Result of FASTA (ccds) for pF1KA0835
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA0835, 1121 aa
  1>>>pF1KA0835 1121 - 1121 aa - 1121 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.7906+/-0.00118; mu= -6.3046+/- 0.071
 mean_var=435.3465+/-87.372, 0's: 0 Z-trim(113.2): 64  B-trim: 0 in 0/55
 Lambda= 0.061469
 statistics sampled from 13800 (13853) to 13800 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.719), E-opt: 0.2 (0.426), width:  16
 Scan time:  6.120

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS13558.1 MYT1 gene_id:4661|Hs108|chr20          (1121) 7463 677.4  5e-194
CCDS77378.1 MYT1L gene_id:23040|Hs108|chr2         (1186) 2665 251.9 6.4e-66
CCDS46222.1 MYT1L gene_id:23040|Hs108|chr2         (1184) 2645 250.1 2.2e-65
CCDS6149.1 ST18 gene_id:9705|Hs108|chr8            (1047) 2484 235.8   4e-61


>>CCDS13558.1 MYT1 gene_id:4661|Hs108|chr20               (1121 aa)
 initn: 7463 init1: 7463 opt: 7463  Z-score: 3596.8  bits: 677.4 E(32554): 5e-194
Smith-Waterman score: 7463; 100.0% identity (100.0% similar) in 1121 aa overlap (1-1121:1-1121)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MSLENEDKRARTRSKALRGPPETTAADLSCPTPGCTGSGHVRGKYSRHRSLQSCPLAKKR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MSLENEDKRARTRSKALRGPPETTAADLSCPTPGCTGSGHVRGKYSRHRSLQSCPLAKKR
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 KLEGAEAEHLVSKRKSHPLKLALDEGYGVDSDGSEDTEVKDASVSDESEGTLEGAEAETS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KLEGAEAEHLVSKRKSHPLKLALDEGYGVDSDGSEDTEVKDASVSDESEGTLEGAEAETS
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 GQDEIHRPETAEGRSPVKSHFGSNPIGSATASSKGSYSSYQGIIATSLLNLGQIAEETLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GQDEIHRPETAEGRSPVKSHFGSNPIGSATASSKGSYSSYQGIIATSLLNLGQIAEETLV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 EEDLGQAAKPGPGIVHLLQEAAEGAASEEGEKGLFIQPEDAEEVVEVTTERSQDLCPQSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 EEDLGQAAKPGPGIVHLLQEAAEGAASEEGEKGLFIQPEDAEEVVEVTTERSQDLCPQSL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 EDAASEESSKQKGILSHEEEDEEEEEEEEEEEEDEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 EDAASEESSKQKGILSHEEEDEEEEEEEEEEEEDEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 EEEEEEAAPDVIFQEDTSHTSAQKAPELRGPESPSPKPEYSVIVEVRSDDDKDEDTHSRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 EEEEEEAAPDVIFQEDTSHTSAQKAPELRGPESPSPKPEYSVIVEVRSDDDKDEDTHSRK
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 STVTDESEMQDMMTRGNLGLLEQAIALKAEQVRTVCEPGCPPAEQSQLGLGEPGKAAKPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 STVTDESEMQDMMTRGNLGLLEQAIALKAEQVRTVCEPGCPPAEQSQLGLGEPGKAAKPL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 DTVRKSYYSKDPSRAEKREIKCPTPGCDGTGHVTGLYPHHRSLSGCPHKDRIPPEILAMH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DTVRKSYYSKDPSRAEKREIKCPTPGCDGTGHVTGLYPHHRSLSGCPHKDRIPPEILAMH
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 ENVLKCPTPGCTGQGHVNSNRNTHRSLSGCPIAAAEKLAKSHEKQQPQTGDPSKSSSNSD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ENVLKCPTPGCTGQGHVNSNRNTHRSLSGCPIAAAEKLAKSHEKQQPQTGDPSKSSSNSD
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA0 RILRPMCFVKQLEVPPYGSYRPNVAPATPRANLAKELEKFSKVTFDYASFDAQVFGKRML
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RILRPMCFVKQLEVPPYGSYRPNVAPATPRANLAKELEKFSKVTFDYASFDAQVFGKRML
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA0 APKIQTSETSPKAFQCFDYSQDAEAAHMAATAILNLSTRCWEMPENLSTKPQDLPSKSVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 APKIQTSETSPKAFQCFDYSQDAEAAHMAATAILNLSTRCWEMPENLSTKPQDLPSKSVD
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA0 IEVDENGTLDLSMHKHRKRENAFPSSSSCSSSPGVKSPDASQRHSSTSAPSSSMTSPQSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 IEVDENGTLDLSMHKHRKRENAFPSSSSCSSSPGVKSPDASQRHSSTSAPSSSMTSPQSS
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KA0 QASRQDEWDRPLDYTKPSRLREEEPEESEPAAHSFASSEADDQEVSEENFEERKYPGEVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QASRQDEWDRPLDYTKPSRLREEEPEESEPAAHSFASSEADDQEVSEENFEERKYPGEVT
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KA0 LTNFKLKFLSKDIKKELLTCPTPGCDGSGHITGNYASHRSLSGCPLADKSLRNLMAAHSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LTNFKLKFLSKDIKKELLTCPTPGCDGSGHITGNYASHRSLSGCPLADKSLRNLMAAHSA
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KA0 DLKCPTPGCDGSGHITGNYASHRSLSGCPRAKKSGVKVAPTKDDKEDPELMKCPVPGCVG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DLKCPTPGCDGSGHITGNYASHRSLSGCPRAKKSGVKVAPTKDDKEDPELMKCPVPGCVG
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KA0 LGHISGKYASHRSASGCPLAARRQKEGSLNGSSFSWKSLKNEGPTCPTPGCDGSGHANGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LGHISGKYASHRSASGCPLAARRQKEGSLNGSSFSWKSLKNEGPTCPTPGCDGSGHANGS
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KA0 FLTHRSLSGCPRATFAGKKGKLSGDEVLSPKFKTSDVLENDEEIKQLNQEIRDLNESNSE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 FLTHRSLSGCPRATFAGKKGKLSGDEVLSPKFKTSDVLENDEEIKQLNQEIRDLNESNSE
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KA0 MEAAMVQLQSQISSMEKNLKNIEEENKLIEEQNEALFLELSGLSQALIQSLANIRLPHME
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MEAAMVQLQSQISSMEKNLKNIEEENKLIEEQNEALFLELSGLSQALIQSLANIRLPHME
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120 
pF1KA0 PICEQNFDAYVSTLTDMYSNQDPENKDLLESIKQAVRGIQV
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PICEQNFDAYVSTLTDMYSNQDPENKDLLESIKQAVRGIQV
             1090      1100      1110      1120 

>>CCDS77378.1 MYT1L gene_id:23040|Hs108|chr2              (1186 aa)
 initn: 2464 init1: 1572 opt: 2665  Z-score: 1296.9  bits: 251.9 E(32554): 6.4e-66
Smith-Waterman score: 3231; 47.7% identity (68.2% similar) in 1216 aa overlap (29-1121:30-1186)

                10        20        30        40        50         
pF1KA0  MSLENEDKRARTRSKALRGPPETTAADLSCPTPGCTGSGHVRGKYSRHRSLQSCPLAKK
                                    ::::::: ::::: :::.::::. .::::::
CCDS77 MEVDTEEKRHRTRSKGVRVPVEPAIQELFSCPTPGCDGSGHVSGKYARHRSVYGCPLAKK
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80                              90       
pF1KA0 RKLEGAEAEHLVSKRKSHPLKL--------------------ALDEG--YGVDSD--GSE
       :: .  . .. . :::   .:                       :::  :. :.:  :.:
CCDS77 RKTQDKQPQEPAPKRKPFAVKADSSSVDECDDSDGTEDMDEKEEDEGEEYSEDNDEPGDE
               70        80        90       100       110       120

         100       110       120             130       140         
pF1KA0 DTEVKDASVSDESEGTLEGAEAETSGQD------EIHRPETAEGRSPVKSH---FGSNPI
       : : ....  .: :   :  . . .:.:      : .. :  : .   ..:     .. :
CCDS77 DEEDEEGDREEEEEIEEEDEDDDEDGEDVEDEEEEEEEEEEEEEEEENEDHQMNCHNTRI
              130       140       150       160       170       180

        150          160       170       180       190       200   
pF1KA0 GSATASSKGS---YSSYQGIIATSLLNLGQIAEETLVEEDLGQAAKPGPGIVHLLQEAAE
        . : .. ..   :..:. ..: ::::::.:::..  .      .. . .  . :.. ..
CCDS77 MQDTEKDDNNNDEYDNYDELVAKSLLNLGKIAEDAAYRAR--TESEMNSNTSNSLEDDSD
              190       200       210       220         230        

           210       220        230                 240       250  
pF1KA0 GAASEEGEKGLFIQPEDAEEVVE-VTTER----------SQDLCPQSLEDAASEESSKQK
           . :.:. .    :.. : : : . .          :...  ..  :. :...:.. 
CCDS77 -KNENLGRKSELSLDLDSDVVRETVDSLKLLAQGHGVVLSENMNDRNYADSMSQQDSRNM
       240       250       260       270       280       290       

            260       270                280       290       300   
pF1KA0 GILSHEEEDEEEEEEEEEEEEDEE---------EEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEE
       . .   .  ..   :.  :: :::         ...  .  ..  : . .:.. ... . 
CCDS77 NYVMLGKPMNNGLMEKMVEESDEEVCLSSLECLRNQCFDLARKLSETNPQERNPQQNMNI
       300       310       320       330       340       350       

           310       320        330       340       350            
pF1KA0 EEEAAPDVIFQEDTSHTSAQKAPEL-RGPESPSPKPEYSVIVEVRSDD---DKDEDTHSR
       .... :.  :   :   . .   .: :  :. ::. .  :..   ..:   ..:.:: : 
CCDS77 RQHVRPEEDFPGRTPDRNYSDMLNLMRLEEQLSPRSR--VFASCAKEDGCHERDDDTTSV
       360       370       380       390         400       410     

     360       370       380       390       400                   
pF1KA0 KSTVTDESEMQDMMTRGNLGLLEQAIALKAEQVRTVCEPGCPPA----------EQSQLG
       .:   :.::    ::.::: :::.::::..:..... :     :          .::   
CCDS77 NS---DRSEEVFDMTKGNLTLLEKAIALETERAKAMREKMAMEAGRRDNMRSYEDQSPRQ
            420       430       440       450       460       470  

     410       420          430       440       450       460      
pF1KA0 LGEPGKAAKPLDT---VRKSYYSKDPSRAEKREIKCPTPGCDGTGHVTGLYPHHRSLSGC
       :  ::.  :: ..   :.: ::.:::::.::.: ::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 L--PGEDRKPKSSDSHVKKPYYGKDPSRTEKKESKCPTPGCDGTGHVTGLYPHHRSLSGC
              480       490       500       510       520       530

        470       480       490       500       510       520      
pF1KA0 PHKDRIPPEILAMHENVLKCPTPGCTGQGHVNSNRNTHRSLSGCPIAAAEKLAKSHEKQQ
       :::::.:::::::::.:::::::::::.::::::::.:::::::::::::::::..::.:
CCDS77 PHKDRVPPEILAMHESVLKCPTPGCTGRGHVNSNRNSHRSLSGCPIAAAEKLAKAQEKHQ
              540       550       560       570       580       590

        530       540       550       560       570       580      
pF1KA0 PQTGDPSKSSSNSDRILRPMCFVKQLEVPPYGSYRPNVAPATPRANLAKELEKFSKVTFD
         . : ::::. :::.:::::::::::.: :: :: ::  .:::.::::::::.::..:.
CCDS77 --SCDVSKSSQASDRVLRPMCFVKQLEIPQYG-YRNNVPTTTPRSNLAKELEKYSKTSFE
                600       610       620        630       640       

        590       600       610                                    
pF1KA0 YASFDAQVFGKRMLAPKIQTSETSPKAFQ-----C-------------------------
       : :.: ...::: .:::.:: . :::...     :                         
CCDS77 YNSYDNHTYGKRAIAPKVQTRDISPKGYDDAKRYCKDPSPSSSSTSSYAPSSSSNLSCGG
       650       660       670       680       690       700       

                    620       630       640       650        660   
pF1KA0 ------------FDYSQDAEAAHMAATAILNLSTRCWEMPENLSTKPQDL-PSKSVDIEV
                   :::..: ::::::::::::::::: :::.:::::::::  ... :.::
CCDS77 GSSASSTCSKSSFDYTHDMEAAHMAATAILNLSTRCREMPQNLSTKPQDLCATRNPDMEV
       710       720       730       740       750       760       

           670       680       690       700       710       720   
pF1KA0 DENGTLDLSMHKHRKRENAFPSSSSCSSSPGVKSPDASQRHSSTSAPSSSMTSPQSSQAS
       ::::::::::.:.:      : .: :   : . .:   .     :  .... . .  : .
CCDS77 DENGTLDLSMNKQR------PRDSCC---P-ILTPLEPM-----SPQQQAVMNNRCFQLG
       770       780                 790            800       810  

           730         740       750       760       770       780 
pF1KA0 RQDEWDRPLDYTK--PSRLREEEPEESEPAAHSFASSEADDQEVSEENFEERKYPGEVTL
       . : :: :.::::  : :. :.: ..  :          .: .  .: .:::.::::::.
CCDS77 EGDCWDLPVDYTKMKPRRIDEDESKDITP----------EDLDPFQEALEERRYPGEVTI
            820       830       840                 850       860  

              790       800       810       820       830       840
pF1KA0 TNFKLKF-LSKDIKKELLTCPTPGCDGSGHITGNYASHRSLSGCPLADKSLRNLMAAHSA
        . : :.   :. ::.:.:                     ::::::::::.:...:. : 
CCDS77 PSPKPKYPQCKESKKDLIT---------------------LSGCPLADKSIRSMLATSSQ
            870       880                            890       900 

              850       860       870       880       890       900
pF1KA0 DLKCPTPGCDGSGHITGNYASHRSLSGCPRAKKSGVKVAPTKDDKEDPELMKCPVPGCVG
       .::::::::::::::::::::::::::::::::::...: .:.:::: : ..:::::: :
CCDS77 ELKCPTPGCDGSGHITGNYASHRSLSGCPRAKKSGIRIAQSKEDKEDQEPIRCPVPGCDG
             910       920       930       940       950       960 

              910       920       930       940       950       960
pF1KA0 LGHISGKYASHRSASGCPLAARRQKEGSLNGSSFSWKSLKNEGPTCPTPGCDGSGHANGS
        :::.::::::::::::::::.:::.: ::::.:::::.:.:: .:::::::::::..::
CCDS77 QGHITGKYASHRSASGCPLAAKRQKDGYLNGSQFSWKSVKTEGMSCPTPGCDGSGHVSGS
             970       980       990      1000      1010      1020 

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KA0 FLTHRSLSGCPRATFAGKKGKLSGDEVLSPKFKTSDVLENDEEIKQLNQEIRDLNESNSE
       :::::::::::::: : ::.::::...:. : ..:. .:::::::::..::..::::::.
CCDS77 FLTHRSLSGCPRATSAMKKAKLSGEQMLTIKQRASNGIENDEEIKQLDEEIKELNESNSQ
            1030      1040      1050      1060      1070      1080 

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KA0 MEAAMVQLQSQISSMEKNLKNIEEENKLIEEQNEALFLELSGLSQALIQSLANIRLPHME
       ::: :..:..::..::.:::.::::::.::.:::.:. ::..:::.::.:::::.::::.
CCDS77 MEADMIKLRTQITTMESNLKTIEEENKVIEQQNESLLHELANLSQSLIHSLANIQLPHMD
            1090      1100      1110      1120      1130      1140 

             1090      1100          1110      1120 
pF1KA0 PICEQNFDAYVSTLTDMYSNQD----PENKDLLESIKQAVRGIQV
       :: ::::::::.:::.::.:::    :::: :::.::::::::::
CCDS77 PINEQNFDAYVTTLTEMYTNQDRYQSPENKALLENIKQAVRGIQV
            1150      1160      1170      1180      

>>CCDS46222.1 MYT1L gene_id:23040|Hs108|chr2              (1184 aa)
 initn: 2422 init1: 1572 opt: 2645  Z-score: 1287.4  bits: 250.1 E(32554): 2.2e-65
Smith-Waterman score: 3212; 47.6% identity (68.0% similar) in 1217 aa overlap (28-1121:29-1184)

                10        20        30        40        50         
pF1KA0  MSLENEDKRARTRSKALRGPPETTAADLSCPTPGCTGSGHVRGKYSRHRSLQSCPLAKK
                                   .::::::: ::::: :::.::::. .::::::
CCDS46 MEVDTEEKRHRTRSKGVRVPVEPAIQELFSCPTPGCDGSGHVSGKYARHRSVYGCPLAKK
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80                              90       
pF1KA0 RKLEGAEAEHLVSKRKSHPLKL--------------------ALDEG--YGVDSD--GSE
       :: .  . .. . :::   .:                       :::  :. :.:  :.:
CCDS46 RKTQDKQPQEPAPKRKPFAVKADSSSVDECDDSDGTEDMDEKEEDEGEEYSEDNDEPGDE
               70        80        90       100       110       120

         100       110       120             130       140         
pF1KA0 DTEVKDASVSDESEGTLEGAEAETSGQD------EIHRPETAEGRSPVKSH---FGSNPI
       : : ....  .: :   :  . . .:.:      : .. :  : .   ..:     .. :
CCDS46 DEEDEEGDREEEEEIEEEDEDDDEDGEDVEDEEEEEEEEEEEEEEEENEDHQMNCHNTRI
              130       140       150       160       170       180

        150          160       170       180       190       200   
pF1KA0 GSATASSKGS---YSSYQGIIATSLLNLGQIAEETLVEEDLGQAAKPGPGIVHLLQEAAE
        . : .. ..   :..:. ..: ::::::.:::..  .      .. . .  . :.. ..
CCDS46 MQDTEKDDNNNDEYDNYDELVAKSLLNLGKIAEDAAYRART--ESEMNSNTSNSLEDDSD
              190       200       210       220         230        

           210       220        230                 240       250  
pF1KA0 GAASEEGEKGLFIQPEDAEEVVE-VTTER----------SQDLCPQSLEDAASEESSKQK
           . :.:. .    :.. : : : . .          :...  ..  :. :...:.. 
CCDS46 -KNENLGRKSELSLDLDSDVVRETVDSLKLLAQGHGVVLSENMNDRNYADSMSQQDSRNM
       240       250       260       270       280       290       

            260       270                280       290       300   
pF1KA0 GILSHEEEDEEEEEEEEEEEEDEE---------EEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEE
       . .   .  ..   :.  :: :::         ...  .  ..  : . .:.. ... . 
CCDS46 NYVMLGKPMNNGLMEKMVEESDEEVCLSSLECLRNQCFDLARKLSETNPQERNPQQNMNI
       300       310       320       330       340       350       

           310       320        330       340       350            
pF1KA0 EEEAAPDVIFQEDTSHTSAQKAPEL-RGPESPSPKPEYSVIVEVRSDD---DKDEDTHSR
       .... :.  :   :   . .   .: :  :. ::. .  :..   ..:   ..:.:: : 
CCDS46 RQHVRPEEDFPGRTPDRNYSDMLNLMRLEEQLSPRSR--VFASCAKEDGCHERDDDTTSV
       360       370       380       390         400       410     

     360       370       380       390       400                   
pF1KA0 KSTVTDESEMQDMMTRGNLGLLEQAIALKAEQVRTVCEPGCPPA----------EQSQLG
       .:   :.::    ::.::: :::.::::..:..... :     :          .::   
CCDS46 NS---DRSEEVFDMTKGNLTLLEKAIALETERAKAMREKMAMEAGRRDNMRSYEDQSPRQ
            420       430       440       450       460       470  

     410       420          430       440       450       460      
pF1KA0 LGEPGKAAKPLDT---VRKSYYSKDPSRAEKREIKCPTPGCDGTGHVTGLYPHHRSLSGC
       :  ::.  :: ..   :.: ::  ::::.::.: ::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 L--PGEDRKPKSSDSHVKKPYY--DPSRTEKKESKCPTPGCDGTGHVTGLYPHHRSLSGC
              480       490         500       510       520        

        470       480       490       500       510       520      
pF1KA0 PHKDRIPPEILAMHENVLKCPTPGCTGQGHVNSNRNTHRSLSGCPIAAAEKLAKSHEKQQ
       :::::.:::::::::.:::::::::::.::::::::.:::::::::::::::::..::.:
CCDS46 PHKDRVPPEILAMHESVLKCPTPGCTGRGHVNSNRNSHRSLSGCPIAAAEKLAKAQEKHQ
      530       540       550       560       570       580        

        530       540       550       560       570       580      
pF1KA0 PQTGDPSKSSSNSDRILRPMCFVKQLEVPPYGSYRPNVAPATPRANLAKELEKFSKVTFD
         . : ::::. :::.:::::::::::.: :: :: ::  .:::.::::::::.::..:.
CCDS46 --SCDVSKSSQASDRVLRPMCFVKQLEIPQYG-YRNNVPTTTPRSNLAKELEKYSKTSFE
        590       600       610        620       630       640     

        590       600       610                                    
pF1KA0 YASFDAQVFGKRMLAPKIQTSETSPKAFQ-----C-------------------------
       : :.: ...::: .:::.:: . :::...     :                         
CCDS46 YNSYDNHTYGKRAIAPKVQTRDISPKGYDDAKRYCKDPSPSSSSTSSYAPSSSSNLSCGG
         650       660       670       680       690       700     

                    620       630       640       650        660   
pF1KA0 ------------FDYSQDAEAAHMAATAILNLSTRCWEMPENLSTKPQDL-PSKSVDIEV
                   :::..: ::::::::::::::::: :::.:::::::::  ... :.::
CCDS46 GSSASSTCSKSSFDYTHDMEAAHMAATAILNLSTRCREMPQNLSTKPQDLCATRNPDMEV
         710       720       730       740       750       760     

           670       680       690       700       710       720   
pF1KA0 DENGTLDLSMHKHRKRENAFPSSSSCSSSPGVKSPDASQRHSSTSAPSSSMTSPQSSQAS
       ::::::::::.:.:      : .: :   : . .:   .     :  .... . .  : .
CCDS46 DENGTLDLSMNKQR------PRDSCC---P-ILTPLEPM-----SPQQQAVMNNRCFQLG
         770             780           790            800       810

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pF1KA0 RQDEWDRPLDYTK--PSRLREEEPEESEPAAHSFASSEADDQEVSEENFEERKYPGEVTL
       . : :: :.::::  : :. :.: ..  :          .: .  .: .:::.::::::.
CCDS46 EGDCWDLPVDYTKMKPRRIDEDESKDITP----------EDLDPFQEALEERRYPGEVTI
              820       830                 840       850       860

              790       800       810       820       830       840
pF1KA0 TNFKLKF-LSKDIKKELLTCPTPGCDGSGHITGNYASHRSLSGCPLADKSLRNLMAAHSA
        . : :.   :. ::.:.:                     ::::::::::.:...:. : 
CCDS46 PSPKPKYPQCKESKKDLIT---------------------LSGCPLADKSIRSMLATSSQ
              870                            880       890         

              850       860       870       880       890       900
pF1KA0 DLKCPTPGCDGSGHITGNYASHRSLSGCPRAKKSGVKVAPTKDDKEDPELMKCPVPGCVG
       .::::::::::::::::::::::::::::::::::...: .:.:::: : ..:::::: :
CCDS46 ELKCPTPGCDGSGHITGNYASHRSLSGCPRAKKSGIRIAQSKEDKEDQEPIRCPVPGCDG
     900       910       920       930       940       950         

              910       920       930       940       950       960
pF1KA0 LGHISGKYASHRSASGCPLAARRQKEGSLNGSSFSWKSLKNEGPTCPTPGCDGSGHANGS
        :::.::::::::::::::::.:::.: ::::.:::::.:.:: .:::::::::::..::
CCDS46 QGHITGKYASHRSASGCPLAAKRQKDGYLNGSQFSWKSVKTEGMSCPTPGCDGSGHVSGS
     960       970       980       990      1000      1010         

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KA0 FLTHRSLSGCPRATFAGKKGKLSGDEVLSPKFKTSDVLENDEEIKQLNQEIRDLNESNSE
       :::::::::::::: : ::.::::...:. : ..:. .:::::::::..::..::::::.
CCDS46 FLTHRSLSGCPRATSAMKKAKLSGEQMLTIKQRASNGIENDEEIKQLDEEIKELNESNSQ
    1020      1030      1040      1050      1060      1070         

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KA0 MEAAMVQLQSQISSMEKNLKNIEEENKLIEEQNEALFLELSGLSQALIQSLANIRLPHME
       ::: :..:..::..::.:::.::::::.::.:::.:. ::..:::.::.:::::.::::.
CCDS46 MEADMIKLRTQITTMESNLKTIEEENKVIEQQNESLLHELANLSQSLIHSLANIQLPHMD
    1080      1090      1100      1110      1120      1130         

             1090      1100          1110      1120 
pF1KA0 PICEQNFDAYVSTLTDMYSNQD----PENKDLLESIKQAVRGIQV
       :: ::::::::.:::.::.:::    :::: :::.::::::::::
CCDS46 PINEQNFDAYVTTLTEMYTNQDRYQSPENKALLENIKQAVRGIQV
    1140      1150      1160      1170      1180    

>>CCDS6149.1 ST18 gene_id:9705|Hs108|chr8                 (1047 aa)
 initn: 1953 init1: 699 opt: 2484  Z-score: 1210.9  bits: 235.8 E(32554): 4e-61
Smith-Waterman score: 2835; 45.4% identity (67.7% similar) in 1166 aa overlap (1-1121:1-1047)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MSLENEDKRARTRSKALRGPPETTAADLSCPTPGCTGSGHVRGKYSRHRSLQSCPLAKKR
       :. : :::  :::::. . : ..   .::                       .: .::::
CCDS61 MDAEAEDKTLRTRSKGTEVPMDSLIQELSVA--------------------YDCSMAKKR
               10        20        30                            40

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 KLEGAEAEHLVSKRKSHPLKLALDEGYGVDSDGSEDTEVKDASVSDESEGTLEGAEAETS
         :       :.::::  .:    . :.  .: .::      :   :..: :: ......
CCDS61 TAEDQALGVPVNKRKSLLMK---PRHYSPKADCQEDR-----SDRTEDDGPLE-THGHST
               50        60           70             80         90 

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 GQDEIHRPETAEGRSPVKSHFGSNPIGSATASSKGSYSSYQGIIATSLLNLGQIAEETLV
       ... . .:      : .. .         .. ..  :: :: ... ::..::.. ... :
CCDS61 AEEIMIKPMDESLLSTAQEN---------SSRKEDRYSCYQELMVKSLMHLGKFEKNVSV
             100       110                120       130       140  

                 190       200       210       220       230       
pF1KA0 E---EDLGQAAKPGPGIVHLLQEAAEGAASEEGEKGLFIQPEDAEEVVEVTTERSQDLCP
       .   :.:...     ::  :  :      :.:... ..:. .:... ..   . .  .: 
CCDS61 QTVSENLNDS-----GIQSLKAE------SDEADECFLIHSDDGRDKID---DSQPPFC-
            150            160             170       180           

       240       250       260       270       280       290       
pF1KA0 QSLEDAASEESSKQKGILSHEEEDEEEEEEEEEEEEDEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEE
        : .:  :.  : ..:  :  . .:: .  .  .    .....  :  : . : ..    
CCDS61 -SSDDNESNSESAENGWDSGSNFSEETKPPRVPKYVLTDHKKDLLEVPEIKTEGDKFIPC
        190       200       210       220       230       240      

       300       310       320       330       340       350       
pF1KA0 EEEEEEEEEAAPDVIFQEDTSHTSAQKAPELRGPESPSPKPEYSVIVEVRSDDDKDEDTH
       :.. . : :       ..: ... :.       : . . .: .         : ..::..
CCDS61 ENRCDSETE-------RKDPQNALAE-------PLDGNAQPSFP--------DVEEEDSE
        250              260              270               280    

       360       370       380       390       400       410       
pF1KA0 SRKSTVTDESEMQDMMTRGNLGLLEQAIALKAEQVRTVCEPGCPPAEQSQLGL----GEP
       :    . . :...   ..:::.::::::::.::.    :       : ... :    :: 
CCDS61 SLAVMTEEGSDLEK--AKGNLSLLEQAIALQAERG---CVFHNTYKELDRFLLEHLAGER
          290         300       310          320       330         

           420        430       440       450       460       470  
pF1KA0 GKAAKPLDTV-RKSYYSKDPSRAEKREIKCPTPGCDGTGHVTGLYPHHRSLSGCPHKDRI
        . .: .:   :. . .:   : :::: ::: ::::::::::::::::::::::::: :.
CCDS61 -RQTKVIDMGGRQIFNNKHSPRPEKRETKCPIPGCDGTGHVTGLYPHHRSLSGCPHKVRV
      340       350       360       370       380       390        

            480       490       500       510       520            
pF1KA0 PPEILAMHENVLKCPTPGCTGQGHVNSNRNTHRSLSGCPIAAAEKLAKSHEKQQ---PQT
       : :::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::: :..:.:   :::
CCDS61 PLEILAMHENVLKCPTPGCTGRGHVNSNRNTHRSLSGCPIAAAEKLAMSQDKNQLDSPQT
      400       410       420       430       440       450        

     530        540       550       560       570       580        
pF1KA0 GD-PSKSSSNSDRILRPMCFVKQLEVPPYGSYRPNVAPATPRANLAKELEKFSKVTFDYA
       :. :...  .:        .:::.:     .. :. : ..:::...:: :::.:: ::::
CCDS61 GQCPDQAHRTS--------LVKQIEF----NF-PSQAITSPRATVSKEQEKFGKVPFDYA
      460               470            480       490       500     

      590       600       610                                  620 
pF1KA0 SFDAQVFGKRMLAPKIQTSETSP----KAF-----------------------QCFDYSQ
       :::::::::: :   .:  .: :    : :                       . ..:.:
CCDS61 SFDAQVFGKRPLIQTVQGRKTPPFPESKHFPNPVKFPNRLPSAGAHTQSPGRASSYSYGQ
         510       520       530       540       550       560     

             630        640       650       660       670       680
pF1KA0 DAEAAHMAATA-ILNLSTRCWEMPENLSTKPQDLPSKSVDIEVDENGTLDLSMHKHRKRE
        .: .:.::.: :::::::: :  . ::.:::.: .:...:::::::::::::.:.:  .
CCDS61 CSEDTHIAAAAAILNLSTRCREATDILSNKPQSLHAKGAEIEVDENGTLDLSMKKNRILD
         570       580       590       600       610       620     

              690       700       710       720        730         
pF1KA0 NAFPSSSSCSSSPGVKSPDASQRHSSTSAPSSSMTSPQSSQA-SRQDEWDRPLDYTKPSR
       .. : .:: .: :   .:..:  ..:     : ...    ::   :. :: :..:.: ..
CCDS61 KSAPLTSSNTSIP---TPSSSPFKTS-----SILVNAAFYQALCDQEGWDTPINYSK-TH
         630          640            650       660       670       

     740       750       760       770       780       790         
pF1KA0 LREEEPEESEPAAHSFASSEADDQEVSEENFEERKYPGEVTLTNFKLKFLSKDIKKELLT
        . :: .:..:..             : ::.::.:.:::... . : :. ..:.::::.:
CCDS61 GKTEEEKEKDPVS-------------SLENLEEKKFPGEASIPSPKPKLHARDLKKELIT
        680                    690       700       710       720   

     800       810       820       830       840       850         
pF1KA0 CPTPGCDGSGHITGNYASHRSLSGCPLADKSLRNLMAAHSADLKCPTPGCDGSGHITGNY
       :::::::::::.:::::::::.::::::::.:..::::.: .:::::::::::::.::::
CCDS61 CPTPGCDGSGHVTGNYASHRSVSGCPLADKTLKSLMAANSQELKCPTPGCDGSGHVTGNY
           730       740       750       760       770       780   

     860       870       880       890       900       910         
pF1KA0 ASHRSLSGCPRAKKSGVKVAPTKDDKEDPELMKCPVPGCVGLGHISGKYASHRSASGCPL
       ::::::::::::.:.:::..:::..:::::: :::: :: : :::::::.:::.::::::
CCDS61 ASHRSLSGCPRARKGGVKMTPTKEEKEDPEL-KCPVIGCDGQGHISGKYTSHRTASGCPL
           790       800       810        820       830       840  

     920       930       940       950       960       970         
pF1KA0 AARRQKEGSLNGSSFSWKSLKNEGPTCPTPGCDGSGHANGSFLTHRSLSGCPRATFAGKK
       ::.::::. :::.:.:::  :.: : :: :::.: ::.:. :.:::::::::  . . ::
CCDS61 AAKRQKENPLNGASLSWKLNKQELPHCPLPGCNGLGHVNNVFVTHRSLSGCPLNAQVIKK
            850       860       870       880       890       900  

     980       990      1000      1010      1020      1030         
pF1KA0 GKLSGDEVLSPKFKTSDVLENDEEIKQLNQEIRDLNESNSEMEAAMVQLQSQISSMEKNL
       ::.: .:... :.:..  .:.::::..:..::..::::: ..:: :..::.::.:::.::
CCDS61 GKVS-EELMTIKLKATGGIESDEEIRHLDEEIKELNESNLKIEADMMKLQTQITSMESNL
             910       920       930       940       950       960 

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pF1KA0 KNIEEENKLIEEQNEALFLELSGLSQALIQSLANIRLPHMEPICEQNFDAYVSTLTDMYS
       :.:::::::::..::.:. ::.:::::::.:::.:.::.: :: ::::.:::.:::::::
CCDS61 KTIEEENKLIEQNNESLLKELAGLSQALISSLADIQLPQMGPISEQNFEAYVNTLTDMYS
             970       980       990      1000      1010      1020 

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pF1KA0 NQD----PENKDLLESIKQAVRGIQV
       : .    :: : :::::::::.::.:
CCDS61 NLERDYSPECKALLESIKQAVKGIHV
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1121 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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