Result of FASTA (ccds) for pF1KSDA1479
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA1479, 1011 aa
  1>>>pF1KSDA1479 1011 - 1011 aa - 1011 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.7693+/-0.00109; mu= 5.3142+/- 0.065
 mean_var=172.5085+/-34.638, 0's: 0 Z-trim(109.4): 61  B-trim: 174 in 1/51
 Lambda= 0.097649
 statistics sampled from 10808 (10865) to 10808 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.68), E-opt: 0.2 (0.334), width:  16
 Scan time:  3.460

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS32224.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15       (1011) 6882 982.6       0
CCDS32226.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15       (1017) 6617 945.3       0
CCDS32228.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15       ( 597) 3747 540.8  3e-153
CCDS32227.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15       ( 998) 3746 540.8 5.2e-153
CCDS32225.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15       (1073) 3742 540.3 8.2e-153
CCDS32229.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15       ( 476) 3220 466.6 5.6e-131
CCDS47256.1 SEMA6A gene_id:57556|Hs108|chr5        (1030) 2434 356.0 2.3e-97
CCDS75288.1 SEMA6A gene_id:57556|Hs108|chr5        (1047) 2434 356.0 2.4e-97
CCDS984.1 SEMA6C gene_id:10500|Hs108|chr1          ( 930) 2147 315.5 3.2e-85
CCDS12131.1 SEMA6B gene_id:10501|Hs108|chr19       ( 888) 2014 296.8 1.3e-79
CCDS53364.1 SEMA6C gene_id:10500|Hs108|chr1        ( 962) 2001 295.0 5.1e-79
CCDS53363.1 SEMA6C gene_id:10500|Hs108|chr1        ( 922) 1308 197.3 1.2e-49
CCDS5599.1 SEMA3A gene_id:10371|Hs108|chr7         ( 771)  923 143.1 2.2e-33
CCDS74941.1 SEMA3B gene_id:7869|Hs108|chr3         ( 749)  879 136.9 1.6e-31
CCDS74995.1 SEMA5B gene_id:54437|Hs108|chr3        (1057)  879 136.9 2.1e-31
CCDS35491.1 SEMA5B gene_id:54437|Hs108|chr3        (1151)  879 136.9 2.3e-31
CCDS58848.1 SEMA5B gene_id:54437|Hs108|chr3        (1205)  879 137.0 2.4e-31
CCDS77744.1 SEMA3B gene_id:7869|Hs108|chr3         ( 748)  870 135.6 3.8e-31
CCDS55121.1 SEMA3E gene_id:9723|Hs108|chr7         ( 715)  859 134.0 1.1e-30
CCDS34674.1 SEMA3E gene_id:9723|Hs108|chr7         ( 775)  859 134.0 1.1e-30
CCDS3875.1 SEMA5A gene_id:9037|Hs108|chr5          (1074)  852 133.1   3e-30
CCDS47991.1 SEMA4D gene_id:10507|Hs108|chr9        ( 738)  822 128.8   4e-29
CCDS6685.1 SEMA4D gene_id:10507|Hs108|chr9         ( 862)  823 129.0 4.2e-29
CCDS82780.1 SEMA3F gene_id:6405|Hs108|chr3         ( 686)  768 121.2 7.4e-27
CCDS82779.1 SEMA3F gene_id:6405|Hs108|chr3         ( 754)  768 121.2   8e-27
CCDS2811.1 SEMA3F gene_id:6405|Hs108|chr3          ( 785)  768 121.2 8.3e-27
CCDS5596.1 SEMA3C gene_id:10512|Hs108|chr7         ( 751)  735 116.6   2e-25
CCDS77743.1 SEMA3B gene_id:7869|Hs108|chr3         ( 754)  722 114.7 7.2e-25
CCDS1132.1 SEMA4A gene_id:64218|Hs108|chr1         ( 761)  667 107.0 1.6e-22
CCDS34676.1 SEMA3D gene_id:223117|Hs108|chr7       ( 777)  656 105.4 4.6e-22
CCDS2029.1 SEMA4C gene_id:54910|Hs108|chr2         ( 833)  649 104.5 9.7e-22
CCDS2856.1 SEMA3G gene_id:56920|Hs108|chr3         ( 782)  603 98.0 8.2e-20
CCDS53378.1 SEMA4A gene_id:64218|Hs108|chr1        ( 629)  506 84.3 8.9e-16
CCDS45347.1 SEMA4B gene_id:10509|Hs108|chr15       ( 837)  483 81.1 1.1e-14
CCDS74529.1 SEMA4F gene_id:10505|Hs108|chr2        ( 737)  456 77.3 1.3e-13
CCDS77745.1 SEMA3B gene_id:7869|Hs108|chr3         ( 406)  444 75.4 2.6e-13


>>CCDS32224.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15            (1011 aa)
 initn: 6882 init1: 6882 opt: 6882  Z-score: 5248.1  bits: 982.6 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 6882; 100.0% identity (100.0% similar) in 1011 aa overlap (1-1011:1-1011)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MRVFLLCAYILLLMVSQLRAVSFPEDDEPLNTVDYHYSRQYPVFRGRPSGNESQHRLDFQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MRVFLLCAYILLLMVSQLRAVSFPEDDEPLNTVDYHYSRQYPVFRGRPSGNESQHRLDFQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD LMLKIRDTLYIAGRDQVYTVNLNEMPKTEVIPNKKLTWRSRQQDRENCAMKGKHKDECHN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LMLKIRDTLYIAGRDQVYTVNLNEMPKTEVIPNKKLTWRSRQQDRENCAMKGKHKDECHN
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD FIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYYRLSTLEYDGEEISGLARCPFDARQTNVALFAD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYYRLSTLEYDGEEISGLARCPFDARQTNVALFAD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD GKLYSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPHFLHAIEYGNYVYFFFREI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GKLYSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPHFLHAIEYGNYVYFFFREI
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD AVEHNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSFFYFDVLQSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 AVEHNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSFFYFDVLQSI
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD TDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWTAVPED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWTAVPED
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD KVPKPRPGCCAKHGLAEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPPIADEPWFTKTRVRYR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KVPKPRPGCCAKHGLAEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPPIADEPWFTKTRVRYR
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD LTAISVDHSAGPYQNYTVIFVGSEAGMVLKVLAKTSPFSLNDSVLLEEIEAYNHAKCSAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LTAISVDHSAGPYQNYTVIFVGSEAGMVLKVLAKTSPFSLNDSVLLEEIEAYNHAKCSAE
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD NEEDKKVISLQLDKDHHALYVAFSSCIIRIPLSRCERYGSCKKSCIASRDPYCGWLSQGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NEEDKKVISLQLDKDHHALYVAFSSCIIRIPLSRCERYGSCKKSCIASRDPYCGWLSQGS
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD CGRVTPGMLLLTEDFFAFHNHSAEGYEQDTEFGNTAHLGDCHGVRWEVQSGESNQMVHMN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 CGRVTPGMLLLTEDFFAFHNHSAEGYEQDTEFGNTAHLGDCHGVRWEVQSGESNQMVHMN
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD VLITCVFAAFVLGAFIAGVAVYCYRDMFVRKNRKIHKDAESAQSCTDSSGSFAKLNGLFD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VLITCVFAAFVLGAFIAGVAVYCYRDMFVRKNRKIHKDAESAQSCTDSSGSFAKLNGLFD
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD SPVKEYQQNIDSPKLYSNLLTSRKELPPNGDTKSMVMDHRGQPPELAALPTPESTPVLHQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SPVKEYQQNIDSPKLYSNLLTSRKELPPNGDTKSMVMDHRGQPPELAALPTPESTPVLHQ
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD KTLQAMKSHSEKAHGHGASRKETPQFFPSSPPPHSPLSHGHIPSAIVLPNATHDYNTSFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KTLQAMKSHSEKAHGHGASRKETPQFFPSSPPPHSPLSHGHIPSAIVLPNATHDYNTSFS
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD NSNAHKAEKKLQNIDHPLTKSSSKRDHRRSVDSRNTLNDLLKHLNDPNSNPKAIMGDIQM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NSNAHKAEKKLQNIDHPLTKSSSKRDHRRSVDSRNTLNDLLKHLNDPNSNPKAIMGDIQM
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KSD AHQNLMLDPMGSMSEVPPKVPNREASLYSPPSTLPRNSPTKRVDVPTTPGVPMTSLERQR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 AHQNLMLDPMGSMSEVPPKVPNREASLYSPPSTLPRNSPTKRVDVPTTPGVPMTSLERQR
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KSD GYHKNSSQRHSISAMPKNLNSPNGVLLSRQPSMNRGGYMPTPTGAKVDYIQGTPVSVHLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GYHKNSSQRHSISAMPKNLNSPNGVLLSRQPSMNRGGYMPTPTGAKVDYIQGTPVSVHLQ
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010 
pF1KSD PSLSRQSSYTSNGTLPRTGLKRTPSLKPDVPPKPSFVPQTPSVRPLNKYTY
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PSLSRQSSYTSNGTLPRTGLKRTPSLKPDVPPKPSFVPQTPSVRPLNKYTY
              970       980       990      1000      1010 

>>CCDS32226.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15            (1017 aa)
 initn: 6637 init1: 3742 opt: 6617  Z-score: 5046.3  bits: 945.3 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 6708; 96.9% identity (96.9% similar) in 1030 aa overlap (1-1011:1-1017)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MRVFLLCAYILLLMVSQLRAVSFPEDDEPLNTVDYHYSRQYPVFRGRPSGNESQHRLDFQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MRVFLLCAYILLLMVSQLRAVSFPEDDEPLNTVDYHYSRQYPVFRGRPSGNESQHRLDFQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD LMLKIRDTLYIAGRDQVYTVNLNEMPKTEVIPNKKLTWRSRQQDRENCAMKGKHKDECHN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LMLKIRDTLYIAGRDQVYTVNLNEMPKTEVIPNKKLTWRSRQQDRENCAMKGKHKDECHN
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD FIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYYRLSTLEYDGEEISGLARCPFDARQTNVALFAD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYYRLSTLEYDGEEISGLARCPFDARQTNVALFAD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD GKLYSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPHFLHAIEYGNYVYFFFREI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GKLYSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPHFLHAIEYGNYVYFFFREI
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD AVEHNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSFFYFDVLQSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 AVEHNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSFFYFDVLQSI
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD TDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWTAVPED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWTAVPED
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD KVPKPRPGCCAKHGLAEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPPIADEPWFTKTRVRYR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KVPKPRPGCCAKHGLAEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPPIADEPWFTKTRVRYR
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD LTAISVDHSAGPYQNYTVIFVGSEAGMVLKVLAKTSPFSLNDSVLLEEIEAYNHAKCSAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LTAISVDHSAGPYQNYTVIFVGSEAGMVLKVLAKTSPFSLNDSVLLEEIEAYNHAKCSAE
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD NEEDKKVISLQLDKDHHALYVAFSSCIIRIPLSRCERYGSCKKSCIASRDPYCGWLSQGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NEEDKKVISLQLDKDHHALYVAFSSCIIRIPLSRCERYGSCKKSCIASRDPYCGWLSQGS
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580                    
pF1KSD CGRVTPGMLLLTEDFFAFHNHSAEGYEQDTEFGNTAHLGDCH------------------
       :::::::::             ::::::::::::::::::::                  
CCDS32 CGRVTPGML-------------AEGYEQDTEFGNTAHLGDCHEILPTSTTPDYKIFGGPT
                           550       560       570       580       

             590       600       610       620       630       640 
pF1KSD -GVRWEVQSGESNQMVHMNVLITCVFAAFVLGAFIAGVAVYCYRDMFVRKNRKIHKDAES
        :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SGVRWEVQSGESNQMVHMNVLITCVFAAFVLGAFIAGVAVYCYRDMFVRKNRKIHKDAES
       590       600       610       620       630       640       

             650       660       670       680       690       700 
pF1KSD AQSCTDSSGSFAKLNGLFDSPVKEYQQNIDSPKLYSNLLTSRKELPPNGDTKSMVMDHRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 AQSCTDSSGSFAKLNGLFDSPVKEYQQNIDSPKLYSNLLTSRKELPPNGDTKSMVMDHRG
       650       660       670       680       690       700       

             710       720       730       740       750       760 
pF1KSD QPPELAALPTPESTPVLHQKTLQAMKSHSEKAHGHGASRKETPQFFPSSPPPHSPLSHGH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QPPELAALPTPESTPVLHQKTLQAMKSHSEKAHGHGASRKETPQFFPSSPPPHSPLSHGH
       710       720       730       740       750       760       

             770       780       790       800       810       820 
pF1KSD IPSAIVLPNATHDYNTSFSNSNAHKAEKKLQNIDHPLTKSSSKRDHRRSVDSRNTLNDLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 IPSAIVLPNATHDYNTSFSNSNAHKAEKKLQNIDHPLTKSSSKRDHRRSVDSRNTLNDLL
       770       780       790       800       810       820       

             830       840       850       860       870       880 
pF1KSD KHLNDPNSNPKAIMGDIQMAHQNLMLDPMGSMSEVPPKVPNREASLYSPPSTLPRNSPTK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KHLNDPNSNPKAIMGDIQMAHQNLMLDPMGSMSEVPPKVPNREASLYSPPSTLPRNSPTK
       830       840       850       860       870       880       

             890       900       910       920       930       940 
pF1KSD RVDVPTTPGVPMTSLERQRGYHKNSSQRHSISAMPKNLNSPNGVLLSRQPSMNRGGYMPT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RVDVPTTPGVPMTSLERQRGYHKNSSQRHSISAMPKNLNSPNGVLLSRQPSMNRGGYMPT
       890       900       910       920       930       940       

             950       960       970       980       990      1000 
pF1KSD PTGAKVDYIQGTPVSVHLQPSLSRQSSYTSNGTLPRTGLKRTPSLKPDVPPKPSFVPQTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PTGAKVDYIQGTPVSVHLQPSLSRQSSYTSNGTLPRTGLKRTPSLKPDVPPKPSFVPQTP
       950       960       970       980       990      1000       

            1010 
pF1KSD SVRPLNKYTY
       ::::::::::
CCDS32 SVRPLNKYTY
      1010       

>>CCDS32228.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15            (597 aa)
 initn: 3874 init1: 3742 opt: 3747  Z-score: 2864.7  bits: 540.8 E(32554): 3e-153
Smith-Waterman score: 3864; 96.0% identity (96.8% similar) in 598 aa overlap (1-598:1-583)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MRVFLLCAYILLLMVSQLRAVSFPEDDEPLNTVDYHYSRQYPVFRGRPSGNESQHRLDFQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MRVFLLCAYILLLMVSQLRAVSFPEDDEPLNTVDYHYSRQYPVFRGRPSGNESQHRLDFQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD LMLKIRDTLYIAGRDQVYTVNLNEMPKTEVIPNKKLTWRSRQQDRENCAMKGKHKDECHN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LMLKIRDTLYIAGRDQVYTVNLNEMPKTEVIPNKKLTWRSRQQDRENCAMKGKHKDECHN
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD FIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYYRLSTLEYDGEEISGLARCPFDARQTNVALFAD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYYRLSTLEYDGEEISGLARCPFDARQTNVALFAD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD GKLYSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPHFLHAIEYGNYVYFFFREI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GKLYSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPHFLHAIEYGNYVYFFFREI
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD AVEHNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSFFYFDVLQSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 AVEHNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSFFYFDVLQSI
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD TDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWTAVPED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWTAVPED
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD KVPKPRPGCCAKHGLAEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPPIADEPWFTKTRVRYR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KVPKPRPGCCAKHGLAEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPPIADEPWFTKTRVRYR
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD LTAISVDHSAGPYQNYTVIFVGSEAGMVLKVLAKTSPFSLNDSVLLEEIEAYNHAKCSAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LTAISVDHSAGPYQNYTVIFVGSEAGMVLKVLAKTSPFSLNDSVLLEEIEAYNHAKCSAE
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD NEEDKKVISLQLDKDHHALYVAFSSCIIRIPLSRCERYGSCKKSCIASRDPYCGWLSQGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NEEDKKVISLQLDKDHHALYVAFSSCIIRIPLSRCERYGSCKKSCIASRDPYCGWLSQGS
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD CGRVTPGMLLLTEDFFAFHNHSAEGYEQDTEFGNTAHLGDCHGVRWEVQSGESNQMVHMN
       :::::::::             :::::::::::::::::::: .  ::.:.  . ::.  
CCDS32 CGRVTPGML-------------AEGYEQDTEFGNTAHLGDCHDM--EVSSSSVTTMVYDG
                           550       560       570         580     

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD VLITCVFAAFVLGAFIAGVAVYCYRDMFVRKNRKIHKDAESAQSCTDSSGSFAKLNGLFD
                                                                   
CCDS32 KSSLESPTRWST                                                
         590                                                       

>>CCDS32227.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15            (998 aa)
 initn: 6778 init1: 3742 opt: 3746  Z-score: 2860.5  bits: 540.8 E(32554): 5.2e-153
Smith-Waterman score: 6756; 98.7% identity (98.7% similar) in 1011 aa overlap (1-1011:1-998)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MRVFLLCAYILLLMVSQLRAVSFPEDDEPLNTVDYHYSRQYPVFRGRPSGNESQHRLDFQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MRVFLLCAYILLLMVSQLRAVSFPEDDEPLNTVDYHYSRQYPVFRGRPSGNESQHRLDFQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD LMLKIRDTLYIAGRDQVYTVNLNEMPKTEVIPNKKLTWRSRQQDRENCAMKGKHKDECHN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LMLKIRDTLYIAGRDQVYTVNLNEMPKTEVIPNKKLTWRSRQQDRENCAMKGKHKDECHN
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD FIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYYRLSTLEYDGEEISGLARCPFDARQTNVALFAD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYYRLSTLEYDGEEISGLARCPFDARQTNVALFAD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD GKLYSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPHFLHAIEYGNYVYFFFREI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GKLYSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPHFLHAIEYGNYVYFFFREI
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD AVEHNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSFFYFDVLQSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 AVEHNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSFFYFDVLQSI
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD TDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWTAVPED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWTAVPED
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD KVPKPRPGCCAKHGLAEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPPIADEPWFTKTRVRYR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KVPKPRPGCCAKHGLAEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPPIADEPWFTKTRVRYR
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD LTAISVDHSAGPYQNYTVIFVGSEAGMVLKVLAKTSPFSLNDSVLLEEIEAYNHAKCSAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LTAISVDHSAGPYQNYTVIFVGSEAGMVLKVLAKTSPFSLNDSVLLEEIEAYNHAKCSAE
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD NEEDKKVISLQLDKDHHALYVAFSSCIIRIPLSRCERYGSCKKSCIASRDPYCGWLSQGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NEEDKKVISLQLDKDHHALYVAFSSCIIRIPLSRCERYGSCKKSCIASRDPYCGWLSQGS
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD CGRVTPGMLLLTEDFFAFHNHSAEGYEQDTEFGNTAHLGDCHGVRWEVQSGESNQMVHMN
       :::::::::             ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 CGRVTPGML-------------AEGYEQDTEFGNTAHLGDCHGVRWEVQSGESNQMVHMN
                           550       560       570       580       

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD VLITCVFAAFVLGAFIAGVAVYCYRDMFVRKNRKIHKDAESAQSCTDSSGSFAKLNGLFD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VLITCVFAAFVLGAFIAGVAVYCYRDMFVRKNRKIHKDAESAQSCTDSSGSFAKLNGLFD
       590       600       610       620       630       640       

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD SPVKEYQQNIDSPKLYSNLLTSRKELPPNGDTKSMVMDHRGQPPELAALPTPESTPVLHQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SPVKEYQQNIDSPKLYSNLLTSRKELPPNGDTKSMVMDHRGQPPELAALPTPESTPVLHQ
       650       660       670       680       690       700       

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD KTLQAMKSHSEKAHGHGASRKETPQFFPSSPPPHSPLSHGHIPSAIVLPNATHDYNTSFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KTLQAMKSHSEKAHGHGASRKETPQFFPSSPPPHSPLSHGHIPSAIVLPNATHDYNTSFS
       710       720       730       740       750       760       

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD NSNAHKAEKKLQNIDHPLTKSSSKRDHRRSVDSRNTLNDLLKHLNDPNSNPKAIMGDIQM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NSNAHKAEKKLQNIDHPLTKSSSKRDHRRSVDSRNTLNDLLKHLNDPNSNPKAIMGDIQM
       770       780       790       800       810       820       

              850       860       870       880       890       900
pF1KSD AHQNLMLDPMGSMSEVPPKVPNREASLYSPPSTLPRNSPTKRVDVPTTPGVPMTSLERQR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 AHQNLMLDPMGSMSEVPPKVPNREASLYSPPSTLPRNSPTKRVDVPTTPGVPMTSLERQR
       830       840       850       860       870       880       

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pF1KSD GYHKNSSQRHSISAMPKNLNSPNGVLLSRQPSMNRGGYMPTPTGAKVDYIQGTPVSVHLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GYHKNSSQRHSISAMPKNLNSPNGVLLSRQPSMNRGGYMPTPTGAKVDYIQGTPVSVHLQ
       890       900       910       920       930       940       

              970       980       990      1000      1010 
pF1KSD PSLSRQSSYTSNGTLPRTGLKRTPSLKPDVPPKPSFVPQTPSVRPLNKYTY
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PSLSRQSSYTSNGTLPRTGLKRTPSLKPDVPPKPSFVPQTPSVRPLNKYTY
       950       960       970       980       990        

>>CCDS32225.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15            (1073 aa)
 initn: 6765 init1: 3742 opt: 3742  Z-score: 2857.0  bits: 540.3 E(32554): 8.2e-153
Smith-Waterman score: 6383; 91.7% identity (91.7% similar) in 1056 aa overlap (1-981:1-1043)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MRVFLLCAYILLLMVSQLRAVSFPEDDEPLNTVDYHYSRQYPVFRGRPSGNESQHRLDFQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MRVFLLCAYILLLMVSQLRAVSFPEDDEPLNTVDYHYSRQYPVFRGRPSGNESQHRLDFQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD LMLKIRDTLYIAGRDQVYTVNLNEMPKTEVIPNKKLTWRSRQQDRENCAMKGKHKDECHN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LMLKIRDTLYIAGRDQVYTVNLNEMPKTEVIPNKKLTWRSRQQDRENCAMKGKHKDECHN
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD FIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYYRLSTLEYDGEEISGLARCPFDARQTNVALFAD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYYRLSTLEYDGEEISGLARCPFDARQTNVALFAD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD GKLYSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPHFLHAIEYGNYVYFFFREI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GKLYSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPHFLHAIEYGNYVYFFFREI
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD AVEHNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSFFYFDVLQSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 AVEHNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSFFYFDVLQSI
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD TDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWTAVPED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWTAVPED
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD KVPKPRPGCCAKHGLAEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPPIADEPWFTKTRVRYR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KVPKPRPGCCAKHGLAEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPPIADEPWFTKTRVRYR
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD LTAISVDHSAGPYQNYTVIFVGSEAGMVLKVLAKTSPFSLNDSVLLEEIEAYNHAKCSAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LTAISVDHSAGPYQNYTVIFVGSEAGMVLKVLAKTSPFSLNDSVLLEEIEAYNHAKCSAE
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD NEEDKKVISLQLDKDHHALYVAFSSCIIRIPLSRCERYGSCKKSCIASRDPYCGWLSQGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NEEDKKVISLQLDKDHHALYVAFSSCIIRIPLSRCERYGSCKKSCIASRDPYCGWLSQGS
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580                    
pF1KSD CGRVTPGMLLLTEDFFAFHNHSAEGYEQDTEFGNTAHLGDCH------------------
       :::::::::             ::::::::::::::::::::                  
CCDS32 CGRVTPGML-------------AEGYEQDTEFGNTAHLGDCHEILPTSTTPDYKIFGGPT
                           550       560       570       580       

                                                                   
pF1KSD ---------------------------------------------------------GVR
                                                                :::
CCDS32 SDMEVSSSSVTTMASIPEITPKVIDTWRPKLTSSRKFVVQDDPNTSDFTDPLSGIPKGVR
       590       600       610       620       630       640       

         590       600       610       620       630       640     
pF1KSD WEVQSGESNQMVHMNVLITCVFAAFVLGAFIAGVAVYCYRDMFVRKNRKIHKDAESAQSC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 WEVQSGESNQMVHMNVLITCVFAAFVLGAFIAGVAVYCYRDMFVRKNRKIHKDAESAQSC
       650       660       670       680       690       700       

         650       660       670       680       690       700     
pF1KSD TDSSGSFAKLNGLFDSPVKEYQQNIDSPKLYSNLLTSRKELPPNGDTKSMVMDHRGQPPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TDSSGSFAKLNGLFDSPVKEYQQNIDSPKLYSNLLTSRKELPPNGDTKSMVMDHRGQPPE
       710       720       730       740       750       760       

         710       720       730       740       750       760     
pF1KSD LAALPTPESTPVLHQKTLQAMKSHSEKAHGHGASRKETPQFFPSSPPPHSPLSHGHIPSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LAALPTPESTPVLHQKTLQAMKSHSEKAHGHGASRKETPQFFPSSPPPHSPLSHGHIPSA
       770       780       790       800       810       820       

         770       780       790       800       810       820     
pF1KSD IVLPNATHDYNTSFSNSNAHKAEKKLQNIDHPLTKSSSKRDHRRSVDSRNTLNDLLKHLN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 IVLPNATHDYNTSFSNSNAHKAEKKLQNIDHPLTKSSSKRDHRRSVDSRNTLNDLLKHLN
       830       840       850       860       870       880       

         830       840       850       860       870       880     
pF1KSD DPNSNPKAIMGDIQMAHQNLMLDPMGSMSEVPPKVPNREASLYSPPSTLPRNSPTKRVDV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DPNSNPKAIMGDIQMAHQNLMLDPMGSMSEVPPKVPNREASLYSPPSTLPRNSPTKRVDV
       890       900       910       920       930       940       

         890       900       910       920       930       940     
pF1KSD PTTPGVPMTSLERQRGYHKNSSQRHSISAMPKNLNSPNGVLLSRQPSMNRGGYMPTPTGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PTTPGVPMTSLERQRGYHKNSSQRHSISAMPKNLNSPNGVLLSRQPSMNRGGYMPTPTGA
       950       960       970       980       990      1000       

         950       960       970       980       990      1000     
pF1KSD KVDYIQGTPVSVHLQPSLSRQSSYTSNGTLPRTGLKRTPSLKPDVPPKPSFVPQTPSVRP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::                        
CCDS32 KVDYIQGTPVSVHLQPSLSRQSSYTSNGTLPRTGLKRTPSLKPDVPPKPSFVPQTPSVRP
      1010      1020      1030      1040      1050      1060       

        1010 
pF1KSD LNKYTY
             
CCDS32 LNKYTY
      1070   

>>CCDS32229.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15            (476 aa)
 initn: 3220 init1: 3220 opt: 3220  Z-score: 2465.0  bits: 466.6 E(32554): 5.6e-131
Smith-Waterman score: 3220; 100.0% identity (100.0% similar) in 476 aa overlap (1-476:1-476)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MRVFLLCAYILLLMVSQLRAVSFPEDDEPLNTVDYHYSRQYPVFRGRPSGNESQHRLDFQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MRVFLLCAYILLLMVSQLRAVSFPEDDEPLNTVDYHYSRQYPVFRGRPSGNESQHRLDFQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD LMLKIRDTLYIAGRDQVYTVNLNEMPKTEVIPNKKLTWRSRQQDRENCAMKGKHKDECHN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LMLKIRDTLYIAGRDQVYTVNLNEMPKTEVIPNKKLTWRSRQQDRENCAMKGKHKDECHN
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD FIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYYRLSTLEYDGEEISGLARCPFDARQTNVALFAD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYYRLSTLEYDGEEISGLARCPFDARQTNVALFAD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD GKLYSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPHFLHAIEYGNYVYFFFREI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GKLYSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPHFLHAIEYGNYVYFFFREI
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD AVEHNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSFFYFDVLQSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 AVEHNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSFFYFDVLQSI
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD TDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWTAVPED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWTAVPED
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD KVPKPRPGCCAKHGLAEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPPIADEPWFTKTRVRYR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KVPKPRPGCCAKHGLAEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPPIADEPWFTKTRVRYR
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD LTAISVDHSAGPYQNYTVIFVGSEAGMVLKVLAKTSPFSLNDSVLLEEIEAYNHAKCSAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::    
CCDS32 LTAISVDHSAGPYQNYTVIFVGSEAGMVLKVLAKTSPFSLNDSVLLEEIEAYNHAK    
              430       440       450       460       470          

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD NEEDKKVISLQLDKDHHALYVAFSSCIIRIPLSRCERYGSCKKSCIASRDPYCGWLSQGS

>>CCDS47256.1 SEMA6A gene_id:57556|Hs108|chr5             (1030 aa)
 initn: 2791 init1: 1929 opt: 2434  Z-score: 1861.4  bits: 356.0 E(32554): 2.3e-97
Smith-Waterman score: 2952; 45.9% identity (70.1% similar) in 1074 aa overlap (1-1005:1-1025)

               10        20        30        40         50         
pF1KSD MRVFLLCAYILLLMVSQLRAVSFPEDDEPLNTVDYHYSRQYPVFRG-RPSGNESQ-HRLD
       ::   :  :. ::   .. ...::::.::..    .:..::::: : .:. : .: ::::
CCDS47 MRSEALLLYFTLL---HFAGAGFPEDSEPISISHGNYTKQYPVFVGHKPGRNTTQRHRLD
               10           20        30        40        50       

       60        70        80        90       100       110        
pF1KSD FQLMLKIRDTLYIAGRDQVYTVNLNEMPKTEVIPNKKLTWRSRQQDRENCAMKGKHKDEC
       .:... .  :::::.::..:::...     :.  .:::::.::: : ..: :::::::::
CCDS47 IQMIMIMNGTLYIAARDHIYTVDIDTSHTEEIYCSKKLTWKSRQADVDTCRMKGKHKDEC
        60        70        80        90       100       110       

      120       130       140       150       160       170        
pF1KSD HNFIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYYRLSTLEYDGEEISGLARCPFDARQTNVALF
       ::::::.. .::. .:::::::::: :: :...:::  :.:.::.::::.::...:::::
CCDS47 HNFIKVLLKKNDDALFVCGTNAFNPSCRNYKMDTLEPFGDEFSGMARCPYDAKHANVALF
       120       130       140       150       160       170       

      180       190       200       210       220       230        
pF1KSD ADGKLYSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPHFLHAIEYGNYVYFFFR
       ::::::::::.:::: :::::::.:.. .:::.:.::::.:::.:..:..::.:.:::::
CCDS47 ADGKLYSATVTDFLAIDAVIYRSLGESPTLRTVKHDSKWLKEPYFVQAVDYGDYIYFFFR
       180       190       200       210       220       230       

      240       250       260       270       280       290        
pF1KSD EIAVEHNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSFFYFDVLQ
       :::::.:..::.:. :::..::::::::::::::.::::::::::::::::: :::..::
CCDS47 EIAVEYNTMGKVVFPRVAQVCKNDMGGSQRVLEKQWTSFLKARLNCSVPGDSHFYFNILQ
       240       250       260       270       280       290       

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pF1KSD SITDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWTAVP
       ..::.:.:::  .:...:.:  ::::::::::..: :: .:: :::::::.:::.:: ::
CCDS47 AVTDVIRINGRDVVLATFSTPYNSIPGSAVCAYDMLDIASVFTGRFKEQKSPDSTWTPVP
       300       310       320       330       340       350       

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pF1KSD EDKVPKPRPGCCAKHGLAEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPPIADEPWFTKTRVR
       ...::::::::::  .  : : :: .:::.::.:::.::::: ::: : ..::: .: ::
CCDS47 DERVPKPRPGCCAGSSSLERYATSNEFPDDTLNFIKTHPLMDEAVPSIFNRPWFLRTMVR
       360       370       380       390       400       410       

      420       430       440       450         460       470      
pF1KSD YRLTAISVDHSAGPYQNYTVIFVGSEAGMVLKVLAK--TSPFSLNDSVLLEEIEAYNHAK
       :::: :.:: .::::::.::.:.::: :..:: ::.  .: : ::::..:::. .::  :
CCDS47 YRLTKIAVDTAAGPYQNHTVVFLGSEKGIILKFLARIGNSGF-LNDSLFLEEMSVYNSEK
       420       430       440       450        460       470      

        480       490       500       510       520       530      
pF1KSD CSAENEEDKKVISLQLDKDHHALYVAFSSCIIRIPLSRCERYGSCKKSCIASRDPYCGWL
       :: .. :::.....:::.   .::::::.:.:..::.::::.:.:::.:::::::::::.
CCDS47 CSYDGVEDKRIMGMQLDRASSSLYVAFSTCVIKVPLGRCERHGKCKKTCIASRDPYCGWI
        480       490       500       510       520       530      

         540       550                       560                   
pF1KSD SQG-SCGRVTPGMLLLTED----------------FFAFHNHSA--------------EG
       ..: .:....:.  :  :.                : :...::.              ::
CCDS47 KEGGACSHLSPNSRLTFEQDIERGNTDGLGDCHNSFVALNGHSSSLLPSTTTSDSTAQEG
        540       550       560       570       580       590      

         570       580                         590       600       
pF1KSD YEQDTEFGNTAHLGDC------------H------GVRWEVQSGESNQMVHMNVLITCVF
       ::.   . .  :: :             :      ::  :      .:.: ...:   :.
CCDS47 YESRGGMLDWKHLLDSPDSTDPLGAVSSHNHQDKKGVIRESYLKGHDQLVPVTLLAIAVI
        600       610       620       630       640       650      

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pF1KSD AAFVLGAFIAGVAVYCYRDMFVRKNRKI--HKDAESAQSCTDSSGSFAKLNGLF-DSPVK
        :::.:: ..:..:::  :   ::.  .  .:. : ..:   : .: .::.::: :.  :
CCDS47 LAFVMGAVFSGITVYCVCDHR-RKDVAVVQRKEKELTHSRRGSMSSVTKLSGLFGDTQSK
        660       670        680       690       700       710     

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pF1KSD EYQ-QNIDSPKLYSNLLTSRKELPPNGDTKSMVMDHRGQPPELAALPTPESTPVLHQKTL
       . . . : .: .... :..    :  :.: .:..    .  .:.:::::::::.:.::  
CCDS47 DPKPEAILTPLMHNGKLAT----P--GNTAKMLIKADQHHLDLTALPTPESTPTLQQKRK
         720       730             740       750       760         

           730         740       750         760       770         
pF1KSD QAMKSHSEKAHGH--GASRKETPQFFPSSPPPHSPL--SHGHIPSAIVLPNATHDYNTSF
        .  :.  . . .  .:  :. : .     :   ::  : .::::..::: . . :.  .
CCDS47 PSRGSREWERNQNLINACTKDMPPMGSPVIPTDLPLRASPSHIPSVVVLPITQQGYQHEY
     770       780       790       800       810       820         

     780       790       800       810       820       830         
pF1KSD SNSNAHKAEKKLQNIDHPLTKSSSKRDHRRSVDSRNTLNDLLKHLNDPNSNPKAIMGDIQ
        .      . :.... .   ....   . ...          .::.. . :         
CCDS47 VD------QPKMSEVAQMALEDQAATLEYKTIK---------EHLSSKSPN---------
     830             840       850                860              

     840       850       860       870       880       890         
pF1KSD MAHQNLMLDPMGSMSEVPPKVPNREASLYSPPSTLPRNSPTKRVDVPTTPGVPMTSLERQ
         :   ... . :.   :::::.:::::  : ..: ... .::...  . .    ... .
CCDS47 --HGVNLVENLDSL---PPKVPQREASLGPPGASLSQTGLSKRLEMHHSSSY---GVDYK
           870          880       890       900       910          

     900        910        920       930       940       950       
pF1KSD RGYHKNSSQR-HSISAMPKN-LNSPNGVLLSRQPSMNRGGYMPTPTGAKVDYIQGTPVSV
       :.:  ::  : :. ... .:  :: :.  :::. :..::   : :.  .:: ::     :
CCDS47 RSYPTNSLTRSHQATTLKRNNTNSSNSSHLSRNQSFGRGDN-PPPAPQRVDSIQ-----V
       920       930       940       950        960       970      

        960            970       980       990      1000      1010 
pF1KSD HL-QPS-----LSRQSSYTSNGTLPRTGLKRTPSLKPDVPPKPSFVPQTPSVRPLNKYTY
       :  :::     .::: : .. ..: :.::::::::::::::::::.: . :..:      
CCDS47 HSSQPSGQAVTVSRQPSLNAYNSLTRSGLKRTPSLKPDVPPKPSFAPLSTSMKPNDACT 
             980       990      1000      1010      1020      1030 

>>CCDS75288.1 SEMA6A gene_id:57556|Hs108|chr5             (1047 aa)
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               10        20        30        40         50         
pF1KSD MRVFLLCAYILLLMVSQLRAVSFPEDDEPLNTVDYHYSRQYPVFRG-RPSGNESQ-HRLD
       ::   :  :. ::   .. ...::::.::..    .:..::::: : .:. : .: ::::
CCDS75 MRSEALLLYFTLL---HFAGAGFPEDSEPISISHGNYTKQYPVFVGHKPGRNTTQRHRLD
               10           20        30        40        50       

       60        70        80        90       100       110        
pF1KSD FQLMLKIRDTLYIAGRDQVYTVNLNEMPKTEVIPNKKLTWRSRQQDRENCAMKGKHKDEC
       .:... .  :::::.::..:::...     :.  .:::::.::: : ..: :::::::::
CCDS75 IQMIMIMNGTLYIAARDHIYTVDIDTSHTEEIYCSKKLTWKSRQADVDTCRMKGKHKDEC
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pF1KSD HNFIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYYRLSTLEYDGEEISGLARCPFDARQTNVALF
       ::::::.. .::. .:::::::::: :: :...:::  :.:.::.::::.::...:::::
CCDS75 HNFIKVLLKKNDDALFVCGTNAFNPSCRNYKMDTLEPFGDEFSGMARCPYDAKHANVALF
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pF1KSD ADGKLYSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPHFLHAIEYGNYVYFFFR
       ::::::::::.:::: :::::::.:.. .:::.:.::::.:::.:..:..::.:.:::::
CCDS75 ADGKLYSATVTDFLAIDAVIYRSLGESPTLRTVKHDSKWLKEPYFVQAVDYGDYIYFFFR
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      240       250       260       270       280       290        
pF1KSD EIAVEHNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSFFYFDVLQ
       :::::.:..::.:. :::..::::::::::::::.::::::::::::::::: :::..::
CCDS75 EIAVEYNTMGKVVFPRVAQVCKNDMGGSQRVLEKQWTSFLKARLNCSVPGDSHFYFNILQ
       240       250       260       270       280       290       

      300       310       320       330       340       350        
pF1KSD SITDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWTAVP
       ..::.:.:::  .:...:.:  ::::::::::..: :: .:: :::::::.:::.:: ::
CCDS75 AVTDVIRINGRDVVLATFSTPYNSIPGSAVCAYDMLDIASVFTGRFKEQKSPDSTWTPVP
       300       310       320       330       340       350       

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pF1KSD EDKVPKPRPGCCAKHGLAEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPPIADEPWFTKTRVR
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CCDS75 DERVPKPRPGCCAGSSSLERYATSNEFPDDTLNFIKTHPLMDEAVPSIFNRPWFLRTMVR
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CCDS75 YRLTKIAVDTAAGPYQNHTVVFLGSEKGIILKFLARIGNSGF-LNDSLFLEEMSVYNSEK
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pF1KSD CSAENEEDKKVISLQLDKDHHALYVAFSSCIIRIPLSRCERYGSCKKSCIASRDPYCGWL
       :: .. :::.....:::.   .::::::.:.:..::.::::.:.:::.:::::::::::.
CCDS75 CSYDGVEDKRIMGMQLDRASSSLYVAFSTCVIKVPLGRCERHGKCKKTCIASRDPYCGWI
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pF1KSD SQG-SCGRVTPGMLLLTED----------------FFAFHN-----------------HS
       ..: .:....:.  :  :.                : :...                 ::
CCDS75 KEGGACSHLSPNSRLTFEQDIERGNTDGLGDCHNSFVALNDISTPLPDNEMSYNTVYGHS
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pF1KSD A--------------EGYEQDTEFGNTAHLGDC------------H------GVRWEVQS
       .              ::::.   . .  :: :             :      ::  :   
CCDS75 SSLLPSTTTSDSTAQEGYESRGGMLDWKHLLDSPDSTDPLGAVSSHNHQDKKGVIRESYL
        600       610       620       630       640       650      

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pF1KSD GESNQMVHMNVLITCVFAAFVLGAFIAGVAVYCYRDMFVRKNRKI--HKDAESAQSCTDS
          .:.: ...:   :. :::.:: ..:..:::  :   ::.  .  .:. : ..:   :
CCDS75 KGHDQLVPVTLLAIAVILAFVMGAVFSGITVYCVCDHR-RKDVAVVQRKEKELTHSRRGS
        660       670       680       690        700       710     

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pF1KSD SGSFAKLNGLF-DSPVKEYQ-QNIDSPKLYSNLLTSRKELPPNGDTKSMVMDHRGQPPEL
        .: .::.::: :.  :. . . : .: .... :..    :  :.: .:..    .  .:
CCDS75 MSSVTKLSGLFGDTQSKDPKPEAILTPLMHNGKLAT----P--GNTAKMLIKADQHHLDL
         720       730       740       750             760         

        710       720       730         740       750         760  
pF1KSD AALPTPESTPVLHQKTLQAMKSHSEKAHGH--GASRKETPQFFPSSPPPHSPL--SHGHI
       .:::::::::.:.::   .  :.  . . .  .:  :. : .     :   ::  : .::
CCDS75 TALPTPESTPTLQQKRKPSRGSREWERNQNLINACTKDMPPMGSPVIPTDLPLRASPSHI
     770       780       790       800       810       820         

            770       780       790       800       810       820  
pF1KSD PSAIVLPNATHDYNTSFSNSNAHKAEKKLQNIDHPLTKSSSKRDHRRSVDSRNTLNDLLK
       ::..::: . . :.  . .      . :.... .   ....   . ...          .
CCDS75 PSVVVLPITQQGYQHEYVD------QPKMSEVAQMALEDQAATLEYKTIK---------E
     830       840             850       860       870             

            830       840       850       860       870       880  
pF1KSD HLNDPNSNPKAIMGDIQMAHQNLMLDPMGSMSEVPPKVPNREASLYSPPSTLPRNSPTKR
       ::.. . :           :   ... . :.   :::::.:::::  : ..: ... .::
CCDS75 HLSSKSPN-----------HGVNLVENLDSL---PPKVPQREASLGPPGASLSQTGLSKR
          880                  890          900       910       920

            890       900        910        920       930       940
pF1KSD VDVPTTPGVPMTSLERQRGYHKNSSQR-HSISAMPKN-LNSPNGVLLSRQPSMNRGGYMP
       ...  . .    ... .:.:  ::  : :. ... .:  :: :.  :::. :..::   :
CCDS75 LEMHHSSSY---GVDYKRSYPTNSLTRSHQATTLKRNNTNSSNSSHLSRNQSFGRGDN-P
                 930       940       950       960       970       

              950        960            970       980       990    
pF1KSD TPTGAKVDYIQGTPVSVHL-QPS-----LSRQSSYTSNGTLPRTGLKRTPSLKPDVPPKP
        :.  .:: ::     ::  :::     .::: : .. ..: :.::::::::::::::::
CCDS75 PPAPQRVDSIQ-----VHSSQPSGQAVTVSRQPSLNAYNSLTRSGLKRTPSLKPDVPPKP
        980            990      1000      1010      1020      1030 

         1000      1010 
pF1KSD SFVPQTPSVRPLNKYTY
       ::.: . :..:      
CCDS75 SFAPLSTSMKPNDACT 
            1040        

>>CCDS984.1 SEMA6C gene_id:10500|Hs108|chr1               (930 aa)
 initn: 2125 init1: 1414 opt: 2147  Z-score: 1643.5  bits: 315.5 E(32554): 3.2e-85
Smith-Waterman score: 2208; 45.5% identity (69.8% similar) in 774 aa overlap (4-756:7-758)

                  10        20        30        40         50      
pF1KSD    MRVFLLCAYILLLMVSQLRAVSFPEDDEPLNTVDYHYSRQYPVFRG-RPSGNESQHR
             :.    .:::.      ..::.:  ::   : . .     ::: . ..  ..  
CCDS98 MPRAPHFMPLLLLLLLLSLPHTQAAFPQDPLPLLISDLQGTSPLSWFRGLEDDAVAAELG
               10        20        30        40        50        60

         60        70        80         90       100       110     
pF1KSD LDFQLMLKIRDTLYIAGRDQVYTVNLNEMPKTE-VIPNKKLTWRSRQQDRENCAMKGKHK
       :::: .: .  :: .:.::.:.. .:.   . : ..::: :::::  :: ::::..::  
CCDS98 LDFQRFLTLNRTLLVAARDHVFSFDLQAEEEGEGLVPNKYLTWRS--QDVENCAVRGKLT
               70        80        90       100         110        

         120       130       140       150       160       170     
pF1KSD DECHNFIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYYRLSTLEYDGEEISGLARCPFDARQTNV
       :::.:.:.:.:: ... ...::::.:.:.:: : ...:. .:::.:: ::::::: :.::
CCDS98 DECYNYIRVLVPWDSQTLLACGTNSFSPVCRSYGITSLQQEGEELSGQARCPFDATQSNV
      120       130       140       150       160       170        

         180       190       200       210       220       230     
pF1KSD ALFADGKLYSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPHFLHAIEYGNYVYF
       :.::.:.:::::.::: :::::.:::.:    ::. ::::::..::::..:.:.:..:::
CCDS98 AIFAEGSLYSATAADFQASDAVVYRSLGPQPPLRSAKYDSKWLREPHFVQALEHGDHVYF
      180       190       200       210       220       230        

         240       250       260       270       280       290     
pF1KSD FFREIAVEHNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSFFYFD
       ::::..::   ::.. .:::::.:: ::::: :.:..::::::: :::::::::: ::::
CCDS98 FFREVSVEDARLGRVQFSRVARVCKRDMGGSPRALDRHWTSFLKLRLNCSVPGDSTFYFD
      240       250       260       270       280       290        

         300       310       320       330       340       350     
pF1KSD VLQSITDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWT
       :::..:  ....:  .. :::::: ::::::::::: .:.::. :.:.::::.. :..::
CCDS98 VLQALTGPVNLHGRSALFGVFTTQTNSIPGSAVCAFYLDEIERGFEGKFKEQRSLDGAWT
      300       310       320       330       340       350        

         360       370       380       390       400       410     
pF1KSD AVPEDKVPKPRPGCCAKHGLAEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPPIADEPWFTKT
        : ::.::.:::: ::  : :  ...: :.::..:.:::.:::.: ::::.. .: .: :
CCDS98 PVSEDRVPSPRPGSCAGVGGAALFSSSRDLPDDVLTFIKAHPLLDPAVPPVTHQPLLTLT
      360       370       380       390       400       410        

         420       430       440       450       460       470     
pF1KSD RVRYRLTAISVDHSAGPYQNYTVIFVGSEAGMVLKVLAKTSPFSLNDSVLLEEIEAYNHA
         :  :: ..::  :::..: ::.:.::. : :::::.  .  .  . .:::::.::. :
CCDS98 S-RALLTQVAVDGMAGPHSNITVMFLGSNDGTVLKVLTPGGRSGGPEPILLEEIDAYSPA
       420       430       440       450       460       470       

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pF1KSD KCSAEN--EEDKKVISLQLDKDHHALYVAFSSCIIRIPLSRCERYGSCKKSCIASRDPYC
       .::..   .  ...:.:.:: . : :.::::.::. .::::: :.:.:..::.::.::::
CCDS98 RCSGKRTAQTARRIIGLELDTEGHRLFVAFSGCIVYLPLSRCARHGACQRSCLASQDPYC
       480       490       500       510       520       530       

           540       550       560       570       580        590  
pF1KSD GWLSQGSCGRVTPGMLLLTEDFFAFHNHSAEGYEQDTEFGNTAHLGDC-HGVRWEVQSGE
       :: :. .:  .  :      :  . ..   .:  ::   :. .  ::  .::: ..  . 
CCDS98 GWHSSRGCVDIR-GSGGTDVDQAGNQESMEHGDCQDGATGSQSGPGDSAYGVRRDLPPAS
       540        550       560       570       580       590      

            600       610       620       630       640        650 
pF1KSD SNQMVHMNVLITCVFAAFVLGAFIAGVAVYCYRDMFVRKNRKIHKDAESAQSCTDSS-GS
       ... : . .:.. : :::.::: ..:. : :      : .:.  :: :.       :  :
CCDS98 ASRSVPIPLLLASVAAAFALGASVSGLLVSC---ACRRAHRRRGKDIETPGLPRPLSLRS
        600       610       620          630       640       650   

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pF1KSD FAKLNGLFDSPVKEYQQN--IDSPKLYSNLLTSRKELPPNGDTKSMVMDHRGQPPELAAL
       .:.:.:    :    ...  ...:.::...:      ::.:            ::::: :
CCDS98 LARLHGGGPEPPPPSKDGDAVQTPQLYTTFLP-----PPEGVP----------PPELACL
           660       670       680            690                  

     710       720              730       740             750      
pF1KSD PTPESTPVLHQKTLQAM-------KSHSEKAHGHGASRK------ETPQFFPSSPPPHSP
       ::::::: :  : :.:        .....  .: : ::        .:. .   :::  :
CCDS98 PTPESTPELPVKHLRAAGDPWEWNQNRNNAKEGPGRSRGGHAAGGPAPRVLVRPPPPGCP
      700       710       720       730       740       750        

        760       770       780       790       800       810      
pF1KSD LSHGHIPSAIVLPNATHDYNTSFSNSNAHKAEKKLQNIDHPLTKSSSKRDHRRSVDSRNT
                                                                   
CCDS98 GQAVEVTTLEELLRYLHGPQPPRKGAEPPAPLTSRALPPEPAPALLGGPSPRPHECASPL
      760       770       780       790       800       810        

>>CCDS12131.1 SEMA6B gene_id:10501|Hs108|chr19            (888 aa)
 initn: 1840 init1: 1413 opt: 2014  Z-score: 1542.6  bits: 296.8 E(32554): 1.3e-79
Smith-Waterman score: 2172; 44.9% identity (70.5% similar) in 786 aa overlap (10-765:15-777)

                    10        20        30        40        50     
pF1KSD      MRVFLLCAYILLLMVSQLRAVSFPEDDEPLNTVDYHYSRQYPVFRGRPSGN----
                     .:::...  ... :::.  ::...   :  .:::: :   :     
CCDS12 MQTPRASPPRPALLLLLLLLGGAHGL-FPEEPPPLSVAPRDYLNHYPVFVGSGPGRLTPA
               10        20         30        40        50         

              60        70        80        90       100       110 
pF1KSD ESQHRLDFQLMLKIRDTLYIAGRDQVYTVNLNEMPKTEVIPNKKLTWRSRQQDRENCAMK
       :.   :..: .:..  ::.:. ::..: :.:.   .::.  ..::::::  .: . : ::
CCDS12 EGADDLNIQRVLRVNRTLFIGDRDNLYRVELEPPTSTELRYQRKLTWRSNPSDINVCRMK
      60        70        80        90       100       110         

             120       130       140       150       160       170 
pF1KSD GKHKDECHNFIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYYRLSTLEYDGEEISGLARCPFDAR
       ::.. ::.::.::.. :..  .::::.:::::.:  : ..::.  :..:::.::::.: .
CCDS12 GKQEGECRNFVKVLLLRDESTLFVCGSNAFNPVCANYSIDTLQPVGDNISGMARCPYDPK
     120       130       140       150       160       170         

             180       190       200       210       220       230 
pF1KSD QTNVALFADGKLYSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPHFLHAIEYGN
       ..:::::.:: :..:::.:::: :::::::.::  .:::.:.::::.:::.:.::.:.:.
CCDS12 HANVALFSDGMLFTATVTDFLAIDAVIYRSLGDRPTLRTVKHDSKWFKEPYFVHAVEWGS
     180       190       200       210       220       230         

             240       250       260       270       280       290 
pF1KSD YVYFFFREIAVEHNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSF
       .:::::::::.: : : :.: :::::.::::.::: :::::.::::::::::::::::: 
CCDS12 HVYFFFREIAMEFNYLEKVVVSRVARVCKNDVGGSPRVLEKQWTSFLKARLNCSVPGDSH
     240       250       260       270       280       290         

             300       310       320       330       340       350 
pF1KSD FYFDVLQSITDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPD
       :::.:::..: .....: :.:..::.:  :::::::::::.. ..  ::.:::.:::.:.
CCDS12 FYFNVLQAVTGVVSLGGRPVVLAVFSTPSNSIPGSAVCAFDLTQVAAVFEGRFREQKSPE
     300       310       320       330       340       350         

             360       370       380       390       400       410 
pF1KSD SVWTAVPEDKVPKPRPGCCAKHGLAEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPPIADEPW
       :.:: ::::.::.:::::::  :.   :..:  .::. :.:.:.::::: ::: ..  ::
CCDS12 SIWTPVPEDQVPRPRPGCCAAPGMQ--YNASSALPDDILNFVKTHPLMDEAVPSLGHAPW
     360       370       380         390       400       410       

             420       430       440       450           460       
pF1KSD FTKTRVRYRLTAISVDHSAGPYQNYTVIFVGSEAGMVLKVL----AKTSPFSLNDSVLLE
       . .: .:..:: ..:: .:::. : ::.:.::::: ::: :    :.::  : . ::.::
CCDS12 ILRTLMRHQLTRVAVDVGAGPWGNQTVVFLGSEAGTVLKFLVRPNASTSGTS-GLSVFLE
       420       430       440       450       460        470      

       470       480         490       500       510       520     
pF1KSD EIEAYNHAKCSAEN--EEDKKVISLQLDKDHHALYVAFSSCIIRIPLSRCERYGSCKKSC
       :.:.:   .:.  .  :  ....::.::    .: .::  :..:.:..::..:..: :.:
CCDS12 EFETYRPDRCGRPGGGETGQRLLSLELDAASGGLLAAFPRCVVRVPVARCQQYSGCMKNC
        480       490       500       510       520       530      

         530       540       550       560       570       580     
pF1KSD IASRDPYCGWLSQGSCGRVTPGMLLLTEDFFAFHNHSAEGYEQDTEFGNTAHLGDCHGVR
       :.:.::::::  .:::  ..::              .  ..:::.  ..:. :::: :. 
CCDS12 IGSQDPYCGWAPDGSCIFLSPG--------------TRAAFEQDVSGASTSGLGDCTGLL
        540       550                     560       570       580  

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pF1KSD WEVQSGESNQMVHMNVLITCVFAAFVLGAFIAGVAVYCYRDMFVRKNRKIHKDAES--AQ
           : .   .: .:.:.:   ::::.:: ..: .:  .  .  :..   .:: :.  :.
CCDS12 RASLSEDRAGLVSVNLLVTSSVAAFVVGAVVSGFSVGWFVGLRERRELARRKDKEAILAH
            590       600       610       620       630       640  

           650        660       670       680       690       700  
pF1KSD SCTDSSGSFAKLNGLF-DSPVKEYQQNIDSPKLYSNLLTSRKELPPNGDTKSMVMDHRGQ
       .  ..  : ..:.    ..:  .   .  .  .  . : .   :  :: .:. ..  .: 
CCDS12 GAGEAVLSVSRLGERRAQGPGGRGGGGGGGAGVPPEALLA--PLMQNGWAKATLL--QGG
            650       660       670       680         690          

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pF1KSD PPELAA--LPTPESTPVLHQKTLQAMKSHSE----KA--HGHG---ASRKET-----PQF
       : .: .  :::::.:: : :: : . . : .    .:  :::    :: . .     :  
CCDS12 PHDLDSGLLPTPEQTP-LPQKRLPTPHPHPHALGPRAWDHGHPLLPASASSSLLLLAPAR
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        : .:: :  :   :.. .:                                        
CCDS12 APEQPPAPGEPTPDGRLYAARPGRASHGDFPLTPHASPDRRRVVSAPTGPLDPASAADGL
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