Result of FASTA (ccds) for pF1KSDA1095
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA1095, 1066 aa
  1>>>pF1KSDA1095 1066 - 1066 aa - 1066 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.9359+/-0.00131; mu= 5.4526+/- 0.078
 mean_var=246.9306+/-51.994, 0's: 0 Z-trim(108.9): 104  B-trim: 687 in 2/50
 Lambda= 0.081618
 statistics sampled from 10417 (10511) to 10417 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.675), E-opt: 0.2 (0.323), width:  16
 Scan time:  4.450

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS33789.1 PDZRN3 gene_id:23024|Hs108|chr3        (1066) 7161 857.8       0
CCDS77771.1 PDZRN3 gene_id:23024|Hs108|chr3        ( 783) 5044 608.4 1.9e-173
CCDS77770.1 PDZRN3 gene_id:23024|Hs108|chr3        ( 723) 4807 580.5 4.6e-165
CCDS53777.1 PDZRN4 gene_id:29951|Hs108|chr12       (1036) 2366 293.2   2e-78
CCDS78518.1 PDZD4 gene_id:57595|Hs108|chrX         ( 775) 2108 262.7 2.2e-69
CCDS8739.1 PDZRN4 gene_id:29951|Hs108|chr12        ( 778) 1969 246.3 1.9e-64
CCDS14732.1 PDZD4 gene_id:57595|Hs108|chrX         ( 769) 1812 227.8 6.9e-59
CCDS78517.1 PDZD4 gene_id:57595|Hs108|chrX         ( 660) 1711 215.9 2.4e-55


>>CCDS33789.1 PDZRN3 gene_id:23024|Hs108|chr3             (1066 aa)
 initn: 7161 init1: 7161 opt: 7161  Z-score: 4572.8  bits: 857.8 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 7161; 100.0% identity (100.0% similar) in 1066 aa overlap (1-1066:1-1066)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MGFELDRFDGDVDPDLKCALCHKVLEDPLTTPCGHVFCAGCVLPWVVQEGSCPARCRGRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MGFELDRFDGDVDPDLKCALCHKVLEDPLTTPCGHVFCAGCVLPWVVQEGSCPARCRGRL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD SAKELNHVLPLKRLILKLDIKCAYATRGCGRVVKLQQLPEHLERCDFAPARCRHAGCGQV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SAKELNHVLPLKRLILKLDIKCAYATRGCGRVVKLQQLPEHLERCDFAPARCRHAGCGQV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD LLRRDVEAHMRDACDARPVGRCQEGCGLPLTHGEQRAGGHCCARALRAHNGALQARLGAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LLRRDVEAHMRDACDARPVGRCQEGCGLPLTHGEQRAGGHCCARALRAHNGALQARLGAL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD HKALKKEALRAGKREKSLVAQLAAAQLELQMTALRYQKKFTEYSARLDSLSRCVAAPPGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 HKALKKEALRAGKREKSLVAQLAAAQLELQMTALRYQKKFTEYSARLDSLSRCVAAPPGG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD KGEETKSLTLVLHRDSGSLGFNIIGGRPSVDNHDGSSSEGIFVSKIVDSGPAAKEGGLQI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KGEETKSLTLVLHRDSGSLGFNIIGGRPSVDNHDGSSSEGIFVSKIVDSGPAAKEGGLQI
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD HDRIIEVNGRDLSRATHDQAVEAFKTAKEPIVVQVLRRTPRTKMFTPPSESQLVDTGTQT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 HDRIIEVNGRDLSRATHDQAVEAFKTAKEPIVVQVLRRTPRTKMFTPPSESQLVDTGTQT
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD DITFEHIMALTKMSSPSPPVLDPYLLPEEHPSAHEYYDPNDYIGDIHQEMDREELELEEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DITFEHIMALTKMSSPSPPVLDPYLLPEEHPSAHEYYDPNDYIGDIHQEMDREELELEEV
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD DLYRMNSQDKLGLTVCYRTDDEDDIGIYISEIDPNSIAAKDGRIREGDRIIQINGIEVQN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DLYRMNSQDKLGLTVCYRTDDEDDIGIYISEIDPNSIAAKDGRIREGDRIIQINGIEVQN
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD REEAVALLTSEENKNFSLLIARPELQLDEGWMDDDRNDFLDDLHMDMLEEQHHQAMQFTA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 REEAVALLTSEENKNFSLLIARPELQLDEGWMDDDRNDFLDDLHMDMLEEQHHQAMQFTA
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD SVLQQKKHDEDGGTTDTATILSNQHEKDSGVGRTDESTRNDESSEQENNGDDATASSNPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SVLQQKKHDEDGGTTDTATILSNQHEKDSGVGRTDESTRNDESSEQENNGDDATASSNPL
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD AGQRKLTCSQDTLGSGDLPFSNESFISADCTDADYLGIPVDECERFRELLELKCQVKSAT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 AGQRKLTCSQDTLGSGDLPFSNESFISADCTDADYLGIPVDECERFRELLELKCQVKSAT
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD PYGLYYPSGPLDAGKSDPESVDKELELLNEELRSIELECLSIVRAHKMQQLKEQYRESWM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PYGLYYPSGPLDAGKSDPESVDKELELLNEELRSIELECLSIVRAHKMQQLKEQYRESWM
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD LHNSGFRNYNTSIDVRRHELSDITELPEKSDKDSSSAYNTGESCRSTPLTLEISPDNSLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LHNSGFRNYNTSIDVRRHELSDITELPEKSDKDSSSAYNTGESCRSTPLTLEISPDNSLR
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD RAAEGISCPSSEGAVGTTEAYGPASKNLLSITEDPEVGTPTYSPSLKELDPNQPLESKER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RAAEGISCPSSEGAVGTTEAYGPASKNLLSITEDPEVGTPTYSPSLKELDPNQPLESKER
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KSD RASDGSRSPTPSQKLGSAYLPSYHHSPYKHAHIPAHAQHYQSYMQLIQQKSAVEYAQSQM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RASDGSRSPTPSQKLGSAYLPSYHHSPYKHAHIPAHAQHYQSYMQLIQQKSAVEYAQSQM
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KSD SLVSMCKDLSSPTPSEPRMEWKVKIRSDGTRYITKRPVRDRLLRERALKIREERSGMTTD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SLVSMCKDLSSPTPSEPRMEWKVKIRSDGTRYITKRPVRDRLLRERALKIREERSGMTTD
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KSD DDAVSEMKMGRYWSKEERKQHLVKAKEQRRRREFMMQSRLDCLKEQQAADDRKEMNILEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DDAVSEMKMGRYWSKEERKQHLVKAKEQRRRREFMMQSRLDCLKEQQAADDRKEMNILEL
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      
pF1KSD SHKKMMKKRNKKIFDNWMTIQELLTHGTKSPDGTRVYNSFLSVTTV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SHKKMMKKRNKKIFDNWMTIQELLTHGTKSPDGTRVYNSFLSVTTV
             1030      1040      1050      1060      

>>CCDS77771.1 PDZRN3 gene_id:23024|Hs108|chr3             (783 aa)
 initn: 5044 init1: 5044 opt: 5044  Z-score: 3227.3  bits: 608.4 E(32554): 1.9e-173
Smith-Waterman score: 5044; 99.6% identity (99.9% similar) in 763 aa overlap (304-1066:21-783)

           280       290       300       310       320       330   
pF1KSD DGSSSEGIFVSKIVDSGPAAKEGGLQIHDRIIEVNGRDLSRATHDQAVEAFKTAKEPIVV
                                     . .:::::::::::::::::::::::::::
CCDS77           MGCSLCSLQKQEEQYKLLYEVCQVNGRDLSRATHDQAVEAFKTAKEPIVV
                         10        20        30        40        50

           340       350       360       370       380       390   
pF1KSD QVLRRTPRTKMFTPPSESQLVDTGTQTDITFEHIMALTKMSSPSPPVLDPYLLPEEHPSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 QVLRRTPRTKMFTPPSESQLVDTGTQTDITFEHIMALTKMSSPSPPVLDPYLLPEEHPSA
               60        70        80        90       100       110

           400       410       420       430       440       450   
pF1KSD HEYYDPNDYIGDIHQEMDREELELEEVDLYRMNSQDKLGLTVCYRTDDEDDIGIYISEID
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 HEYYDPNDYIGDIHQEMDREELELEEVDLYRMNSQDKLGLTVCYRTDDEDDIGIYISEID
              120       130       140       150       160       170

           460       470       480       490       500       510   
pF1KSD PNSIAAKDGRIREGDRIIQINGIEVQNREEAVALLTSEENKNFSLLIARPELQLDEGWMD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 PNSIAAKDGRIREGDRIIQINGIEVQNREEAVALLTSEENKNFSLLIARPELQLDEGWMD
              180       190       200       210       220       230

           520       530       540       550       560       570   
pF1KSD DDRNDFLDDLHMDMLEEQHHQAMQFTASVLQQKKHDEDGGTTDTATILSNQHEKDSGVGR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 DDRNDFLDDLHMDMLEEQHHQAMQFTASVLQQKKHDEDGGTTDTATILSNQHEKDSGVGR
              240       250       260       270       280       290

           580       590       600       610       620       630   
pF1KSD TDESTRNDESSEQENNGDDATASSNPLAGQRKLTCSQDTLGSGDLPFSNESFISADCTDA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 TDESTRNDESSEQENNGDDATASSNPLAGQRKLTCSQDTLGSGDLPFSNESFISADCTDA
              300       310       320       330       340       350

           640       650       660       670       680       690   
pF1KSD DYLGIPVDECERFRELLELKCQVKSATPYGLYYPSGPLDAGKSDPESVDKELELLNEELR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 DYLGIPVDECERFRELLELKCQVKSATPYGLYYPSGPLDAGKSDPESVDKELELLNEELR
              360       370       380       390       400       410

           700       710       720       730       740       750   
pF1KSD SIELECLSIVRAHKMQQLKEQYRESWMLHNSGFRNYNTSIDVRRHELSDITELPEKSDKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 SIELECLSIVRAHKMQQLKEQYRESWMLHNSGFRNYNTSIDVRRHELSDITELPEKSDKD
              420       430       440       450       460       470

           760       770       780       790       800       810   
pF1KSD SSSAYNTGESCRSTPLTLEISPDNSLRRAAEGISCPSSEGAVGTTEAYGPASKNLLSITE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 SSSAYNTGESCRSTPLTLEISPDNSLRRAAEGISCPSSEGAVGTTEAYGPASKNLLSITE
              480       490       500       510       520       530

           820       830       840       850       860       870   
pF1KSD DPEVGTPTYSPSLKELDPNQPLESKERRASDGSRSPTPSQKLGSAYLPSYHHSPYKHAHI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 DPEVGTPTYSPSLKELDPNQPLESKERRASDGSRSPTPSQKLGSAYLPSYHHSPYKHAHI
              540       550       560       570       580       590

           880       890       900       910       920       930   
pF1KSD PAHAQHYQSYMQLIQQKSAVEYAQSQMSLVSMCKDLSSPTPSEPRMEWKVKIRSDGTRYI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 PAHAQHYQSYMQLIQQKSAVEYAQSQMSLVSMCKDLSSPTPSEPRMEWKVKIRSDGTRYI
              600       610       620       630       640       650

           940       950       960       970       980       990   
pF1KSD TKRPVRDRLLRERALKIREERSGMTTDDDAVSEMKMGRYWSKEERKQHLVKAKEQRRRRE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 TKRPVRDRLLRERALKIREERSGMTTDDDAVSEMKMGRYWSKEERKQHLVKAKEQRRRRE
              660       670       680       690       700       710

          1000      1010      1020      1030      1040      1050   
pF1KSD FMMQSRLDCLKEQQAADDRKEMNILELSHKKMMKKRNKKIFDNWMTIQELLTHGTKSPDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 FMMQSRLDCLKEQQAADDRKEMNILELSHKKMMKKRNKKIFDNWMTIQELLTHGTKSPDG
              720       730       740       750       760       770

          1060      
pF1KSD TRVYNSFLSVTTV
       :::::::::::::
CCDS77 TRVYNSFLSVTTV
              780   

>>CCDS77770.1 PDZRN3 gene_id:23024|Hs108|chr3             (723 aa)
 initn: 4807 init1: 4807 opt: 4807  Z-score: 3077.0  bits: 580.5 E(32554): 4.6e-165
Smith-Waterman score: 4807; 100.0% identity (100.0% similar) in 723 aa overlap (344-1066:1-723)

           320       330       340       350       360       370   
pF1KSD RATHDQAVEAFKTAKEPIVVQVLRRTPRTKMFTPPSESQLVDTGTQTDITFEHIMALTKM
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77                               MFTPPSESQLVDTGTQTDITFEHIMALTKM
                                             10        20        30

           380       390       400       410       420       430   
pF1KSD SSPSPPVLDPYLLPEEHPSAHEYYDPNDYIGDIHQEMDREELELEEVDLYRMNSQDKLGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 SSPSPPVLDPYLLPEEHPSAHEYYDPNDYIGDIHQEMDREELELEEVDLYRMNSQDKLGL
               40        50        60        70        80        90

           440       450       460       470       480       490   
pF1KSD TVCYRTDDEDDIGIYISEIDPNSIAAKDGRIREGDRIIQINGIEVQNREEAVALLTSEEN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 TVCYRTDDEDDIGIYISEIDPNSIAAKDGRIREGDRIIQINGIEVQNREEAVALLTSEEN
              100       110       120       130       140       150

           500       510       520       530       540       550   
pF1KSD KNFSLLIARPELQLDEGWMDDDRNDFLDDLHMDMLEEQHHQAMQFTASVLQQKKHDEDGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 KNFSLLIARPELQLDEGWMDDDRNDFLDDLHMDMLEEQHHQAMQFTASVLQQKKHDEDGG
              160       170       180       190       200       210

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pF1KSD TTDTATILSNQHEKDSGVGRTDESTRNDESSEQENNGDDATASSNPLAGQRKLTCSQDTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 TTDTATILSNQHEKDSGVGRTDESTRNDESSEQENNGDDATASSNPLAGQRKLTCSQDTL
              220       230       240       250       260       270

           620       630       640       650       660       670   
pF1KSD GSGDLPFSNESFISADCTDADYLGIPVDECERFRELLELKCQVKSATPYGLYYPSGPLDA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 GSGDLPFSNESFISADCTDADYLGIPVDECERFRELLELKCQVKSATPYGLYYPSGPLDA
              280       290       300       310       320       330

           680       690       700       710       720       730   
pF1KSD GKSDPESVDKELELLNEELRSIELECLSIVRAHKMQQLKEQYRESWMLHNSGFRNYNTSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 GKSDPESVDKELELLNEELRSIELECLSIVRAHKMQQLKEQYRESWMLHNSGFRNYNTSI
              340       350       360       370       380       390

           740       750       760       770       780       790   
pF1KSD DVRRHELSDITELPEKSDKDSSSAYNTGESCRSTPLTLEISPDNSLRRAAEGISCPSSEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 DVRRHELSDITELPEKSDKDSSSAYNTGESCRSTPLTLEISPDNSLRRAAEGISCPSSEG
              400       410       420       430       440       450

           800       810       820       830       840       850   
pF1KSD AVGTTEAYGPASKNLLSITEDPEVGTPTYSPSLKELDPNQPLESKERRASDGSRSPTPSQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 AVGTTEAYGPASKNLLSITEDPEVGTPTYSPSLKELDPNQPLESKERRASDGSRSPTPSQ
              460       470       480       490       500       510

           860       870       880       890       900       910   
pF1KSD KLGSAYLPSYHHSPYKHAHIPAHAQHYQSYMQLIQQKSAVEYAQSQMSLVSMCKDLSSPT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 KLGSAYLPSYHHSPYKHAHIPAHAQHYQSYMQLIQQKSAVEYAQSQMSLVSMCKDLSSPT
              520       530       540       550       560       570

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pF1KSD PSEPRMEWKVKIRSDGTRYITKRPVRDRLLRERALKIREERSGMTTDDDAVSEMKMGRYW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 PSEPRMEWKVKIRSDGTRYITKRPVRDRLLRERALKIREERSGMTTDDDAVSEMKMGRYW
              580       590       600       610       620       630

           980       990      1000      1010      1020      1030   
pF1KSD SKEERKQHLVKAKEQRRRREFMMQSRLDCLKEQQAADDRKEMNILELSHKKMMKKRNKKI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 SKEERKQHLVKAKEQRRRREFMMQSRLDCLKEQQAADDRKEMNILELSHKKMMKKRNKKI
              640       650       660       670       680       690

          1040      1050      1060      
pF1KSD FDNWMTIQELLTHGTKSPDGTRVYNSFLSVTTV
       :::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 FDNWMTIQELLTHGTKSPDGTRVYNSFLSVTTV
              700       710       720   

>>CCDS53777.1 PDZRN4 gene_id:29951|Hs108|chr12            (1036 aa)
 initn: 2915 init1: 661 opt: 2366  Z-score: 1521.5  bits: 293.2 E(32554): 2e-78
Smith-Waterman score: 3877; 57.5% identity (79.2% similar) in 1084 aa overlap (1-1066:1-1036)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MGFELDRFDGDVDPDLKCALCHKVLEDPLTTPCGHVFCAGCVLPWVVQEGSCPARCRGRL
       ::: :.::   ::: :.: :: .:::.:: :::::::::.:.:::.:..  :: .:.  :
CCDS53 MGFALERFAEAVDPALECKLCGQVLEEPLCTPCGHVFCASCLLPWAVRRRRCPLQCQP-L
               10        20        30        40        50          

               70        80        90       100       110          
pF1KSD SAKELNHVLPLKRLILKLDIKCAYATRGCGRVVKLQQLPEHLERCDFAPAR-CR-HAGCG
       .  :: .::::. :: :: ..: : .::::. :.:..:  :.:.:::.:::  : ..::.
CCDS53 APGELYRVLPLRSLIQKLRVQCDYRARGCGHSVRLHELEAHVEHCDFGPARRLRSRGGCA
      60        70        80        90       100       110         

      120       130       140       150       160       170        
pF1KSD QVLLRRDVEAHMRDACDARPVGRCQEGCGLPLTHGEQRAGGHCCARALRAHNGALQARLG
       . :   .: :  : .:   :    . :          :.::        :..:   .: :
CCDS53 SGLGGGEVPA--RGGCGPTP----RAG----------RGGG--------ARGGPPGGRWG
     120         130           140                         150     

      180       190       200       210       220       230        
pF1KSD ALHKALKKEALRAGKREKSLVAQLAAAQLELQMTALRYQKKFTEYSARLDSLSRCVAAPP
          ..   ..:   .:::.:.::: : : :.:.:: :::.:::.: :.. ..   :.   
CCDS53 R-GRGPGPRVLAWRRREKALLAQLWALQGEVQLTARRYQEKFTQYMAHVRNF---VGDLG
          160       170       180       190       200          210 

      240         250       260       270       280       290      
pF1KSD GG--KGEETKSLTLVLHRDSGSLGFNIIGGRPSVDNHDGSSSEGIFVSKIVDSGPAAKEG
       ::  .  : : .:.::.:.. .::::::::::. .:..:.:.:::.::::...::: .  
CCDS53 GGHRRDGEHKPFTIVLERENDTLGFNIIGGRPNQNNQEGTSTEGIYVSKILENGPADRAD
             220       230       240       250       260       270 

        300       310       320       330       340        350     
pF1KSD GLQIHDRIIEVNGRDLSRATHDQAVEAFKTAKEPIVVQVLRRTPRTK-MFTPPSESQLVD
       ::.:::.:.::::.:::.:::..:::::..:::::::::::::: ..  .   :: ::..
CCDS53 GLEIHDKIMEVNGKDLSKATHEEAVEAFRNAKEPIVVQVLRRTPLSRPAYGMASEVQLMN
             280       290       300       310       320       330 

         360       370       380             390       400         
pF1KSD TGTQTDITFEHIMALTKMSSPSPPVLD--PYLLPEE----HPSAHEYYDPNDYIGDIHQE
       ..:::::::::::::.:.  :.::: :  :.:: .     ::  ::.:. :.::...  .
CCDS53 ASTQTDITFEHIMALAKLRPPTPPVPDICPFLLSDSCHSLHPMEHEFYEDNEYISSLPAD
             340       350       360       370       380       390 

     410        420       430       440       450       460        
pF1KSD MDR-EELELEEVDLYRMNSQDKLGLTVCYRTDDEDDIGIYISEIDPNSIAAKDGRIREGD
        :: :..: :::.: :..::.:::::::::::::.: :::.::.::::::::::::::::
CCDS53 ADRTEDFEYEEVELCRVSSQEKLGLTVCYRTDDEEDTGIYVSEVDPNSIAAKDGRIREGD
             400       410       420       430       440       450 

      470       480       490       500       510       520        
pF1KSD RIIQINGIEVQNREEAVALLTSEENKNFSLLIARPELQLDEGWMDDDRNDFLDDLHMDML
       ::.:::: .:::::::::::...: : . ::.::::.::::::..:.::.::..:...::
CCDS53 RILQINGEDVQNREEAVALLSNDECKRIVLLVARPEIQLDEGWLEDERNEFLEELNLEML
             460       470       480       490       500       510 

      530       540        550       560       570       580       
pF1KSD EEQHHQAMQFTAS-VLQQKKHDEDGGTTDTATILSNQHEKDSGVGRTDESTRNDESSEQE
       ::.:..::: ::. : : ::..:. :::::::  ::.::::::::::::: :::::::::
CCDS53 EEEHNEAMQPTANEVEQPKKQEEEEGTTDTATSSSNNHEKDSGVGRTDESLRNDESSEQE
             520       530       540       550       560       570 

       590       600       610       620       630       640       
pF1KSD NNGDDATASSNPLAGQRKLTCSQDTLGSGDLPFSNESFISADCTDADYLGIPVDECERFR
       : ..: ...:  : ..: :  ::::::: .: . :::..:..  :.: .: : ..:::::
CCDS53 NAAEDPNSTS--LKSKRDLGQSQDTLGSVELQY-NESLVSGEYIDSDCIGNPDEDCERFR
             580         590       600        610       620        

       650       660       670       680       690       700       
pF1KSD ELLELKCQVKSATPYGLYYPSGPLDAGKSDPESVDKELELLNEELRSIELECLSIVRAHK
       .::::::....   : ::: :. .. .... :.:..::.:::::::.::::: .:..::.
CCDS53 QLLELKCKIRNHGEYDLYYSSSTIECNQGEQEGVEHELQLLNEELRNIELECQNIMQAHR
      630       640       650       660       670       680        

       710       720       730       740       750       760       
pF1KSD MQQLKEQYRESWMLHNSGFRNYNTSIDVRRHELSDITELPEKSDKDSSSAYNTGESCRST
       .:.. .:: . : ::..::::::::::..: .:.:: : ::::::::::::::.::::::
CCDS53 LQKVTDQYGDIWTLHDGGFRNYNTSIDMQRGKLDDIMEHPEKSDKDSSSAYNTAESCRST
      690       700       710       720       730       740        

       770       780       790       800        810       820      
pF1KSD PLTLEISPDNSLRRAAEGISCPSSEGAVGTTEAY-GPASKNLLSITEDPEVGTPTYSPSL
       :::.. :::.:: :. .  .  . ......:..  : .::.             . : . 
CCDS53 PLTVDRSPDSSLPRVINLTNKKNLRSTMAATQSSSGQSSKE-------------STSTKA
      750       760       770       780                    790     

        830       840       850         860       870       880    
pF1KSD KELDPNQPLESKERRASDGSRSPTPSQKLGS--AYLPSYHHSPYKHAHIPAHAQHYQSYM
       :  . .   ::::. . .::. :   . ..    ::  :: : :..:.:::::.::::::
CCDS53 KTTEQGCSAESKEK-VLEGSKLPDQEKAVSEHIPYLSPYHSSSYRYANIPAHARHYQSYM
         800        810       820       830       840       850    

          890       900       910       920       930       940    
pF1KSD QLIQQKSAVEYAQSQMSLVSMCKDLSSPTPSEPRMEWKVKIRSDGTRYITKRPVRDRLLR
       :::::::::::::::.:::::::.  :   :::.:::::::::::::::::::::::.:.
CCDS53 QLIQQKSAVEYAQSQLSLVSMCKE--SQKCSEPKMEWKVKIRSDGTRYITKRPVRDRILK
          860       870         880       890       900       910  

          950       960       970       980       990      1000    
pF1KSD ERALKIREERSGMTTDDDAVSEMKMGRYWSKEERKQHLVKAKEQRRRREFMMQSRLDCLK
       ::::::.:::::::::::..:::::::::::::::::::.::::::::::::.:::.:::
CCDS53 ERALKIKEERSGMTTDDDTMSEMKMGRYWSKEERKQHLVRAKEQRRRREFMMRSRLECLK
            920       930       940       950       960       970  

           1010      1020      1030      1040      1050      1060  
pF1KSD E--QQAADDRKEMNILELSHKKMMKKRNKKIFDNWMTIQELLTHGTKSPDGTRVYNSFLS
       :  :.... .::.::.:::::::::::::::.:::::::::.:::.::::::::.:.:::
CCDS53 ESPQSGSEGKKEINIIELSHKKMMKKRNKKILDNWMTIQELMTHGAKSPDGTRVHNAFLS
            980       990      1000      1010      1020      1030  

           
pF1KSD VTTV
       ::::
CCDS53 VTTV
           

>>CCDS78518.1 PDZD4 gene_id:57595|Hs108|chrX              (775 aa)
 initn: 2054 init1: 842 opt: 2108  Z-score: 1359.0  bits: 262.7 E(32554): 2.2e-69
Smith-Waterman score: 2499; 51.9% identity (76.4% similar) in 777 aa overlap (304-1066:18-775)

           280       290       300       310       320       330   
pF1KSD DGSSSEGIFVSKIVDSGPAAKEGGLQIHDRIIEVNGRDLSRATHDQAVEAFKTAKEPIVV
                                     ...:::..::. ...:...:....:::.:.
CCDS78              MGCNMCVVQKPEEQYKVMLQVNGKELSKLSQEQTLQALRSSKEPLVI
                            10        20        30        40       

           340       350       360       370         380       390 
pF1KSD QVLRRTPRTKMFTPPSESQLVDTGTQTDITFEHIMALTKMSSPSPP--VLDPYLLPEEHP
       :::::.:: .  .   . ::::.:::::::::::::: :.  :.::  .:.::.: :  :
CCDS78 QVLRRSPRLRGDSSCHDLQLVDSGTQTDITFEHIMALGKLRPPTPPMVILEPYVLSELPP
        50        60        70        80        90       100       

             400       410        420       430       440       450
pF1KSD SAHEYYDPNDYIGDIHQEMDR-EELELEEVDLYRMNSQDKLGLTVCYRTDDEDDIGIYIS
        .:::::: ...    :: :: .::: :::.::. . .::::: ::::::::.:.:::..
CCDS78 ISHEYYDPAEFMEGGPQEADRLDELEYEEVELYKSSHRDKLGLMVCYRTDDEEDLGIYVG
       110       120       130       140       150       160       

              460       470       480       490       500       510
pF1KSD EIDPNSIAAKDGRIREGDRIIQINGIEVQNREEAVALLTSEENKNFSLLIARPELQLDEG
       :..::::::::::::::::::::::..:::::::::.:..::: :.:::.:::: :: . 
CCDS78 EVNPNSIAAKDGRIREGDRIIQINGVDVQNREEAVAILSQEENTNISLLVARPESQLAKR
       170       180       190       200       210       220       

              520       530       540       550       560       570
pF1KSD WMDDDRNDFLDDLHMDMLEEQHHQAMQFTASVLQQKKHDEDGGTTDTATILSNQHEKDSG
       : :.::.:::::.  .  .: . .: .. .   ::  ..:. :. :..  :::..: :::
CCDS78 WKDSDRDDFLDDFGSE--NEGELRARKLKSPPAQQPGNEEEKGAPDAGPGLSNSQELDSG
       230       240         250       260       270       280     

              580       590       600       610       620          
pF1KSD VGRTDESTRNDESSEQENNGDDATASSNPLAGQRKLTCSQDTLGSGDLPFSNESFIS--A
       ::::::::::.::::..  ::.  .:.:  .. ::.  . :.: : :. :: .:...  :
CCDS78 VGRTDESTRNEESSEHDLLGDEPPSSTNTPGSLRKFGLQGDALQSRDFHFSMDSLLAEGA
         290       300       310       320       330       340     

      630       640       650       660            670       680   
pF1KSD DCTDADYLGIPVDECERFRELLELKCQVKSATPYGLYYP--SG---PLDAGKSDPESVDK
           .:  :.  .: ::.:::::.::......  :: .:  ::    ::....  ::. .
CCDS78 GLGGGDVPGLTDEEYERYRELLEIKCHLENGNQLGLLFPRASGGNSALDVNRN--ESLGH
         350       360       370       380       390         400   

           690       700       710       720       730       740   
pF1KSD ELELLNEELRSIELECLSIVRAHKMQQLKEQYRESWMLHNSGFRNYNTSIDVRRHELSDI
       :. .:.:::: .:..: .:.::.:::::.:.  ..:.:.. .. .  .: . ..::::::
CCDS78 EMAMLEEELRHLEFKCRNILRAQKMQQLRERCMKAWLLEEESLYDLAAS-EPKKHELSDI
           410       420       430       440       450        460  

           750       760       770       780       790       800   
pF1KSD TELPEKSDKDSSSAYNTGESCRSTPLTLEISPDNSLRRAAEGISCPSSEGAVGTTEAYGP
       .::::::::::.:::::::::::::: .:  :.. ::::  : :       .. :   ::
CCDS78 SELPEKSDKDSTSAYNTGESCRSTPLLVEPLPESPLRRAMAGNS------NLNRTPP-GP
            470       480       490       500             510      

           810       820       830       840         850       860 
pF1KSD ASKNLLSITEDPEVGTPTYSPSLKELDPNQPLESKERRASD--GSRSPTPSQKLGSAYLP
       :  .  . .  :  :.:.   ::.. ::    :. .:. ..  : :.:  .  :  .   
CCDS78 AVATPAKAAPPP--GSPAKFRSLSR-DP----EAGRRQHAEERGRRNPKTGLTLERVGPE
         520         530        540           550       560        

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pF1KSD SYHHSPYKHAHIPAHAQHYQSYMQLIQQKSAVEYAQSQMSLVSMCK--DLSSPTPSEPRM
       :  .   .:     ...::.: .::   ..  : ... .::..  .   ... .   :::
CCDS78 SSPYLSRRHRGQGQEGEHYHSCVQLAPTRGLEELGHGPLSLAGGPRVGGVAAAATEAPRM
      570       580       590       600       610       620        

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pF1KSD EWKVKIRSDGTRYITKRPVRDRLLRERALKIREERSGMTTDDDAVSEMKMGRYWSKEERK
       :::::.:::::::..:::::::::. ::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 EWKVKVRSDGTRYVAKRPVRDRLLKARALKIREERSGMTTDDDAVSEMKMGRYWSKEERK
      630       640       650       660       670       680        

     980       990      1000      1010      1020      1030         
pF1KSD QHLVKAKEQRRRREFMMQSRLDCLKEQQAADDRKEMNILELSHKKMMKKRNKKIFDNWMT
       :::..:.:::.::::::::::.::.::: .:.. :.::. :::.: ::::::::.:::.:
CCDS78 QHLIRAREQRKRREFMMQSRLECLREQQNGDSKPELNIIALSHRKTMKKRNKKILDNWIT
      690       700       710       720       730       740        

    1040      1050      1060      
pF1KSD IQELLTHGTKSPDGTRVYNSFLSVTTV
       :::.:.::..: :: :::: .::::::
CCDS78 IQEMLAHGARSADGKRVYNPLLSVTTV
      750       760       770     

>>CCDS8739.1 PDZRN4 gene_id:29951|Hs108|chr12             (778 aa)
 initn: 2280 init1: 661 opt: 1969  Z-score: 1270.5  bits: 246.3 E(32554): 1.9e-64
Smith-Waterman score: 3070; 61.4% identity (83.0% similar) in 787 aa overlap (294-1066:11-778)

           270       280       290       300       310       320   
pF1KSD IGGRPSVDNHDGSSSEGIFVSKIVDSGPAAKEGGLQIHDRIIEVNGRDLSRATHDQAVEA
                                     .:   ..  .. .:::.:::.:::..::::
CCDS87                     MGCNLCTFQKREEHYKLLYEVSQVNGKDLSKATHEEAVEA
                                   10        20        30        40

           330       340        350       360       370       380  
pF1KSD FKTAKEPIVVQVLRRTPRTK-MFTPPSESQLVDTGTQTDITFEHIMALTKMSSPSPPVLD
       :..:::::::::::::: ..  .   :: ::....:::::::::::::.:.  :.::: :
CCDS87 FRNAKEPIVVQVLRRTPLSRPAYGMASEVQLMNASTQTDITFEHIMALAKLRPPTPPVPD
               50        60        70        80        90       100

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pF1KSD --PYLLPEE----HPSAHEYYDPNDYIGDIHQEMDR-EELELEEVDLYRMNSQDKLGLTV
         :.:: .     ::  ::.:. :.::...  . :: :..: :::.: :..::.::::::
CCDS87 ICPFLLSDSCHSLHPMEHEFYEDNEYISSLPADADRTEDFEYEEVELCRVSSQEKLGLTV
              110       120       130       140       150       160

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pF1KSD CYRTDDEDDIGIYISEIDPNSIAAKDGRIREGDRIIQINGIEVQNREEAVALLTSEENKN
       :::::::.: :::.::.::::::::::::::::::.:::: .:::::::::::...: : 
CCDS87 CYRTDDEEDTGIYVSEVDPNSIAAKDGRIREGDRILQINGEDVQNREEAVALLSNDECKR
              170       180       190       200       210       220

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pF1KSD FSLLIARPELQLDEGWMDDDRNDFLDDLHMDMLEEQHHQAMQFTAS-VLQQKKHDEDGGT
       . ::.::::.::::::..:.::.::..:...::::.:..::: ::. : : ::..:. ::
CCDS87 IVLLVARPEIQLDEGWLEDERNEFLEELNLEMLEEEHNEAMQPTANEVEQPKKQEEEEGT
              230       240       250       260       270       280

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pF1KSD TDTATILSNQHEKDSGVGRTDESTRNDESSEQENNGDDATASSNPLAGQRKLTCSQDTLG
       :::::  ::.::::::::::::: :::::::::: ..: ...:  : ..: :  ::::::
CCDS87 TDTATSSSNNHEKDSGVGRTDESLRNDESSEQENAAEDPNSTS--LKSKRDLGQSQDTLG
              290       300       310       320         330        

          620       630       640       650       660       670    
pF1KSD SGDLPFSNESFISADCTDADYLGIPVDECERFRELLELKCQVKSATPYGLYYPSGPLDAG
       : .: . :::..:..  :.: .: : ..:::::.::::::....   : ::: :. .. .
CCDS87 SVELQY-NESLVSGEYIDSDCIGNPDEDCERFRQLLELKCKIRNHGEYDLYYSSSTIECN
      340        350       360       370       380       390       

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pF1KSD KSDPESVDKELELLNEELRSIELECLSIVRAHKMQQLKEQYRESWMLHNSGFRNYNTSID
       ... :.:..::.:::::::.::::: .:..::..:.. .:: . : ::..::::::::::
CCDS87 QGEQEGVEHELQLLNEELRNIELECQNIMQAHRLQKVTDQYGDIWTLHDGGFRNYNTSID
       400       410       420       430       440       450       

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pF1KSD VRRHELSDITELPEKSDKDSSSAYNTGESCRSTPLTLEISPDNSLRRAAEGISCPSSEGA
       ..: .:.:: : ::::::::::::::.:::::::::.. :::.:: :. .  .  . ...
CCDS87 MQRGKLDDIMEHPEKSDKDSSSAYNTAESCRSTPLTVDRSPDSSLPRVINLTNKKNLRST
       460       470       480       490       500       510       

          800        810       820       830       840       850   
pF1KSD VGTTEAY-GPASKNLLSITEDPEVGTPTYSPSLKELDPNQPLESKERRASDGSRSPTPSQ
       ...:..  : .::.             . : . :  . .   ::::. . .::. :   .
CCDS87 MAATQSSSGQSSKE-------------STSTKAKTTEQGCSAESKEK-VLEGSKLPDQEK
       520       530                    540       550        560   

             860       870       880       890       900       910 
pF1KSD KLGS--AYLPSYHHSPYKHAHIPAHAQHYQSYMQLIQQKSAVEYAQSQMSLVSMCKDLSS
        ..    ::  :: : :..:.:::::.:::::::::::::::::::::.:::::::.  :
CCDS87 AVSEHIPYLSPYHSSSYRYANIPAHARHYQSYMQLIQQKSAVEYAQSQLSLVSMCKE--S
           570       580       590       600       610       620   

             920       930       940       950       960       970 
pF1KSD PTPSEPRMEWKVKIRSDGTRYITKRPVRDRLLRERALKIREERSGMTTDDDAVSEMKMGR
          :::.:::::::::::::::::::::::.:.::::::.:::::::::::..:::::::
CCDS87 QKCSEPKMEWKVKIRSDGTRYITKRPVRDRILKERALKIKEERSGMTTDDDTMSEMKMGR
             630       640       650       660       670       680 

             980       990      1000        1010      1020         
pF1KSD YWSKEERKQHLVKAKEQRRRREFMMQSRLDCLKE--QQAADDRKEMNILELSHKKMMKKR
       ::::::::::::.::::::::::::.:::.::::  :.... .::.::.:::::::::::
CCDS87 YWSKEERKQHLVRAKEQRRRREFMMRSRLECLKESPQSGSEGKKEINIIELSHKKMMKKR
             690       700       710       720       730       740 

    1030      1040      1050      1060      
pF1KSD NKKIFDNWMTIQELLTHGTKSPDGTRVYNSFLSVTTV
       ::::.:::::::::.:::.::::::::.:.:::::::
CCDS87 NKKILDNWMTIQELMTHGAKSPDGTRVHNAFLSVTTV
             750       760       770        

>>CCDS14732.1 PDZD4 gene_id:57595|Hs108|chrX              (769 aa)
 initn: 1656 init1: 842 opt: 1812  Z-score: 1170.7  bits: 227.8 E(32554): 6.9e-59
Smith-Waterman score: 2463; 51.5% identity (76.1% similar) in 775 aa overlap (304-1066:18-769)

           280       290       300       310       320       330   
pF1KSD DGSSSEGIFVSKIVDSGPAAKEGGLQIHDRIIEVNGRDLSRATHDQAVEAFKTAKEPIVV
                                     ...:::..::. ...:...:....:::.:.
CCDS14              MGCNMCVVQKPEEQYKVMLQVNGKELSKLSQEQTLQALRSSKEPLVI
                            10        20        30        40       

           340       350       360       370       380       390   
pF1KSD QVLRRTPRTKMFTPPSESQLVDTGTQTDITFEHIMALTKMSSPSPPVLDPYLLPEEHPSA
       :::::.:: .  .   . ::::.:::::::::::::: :.  :.::..    . :  : .
CCDS14 QVLRRSPRLRGDSSCHDLQLVDSGTQTDITFEHIMALGKLRPPTPPMV----ILEPPPIS
        50        60        70        80        90           100   

           400       410        420       430       440       450  
pF1KSD HEYYDPNDYIGDIHQEMDR-EELELEEVDLYRMNSQDKLGLTVCYRTDDEDDIGIYISEI
       :::::: ...    :: :: .::: :::.::. . .::::: ::::::::.:.:::..:.
CCDS14 HEYYDPAEFMEGGPQEADRLDELEYEEVELYKSSHRDKLGLMVCYRTDDEEDLGIYVGEV
           110       120       130       140       150       160   

            460       470       480       490       500       510  
pF1KSD DPNSIAAKDGRIREGDRIIQINGIEVQNREEAVALLTSEENKNFSLLIARPELQLDEGWM
       .::::::::::::::::::::::..:::::::::.:..::: :.:::.:::: :: . : 
CCDS14 NPNSIAAKDGRIREGDRIIQINGVDVQNREEAVAILSQEENTNISLLVARPESQLAKRWK
           170       180       190       200       210       220   

            520       530       540       550       560       570  
pF1KSD DDDRNDFLDDLHMDMLEEQHHQAMQFTASVLQQKKHDEDGGTTDTATILSNQHEKDSGVG
       :.::.:::::.  .  .: . .: .. .   ::  ..:. :. :..  :::..: :::::
CCDS14 DSDRDDFLDDFGSE--NEGELRARKLKSPPAQQPGNEEEKGAPDAGPGLSNSQELDSGVG
           230         240       250       260       270       280 

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pF1KSD RTDESTRNDESSEQENNGDDATASSNPLAGQRKLTCSQDTLGSGDLPFSNESFIS--ADC
       ::::::::.::::..  ::.  .:.:  .. ::.  . :.: : :. :: .:...  :  
CCDS14 RTDESTRNEESSEHDLLGDEPPSSTNTPGSLRKFGLQGDALQSRDFHFSMDSLLAEGAGL
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pF1KSD TDADYLGIPVDECERFRELLELKCQVKSATPYGLYYP--SG---PLDAGKSDPESVDKEL
         .:  :.  .: ::.:::::.::......  :: .:  ::    ::....  ::. .:.
CCDS14 GGGDVPGLTDEEYERYRELLEIKCHLENGNQLGLLFPRASGGNSALDVNRN--ESLGHEM
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pF1KSD ELLNEELRSIELECLSIVRAHKMQQLKEQYRESWMLHNSGFRNYNTSIDVRRHELSDITE
        .:.:::: .:..: .:.::.:::::.:.  ..:.:.. .. .  .: . ..::::::.:
CCDS14 AMLEEELRHLEFKCRNILRAQKMQQLRERCMKAWLLEEESLYDLAAS-EPKKHELSDISE
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pF1KSD LPEKSDKDSSSAYNTGESCRSTPLTLEISPDNSLRRAAEGISCPSSEGAVGTTEAYGPAS
       :::::::::.:::::::::::::: .:  :.. ::::  : :       .. :   ::: 
CCDS14 LPEKSDKDSTSAYNTGESCRSTPLLVEPLPESPLRRAMAGNS------NLNRTPP-GPAV
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pF1KSD KNLLSITEDPEVGTPTYSPSLKELDPNQPLESKERRASD--GSRSPTPSQKLGSAYLPSY
        .  . .  :  :.:.   ::.. ::    :. .:. ..  : :.:  .  :  .   : 
CCDS14 ATPAKAAPPP--GSPAKFRSLSR-DP----EAGRRQHAEERGRRNPKTGLTLERVGPESS
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pF1KSD HHSPYKHAHIPAHAQHYQSYMQLIQQKSAVEYAQSQMSLVSMCK--DLSSPTPSEPRMEW
        .   .:     ...::.: .::   ..  : ... .::..  .   ... .   :::::
CCDS14 PYLSRRHRGQGQEGEHYHSCVQLAPTRGLEELGHGPLSLAGGPRVGGVAAAATEAPRMEW
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pF1KSD KVKIRSDGTRYITKRPVRDRLLRERALKIREERSGMTTDDDAVSEMKMGRYWSKEERKQH
       :::.:::::::..:::::::::. ::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KVKVRSDGTRYVAKRPVRDRLLKARALKIREERSGMTTDDDAVSEMKMGRYWSKEERKQH
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pF1KSD LVKAKEQRRRREFMMQSRLDCLKEQQAADDRKEMNILELSHKKMMKKRNKKIFDNWMTIQ
       :..:.:::.::::::::::.::.::: .:.. :.::. :::.: ::::::::.:::.:::
CCDS14 LIRAREQRKRREFMMQSRLECLREQQNGDSKPELNIIALSHRKTMKKRNKKILDNWITIQ
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pF1KSD ELLTHGTKSPDGTRVYNSFLSVTTV
       :.:.::..: :: :::: .::::::
CCDS14 EMLAHGARSADGKRVYNPLLSVTTV
          750       760         

>>CCDS78517.1 PDZD4 gene_id:57595|Hs108|chrX              (660 aa)
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                                     ...  .. .. :.::.::. . .::::: :
CCDS78                        MGCNMCVVQKPEEQYKVMLQEVELYKSSHRDKLGLMV
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       :::::::.:.:::..:..::::::::::::::::::::::..:::::::::.:..::: :
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pF1KSD FSLLIARPELQLDEGWMDDDRNDFLDDLHMDMLEEQHHQAMQFTASVLQQKKHDEDGGTT
       .:::.:::: :: . : :.::.:::::.  .  .: . .: .. .   ::  ..:. :. 
CCDS78 ISLLVARPESQLAKRWKDSDRDDFLDDFGSE--NEGELRARKLKSPPAQQPGNEEEKGAP
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CCDS78 DAGPGLSNSQELDSGVGRTDESTRNEESSEHDLLGDEPPSSTNTPGSLRKFGLQGDALQS
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        :. :: .:...  :    .:  :.  .: ::.:::::.::......  :: .:  ::  
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pF1KSD -PLDAGKSDPESVDKELELLNEELRSIELECLSIVRAHKMQQLKEQYRESWMLHNSGFRN
         ::....  ::. .:. .:.:::: .:..: .:.::.:::::.:.  ..:.:.. .. .
CCDS78 SALDVNRN--ESLGHEMAMLEEELRHLEFKCRNILRAQKMQQLRERCMKAWLLEEESLYD
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         .: . ..::::::.::::::::::.:::::::::::::: .:  :.. ::::  : : 
CCDS78 LAAS-EPKKHELSDISELPEKSDKDSTSAYNTGESCRSTPLLVEPLPESPLRRAMAGNS-
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CCDS78 -----NLNRTPP-GPAVATPAKAAPPP--GSPAKFRSLSR-DP----EAGRRQHAEERGR
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CCDS78 RNPKTGLTLERVGPESSPYLSRRHRGQGQEGEHYHSCVQLAPTRGLEELGHGPLSLAGGP
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       ::::::::::::::::::..:.:::.::::::::::.::.::: .:.. :.::. :::.:
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 Total Scan time:  4.450 Total Display time:  0.270

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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