Result of FASTA (ccds) for pF1KA0751
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA0751, 1188 aa
  1>>>pF1KA0751 1188 - 1188 aa - 1188 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.3573+/-0.00105; mu= 4.1186+/- 0.063
 mean_var=220.5186+/-46.169, 0's: 0 Z-trim(111.3): 83  B-trim: 203 in 1/50
 Lambda= 0.086368
 statistics sampled from 12185 (12263) to 12185 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.701), E-opt: 0.2 (0.377), width:  16
 Scan time:  5.400

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS64948.1 RIMS2 gene_id:9699|Hs108|chr8          (1188) 7951 1004.6       0
CCDS55269.1 RIMS2 gene_id:9699|Hs108|chr8          (1349) 4118 527.0 1.1e-148
CCDS55029.1 RIMS1 gene_id:22999|Hs108|chr6         ( 817) 3493 449.0 2.1e-125
CCDS43761.1 RIMS2 gene_id:9699|Hs108|chr8          (1163) 3069 396.3 2.3e-109
CCDS55030.1 RIMS1 gene_id:22999|Hs108|chr6         (1012) 2158 282.7   3e-75
CCDS47449.1 RIMS1 gene_id:22999|Hs108|chr6         (1692) 2125 278.8 7.8e-74
CCDS55031.1 RIMS1 gene_id:22999|Hs108|chr6         ( 826) 2117 277.6 8.8e-74
CCDS55032.1 RIMS1 gene_id:22999|Hs108|chr6         ( 760) 1973 259.6 2.1e-68
CCDS64949.1 RIMS2 gene_id:9699|Hs108|chr8          ( 285) 1546 206.1 9.7e-53
CCDS55033.1 RIMS1 gene_id:22999|Hs108|chr6         ( 219) 1232 166.9 4.7e-41
CCDS30687.1 RIMS3 gene_id:9783|Hs108|chr1          ( 308) 1145 156.2 1.1e-37
CCDS13338.1 RIMS4 gene_id:140730|Hs108|chr20       ( 269) 1084 148.6   2e-35
CCDS56191.1 RIMS4 gene_id:140730|Hs108|chr20       ( 270) 1082 148.3 2.4e-35


>>CCDS64948.1 RIMS2 gene_id:9699|Hs108|chr8               (1188 aa)
 initn: 7951 init1: 7951 opt: 7951  Z-score: 5364.5  bits: 1004.6 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 7951; 100.0% identity (100.0% similar) in 1188 aa overlap (1-1188:1-1188)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MQFETLRQVCNSVLSHFHGVFSSPPNILQNELFGQTLNNARKRSPSVSRDQNRRYDQREE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 MQFETLRQVCNSVLSHFHGVFSSPPNILQNELFGQTLNNARKRSPSVSRDQNRRYDQREE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 REEYSQYATSDTAMPRSPSDYADRRSQHEPQFYEDSDHLSYRDSNRRSHRHSKEYIVDDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 REEYSQYATSDTAMPRSPSDYADRRSQHEPQFYEDSDHLSYRDSNRRSHRHSKEYIVDDE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 DVESRDEYERQRREEEYQSRYRSDPNLARYPVKPQPYEEQMRIHAEVSRARHERRHSDVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 DVESRDEYERQRREEEYQSRYRSDPNLARYPVKPQPYEEQMRIHAEVSRARHERRHSDVS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 LANADLEDSRISMLRMDRPSRQRSISERRAAMENQRSYSMERTREAQGPSSYAQRTTNHS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 LANADLEDSRISMLRMDRPSRQRSISERRAAMENQRSYSMERTREAQGPSSYAQRTTNHS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 PPTPRRSPLPIDRPDLRRTDSLRKQHHLDPSSAVRKTKREKMETMLRNDSLSSDQSESVR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 PPTPRRSPLPIDRPDLRRTDSLRKQHHLDPSSAVRKTKREKMETMLRNDSLSSDQSESVR
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 PPPPKPHKSKKGGKMRQISLSSSEEELASTPEYTSCDDVEIESESVSEKGDSQKGKRKTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 PPPPKPHKSKKGGKMRQISLSSSEEELASTPEYTSCDDVEIESESVSEKGDSQKGKRKTS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 EQAVLSDSNTRSERQKEMMYFGGHSLEEDLEWSEPQIKDSGVDTCSSTTLNEEHSHSDKH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 EQAVLSDSNTRSERQKEMMYFGGHSLEEDLEWSEPQIKDSGVDTCSSTTLNEEHSHSDKH
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 PVTWQPSKDGDRLIGRILLNKRLKDGSVPRDSGAMLGLKVVGGKMTESGRLCAFITKVKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 PVTWQPSKDGDRLIGRILLNKRLKDGSVPRDSGAMLGLKVVGGKMTESGRLCAFITKVKK
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 GSLADTVGHLRPGDEVLEWNGRLLQGATFEEVYNIILESKPEPQVELVVSRPIGDIPRIP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 GSLADTVGHLRPGDEVLEWNGRLLQGATFEEVYNIILESKPEPQVELVVSRPIGDIPRIP
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA0 DSTHAQLESSSSSFESQKMDRPSISVTSPMSPGMLRDVPQFLSGQLSIKLWFDKVGHQLI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 DSTHAQLESSSSSFESQKMDRPSISVTSPMSPGMLRDVPQFLSGQLSIKLWFDKVGHQLI
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA0 VTILGAKDLPSREDGRPRNPYVKIYFLPDRSDKNKRRTKTVKKTLEPKWNQTFIYSPVHR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 VTILGAKDLPSREDGRPRNPYVKIYFLPDRSDKNKRRTKTVKKTLEPKWNQTFIYSPVHR
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA0 REFRERMLEITLWDQARVREEESEFLGEILIELETALLDDEPHWYKLQTHDVSSLPLPHP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 REFRERMLEITLWDQARVREEESEFLGEILIELETALLDDEPHWYKLQTHDVSSLPLPHP
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KA0 SPYMPRRQLHGESPTRRLQRSKRISDSEVSDYDCDDGIGVVSDYRHDGRDLQSSTLSVPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 SPYMPRRQLHGESPTRRLQRSKRISDSEVSDYDCDDGIGVVSDYRHDGRDLQSSTLSVPE
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KA0 QVMSSNHCSPSGSPHRVDVIGRTRSWSPSVPPPQSRNVEQGLRGTRTMTGHYNTISRMDR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 QVMSSNHCSPSGSPHRVDVIGRTRSWSPSVPPPQSRNVEQGLRGTRTMTGHYNTISRMDR
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KA0 HRVMDDHYSPDRDRDCEAADRQPYHRSRSTEQRPLLERTTTRSRSTERPDTNLMRSMPSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 HRVMDDHYSPDRDRDCEAADRQPYHRSRSTEQRPLLERTTTRSRSTERPDTNLMRSMPSL
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KA0 MTGRSAPPSPALSRSHPRTGSVQTSPSSTPVAGRRGRQLPQLPPKGTLDRKAGGKKLRST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 MTGRSAPPSPALSRSHPRTGSVQTSPSSTPVAGRRGRQLPQLPPKGTLDRKAGGKKLRST
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KA0 VQRSTETGLAVEMRNWMTRQASRESTDGSMNSYSSEGNLIFPGVRLASDSQFSDFLDGLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 VQRSTETGLAVEMRNWMTRQASRESTDGSMNSYSSEGNLIFPGVRLASDSQFSDFLDGLG
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KA0 PAQLVGRQTLATPAMGDIQVGMMDKKGQLEVEIIRARGLVVKPGSKTLPAPYVKVYLLDN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 PAQLVGRQTLATPAMGDIQVGMMDKKGQLEVEIIRARGLVVKPGSKTLPAPYVKVYLLDN
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KA0 GVCIAKKKTKVARKTLEPLYQQLLSFEESPQGKVLQIIVWGDYGRMDHKSFMGVAQILLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 GVCIAKKKTKVARKTLEPLYQQLLSFEESPQGKVLQIIVWGDYGRMDHKSFMGVAQILLD
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180        
pF1KA0 ELELSNMVIGWFKLFPPSSLVDPTLAPLTRRASQSSLESSTGPSYSRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 ELELSNMVIGWFKLFPPSSLVDPTLAPLTRRASQSSLESSTGPSYSRS
             1150      1160      1170      1180        

>>CCDS55269.1 RIMS2 gene_id:9699|Hs108|chr8               (1349 aa)
 initn: 6108 init1: 4044 opt: 4118  Z-score: 2782.5  bits: 527.0 E(32554): 1.1e-148
Smith-Waterman score: 7095; 93.1% identity (93.6% similar) in 1164 aa overlap (41-1188:233-1349)

               20        30        40        50        60        70
pF1KA0 NSVLSHFHGVFSSPPNILQNELFGQTLNNARKRSPSVSRDQNRRYDQREEREEYSQYATS
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KSRSHGLTRQHSIKNGSGVKHHIASDIASDRKRSPSVSRDQNRRYDQREEREEYSQYATS
            210       220       230       240       250       260  

               80        90       100       110       120       130
pF1KA0 DTAMPRSPSDYADRRSQHEPQFYEDSDHLSYRDSNRRSHRHSKEYIVDDEDVESRDEYER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DTAMPRSPSDYADRRSQHEPQFYEDSDHLSYRDSNRRSHRHSKEYIVDDEDVESRDEYER
            270       280       290       300       310       320  

              140       150       160       170       180       190
pF1KA0 QRREEEYQSRYRSDPNLARYPVKPQPYEEQMRIHAEVSRARHERRHSDVSLANADLEDSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QRREEEYQSRYRSDPNLARYPVKPQPYEEQMRIHAEVSRARHERRHSDVSLANADLEDSR
            330       340       350       360       370       380  

              200       210       220       230       240       250
pF1KA0 ISMLRMDRPSRQRSISERRAAMENQRSYSMERTREAQGPSSYAQRTTNHSPPTPRRSPLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ISMLRMDRPSRQRSISERRAAMENQRSYSMERTREAQGPSSYAQRTTNHSPPTPRRSPLP
            390       400       410       420       430       440  

              260       270       280       290       300       310
pF1KA0 IDRPDLRRTDSLRKQHHLDPSSAVRKTKREKMETMLRNDSLSSDQSESVRPPPPKPHKSK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 IDRPDLRRTDSLRKQHHLDPSSAVRKTKREKMETMLRNDSLSSDQSESVRPPPPKPHKSK
            450       460       470       480       490       500  

              320       330       340       350       360       370
pF1KA0 KGGKMRQISLSSSEEELASTPEYTSCDDVEIESESVSEKGDSQKGKRKTSEQAVLSDSNT
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::                   
CCDS55 KGGKMRQISLSSSEEELASTPEYTSCDDVEIESESVSEKGDM------------------
            510       520       530       540                      

              380       390       400       410       420       430
pF1KA0 RSERQKEMMYFGGHSLEEDLEWSEPQIKDSGVDTCSSTTLNEEHSHSDKHPVTWQPSKDG
                         : .: .            ..  . : :  . :::::::::::
CCDS55 ------------------DYNWLD-----------HTSWHSSEASPMSLHPVTWQPSKDG
                            550                  560       570     

              440       450       460       470       480       490
pF1KA0 DRLIGRILLNKRLKDGSVPRDSGAMLGLKVVGGKMTESGRLCAFITKVKKGSLADTVGHL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DRLIGRILLNKRLKDGSVPRDSGAMLGLKVVGGKMTESGRLCAFITKVKKGSLADTVGHL
         580       590       600       610       620       630     

              500       510       520       530       540       550
pF1KA0 RPGDEVLEWNGRLLQGATFEEVYNIILESKPEPQVELVVSRPIGDIPRIPDSTHAQLESS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RPGDEVLEWNGRLLQGATFEEVYNIILESKPEPQVELVVSRPIGDIPRIPDSTHAQLESS
         640       650       660       670       680       690     

              560       570       580                       590    
pF1KA0 SSSFESQKMDRPSISVTSPMSPGMLRDVPQFLSGQLS----------------IKLWFDK
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::                :::::::
CCDS55 SSSFESQKMDRPSISVTSPMSPGMLRDVPQFLSGQLSSQSLSRRTTPFVPRVQIKLWFDK
         700       710       720       730       740       750     

          600       610       620       630       640       650    
pF1KA0 VGHQLIVTILGAKDLPSREDGRPRNPYVKIYFLPDRSDKNKRRTKTVKKTLEPKWNQTFI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VGHQLIVTILGAKDLPSREDGRPRNPYVKIYFLPDRSDKNKRRTKTVKKTLEPKWNQTFI
         760       770       780       790       800       810     

          660       670       680       690       700       710    
pF1KA0 YSPVHRREFRERMLEITLWDQARVREEESEFLGEILIELETALLDDEPHWYKLQTHDVSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 YSPVHRREFRERMLEITLWDQARVREEESEFLGEILIELETALLDDEPHWYKLQTHDVSS
         820       830       840       850       860       870     

          720       730       740       750       760       770    
pF1KA0 LPLPHPSPYMPRRQLHGESPTRRLQRSKRISDSEVSDYDCDDGIGVVSDYRHDGRDLQSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LPLPHPSPYMPRRQLHGESPTRRLQRSKRISDSEVSDYDCDDGIGVVSDYRHDGRDLQSS
         880       890       900       910       920       930     

          780       790       800       810       820       830    
pF1KA0 TLSVPEQVMSSNHCSPSGSPHRVDVIGRTRSWSPSVPPPQSRNVEQGLRGTRTMTGHYNT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TLSVPEQVMSSNHCSPSGSPHRVDVIGRTRSWSPSVPPPQSRNVEQGLRGTRTMTGHYNT
         940       950       960       970       980       990     

          840       850       860       870       880       890    
pF1KA0 ISRMDRHRVMDDHYSPDRDRDCEAADRQPYHRSRSTEQRPLLERTTTRSRSTERPDTNLM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ISRMDRHRVMDDHYSPDRDRDCEAADRQPYHRSRSTEQRPLLERTTTRSRSTERPDTNLM
        1000      1010      1020      1030      1040      1050     

          900       910       920       930       940       950    
pF1KA0 RSMPSLMTGRSAPPSPALSRSHPRTGSVQTSPSSTPVAGRRGRQLPQLPPKGTLDRKAGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RSMPSLMTGRSAPPSPALSRSHPRTGSVQTSPSSTPVAGRRGRQLPQLPPKGTLDRKAGG
        1060      1070      1080      1090      1100      1110     

          960       970       980       990      1000      1010    
pF1KA0 KKLRSTVQRSTETGLAVEMRNWMTRQASRESTDGSMNSYSSEGNLIFPGVRLASDSQFSD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KKLRSTVQRSTETGLAVEMRNWMTRQASRESTDGSMNSYSSEGNLIFPGVRLASDSQFSD
        1120      1130      1140      1150      1160      1170     

         1020      1030      1040      1050      1060      1070    
pF1KA0 FLDGLGPAQLVGRQTLATPAMGDIQVGMMDKKGQLEVEIIRARGLVVKPGSKTLPAPYVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 FLDGLGPAQLVGRQTLATPAMGDIQVGMMDKKGQLEVEIIRARGLVVKPGSKTLPAPYVK
        1180      1190      1200      1210      1220      1230     

         1080      1090      1100      1110      1120      1130    
pF1KA0 VYLLDNGVCIAKKKTKVARKTLEPLYQQLLSFEESPQGKVLQIIVWGDYGRMDHKSFMGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VYLLDNGVCIAKKKTKVARKTLEPLYQQLLSFEESPQGKVLQIIVWGDYGRMDHKSFMGV
        1240      1250      1260      1270      1280      1290     

         1140      1150      1160      1170      1180        
pF1KA0 AQILLDELELSNMVIGWFKLFPPSSLVDPTLAPLTRRASQSSLESSTGPSYSRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AQILLDELELSNMVIGWFKLFPPSSLVDPTLAPLTRRASQSSLESSTGPSYSRS
        1300      1310      1320      1330      1340         

>>CCDS55029.1 RIMS1 gene_id:22999|Hs108|chr6              (817 aa)
 initn: 3064 init1: 1766 opt: 3493  Z-score: 2364.8  bits: 449.0 E(32554): 2.1e-125
Smith-Waterman score: 3519; 68.7% identity (84.0% similar) in 788 aa overlap (411-1188:48-817)

              390       400       410       420       430       440
pF1KA0 FGGHSLEEDLEWSEPQIKDSGVDTCSSTTLNEEHSHSDKHPVTWQPSKDGDRLIGRILLN
                                     ..: :  ..:::::::::.:::::::..::
CCDS55 SVDSEEGTIEARRAVAGDLDYYWLDPATWHSRETSPISSHPVTWQPSKEGDRLIGRVILN
        20        30        40        50        60        70       

              450       460       470       480       490       500
pF1KA0 KRLKDGSVPRDSGAMLGLKVVGGKMTESGRLCAFITKVKKGSLADTVGHLRPGDEVLEWN
       ::    ..:.::::.:::::::::::. ::: :::::::::::::.::::: ::::::::
CCDS55 KRT---TMPKDSGALLGLKVVGGKMTDLGRLGAFITKVKKGSLADVVGHLRAGDEVLEWN
        80           90       100       110       120       130    

              510       520       530       540       550       560
pF1KA0 GRLLQGATFEEVYNIILESKPEPQVELVVSRPIGDIPRIPDSTHAQLESSSSSFESQKMD
       :. : ::: ::::::::::: :::::..::::::::::::.:.:  :::::::::::::.
CCDS55 GKPLPGATNEEVYNIILESKSEPQVEIIVSRPIGDIPRIPESSHPPLESSSSSFESQKME
          140       150       160       170       180       190    

              570       580       590       600       610       620
pF1KA0 RPSISVTSPMSPGMLRDVPQFLSGQLSIKLWFDKVGHQLIVTILGAKDLPSREDGRPRNP
       :::::: :: ::: :.:.:: : ::::.:::.:::::::::..: : :::.: :::::::
CCDS55 RPSISVISPTSPGALKDAPQVLPGQLSVKLWYDKVGHQLIVNVLQATDLPARVDGRPRNP
          200       210       220       230       240       250    

              630       640       650       660       670       680
pF1KA0 YVKIYFLPDRSDKNKRRTKTVKKTLEPKWNQTFIYSPVHRREFRERMLEITLWDQARVRE
       :::.:::::::::.::::::::: :::::::::.:: ::::.:::::::::.::: ::.:
CCDS55 YVKMYFLPDRSDKSKRRTKTVKKILEPKWNQTFVYSHVHRRDFRERMLEITVWDQPRVQE
          260       270       280       290       300       310    

              690       700       710       720       730       740
pF1KA0 EESEFLGEILIELETALLDDEPHWYKLQTHDVSSLPLPHPSPYMPRRQLHGESPTRRLQR
       ::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::.:::.::::..:::: ...:::
CCDS55 EESEFLGEILIELETALLDDEPHWYKLQTHDESSLPLPQPSPFMPRRHIHGESSSKKLQR
          320       330       340       350       360       370    

              750       760         770       780       790        
pF1KA0 SKRISDSEVSDYDCDDGIGVVSD--YRHDGRDLQSSTLSVPEQVMSSNHCSPSGSPHRVD
       :.:::::..:::. :::::::    :: ..:. .:.::.::::  ...: : : :::: .
CCDS55 SQRISDSDISDYEVDDGIGVVPPVGYRSSARESKSTTLTVPEQQRTTHHRSRSVSPHRGN
          380       390       400       410       420       430    

      800       810       820       830         840       850      
pF1KA0 VIGRTRSWSPSVPPPQSRNVEQGLRGTRTMTGHYN-TISRMD-RHRVMDDHYSPDRDRDC
         :. ::  :.::  .: .  .  : .:. : :.. . : .: : : .:..:  ..: . 
CCDS55 DQGKPRSRLPNVPLQRSLDEIHPTRRSRSPTRHHDASRSPVDHRTRDVDSQYLSEQDSEL
          440       450       460       470       480       490    

        860            870       880       890       900       910 
pF1KA0 EAADRQPYHRS-----RSTEQRPLLERTTTRSRSTERPDTNLMRSMPSLMTGRSAPPSPA
           :    ::      ..: .:.:.:. . : .  ::::.:               :: 
CCDS55 LMLPRAKRGRSAECLHTTSELQPFLDRARSASTNCLRPDTSLH--------------SPE
          500       510       520       530                     540

             920       930       940        950       960       970
pF1KA0 LSRSHPRTGSVQTSPSSTPVAGRRGRQLPQLPPK-GTLDRKAGGKKLRSTVQRSTETGLA
         : : . . .:. :..:  ..::::::::.: . :......: :::.::.:::::::.:
CCDS55 RERMHRQRSPTQSPPADTSFSSRRGRQLPQVPVRSGSIEQESGHKKLKSTIQRSTETGMA
              550       560       570       580       590       600

              980       990      1000      1010      1020      1030
pF1KA0 VEMRNWMTRQASRESTDGSMNSYSSEGNLIFPGVRLASDSQFSDFLDGLGPAQLVGRQTL
       .:::. :.:: ::::::::.::::::::::::::::..::::::::::::::::::::::
CCDS55 AEMRK-MVRQPSRESTDGSINSYSSEGNLIFPGVRLGADSQFSDFLDGLGPAQLVGRQTL
               610       620       630       640       650         

             1040      1050      1060      1070      1080      1090
pF1KA0 ATPAMGDIQVGMMDKKGQLEVEIIRARGLVVKPGSKTLPAPYVKVYLLDNGVCIAKKKTK
       :::::::::.:: :::::::::.::::.:. :::::. ::::::::::.::.:::::::.
CCDS55 ATPAMGDIQIGMEDKKGQLEVEVIRARSLTQKPGSKSTPAPYVKVYLLENGACIAKKKTR
     660       670       680       690       700       710         

             1100      1110      1120      1130      1140      1150
pF1KA0 VARKTLEPLYQQLLSFEESPQGKVLQIIVWGDYGRMDHKSFMGVAQILLDELELSNMVIG
       .:::::.::::: : :.:::::::::.:::::::::::: :::::::::.::.::.::::
CCDS55 IARKTLDPLYQQSLVFDESPQGKVLQVIVWGDYGRMDHKCFMGVAQILLEELDLSSMVIG
     720       730       740       750       760       770         

             1160      1170      1180        
pF1KA0 WFKLFPPSSLVDPTLAPLTRRASQSSLESSTGPSYSRS
       :.:::::::::::::.:::::::::::::::::   ::
CCDS55 WYKLFPPSSLVDPTLTPLTRRASQSSLESSTGPPCIRS
     780       790       800       810       

>>CCDS43761.1 RIMS2 gene_id:9699|Hs108|chr8               (1163 aa)
 initn: 5299 init1: 2965 opt: 3069  Z-score: 2077.0  bits: 396.3 E(32554): 2.3e-109
Smith-Waterman score: 7353; 92.9% identity (93.4% similar) in 1210 aa overlap (1-1188:1-1163)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MQFETLRQVCNSVLSHFHGVFSSPPNILQNELFGQTLNNARKRSPSVSRDQNRRYDQREE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MQFETLRQVCNSVLSHFHGVFSSPPNILQNELFGQTLNNARKRSPSVSRDQNRRYDQREE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 REEYSQYATSDTAMPRSPSDYADRRSQHEPQFYEDSDHLSYRDSNRRSHRHSKEYIVDDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 REEYSQYATSDTAMPRSPSDYADRRSQHEPQFYEDSDHLSYRDSNRRSHRHSKEYIVDDE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 DVESRDEYERQRREEEYQSRYRSDPNLARYPVKPQPYEEQMRIHAEVSRARHERRHSDVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DVESRDEYERQRREEEYQSRYRSDPNLARYPVKPQPYEEQMRIHAEVSRARHERRHSDVS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 LANADLEDSRISMLRMDRPSRQRSISERRAAMENQRSYSMERTREAQGPSSYAQRTTNHS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LANADLEDSRISMLRMDRPSRQRSISERRAAMENQRSYSMERTREAQGPSSYAQRTTNHS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 PPTPRRSPLPIDRPDLRRTDSLRKQHHLDPSSAVRKTKREKMETMLRNDSLSSDQSESVR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PPTPRRSPLPIDRPDLRRTDSLRKQHHLDPSSAVRKTKREKMETMLRNDSLSSDQSESVR
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 PPPPKPHKSKKGGKMRQISLSSSEEELASTPEYTSCDDVEIESESVSEKGDSQKGKRKTS
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::         
CCDS43 PPPPKPHKSKKGGKMRQISLSSSEEELASTPEYTSCDDVEIESESVSEKGDM--------
              310       320       330       340       350          

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 EQAVLSDSNTRSERQKEMMYFGGHSLEEDLEWSEPQIKDSGVDTCSSTTLNEEHSHSDKH
                                   : .: .            ..  . : :  . :
CCDS43 ----------------------------DYNWLD-----------HTSWHSSEASPMSLH
                                                   360       370   

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 PVTWQPSKDGDRLIGRILLNKRLKDGSVPRDSGAMLGLKVVGGKMTESGRLCAFITKVKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PVTWQPSKDGDRLIGRILLNKRLKDGSVPRDSGAMLGLKVVGGKMTESGRLCAFITKVKK
           380       390       400       410       420       430   

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 GSLADTVGHLRPGDEVLEWNGRLLQGATFEEVYNIILESKPEPQVELVVSRPIGDIPRIP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GSLADTVGHLRPGDEVLEWNGRLLQGATFEEVYNIILESKPEPQVELVVSRPIGDIPRIP
           440       450       460       470       480       490   

              550       560       570       580       590       600
pF1KA0 DSTHAQLESSSSSFESQKMDRPSISVTSPMSPGMLRDVPQFLSGQLSIKLWFDKVGHQLI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DSTHAQLESSSSSFESQKMDRPSISVTSPMSPGMLRDVPQFLSGQLSIKLWFDKVGHQLI
           500       510       520       530       540       550   

              610       620       630       640       650       660
pF1KA0 VTILGAKDLPSREDGRPRNPYVKIYFLPDRSDKNKRRTKTVKKTLEPKWNQTFIYSPVHR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VTILGAKDLPSREDGRPRNPYVKIYFLPDRSDKNKRRTKTVKKTLEPKWNQTFIYSPVHR
           560       570       580       590       600       610   

              670       680       690       700       710       720
pF1KA0 REFRERMLEITLWDQARVREEESEFLGEILIELETALLDDEPHWYKLQTHDVSSLPLPHP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 REFRERMLEITLWDQARVREEESEFLGEILIELETALLDDEPHWYKLQTHDVSSLPLPHP
           620       630       640       650       660       670   

              730       740       750       760       770       780
pF1KA0 SPYMPRRQLHGESPTRRLQRSKRISDSEVSDYDCDDGIGVVSDYRHDGRDLQSSTLSVPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SPYMPRRQLHGESPTRRLQRSKRISDSEVSDYDCDDGIGVVSDYRHDGRDLQSSTLSVPE
           680       690       700       710       720       730   

              790       800       810       820       830       840
pF1KA0 QVMSSNHCSPSGSPHRVDVIGRTRSWSPSVPPPQSRNVEQGLRGTRTMTGHYNTISRMDR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QVMSSNHCSPSGSPHRVDVIGRTRSWSPSVPPPQSRNVEQGLRGTRTMTGHYNTISRMDR
           740       750       760       770       780       790   

              850                             860       870        
pF1KA0 HRVMDDHYSPDRD----------------------RDCEAADRQPYHRSRSTEQRPLLER
       :::::::::::::                      :::::::::::::::::::::::::
CCDS43 HRVMDDHYSPDRDSHFLTLPRSRYSQTIDHHHRDGRDCEAADRQPYHRSRSTEQRPLLER
           800       810       820       830       840       850   

      880       890       900       910       920       930        
pF1KA0 TTTRSRSTERPDTNLMRSMPSLMTGRSAPPSPALSRSHPRTGSVQTSPSSTPVAGRRGRQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TTTRSRSTERPDTNLMRSMPSLMTGRSAPPSPALSRSHPRTGSVQTSPSSTPVAGRRGRQ
           860       870       880       890       900       910   

      940       950       960       970       980       990        
pF1KA0 LPQLPPKGTLDRKAGGKKLRSTVQRSTETGLAVEMRNWMTRQASRESTDGSMNSYSSEGN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LPQLPPKGTLDRKAGGKKLRSTVQRSTETGLAVEMRNWMTRQASRESTDGSMNSYSSEGN
           920       930       940       950       960       970   

     1000      1010      1020      1030      1040      1050        
pF1KA0 LIFPGVRLASDSQFSDFLDGLGPAQLVGRQTLATPAMGDIQVGMMDKKGQLEVEIIRARG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LIFPGVRLASDSQFSDFLDGLGPAQLVGRQTLATPAMGDIQVGMMDKKGQLEVEIIRARG
           980       990      1000      1010      1020      1030   

     1060      1070      1080      1090      1100      1110        
pF1KA0 LVVKPGSKTLPAPYVKVYLLDNGVCIAKKKTKVARKTLEPLYQQLLSFEESPQGKVLQII
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LVVKPGSKTLPAPYVKVYLLDNGVCIAKKKTKVARKTLEPLYQQLLSFEESPQGKVLQII
          1040      1050      1060      1070      1080      1090   

     1120      1130      1140      1150      1160      1170        
pF1KA0 VWGDYGRMDHKSFMGVAQILLDELELSNMVIGWFKLFPPSSLVDPTLAPLTRRASQSSLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VWGDYGRMDHKSFMGVAQILLDELELSNMVIGWFKLFPPSSLVDPTLAPLTRRASQSSLE
          1100      1110      1120      1130      1140      1150   

     1180        
pF1KA0 SSTGPSYSRS
       ::::::::::
CCDS43 SSTGPSYSRS
          1160   

>>CCDS55030.1 RIMS1 gene_id:22999|Hs108|chr6              (1012 aa)
 initn: 3322 init1: 1766 opt: 2158  Z-score: 1464.4  bits: 282.7 E(32554): 3e-75
Smith-Waterman score: 2279; 51.3% identity (64.4% similar) in 811 aa overlap (411-1030:48-854)

              390       400       410       420       430       440
pF1KA0 FGGHSLEEDLEWSEPQIKDSGVDTCSSTTLNEEHSHSDKHPVTWQPSKDGDRLIGRILLN
                                     ..: :  ..:::::::::.:::::::..::
CCDS55 SVDSEEGTIEARRAVAGDLDYYWLDPATWHSRETSPISSHPVTWQPSKEGDRLIGRVILN
        20        30        40        50        60        70       

              450       460       470       480       490       500
pF1KA0 KRLKDGSVPRDSGAMLGLKVVGGKMTESGRLCAFITKVKKGSLADTVGHLRPGDEVLEWN
       ::    ..:.::::.:::::::::::. ::: :::::::::::::.::::: ::::::::
CCDS55 KRT---TMPKDSGALLGLKVVGGKMTDLGRLGAFITKVKKGSLADVVGHLRAGDEVLEWN
        80           90       100       110       120       130    

              510       520       530       540       550       560
pF1KA0 GRLLQGATFEEVYNIILESKPEPQVELVVSRPIGDIPRIPDSTHAQLESSSSSFESQKMD
       :. : ::: ::::::::::: :::::..::::::::::::.:.:  :::::::::::::.
CCDS55 GKPLPGATNEEVYNIILESKSEPQVEIIVSRPIGDIPRIPESSHPPLESSSSSFESQKME
          140       150       160       170       180       190    

              570       580       590       600       610       620
pF1KA0 RPSISVTSPMSPGMLRDVPQFLSGQLSIKLWFDKVGHQLIVTILGAKDLPSREDGRPRNP
       :::::: :: ::: :.:.:: : ::::.:::.:::::::::..: : :::.: :::::::
CCDS55 RPSISVISPTSPGALKDAPQVLPGQLSVKLWYDKVGHQLIVNVLQATDLPARVDGRPRNP
          200       210       220       230       240       250    

              630       640       650       660       670       680
pF1KA0 YVKIYFLPDRSDKNKRRTKTVKKTLEPKWNQTFIYSPVHRREFRERMLEITLWDQARVRE
       :::.:::::::::.::::::::: :::::::::.:: ::::.:::::::::.::: ::.:
CCDS55 YVKMYFLPDRSDKSKRRTKTVKKILEPKWNQTFVYSHVHRRDFRERMLEITVWDQPRVQE
          260       270       280       290       300       310    

              690       700       710       720       730       740
pF1KA0 EESEFLGEILIELETALLDDEPHWYKLQTHDVSSLPLPHPSPYMPRRQLHGESPTRRLQR
       ::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::.:::.::::..:::: ...:::
CCDS55 EESEFLGEILIELETALLDDEPHWYKLQTHDESSLPLPQPSPFMPRRHIHGESSSKKLQR
          320       330       340       350       360       370    

              750       760        770       780       790         
pF1KA0 SKRISDSEVSDYDCDDGIGVVSD-YRHDGRDLQSSTLSVPEQVMSSNHCSPSGSPHRVDV
       :.:::::..:::. :::::::   :: ..:. .:.::.::::  ...: : : :::: . 
CCDS55 SQRISDSDISDYEVDDGIGVVPPGYRSSARESKSTTLTVPEQQRTTHHRSRSVSPHRGND
          380       390       400       410       420       430    

     800       810       820       830         840       850       
pF1KA0 IGRTRSWSPSVPPPQSRNVEQGLRGTRTMTGHYN-TISRMD-RHRVMDDHYSPDRDRDCE
        :. ::  :.::  .: .  .  : .:. : :.. . : .: : : .:..:  ..: .  
CCDS55 QGKPRSRLPNVPLQRSLDEIHPTRRSRSPTRHHDASRSPVDHRTRDVDSQYLSEQDSELL
          440       450       460       470       480       490    

       860            870       880       890          900         
pF1KA0 AADRQPYHRS-----RSTEQRPLLERTTTRSRSTERPDTNLM---RSMPSLMTGRSAPPS
          :    ::      ..: .:.:.:. . : .  ::::.:    :   :  . ::.  .
CCDS55 MLPRAKRGRSAECLHTTSELQPFLDRARSASTNCLRPDTSLHSPERERHSRKSERSSIQK
          500       510       520       530       540       550    

     910              920       930       940                      
pF1KA0 PALS-------RSHPRTGSVQTSPSSTPVAGRRGRQLPQLP-------------------
        . .       : : . . .:. :..:  ..::::::::.:                   
CCDS55 QTRKGTASDAERMHRQRSPTQSPPADTSFSSRRGRQLPQVPVRSGSIEQASLVVEERTRQ
          560       570       580       590       600       610    

                                                                   
pF1KA0 ------------------------------------------------------------
                                                                   
CCDS55 MKMKVHRFKQTTGSGSSQELDREQYSKYNIHKDQYRSCDNVSAKSSDSDVSDVSAISRTS
          620       630       640       650       660       670    

                                                            950    
pF1KA0 -----------------PKG--------------------------------TLDRK---
                        :.:                                ::...   
CCDS55 SASRLSSTSFMSEQSERPRGRISSFTPKMQGRRMGTSGRSIMKSTSVSGEMYTLEHNDGS
          680       690       700       710       720       730    

                                                       960         
pF1KA0 ----------AGGKK--------------------------------LRSTVQRSTETGL
                 :::::                                :.::.:::::::.
CCDS55 QSDTAVGTVGAGGKKRRSSLSAKVVAIVSRRSRSTSQLSQTESGHKKLKSTIQRSTETGM
          740       750       760       770       780       790    

     970       980       990      1000      1010      1020         
pF1KA0 AVEMRNWMTRQASRESTDGSMNSYSSEGNLIFPGVRLASDSQFSDFLDGLGPAQLVGRQT
       :.:::. :.:: ::::::::.::::::::::::::::..:::::::::::::::::::::
CCDS55 AAEMRK-MVRQPSRESTDGSINSYSSEGNLIFPGVRLGADSQFSDFLDGLGPAQLVGRQT
          800        810       820       830       840       850   

    1030      1040      1050      1060      1070      1080         
pF1KA0 LATPAMGDIQVGMMDKKGQLEVEIIRARGLVVKPGSKTLPAPYVKVYLLDNGVCIAKKKT
       :                                                           
CCDS55 LATPAMGDIQIGMEDKKGQLEVEVIRARSLTQKPGSKSTPAPYVKVYLLENGACIAKKKT
           860       870       880       890       900       910   

>--
 initn: 893 init1: 893 opt: 893  Z-score: 612.6  bits: 125.1 E(32554): 8.4e-28
Smith-Waterman score: 893; 83.5% identity (94.3% similar) in 158 aa overlap (1031-1188:855-1012)

             1010      1020      1030      1040      1050      1060
pF1KA0 FPGVRLASDSQFSDFLDGLGPAQLVGRQTLATPAMGDIQVGMMDKKGQLEVEIIRARGLV
                                     :::::::::.:: :::::::::.::::.:.
CCDS55 FPGVRLGADSQFSDFLDGLGPAQLVGRQTLATPAMGDIQIGMEDKKGQLEVEVIRARSLT
          830       840       850       860       870       880    

             1070      1080      1090      1100      1110      1120
pF1KA0 VKPGSKTLPAPYVKVYLLDNGVCIAKKKTKVARKTLEPLYQQLLSFEESPQGKVLQIIVW
        :::::. ::::::::::.::.:::::::..:::::.::::: : :.:::::::::.:::
CCDS55 QKPGSKSTPAPYVKVYLLENGACIAKKKTRIARKTLDPLYQQSLVFDESPQGKVLQVIVW
          890       900       910       920       930       940    

             1130      1140      1150      1160      1170      1180
pF1KA0 GDYGRMDHKSFMGVAQILLDELELSNMVIGWFKLFPPSSLVDPTLAPLTRRASQSSLESS
       ::::::::: :::::::::.::.::.:::::.:::::::::::::.::::::::::::::
CCDS55 GDYGRMDHKCFMGVAQILLEELDLSSMVIGWYKLFPPSSLVDPTLTPLTRRASQSSLESS
          950       960       970       980       990      1000    

               
pF1KA0 TGPSYSRS
       :::   ::
CCDS55 TGPPCIRS
         1010  

>>CCDS47449.1 RIMS1 gene_id:22999|Hs108|chr6              (1692 aa)
 initn: 4158 init1: 1766 opt: 2125  Z-score: 1439.0  bits: 278.8 E(32554): 7.8e-74
Smith-Waterman score: 2962; 54.9% identity (72.2% similar) in 909 aa overlap (22-918:236-1079)

                        10        20        30         40        50
pF1KA0          MQFETLRQVCNSVLSHFHGVFSSPPNILQN-ELFGQTLNNARKRSPSVSRD
                                     :.::.  .. :   :.:.  .:.. : ::.
CCDS47 REKKARLQERSRSQTPLSTAAASSQDAAPPSAPPDRSKGAEPSQQALGPEQKQASSRSRS
         210       220       230       240       250       260     

               60        70        80        90       100       110
pF1KA0 QNRRYDQREEREEYSQYATSDTAMPRSPSDYADRRSQHEPQFYEDSDHLSYRDSNRRSHR
       .  :  .:..    :.  ..  :.    .      .:      :. ..   :.: :  . 
CCDS47 EPPR--ERKKTPGLSEQ-NGKGALKSERKRVPKTSAQPVEGAVEERERKERRESRRLEKG
           270       280        290       300       310       320  

              120            130       140       150       160     
pF1KA0 HSKEYIVDDEDVESRDE-----YERQRREEEYQSRYRSDPNLARYPVKPQPYEEQMRIHA
       .:..:    .  :.:::      :.::.::.::.::::::::::::::: : :.:::.::
CCDS47 RSQDY---PDTPEKRDEGKAADEEKQRKEEDYQTRYRSDPNLARYPVKPPPEEQQMRMHA
               330       340       350       360       370         

         170       180       190       200       210       220     
pF1KA0 EVSRARHERRHSDVSLANADLEDSRISMLRMDRPSRQRSISERRAAMENQRSYSMERTRE
       .:::::::::::::.:  ..      . :   . ...   . : .  .. :.:: ::: :
CCDS47 RVSRARHERRHSDVALPRTEAG----AALPEGKAGKRAPAAARASPPDSPRAYSAERTAE
     380       390       400           410       420       430     

         230       240       250       260       270         280   
pF1KA0 AQGPSSYAQRTTNHSPPTPRRSPLPIDRPDLRRTDSLRKQHHLDPSSAV--RKTKREKME
       ...:.  :.. ::::::.::..:.: . :.:.  . :::: .:::::::  ::.::::.:
CCDS47 TRAPG--AKQLTNHSPPAPRHGPVPAEAPELKAQEPLRKQSRLDPSSAVLMRKAKREKVE
         440         450       460       470       480       490   

           290       300       310       320       330       340   
pF1KA0 TMLRNDSLSSDQSESVRPPPPKPHKSKKGGKMRQISLSSSEEELASTPEYTSCDDVEIES
       :::::::::::::::::: :::::.::.::: ::.:.:::::: .::::::::.:::.::
CCDS47 TMLRNDSLSSDQSESVRPSPPKPHRSKRGGKKRQMSVSSSEEEGVSTPEYTSCEDVELES
           500       510       520       530       540       550   

           350       360       370       380       390       400   
pF1KA0 ESVSEKGDSQKGKRKTSEQAVLSDSNTRSERQKEMMYFGGHSLEEDLEWSEPQIKDSGVD
       ::::::::                                     :  : .:        
CCDS47 ESVSEKGDL------------------------------------DYYWLDP--------
           560                                                     

           410       420       430       440       450       460   
pF1KA0 TCSSTTLNEEHSHSDKHPVTWQPSKDGDRLIGRILLNKRLKDGSVPRDSGAMLGLKVVGG
          .:  ..: :  ..:::::::::.:::::::..::::    ..:.::::.::::::::
CCDS47 ---ATWHSRETSPISSHPVTWQPSKEGDRLIGRVILNKRT---TMPKDSGALLGLKVVGG
        570       580       590       600          610       620   

           470       480       490       500       510       520   
pF1KA0 KMTESGRLCAFITKVKKGSLADTVGHLRPGDEVLEWNGRLLQGATFEEVYNIILESKPEP
       :::. ::: :::::::::::::.::::: :::::::::. : ::: ::::::::::: ::
CCDS47 KMTDLGRLGAFITKVKKGSLADVVGHLRAGDEVLEWNGKPLPGATNEEVYNIILESKSEP
           630       640       650       660       670       680   

           530       540       550       560       570       580   
pF1KA0 QVELVVSRPIGDIPRIPDSTHAQLESSSSSFESQKMDRPSISVTSPMSPGMLRDVPQFLS
       :::..::::::::::::.:.:  :::::::::::::.:::::: :: ::: :.:.:: : 
CCDS47 QVEIIVSRPIGDIPRIPESSHPPLESSSSSFESQKMERPSISVISPTSPGALKDAPQVLP
           690       700       710       720       730       740   

           590       600       610       620       630       640   
pF1KA0 GQLSIKLWFDKVGHQLIVTILGAKDLPSREDGRPRNPYVKIYFLPDRSDKNKRRTKTVKK
       ::::.:::.:::::::::..: : :::.: ::::::::::.:::::::::.:::::::::
CCDS47 GQLSVKLWYDKVGHQLIVNVLQATDLPARVDGRPRNPYVKMYFLPDRSDKSKRRTKTVKK
           750       760       770       780       790       800   

           650       660       670       680       690       700   
pF1KA0 TLEPKWNQTFIYSPVHRREFRERMLEITLWDQARVREEESEFLGEILIELETALLDDEPH
        :::::::::.:: ::::.:::::::::.::: ::.::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ILEPKWNQTFVYSHVHRRDFRERMLEITVWDQPRVQEEESEFLGEILIELETALLDDEPH
           810       820       830       840       850       860   

           710       720       730       740       750       760   
pF1KA0 WYKLQTHDVSSLPLPHPSPYMPRRQLHGESPTRRLQRSKRISDSEVSDYDCDDGIGVVSD
       :::::::: ::::::.:::.::::..:::: ...::::.:::::..:::. :::::::  
CCDS47 WYKLQTHDESSLPLPQPSPFMPRRHIHGESSSKKLQRSQRISDSDISDYEVDDGIGVVPP
           870       880       890       900       910       920   

             770       780       790       800       810       820 
pF1KA0 --YRHDGRDLQSSTLSVPEQVMSSNHCSPSGSPHRVDVIGRTRSWSPSVPPPQSRNVEQG
         :: ..:. .:.::.::::  ...: : : :::: .  :. ::  :.::  .: .  . 
CCDS47 VGYRSSARESKSTTLTVPEQQRTTHHRSRSVSPHRGNDQGKPRSRLPNVPLQRSLDEIHP
           930       940       950       960       970       980   

             830         840       850       860       870         
pF1KA0 LRGTRTMTGHYN-TISRMD-RHRVMDDHYSPDRDRDCEAADRQPYHRSRSTEQRPLLERT
        : .:. : :.. . : .: : : .:..:  ..: .     :   .:.::.:      : 
CCDS47 TRRSRSPTRHHDASRSPVDHRTRDVDSQYLSEQDSELLMLPRA--KRGRSAECLHTT-RH
           990      1000      1010      1020        1030       1040

     880       890       900       910       920       930         
pF1KA0 TTRSRSTERPDTNLMRSMPSLMTGRSAPPSPALSRSHPRTGSVQTSPSSTPVAGRRGRQL
        .:  .:  :   :..:        :  :. . ..:  :                     
CCDS47 LVRHYKTLPPKMPLLQSSSHWNIYSSILPAHTKTKSVTRQDISLHHECFNSTVLRFTDEI
             1050      1060      1070      1080      1090      1100

     940       950       960       970       980       990         
pF1KA0 PQLPPKGTLDRKAGGKKLRSTVQRSTETGLAVEMRNWMTRQASRESTDGSMNSYSSEGNL
                                                                   
CCDS47 LVSELQPFLDRARSASTNCLRPDTSLHSPERERGRWSPSLDRRRPPSPRIQIQHASPEND
             1110      1120      1130      1140      1150      1160

>--
 initn: 1523 init1: 1216 opt: 1338  Z-score: 909.0  bits: 180.7 E(32554): 2.6e-44
Smith-Waterman score: 1360; 48.3% identity (66.0% similar) in 553 aa overlap (715-1188:1150-1692)

          690       700       710       720       730        740   
pF1KA0 FLGEILIELETALLDDEPHWYKLQTHDVSSLPLPHPSPYMPRRQLHGE-SPTRRLQRSKR
                                     . . : ::   :.. ..: :  ..  :.  
CCDS47 LRPDTSLHSPERERGRWSPSLDRRRPPSPRIQIQHASPENDRHSRKSERSSIQKQTRKGT
    1120      1130      1140      1150      1160      1170         

           750           760            770       780       790    
pF1KA0 ISDSEVSDYDCDDGIG----VVSDY-----RHDGRDLQSSTLSVPEQVMSSNHCSPSGSP
        ::.:     : .  :     ..:      .: .:. .::  :  . . : .:  :.:: 
CCDS47 ASDAERVLPTCLSRRGHAAPRATDQPVIRGKHPARS-RSSEHSSIRTLCSMHHLVPGGSA
    1180      1190      1200      1210       1220      1230        

          800        810                         820               
pF1KA0 HRVDVIGRT-RSWSPSVPPP------------------QSRNVEQGL----RGTRTM---
           .. :  :. ::.  ::                  .: ..::.     . :: :   
CCDS47 PPSPLLTRMHRQRSPTQSPPADTSFSSRRGRQLPQVPVRSGSIEQASLVVEERTRQMKMK
     1240      1250      1260      1270      1280      1290        

               830         840        850           860       870  
pF1KA0 ---------TGHYNTISR--MDRHRVMDDHY-SPD----RDRDCEAADRQPYHRSRSTEQ
                .:  . ..:  .... .  :.: : :    .. : ...: .   :. :. .
CCDS47 VHRFKQTTGSGSSQELDREQYSKYNIHKDQYRSCDNVSAKSSDSDVSDVSAISRTSSASR
     1300      1310      1320      1330      1340      1350        

            880       890       900             910                
pF1KA0 RPLLERTTTRSRSTERPDTNLMRSMPSLM------TGRSAPPSPALS------------R
          :  :.  :...:::   .    :...      .:::   : ..:            .
CCDS47 ---LSSTSFMSEQSERPRGRISSFTPKMQGRRMGTSGRSIMKSTSVSGEMYTLEHNDGSQ
        1360      1370      1380      1390      1400      1410     

          920              930         940       950       960     
pF1KA0 SHPRTGSV-------QTSPSSTPVA--GRRGRQLPQLPPKGTLDRKAGGKKLRSTVQRST
       :   .:.:       ..: :.  ::  .::.:.  ::      . ..: :::.::.::::
CCDS47 SDTAVGTVGAGGKKRRSSLSAKVVAIVSRRSRSTSQLS-----QTESGHKKLKSTIQRST
        1420      1430      1440      1450           1460      1470

         970       980       990      1000      1010      1020     
pF1KA0 ETGLAVEMRNWMTRQASRESTDGSMNSYSSEGNLIFPGVRLASDSQFSDFLDGLGPAQLV
       :::.:.:::. :.:: ::::::::.::::::::::::::::..:::::::::::::::::
CCDS47 ETGMAAEMRK-MVRQPSRESTDGSINSYSSEGNLIFPGVRLGADSQFSDFLDGLGPAQLV
             1480       1490      1500      1510      1520         

        1030      1040      1050      1060      1070      1080     
pF1KA0 GRQTLATPAMGDIQVGMMDKKGQLEVEIIRARGLVVKPGSKTLPAPYVKVYLLDNGVCIA
       ::::::::::::::.:: :::::::::.::::.:. :::::. ::::::::::.::.:::
CCDS47 GRQTLATPAMGDIQIGMEDKKGQLEVEVIRARSLTQKPGSKSTPAPYVKVYLLENGACIA
    1530      1540      1550      1560      1570      1580         

        1090      1100      1110      1120      1130      1140     
pF1KA0 KKKTKVARKTLEPLYQQLLSFEESPQGKVLQIIVWGDYGRMDHKSFMGVAQILLDELELS
       ::::..:::::.::::: : :.:::::::::.:::::::::::: :::::::::.::.::
CCDS47 KKKTRIARKTLDPLYQQSLVFDESPQGKVLQVIVWGDYGRMDHKCFMGVAQILLEELDLS
    1590      1600      1610      1620      1630      1640         

        1150      1160      1170      1180        
pF1KA0 NMVIGWFKLFPPSSLVDPTLAPLTRRASQSSLESSTGPSYSRS
       .:::::.:::::::::::::.:::::::::::::::::   ::
CCDS47 SMVIGWYKLFPPSSLVDPTLTPLTRRASQSSLESSTGPPCIRS
    1650      1660      1670      1680      1690  

>>CCDS55031.1 RIMS1 gene_id:22999|Hs108|chr6              (826 aa)
 initn: 3054 init1: 1766 opt: 2117  Z-score: 1438.1  bits: 277.6 E(32554): 8.8e-74
Smith-Waterman score: 3513; 68.0% identity (83.8% similar) in 798 aa overlap (411-1188:33-826)

              390       400       410       420       430       440
pF1KA0 FGGHSLEEDLEWSEPQIKDSGVDTCSSTTLNEEHSHSDKHPVTWQPSKDGDRLIGRILLN
                                     ..: :  ..:::::::::.:::::::..::
CCDS55 AGFLQFLLLHTLHSGTGDLDYYWLDPATWHSRETSPISSHPVTWQPSKEGDRLIGRVILN
             10        20        30        40        50        60  

              450       460       470       480       490       500
pF1KA0 KRLKDGSVPRDSGAMLGLKVVGGKMTESGRLCAFITKVKKGSLADTVGHLRPGDEVLEWN
       ::    ..:.::::.:::::::::::. ::: :::::::::::::.::::: ::::::::
CCDS55 KRT---TMPKDSGALLGLKVVGGKMTDLGRLGAFITKVKKGSLADVVGHLRAGDEVLEWN
                70        80        90       100       110         

              510       520       530       540       550       560
pF1KA0 GRLLQGATFEEVYNIILESKPEPQVELVVSRPIGDIPRIPDSTHAQLESSSSSFESQKMD
       :. : ::: ::::::::::: :::::..::::::::::::.:.:  :::::::::::::.
CCDS55 GKPLPGATNEEVYNIILESKSEPQVEIIVSRPIGDIPRIPESSHPPLESSSSSFESQKME
     120       130       140       150       160       170         

              570       580       590       600       610       620
pF1KA0 RPSISVTSPMSPGMLRDVPQFLSGQLSIKLWFDKVGHQLIVTILGAKDLPSREDGRPRNP
       :::::: :: ::: :.:.:: : ::::.:::.:::::::::..: : :::.: :::::::
CCDS55 RPSISVISPTSPGALKDAPQVLPGQLSVKLWYDKVGHQLIVNVLQATDLPARVDGRPRNP
     180       190       200       210       220       230         

              630       640       650       660       670       680
pF1KA0 YVKIYFLPDRSDKNKRRTKTVKKTLEPKWNQTFIYSPVHRREFRERMLEITLWDQARVRE
       :::.:::::::::.::::::::: :::::::::.:: ::::.:::::::::.::: ::.:
CCDS55 YVKMYFLPDRSDKSKRRTKTVKKILEPKWNQTFVYSHVHRRDFRERMLEITVWDQPRVQE
     240       250       260       270       280       290         

              690       700       710       720       730       740
pF1KA0 EESEFLGEILIELETALLDDEPHWYKLQTHDVSSLPLPHPSPYMPRRQLHGESPTRRLQR
       ::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::.:::.::::..:::: ...:::
CCDS55 EESEFLGEILIELETALLDDEPHWYKLQTHDESSLPLPQPSPFMPRRHIHGESSSKKLQR
     300       310       320       330       340       350         

              750       760         770       780       790        
pF1KA0 SKRISDSEVSDYDCDDGIGVVSD--YRHDGRDLQSSTLSVPEQVMSSNHCSPSGSPHRVD
       :.:::::..:::. :::::::    :: ..:. .:.::.::::  ...: : : :::: .
CCDS55 SQRISDSDISDYEVDDGIGVVPPVGYRSSARESKSTTLTVPEQQRTTHHRSRSVSPHRGN
     360       370       380       390       400       410         

      800       810       820       830         840       850      
pF1KA0 VIGRTRSWSPSVPPPQSRNVEQGLRGTRTMTGHYN-TISRMD-RHRVMDDHYSPDRDRDC
         :. ::  :.::  .: .  .  : .:. : :.. . : .: : : .:..:  ..: . 
CCDS55 DQGKPRSRLPNVPLQRSLDEIHPTRRSRSPTRHHDASRSPVDHRTRDVDSQYLSEQDSEL
     420       430       440       450       460       470         

        860            870       880       890          900        
pF1KA0 EAADRQPYHRS-----RSTEQRPLLERTTTRSRSTERPDTNLM---RSMPSLMTGRSAPP
           :    ::      ..: .:.:.:. . : .  ::::.:    :   :  . ::.  
CCDS55 LMLPRAKRGRSAECLHTTSELQPFLDRARSASTNCLRPDTSLHSPERERHSRKSERSSIQ
     480       490       500       510       520       530         

      910              920       930       940        950       960
pF1KA0 SPALS-------RSHPRTGSVQTSPSSTPVAGRRGRQLPQLPPK-GTLDRKAGGKKLRST
       . . .       : : . . .:. :..:  ..::::::::.: . :......: :::.::
CCDS55 KQTRKGTASDAERMHRQRSPTQSPPADTSFSSRRGRQLPQVPVRSGSIEQESGHKKLKST
     540       550       560       570       580       590         

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KA0 VQRSTETGLAVEMRNWMTRQASRESTDGSMNSYSSEGNLIFPGVRLASDSQFSDFLDGLG
       .:::::::.:.:::. :.:: ::::::::.::::::::::::::::..::::::::::::
CCDS55 IQRSTETGMAAEMRK-MVRQPSRESTDGSINSYSSEGNLIFPGVRLGADSQFSDFLDGLG
     600       610        620       630       640       650        

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KA0 PAQLVGRQTLATPAMGDIQVGMMDKKGQLEVEIIRARGLVVKPGSKTLPAPYVKVYLLDN
       :::::::::::::::::::.:: :::::::::.::::.:. :::::. ::::::::::.:
CCDS55 PAQLVGRQTLATPAMGDIQIGMEDKKGQLEVEVIRARSLTQKPGSKSTPAPYVKVYLLEN
      660       670       680       690       700       710        

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KA0 GVCIAKKKTKVARKTLEPLYQQLLSFEESPQGKVLQIIVWGDYGRMDHKSFMGVAQILLD
       :.:::::::..:::::.::::: : :.:::::::::.:::::::::::: :::::::::.
CCDS55 GACIAKKKTRIARKTLDPLYQQSLVFDESPQGKVLQVIVWGDYGRMDHKCFMGVAQILLE
      720       730       740       750       760       770        

             1150      1160      1170      1180        
pF1KA0 ELELSNMVIGWFKLFPPSSLVDPTLAPLTRRASQSSLESSTGPSYSRS
       ::.::.:::::.:::::::::::::.:::::::::::::::::   ::
CCDS55 ELDLSSMVIGWYKLFPPSSLVDPTLTPLTRRASQSSLESSTGPPCIRS
      780       790       800       810       820      

>>CCDS55032.1 RIMS1 gene_id:22999|Hs108|chr6              (760 aa)
 initn: 3050 init1: 1762 opt: 1973  Z-score: 1341.7  bits: 259.6 E(32554): 2.1e-68
Smith-Waterman score: 3369; 68.5% identity (84.0% similar) in 761 aa overlap (448-1188:1-760)

       420       430       440       450       460       470       
pF1KA0 DKHPVTWQPSKDGDRLIGRILLNKRLKDGSVPRDSGAMLGLKVVGGKMTESGRLCAFITK
                                     .:.::::.:::::::::::. ::: :::::
CCDS55                               MPKDSGALLGLKVVGGKMTDLGRLGAFITK
                                             10        20        30

       480       490       500       510       520       530       
pF1KA0 VKKGSLADTVGHLRPGDEVLEWNGRLLQGATFEEVYNIILESKPEPQVELVVSRPIGDIP
       ::::::::.::::: :::::::::. : ::: ::::::::::: :::::..:::::::::
CCDS55 VKKGSLADVVGHLRAGDEVLEWNGKPLPGATNEEVYNIILESKSEPQVEIIVSRPIGDIP
               40        50        60        70        80        90

       540       550       560       570       580       590       
pF1KA0 RIPDSTHAQLESSSSSFESQKMDRPSISVTSPMSPGMLRDVPQFLSGQLSIKLWFDKVGH
       :::.:.:  :::::::::::::.:::::: :: ::: :.:.:: : ::::.:::.:::::
CCDS55 RIPESSHPPLESSSSSFESQKMERPSISVISPTSPGALKDAPQVLPGQLSVKLWYDKVGH
              100       110       120       130       140       150

       600       610       620       630       640       650       
pF1KA0 QLIVTILGAKDLPSREDGRPRNPYVKIYFLPDRSDKNKRRTKTVKKTLEPKWNQTFIYSP
       ::::..: : :::.: ::::::::::.:::::::::.::::::::: :::::::::.:: 
CCDS55 QLIVNVLQATDLPARVDGRPRNPYVKMYFLPDRSDKSKRRTKTVKKILEPKWNQTFVYSH
              160       170       180       190       200       210

       660       670       680       690       700       710       
pF1KA0 VHRREFRERMLEITLWDQARVREEESEFLGEILIELETALLDDEPHWYKLQTHDVSSLPL
       ::::.:::::::::.::: ::.:::::::::::::::::::::::::::::::: :::::
CCDS55 VHRRDFRERMLEITVWDQPRVQEEESEFLGEILIELETALLDDEPHWYKLQTHDESSLPL
              220       230       240       250       260       270

       720       730       740       750       760         770     
pF1KA0 PHPSPYMPRRQLHGESPTRRLQRSKRISDSEVSDYDCDDGIGVVSD--YRHDGRDLQSST
       :.:::.::::..:::: ...::::.:::::..:::. :::::::    :: ..:. .:.:
CCDS55 PQPSPFMPRRHIHGESSSKKLQRSQRISDSDISDYEVDDGIGVVPPVGYRSSARESKSTT
              280       290       300       310       320       330

         780       790       800       810       820       830     
pF1KA0 LSVPEQVMSSNHCSPSGSPHRVDVIGRTRSWSPSVPPPQSRNVEQGLRGTRTMTGHYN-T
       :.::::  ...: : : :::: .  :. ::  :.::  .: .  .  : .:. : :.. .
CCDS55 LTVPEQQRTTHHRSRSVSPHRGNDQGKPRSRLPNVPLQRSLDEIHPTRRSRSPTRHHDAS
              340       350       360       370       380       390

           840       850       860            870       880        
pF1KA0 ISRMD-RHRVMDDHYSPDRDRDCEAADRQPYHRS-----RSTEQRPLLERTTTRSRSTER
        : .: : : .:..:  ..: .     :    ::      ..: .:.:.:. . : .  :
CCDS55 RSPVDHRTRDVDSQYLSEQDSELLMLPRAKRGRSAECLHTTSELQPFLDRARSASTNCLR
              400       410       420       430       440       450

      890          900       910              920       930        
pF1KA0 PDTNLM---RSMPSLMTGRSAPPSPALS-------RSHPRTGSVQTSPSSTPVAGRRGRQ
       :::.:    :   :  . ::.  . . .       : : . . .:. :..:  ..:::::
CCDS55 PDTSLHSPERERHSRKSERSSIQKQTRKGTASDAERMHRQRSPTQSPPADTSFSSRRGRQ
              460       470       480       490       500       510

      940        950       960       970       980       990       
pF1KA0 LPQLPPK-GTLDRKAGGKKLRSTVQRSTETGLAVEMRNWMTRQASRESTDGSMNSYSSEG
       :::.: . :......: :::.::.:::::::.:.:::. :.:: ::::::::.:::::::
CCDS55 LPQVPVRSGSIEQESGHKKLKSTIQRSTETGMAAEMRK-MVRQPSRESTDGSINSYSSEG
              520       530       540        550       560         

      1000      1010      1020      1030      1040      1050       
pF1KA0 NLIFPGVRLASDSQFSDFLDGLGPAQLVGRQTLATPAMGDIQVGMMDKKGQLEVEIIRAR
       :::::::::..:::::::::::::::::::::::::::::::.:: :::::::::.::::
CCDS55 NLIFPGVRLGADSQFSDFLDGLGPAQLVGRQTLATPAMGDIQIGMEDKKGQLEVEVIRAR
     570       580       590       600       610       620         

      1060      1070      1080      1090      1100      1110       
pF1KA0 GLVVKPGSKTLPAPYVKVYLLDNGVCIAKKKTKVARKTLEPLYQQLLSFEESPQGKVLQI
       .:. :::::. ::::::::::.::.:::::::..:::::.::::: : :.:::::::::.
CCDS55 SLTQKPGSKSTPAPYVKVYLLENGACIAKKKTRIARKTLDPLYQQSLVFDESPQGKVLQV
     630       640       650       660       670       680         

      1120      1130      1140      1150      1160      1170       
pF1KA0 IVWGDYGRMDHKSFMGVAQILLDELELSNMVIGWFKLFPPSSLVDPTLAPLTRRASQSSL
       :::::::::::: :::::::::.::.::.:::::.:::::::::::::.:::::::::::
CCDS55 IVWGDYGRMDHKCFMGVAQILLEELDLSSMVIGWYKLFPPSSLVDPTLTPLTRRASQSSL
     690       700       710       720       730       740         

      1180        
pF1KA0 ESSTGPSYSRS
       ::::::   ::
CCDS55 ESSTGPPCIRS
     750       760

>>CCDS64949.1 RIMS2 gene_id:9699|Hs108|chr8               (285 aa)
 initn: 1538 init1: 1538 opt: 1546  Z-score: 1060.3  bits: 206.1 E(32554): 9.7e-53
Smith-Waterman score: 1546; 88.5% identity (91.8% similar) in 279 aa overlap (911-1188:11-285)

              890       900       910       920        930         
pF1KA0 TRSRSTERPDTNLMRSMPSLMTGRSAPPSPALSRSHPRTGSVQT-SPSSTPVAGRRGRQL
                                     : .::  :. : .. : :   .::     .
CCDS64                     MGRQGLGGASAAGRSMQRSQSRSSLSASFEALAGY----F
                                   10        20        30          

     940       950       960       970       980       990         
pF1KA0 PQLPPKGTLDRKAGGKKLRSTVQRSTETGLAVEMRNWMTRQASRESTDGSMNSYSSEGNL
       : .      . .::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 PCMNSLEEEEGEAGGKKLRSTVQRSTETGLAVEMRNWMTRQASRESTDGSMNSYSSEGNL
         40        50        60        70        80        90      

    1000      1010      1020      1030      1040      1050         
pF1KA0 IFPGVRLASDSQFSDFLDGLGPAQLVGRQTLATPAMGDIQVGMMDKKGQLEVEIIRARGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 IFPGVRLASDSQFSDFLDGLGPAQLVGRQTLATPAMGDIQVGMMDKKGQLEVEIIRARGL
        100       110       120       130       140       150      

    1060      1070      1080      1090      1100      1110         
pF1KA0 VVKPGSKTLPAPYVKVYLLDNGVCIAKKKTKVARKTLEPLYQQLLSFEESPQGKVLQIIV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 VVKPGSKTLPAPYVKVYLLDNGVCIAKKKTKVARKTLEPLYQQLLSFEESPQGKVLQIIV
        160       170       180       190       200       210      

    1120      1130      1140      1150      1160      1170         
pF1KA0 WGDYGRMDHKSFMGVAQILLDELELSNMVIGWFKLFPPSSLVDPTLAPLTRRASQSSLES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 WGDYGRMDHKSFMGVAQILLDELELSNMVIGWFKLFPPSSLVDPTLAPLTRRASQSSLES
        220       230       240       250       260       270      

    1180        
pF1KA0 STGPSYSRS
       :::::::::
CCDS64 STGPSYSRS
        280     

>>CCDS55033.1 RIMS1 gene_id:22999|Hs108|chr6              (219 aa)
 initn: 1216 init1: 1216 opt: 1232  Z-score: 850.5  bits: 166.9 E(32554): 4.7e-41
Smith-Waterman score: 1232; 84.1% identity (95.0% similar) in 220 aa overlap (969-1188:1-219)

      940       950       960       970       980       990        
pF1KA0 LPQLPPKGTLDRKAGGKKLRSTVQRSTETGLAVEMRNWMTRQASRESTDGSMNSYSSEGN
                                     .:.:::. :.:: ::::::::.::::::::
CCDS55                               MAAEMRK-MVRQPSRESTDGSINSYSSEGN
                                              10        20         

     1000      1010      1020      1030      1040      1050        
pF1KA0 LIFPGVRLASDSQFSDFLDGLGPAQLVGRQTLATPAMGDIQVGMMDKKGQLEVEIIRARG
       ::::::::..:::::::::::::::::::::::::::::::.:: :::::::::.::::.
CCDS55 LIFPGVRLGADSQFSDFLDGLGPAQLVGRQTLATPAMGDIQIGMEDKKGQLEVEVIRARS
      30        40        50        60        70        80         

     1060      1070      1080      1090      1100      1110        
pF1KA0 LVVKPGSKTLPAPYVKVYLLDNGVCIAKKKTKVARKTLEPLYQQLLSFEESPQGKVLQII
       :. :::::. ::::::::::.::.:::::::..:::::.::::: : :.:::::::::.:
CCDS55 LTQKPGSKSTPAPYVKVYLLENGACIAKKKTRIARKTLDPLYQQSLVFDESPQGKVLQVI
      90       100       110       120       130       140         

     1120      1130      1140      1150      1160      1170        
pF1KA0 VWGDYGRMDHKSFMGVAQILLDELELSNMVIGWFKLFPPSSLVDPTLAPLTRRASQSSLE
       ::::::::::: :::::::::.::.::.:::::.:::::::::::::.::::::::::::
CCDS55 VWGDYGRMDHKCFMGVAQILLEELDLSSMVIGWYKLFPPSSLVDPTLTPLTRRASQSSLE
     150       160       170       180       190       200         

     1180        
pF1KA0 SSTGPSYSRS
       :::::   ::
CCDS55 SSTGPPCIRS
     210         




1188 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Thu Nov  3 10:15:55 2016 done: Thu Nov  3 10:15:56 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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