Result of FASTA (omim) for pF1KSDA1874
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA1874, 521 aa
  1>>>pF1KSDA1874 521 - 521 aa - 521 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9444+/-0.000886; mu= 12.7254+/- 0.055
 mean_var=317.4633+/-61.643, 0's: 0 Z-trim(111.6): 2097  B-trim: 159 in 2/48
 Lambda= 0.071983
 statistics sampled from 17879 (20251) to 17879 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.562), E-opt: 0.2 (0.237), width:  16
 Scan time:  9.530

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_056209 (OMIM: 194538) zinc finger protein 10 [H ( 573) 1514 172.4 3.2e-42
NP_653285 (OMIM: 613910) zinc finger protein 480 i ( 535) 1491 170.0 1.6e-41
XP_011524767 (OMIM: 613910) PREDICTED: zinc finger ( 535) 1491 170.0 1.6e-41
NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 616) 1466 167.5   1e-40
XP_016882731 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 621) 1466 167.5   1e-40
XP_016882730 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 628) 1466 167.5 1.1e-40
XP_016882729 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 658) 1466 167.5 1.1e-40
NP_001276330 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 658) 1466 167.5 1.1e-40
XP_005259268 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1466 167.5 1.1e-40
XP_006723425 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1466 167.5 1.1e-40
XP_006723426 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1466 167.5 1.1e-40
NP_003427 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 670) 1466 167.5 1.1e-40
NP_009065 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 682) 1466 167.6 1.1e-40
NP_001152765 (OMIM: 603984) zinc finger protein 73 ( 536) 1438 164.5 7.3e-40
XP_006722660 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 550) 1438 164.5 7.4e-40
XP_011525901 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 550) 1438 164.5 7.4e-40
XP_005259754 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 551) 1438 164.5 7.4e-40
XP_011525900 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 551) 1438 164.5 7.4e-40
NP_775802 (OMIM: 603982) zinc finger protein 100 [ ( 542) 1425 163.1 1.9e-39
XP_016882741 (OMIM: 606740) PREDICTED: zinc finger ( 349) 1411 161.4 4.1e-39
XP_016882740 (OMIM: 606740) PREDICTED: zinc finger ( 349) 1411 161.4 4.1e-39
NP_001275691 (OMIM: 606740) zinc finger protein 18 ( 349) 1411 161.4 4.1e-39
XP_016882739 (OMIM: 606740) PREDICTED: zinc finger ( 349) 1411 161.4 4.1e-39
NP_001275689 (OMIM: 606740) zinc finger protein 18 ( 349) 1411 161.4 4.1e-39
XP_016882743 (OMIM: 606740) PREDICTED: zinc finger ( 349) 1411 161.4 4.1e-39
NP_001275690 (OMIM: 606740) zinc finger protein 18 ( 349) 1411 161.4 4.1e-39
XP_016882742 (OMIM: 606740) PREDICTED: zinc finger ( 349) 1411 161.4 4.1e-39
XP_016882745 (OMIM: 606740) PREDICTED: zinc finger ( 349) 1411 161.4 4.1e-39
XP_016882744 (OMIM: 606740) PREDICTED: zinc finger ( 349) 1411 161.4 4.1e-39
NP_001265438 (OMIM: 606740) zinc finger protein 18 ( 665) 1411 161.8 5.7e-39
NP_001278562 (OMIM: 606740) zinc finger protein 18 ( 665) 1411 161.8 5.7e-39
NP_001265437 (OMIM: 606740) zinc finger protein 18 ( 667) 1411 161.8 5.7e-39
NP_001275688 (OMIM: 606740) zinc finger protein 18 ( 691) 1411 161.9 5.8e-39
NP_037388 (OMIM: 606740) zinc finger protein 180 i ( 692) 1411 161.9 5.8e-39
XP_011525582 (OMIM: 606740) PREDICTED: zinc finger ( 734) 1411 161.9   6e-39
NP_001291968 (OMIM: 194522) zinc finger protein 33 ( 666) 1408 161.5 7.1e-39
NP_001291967 (OMIM: 194522) zinc finger protein 33 ( 666) 1408 161.5 7.1e-39
NP_001291964 (OMIM: 194522) zinc finger protein 33 ( 666) 1408 161.5 7.1e-39
NP_001291969 (OMIM: 194522) zinc finger protein 33 ( 666) 1408 161.5 7.1e-39
NP_001291965 (OMIM: 194522) zinc finger protein 33 ( 666) 1408 161.5 7.1e-39
NP_001291966 (OMIM: 194522) zinc finger protein 33 ( 666) 1408 161.5 7.1e-39
NP_008886 (OMIM: 194522) zinc finger protein 33B i ( 778) 1408 161.6 7.6e-39
NP_001291962 (OMIM: 194522) zinc finger protein 33 ( 785) 1408 161.6 7.7e-39
XP_011515618 (OMIM: 194526) PREDICTED: zinc finger ( 539) 1390 159.5 2.3e-38
XP_011515617 (OMIM: 194526) PREDICTED: zinc finger ( 539) 1390 159.5 2.3e-38
XP_016869364 (OMIM: 194526) PREDICTED: zinc finger ( 539) 1390 159.5 2.3e-38
XP_011515620 (OMIM: 194526) PREDICTED: zinc finger ( 539) 1390 159.5 2.3e-38
NP_001273698 (OMIM: 194526) zinc finger protein 34 ( 539) 1390 159.5 2.3e-38
XP_016869362 (OMIM: 194526) PREDICTED: zinc finger ( 560) 1390 159.5 2.4e-38
XP_016869363 (OMIM: 194526) PREDICTED: zinc finger ( 560) 1390 159.5 2.4e-38


>>NP_056209 (OMIM: 194538) zinc finger protein 10 [Homo   (573 aa)
 initn: 4809 init1: 1171 opt: 1514  Z-score: 879.0  bits: 172.4 E(85289): 3.2e-42
Smith-Waterman score: 1534; 46.9% identity (69.9% similar) in 518 aa overlap (34-520:3-515)

            10        20        30        40        50        60   
pF1KSD DLAEMPEKGALSSQDSPHFQEKSTEEGEVAALRLTARSQETVTFKDVAMDFTPEEWGKLD
                                     :  ::: :.  :::::: .::: :::  ::
NP_056                             MDAKSLTAWSRTLVTFKDVFVDFTREEWKLLD
                                           10        20        30  

                70        80         90       100       110        
pF1KSD PAQ----RDVMLENYRNLVSLWLPVSKPES-HNLENGKEPLKLERKAPKSSYSDMETRPQ
        ::    :.::::::.:::::   ..::.    ::.:.::  .::.  . .. : ::  .
NP_056 TAQQIVYRNVMLENYKNLVSLGYQLTKPDVILRLEKGEEPWLVEREIHQETHPDSETAFE
             40        50        60        70        80        90  

      120        130       140       150       160       170       
pF1KSD SKDSTSVQD-FSKAESCKVAIIDRLTRNSVYDSNLEAALECENWLENQQGNQERHLREM-
        :.:.: .. :.  .:: . . . ..::...  .:: . .:.. :.. : : :::::.. 
NP_056 IKSSVSSRSIFKDKQSCDIKM-EGMARNDLWYLSLEEVWKCRDQLDKYQENPERHLRQVA
            100       110        120       130       140       150 

        180                             190       200        210   
pF1KSD FTHMNSLSEETD----------------------HKHDVYWKSFNQKSVLIT-EDRVPKG
       ::. . :..:                        ::.: . ::...  ::   .:   ..
NP_056 FTQKKVLTQERVSESGKYGGNCLLPAQLVLREYFHKRDSHTKSLKHDLVLNGHQDSCASN
             160       170       180       190       200       210 

           220       230       240       250       260       270   
pF1KSD SYAFHTLEKSLKQKSNLMKKQRTYKEKKPHKCNDCGELFTYHSVLIRHQRVHTGEKPYTC
       :   .   ... :. .:..  ::.   : .:: :  . .:. : :   . .:  :::: :
NP_056 S---NECGQTFCQNIHLIQFARTHTGDKSYKCPDNDNSLTHGSSLGISKGIHR-EKPYEC
                220       230       240       250       260        

           280       290        300       310       320       330  
pF1KSD NECGKSFSHRANLTKHQRTHT-RILFECSECKKTFTESSSLATHQRIHVGERPYECNECG
       .:::: :: :.:::.::  :: .  .::.:: :.:..:: :  ::. :.::.::::.:::
NP_056 KECGKFFSWRSNLTRHQLIHTGEKPYECKECGKSFSRSSHLIGHQKTHTGEEPYECKECG
       270       280       290       300       310       320       

            340       350       360       370       380       390  
pF1KSD KGFNRSTHLVQHQLIHTGVKPYECNECDKAFIHSSALIKHQRTHTGEKPYKCQECGKAFS
       :.:.  .::: ::  ::: : : ::.: :.:.::: ::.:::::::::::.: ::::.: 
NP_056 KSFSWFSHLVTHQRTHTGDKLYTCNQCGKSFVHSSRLIRHQRTHTGEKPYECPECGKSFR
       330       340       350       360       370       380       

            400       410       420       430       440       450  
pF1KSD HCSSLTKHQRVHTGEKPYECSECGKTFSQSTHLVQHQRIHTGEKPYECNECGKTFSRSSN
       . . :  :::.:.  .::::.::::..:: .::: :.::::: ::.::..::: :::::.
NP_056 QSTHLILHQRTHVRVRPYECNECGKSYSQRSHLVVHHRIHTGLKPFECKDCGKCFSRSSH
       390       400       410       420       430       440       

            460       470       480       490       500       510  
pF1KSD FAKHQRIHIGKKPYKCSECGKAFIHSSALIQHQRTHTGEKPFRCNECGKSFKCSSSLIRH
       . .::: : :.:::.: .:::.: .::::: ::: ::::::..: .:::.:  ...::.:
NP_056 LYSHQRTHTGEKPYECHDCGKSFSQSSALIVHQRIHTGEKPYECCQCGKAFIRKNDLIKH
       450       460       470       480       490       500       

            520                                                    
pF1KSD QRVHTEEQP                                                   
       ::.:. :.                                                    
NP_056 QRIHVGEETYKCNQCGIIFSQNSPFIVHQIAHTGEQFLTCNQCGTALVNTSNLIGYQTNH
       510       520       530       540       550       560       

>>NP_653285 (OMIM: 613910) zinc finger protein 480 isofo  (535 aa)
 initn: 6398 init1: 1055 opt: 1491  Z-score: 866.4  bits: 170.0 E(85289): 1.6e-41
Smith-Waterman score: 1491; 45.7% identity (72.0% similar) in 497 aa overlap (39-521:21-510)

       10        20        30        40        50        60        
pF1KSD PEKGALSSQDSPHFQEKSTEEGEVAALRLTARSQETVTFKDVAMDFTPEEWGKLDPAQR-
                                     :  :  .::.:::..:.  ::  :::::: 
NP_653           MLCDEKAQKRRKRKAKESGMALPQGHLTFRDVAIEFSQAEWKCLDPAQRA
                         10        20        30        40        50

           70        80        90       100       110       120    
pF1KSD ---DVMLENYRNLVSLWLPVSKPESHNLENGKEPLKLERKAPKSSYSDMETRPQSKDSTS
          :::::::::::::   .: :.  :...  :    .:. : :. :...   .:     
NP_653 LYKDVMLENYRNLVSL--GISLPDL-NINSMLE----QRREPWSGESEVKIAKNSDGREC
               60          70         80            90       100   

          130         140       150       160       170       180  
pF1KSD VQDFSKAESCKVA--IIDRLTRNSVYDSNLEAALECENWLENQQGNQERHLREMFTHMNS
       ..  . . :  ..    :.  ....  :      : : . ...  :   .......: .:
NP_653 IKGVNTGSSYALGSNAEDKPIKKQLGVSFHLHLSELELFPDERVINGCNQVENFINHSSS
           110       120       130       140       150       160   

                190        200       210         220       230     
pF1KSD LS--EETDH--KHDVYWKS-FNQKSVLITEDRVP--KGSYAFHTLEKSLKQKSNLMKKQR
       .:  .: .   :  .. .. :...: :  :..:   .  :  .   : .. .:.: :.: 
NP_653 VSCLQEMSSSVKTPIFNRNDFDDSSFLPQEQKVHLREKPYECNEHSKVFRVSSSLTKHQV
           170       180       190       200       210       220   

         240       250       260       270       280       290     
pF1KSD TYKEKKPHKCNDCGELFTYHSVLIRHQRVHTGEKPYTCNECGKSFSHRANLTKHQRTHTR
        .  .::.:::.::..:. .: : .: :.::::::: :: ::: ::. .:...::: :::
NP_653 IHTVEKPYKCNSCGKVFSRNSHLAEHCRIHTGEKPYKCNVCGKVFSYNSNFARHQRIHTR
           230       240       250       260       270       280   

          300       310       320       330       340       350    
pF1KSD IL-FECSECKKTFTESSSLATHQRIHVGERPYECNECGKGFNRSTHLVQHQLIHTGVKPY
          .::.:: :.:...: :: :::::. :.::.::::::::.... :..:  :.:: :::
NP_653 EKPYECNECGKVFSNNSYLARHQRIHAEEKPYKCNECGKGFSHKSSLANHWRIYTGEKPY
           290       300       310       320       330       340   

          360       370       380       390       400       410    
pF1KSD ECNECDKAFIHSSALIKHQRTHTGEKPYKCQECGKAFSHCSSLTKHQRVHTGEKPYECSE
       .:.:: ::: . . :..::. :::::::::.::::.: . : :..: :.:::::::.:.:
NP_653 KCDECGKAFYRIALLVRHQKIHTGEKPYKCNECGKVFIQNSHLAQHWRIHTGEKPYKCNE
           350       360       370       380       390       400   

          420       430       440       450       460       470    
pF1KSD CGKTFSQSTHLVQHQRIHTGEKPYECNECGKTFSRSSNFAKHQRIHIGKKPYKCSECGKA
       :::.:.: ..:..:.:::::::::.::::::.::. :... :  :: :.:::::::::::
NP_653 CGKVFNQLSNLARHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSEYSGLSAHLVIHTGEKPYKCSECGKA
           410       420       430       440       450       460   

          480       490       500       510       520              
pF1KSD FIHSSALIQHQRTHTGEKPFRCNECGKSFKCSSSLIRHQRVHTEEQP             
       : :. .: .::: ::::.:..:::::: :.  . : ::...:: :.:             
NP_653 FRHKLSLTNHQRIHTGERPYKCNECGKVFNRIAHLARHRKIHTGEKPYKCNECGKAFSRI
           470       480       490       500       510       520   

NP_653 SYLAQHWTIHMG
           530     

>>XP_011524767 (OMIM: 613910) PREDICTED: zinc finger pro  (535 aa)
 initn: 6398 init1: 1055 opt: 1491  Z-score: 866.4  bits: 170.0 E(85289): 1.6e-41
Smith-Waterman score: 1491; 45.7% identity (72.0% similar) in 497 aa overlap (39-521:21-510)

       10        20        30        40        50        60        
pF1KSD PEKGALSSQDSPHFQEKSTEEGEVAALRLTARSQETVTFKDVAMDFTPEEWGKLDPAQR-
                                     :  :  .::.:::..:.  ::  :::::: 
XP_011           MLCDEKAQKRRKRKAKESGMALPQGHLTFRDVAIEFSQAEWKCLDPAQRA
                         10        20        30        40        50

           70        80        90       100       110       120    
pF1KSD ---DVMLENYRNLVSLWLPVSKPESHNLENGKEPLKLERKAPKSSYSDMETRPQSKDSTS
          :::::::::::::   .: :.  :...  :    .:. : :. :...   .:     
XP_011 LYKDVMLENYRNLVSL--GISLPDL-NINSMLE----QRREPWSGESEVKIAKNSDGREC
               60          70         80            90       100   

          130         140       150       160       170       180  
pF1KSD VQDFSKAESCKVA--IIDRLTRNSVYDSNLEAALECENWLENQQGNQERHLREMFTHMNS
       ..  . . :  ..    :.  ....  :      : : . ...  :   .......: .:
XP_011 IKGVNTGSSYALGSNAEDKPIKKQLGVSFHLHLSELELFPDERVINGCNQVENFINHSSS
           110       120       130       140       150       160   

                190        200       210         220       230     
pF1KSD LS--EETDH--KHDVYWKS-FNQKSVLITEDRVP--KGSYAFHTLEKSLKQKSNLMKKQR
       .:  .: .   :  .. .. :...: :  :..:   .  :  .   : .. .:.: :.: 
XP_011 VSCLQEMSSSVKTPIFNRNDFDDSSFLPQEQKVHLREKPYECNEHSKVFRVSSSLTKHQV
           170       180       190       200       210       220   

         240       250       260       270       280       290     
pF1KSD TYKEKKPHKCNDCGELFTYHSVLIRHQRVHTGEKPYTCNECGKSFSHRANLTKHQRTHTR
        .  .::.:::.::..:. .: : .: :.::::::: :: ::: ::. .:...::: :::
XP_011 IHTVEKPYKCNSCGKVFSRNSHLAEHCRIHTGEKPYKCNVCGKVFSYNSNFARHQRIHTR
           230       240       250       260       270       280   

          300       310       320       330       340       350    
pF1KSD IL-FECSECKKTFTESSSLATHQRIHVGERPYECNECGKGFNRSTHLVQHQLIHTGVKPY
          .::.:: :.:...: :: :::::. :.::.::::::::.... :..:  :.:: :::
XP_011 EKPYECNECGKVFSNNSYLARHQRIHAEEKPYKCNECGKGFSHKSSLANHWRIYTGEKPY
           290       300       310       320       330       340   

          360       370       380       390       400       410    
pF1KSD ECNECDKAFIHSSALIKHQRTHTGEKPYKCQECGKAFSHCSSLTKHQRVHTGEKPYECSE
       .:.:: ::: . . :..::. :::::::::.::::.: . : :..: :.:::::::.:.:
XP_011 KCDECGKAFYRIALLVRHQKIHTGEKPYKCNECGKVFIQNSHLAQHWRIHTGEKPYKCNE
           350       360       370       380       390       400   

          420       430       440       450       460       470    
pF1KSD CGKTFSQSTHLVQHQRIHTGEKPYECNECGKTFSRSSNFAKHQRIHIGKKPYKCSECGKA
       :::.:.: ..:..:.:::::::::.::::::.::. :... :  :: :.:::::::::::
XP_011 CGKVFNQLSNLARHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSEYSGLSAHLVIHTGEKPYKCSECGKA
           410       420       430       440       450       460   

          480       490       500       510       520              
pF1KSD FIHSSALIQHQRTHTGEKPFRCNECGKSFKCSSSLIRHQRVHTEEQP             
       : :. .: .::: ::::.:..:::::: :.  . : ::...:: :.:             
XP_011 FRHKLSLTNHQRIHTGERPYKCNECGKVFNRIAHLARHRKIHTGEKPYKCNECGKAFSRI
           470       480       490       500       510       520   

XP_011 SYLAQHWTIHMG
           530     

>>NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 is  (616 aa)
 initn: 9800 init1: 1159 opt: 1466  Z-score: 851.8  bits: 167.5 E(85289): 1e-40
Smith-Waterman score: 1504; 46.9% identity (72.0% similar) in 482 aa overlap (70-521:1-479)

      40        50        60        70        80          90       
pF1KSD RSQETVTFKDVAMDFTPEEWGKLDPAQRDVMLENYRNLVSL--WLPVSKPESHNL-ENGK
                                     ::...: :::.  :::  ::.  .: :.  
NP_001                               MLDTFRLLVSVGHWLP--KPNVISLLEQEA
                                             10          20        

        100       110       120       130       140            150 
pF1KSD EPLKLERKAPKSSYSDMETRPQSKDSTSVQDFSKAESCKVAIIDRLTRNSVY-----DSN
       :   .: . :.. : :.::::. : :.  : .:.  : .: ...:.  ....     :..
NP_001 ELWAVESRLPQGVYPDLETRPKVKLSVLKQGISEEISNSVILVERFLWDGLWYCRGEDTE
       30        40        50        60        70        80        

             160                 170       180       190           
pF1KSD LEAALECENWLEN----------QQGNQERHLREMFTHMNSLSEETDHKHDV-------Y
        .    ::. ::.          .    :.  :. : .  ::. .  :.  .        
NP_001 GHWEWSCES-LESLAVPVAFTPVKTPVLEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHT
       90        100       110       120       130       140       

          200           210       220       230       240       250
pF1KSD WKSFNQKSV----LITEDRVPKGSYAFHTLEKSLKQKSNLMKKQRTYKEKKPHKCNDCGE
       : . ...      .. .  : .  :  .   :.....: :....::.  ..:..:..: .
NP_001 WGTRGKREKPDLNVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLK
       150       160       170       180       190       200       

              260       270       280       290        300         
pF1KSD LFTYHSVLIRHQRVHTGEKPYTCNECGKSFSHRANLTKHQRTHT-RILFECSECKKTFTE
        :   :.: .:::.::::::: :..::..:.. : : .:::::: .  .::::: :.:. 
NP_001 GFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSF
       210       220       230       240       250       260       

     310       320       330       340       350       360         
pF1KSD SSSLATHQRIHVGERPYECNECGKGFNRSTHLVQHQLIHTGVKPYECNECDKAFIHSSAL
        ::.. :.: :.::.::::.::::.: .: ::.::  :::: :::.:.:: ::: :::.:
NP_001 RSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSL
       270       280       290       300       310       320       

     370       380       390       400       410       420         
pF1KSD IKHQRTHTGEKPYKCQECGKAFSHCSSLTKHQRVHTGEKPYECSECGKTFSQSTHLVQHQ
        :::: :::::::.:.::::::.. . : .:::.:::::::::.::::.::::: :..:.
NP_001 TKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHR
       330       340       350       360       370       380       

     430       440       450       460       470       480         
pF1KSD RIHTGEKPYECNECGKTFSRSSNFAKHQRIHIGKKPYKCSECGKAFIHSSALIQHQRTHT
       ::::::::: :::::::::.::....:.: : :.:::.::.::::: .:. : :::: ::
NP_001 RIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHT
       390       400       410       420       430       440       

     490       500       510       520                             
pF1KSD GEKPFRCNECGKSFKCSSSLIRHQRVHTEEQP                            
       ::::..::.:::.:. :::: .:::.:: :.:                            
NP_001 GEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKP
       450       460       470       480       490       500       

NP_001 YECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECH
       510       520       530       540       550       560       

>--
 initn: 1260 init1: 720 opt: 720  Z-score: 433.1  bits: 90.0 E(85289): 2.2e-17
Smith-Waterman score: 720; 67.2% identity (87.6% similar) in 137 aa overlap (326-462:480-616)

         300       310       320       330       340       350     
pF1KSD ILFECSECKKTFTESSSLATHQRIHVGERPYECNECGKGFNRSTHLVQHQLIHTGVKPYE
                                     ::::.::..:.. . :.::: :::: ::::
NP_001 KPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYE
     450       460       470       480       490       500         

         360       370       380       390       400       410     
pF1KSD CNECDKAFIHSSALIKHQRTHTGEKPYKCQECGKAFSHCSSLTKHQRVHTGEKPYECSEC
       ::.: .:: .:: ::.::: :: :::: :.::::.::: :::..:.:.::::::::: .:
NP_001 CNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDC
     510       520       530       540       550       560         

         420       430       440       450       460       470     
pF1KSD GKTFSQSTHLVQHQRIHTGEKPYECNECGKTFSRSSNFAKHQRIHIGKKPYKCSECGKAF
       ::.: :::::.::.::::::::: : .:::.:..::...:::: : :             
NP_001 GKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG             
     570       580       590       600       610                   

         480       490       500       510       520 
pF1KSD IHSSALIQHQRTHTGEKPFRCNECGKSFKCSSSLIRHQRVHTEEQP

>>XP_016882731 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger pro  (621 aa)
 initn: 9800 init1: 1159 opt: 1466  Z-score: 851.8  bits: 167.5 E(85289): 1e-40
Smith-Waterman score: 1466; 54.2% identity (81.0% similar) in 358 aa overlap (167-521:183-540)

        140       150       160       170       180       190      
pF1KSD AIIDRLTRNSVYDSNLEAALECENWLENQQGNQERHLREMFTHMNSLSEETDHKHDVYWK
                                     :.   :   .. :  . . :  ..     :
XP_016 WGTRGKREKPDLNVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLK
            160       170       180       190       200       210  

        200       210       220         230       240       250    
pF1KSD SFNQKSVLITEDRVPKGSYAFHTLE--KSLKQKSNLMKKQRTYKEKKPHKCNDCGELFTY
       .: ..:.:  ..:.  :   ..  .  ....: . :...:::.  .::..:..::. :..
XP_016 GFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSF
            220       230       240       250       260       270  

          260       270       280       290        300       310   
pF1KSD HSVLIRHQRVHTGEKPYTCNECGKSFSHRANLTKHQRTHT-RILFECSECKKTFTESSSL
       .: . .:.:.::::::: :.::::.: .  .::.: : :: .  ..:.:: :.:..::::
XP_016 RSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSL
            280       290       300       310       320       330  

           320       330       340       350       360       370   
pF1KSD ATHQRIHVGERPYECNECGKGFNRSTHLVQHQLIHTGVKPYECNECDKAFIHSSALIKHQ
       . :::::.::.::::.::::.:.. : :.:::  ::: :::::.:: ::: .:. : .:.
XP_016 TKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHR
            340       350       360       370       380       390  

           380       390       400       410       420       430   
pF1KSD RTHTGEKPYKCQECGKAFSHCSSLTKHQRVHTGEKPYECSECGKTFSQSTHLVQHQRIHT
       : ::::::: :.::::.::: :::..:.:.::::::::::.:::.: :::::.:::::::
XP_016 RIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHT
            400       410       420       430       440       450  

           440       450       460       470       480       490   
pF1KSD GEKPYECNECGKTFSRSSNFAKHQRIHIGKKPYKCSECGKAFIHSSALIQHQRTHTGEKP
       ::::::::.:::.::.::...:::::: :.:::.:..::.:: . . :::::: ::::::
XP_016 GEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKP
            460       470       480       490       500       510  

           500       510       520                                 
pF1KSD FRCNECGKSFKCSSSLIRHQRVHTEEQP                                
       ..::.::..:. :: ::.:::.::.:.:                                
XP_016 YECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECH
            520       530       540       550       560       570  

>--
 initn: 426 init1: 426 opt: 445  Z-score: 278.8  bits: 61.5 E(85289): 8.7e-09
Smith-Waterman score: 445; 69.1% identity (90.1% similar) in 81 aa overlap (382-462:541-621)

             360       370       380       390       400       410 
pF1KSD KPYECNECDKAFIHSSALIKHQRTHTGEKPYKCQECGKAFSHCSSLTKHQRVHTGEKPYE
                                     : :.::::.::: :::..:.:.::::::::
XP_016 KPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYE
              520       530       540       550       560       570

             420       430       440       450       460       470 
pF1KSD CSECGKTFSQSTHLVQHQRIHTGEKPYECNECGKTFSRSSNFAKHQRIHIGKKPYKCSEC
       : .:::.: :::::.::.::::::::: : .:::.:..::...:::: : :         
XP_016 CHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG         
              580       590       600       610       620          

             480       490       500       510       520 
pF1KSD GKAFIHSSALIQHQRTHTGEKPFRCNECGKSFKCSSSLIRHQRVHTEEQP

>>XP_016882730 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger pro  (628 aa)
 initn: 9800 init1: 1159 opt: 1466  Z-score: 851.7  bits: 167.5 E(85289): 1.1e-40
Smith-Waterman score: 1476; 46.0% identity (70.4% similar) in 494 aa overlap (70-521:1-491)

      40        50        60        70        80          90       
pF1KSD RSQETVTFKDVAMDFTPEEWGKLDPAQRDVMLENYRNLVSL--WLPVSKPESHNL-ENGK
                                     ::...: :::.  :::  ::.  .: :.  
XP_016                               MLDTFRLLVSVGHWLP--KPNVISLLEQEA
                                             10          20        

        100       110                   120       130       140    
pF1KSD EPLKLERKAPKSSY------------SDMETRPQSKDSTSVQDFSKAESCKVAIIDRLTR
       :   .: . :.. :            ::.::::. : :.  : .:.  : .: ...:.  
XP_016 ELWAVESRLPQGVYPEIKGHFQFLLLSDLETRPKVKLSVLKQGISEEISNSVILVERFLW
       30        40        50        60        70        80        

               150       160                 170       180         
pF1KSD NSVY-----DSNLEAALECENWLEN----------QQGNQERHLREMFTHMNSLSEETDH
       ....     :.. .    ::. ::.          .    :.  :. : .  ::. .  :
XP_016 DGLWYCRGEDTEGHWEWSCES-LESLAVPVAFTPVKTPVLEQWQRNGFGENISLNPDLPH
       90       100        110       120       130       140       

     190              200           210       220       230        
pF1KSD KHDV-------YWKSFNQKSV----LITEDRVPKGSYAFHTLEKSLKQKSNLMKKQRTYK
       .  .        : . ...      .. .  : .  :  .   :.....: :....::. 
XP_016 QPMTPERQSPHTWGTRGKREKPDLNVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHT
       150       160       170       180       190       200       

      240       250       260       270       280       290        
pF1KSD EKKPHKCNDCGELFTYHSVLIRHQRVHTGEKPYTCNECGKSFSHRANLTKHQRTHT-RIL
        ..:..:..: . :   :.: .:::.::::::: :..::..:.. : : .:::::: .  
XP_016 GERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKP
       210       220       230       240       250       260       

       300       310       320       330       340       350       
pF1KSD FECSECKKTFTESSSLATHQRIHVGERPYECNECGKGFNRSTHLVQHQLIHTGVKPYECN
       .::::: :.:.  ::.. :.: :.::.::::.::::.: .: ::.::  :::: :::.:.
XP_016 YECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCG
       270       280       290       300       310       320       

       360       370       380       390       400       410       
pF1KSD ECDKAFIHSSALIKHQRTHTGEKPYKCQECGKAFSHCSSLTKHQRVHTGEKPYECSECGK
       :: ::: :::.: :::: :::::::.:.::::::.. . : .:::.:::::::::.::::
XP_016 ECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGK
       330       340       350       360       370       380       

       420       430       440       450       460       470       
pF1KSD TFSQSTHLVQHQRIHTGEKPYECNECGKTFSRSSNFAKHQRIHIGKKPYKCSECGKAFIH
       .::::: :..:.::::::::: :::::::::.::....:.: : :.:::.::.::::: .
XP_016 AFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQ
       390       400       410       420       430       440       

       480       490       500       510       520                 
pF1KSD SSALIQHQRTHTGEKPFRCNECGKSFKCSSSLIRHQRVHTEEQP                
       :. : :::: ::::::..::.:::.:. :::: .:::.:: :.:                
XP_016 STHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPL
       450       460       470       480       490       500       

XP_016 IQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHE
       510       520       530       540       550       560       

>--
 initn: 1260 init1: 720 opt: 720  Z-score: 433.1  bits: 90.0 E(85289): 2.2e-17
Smith-Waterman score: 720; 67.2% identity (87.6% similar) in 137 aa overlap (326-462:492-628)

         300       310       320       330       340       350     
pF1KSD ILFECSECKKTFTESSSLATHQRIHVGERPYECNECGKGFNRSTHLVQHQLIHTGVKPYE
                                     ::::.::..:.. . :.::: :::: ::::
XP_016 KPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYE
             470       480       490       500       510       520 

         360       370       380       390       400       410     
pF1KSD CNECDKAFIHSSALIKHQRTHTGEKPYKCQECGKAFSHCSSLTKHQRVHTGEKPYECSEC
       ::.: .:: .:: ::.::: :: :::: :.::::.::: :::..:.:.::::::::: .:
XP_016 CNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDC
             530       540       550       560       570       580 

         420       430       440       450       460       470     
pF1KSD GKTFSQSTHLVQHQRIHTGEKPYECNECGKTFSRSSNFAKHQRIHIGKKPYKCSECGKAF
       ::.: :::::.::.::::::::: : .:::.:..::...:::: : :             
XP_016 GKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG             
             590       600       610       620                     

         480       490       500       510       520 
pF1KSD IHSSALIQHQRTHTGEKPFRCNECGKSFKCSSSLIRHQRVHTEEQP

>>XP_016882729 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger pro  (658 aa)
 initn: 9800 init1: 1159 opt: 1466  Z-score: 851.6  bits: 167.5 E(85289): 1.1e-40
Smith-Waterman score: 1569; 47.5% identity (71.9% similar) in 499 aa overlap (57-521:26-521)

         30        40        50        60            70        80  
pF1KSD TEEGEVAALRLTARSQETVTFKDVAMDFTPEEWGKLDPAQR----DVMLENYRNLVSL--
                                     ::::.: ::::    ::::...: :::.  
XP_016      MTPGVRVSTDPEQVTFEDVVVGFSQEEWGQLKPAQRTLYRDVMLDTFRLLVSVGH
                    10        20        30        40        50     

               90        100       110       120       130         
pF1KSD WLPVSKPESHNL-ENGKEPLKLERKAPKSSYSDMETRPQSKDSTSVQDFSKAESCKVAII
       :::  ::.  .: :.  :   .: . :.. : :.::::. : :.  : .:.  : .: ..
XP_016 WLP--KPNVISLLEQEAELWAVESRLPQGVYPDLETRPKVKLSVLKQGISEEISNSVILV
            60        70        80        90       100       110   

     140            150       160                 170       180    
pF1KSD DRLTRNSVY-----DSNLEAALECENWLEN----------QQGNQERHLREMFTHMNSLS
       .:.  ....     :.. .    ::. ::.          .    :.  :. : .  ::.
XP_016 ERFLWDGLWYCRGEDTEGHWEWSCES-LESLAVPVAFTPVKTPVLEQWQRNGFGENISLN
           120       130        140       150       160       170  

          190              200           210       220       230   
pF1KSD EETDHKHDV-------YWKSFNQKSV----LITEDRVPKGSYAFHTLEKSLKQKSNLMKK
        .  :.  .        : . ...      .. .  : .  :  .   :.....: :...
XP_016 PDLPHQPMTPERQSPHTWGTRGKREKPDLNVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEH
            180       190       200       210       220       230  

           240       250       260       270       280       290   
pF1KSD QRTYKEKKPHKCNDCGELFTYHSVLIRHQRVHTGEKPYTCNECGKSFSHRANLTKHQRTH
       .::.  ..:..:..: . :   :.: .:::.::::::: :..::..:.. : : .:::::
XP_016 HRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTH
            240       250       260       270       280       290  

            300       310       320       330       340       350  
pF1KSD T-RILFECSECKKTFTESSSLATHQRIHVGERPYECNECGKGFNRSTHLVQHQLIHTGVK
       : .  .::::: :.:.  ::.. :.: :.::.::::.::::.: .: ::.::  :::: :
XP_016 TGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEK
            300       310       320       330       340       350  

            360       370       380       390       400       410  
pF1KSD PYECNECDKAFIHSSALIKHQRTHTGEKPYKCQECGKAFSHCSSLTKHQRVHTGEKPYEC
       ::.:.:: ::: :::.: :::: :::::::.:.::::::.. . : .:::.:::::::::
XP_016 PYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYEC
            360       370       380       390       400       410  

            420       430       440       450       460       470  
pF1KSD SECGKTFSQSTHLVQHQRIHTGEKPYECNECGKTFSRSSNFAKHQRIHIGKKPYKCSECG
       .::::.::::: :..:.::::::::: :::::::::.::....:.: : :.:::.::.::
XP_016 GECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCG
            420       430       440       450       460       470  

            480       490       500       510       520            
pF1KSD KAFIHSSALIQHQRTHTGEKPFRCNECGKSFKCSSSLIRHQRVHTEEQP           
       ::: .:. : :::: ::::::..::.:::.:. :::: .:::.:: :.:           
XP_016 KAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFS
            480       490       500       510       520       530  

XP_016 QLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSS
            540       550       560       570       580       590  

>--
 initn: 1260 init1: 720 opt: 720  Z-score: 432.9  bits: 90.1 E(85289): 2.3e-17
Smith-Waterman score: 720; 67.2% identity (87.6% similar) in 137 aa overlap (326-462:522-658)

         300       310       320       330       340       350     
pF1KSD ILFECSECKKTFTESSSLATHQRIHVGERPYECNECGKGFNRSTHLVQHQLIHTGVKPYE
                                     ::::.::..:.. . :.::: :::: ::::
XP_016 KPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYE
             500       510       520       530       540       550 

         360       370       380       390       400       410     
pF1KSD CNECDKAFIHSSALIKHQRTHTGEKPYKCQECGKAFSHCSSLTKHQRVHTGEKPYECSEC
       ::.: .:: .:: ::.::: :: :::: :.::::.::: :::..:.:.::::::::: .:
XP_016 CNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDC
             560       570       580       590       600       610 

         420       430       440       450       460       470     
pF1KSD GKTFSQSTHLVQHQRIHTGEKPYECNECGKTFSRSSNFAKHQRIHIGKKPYKCSECGKAF
       ::.: :::::.::.::::::::: : .:::.:..::...:::: : :             
XP_016 GKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG             
             620       630       640       650                     

         480       490       500       510       520 
pF1KSD IHSSALIQHQRTHTGEKPFRCNECGKSFKCSSSLIRHQRVHTEEQP

>>NP_001276330 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 is  (658 aa)
 initn: 9800 init1: 1159 opt: 1466  Z-score: 851.6  bits: 167.5 E(85289): 1.1e-40
Smith-Waterman score: 1569; 47.5% identity (71.9% similar) in 499 aa overlap (57-521:26-521)

         30        40        50        60            70        80  
pF1KSD TEEGEVAALRLTARSQETVTFKDVAMDFTPEEWGKLDPAQR----DVMLENYRNLVSL--
                                     ::::.: ::::    ::::...: :::.  
NP_001      MTPGVRVSTDPEQVTFEDVVVGFSQEEWGQLKPAQRTLYRDVMLDTFRLLVSVGH
                    10        20        30        40        50     

               90        100       110       120       130         
pF1KSD WLPVSKPESHNL-ENGKEPLKLERKAPKSSYSDMETRPQSKDSTSVQDFSKAESCKVAII
       :::  ::.  .: :.  :   .: . :.. : :.::::. : :.  : .:.  : .: ..
NP_001 WLP--KPNVISLLEQEAELWAVESRLPQGVYPDLETRPKVKLSVLKQGISEEISNSVILV
            60        70        80        90       100       110   

     140            150       160                 170       180    
pF1KSD DRLTRNSVY-----DSNLEAALECENWLEN----------QQGNQERHLREMFTHMNSLS
       .:.  ....     :.. .    ::. ::.          .    :.  :. : .  ::.
NP_001 ERFLWDGLWYCRGEDTEGHWEWSCES-LESLAVPVAFTPVKTPVLEQWQRNGFGENISLN
           120       130        140       150       160       170  

          190              200           210       220       230   
pF1KSD EETDHKHDV-------YWKSFNQKSV----LITEDRVPKGSYAFHTLEKSLKQKSNLMKK
        .  :.  .        : . ...      .. .  : .  :  .   :.....: :...
NP_001 PDLPHQPMTPERQSPHTWGTRGKREKPDLNVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEH
            180       190       200       210       220       230  

           240       250       260       270       280       290   
pF1KSD QRTYKEKKPHKCNDCGELFTYHSVLIRHQRVHTGEKPYTCNECGKSFSHRANLTKHQRTH
       .::.  ..:..:..: . :   :.: .:::.::::::: :..::..:.. : : .:::::
NP_001 HRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTH
            240       250       260       270       280       290  

            300       310       320       330       340       350  
pF1KSD T-RILFECSECKKTFTESSSLATHQRIHVGERPYECNECGKGFNRSTHLVQHQLIHTGVK
       : .  .::::: :.:.  ::.. :.: :.::.::::.::::.: .: ::.::  :::: :
NP_001 TGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEK
            300       310       320       330       340       350  

            360       370       380       390       400       410  
pF1KSD PYECNECDKAFIHSSALIKHQRTHTGEKPYKCQECGKAFSHCSSLTKHQRVHTGEKPYEC
       ::.:.:: ::: :::.: :::: :::::::.:.::::::.. . : .:::.:::::::::
NP_001 PYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYEC
            360       370       380       390       400       410  

            420       430       440       450       460       470  
pF1KSD SECGKTFSQSTHLVQHQRIHTGEKPYECNECGKTFSRSSNFAKHQRIHIGKKPYKCSECG
       .::::.::::: :..:.::::::::: :::::::::.::....:.: : :.:::.::.::
NP_001 GECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCG
            420       430       440       450       460       470  

            480       490       500       510       520            
pF1KSD KAFIHSSALIQHQRTHTGEKPFRCNECGKSFKCSSSLIRHQRVHTEEQP           
       ::: .:. : :::: ::::::..::.:::.:. :::: .:::.:: :.:           
NP_001 KAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFS
            480       490       500       510       520       530  

NP_001 QLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSS
            540       550       560       570       580       590  

>--
 initn: 1260 init1: 720 opt: 720  Z-score: 432.9  bits: 90.1 E(85289): 2.3e-17
Smith-Waterman score: 720; 67.2% identity (87.6% similar) in 137 aa overlap (326-462:522-658)

         300       310       320       330       340       350     
pF1KSD ILFECSECKKTFTESSSLATHQRIHVGERPYECNECGKGFNRSTHLVQHQLIHTGVKPYE
                                     ::::.::..:.. . :.::: :::: ::::
NP_001 KPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYE
             500       510       520       530       540       550 

         360       370       380       390       400       410     
pF1KSD CNECDKAFIHSSALIKHQRTHTGEKPYKCQECGKAFSHCSSLTKHQRVHTGEKPYECSEC
       ::.: .:: .:: ::.::: :: :::: :.::::.::: :::..:.:.::::::::: .:
NP_001 CNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDC
             560       570       580       590       600       610 

         420       430       440       450       460       470     
pF1KSD GKTFSQSTHLVQHQRIHTGEKPYECNECGKTFSRSSNFAKHQRIHIGKKPYKCSECGKAF
       ::.: :::::.::.::::::::: : .:::.:..::...:::: : :             
NP_001 GKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG             
             620       630       640       650                     

         480       490       500       510       520 
pF1KSD IHSSALIQHQRTHTGEKPFRCNECGKSFKCSSSLIRHQRVHTEEQP

>>XP_005259268 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger pro  (670 aa)
 initn: 9800 init1: 1159 opt: 1466  Z-score: 851.5  bits: 167.5 E(85289): 1.1e-40
Smith-Waterman score: 1569; 47.5% identity (71.9% similar) in 499 aa overlap (57-521:38-533)

         30        40        50        60            70        80  
pF1KSD TEEGEVAALRLTARSQETVTFKDVAMDFTPEEWGKLDPAQR----DVMLENYRNLVSL--
                                     ::::.: ::::    ::::...: :::.  
XP_005 RSVGCRCRGLCLAVRREQVTFEDVVVGFSQEEWGQLKPAQRTLYRDVMLDTFRLLVSVGH
        10        20        30        40        50        60       

               90        100       110       120       130         
pF1KSD WLPVSKPESHNL-ENGKEPLKLERKAPKSSYSDMETRPQSKDSTSVQDFSKAESCKVAII
       :::  ::.  .: :.  :   .: . :.. : :.::::. : :.  : .:.  : .: ..
XP_005 WLP--KPNVISLLEQEAELWAVESRLPQGVYPDLETRPKVKLSVLKQGISEEISNSVILV
        70          80        90       100       110       120     

     140            150       160                 170       180    
pF1KSD DRLTRNSVY-----DSNLEAALECENWLEN----------QQGNQERHLREMFTHMNSLS
       .:.  ....     :.. .    ::. ::.          .    :.  :. : .  ::.
XP_005 ERFLWDGLWYCRGEDTEGHWEWSCES-LESLAVPVAFTPVKTPVLEQWQRNGFGENISLN
         130       140       150        160       170       180    

          190              200           210       220       230   
pF1KSD EETDHKHDV-------YWKSFNQKSV----LITEDRVPKGSYAFHTLEKSLKQKSNLMKK
        .  :.  .        : . ...      .. .  : .  :  .   :.....: :...
XP_005 PDLPHQPMTPERQSPHTWGTRGKREKPDLNVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEH
          190       200       210       220       230       240    

           240       250       260       270       280       290   
pF1KSD QRTYKEKKPHKCNDCGELFTYHSVLIRHQRVHTGEKPYTCNECGKSFSHRANLTKHQRTH
       .::.  ..:..:..: . :   :.: .:::.::::::: :..::..:.. : : .:::::
XP_005 HRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTH
          250       260       270       280       290       300    

            300       310       320       330       340       350  
pF1KSD T-RILFECSECKKTFTESSSLATHQRIHVGERPYECNECGKGFNRSTHLVQHQLIHTGVK
       : .  .::::: :.:.  ::.. :.: :.::.::::.::::.: .: ::.::  :::: :
XP_005 TGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEK
          310       320       330       340       350       360    

            360       370       380       390       400       410  
pF1KSD PYECNECDKAFIHSSALIKHQRTHTGEKPYKCQECGKAFSHCSSLTKHQRVHTGEKPYEC
       ::.:.:: ::: :::.: :::: :::::::.:.::::::.. . : .:::.:::::::::
XP_005 PYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYEC
          370       380       390       400       410       420    

            420       430       440       450       460       470  
pF1KSD SECGKTFSQSTHLVQHQRIHTGEKPYECNECGKTFSRSSNFAKHQRIHIGKKPYKCSECG
       .::::.::::: :..:.::::::::: :::::::::.::....:.: : :.:::.::.::
XP_005 GECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCG
          430       440       450       460       470       480    

            480       490       500       510       520            
pF1KSD KAFIHSSALIQHQRTHTGEKPFRCNECGKSFKCSSSLIRHQRVHTEEQP           
       ::: .:. : :::: ::::::..::.:::.:. :::: .:::.:: :.:           
XP_005 KAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFS
          490       500       510       520       530       540    

XP_005 QLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSS
          550       560       570       580       590       600    

>--
 initn: 1260 init1: 720 opt: 720  Z-score: 432.8  bits: 90.1 E(85289): 2.3e-17
Smith-Waterman score: 720; 67.2% identity (87.6% similar) in 137 aa overlap (326-462:534-670)

         300       310       320       330       340       350     
pF1KSD ILFECSECKKTFTESSSLATHQRIHVGERPYECNECGKGFNRSTHLVQHQLIHTGVKPYE
                                     ::::.::..:.. . :.::: :::: ::::
XP_005 KPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYE
           510       520       530       540       550       560   

         360       370       380       390       400       410     
pF1KSD CNECDKAFIHSSALIKHQRTHTGEKPYKCQECGKAFSHCSSLTKHQRVHTGEKPYECSEC
       ::.: .:: .:: ::.::: :: :::: :.::::.::: :::..:.:.::::::::: .:
XP_005 CNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDC
           570       580       590       600       610       620   

         420       430       440       450       460       470     
pF1KSD GKTFSQSTHLVQHQRIHTGEKPYECNECGKTFSRSSNFAKHQRIHIGKKPYKCSECGKAF
       ::.: :::::.::.::::::::: : .:::.:..::...:::: : :             
XP_005 GKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG             
           630       640       650       660       670             

         480       490       500       510       520 
pF1KSD IHSSALIQHQRTHTGEKPFRCNECGKSFKCSSSLIRHQRVHTEEQP

>>XP_006723425 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger pro  (670 aa)
 initn: 9800 init1: 1159 opt: 1466  Z-score: 851.5  bits: 167.5 E(85289): 1.1e-40
Smith-Waterman score: 1496; 46.7% identity (70.6% similar) in 497 aa overlap (67-521:40-533)

         40        50        60        70        80          90    
pF1KSD LTARSQETVTFKDVAMDFTPEEWGKLDPAQRDVMLENYRNLVSL--WLPVSKPESHNL-E
                                     :::::...: :::.  :::  ::.  .: :
XP_006 DPEQVTFEDVVVGFSQEEWGQLKPAQRTLYRDVMLDTFRLLVSVGHWLP--KPNVISLLE
      10        20        30        40        50          60       

           100       110                   120       130       140 
pF1KSD NGKEPLKLERKAPKSSY------------SDMETRPQSKDSTSVQDFSKAESCKVAIIDR
       .  :   .: . :.. :            ::.::::. : :.  : .:.  : .: ...:
XP_006 QEAELWAVESRLPQGVYPEIKGHFQFLLLSDLETRPKVKLSVLKQGISEEISNSVILVER
        70        80        90       100       110       120       

                  150       160                 170       180      
pF1KSD LTRNSVY-----DSNLEAALECENWLEN----------QQGNQERHLREMFTHMNSLSEE
       .  ....     :.. .    ::. ::.          .    :.  :. : .  ::. .
XP_006 FLWDGLWYCRGEDTEGHWEWSCES-LESLAVPVAFTPVKTPVLEQWQRNGFGENISLNPD
       130       140       150        160       170       180      

        190                200         210       220       230     
pF1KSD TDHK---------HDVYWKSFNQKSVLITEDR--VPKGSYAFHTLEKSLKQKSNLMKKQR
         :.         :    ..  .:  : . ..  : .  :  .   :.....: :....:
XP_006 LPHQPMTPERQSPHTWGTRGKREKPDLNVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHR
        190       200       210       220       230       240      

         240       250       260       270       280       290     
pF1KSD TYKEKKPHKCNDCGELFTYHSVLIRHQRVHTGEKPYTCNECGKSFSHRANLTKHQRTHT-
       :.  ..:..:..: . :   :.: .:::.::::::: :..::..:.. : : .:::::: 
XP_006 THTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTG
        250       260       270       280       290       300      

          300       310       320       330       340       350    
pF1KSD RILFECSECKKTFTESSSLATHQRIHVGERPYECNECGKGFNRSTHLVQHQLIHTGVKPY
       .  .::::: :.:.  ::.. :.: :.::.::::.::::.: .: ::.::  :::: :::
XP_006 EKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPY
        310       320       330       340       350       360      

          360       370       380       390       400       410    
pF1KSD ECNECDKAFIHSSALIKHQRTHTGEKPYKCQECGKAFSHCSSLTKHQRVHTGEKPYECSE
       .:.:: ::: :::.: :::: :::::::.:.::::::.. . : .:::.:::::::::.:
XP_006 QCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGE
        370       380       390       400       410       420      

          420       430       440       450       460       470    
pF1KSD CGKTFSQSTHLVQHQRIHTGEKPYECNECGKTFSRSSNFAKHQRIHIGKKPYKCSECGKA
       :::.::::: :..:.::::::::: :::::::::.::....:.: : :.:::.::.::::
XP_006 CGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKA
        430       440       450       460       470       480      

          480       490       500       510       520              
pF1KSD FIHSSALIQHQRTHTGEKPFRCNECGKSFKCSSSLIRHQRVHTEEQP             
       : .:. : :::: ::::::..::.:::.:. :::: .:::.:: :.:             
XP_006 FRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQL
        490       500       510       520       530       540      

XP_006 APLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLS
        550       560       570       580       590       600      

>--
 initn: 1260 init1: 720 opt: 720  Z-score: 432.8  bits: 90.1 E(85289): 2.3e-17
Smith-Waterman score: 720; 67.2% identity (87.6% similar) in 137 aa overlap (326-462:534-670)

         300       310       320       330       340       350     
pF1KSD ILFECSECKKTFTESSSLATHQRIHVGERPYECNECGKGFNRSTHLVQHQLIHTGVKPYE
                                     ::::.::..:.. . :.::: :::: ::::
XP_006 KPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYE
           510       520       530       540       550       560   

         360       370       380       390       400       410     
pF1KSD CNECDKAFIHSSALIKHQRTHTGEKPYKCQECGKAFSHCSSLTKHQRVHTGEKPYECSEC
       ::.: .:: .:: ::.::: :: :::: :.::::.::: :::..:.:.::::::::: .:
XP_006 CNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDC
           570       580       590       600       610       620   

         420       430       440       450       460       470     
pF1KSD GKTFSQSTHLVQHQRIHTGEKPYECNECGKTFSRSSNFAKHQRIHIGKKPYKCSECGKAF
       ::.: :::::.::.::::::::: : .:::.:..::...:::: : :             
XP_006 GKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG             
           630       640       650       660       670             

         480       490       500       510       520 
pF1KSD IHSSALIQHQRTHTGEKPFRCNECGKSFKCSSSLIRHQRVHTEEQP




521 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Thu Nov  3 07:34:59 2016 done: Thu Nov  3 07:35:00 2016
 Total Scan time:  9.530 Total Display time:  0.120

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com