Result of FASTA (ccds) for pF1KA0619
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA0619, 1388 aa
  1>>>pF1KA0619 1388 - 1388 aa - 1388 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 17.2219+/-0.00161; mu= -33.9829+/- 0.094
 mean_var=786.4064+/-172.489, 0's: 0 Z-trim(109.9): 569  B-trim: 0 in 0/53
 Lambda= 0.045735
 statistics sampled from 10663 (11227) to 10663 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.654), E-opt: 0.2 (0.345), width:  16
 Scan time:  6.100

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS42654.1 ROCK2 gene_id:9475|Hs108|chr2          (1388) 9053 614.6 6.1e-175
CCDS11870.2 ROCK1 gene_id:6093|Hs108|chr18         (1354) 4176 292.8 4.4e-78
CCDS1558.1 CDC42BPA gene_id:8476|Hs108|chr1        (1719) 1516 117.4 3.6e-25
CCDS9978.1 CDC42BPB gene_id:9578|Hs108|chr14       (1711) 1486 115.4 1.4e-24
CCDS1559.1 CDC42BPA gene_id:8476|Hs108|chr1        (1638) 1476 114.7 2.2e-24
CCDS9192.1 CIT gene_id:11113|Hs108|chr12           (2027) 1410 110.4 5.3e-23
CCDS31601.1 CDC42BPG gene_id:55561|Hs108|chr11     (1551) 1398 109.5 7.4e-23
CCDS55891.1 CIT gene_id:11113|Hs108|chr12          (2069) 1396 109.5   1e-22
CCDS74400.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19          ( 530) 1262 100.2 1.6e-20
CCDS46118.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19          ( 624) 1262 100.3 1.8e-20
CCDS46117.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19          ( 625) 1262 100.3 1.8e-20
CCDS12674.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19          ( 629) 1186 95.3 5.9e-19
CCDS46119.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19          ( 639) 1115 90.6 1.5e-17
CCDS693.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1           ( 398)  783 68.5 4.2e-11


>>CCDS42654.1 ROCK2 gene_id:9475|Hs108|chr2               (1388 aa)
 initn: 9053 init1: 9053 opt: 9053  Z-score: 3254.2  bits: 614.6 E(32554): 6.1e-175
Smith-Waterman score: 9053; 99.9% identity (100.0% similar) in 1388 aa overlap (1-1388:1-1388)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MSRPPPTGKMPGAPETAPGDGAGASRQRKLEALIRDPRSPINVESLLDGLNSLVLDLDFP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MSRPPPTGKMPGAPETAPGDGAGASRQRKLEALIRDPRSPINVESLLDGLNSLVLDLDFP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 ALRKNKNIDNFLNRYEKIVKKIRGLQMKAEDYDVVKVIGRGAFGEVQLVRHKASQKVYAM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ALRKNKNIDNFLNRYEKIVKKIRGLQMKAEDYDVVKVIGRGAFGEVQLVRHKASQKVYAM
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 KLLSKFEMIKRSDSAFFWEERDIMAFANSPWVVQLFYAFQDDRYLYMVMEYMPGGDLVNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KLLSKFEMIKRSDSAFFWEERDIMAFANSPWVVQLFYAFQDDRYLYMVMEYMPGGDLVNL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 MSNYDVPEKWAKFYTAEVVLALDAIHSMGLIHRDVKPDNMLLDKHGHLKLADFGTCMKMD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MSNYDVPEKWAKFYTAEVVLALDAIHSMGLIHRDVKPDNMLLDKHGHLKLADFGTCMKMD
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 ETGMVHCDTAVGTPDYISPEVLKSQGGDGFYGRECDWWSVGVFLYEMLVGDTPFYADSLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ETGMVHCDTAVGTPDYISPEVLKSQGGDGFYGRECDWWSVGVFLYEMLVGDTPFYADSLV
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 GTYSKIMDHKNSLCFPEDAEISKHAKNLICAFLTDREVRLGRNGVEEIRQHPFFKNDQWH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GTYSKIMDHKNSLCFPEDAEISKHAKNLICAFLTDREVRLGRNGVEEIRQHPFFKNDQWH
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 WDNIRETAAPVVPELSSDIDSSNFDDIEDDKGDVETFPIPKAFVGNQLPFIGFTYYRENL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 WDNIRETAAPVVPELSSDIDSSNFDDIEDDKGDVETFPIPKAFVGNQLPFIGFTYYRENL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 LLSDSPSCRENDSIQSRKNEESQEIQKKLYTLEEHLSNEMQAKEELEQKCKSVNTRLEKT
       ::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LLSDSPSCRETDSIQSRKNEESQEIQKKLYTLEEHLSNEMQAKEELEQKCKSVNTRLEKT
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 AKELEEEITLRKSVESALRQLEREKALLQHKNAEYQRKADHEADKKRNLENDVNSLKDQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 AKELEEEITLRKSVESALRQLEREKALLQHKNAEYQRKADHEADKKRNLENDVNSLKDQL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA0 EDLKKRNQNSQISTEKVNQLQRQLDETNALLRTESDTAARLRKTQAESSKQIQQLESNNR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EDLKKRNQNSQISTEKVNQLQRQLDETNALLRTESDTAARLRKTQAESSKQIQQLESNNR
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA0 DLQDKNCLLETAKLKLEKEFINLQSALESERRDRTHGSEIINDLQGRICGLEEDLKNGKI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 DLQDKNCLLETAKLKLEKEFINLQSALESERRDRTHGSEIINDLQGRICGLEEDLKNGKI
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA0 LLAKVELEKRQLQERFTDLEKEKSNMEIDMTYQLKVIQQSLEQEEAEHKATKARLADKNK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LLAKVELEKRQLQERFTDLEKEKSNMEIDMTYQLKVIQQSLEQEEAEHKATKARLADKNK
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KA0 IYESIEEAKSEAMKEMEKKLLEERTLKQKVENLLLEAEKRCSLLDCDLKQSQQKINELLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 IYESIEEAKSEAMKEMEKKLLEERTLKQKVENLLLEAEKRCSLLDCDLKQSQQKINELLK
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KA0 QKDVLNEDVRNLTLKIEQETQKRCLTQNDLKMQTQQVNTLKMSEKQLKQENNHLMEMKMN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 QKDVLNEDVRNLTLKIEQETQKRCLTQNDLKMQTQQVNTLKMSEKQLKQENNHLMEMKMN
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KA0 LEKQNAELRKERQDADGQMKELQDQLEAEQYFSTLYKTQVRELKEECEEKTKLGKELQQK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LEKQNAELRKERQDADGQMKELQDQLEAEQYFSTLYKTQVRELKEECEEKTKLGKELQQK
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KA0 KQELQDERDSLAAQLEITLTKADSEQLARSIAEEQYSDLEKEKIMKELEIKEMMARHKQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KQELQDERDSLAAQLEITLTKADSEQLARSIAEEQYSDLEKEKIMKELEIKEMMARHKQE
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KA0 LTEKDATIASLEETNRTLTSDVANLANEKEELNNKLKDVQEQLSRLKDEEISAAAIKAQF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LTEKDATIASLEETNRTLTSDVANLANEKEELNNKLKDVQEQLSRLKDEEISAAAIKAQF
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KA0 EKQLLTERTLKTQAVNKLAEIMNRKEPVKRGNDTDVRRKEKENRKLHMELKSEREKLTQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EKQLLTERTLKTQAVNKLAEIMNRKEPVKRGNDTDVRRKEKENRKLHMELKSEREKLTQQ
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KA0 MIKYQKELNEMQAQIAEESQIRIELQMTLDSKDSDIEQLRSQLQALHIGLDSSSIGSGPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MIKYQKELNEMQAQIAEESQIRIELQMTLDSKDSDIEQLRSQLQALHIGLDSSSIGSGPG
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KA0 DAEADDGFPESRLEGWLSLPVRNNTKKFGWVKKYVIVSSKKILFYDSEQDKEQSNPYMVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 DAEADDGFPESRLEGWLSLPVRNNTKKFGWVKKYVIVSSKKILFYDSEQDKEQSNPYMVL
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KA0 DIDKLFHVRPVTQTDVYRADAKEIPRIFQILYANEGESKKEQEFPVEPVGEKSNYICHKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 DIDKLFHVRPVTQTDVYRADAKEIPRIFQILYANEGESKKEQEFPVEPVGEKSNYICHKG
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KA0 HEFIPTLYHFPTNCEACMKPLWHMFKPPPALECRRCHIKCHKDHMDKKEEIIAPCKVYYD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 HEFIPTLYHFPTNCEACMKPLWHMFKPPPALECRRCHIKCHKDHMDKKEEIIAPCKVYYD
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KA0 ISTAKNLLLLANSTEEQQKWVSRLVKKIPKKPPAPDPFARSSPRTSMKIQQNQSIRRPSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ISTAKNLLLLANSTEEQQKWVSRLVKKIPKKPPAPDPFARSSPRTSMKIQQNQSIRRPSR
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

               
pF1KA0 QLAPNKPS
       ::::::::
CCDS42 QLAPNKPS
               

>>CCDS11870.2 ROCK1 gene_id:6093|Hs108|chr18              (1354 aa)
 initn: 5013 init1: 2349 opt: 4176  Z-score: 1515.3  bits: 292.8 E(32554): 4.4e-78
Smith-Waterman score: 5872; 65.9% identity (86.1% similar) in 1361 aa overlap (25-1377:9-1344)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MSRPPPTGKMPGAPETAPGDGAGASRQRKLEALIRDPRSPINVESLLDGLNSLVLDLDFP
                               .: .:.. :.:::.: .: . :::::..:: :::::
CCDS11                 MSTGDSFETRFEKMDNLLRDPKSEVNSDCLLDGLDALVYDLDFP
                               10        20        30        40    

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 ALRKNKNIDNFLNRYEKIVKKIRGLQMKAEDYDVVKVIGRGAFGEVQLVRHKASQKVYAM
       ::::::::::::.::.  ..::: :.::::::.:::::::::::::::::::...:::::
CCDS11 ALRKNKNIDNFLSRYKDTINKIRDLRMKAEDYEVVKVIGRGAFGEVQLVRHKSTRKVYAM
           50        60        70        80        90       100    

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 KLLSKFEMIKRSDSAFFWEERDIMAFANSPWVVQLFYAFQDDRYLYMVMEYMPGGDLVNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KLLSKFEMIKRSDSAFFWEERDIMAFANSPWVVQLFYAFQDDRYLYMVMEYMPGGDLVNL
          110       120       130       140       150       160    

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 MSNYDVPEKWAKFYTAEVVLALDAIHSMGLIHRDVKPDNMLLDKHGHLKLADFGTCMKMD
       :::::::::::.:::::::::::::::::.:::::::::::::: ::::::::::::::.
CCDS11 MSNYDVPEKWARFYTAEVVLALDAIHSMGFIHRDVKPDNMLLDKSGHLKLADFGTCMKMN
          170       180       190       200       210       220    

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 ETGMVHCDTAVGTPDYISPEVLKSQGGDGFYGRECDWWSVGVFLYEMLVGDTPFYADSLV
       . :::.:::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KEGMVRCDTAVGTPDYISPEVLKSQGGDGYYGRECDWWSVGVFLYEMLVGDTPFYADSLV
          230       240       250       260       270       280    

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 GTYSKIMDHKNSLCFPEDAEISKHAKNLICAFLTDREVRLGRNGVEEIRQHPFFKNDQWH
       :::::::.::::: ::.: .:::.::::::::::::::::::::::::..: ::::::: 
CCDS11 GTYSKIMNHKNSLTFPDDNDISKEAKNLICAFLTDREVRLGRNGVEEIKRHLFFKNDQWA
          290       300       310       320       330       340    

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 WDNIRETAAPVVPELSSDIDSSNFDDIEDDKGDVETFPIPKAFVGNQLPFIGFTYYRENL
       :...:.:.:::::.::::::.:::::.:.:::. ::::::::::::::::.::::: .  
CCDS11 WETLRDTVAPVVPDLSSDIDTSNFDDLEEDKGEEETFPIPKAFVGNQLPFVGFTYYSNRR
          350       360       370       380       390       400    

              430       440         450       460       470        
pF1KA0 LLSDSPSCRENDSIQSRKNEES-QE-IQKKLYTLEEHLSNEMQAKEELEQKCKSVNTRLE
        ::   :   ::.  : . ..: :: .:: .: :::.: :::: :.:.::::.. : .:.
CCDS11 YLS---SANPNDNRTSSNADKSLQESLQKTIYKLEEQLHNEMQLKDEMEQKCRTSNIKLD
             410       420       430       440       450       460 

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pF1KA0 KTAKELEEEITLRKSVESALRQLEREKALLQHKNAEYQRKADHEADKKRNLENDVNSLKD
       :  :::.:: . :...::.. :.:.:: ::::.  ::::::..: .:.::.::.:..:::
CCDS11 KIMKELDEEGNQRRNLESTVSQIEKEKMLLQHRINEYQRKAEQENEKRRNVENEVSTLKD
             470       480       490       500       510       520 

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pF1KA0 QLEDLKKRNQNSQISTEKVNQLQRQLDETNALLRTESDTAARLRKTQAESSKQIQQLESN
       ::::::: .::::...::..:::.::.:.: :::::::::.::::...: ::.:.:::: 
CCDS11 QLEDLKKVSQNSQLANEKLSQLQKQLEEANDLLRTESDTAVRLRKSHTEMSKSISQLESL
             530       540       550       560       570       580 

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pF1KA0 NRDLQDKNCLLETAKLKLEKEFINLQSALESERRDRTHGSEIINDLQGRICGLEEDLKNG
       ::.::..: .::..: . .:.. .::. ::.::::: : ::.:.:::.:: .:.:..:. 
CCDS11 NRELQERNRILENSKSQTDKDYYQLQAILEAERRDRGHDSEMIGDLQARITSLQEEVKHL
             590       600       610       620       630       640 

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pF1KA0 KILLAKVELEKRQLQERFTDLEKEKSNMEIDMTYQLKVIQQSLEQEEAEHKATKARLADK
       :  : ::: :... :. ..  ::::.:.:::..:.:: .:: ::::  :::.:::::.::
CCDS11 KHNLEKVEGERKEAQDMLNHSEKEKNNLEIDLNYKLKSLQQRLEQEVNEHKVTKARLTDK
             650       660       670       680       690       700 

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pF1KA0 NKIYESIEEAKSEAMKEMEKKLLEERTLKQKVENLLLEAEKRCSLLDCDLKQSQQKINEL
          ..::::::: :: :::::: :::  ..:.:: ... ::.::.:: ::::::::...:
CCDS11 ---HQSIEEAKSVAMCEMEKKLKEEREAREKAENRVVQIEKQCSMLDVDLKQSQQKLEHL
                710       720       730       740       750        

      780       790       800       810       820       830        
pF1KA0 LKQKDVLNEDVRNLTLKIEQETQKRCLTQNDLKMQTQQVNTLKMSEKQLKQENNHLMEMK
         .:. ....:.::::..:::..:: : ::.:: :. ....::  :::.::: : :.: :
CCDS11 TGNKERMEDEVKNLTLQLEQESNKRLLLQNELKTQAFEADNLKGLEKQMKQEINTLLEAK
      760       770       780       790       800       810        

      840       850       860       870       880       890        
pF1KA0 MNLEKQNAELRKERQDADGQMKELQDQLEAEQYFSTLYKTQVRELKEECEEKTKLGKELQ
         :: . :.: :. .  .:::.::::::::::::::::::::.::::: :::..   :  
CCDS11 RLLEFELAQLTKQYRGNEGQMRELQDQLEAEQYFSTLYKTQVKELKEEIEEKNR---ENL
      820       830       840       850       860       870        

      900       910       920       930       940       950        
pF1KA0 QKKQELQDERDSLAAQLEITLTKADSEQLARSIAEEQYSDLEKEKIMKELEIKEMMARHK
       .: ::::.:...::.::... :::.::::::.. :::: .: .:.       :.  .:..
CCDS11 KKIQELQNEKETLATQLDLAETKAESEQLARGLLEEQYFELTQES-------KKAASRNR
         880       890       900       910       920               

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pF1KA0 QELTEKDATIASLEETNRTLTSDVANLANEKEELNNKLKDVQEQLSRLKDEEISAAAIKA
       ::.:.:: :.. :::.:  ::.:.  :  :.:::..:.: ..:. .  :.::::   .::
CCDS11 QEITDKDHTVSRLEEANSMLTKDIEILRRENEELTEKMKKAEEEYKLEKEEEISN--LKA
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pF1KA0 QFEKQLLTERTLKTQAVNKLAEIMNRKE---PVKRGNDTDVRRKEKENRKLHMELKSERE
        :::.. ::::::::::::::::::::.     :..:  :.:.::::::::..::..:::
CCDS11 AFEKNINTERTLKTQAVNKLAEIMNRKDFKIDRKKANTQDLRKKEKENRKLQLELNQERE
        990      1000      1010      1020      1030      1040      

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pF1KA0 KLTQQMIKYQKELNEMQAQIAEESQIRIELQMTLDSKDSDIEQLRSQLQALHIGLDSSSI
       :..:...:.:::::.::::..::   : :::: : ::.:::::::..:  :    ::.:.
CCDS11 KFNQMVVKHQKELNDMQAQLVEECAHRNELQMQLASKESDIEQLRAKLLDLS---DSTSV
       1050      1060      1070      1080      1090         1100   

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pF1KA0 GSGPGDAEADDGFPESRLEGWLSLPVRNNTKKFGWVKKYVIVSSKKILFYDSEQDKEQSN
       .: :.  :.: ..::::.:::::.: :.: :..:: :.::.:::::::::..::::::::
CCDS11 ASFPSADETDGNLPESRIEGWLSVPNRGNIKRYGWKKQYVVVSSKKILFYNDEQDKEQSN
          1110      1120      1130      1140      1150      1160   

        1200      1210      1220      1230      1240        1250   
pF1KA0 PYMVLDIDKLFHVRPVTQTDVYRADAKEIPRIFQILYANEGESKKEQEFPVEPV--GEKS
       : :::::::::::::::: :::::...:::.::::::::::: .:. :  .:::  .::.
CCDS11 PSMVLDIDKLFHVRPVTQGDVYRAETEEIPKIFQILYANEGECRKDVE--MEPVQQAEKT
          1170      1180      1190      1200      1210        1220 

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pF1KA0 NYICHKGHEFIPTLYHFPTNCEACMKPLWHMFKPPPALECRRCHIKCHKDHMDKKEEIIA
       :.  ::::::::::::::.::.:: :::::.:::::::::::::.:::.::.::::..: 
CCDS11 NFQNHKGHEFIPTLYHFPANCDACAKPLWHVFKPPPALECRRCHVKCHRDHLDKKEDLIC
            1230      1240      1250      1260      1270      1280 

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pF1KA0 PCKVYYDISTAKNLLLLANSTEEQQKWVSRLVKKIPKKPPAPDPFARSSPRT-SMKIQQN
       :::: ::...:...:::: : .::.:::..:::::::.::.   :.:.:::: : .   :
CCDS11 PCKVSYDVTSARDMLLLACSQDEQKKWVTHLVKKIPKNPPSG--FVRASPRTLSTRSTAN
            1290      1300      1310      1320        1330         

           1380        
pF1KA0 QSIRRPSRQLAPNKPS
       ::.:.           
CCDS11 QSFRKVVKNTSGKTS 
    1340      1350     

>>CCDS1558.1 CDC42BPA gene_id:8476|Hs108|chr1             (1719 aa)
 initn: 1310 init1: 449 opt: 1516  Z-score: 565.3  bits: 117.4 E(32554): 3.6e-25
Smith-Waterman score: 1642; 30.5% identity (62.1% similar) in 1241 aa overlap (22-1230:2-1152)

               10        20        30        40             50     
pF1KA0 MSRPPPTGKMPGAPETAPGDGAGASRQRKLEALIRDPRSPIN-----VESLLDGLNSLVL
                            .:  : :.:: .: :  .  :     ::.::: :  :  
CCDS15                     MSGEVRLRQLEQFILDGPAQTNGQCFSVETLLDILICLYD
                                   10        20        30        40

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pF1KA0 DLDFPALRKNKNIDNFLNRYEKIVKKIRGLQMKAEDYDVVKVIGRGAFGEVQLVRHKASQ
       . .   ::..::: ..:.  . ...:.. .... ::....::::::::::: .:. : ..
CCDS15 ECNNSPLRREKNILEYLEWAKPFTSKVKQMRLHREDFEILKVIGRGAFGEVAVVKLKNAD
               50        60        70        80        90       100

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pF1KA0 KVYAMKLLSKFEMIKRSDSAFFWEERDIMAFANSPWVVQLFYAFQDDRYLYMVMEYMPGG
       ::.:::.:.:.::.::...: : ::::... ... :.. : ::::::  ::.::.:. ::
CCDS15 KVFAMKILNKWEMLKRAETACFREERDVLVNGDNKWITTLHYAFQDDNNLYLVMDYYVGG
              110       120       130       140       150       160

         180         190       200       210       220       230   
pF1KA0 DLVNLMSNYD--VPEKWAKFYTAEVVLALDAIHSMGLIHRDVKPDNMLLDKHGHLKLADF
       ::..:.:...  .::  :.:: ::.:.:.:..:..  .:::.::::.:.: .::..::::
CCDS15 DLLTLLSKFEDRLPEDMARFYLAEMVIAIDSVHQLHYVHRDIKPDNILMDMNGHIRLADF
              170       180       190       200       210       220

           240       250       260        270       280       290  
pF1KA0 GTCMKMDETGMVHCDTAVGTPDYISPEVLKS-QGGDGFYGRECDWWSVGVFLYEMLVGDT
       :.:.:. : : :. ..:::::::::::.:.. . : : :: ::::::.:: .:::: :.:
CCDS15 GSCLKLMEDGTVQSSVAVGTPDYISPEILQAMEDGKGRYGPECDWWSLGVCMYEMLYGET
              230       240       250       260       270       280

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pF1KA0 PFYADSLVGTYSKIMDHKNSLCFPEDA-EISKHAKNLICAFLTDREVRLGRNGVEEIRQH
       ::::.::: ::.:::.::. . :: .. ..:..::.::  .. .:: :::.::.:....:
CCDS15 PFYAESLVETYGKIMNHKERFQFPAQVTDVSENAKDLIRRLICSREHRLGQNGIEDFKKH
              290       300       310       320       330       340

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pF1KA0 PFFKNDQWHWDNIRETAAPVVPELSSDIDSSNFDDIEDDK-GDVETFPIPK--AFVGNQL
       :::.. .  :::::.  :: .::.::  :.:::: ..::   . ::.: :   :: :..:
CCDS15 PFFSGID--WDNIRNCEAPYIPEVSSPTDTSNFD-VDDDCLKNSETMPPPTHTAFSGHHL
                350       360       370        380       390       

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pF1KA0 PFIGFTYYRENLLLSDSPSCRENDSIQSRKNEESQEIQKKLYTLEEHLSNEMQAKEELEQ
       ::.::::   . .:::  ::     ..   .  : ...    .... :.:.. : :  :.
CCDS15 PFVGFTY-TSSCVLSDR-SC-----LRVTAGPTSLDLD---VNVQRTLDNNL-ATEAYER
       400        410             420          430        440      

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pF1KA0 KCKSVNTRLEKTAKELEEEITLRKSVESALRQLEREKALLQHKNAEYQRKADHEADKKRN
       . :    :::.   :: ..  :..:....       .:: :....      :     ...
CCDS15 RIK----RLEQEKLELSRK--LQESTQTV-------QAL-QYSTV------DGPLTASKD
            450       460                470              480      

      530       540       550       560       570       580        
pF1KA0 LENDVNSLKDQLEDLKKRNQNSQISTEKVNQLQRQLDETNALLRTESDTAARLRKTQAES
       ::  ...::...: :.:.  .:       ..:..::.:.::. : : : :  .:. .:  
CCDS15 LE--IKNLKEEIEKLRKQVTES-------SHLEQQLEEANAV-RQELDDA--FRQIKAYE
          490       500              510        520         530    

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pF1KA0 SKQIQQLESNNRDLQDKNCLLETAKLKLEKEFINLQSALESERRDRTHGSEIINDLQGRI
        :::. :... .:: .:. .  . .::      : .. :.. . .:  . . . ... :.
CCDS15 -KQIKTLQQEREDL-NKELVQASERLK------NQSKELKDAHCQRKLAMQEFMEINERL
           540        550             560       570       580      

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pF1KA0 CGLEEDLKNGKILLAKVELEKRQLQERFTDLEKEKSNMEIDMTYQLKVIQQSLEQEEAEH
            .:.. :  ::.   .:    :. .::  .: .   ..  .:.  ... .. :.. 
CCDS15 ----TELHTQKQKLARHVRDK----EEEVDLVMQKVE---SLRQELRRTERAKKELEVHT
            590       600           610          620       630     

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pF1KA0 KATKARLADKNKIYESIEEAKSEAMKEMEKKLLEERTLKQKVENLLLEAEKRCSLLDCDL
       .:  :. .   :. :. :. ...  .:.:   :... .. .     .: ... . :  ::
CCDS15 EALAAEASKDRKLREQSEHYSKQLENELEG--LKQKQISYSPGVCSIEHQQEITKLKTDL
         640       650       660         670       680       690   

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pF1KA0 -KQSQQKINELLKQKDVLNEDVRNLTLKI-EQETQKRCLTQNDLKMQTQQVNTLKMSEKQ
        :.:    .:: :.. .  ....::  .. ..: :.  :... . .. .  .: . :...
CCDS15 EKKSIFYEEELSKREGIHANEIKNLKKELHDSEGQQLALNKEIMILKDKLEKTRRESQSE
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pF1KA0 LKQENNHLMEMKMNLEKQNAELRKERQDADGQMKELQDQLEAEQYFSTLYKTQVRELKEE
        .. ..   :.:.. :.... : .: .   ... .:    :  .  .   . .:..: ..
CCDS15 REEFES---EFKQQYEREKVLLTEENKKLTSELDKLTTLYENLSIHNQQLEEEVKDLADK
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pF1KA0 CEEKTKLGKELQQKKQELQDERDSLAAQLEITLTKA--DSEQLARSIAEEQYSDLE-KEK
        :  ..   .. .  : ..::.:.  . :.   .:   . : :  :    . .:.  : .
CCDS15 KESVAHWEAQITEIIQWVSDEKDA-RGYLQALASKMTEELEALRNSSLGTRATDMPWKMR
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pF1KA0 IMKELEIKEMMARHKQELTEKDATIASLEETNRTLTSDVANLANEKEELNNKLKDVQEQL
        . .:...  .  ..   .:  :  :  :: :.. .:.. .  . :.  ...:. ..:  
CCDS15 RFAKLDMSARLELQSALDAEIRAKQAIQEELNKVKASNIITECKLKDSEKKNLELLSEIE
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pF1KA0 SRLKD-EEI-SAAAIKAQ-FEKQLLTERTLKTQAVNKLAEI----MNRKEPVKRGNDTDV
       . .:: ::. :  .:. :  ....:.  .  :.:....  .    .. . :. : .    
CCDS15 QLIKDTEELRSEKGIEHQDSQHSFLAFLNTPTDALDQFETVDSTPLSVHTPTLRKKGCPG
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pF1KA0 RRKEKENRKLHMELKSEREKLTQQMIKYQKELNEMQAQIAEESQIRI---ELQMTLDSKD
             .:: :. . .     :    : ..  . : . : .  . ..     ..:  .: 
CCDS15 STGFPPKRKTHQFFVKSFTTPT----KCHQCTSLMVGLIRQGCSCEVCGFSCHITCVNKA
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pF1KA0 SDIEQLRSQLQALHIGLDSSSIGSGPGDAEADDGFPESRLEGWLSLPVRNNTKKFGWVKK
            .  .     .:.: ..   : : :           :: . .:   ..:: :: . 
CCDS15 PTTCPVPPEQTKGPLGIDPQK---GIGTA----------YEGHVRIPKPAGVKK-GWQRA
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pF1KA0 YVIVSSKKILFYDSEQDKEQSNPYMVL----DI-DKLFHVRPVTQTDVYRADAKEIPRIF
        .:: . :...::  . :  :.: .:.    :. :. : :  :  .:: .:. :.:: ::
CCDS15 LAIVCDFKLFLYDIAEGKA-SQPSVVISQVIDMRDEEFSVSSVLASDVIHASRKDIPCIF
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pF1KA0 QILYANEGESKKEQEFPVEPVGEKSNYICHKGHEFIPTLYHFPTNCEACMKPLWHMFKPP
       ..                                                          
CCDS15 RVTASQLSASNNKCSILMLADTENEKNKWVGVLSELHKILKKNKFRDRSVYVPKEAYDST
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>>CCDS9978.1 CDC42BPB gene_id:9578|Hs108|chr14            (1711 aa)
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pF1KA0 MSRPPPTGKMPGAPETAPGDGAGASRQRKLEALIRD-P---RSPINVESLLDGLNSLVLD
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CCDS99                     MSAKVRLKKLEQLLLDGPWRNESALSVETLLDVLVCLYTE
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pF1KA0 LDFPALRKNKNIDNFLNRYEKIVKKIRGLQMKAEDYDVVKVIGRGAFGEVQLVRHKASQK
        .  :::..: . .::.  . ... .. .:.. ::....::::::::::: .:. : ...
CCDS99 CSHSALRRDKYVAEFLEWAKPFTQLVKEMQLHREDFEIIKVIGRGAFGEVAVVKMKNTER
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pF1KA0 VYAMKLLSKFEMIKRSDSAFFWEERDIMAFANSPWVVQLFYAFQDDRYLYMVMEYMPGGD
       .::::.:.:.::.::...: : ::::... ..  :.. : :::::. .::.::.:. :::
CCDS99 IYAMKILNKWEMLKRAETACFREERDVLVNGDCQWITALHYAFQDENHLYLVMDYYVGGD
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pF1KA0 LVNLMSNYD--VPEKWAKFYTAEVVLALDAIHSMGLIHRDVKPDNMLLDKHGHLKLADFG
       :..:.:...  .::  :.:: .:.:::.:.::..  .:::.::::.::: .::..:::::
CCDS99 LLTLLSKFEDKLPEDMARFYIGEMVLAIDSIHQLHYVHRDIKPDNVLLDVNGHIRLADFG
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pF1KA0 TCMKMDETGMVHCDTAVGTPDYISPEVLKS-QGGDGFYGRECDWWSVGVFLYEMLVGDTP
       .:.::.. : :. ..:::::::::::.:.. . : : :: ::::::.:: .:::: :.::
CCDS99 SCLKMNDDGTVQSSVAVGTPDYISPEILQAMEDGMGKYGPECDWWSLGVCMYEMLYGETP
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pF1KA0 FYADSLVGTYSKIMDHKNSLCFPEDA-EISKHAKNLICAFLTDREVRLGRNGVEEIRQHP
       :::.::: ::.:::.:.. . ::  . ..:..::.::  .. .:: :::.::.:....: 
CCDS99 FYAESLVETYGKIMNHEERFQFPSHVTDVSEEAKDLIQRLICSRERRLGQNGIEDFKKHA
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pF1KA0 FFKNDQWHWDNIRETAAPVVPELSSDIDSSNFDDIEDDK-GDVETFPIPKA---FVGNQL
       ::..   .:.:::.  :: .:..::  :.:::: ..::   ..: .: : .   : : .:
CCDS99 FFEG--LNWENIRNLEAPYIPDVSSPSDTSNFD-VDDDVLRNTEILP-PGSHTGFSGLHL
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pF1KA0 PFIGFTYYRENLLLSDSPSCRENDSIQSRKNEESQEIQKKLYTLEEHLSNEMQAKEELEQ
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CCDS99 PFIGFTFTTESCF-SDRGSLK--SIMQSNTLTKDEDVQRDL----EH-SLQMEA---YER
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pF1KA0 KCKSVNTRLEKTAKELEEEITLRKSVESALRQLEREKALLQHKNAEYQRKADHEADKKRN
       . .    :::.   :: ..  :..:....       .:: . .  .  .: ..: .. .:
CCDS99 RIR----RLEQEKLELSRK--LQESTQTVQSLHGSSRALSNSNRDKEIKKLNEEIERLKN
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pF1KA0 LENDVNSLKDQLEDLKKRNQNSQISTEKVNQLQRQLDETNALLRTESDTAARLRKTQAES
          : : :. ::::     :. . ::...  :..:    . ..: :..   .:.:  .:.
CCDS99 KIADSNRLERQLEDTVALRQEREDSTQRLRGLEKQ----HRVVRQEKE---ELHKQLVEA
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pF1KA0 SKQIQQLESNNRDLQDKNCLLETAKLKLEKEFINLQSALESERRDRTHGSEIINDLQGRI
       :   ..:.:. ..:.: .   .  :: :. :: .:.  .   : .. . :. . : . ..
CCDS99 S---ERLKSQAKELKDAH---QQRKLALQ-EFSELNERMAELRAQKQKVSRQLRDKEEEM
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pF1KA0 CGLEEDLKNGKILLAKVELEKRQLQERFTDLEKEKSNMEIDMTYQLKVIQQSL-EQEEAE
           . .   .  . ..:  ...:. .. :   : :. .     .:.  .... .: :.:
CCDS99 EVATQKVDAMRQEMRRAEKLRKELEAQLDDAVAEASKER-----KLREHSENFCKQMESE
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pF1KA0 HKATKARLADKNKIYESIEEAK--SEAMKEMEKKLL--EERTLKQKVENLLLEAEKRCSL
        .: :.. . ..    ..:. .  :.  .:.:::.:  ::. ..... ..:   . .  .
CCDS99 LEALKVKQGGRGA-GATLEHQQEISKIKSELEKKVLFYEEELVRREASHVLEVKNVKKEV
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pF1KA0 LDCDLKQ-SQQKINELLKQKDVLNEDVRNLTLKIEQETQKRCLTQNDLKMQTQQVNTLKM
        : . .: . ::  :.:  :: :... :.   ..:. .       . .: . ..  .. .
CCDS99 HDSESHQLALQK--EILMLKDKLEKSKRERHNEMEEAV-------GTIKDKYERERAMLF
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pF1KA0 SE-KQLKQENNHLMEMKMNLEKQNAELRKERQDA----------DGQMKEL----QDQLE
       .: :.:  ::..:  .  .:  :: .:. : ::           ..:. :.    .:. .
CCDS99 DENKKLTAENEKLCSFVDKLTAQNRQLEDELQDLAAKKESVAHWEAQIAEIIQWVSDEKD
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pF1KA0 AEQYFSTLYKTQVRELKEECEEKTKLG-KELQQKKQELQDERDSLAAQLEITLTKADSEQ
       :. :...: . ...::  :  ....:: . :.   .  .... ...:.::.  .  ..: 
CCDS99 ARGYLQALASKMTEEL--EALRSSSLGSRTLDPLWKVRRSQKLDMSARLELQ-SALEAEI
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pF1KA0 LARSIAEEQYSDLEKEKIMKELEIKEMMARHKQELTEKDATIASLEETNRTLTS-DVANL
        :.....:.   ..  ..  : ..:.  :.... : : .    ..::  :. :.  . ..
CCDS99 RAKQLVQEELRKVKDANLTLESKLKDSEAKNRELLEEMEILKKKMEEKFRADTGLKLPDF
       890       900       910       920       930       940       

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pF1KA0 ANEKEELNNKLKDVQEQLSRLKDEEISAAAIKAQFEKQLLTERTLKTQAVNKLAEIMNRK
        .   :  :    ...   : .    ::.  ..:  :   .     . :...  : : : 
CCDS99 QDSIFEYFNTAPLAHDLTFRTS----SASEQETQAPKPEASPSM--SVAASEQQEDMAR-
       950       960           970       980         990      1000 

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pF1KA0 EPVKRGNDTDVRRKEKENRKLHMELKSEREKLTQQMIK-YQKELNEMQAQIAEESQIRIE
        : .: . . .   .       . : . . :  :  :: ...  .  .      . ::  
CCDS99 -PPQRPSAVPLPTTQA------LALAGPKPKAHQFSIKSFSSPTQCSHCTSLMVGLIRQG
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pF1KA0 LQMTLDSKDSDIEQLRSQLQALHIGLDSSSIGSGPGDAEADDGFPESRLEGWLSLPVRNN
           . :    .    .  :.  :  ..:.    :  .... :.  .  .: ...:  ..
CCDS99 YACEVCSFACHVSCKDGAPQVCPIPPEQSK---RPLGVDVQRGIGTAY-KGHVKVPKPTG
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pF1KA0 TKKFGWVKKYVIVSSKKILFYDSEQDKEQSNPYM----VLDI-DKLFHVRPVTQTDVYRA
       .:: :: . :..: . :...::  . : ...: .    :::. :  : :  :  .:: .:
CCDS99 VKK-GWQRAYAVVCDCKLFLYDLPEGK-STQPGVIASQVLDLRDDEFSVSSVLASDVIHA
    1110       1120      1130       1140      1150      1160       

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pF1KA0 DAKEIPRIFQILYANEGESKKEQEFPV--EPVGEKSNYICHKGHEFIPTLYHFPTNCEAC
         ..:: ::..  .  :  .: . . .  :  .:: ...                     
CCDS99 TRRDIPCIFRVTASLLGAPSKTSSLLILTENENEKRKWVGILEGLQSILHKNRLRNQVVH
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pF1KA0 MKPLWHMFKPPPALECRRCHIKCHKDHMDKKEEIIAPCKVYYDISTAKNLLLLANSTEEQ
                                                                   
CCDS99 VPLEAYDSSLPLIKAILTAAIVDADRIAVGLEEGLYVIEVTRDVIVRAADCKKVHQIELA
      1230      1240      1250      1260      1270      1280       

>>CCDS1559.1 CDC42BPA gene_id:8476|Hs108|chr1             (1638 aa)
 initn: 1347 init1: 449 opt: 1476  Z-score: 551.3  bits: 114.7 E(32554): 2.2e-24
Smith-Waterman score: 1578; 30.9% identity (61.1% similar) in 1229 aa overlap (22-1230:2-1071)

               10        20        30        40             50     
pF1KA0 MSRPPPTGKMPGAPETAPGDGAGASRQRKLEALIRDPRSPIN-----VESLLDGLNSLVL
                            .:  : :.:: .: :  .  :     ::.::: :  :  
CCDS15                     MSGEVRLRQLEQFILDGPAQTNGQCFSVETLLDILICLYD
                                   10        20        30        40

          60        70        80        90       100       110     
pF1KA0 DLDFPALRKNKNIDNFLNRYEKIVKKIRGLQMKAEDYDVVKVIGRGAFGEVQLVRHKASQ
       . .   ::..::: ..:.  . ...:.. .... ::....::::::::::: .:. : ..
CCDS15 ECNNSPLRREKNILEYLEWAKPFTSKVKQMRLHREDFEILKVIGRGAFGEVAVVKLKNAD
               50        60        70        80        90       100

         120       130       140       150       160       170     
pF1KA0 KVYAMKLLSKFEMIKRSDSAFFWEERDIMAFANSPWVVQLFYAFQDDRYLYMVMEYMPGG
       ::.:::.:.:.::.::...: : ::::... ... :.. : ::::::  ::.::.:. ::
CCDS15 KVFAMKILNKWEMLKRAETACFREERDVLVNGDNKWITTLHYAFQDDNNLYLVMDYYVGG
              110       120       130       140       150       160

         180         190       200       210       220       230   
pF1KA0 DLVNLMSNYD--VPEKWAKFYTAEVVLALDAIHSMGLIHRDVKPDNMLLDKHGHLKLADF
       ::..:.:...  .::  :.:: ::.:.:.:..:..  .:::.::::.:.: .::..::::
CCDS15 DLLTLLSKFEDRLPEDMARFYLAEMVIAIDSVHQLHYVHRDIKPDNILMDMNGHIRLADF
              170       180       190       200       210       220

           240       250       260        270       280       290  
pF1KA0 GTCMKMDETGMVHCDTAVGTPDYISPEVLKS-QGGDGFYGRECDWWSVGVFLYEMLVGDT
       :.:.:. : : :. ..:::::::::::.:.. . : : :: ::::::.:: .:::: :.:
CCDS15 GSCLKLMEDGTVQSSVAVGTPDYISPEILQAMEDGKGRYGPECDWWSLGVCMYEMLYGET
              230       240       250       260       270       280

            300       310        320       330       340       350 
pF1KA0 PFYADSLVGTYSKIMDHKNSLCFPEDA-EISKHAKNLICAFLTDREVRLGRNGVEEIRQH
       ::::.::: ::.:::.::. . :: .. ..:..::.::  .. .:: :::.::.:....:
CCDS15 PFYAESLVETYGKIMNHKERFQFPAQVTDVSENAKDLIRRLICSREHRLGQNGIEDFKKH
              290       300       310       320       330       340

             360       370       380       390        400          
pF1KA0 PFFKNDQWHWDNIRETAAPVVPELSSDIDSSNFDDIEDDK-GDVETFPIPK--AFVGNQL
       :::.. .  :::::.  :: .::.::  :.:::: ..::   . ::.: :   :: :..:
CCDS15 PFFSGID--WDNIRNCEAPYIPEVSSPTDTSNFD-VDDDCLKNSETMPPPTHTAFSGHHL
                350       360       370        380       390       

      410       420       430       440       450       460        
pF1KA0 PFIGFTYYRENLLLSDSPSCRENDSIQSRKNEESQEIQKKLYTLEEHLSNEMQAKEELEQ
       ::.::::   . .:::  ::     ..   .  : ...    .... :.:.. : :  :.
CCDS15 PFVGFTY-TSSCVLSDR-SC-----LRVTAGPTSLDLD---VNVQRTLDNNL-ATEAYER
       400        410             420          430        440      

      470       480       490       500       510       520        
pF1KA0 KCKSVNTRLEKTAKELEEEITLRKSVESALRQLEREKALLQHKNAEYQRKADHEADKKRN
       . :    :::.   :: ..  :..:....       .:: :....      :     ...
CCDS15 RIK----RLEQEKLELSRK--LQESTQTV-------QAL-QYSTV------DGPLTASKD
            450       460                470              480      

      530       540       550       560       570       580        
pF1KA0 LENDVNSLKDQLEDLKKRNQNSQISTEKVNQLQRQLDETNALLRTESDTAARLRKTQAES
       ::  ...::...: :.:.  .:       ..:..::.:.::. : : : :  .:. .:  
CCDS15 LE--IKNLKEEIEKLRKQVTES-------SHLEQQLEEANAV-RQELDDA--FRQIKAYE
          490       500              510        520         530    

      590       600       610       620       630       640        
pF1KA0 SKQIQQLESNNRDLQDKNCLLETAKLKLEKEFINLQSALESERRDRTHGSEIINDLQGRI
        :::. :... .::.           ::: .   : .   ..:. : .. .  ..:....
CCDS15 -KQIKTLQQEREDLN-----------KLEVHTEALAAEASKDRKLREQSEHYSKQLENEL
           540                  550       560       570       580  

      650       660       670       680       690       700        
pF1KA0 CGLEEDLKNGKILLAKVELEKRQLQERFTDLEKEKSNMEIDMTYQLKVIQQSLEQEEAEH
        ::..   . .  . ..: ..... .  ::::: ::     . :.     . : ..:. :
CCDS15 EGLKQKQISYSPGVCSIE-HQQEITKLKTDLEK-KS-----IFYE-----EELSKREGIH
            590       600        610             620            630

      710       720       730       740       750       760        
pF1KA0 KATKARLADKNKIYESIEEAKSEAMKEMEKKLLEERTLKQKVENLLLEAEKRCSLLDCDL
             :  :.....:  :... :..   :...    ::.:.:.   :....   .. ..
CCDS15 ANEIKNL--KKELHDS--EGQQLALN---KEIM---ILKDKLEKTRRESQSEREEFESEF
                640         650             660       670       680

      770       780       790       800       810       820        
pF1KA0 KQSQQKINELLKQKDVLNEDVRNLTLKIEQETQKRCLTQNDLKMQTQQVNTLKMSEKQLK
       ::. ..      .: .:.:. ..:: .... :    : .:           :.. ..::.
CCDS15 KQQYER------EKVLLTEENKKLTSELDKLTT---LYEN-----------LSIHNQQLE
                    690       700          710                  720

      830       840       850       860       870       880        
pF1KA0 QENNHLMEMKMNLEKQNAELRKERQDADGQMKELQDQLEAEQYFSTLYKTQVRELKEECE
       .: . : . : .. . .:.. .        .. ..:. .:. :...: . ...::  :  
CCDS15 EEVKDLADKKESVAHWEAQITE-------IIQWVSDEKDARGYLQALASKMTEEL--EAL
              730       740              750       760         770 

      890       900        910       920       930       940       
pF1KA0 EKTKLGKELQQKKQELQD-ERDSLAAQLEITLTKADSEQLARSIAEEQYSDLEKEKIMKE
       ....:: .  .   ...   . ...:.::.  .  :.:  :..  .:. . ..  .:. :
CCDS15 RNSSLGTRATDMPWKMRRFAKLDMSARLELQ-SALDAEIRAKQAIQEELNKVKASNIITE
             780       790       800        810       820       830

       950       960       970       980       990      1000       
pF1KA0 LEIKEMMARHKQELTEKDATIASLEETNRTLTSDVANLANEKEELNNKLKDVQEQLSRLK
        ..:.                   :. :  : :.. .: .. ::: .. : ...: :. .
CCDS15 CKLKDS------------------EKKNLELLSEIEQLIKDTEELRSE-KGIEHQDSQHS
                                840       850       860        870 

      1010        1020      1030      1040      1050      1060     
pF1KA0 DEEISAAAIKA--QFEKQLLTERTLKTQAVNKLAEIMNRKEPVKRGNDTDVRRKEKENRK
          .  .   :  :::    :  ...: .. : .   .   : :: .     ..     :
CCDS15 FLAFLNTPTDALDQFETVDSTPLSVHTPTLRKKGCPGSTGFPPKRKTHQFFVKSFTTPTK
             880       890       900       910       920       930 

        1070      1080      1090      1100      1110      1120     
pF1KA0 LHMELKSEREKLTQQMIKYQKELNEMQAQIAEESQIRIELQMTLDSKDSDIEQLRSQLQA
        :        . :. :.   ..    . ..   :     .. .  .     :: .. :  
CCDS15 CH--------QCTSLMVGLIRQ--GCSCEVCGFSCHITCVNKAPTTCPVPPEQTKGPL--
                     940         950       960       970           

        1130      1140      1150      1160      1170      1180     
pF1KA0 LHIGLDSSSIGSGPGDAEADDGFPESRLEGWLSLPVRNNTKKFGWVKKYVIVSSKKILFY
          :.: ..   : : :           :: . .:   ..:: :: .  .:: . :...:
CCDS15 ---GIDPQK---GIGTA----------YEGHVRIPKPAGVKK-GWQRALAIVCDFKLFLY
        980          990                1000       1010      1020  

        1190      1200           1210      1220      1230      1240
pF1KA0 DSEQDKEQSNPYMVL----DI-DKLFHVRPVTQTDVYRADAKEIPRIFQILYANEGESKK
       :  . :  :.: .:.    :. :. : :  :  .:: .:. :.:: ::..          
CCDS15 DIAEGKA-SQPSVVISQVIDMRDEEFSVSSVLASDVIHASRKDIPCIFRVTASQLSASNN
            1030      1040      1050      1060      1070      1080 

             1250      1260      1270      1280      1290      1300
pF1KA0 EQEFPVEPVGEKSNYICHKGHEFIPTLYHFPTNCEACMKPLWHMFKPPPALECRRCHIKC
                                                                   
CCDS15 KCSILMLADTENEKNKWVGVLSELHKILKKNKFRDRSVYVPKEAYDSTLPLIKTTQAAAI
            1090      1100      1110      1120      1130      1140 

>>CCDS9192.1 CIT gene_id:11113|Hs108|chr12                (2027 aa)
 initn: 1105 init1: 441 opt: 1410  Z-score: 526.5  bits: 110.4 E(32554): 5.3e-23
Smith-Waterman score: 1520; 26.9% identity (58.9% similar) in 1410 aa overlap (27-1300:32-1403)

                   10        20        30        40        50      
pF1KA0     MSRPPPTGKMPGAPETAPGDGAGASRQRKLEALIRDPRSPINVESLLDGLNSLVLD
                                     : :   . ..  ::.. :..::.:  :  .
CCDS91 LKFKYGARNPLDAGAAEPIASRASRLNLFFQGKPPFMTQQQMSPLSREGILDALFVLFEE
              10        20        30        40        50        60 

         60        70        80        90       100       110      
pF1KA0 LDFPALRKNKNIDNFLNRYEKIVKKIRGLQMKAEDYDVVKVIGRGAFGEVQLVRHKASQK
        . ::: : :...::. .:   . ... :: .:.:..: ...: : :.:::.::.::.  
CCDS91 CSQPALMKIKHVSNFVRKYSDTIAELQELQPSAKDFEVRSLVGCGHFAEVQVVREKATGD
              70        80        90       100       110       120 

        120       130       140       150       160       170      
pF1KA0 VYAMKLLSKFEMIKRSDSAFFWEERDIMAFANSPWVVQLFYAFQDDRYLYMVMEYMPGGD
       .::::...:  .. . . .:: :::.:.. ..:::. :: :::::  .::.::::.::::
CCDS91 IYAMKVMKKKALLAQEQVSFFEEERNILSRSTSPWIPQLQYAFQDKNHLYLVMEYQPGGD
             130       140       150       160       170       180 

        180         190       200       210       220       230    
pF1KA0 LVNLMSNYD--VPEKWAKFYTAEVVLALDAIHSMGLIHRDVKPDNMLLDKHGHLKLADFG
       :..:.. :.  . :.  .:: ::..::. ..: :: .:::.::.:.:.:. ::.::.:::
CCDS91 LLSLLNRYEDQLDENLIQFYLAELILAVHSVHLMGYVHRDIKPENILVDRTGHIKLVDFG
             190       200       210       220       230       240 

          240       250       260         270       280       290  
pF1KA0 TCMKMDETGMVHCDTAVGTPDYISPEVLKSQGGDG--FYGRECDWWSVGVFLYEMLVGDT
       .  ::. . ::.    .:::::..::::  ..:::   :: .::::::::. :::. : .
CCDS91 SAAKMNSNKMVNAKLPIGTPDYMAPEVLTVMNGDGKGTYGLDCDWWSVGVIAYEMIYGRS
             250       260       270       280       290       300 

            300       310       320       330       340       350  
pF1KA0 PFYADSLVGTYSKIMDHKNSLCFPEDAEISKHAKNLICAFLTDREVRLGRNGVEEIRQHP
       ::   . . :...::. .  : ::.: ..:.   .:: ..:  .. ::  .:   .  ::
CCDS91 PFAEGTSARTFNNIMNFQRFLKFPDDPKVSSDFLDLIQSLLCGQKERLKFEG---LCCHP
             310       320       330       340       350           

            360       370       380       390          400         
pF1KA0 FFKNDQWHWDNIRETAAPVVPELSSDIDSSNFDDIEDDKGDVETFPI---PKAFVGNQLP
       ::.  .  :.:::..  : :: :.:: :.::::. : ..  : . :    :..: :..::
CCDS91 FFS--KIDWNNIRNSPPPFVPTLKSDDDTSNFDEPEKNSW-VSSSPCQLSPSGFSGEELP
      360         370       380       390        400       410     

     410       420                430          440       450       
pF1KA0 FIGFTYYRENLLLS---------DSPSCRENDSIQSR---KNEESQEIQKKLYTLEEHLS
       :.::.: .   .:.         :::.  ...:....   :..: :. : : . .:....
CCDS91 FVGFSYSKALGILGRSESVVSGLDSPA--KTSSMEKKLLIKSKELQDSQDKCHKMEQEMT
         420       430       440         450       460       470   

       460       470       480       490       500       510       
pF1KA0 NEMQAKEELEQKCKSVNTRLEKTAKELEEEITLRKSVESALRQLEREKALLQHKNAEYQR
              .:... . :.. : .   ::.   : :. .:. :     : . :...  . . 
CCDS91 -------RLHRRVSEVEAVLSQKEVELKASETQRSLLEQDLATYITECSSLKRSLEQARM
                  480       490       500       510       520      

       520       530       540       550       560       570       
pF1KA0 KADHEADKKRNLENDVNSLKDQLEDLKKRNQNSQISTEKVNQLQRQLDETNALLRTESDT
       ....: ::  .: .:.   . .:...:... ..:.  :..  .. ::.:  .  : .:: 
CCDS91 EVSQEDDKALQLLHDIREQSRKLQEIKEQEYQAQV--EEMRLMMNQLEEDLVSARRRSDL
        530       540       550       560         570       580    

        580         590       600           610            620     
pF1KA0 -AARLRKTQ--AESSKQIQQLESNNRDL----QDKNCLLETAKL-KLEKE----FINLQS
         ..::...  ::  :. .  : ... :    : :  . : ::: :.. :    . .:: 
CCDS91 YESELRESRLAAEEFKR-KATECQHKLLKAKDQGKPEVGEYAKLEKINAEQQLKIQELQE
          590       600        610       620       630       640   

         630       640       650       660       670       680     
pF1KA0 ALESERRDRTHGSEIINDLQGRICGLEEDLKNGKILLAKVELEKRQLQERFTDLEK-EKS
        ::.  .  :...:......      :..:..    : . :  .. ....... :. :..
CCDS91 KLEKAVKASTEATELLQNIRQAKERAERELEK----LQNREDSSEGIRKKLVEAEELEEK
           650       660       670           680       690         

          690       700       710       720       730       740    
pF1KA0 NMEIDMTYQLKVIQQSLEQEEAEHKATKARLADKNKIYESIEEAKSEAMKEMEKKLLEER
       . : ... :   ..  :.:.: .:   : .. : :.: ...  : .:....: ..  :: 
CCDS91 HREAQVSAQH--LEVHLKQKE-QHYEEKIKVLD-NQIKKDL--ADKETLENMMQRHEEEA
     700         710        720        730         740       750   

          750       760       770                        780       
pF1KA0 TLKQKVENLLLEAEKRCSLLDCDLKQSQQKINEL-----------------LKQKDVLNE
         : :.   : : .   . .:  ... .:.: ::                 .: .. .  
CCDS91 HEKGKI---LSEQKAMINAMDSKIRSLEQRIVELSEANKLAANSSLFTQRNMKAQEEMIS
              760       770       780       790       800       810

       790       800       810       820        830       840      
pF1KA0 DVRNLTLKIEQETQKRCLTQNDLKMQTQQVNTLKMSEK-QLKQENNHLMEMKMNLEKQNA
       ..:.  . .: .. :    .  :. : ....    :.: .: . ...: :.... :.:. 
CCDS91 ELRQQKFYLETQAGKLEAQNRKLEEQLEKISHQDHSDKNRLLELETRLREVSLEHEEQKL
              820       830       840       850       860       870

        850       860       870       880       890           900  
pF1KA0 ELRKERQDADGQMKELQDQLEAEQYFSTLYKTQVRELKEECEEKTKLGKE----LQQKKQ
       ::...  . . ...: ..:: : :   .  ..:.:. : : :: :  ..:    :  ...
CCDS91 ELKRQLTELQLSLQERESQLTALQAARAALESQLRQAKTELEETTAEAEEEIQALTAHRD
              880       890       900       910       920       930

            910                920             930       940       
pF1KA0 ELQDERDSLAAQLEIT---------LTKADSE------QLARSIAEEQYSDLEKEKIMKE
       :.: . :.:  .  .          ::. ..:       :.... : . .. :  .. .:
CCDS91 EIQRKFDALRNSCTVITDLEEQLNQLTEDNAELNNQNFYLSKQLDEASGANDEIVQLRSE
              940       950       960       970       980       990

        950       960       970       980       990      1000      
pF1KA0 LE-IKEMMARHKQELTEKDATIASLEETNRTLTSDVANLANEKEELNNKLKDVQEQLSRL
       .. ... .......:: .  :. .:. :   :  .: .:   ..:: .: .. .   : :
CCDS91 VDHLRREITEREMQLTSQKQTMEALKTTCTMLEEQVMDLEALNDELLEKERQWEAWRSVL
             1000      1010      1020      1030      1040      1050

       1010      1020      1030                     1040      1050 
pF1KA0 KDEEISAAAIKAQFEKQLLTERTLKTQAVNKL---------------AEIMNRKEPVKRG
        ::. .      .....: ::.  ...: ...               :::.  .. .:. 
CCDS91 GDEKSQFECRVRELQRMLDTEKQSRARADQRITESRQVVELAVKEHKAEILALQQALKEQ
             1060      1070      1080      1090      1100      1110

                         1060      1070      1080      1090        
pF1KA0 -------ND--TDVRRK----EKENRKLHMELKSEREKLTQQMIKYQKELNEMQAQIAEE
              .:  .:...:    : . :.:...:..::: : :.... : .:.. : .. ..
CCDS91 KLKAESLSDKLNDLEKKHAMLEMNARSLQQKLETERE-LKQRLLEEQAKLQQ-QMDLQKN
             1120      1130      1140       1150      1160         

     1100        1110            1120      1130      1140          
pF1KA0 SQIRIE--LQMTLDSKD------SDIEQLRSQLQALHIGLDSSSIGSGPGDAEADDGF--
         .:.   :: .::  :      ::.:    ..:.:.     .  :.   ...  : .  
CCDS91 HIFRLTQGLQEALDRADLLKTERSDLEYQLENIQVLYSHEKVKMEGTISQQTKLIDFLQA
     1170      1180      1190      1200      1210      1220        

         1150                 1160      1170             1180      
pF1KA0 ----PESRLEGWLS-----------LPVRNNTKKFGWVKKYV-------IVSSKKILFYD
           : .. .: .:           .:.. :  :..  :. .        ... .: . .
CCDS91 KMDQPAKKKKGLFSRRKEDPALPTQVPLQYNELKLALEKEKARCAELEEALQKTRIELRS
     1230      1240      1250      1260      1270      1280        

       1190          1200      1210      1220      1230      1240  
pF1KA0 SEQD----KEQSNPYMVLDIDKLFHVRPVTQTDVYRADAKEIPRIFQILYANEGESKKEQ
       ....    :  ..:.           . .... . :.  .. :  ...: :  .  .::.
CCDS91 AREEAAHRKATDHPHPSTPATAR---QQIAMSAIVRSPEHQ-PSAMSLL-APPSSRRKES
     1290      1300      1310         1320       1330       1340   

           1250       1260      1270      1280      1290       1300
pF1KA0 EFPVEPVGEKSNYICHK-GHEFIPTLYHFPTNCEACMKPLWHMFKPPPALECR-RCHIKC
         : :   . .. . :.  :.:   :    :.: .:.  .    .    :::.  :: ::
CCDS91 STPEEFSRRLKERMHHNIPHRFNVGLNMRATKCAVCLDTVHFGRQASKCLECQVMCHPKC
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             1310      1320      1330      1340      1350      1360
pF1KA0 HKDHMDKKEEIIAPCKVYYDISTAKNLLLLANSTEEQQKWVSRLVKKIPKKPPAPDPFAR
                                                                   
CCDS91 STCLPATCGLPAEYATHFTEAFCRDKMNSPGLQTKEPSSSLHLEGWMKVPRNNKRGQQGW
          1410      1420      1430      1440      1450      1460   

>>CCDS31601.1 CDC42BPG gene_id:55561|Hs108|chr11          (1551 aa)
 initn: 1283 init1: 447 opt: 1398  Z-score: 523.8  bits: 109.5 E(32554): 7.4e-23
Smith-Waterman score: 1424; 34.4% identity (64.9% similar) in 834 aa overlap (26-836:4-796)

               10        20        30          40        50        
pF1KA0 MSRPPPTGKMPGAPETAPGDGAGASRQRKLEALIRDPRS--PINVESLLDGLNSLVLDLD
                                : : :: : :   .  : ....::: : .:  .:.
CCDS31                       MERRLRALEQLARGEAGGCP-GLDGLLDLLLALHHELS
                                     10        20         30       

       60        70        80        90       100       110        
pF1KA0 FPALRKNKNIDNFLNRYEKIVKKIRGLQMKAEDYDVVKVIGRGAFGEVQLVRHKASQKVY
          ::..... .::.    .:.:.. :... .:....::::::::::: .::.. . ...
CCDS31 SGPLRRERSVAQFLSWASPFVSKVKELRLQRDDFEILKVIGRGAFGEVTVVRQRDTGQIF
        40        50        60        70        80        90       

      120       130       140       150       160       170        
pF1KA0 AMKLLSKFEMIKRSDSAFFWEERDIMAFANSPWVVQLFYAFQDDRYLYMVMEYMPGGDLV
       :::.: :.::.::...: : ::::... ..: ::. : :::::..:::.::.:. ::::.
CCDS31 AMKMLHKWEMLKRAETACFREERDVLVKGDSRWVTTLHYAFQDEEYLYLVMDYYAGGDLL
       100       110       120       130       140       150       

      180         190       200       210       220       230      
pF1KA0 NLMSNYD--VPEKWAKFYTAEVVLALDAIHSMGLIHRDVKPDNMLLDKHGHLKLADFGTC
       .:.: ..  .: . :.:: ::.:::. ..:..: .::::::::.::: .::..:::::.:
CCDS31 TLLSRFEDRLPPELAQFYLAEMVLAIHSLHQLGYVHRDVKPDNVLLDVNGHIRLADFGSC
       160       170       180       190       200       210       

        240       250       260        270       280       290     
pF1KA0 MKMDETGMVHCDTAVGTPDYISPEVLKS-QGGDGFYGRECDWWSVGVFLYEMLVGDTPFY
       .... .:::  ..:::::::::::.:.. . : : :: .:::::.::  ::.: :.::::
CCDS31 LRLNTNGMVDSSVAVGTPDYISPEILQAMEEGKGHYGPQCDWWSLGVCAYELLFGETPFY
       220       230       240       250       260       270       

         300       310        320       330       340       350    
pF1KA0 ADSLVGTYSKIMDHKNSLCFPEDA-EISKHAKNLICAFLTDREVRLGRNGVEEIRQHPFF
       :.::: ::.:::.:.. : :: :. ..   :..::  .:  .: ::::.:....:.::::
CCDS31 AESLVETYGKIMNHEDHLQFPPDVPDVPASAQDLIRQLLCRQEERLGRGGLDDFRNHPFF
       280       290       300       310       320       330       

          360       370       380       390       400         410  
pF1KA0 KNDQWHWDNIRETAAPVVPELSSDIDSSNFDDIEDDKGDVETFPIPK--AFVGNQLPFIG
       .. .:  . .  ..:: .::: . .:.::::  .:  .   :.: :.  :: :..:::.:
CCDS31 EGVDW--ERLASSTAPYIPELRGPMDTSNFDVDDDTLNHPGTLPPPSHGAFSGHHLPFVG
       340         350       360       370       380       390     

            420       430       440       450       460       470  
pF1KA0 FTYYRENLLLSDSPSCRENDSIQSRKNEESQEIQKKLYTLEEHLSNEMQAKEELEQKCKS
       :::       : ::   :..:      :    ...::  ::.. . :.. :..   .  .
CCDS31 FTYTSG----SHSP---ESSS------EAWAALERKLQCLEQE-KVELSRKHQEALHAPT
         400                    410       420        430       440 

            480       490       500       510       520            
pF1KA0 VNTRLEKTAKELEEEITLRKSVESALRQLEREKALLQHKNAEYQRKADHEADKK------
        . .::.  ::..   :::      : .. :.:: :.. ..    .  ...: .      
CCDS31 DHRELEQLRKEVQ---TLRDR----LPEMLRDKASLSQTDGPPAGSPGQDSDLRQELDRL
             450              460       470       480       490    

         530       540       550       560       570       580     
pF1KA0 -RNLENDVNSLKDQLEDLKKRNQNSQISTEKVNQLQRQLDETNALLRTESDTAARLRKTQ
        :.: .   .:. : ..: . . ...   ..... :..   : .  :. :.   . : .:
CCDS31 HRELAEGRAGLQAQEQELCRAQGQQEELLQRLQEAQEREAATASQTRALSSQLEEARAAQ
          500       510       520       530       540       550    

         590       600       610       620       630       640     
pF1KA0 AESSKQIQQLESNNRDLQDKNCLLETAKLKLEKEFINLQSALESERRDRTHGSEIINDLQ
        :   :...:  .  .:: .       .:.  ..  ....: :..     .:.    .:.
CCDS31 RELEAQVSSLSRQVTQLQGQ----WEQRLEESSQAKTIHTASETNGMGPPEGGPQEAQLR
          560       570           580       590       600       610

         650       660       670        680       690       700    
pF1KA0 GRICGLEEDLKNGKILLAKVELEKR-QLQERFTDLEKEKSNMEIDMTYQLKVIQQSLEQE
        .. .:.:.:....    . . :   ::::.   : .:.  .: ... : .  .: :: :
CCDS31 KEVAALREQLEQAHSHRPSGKEEALCQLQEENRRLSREQERLEAELA-QEQESKQRLEGE
              620       630       640       650        660         

          710        720       730       740       750       760   
pF1KA0 EAEHKAT-KARLADKNKIYESIEEAKSEAMKEMEKKLLEERTLKQKVENLLLEAEKRCSL
       . : ... .:.:::  . . . :...   .. .  :. ::    ..: .  : :.     
CCDS31 RRETESNWEAQLADILS-WVNDEKVSRGYLQALATKMAEELESLRNVGTQTLPARP----
     670       680        690       700       710       720        

           770          780       790       800       810       820
pF1KA0 LDCDLKQSQ-QKI--NELLKQKDVLNEDVRNLTLKIEQETQKRCLTQNDLKMQTQQVNTL
       :: . :  . ::.  .  :. ...:. ..:      .:  :.: ::: . . : :    :
CCDS31 LDHQWKARRLQKMEASARLELQSALEAEIRA-----KQGLQER-LTQVQ-EAQLQAERRL
          730       740       750            760         770       

                 830       840       850       860       870       
pF1KA0 KMSEKQ---LKQENNHLMEMKMNLEKQNAELRKERQDADGQMKELQDQLEAEQYFSTLYK
       . .:::   :.::   : :                                         
CCDS31 QEAEKQSQALQQELAMLREELRARGPVDTKPSNSLIPFLSFRSSEKDSAKDPGISGEATR
       780       790       800       810       820       830       

>>CCDS55891.1 CIT gene_id:11113|Hs108|chr12               (2069 aa)
 initn: 1105 init1: 441 opt: 1396  Z-score: 521.3  bits: 109.5 E(32554): 1e-22
Smith-Waterman score: 1500; 28.6% identity (61.2% similar) in 1236 aa overlap (27-1127:32-1247)

                   10        20        30        40        50      
pF1KA0     MSRPPPTGKMPGAPETAPGDGAGASRQRKLEALIRDPRSPINVESLLDGLNSLVLD
                                     : :   . ..  ::.. :..::.:  :  .
CCDS55 LKFKYGARNPLDAGAAEPIASRASRLNLFFQGKPPFMTQQQMSPLSREGILDALFVLFEE
              10        20        30        40        50        60 

         60        70        80        90       100       110      
pF1KA0 LDFPALRKNKNIDNFLNRYEKIVKKIRGLQMKAEDYDVVKVIGRGAFGEVQLVRHKASQK
        . ::: : :...::. .:   . ... :: .:.:..: ...: : :.:::.::.::.  
CCDS55 CSQPALMKIKHVSNFVRKYSDTIAELQELQPSAKDFEVRSLVGCGHFAEVQVVREKATGD
              70        80        90       100       110       120 

        120       130       140       150       160       170      
pF1KA0 VYAMKLLSKFEMIKRSDSAFFWEERDIMAFANSPWVVQLFYAFQDDRYLYMVMEYMPGGD
       .::::...:  .. . . .:: :::.:.. ..:::. :: :::::  .::.::::.::::
CCDS55 IYAMKVMKKKALLAQEQVSFFEEERNILSRSTSPWIPQLQYAFQDKNHLYLVMEYQPGGD
             130       140       150       160       170       180 

        180         190       200       210       220       230    
pF1KA0 LVNLMSNYD--VPEKWAKFYTAEVVLALDAIHSMGLIHRDVKPDNMLLDKHGHLKLADFG
       :..:.. :.  . :.  .:: ::..::. ..: :: .:::.::.:.:.:. ::.::.:::
CCDS55 LLSLLNRYEDQLDENLIQFYLAELILAVHSVHLMGYVHRDIKPENILVDRTGHIKLVDFG
             190       200       210       220       230       240 

          240       250       260         270       280       290  
pF1KA0 TCMKMDETGMVHCDTAVGTPDYISPEVLKSQGGDG--FYGRECDWWSVGVFLYEMLVGDT
       .  ::. . ::.    .:::::..::::  ..:::   :: .::::::::. :::. : .
CCDS55 SAAKMNSNKMVNAKLPIGTPDYMAPEVLTVMNGDGKGTYGLDCDWWSVGVIAYEMIYGRS
             250       260       270       280       290       300 

            300       310       320       330       340       350  
pF1KA0 PFYADSLVGTYSKIMDHKNSLCFPEDAEISKHAKNLICAFLTDREVRLGRNGVEEIRQHP
       ::   . . :...::. .  : ::.: ..:.   .:: ..:  .. ::  .:.     ::
CCDS55 PFAEGTSARTFNNIMNFQRFLKFPDDPKVSSDFLDLIQSLLCGQKERLKFEGLCC---HP
             310       320       330       340       350           

            360       370       380       390          400         
pF1KA0 FFKNDQWHWDNIRETAAPVVPELSSDIDSSNFDDIEDDKGDVETFPI---PKAFVGNQLP
       ::  ..  :.:::..  : :: :.:: :.::::. : ..  : . :    :..: :..::
CCDS55 FF--SKIDWNNIRNSPPPFVPTLKSDDDTSNFDEPEKNSW-VSSSPCQLSPSGFSGEELP
      360         370       380       390        400       410     

     410       420                430          440       450       
pF1KA0 FIGFTYYRENLLLS---------DSPSCRENDSIQSR---KNEESQEIQKKLYTLEEHLS
       :.::.: .   .:.         :::.  ...:....   :..: :. : : . .:....
CCDS55 FVGFSYSKALGILGRSESVVSGLDSPA--KTSSMEKKLLIKSKELQDSQDKCHKMEQEMT
         420       430       440         450       460       470   

             460          470         480       490       500      
pF1KA0 ------NEMQA---KEELEQKCKSVNTRL--EKTAKELEEEITLRKSVESALRQLERE--
             .:..:   ..:.: : . ..  :  .  :  . :  .:..:.:.:  .. .:  
CCDS55 RLHRRVSEVEAVLSQKEVELKASETQRSLLEQDLATYITECSSLKRSLEQARMEVSQEDD
           480       490       500       510       520       530   

           510       520       530            540              550 
pF1KA0 KAL-LQHKNAEYQRKADHEADKKRNLEND-----VNSLKDQLEDLKKRN-------QNSQ
       ::: : :   : .:: ..  ... . . .     .:.:...: . ..:.       ..:.
CCDS55 KALQLLHDIREQSRKLQEIKEQEYQAQVEEMRLMMNQLEEDLVSARRRSDLYESELRESR
           540       550       560       570       580       590   

                 560       570       580       590           600   
pF1KA0 ISTE----KVNQLQRQLDETNALLRTESDTAARLRKTQAESSKQIQQL----ESNNRDLQ
       ...:    :... :..: ...   . :    :.:.: .::.. .::.:    :.  .   
CCDS55 LAAEEFKRKATECQHKLLKAKDQGKPEVGEYAKLEKINAEQQLKIQELQEKLEKAVKAST
           600       610       620       630       640       650   

           610          620       630          640       650       
pF1KA0 DKNCLLET---AKLKLEKEFINLQSALESE---RRDRTHGSEIINDLQGRICGLEEDLKN
       . . ::..   :: . :.:. .::.  .:    :.  ... :  ..:....  ::   . 
CCDS55 EATELLQNIRQAKERAERELEKLQNREDSSEGIRKKLVEAEERRHSLENKVKRLETMERR
           660       670       680       690       700       710   

       660       670         680       690       700       710     
pF1KA0 GKILLAKVELEKRQLQERFTD--LEKEKSNMEIDMTYQLKVIQQSLEQEEAEHKATKARL
        . :   .. ...:.:. ..:  :: :... : ... :   ..  :.:.: .:   : ..
CCDS55 ENRLKDDIQTKSQQIQQ-MADKILELEEKHREAQVSAQH--LEVHLKQKE-QHYEEKIKV
           720       730        740       750         760          

         720       730       740       750       760       770     
pF1KA0 ADKNKIYESIEEAKSEAMKEMEKKLLEERTLKQKVENLLLEAEKRCSLLDCDLKQSQQKI
        : :.: ...  : .:....: ..  ::   : :.   : : .   . .:  ... .:.:
CCDS55 LD-NQIKKDL--ADKETLENMMQRHEEEAHEKGKI---LSEQKAMINAMDSKIRSLEQRI
     770          780       790       800          810       820   

                          780       790       800       810        
pF1KA0 NEL-----------------LKQKDVLNEDVRNLTLKIEQETQKRCLTQNDLKMQTQQVN
        ::                 .: .. .  ..:.  . .: .. :    .  :. : ....
CCDS55 VELSEANKLAANSSLFTQRNMKAQEEMISELRQQKFYLETQAGKLEAQNRKLEEQLEKIS
           830       840       850       860       870       880   

      820        830       840       850       860       870       
pF1KA0 TLKMSEK-QLKQENNHLMEMKMNLEKQNAELRKERQDADGQMKELQDQLEAEQYFSTLYK
           :.: .: . ...: :.... :.:. ::...  . . ...: ..:: : :   .  .
CCDS55 HQDHSDKNRLLELETRLREVSLEHEEQKLELKRQLTELQLSLQERESQLTALQAARAALE
           890       900       910       920       930       940   

       880       890           900       910                920    
pF1KA0 TQVRELKEECEEKTKLGKE----LQQKKQELQDERDSLAAQLEIT---------LTKADS
       .:.:. : : :: :  ..:    :  ...:.: . :.:  .  .          ::. ..
CCDS55 SQLRQAKTELEETTAEAEEEIQALTAHRDEIQRKFDALRNSCTVITDLEEQLNQLTEDNA
           950       960       970       980       990      1000   

                930       940        950       960       970       
pF1KA0 E------QLARSIAEEQYSDLEKEKIMKELE-IKEMMARHKQELTEKDATIASLEETNRT
       :       :.... : . .. :  .. .:.. ... .......:: .  :. .:. :   
CCDS55 ELNNQNFYLSKQLDEASGANDEIVQLRSEVDHLRREITEREMQLTSQKQTMEALKTTCTM
          1010      1020      1030      1040      1050      1060   

       980       990      1000      1010      1020      1030       
pF1KA0 LTSDVANLANEKEELNNKLKDVQEQLSRLKDEEISAAAIKAQFEKQLLTERTLKTQAVNK
       :  .: .:   ..:: .: .. .   : : ::. .      .....: ::.  ...: ..
CCDS55 LEEQVMDLEALNDELLEKERQWEAWRSVLGDEKSQFECRVRELQRMLDTEKQSRARADQR
          1070      1080      1090      1100      1110      1120   

                     1040      1050                   1060         
pF1KA0 L---------------AEIMNRKEPVKRG-------ND--TDVRRK----EKENRKLHME
       .               :::.  .. .:.        .:  .:...:    : . :.:...
CCDS55 ITESRQVVELAVKEHKAEILALQQALKEQKLKAESLSDKLNDLEKKHAMLEMNARSLQQK
          1130      1140      1150      1160      1170      1180   

    1070      1080      1090      1100        1110            1120 
pF1KA0 LKSEREKLTQQMIKYQKELNEMQAQIAEESQIRIE--LQMTLDSKD------SDIEQLRS
       :..::: : :.... : .: ..: .. ..  .:.   :: .::  :      ::.:    
CCDS55 LETERE-LKQRLLEEQAKL-QQQMDLQKNHIFRLTQGLQEALDRADLLKTERSDLEYQLE
           1190      1200       1210      1220      1230      1240 

            1130      1140      1150      1160      1170      1180 
pF1KA0 QLQALHIGLDSSSIGSGPGDAEADDGFPESRLEGWLSLPVRNNTKKFGWVKKYVIVSSKK
       ..:.:.                                                      
CCDS55 NIQVLYSHEKVKMEGTISQQTKLIDFLQAKMDQPAKKKKGLFSRRKEDPALPTQVPLQYN
            1250      1260      1270      1280      1290      1300 

>>CCDS74400.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19               (530 aa)
 initn: 1142 init1: 419 opt: 1262  Z-score: 481.9  bits: 100.2 E(32554): 1.6e-20
Smith-Waterman score: 1262; 38.3% identity (68.4% similar) in 532 aa overlap (26-544:6-523)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MSRPPPTGKMPGAPETAPGDGAGASRQRKLEALIRDPRSPINVESLLDGLNSLVLDLDFP
                                : :.:. :. :: . ...: ::: : ..  .:   
CCDS74                     MSAEVRLRRLQQLVLDP-GFLGLEPLLDLLLGVHQELGAS
                                   10         20        30         

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 ALRKNKNIDNFLNRYEKIVKKIRGLQMKAEDYDVVKVIGRGAFGEVQLVRHKASQKVYAM
        : ..: . .::.  : :: ... .... .:....::::::::.:: .:. : . .::::
CCDS74 ELAQDKYVADFLQWAEPIVVRLKEVRLQRDDFEILKVIGRGAFSEVAVVKMKQTGQVYAM
      40        50        60        70        80        90         

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 KLLSKFEMIKRSDSAFFWEERDIMAFANSPWVVQLFYAFQDDRYLYMVMEYMPGGDLVNL
       :...:..:.::.. . : ::::... ..  :..:: .::::. :::.::::. ::::..:
CCDS74 KIMNKWDMLKRGEVSCFREERDVLVNGDRRWITQLHFAFQDENYLYLVMEYYVGGDLLTL
     100       110       120       130       140       150         

                190       200       210       220       230        
pF1KA0 MSNYD--VPEKWAKFYTAEVVLALDAIHSMGLIHRDVKPDNMLLDKHGHLKLADFGTCMK
       .:..   .: . :.:: ::.:.:.:..: .: .:::.::::.:::. ::..:::::.:.:
CCDS74 LSKFGERIPAEMARFYLAEIVMAIDSVHRLGYVHRDIKPDNILLDRCGHIRLADFGSCLK
     160       170       180       190       200       210         

      240       250       260          270       280       290     
pF1KA0 MDETGMVHCDTAVGTPDYISPEVLKSQGGD---GFYGRECDWWSVGVFLYEMLVGDTPFY
       .   : :.  .:::::::.:::.:.. ::    : :: :::::..::: :::. :.::::
CCDS74 LRADGTVRSLVAVGTPDYLSPEILQAVGGGPGTGSYGPECDWWALGVFAYEMFYGQTPFY
     220       230       240       250       260       270         

         300       310        320       330       340       350    
pF1KA0 ADSLVGTYSKIMDHKNSLCFPE-DAEISKHAKNLICAFLTDREVRLGRNGVEEIRQHPFF
       ::: . ::.::. .:. : .:  :  . ..:...:  .:   :.::::.:. ..: ::::
CCDS74 ADSTAETYGKIVHYKEHLSLPLVDEGVPEEARDFIQRLLCPPETRLGRGGAGDFRTHPFF
     280       290       300       310       320       330         

          360       370       380       390       400         410  
pF1KA0 KNDQWHWDNIRETAAPVVPELSSDIDSSNFDDIEDDKGDVETFPIPK--AFVGNQLPFIG
        .    ::..:... : .:.. .  :. ::: .::    .::.   .  : .: .:::.:
CCDS74 FG--LDWDGLRDSVPPFTPDFEGATDTCNFDLVEDGLTAMETLSDIREGAPLGVHLPFVG
     340         350       360       370       380       390       

            420       430       440       450       460        470 
pF1KA0 FTYYRENLLLSDSPSCRENDSIQSRKNEESQEIQKKLYTLEEHLSNEMQAKE-ELEQKCK
       ..:    :  :. :    . . .  . :.  : . .  .::  .: . .. :  .     
CCDS74 YSYSCMALRDSEVP----GPTPMELEAEQLLEPHVQAPSLEPSVSPQDETAEVAVPAAVP
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       ..... : : .::    :::.  :.:       : ::   ..  : ..  .  .   ..:
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