Result of FASTA (ccds) for pF1KSDB1426
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDB1426, 681 aa
  1>>>pF1KSDB1426 681 - 681 aa - 681 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.8655+/-0.00118; mu= -14.6051+/- 0.070
 mean_var=439.2127+/-91.923, 0's: 0 Z-trim(114.7): 617  B-trim: 0 in 0/52
 Lambda= 0.061198
 statistics sampled from 14579 (15270) to 14579 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.766), E-opt: 0.2 (0.469), width:  16
 Scan time:  4.720

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS10054.1 PAK6 gene_id:56924|Hs108|chr15         ( 681) 4595 420.3 4.5e-117
CCDS61590.1 PAK6 gene_id:56924|Hs108|chr15         ( 636) 3917 360.4 4.4e-99
CCDS12528.1 PAK4 gene_id:10298|Hs108|chr19         ( 591) 1565 152.8 1.4e-36
CCDS33019.1 PAK4 gene_id:10298|Hs108|chr19         ( 438) 1537 150.2 5.9e-36
CCDS13107.1 PAK5 gene_id:57144|Hs108|chr20         ( 719) 1542 150.8 6.5e-36
CCDS8250.1 PAK1 gene_id:5058|Hs108|chr11           ( 545) 1010 103.7 7.2e-22
CCDS14554.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX           ( 544) 1007 103.5 8.6e-22
CCDS48153.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX           ( 559) 1007 103.5 8.8e-22
CCDS48152.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX           ( 565) 1007 103.5 8.9e-22
CCDS3321.1 PAK2 gene_id:5062|Hs108|chr3            ( 524) 1006 103.4 8.9e-22
CCDS48151.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX           ( 580) 1007 103.5 9.1e-22
CCDS44687.1 PAK1 gene_id:5058|Hs108|chr11          ( 553)  978 100.9 5.1e-21
CCDS58707.1 MAP4K3 gene_id:8491|Hs108|chr2         ( 873)  687 75.4   4e-13
CCDS1803.1 MAP4K3 gene_id:8491|Hs108|chr2          ( 894)  687 75.4 4.1e-13
CCDS81582.1 MAP4K2 gene_id:5871|Hs108|chr11        ( 812)  682 74.9 5.1e-13
CCDS8082.1 MAP4K2 gene_id:5871|Hs108|chr11         ( 820)  682 74.9 5.2e-13
CCDS13341.1 STK4 gene_id:6789|Hs108|chr20          ( 487)  671 73.8 6.7e-13
CCDS42564.1 MAP4K1 gene_id:11184|Hs108|chr19       ( 821)  677 74.5   7e-13
CCDS59385.1 MAP4K1 gene_id:11184|Hs108|chr19       ( 833)  677 74.5 7.1e-13
CCDS47900.1 STK3 gene_id:6788|Hs108|chr8           ( 491)  670 73.7 7.2e-13
CCDS59108.1 STK3 gene_id:6788|Hs108|chr8           ( 519)  670 73.7 7.5e-13
CCDS32001.1 STK24 gene_id:8428|Hs108|chr13         ( 431)  667 73.4 7.8e-13
CCDS9488.1 STK24 gene_id:8428|Hs108|chr13          ( 443)  667 73.4   8e-13
CCDS2549.1 STK25 gene_id:10494|Hs108|chr2          ( 426)  656 72.4 1.5e-12
CCDS14631.1 STK26 gene_id:51765|Hs108|chrX         ( 416)  642 71.2 3.5e-12
CCDS34290.1 STK10 gene_id:6793|Hs108|chr5          ( 968)  639 71.2 8.2e-12
CCDS76334.1 SLK gene_id:9748|Hs108|chr10           (1204)  634 70.8 1.3e-11
CCDS7553.1 SLK gene_id:9748|Hs108|chr10            (1235)  634 70.8 1.3e-11


>>CCDS10054.1 PAK6 gene_id:56924|Hs108|chr15              (681 aa)
 initn: 4595 init1: 4595 opt: 4595  Z-score: 2215.4  bits: 420.3 E(32554): 4.5e-117
Smith-Waterman score: 4595; 100.0% identity (100.0% similar) in 681 aa overlap (1-681:1-681)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MFRKKKKKRPEISAPQNFQHRVHTSFDPKEGKFVGLPPQWQNILDTLRRPKPVVDPSRIT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MFRKKKKKRPEISAPQNFQHRVHTSFDPKEGKFVGLPPQWQNILDTLRRPKPVVDPSRIT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD RVQLQPMKTVVRGSAMPVDGYISGLLNDIQKLSVISSNTLRGRSPTSRRRAQSLGLLGDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RVQLQPMKTVVRGSAMPVDGYISGLLNDIQKLSVISSNTLRGRSPTSRRRAQSLGLLGDE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD HWATDPDMYLQSPQSERTDPHGLYLSCNGGTPAGHKQMPWPEPQSPRVLPNGLAAKAQSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 HWATDPDMYLQSPQSERTDPHGLYLSCNGGTPAGHKQMPWPEPQSPRVLPNGLAAKAQSL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD GPAEFQGASQRCLQLGACLQSSPPGASPPTGTNRHGMKAAKHGSEEARPQSCLVGSATGR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GPAEFQGASQRCLQLGACLQSSPPGASPPTGTNRHGMKAAKHGSEEARPQSCLVGSATGR
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD PGGEGSPSPKTRESSLKRRLFRSMFLSTAATAPPSSSKPGPPPQSKPNSSFRPPQKDNPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PGGEGSPSPKTRESSLKRRLFRSMFLSTAATAPPSSSKPGPPPQSKPNSSFRPPQKDNPP
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD SLVAKAQSLPSDQPVGTFSPLTTSDTSSPQKSLRTAPATGQLPGRSSPAGSPRTWHAQIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SLVAKAQSLPSDQPVGTFSPLTTSDTSSPQKSLRTAPATGQLPGRSSPAGSPRTWHAQIS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD TSNLYLPQDPTVAKGALAGEDTGVVTHEQFKAALRMVVDQGDPRLLLDSYVKIGEGSTGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TSNLYLPQDPTVAKGALAGEDTGVVTHEQFKAALRMVVDQGDPRLLLDSYVKIGEGSTGI
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD VCLAREKHSGRQVAVKMMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQHFNVVEMYKSYLVGEELWVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VCLAREKHSGRQVAVKMMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQHFNVVEMYKSYLVGEELWVL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD MEFLQGGALTDIVSQVRLNEEQIATVCEAVLQALAYLHAQGVIHRDIKSDSILLTLDGRV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MEFLQGGALTDIVSQVRLNEEQIATVCEAVLQALAYLHAQGVIHRDIKSDSILLTLDGRV
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD KLSDFGFCAQISKDVPKRKSLVGTPYWMAPEVISRSLYATEVDIWSLGIMVIEMVDGEPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KLSDFGFCAQISKDVPKRKSLVGTPYWMAPEVISRSLYATEVDIWSLGIMVIEMVDGEPP
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD YFSDSPVQAMKRLRDSPPPKLKNSHKVSPVLRDFLERMLVRDPQERATAQELLDHPFLLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 YFSDSPVQAMKRLRDSPPPKLKNSHKVSPVLRDFLERMLVRDPQERATAQELLDHPFLLQ
              610       620       630       640       650       660

              670       680 
pF1KSD TGLPECLVPLIQLYRKQTSTC
       :::::::::::::::::::::
CCDS10 TGLPECLVPLIQLYRKQTSTC
              670       680 

>>CCDS61590.1 PAK6 gene_id:56924|Hs108|chr15              (636 aa)
 initn: 3917 init1: 3917 opt: 3917  Z-score: 1892.3  bits: 360.4 E(32554): 4.4e-99
Smith-Waterman score: 4181; 93.4% identity (93.4% similar) in 681 aa overlap (1-681:1-636)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MFRKKKKKRPEISAPQNFQHRVHTSFDPKEGKFVGLPPQWQNILDTLRRPKPVVDPSRIT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 MFRKKKKKRPEISAPQNFQHRVHTSFDPKEGKFVGLPPQWQNILDTLRRPKPVVDPSRIT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD RVQLQPMKTVVRGSAMPVDGYISGLLNDIQKLSVISSNTLRGRSPTSRRRAQSLGLLGDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 RVQLQPMKTVVRGSAMPVDGYISGLLNDIQKLSVISSNTLRGRSPTSRRRAQSLGLLGDE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD HWATDPDMYLQSPQSERTDPHGLYLSCNGGTPAGHKQMPWPEPQSPRVLPNGLAAKAQSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 HWATDPDMYLQSPQSERTDPHGLYLSCNGGTPAGHKQMPWPEPQSPRVLPNGLAAKAQSL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD GPAEFQGASQRCLQLGACLQSSPPGASPPTGTNRHGMKAAKHGSEEARPQSCLVGSATGR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 GPAEFQGASQRCLQLGACLQSSPPGASPPTGTNRHGMKAAKHGSEEARPQSCLVGSATGR
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD PGGEGSPSPKTRESSLKRRLFRSMFLSTAATAPPSSSKPGPPPQSKPNSSFRPPQKDNPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 PGGEGSPSPKTRESSLKRRLFRSMFLSTAATAPPSSSKPGPPPQSKPNSSFRPPQKDNPP
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD SLVAKAQSLPSDQPVGTFSPLTTSDTSSPQKSLRTAPATGQLPGRSSPAGSPRTWHAQIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 SLVAKAQSLPSDQPVGTFSPLTTSDTSSPQKSLRTAPATGQLPGRSSPAGSPRTWHAQIS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD TSNLYLPQDPTVAKGALAGEDTGVVTHEQFKAALRMVVDQGDPRLLLDSYVKIGEGSTGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 TSNLYLPQDPTVAKGALAGEDTGVVTHEQFKAALRMVVDQGDPRLLLDSYVKIGEGSTGI
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD VCLAREKHSGRQVAVKMMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQHFNVVEMYKSYLVGEELWVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 VCLAREKHSGRQVAVKMMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQHFNVVEMYKSYLVGEELWVL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD MEFLQGGALTDIVSQVRLNEEQIATVCEAVLQALAYLHAQGVIHRDIKSDSILLTLDGRV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 MEFLQGGALTDIVSQVRLNEEQIATVCEAVLQALAYLHAQGVIHRDIKSDSILLTLDGRV
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD KLSDFGFCAQISKDVPKRKSLVGTPYWMAPEVISRSLYATEVDIWSLGIMVIEMVDGEPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::                  
CCDS61 KLSDFGFCAQISKDVPKRKSLVGTPYWMAPEVISRSLYATEV------------------
              550       560       570       580                    

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD YFSDSPVQAMKRLRDSPPPKLKNSHKVSPVLRDFLERMLVRDPQERATAQELLDHPFLLQ
                                  :::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 ---------------------------SPVLRDFLERMLVRDPQERATAQELLDHPFLLQ
                                       590       600       610     

              670       680 
pF1KSD TGLPECLVPLIQLYRKQTSTC
       :::::::::::::::::::::
CCDS61 TGLPECLVPLIQLYRKQTSTC
         620       630      

>>CCDS12528.1 PAK4 gene_id:10298|Hs108|chr19              (591 aa)
 initn: 1750 init1: 1487 opt: 1565  Z-score: 770.4  bits: 152.8 E(32554): 1.4e-36
Smith-Waterman score: 1860; 50.3% identity (67.2% similar) in 680 aa overlap (1-675:1-589)

               10        20        30        40         50         
pF1KSD MFRKKKKKRPEISAPQNFQHRVHTSFDPKEGKFVGLPPQWQNILD-TLRRPKPVVDPSRI
       ::  :.::: :::::.::.:::::.:: .: ::.::: :::.... . :::::.:::. :
CCDS12 MF-GKRKKRVEISAPSNFEHRVHTGFDQHEQKFTGLPRQWQSLIEESARRPKPLVDPACI
                10        20        30        40        50         

      60        70        80        90       100       110         
pF1KSD TRVQLQPMKTVVRGSAMPVDGYISGLLNDIQKLSVISSNTLRGRSPTSRRRAQSLGLLGD
       : .:    ::.::::    :: .. ::......::  ::.::  ::    ::.. . . .
CCDS12 TSIQPGAPKTIVRGSKGAKDGALTLLLDEFENMSVTRSNSLRRDSPPPPARARQENGMPE
      60        70        80        90       100       110         

     120       130       140       150       160       170         
pF1KSD EHWATDPDMYLQSPQSERTDPHGLYLSCNGGTPAGHKQMPWPEPQSPRVLPNGLAAKAQS
       :  .:      .. .  :   :.     .::.   ..  :  .:.: :   .:      :
CCDS12 EPATTARGGPGKAGSRGRFAGHS---EAGGGSGDRRRAGPEKRPKSSR---EG------S
     120       130       140          150       160                

     180       190       200        210       220       230        
pF1KSD LGPAEFQGASQRCLQLGACLQSSPPGASP-PTGTNRHGMKAAKHGSEEARPQSCLVGSAT
        :: : .. ..: :       :.:  ..: :.:    : : :      .:: .    . :
CCDS12 GGPQE-SSRDKRPL-------SGPDVGTPQPAGLAS-GAKLA-----AGRPFNTYPRADT
       170        180              190        200            210   

      240         250       260       270       280        290     
pF1KSD GRP--GGEGSPSPKTRESSLKRRLFRSMFLSTAATAPPSSSKPG-PPPQSKPNSSFRPPQ
        .:  :..: :                       .:: . :  :   :::. .:: ::: 
CCDS12 DHPSRGAQGEPHD---------------------VAPNGPSAGGLAIPQSSSSSS-RPP-
           220                            230       240        250 

         300       310       320       330       340       350     
pF1KSD KDNPPSLVAKAQSLPSDQPVGTFSPLTTSDTSSPQKSLRTAPATGQLPGRSSPAGSPRTW
               ..:.. ::  : :...: ..    .:     .:::   .::   : : ::. 
CCDS12 --------TRARGAPS--P-GVLGPHASEPQLAPPACTPAAPA---VPG---PPG-PRS-
                         260       270       280              290  

         360       370       380       390       400       410     
pF1KSD HAQISTSNLYLPQDPTVAKGALAGEDTGVVTHEQFKAALRMVVDQGDPRLLLDSYVKIGE
                  ::           ..   :.::::.:::..::: ::::  ::...::::
CCDS12 -----------PQ-----------REPQRVSHEQFRAALQLVVDPGDPRSYLDNFIKIGE
                                   300       310       320         

         420       430       440       450       460       470     
pF1KSD GSTGIVCLAREKHSGRQVAVKMMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQHFNVVEMYKSYLVGE
       :::::::.:  . ::. :::: :::::::::::::::::::::::: ::::::.:::::.
CCDS12 GSTGIVCIATVRSSGKLVAVKKMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQHENVVEMYNSYLVGD
     330       340       350       360       370       380         

         480       490       500       510       520       530     
pF1KSD ELWVLMEFLQGGALTDIVSQVRLNEEQIATVCEAVLQALAYLHAQGVIHRDIKSDSILLT
       ::::.::::.::::::::...:.::::::.:: ::::::. :::::::::::::::::::
CCDS12 ELWVVMEFLEGGALTDIVTHTRMNEEQIAAVCLAVLQALSVLHAQGVIHRDIKSDSILLT
     390       400       410       420       430       440         

         540       550       560       570       580       590     
pF1KSD LDGRVKLSDFGFCAQISKDVPKRKSLVGTPYWMAPEVISRSLYATEVDIWSLGIMVIEMV
        ::::::::::::::.::.::.::::::::::::::.:::  :. :::::::::::::::
CCDS12 HDGRVKLSDFGFCAQVSKEVPRRKSLVGTPYWMAPELISRLPYGPEVDIWSLGIMVIEMV
     450       460       470       480       490       500         

         600       610       620       630       640       650     
pF1KSD DGEPPYFSDSPVQAMKRLRDSPPPKLKNSHKVSPVLRDFLERMLVRDPQERATAQELLDH
       :::::::.. :..::: .::. ::.::: ::::: :. ::.:.::::: .:::: ::: :
CCDS12 DGEPPYFNEPPLKAMKMIRDNLPPRLKNLHKVSPSLKGFLDRLLVRDPAQRATAAELLKH
     510       520       530       540       550       560         

         660       670       680 
pF1KSD PFLLQTGLPECLVPLIQLYRKQTSTC
       ::: ..: :  .:::..  :      
CCDS12 PFLAKAGPPASIVPLMRQNRTR    
     570       580       590     

>>CCDS33019.1 PAK4 gene_id:10298|Hs108|chr19              (438 aa)
 initn: 1750 init1: 1487 opt: 1537  Z-score: 758.9  bits: 150.2 E(32554): 5.9e-36
Smith-Waterman score: 1550; 60.8% identity (76.9% similar) in 403 aa overlap (275-675:46-436)

          250       260       270       280       290       300    
pF1KSD GSPSPKTRESSLKRRLFRSMFLSTAATAPPSSSKPGPPPQSKPNSSFRPPQKDNPPSLVA
                                     :. .: :  .    .:..:    . :  ::
CCDS33 NFEHRVHTGFDQHEQKFTGLPRQWQSLIEESARRPKPLVDPACITSIQPGAPKGEPHDVA
          20        30        40        50        60        70     

          310        320       330       340        350       360  
pF1KSD KAQSLPSDQPVGTFS-PLTTSDTSSPQKSLRTAPATGQL-PGRSSPAGSPRTWHAQISTS
            :.   .: .. : ..:..: :    : ::. : : :  : :  .: .     .. 
CCDS33 -----PNGPSAGGLAIPQSSSSSSRPPTRARGAPSPGVLGPHASEPQLAPPA--CTPAAP
               80        90       100       110       120          

            370       380       390       400       410       420  
pF1KSD NLYLPQDPTVAKGALAGEDTGVVTHEQFKAALRMVVDQGDPRLLLDSYVKIGEGSTGIVC
        .  :  :   .     ..   :.::::.:::..::: ::::  ::...:::::::::::
CCDS33 AVPGPPGPRSPQ-----REPQRVSHEQFRAALQLVVDPGDPRSYLDNFIKIGEGSTGIVC
      130       140            150       160       170       180   

            430       440       450       460       470       480  
pF1KSD LAREKHSGRQVAVKMMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQHFNVVEMYKSYLVGEELWVLME
       .:  . ::. :::: :::::::::::::::::::::::: ::::::.:::::.::::.::
CCDS33 IATVRSSGKLVAVKKMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQHENVVEMYNSYLVGDELWVVME
           190       200       210       220       230       240   

            490       500       510       520       530       540  
pF1KSD FLQGGALTDIVSQVRLNEEQIATVCEAVLQALAYLHAQGVIHRDIKSDSILLTLDGRVKL
       ::.::::::::...:.::::::.:: ::::::. ::::::::::::::::::: ::::::
CCDS33 FLEGGALTDIVTHTRMNEEQIAAVCLAVLQALSVLHAQGVIHRDIKSDSILLTHDGRVKL
           250       260       270       280       290       300   

            550       560       570       580       590       600  
pF1KSD SDFGFCAQISKDVPKRKSLVGTPYWMAPEVISRSLYATEVDIWSLGIMVIEMVDGEPPYF
       ::::::::.::.::.::::::::::::::.:::  :. ::::::::::::::::::::::
CCDS33 SDFGFCAQVSKEVPRRKSLVGTPYWMAPELISRLPYGPEVDIWSLGIMVIEMVDGEPPYF
           310       320       330       340       350       360   

            610       620       630       640       650       660  
pF1KSD SDSPVQAMKRLRDSPPPKLKNSHKVSPVLRDFLERMLVRDPQERATAQELLDHPFLLQTG
       .. :..::: .::. ::.::: ::::: :. ::.:.::::: .:::: ::: :::: ..:
CCDS33 NEPPLKAMKMIRDNLPPRLKNLHKVSPSLKGFLDRLLVRDPAQRATAAELLKHPFLAKAG
           370       380       390       400       410       420   

            670       680 
pF1KSD LPECLVPLIQLYRKQTSTC
        :  .:::..  :      
CCDS33 PPASIVPLMRQNRTR    
           430            

>>CCDS13107.1 PAK5 gene_id:57144|Hs108|chr20              (719 aa)
 initn: 1905 init1: 1518 opt: 1542  Z-score: 758.3  bits: 150.8 E(32554): 6.5e-36
Smith-Waterman score: 1889; 46.4% identity (68.3% similar) in 728 aa overlap (12-677:11-719)

               10        20        30        40         50         
pF1KSD MFRKKKKKRPEISAPQNFQHRVHTSFDPKEGKFVGLPPQWQNIL-DTLRRPKPVVDPSRI
                  ::.:.::.:::::.:::.: ::.::: ::...: ::  ::::.:::: :
CCDS13  MFGKKKKKIEISGPSNFEHRVHTGFDPQEQKFTGLPQQWHSLLADTANRPKPMVDPSCI
                10        20        30        40        50         

      60        70        80        90       100       110         
pF1KSD TRVQLQPMKTVVRGSAMPVDGYISGLLNDIQKLSVISSNTLRGRSPTSRRR---------
       : .:: ::::.:::.    .  :.:::.:....::  ::.:: .:: .  .         
CCDS13 TPIQLAPMKTIVRGNKPCKETSINGLLEDFDNISVTRSNSLRKESPPTPDQGASSHGPGH
      60        70        80        90       100       110         

              120          130             140       150        160
pF1KSD AQSLGLLGDEHWATDPDM---YLQSPQSERT------DPHGLYLSCNGGTPAGH-KQMPW
       :.  :..   ..... :    :      :..      ::.  : . ...   ::  .:  
CCDS13 AEENGFITFSQYSSESDTTADYTTEKYREKSLYGDDLDPY--YRGSHAAKQNGHVMKMKH
     120       130       140       150         160       170       

              170                180           190          200    
pF1KSD PEPQSPRVLP--NGLA-------AKAQSLG-PAEFQGAS---QRCLQ---LGACLQSSPP
        :    .: :  . .:       .. .::. :.:..  .   ::  .   :   .: .: 
CCDS13 GEAYYSEVKPLKSDFARFSADYHSHLDSLSKPSEYSDLKWEYQRASSSSPLDYSFQFTPS
       180       190       200       210       220       230       

          210       220             230       240       250        
pF1KSD GASPPTGTNRHGMKAAKH------GSEEARPQSCLVGSATGRPGGEGSPSPKTRESSLKR
        ..  .: .....  ..        . . ::.:  ....        ::.:  :. :   
CCDS13 RTAGTSGCSKESLAYSESEWGPSLDDYDRRPKSSYLNQT--------SPQPTMRQRS---
       240       250       260       270               280         

      260       270       280       290       300       310        
pF1KSD RLFRSMFLSTAATAPPSSSKPGPPPQSKPNSSFRPPQKDNPPSLVAKAQSLPSDQPVGTF
          ::         : ..:     ::..  .:.  :. ..:   . :..    :.   ..
CCDS13 ---RSGSGLQEPMMPFGASAFKTHPQGHSYNSYTYPRLSEPTMCIPKVDY---DRAQMVL
           290       300       310       320       330          340

      320          330       340        350          360           
pF1KSD SP-LTTSDT--SSPQKSLRTAPATG-QLPGRSSPAGSPRTW---HAQISTSNLYLPQD--
       :: :. :::   .: :  ..   .: .  ... :.:  ..    : ....:. :.     
CCDS13 SPPLSGSDTYPRGPAKLPQSQSKSGYSSSSHQYPSGYHKATLYHHPSLQSSSQYISTASY
              350       360       370       380       390       400

                370       380       390       400       410        
pF1KSD -----------PTVAKGALAGEDTGVVTHEQFKAALRMVVDQGDPRLLLDSYVKIGEGST
                  :  . :. . .. . :.::::.:::..::. ::::  : ...:::::::
CCDS13 LSSLSLSSSTYPPPSWGSSSDQQPSRVSHEQFRAALQLVVSPGDPREYLANFIKIGEGST
              410       420       430       440       450       460

      420       430       440       450       460       470        
pF1KSD GIVCLAREKHSGRQVAVKMMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQHFNVVEMYKSYLVGEELW
       ::::.: :::.:.::::: ::::::::::::::::::::::.: :::.::.:::::.:::
CCDS13 GIVCIATEKHTGKQVAVKKMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYHHDNVVDMYSSYLVGDELW
              470       480       490       500       510       520

      480       490       500       510       520       530        
pF1KSD VLMEFLQGGALTDIVSQVRLNEEQIATVCEAVLQALAYLHAQGVIHRDIKSDSILLTLDG
       :.::::.::::::::...:.::::::::: .::.::.::: :::::::::::::::: ::
CCDS13 VVMEFLEGGALTDIVTHTRMNEEQIATVCLSVLRALSYLHNQGVIHRDIKSDSILLTSDG
              530       540       550       560       570       580

      540       550       560       570       580       590        
pF1KSD RVKLSDFGFCAQISKDVPKRKSLVGTPYWMAPEVISRSLYATEVDIWSLGIMVIEMVDGE
       :.::::::::::.::.:::::::::::::::::::::  :.:::::::::::::::.:::
CCDS13 RIKLSDFGFCAQVSKEVPKRKSLVGTPYWMAPEVISRLPYGTEVDIWSLGIMVIEMIDGE
              590       600       610       620       630       640

      600       610       620       630       640       650        
pF1KSD PPYFSDSPVQAMKRLRDSPPPKLKNSHKVSPVLRDFLERMLVRDPQERATAQELLDHPFL
       ::::.. :.:::.:.::: ::..:. :::: ::: ::. ::::.:..:::::::: ::::
CCDS13 PPYFNEPPLQAMRRIRDSLPPRVKDLHKVSSVLRGFLDLMLVREPSQRATAQELLGHPFL
              650       660       670       680       690       700

      660       670       680 
pF1KSD LQTGLPECLVPLIQLYRKQTSTC
         .: : :.:::.. ::..    
CCDS13 KLAGPPSCIVPLMRQYRHH    
              710             

>>CCDS8250.1 PAK1 gene_id:5058|Hs108|chr11                (545 aa)
 initn: 1152 init1: 990 opt: 1010  Z-score: 506.1  bits: 103.7 E(32554): 7.2e-22
Smith-Waterman score: 1015; 36.1% identity (64.9% similar) in 524 aa overlap (201-678:21-541)

              180       190       200        210       220         
pF1KSD NGLAAKAQSLGPAEFQGASQRCLQLGACLQSSPPGA-SPPTGTNRHGMKAAKHGSEEARP
                                     :.  :: :  .::  :: :    . :: . 
CCDS82           MSNNGLDIQDKPPAPPMRNTSTMIGAGSKDAGTLNHGSKPLPPNPEEKKK
                         10        20        30        40        50

     230       240        250        260       270       280       
pF1KSD QSCLVGSATGRPGGE-GSPSPKTR-ESSLKRRLFRSMFLSTAATAPPSSSKPGPPPQSKP
       .. .  :    :: . .. . : : : ::   . ... ..  :..   .. :    .   
CCDS82 KDRFYRSIL--PGDKTNKKKEKERPEISLPSDFEHTIHVGFDAVTGEFTGMPEQWARLLQ
                 60        70        80        90       100        

       290        300            310       320        330       340
pF1KSD NSSF-RPPQKDNPPSLVA-----KAQSLPSDQPVGTFSPLTTSD-TSSPQKSLRTAPATG
       .:.. .  :: :: ...      ....  ..:   .:.  .. : .::   .....  : 
CCDS82 TSNITKSEQKKNPQAVLDVLEFYNSKKTSNSQKYMSFTDKSAEDYNSSNALNVKAVSETP
      110       120       130       140       150       160        

                          350        360         370         380   
pF1KSD QLPGRSS------------PAGSPRTWHAQ-ISTSNLY--LPQDPT--VAKGALAGEDTG
        .:  :             :. .::  :.. . : ..   ::  ::  :: . ..  ...
CCDS82 AVPPVSEDEDDDDDDATPPPVIAPRPEHTKSVYTRSVIEPLPVTPTRDVATSPISPTENN
      170       180       190       200       210       220        

                             390       400       410       420     
pF1KSD V------------------VTHEQFKAALRMVVDQGDPRLLLDSYVKIGEGSTGIVCLAR
       .                  .. :..   :: .:. :::.     . :::.:..: :  : 
CCDS82 TTPPDALTRNTEKQKKKPKMSDEEILEKLRSIVSVGDPKKKYTRFEKIGQGASGTVYTAM
      230       240       250       260       270       280        

         430       440       450       460       470       480     
pF1KSD EKHSGRQVAVKMMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQHFNVVEMYKSYLVGEELWVLMEFLQ
       .  .:..::.:.:.:..: ..::..::...::. .. :.:..  :::::.::::.::.: 
CCDS82 DVATGQEVAIKQMNLQQQPKKELIINEILVMRENKNPNIVNYLDSYLVGDELWVVMEYLA
      290       300       310       320       330       340        

         490       500       510       520       530       540     
pF1KSD GGALTDIVSQVRLNEEQIATVCEAVLQALAYLHAQGVIHRDIKSDSILLTLDGRVKLSDF
       ::.:::.:... ..: :::.::.  :::: .::.. :::::::::.::: .:: :::.::
CCDS82 GGSLTDVVTETCMDEGQIAAVCRECLQALEFLHSNQVIHRDIKSDNILLGMDGSVKLTDF
      350       360       370       380       390       400        

         550       560       570       580       590       600     
pF1KSD GFCAQISKDVPKRKSLVGTPYWMAPEVISRSLYATEVDIWSLGIMVIEMVDGEPPYFSDS
       ::::::. .  ::...:::::::::::..:. :. .:::::::::.:::..:::::....
CCDS82 GFCAQITPEQSKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMIEGEPPYLNEN
      410       420       430       440       450       460        

         610       620       630       640       650       660     
pF1KSD PVQAMKRLRDSPPPKLKNSHKVSPVLRDFLERMLVRDPQERATAQELLDHPFLLQTGLP-
       :..:.  .  .  :.:.: .:.: ..::::.: :  : ..:..:.:::.: :: . . : 
CCDS82 PLRALYLIATNGTPELQNPEKLSAIFRDFLNRCLEMDVEKRGSAKELLQHQFL-KIAKPL
      470       480       490       500       510       520        

          670       680  
pF1KSD ECLVPLIQLYRKQTSTC 
         :.:::   .. :    
CCDS82 SSLTPLIAAAKEATKNNH
       530       540     

>>CCDS14554.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX                (544 aa)
 initn: 1214 init1: 996 opt: 1007  Z-score: 504.7  bits: 103.5 E(32554): 8.6e-22
Smith-Waterman score: 1027; 41.8% identity (70.1% similar) in 402 aa overlap (272-671:153-532)

             250       260       270       280        290       300
pF1KSD GGEGSPSPKTRESSLKRRLFRSMFLSTAATAPPSSSKPGP-PPQSKPNSSFRPPQKDNPP
                                     : :::.: .  :: . : :  .  ....  
CCDS14 LKFYDSKETVNNQKYMSFTSGDKSAHGYIAAHPSSTKTASEPPLAPPVSEEEDEEEEEEE
            130       140       150       160       170       180  

              310       320       330       340        350         
pF1KSD SLVAKAQSLPSDQPVGTFSPLTTSDTSSPQKSLRTAPATGQLPGRS-SPAGSPRTWHAQI
       .          ..:  ...:      :   .:.  . :.  .:..  .:   : . .:  
CCDS14 D---------ENEPPPVIAPRPEHTKSIYTRSVVESIASPAVPNKEVTP---PSAENA--
                     190       200       210       220             

     360       370       380       390       400       410         
pF1KSD STSNLYLPQDPTVAKGALAGEDTGVVTHEQFKAALRMVVDQGDPRLLLDSYVKIGEGSTG
       ..:.::   :    :. .        : :..   :: .:. :::.     . :::.:..:
CCDS14 NSSTLYRNTDRQRKKSKM--------TDEEILEKLRSIVSVGDPKKKYTRFEKIGQGASG
      230       240               250       260       270       280

     420       430       440       450       460       470         
pF1KSD IVCLAREKHSGRQVAVKMMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQHFNVVEMYKSYLVGEELWV
        :  : .  .:..::.:.:.:..: ..::..::...::. .. :.:..  :::::.::::
CCDS14 TVYTALDIATGQEVAIKQMNLQQQPKKELIINEILVMRENKNPNIVNYLDSYLVGDELWV
              290       300       310       320       330       340

     480       490       500       510       520       530         
pF1KSD LMEFLQGGALTDIVSQVRLNEEQIATVCEAVLQALAYLHAQGVIHRDIKSDSILLTLDGR
       .::.: ::.:::.:... ..: :::.::.  :::: .::.. :::::::::.::: .:: 
CCDS14 VMEYLAGGSLTDVVTETCMDEGQIAAVCRECLQALDFLHSNQVIHRDIKSDNILLGMDGS
              350       360       370       380       390       400

     540       550       560       570       580       590         
pF1KSD VKLSDFGFCAQISKDVPKRKSLVGTPYWMAPEVISRSLYATEVDIWSLGIMVIEMVDGEP
       :::.::::::::. .  ::...:::::::::::..:. :. .:::::::::.::::.:::
CCDS14 VKLTDFGFCAQITPEQSKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMVEGEP
              410       420       430       440       450       460

     600       610       620       630       640       650         
pF1KSD PYFSDSPVQAMKRLRDSPPPKLKNSHKVSPVLRDFLERMLVRDPQERATAQELLDHPFLL
       ::....:..:.  .  .  :.:.: ...: :.::::.: :  : ..:..:.:::.:::: 
CCDS14 PYLNENPLRALYLIATNGTPELQNPERLSAVFRDFLNRCLEMDVDRRGSAKELLQHPFLK
              470       480       490       500       510       520

     660       670       680   
pF1KSD QTGLPECLVPLIQLYRKQTSTC  
        .     :.:::            
CCDS14 LAKPLSSLTPLIIAAKEAIKNSSR
              530       540    

>>CCDS48153.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX                (559 aa)
 initn: 1154 init1: 996 opt: 1007  Z-score: 504.5  bits: 103.5 E(32554): 8.8e-22
Smith-Waterman score: 1027; 41.8% identity (70.1% similar) in 402 aa overlap (272-671:168-547)

             250       260       270       280        290       300
pF1KSD GGEGSPSPKTRESSLKRRLFRSMFLSTAATAPPSSSKPGP-PPQSKPNSSFRPPQKDNPP
                                     : :::.: .  :: . : :  .  ....  
CCDS48 LKFYDSKETVNNQKYMSFTSGDKSAHGYIAAHPSSTKTASEPPLAPPVSEEEDEEEEEEE
       140       150       160       170       180       190       

              310       320       330       340        350         
pF1KSD SLVAKAQSLPSDQPVGTFSPLTTSDTSSPQKSLRTAPATGQLPGRS-SPAGSPRTWHAQI
       .          ..:  ...:      :   .:.  . :.  .:..  .:   : . .:  
CCDS48 D---------ENEPPPVIAPRPEHTKSIYTRSVVESIASPAVPNKEVTP---PSAENA--
                200       210       220       230          240     

     360       370       380       390       400       410         
pF1KSD STSNLYLPQDPTVAKGALAGEDTGVVTHEQFKAALRMVVDQGDPRLLLDSYVKIGEGSTG
       ..:.::   :    :. .        : :..   :: .:. :::.     . :::.:..:
CCDS48 NSSTLYRNTDRQRKKSKM--------TDEEILEKLRSIVSVGDPKKKYTRFEKIGQGASG
           250       260               270       280       290     

     420       430       440       450       460       470         
pF1KSD IVCLAREKHSGRQVAVKMMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQHFNVVEMYKSYLVGEELWV
        :  : .  .:..::.:.:.:..: ..::..::...::. .. :.:..  :::::.::::
CCDS48 TVYTALDIATGQEVAIKQMNLQQQPKKELIINEILVMRENKNPNIVNYLDSYLVGDELWV
         300       310       320       330       340       350     

     480       490       500       510       520       530         
pF1KSD LMEFLQGGALTDIVSQVRLNEEQIATVCEAVLQALAYLHAQGVIHRDIKSDSILLTLDGR
       .::.: ::.:::.:... ..: :::.::.  :::: .::.. :::::::::.::: .:: 
CCDS48 VMEYLAGGSLTDVVTETCMDEGQIAAVCRECLQALDFLHSNQVIHRDIKSDNILLGMDGS
         360       370       380       390       400       410     

     540       550       560       570       580       590         
pF1KSD VKLSDFGFCAQISKDVPKRKSLVGTPYWMAPEVISRSLYATEVDIWSLGIMVIEMVDGEP
       :::.::::::::. .  ::...:::::::::::..:. :. .:::::::::.::::.:::
CCDS48 VKLTDFGFCAQITPEQSKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMVEGEP
         420       430       440       450       460       470     

     600       610       620       630       640       650         
pF1KSD PYFSDSPVQAMKRLRDSPPPKLKNSHKVSPVLRDFLERMLVRDPQERATAQELLDHPFLL
       ::....:..:.  .  .  :.:.: ...: :.::::.: :  : ..:..:.:::.:::: 
CCDS48 PYLNENPLRALYLIATNGTPELQNPERLSAVFRDFLNRCLEMDVDRRGSAKELLQHPFLK
         480       490       500       510       520       530     

     660       670       680   
pF1KSD QTGLPECLVPLIQLYRKQTSTC  
        .     :.:::            
CCDS48 LAKPLSSLTPLIIAAKEAIKNSSR
         540       550         

>>CCDS48152.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX                (565 aa)
 initn: 1154 init1: 996 opt: 1007  Z-score: 504.5  bits: 103.5 E(32554): 8.9e-22
Smith-Waterman score: 1027; 41.8% identity (70.1% similar) in 402 aa overlap (272-671:174-553)

             250       260       270       280        290       300
pF1KSD GGEGSPSPKTRESSLKRRLFRSMFLSTAATAPPSSSKPGP-PPQSKPNSSFRPPQKDNPP
                                     : :::.: .  :: . : :  .  ....  
CCDS48 LKFYDSKETVNNQKYMSFTSGDKSAHGYIAAHPSSTKTASEPPLAPPVSEEEDEEEEEEE
           150       160       170       180       190       200   

              310       320       330       340        350         
pF1KSD SLVAKAQSLPSDQPVGTFSPLTTSDTSSPQKSLRTAPATGQLPGRS-SPAGSPRTWHAQI
       .          ..:  ...:      :   .:.  . :.  .:..  .:   : . .:  
CCDS48 D---------ENEPPPVIAPRPEHTKSIYTRSVVESIASPAVPNKEVTP---PSAENA--
                    210       220       230       240              

     360       370       380       390       400       410         
pF1KSD STSNLYLPQDPTVAKGALAGEDTGVVTHEQFKAALRMVVDQGDPRLLLDSYVKIGEGSTG
       ..:.::   :    :. .        : :..   :: .:. :::.     . :::.:..:
CCDS48 NSSTLYRNTDRQRKKSKM--------TDEEILEKLRSIVSVGDPKKKYTRFEKIGQGASG
     250       260               270       280       290       300 

     420       430       440       450       460       470         
pF1KSD IVCLAREKHSGRQVAVKMMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQHFNVVEMYKSYLVGEELWV
        :  : .  .:..::.:.:.:..: ..::..::...::. .. :.:..  :::::.::::
CCDS48 TVYTALDIATGQEVAIKQMNLQQQPKKELIINEILVMRENKNPNIVNYLDSYLVGDELWV
             310       320       330       340       350       360 

     480       490       500       510       520       530         
pF1KSD LMEFLQGGALTDIVSQVRLNEEQIATVCEAVLQALAYLHAQGVIHRDIKSDSILLTLDGR
       .::.: ::.:::.:... ..: :::.::.  :::: .::.. :::::::::.::: .:: 
CCDS48 VMEYLAGGSLTDVVTETCMDEGQIAAVCRECLQALDFLHSNQVIHRDIKSDNILLGMDGS
             370       380       390       400       410       420 

     540       550       560       570       580       590         
pF1KSD VKLSDFGFCAQISKDVPKRKSLVGTPYWMAPEVISRSLYATEVDIWSLGIMVIEMVDGEP
       :::.::::::::. .  ::...:::::::::::..:. :. .:::::::::.::::.:::
CCDS48 VKLTDFGFCAQITPEQSKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMVEGEP
             430       440       450       460       470       480 

     600       610       620       630       640       650         
pF1KSD PYFSDSPVQAMKRLRDSPPPKLKNSHKVSPVLRDFLERMLVRDPQERATAQELLDHPFLL
       ::....:..:.  .  .  :.:.: ...: :.::::.: :  : ..:..:.:::.:::: 
CCDS48 PYLNENPLRALYLIATNGTPELQNPERLSAVFRDFLNRCLEMDVDRRGSAKELLQHPFLK
             490       500       510       520       530       540 

     660       670       680   
pF1KSD QTGLPECLVPLIQLYRKQTSTC  
        .     :.:::            
CCDS48 LAKPLSSLTPLIIAAKEAIKNSSR
             550       560     

>>CCDS3321.1 PAK2 gene_id:5062|Hs108|chr3                 (524 aa)
 initn: 1216 init1: 1006 opt: 1006  Z-score: 504.5  bits: 103.4 E(32554): 8.9e-22
Smith-Waterman score: 1048; 43.0% identity (71.6% similar) in 391 aa overlap (290-671:141-513)

     260       270       280       290       300       310         
pF1KSD LFRSMFLSTAATAPPSSSKPGPPPQSKPNSSFRPPQKDNPPSLVAKAQSLPSDQPVGTFS
                                     :: ::.::. ::      . :. .  :: .
CCDS33 ITKLEQKKNPQAVLDVLKFYDSNTVKQKYLSFTPPEKDGFPS------GTPALNAKGTEA
              120       130       140       150             160    

     320       330       340       350        360       370        
pF1KSD PLTTSDTSSPQKSLRTAPATGQLPGRSSPAGSPRTWHAQ-ISTSNLYLPQDPTVAKGALA
       : ....  . ..  .:::          :. .::  :.. : : ..  :    :. . . 
CCDS33 PAVVTEEEDDDE--ETAP----------PVIAPRPDHTKSIYTRSVIDPVPAPVGDSHVD
          170         180                 190       200       210  

      380               390       400       410       420       430
pF1KSD GEDTGV--------VTHEQFKAALRMVVDQGDPRLLLDSYVKIGEGSTGIVCLAREKHSG
       :   ..        .: :..   :: .:. :::.     : :::.:..: :  : .   :
CCDS33 GAAKSLDKQKKKTKMTDEEIMEKLRTIVSIGDPKKKYTRYEKIGQGASGTVFTATDVALG
            220       230       240       250       260       270  

              440       450       460       470       480       490
pF1KSD RQVAVKMMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQHFNVVEMYKSYLVGEELWVLMEFLQGGALT
       ..::.:...:.:: ..::..::...:.. .. :.:..  :::::.::.:.::.: ::.::
CCDS33 QEVAIKQINLQKQPKKELIINEILVMKELKNPNIVNFLDSYLVGDELFVVMEYLAGGSLT
            280       290       300       310       320       330  

              500       510       520       530       540       550
pF1KSD DIVSQVRLNEEQIATVCEAVLQALAYLHAQGVIHRDIKSDSILLTLDGRVKLSDFGFCAQ
       :.:... ..: :::.::.  :::: .:::. :::::::::..:: ..: :::.:::::::
CCDS33 DVVTETCMDEAQIAAVCRECLQALEFLHANQVIHRDIKSDNVLLGMEGSVKLTDFGFCAQ
            340       350       360       370       380       390  

              560       570       580       590       600       610
pF1KSD ISKDVPKRKSLVGTPYWMAPEVISRSLYATEVDIWSLGIMVIEMVDGEPPYFSDSPVQAM
       :. .  ::...:::::::::::..:. :. .:::::::::.::::.:::::....:..:.
CCDS33 ITPEQSKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMVEGEPPYLNENPLRAL
            400       410       420       430       440       450  

              620       630       640       650       660       670
pF1KSD KRLRDSPPPKLKNSHKVSPVLRDFLERMLVRDPQERATAQELLDHPFLLQTGLPECLVPL
         .  .  :.:.: .:.::..::::.: :  : ..:..:.:::.::::  .     :.::
CCDS33 YLIATNGTPELQNPEKLSPIFRDFLNRCLEMDVEKRGSAKELLQHPFLKLAKPLSSLTPL
            460       470       480       490       500       510  

              680  
pF1KSD IQLYRKQTSTC 
       :           
CCDS33 IMAAKEAMKSNR
            520    




681 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Thu Nov  3 08:35:55 2016 done: Thu Nov  3 08:35:56 2016
 Total Scan time:  4.720 Total Display time:  0.150

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com