Result of FASTA (ccds) for pF1KSDA0967
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA0967, 1578 aa
  1>>>pF1KSDA0967 1578 - 1578 aa - 1578 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.0738+/- 0.001; mu= 6.9498+/- 0.060
 mean_var=180.3527+/-36.727, 0's: 0 Z-trim(111.1): 16  B-trim: 334 in 1/53
 Lambda= 0.095502
 statistics sampled from 12071 (12081) to 12071 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.697), E-opt: 0.2 (0.371), width:  16
 Scan time:  4.850

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS6612.1 FRMPD1 gene_id:22844|Hs108|chr9         (1578) 10506 1460.9       0
CCDS35201.1 FRMPD4 gene_id:9758|Hs108|chrX         (1322) 1515 222.1 9.7e-57
CCDS76006.1 FRMPD3 gene_id:84443|Hs108|chrX        (1810) 1158 172.9 8.2e-42


>>CCDS6612.1 FRMPD1 gene_id:22844|Hs108|chr9              (1578 aa)
 initn: 10506 init1: 10506 opt: 10506  Z-score: 7825.8  bits: 1460.9 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 10506; 99.9% identity (99.9% similar) in 1578 aa overlap (1-1578:1-1578)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MEELETSLFQTRKAHRIEQMVARWLRRSRDSSARAKVAAADGPARNPTQTLIPVRHTVKI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 MEELETSLFQTRKAHRIEQMVARWLRRSRDSSARAKVAAADGPARNPTQTLIPVRHTVKI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD DKDTLLQDYGFHISESLPLTVVAVTAGGSAHGKLFPGDQILQMNNEPAEDLSWERAVDIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 DKDTLLQDYGFHISESLPLTVVAVTAGGSAHGKLFPGDQILQMNNEPAEDLSWERAVDIL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD REAEDSLSITVVRCTSGVPKSSFLTEEKRARLKTNPVKVHFAEEVLISGHSQGNSLLCMP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 REAEDSLSITVVRCTSGVPKSSFLTEEKRARLKTNPVKVHFAEEVLISGHSQGNSLLCMP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD NVLKLYLENGQTKAFKFEANTTVKDIILTVKEKLSIRSIEYFALALEEQYSISRLHLLHE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 NVLKLYLENGQTKAFKFEANTTVKDIILTVKEKLSIRSIEYFALALEEQYSISRLHLLHE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD EELIQQVVEREESHDYRCLFRVCFVPKDPLDLLKEDPVAFEYLYLQSCSDVLQERFAVEM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 EELIQQVVEREESHDYRCLFRVCFVPKDPLDLLKEDPVAFEYLYLQSCSDVLQERFAVEM
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD KCSSALRLAALHIQERIYACAQPQKISLKYIEKDWGIENFISPTLLRNMKGKDIKKAISF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 KCSSALRLAALHIQERIYACAQPQKISLKYIEKDWGIENFISPTLLRNMKGKDIKKAISF
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD HMKRNQNLLEPRQKQLISAAQLRLNYLQILGELKTYGGRIFNATLMLQDRESYIALLVGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 HMKRNQNLLEPRQKQLISAAQLRLNYLQILGELKTYGGRIFNATLMLQDRESYIALLVGA
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD KYGISQVINSKLNIMSTLAEFANISRVELTEESEKVSVVKVYLQDVKVLTLLLESNSAKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 KYGISQVINSKLNIMSTLAEFANISRVELTEESEKVSVVKVYLQDVKVLTLLLESNSAKD
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD LACLIAGYYRLLVDPVTSIFLWPGNKQQAHRVSAEEGYESRACSDSEESSEVDCVLEPLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 LACLIAGYYRLLVDPVTSIFLWPGNKQQAHRVSAEEGYESRACSDSEESSEVDCVLEPLS
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD DRRLVKLAPCRSLIKEEQPPGNSPTPEVARRGPSTCGASSTTDSAESEASDSANTESRGY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 DRRLVKLAPCRSLIKEEQPPGNSPTPEVARRGPSTCGASSTTDSAESEASDSANTESRGY
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD RTSGSSESMDALEEDDLDTCSSSRSTFFHFGSPGLAESIDSDSQEERSGIETSGFLCLLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 RTSGSSESMDALEEDDLDTCSSSRSTFFHFGSPGLAESIDSDSQEERSGIETSGFLCLLD
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD LAQRANPQCQKTEFSESAALETFGWAPELSTVRLDPRLYEGSHADYYSLCSSVSPASYLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 LAQRANPQCQKTEFSESAALETFGWAPELSTVRLDPRLYEGSHADYYSLCSSVSPASYLS
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD DSSESTASRQGGAPPAWGQQGWTEAQPSSMLEPLALHPPLAFEDGSSDEEYYDAADKLTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 DSSESTASRQGGAPPAWGQQGWTEAQPSSMLEPLALHPPLAFEDGSSDEEYYDAADKLTP
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD PGPPSGPRDVSTAEPSATSLQNKASTSSPENSLPCGPDGRQPSRRGGVKKYAKTLRKRRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 PGPPSGPRDVSTAEPSATSLQNKASTSSPENSLPCGPDGRQPSRRGGVKKYAKTLRKRRS
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KSD FLQTDYTSQVSFPLVPSASLESVDDVCYYDREPYLALGAPSPTVSSLQDMQGEPGLLETK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 FLQTDYTSQVSFPLVPSASLESVDDVCYYDREPYLALGAPSPTVSSLQDMQGEPGLLETK
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KSD ALGLLAPLRETKSTNPASRVMEMEPETMETKSVIDSRVSSISAIRFRIDPNNKENSGVVP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 ALGLLAPLRETKSTNPASRVMEMEPETMETKSVIDSRVSSISAIRFRIDPNNKENSGVVP
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KSD AASSSASTPHCSNPGSSGPDTAQARPSQILPLSQDLDGIAPKEPTIEHGDSSFSLSSGDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 AASSSASTPHCSNPGSSGPDTAQARPSQILPLSQDLDGIAPKEPTIEHGDSSFSLSSGDP
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KSD NPDRACLASNPGLNNVSQGDTLELQLEPHVQLEMGLESFCTNHIQETAPKYTEPLLSPRD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 NPDRACLASNPGLNNVSQGDTLELQLEPHVQLEMGLESFCTNHIQETAPKYTEPLLSPRD
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KSD EPRSDECGINPGEKIASIPTKEEPQGQLSLERDREVTNKNGTNVFQEESRKDSGDSPGDV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 EPRSDECGINPGEKIASIPTKEEPQGQLSLERDREVTNKNGTNVFQEESRKDSGDSPGDV
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KSD SNNVSQTLDISSPAGKIVTSLSLDAPVTGTEQIPPHPPRDPQGQSREPPGQGCQAQEQKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 SNNVSQTLDISSPAGKIVTSLSLDAPVTGTEQIPPHPPRDPQGQSREPPGQGCQAQEQKL
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KSD FVELDLDPDFFLGKQTVSPAVPPEGIKAEAPNHVTGQDIAPRDSPEWVCFNPEPSLPEPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 FVELDLDPDFFLGKQTVSPAVPPEGIKAEAPNHVTGQDIAPRDSPEWVCFNPEPSLPEPL
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KSD PCPQEDPHLETSNHCLLLEGKSDSSSICLSAEKSFLCFAPESHPEVSASLRVATSLGFAG
       ::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 PCPQEDPHLETSNHCLLSEGKSDSSSICLSAEKSFLCFAPESHPEVSASLRVATSLGFAG
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KSD MNEMVAPRIGMDQCSCQFSYATCFRGPQPETEEEDRDLEAHPMAPLTSPPSAGSPVVLPW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 MNEMVAPRIGMDQCSCQFSYATCFRGPQPETEEEDRDLEAHPMAPLTSPPSAGSPVVLPW
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KSD RPARAHSCTTAPLSRKSHIWPEYCSRALRQLKATPASTPEGFIQLMESLLELQDILETSW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 RPARAHSCTTAPLSRKSHIWPEYCSRALRQLKATPASTPEGFIQLMESLLELQDILETSW
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KSD GVGNKHPPEKCTWHFTESRSRLCMGSQKLLSSCRHVIRMDQSPEEMQGAVRDTFQHLVQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 GVGNKHPPEKCTWHFTESRSRLCMGSQKLLSSCRHVIRMDQSPEEMQGAVRDTFQHLVQL
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1510      1520      1530      1540      1550      1560
pF1KSD AGLCFQFTDCSRCSARHREAAGNLRDVVYTYHQFIEAAKSTCERGYHDLSVKLLARQCTA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 AGLCFQFTDCSRCSARHREAAGNLRDVVYTYHQFIEAAKSTCERGYHDLSVKLLARQCTA
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

             1570        
pF1KSD LTAAVFCLTQKFRASTAL
       ::::::::::::::::::
CCDS66 LTAAVFCLTQKFRASTAL
             1570        

>>CCDS35201.1 FRMPD4 gene_id:9758|Hs108|chrX              (1322 aa)
 initn: 927 init1: 557 opt: 1515  Z-score: 1132.1  bits: 222.1 E(32554): 9.7e-57
Smith-Waterman score: 1538; 30.3% identity (58.9% similar) in 1295 aa overlap (41-1257:62-1292)

               20        30        40        50        60        70
pF1KSD TRKAHRIEQMVARWLRRSRDSSARAKVAAADGPARNPTQTLIPVRHTVKIDKDTLLQDYG
                                     : :  .  : . :. . :.. .: .:  .:
CCDS35 SQVPPYGWEMTANRDGRDYFINHMTQAIPFDDPRLESCQIIPPAPRKVEMRRDPVL-GFG
              40        50        60        70        80         90

               80        90       100       110       120       130
pF1KSD FHISESLPLTVVAVTAGGSAHGKLFPGDQILQMNNEPAEDLSWERAVDILREAEDSLSIT
       :  .   :..: .:: :: ..:::.:::::...:.::.     ::..:..:  ..:. .:
CCDS35 FVAGSEKPVVVRSVTPGGPSEGKLIPGDQIVMINDEPVSAAPRERVIDLVRSCKESILLT
              100       110       120       130       140       150

              140       150       160       170           180      
pF1KSD VVRCTSGVPKSSFLTEEKRARLKTNPVKVHFAEEVLISGHS----QGNSLLCMPNVLKLY
       :..     :::.:..  :.::::.:::::.:.:::.:.:.     . :::: ::::::.:
CCDS35 VIQ-PYPSPKSAFISAAKKARLKSNPVKVRFSEEVIINGQVSETVKDNSLLFMPNVLKVY
               160       170       180       190       200         

        190       200       210       220       230         240    
pF1KSD LENGQTKAFKFEANTTVKDIILTVKEKLSIRSIEYFALALEEQY--SISRLHLLHEEELI
       :::::::.:.:. .:..::.:::..:::::..::.:.: ::..   . ..: ::::.: .
CCDS35 LENGQTKSFRFDCSTSIKDVILTLQEKLSIKGIEHFSLMLEQRTEGAGTKLLLLHEQETL
     210       220       230       240       250       260         

          250       260       270       280       290       300    
pF1KSD QQVVEREESHDYRCLFRVCFVPKDPLDLLKEDPVAFEYLYLQSCSDVLQERFAVEMKCSS
        ::..:  :: .:::::. ::::::.:::..:::::::::.:::.::.::::. :.: . 
CCDS35 TQVTQRPSSHKMRCLFRISFVPKDPIDLLRRDPVAFEYLYVQSCNDVVQERFGPELKYDI
     270       280       290       300       310       320         

          310       320       330       340       350       360    
pF1KSD ALRLAALHIQERIYACAQPQKISLKYIEKDWGIENFISPTLLRNMKGKDIKKAISFHMKR
       :::::::..     .  : ::::::::::.::.:.:.  ..:..:: :.::::.:  .: 
CCDS35 ALRLAALQMYIATVTTKQTQKISLKYIEKEWGLETFLPSAVLQSMKEKNIKKALSHLVKA
     330       340       350       360       370       380         

          370       380       390       400       410       420    
pF1KSD NQNLLEPRQKQLISAAQLRLNYLQILGELKTYGGRIFNATLMLQDRESYIALLVGAKYGI
       ::::. : .:  .:: : ...::..:..:. ::::.:.:::.  ...: ..:::: .:::
CCDS35 NQNLVPPGKK--LSALQAKVHYLKFLSDLRLYGGRVFKATLVQAEKRSEVTLLVGPRYGI
     390         400       410       420       430       440       

          430       440       450       460       470       480    
pF1KSD SQVINSKLNIMSTLAEFANISRVELTEESEKVSVVKVYLQDVKVLTLLLESNSAKDLACL
       :.:::.: :... ::.:....:.:.  : :..  :.... ::: .:::.::..: .::::
CCDS35 SHVINTKTNLVALLADFSHVNRIEMFSEEESLVRVELHVLDVKPITLLMESSDAMNLACL
       450       460       470       480       490       500       

          490       500       510       520       530       540    
pF1KSD IAGYYRLLVDPVTSIFLWPGNKQQAHRVSAEEGYESRACSDSEESSEVDCVLEPLS----
        :::::::::   :::   ..:. :   . : : :... . .  . . .:. .  .    
CCDS35 TAGYYRLLVDSRRSIFNMANKKNTA---TQETGPENKG-KHNLLGPDWNCIPQMTTFIGE
       510       520       530          540        550       560   

              550       560       570            580       590     
pF1KSD DRRLVKLAPCRSLIKEEQPPGNSPTPEVARR-----GPSTCGASSTTDSAESEASDSANT
        .. ....   :  :  .   ..  :.  :.     . :. : ..   :  .::   :. 
CCDS35 GEQEAQITYIDSKQKTVEITDSTMCPKEHRHLYIDNAYSSDGLNQQL-SQPGEAPCEADY
           570       580       590       600       610        620  

         600       610       620       630       640       650     
pF1KSD ESRGYRTSGSSESMDALEEDDLDTCSSSRSTFFHFGSPGLAESIDSDSQEERSGIETSGF
       .: . :.  .  . ..:.. . ..  ... .:. ::. .: ..:.           : :.
CCDS35 RSLAQRSLLTLSGPETLKKAQ-ESPRGAKVSFI-FGDFALDDGISPP---------TLGY
            630       640        650        660                670 

         660       670       680       690                 700     
pF1KSD LCLLDLAQRANPQCQKTEFSESAALETFGWAPELSTVRL----------DPRLYEGSHAD
         ::: . .   . ..  .. .  .. .  .::   ...          : . ...... 
CCDS35 ETLLDEGPEMLEKQRNLYIGSANDMKGLDLTPEAEGIQFVENSVYANIGDVKSFQAAEGI
             680       690       700       710       720       730 

         710       720         730       740         750       760 
pF1KSD YYSLCSSVSPASYLSDSSES--TASRQGGAPPAWGQQGWTEAQPSS--MLEPLALHPPLA
          :  ..  :   .:. .   .. ..  .    .: .  . . ::  ...  .: ::  
CCDS35 EEPLLHDICYAENTDDAEDEDEVSCEEDLVVGEMNQPAILNLSGSSDDIIDLTSLPPP--
             740       750       760       770       780           

             770       780       790                    800        
pF1KSD FEDGSSDEEYYDAADKLTPPGPPSGPRDVSTAEPS-------------ATSLQNKASTSS
        :  ......   . ...  .:: : :: :  : :             ..::::     :
CCDS35 -EGDDNEDDFLLRSLNMAIAAPPPGFRDSSDEEDSQSQAASFPEDKEKGSSLQNDEIPVS
      790       800       810       820       830       840        

      810       820       830       840            850         860 
pF1KSD PENSLPCGPDGRQPSRRGGVKKYAKTLRKRRSF-----LQTDYTSQVSF--PLVPSASLE
         ...: . .:.   ..:  .  ..::   ...      ::. .: :..     : .: .
CCDS35 LIDAVPTSAEGK--CEKGLDNAVVSTLGALEALSVSEEQQTSDNSGVAILRAYSPESSSD
      850       860         870       880       890       900      

             870       880       890       900       910       920 
pF1KSD SVDDVCYYDREPYLALGAPSPTVSSLQDMQGEPGLLETKALGLLAPLRETKSTNPASRV-
       : ...   .      :.. .    .:. :     .: :.  :   :: : ..  :::.. 
CCDS35 SGNETNSSEMTESSELATAQKQSENLSRM-----FLATHE-GY-HPLAEEQTEFPASKTP
        910       920       930            940         950         

                         930       940       950       960         
pF1KSD -----------MEMEPETMETKSVIDSRVSSISAIRFRIDPNNKENSGVVPAASSSASTP
                  .  .: :    .:. :. . . . .....:.. :...:    ..  :  
CCDS35 AGGLPPKSSHALAARPATDLPPKVVPSK-QLLHSDHMEMEPETMETKSV----TDYFSKL
     960       970       980        990      1000          1010    

     970       980       990      1000      1010      1020         
pF1KSD HCSNPGSSGPDTAQARPSQILPLSQDLDGIAPKEPTIEHGDSSFSLSSGDPNPDRACLAS
       :    :: . . .. : :..     : .: ::  :   .:... . ..:  . .    ::
CCDS35 HM---GSVAYSCTSKRKSKL----ADGEGKAP--P---NGNTTGKKQQGTKTAEMEEEAS
            1020      1030            1040         1050      1060  

    1030      1040         1050      1060      1070      1080      
pF1KSD NPGLNNVSQGDTLELQ---LEPHVQLEMGLESFCTNHIQETAPKYTEPLLSPRDEPRSDE
       .  ...::. :. .:.   :: .. ..   . . .      : :      . .  ::.. 
CCDS35 GK-FGTVSSRDSQHLSTFNLE-RTAFRKDSQRWYVATEGGMAEKSGLEAATGKTFPRASG
            1070      1080       1090      1100      1110      1120

       1090       1100      1110      1120      1130      1140     
pF1KSD CGINPGE-KIASIPTKEEPQGQLSLERDREVTNKNGTNVFQEESRKDSGDSPGDVSNNVS
        :   .: :  . :  :  .:.   . :: .:.     :    : ::  :.: :..... 
CCDS35 LGAREAEGKEEGAPDGETSDGSGLGQGDRFLTD-----VTCASSAKDL-DNPEDADSSTC
             1130      1140      1150           1160       1170    

        1150      1160         1170       1180       1190      1200
pF1KSD QTLDISSPAGKIVTSLSLD---APVTGTEQIPPHPP-RDPQGQSREPP-GQGCQAQEQKL
       .  .    : . :. :  :   :   .. :   :   .. ::.: .   : : ...    
CCDS35 DHPSKLPEADESVARLC-DYHLAKRMSSLQSEGHFSLQSSQGSSVDAGCGTGSSGSACAT
         1180      1190       1200      1210      1220      1230   

             1210      1220             1230       1240      1250  
pF1KSD FVELDLDPDFFLGKQTVSPA-------VPPEGIKAEAPNH-VTGQDIAPRDSPEWVCFNP
        ::  : :.  :::. .  :       .: :      ::: .: ... :.   : .:  :
CCDS35 PVESPLCPS--LGKHLIPDASGKGVNYIPSEERAPGLPNHGATFKELHPQ--TEGMC--P
          1240        1250      1260      1270      1280           

           1260      1270      1280      1290      1300      1310  
pF1KSD EPSLPEPLPCPQEDPHLETSNHCLLLEGKSDSSSICLSAEKSFLCFAPESHPEVSASLRV
       . ..:                                                       
CCDS35 RMTVPALHTAINTEPLFGTLRDGCHRLPKIKETTV                         
      1290      1300      1310      1320                           

>>CCDS76006.1 FRMPD3 gene_id:84443|Hs108|chrX             (1810 aa)
 initn: 1304 init1: 422 opt: 1158  Z-score: 864.1  bits: 172.9 E(32554): 8.2e-42
Smith-Waterman score: 1197; 27.5% identity (55.8% similar) in 1406 aa overlap (58-1376:55-1350)

        30        40        50        60        70        80       
pF1KSD SRDSSARAKVAAADGPARNPTQTLIPVRHTVKIDKDTLLQDYGFHISESLPLTVVAVTAG
                                     : . .: .   .::  .   :..: .:  :
CCDS76 QQELFSSHVMQEESANDMECEQLPAEILRQVTVHRDPIY-GFGFVAGSERPVVVRSVRPG
           30        40        50        60         70        80   

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pF1KSD GSAHGKLFPGDQILQMNNEPAEDLSWERAVDILREAEDSLSITVVRCTSGVPKSSFLTEE
       : ...::. ::::. .:.: . .   :: ....: :.. . .::.. :   :::.:..  
CCDS76 GPSENKLLAGDQIVAINEEDVSEAPRERLIELIRSAKEFIVLTVLH-THQSPKSAFISAA
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pF1KSD KRARLKTNPVKVHFAEEVLISGHSQGN-----SLLCMPNVLKLYLENGQTKAFKFEANTT
       :.:.:..:::::.:.:.: . :.....     .:: .:::::..::::: :.: :.. ::
CCDS76 KKAKLRSNPVKVRFSEQVAV-GETDAKMMKKEALLLIPNVLKVFLENGQIKSFTFDGRTT
            150       160        170       180       190       200 

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pF1KSD VKDIILTVKEKLSIRSIEYFALALE----EQYSISRLHLLHEEELIQQVVEREESHDYRC
       :::..::....::.: ::.:::.::    ::    .. ::.... .  ::.: . : ..:
CCDS76 VKDVMLTLQDRLSLRFIEHFALVLEYAGPEQNH--KFLLLQDKQPLAYVVQRTHYHGMKC
             210       220       230         240       250         

      260       270       280       290       300       310        
pF1KSD LFRVCFVPKDPLDLLKEDPVAFEYLYLQSCSDVLQERFAVEMKCSSALRLAALHIQERIY
       :::. : ::::..::..::.::::::.:: .::..:::... :    : ::::::   . 
CCDS76 LFRISFFPKDPVELLRRDPAAFEYLYIQSRNDVIRERFGMDPKPEMLLGLAALHIYITVS
     260       270       280       290       300       310         

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pF1KSD ACAQPQKISLKYIEKDWGIENFISPTLLRNMKGKDIKKAISFHMKRNQNLLEPRQKQLIS
       :    :::::: .::.::.: :. :.::. .: :...:..: ..: .:.  .:      :
CCDS76 ATRPSQKISLKNVEKEWGLEPFLPPSLLQVIKEKNLRKSLSQQLKAHQT--HPSCGTKGS
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pF1KSD AAQLRLNYLQILGELKTYGGRIFNATLMLQDRESYIALLVGAKYGISQVINSKLNIMSTL
       : : .:.::.::.:: :. : .:: :. :....:  .:::: ..:::.::. : :. ..:
CCDS76 AIQAKLQYLRILNELPTFTGVLFN-TVGLDEKQSATTLLVGPRHGISHVIDLKTNLTTVL
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pF1KSD AEFANISRVELTEESEKVSVVKVYLQDVKVLTLLLESNSAKDLACLIAGYYRLLVDPVTS
       .::..::...: .:.. :. :.. ..:.: :.::.:   : ..::::::: :::.:    
CCDS76 SEFSKISKIQLFRENQGVARVETSIMDAKPLVLLMEWPEATNFACLIAGYCRLLLDSRKM
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pF1KSD IFLWPGNK------------QQAHR-VSA------EEGYESRACSDSEESSEVDCVLEPL
       .:  :...            ..::: :..      : .: . . .. ..::.  :.  : 
CCDS76 VFSRPASQPLPPPMIKADYMHSAHRPVTGGHLGKKESSYVGSVGTSPRKSSR--CT-PPP
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pF1KSD SDRRLVKLAPCRSLIKEEQPPGNSPTPEVARRGPSTCGASSTTDSAESEASDSANTESRG
       .: .::..  :   ..:..   .:      :   .           ..... .... ..:
CCDS76 ADSELVSF--CYLHMREQRKEQES------RTDVNENLIFFEETRPRTKSDPTSKSSGQG
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pF1KSD YRTSGSSESMDALEEDDLDTCSSSRSTFFH--FGSPGLAESIDSDS---QEE----RSGI
       :..    ...::   :     : .::  .   .:. .:    :: .   ::.    ..: 
CCDS76 YEV--VPDDFDAASLDHEPCASRARSYTLDNSLGAEALNFYCDSCKAKLQEQLGPRKGGK
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pF1KSD ETSGFLCLLDLAQRANP--QCQKTEFSESAALETFGWAP-----ELSTVRLDPRLY----
         :.   ..:: .   :  . .. : .:...:     ::     . :. . ::.      
CCDS76 PGSSRDNIVDLMSLPPPGSEEEEEEEDETTSLLPAIAAPPPGFRDNSSDEDDPKRRAVQS
           670       680       690       700       710       720   

       700       710       720       730       740       750       
pF1KSD --EGSHADYYSLCSSVSPASYLSDSSESTASRQGGAPPAWGQQGWTEAQPSSM--LEPLA
         .: :    .:  .  :.. : :: .. . :. .       :   .:  :..  :: ::
CCDS76 QEQGRH--LRGLLYDEIPVT-LIDSVQTRTVRDHA-------QELDDALVSTLQALEALA
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            : :::               : ::          :  :.     .: .::.::  
CCDS76 -----ASEDG---------------PHPP----------PPQTAGLIVLATITPESSLDS
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pF1KSD GPDGRQPSRRGGVKKYAKTLRKRR--SFLQTDYTSQVSFPLVPSASLESVDDVCYYD---
       : .  . :.   .... .......  ... ... .. :  :.   .:    . :  .   
CCDS76 GHE-TNSSELTDMSEMMSAMKQHQNTTYFLAQHLNKDS--LLARKDLPFRIQSCAAQAVL
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pF1KSD REPYLALGAPSPTVSSLQDMQ-----GEPGLLET--KALGLLAPLRE-TKSTNPASRVME
         :: .:: :.:.  ::: .      : ::  .   .. : .   :  . ...::     
CCDS76 TAPY-SLGRPDPN-PSLQPIATGQSPGPPGARRKLPQSEGQVQGERTYSLAVHPA-----
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       . :.  : :.     .: .: .     :.. . .:.   . ::.:: :  . :.  .. :
CCDS76 LSPQLSEQKN-----LSLLSPVPEDKGPGHTR-AGLEMSLRAATSSLSEEQVSELRDNLP
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pF1KSD DTAQARPSQIL-PLSQDLDGIAPKE-PTIEHGDSSFSLSS--GDPNPDRAC--LASNPGL
         ..  :. :: : :.   .:       . :. :  . ..  :.: :.:.   : .. : 
CCDS76 KEVRLSPKLILDPKSSVTPAIISAALQQVVHNKSLVTAGGALGNP-PSRGERRLEASMGR
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pF1KSD NNVSQ-GDTLELQLEPHVQLEMGLESFCTNHIQETAPKYTEPLLSPRDEPRSDECGINPG
        .::. ...   .:. ...      :. ..: :  :    :   :::    :   ... .
CCDS76 PEVSMMSSSASKNLKFKISPSAPETSWNSQH-QLGA----EVSSSPRAPTGSRADSLHLS
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pF1KSD EKIASIPTKEEPQGQLSLERDREVTNKNGTNVFQEESRKDSG----DSPGDVSNNVSQTL
       ..  :.:... :  .  :. .:: ..:..:.    ..   .:    .. : .:..  .. 
CCDS76 QQEDSLPVQNFPPKSYLLRTSRESVGKQATGEVAGKGGPVGGKPTLQKQGTISSQGEKAQ
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pF1KSD DISSPAGKIVTSLSLDAPVTGTEQIPPHPPRDPQGQSREPPGQGCQAQEQKLFVELDLDP
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CCDS76 LESTPKRSKLEETSL-VP----RATYPMALQSPSCQSRSH-SPSCQPHGHS--------P
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pF1KSD DFFLGKQTVSPAVPPEGIKAEAPNHVTGQDIAPRDSPEW-VCFNPEPSLPE-PL-PCPQE
       .     :  ::.  :.: ..   .........   : .  . .:   :  : :  :  ..
CCDS76 SSQSRGQ--SPSCQPRG-QSPLRSQAASRQVSTMPSRKLETTLNGAHSTSEGPAKPKSSR
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pF1KSD DP----HLETSNHCLLLEGKSDSSSICLSAEKSF-LCFAPESHPEVSASLRVATSLGFAG
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CCDS76 GPFRLRNLFSATFPTRQKKETDERQAQLQKVKQYELEFLEEL-------LKPPSQGELPG
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CCDS76 TEYLQPPAPG--RCSCQLRSSPVQQGPG-MSREQRRSCDCKRICRGGRPQATQTPVPSLR
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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