Result of FASTA (ccds) for pF1KSDA1142
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA1142, 438 aa
  1>>>pF1KSDA1142 438 - 438 aa - 438 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.8820+/-0.0012; mu= -9.7177+/- 0.072
 mean_var=443.5021+/-92.813, 0's: 0 Z-trim(115.4): 596  B-trim: 229 in 1/52
 Lambda= 0.060901
 statistics sampled from 15300 (15951) to 15300 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.786), E-opt: 0.2 (0.49), width:  16
 Scan time:  3.120

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS33019.1 PAK4 gene_id:10298|Hs108|chr19         ( 438) 2972 275.0   1e-73
CCDS12528.1 PAK4 gene_id:10298|Hs108|chr19         ( 591) 2503 234.0 3.2e-61
CCDS13107.1 PAK5 gene_id:57144|Hs108|chr20         ( 719) 1730 166.1   1e-40
CCDS10054.1 PAK6 gene_id:56924|Hs108|chr15         ( 681) 1537 149.1 1.2e-35
CCDS61590.1 PAK6 gene_id:56924|Hs108|chr15         ( 636) 1099 110.6 4.5e-24
CCDS3321.1 PAK2 gene_id:5062|Hs108|chr3            ( 524) 1088 109.6 7.7e-24
CCDS14554.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX           ( 544) 1085 109.3 9.5e-24
CCDS48153.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX           ( 559) 1085 109.3 9.7e-24
CCDS48152.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX           ( 565) 1085 109.3 9.8e-24
CCDS48151.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX           ( 580) 1085 109.4 9.9e-24
CCDS8250.1 PAK1 gene_id:5058|Hs108|chr11           ( 545) 1073 108.3   2e-23
CCDS44687.1 PAK1 gene_id:5058|Hs108|chr11          ( 553) 1021 103.7 4.7e-22
CCDS47900.1 STK3 gene_id:6788|Hs108|chr8           ( 491)  676 73.4 5.8e-13
CCDS59108.1 STK3 gene_id:6788|Hs108|chr8           ( 519)  676 73.4   6e-13
CCDS58707.1 MAP4K3 gene_id:8491|Hs108|chr2         ( 873)  679 73.8 7.3e-13
CCDS1803.1 MAP4K3 gene_id:8491|Hs108|chr2          ( 894)  679 73.9 7.4e-13
CCDS13341.1 STK4 gene_id:6789|Hs108|chr20          ( 487)  668 72.6 9.4e-13
CCDS42564.1 MAP4K1 gene_id:11184|Hs108|chr19       ( 821)  658 72.0 2.5e-12
CCDS59385.1 MAP4K1 gene_id:11184|Hs108|chr19       ( 833)  658 72.0 2.5e-12
CCDS81582.1 MAP4K2 gene_id:5871|Hs108|chr11        ( 812)  655 71.7   3e-12
CCDS8082.1 MAP4K2 gene_id:5871|Hs108|chr11         ( 820)  655 71.7   3e-12
CCDS14631.1 STK26 gene_id:51765|Hs108|chrX         ( 416)  646 70.7 3.2e-12
CCDS32001.1 STK24 gene_id:8428|Hs108|chr13         ( 431)  641 70.2 4.4e-12
CCDS9488.1 STK24 gene_id:8428|Hs108|chr13          ( 443)  641 70.2 4.5e-12
CCDS2549.1 STK25 gene_id:10494|Hs108|chr2          ( 426)  617 68.1 1.9e-11
CCDS76334.1 SLK gene_id:9748|Hs108|chr10           (1204)  616 68.4 4.3e-11
CCDS7553.1 SLK gene_id:9748|Hs108|chr10            (1235)  616 68.5 4.4e-11
CCDS34290.1 STK10 gene_id:6793|Hs108|chr5          ( 968)  603 67.2 8.1e-11
CCDS9188.1 TAOK3 gene_id:51347|Hs108|chr12         ( 898)  600 66.9 9.2e-11


>>CCDS33019.1 PAK4 gene_id:10298|Hs108|chr19              (438 aa)
 initn: 2972 init1: 2972 opt: 2972  Z-score: 1437.1  bits: 275.0 E(32554): 1e-73
Smith-Waterman score: 2972; 100.0% identity (100.0% similar) in 438 aa overlap (1-438:1-438)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MFGKRKKRVEISAPSNFEHRVHTGFDQHEQKFTGLPRQWQSLIEESARRPKPLVDPACIT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MFGKRKKRVEISAPSNFEHRVHTGFDQHEQKFTGLPRQWQSLIEESARRPKPLVDPACIT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD SIQPGAPKGEPHDVAPNGPSAGGLAIPQSSSSSSRPPTRARGAPSPGVLGPHASEPQLAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SIQPGAPKGEPHDVAPNGPSAGGLAIPQSSSSSSRPPTRARGAPSPGVLGPHASEPQLAP
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD PACTPAAPAVPGPPGPRSPQREPQRVSHEQFRAALQLVVDPGDPRSYLDNFIKIGEGSTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PACTPAAPAVPGPPGPRSPQREPQRVSHEQFRAALQLVVDPGDPRSYLDNFIKIGEGSTG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD IVCIATVRSSGKLVAVKKMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQHENVVEMYNSYLVGDELWV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 IVCIATVRSSGKLVAVKKMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQHENVVEMYNSYLVGDELWV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD VMEFLEGGALTDIVTHTRMNEEQIAAVCLAVLQALSVLHAQGVIHRDIKSDSILLTHDGR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VMEFLEGGALTDIVTHTRMNEEQIAAVCLAVLQALSVLHAQGVIHRDIKSDSILLTHDGR
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD VKLSDFGFCAQVSKEVPRRKSLVGTPYWMAPELISRLPYGPEVDIWSLGIMVIEMVDGEP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VKLSDFGFCAQVSKEVPRRKSLVGTPYWMAPELISRLPYGPEVDIWSLGIMVIEMVDGEP
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD PYFNEPPLKAMKMIRDNLPPRLKNLHKVSPSLKGFLDRLLVRDPAQRATAAELLKHPFLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PYFNEPPLKAMKMIRDNLPPRLKNLHKVSPSLKGFLDRLLVRDPAQRATAAELLKHPFLA
              370       380       390       400       410       420

              430        
pF1KSD KAGPPASIVPLMRQNRTR
       ::::::::::::::::::
CCDS33 KAGPPASIVPLMRQNRTR
              430        

>>CCDS12528.1 PAK4 gene_id:10298|Hs108|chr19              (591 aa)
 initn: 2499 init1: 2499 opt: 2503  Z-score: 1212.7  bits: 234.0 E(32554): 3.2e-61
Smith-Waterman score: 2503; 90.3% identity (92.7% similar) in 424 aa overlap (15-438:173-591)

                               10        20        30        40    
pF1KSD                 MFGKRKKRVEISAPSNFEHRVHTGFDQHEQKFTGLPRQWQSLIE
                                     :. ..:  .: :    . .::     :  .
CCDS12 EAGGGSGDRRRAGPEKRPKSSREGSGGPQESSRDKRPLSGPDVGTPQPAGLA----SGAK
            150       160       170       180       190            

           50        60        70        80        90       100    
pF1KSD ESARRPKPLVDPACITSIQPGAPKGEPHDVAPNGPSAGGLAIPQSSSSSSRPPTRARGAP
        .: ::      :     . :: .::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LAAGRPFNTYPRADTDHPSRGA-QGEPHDVAPNGPSAGGLAIPQSSSSSSRPPTRARGAP
      200       210       220        230       240       250       

          110       120       130       140       150       160    
pF1KSD SPGVLGPHASEPQLAPPACTPAAPAVPGPPGPRSPQREPQRVSHEQFRAALQLVVDPGDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SPGVLGPHASEPQLAPPACTPAAPAVPGPPGPRSPQREPQRVSHEQFRAALQLVVDPGDP
       260       270       280       290       300       310       

          170       180       190       200       210       220    
pF1KSD RSYLDNFIKIGEGSTGIVCIATVRSSGKLVAVKKMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQHEN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RSYLDNFIKIGEGSTGIVCIATVRSSGKLVAVKKMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQHEN
       320       330       340       350       360       370       

          230       240       250       260       270       280    
pF1KSD VVEMYNSYLVGDELWVVMEFLEGGALTDIVTHTRMNEEQIAAVCLAVLQALSVLHAQGVI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VVEMYNSYLVGDELWVVMEFLEGGALTDIVTHTRMNEEQIAAVCLAVLQALSVLHAQGVI
       380       390       400       410       420       430       

          290       300       310       320       330       340    
pF1KSD HRDIKSDSILLTHDGRVKLSDFGFCAQVSKEVPRRKSLVGTPYWMAPELISRLPYGPEVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 HRDIKSDSILLTHDGRVKLSDFGFCAQVSKEVPRRKSLVGTPYWMAPELISRLPYGPEVD
       440       450       460       470       480       490       

          350       360       370       380       390       400    
pF1KSD IWSLGIMVIEMVDGEPPYFNEPPLKAMKMIRDNLPPRLKNLHKVSPSLKGFLDRLLVRDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 IWSLGIMVIEMVDGEPPYFNEPPLKAMKMIRDNLPPRLKNLHKVSPSLKGFLDRLLVRDP
       500       510       520       530       540       550       

          410       420       430        
pF1KSD AQRATAAELLKHPFLAKAGPPASIVPLMRQNRTR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AQRATAAELLKHPFLAKAGPPASIVPLMRQNRTR
       560       570       580       590 

>>CCDS13107.1 PAK5 gene_id:57144|Hs108|chr20              (719 aa)
 initn: 2085 init1: 1681 opt: 1730  Z-score: 844.5  bits: 166.1 E(32554): 1e-40
Smith-Waterman score: 1732; 65.6% identity (77.6% similar) in 425 aa overlap (23-436:302-717)

                       10        20        30        40        50  
pF1KSD         MFGKRKKRVEISAPSNFEHRVHTGFDQHEQKFTGLPRQWQSLIEESARRPKP
                                     ..:  : :  .     .  : : .   :: 
CCDS13 YLNQTSPQPTMRQRSRSGSGLQEPMMPFGASAFKTHPQGHSYNSYTYPRLSEPTMCIPKV
             280       290       300       310       320       330 

             60        70        80        90       100            
pF1KSD LVDPACITSIQPGAPKGEPHDVAPNGPSAGGLAIPQSSSSSSRPPTRARGAPS---PGVL
         : : ..     .:     :. : ::.     .:::.:.:.   . ..  ::    ..:
CCDS13 DYDRAQMVL----SPPLSGSDTYPRGPAK----LPQSQSKSGYS-SSSHQYPSGYHKATL
             340           350           360        370       380  

     110          120            130       140       150       160 
pF1KSD GPHAS---EPQLAPPAC-----TPAAPAVPGPPGPRSPQREPQRVSHEQFRAALQLVVDP
         : :     :    :      . .. . : :    : ...:.:::::::::::::::.:
CCDS13 YHHPSLQSSSQYISTASYLSSLSLSSSTYPPPSWGSSSDQQPSRVSHEQFRAALQLVVSP
            390       400       410       420       430       440  

             170       180       190       200       210       220 
pF1KSD GDPRSYLDNFIKIGEGSTGIVCIATVRSSGKLVAVKKMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQ
       :::: :: ::::::::::::::::: . .:: :::::::::::::::::::::::::::.
CCDS13 GDPREYLANFIKIGEGSTGIVCIATEKHTGKQVAVKKMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYH
            450       460       470       480       490       500  

             230       240       250       260       270       280 
pF1KSD HENVVEMYNSYLVGDELWVVMEFLEGGALTDIVTHTRMNEEQIAAVCLAVLQALSVLHAQ
       :.:::.::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.::.::: :: :
CCDS13 HDNVVDMYSSYLVGDELWVVMEFLEGGALTDIVTHTRMNEEQIATVCLSVLRALSYLHNQ
            510       520       530       540       550       560  

             290       300       310       320       330       340 
pF1KSD GVIHRDIKSDSILLTHDGRVKLSDFGFCAQVSKEVPRRKSLVGTPYWMAPELISRLPYGP
       ::::::::::::::: :::.::::::::::::::::.::::::::::::::.::::::: 
CCDS13 GVIHRDIKSDSILLTSDGRIKLSDFGFCAQVSKEVPKRKSLVGTPYWMAPEVISRLPYGT
            570       580       590       600       610       620  

             350       360       370       380       390       400 
pF1KSD EVDIWSLGIMVIEMVDGEPPYFNEPPLKAMKMIRDNLPPRLKNLHKVSPSLKGFLDRLLV
       ::::::::::::::.::::::::::::.::. :::.::::.:.:::::  :.:::: .::
CCDS13 EVDIWSLGIMVIEMIDGEPPYFNEPPLQAMRRIRDSLPPRVKDLHKVSSVLRGFLDLMLV
            630       640       650       660       670       680  

             410       420       430        
pF1KSD RDPAQRATAAELLKHPFLAKAGPPASIVPLMRQNRTR
       :.:.::::: ::: ::::  ::::. ::::::: :  
CCDS13 REPSQRATAQELLGHPFLKLAGPPSCIVPLMRQYRHH
            690       700       710         

>>CCDS10054.1 PAK6 gene_id:56924|Hs108|chr15              (681 aa)
 initn: 1750 init1: 1487 opt: 1537  Z-score: 753.2  bits: 149.1 E(32554): 1.2e-35
Smith-Waterman score: 1550; 60.8% identity (76.9% similar) in 403 aa overlap (46-436:275-675)

          20        30        40        50        60        70     
pF1KSD NFEHRVHTGFDQHEQKFTGLPRQWQSLIEESARRPKPLVDPACITSIQPGAPKGEPHDVA
                                     :. .: :  .    .:..:    . :  ::
CCDS10 GSPSPKTRESSLKRRLFRSMFLSTAATAPPSSSKPGPPPQSKPNSSFRPPQKDNPPSLVA
          250       260       270       280       290       300    

               80        90       100       110       120          
pF1KSD -----PNGPSAGGLAIPQSSSSSSRPPTRARGAPSPGVLGPHASEPQLAPPA--CTPAAP
            :.   .: .. : ..:..: :    : ::. : : :  : :  .: .     .. 
CCDS10 KAQSLPSDQPVGTFS-PLTTSDTSSPQKSLRTAPATGQL-PGRSSPAGSPRTWHAQISTS
          310        320       330       340        350       360  

      130       140            150       160       170       180   
pF1KSD AVPGPPGPRSPQ-----REPQRVSHEQFRAALQLVVDPGDPRSYLDNFIKIGEGSTGIVC
        .  :  :   .     ..   :.::::.:::..::: ::::  ::...:::::::::::
CCDS10 NLYLPQDPTVAKGALAGEDTGVVTHEQFKAALRMVVDQGDPRLLLDSYVKIGEGSTGIVC
            370       380       390       400       410       420  

           190       200       210       220       230       240   
pF1KSD IATVRSSGKLVAVKKMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQHENVVEMYNSYLVGDELWVVME
       .:  . ::. :::: :::::::::::::::::::::::: ::::::.:::::.::::.::
CCDS10 LAREKHSGRQVAVKMMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQHFNVVEMYKSYLVGEELWVLME
            430       440       450       460       470       480  

           250       260       270       280       290       300   
pF1KSD FLEGGALTDIVTHTRMNEEQIAAVCLAVLQALSVLHAQGVIHRDIKSDSILLTHDGRVKL
       ::.::::::::...:.::::::.:: ::::::. ::::::::::::::::::: ::::::
CCDS10 FLQGGALTDIVSQVRLNEEQIATVCEAVLQALAYLHAQGVIHRDIKSDSILLTLDGRVKL
            490       500       510       520       530       540  

           310       320       330       340       350       360   
pF1KSD SDFGFCAQVSKEVPRRKSLVGTPYWMAPELISRLPYGPEVDIWSLGIMVIEMVDGEPPYF
       ::::::::.::.::.::::::::::::::.:::  :. ::::::::::::::::::::::
CCDS10 SDFGFCAQISKDVPKRKSLVGTPYWMAPEVISRSLYATEVDIWSLGIMVIEMVDGEPPYF
            550       560       570       580       590       600  

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pF1KSD NEPPLKAMKMIRDNLPPRLKNLHKVSPSLKGFLDRLLVRDPAQRATAAELLKHPFLAKAG
       .. :..::: .::. ::.::: ::::: :. ::.:.::::: .:::: ::: :::: ..:
CCDS10 SDSPVQAMKRLRDSPPPKLKNSHKVSPVLRDFLERMLVRDPQERATAQELLDHPFLLQTG
            610       620       630       640       650       660  

           430            
pF1KSD PPASIVPLMRQNRTR    
        :  .:::..  :      
CCDS10 LPECLVPLIQLYRKQTSTC
            670       680 

>>CCDS61590.1 PAK6 gene_id:56924|Hs108|chr15              (636 aa)
 initn: 1458 init1: 1056 opt: 1099  Z-score: 545.6  bits: 110.6 E(32554): 4.5e-24
Smith-Waterman score: 1202; 52.4% identity (66.7% similar) in 403 aa overlap (46-436:275-630)

          20        30        40        50        60        70     
pF1KSD NFEHRVHTGFDQHEQKFTGLPRQWQSLIEESARRPKPLVDPACITSIQPGAPKGEPHDVA
                                     :. .: :  .    .:..:    . :  ::
CCDS61 GSPSPKTRESSLKRRLFRSMFLSTAATAPPSSSKPGPPPQSKPNSSFRPPQKDNPPSLVA
          250       260       270       280       290       300    

               80        90       100       110       120          
pF1KSD -----PNGPSAGGLAIPQSSSSSSRPPTRARGAPSPGVLGPHASEPQLAPPA--CTPAAP
            :.   .: .. : ..:..: :    : ::. : : :  : :  .: .     .. 
CCDS61 KAQSLPSDQPVGTFS-PLTTSDTSSPQKSLRTAPATGQL-PGRSSPAGSPRTWHAQISTS
          310        320       330       340        350       360  

      130       140            150       160       170       180   
pF1KSD AVPGPPGPRSPQ-----REPQRVSHEQFRAALQLVVDPGDPRSYLDNFIKIGEGSTGIVC
        .  :  :   .     ..   :.::::.:::..::: ::::  ::...:::::::::::
CCDS61 NLYLPQDPTVAKGALAGEDTGVVTHEQFKAALRMVVDQGDPRLLLDSYVKIGEGSTGIVC
            370       380       390       400       410       420  

           190       200       210       220       230       240   
pF1KSD IATVRSSGKLVAVKKMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQHENVVEMYNSYLVGDELWVVME
       .:  . ::. :::: :::::::::::::::::::::::: ::::::.:::::.::::.::
CCDS61 LAREKHSGRQVAVKMMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQHFNVVEMYKSYLVGEELWVLME
            430       440       450       460       470       480  

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pF1KSD FLEGGALTDIVTHTRMNEEQIAAVCLAVLQALSVLHAQGVIHRDIKSDSILLTHDGRVKL
       ::.::::::::...:.::::::.:: ::::::. ::::::::::::::::::: ::::::
CCDS61 FLQGGALTDIVSQVRLNEEQIATVCEAVLQALAYLHAQGVIHRDIKSDSILLTLDGRVKL
            490       500       510       520       530       540  

           310       320       330       340       350       360   
pF1KSD SDFGFCAQVSKEVPRRKSLVGTPYWMAPELISRLPYGPEVDIWSLGIMVIEMVDGEPPYF
       ::::::::.::.::.::::::::::::::.:::  :. :                     
CCDS61 SDFGFCAQISKDVPKRKSLVGTPYWMAPEVISRSLYATE---------------------
            550       560       570       580                      

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pF1KSD NEPPLKAMKMIRDNLPPRLKNLHKVSPSLKGFLDRLLVRDPAQRATAAELLKHPFLAKAG
                               ::: :. ::.:.::::: .:::: ::: :::: ..:
CCDS61 ------------------------VSPVLRDFLERMLVRDPQERATAQELLDHPFLLQTG
                                     590       600       610       

           430            
pF1KSD PPASIVPLMRQNRTR    
        :  .:::..  :      
CCDS61 LPECLVPLIQLYRKQTSTC
       620       630      

>>CCDS3321.1 PAK2 gene_id:5062|Hs108|chr3                 (524 aa)
 initn: 1240 init1: 1035 opt: 1088  Z-score: 541.5  bits: 109.6 E(32554): 7.7e-24
Smith-Waterman score: 1222; 43.0% identity (68.8% similar) in 458 aa overlap (4-432:67-513)

                                          10        20        30   
pF1KSD                            MFGKRKKRVEISAPSNFEHRVHTGFDQHEQKFT
                                     :.:.: ::: ::.::: .:.:::    .::
CCDS33 LKPLPSVPEEKKPRHKIISIFSGTEKGSKKKEKERPEISPPSDFEHTIHVGFDAVTGEFT
         40        50        60        70        80        90      

            40               50        60        70        80      
pF1KSD GLPRQWQSLIE-------ESARRPKPLVDPACITSIQPGAPKGEPHDVAPNGPSAGGLAI
       :.:.::  :..       :. . :. ..:   .   . .. : .  . .:  :   :.  
CCDS33 GMPEQWARLLQTSNITKLEQKKNPQAVLD--VLKFYDSNTVKQKYLSFTP--PEKDGF--
        100       110       120         130       140         150  

         90       100       110        120                   130   
pF1KSD PQSSSSSSRPPTRARGAPSPGVLGPHASEPQ-LAPPACTP------------AAPAVPGP
       :     :. :   :.:. .:.:.  . .. .  :::. .:            .   ::.:
CCDS33 P-----SGTPALNAKGTEAPAVVTEEEDDDEETAPPVIAPRPDHTKSIYTRSVIDPVPAP
                   160       170       180       190       200     

                    140       150       160       170       180    
pF1KSD PGPR---------SPQREPQRVSHEQFRAALQLVVDPGDPRSYLDNFIKIGEGSTGIVCI
        :           . :..  ... :..   :. .:. :::..    . :::.:..: :  
CCDS33 VGDSHVDGAAKSLDKQKKKTKMTDEEIMEKLRTIVSIGDPKKKYTRYEKIGQGASGTVFT
         210       220       230       240       250       260     

          190       200       210       220       230       240    
pF1KSD ATVRSSGKLVAVKKMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQHENVVEMYNSYLVGDELWVVMEF
       ::  . :. ::.:...:.:: ..::..::...:.. .. :.:.. .::::::::.::::.
CCDS33 ATDVALGQEVAIKQINLQKQPKKELIINEILVMKELKNPNIVNFLDSYLVGDELFVVMEY
         270       280       290       300       310       320     

          250       260       270       280       290       300    
pF1KSD LEGGALTDIVTHTRMNEEQIAAVCLAVLQALSVLHAQGVIHRDIKSDSILLTHDGRVKLS
       : ::.:::.::.: :.: ::::::   ::::  :::. :::::::::..::  .: :::.
CCDS33 LAGGSLTDVVTETCMDEAQIAAVCRECLQALEFLHANQVIHRDIKSDNVLLGMEGSVKLT
         330       340       350       360       370       380     

          310       320       330       340       350       360    
pF1KSD DFGFCAQVSKEVPRRKSLVGTPYWMAPELISRLPYGPEVDIWSLGIMVIEMVDGEPPYFN
       :::::::.. :  .:...::::::::::...:  :::.:::::::::.::::.:::::.:
CCDS33 DFGFCAQITPEQSKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMVEGEPPYLN
         390       400       410       420       430       440     

          370       380       390       400       410       420    
pF1KSD EPPLKAMKMIRDNLPPRLKNLHKVSPSLKGFLDRLLVRDPAQRATAAELLKHPFLAKAGP
       : ::.:. .:  :  :.:.: .:.:: .. ::.: :  :  .:..: :::.::::  : :
CCDS33 ENPLRALYLIATNGTPELQNPEKLSPIFRDFLNRCLEMDVEKRGSAKELLQHPFLKLAKP
         450       460       470       480       490       500     

          430             
pF1KSD PASIVPLMRQNRTR     
        .:..::.           
CCDS33 LSSLTPLIMAAKEAMKSNR
         510       520    

>>CCDS14554.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX                (544 aa)
 initn: 1274 init1: 1072 opt: 1085  Z-score: 539.8  bits: 109.3 E(32554): 9.5e-24
Smith-Waterman score: 1208; 42.6% identity (68.6% similar) in 465 aa overlap (10-432:69-532)

                                    10        20        30         
pF1KSD                      MFGKRKKRVEISAPSNFEHRVHTGFDQHEQKFTGLPRQW
                                     ::: ::.::: .:.:::    .:::.:.::
CCDS14 PEEKNKKARLRSIFPGGGDKTNKKKEKERPEISLPSDFEHTIHVGFDAVTGEFTGIPEQW
       40        50        60        70        80        90        

      40               50        60        70        80          90
pF1KSD QSLIE-------ESARRPKPLVDPACITSIQPGAPKGEPHDVAPNGPSAGGL--AIPQSS
         :..       :. . :. ..:   . . .  . . .  . . .  :: :   : :.:.
CCDS14 ARLLQTSNITKLEQKKNPQAVLDVLKFYDSKETVNNQKYMSFTSGDKSAHGYIAAHPSST
      100       110       120       130       140       150        

                             100       110          120       130  
pF1KSD SSSSRPPT---------------RARGAPSPGVLGP---HASEPQLAPPACTPAAPAVPG
       ...:.::                . .. : : :..:   :..       . . :.::::.
CCDS14 KTASEPPLAPPVSEEEDEEEEEEEDENEPPP-VIAPRPEHTKSIYTRSVVESIASPAVPN
      160       170       180        190       200       210       

                           140       150       160       170       
pF1KSD ----PPGPRSP-----------QREPQRVSHEQFRAALQLVVDPGDPRSYLDNFIKIGEG
           ::. ..            ::. .... :..   :. .:. :::..    : :::.:
CCDS14 KEVTPPSAENANSSTLYRNTDRQRKKSKMTDEEILEKLRSIVSVGDPKKKYTRFEKIGQG
       220       230       240       250       260       270       

       180       190       200       210       220       230       
pF1KSD STGIVCIATVRSSGKLVAVKKMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQHENVVEMYNSYLVGDE
       ..: :  :   ..:. ::.:.:.:..: ..::..::...::. .. :.:.. .:::::::
CCDS14 ASGTVYTALDIATGQEVAIKQMNLQQQPKKELIINEILVMRENKNPNIVNYLDSYLVGDE
       280       290       300       310       320       330       

       240       250       260       270       280       290       
pF1KSD LWVVMEFLEGGALTDIVTHTRMNEEQIAAVCLAVLQALSVLHAQGVIHRDIKSDSILLTH
       ::::::.: ::.:::.::.: :.: ::::::   ::::. ::.. :::::::::.:::  
CCDS14 LWVVMEYLAGGSLTDVVTETCMDEGQIAAVCRECLQALDFLHSNQVIHRDIKSDNILLGM
       340       350       360       370       380       390       

       300       310       320       330       340       350       
pF1KSD DGRVKLSDFGFCAQVSKEVPRRKSLVGTPYWMAPELISRLPYGPEVDIWSLGIMVIEMVD
       :: :::.:::::::.. :  .:...::::::::::...:  :::.:::::::::.::::.
CCDS14 DGSVKLTDFGFCAQITPEQSKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMVE
       400       410       420       430       440       450       

       360       370       380       390       400       410       
pF1KSD GEPPYFNEPPLKAMKMIRDNLPPRLKNLHKVSPSLKGFLDRLLVRDPAQRATAAELLKHP
       :::::.:: ::.:. .:  :  :.:.: ...:  .. ::.: :  :  .:..: :::.::
CCDS14 GEPPYLNENPLRALYLIATNGTPELQNPERLSAVFRDFLNRCLEMDVDRRGSAKELLQHP
       460       470       480       490       500       510       

       420       430              
pF1KSD FLAKAGPPASIVPLMRQNRTR      
       ::  : : .:..::.            
CCDS14 FLKLAKPLSSLTPLIIAAKEAIKNSSR
       520       530       540    

>>CCDS48153.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX                (559 aa)
 initn: 1238 init1: 1072 opt: 1085  Z-score: 539.7  bits: 109.3 E(32554): 9.7e-24
Smith-Waterman score: 1110; 41.7% identity (68.3% similar) in 441 aa overlap (34-432:108-547)

            10        20        30        40               50      
pF1KSD KRKKRVEISAPSNFEHRVHTGFDQHEQKFTGLPRQWQSLIE-------ESARRPKPLVDP
                                     :.:.::  :..       :. . :. ..: 
CCDS48 HTIHVGFDAVTGEFTPDLYGSQMCPGKLPEGIPEQWARLLQTSNITKLEQKKNPQAVLDV
        80        90       100       110       120       130       

         60        70        80          90                        
pF1KSD ACITSIQPGAPKGEPHDVAPNGPSAGGL--AIPQSSSSSSRPPT---------------R
         . . .  . . .  . . .  :: :   : :.:....:.::                .
CCDS48 LKFYDSKETVNNQKYMSFTSGDKSAHGYIAAHPSSTKTASEPPLAPPVSEEEDEEEEEEE
       140       150       160       170       180       190       

     100       110          120       130                      140 
pF1KSD ARGAPSPGVLGP---HASEPQLAPPACTPAAPAVPG----PPGPRSP-----------QR
        .. : : :..:   :..       . . :.::::.    ::. ..            ::
CCDS48 DENEPPP-VIAPRPEHTKSIYTRSVVESIASPAVPNKEVTPPSAENANSSTLYRNTDRQR
       200        210       220       230       240       250      

             150       160       170       180       190       200 
pF1KSD EPQRVSHEQFRAALQLVVDPGDPRSYLDNFIKIGEGSTGIVCIATVRSSGKLVAVKKMDL
       . .... :..   :. .:. :::..    : :::.:..: :  :   ..:. ::.:.:.:
CCDS48 KKSKMTDEEILEKLRSIVSVGDPKKKYTRFEKIGQGASGTVYTALDIATGQEVAIKQMNL
        260       270       280       290       300       310      

             210       220       230       240       250       260 
pF1KSD RKQQRRELLFNEVVIMRDYQHENVVEMYNSYLVGDELWVVMEFLEGGALTDIVTHTRMNE
       ..: ..::..::...::. .. :.:.. .:::::::::::::.: ::.:::.::.: :.:
CCDS48 QQQPKKELIINEILVMRENKNPNIVNYLDSYLVGDELWVVMEYLAGGSLTDVVTETCMDE
        320       330       340       350       360       370      

             270       280       290       300       310       320 
pF1KSD EQIAAVCLAVLQALSVLHAQGVIHRDIKSDSILLTHDGRVKLSDFGFCAQVSKEVPRRKS
        ::::::   ::::. ::.. :::::::::.:::  :: :::.:::::::.. :  .:..
CCDS48 GQIAAVCRECLQALDFLHSNQVIHRDIKSDNILLGMDGSVKLTDFGFCAQITPEQSKRST
        380       390       400       410       420       430      

             330       340       350       360       370       380 
pF1KSD LVGTPYWMAPELISRLPYGPEVDIWSLGIMVIEMVDGEPPYFNEPPLKAMKMIRDNLPPR
       .::::::::::...:  :::.:::::::::.::::.:::::.:: ::.:. .:  :  :.
CCDS48 MVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMVEGEPPYLNENPLRALYLIATNGTPE
        440       450       460       470       480       490      

             390       400       410       420       430           
pF1KSD LKNLHKVSPSLKGFLDRLLVRDPAQRATAAELLKHPFLAKAGPPASIVPLMRQNRTR   
       :.: ...:  .. ::.: :  :  .:..: :::.::::  : : .:..::.         
CCDS48 LQNPERLSAVFRDFLNRCLEMDVDRRGSAKELLQHPFLKLAKPLSSLTPLIIAAKEAIKN
        500       510       520       530       540       550      

CCDS48 SSR
          

>>CCDS48152.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX                (565 aa)
 initn: 1232 init1: 1072 opt: 1085  Z-score: 539.6  bits: 109.3 E(32554): 9.8e-24
Smith-Waterman score: 1117; 40.8% identity (67.8% similar) in 463 aa overlap (12-432:93-553)

                                  10        20        30        40 
pF1KSD                    MFGKRKKRVEISAPSNFEHRVHTGFDQHEQKFTGLPRQWQS
                                     ..: .  . : .. .: : :. :.:.::  
CCDS48 KEKERPEISLPSDFEHTIHVGFDAVTGEFTNSPFQTSRPVTVASSQSEGKM-GIPEQWAR
             70        80        90       100       110        120 

                     50        60        70        80          90  
pF1KSD LIE-------ESARRPKPLVDPACITSIQPGAPKGEPHDVAPNGPSAGGL--AIPQSSSS
       :..       :. . :. ..:   . . .  . . .  . . .  :: :   : :.:...
CCDS48 LLQTSNITKLEQKKNPQAVLDVLKFYDSKETVNNQKYMSFTSGDKSAHGYIAAHPSSTKT
             130       140       150       160       170       180 

                           100       110          120       130    
pF1KSD SSRPPT---------------RARGAPSPGVLGP---HASEPQLAPPACTPAAPAVPG--
       .:.::                . .. : : :..:   :..       . . :.::::.  
CCDS48 ASEPPLAPPVSEEEDEEEEEEEDENEPPP-VIAPRPEHTKSIYTRSVVESIASPAVPNKE
             190       200       210        220       230       240

                         140       150       160       170         
pF1KSD --PPGPRSP-----------QREPQRVSHEQFRAALQLVVDPGDPRSYLDNFIKIGEGST
         ::. ..            ::. .... :..   :. .:. :::..    : :::.:..
CCDS48 VTPPSAENANSSTLYRNTDRQRKKSKMTDEEILEKLRSIVSVGDPKKKYTRFEKIGQGAS
              250       260       270       280       290       300

     180       190       200       210       220       230         
pF1KSD GIVCIATVRSSGKLVAVKKMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQHENVVEMYNSYLVGDELW
       : :  :   ..:. ::.:.:.:..: ..::..::...::. .. :.:.. .:::::::::
CCDS48 GTVYTALDIATGQEVAIKQMNLQQQPKKELIINEILVMRENKNPNIVNYLDSYLVGDELW
              310       320       330       340       350       360

     240       250       260       270       280       290         
pF1KSD VVMEFLEGGALTDIVTHTRMNEEQIAAVCLAVLQALSVLHAQGVIHRDIKSDSILLTHDG
       ::::.: ::.:::.::.: :.: ::::::   ::::. ::.. :::::::::.:::  ::
CCDS48 VVMEYLAGGSLTDVVTETCMDEGQIAAVCRECLQALDFLHSNQVIHRDIKSDNILLGMDG
              370       380       390       400       410       420

     300       310       320       330       340       350         
pF1KSD RVKLSDFGFCAQVSKEVPRRKSLVGTPYWMAPELISRLPYGPEVDIWSLGIMVIEMVDGE
        :::.:::::::.. :  .:...::::::::::...:  :::.:::::::::.::::.::
CCDS48 SVKLTDFGFCAQITPEQSKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMVEGE
              430       440       450       460       470       480

     360       370       380       390       400       410         
pF1KSD PPYFNEPPLKAMKMIRDNLPPRLKNLHKVSPSLKGFLDRLLVRDPAQRATAAELLKHPFL
       :::.:: ::.:. .:  :  :.:.: ...:  .. ::.: :  :  .:..: :::.::::
CCDS48 PPYLNENPLRALYLIATNGTPELQNPERLSAVFRDFLNRCLEMDVDRRGSAKELLQHPFL
              490       500       510       520       530       540

     420       430              
pF1KSD AKAGPPASIVPLMRQNRTR      
         : : .:..::.            
CCDS48 KLAKPLSSLTPLIIAAKEAIKNSSR
              550       560     

>>CCDS48151.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX                (580 aa)
 initn: 1249 init1: 1072 opt: 1085  Z-score: 539.5  bits: 109.4 E(32554): 9.9e-24
Smith-Waterman score: 1110; 41.7% identity (68.3% similar) in 441 aa overlap (34-432:129-568)

            10        20        30        40               50      
pF1KSD KRKKRVEISAPSNFEHRVHTGFDQHEQKFTGLPRQWQSLIE-------ESARRPKPLVDP
                                     :.:.::  :..       :. . :. ..: 
CCDS48 SRPVTVASSQSEGKMPDLYGSQMCPGKLPEGIPEQWARLLQTSNITKLEQKKNPQAVLDV
      100       110       120       130       140       150        

         60        70        80          90                        
pF1KSD ACITSIQPGAPKGEPHDVAPNGPSAGGL--AIPQSSSSSSRPPT---------------R
         . . .  . . .  . . .  :: :   : :.:....:.::                .
CCDS48 LKFYDSKETVNNQKYMSFTSGDKSAHGYIAAHPSSTKTASEPPLAPPVSEEEDEEEEEEE
      160       170       180       190       200       210        

     100       110          120       130                      140 
pF1KSD ARGAPSPGVLGP---HASEPQLAPPACTPAAPAVPG----PPGPRSP-----------QR
        .. : : :..:   :..       . . :.::::.    ::. ..            ::
CCDS48 DENEPPP-VIAPRPEHTKSIYTRSVVESIASPAVPNKEVTPPSAENANSSTLYRNTDRQR
      220        230       240       250       260       270       

             150       160       170       180       190       200 
pF1KSD EPQRVSHEQFRAALQLVVDPGDPRSYLDNFIKIGEGSTGIVCIATVRSSGKLVAVKKMDL
       . .... :..   :. .:. :::..    : :::.:..: :  :   ..:. ::.:.:.:
CCDS48 KKSKMTDEEILEKLRSIVSVGDPKKKYTRFEKIGQGASGTVYTALDIATGQEVAIKQMNL
       280       290       300       310       320       330       

             210       220       230       240       250       260 
pF1KSD RKQQRRELLFNEVVIMRDYQHENVVEMYNSYLVGDELWVVMEFLEGGALTDIVTHTRMNE
       ..: ..::..::...::. .. :.:.. .:::::::::::::.: ::.:::.::.: :.:
CCDS48 QQQPKKELIINEILVMRENKNPNIVNYLDSYLVGDELWVVMEYLAGGSLTDVVTETCMDE
       340       350       360       370       380       390       

             270       280       290       300       310       320 
pF1KSD EQIAAVCLAVLQALSVLHAQGVIHRDIKSDSILLTHDGRVKLSDFGFCAQVSKEVPRRKS
        ::::::   ::::. ::.. :::::::::.:::  :: :::.:::::::.. :  .:..
CCDS48 GQIAAVCRECLQALDFLHSNQVIHRDIKSDNILLGMDGSVKLTDFGFCAQITPEQSKRST
       400       410       420       430       440       450       

             330       340       350       360       370       380 
pF1KSD LVGTPYWMAPELISRLPYGPEVDIWSLGIMVIEMVDGEPPYFNEPPLKAMKMIRDNLPPR
       .::::::::::...:  :::.:::::::::.::::.:::::.:: ::.:. .:  :  :.
CCDS48 MVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMVEGEPPYLNENPLRALYLIATNGTPE
       460       470       480       490       500       510       

             390       400       410       420       430           
pF1KSD LKNLHKVSPSLKGFLDRLLVRDPAQRATAAELLKHPFLAKAGPPASIVPLMRQNRTR   
       :.: ...:  .. ::.: :  :  .:..: :::.::::  : : .:..::.         
CCDS48 LQNPERLSAVFRDFLNRCLEMDVDRRGSAKELLQHPFLKLAKPLSSLTPLIIAAKEAIKN
       520       530       540       550       560       570       

CCDS48 SSR
       580




438 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Thu Nov  3 05:08:42 2016 done: Thu Nov  3 05:08:43 2016
 Total Scan time:  3.120 Total Display time:  0.050

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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