Result of FASTA (ccds) for pF1KA1531
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA1531, 1121 aa
  1>>>pF1KA1531 1121 - 1121 aa - 1121 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1164+/-0.000987; mu= 16.2437+/- 0.060
 mean_var=179.6078+/-36.597, 0's: 0 Z-trim(112.2): 144  B-trim: 933 in 2/53
 Lambda= 0.095700
 statistics sampled from 12865 (13029) to 12865 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.721), E-opt: 0.2 (0.4), width:  16
 Scan time:  5.830

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS6097.2 ADGRA2 gene_id:25960|Hs108|chr8         (1338) 4002 565.9 2.2e-160
CCDS33964.1 ADGRA3 gene_id:166647|Hs108|chr4       (1321) 1772 258.0   1e-67
CCDS41580.1 ADGRA1 gene_id:84435|Hs108|chr10       ( 560)  765 118.6 4.1e-26


>>CCDS6097.2 ADGRA2 gene_id:25960|Hs108|chr8              (1338 aa)
 initn: 3995 init1: 3995 opt: 4002  Z-score: 2993.0  bits: 565.9 E(32554): 2.2e-160
Smith-Waterman score: 5940; 81.1% identity (81.2% similar) in 1153 aa overlap (186-1121:186-1338)

         160       170       180       190       200       210     
pF1KA1 PRLLRLNISGNIFSSLQPGVFDELPALKVVDLGTEFLTCDCHLRWLLPWAQNRSLQLSEH
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 PRLLRLNISGNIFSSLQPGVFDELPALKVVDLGTEFLTCDCHLRWLLPWAQNRSLQLSEH
         160       170       180       190       200       210     

         220       230       240       250       260       270     
pF1KA1 TLCAYPSALHAQALGSLQEAQLCCEGALELHTHHLIPSLRQVVFQGDRLPFQCSASYLGN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 TLCAYPSALHAQALGSLQEAQLCCEGALELHTHHLIPSLRQVVFQGDRLPFQCSASYLGN
         220       230       240       250       260       270     

         280       290       300       310       320       330     
pF1KA1 DTRIRWYHNRAPVEGDEQAGILLAESLIHDCTFITSELTLSHIGVWASGEWECTVSMAQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 DTRIRWYHNRAPVEGDEQAGILLAESLIHDCTFITSELTLSHIGVWASGEWECTVSMAQG
         280       290       300       310       320       330     

         340       350       360       370       380       390     
pF1KA1 NASKKVEIVVLETSASYCPAERVANNRGDFRWPRTLAGITAYQSCLQYPFTSVPLGGGAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 NASKKVEIVVLETSASYCPAERVANNRGDFRWPRTLAGITAYQSCLQYPFTSVPLGGGAP
         340       350       360       370       380       390     

         400       410       420       430       440       450     
pF1KA1 GTRASRRCDRAGRWEPGDYSHCLYTNDITRVLYTFVLMPINASNALTLAHQLRVYTAEAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 GTRASRRCDRAGRWEPGDYSHCLYTNDITRVLYTFVLMPINASNALTLAHQLRVYTAEAA
         400       410       420       430       440       450     

         460       470       480       490       500       510     
pF1KA1 SFSDMMDVVYVAQMIQKFLGYVDQIKELVEVMVDMASNLMLVDEHLLWLAQREDKACSRI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 SFSDMMDVVYVAQMIQKFLGYVDQIKELVEVMVDMASNLMLVDEHLLWLAQREDKACSRI
         460       470       480       490       500       510     

         520       530                                             
pF1KA1 VGALERIGGAALSPHAQHISV---------------------------------------
       :::::::::::::::::::::                                       
CCDS60 VGALERIGGAALSPHAQHISVNARNVALEAYLIKPHSYVGLTCTAFQRREGGVPGTRPGS
         520       530       540       550       560       570     

                                                                   
pF1KA1 ------------------------------------------------------------
                                                                   
CCDS60 PGQNPPPEPEPPADQQLRFRCTTGRPNVSLSSFHIKNSVALASIQLPPSLFSSLPAALAP
         580       590       600       610       620       630     

                                                                   
pF1KA1 ------------------------------------------------------------
                                                                   
CCDS60 PVPPDCTLQLLVFRNGRLFHSHSNTSRPGAAGPGKRRGVATPVIFAGTSGCGVGNLTEPV
         640       650       660       670       680       690     

                                                                   
pF1KA1 ----------------------------------------------------------EL
                                                                 ::
CCDS60 AVSLRHWAEGAEPVAAWWSQEGPGEAGGWTSEGCQLRSSQPNVSALHCQHLGNVAVLMEL
         700       710       720       730       740       750     

      540       550       560       570       580       590        
pF1KA1 SAFPREVGGAGAGLHPVVYPCTALLLLCLFATIITYILNHSSIRVSRKGWHMLLNLCFHI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 SAFPREVGGAGAGLHPVVYPCTALLLLCLFATIITYILNHSSIRVSRKGWHMLLNLCFHI
         760       770       780       790       800       810     

      600       610       620       630       640       650        
pF1KA1 AMTSAVFAGGITLTNYQMVCQAVGITLHYSSLSTLLWMGVKARVLHKELTWRAPPPQEGD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 AMTSAVFAGGITLTNYQMVCQAVGITLHYSSLSTLLWMGVKARVLHKELTWRAPPPQEGD
         820       830       840       850       860       870     

      660       670       680       690       700       710        
pF1KA1 PALPTPSPMLRFYLIAGGIPLIICGITAAVNIHNYRDHSPYCWLVWRPSLGAFYIPVALI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 PALPTPSPMLRFYLIAGGIPLIICGITAAVNIHNYRDHSPYCWLVWRPSLGAFYIPVALI
         880       890       900       910       920       930     

      720       730       740       750       760       770        
pF1KA1 LLITWIYFLCAGLRLRGPLAQNPKAGNSRASLEAGEELRGSTRLRGSGPLLSDSGSLLAT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 LLITWIYFLCAGLRLRGPLAQNPKAGNSRASLEAGEELRGSTRLRGSGPLLSDSGSLLAT
         940       950       960       970       980       990     

      780       790       800       810       820       830        
pF1KA1 GSARVGTPGPPEDGDSLYSPGVQLGALVTTHFLYLAMWACGALAVSQRWLPRVVCSCLYG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 GSARVGTPGPPEDGDSLYSPGVQLGALVTTHFLYLAMWACGALAVSQRWLPRVVCSCLYG
        1000      1010      1020      1030      1040      1050     

      840       850       860       870       880       890        
pF1KA1 VAASALGLFVFTHHCARRRDVRASWRACCPPASPAAPHAPPRALPAAAEDGSPVFGEGPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 VAASALGLFVFTHHCARRRDVRASWRACCPPASPAAPHAPPRALPAAAEDGSPVFGEGPP
        1060      1070      1080      1090      1100      1110     

      900       910       920       930       940       950        
pF1KA1 SLKSSPSGSSGHPLALGPCKLTNLQLAQSQVCEAGAAAGGEGEPEPAGTRGNLAHRHPNN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 SLKSSPSGSSGHPLALGPCKLTNLQLAQSQVCEAGAAAGGEGEPEPAGTRGNLAHRHPNN
        1120      1130      1140      1150      1160      1170     

      960       970       980       990      1000      1010        
pF1KA1 VHHGRRAHKSRAKGHRAGEACGKNRLKALRGGAAGALELLSSESGGLHNSPTDSYLGSSR
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
CCDS60 VHHGRRAHKSRAKGHRAGEACGKNRLKALRGGAAGALELLSSESGSLHNSPTDSYLGSSR
        1180      1190      1200      1210      1220      1230     

     1020      1030      1040      1050      1060      1070        
pF1KA1 NSPGAGLQLEGEPMLTPSEGSDTSAAPLSEAGRAGQRRSASRDSLKGGGALEKESHRRSY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 NSPGAGLQLEGEPMLTPSEGSDTSAAPLSEAGRAGQRRSASRDSLKGGGALEKESHRRSY
        1240      1250      1260      1270      1280      1290     

     1080      1090      1100      1110      1120 
pF1KA1 PLNAASLNGAPKGGKYDDVTLMGAEVASGGCMKTGLWKSETTV
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 PLNAASLNGAPKGGKYDDVTLMGAEVASGGCMKTGLWKSETTV
        1300      1310      1320      1330        

>--
 initn: 1243 init1: 1243 opt: 1243  Z-score: 934.3  bits: 185.0 E(32554): 1e-45
Smith-Waterman score: 1243; 100.0% identity (100.0% similar) in 185 aa overlap (1-185:1-185)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MGAGGRRMRGAPARLLLPLLPWLLLLLAPEARGAPGCPLSIRSCKCSGERPKGLSGGVPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 MGAGGRRMRGAPARLLLPLLPWLLLLLAPEARGAPGCPLSIRSCKCSGERPKGLSGGVPG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 PARRRVVCSGGDLPEPPEPGLLPNGTVTLLLSNNKITGLRNGSFLGLSLLEKLDLRNNII
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 PARRRVVCSGGDLPEPPEPGLLPNGTVTLLLSNNKITGLRNGSFLGLSLLEKLDLRNNII
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA1 STVQPGAFLGLGELKRLDLSNNRIGCLTSETFQGLPRLLRLNISGNIFSSLQPGVFDELP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 STVQPGAFLGLGELKRLDLSNNRIGCLTSETFQGLPRLLRLNISGNIFSSLQPGVFDELP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA1 ALKVVDLGTEFLTCDCHLRWLLPWAQNRSLQLSEHTLCAYPSALHAQALGSLQEAQLCCE
       :::::                                                       
CCDS60 ALKVVDLGTEFLTCDCHLRWLLPWAQNRSLQLSEHTLCAYPSALHAQALGSLQEAQLCCE
              190       200       210       220       230       240

>>CCDS33964.1 ADGRA3 gene_id:166647|Hs108|chr4            (1321 aa)
 initn: 1793 init1: 798 opt: 1772  Z-score: 1329.1  bits: 258.0 E(32554): 1e-67
Smith-Waterman score: 2319; 39.9% identity (59.8% similar) in 1151 aa overlap (4-934:5-1129)

                10        20        30        40         50        
pF1KA1  MGAGGRRMRGAPARLLLPLLPWLLLLLAPEARGAPGCPLSIRS-CKCSGERPKGLSGGV
           : :: :. :  :::::   :: :::  . :. :   .. . :: .: ::.: .: .
CCDS33 MEPPGRRRGRAQPP-LLLPLS--LLALLALLGGGGGGGAAALPAGCKHDG-RPRG-AGRA
               10         20          30        40         50      

       60        70        80        90       100       110        
pF1KA1 PGPARRRVVCSGGDLPEPPEPGLLPNGTVTLLLSNNKITGLRNGSFLGLSLLEKLDLRNN
        : :. .::::. .: .   :  ::: ::::.::::::. :.:::: ::::::.::::::
CCDS33 AGAAEGKVVCSSLELAQVLPPDTLPNRTVTLILSNNKISELKNGSFSGLSLLERLDLRNN
          60        70        80        90       100       110     

      120       130       140       150       160       170        
pF1KA1 IISTVQPGAFLGLGELKRLDLSNNRIGCLTSETFQGLPRLLRLNISGNIFSSLQPGVFDE
       .::...:::: ::. ::::::.:::::::... :.::  :.:::.:::.::::. :.:: 
CCDS33 LISSIDPGAFWGLSSLKRLDLTNNRIGCLNADIFRGLTNLVRLNLSGNLFSSLSQGTFDY
         120       130       140       150       160       170     

      180       190       200       210       220       230        
pF1KA1 LPALKVVDLGTEFLTCDCHLRWLLPWAQNRSLQLSEHTLCAYPSALHAQALGSLQEAQLC
       : .:. ... ::.: :::.. :.  :...... . . : :.::..:.:: . ....  : 
CCDS33 LASLRSLEFQTEYLLCDCNILWMHRWVKEKNITVRD-TRCVYPKSLQAQPVTGVKQELLT
         180       190       200       210        220       230    

      240       250       260       270       280       290        
pF1KA1 CEGALELHTHHLIPSLRQVVFQGDRLPFQCSASYLGNDTRIRWYHNRAPVEGDEQAGILL
       :.  ::: . .. :: :::::.:: ::::: :::. .: .. ::..   :: ::. ::..
CCDS33 CDPPLELPSFYMTPSHRQVVFEGDSLPFQCMASYIDQDMQVLWYQDGRIVETDESQGIFV
          240       250       260       270       280       290    

      300       310       320       330       340       350        
pF1KA1 AESLIHDCTFITSELTLSHIGVWASGEWECTVSMAQGNASKKVEIVVLETSASYCPAERV
        ...::.:..:.: ::.:.: . ..:.: : :.  .:: .. :.:::::.::.::: :::
CCDS33 EKNMIHNCSLIASALTISNIQAGSTGNWGCHVQTKRGNNTRTVDIVVLESSAQYCPPERV
          300       310       320       330       340       350    

      360       370       380       390        400       410       
pF1KA1 ANNRGDFRWPRTLAGITAYQSCLQYPFTSVPLGGGAPGTR-ASRRCDRAGRWEPGDYSHC
       .::.::::::::::::::: .: .    :    :.    : : :::::.: :   :::.:
CCDS33 VNNKGDFRWPRTLAGITAYLQCTRNTHGSGIYPGNPQDERKAWRRCDRGGFWADDDYSRC
          360       370       380       390       400       410    

       420       430       440       450       460       470       
pF1KA1 LYTNDITRVLYTFVLMPINASNALTLAHQLRVYTAEAASFSDMMDVVYVAQMIQKFLGYV
        :.::.::::: :  ::.: .::.. :.:: .::.:::.::: :::..::.::.::  ..
CCDS33 QYANDVTRVLYMFNQMPLNLTNAVATARQLLAYTVEAANFSDKMDVIFVAEMIEKFGRFT
          420       430       440       450       460       470    

         480       490       500       510       520               
pF1KA1 --DQIKELVEVMVDMASNLMLVDEHLLWLAQREDKACSRIVGALERI------GGAAL--
         .. ::: .::::.:::.::.::..::::::: :::::::  :.::      ::: .  
CCDS33 KEEKSKELGDVMVDIASNIMLADERVLWLAQREAKACSRIVQCLQRIATYRLAGGAHVYS
          480       490       500       510       520       530    

         530                                                       
pF1KA1 --SPHA--------------------QHIS------------------------------
         ::.                     :...                              
CCDS33 TYSPNIALEAYVIKSTGFTGMTCTVFQKVAASDRTGLSDYGRRDPEGNLDKQLSFKCNVS
          540       550       560       570       580       590    

                     540                                           
pF1KA1 ------------VELSA-----------------------------------FP------
                   :: :                                    ::      
CCDS33 NTFSSLALKNTIVEASIQLPPSLFSPKQKRELRPTDDSLYKLQLIAFRNGKLFPATGNST
          600       610       620       630       640       650    

                                                              550  
pF1KA1 ------------------------------------REVG-GA-------------GAG-
                                           :... ::             : : 
CCDS33 NLADDGKRRTVVTPVILTKIDGVNVDTHHIPVNVTLRRIAHGADAVAARWDFDLLNGQGG
          660       670       680       690       700       710    

                                                         560       
pF1KA1 --------------------------------------------LHPVVYPCTALLLLCL
                                                   ::::::  . .:::::
CCDS33 WKSDGCHILYSDENITTIQCYSLSNYAVLMDLTGSELYTQAASLLHPVVYTTAIILLLCL
          720       730       740       750       760       770    

       570       580       590       600       610       620       
pF1KA1 FATIITYILNHSSIRVSRKGWHMLLNLCFHIAMTSAVFAGGITLTNYQMVCQAVGITLHY
       .:.:..:: .:: ::.: :.::::.:::::: .: .::.:::: :    .:::::: :::
CCDS33 LAVIVSYIYHHSLIRISLKSWHMLVNLCFHIFLTCVVFVGGITQTRNASICQAVGIILHY
          780       790       800       810       820       830    

       630       640       650       660       670       680       
pF1KA1 SSLSTLLWMGVKARVLHKELTWRAPPPQEGDPALPTPSPMLRFYLIAGGIPLIICGITAA
       :.:.:.::.:: :: ..:..: .:   :. :   : : ::::::::.::::.:.::::::
CCDS33 STLATVLWVGVTARNIYKQVTKKAKRCQDPDEPPPPPRPMLRFYLIGGGIPIIVCGITAA
          840       850       860       870       880       890    

       690         700       710       720       730       740     
pF1KA1 VNIHNY--RDHSPYCWLVWRPSLGAFYIPVALILLITWIYFLCAGLRLRGPLAQNPKAGN
       .::.::  : ..::::..:.::::::: :...: ... .:::   ..:.    ..:.   
CCDS33 ANIKNYGSRPNAPYCWMAWEPSLGAFYGPASFITFVNCMYFLSIFIQLK----RHPE---
          900       910       920       930       940              

         750       760        770        780       790       800   
pF1KA1 SRASLEAGEELRGSTRLRGSGPL-LSDSGSL-LATGSARVGTPGPPEDGDSLYSPGVQLG
        .  :.   : .       .: .  .:: :: : . ::        :.  ...:    ::
CCDS33 RKYELKEPTEEQQRLAANENGEINHQDSMSLSLISTSAL-------ENEHTFHSQ--LLG
       950       960       970       980              990          

           810       820       830       840       850       860   
pF1KA1 ALVTTHFLYLAMWACGALAVSQRWLPRVVCSCLYGVAASALGLFVFTHHCARRRDVRASW
       : .:  .::.:.:  ::::::  .   .: : ..:... ... :  .:::. :.::: .:
CCDS33 ASLTL-LLYVALWMFGALAVSLYYPLDLVFSFVFGATSLSFSAFFVVHHCVNREDVRLAW
     1000       1010      1020      1030      1040      1050       

            870          880       890       900       910         
pF1KA1 -RACCPPASPAAPHA---PPRALPAAAEDGSPVFGEGPPSLKSSPSGSSGHPLALGPCKL
         .:::  :  . ..   :: .  . .: .    . .  :  .. :.:: .  . : :::
CCDS33 IMTCCPGRSSYSVQVNVQPPNSNGTNGE-APKCPNSSAESSCTNKSASSFKNSSQG-CKL
      1060      1070      1080       1090      1100      1110      

     920       930       940       950       960       970         
pF1KA1 TNLQLAQSQVCEAGAAAGGEGEPEPAGTRGNLAHRHPNNVHHGRRAHKSRAKGHRAGEAC
       :::: : .: :.:..                                             
CCDS33 TNLQAAAAQ-CHANSLPLNSTPQLDNSLTEHSMDNDIKMHVAPLEVQFRTNVHSSRHHKN
        1120       1130      1140      1150      1160      1170    

>>CCDS41580.1 ADGRA1 gene_id:84435|Hs108|chr10            (560 aa)
 initn: 1075 init1: 605 opt: 765  Z-score: 582.2  bits: 118.6 E(32554): 4.1e-26
Smith-Waterman score: 1210; 42.0% identity (62.0% similar) in 595 aa overlap (549-1121:14-560)

      520       530       540       550       560       570        
pF1KA1 LERIGGAALSPHAQHISVELSAFPREVGGAGAGLHPVVYPCTALLLLCLFATIITYILNH
                                     :  :::::: :::..::::.:...:::...
CCDS41                  MDLKTVLSLPRYPGEFLHPVVYACTAVMLLCLLASFVTYIVHQ
                                10        20        30        40   

      580       590       600       610       620       630        
pF1KA1 SSIRVSRKGWHMLLNLCFHIAMTSAVFAGGITLTNYQMVCQAVGITLHYSSLSTLLWMGV
       :.::.:::: : :::.::: :.: .::::::. :.: ..::::::.::::.:::.::.::
CCDS41 SAIRISRKGRHTLLNFCFHAALTFTVFAGGINRTKYPILCQAVGIVLHYSTLSTMLWIGV
            50        60        70        80        90       100   

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pF1KA1 KARVLHKELTWRAPPPQEGD-PALPTPSPMLRFYLIAGGIPLIICGITAAVNIHNY---R
        :: ..:..: .::   . : :  :  .:.:::::..::.:.::::.:::.::.::    
CCDS41 TARNIYKQVTKKAPLCLDTDQPPYPR-QPLLRFYLVSGGVPFIICGVTAATNIRNYGTED
           110       120        130       140       150       160  

          700       710       720       730       740       750    
pF1KA1 DHSPYCWLVWRPSLGAFYIPVALILLITWIYFLCAGLRLRGPLAQNPKAGNSRASLEAGE
       . . :::..:.::::::: :.:.: :.: .::: . ..::    ..:  :         :
CCDS41 EDTAYCWMAWEPSLGAFYGPAAIITLVTCVYFLGTYVQLR----RHP--GRRYELRTQPE
            170       180       190       200             210      

          760       770       780       790             800        
pF1KA1 ELRGSTRLRGSGPLLSDSGSLLATGSARVGTPGPPED--GDSL----YSPGVQLGALVTT
       : :     : . :   ..:      . : ::: : .:  : :.    .:  .:: : . :
CCDS41 EQR-----RLATP---EGGR-----GIRPGTP-PAHDAPGASVLQNEHSFQAQLRAAAFT
             220               230        240       250       260  

      810       820       830       840       850       860        
pF1KA1 HFLYLAMWACGALAVSQRWLPRVVCSCLYGVAASALGLFVFTHHCARRRDVRASWRACCP
        ::. : :: :::::::  .  .: :::::.   .:::::. ::::.:.::   : ::::
CCDS41 LFLFTATWAFGALAVSQGHFLDMVFSCLYGAFCVTLGLFVLIHHCAKREDVWQCWWACCP
            270       280       290       300       310       320  

      870         880       890       900       910       920      
pF1KA1 PASPAAP--HAPPRALPAAAEDGSPVFGEGPPSLKSSPSGSSGHPLALGPCKLTNLQLAQ
       : . : :   :   ::  ::   :: .:.        : : . ::   ::::.:::: ::
CCDS41 PRKDAHPALDANGAALGRAACLHSPGLGQ--------PRGFA-HPP--GPCKMTNLQAAQ
            330       340       350                  360       370 

         930          940       950       960       970       980  
pF1KA1 SQV-CEAGAA---AGGEGEPEPAGTRGNLAHRHPNNVHHGRRAHKSRAKGHRAGEACGKN
       ... : . :.   :  . ::  :    . :: : .  ..:  .:  . .:   :..    
CCDS41 GHASCLSPATPCCAKMHCEPLTA----DEAHVHLQ--EEGAFGHDPHLHGCLQGRTKPPY
             380       390           400         410       420     

            990      1000      1010      1020          1030        
pF1KA1 RLKALRGGAAGALELLSSESGGLHNSPTDSYLGSSRNSPGAGLQL----EGEP--MLTPS
         .        : .. :: .:. ..: :::   :: ..:..   :    .:.:  :.:  
CCDS41 FSRHPAEEPEYAYHIPSSLDGSPRSSRTDSP-PSSLDGPAGTHTLACCTQGDPFPMVTQP
         430       440       450        460       470       480    

       1040      1050      1060      1070      1080      1090      
pF1KA1 EGSDTSAAPLSEAGRAGQRRSASRDSLKGGGALEKESHRRSYPLNAASLNGAPKGGKYDD
       :::: : :  :   . :      :..  : : ::   . .: :... : :: :::   . 
CCDS41 EGSDGSPALYSCPTQPG------REAALGPGHLEMLRRTQSLPFGGPSQNGLPKGKLLEG
          490       500             510       520       530        

       1100      1110      1120 
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       . . :..  . : ..:: ::.::::
CCDS41 LPF-GTD--GTGNIRTGPWKNETTV
      540          550       560




1121 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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