Result of FASTA (omim) for pF1KSDA1852
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA1852, 792 aa
  1>>>pF1KSDA1852 792 - 792 aa - 792 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9310+/-0.000981; mu= 14.5830+/- 0.060
 mean_var=341.2151+/-67.482, 0's: 0 Z-trim(110.0): 2107  B-trim: 107 in 1/49
 Lambda= 0.069432
 statistics sampled from 15943 (18287) to 15943 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.521), E-opt: 0.2 (0.214), width:  16
 Scan time:  9.170

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_079303 (OMIM: 613905) zinc finger protein 606 [ ( 792) 5674 584.6 5.7e-166
XP_005259333 (OMIM: 613905) PREDICTED: zinc finger ( 792) 5674 584.6 5.7e-166
NP_008886 (OMIM: 194522) zinc finger protein 33B i ( 778) 2138 230.4 2.4e-59
NP_001291962 (OMIM: 194522) zinc finger protein 33 ( 785) 2138 230.4 2.4e-59
NP_001265099 (OMIM: 194521) zinc finger protein 33 ( 817) 2101 226.7 3.2e-58
NP_001311107 (OMIM: 194521) zinc finger protein 33 ( 818) 2098 226.4 3.9e-58
XP_016872106 (OMIM: 194521) PREDICTED: zinc finger ( 818) 2098 226.4 3.9e-58
XP_011517953 (OMIM: 194521) PREDICTED: zinc finger ( 810) 2090 225.6 6.7e-58
NP_008905 (OMIM: 194521) zinc finger protein 33A i ( 810) 2090 225.6 6.7e-58
NP_008885 (OMIM: 194521) zinc finger protein 33A i ( 811) 2087 225.3 8.3e-58
XP_011517952 (OMIM: 194521) PREDICTED: zinc finger ( 811) 2087 225.3 8.3e-58
NP_001265102 (OMIM: 194521) zinc finger protein 33 ( 829) 2087 225.3 8.4e-58
NP_001265106 (OMIM: 194521) zinc finger protein 33 ( 832) 2087 225.3 8.4e-58
XP_016881867 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 650) 2038 220.2 2.2e-56
XP_011524841 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 686) 2038 220.3 2.3e-56
NP_689697 (OMIM: 613904) zinc finger protein 569 i ( 686) 2038 220.3 2.3e-56
XP_016881866 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 686) 2038 220.3 2.3e-56
XP_016881865 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 686) 2038 220.3 2.3e-56
XP_006723109 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 710) 2038 220.3 2.3e-56
XP_006723111 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 710) 2038 220.3 2.3e-56
XP_011524840 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 710) 2038 220.3 2.3e-56
XP_006723110 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 710) 2038 220.3 2.3e-56
XP_016881868 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 527) 1981 214.3 1.1e-54
XP_016881869 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 527) 1981 214.3 1.1e-54
NP_001317411 (OMIM: 613904) zinc finger protein 56 ( 527) 1981 214.3 1.1e-54
XP_016881871 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 527) 1981 214.3 1.1e-54
NP_001243580 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 744) 1980 214.5 1.3e-54
NP_001243583 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 744) 1980 214.5 1.3e-54
XP_016882699 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1980 214.6 1.4e-54
XP_016882696 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1980 214.6 1.4e-54
NP_001243577 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 1980 214.6 1.4e-54
XP_016882698 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1980 214.6 1.4e-54
XP_016882700 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1980 214.6 1.4e-54
XP_016882703 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1980 214.6 1.4e-54
XP_011526561 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1980 214.6 1.4e-54
XP_016882701 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1980 214.6 1.4e-54
XP_016882705 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1980 214.6 1.4e-54
XP_016882702 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1980 214.6 1.4e-54
NP_001243579 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 1980 214.6 1.4e-54
NP_001243578 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 1980 214.6 1.4e-54
XP_011526559 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1980 214.6 1.4e-54
XP_016882697 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1980 214.6 1.4e-54
XP_016882704 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1980 214.6 1.4e-54
NP_003414 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 is ( 809) 1980 214.6 1.4e-54
NP_001243582 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 818) 1980 214.6 1.4e-54
NP_001159354 (OMIM: 604753) zinc finger protein 26 ( 864) 1944 211.0 1.8e-53
NP_003406 (OMIM: 604753) zinc finger protein 268 i ( 947) 1944 211.1 1.8e-53
NP_001159353 (OMIM: 604753) zinc finger protein 26 ( 947) 1944 211.1 1.8e-53
NP_001305822 (OMIM: 602277) zinc finger protein 18 ( 675) 1937 210.1 2.5e-53
XP_011513163 (OMIM: 602277) PREDICTED: zinc finger ( 675) 1937 210.1 2.5e-53


>>NP_079303 (OMIM: 613905) zinc finger protein 606 [Homo  (792 aa)
 initn: 5674 init1: 5674 opt: 5674  Z-score: 3100.7  bits: 584.6 E(85289): 5.7e-166
Smith-Waterman score: 5674; 100.0% identity (100.0% similar) in 792 aa overlap (1-792:1-792)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MAAINPWASWGALTDQSWGMTAVDPWASWALCPQYPAWHVEGSLEEGRRATGLPAAQVQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 MAAINPWASWGALTDQSWGMTAVDPWASWALCPQYPAWHVEGSLEEGRRATGLPAAQVQE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD PVTFKDVAVDFTQEEWGQLDLVQRTLYRDVMLETYGHLLSVGNQIAKPEVISLLEQGEEP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 PVTFKDVAVDFTQEEWGQLDLVQRTLYRDVMLETYGHLLSVGNQIAKPEVISLLEQGEEP
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD WSVEQACPQRTCPEWVRNLESKALIPAQSIFEEEQSHGMKLERYIWDDPWFSRLEVLGCK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 WSVEQACPQRTCPEWVRNLESKALIPAQSIFEEEQSHGMKLERYIWDDPWFSRLEVLGCK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD DQLEMYHMNQSTAMRQMVFMQKQVLSQRSSEFCGLGAEFSQNLNFVPSQRVSQIEHFYKP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 DQLEMYHMNQSTAMRQMVFMQKQVLSQRSSEFCGLGAEFSQNLNFVPSQRVSQIEHFYKP
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD DTHAQSWRCDSAIMYADKVTCENNDYDKTVYQSIQPIYPARIQTGDNLFKCTDAVKSFNH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 DTHAQSWRCDSAIMYADKVTCENNDYDKTVYQSIQPIYPARIQTGDNLFKCTDAVKSFNH
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD IIHFGDHKGIHTGEKLYEYKECHQIFNQSPSFNEHPRLHVGENQYNYKEYENIFYFSSFM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 IIHFGDHKGIHTGEKLYEYKECHQIFNQSPSFNEHPRLHVGENQYNYKEYENIFYFSSFM
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD EHQKIGTVEKAYKYNEWEKVFGYDSFLTQHTSTYTAEKPYDYNECGTSFIWSSYLIQHKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 EHQKIGTVEKAYKYNEWEKVFGYDSFLTQHTSTYTAEKPYDYNECGTSFIWSSYLIQHKK
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD THTGEKPYECDKCGKVFRNRSALTKHERTHTGIKPYECNKCGKAFSWNSHLIVHKRIHTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 THTGEKPYECDKCGKVFRNRSALTKHERTHTGIKPYECNKCGKAFSWNSHLIVHKRIHTG
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD EKPYVCNECGKSFNWNSHLIGHQRTHTGEKPFECTECGKSFSWSSHLIAHMRMHTGEKPF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 EKPYVCNECGKSFNWNSHLIGHQRTHTGEKPFECTECGKSFSWSSHLIAHMRMHTGEKPF
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD KCDECEKAFRDYSALSKHERTHSGAKPYKCTECGKSFSWSSHLIAHQRTHTGEKPYNCQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 KCDECEKAFRDYSALSKHERTHSGAKPYKCTECGKSFSWSSHLIAHQRTHTGEKPYNCQE
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD CGKAFRERSALTKHEIIHSGIKPYECNKCGKSCSQMAHLVRHQRTHTGEKPYECNKCGKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 CGKAFRERSALTKHEIIHSGIKPYECNKCGKSCSQMAHLVRHQRTHTGEKPYECNKCGKS
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD FSQSCHLVAHRRIHTGEKPYKCNQCERSFNCSSHLIAHRRTHTGEKPYRCNECGKAFNES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 FSQSCHLVAHRRIHTGEKPYKCNQCERSFNCSSHLIAHRRTHTGEKPYRCNECGKAFNES
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD SSLIVHLRNHTGEKPYKCNHCEKAFCKNSSLIIHQRMHSGEKRFICSECGKAFSGHSALL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 SSLIVHLRNHTGEKPYKCNHCEKAFCKNSSLIIHQRMHSGEKRFICSECGKAFSGHSALL
              730       740       750       760       770       780

              790  
pF1KSD QHQRNHSEEKLN
       ::::::::::::
NP_079 QHQRNHSEEKLN
              790  

>>XP_005259333 (OMIM: 613905) PREDICTED: zinc finger pro  (792 aa)
 initn: 5674 init1: 5674 opt: 5674  Z-score: 3100.7  bits: 584.6 E(85289): 5.7e-166
Smith-Waterman score: 5674; 100.0% identity (100.0% similar) in 792 aa overlap (1-792:1-792)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MAAINPWASWGALTDQSWGMTAVDPWASWALCPQYPAWHVEGSLEEGRRATGLPAAQVQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MAAINPWASWGALTDQSWGMTAVDPWASWALCPQYPAWHVEGSLEEGRRATGLPAAQVQE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD PVTFKDVAVDFTQEEWGQLDLVQRTLYRDVMLETYGHLLSVGNQIAKPEVISLLEQGEEP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PVTFKDVAVDFTQEEWGQLDLVQRTLYRDVMLETYGHLLSVGNQIAKPEVISLLEQGEEP
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD WSVEQACPQRTCPEWVRNLESKALIPAQSIFEEEQSHGMKLERYIWDDPWFSRLEVLGCK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 WSVEQACPQRTCPEWVRNLESKALIPAQSIFEEEQSHGMKLERYIWDDPWFSRLEVLGCK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD DQLEMYHMNQSTAMRQMVFMQKQVLSQRSSEFCGLGAEFSQNLNFVPSQRVSQIEHFYKP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DQLEMYHMNQSTAMRQMVFMQKQVLSQRSSEFCGLGAEFSQNLNFVPSQRVSQIEHFYKP
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD DTHAQSWRCDSAIMYADKVTCENNDYDKTVYQSIQPIYPARIQTGDNLFKCTDAVKSFNH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DTHAQSWRCDSAIMYADKVTCENNDYDKTVYQSIQPIYPARIQTGDNLFKCTDAVKSFNH
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD IIHFGDHKGIHTGEKLYEYKECHQIFNQSPSFNEHPRLHVGENQYNYKEYENIFYFSSFM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 IIHFGDHKGIHTGEKLYEYKECHQIFNQSPSFNEHPRLHVGENQYNYKEYENIFYFSSFM
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD EHQKIGTVEKAYKYNEWEKVFGYDSFLTQHTSTYTAEKPYDYNECGTSFIWSSYLIQHKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EHQKIGTVEKAYKYNEWEKVFGYDSFLTQHTSTYTAEKPYDYNECGTSFIWSSYLIQHKK
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD THTGEKPYECDKCGKVFRNRSALTKHERTHTGIKPYECNKCGKAFSWNSHLIVHKRIHTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 THTGEKPYECDKCGKVFRNRSALTKHERTHTGIKPYECNKCGKAFSWNSHLIVHKRIHTG
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD EKPYVCNECGKSFNWNSHLIGHQRTHTGEKPFECTECGKSFSWSSHLIAHMRMHTGEKPF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EKPYVCNECGKSFNWNSHLIGHQRTHTGEKPFECTECGKSFSWSSHLIAHMRMHTGEKPF
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD KCDECEKAFRDYSALSKHERTHSGAKPYKCTECGKSFSWSSHLIAHQRTHTGEKPYNCQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KCDECEKAFRDYSALSKHERTHSGAKPYKCTECGKSFSWSSHLIAHQRTHTGEKPYNCQE
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD CGKAFRERSALTKHEIIHSGIKPYECNKCGKSCSQMAHLVRHQRTHTGEKPYECNKCGKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 CGKAFRERSALTKHEIIHSGIKPYECNKCGKSCSQMAHLVRHQRTHTGEKPYECNKCGKS
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD FSQSCHLVAHRRIHTGEKPYKCNQCERSFNCSSHLIAHRRTHTGEKPYRCNECGKAFNES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 FSQSCHLVAHRRIHTGEKPYKCNQCERSFNCSSHLIAHRRTHTGEKPYRCNECGKAFNES
              670       680       690       700       710       720

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pF1KSD SSLIVHLRNHTGEKPYKCNHCEKAFCKNSSLIIHQRMHSGEKRFICSECGKAFSGHSALL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SSLIVHLRNHTGEKPYKCNHCEKAFCKNSSLIIHQRMHSGEKRFICSECGKAFSGHSALL
              730       740       750       760       770       780

              790  
pF1KSD QHQRNHSEEKLN
       ::::::::::::
XP_005 QHQRNHSEEKLN
              790  

>>NP_008886 (OMIM: 194522) zinc finger protein 33B isofo  (778 aa)
 initn: 1820 init1: 1820 opt: 2138  Z-score: 1186.6  bits: 230.4 E(85289): 2.4e-59
Smith-Waterman score: 2138; 43.3% identity (69.3% similar) in 753 aa overlap (57-790:7-747)

         30        40        50        60        70        80      
pF1KSD ASWALCPQYPAWHVEGSLEEGRRATGLPAAQVQEPVTFKDVAVDFTQEEWGQLDLVQRTL
                                     . :  :.::::.: :::::: .::  ::.:
NP_008                         MNKVDQKFQGSVSFKDVTVGFTQEEWQHLDPSQRAL
                                       10        20        30      

         90       100       110       120       130                
pF1KSD YRDVMLETYGHLLSVGNQIAKPEVISLLEQGEEPWSVEQACPQRTCPE-WV------RNL
       :::::::.:..:.:::    :::::  :::::::: .:.  :... :: :.      :. 
NP_008 YRDVMLENYSNLVSVGYCAHKPEVIFRLEQGEEPWRLEEEFPSQSFPEVWTADHLKERSQ
         40        50        60        70        80        90      

     140             150       160       170       180       190   
pF1KSD ESKA------LIPAQSIFEEEQSHGMKLERYIWDDPWFSRLEVLGCKDQLEMYHMNQSTA
       :...      ..  . .. .::.. . .  .  :   :   ... :  : .   :. .: 
NP_008 ENQSKHLWEVVFINNEMLTKEQGNVIGIP-FNMDVSSFPSRKMF-C--QYDSRGMSFNT-
        100       110       120        130        140         150  

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pF1KSD MRQMVFMQKQVLSQRSSEFCGLGAEFSQNLNFVPSQRVSQIEHFYKPDTHAQSWRCDSAI
       . ..:. . . :...:.:: . :  .   ::.  ..  .. ..    . .. : : ..  
NP_008 VSELVISKINYLGKKSDEFNACGKLL---LNIKHDETHTREKNEVLKNRNTLSHRENT--
             160       170          180       190       200        

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pF1KSD MYADKVTCENNDYDKTVYQSI---QPIYPARIQTGDNLFKC--TDAVKSFNHIIHFGDHK
       .  .:.   ..... .. :     . .. .: . . .  .:  ..  ..:     .  :.
NP_008 LQHEKIQTLDHNFEYSICQETLLEKAVFNTRKRENAEENNCDYNEFGRTFCDSSSLLFHQ
        210       220       230       240       250       260      

      310       320       330       340       350       360        
pF1KSD GIHTGEKLYEYKECHQIFNQSPSFNEHPRLHVGENQYNYKEYENIFYFSSFMEH-QKIGT
          . .. ::...:....  . ....:  . :  ..:.  :  : :  .  . . ::   
NP_008 IPPSKDSHYEFSDCEKFLCVKSTLSKHDGVPV--KHYDCGESGNNFRRKLCLSQLQKGDK
        270       280       290         300       310       320    

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pF1KSD VEKAYKYNEWEKVFGYDSFLTQHTSTYTAEKPYDYNECGTSFIWSSYLIQHKKTHTGEKP
        :: .. ::  :.:   : ::.:  ..:.:: .. :.:: .:  .: : .:...::::::
NP_008 GEKHFECNECGKAFWEKSHLTRHQRVHTGEKHFQCNQCGKTFWEKSNLTKHQRSHTGEKP
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pF1KSD YECDKCGKVFRNRSALTKHERTHTGIKPYECNKCGKAFSWNSHLIVHKRIHTGEKPYVCN
       .::..:::.: ..:::: :.::::: :::.:: :::.:  .: :  :.: :::.::: : 
NP_008 FECNECGKAFSHKSALTLHQRTHTGEKPYQCNACGKTFYQKSDLTKHQRTHTGQKPYECY
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pF1KSD ECGKSFNWNSHLIGHQRTHTGEKPFECTECGKSFSWSSHLIAHMRMHTGEKPFKCDECEK
       ::::::  ::::  ::::::::::::: ::::::  .:::  :.: : :.::..:. : :
NP_008 ECGKSFCMNSHLTVHQRTHTGEKPFECLECGKSFCQKSHLTQHQRTHIGDKPYECNACGK
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pF1KSD AFRDYSALSKHERTHSGAKPYKCTECGKSFSWSSHLIAHQRTHTGEKPYNCQECGKAFRE
       .:   :.:..:.  :.: :::.: ::::.:  .: :  ::::::::::. : :::: : .
NP_008 TFYHKSVLTRHQIIHTGLKPYECYECGKTFCLKSDLTIHQRTHTGEKPFACPECGKFFSH
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pF1KSD RSALTKHEIIHSGIKPYECNKCGKSCSQMAHLVRHQRTHTGEKPYECNKCGKSFSQSCHL
       .:.:..:   :.: :::::..:::   . ..:..:.::::::::::::.:::.: :. .:
NP_008 KSTLSQHYRTHTGEKPYECHECGKIFYNKSYLTKHNRTHTGEKPYECNECGKTFCQKSQL
          570       580       590       600       610       620    

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pF1KSD VAHRRIHTGEKPYKCNQCERSFNCSSHLIAHRRTHTGEKPYRCNECGKAFNESSSLIVHL
       . :.::: :::::.::.: ..:  .: ::.:.:::: ::::.::::::.:  .:.::.: 
NP_008 TQHQRIHIGEKPYECNECGKAFCHKSALIVHQRTHTQEKPYKCNECGKSFCVKSGLILHE
          630       640       650       660       670       680    

       730       740       750       760       770       780       
pF1KSD RNHTGEKPYKCNHCEKAFCKNSSLIIHQRMHSGEKRFICSECGKAFSGHSALLQHQRNHS
       :.:::::::.::.: :.: ..::: .:.: :.:::   :.:::: :  .: : .:::.:.
NP_008 RKHTGEKPYECNECGKSFSHKSSLTVHHRAHTGEKSCQCNECGKIFYRKSDLAKHQRSHT
          690       700       710       720       730       740    

       790                               
pF1KSD EEKLN                             
        ::                               
NP_008 GEKPYECNTCRKTFSQKSNLIVHQRTHIGEKPYE
          750       760       770        

>>NP_001291962 (OMIM: 194522) zinc finger protein 33B is  (785 aa)
 initn: 1820 init1: 1820 opt: 2138  Z-score: 1186.5  bits: 230.4 E(85289): 2.4e-59
Smith-Waterman score: 2138; 43.3% identity (69.3% similar) in 753 aa overlap (57-790:14-754)

         30        40        50        60        70        80      
pF1KSD ASWALCPQYPAWHVEGSLEEGRRATGLPAAQVQEPVTFKDVAVDFTQEEWGQLDLVQRTL
                                     . :  :.::::.: :::::: .::  ::.:
NP_001                  MANATRRESEVDQKFQGSVSFKDVTVGFTQEEWQHLDPSQRAL
                                10        20        30        40   

         90       100       110       120       130                
pF1KSD YRDVMLETYGHLLSVGNQIAKPEVISLLEQGEEPWSVEQACPQRTCPE-WV------RNL
       :::::::.:..:.:::    :::::  :::::::: .:.  :... :: :.      :. 
NP_001 YRDVMLENYSNLVSVGYCAHKPEVIFRLEQGEEPWRLEEEFPSQSFPEVWTADHLKERSQ
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     140             150       160       170       180       190   
pF1KSD ESKA------LIPAQSIFEEEQSHGMKLERYIWDDPWFSRLEVLGCKDQLEMYHMNQSTA
       :...      ..  . .. .::.. . .  .  :   :   ... :  : .   :. .: 
NP_001 ENQSKHLWEVVFINNEMLTKEQGNVIGIP-FNMDVSSFPSRKMF-C--QYDSRGMSFNT-
           110       120       130        140          150         

           200       210       220       230       240       250   
pF1KSD MRQMVFMQKQVLSQRSSEFCGLGAEFSQNLNFVPSQRVSQIEHFYKPDTHAQSWRCDSAI
       . ..:. . . :...:.:: . :  .   ::.  ..  .. ..    . .. : : ..  
NP_001 VSELVISKINYLGKKSDEFNACGKLL---LNIKHDETHTREKNEVLKNRNTLSHRENT--
      160       170       180          190       200       210     

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pF1KSD MYADKVTCENNDYDKTVYQSI---QPIYPARIQTGDNLFKC--TDAVKSFNHIIHFGDHK
       .  .:.   ..... .. :     . .. .: . . .  .:  ..  ..:     .  :.
NP_001 LQHEKIQTLDHNFEYSICQETLLEKAVFNTRKRENAEENNCDYNEFGRTFCDSSSLLFHQ
           220       230       240       250       260       270   

      310       320       330       340       350       360        
pF1KSD GIHTGEKLYEYKECHQIFNQSPSFNEHPRLHVGENQYNYKEYENIFYFSSFMEH-QKIGT
          . .. ::...:....  . ....:  . :  ..:.  :  : :  .  . . ::   
NP_001 IPPSKDSHYEFSDCEKFLCVKSTLSKHDGVPV--KHYDCGESGNNFRRKLCLSQLQKGDK
           280       290       300         310       320       330 

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pF1KSD VEKAYKYNEWEKVFGYDSFLTQHTSTYTAEKPYDYNECGTSFIWSSYLIQHKKTHTGEKP
        :: .. ::  :.:   : ::.:  ..:.:: .. :.:: .:  .: : .:...::::::
NP_001 GEKHFECNECGKAFWEKSHLTRHQRVHTGEKHFQCNQCGKTFWEKSNLTKHQRSHTGEKP
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pF1KSD YECDKCGKVFRNRSALTKHERTHTGIKPYECNKCGKAFSWNSHLIVHKRIHTGEKPYVCN
       .::..:::.: ..:::: :.::::: :::.:: :::.:  .: :  :.: :::.::: : 
NP_001 FECNECGKAFSHKSALTLHQRTHTGEKPYQCNACGKTFYQKSDLTKHQRTHTGQKPYECY
             400       410       420       430       440       450 

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pF1KSD ECGKSFNWNSHLIGHQRTHTGEKPFECTECGKSFSWSSHLIAHMRMHTGEKPFKCDECEK
       ::::::  ::::  ::::::::::::: ::::::  .:::  :.: : :.::..:. : :
NP_001 ECGKSFCMNSHLTVHQRTHTGEKPFECLECGKSFCQKSHLTQHQRTHIGDKPYECNACGK
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pF1KSD AFRDYSALSKHERTHSGAKPYKCTECGKSFSWSSHLIAHQRTHTGEKPYNCQECGKAFRE
       .:   :.:..:.  :.: :::.: ::::.:  .: :  ::::::::::. : :::: : .
NP_001 TFYHKSVLTRHQIIHTGLKPYECYECGKTFCLKSDLTIHQRTHTGEKPFACPECGKFFSH
             520       530       540       550       560       570 

       610       620       630       640       650       660       
pF1KSD RSALTKHEIIHSGIKPYECNKCGKSCSQMAHLVRHQRTHTGEKPYECNKCGKSFSQSCHL
       .:.:..:   :.: :::::..:::   . ..:..:.::::::::::::.:::.: :. .:
NP_001 KSTLSQHYRTHTGEKPYECHECGKIFYNKSYLTKHNRTHTGEKPYECNECGKTFCQKSQL
             580       590       600       610       620       630 

       670       680       690       700       710       720       
pF1KSD VAHRRIHTGEKPYKCNQCERSFNCSSHLIAHRRTHTGEKPYRCNECGKAFNESSSLIVHL
       . :.::: :::::.::.: ..:  .: ::.:.:::: ::::.::::::.:  .:.::.: 
NP_001 TQHQRIHIGEKPYECNECGKAFCHKSALIVHQRTHTQEKPYKCNECGKSFCVKSGLILHE
             640       650       660       670       680       690 

       730       740       750       760       770       780       
pF1KSD RNHTGEKPYKCNHCEKAFCKNSSLIIHQRMHSGEKRFICSECGKAFSGHSALLQHQRNHS
       :.:::::::.::.: :.: ..::: .:.: :.:::   :.:::: :  .: : .:::.:.
NP_001 RKHTGEKPYECNECGKSFSHKSSLTVHHRAHTGEKSCQCNECGKIFYRKSDLAKHQRSHT
             700       710       720       730       740       750 

       790                               
pF1KSD EEKLN                             
        ::                               
NP_001 GEKPYECNTCRKTFSQKSNLIVHQRTHIGEKPYE
             760       770       780     

>>NP_001265099 (OMIM: 194521) zinc finger protein 33A is  (817 aa)
 initn: 1785 init1: 1785 opt: 2101  Z-score: 1166.3  bits: 226.7 E(85289): 3.2e-58
Smith-Waterman score: 2114; 44.0% identity (68.4% similar) in 769 aa overlap (48-790:6-753)

        20        30        40        50        60        70       
pF1KSD WGMTAVDPWASWALCPQYPAWHVEGSLEEGRRATGLPAAQVQEPVTFKDVAVDFTQEEWG
                                     ::..:.   . :: :.::::.: :::::: 
NP_001                          MANATRRGSGVEQ-KSQESVSFKDVTVGFTQEEWQ
                                        10         20        30    

        80        90       100       110       120       130       
pF1KSD QLDLVQRTLYRDVMLETYGHLLSVGNQIAKPEVISLLEQGEEPWSVEQACPQRTCPEWV-
       .::  ::.::::::::.:..:.:::  . :::::  :.::::::. :.  :... : :. 
NP_001 HLDPSQRALYRDVMLENYSNLVSVGYCVHKPEVIFRLQQGEEPWKQEEEFPSQSFPVWTA
           40        50        60        70        80        90    

             140             150       160       170       180     
pF1KSD -----RNLESKA------LIPAQSIFEEEQSHGMKLERYIWDDPWFSRLEVLGCKDQLEM
            :. :...      ..  . .. .::.  . .   .  . . ::     : :.  :
NP_001 DHLKERSQENQSKHLWEVVFINNEMLTKEQGDVIGIPFNVDVSSFPSRKMFCQC-DSCGM
          100       110       120       130       140        150   

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pF1KSD YHMNQSTAMRQMVFMQKQVLSQRSSEF--CG---LGAEF----SQNLNFVPSQRVSQIEH
           . ... ..:. . . :...:.::  ::   :. .     .:. : : ..: . . :
NP_001 ----SFNTVSELVISKINYLGKKSDEFNACGKLLLNIKHDETHTQEKNEVLKNR-NTLSH
               160       170       180       190       200         

        240       250       260       270       280        290     
pF1KSD FYKPDTHAQSWRCDSAIMYADKVTCENNDYDKTVYQSIQPIYPARIQTGD-NLFK---CT
         .   : .    .  . :.    :...  .:.:... :    :. .. : : :    : 
NP_001 HEETLQHEKIQTLEHNFEYS---ICQETLLEKAVFNT-QKRENAEENNCDYNEFGRTLCD
      210       220          230       240        250       260    

            300       310       320       330       340       350  
pF1KSD DAVKSFNHIIHFGDHKGIHTGEKLYEYKECHQIFNQSPSFNEHPRLHVGENQYNYKEYEN
       ..   :..:    :..        ::...:....  . .... :.  :. ..:.  :  :
NP_001 SSSLLFHQISPSRDNH--------YEFSDCEKFLCVKSTLSK-PH-GVSMKHYDCGESGN
          270       280               290        300        310    

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pF1KSD IFYFSSFMEH-QKIGTVEKAYKYNEWEKVFGYDSFLTQHTSTYTAEKPYDYNECGTSFIW
        :  .  . : ::    :: .. ::  :.:   : ::.:  ..:..::.. :::  .:  
NP_001 NFRRKLCLSHLQKGDKGEKHFECNECGKAFWEKSHLTRHQRVHTGQKPFQCNECEKAFWD
          320       330       340       350       360       370    

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pF1KSD SSYLIQHKKTHTGEKPYECDKCGKVFRNRSALTKHERTHTGIKPYECNKCGKAFSWNSHL
       .: : .:...::::::.::..:::.: ..:::: :.::::: :::.:: :::.:  .: :
NP_001 KSNLTKHQRSHTGEKPFECNECGKAFSHKSALTLHQRTHTGEKPYQCNACGKTFCQKSDL
          380       390       400       410       420       430    

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pF1KSD IVHKRIHTGEKPYVCNECGKSFNWNSHLIGHQRTHTGEKPFECTECGKSFSWSSHLIAHM
         :.: ::: ::: : ::::::  .:::  ::::::::::::: ::::::: .:.:  :.
NP_001 TKHQRTHTGLKPYECYECGKSFRVTSHLKVHQRTHTGEKPFECLECGKSFSEKSNLTQHQ
          440       450       460       470       480       490    

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pF1KSD RMHTGEKPFKCDECEKAFRDYSALSKHERTHSGAKPYKCTECGKSFSWSSHLIAHQRTHT
       :.: :.: ..:. : :.:   : :..:.  :.: :::.: ::::.:  .: : .::::::
NP_001 RIHIGDKSYECNACGKTFYHKSLLTRHQIIHTGWKPYECYECGKTFCLKSDLTVHQRTHT
          500       510       520       530       540       550    

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pF1KSD GEKPYNCQECGKAFRERSALTKHEIIHSGIKPYECNKCGKSCSQMAHLVRHQRTHTGEKP
       :.::. : :::: : ..:.:..:   :.: :::::..:::   . ..:..:.::::::::
NP_001 GQKPFACPECGKFFSHKSTLSQHYRTHTGEKPYECHECGKIFYNKSYLTKHNRTHTGEKP
          560       570       580       590       600       610    

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pF1KSD YECNKCGKSFSQSCHLVAHRRIHTGEKPYKCNQCERSFNCSSHLIAHRRTHTGEKPYRCN
       ::::.:::.: :. .:. :.::: ::::::::.: ..:  .: ::.:.:::: ::::.::
NP_001 YECNECGKAFYQKSQLTQHQRIHIGEKPYKCNECGKAFCHKSALIVHQRTHTQEKPYKCN
          620       630       640       650       660       670    

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pF1KSD ECGKAFNESSSLIVHLRNHTGEKPYKCNHCEKAFCKNSSLIIHQRMHSGEKRFICSECGK
       ::::.:  .:.:: : :.:::::::.::.: : : ..::: .:.: :.:::   :.::::
NP_001 ECGKSFCVKSGLIFHERKHTGEKPYECNECGKFFRHKSSLTVHHRAHTGEKSCQCNECGK
          680       690       700       710       720       730    

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pF1KSD AFSGHSALLQHQRNHSEEKLN                                       
        :  .: : ::::.:. ::                                         
NP_001 IFYRKSELAQHQRSHTGEKPYECNTCRKTFSQKSNLIVHQRRHIGENLMNEMDIRNFQPQ
          740       750       760       770       780       790    

>>NP_001311107 (OMIM: 194521) zinc finger protein 33A is  (818 aa)
 initn: 1785 init1: 1785 opt: 2098  Z-score: 1164.7  bits: 226.4 E(85289): 3.9e-58
Smith-Waterman score: 2111; 44.0% identity (68.4% similar) in 770 aa overlap (48-790:6-754)

        20        30        40        50        60        70       
pF1KSD WGMTAVDPWASWALCPQYPAWHVEGSLEEGRRATGLPAAQVQEPVTFKDVAVDFTQEEWG
                                     ::..:.   . :: :.::::.: :::::: 
NP_001                          MANATRRGSGVEQ-KSQESVSFKDVTVGFTQEEWQ
                                        10         20        30    

        80        90       100       110       120       130       
pF1KSD QLDLVQRTLYRDVMLETYGHLLSVGNQIAKPEVISLLEQGEEPWSVEQACPQRTCPE-WV
       .::  ::.::::::::.:..:.:::  . :::::  :.::::::. :.  :... :: :.
NP_001 HLDPSQRALYRDVMLENYSNLVSVGYCVHKPEVIFRLQQGEEPWKQEEEFPSQSFPEVWT
           40        50        60        70        80        90    

              140             150       160       170       180    
pF1KSD ------RNLESKA------LIPAQSIFEEEQSHGMKLERYIWDDPWFSRLEVLGCKDQLE
             :. :...      ..  . .. .::.  . .   .  . . ::     : :.  
NP_001 ADHLKERSQENQSKHLWEVVFINNEMLTKEQGDVIGIPFNVDVSSFPSRKMFCQC-DSCG
          100       110       120       130       140        150   

          190       200       210                220       230     
pF1KSD MYHMNQSTAMRQMVFMQKQVLSQRSSEF--CG---LGAEF----SQNLNFVPSQRVSQIE
       :    . ... ..:. . . :...:.::  ::   :. .     .:. : : ..: . . 
NP_001 M----SFNTVSELVISKINYLGKKSDEFNACGKLLLNIKHDETHTQEKNEVLKNR-NTLS
               160       170       180       190       200         

         240       250       260       270       280        290    
pF1KSD HFYKPDTHAQSWRCDSAIMYADKVTCENNDYDKTVYQSIQPIYPARIQTGD-NLFK---C
       :  .   : .    .  . :.    :...  .:.:... :    :. .. : : :    :
NP_001 HHEETLQHEKIQTLEHNFEYS---ICQETLLEKAVFNT-QKRENAEENNCDYNEFGRTLC
      210       220          230       240        250       260    

             300       310       320       330       340       350 
pF1KSD TDAVKSFNHIIHFGDHKGIHTGEKLYEYKECHQIFNQSPSFNEHPRLHVGENQYNYKEYE
        ..   :..:    :..        ::...:....  . .... :.  :. ..:.  :  
NP_001 DSSSLLFHQISPSRDNH--------YEFSDCEKFLCVKSTLSK-PH-GVSMKHYDCGESG
          270       280               290        300        310    

             360        370       380       390       400       410
pF1KSD NIFYFSSFMEH-QKIGTVEKAYKYNEWEKVFGYDSFLTQHTSTYTAEKPYDYNECGTSFI
       : :  .  . : ::    :: .. ::  :.:   : ::.:  ..:..::.. :::  .: 
NP_001 NNFRRKLCLSHLQKGDKGEKHFECNECGKAFWEKSHLTRHQRVHTGQKPFQCNECEKAFW
          320       330       340       350       360       370    

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pF1KSD WSSYLIQHKKTHTGEKPYECDKCGKVFRNRSALTKHERTHTGIKPYECNKCGKAFSWNSH
        .: : .:...::::::.::..:::.: ..:::: :.::::: :::.:: :::.:  .: 
NP_001 DKSNLTKHQRSHTGEKPFECNECGKAFSHKSALTLHQRTHTGEKPYQCNACGKTFCQKSD
          380       390       400       410       420       430    

              480       490       500       510       520       530
pF1KSD LIVHKRIHTGEKPYVCNECGKSFNWNSHLIGHQRTHTGEKPFECTECGKSFSWSSHLIAH
       :  :.: ::: ::: : ::::::  .:::  ::::::::::::: ::::::: .:.:  :
NP_001 LTKHQRTHTGLKPYECYECGKSFRVTSHLKVHQRTHTGEKPFECLECGKSFSEKSNLTQH
          440       450       460       470       480       490    

              540       550       560       570       580       590
pF1KSD MRMHTGEKPFKCDECEKAFRDYSALSKHERTHSGAKPYKCTECGKSFSWSSHLIAHQRTH
       .:.: :.: ..:. : :.:   : :..:.  :.: :::.: ::::.:  .: : .:::::
NP_001 QRIHIGDKSYECNACGKTFYHKSLLTRHQIIHTGWKPYECYECGKTFCLKSDLTVHQRTH
          500       510       520       530       540       550    

              600       610       620       630       640       650
pF1KSD TGEKPYNCQECGKAFRERSALTKHEIIHSGIKPYECNKCGKSCSQMAHLVRHQRTHTGEK
       ::.::. : :::: : ..:.:..:   :.: :::::..:::   . ..:..:.:::::::
NP_001 TGQKPFACPECGKFFSHKSTLSQHYRTHTGEKPYECHECGKIFYNKSYLTKHNRTHTGEK
          560       570       580       590       600       610    

              660       670       680       690       700       710
pF1KSD PYECNKCGKSFSQSCHLVAHRRIHTGEKPYKCNQCERSFNCSSHLIAHRRTHTGEKPYRC
       :::::.:::.: :. .:. :.::: ::::::::.: ..:  .: ::.:.:::: ::::.:
NP_001 PYECNECGKAFYQKSQLTQHQRIHIGEKPYKCNECGKAFCHKSALIVHQRTHTQEKPYKC
          620       630       640       650       660       670    

              720       730       740       750       760       770
pF1KSD NECGKAFNESSSLIVHLRNHTGEKPYKCNHCEKAFCKNSSLIIHQRMHSGEKRFICSECG
       :::::.:  .:.:: : :.:::::::.::.: : : ..::: .:.: :.:::   :.:::
NP_001 NECGKSFCVKSGLIFHERKHTGEKPYECNECGKFFRHKSSLTVHHRAHTGEKSCQCNECG
          680       690       700       710       720       730    

              780       790                                        
pF1KSD KAFSGHSALLQHQRNHSEEKLN                                      
       : :  .: : ::::.:. ::                                        
NP_001 KIFYRKSELAQHQRSHTGEKPYECNTCRKTFSQKSNLIVHQRRHIGENLMNEMDIRNFQP
          740       750       760       770       780       790    

>>XP_016872106 (OMIM: 194521) PREDICTED: zinc finger pro  (818 aa)
 initn: 1785 init1: 1785 opt: 2098  Z-score: 1164.7  bits: 226.4 E(85289): 3.9e-58
Smith-Waterman score: 2111; 44.0% identity (68.4% similar) in 770 aa overlap (48-790:6-754)

        20        30        40        50        60        70       
pF1KSD WGMTAVDPWASWALCPQYPAWHVEGSLEEGRRATGLPAAQVQEPVTFKDVAVDFTQEEWG
                                     ::..:.   . :: :.::::.: :::::: 
XP_016                          MANATRRGSGVEQ-KSQESVSFKDVTVGFTQEEWQ
                                        10         20        30    

        80        90       100       110       120       130       
pF1KSD QLDLVQRTLYRDVMLETYGHLLSVGNQIAKPEVISLLEQGEEPWSVEQACPQRTCPE-WV
       .::  ::.::::::::.:..:.:::  . :::::  :.::::::. :.  :... :: :.
XP_016 HLDPSQRALYRDVMLENYSNLVSVGYCVHKPEVIFRLQQGEEPWKQEEEFPSQSFPEVWT
           40        50        60        70        80        90    

              140             150       160       170       180    
pF1KSD ------RNLESKA------LIPAQSIFEEEQSHGMKLERYIWDDPWFSRLEVLGCKDQLE
             :. :...      ..  . .. .::.  . .   .  . . ::     : :.  
XP_016 ADHLKERSQENQSKHLWEVVFINNEMLTKEQGDVIGIPFNVDVSSFPSRKMFCQC-DSCG
          100       110       120       130       140        150   

          190       200       210                220       230     
pF1KSD MYHMNQSTAMRQMVFMQKQVLSQRSSEF--CG---LGAEF----SQNLNFVPSQRVSQIE
       :    . ... ..:. . . :...:.::  ::   :. .     .:. : : ..: . . 
XP_016 M----SFNTVSELVISKINYLGKKSDEFNACGKLLLNIKHDETHTQEKNEVLKNR-NTLS
               160       170       180       190       200         

         240       250       260       270       280        290    
pF1KSD HFYKPDTHAQSWRCDSAIMYADKVTCENNDYDKTVYQSIQPIYPARIQTGD-NLFK---C
       :  .   : .    .  . :.    :...  .:.:... :    :. .. : : :    :
XP_016 HHEETLQHEKIQTLEHNFEYS---ICQETLLEKAVFNT-QKRENAEENNCDYNEFGRTLC
      210       220          230       240        250       260    

             300       310       320       330       340       350 
pF1KSD TDAVKSFNHIIHFGDHKGIHTGEKLYEYKECHQIFNQSPSFNEHPRLHVGENQYNYKEYE
        ..   :..:    :..        ::...:....  . .... :.  :. ..:.  :  
XP_016 DSSSLLFHQISPSRDNH--------YEFSDCEKFLCVKSTLSK-PH-GVSMKHYDCGESG
          270       280               290        300        310    

             360        370       380       390       400       410
pF1KSD NIFYFSSFMEH-QKIGTVEKAYKYNEWEKVFGYDSFLTQHTSTYTAEKPYDYNECGTSFI
       : :  .  . : ::    :: .. ::  :.:   : ::.:  ..:..::.. :::  .: 
XP_016 NNFRRKLCLSHLQKGDKGEKHFECNECGKAFWEKSHLTRHQRVHTGQKPFQCNECEKAFW
          320       330       340       350       360       370    

              420       430       440       450       460       470
pF1KSD WSSYLIQHKKTHTGEKPYECDKCGKVFRNRSALTKHERTHTGIKPYECNKCGKAFSWNSH
        .: : .:...::::::.::..:::.: ..:::: :.::::: :::.:: :::.:  .: 
XP_016 DKSNLTKHQRSHTGEKPFECNECGKAFSHKSALTLHQRTHTGEKPYQCNACGKTFCQKSD
          380       390       400       410       420       430    

              480       490       500       510       520       530
pF1KSD LIVHKRIHTGEKPYVCNECGKSFNWNSHLIGHQRTHTGEKPFECTECGKSFSWSSHLIAH
       :  :.: ::: ::: : ::::::  .:::  ::::::::::::: ::::::: .:.:  :
XP_016 LTKHQRTHTGLKPYECYECGKSFRVTSHLKVHQRTHTGEKPFECLECGKSFSEKSNLTQH
          440       450       460       470       480       490    

              540       550       560       570       580       590
pF1KSD MRMHTGEKPFKCDECEKAFRDYSALSKHERTHSGAKPYKCTECGKSFSWSSHLIAHQRTH
       .:.: :.: ..:. : :.:   : :..:.  :.: :::.: ::::.:  .: : .:::::
XP_016 QRIHIGDKSYECNACGKTFYHKSLLTRHQIIHTGWKPYECYECGKTFCLKSDLTVHQRTH
          500       510       520       530       540       550    

              600       610       620       630       640       650
pF1KSD TGEKPYNCQECGKAFRERSALTKHEIIHSGIKPYECNKCGKSCSQMAHLVRHQRTHTGEK
       ::.::. : :::: : ..:.:..:   :.: :::::..:::   . ..:..:.:::::::
XP_016 TGQKPFACPECGKFFSHKSTLSQHYRTHTGEKPYECHECGKIFYNKSYLTKHNRTHTGEK
          560       570       580       590       600       610    

              660       670       680       690       700       710
pF1KSD PYECNKCGKSFSQSCHLVAHRRIHTGEKPYKCNQCERSFNCSSHLIAHRRTHTGEKPYRC
       :::::.:::.: :. .:. :.::: ::::::::.: ..:  .: ::.:.:::: ::::.:
XP_016 PYECNECGKAFYQKSQLTQHQRIHIGEKPYKCNECGKAFCHKSALIVHQRTHTQEKPYKC
          620       630       640       650       660       670    

              720       730       740       750       760       770
pF1KSD NECGKAFNESSSLIVHLRNHTGEKPYKCNHCEKAFCKNSSLIIHQRMHSGEKRFICSECG
       :::::.:  .:.:: : :.:::::::.::.: : : ..::: .:.: :.:::   :.:::
XP_016 NECGKSFCVKSGLIFHERKHTGEKPYECNECGKFFRHKSSLTVHHRAHTGEKSCQCNECG
          680       690       700       710       720       730    

              780       790                                        
pF1KSD KAFSGHSALLQHQRNHSEEKLN                                      
       : :  .: : ::::.:. ::                                        
XP_016 KIFYRKSELAQHQRSHTGEKPYECNTCRKTFSQKSNLIVHQRRHIGENLMNEMDIRNFQP
          740       750       760       770       780       790    

>>XP_011517953 (OMIM: 194521) PREDICTED: zinc finger pro  (810 aa)
 initn: 1785 init1: 1785 opt: 2090  Z-score: 1160.4  bits: 225.6 E(85289): 6.7e-58
Smith-Waterman score: 2103; 44.2% identity (68.5% similar) in 758 aa overlap (59-790:9-746)

       30        40        50        60        70        80        
pF1KSD WALCPQYPAWHVEGSLEEGRRATGLPAAQVQEPVTFKDVAVDFTQEEWGQLDLVQRTLYR
                                     :: :.::::.: :::::: .::  ::.:::
XP_011                       MNKVEQKSQESVSFKDVTVGFTQEEWQHLDPSQRALYR
                                     10        20        30        

       90       100       110       120       130             140  
pF1KSD DVMLETYGHLLSVGNQIAKPEVISLLEQGEEPWSVEQACPQRTCPEWV------RNLESK
       :::::.:..:.:::  . :::::  :.::::::. :.  :... : :.      :. :..
XP_011 DVMLENYSNLVSVGYCVHKPEVIFRLQQGEEPWKQEEEFPSQSFPVWTADHLKERSQENQ
       40        50        60        70        80        90        

                  150       160       170       180       190      
pF1KSD A------LIPAQSIFEEEQSHGMKLERYIWDDPWFSRLEVLGCKDQLEMYHMNQSTAMRQ
       .      ..  . .. .::.  . .   .  . . ::     : :.  :    . ... .
XP_011 SKHLWEVVFINNEMLTKEQGDVIGIPFNVDVSSFPSRKMFCQC-DSCGM----SFNTVSE
      100       110       120       130       140            150   

        200       210                220       230       240       
pF1KSD MVFMQKQVLSQRSSEF--CG---LGAEF----SQNLNFVPSQRVSQIEHFYKPDTHAQSW
       .:. . . :...:.::  ::   :. .     .:. : : ..: . . :  .   : .  
XP_011 LVISKINYLGKKSDEFNACGKLLLNIKHDETHTQEKNEVLKNR-NTLSHHEETLQHEKIQ
           160       170       180       190        200       210  

       250       260       270       280        290          300   
pF1KSD RCDSAIMYADKVTCENNDYDKTVYQSIQPIYPARIQTGD-NLFK---CTDAVKSFNHIIH
         .  . :.    :...  .:.:... :    :. .. : : :    : ..   :..:  
XP_011 TLEHNFEYS---ICQETLLEKAVFNT-QKRENAEENNCDYNEFGRTLCDSSSLLFHQISP
            220          230        240       250       260        

           310       320       330       340       350       360   
pF1KSD FGDHKGIHTGEKLYEYKECHQIFNQSPSFNEHPRLHVGENQYNYKEYENIFYFSSFMEH-
         :..        ::...:....  . .... :.  :. ..:.  :  : :  .  . : 
XP_011 SRDNH--------YEFSDCEKFLCVKSTLSK-PH-GVSMKHYDCGESGNNFRRKLCLSHL
      270               280       290         300       310        

            370       380       390       400       410       420  
pF1KSD QKIGTVEKAYKYNEWEKVFGYDSFLTQHTSTYTAEKPYDYNECGTSFIWSSYLIQHKKTH
       ::    :: .. ::  :.:   : ::.:  ..:..::.. :::  .:  .: : .:...:
XP_011 QKGDKGEKHFECNECGKAFWEKSHLTRHQRVHTGQKPFQCNECEKAFWDKSNLTKHQRSH
      320       330       340       350       360       370        

            430       440       450       460       470       480  
pF1KSD TGEKPYECDKCGKVFRNRSALTKHERTHTGIKPYECNKCGKAFSWNSHLIVHKRIHTGEK
       :::::.::..:::.: ..:::: :.::::: :::.:: :::.:  .: :  :.: ::: :
XP_011 TGEKPFECNECGKAFSHKSALTLHQRTHTGEKPYQCNACGKTFCQKSDLTKHQRTHTGLK
      380       390       400       410       420       430        

            490       500       510       520       530       540  
pF1KSD PYVCNECGKSFNWNSHLIGHQRTHTGEKPFECTECGKSFSWSSHLIAHMRMHTGEKPFKC
       :: : ::::::  .:::  ::::::::::::: ::::::: .:.:  :.:.: :.: ..:
XP_011 PYECYECGKSFRVTSHLKVHQRTHTGEKPFECLECGKSFSEKSNLTQHQRIHIGDKSYEC
      440       450       460       470       480       490        

            550       560       570       580       590       600  
pF1KSD DECEKAFRDYSALSKHERTHSGAKPYKCTECGKSFSWSSHLIAHQRTHTGEKPYNCQECG
       . : :.:   : :..:.  :.: :::.: ::::.:  .: : .:::::::.::. : :::
XP_011 NACGKTFYHKSLLTRHQIIHTGWKPYECYECGKTFCLKSDLTVHQRTHTGQKPFACPECG
      500       510       520       530       540       550        

            610       620       630       640       650       660  
pF1KSD KAFRERSALTKHEIIHSGIKPYECNKCGKSCSQMAHLVRHQRTHTGEKPYECNKCGKSFS
       : : ..:.:..:   :.: :::::..:::   . ..:..:.::::::::::::.:::.: 
XP_011 KFFSHKSTLSQHYRTHTGEKPYECHECGKIFYNKSYLTKHNRTHTGEKPYECNECGKAFY
      560       570       580       590       600       610        

            670       680       690       700       710       720  
pF1KSD QSCHLVAHRRIHTGEKPYKCNQCERSFNCSSHLIAHRRTHTGEKPYRCNECGKAFNESSS
       :. .:. :.::: ::::::::.: ..:  .: ::.:.:::: ::::.::::::.:  .:.
XP_011 QKSQLTQHQRIHIGEKPYKCNECGKAFCHKSALIVHQRTHTQEKPYKCNECGKSFCVKSG
      620       630       640       650       660       670        

            730       740       750       760       770       780  
pF1KSD LIVHLRNHTGEKPYKCNHCEKAFCKNSSLIIHQRMHSGEKRFICSECGKAFSGHSALLQH
       :: : :.:::::::.::.: : : ..::: .:.: :.:::   :.:::: :  .: : ::
XP_011 LIFHERKHTGEKPYECNECGKFFRHKSSLTVHHRAHTGEKSCQCNECGKIFYRKSELAQH
      680       690       700       710       720       730        

            790                                                    
pF1KSD QRNHSEEKLN                                                  
       ::.:. ::                                                    
XP_011 QRSHTGEKPYECNTCRKTFSQKSNLIVHQRRHIGENLMNEMDIRNFQPQVSLHNASEYSH
      740       750       760       770       780       790        

>>NP_008905 (OMIM: 194521) zinc finger protein 33A isofo  (810 aa)
 initn: 1785 init1: 1785 opt: 2090  Z-score: 1160.4  bits: 225.6 E(85289): 6.7e-58
Smith-Waterman score: 2103; 44.2% identity (68.5% similar) in 758 aa overlap (59-790:9-746)

       30        40        50        60        70        80        
pF1KSD WALCPQYPAWHVEGSLEEGRRATGLPAAQVQEPVTFKDVAVDFTQEEWGQLDLVQRTLYR
                                     :: :.::::.: :::::: .::  ::.:::
NP_008                       MNKVEQKSQESVSFKDVTVGFTQEEWQHLDPSQRALYR
                                     10        20        30        

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pF1KSD DVMLETYGHLLSVGNQIAKPEVISLLEQGEEPWSVEQACPQRTCPEWV------RNLESK
       :::::.:..:.:::  . :::::  :.::::::. :.  :... : :.      :. :..
NP_008 DVMLENYSNLVSVGYCVHKPEVIFRLQQGEEPWKQEEEFPSQSFPVWTADHLKERSQENQ
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pF1KSD A------LIPAQSIFEEEQSHGMKLERYIWDDPWFSRLEVLGCKDQLEMYHMNQSTAMRQ
       .      ..  . .. .::.  . .   .  . . ::     : :.  :    . ... .
NP_008 SKHLWEVVFINNEMLTKEQGDVIGIPFNVDVSSFPSRKMFCQC-DSCGM----SFNTVSE
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pF1KSD MVFMQKQVLSQRSSEF--CG---LGAEF----SQNLNFVPSQRVSQIEHFYKPDTHAQSW
       .:. . . :...:.::  ::   :. .     .:. : : ..: . . :  .   : .  
NP_008 LVISKINYLGKKSDEFNACGKLLLNIKHDETHTQEKNEVLKNR-NTLSHHEETLQHEKIQ
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pF1KSD RCDSAIMYADKVTCENNDYDKTVYQSIQPIYPARIQTGD-NLFK---CTDAVKSFNHIIH
         .  . :.    :...  .:.:... :    :. .. : : :    : ..   :..:  
NP_008 TLEHNFEYS---ICQETLLEKAVFNT-QKRENAEENNCDYNEFGRTLCDSSSLLFHQISP
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pF1KSD FGDHKGIHTGEKLYEYKECHQIFNQSPSFNEHPRLHVGENQYNYKEYENIFYFSSFMEH-
         :..        ::...:....  . .... :.  :. ..:.  :  : :  .  . : 
NP_008 SRDNH--------YEFSDCEKFLCVKSTLSK-PH-GVSMKHYDCGESGNNFRRKLCLSHL
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pF1KSD QKIGTVEKAYKYNEWEKVFGYDSFLTQHTSTYTAEKPYDYNECGTSFIWSSYLIQHKKTH
       ::    :: .. ::  :.:   : ::.:  ..:..::.. :::  .:  .: : .:...:
NP_008 QKGDKGEKHFECNECGKAFWEKSHLTRHQRVHTGQKPFQCNECEKAFWDKSNLTKHQRSH
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pF1KSD TGEKPYECDKCGKVFRNRSALTKHERTHTGIKPYECNKCGKAFSWNSHLIVHKRIHTGEK
       :::::.::..:::.: ..:::: :.::::: :::.:: :::.:  .: :  :.: ::: :
NP_008 TGEKPFECNECGKAFSHKSALTLHQRTHTGEKPYQCNACGKTFCQKSDLTKHQRTHTGLK
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pF1KSD PYVCNECGKSFNWNSHLIGHQRTHTGEKPFECTECGKSFSWSSHLIAHMRMHTGEKPFKC
       :: : ::::::  .:::  ::::::::::::: ::::::: .:.:  :.:.: :.: ..:
NP_008 PYECYECGKSFRVTSHLKVHQRTHTGEKPFECLECGKSFSEKSNLTQHQRIHIGDKSYEC
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pF1KSD DECEKAFRDYSALSKHERTHSGAKPYKCTECGKSFSWSSHLIAHQRTHTGEKPYNCQECG
       . : :.:   : :..:.  :.: :::.: ::::.:  .: : .:::::::.::. : :::
NP_008 NACGKTFYHKSLLTRHQIIHTGWKPYECYECGKTFCLKSDLTVHQRTHTGQKPFACPECG
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pF1KSD KAFRERSALTKHEIIHSGIKPYECNKCGKSCSQMAHLVRHQRTHTGEKPYECNKCGKSFS
       : : ..:.:..:   :.: :::::..:::   . ..:..:.::::::::::::.:::.: 
NP_008 KFFSHKSTLSQHYRTHTGEKPYECHECGKIFYNKSYLTKHNRTHTGEKPYECNECGKAFY
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pF1KSD QSCHLVAHRRIHTGEKPYKCNQCERSFNCSSHLIAHRRTHTGEKPYRCNECGKAFNESSS
       :. .:. :.::: ::::::::.: ..:  .: ::.:.:::: ::::.::::::.:  .:.
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pF1KSD LIVHLRNHTGEKPYKCNHCEKAFCKNSSLIIHQRMHSGEKRFICSECGKAFSGHSALLQH
       :: : :.:::::::.::.: : : ..::: .:.: :.:::   :.:::: :  .: : ::
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       ::.:. ::                                                    
NP_008 QRSHTGEKPYECNTCRKTFSQKSNLIVHQRRHIGENLMNEMDIRNFQPQVSLHNASEYSH
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                                     :: :.::::.: :::::: .::  ::.:::
NP_008                       MNKVEQKSQESVSFKDVTVGFTQEEWQHLDPSQRALYR
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pF1KSD DVMLETYGHLLSVGNQIAKPEVISLLEQGEEPWSVEQACPQRTCPE-WV------RNLES
       :::::.:..:.:::  . :::::  :.::::::. :.  :... :: :.      :. :.
NP_008 DVMLENYSNLVSVGYCVHKPEVIFRLQQGEEPWKQEEEFPSQSFPEVWTADHLKERSQEN
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pF1KSD KA------LIPAQSIFEEEQSHGMKLERYIWDDPWFSRLEVLGCKDQLEMYHMNQSTAMR
       ..      ..  . .. .::.  . .   .  . . ::     : :.  :    . ... 
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pF1KSD QMVFMQKQVLSQRSSEF--CG---LGAEF----SQNLNFVPSQRVSQIEHFYKPDTHAQS
       ..:. . . :...:.::  ::   :. .     .:. : : ..: . . :  .   : . 
NP_008 ELVISKINYLGKKSDEFNACGKLLLNIKHDETHTQEKNEVLKNR-NTLSHHEETLQHEKI
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pF1KSD WRCDSAIMYADKVTCENNDYDKTVYQSIQPIYPARIQTGD-NLFK---CTDAVKSFNHII
          .  . :.    :...  .:.:... :    :. .. : : :    : ..   :..: 
NP_008 QTLEHNFEYS---ICQETLLEKAVFNT-QKRENAEENNCDYNEFGRTLCDSSSLLFHQIS
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pF1KSD HFGDHKGIHTGEKLYEYKECHQIFNQSPSFNEHPRLHVGENQYNYKEYENIFYFSSFMEH
          :..        ::...:....  . .... :.  :. ..:.  :  : :  .  . :
NP_008 PSRDNH--------YEFSDCEKFLCVKSTLSK-PH-GVSMKHYDCGESGNNFRRKLCLSH
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pF1KSD -QKIGTVEKAYKYNEWEKVFGYDSFLTQHTSTYTAEKPYDYNECGTSFIWSSYLIQHKKT
        ::    :: .. ::  :.:   : ::.:  ..:..::.. :::  .:  .: : .:...
NP_008 LQKGDKGEKHFECNECGKAFWEKSHLTRHQRVHTGQKPFQCNECEKAFWDKSNLTKHQRS
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pF1KSD HTGEKPYECDKCGKVFRNRSALTKHERTHTGIKPYECNKCGKAFSWNSHLIVHKRIHTGE
       ::::::.::..:::.: ..:::: :.::::: :::.:: :::.:  .: :  :.: ::: 
NP_008 HTGEKPFECNECGKAFSHKSALTLHQRTHTGEKPYQCNACGKTFCQKSDLTKHQRTHTGL
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pF1KSD KPYVCNECGKSFNWNSHLIGHQRTHTGEKPFECTECGKSFSWSSHLIAHMRMHTGEKPFK
       ::: : ::::::  .:::  ::::::::::::: ::::::: .:.:  :.:.: :.: ..
NP_008 KPYECYECGKSFRVTSHLKVHQRTHTGEKPFECLECGKSFSEKSNLTQHQRIHIGDKSYE
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pF1KSD CDECEKAFRDYSALSKHERTHSGAKPYKCTECGKSFSWSSHLIAHQRTHTGEKPYNCQEC
       :. : :.:   : :..:.  :.: :::.: ::::.:  .: : .:::::::.::. : ::
NP_008 CNACGKTFYHKSLLTRHQIIHTGWKPYECYECGKTFCLKSDLTVHQRTHTGQKPFACPEC
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pF1KSD GKAFRERSALTKHEIIHSGIKPYECNKCGKSCSQMAHLVRHQRTHTGEKPYECNKCGKSF
       :: : ..:.:..:   :.: :::::..:::   . ..:..:.::::::::::::.:::.:
NP_008 GKFFSHKSTLSQHYRTHTGEKPYECHECGKIFYNKSYLTKHNRTHTGEKPYECNECGKAF
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pF1KSD SQSCHLVAHRRIHTGEKPYKCNQCERSFNCSSHLIAHRRTHTGEKPYRCNECGKAFNESS
        :. .:. :.::: ::::::::.: ..:  .: ::.:.:::: ::::.::::::.:  .:
NP_008 YQKSQLTQHQRIHIGEKPYKCNECGKAFCHKSALIVHQRTHTQEKPYKCNECGKSFCVKS
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pF1KSD SLIVHLRNHTGEKPYKCNHCEKAFCKNSSLIIHQRMHSGEKRFICSECGKAFSGHSALLQ
       .:: : :.:::::::.::.: : : ..::: .:.: :.:::   :.:::: :  .: : :
NP_008 GLIFHERKHTGEKPYECNECGKFFRHKSSLTVHHRAHTGEKSCQCNECGKIFYRKSELAQ
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pF1KSD HQRNHSEEKLN                                                 
       :::.:. ::                                                   
NP_008 HQRSHTGEKPYECNTCRKTFSQKSNLIVHQRRHIGENLMNEMDIRNFQPQVSLHNASEYS
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792 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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