Result of FASTA (ccds) for pF1KSDB0185
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDB0185, 1646 aa
  1>>>pF1KSDB0185 1646 - 1646 aa - 1646 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5272+/-0.00111; mu= 22.3916+/- 0.066
 mean_var=69.0354+/-13.879, 0's: 0 Z-trim(102.9): 79  B-trim: 3 in 1/50
 Lambda= 0.154361
 statistics sampled from 7086 (7166) to 7086 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.561), E-opt: 0.2 (0.22), width:  16
 Scan time:  4.940

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS10466.1 ABCA3 gene_id:21|Hs108|chr16           (1704) 8468 1896.1       0
CCDS6762.1 ABCA1 gene_id:19|Hs108|chr9             (2261) 1167 270.2 5.4e-71
CCDS43909.1 ABCA2 gene_id:20|Hs108|chr9            (2436) 1139 264.0 4.4e-69
CCDS747.1 ABCA4 gene_id:24|Hs108|chr1              (2273) 1130 262.0 1.6e-68
CCDS12055.1 ABCA7 gene_id:10347|Hs108|chr19        (2146) 1093 253.7 4.7e-66
CCDS11685.1 ABCA5 gene_id:23461|Hs108|chr17        (1642) 1063 247.0 3.9e-64
CCDS74138.1 ABCA8 gene_id:10351|Hs108|chr17        (1616) 1033 240.3 3.9e-62
CCDS74139.1 ABCA8 gene_id:10351|Hs108|chr17        (1621) 1033 240.3 3.9e-62
CCDS11681.1 ABCA9 gene_id:10350|Hs108|chr17        (1624) 1011 235.4 1.2e-60
CCDS47584.1 ABCA13 gene_id:154664|Hs108|chr7       (5058) 1017 237.0 1.2e-60
CCDS33373.1 ABCA12 gene_id:26154|Hs108|chr2        (2277)  976 227.7 3.5e-58
CCDS33372.1 ABCA12 gene_id:26154|Hs108|chr2        (2595)  976 227.7 3.9e-58
CCDS11684.1 ABCA10 gene_id:10349|Hs108|chr17       (1543)  967 225.6   1e-57
CCDS11683.1 ABCA6 gene_id:23460|Hs108|chr17        (1617)  949 221.6 1.7e-56
CCDS11680.1 ABCA8 gene_id:10351|Hs108|chr17        (1581)  547 132.1 1.5e-29
CCDS1814.1 ABCG5 gene_id:64240|Hs108|chr2          ( 651)  320 81.3 1.1e-14
CCDS5371.1 ABCB5 gene_id:340273|Hs108|chr7         ( 812)  315 80.3   3e-14
CCDS64798.1 ABCB8 gene_id:11194|Hs108|chr7         ( 630)  312 79.6 3.8e-14
CCDS5913.1 ABCB8 gene_id:11194|Hs108|chr7          ( 718)  312 79.6 4.2e-14
CCDS55090.1 ABCB5 gene_id:340273|Hs108|chr7        (1257)  315 80.4 4.3e-14
CCDS64799.1 ABCB8 gene_id:11194|Hs108|chr7         ( 735)  312 79.6 4.3e-14
CCDS1580.1 ABCB10 gene_id:23456|Hs108|chr1         ( 738)  312 79.6 4.3e-14
CCDS13681.1 ABCG1 gene_id:9619|Hs108|chr21         ( 663)  305 78.0 1.2e-13
CCDS42938.1 ABCG1 gene_id:9619|Hs108|chr21         ( 666)  305 78.0 1.2e-13
CCDS42937.1 ABCG1 gene_id:9619|Hs108|chr21         ( 668)  305 78.0 1.2e-13
CCDS13683.1 ABCG1 gene_id:9619|Hs108|chr21         ( 677)  305 78.0 1.2e-13
CCDS13682.1 ABCG1 gene_id:9619|Hs108|chr21         ( 678)  305 78.0 1.2e-13
CCDS5608.1 ABCB1 gene_id:5243|Hs108|chr7           (1280)  305 78.2   2e-13
CCDS5607.1 ABCB4 gene_id:5244|Hs108|chr7           (1232)  304 77.9 2.3e-13
CCDS5605.1 ABCB4 gene_id:5244|Hs108|chr7           (1279)  304 77.9 2.4e-13
CCDS8415.1 ABCG4 gene_id:64137|Hs108|chr11         ( 646)  293 75.3 7.3e-13
CCDS64800.1 ABCB8 gene_id:11194|Hs108|chr7         ( 693)  293 75.3 7.7e-13
CCDS2436.1 ABCB6 gene_id:10058|Hs108|chr2          ( 842)  286 73.8 2.7e-12
CCDS78129.1 TAP2 gene_id:6891|Hs108|chr6           ( 686)  278 72.0 7.7e-12
CCDS46444.1 ABCB11 gene_id:8647|Hs108|chr2         (1321)  274 71.3 2.5e-11
CCDS4758.1 TAP1 gene_id:6890|Hs108|chr6            ( 808)  270 70.3 3.1e-11
CCDS1815.1 ABCG8 gene_id:64241|Hs108|chr2          ( 673)  265 69.1 5.7e-11


>>CCDS10466.1 ABCA3 gene_id:21|Hs108|chr16                (1704 aa)
 initn: 8449 init1: 8449 opt: 8468  Z-score: 10177.0  bits: 1896.1 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 10612; 96.5% identity (96.5% similar) in 1678 aa overlap (27-1646:27-1704)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MAVLRQLALLLWKNYTLQKRKVLVTVLELFLPLLFSGILIWLRLKIQSENVPNATIYPGQ
                                 ::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MAVLRQLALLLWKNYTLQKRKVLVTVLELFLPLLFSGILIWLRLKIQSENVPNATIYPGQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD SIQELPLFFTFPPPGDTWELAYIPSHSDAAKTVTETVRRALVINMRVRGFPSEKDFEDYI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SIQELPLFFTFPPPGDTWELAYIPSHSDAAKTVTETVRRALVINMRVRGFPSEKDFEDYI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD RYDNCSSSVLAAVVFEHPFNHSKEPLPLAVKYHLRFSYTRRNYMWTQTGSFFLKETEGWH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RYDNCSSSVLAAVVFEHPFNHSKEPLPLAVKYHLRFSYTRRNYMWTQTGSFFLKETEGWH
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD TTSLFPLFPNPGPREPTSPDGGEPGYIREGFLAVQHAVDRAIMEYHADAATRQLFQRLTV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TTSLFPLFPNPGPREPTSPDGGEPGYIREGFLAVQHAVDRAIMEYHADAATRQLFQRLTV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD TIKRFPYPPFIADPFLVAIQYQLPLLLLLSFTYTALTIARAVVQEKERRLKEYMRMMGLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TIKRFPYPPFIADPFLVAIQYQLPLLLLLSFTYTALTIARAVVQEKERRLKEYMRMMGLS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD SWLHWSAWFLLFFLFLLIAASFMTLLFCVKVKPNVAVLSRSDPSLVLAFLLCFAISTISF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SWLHWSAWFLLFFLFLLIAASFMTLLFCVKVKPNVAVLSRSDPSLVLAFLLCFAISTISF
              310       320       330       340       350       360

              370                                                  
pF1KSD SFMVSTFFSK--------------------------------------------------
       ::::::::::                                                  
CCDS10 SFMVSTFFSKANMAAAFGGFLYFFTYIPYFFVAPRYNWMTLSQKLCSCLLSNVAMAMGAQ
              370       380       390       400       410       420

                      380       390       400       410       420  
pF1KSD --------GMGIQWRDLLSPVNVDDDFCFGQVLGMLLLDSVLYGLVTWYMEAVFPGQFGV
               ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LIGKFEAKGMGIQWRDLLSPVNVDDDFCFGQVLGMLLLDSVLYGLVTWYMEAVFPGQFGV
              430       440       450       460       470       480

            430       440       450       460       470       480  
pF1KSD PQPWYFFIMPSYWCGKPRAVAGKEEEDSDPEKALRNEYFEAEPEDLVAGIKIKHLSKVFR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PQPWYFFIMPSYWCGKPRAVAGKEEEDSDPEKALRNEYFEAEPEDLVAGIKIKHLSKVFR
              490       500       510       520       530       540

            490       500       510       520       530       540  
pF1KSD VGNKDRAAVRDLNLNLYEGQITVLLGHNGAGKTTTLSMLTGLFPPTSGRAYISGYEISQD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VGNKDRAAVRDLNLNLYEGQITVLLGHNGAGKTTTLSMLTGLFPPTSGRAYISGYEISQD
              550       560       570       580       590       600

            550       560       570       580       590       600  
pF1KSD MVQIRKSLGLCPQHDILFDNLTVAEHLYFYAQLKGLSRQKCPEEVKQMLHIIGLEDKWNS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MVQIRKSLGLCPQHDILFDNLTVAEHLYFYAQLKGLSRQKCPEEVKQMLHIIGLEDKWNS
              610       620       630       640       650       660

            610       620       630       640       650       660  
pF1KSD RSRFLSGGMRRKLSIGIALIAGSKVLILDEPTSGMDAISRRAIWDLLQRQKSDRTIVLTT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RSRFLSGGMRRKLSIGIALIAGSKVLILDEPTSGMDAISRRAIWDLLQRQKSDRTIVLTT
              670       680       690       700       710       720

            670       680       690       700       710       720  
pF1KSD HFMDEADLLGDRIAIMAKGELQCCGSSLFLKQKYGAGYHMTLVKEPHCNPEDISQLVHHH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 HFMDEADLLGDRIAIMAKGELQCCGSSLFLKQKYGAGYHMTLVKEPHCNPEDISQLVHHH
              730       740       750       760       770       780

            730       740       750       760       770       780  
pF1KSD VPNATLESSAGAELSFILPRESTHRFEGLFAKLEKKQKELGIASFGASITTMEEVFLRVG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VPNATLESSAGAELSFILPRESTHRFEGLFAKLEKKQKELGIASFGASITTMEEVFLRVG
              790       800       810       820       830       840

            790       800       810       820       830       840  
pF1KSD KLVDSSMDIQAIQLPALQYQHERRASDWAVDSNLCGAMDPSDGIGALIEEERTAVKLNTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KLVDSSMDIQAIQLPALQYQHERRASDWAVDSNLCGAMDPSDGIGALIEEERTAVKLNTG
              850       860       870       880       890       900

            850       860       870       880       890       900  
pF1KSD LALHCQQFWAMFLKKAAYSWREWKMVAAQVLVPLTCVTLALLAINYSSELFDDPMLRLTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LALHCQQFWAMFLKKAAYSWREWKMVAAQVLVPLTCVTLALLAINYSSELFDDPMLRLTL
              910       920       930       940       950       960

            910       920       930       940       950       960  
pF1KSD GEYGRTVVPFSVPGTSQLGQQLSEHLKDALQAEGQEPREVLGDLEEFLIFRASVEGGGFN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GEYGRTVVPFSVPGTSQLGQQLSEHLKDALQAEGQEPREVLGDLEEFLIFRASVEGGGFN
              970       980       990      1000      1010      1020

            970       980       990      1000      1010      1020  
pF1KSD ERCLVAASFRDVGERTVVNALFNNQAYHSPATALAVVDNLLFKLLCGPHASIVVSNFPQP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ERCLVAASFRDVGERTVVNALFNNQAYHSPATALAVVDNLLFKLLCGPHASIVVSNFPQP
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

           1030      1040      1050      1060      1070      1080  
pF1KSD RSALQAAKDQFNEGRKGFDIALNLLFAMAFLASTFSILAVSERAVQAKHVQFVSGVHVAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RSALQAAKDQFNEGRKGFDIALNLLFAMAFLASTFSILAVSERAVQAKHVQFVSGVHVAS
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

           1090      1100      1110      1120      1130      1140  
pF1KSD FWLSALLWDLISFLIPSLLLLVVFKAFDVRAFTRDGHMADTLLLLLLYGWAIIPLMYLMN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 FWLSALLWDLISFLIPSLLLLVVFKAFDVRAFTRDGHMADTLLLLLLYGWAIIPLMYLMN
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

           1150      1160      1170      1180      1190      1200  
pF1KSD FFFLGAATAYTRLTIFNILSGIATFLMVTIMRIPAVKLEELSKTLDHVFLVLPNHCLGMA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 FFFLGAATAYTRLTIFNILSGIATFLMVTIMRIPAVKLEELSKTLDHVFLVLPNHCLGMA
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

           1210      1220      1230      1240      1250      1260  
pF1KSD VSSFYENYETRRYCTSSEVAAHYCKKYNIQYQENFYAWSAPGVGRFVASMAASGCAYLIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VSSFYENYETRRYCTSSEVAAHYCKKYNIQYQENFYAWSAPGVGRFVASMAASGCAYLIL
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

           1270      1280      1290      1300      1310      1320  
pF1KSD LFLIETNLLQRLRGILCALRRRRTLTELYTRMPVLPEDQDVADERTRILAPSPDSLLHTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LFLIETNLLQRLRGILCALRRRRTLTELYTRMPVLPEDQDVADERTRILAPSPDSLLHTP
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

           1330      1340      1350      1360      1370      1380  
pF1KSD LIIKELSKVYEQRVPLLAVDRLSLAVQKGECFGLLGFNGAGKTTTFKMLTGEESLTSGDA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LIIKELSKVYEQRVPLLAVDRLSLAVQKGECFGLLGFNGAGKTTTFKMLTGEESLTSGDA
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

           1390      1400      1410      1420      1430      1440  
pF1KSD FVGGHRISSDVGKVRQRIGYCPQFDALLDHMTGREMLVMYARLRGIPERHIGACVENTLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 FVGGHRISSDVGKVRQRIGYCPQFDALLDHMTGREMLVMYARLRGIPERHIGACVENTLR
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

           1450      1460      1470      1480      1490      1500  
pF1KSD GLLLEPHANKLVRTYSGGNKRKLSTGIALIGEPAVIFLDEPSTGMDPVARRLLWDTVARA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GLLLEPHANKLVRTYSGGNKRKLSTGIALIGEPAVIFLDEPSTGMDPVARRLLWDTVARA
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           1510      1520      1530      1540      1550      1560  
pF1KSD RESGKAIIITSHSMEECEALCTRLAIMVQGQFKCLGSPQHLKSKFGSGYSLRAKVQSEGQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RESGKAIIITSHSMEECEALCTRLAIMVQGQFKCLGSPQHLKSKFGSGYSLRAKVQSEGQ
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           1570      1580      1590      1600      1610      1620  
pF1KSD QEALEEFKAFVDLTFPGSVLEDEHQGMVHYHLPGRDLSWAKVFGILEKAKEKYGVDDYSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QEALEEFKAFVDLTFPGSVLEDEHQGMVHYHLPGRDLSWAKVFGILEKAKEKYGVDDYSV
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pF1KSD SQISLEQVFLSFAHLQPPTAEEGR
       ::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SQISLEQVFLSFAHLQPPTAEEGR
             1690      1700    

>>CCDS6762.1 ABCA1 gene_id:19|Hs108|chr9                  (2261 aa)
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       .::..  . .      ..  : ....::: .. : :: ... ..::.. :.. :.. .: 
CCDS67 QAIIRVLTGTE-----KKTGVYMQQMPYPCYVDDIFLRVMSRSMPLFMTLAWIYSVAVII
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pF1KSD RAVVQEKERRLKEYMRMMGLSSWLHWSAWFLLFFLFLLIAASFMTLLFCVKVKPNVAVLS
       ...: ::: :::: ::.:::.. . : .::.  .. ::..:....... .       .: 
CCDS67 KGIVYEKEARLKETMRIMGLDNSILWFSWFISSLIPLLVSAGLLVVILKLG-----NLLP
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pF1KSD RSDPSLVLAFLLCFAISTISFSFMVSTFFSK-----------------------------
        ::::.:..::  ::. ::   :..::.::.                             
CCDS67 YSDPSVVFVFLSVFAVVTILQCFLISTLFSRANLAAACGGIIYFTLYLPYVLCVAWQDYV
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pF1KSD -----------------------------GMGIQWRDLL-SPVNVDDDFCFGQVLGMLLL
                                    :.:.:: .:. :::. .: : .   ..:.:.
CCDS67 GFTLKIFASLLSPVAFGFGCEYFALFEEQGIGVQWDNLFESPVE-EDGFNLTTSVSMMLF
             780       790       800       810        820       830

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pF1KSD DSVLYGLVTWYMEAVFPGQFGVPQPWYFFIMPSYWCGKPRAVAGKEEEDSDP---EKALR
       :. :::..:::.:::::::.:.:.::::    ::: :.      . .: : :   .: . 
CCDS67 DTFLYGVMTWYIEAVFPGQYGIPRPWYFPCTKSYWFGE------ESDEKSHPGSNQKRIS
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pF1KSD NEYFEAEPEDLVAGIKIKHLSKVFRVGNKDRAAVRDLNLNLYEGQITVLLGHNGAGKTTT
       .  .: ::  :  :..:..: ::.: : :  .::  : ::.:::::: .:::::::::::
CCDS67 EICMEEEPTHLKLGVSIQNLVKVYRDGMK--VAVDGLALNFYEGQITSFLGHNGAGKTTT
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pF1KSD LSMLTGLFPPTSGRAYISGYEISQDMVQIRKSLGLCPQHDILFDNLTVAEHLYFYAQLKG
       .:.:::::::::: ::: : .: ..:  ::..::.::::..::: ::: ::..:::.:::
CCDS67 MSILTGLFPPTSGTAYILGKDIRSEMSTIRQNLGVCPQHNVLFDMLTVEEHIWFYARLKG
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pF1KSD LSRQKCPEEVKQMLHIIGLED-KWNSRSRFLSGGMRRKLSIGIALIAGSKVLILDEPTSG
       ::...   :..::   .:: . : .:..  :::::.::::...:...::::.::::::.:
CCDS67 LSEKHVKAEMEQMALDVGLPSSKLKSKTSQLSGGMQRKLSVALAFVGGSKVVILDEPTAG
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pF1KSD MDAISRRAIWDLLQRQKSDRTIVLTTHFMDEADLLGDRIAIMAKGELQCCGSSLFLKQKY
       .:  :::.::.:: . .. :::.:.:: :::::.:::::::...:.: : :::::::.. 
CCDS67 VDPYSRRGIWELLLKYRQGRTIILSTHHMDEADVLGDRIAIISHGKLCCVGSSLFLKNQL
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pF1KSD GAGYHMTLVKEP------HC----------NPED--------------------------
       :.::..::::.        :          . ::                          
CCDS67 GTGYYLTLVKKDVESSLSSCRNSSSTVSYLKKEDSVSQSSSDAGLGSDHESDTLTIDVSA
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pF1KSD ISQLVHHHVPNATLESSAGAELSFILPRESTHR--FEGLFAKLEKKQKELGIASFGASIT
       ::.:...:: .: :  . : ::...:: :....  :  :: ... . ..:::.:.: : :
CCDS67 ISNLIRKHVSEARLVEDIGHELTYVLPYEAAKEGAFVELFHEIDDRLSDLGISSYGISET
           1190      1200      1210      1220      1230      1240  

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       :.::.::.:..  .:..: .. .  :::   ...:::     :.. :        : ::.
CCDS67 TLEEIFLKVAE--ESGVDAETSDGTLPA---RRNRRAFG---DKQSCLRPFTEDDAADPN
           1250        1260         1270         1280      1290    

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pF1KSD DGIGALIEEERTAVKLNTGL-----------ALHCQQFWAMFLKKAAYSWREWKMVAAQV
       :   . :. :   . : .:.            :  ::: :.. :.   . :  :   ::.
CCDS67 D---SDIDPESRETDLLSGMDGKGSYQVKGWKLTQQQFVALLWKRLLIARRSRKGFFAQI
            1300      1310      1320      1330      1340      1350 

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pF1KSD LVP--LTCVTLALLAI-----NYSS--------------------------ELFD----D
       ..:  ..:..:..  :     .: :                          ::..    :
CCDS67 VLPAVFVCIALVFSLIVPPFGKYPSLELQPWMYNEQYTFVSNDAPEDTGTLELLNALTKD
            1360      1370      1380      1390      1400      1410 

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pF1KSD PML--RLTLG-------------EYGRTVVPFSVPGTSQLG-----------QQLSEHLK
       : .  :   :             :.  . :: ..    : :           :  :...:
CCDS67 PGFGTRCMEGNPIPDTPCQAGEEEWTTAPVPQTIMDLFQNGNWTMQNPSPACQCSSDKIK
            1420      1430      1440      1450      1460      1470 

     930                   940            950                      
pF1KSD DALQ-----AEGQEP-------REVLGDLE-----EFL------IFRASVEG--------
         :      : :  :        ..: ::      ..:      :.  :...        
CCDS67 KMLPVCPPGAGGLPPPQRKQNTADILQDLTGRNISDYLVKTYVQIIAKSLKNKIWVNEFR
            1480      1490      1500      1510      1520      1530 

       960            970                      980                 
pF1KSD -GGF-----NERCLVAASF---------------RDVGERTVVNAL--------------
        :::     : . :  ..                .: .    .:.:              
CCDS67 YGGFSLGVSNTQALPPSQEVNDAIKQMKKHLKLAKDSSADRFLNSLGRFMTGLDTKNNVK
            1540      1550      1560      1570      1580      1590 

             990      1000          1010       1020      1030      
pF1KSD --FNNQAYHSPATALAVVDNLLFK--LLCG--P-HASIVVSNFPQPRSALQAAKDQFNEG
         :::...:. .. : :..: ...  :  :  : : .:.. : :   .  : ..  .   
CCDS67 VWFNNKGWHAISSFLNVINNAILRANLQKGENPSHYGITAFNHPLNLTKQQLSEVALMTT
            1600      1610      1620      1630      1640      1650 

       1040      1050      1060      1070      1080      1090      
pF1KSD RKGFDIALNLLFAMAFLASTFSILAVSERAVQAKHVQFVSGVHVASFWLSALLWDLISFL
            ... ..:::.:. ..: .. ..::. .:::.::.:::. . .::: ..::. ...
CCDS67 SVDVLVSICVIFAMSFVPASFVVFLIQERVSKAKHLQFISGVKPVIYWLSNFVWDMCNYV
            1660      1670      1680      1690      1700      1710 

       1100      1110      1120      1130      1140      1150      
pF1KSD IPSLLLLVVFKAFDVRAFTRDGHMADTLLLLLLYGWAIIPLMYLMNFFFLGAATAYTRLT
       .:. :....:  :. .... . ..    ::::::::.: ::::  .: :   .:::. ::
CCDS67 VPATLVIIIFICFQQKSYVSSTNLPVLALLLLLYGWSITPLMYPASFVFKIPSTAYVVLT
            1720      1730      1740      1750      1760      1770 

       1160      1170       1180      1190      1200      1210     
pF1KSD IFNILSGIATFLMVTIMRI-PAVKLEELSKTLDHVFLVLPNHCLGMAVSSFYENYETRRY
         :.. ::   . . ....    ::....  :  :::..:. ::: .. .. .:      
CCDS67 SVNLFIGINGSVATFVLELFTDNKLNNINDILKSVFLIFPHFCLGRGLIDMVKN------
            1780      1790      1800      1810      1820           

        1220      1230      1240      1250      1260      1270     
pF1KSD CTSSEVAAHYCKKYNIQYQENFYAWSAPGVGRFVASMAASGCAYLILLFLIETNLLQRLR
           .. :   .... .   .  .:.   ::: . .::. : .....  ::.  .. : :
CCDS67 ----QAMADALERFGENRFVSPLSWDL--VGRNLFAMAVEGVVFFLITVLIQYRFFIRPR
            1830      1840        1850      1860      1870         

        1280      1290      1300      1310      1320      1330     
pF1KSD GILCALRRRRTLTELYTRMPVLPEDQDVADERTRILAPSPDSLLHTPLIIKELSKVYE-Q
        .   :             :.  ::.::  :: :::  . .. .   : ::::.:.:. .
CCDS67 PVNAKLS------------PLNDEDEDVRRERQRILDGGGQNDI---LEIKELTKIYRRK
    1880                  1890      1900      1910         1920    

         1340      1350      1360      1370      1380      1390    
pF1KSD RVPLLAVDRLSLAVQKGECFGLLGFNGAGKTTTFKMLTGEESLTSGDAFVGGHRISSDVG
       : :  ::::. ...  :::::::: :::::..:::::::. ..: ::::.. . : :.. 
CCDS67 RKP--AVDRICVGIPPGECFGLLGVNGAGKSSTFKMLTGDTTVTRGDAFLNKNSILSNIH
           1930      1940      1950      1960      1970      1980  

         1400      1410      1420      1430      1440      1450    
pF1KSD KVRQRIGYCPQFDALLDHMTGREMLVMYARLRGIPERHIGACVENTLRGLLLEPHANKLV
       .:.: .::::::::. . .:::: . ..: :::.::...:   : ..: : :  ...: .
CCDS67 EVHQNMGYCPQFDAITELLTGREHVEFFALLRGVPEKEVGKVGEWAIRKLGLVKYGEKYA
           1990      2000      2010      2020      2030      2040  

         1460      1470      1480      1490      1500      1510    
pF1KSD RTYSGGNKRKLSTGIALIGEPAVIFLDEPSTGMDPVARRLLWDTVARARESGKAIIITSH
        .:::::::::::..:::: : :.:::::.::::: :::.::. .  . . :.....:::
CCDS67 GNYSGGNKRKLSTAMALIGGPPVVFLDEPTTGMDPKARRFLWNCALSVVKEGRSVVLTSH
           2050      2060      2070      2080      2090      2100  

         1520      1530      1540      1550      1560      1570    
pF1KSD SMEECEALCTRLAIMVQGQFKCLGSPQHLKSKFGSGYSLRAKVQSEGQQEALEEFKAFVD
       :::::::::::.::::.:.:.:::: ::::..::.::.. ...   :..  :.  . :  
CCDS67 SMEECEALCTRMAIMVNGRFRCLGSVQHLKNRFGDGYTIVVRIA--GSNPDLKPVQDFFG
           2110      2120      2130      2140        2150      2160

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pF1KSD LTFPGSVLEDEHQGMVHYHLPGRDLSWAKVFGILEKAKEKYGVDDYSVSQISLEQVFLSF
       :.::::::...:..:..:.::.   : :..:.:: ..:..  ..:::::: .:.:::..:
CCDS67 LAFPGSVLKEKHRNMLQYQLPSSLSSLARIFSILSQSKKRLHIEDYSVSQTTLDQVFVNF
             2170      2180      2190      2200      2210      2220

         1640                                   
pF1KSD AHLQPPTAEEGR                             
       :. :                                     
CCDS67 AKDQSDDDHLKDLSLHKNQTVVDVAVLTSFLQDEKVKESYV
             2230      2240      2250      2260 

>>CCDS43909.1 ABCA2 gene_id:20|Hs108|chr9                 (2436 aa)
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CCDS43 AIIDTFVGHDVVEPGSYVQMFPYPCYTRDDFLFVIEHMMPLCMVISWVYSVAMTIQHIVA
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pF1KSD EKERRLKEYMRMMGLSSWLHWSAWFLLFFLFLLIAASFMTLLFCVKVKPNVAVLSRSDPS
       :::.:::: :. :::.. .:: :::.  :. : :... .: ..         :: .:   
CCDS43 EKEHRLKEVMKTMGLNNAVHWVAWFITGFVQLSISVTALTAILKYG-----QVLMHSHVV
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pF1KSD LVLAFLLCFAISTISFSFMVSTFFSK----------------------------------
       ..  ::  .:..:: : :.::...::                                  
CCDS43 IIWLFLAVYAVATIMFCFLVSVLYSKAKLASACGGIIYFLSYVPYMYVAIREEVAHDKIT
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                                           380       390       400 
pF1KSD ----------------------------GMGIQWRDL-LSPVNVDDDFCFGQVLGMLLLD
                                   :.::::. .  :::.  ::: .  .. ::..:
CCDS43 AFEKCIASLMSTTAFGLGSKYFALYEVAGVGIQWHTFSQSPVE-GDDFNLLLAVTMLMVD
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pF1KSD SVLYGLVTWYMEAVFPGQFGVPQPWYFFIMPSYWCGKPRAVAGKEE-----------EDS
       .:.::..:::.::: ::..:.:.:::: .. ::: :. :. : .              . 
CCDS43 AVVYGILTWYIEAVHPGMYGLPRPWYFPLQKSYWLGSGRTEAWEWSWPWARTPRLSVMEE
           910       920       930       940       950       960   

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pF1KSD DPEKALRNEYFEA------EPEDLVAGIKIKHLSKVFRVGNKDRAAVRDLNLNLYEGQIT
       :   :.... ::       ::  :   . . .:.::..  .  . :.  :.:::::.:..
CCDS43 DQACAMESRRFEETRGMEEEPTHLPLVVCVDKLTKVYK--DDKKLALNKLSLNLYENQVV
           970       980       990      1000        1010      1020 

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pF1KSD VLLGHNGAGKTTTLSMLTGLFPPTSGRAYISGYEISQDMVQIRKSLGLCPQHDILFDNLT
        .:::::::::::.:.:::::::::: : : :..:  .: .:::.::.::::..::: ::
CCDS43 SFLGHNGAGKTTTMSILTGLFPPTSGSATIYGHDIRTEMDEIRKNLGMCPQHNVLFDRLT
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pF1KSD VAEHLYFYAQLKGLSRQKCPEEVKQMLHIIGLEDKWNSRSRFLSGGMRRKLSIGIALIAG
       : :::.::..::......  .:. .:.. . : .: .:  . :::::.::::..::...:
CCDS43 VEEHLWFYSRLKSMAQEEIRREMDKMIEDLELSNKRHSLVQTLSGGMKRKLSVAIAFVGG
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pF1KSD SKVLILDEPTSGMDAISRRAIWDLLQRQKSDRTIVLTTHFMDEADLLGDRIAIMAKGELQ
       :...::::::.:.:  .:::::::. . :  :::.:.:: :::::::::::::...:.:.
CCDS43 SRAIILDEPTAGVDPYARRAIWDLILKYKPGRTILLSTHHMDEADLLGDRIAIISHGKLK
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pF1KSD CCGSSLFLKQKYGAGYHMTLVKEP----------------------HCNPEDISQLVHHH
       :::: ::::  :: ::..::::.:                       :.  ..::....:
CCDS43 CCGSPLFLKGTYGDGYRLTLVKRPAEPGGPQEPGLASSPPGRAPLSSCSELQVSQFIRKH
            1210      1220      1230      1240      1250      1260 

            730       740         750       760       770       780
pF1KSD VPNATLESSAGAELSFILPRESTHR--FEGLFAKLEKKQKELGIASFGASITTMEEVFLR
       : .  : :....:::.::: :....  :: :: .::..   : ..:::   ::.:::::.
CCDS43 VASCLLVSDTSTELSYILPSEAAKKGAFERLFQHLERSLDALHLSSFGLMDTTLEEVFLK
            1270      1280      1290      1300      1310      1320 

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pF1KSD VGK----LVDSSMDIQAIQ---LPALQ--YQHERRASDWAVDSNLC------------GA
       :..    : .:  :..  .   ::. .   . : .:.. :  :.:             :.
CCDS43 VSEEDQSLENSEADVKESRKDVLPGAEGPASGEGHAGNLARCSELTQSQASLQSASSVGS
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pF1KSD MDPSDGIG---------------------ALIEEERTAV--------KLNTGLALHCQQF
          ..: :                     .: : :  :.        ::. :  :. .::
CCDS43 ARGDEGAGYTDVYGDYRPLFDNPQDPDNVSLQEVEAEALSRVGQGSRKLDGGW-LKVRQF
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pF1KSD WAMFLKKAAYSWREWKMVAAQVLVPLTCVTLALLAINYSSELFDDPMLRLTLGEYGRTVV
        ....:.   . :. : . .:.:.:   : .:. .     :. : : : :. ..:   . 
CCDS43 HGLLVKRFHCARRNSKALFSQILLPAFFVCVAMTVALSVPEIGDLPPLVLSPSQYHNYTQ
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pF1KSD P-------------------------------FSVP------------------------
       :                               : .:                        
CCDS43 PRGNFIPYANEERREYRLRLSPDASPQQLVSTFRLPSGVGATCVLKSPANGSLGPTLNLS
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

          920                                      930             
pF1KSD -GTSQL----------------GQQLSEHLK---------------DALQAE--------
        : :.:                :  ::. .                . :::         
CCDS43 SGESRLLAARFFDSMCLESFTQGLPLSNFVPPPPSPAPSDSPASPDEDLQAWNVSLPPTA
             1570      1580      1590      1600      1610      1620

                                                940                
pF1KSD -------------------------------------GQEP--REVLGDL---------E
                                            :. :  : : ::.          
CCDS43 GPEMWTSAPSLPRLVREPVRCTCSAQGTGFSCPSSVGGHPPQMRVVTGDILTDITGHNVS
             1630      1640      1650      1660      1670      1680

       950          960           970               980       990  
pF1KSD EFLIF---RASVEGGG---F-NERCLVAASF--------RDVGERTVVNALFNNQAYHSP
       :.:.:   :  ..  :   : :    . :::        : .. : ......::..::: 
CCDS43 EYLLFTSDRFRLHRYGAITFGNVLKSIPASFGTRAPPMVRKIAVRRAAQVFYNNKGYHSM
             1690      1700      1710      1720      1730      1740

           1000           1010       1020      1030      1040      
pF1KSD ATALAVVDNLLF-----KLLCGPHA-SIVVSNFPQPRSALQAAKDQFNEGRKGFDIALNL
        : :  ..: ..     :   .: : .:.:.: :. ... . . : . .:     ::. .
CCDS43 PTYLNSLNNAILRANLPKSKGNPAAYGITVTNHPMNKTSASLSLDYLLQGTDVV-IAIFI
             1750      1760      1770      1780      1790          

       1050      1060      1070      1080      1090      1100      
pF1KSD LFAMAFLASTFSILAVSERAVQAKHVQFVSGVHVASFWLSALLWDLISFLIPSLLLLVVF
       . ::.:. ..: .. :.:....:::.::::: .   .::.  .::....:.:.   ....
CCDS43 IVAMSFVPASFVVFLVAEKSTKAKHLQFVSGCNPIIYWLANYVWDMLNYLVPATCCVIIL
    1800      1810      1820      1830      1840      1850         

       1110      1120      1130      1140      1150      1160      
pF1KSD KAFDVRAFTRDGHMADTLLLLLLYGWAIIPLMYLMNFFFLGAATAYTRLTIFNILSGI--
        .::. :.:   ..  .: :.:::::.: :.::  .:.:   ..::. : ..:.. ::  
CCDS43 FVFDLPAYTSPTNFPAVLSLFLLYGWSITPIMYPASFWFEVPSSAYVFLIVINLFIGITA
    1860      1870      1880      1890      1900      1910         

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pF1KSD --ATFLMVTIMRIPAVKLEELSKTLDHVFLVLPNHCLGMAVSSF-YENYETRRYCTSSEV
         ::::.  . .   .:.  ... :   ::..::. :: ..  . :..:          .
CCDS43 TVATFLLQLFEHDKDLKV--VNSYLKSCFLIFPNYNLGHGLMEMAYNEY----------I
    1920      1930        1940      1950      1960                 

            1230      1240      1250      1260      1270      1280 
pF1KSD AAHYCKKYNIQYQENFYAWSAPGVGRFVASMAASGCAYLILLFLIETNLLQRLRGILCAL
         .: :  ... ... . :.   : : ...::. : . ..: .. . :.:.: .      
CCDS43 NEYYAKIGQFDKMKSPFEWDI--VTRGLVAMAVEGVVGFLLTIMCQYNFLRRPQ------
      1970      1980        1990      2000      2010               

            1290          1300      1310      1320      1330       
pF1KSD RRRRTLTELYTRMPV----LPEDQDVADERTRILAPSPDSLLHTPLIIKELSKVYEQRVP
                  ::::    . .: :::.:: :.:  . :. .   . :..:.:::..:  
CCDS43 -----------RMPVSTKPVEDDVDVASERQRVLRGDADNDM---VKIENLTKVYKSRKI
               2020      2030      2040      2050         2060     

        1340      1350      1360      1370      1380      1390     
pF1KSD --LLAVDRLSLAVQKGECFGLLGFNGAGKTTTFKMLTGEESLTSGDAFVGGHRISSDVGK
         .:::::: :.:. :::::::: ::::::.:::::::.:: :.:.:::.:: . ... .
CCDS43 GRILAVDRLCLGVRPGECFGLLGVNGAGKTSTFKMLTGDESTTGGEAFVNGHSVLKELLQ
        2070      2080      2090      2100      2110      2120     

        1400      1410      1420      1430      1440      1450     
pF1KSD VRQRIGYCPQFDALLDHMTGREMLVMYARLRGIPERHIGACVENTLRGLLLEPHANKLVR
       :.: .::::: :::.:..:.:: : .:.:::::  .  .  :. .:. : :  .:.: . 
CCDS43 VQQSLGYCPQCDALFDELTAREHLQLYTRLRGISWKDEARVVKWALEKLELTKYADKPAG
        2130      2140      2150      2160      2170      2180     

        1460      1470      1480      1490      1500      1510     
pF1KSD TYSGGNKRKLSTGIALIGEPAVIFLDEPSTGMDPVARRLLWDTVARARESGKAIIITSHS
       ::::::::::::.::::: :: ::::::.::::: :::.::. .    ..:.....::::
CCDS43 TYSGGNKRKLSTAIALIGYPAFIFLDEPTTGMDPKARRFLWNLILDLIKTGRSVVLTSHS
        2190      2200      2210      2220      2230      2240     

        1520      1530      1540      1550      1560      1570     
pF1KSD MEECEALCTRLAIMVQGQFKCLGSPQHLKSKFGSGYSLRAKVQSEGQQEALEEFKAFVDL
       :::::::::::::::.:...:::: ::::..::.:: . ....:   ......   : . 
CCDS43 MEECEALCTRLAIMVNGRLRCLGSIQHLKNRFGDGYMITVRTKS---SQSVKDVVRFFNR
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       .:: ..:...:.  :.:.: .. .: :.::. .:...   :..:::::: .:..::..::
CCDS43 NFPEAMLKERHHTKVQYQLKSEHISLAQVFSKMEQVSGVLGIEDYSVSQTTLDNVFVNFA
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       . :  . :.                                                   
CCDS43 KKQSDNLEQQETEPPSALQSPLGCLLSLLRPRSAPTELRALVADEPEDLDTEDEGLISFE
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CCDS74 TAELKKAVSLLSPVAFGFGTEYLVRFEEQGLGLQWSNIGNSPTEGDEFSFLLSMQMMLLD
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pF1KSD SVLYGLVTWYMEAVFPGQFGVPQPWYFFIMPSYWCG-------KPRAVAGKE---EEDSD
       ...:::..::.. ::::..:.: ::::... ::: :       . ::.   :   ::  :
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       ::  ..... .:: :    : :. .:.: :.:.     : ::  ::...::.:::..:::
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CCDS74 LFYAQLKGKSQEEAQLEMEAMLEDTGLHHKRNEEAQDLSGGMQRKLSVAIAFVGDAKVVI
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       :: ::.   .:   ..  ..:. .:.. . :                  :.: : .    
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CCDS74 GKLPVVPITGEALVGFLSDLGRIMNVSGGPITREASKEIPDFLKHLETEDNIKVWFNNKG
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pF1KSD ---LFKLLCGPHASIVVSNFPQPRSA-----------LQAAKDQFNEGR---KGFD--IA
          : ..:   : .:. ...:. ::            :. .:.:..:      . :  .:
CCDS74 WHALVSFLNVAHNAILRASLPKDRSPEEYGITVISQPLNLTKEQLSEITVLTTSVDAVVA
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       . ..:.:.:. ..: .  ..::. ..::.::.:::  ...:.. .:::.... . . :..
CCDS74 ICVIFSMSFVPASFVLYLIQERVNKSKHLQFISGVSPTTYWVTNFLWDIMNYSVSAGLVV
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        .: .:. .:.:   ..   . ::::::::.::.::  .:.:   .:::. :.  :.. :
CCDS74 GIFIGFQKKAYTSPENLPALVALLLLYGWAVIPMMYPASFLFDVPSTAYVALSCANLFIG
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CCDS74 INSSAITFILELFENNRTLLRFNAVLRKLLIVFPHFCLGRGLIDL----------ALSQA
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       ..    ... ... : . :.   .:. . .:.. : .:..: .:.. ...          
CCDS74 VTDVYARFGEEHSANPFHWDL--IGKNLFAMVVEGVVYFLLTLLVQRHFFLS--------
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          . ..:  :. :.. ::.:::.:: ::.. .  . .   : ..::.:.:     :  :
CCDS74 ---QWIAE-PTKEPIVDEDDDVAEERQRIITGGNKTDI---LRLHELTKIYPGTSSP--A
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pF1KSD VDRLSLAVQKGECFGLLGFNGAGKTTTFKMLTGEESLTSGDAFVGGHRISSDVGKVRQRI
       :::: ..:. :::::::: ::::::::::::::. ..::::: :.:. : .....:.: .
CCDS74 VDRLCVGVRPGECFGLLGVNGAGKTTTFKMLTGDTTVTSGDATVAGKSILTNISEVHQNM
         1960      1970      1980      1990      2000      2010    

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pF1KSD GYCPQFDALLDHMTGREMLVMYARLRGIPERHIGACVENTLRGLLLEPHANKLVRTYSGG
       ::::::::. . .:::: : .::::::.: ..:   .. ....: :  .:. :. :::::
CCDS74 GYCPQFDAIDELLTGREHLYLYARLRGVPAEEIEKVANWSIKSLGLTVYADCLAGTYSGG
         2020      2030      2040      2050      2060      2070    

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pF1KSD NKRKLSTGIALIGEPAVIFLDEPSTGMDPVARRLLWDTVARARESGKAIIITSHSMEECE
       :::::::.::::: : ...::::.::::: :::.::....   . :.:...:::::::::
CCDS74 NKRKLSTAIALIGCPPLVLLDEPTTGMDPQARRMLWNVIVSIIREGRAVVLTSHSMEECE
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CCDS74 ALCTRLAIMVKGAFRCMGTIQHLKSKFGDGYIVTMKIKSPKDDLLPDLNPVEQFFQGNFP
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CCDS74 GSVQRERHYNMLQFQVSSSSL--ARIFQLLLSHKDSLLIEEYSVTQTTLDQVFVNFAKQQ
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     1640                   
pF1KSD PPTAEEGR             
                            
CCDS74 TESHDLPLHPRAAGASRQAQD
           2260      2270   

>>CCDS12055.1 ABCA7 gene_id:10347|Hs108|chr19             (2146 aa)
 initn: 2793 init1: 854 opt: 1093  Z-score: 1299.3  bits: 253.7 E(32554): 4.7e-66
Smith-Waterman score: 2894; 35.5% identity (59.7% similar) in 1687 aa overlap (188-1638:483-2104)

       160       170       180       190        200       210      
pF1KSD YTRRNYMWTQTGSFFLKETEGWHTTSLFPLFPNPGPR-EPTSPDGGEPGYIREGFLAVQH
                                     : .:::  .: .    .  :.  ::. .: 
CCDS12 PTPDLGPGHVRIKIRMDIDVVTRTNKIRDRFWDPGPAADPLT----DLRYVWGGFVYLQD
            460       470       480       490           500        

        220       230       240       250       260       270      
pF1KSD AVDRAIMEYHADAATRQLFQRLTVTIKRFPYPPFIADPFLVAIQYQLPLLLLLSFTYTAL
        :.:: ..  . :  :       . ....::: .. : :: ... .:::.: :.. :.. 
CCDS12 LVERAAVRVLSGANPRA-----GLYLQQMPYPCYVDDVFLRVLSRSLPLFLTLAWIYSVT
      510       520            530       540       550       560   

        280       290       300       310       320       330      
pF1KSD TIARAVVQEKERRLKEYMRMMGLSSWLHWSAWFLLFFLFLLIAASFMTLLFCVKVKPNVA
         ..:::.::: ::.. :: ::::  . : .:::  .  .:..:....:..  :.     
CCDS12 LTVKAVVREKETRLRDTMRAMGLSRAVLWLGWFLSCLGPFLLSAALLVLVL--KLGD---
           570       580       590       600       610             

        340       350       360       370                          
pF1KSD VLSRSDPSLVLAFLLCFAISTISFSFMVSTFFSK--------GMG-----------IQWR
       .:  : :..:. ::  ::..:.. ::..:.:::.        :..           . ::
CCDS12 ILPYSHPGVVFLFLAAFAVATVTQSFLLSAFFSRANLAAACGGLAYFSLYLPYVLCVAWR
      620       630       640       650       660       670        

                  380                                  390         
pF1KSD D-----------LLSPV----------------------NVD-----DDFCFGQVLGMLL
       :           :::::                      ::      : : ..:: :.::
CCDS12 DRLPAGGRVAASLLSPVAFGFGCESLALLEEQGEGAQWHNVGTRPTADVFSLAQVSGLLL
      680       690       700       710       720       730        

     400       410       420       430        440       450        
pF1KSD LDSVLYGLVTWYMEAVFPGQFGVPQPWYFFIMPSYWCG-KPRAVAGKEEEDSDPEKALRN
       ::..::::.:::.::: :::.:.:.:: : .  ::::: .:    .      :: :.:  
CCDS12 LDAALYGLATWYLEAVCPGQYGIPEPWNFPFRRSYWCGPRPPKSPAPCPTPLDP-KVL--
      740       750       760       770       780       790        

      460       470       480       490       500       510        
pF1KSD EYFEAEPEDLVAGIKIKHLSKVFRVGNKDRAAVRDLNLNLYEGQITVLLGHNGAGKTTTL
          :  :  :  :.... : :  :  .. . :.: :.:..:.:.::..::::::::::::
CCDS12 --VEEAPPGLSPGVSVRSLEK--RFPGSPQPALRGLSLDFYQGHITAFLGHNGAGKTTTL
           800       810         820       830       840       850 

      520       530       540       550       560       570        
pF1KSD SMLTGLFPPTSGRAYISGYEISQDMVQIRKSLGLCPQHDILFDNLTVAEHLYFYAQLKGL
       :.:.:::::..: :.: :... ..:. ::  ::.:::...::: ::: ::..::..::::
CCDS12 SILSGLFPPSGGSAFILGHDVRSSMAAIRPHLGVCPQYNVLFDMLTVDEHVWFYGRLKGL
             860       870       880       890       900       910 

      580       590       600       610       620       630        
pF1KSD SRQKCPEEVKQMLHIIGLEDKWNSRSRFLSGGMRRKLSIGIALIAGSKVLILDEPTSGMD
       :      :  ..:. .:: .: . ..: :::::.::::..::...::.:.::::::.:.:
CCDS12 SAAVVGPEQDRLLQDVGLVSKQSVQTRHLSGGMQRKLSVAIAFVGGSQVVILDEPTAGVD
             920       930       940       950       960       970 

      640       650       660       670       680       690        
pF1KSD AISRRAIWDLLQRQKSDRTIVLTTHFMDEADLLGDRIAIMAKGELQCCGSSLFLKQKYGA
         :::.::.:: . .  ::..:.:: .:::.:::::.:..: :.: :::: :::... :.
CCDS12 PASRRGIWELLLKYREGRTLILSTHHLDEAELLGDRVAVVAGGRLCCCGSPLFLRRHLGS
             980       990      1000      1010      1020      1030 

      700         710                                   720        
pF1KSD GYHMTLVKE--PHCNPE----------DISQ------------------LVHHHVPNATL
       ::..::::   :  . :          :  :                  ::.: ::.: :
CCDS12 GYYLTLVKARLPLTTNEKADTDMEGSVDTRQEKKNGSQGSRVGTPQLLALVQHWVPGARL
            1040      1050      1060      1070      1080      1090 

      730       740         750       760       770       780      
pF1KSD ESSAGAELSFILPRESTH--RFEGLFAKLEKKQKELGIASFGASITTMEEVFLRVGKLVD
             :: ..::  ..:   :  :: .:. .  :: ....: : :..::.::.: .   
CCDS12 VEELPHELVLVLPYTGAHDGSFATLFRELDTRLAELRLTGYGISDTSLEEIFLKVVEECA
            1100      1110      1120      1130      1140      1150 

        790       800       810       820              830         
pF1KSD SSMDIQAIQLPALQYQHERRASDWAVDSNLCGAMDPSDGI-------GALIEEER----T
       .. :..     .   ::   .   ..: .:   : :..         :.  : ..     
CCDS12 ADTDME----DGSCGQHLCTGIA-GLDVTLRLKMPPQETALENGEPAGSAPETDQGSGPD
                1160      1170       1180      1190      1200      

         840       850       860       870       880       890     
pF1KSD AVKLNTGLALHCQQFWAMFLKKAAYSWREWKMVAAQVLVPLTCVTLALLAINYSSELFDD
       ::    : ::  ::. :..::.   . :  . . ::...:   : :::.       .   
CCDS12 AVGRVQGWALTRQQLQALLLKRFLLARRSRRGLFAQIVLPALFVGLALVFSLIVPPFGHY
       1210      1220      1230      1240      1250      1260      

         900       910            920                              
pF1KSD PMLRLTLGEYGRTVVPFSV-----PGTSQLGQQL-------------SEH----------
       : :::.   ::  :  ::      :: ..: . :             : :          
CCDS12 PALRLSPTMYGAQVSFFSEDAPGDPGRARLLEALLQEAGLEEPPVQHSSHRFSAPEVPAE
       1270      1280      1290      1300      1310      1320      

                                    930         940                
pF1KSD -----------------------------LKDALQAEG--QEPREVLG-----------D
                                    : :   : :    :. : :           .
CCDS12 VAKVLASGNWTPESPSPACQCSRPGARRLLPDCPAAAGGPPPPQAVTGSGEVVQNLTGRN
       1330      1340      1350      1360      1370      1380      

         950                      960                              
pF1KSD LEEFLI---------------FRASVEGGGFN----------------------------
       : .::.               .   :. :::.                            
CCDS12 LSDFLVKTYPRLVRQGLKTKKWVNEVRYGGFSLGGRDPGLPSGQELGRSVEELWALLSPL
       1390      1400      1410      1420      1430      1440      

                   970       980       990      1000        1010   
pF1KSD -----ERCL--VAASFRDVGERTVVNALFNNQAYHSPATALAVVDNLLFK--LLCGP--H
            .: :  ..:  ...  .  ..  :::...:: .. .  ..: ...  :  ::  :
CCDS12 PGGALDRVLKNLTAWAHSLDAQDSLKIWFNNKGWHSMVAFVNRASNAILRAHLPPGPARH
       1450      1460      1470      1480      1490      1500      

             1020      1030         1040        1050      1060     
pF1KSD A-SIVVSNFPQPRSALQAAKDQFNEGR---KGFDIALNL--LFAMAFLASTFSILAVSER
       : ::.. : :     :. .:.:..::    .. :. ...  .:::.:. ..:... . ::
CCDS12 AHSITTLNHP-----LNLTKEQLSEGALMASSVDVLVSICVVFAMSFVPASFTLVLIEER
       1510           1520      1530      1540      1550      1560 

        1070      1080      1090      1100      1110      1120     
pF1KSD AVQAKHVQFVSGVHVASFWLSALLWDLISFLIPSLLLLVVFKAFDVRAFTRDGHMADTLL
       ...:::.:...:.  . .::. .:::. ..:.:. .....: ::. ::..  ...   ::
CCDS12 VTRAKHLQLMGGLSPTLYWLGNFLWDMCNYLVPACIVVLIFLAFQQRAYVAPANLPALLL
            1570      1580      1590      1600      1610      1620 

        1130      1140      1150      1160      1170       1180    
pF1KSD LLLLYGWAIIPLMYLMNFFFLGAATAYTRLTIFNILSGIATFLMVTIMRIPA-VKLEELS
       :::::::.: ::::  .:::   .:::. :: .:.. ::   . . .... .  ::.:.:
CCDS12 LLLLYGWSITPLMYPASFFFSVPSTAYVVLTCINLFIGINGSMATFVLELFSDQKLQEVS
            1630      1640      1650      1660      1670      1680 

         1190      1200      1210      1220      1230      1240    
pF1KSD KTLDHVFLVLPNHCLGMAVSSFYENYETRRYCTSSEVAAHYCKKYNIQYQENFYAWSAPG
       . : .:::..:. ::: .. .. .:         . .:  . .  . :.:  .  : .  
CCDS12 RILKQVFLIFPHFCLGRGLIDMVRN---------QAMADAFERLGDRQFQSPLR-WEV--
            1690      1700               1710      1720            

         1250      1260      1270      1280      1290       1300   
pF1KSD VGRFVASMAASGCAYLILLFLIETNLLQRLRGILCALRRRRTLTELYTRMPVL-PEDQDV
       ::. . .:. .:      :::. : :::. :. :    : :.:       :.:  ::.::
CCDS12 VGKNLLAMVIQGP-----LFLLFTLLLQH-RSQLLPQPRVRSL-------PLLGEEDEDV
    1730      1740           1750       1760             1770      

          1310      1320      1330       1340      1350      1360  
pF1KSD ADERTRILAPSPDSLLHTPLIIKELSKVYE-QRVPLLAVDRLSLAVQKGECFGLLGFNGA
       : :: :..  . .. .   :....:.:::. ::.:  ::::: :..  :::::::: :::
CCDS12 ARERERVVQGATQGDV---LVLRNLTKVYRGQRMP--AVDRLCLGIPPGECFGLLGVNGA
       1780      1790         1800        1810      1820      1830 

           1370      1380      1390      1400      1410      1420  
pF1KSD GKTTTFKMLTGEESLTSGDAFVGGHRISSDVGKVRQRIGYCPQFDALLDHMTGREMLVMY
       :::.::.:.::.   . :.: ..:: .. . . ..  .::::: ::... .:::: : . 
CCDS12 GKTSTFRMVTGDTLASRGEAVLAGHSVAREPSAAHLSMGYCPQSDAIFELLTGREHLELL
            1840      1850      1860      1870      1880      1890 

           1430      1440      1450      1460      1470      1480  
pF1KSD ARLRGIPERHIGACVENTLRGLLLEPHANKLVRTYSGGNKRKLSTGIALIGEPAVIFLDE
       :::::.:: ...  . . :  : :  .:.. . ::::::::::.:..::.:.:::.::::
CCDS12 ARLRGVPEAQVAQTAGSGLARLGLSWYADRPAGTYSGGNKRKLATALALVGDPAVVFLDE
            1900      1910      1920      1930      1940      1950 

           1490      1500      1510      1520      1530      1540  
pF1KSD PSTGMDPVARRLLWDTVARARESGKAIIITSHSMEECEALCTRLAIMVQGQFKCLGSPQH
       :.::::: :::.::...  . . :.....::::::::::::.::::::.:.:.:::::::
CCDS12 PTTGMDPSARRFLWNSLLAVVREGRSVMLTSHSMEECEALCSRLAIMVNGRFRCLGSPQH
            1960      1970      1980      1990      2000      2010 

           1550      1560      1570      1580      1590       1600 
pF1KSD LKSKFGSGYSLRAKVQSEGQQEALEEFKAFVDLTFPGSVLEDEHQGMVHYHLP-GRDLSW
       ::..:..:..:  .: .  .: :     :::   :::. :.. : : ....:: :   . 
CCDS12 LKGRFAAGHTLTLRVPAARSQPA----AAFVAAEFPGAELREAHGGRLRFQLPPGGRCAL
            2020      2030          2040      2050      2060       

            1610      1620      1630      1640                     
pF1KSD AKVFGILEKAKEKYGVDDYSVSQISLEQVFLSFAHLQPPTAEEGR               
       :.::: :     ..::.:.::::  ::.::: :.. :                       
CCDS12 ARVFGELAVHGAEHGVEDFSVSQTMLEEVFLYFSKDQGKDEDTEEQKEAGVGVDPAPGLQ
      2070      2080      2090      2100      2110      2120       

CCDS12 HPKRVSQFLDDPSTAETVL
      2130      2140      

>>CCDS11685.1 ABCA5 gene_id:23461|Hs108|chr17             (1642 aa)
 initn: 1363 init1: 668 opt: 1063  Z-score: 1265.0  bits: 247.0 E(32554): 3.9e-64
Smith-Waterman score: 1916; 26.9% identity (57.5% similar) in 1730 aa overlap (1-1638:8-1616)

                      10        20        30        40        50   
pF1KSD        MAVLRQLALLLWKNYTLQKRKVLVTVLELFLPLLFSGILIWLRLKIQSENVPN
              ..: ::   :: ::: .. :    .: :...::.:   :.:: :         
CCDS11 MSTAIREVGVWRQTRTLLLKNYLIKCRTKKSSVQEILFPLFF---LFWLILI--------
               10        20        30        40                    

            60        70        80        90       100       110   
pF1KSD ATIYPGQSIQELPLFFTFPPPGDTWELAYIPSHSDAAKTVTETVRRALVINMRVRGFPSE
       . ..:... .:.: .     : : . :. .      . ..: .. . .  .     .:. 
CCDS11 SMMHPNKKYEEVPNIEL--NPMDKFTLSNLILGYTPVTNITSSIMQKVSTDH----LPDV
      50        60          70        80        90           100   

           120       130       140       150       160       170   
pF1KSD KDFEDYIRYDNCSSSVLAAVVFEHPFNHSKEPLPLAVKYHLRFSYTRRNYMWTQTGSFFL
          :.:    .  .: :.     .: :     .  ...:.:::           ..:...
CCDS11 IITEEYTNEKEMLTSSLS-----KPSNFVGVVFKDSMSYELRFFPD-----MIPVSSIYM
           110       120            130       140            150   

           180       190       200       210       220       230   
pF1KSD KETEGWHTTSLFPLFPNPGPREPTSPDGGEPGYIREGFLAVQHAVDRAIMEYHADAAT-R
           :                   : .     :   :: ..: ..: ::.. .....  .
CCDS11 DSRAG------------------CSKSCEAAQYWSSGFTVLQASIDAAIIQLKTNVSLWK
                             160       170       180       190     

            240       250       260       270       280       290  
pF1KSD QLFQRLTVTIKRFPYPPFIADPFLVAIQYQLPLLLLLSFTYTALTIARAVVQEKERRLKE
       .: .  .: . .     . . :  : . :     :...:.  .  .:  .: :::...::
CCDS11 ELESTKAVIMGETAVVEIDTFPRGVILIY-----LVIAFSPFGYFLAIHIVAEKEKKIKE
         200       210       220            230       240       250

            300       310       320       330       340       350  
pF1KSD YMRMMGLSSWLHWSAWFLLFFLFLLIAASFMTLLFCVKVKPNVAVLSRSDPSLVLAFLLC
       ....::: .   : .: ::.  ....    :.::. : .  ..   . :.  . : :.: 
CCDS11 FLKIMGLHDTAFWLSWVLLYTSLIFL----MSLLMAVIATASLLFPQSSSIVIFLLFFL-
              260       270           280       290       300      

            360         370                                 380    
pF1KSD FAISTISFSFMVSTFF--SKGMGIQ--------------------------WRDLLSP--
       ...:.. :..:.. .:  :: .::                           :  :.::  
CCDS11 YGLSSVFFALMLTPLFKKSKHVGIVEFFVTVAFGFIGLMIILIESFPKSLVW--LFSPFC
         310       320       330       340       350         360   

                      390                     400       410        
pF1KSD -----VNVD-----DDFCFGQVLG--------------MLLLDSVLYGLVTWYMEAVFPG
            ...      .::  :  ..              :: :.:..: :.. :.. :.::
CCDS11 HCTFVIGIAQVMHLEDFNEGASFSNLTAGPYPLIITIIMLTLNSIFYVLLAVYLDQVIPG
           370       380       390       400       410       420   

      420       430       440       450       460       470        
pF1KSD QFGVPQPWYFFIMPSYWCGKPRAVAGKEEEDSDPEKALRNEYFEAEPEDLVA--GIKIKH
       .::. .   .:. ::::  . :      : . . . .. .: .:    ..:.  .:.:. 
CCDS11 EFGLRRSSLYFLKPSYWSKSKRNYEELSEGNVNGNISF-SEIIEPVSSEFVGKEAIRISG
           430       440       450       460        470       480  

        480       490       500       510       520       530      
pF1KSD LSKVFRVGNKDRAAVRDLNLNLYEGQITVLLGHNGAGKTTTLSMLTGLFPPTSGRAYISG
       ..:..:  ...  :.:.:....::::::.::::.:.::.: ...: :: ::..: : : :
CCDS11 IQKTYRKKGENVEALRNLSFDIYEGQITALLGHSGTGKSTLMNILCGLCPPSDGFASIYG
            490       500       510       520       530       540  

        540         550       560       570       580       590    
pF1KSD YEISQ--DMVQIRKSLGLCPQHDILFDNLTVAEHLYFYAQLKGLSRQKCPEEVKQMLHII
       ...:.  .: . :: .:.::: :: :: ::: :.: . :..::.  ..  .::...:  .
CCDS11 HRVSEIDEMFEARKMIGICPQLDIHFDVLTVEENLSILASIKGIPANNIIQEVQKVLLDL
            550       560       570       580       590       600  

          600       610       620       630       640       650    
pF1KSD GLEDKWNSRSRFLSGGMRRKLSIGIALIAGSKVLILDEPTSGMDAISRRAIWDLLQRQKS
        ..   ..... ::::..::::.:::.... :.:.:::::.:::  ::. .:.::. .:.
CCDS11 DMQTIKDNQAKKLSGGQKRKLSLGIAVLGNPKILLLDEPTAGMDPCSRHIVWNLLKYRKA
            610       620       630       640       650       660  

          660       670       680       690       700       710    
pF1KSD DRTIVLTTHFMDEADLLGDRIAIMAKGELQCCGSSLFLKQKYGAGYHMTLVKEPHCNPED
       .:. :..::::::::.:.:: :....: :.: :::.:::.:.: ::....  . .:  :.
CCDS11 NRVTVFSTHFMDEADILADRKAVISQGMLKCVGSSMFLKSKWGIGYRLSMYIDKYCATES
            670       680       690       700       710       720  

          720       730       740       750       760       770    
pF1KSD ISQLVHHHVPNATLESSAGAELSFILPRESTHRFEGLFAKLEKKQKELGIASFGASITTM
       .:.::..:.:.::: ..   .: . :: ..  .: :::. :.. ...::. :.:.:.::.
CCDS11 LSSLVKQHIPGATLLQQNDQQLVYSLPFKDMDKFSGLFSALDS-HSNLGVISYGVSMTTL
            730       740       750       760        770       780 

          780       790       800       810       820       830    
pF1KSD EEVFLRVGKLVDSSMDIQAIQLPALQYQHERRASDWAVDSNLCGAMDPSDGIGALIEEER
       :.:::..   :.. .:    .. . :  .:.      .::.    :. :     ::  : 
CCDS11 EDVFLKL--EVEAEIDQADYSVFTQQPLEEE------MDSKSFDEMEQS----LLILSET
               790       800       810             820             

          840       850       860       870       880       890    
pF1KSD TAVKLNTGLALHCQQFWAMFLKKAAYSWREWKMVAAQVLVPLTCVTLALLAINYSSELFD
        :. ..: ..:  ::....    : . .   :  . .:       .: :: : .. ..: 
CCDS11 KAALVST-MSLWKQQMYTI----AKFHFFTLKRESKSVRS-----VLLLLLIFFTVQIF-
     830        840           850       860            870         

          900       910        920        930       940       950  
pF1KSD DPMLRLTLGEYGRTVVPFS-VPGTSQLGQQLSEH-LKDALQAEGQEPREVLGDLEEFL--
          . :.   .  .:::.. ::    :    . :  : .:  ...   .. .::  :.  
CCDS11 ---MFLVHHSFKNAVVPIKLVPDLYFLKPGDKPHKYKTSLLLQNSADSDI-SDLISFFTS
         880       890       900       910       920        930    

                960       970        980        990      1000      
pF1KSD --IFRASVEGGGFNERCLVAASFRDV-GERTVV-NALFNNQAYHSPATALAVVDNL-LFK
         :. . .. . .      .:..  . .:.  :  :.::.   .:    . ...:  :..
CCDS11 QNIMVTMINDSDYVSVAPHSAALNVMHSEKDYVFAAVFNSTMVYSLPILVNIISNYYLYH
          940       950       960       970       980       990    

        1010      1020      1030      1040      1050      1060     
pF1KSD LLCGPHASIVVSNFPQPRSALQAAKDQFNEGRKGFDIALNLLFAMAFLASTFSILAVSER
       :      .:  . :      .:   :   . .  :. :: : . .. .   :..  . ..
CCDS11 LNVTETIQIWSTPF------FQEITDIVFKIELYFQAAL-LGIIVTAMPPYFAMENAENH
         1000            1010      1020       1030      1040       

        1070      1080      1090      1100      1110      1120     
pF1KSD AVQAKHVQFVSGVHVASFWLSALLWDLISFLIPSLLLLVVFKAFDVRAFTRDGHMADTLL
        ..:     .::.  ...:..  . :.  :.:  .:.:  . ::    .    ..  ...
CCDS11 KIKAYTQLKLSGLLPSAYWIGQAVVDIPLFFIILILMLGSLLAFHYGLYFYTVKFLAVVF
      1050      1060      1070      1080      1090      1100       

        1130      1140      1150      1160      1170      1180     
pF1KSD LLLLYGWAIIPLMYLMNFFFLGAATAYTRLTIFNILSGIATFLMVTIMRIPAVKLEELSK
        :. :  ..: . :. .: :       .   ..... ..:..  ..: .:       .. 
CCDS11 CLIGYVPSVILFTYIASFTF---KKILNTKEFWSFIYSVAALACIAITEITFFMGYTIAT
      1110      1120         1130      1140      1150      1160    

        1190       1200      1210      1220      1230      1240    
pF1KSD TLDHVF-LVLPNHCLGMAVSSFYENYETRRYCTSSEVAAHYCKKYNIQYQENFYAWSAPG
        : ..: ...: . :   . :: .            .. .  .: :.   ...  :.   
CCDS11 ILHYAFCIIIPIYPLLGCLISFIK------------ISWKNVRK-NV---DTYNPWD---
         1170      1180                  1190          1200        

         1250      1260      1270      1280      1290              
pF1KSD VGRFVASMAASGCAYLILLFLIETNLLQRLRGILCALRRRRTLTELYTR-----MPVLP-
         :. ... .     .. .::..    ..  :   ..:.   . .: :.     .:  : 
CCDS11 --RLSVAVISPYLQCVLWIFLLQ--YYEKKYGGR-SIRKDPFFRNLSTKSKNRKLPEPPD
          1210      1220        1230       1240      1250      1260

        1300      1310        1320      1330              1340     
pF1KSD ---EDQDVADERTRI--LAPSPDSLLHTPLIIKELSKVYE--------QRVPLLAVDRLS
          ::.::  :: ..  :        .  .....: : :.        ..:  .:.  .:
CCDS11 NEDEDEDVKAERLKVKELMGCQCCEEKPSIMVSNLHKEYDDKKDFLLSRKVKKVATKYIS
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

        1350      1360      1370      1380        1390      1400   
pF1KSD LAVQKGECFGLLGFNGAGKTTTFKMLTGEESLTSGDAFVGGH--RISSDVGKVRQRIGYC
       . :.::: .:::: :::::.: ...:.:.   :::..:.: .  . : :  ...  .:::
CCDS11 FCVKKGEILGLLGPNGAGKSTIINILVGDIEPTSGQVFLGDYSSETSEDDDSLKC-MGYC
             1330      1340      1350      1360      1370          

          1410      1420      1430      1440      1450      1460   
pF1KSD PQFDALLDHMTGREMLVMYARLRGIPERHIGACVENTLRGLLLEPHANKLVRTYSGGNKR
       ::.. :    : .: . .:. ..:.    .   .    ..: :. : .: :.   .: ::
CCDS11 PQINPLWPDTTLQEHFEIYGAVKGMSASDMKEVISRITHALDLKEHLQKTVKKLPAGIKR
    1380      1390      1400      1410      1420      1430         

          1470      1480      1490      1500       1510      1520  
pF1KSD KLSTGIALIGEPAVIFLDEPSTGMDPVARRLLWDTVARA-RESGKAIIITSHSMEECEAL
       ::  .....:.: . .:::::::::: :.. .: ..  : ..  .: :.:.: ::: ::.
CCDS11 KLCFALSMLGNPQITLLDEPSTGMDPKAKQHMWRAIRTAFKNRKRAAILTTHYMEEAEAV
    1440      1450      1460      1470      1480      1490         

           1530      1540      1550      1560      1570      1580  
pF1KSD CTRLAIMVQGQFKCLGSPQHLKSKFGSGYSLRAKVQSEGQQEALEEFKAFVDLTFPGSVL
       : :.::::.::..:.:. ::::::::.:: :. :...  ..  .....  ..  ::..  
CCDS11 CDRVAIMVSGQLRCIGTVQHLKSKFGKGYFLEIKLKDWIENLEVDRLQREIQYIFPNASR
    1500      1510      1520      1530      1540      1550         

           1590       1600      1610      1620      1630      1640 
pF1KSD EDEHQGMVHYHLPGRDL-SWAKVFGILEKAKEKYGVDDYSVSQISLEQVFLSFAHLQPPT
       ..  .... :..: .:. : .. :  ::.::. .....:: :: .:::::. ... :   
CCDS11 QESFSSILAYKIPKEDVQSLSQSFFKLEEAKHAFAIEEYSFSQATLEQVFVELTKEQEEE
    1560      1570      1580      1590      1600      1610         

                              
pF1KSD AEEGR                  
                              
CCDS11 DNSCGTLNSTLWWERTQEDRVVF
    1620      1630      1640  

>>CCDS74138.1 ABCA8 gene_id:10351|Hs108|chr17             (1616 aa)
 initn: 1424 init1: 639 opt: 1033  Z-score: 1229.0  bits: 240.3 E(32554): 3.9e-62
Smith-Waterman score: 1825; 29.0% identity (59.9% similar) in 1530 aa overlap (206-1638:172-1593)

         180       190       200       210       220       230     
pF1KSD TEGWHTTSLFPLFPNPGPREPTSPDGGEPGYIREGFLAVQHAVDRAIMEYHADAATRQLF
                                     . .:::.:.: :.. ::.:  .. .. .  
CCDS74 GHGMPAKKEHKDHTAHCYETNEDVYCEVSVFWKEGFVALQAAINAAIIEITTNHSVME--
             150       160       170       180       190           

         240       250       260       270       280       290     
pF1KSD QRLTVTIKRFPYPPFIADPFLVAIQYQLPLLLLLSFTYTALTIARAVVQEKERRLKEYMR
       . ..:: : . .  ::..  ...  : .  .  .::. . .  : . : ....:.:  : 
CCDS74 ELMSVTGKNMKMHSFIGQSGVITDLYLFSCI--ISFS-SFIYYASVNVTRERKRMKALMT
     200       210       220       230          240       250      

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pF1KSD MMGLSSWLHWSAWFLLFFLFLLIAASFMTLLFCVKVKPNVAVLSRSDPSLVLAFLLCFAI
       :::: .   : .: ::.  :..: : :..:   :  . .  .::     .:....: ...
CCDS74 MMGLRDSAFWLSWGLLYAGFIFIMALFLAL---VIRSTQFIILS--GFMVVFSLFLLYGL
        260       270       280          290         300       310 

         360       370                                   380       
pF1KSD STISFSFMVSTFFSK----GM-----------------------GIQW-RDLLSP-----
       : ....:..: . .:    :.                       ...:  .::::     
CCDS74 SLVALAFLMSILVKKSFLTGLVVFLLTVFWGCLGFTSLYRHLPASLEWILSLLSPFAFML
             320       330       340       350       360       370 

                    390                 400       410       420    
pF1KSD -----VNVDDDF---CF-----GQVLG-----MLLLDSVLYGLVTWYMEAVFPGQFGVPQ
            ...: :.    :     :. :      :: .:. ::  .. :.: ..:...:  .
CCDS74 GMAQLLHLDYDLNSNAFPHPSDGSNLIVATNFMLAFDTCLYLALAIYFEKILPNEYGHRR
             380       390       400       410       420       430 

          430       440         450       460        470       480 
pF1KSD PWYFFIMPSYWCGKPRA--VAGKEEEDSDPEKALRNEYFEAEPE-DLVAGIKIKHLSKVF
       :  ::.  :.:    ..  :: ..: :.::  .... . .: :: .   .:.:....: .
CCDS74 PPLFFLKSSFWSQTQKTDHVALEDEMDADP--SFHDSFEQAPPEFQGKEAIRIRNVTKEY
             440       450       460         470       480         

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pF1KSD RVGNKDRA-AVRDLNLNLYEGQITVLLGHNGAGKTTTLSMLTGLFPPTSGRAYISGYEIS
       . :. :.  :..:: ...::::::..:::.::::.: :..:.::  ::.: . : . ..:
CCDS74 K-GKPDKIEALKDLVFDIYEGQITAILGHSGAGKSTLLNILSGLSVPTKGSVTIYNNKLS
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pF1KSD Q--DMVQIRKSLGLCPQHDILFDNLTVAEHLYFYAQLKGLSRQKCPEEVKQMLHIIGLED
       .  :. .. :  :.::: .. :: ::: :.: ..:..::.  :.  .:....:  . ...
CCDS74 EMADLENLSKLTGVCPQSNVQFDFLTVRENLRLFAKIKGILPQEVDKEIQRVLLELEMKN
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pF1KSD KWNSRSRFLSGGMRRKLSIGIALIAGSKVLILDEPTSGMDAISRRAIWDLLQRQKSDRTI
         .  .. ::::..:::..:::...  ....:::::.:.: .::. .:.::...:.::.:
CCDS74 IQDVLAQNLSGGQKRKLTFGIAILGDPQIFLLDEPTAGLDPFSRHQVWNLLKERKTDRVI
      610       620       630       640       650       660        

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pF1KSD VLTTHFMDEADLLGDRIAIMAKGELQCCGSSLFLKQKYGAGYHMTLVKEPHCNPEDISQL
       ...:.::::::.:.:: .....:.:.: :::::::.:.: :::..:  .  :  :.:..:
CCDS74 LFSTQFMDEADILADRKVFLSQGKLKCAGSSLFLKKKWGIGYHLSLQLNEICVEENITSL
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pF1KSD VHHHVPNATLESSAGAELSFILPRESTHRFEGLFAKLEKKQKELGIASFGASITTMEEVF
       :..:.:.: : ... ..: . :: : :..:  :.  :..   .::: ..:.:.::..:::
CCDS74 VKQHIPDAKLSAKSEGKLIYTLPLERTNKFPELYKDLDS-YPDLGIENYGVSMTTLNEVF
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pF1KSD LRV-GKLVDSSMDIQAIQLPALQYQHERRASDWAVDSNLCGAMDPSDGIGALIEEERTAV
       :.. :: . .  ::  .     . : :.     : :..    :.    . . ... : ..
CCDS74 LKLEGKSTINESDIAILG----EVQAEK-----ADDTERLVEMEQ---VLSSLNKMRKTI
       790       800           810            820          830     

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pF1KSD KLNTGLALHCQQFWAMFLKKAAYSWREWKMVAAQVLVPLTCVTLALLAINYSSELFDDPM
           :.::  ::. :.   .     .: : . : .:.        :.: ..   : .  :
CCDS74 G---GVALWRQQICAIARVRLLKLKHERKALLALLLI--------LMA-GFCPLLVEYTM
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pF1KSD LRLTLGEYGRTVVPFSVPGTSQLGQQLSEHLKDALQAEGQEPREVLGDLEEFLIFRASVE
       ...  . :                 .:: ::   . : ::.:.. : .:  ..: .... 
CCDS74 VKIYQNSYT---------------WELSPHLY--FLAPGQQPHDPLTQL--LIINKTGAS
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pF1KSD GGGFN---ERCLVAASFRDVGERTVVNALFNNQAYHSPATALAVVDNLLFKLLCG-----
          :    :.  .:      : :. ..    . .:..  :.     :  :.: :.     
CCDS74 IDDFIQSVEHQNIALEVDAFGTRNGTD----DPSYNGAITVCCNEKNYSFSLACNAKRLN
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pF1KSD --PHASIVVSN----FPQPRSALQAAKDQFNEGRKGFDIAL--NLLFAMAFLASTFSILA
         :    .:::    . .:   ... .. : :. .   :..   ..: ... .:    .:
CCDS74 CFPVLMDIVSNGLLGMVKPSVHIRTERSTFLENGQDNPIGFLAYIMFWLVLTSSCPPYIA
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pF1KSD VS---ERAVQAKHVQFVSGVHVASFWLSALLWDL-ISFLIPSLLLLVVF-KAFDVRAFTR
       .:   .   .:.    .::.  ...:..  : :. . ::.  .. :. . . :.   .: 
CCDS74 MSSIDDYKNRARSQLRISGLSPSAYWFGQALVDVSLYFLVFVFIYLMSYISNFEDMLLTI
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pF1KSD DGHMADTLLLLLLYGWAIIPLMYLMNFFFLGAATAYTRLTIFNILSGIATF--LMVTIMR
         :. . .   . :....: . :...:.:        :    :  ::: .:   .::.. 
CCDS74 I-HIIQ-IPCAVGYSFSLIFMTYVISFIF--------RKGRKN--SGIWSFCFYVVTVFS
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pF1KSD IP--AVKLEELSKTLDHVFLVLPNHCLGMAVSSFYENYETRRYCTSSEVAAHYCKKYNIQ
       .   : .. : .  .  .::. :   .:    : .  . .      ::      .....:
CCDS74 VAGFAFSIFESDIPFIFTFLIPPATMIGCLFLSSHLLFSS----LFSE------ERMDVQ
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pF1KSD YQENFYAWSAPGVGRFVASMAASGCAYLILLFLIETNLLQRLRGILCALRRRRTLTELYT
           : ..  : . .:.         .:. :  .: .. ..      ..:.   ..    
CCDS74 ---PFLVFLIPFL-HFI--------IFLFTLRCLEWKFGKK------SMRKDPFFSSDVC
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pF1KSD RMPVLPE--DQDVADERTRIL-APSPDSLLHTPLIIKE-LSKVYE--------QRVPLLA
       . :  ::  :.::  ::.:   : .  .. . :.::   : : :         .:   .:
CCDS74 QNPEEPEGEDEDVQMERVRTANALNSTNFDEKPVIIASCLRKEYAGKRKGCFSKRKNKIA
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pF1KSD VDRLSLAVQKGECFGLLGFNGAGKTTTFKMLTGEESLTSGDAFVGGHRISSDVGKVRQRI
       .  .:. :.::: .:::: :::::.:..:..::. . :.:.... :    :  : . . .
CCDS74 TRNVSFCVRKGEVLGLLGHNGAGKSTSIKVITGDTKPTAGQVLLKG----SGGGDALEFL
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pF1KSD GYCPQFDALLDHMTGREMLVMYARLRGIPERHIGACVENTLRGLLLEPHANKLVRTYSGG
       ::::: .::  ..: :. : .:: ..:. .    . .   . .: :. . .. :.: : :
CCDS74 GYCPQENALWPNLTVRQHLEVYAAVKGLRKGDAEVAITRLVDALKLQDQLKSPVKTLSEG
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pF1KSD NKRKLSTGIALIGEPAVIFLDEPSTGMDPVARRLLWDTV-ARARESGKAIIITSHSMEEC
        ::::   ....:.:.:..:::::::::: ... .:... :  :.. .. ..:.: : : 
CCDS74 IKRKLCFVLSILGNPSVVLLDEPSTGMDPEGQQQMWQAIRATFRNTERGALLTTHYMAEA
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pF1KSD EALCTRLAIMVQGQFKCLGSPQHLKSKFGSGYSLRAKVQSEGQQEALEEFKAFVDLTFPG
       ::.: :.::::.:...:.:: ::::::::. : :. ::.. .: : :.   : .   :: 
CCDS74 EAVCDRVAIMVSGRLRCIGSIQHLKSKFGKDYLLEMKVKNLAQVEPLH---AEILRLFPQ
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pF1KSD SVLEDEHQGMVHYHLPGRDLS-WAKVFGILEKAKEKYGVDDYSVSQISLEQVFLSFAHLQ
       .. ........ :.:: .:..  :..:  :::.:... ...::.:: .:::::: ... :
CCDS74 AARQERYSSLMVYKLPVEDVQPLAQAFFKLEKVKQSFDLEEYSLSQSTLEQVFLELSKEQ
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     1640                     
pF1KSD PPTAEEGR               
                              
CCDS74 ELGDFEEDFDPSVKWKLLPQEEP
          1600      1610      

>>CCDS74139.1 ABCA8 gene_id:10351|Hs108|chr17             (1621 aa)
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CCDS74 GHGMPAKKEHKDHTAHCYETNEDVYCEVSVFWKEGFVALQAAINAAIIEITTNHSVME--
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pF1KSD QRLTVTIKRFPYPPFIADPFLVAIQYQLPLLLLLSFTYTALTIARAVVQEKERRLKEYMR
       . ..:: : . .  ::..  ...  : .  .  .::. . .  : . : ....:.:  : 
CCDS74 ELMSVTGKNMKMHSFIGQSGVITDLYLFSCI--ISFS-SFIYYASVNVTRERKRMKALMT
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       :::: .   : .: ::.  :..: : :..:   :  . .  .::     .:....: ...
CCDS74 MMGLRDSAFWLSWGLLYAGFIFIMALFLAL---VIRSTQFIILS--GFMVVFSLFLLYGL
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pF1KSD STISFSFMVSTFFSK----GM-----------------------GIQW-RDLLSP-----
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CCDS74 SLVALAFLMSILVKKSFLTGLVVFLLTVFWGCLGFTSLYRHLPASLEWILSLLSPFAFML
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pF1KSD -----VNVDDDF---CF-----GQVLG-----MLLLDSVLYGLVTWYMEAVFPGQFGVPQ
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CCDS74 GMAQLLHLDYDLNSNAFPHPSDGSNLIVATNFMLAFDTCLYLALAIYFEKILPNEYGHRR
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pF1KSD PWYFFIMPSYWCGKPRA--VAGKEEEDSDPEKALRNEYFEAEPE-DLVAGIKIKHLSKVF
       :  ::.  :.:    ..  :: ..: :.::  .... . .: :: .   .:.:....: .
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pF1KSD RVGNKDRA-AVRDLNLNLYEGQITVLLGHNGAGKTTTLSMLTGLFPPTSGRAYISGYEIS
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CCDS74 K-GKPDKIEALKDLVFDIYEGQITAILGHSGAGKSTLLNILSGLSVPTKGSVTIYNNKLS
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       .  :. .. :  :.::: .. :: ::: :.: ..:..::.  :.  .:....:  . ...
CCDS74 EMADLENLSKLTGVCPQSNVQFDFLTVRENLRLFAKIKGILPQEVDKEIQRVLLELEMKN
      550       560       570       580       590       600        

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pF1KSD KWNSRSRFLSGGMRRKLSIGIALIAGSKVLILDEPTSGMDAISRRAIWDLLQRQKSDRTI
         .  .. ::::..:::..:::...  ....:::::.:.: .::. .:.::...:.::.:
CCDS74 IQDVLAQNLSGGQKRKLTFGIAILGDPQIFLLDEPTAGLDPFSRHQVWNLLKERKTDRVI
      610       620       630       640       650       660        

      660       670       680       690       700       710        
pF1KSD VLTTHFMDEADLLGDRIAIMAKGELQCCGSSLFLKQKYGAGYHMTLVKEPHCNPEDISQL
       ...:.::::::.:.:: .....:.:.: :::::::.:.: :::..:  .  :  :.:..:
CCDS74 LFSTQFMDEADILADRKVFLSQGKLKCAGSSLFLKKKWGIGYHLSLQLNEICVEENITSL
      670       680       690       700       710       720        

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pF1KSD VHHHVPNATLESSAGAELSFILPRESTHRFEGLFAKLEKKQKELGIASFGASITTMEEVF
       :..:.:.: : ... ..: . :: : :..:  :.  :..   .::: ..:.:.::..:::
CCDS74 VKQHIPDAKLSAKSEGKLIYTLPLERTNKFPELYKDLDS-YPDLGIENYGVSMTTLNEVF
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pF1KSD LRV-GKLVDSSMDIQAIQLPALQYQHERRASDWAVDSNLCGAMDPSDGIGALIEEERTAV
       :.. :: . .  ::  .     . : :.     : :..    :.    . . ... : ..
CCDS74 LKLEGKSTINESDIAILG----EVQAEK-----ADDTERLVEMEQ---VLSSLNKMRKTI
       790       800           810            820          830     

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pF1KSD KLNTGLALHCQQFWAMFLKKAAYSWREWKMVAAQVLVPLTCVTLALLAINYSSELFDDPM
           :.::  ::. :.   .     .: : . : .:.        :.: ..   : .  :
CCDS74 G---GVALWRQQICAIARVRLLKLKHERKALLALLLI--------LMA-GFCPLLVEYTM
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pF1KSD LRLTLGEYGRTVVPFSVPGTSQLGQQLSEHLKDALQAEGQEPREVLGDLEEFLIFRASVE
       ...  . :                 .:: ::   . : ::.:.. : .:  ..: .... 
CCDS74 VKIYQNSYT---------------WELSPHLY--FLAPGQQPHDPLTQL--LIINKTGAS
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pF1KSD GGGFN---ERCLVAASFRDVGERTVVNALFNNQAYHSPATALAVVDNLLFKLLCG-----
          :    :.  .:      : :. ..    . .:..  :.     :  :.: :.     
CCDS74 IDDFIQSVEHQNIALEVDAFGTRNGTD----DPSYNGAITVCCNEKNYSFSLACNAKRLN
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pF1KSD --PHASIVVSN----FPQPRSALQAAKDQFNEGRKGFDIAL--NLLFAMAFLASTFSILA
         :    .:::    . .:   ... .. : :. .   :..   ..: ... .:    .:
CCDS74 CFPVLMDIVSNGLLGMVKPSVHIRTERSTFLENGQDNPIGFLAYIMFWLVLTSSCPPYIA
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pF1KSD VS---ERAVQAKHVQFVSGVHVASFWLSALLWDL-ISFLIPSLLLLVVF-KAFDVRAFTR
       .:   .   .:.    .::.  ...:..  : :. . ::.  .. :. . . :.   .: 
CCDS74 MSSIDDYKNRARSQLRISGLSPSAYWFGQALVDVSLYFLVFVFIYLMSYISNFEDMLLTI
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pF1KSD DGHMADTLLLLLLYGWAIIPLMYLMNFFFLGAATAYTRLTIFNILSGIATF--LMVTIMR
         :. . .   . :....: . :...:.:        :    :  ::: .:   .::.. 
CCDS74 I-HIIQ-IPCAVGYSFSLIFMTYVISFIF--------RKGRKN--SGIWSFCFYVVTVFS
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pF1KSD IP--AVKLEELSKTLDHVFLVLPNHCLGMAVSSFYENYETRRYCTSSEVAAHYCKKYNIQ
       .   : .. : .  .  .::. :   .:    : .  . .      ::      .....:
CCDS74 VAGFAFSIFESDIPFIFTFLIPPATMIGCLFLSSHLLFSS----LFSE------ERMDVQ
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pF1KSD YQENFYAWSAPGVGRFVASMAASGCAYLILLFLIETNLLQR-LRGILCALRRRRTLTELY
           : ..  : . .:.         .:. :  .: .. .. .:     . :    .   
CCDS74 ---PFLVFLIPFL-HFI--------IFLFTLRCLEWKFGKKSMRKD--PFFRISPRSSDV
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pF1KSD TRMPVLPE--DQDVADERTRIL-APSPDSLLHTPLIIKE-LSKVYE--------QRVPLL
        . :  ::  :.::  ::.:   : .  .. . :.::   : : :         .:   .
CCDS74 CQNPEEPEGEDEDVQMERVRTANALNSTNFDEKPVIIASCLRKEYAGKRKGCFSKRKNKI
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pF1KSD AVDRLSLAVQKGECFGLLGFNGAGKTTTFKMLTGEESLTSGDAFVGGHRISSDVGKVRQR
       :.  .:. :.::: .:::: :::::.:..:..::. . :.:.... :    :  : . . 
CCDS74 ATRNVSFCVRKGEVLGLLGHNGAGKSTSIKVITGDTKPTAGQVLLKG----SGGGDALEF
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pF1KSD IGYCPQFDALLDHMTGREMLVMYARLRGIPERHIGACVENTLRGLLLEPHANKLVRTYSG
       .::::: .::  ..: :. : .:: ..:. .    . .   . .: :. . .. :.: : 
CCDS74 LGYCPQENALWPNLTVRQHLEVYAAVKGLRKGDAEVAITRLVDALKLQDQLKSPVKTLSE
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pF1KSD GNKRKLSTGIALIGEPAVIFLDEPSTGMDPVARRLLWDTV-ARARESGKAIIITSHSMEE
       : ::::   ....:.:.:..:::::::::: ... .:... :  :.. .. ..:.: : :
CCDS74 GIKRKLCFVLSILGNPSVVLLDEPSTGMDPEGQQQMWQAIRATFRNTERGALLTTHYMAE
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pF1KSD CEALCTRLAIMVQGQFKCLGSPQHLKSKFGSGYSLRAKVQSEGQQEALEEFKAFVDLTFP
        ::.: :.::::.:...:.:: ::::::::. : :. ::.. .: : :.   : .   ::
CCDS74 AEAVCDRVAIMVSGRLRCIGSIQHLKSKFGKDYLLEMKVKNLAQVEPLH---AEILRLFP
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pF1KSD GSVLEDEHQGMVHYHLPGRDLS-WAKVFGILEKAKEKYGVDDYSVSQISLEQVFLSFAHL
        .. ........ :.:: .:..  :..:  :::.:... ...::.:: .:::::: ... 
CCDS74 QAARQERYSSLMVYKLPVEDVQPLAQAFFKLEKVKQSFDLEEYSLSQSTLEQVFLELSKE
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pF1KSD QPPTAEEGR               
       :                       
CCDS74 QELGDFEEDFDPSVKWKLLPQEEP
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            :.: .:   :: ::  :.: ..   .:   :  ::: .:. : : .   :. .. 
CCDS11 MSKRRMSVGQQTWALLCKN-CLKKWRMKRQTL---LEWLFSFLLV-LFLYLFFSNLHQVH
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         : .: ..:    .:   .:: . .:. : .: ... . . :  :  .. : . :.:.:
CCDS11 DTPQMSSMDLGRVDSF---NDTNYVIAFAP-ESKTTQEIMNKVASAPFLKGRTIMGWPDE
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       :....     . . :. :. :.:   :.           :::.::. .:  :        
CCDS11 KSMDEL----DLNYSIDAVRVIFTDTFS-----------YHLKFSWGHRIPM--------
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       .:: .  :..         .  :  . .:.:  . ..::.: : :.. ::.:  .. .. 
CCDS11 MKEHRD-HSAHC------QAVNEKMKCEGSE--FWEKGFVAFQAAINAAIIEIATNHSVM
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pF1KSD QLFQRLTVTIKRFPYPPFIADPFLVAIQYQLPLLLLLSFTYTALTIARAVVQEKERRLKE
       .  : ..::  ..   ::.:.   :: .. . .. ..::.     ..  :.::..  .  
CCDS11 E--QLMSVTGVHMKILPFVAQGG-VATDF-FIFFCIISFSTFIYYVSVNVTQERQY-ITS
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        : ::::     : .: :..  :.:: :..:.:.  :: . ...::.     .:....: 
CCDS11 LMTMMGLRESAFWLSWGLMYAGFILIMATLMALI--VK-SAQIVVLT--GFVMVFTLFLL
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       ...: :...:..:....:    :.         ::              .:   ::::  
CCDS11 YGLSLITLAFLMSVLIKKPFLTGLVVFLLIVFWGILGFPALYTRLPAFLEWTLCLLSPFA
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CCDS11 FTVGMAQLIHLDYDVNSNAHLDSSQNPYLIIATLFMLVFDTLLYLVLTLYFDKILPAEYG
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             ::.   .:  . ::  :. ..: ::::     :. ::    .. .  .:.::.:
CCDS11 HRCSPLFFLKSCFWFQHGRANHVVLENETDSDPTP---NDCFEPVSPEFCGKEAIRIKNL
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       .: . .:. .:. :.. . ...::::::.::::.:::::: :..:.::  :::: . . .
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CCDS11 HTLSRMADIENISKFTGFCPQSNVQFGFLTVKENLRLFAKIKGILPHEVEKEVQRVVQEL
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CCDS11 EMENIQDILAQNLSGGQNRKLTFGIAILGDPQVLLLDEPTAGLDPLSRHRIWNLLKEGKS
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       ::.:...:.:.::::.:.:: .....:.:.: :::::::.:.: :::..:  . .:.::.
CCDS11 DRVILFSTQFIDEADILADRKVFISNGKLKCAGSSLFLKKKWGIGYHLSLHLNERCDPES
         670       680       690       700       710       720     

          720       730       740       750       760       770    
pF1KSD ISQLVHHHVPNATLESSAGAELSFILPRESTHRFEGLFAKLEKKQKELGIASFGASITTM
       :..::..:. .: : ...  .: .::: : :..:  :.  :.. ... :: ..:.::::.
CCDS11 ITSLVKQHISDAKLTAQSEEKLVYILPLERTNKFPELYRDLDRCSNQ-GIEDYGVSITTL
         730       740       750       760       770        780    

          780        790       800       810       820       830   
pF1KSD EEVFLRV-GKLVDSSMDIQAIQLPALQYQHERRASDWAVDSNLCGAMDPSDGIGALIEEE
       .::::.. ::   :..: . : . . : :     .: : :    :..   . . . ..: 
CCDS11 NEVFLKLEGK---STIDESDIGIWG-QLQ-----TDGAKD---IGSLVELEQVLSSFHET
          790          800             810          820       830  

           840       850           860       870       880         
pF1KSD RTAVKLNTGLALHCQQFWAM----FLKKAAYSWREWKMVAAQVLVPLTCVTLALLAINYS
       : ..   .:.::  ::  :.    :::        : ..   .:  .. .   :  . : 
CCDS11 RKTI---SGVALWRQQVCAIAKVRFLKLKKERKSLWTIL---LLFGISFIPQLLEHLFYE
               840       850       860          870       880      

     890       900       910       920       930       940         
pF1KSD SELFDDPMLRLTLGEYGRTVVPFSVPGTSQLGQQLSEHLKDALQAEGQEPREVLGDLE--
       :   . :  .:. . :      :  ::  :  :.   ::  ...  :.   . : .:.  
CCDS11 SYQKSYPW-ELSPNTY------FLSPG--QQPQDPLTHLL-VINKTGSTIDNFLHSLRRQ
        890        900               910        920       930      

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pF1KSD ----EFLIF--RASVEGGGFNERCLVAASFRDVGERTVVNALFNNQAYHSPATALAVVDN
           :   :  : ...  ..:   .:... .:  .:  .    :..  .   . : :..:
CCDS11 NIAIEVDAFGTRNGTDDPSYNGAIIVSGDEKD--HRFSIAC--NTKRLNCFPVLLDVISN
        940       950       960         970         980       990  

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pF1KSD LLFKLLCGPHASIVVSNFPQPRSALQAAKDQFNEGRKGFDIALNLLFAMAFLASTFSILA
        :. .. . .      ..   ::..   . ... : ..     : .: . . ::    .:
CCDS11 GLLGIFNSSE------HIQTDRSTFFEEHMDYEYGYRS-----NTFFWIPMAASFTPYIA
           1000            1010      1020           1030      1040 

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pF1KSD VSERAVQAK--HVQF-VSGVHVASFWLSALLWDLISFLIPSLLLLVVFKAFDVRAFTRDG
       .:  .   :  : :. .::.. ...:..  : :.  ...  ::. ..   :. . .    
CCDS11 MSSIGDYKKKAHSQLRISGLYPSAYWFGQALVDVSLYFLILLLMQIMDYIFSPEEII---
            1050      1060      1070      1080      1090           

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pF1KSD HMADTLLLLLL----YGWAIIPLMYLMNFFFLGAATAYTRLTIFNILSGIATFLMVTIMR
        . ..::. .:    :  ... : :...:.: ..       ..:        ::.:.:. 
CCDS11 FIIQNLLIQILCSIGYVSSLVFLTYVISFIFRNGRKNSGIWSFF--------FLIVVIFS
     1100      1110      1120      1130      1140              1150

         1180      1190        1200       1210      1220      1230 
pF1KSD IPAVKLEELSKTLDHVF--LVLPNHCLGMAVSSFYE-NYETRRYCTSSEVAAHYCKKYNI
       : :. :.: .  :   :  ...:   :  ..  : : . ..  :  .::    :      
CCDS11 IVATDLNEYG-FLGLFFGTMLIPPFTLIGSLFIFSEISPDSMDYLGASESEIVY------
             1160       1170      1180      1190      1200         

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pF1KSD QYQENFYAWSAPGVGRFVASMAASGCAYLILLFLIETNLLQRLRGILCALRRRRTLTELY
              :   : .  ..         .:..:  .: :  ..:     ..:     . ..
CCDS11 ------LALLIPYLHFLI---------FLFILRCLEMNCRKKLMRKDPVFRISPRSNAIF
                1210               1220      1230      1240        

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pF1KSD TRMPVLPE--DQDVADERTRIL-APSPDSLLHTPLII-----KELS----KVYEQRVPLL
          :  ::  ..:.  :: : . : .  .. .::.::     :: .    . . .:   .
CCDS11 PN-PEEPEGEEEDIQMERMRTVNAMAVRDFDETPVIIASCLRKEYAGKKKNCFSKRKKKI
     1250       1260      1270      1280      1290      1300       

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pF1KSD AVDRLSLAVQKGECFGLLGFNGAGKTTTFKMLTGEESLTSGDAFVGGHRISSDVGKVRQR
       :.  .:. :.::: .:::: :::::.::.::.::. . :.:.... :    :  :.    
CCDS11 ATRNVSFCVKKGEVIGLLGHNGAGKSTTIKMITGDTKPTAGQVILKG----SGGGEPLGF
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pF1KSD IGYCPQFDALLDHMTGREMLVMYARLRGIPERHIGACVENTLRGLLLEPHANKLVRTYSG
       .::::: .::  ..: :. : .:: ..:. .      .   . .: :. . .  :.: : 
CCDS11 LGYCPQENALWPNLTVRQHLEVYAAVKGLRKGDAMIAITRLVDALKLQDQLKAPVKTLSE
          1370      1380      1390      1400      1410      1420   

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pF1KSD GNKRKLSTGIALIGEPAVIFLDEPSTGMDPVARRLLWDTV-ARARESGKAIIITSHSMEE
       : ::::   ....:.:.:..:::::::::: ... .:... :  :.. .. ..:.: : :
CCDS11 GIKRKLCFVLSILGNPSVVLLDEPSTGMDPEGQQQMWQVIRATFRNTERGALLTTHYMAE
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pF1KSD CEALCTRLAIMVQGQFKCLGSPQHLKSKFGSGYSLRAKVQSEGQQEALEEFKAFVDLTFP
        ::.: :.::::.:...:.:: ::::::::. : :. :... .:.: :   .: .   ::
CCDS11 AEAVCDRVAIMVSGRLRCIGSIQHLKSKFGKDYLLEMKLKNLAQMEPL---HAEILRLFP
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pF1KSD GSVLEDEHQGMVHYHLPGRDLS-WAKVFGILEKAKEKYGVDDYSVSQISLEQVFLSFAHL
        .. ... .... :.:: .:.   ...:  :: .:... ...::.:: .:::::: ... 
CCDS11 QAAQQERFSSLMVYKLPVEDVRPLSQAFFKLEIVKQSFDLEEYSLSQSTLEQVFLELSKE
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      1640                     
pF1KSD QPPTAEEGR               
       :                       
CCDS11 QELGDLEEDFDPSVKWKLLLQEEP
             1610      1620    

>>CCDS47584.1 ABCA13 gene_id:154664|Hs108|chr7            (5058 aa)
 initn: 1919 init1: 642 opt: 1017  Z-score: 1202.1  bits: 237.0 E(32554): 1.2e-60
Smith-Waterman score: 2519; 32.0% identity (60.8% similar) in 1659 aa overlap (127-1641:3456-5039)

        100       110       120       130       140       150      
pF1KSD VRRALVINMRVRGFPSEKDFEDYIRYDNCSSSVLAAVVFEHPFNHSKEPLPLAVKYHLRF
                                     .: ::...: . .  .:.    .::   . 
CCDS47 NLSSCVALNRFQALQSVDILETKAHELLQQNSFLASIIFSNSL-FDKNFRSESVKLPPHV
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pF1KSD SYT-RRNYMWTQTGSFFLKETEGWHTTSLFPLFPNPGPREPTSPDGGEPGYIREGFLAVQ
       ::: : : ...   .  . .. .:.      . :.  :      :: . .:.   :  .:
CCDS47 SYTIRTNVLYSVRTD--VVKNPSWK------FHPQNLP-----ADGFKYNYV---FAPLQ
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pF1KSD HAVDRAIMEYHADAATRQLFQRLTVTIKRFPYPPFIADPFLVAIQYQLPLLLLLSFTYTA
         ..:::.  .    : :   . ..  .  :::   .: ::  . . .::...:..  ..
CCDS47 DMIERAIILVQ----TGQEALEPAAQTQAAPYPCHTSDLFLNNVGFFFPLIMMLTWMVSV
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pF1KSD LTIARAVVQEKERRLKEYMRMMGLSSWLHWSAWFL-------------------------
        ...: .: :.: ...:::::::.   .:. ::::                         
CCDS47 ASMVRKLVYEQEIQIEEYMRMMGVHPVIHFLAWFLENMAVLTISSATLAIVLKTSGIFAH
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pF1KSD ----LFFLFLL------IAASFM---------------TLLFCVKVKPNVAVLSRSDP-S
           . :::::      .  :..               .:.. ..  : ...:   .  :
CCDS47 SNTFIVFLFLLDFGMSVVMLSYLLSAFFSQANTAALCTSLVYMISFLPYIVLLVLHNQLS
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pF1KSD LVLAFLLCFAISTISFS---FMVSTFFSKGMGIQWRDLLSPVNVDDDFCFGQVLGMLLLD
       .:   .::. .:: .:.   :... . ..  :::: .. . .. .  . :: :  :.:.:
CCDS47 FVNQTFLCL-LSTTAFGQGVFFITFLEGQETGIQWNNMYQALE-QGGMTFGWVCWMILFD
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pF1KSD SVLYGLVTWYMEAVFPGQFGVPQPWYFFIMPSYWCGKPRAVAGKE----------EEDSD
       : :: :  ::.  ..:: ::. .:::: .  ::: .    :  ..          .:. :
CCDS47 SSLYFLCGWYLSNLIPGTFGLRKPWYFPFTASYWKSVGFLVEKRQYFLSSSLFFFNENFD
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pF1KSD PE-KALRNEYFEAEPEDLVAGIKIKHLSKVFRVGNKDRAAVRDLNLNLYEGQITVLLGHN
        . ..:.:.  :.: :  . :. .  ..: .. :.:  :.:.::.:..:. :::.::: :
CCDS47 NKGSSLQNR--EGELEGSAPGVTLVSVTKEYE-GHK--AVVQDLSLTFYRDQITALLGTN
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pF1KSD GAGKTTTLSMLTGLFPPTSGRAYISGYEISQDMVQIRKSLGLCPQHDILFDNLTVAEHLY
       :::::: .:::::: :::::   :.: ... :. ..:  ::.:::.:::.::::: ::: 
CCDS47 GAGKTTIISMLTGLHPPTSGTIIINGKNLQTDLSRVRMELGVCPQQDILLDNLTVREHLL
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pF1KSD FYAQLKG--LSRQKCPEEVKQMLHIIGLEDKWNSRSRFLSGGMRRKLSIGIALIAGSKVL
       ..:..:.   ....  ..:.: :. . : .. ....: ::::..::::.:::... :...
CCDS47 LFASIKAPQWTKKELHQQVNQTLQDVDLTQHQHKQTRALSGGLKRKLSLGIAFMGMSRTV
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pF1KSD ILDEPTSGMDAISRRAIWDLLQRQKSDRTIVLTTHFMDEADLLGDRIAIMAKGELQCCGS
       .:::::::.:  ::...::.: . .  :::..::: .:::. :.::.:.. .:.:.::: 
CCDS47 VLDEPTSGVDPCSRHSLWDILLKYREGRTIIFTTHHLDEAEALSDRVAVLQHGRLRCCGP
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pF1KSD SLFLKQKYGAGYHMTLVKEPHC-NPED------ISQLVHHHVPNATLESSAGAELSFILP
        . ::. :: : ..::...:   . .:      ...:.. ..:.: :..:.:.::.. .:
CCDS47 PFCLKEAYGQGLRLTLTRQPSVLEAHDLKDMACVTSLIKIYIPQAFLKDSSGSELTYTIP
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pF1KSD RESTHR-FEGLFAKLEKKQKELGIASFGASITTMEEVFLRVGKLVDSSMDIQAIQLPALQ
       ... .  ..:::  :... ..: ....: : ::.::::: .  : ::.   .       .
CCDS47 KDTDKACLKGLFQALDENLHQLHLTGYGISDTTLEEVFLML--LQDSNKKSHIALGTESE
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pF1KSD YQHERRASDWAVDSNLCGAMDPSDGIGALIEEERTAVKLNTGLALHCQQFWAMFLKKAAY
        :..: ..     :. ::..             : :.    :. :   :  :.. ..   
CCDS47 LQNHRPTGHL---SGYCGSL------------ARPATV--QGVQLLRAQVAAILARRLRR
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pF1KSD SWREWKMVAAQVLVPLTCVTLALLAINYSSELFDDPMLRLTLGEYGRTVVPFSVPGTSQL
       . :  : . :..:.:.  :.::.  .       . : :::: :.: :. . :   : ..:
CCDS47 TLRAGKSTLADLLLPVLFVALAMGLFMVRPLATEYPPLRLTPGHYQRAETYFFSSGGDNL
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          . : ....:  :     .::.                    : :.         .: 
CCDS47 DLTRVLLRKFRDQDLPCADLNPRQKNSSCWRTDPFSHPEFQDSCGCLKCPNRSASAPYLT
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pF1KSD --IFRASVEGGGFN-ERCLVAASFR------DVGER----------------TVVNALFN
         . .. .. .::: :. :.: : .      . : .                :.... .:
CCDS47 NHLGHTLLNLSGFNMEEYLLAPSEKPRLGGWSFGLKIPSEAGGANGNISKPPTLAKVWYN
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pF1KSD NQAYHSPATALAVVDNLLFKLLCGPHAS---IVVSNFPQPRSALQAAKDQFNEGRKGFDI
       ....::  . :  ..::..     : ..     .. . .: ..    .:.. :. .   .
CCDS47 QKGFHSLPSYLNHLNNLILWQHLPPTVDWRQYGITLYSHPYGGALLNEDKILESIRQCGV
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       :: .......:.....  .: .:.. ::..: .::.    .:.. .:.:.. .:.   : 
CCDS47 ALCIVLGFSILSASIGSSVVRDRVIGAKRLQHISGLGYRMYWFTNFLYDMLFYLVSVCLC
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       ..:. ::.. :::   ..: : ::: :.:.: .: ::::. .: .. .:.   . .:.. 
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       :. :.:.. . :. :.     .:...  .:  :: ..:. :::...  .   :.  .:  
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pF1KSD SSEVAAHYCKKYNIQYQENFYAWSAPGVGRFVASMAASGCAYLILLFLIETNLLQRLRGI
       . . .     .:   .. :: .:       :: ..:..: . :.:  :.. .::.  :: 
CCDS47 THNFGI---DSYVSPFEMNFLGWI------FV-QLASQGTVLLLLRVLLHWDLLRWPRG-
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pF1KSD LCALRRRRTLTELYTRMPVLPEDQDVADERTRILAPSPDSLLHTPLIIKELSKVYEQRVP
             . ::           .: ::  :. :..    .. .   :.. .::: :..   
CCDS47 ------HSTLQGTVKS----SKDTDVEKEEKRVFEGRTNGDI---LVLYNLSKHYRRFFQ
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pF1KSD -LLAVDRLSLAVQKGECFGLLGFNGAGKTTTFKMLTGEESLTSGDAFVG---GHRIS-SD
        ..::. .::.. ::::::::: :::::.::::::.:: ::::: :..    :  .. :.
CCDS47 NIIAVQDISLGIPKGECFGLLGVNGAGKSTTFKMLNGEVSLTSGHAIIRTPMGDAVDLSS
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pF1KSD VGKVRQRIGYCPQFDALLDHMTGREMLVMYARLRGIPERHIGACVENTLRGLLLEPHANK
       .: .   :::::: ::: . .:: : : .:  :::::.. :   . . .: : :: ::.:
CCDS47 AGTAGVLIGYCPQQDALDELLTGWEHLYYYCSLRGIPRQCIPEVAGDLIRRLHLEAHADK
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pF1KSD LVRTYSGGNKRKLSTGIALIGEPAVIFLDEPSTGMDPVARRLLWDTVARARESGKAIIIT
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CCDS47 PVATYSGGTKRKLSTALALVGKPDILLLDEPSSGMDPCSKRYLWQTIMKEVREGCAAVLT
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CCDS47 SHSMEECEALCTRLAIMVNGSFKCLGSPQHIKNRFGDGYTVKVWLCKEANQHCT--VSDH
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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