Result of FASTA (ccds) for pF1KA0829
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA0829, 1230 aa
  1>>>pF1KA0829 1230 - 1230 aa - 1230 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8921+/-0.00126; mu= 20.4267+/- 0.076
 mean_var=86.8738+/-16.851, 0's: 0 Z-trim(102.3): 48  B-trim: 21 in 1/49
 Lambda= 0.137604
 statistics sampled from 6856 (6872) to 6856 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.558), E-opt: 0.2 (0.211), width:  16
 Scan time:  5.120

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS8977.1 CAND1 gene_id:55832|Hs108|chr12         (1230) 7917 1582.9       0
CCDS54554.1 CAND2 gene_id:23066|Hs108|chr3         (1236) 5192 1041.9       0
CCDS43053.1 CAND2 gene_id:23066|Hs108|chr3         (1119) 3141 634.8 3.7e-181


>>CCDS8977.1 CAND1 gene_id:55832|Hs108|chr12              (1230 aa)
 initn: 7917 init1: 7917 opt: 7917  Z-score: 8489.3  bits: 1582.9 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 7917; 100.0% identity (100.0% similar) in 1230 aa overlap (1-1230:1-1230)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MASASYHISNLLEKMTSSDKDFRFMATNDLMTELQKDSIKLDDDSERKVVKMILKLLEDK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 MASASYHISNLLEKMTSSDKDFRFMATNDLMTELQKDSIKLDDDSERKVVKMILKLLEDK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 NGEVQNLAVKCLGPLVSKVKEYQVETIVDTLCTNMLSDKEQLRDISSIGLKTVIGELPPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 NGEVQNLAVKCLGPLVSKVKEYQVETIVDTLCTNMLSDKEQLRDISSIGLKTVIGELPPA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 SSGSALAANVCKKITGRLTSAIAKQEDVSVQLEALDIMADMLSRQGGLLVNFHPSILTCL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 SSGSALAANVCKKITGRLTSAIAKQEDVSVQLEALDIMADMLSRQGGLLVNFHPSILTCL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 LPQLTSPRLAVRKRTIIALGHLVMSCGNIVFVDLIEHLLSELSKNDSMSTTRTYIQCIAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 LPQLTSPRLAVRKRTIIALGHLVMSCGNIVFVDLIEHLLSELSKNDSMSTTRTYIQCIAA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 ISRQAGHRIGEYLEKIIPLVVKFCNVDDDELREYCIQAFESFVRRCPKEVYPHVSTIINI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 ISRQAGHRIGEYLEKIIPLVVKFCNVDDDELREYCIQAFESFVRRCPKEVYPHVSTIINI
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 CLKYLTYDPNYNYDDEDEDENAMDADGGDDDDQGSDDEYSDDDDMSWKVRRAAAKCLDAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 CLKYLTYDPNYNYDDEDEDENAMDADGGDDDDQGSDDEYSDDDDMSWKVRRAAAKCLDAV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 VSTRHEMLPEFYKTVSPALISRFKEREENVKADVFHAYLSLLKQTRPVQSWLCDPDAMEQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 VSTRHEMLPEFYKTVSPALISRFKEREENVKADVFHAYLSLLKQTRPVQSWLCDPDAMEQ
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 GETPLTMLQSQVPNIVKALHKQMKEKSVKTRQCCFNMLTELVNVLPGALTQHIPVLVPGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 GETPLTMLQSQVPNIVKALHKQMKEKSVKTRQCCFNMLTELVNVLPGALTQHIPVLVPGI
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 IFSLNDKSSSSNLKIDALSCLYVILCNHSPQVFHPHVQALVPPVVACVGDPFYKITSEAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 IFSLNDKSSSSNLKIDALSCLYVILCNHSPQVFHPHVQALVPPVVACVGDPFYKITSEAL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA0 LVTQQLVKVIRPLDQPSSFDATPYIKDLFTCTIKRLKAADIDQEVKERAISCMGQIICNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 LVTQQLVKVIRPLDQPSSFDATPYIKDLFTCTIKRLKAADIDQEVKERAISCMGQIICNL
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA0 GDNLGSDLPNTLQIFLERLKNEITRLTTVKALTLIAGSPLKIDLRPVLGEGVPILASFLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 GDNLGSDLPNTLQIFLERLKNEITRLTTVKALTLIAGSPLKIDLRPVLGEGVPILASFLR
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA0 KNQRALKLGTLSALDILIKNYSDSLTAAMIDAVLDELPPLISESDMHVSQMAISFLTTLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 KNQRALKLGTLSALDILIKNYSDSLTAAMIDAVLDELPPLISESDMHVSQMAISFLTTLA
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KA0 KVYPSSLSKISGSILNELIGLVRSPLLQGGALSAMLDFFQALVVTGTNNLGYMDLLRMLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 KVYPSSLSKISGSILNELIGLVRSPLLQGGALSAMLDFFQALVVTGTNNLGYMDLLRMLT
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KA0 GPVYSQSTALTHKQSYYSIAKCVAALTRACPKEGPAVVGQFIQDVKNSRSTDSIRLLALL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 GPVYSQSTALTHKQSYYSIAKCVAALTRACPKEGPAVVGQFIQDVKNSRSTDSIRLLALL
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KA0 SLGEVGHHIDLSGQLELKSVILEAFSSPSEEVKSAASYALGSISVGNLPEYLPFVLQEIT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 SLGEVGHHIDLSGQLELKSVILEAFSSPSEEVKSAASYALGSISVGNLPEYLPFVLQEIT
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KA0 SQPKRQYLLLHSLKEIISSASVVGLKPYVENIWALLLKHCECAEEGTRNVVAECLGKLTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 SQPKRQYLLLHSLKEIISSASVVGLKPYVENIWALLLKHCECAEEGTRNVVAECLGKLTL
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KA0 IDPETLLPRLKGYLISGSSYARSSVVTAVKFTISDHPQPIDPLLKNCIGDFLKTLEDPDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 IDPETLLPRLKGYLISGSSYARSSVVTAVKFTISDHPQPIDPLLKNCIGDFLKTLEDPDL
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KA0 NVRRVALVTFNSAAHNKPSLIRDLLDTVLPHLYNETKVRKELIREVEMGPFKHTVDDGLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 NVRRVALVTFNSAAHNKPSLIRDLLDTVLPHLYNETKVRKELIREVEMGPFKHTVDDGLD
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KA0 IRKAAFECMYTLLDSCLDRLDIFEFLNHVEDGLKDHYDIKMLTFLMLVRLSTLCPSAVLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 IRKAAFECMYTLLDSCLDRLDIFEFLNHVEDGLKDHYDIKMLTFLMLVRLSTLCPSAVLQ
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KA0 RLDRLVEPLRATCTTKVKANSVKQEFEKQDELKRSAMRAVAALLTIPEAEKSPLMSEFQS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 RLDRLVEPLRATCTTKVKANSVKQEFEKQDELKRSAMRAVAALLTIPEAEKSPLMSEFQS
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230
pF1KA0 QISSNPELAAIFESIQKDSSSTNLESMDTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 QISSNPELAAIFESIQKDSSSTNLESMDTS
             1210      1220      1230

>>CCDS54554.1 CAND2 gene_id:23066|Hs108|chr3              (1236 aa)
 initn: 4800 init1: 1985 opt: 5192  Z-score: 5565.7  bits: 1041.9 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5192; 62.4% identity (87.4% similar) in 1237 aa overlap (1-1230:1-1236)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MASASYHISNLLEKMTSSDKDFRFMATNDLMTELQKDSIKLDDDSERKVVKMILKLLEDK
       :..:..:::.:::::::::::::::::.:::.:::::::.::.:::::::::.:.:::::
CCDS54 MSTAAFHISSLLEKMTSSDKDFRFMATSDLMSELQKDSIQLDEDSERKVVKMLLRLLEDK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 NGEVQNLAVKCLGPLVSKVKEYQVETIVDTLCTNMLSDKEQLRDISSIGLKTVIGELPPA
       :::::::::::::::: :::::::::::::::::: :::::::::..::::::..:::::
CCDS54 NGEVQNLAVKCLGPLVVKVKEYQVETIVDTLCTNMRSDKEQLRDIAGIGLKTVLSELPPA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 SSGSALAANVCKKITGRLTSAIAKQEDVSVQLEALDIMADMLSRQGGLLVNFHPSILTCL
       ..::.::.:::.::::.::::::.::::.::::::::..::::: :  :  :: :.: ::
CCDS54 ATGSGLATNVCRKITGQLTSAIAQQEDVAVQLEALDILSDMLSRLGVPLGAFHASLLHCL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220          230       
pF1KA0 LPQLTSPRLAVRKRTIIALGHLVMSCGNIVFVDLIEHLLSELSKN---DSMSTTRTYIQC
       ::::.:::::::::.. :::::. .:.. .::.: .:::..:       : .. :: :::
CCDS54 LPQLSSPRLAVRKRAVGALGHLAAACSTDLFVELADHLLDRLPGPRVPTSPTAIRTLIQC
              190       200       210       220       230       240

       240       250       260       270       280       290       
pF1KA0 IAAISRQAGHRIGEYLEKIIPLVVKFCNVDDDELREYCIQAFESFVRRCPKEVYPHVSTI
       .....::::::.: .:....:::  :::.::::::: :.::::.:.:.::::. ::: ..
CCDS54 LGSVGRQAGHRLGAHLDRLVPLVEDFCNLDDDELRESCLQAFEAFLRKCPKEMGPHVPNV
              250       260       270       280       290       300

       300       310       320       330       340       350       
pF1KA0 INICLKYLTYDPNYNYDDEDEDENAMDADGGDDDDQGSDDEYSDDDDMSWKVRRAAAKCL
        ..::.:. .:::::::. ::::. :... .. ..: :.::::::::::::::::::::.
CCDS54 TSLCLQYIKHDPNYNYDS-DEDEEQMETEDSEFSEQESEDEYSDDDDMSWKVRRAAAKCI
              310        320       330       340       350         

       360       370       380       390       400       410       
pF1KA0 DAVVSTRHEMLPEFYKTVSPALISRFKEREENVKADVFHAYLSLLKQTRPVQSWLCDPDA
        :..:.: ..::.:. :..:.:: :::::::::::::: ::. ::.::.: ..::   . 
CCDS54 AALISSRPDLLPDFHCTLAPVLIRRFKEREENVKADVFTAYIVLLRQTQPPKGWLEAMEE
     360       370       380       390       400       410         

       420       430       440       450       460       470       
pF1KA0 MEQGETPLTMLQSQVPNIVKALHKQMKEKSVKTRQCCFNMLTELVNVLPGALTQHIPVLV
         :  . : ::..::: .::::..:.:..::..:: ::..::::..::::.:..:.::::
CCDS54 PTQTGSNLHMLRGQVPLVVKALQRQLKDRSVRARQGCFSLLTELAGVLPGSLAEHMPVLV
     420       430       440       450       460       470         

       480       490       500       510       520       530       
pF1KA0 PGIIFSLNDKSSSSNLKIDALSCLYVILCNHSPQVFHPHVQALVPPVVACVGDPFYKITS
        :::::: :.::::....:::. :  .: ..  ..::::.  :.:::.:::.: ::::..
CCDS54 SGIIFSLADRSSSSTIRMDALAFLQGLLGTEPAEAFHPHLPILLPPVMACVADSFYKIAA
     480       490       500       510       520       530         

       540       550       560       570       580       590       
pF1KA0 EALLVTQQLVKVIRPLDQPSSFDATPYIKDLFTCTIKRLKAADIDQEVKERAISCMGQII
       :::.: :.::... :: .:  .:  ::. .. . :. ::.:.:.:::::::::::::...
CCDS54 EALVVLQELVRALWPLHRPRMLDPEPYVGEMSAVTLARLRATDLDQEVKERAISCMGHLV
     540       550       560       570       580       590         

       600       610       620       630       640       650       
pF1KA0 CNLGDNLGSDLPNTLQIFLERLKNEITRLTTVKALTLIAGSPLKIDLRPVLGEGVPILAS
        .::: ::.::  :: ..:.::.:::::: ..:::::.: :::..::.:.:.:.. ::::
CCDS54 GHLGDRLGDDLEPTLLLLLDRLRNEITRLPAIKALTLVAVSPLQLDLQPILAEALHILAS
     600       610       620       630       640       650         

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pF1KA0 FLRKNQRALKLGTLSALDILIKNYSDSLTAAMIDAVLDELPPLISESDMHVSQMAISFLT
       :::::::::.:.::.::: : .. . ::  . ..::: ::: :..::::::.:.:..::.
CCDS54 FLRKNQRALRLATLAALDALAQSQGLSLPPSAVQAVLAELPALVNESDMHVAQLAVDFLA
     660       670       680       690       700       710         

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pF1KA0 TLAKVYPSSLSKISGSILNELIGLVRSPLLQGGALSAMLDFFQALVVTGTNNLGYMDLLR
       :.... :.:: ..:: .:.::. :.::::: .:.:.:   :.:::: :    . :  :. 
CCDS54 TVTQAQPASLVEVSGPVLSELLRLLRSPLLPAGVLAAAEGFLQALVGTRPPCVDYAKLIS
     720       730       740       750       760       770         

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pF1KA0 MLTGPVYSQST---ALTHKQSYYSIAKCVAALTRACPKEGPAVVGQFIQDVKNSRSTDSI
       .::.::: :..      ::: ..:.:.:::::. :::.:. ....... :... .:. ..
CCDS54 LLTAPVYEQAVDGGPGLHKQVFHSLARCVAALSAACPQEAASTASRLVCDARSPHSSTGV
     780       790       800       810       820       830         

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pF1KA0 RLLALLSLGEVGHHIDLSGQLELKSVILEAFSSPSEEVKSAASYALGSISVGNLPEYLPF
       ..::.:::.:::.    . : :::.:.:::..::::.:..::::::: ...:.::..:::
CCDS54 KVLAFLSLAEVGQVAGPGHQRELKAVLLEALGSPSEDVRAAASYALGRVGAGSLPDFLPF
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pF1KA0 VLQEITSQPKRQYLLLHSLKEIISSASVVGLKPYVENIWALLLKHCECAEEGTRNVVAEC
       .:..: ..:.:::::::::.: ...:.  .::::.:.:::::...:: ::::::.:::::
CCDS54 LLEQIEAEPRRQYLLLHSLREALGAAQPDSLKPYAEDIWALLFQRCEGAEEGTRGVVAEC
     900       910       920       930       940       950         

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pF1KA0 LGKLTLIDPETLLPRLKGYLISGSSYARSSVVTAVKFTISDHPQPIDPLLKNCIGDFLKT
       .:::.:..:  :::::.  : .:  ..::.:.::::: :::.:.:::::::. ::.:...
CCDS54 IGKLVLVNPSFLLPRLRKQLAAGRPHTRSTVITAVKFLISDQPHPIDPLLKSFIGEFMES
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pF1KA0 LEDPDLNVRRVALVTFNSAAHNKPSLIRDLLDTVLPHLYNETKVRKELIREVEMGPFKHT
       :.::::::::..:. ::::.::::::.::::: .:: ::.:::.:..:::::::::::::
CCDS54 LQDPDLNVRRATLAFFNSAVHNKPSLVRDLLDDILPLLYQETKIRRDLIREVEMGPFKHT
    1020      1030      1040      1050      1060      1070         

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pF1KA0 VDDGLDIRKAAFECMYTLLDSCLDRLDIFEFLNHVEDGLKDHYDIKMLTFLMLVRLSTLC
       ::::::.:::::::::.::.::: .::: ::::::::::::::::.::::.:..::.:::
CCDS54 VDDGLDVRKAAFECMYSLLESCLGQLDICEFLNHVEDGLKDHYDIRMLTFIMVARLATLC
    1080      1090      1100      1110      1120      1130         

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pF1KA0 PSAVLQRLDRLVEPLRATCTTKVKANSVKQEFEKQDELKRSAMRAVAALLTIPEAEKSPL
       :. ::::.:::.::::::::.::::.::::::::::::::::::::::::::::. :::.
CCDS54 PAPVLQRVDRLIEPLRATCTAKVKAGSVKQEFEKQDELKRSAMRAVAALLTIPEVGKSPI
    1140      1150      1160      1170      1180      1190         

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pF1KA0 MSEFQSQISSNPELAAIFESIQKDSSST-NLESMDTS
       :..:.::: :::::::.::::::::.:. . .::. :
CCDS54 MADFSSQIRSNPELAALFESIQKDSASAPSTDSMELS
    1200      1210      1220      1230      

>>CCDS43053.1 CAND2 gene_id:23066|Hs108|chr3              (1119 aa)
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pF1KA0 MASASYHISNLLEKMTSSDKDFRFMATNDLMTELQKDSIKLDDDSERKVVKMILKLLEDK
       :..:..:::.:::::::::::::::::.:::.:::::::.::.:::::::::.:.:::::
CCDS43 MSTAAFHISSLLEKMTSSDKDFRFMATSDLMSELQKDSIQLDEDSERKVVKMLLRLLEDK
               10        20        30        40        50        60

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pF1KA0 NGEVQNLAVKCLGPLVSKVKEYQVETIVDTLCTNMLSDKEQLRDISSIGLKTVIGELPPA
       :::::::::: ::                                               
CCDS43 NGEVQNLAVKWLG-----------------------------------------------
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pF1KA0 SSGSALAANVCKKITGRLTSAIAKQEDVSVQLEALDIMADMLSRQGGLLVNFHPSILTCL
                                    : : :                 :: :.: ::
CCDS43 -----------------------------VPLGA-----------------FHASLLHCL
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pF1KA0 LPQLTSPRLAVRKRTIIALGHLVMSCGNIVFVDLIEHLLSELSKN---DSMSTTRTYIQC
       ::::.:::::::::.. :::::. .:.. .::.: .:::..:       : .. :: :::
CCDS43 LPQLSSPRLAVRKRAVGALGHLAAACSTDLFVELADHLLDRLPGPRVPTSPTAIRTLIQC
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pF1KA0 IAAISRQAGHRIGEYLEKIIPLVVKFCNVDDDELREYCIQAFESFVRRCPKEVYPHVSTI
       .....::::::.: .:....:::  :::.::::::: :.::::.:.:.::::. ::: ..
CCDS43 LGSVGRQAGHRLGAHLDRLVPLVEDFCNLDDDELRESCLQAFEAFLRKCPKEMGPHVPNV
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pF1KA0 INICLKYLTYDPNYNYDDEDEDENAMDADGGDDDDQGSDDEYSDDDDMSWKVRRAAAKCL
        ..::.:. .:::::::. ::::. :... .. ..: :.::::::::::::::::::::.
CCDS43 TSLCLQYIKHDPNYNYDS-DEDEEQMETEDSEFSEQESEDEYSDDDDMSWKVRRAAAKCI
       210       220        230       240       250       260      

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pF1KA0 DAVVSTRHEMLPEFYKTVSPALISRFKEREENVKADVFHAYLSLLKQTRPVQSWLCDPDA
        :..:.: ..::.:. :..:.:: :::::::::::::: ::. ::.::.: ..::   . 
CCDS43 AALISSRPDLLPDFHCTLAPVLIRRFKEREENVKADVFTAYIVLLRQTQPPKGWLEAMEE
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pF1KA0 MEQGETPLTMLQSQVPNIVKALHKQMKEKSVKTRQCCFNMLTELVNVLPGALTQHIPVLV
         :  . : ::..::: .::::..:.:..::..:: ::..::::..::::.:..:.::::
CCDS43 PTQTGSNLHMLRGQVPLVVKALQRQLKDRSVRARQGCFSLLTELAGVLPGSLAEHMPVLV
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pF1KA0 PGIIFSLNDKSSSSNLKIDALSCLYVILCNHSPQVFHPHVQALVPPVVACVGDPFYKITS
        :::::: :.::::....:::. :  .: ..  ..::::.  :.:::.:::.: ::::..
CCDS43 SGIIFSLADRSSSSTIRMDALAFLQGLLGTEPAEAFHPHLPILLPPVMACVADSFYKIAA
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pF1KA0 EALLVTQQLVKVIRPLDQPSSFDATPYIKDLFTCTIKRLKAADIDQEVKERAISCMGQII
       :::.: :.::... :: .:  .:  ::. .. . :. ::.:.:.:::::::::::::...
CCDS43 EALVVLQELVRALWPLHRPRMLDPEPYVGEMSAVTLARLRATDLDQEVKERAISCMGHLV
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pF1KA0 CNLGDNLGSDLPNTLQIFLERLKNEITRLTTVKALTLIAGSPLKIDLRPVLGEGVPILAS
        .::: ::.::  :: ..:.::.:::::: ..:::::.: :::..::.:.:.:.. ::::
CCDS43 GHLGDRLGDDLEPTLLLLLDRLRNEITRLPAIKALTLVAVSPLQLDLQPILAEALHILAS
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pF1KA0 FLRKNQRALKLGTLSALDILIKNYSDSLTAAMIDAVLDELPPLISESDMHVSQMAISFLT
       :::::::::.:.::.::: : .. . ::  . ..::: ::: :..::::::.:.:..::.
CCDS43 FLRKNQRALRLATLAALDALAQSQGLSLPPSAVQAVLAELPALVNESDMHVAQLAVDFLA
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pF1KA0 TLAKVYPSSLSKISGSILNELIGLVRSPLLQGGALSAMLDFFQALVVTGTNNLGYMDLLR
       :.... :.:: ..:: .:.::. :.::::: .:.:.:   :.:::: :    . :  :. 
CCDS43 TVTQAQPASLVEVSGPVLSELLRLLRSPLLPAGVLAAAEGFLQALVGTRPPCVDYAKLIS
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CCDS43 LLTAPVYEQAVDGGPGLHKQVFHSLARCVAALSAACPQEAASTASRLVCDARSPHSSTGV
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       ..::.:::.:::.    . : :::.:.:::..::::.:..::::::: ...:.::..:::
CCDS43 KVLAFLSLAEVGQVAGPGHQRELKAVLLEALGSPSEDVRAAASYALGRVGAGSLPDFLPF
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       .:..: ..:.:::::::::.: ...:.  .::::.:.:::::...:: ::::::.:::::
CCDS43 LLEQIEAEPRRQYLLLHSLREALGAAQPDSLKPYAEDIWALLFQRCEGAEEGTRGVVAEC
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pF1KA0 LGKLTLIDPETLLPRLKGYLISGSSYARSSVVTAVKFTISDHPQPIDPLLKNCIGDFLKT
       .:::.:..:  :::::.  : .:  ..::.:.::::: :::.:.:::::::. :      
CCDS43 IGKLVLVNPSFLLPRLRKQLAAGRPHTRSTVITAVKFLISDQPHPIDPLLKSFI------
        870       880       890       900       910       920      

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pF1KA0 LEDPDLNVRRVALVTFNSAAHNKPSLIRDLLDTVLPHLYNETKVRKELIREVEMGPFKHT
                         :.::::::.::::: .:: ::.:::.:..:::::::::::::
CCDS43 ------------------AVHNKPSLVRDLLDDILPLLYQETKIRRDLIREVEMGPFKHT
                                930       940       950       960  

         1080      1090      1100      1110      1120      1130    
pF1KA0 VDDGLDIRKAAFECMYTLLDSCLDRLDIFEFLNHVEDGLKDHYDIKMLTFLMLVRLSTLC
       ::::::.:::::::::.::.::: .::: ::::::::::::::::.::::.:..::.:::
CCDS43 VDDGLDVRKAAFECMYSLLESCLGQLDICEFLNHVEDGLKDHYDIRMLTFIMVARLATLC
            970       980       990      1000      1010      1020  

         1140      1150      1160      1170      1180      1190    
pF1KA0 PSAVLQRLDRLVEPLRATCTTKVKANSVKQEFEKQDELKRSAMRAVAALLTIPEAEKSPL
       :. ::::.:::.::::::::.::::.::::::::::::::::::::::::::::. :::.
CCDS43 PAPVLQRVDRLIEPLRATCTAKVKAGSVKQEFEKQDELKRSAMRAVAALLTIPEVGKSPI
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pF1KA0 MSEFQSQISSNPELAAIFESIQKDSSST-NLESMDTS
       :..:.::: :::::::.::::::::.:. . .::. :
CCDS43 MADFSSQIRSNPELAALFESIQKDSASAPSTDSMELS
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1230 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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 start: Thu Nov  3 10:23:05 2016 done: Thu Nov  3 10:23:05 2016
 Total Scan time:  5.120 Total Display time:  0.220

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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