLPPRRRELPALRTTNGKADSLNVSRNSVMQELS
        . .:.   .: .                                               
XP_005 SSFKRRRSSKDTQYHPTDITGPLNLSDPSVSTVV                          
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pF1KA1 AIEAGLGDLPLLPFSSPSSPWSSDPFSFLQSVCHTVVVQGVSALL-AFPQSQGEMMELDL
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XP_005 NQANKRHGSWKIQLNATSVTHKPNAIQMALSVCEDLISSQVYAILVSHPPTPNDHFTPTP
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XP_005 VSYTAGFYRIPVLGLTTR-MSIYSDKSIHLSFLRTVPPYSHQSSVWFEMMRVYSW-NHII
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       .   :   :.    :.... . ..   ... ......      :..:.   : :. .   
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pF1KA1 EGLPLGL-IAHGKTTQSVFEHYVQDAMELVARAVATATMIQPELALIPSTMNCMEVETTN
       .:. ::: . .::. ..    ...::. .::.::    ... :    :   .:  : .::
XP_005 DGI-LGLQLINGKNESA----HISDAVGVVAQAVH--ELLEKENITDPPR-GC--VGNTN
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       .  .:  ..: : .. .  :..: .. . .    .  :. : :::.  .     ...: .
XP_005 IWKTGPLFKRVLMSSKYADGVTGRVEFNEDGD-RKFANYSIMNLQNRKL-----VQVGIY
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pF1KA1 QGGKIVMDYG--IWPEQAQRHKTHFQHPSKLHLRVVTLIEHPFVFTREVDDEGLCPAG-Q
       .: ... .    :::    ..   .:  ..  :..::. ..:::... . ..: :     
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