Result of FASTA (ccds) for pF1KSDA1242
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA1242, 493 aa
  1>>>pF1KSDA1242 493 - 493 aa - 493 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4569+/-0.00117; mu= 7.4695+/- 0.069
 mean_var=148.5769+/-31.790, 0's: 0 Z-trim(106.9): 145  B-trim: 201 in 1/50
 Lambda= 0.105220
 statistics sampled from 9087 (9272) to 9087 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.647), E-opt: 0.2 (0.285), width:  16
 Scan time:  3.320

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS12109.1 FZR1 gene_id:51343|Hs108|chr19         ( 493) 3300 513.3 2.4e-145
CCDS45916.1 FZR1 gene_id:51343|Hs108|chr19         ( 496) 3284 510.9 1.3e-144
CCDS45917.1 FZR1 gene_id:51343|Hs108|chr19         ( 404) 1856 294.1   2e-79
CCDS484.1 CDC20 gene_id:991|Hs108|chr1             ( 499) 1094 178.5 1.5e-44
CCDS54852.1 CDC20B gene_id:166979|Hs108|chr5       ( 519)  731 123.4 6.1e-28
CCDS3966.1 CDC20B gene_id:166979|Hs108|chr5        ( 515)  720 121.7 1.9e-27
CCDS47207.1 CDC20B gene_id:166979|Hs108|chr5       ( 477)  479 85.1 1.9e-16


>>CCDS12109.1 FZR1 gene_id:51343|Hs108|chr19              (493 aa)
 initn: 3300 init1: 3300 opt: 3300  Z-score: 2723.0  bits: 513.3 E(32554): 2.4e-145
Smith-Waterman score: 3300; 100.0% identity (100.0% similar) in 493 aa overlap (1-493:1-493)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MDQDYERRLLRQIVIQNENTMPRVTEMRRTLTPASSPVSSPSKHGDRFIPSRAGANWSVN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MDQDYERRLLRQIVIQNENTMPRVTEMRRTLTPASSPVSSPSKHGDRFIPSRAGANWSVN
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD FHRINENEKSPSQNRKAKDATSDNGKDGLAYSALLKNELLGAGIEKVQDPQTEDRRLQPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 FHRINENEKSPSQNRKAKDATSDNGKDGLAYSALLKNELLGAGIEKVQDPQTEDRRLQPS
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD TPEKKGLFTYSLSTKRSSPDDGNDVSPYSLSPVSNKSQKLLRSPRKPTRKISKIPFKVLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TPEKKGLFTYSLSTKRSSPDDGNDVSPYSLSPVSNKSQKLLRSPRKPTRKISKIPFKVLD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD APELQDDFYLNLVDWSSLNVLSVGLGTCVYLWSACTSQVTRLCDLSVEGDSVTSVGWSER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 APELQDDFYLNLVDWSSLNVLSVGLGTCVYLWSACTSQVTRLCDLSVEGDSVTSVGWSER
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD GNLVAVGTHKGFVQIWDAAAGKKLSMLEGHTARVGALAWNAEQLSSGSRDRMILQRDIRT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GNLVAVGTHKGFVQIWDAAAGKKLSMLEGHTARVGALAWNAEQLSSGSRDRMILQRDIRT
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD PPLQSERRLQGHRQEVCGLKWSTDHQLLASGGNDNKLLVWNHSSLSPVQQYTEHLAAVKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PPLQSERRLQGHRQEVCGLKWSTDHQLLASGGNDNKLLVWNHSSLSPVQQYTEHLAAVKA
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD IAWSPHQHGLLASGGGTADRCIRFWNTLTGQPLQCIDTGSQVCNLAWSKHANELVSTHGY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 IAWSPHQHGLLASGGGTADRCIRFWNTLTGQPLQCIDTGSQVCNLAWSKHANELVSTHGY
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD SQNQILVWKYPSLTQVAKLTGHSYRVLYLAMSPDGEAIVTGAGDETLRFWNVFSKTRSTK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SQNQILVWKYPSLTQVAKLTGHSYRVLYLAMSPDGEAIVTGAGDETLRFWNVFSKTRSTK
              430       440       450       460       470       480

              490   
pF1KSD ESVSVLNLFTRIR
       :::::::::::::
CCDS12 ESVSVLNLFTRIR
              490   

>>CCDS45916.1 FZR1 gene_id:51343|Hs108|chr19              (496 aa)
 initn: 3286 init1: 3225 opt: 3284  Z-score: 2709.9  bits: 510.9 E(32554): 1.3e-144
Smith-Waterman score: 3284; 99.4% identity (99.4% similar) in 496 aa overlap (1-493:1-496)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MDQDYERRLLRQIVIQNENTMPRVTEMRRTLTPASSPVSSPSKHGDRFIPSRAGANWSVN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MDQDYERRLLRQIVIQNENTMPRVTEMRRTLTPASSPVSSPSKHGDRFIPSRAGANWSVN
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD FHRINENEKSPSQNRKAKDATSDNGKDGLAYSALLKNELLGAGIEKVQDPQTEDRRLQPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 FHRINENEKSPSQNRKAKDATSDNGKDGLAYSALLKNELLGAGIEKVQDPQTEDRRLQPS
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD TPEKKGLFTYSLSTKRSSPDDGNDVSPYSLSPVSNKSQKLLRSPRKPTRKISKIPFKVLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TPEKKGLFTYSLSTKRSSPDDGNDVSPYSLSPVSNKSQKLLRSPRKPTRKISKIPFKVLD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD APELQDDFYLNLVDWSSLNVLSVGLGTCVYLWSACTSQVTRLCDLSVEGDSVTSVGWSER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 APELQDDFYLNLVDWSSLNVLSVGLGTCVYLWSACTSQVTRLCDLSVEGDSVTSVGWSER
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD GNLVAVGTHKGFVQIWDAAAGKKLSMLEGHTARVGALAWNAEQLSSGSRDRMILQRDIRT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GNLVAVGTHKGFVQIWDAAAGKKLSMLEGHTARVGALAWNAEQLSSGSRDRMILQRDIRT
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD PPLQSERRLQGHRQEVCGLKWSTDHQLLASGGNDNKLLVWNHSSLSPVQQYTEHLAAVKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PPLQSERRLQGHRQEVCGLKWSTDHQLLASGGNDNKLLVWNHSSLSPVQQYTEHLAAVKA
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD IAWSPHQHGLLASGGGTADRCIRFWNTLTGQPLQCIDTGSQVCNLAWSKHANELVSTHGY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 IAWSPHQHGLLASGGGTADRCIRFWNTLTGQPLQCIDTGSQVCNLAWSKHANELVSTHGY
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD SQNQILVWKYPSLTQVAKLTGHSYRVLYLAMSPDGEAIVTGAGDETLRFWNVFSKTRSTK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SQNQILVWKYPSLTQVAKLTGHSYRVLYLAMSPDGEAIVTGAGDETLRFWNVFSKTRSTK
              430       440       450       460       470       480

                 490   
pF1KSD ---ESVSVLNLFTRIR
          :::::::::::::
CCDS45 VKWESVSVLNLFTRIR
              490      

>>CCDS45917.1 FZR1 gene_id:51343|Hs108|chr19              (404 aa)
 initn: 1856 init1: 1856 opt: 1856  Z-score: 1539.6  bits: 294.1 E(32554): 2e-79
Smith-Waterman score: 2518; 81.9% identity (81.9% similar) in 493 aa overlap (1-493:1-404)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MDQDYERRLLRQIVIQNENTMPRVTEMRRTLTPASSPVSSPSKHGDRFIPSRAGANWSVN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MDQDYERRLLRQIVIQNENTMPRVTEMRRTLTPASSPVSSPSKHGDRFIPSRAGANWSVN
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD FHRINENEKSPSQNRKAKDATSDNGKDGLAYSALLKNELLGAGIEKVQDPQTEDRRLQPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 FHRINENEKSPSQNRKAKDATSDNGKDGLAYSALLKNELLGAGIEKVQDPQTEDRRLQPS
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD TPEKKGLFTYSLSTKRSSPDDGNDVSPYSLSPVSNKSQKLLRSPRKPTRKISKIPFKVLD
       :::::::::                                                   
CCDS45 TPEKKGLFT---------------------------------------------------
                                                                   

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD APELQDDFYLNLVDWSSLNVLSVGLGTCVYLWSACTSQVTRLCDLSVEGDSVTSVGWSER
                                             ::::::::::::::::::::::
CCDS45 --------------------------------------VTRLCDLSVEGDSVTSVGWSER
                                           130       140       150 

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD GNLVAVGTHKGFVQIWDAAAGKKLSMLEGHTARVGALAWNAEQLSSGSRDRMILQRDIRT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GNLVAVGTHKGFVQIWDAAAGKKLSMLEGHTARVGALAWNAEQLSSGSRDRMILQRDIRT
             160       170       180       190       200       210 

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD PPLQSERRLQGHRQEVCGLKWSTDHQLLASGGNDNKLLVWNHSSLSPVQQYTEHLAAVKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PPLQSERRLQGHRQEVCGLKWSTDHQLLASGGNDNKLLVWNHSSLSPVQQYTEHLAAVKA
             220       230       240       250       260       270 

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD IAWSPHQHGLLASGGGTADRCIRFWNTLTGQPLQCIDTGSQVCNLAWSKHANELVSTHGY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 IAWSPHQHGLLASGGGTADRCIRFWNTLTGQPLQCIDTGSQVCNLAWSKHANELVSTHGY
             280       290       300       310       320       330 

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD SQNQILVWKYPSLTQVAKLTGHSYRVLYLAMSPDGEAIVTGAGDETLRFWNVFSKTRSTK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SQNQILVWKYPSLTQVAKLTGHSYRVLYLAMSPDGEAIVTGAGDETLRFWNVFSKTRSTK
             340       350       360       370       380       390 

              490   
pF1KSD ESVSVLNLFTRIR
       :::::::::::::
CCDS45 ESVSVLNLFTRIR
             400    

>>CCDS484.1 CDC20 gene_id:991|Hs108|chr1                  (499 aa)
 initn: 1157 init1: 490 opt: 1094  Z-score: 913.2  bits: 178.5 E(32554): 1.5e-44
Smith-Waterman score: 1113; 41.3% identity (67.2% similar) in 458 aa overlap (29-473:58-473)

                 10        20        30         40         50      
pF1KSD   MDQDYERRLLRQIVIQNENTMPRVTEMRRTLTPASSPV-SSPSKHG-DRFIPSRAGAN
                                     ::   .:: : ..::: : ::.:: :..:.
CCDS48 WQRKAKEAAGPAPSPMRAANRSHSAGRTPGRTPGKSSSKVQTTPSKPGGDRYIPHRSAAQ
        30        40        50        60        70        80       

         60             70         80        90       100          
pF1KSD WSVNFHRIN-----ENEKSPSQNRKAKD-ATSDNGKDGLAYSALLKNELLGAGIEKVQD-
         :    ..     :: ..:..... :  : . :: : .  . .:.  : :    : :. 
CCDS48 MEVASFLLSKENQPENSQTPTKKEHQKAWALNLNGFD-VEEAKILR--LSG----KPQNA
        90       100       110       120        130             140

     110       120       130       140       150       160         
pF1KSD PQTEDRRLQPSTPEKKGLFTYSLSTKRSSPDDGNDVSPYSLSPVSNKSQKLLRSPRKPTR
       :.  . ::.             : .....:                       : ::  :
CCDS48 PEGYQNRLK------------VLYSQKATPG----------------------SSRKTCR
                          150                             160      

     170       180       190       200       210       220         
pF1KSD KISKIPFKVLDAPELQDDFYLNLVDWSSLNVLSVGLGTCVYLWSACTSQVTRLCDLSVEG
        : ..: ..:::::...:.::::::::: :::.:.: . :::::: .... .: ..   :
CCDS48 YIPSLPDRILDAPEIRNDYYLNLVDWSSGNVLAVALDNSVYLWSASSGDILQLLQMEQPG
        170       180       190       200       210       220      

     230       240       250       260       270       280         
pF1KSD DSVTSVGWSERGNLVAVGTHKGFVQIWDAAAGKKLSMLEGHTARVGALAWNAEQLSSGSR
       . ..::.: ..:: .:::: .. ::.::.   :.:  . .:.::::.:.::.  ::::::
CCDS48 EYISSVAWIKEGNYLAVGTSSAEVQLWDVQQQKRLRNMTSHSARVGSLSWNSYILSSGSR
        230       240       250       260       270       280      

     290       300       310       320       330       340         
pF1KSD DRMILQRDIRTPPLQSERRLQGHRQEVCGLKWSTDHQLLASGGNDNKLLVW----NHSSL
       .  : ..:.:.   .    :.:: ::::::.:. : . :::::::: . ::    .... 
CCDS48 SGHIHHHDVRVAE-HHVATLSGHSQEVCGLRWAPDGRHLASGGNDNLVNVWPSAPGEGGW
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pF1KSD SPVQQYTEHLAAVKAIAWSPHQHGLLASGGGTADRCIRFWNTLTGQPLQCIDTGSQVCNL
        :.: .:.: .::::.:: : : ..::.::::.:: ::.::. .:  :. .:. ::::..
CCDS48 VPLQTFTQHQGAVKAVAWCPWQSNVLATGGGTSDRHIRIWNVCSGACLSAVDAHSQVCSI
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pF1KSD AWSKHANELVSTHGYSQNQILVWKYPSLTQVAKLTGHSYRVLYLAMSPDGEAIVTGAGDE
        :: : .::.: ::..:::...::::....::.: ::. ::: :.::::: .....:.::
CCDS48 LWSPHYKELISGHGFAQNQLVIWKYPTMAKVAELKGHTSRVLSLTMSPDGATVASAAADE
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         470       480       490         
pF1KSD TLRFWNVFSKTRSTKESVSVLNLFTRIR      
       :::.:  :                          
CCDS48 TLRLWRCFELDPARRREREKASAAKSSLIHQGIR
         470       480       490         

>>CCDS54852.1 CDC20B gene_id:166979|Hs108|chr5            (519 aa)
 initn: 710 init1: 323 opt: 731  Z-score: 615.1  bits: 123.4 E(32554): 6.1e-28
Smith-Waterman score: 731; 37.1% identity (68.0% similar) in 294 aa overlap (184-473:228-519)

           160       170       180       190       200       210   
pF1KSD SNKSQKLLRSPRKPTRKISKIPFKVLDAPELQDDFYLNLVDWSSLNVLSVGLGTCVYLWS
                                     :..:.:::..:::  :.....::. ::.:.
CCDS54 GVRDESFHLKSSGDINDSILQPEVKIHITGLRNDYYLNILDWSFQNLVAIALGSAVYIWN
       200       210       220       230       240       250       

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pF1KSD ACTSQVTRLCDLSVEGDSVTSVGWSERGNLVAVGTHKGFVQIWDAAAGKKLSMLEGHTAR
       . . .  .  :::.  . ..::.: ..:. .:::: .: ::.::... :.:  . :: . 
CCDS54 GENHNGIENIDLSLTCNYISSVSWIKEGTCLAVGTSEGEVQLWDVVTKKRLRNMLGHLSV
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pF1KSD VGALAWNAEQLSSGSRDRMILQRDIRTPPLQSERRLQGHRQEVCGLKWSTDHQLLASGGN
       ::::.::   ::::::   . ..:.:.   : .     :.: ::.:::: : .::.:: .
CCDS54 VGALSWNHFILSSGSRLGRVYHHDVRVA--QHHVGTLRHKQAVCALKWSPDGRLLSSGCS
       320       330       340         350       360       370     

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pF1KSD DNKLLVWNHSSLSPVQ----QYTEHLAAVKAIAWSPHQHGLLASGGGTADRCIRFWNTLT
       :. : .: :.  . .:    .   . .::::. : : : :.:: :::  :  ... .  .
CCDS54 DGLLTIWPHDPGASAQGQPLKVITQSTAVKAMDWCPWQSGVLAIGGGMKDGRLHILDINA
         380       390       400       410       420       430     

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pF1KSD GQPLQCIDTGSQVCNLAWSKHANELVSTHGYSQNQILVWKYPSLTQVAKLTGHSYRVLYL
       :. .:  .:.::.:.: :  ...:... .:  .:.. ::  :.... . . ::  :::.:
CCDS54 GKSIQTPSTNSQICSLIWLPKTKEIATGQGTPKNDVTVWTCPTVSRSGGFFGHRGRVLHL
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pF1KSD AMSPDGEAIVTGAGDETLRFWNVFSKTRSTKESVSVLNLFTRIR
       ..:::   . ..:.: :   :: .                    
CCDS54 SLSPDQTRVFSAAADGTASVWNCY                    
         500       510                             

>>CCDS3966.1 CDC20B gene_id:166979|Hs108|chr5             (515 aa)
 initn: 635 init1: 323 opt: 720  Z-score: 606.2  bits: 121.7 E(32554): 1.9e-27
Smith-Waterman score: 720; 37.1% identity (67.7% similar) in 294 aa overlap (184-473:228-515)

           160       170       180       190       200       210   
pF1KSD SNKSQKLLRSPRKPTRKISKIPFKVLDAPELQDDFYLNLVDWSSLNVLSVGLGTCVYLWS
                                     :..:.:::..:::  :.....::. ::.:.
CCDS39 GVRDESFHLKSSGDINDSILQPEVKIHITGLRNDYYLNILDWSFQNLVAIALGSAVYIWN
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pF1KSD ACTSQVTRLCDLSVEGDSVTSVGWSERGNLVAVGTHKGFVQIWDAAAGKKLSMLEGHTAR
       . . .  .  :::.  . ..::.: ..:. .:::: .: ::.::... :.:  . :: . 
CCDS39 GENHNGIENIDLSLTCNYISSVSWIKEGTCLAVGTSEGEVQLWDVVTKKRLRNMLGHLSV
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pF1KSD VGALAWNAEQLSSGSRDRMILQRDIRTPPLQSERRLQGHRQEVCGLKWSTDHQLLASGGN
       ::::.::   ::::::   . ..:.:.   : .     :.: ::.:::: : .::.:: .
CCDS39 VGALSWNHFILSSGSRLGRVYHHDVRVA--QHHVGTLRHKQAVCALKWSPDGRLLSSGCS
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pF1KSD DNKLLVWNHSSLSPVQ----QYTEHLAAVKAIAWSPHQHGLLASGGGTADRCIRFWNTLT
       :. : .: :.  . .:    .   . .::::. : : : :.:: :::  :  ... .  .
CCDS39 DGLLTIWPHDPGASAQGQPLKVITQSTAVKAMDWCPWQSGVLAIGGGMKDGRLHILDINA
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pF1KSD GQPLQCIDTGSQVCNLAWSKHANELVSTHGYSQNQILVWKYPSLTQVAKLTGHSYRVLYL
       :. .:  .:.::.:.: :  ...:... .:  .:.. ::  :....    .::  :::.:
CCDS39 GKSIQTPSTNSQICSLIWLPKTKEIATGQGTPKNDVTVWTCPTVSR----SGHRGRVLHL
         440       450       460       470       480           490 

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pF1KSD AMSPDGEAIVTGAGDETLRFWNVFSKTRSTKESVSVLNLFTRIR
       ..:::   . ..:.: :   :: .                    
CCDS39 SLSPDQTRVFSAAADGTASVWNCY                    
             500       510                         

>>CCDS47207.1 CDC20B gene_id:166979|Hs108|chr5            (477 aa)
 initn: 559 init1: 323 opt: 479  Z-score: 408.9  bits: 85.1 E(32554): 1.9e-16
Smith-Waterman score: 580; 33.6% identity (61.0% similar) in 292 aa overlap (184-473:228-477)

           160       170       180       190       200       210   
pF1KSD SNKSQKLLRSPRKPTRKISKIPFKVLDAPELQDDFYLNLVDWSSLNVLSVGLGTCVYLWS
                                     :..:.:::..:::  :.....::. ::.:.
CCDS47 GVRDESFHLKSSGDINDSILQPEVKIHITGLRNDYYLNILDWSFQNLVAIALGSAVYIWN
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           220       230       240       250       260       270   
pF1KSD ACTSQVTRLCDLSVEGDSVTSVGWSERGNLVAVGTHKGFVQIWDAAAGKKLSMLEGHTAR
       . . .  .  :::.  . ..::.: ..:. .:::: .: ::.::... :.:  . :: . 
CCDS47 GENHNGIENIDLSLTCNYISSVSWIKEGTCLAVGTSEGEVQLWDVVTKKRLRNMLGHLSV
       260       270       280       290       300       310       

           280       290       300       310       320       330   
pF1KSD VGALAWNAEQLSSGSRDRMILQRDIRTPPLQSERRLQGHRQEVCGLKWSTDHQLLASGGN
       ::::.::   ::::::   . ..:.:.   : .     :.: ::.:::: : .::.:: .
CCDS47 VGALSWNHFILSSGSRLGRVYHHDVRVA--QHHVGTLRHKQAVCALKWSPDGRLLSSGCS
       320       330       340         350       360       370     

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pF1KSD DNKLLVWNHSSLSPVQQYTEHLAAVKAIAWSPHQHGLLASGGGTADRCIRFWNTLTGQPL
       :. : .:                        ::. :  :.:                :::
CCDS47 DGLLTIW------------------------PHDPGASAQG----------------QPL
         380                               390                     

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pF1KSD QCI--DTGSQVCNLAWSKHANELVSTHGYSQNQILVWKYPSLTQVAKLTGHSYRVLYLAM
       . :  .:. ..:.: :  ...:... .:  .:.. ::  :.... . . ::  :::.:..
CCDS47 KVITQSTAVKICSLIWLPKTKEIATGQGTPKNDVTVWTCPTVSRSGGFFGHRGRVLHLSL
         400       410       420       430       440       450     

             460       470       480       490   
pF1KSD SPDGEAIVTGAGDETLRFWNVFSKTRSTKESVSVLNLFTRIR
       :::   . ..:.: :   :: .                    
CCDS47 SPDQTRVFSAAADGTASVWNCY                    
         460       470                           




493 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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