Result of FASTA (ccds) for pF1KSDA0883
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA0883, 364 aa
  1>>>pF1KSDA0883 364 - 364 aa - 364 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0720+/-0.000741; mu= 13.4335+/- 0.045
 mean_var=83.3278+/-16.642, 0's: 0 Z-trim(110.0): 17  B-trim: 0 in 0/52
 Lambda= 0.140501
 statistics sampled from 11237 (11253) to 11237 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.721), E-opt: 0.2 (0.346), width:  16
 Scan time:  3.020

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS34868.1 PNMA2 gene_id:10687|Hs108|chr8         ( 364) 2386 493.0 1.6e-139
CCDS9818.1 PNMA1 gene_id:9240|Hs108|chr14          ( 353) 1098 232.0 6.2e-61
CCDS65344.1 PNMA3 gene_id:29944|Hs108|chrX         ( 455) 1097 231.8 8.9e-61
CCDS35435.2 PNMA3 gene_id:29944|Hs108|chrX         ( 463) 1097 231.8 9.1e-61
CCDS14718.1 PNMA5 gene_id:114824|Hs108|chrX        ( 448) 1047 221.7 9.9e-58
CCDS9908.1 MOAP1 gene_id:64112|Hs108|chr14         ( 351) 1022 216.6 2.7e-56
CCDS14719.1 PNMA6A gene_id:84968|Hs108|chrX        ( 399)  552 121.3 1.4e-27
CCDS65304.1 ZCCHC18 gene_id:644353|Hs108|chrX      ( 403)  509 112.6 6.1e-25
CCDS14574.1 ZCCHC12 gene_id:170261|Hs108|chrX      ( 402)  492 109.1 6.6e-24
CCDS46124.1 PNMAL1 gene_id:55228|Hs108|chr19       ( 378)  463 103.3 3.7e-22
CCDS33059.1 PNMAL1 gene_id:55228|Hs108|chr19       ( 439)  463 103.3 4.2e-22
CCDS59400.1 PNMAL2 gene_id:57469|Hs108|chr19       ( 635)  356 81.7 1.9e-15


>>CCDS34868.1 PNMA2 gene_id:10687|Hs108|chr8              (364 aa)
 initn: 2386 init1: 2386 opt: 2386  Z-score: 2618.2  bits: 493.0 E(32554): 1.6e-139
Smith-Waterman score: 2386; 100.0% identity (100.0% similar) in 364 aa overlap (1-364:1-364)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MALALLEDWCRIMSVDEQKSLMVTGIPADFEEAEIQEVLQETLKSLGRYRLLGKIFRKQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MALALLEDWCRIMSVDEQKSLMVTGIPADFEEAEIQEVLQETLKSLGRYRLLGKIFRKQE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD NANAVLLELLEDTDVSAIPSEVQGKGGVWKVIFKTPNQDTEFLERLNLFLEKEGQTVSGM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NANAVLLELLEDTDVSAIPSEVQGKGGVWKVIFKTPNQDTEFLERLNLFLEKEGQTVSGM
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD FRALGQEGVSPATVPCISPELLAHLLGQAMAHAPQPLLPMRYRKLRVFSGSAVPAPEEES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 FRALGQEGVSPATVPCISPELLAHLLGQAMAHAPQPLLPMRYRKLRVFSGSAVPAPEEES
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD FEVWLEQATEIVKEWPVTEAEKKRWLAESLRGPALDLMHIVQADNPSISVEECLEAFKQV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 FEVWLEQATEIVKEWPVTEAEKKRWLAESLRGPALDLMHIVQADNPSISVEECLEAFKQV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD FGSLESRRTAQVRYLKTYQEEGEKVSAYVLRLETLLRRAVEKRAIPRRIADQVRLEQVMA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 FGSLESRRTAQVRYLKTYQEEGEKVSAYVLRLETLLRRAVEKRAIPRRIADQVRLEQVMA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD GATLNQMLWCRLRELKDQGPPPSFLELMKVIREEEEEEASFENESIEEPEERDGYGRWNH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GATLNQMLWCRLRELKDQGPPPSFLELMKVIREEEEEEASFENESIEEPEERDGYGRWNH
              310       320       330       340       350       360

           
pF1KSD EGDD
       ::::
CCDS34 EGDD
           

>>CCDS9818.1 PNMA1 gene_id:9240|Hs108|chr14               (353 aa)
 initn: 952 init1: 546 opt: 1098  Z-score: 1207.4  bits: 232.0 E(32554): 6.2e-61
Smith-Waterman score: 1098; 48.6% identity (79.4% similar) in 350 aa overlap (1-345:1-342)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MALALLEDWCRIMSVDEQKSLMVTGIPADFEEAEIQEVLQETLKSLGRYRLLGKIFRKQE
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CCDS98 MAMTLLEDWCRGMDVNSQRALLVWGIPVNCDEAEIEETLQAAMPQVS-YRMLGRMFWREE
               10        20        30        40         50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD NANAVLLELLEDTDVSAIPSEVQGKGGVWKVIFKTPNQDTEFLERLNLFLEKEGQTVSGM
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CCDS98 NAKAALLELTGAVDYAAIPREMPGKGGVWKVLFKPPTSDAEFLERLHLFLAREGWTVQDV
      60        70        80        90       100       110         

              130       140       150        160       170         
pF1KSD FRALGQEGVSPATVPCISPELLAHLLGQAMAHAPQPLLP-MRYRKLRVFSGSAVPAPEEE
        :.:: .  .:. .:  .::. :..:.  . .. :::.  . :..: .:::  .:.: ::
CCDS98 ARVLGFQ--NPTPTP--GPEMPAEMLNYILDNVIQPLVESIWYKRLTLFSGRDIPGPGEE
     120         130         140       150       160       170     

     180       190       200       210       220       230         
pF1KSD SFEVWLEQATEIVKEWPVTEAEKKRWLAESLRGPALDLMHIVQADNPSISVEECLEAFKQ
       .:. :::...:...:: :...::.: : ::::::: :...:....::.:.. :::.:..:
CCDS98 TFDPWLEHTNEVLEEWQVSDVEKRRRLMESLRGPAADVIRILKSNNPAITTAECLKALEQ
         180       190       200       210       220       230     

     240       250       260       270       280       290         
pF1KSD VFGSLESRRTAQVRYLKTYQEEGEKVSAYVLRLETLLRRAVEKRAIPRRIADQVRLEQVM
       ::::.:: : ::...:.:::. :::.::::.::: ::...::: :: .  ..:.:::::.
CCDS98 VFGSVESSRDAQIKFLNTYQNPGEKLSAYVIRLEPLLQKVVEKGAIDKDNVNQARLEQVI
         240       250       260       270       280       290     

     300           310       320       330       340       350     
pF1KSD AGAT----LNQMLWCRLRELKDQGPPPSFLELMKVIREEEEEEASFENESIEEPEERDGY
       :::.    . ..::        .:: :....:.  ::::: .:   : :.          
CCDS98 AGANHSGAIRRQLWLTG---AGEGPAPNLFQLLVQIREEEAKEEEEEAEATLLQLGLEGH
         300       310          320       330       340       350  

         360    
pF1KSD GRWNHEGDD
                
CCDS98 F        
                

>>CCDS65344.1 PNMA3 gene_id:29944|Hs108|chrX              (455 aa)
 initn: 1090 init1: 613 opt: 1097  Z-score: 1204.6  bits: 231.8 E(32554): 8.9e-61
Smith-Waterman score: 1097; 49.7% identity (76.9% similar) in 350 aa overlap (1-347:1-348)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MALALLEDWCRIMSVDEQKSLMVTGIPADFEEAEIQEVLQETLKSLGRYRLLGKIFRKQE
       : :.::.::::   .. .. ... ::: :  : :..:.:::. . :::::..:..::..:
CCDS65 MPLTLLQDWCRGEHLNTRRCMLILGIPEDCGEDEFEETLQEACRHLGRYRVIGRMFRREE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD NANAVLLELLEDTDVSAIPSEVQGKGGVWKVIFKTPNQDTEFLERLNLFLEKEGQTVSGM
       ::.:.:::: .: : . .: :. :::: :.:: :  :.: :::.::: :::.: .::: :
CCDS65 NAQAILLELAQDIDYALLPREIPGKGGPWEVIVKPRNSDGEFLNRLNRFLEEERRTVSDM
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150        160       170         
pF1KSD FRALGQEGVSPATVPCISPELLAHLLGQAMAHAPQPLLP-MRYRKLRVFSGSAVPAPEEE
        :.::..    :    ::::. .   .:... : ::::  : ::.::::::...  :   
CCDS65 NRVLGSDTNCSAPRVTISPEFWT--WAQTLGAAVQPLLEQMLYRELRVFSGNTISIPGAL
              130       140         150       160       170        

     180       190       200       210       220       230         
pF1KSD SFEVWLEQATEIVKEWPVTEAEKKRWLAESLRGPALDLMHIVQADNPSISVEECLEAFKQ
       .:..:::..::... : : :.::.: : : ::::::...  ..:.: ::.::::: :..:
CCDS65 AFDAWLEHTTEMLQMWQVPEGEKRRRLMECLRGPALQVVSGLRASNASITVEECLAALQQ
      180       190       200       210       220       230        

     240       250       260       270       280       290         
pF1KSD VFGSLESRRTAQVRYLKTYQEEGEKVSAYVLRLETLLRRAVEKRAIPRRIADQVRLEQVM
       ::: .::.. :::.  :.::: :::::..::::: ::.::::. .. :: ..:.::..:.
CCDS65 VFGPVESHKIAQVKLCKAYQEAGEKVSSFVLRLEPLLQRAVENNVVSRRNVNQTRLKRVL
      240       250       260       270       280       290        

     300       310       320       330       340         350       
pF1KSD AGATLNQMLWCRLRELKDQGPPPSFLELMKVIREEEEEEASF--ENESIEEPEERDGYGR
       .:::: . :  .:. .:..  ::.:: :.:..::::: ::..  . ::.:          
CCDS65 SGATLPDKLRDKLKLMKQRRKPPGFLALVKLLREEEEWEATLGPDRESLEGLEVAPRPPA
      300       310       320       330       340       350        

       360                                                         
pF1KSD WNHEGDD                                                     
                                                                   
CCDS65 RITGVGAVPLPASGNSFDARPSQGYRRRRGRGQHRRGGVARAGSRGSRKRKRHTFCYSCG
      360       370       380       390       400       410        

>>CCDS35435.2 PNMA3 gene_id:29944|Hs108|chrX              (463 aa)
 initn: 1090 init1: 613 opt: 1097  Z-score: 1204.5  bits: 231.8 E(32554): 9.1e-61
Smith-Waterman score: 1097; 49.7% identity (76.9% similar) in 350 aa overlap (1-347:1-348)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MALALLEDWCRIMSVDEQKSLMVTGIPADFEEAEIQEVLQETLKSLGRYRLLGKIFRKQE
       : :.::.::::   .. .. ... ::: :  : :..:.:::. . :::::..:..::..:
CCDS35 MPLTLLQDWCRGEHLNTRRCMLILGIPEDCGEDEFEETLQEACRHLGRYRVIGRMFRREE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD NANAVLLELLEDTDVSAIPSEVQGKGGVWKVIFKTPNQDTEFLERLNLFLEKEGQTVSGM
       ::.:.:::: .: : . .: :. :::: :.:: :  :.: :::.::: :::.: .::: :
CCDS35 NAQAILLELAQDIDYALLPREIPGKGGPWEVIVKPRNSDGEFLNRLNRFLEEERRTVSDM
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150        160       170         
pF1KSD FRALGQEGVSPATVPCISPELLAHLLGQAMAHAPQPLLP-MRYRKLRVFSGSAVPAPEEE
        :.::..    :    ::::. .   .:... : ::::  : ::.::::::...  :   
CCDS35 NRVLGSDTNCSAPRVTISPEFWT--WAQTLGAAVQPLLEQMLYRELRVFSGNTISIPGAL
              130       140         150       160       170        

     180       190       200       210       220       230         
pF1KSD SFEVWLEQATEIVKEWPVTEAEKKRWLAESLRGPALDLMHIVQADNPSISVEECLEAFKQ
       .:..:::..::... : : :.::.: : : ::::::...  ..:.: ::.::::: :..:
CCDS35 AFDAWLEHTTEMLQMWQVPEGEKRRRLMECLRGPALQVVSGLRASNASITVEECLAALQQ
      180       190       200       210       220       230        

     240       250       260       270       280       290         
pF1KSD VFGSLESRRTAQVRYLKTYQEEGEKVSAYVLRLETLLRRAVEKRAIPRRIADQVRLEQVM
       ::: .::.. :::.  :.::: :::::..::::: ::.::::. .. :: ..:.::..:.
CCDS35 VFGPVESHKIAQVKLCKAYQEAGEKVSSFVLRLEPLLQRAVENNVVSRRNVNQTRLKRVL
      240       250       260       270       280       290        

     300       310       320       330       340         350       
pF1KSD AGATLNQMLWCRLRELKDQGPPPSFLELMKVIREEEEEEASF--ENESIEEPEERDGYGR
       .:::: . :  .:. .:..  ::.:: :.:..::::: ::..  . ::.:          
CCDS35 SGATLPDKLRDKLKLMKQRRKPPGFLALVKLLREEEEWEATLGPDRESLEGLEVAPRPPA
      300       310       320       330       340       350        

       360                                                         
pF1KSD WNHEGDD                                                     
                                                                   
CCDS35 RITGVGAVPLPASGNSFDARPSQGYRRRRGRGQHRRGGVARAGSRGSRKRKRHTFCYSCG
      360       370       380       390       400       410        

>>CCDS14718.1 PNMA5 gene_id:114824|Hs108|chrX             (448 aa)
 initn: 1038 init1: 624 opt: 1047  Z-score: 1149.9  bits: 221.7 E(32554): 9.9e-58
Smith-Waterman score: 1047; 46.7% identity (76.5% similar) in 362 aa overlap (1-357:1-349)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MALALLEDWCRIMSVDEQKSLMVTGIPADFEEAEIQEVLQETLKSLGRYRLLGKIFRKQE
       :::.::::::. :..: .:.:...::: .  :.:::....  :. :  ::.::..::...
CCDS14 MALTLLEDWCKGMDMDPRKALLIVGIPMECSEVEIQDTVKAGLQPLCAYRVLGRMFRRED
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD NANAVLLELLEDTDVSAIPSEVQGKGGVWKVIFKTPNQDTEFLERLNLFLEKEGQTVSGM
       ::.::..:: . .. ...::.. :::: :.:. :  : : ::: ::: ::. ::.... .
CCDS14 NAKAVFIELADTVNYTTLPSHIPGKGGSWEVVVKPRNPDDEFLSRLNYFLKDEGRSMTDV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150           160       170      
pF1KSD FRALGQEGVSPATVPCISPELLAHLLGQAMAHAPQPLLP----MRYRKLRVFSGSAVPAP
        ::::       ..:  :  : :... :.  ..: :: :    : ::::.::::.: :.:
CCDS14 ARALGC-----CSLPAES--LDAEVMPQV--RSP-PLEPPKESMWYRKLKVFSGTASPSP
                   130         140          150       160       170

        180       190       200       210       220       230      
pF1KSD EEESFEVWLEQATEIVKEWPVTEAEKKRWLAESLRGPALDLMHIVQADNPSISVEECLEA
        ::.:: ::::.:::.  : :.:.::.: : ::::::::..:...::.: ::.::.::.:
CCDS14 GEETFEDWLEQVTEIMPIWQVSEVEKRRRLLESLRGPALSIMRVLQANNDSITVEQCLDA
              180       190       200       210       220       230

        240       250       260       270       280       290      
pF1KSD FKQVFGSLESRRTAQVRYLKTYQEEGEKVSAYVLRLETLLRRAVEKRAIPRRIADQVRLE
       .::.::. :. :..: :.:.:  . :::::...:::: ::..::.:  .  : .:..::.
CCDS14 LKQIFGDKEDFRASQFRFLQTSPKIGEKVSTFLLRLEPLLQKAVHKSPLSVRSTDMIRLK
              240       250       260       270       280       290

        300       310       320       330       340       350      
pF1KSD QVMAGATLNQMLWCRLRELKDQGPPPSFLELMKVIREEEEEEASFENESIEEPEER-DGY
       ...: ....  :  .:. : ..: ::.::::::.::.::: : .   :.. . .:. .: 
CCDS14 HLLARVAMTPALRGKLELLDQRGCPPNFLELMKLIRDEEEWENT---EAVMKNKEKPSGR
              300       310       320       330          340       

         360                                                       
pF1KSD GRWNHEGDD                                                   
       ::                                                          
CCDS14 GRGASGRQARAEASVSAPQATVQARSFSDSSPQTIQGGLPPLVKRRRLLGSESTRGEDHG
       350       360       370       380       390       400       

>>CCDS9908.1 MOAP1 gene_id:64112|Hs108|chr14              (351 aa)
 initn: 1011 init1: 959 opt: 1022  Z-score: 1124.2  bits: 216.6 E(32554): 2.7e-56
Smith-Waterman score: 1022; 47.5% identity (74.9% similar) in 343 aa overlap (1-339:1-340)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MALALLEDWCRIMSVDEQKSLMVTGIPADFEEAEIQEVLQETLKSLGRYRLLGKIFRKQE
       :.: ::::::: :... .:.:...::  .   :::.:.::  :  ::.:::::..::..:
CCDS99 MTLRLLEDWCRGMDMNPRKALLIAGISQSCSVAEIEEALQAGLAPLGEYRLLGRMFRRDE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD NANAVLLELLEDTDVSAIPSEVQGKGGVWKVIFKTPNQDTEFLERLNLFLEKEGQTVSGM
       : ...:. :  .:. . .:.:. ::::.:.:::: :. :. :: ::: ::  ::.::. .
CCDS99 NRKVALVGLTAETSHALVPKEIPGKGGIWRVIFKPPDPDNTFLSRLNEFLAGEGMTVGEL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150        160       170         
pF1KSD FRALGQEGVSPATVPCISPELLAHLLGQAMAHAPQPLLP-MRYRKLRVFSGSAVPAPEEE
        ::::.:. :      . ::. : .:.::. .: :: :  ..:.:::::::   : : ::
CCDS99 SRALGHENGSLDPEQGMIPEMWAPMLAQAL-EALQPALQCLKYKKLRVFSGRESPEPGEE
              130       140       150        160       170         

     180       190       200       210       220       230         
pF1KSD SFEVWLEQATEIVKEWPVTEAEKKRWLAESLRGPALDLMHIVQADNPSISVEECLEAFKQ
        :  :. ..:...: : : ..::.: : :::::::::...... .:: :.:.:::.:...
CCDS99 EFGRWMFHTTQMIKAWQVPDVEKRRRLLESLRGPALDVIRVLKINNPLITVDECLQALEE
     180       190       200       210       220       230         

     240       250       260       270       280       290         
pF1KSD VFGSLESRRTAQVRYLKTYQEEGEKVSAYVLRLETLLRRAVEKRAIPRRIADQVRLEQVM
       :::  .. :  ::.:: :::.. ::.:::::::: ::.. :.. :: :  ..:.::.::.
CCDS99 VFGVTDNPRELQVKYLTTYQKDEEKLSAYVLRLEPLLQKLVQRGAIERDAVNQARLDQVI
     240       250       260       270       280       290         

     300       310       320       330          340       350      
pF1KSD AGATLNQMLWCRLRELKDQGPPPSFLELMKVIRE---EEEEEASFENESIEEPEERDGYG
       :::. . .   :  .: ..:: :.::.:. .:..    :::::                 
CCDS99 AGAVHKTIR--RELNLPEDGPAPGFLQLLVLIKDYEAAEEEEALLQAILEGNFT      
     300         310       320       330       340       350       

        360    
pF1KSD RWNHEGDD

>>CCDS14719.1 PNMA6A gene_id:84968|Hs108|chrX             (399 aa)
 initn: 865 init1: 382 opt: 552  Z-score: 608.4  bits: 121.3 E(32554): 1.4e-27
Smith-Waterman score: 869; 42.5% identity (70.4% similar) in 358 aa overlap (1-354:1-345)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MALALLEDWCRIMSVDEQKSLMVTGIPADFEEAEIQEVLQETLKSLGRYRLLGKIFRKQE
       ::...:.:::: :.:. ...:.. ::: : ..::.:: :. .:. .:.. .::: ::...
CCDS14 MAVTMLQDWCRWMGVNARRGLLILGIPEDCDDAEFQESLEAALRPMGHFTVLGKAFREED
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100         110        
pF1KSD NANAVLLELLEDTDVSAIPSEVQGKGGVWKVIFKTPNQDTEFLE--RLNLFLEKEGQTVS
       ::.:.:.:: .... . .: :. : :: :.:.:    .  :::   :.  : :.::: : 
CCDS14 NATAALVELDREVNYALVPREIPGTGGPWNVVFVPRCSGEEFLGLGRVFHFPEQEGQMVE
               70        80        90       100       110       120

      120       130       140       150        160       170       
pF1KSD GMFRALGQEGVSPATVPCISPELLAHLLGQAMAHAPQPLLP-MRYRKLRVFSGSAVPAPE
       ..  :::   :.   : :       . .:::.    :: .  .: ..: ::::   ::: 
CCDS14 SVAGALG---VGLRRV-C-----WLRSIGQAV----QPWVEAVRCQSLGVFSGRDQPAPG
                 130             140           150       160       

       180       190        200       210       220       230      
pF1KSD EESFEVWLEQATEIVKEWP-VTEAEKKRWLAESLRGPALDLMHIVQADNPSISVEECLEA
       ::::::::...::... :  :.: :..: : :.::: ::.:.: . :.::. ....:: :
CCDS14 EESFEVWLDHTTEMLHVWQGVSERERRRRLLEGLRGTALQLVHALLAENPARTAQDCLAA
       170       180       190       200       210       220       

        240       250       260       270       280       290      
pF1KSD FKQVFGSLESRRTAQVRYLKTYQEEGEKVSAYVLRLETLLRRAVEKRAIPRRIADQVRLE
       . ::::. ::. : .:. : . :. ::..::.:::::.::..:.::.:. :  ::.:::.
CCDS14 LAQVFGDNESQATIRVKCLTAQQQSGERLSAFVLRLEVLLQKAMEKEALARASADRVRLR
       230       240       250       260       270       280       

        300       310       320       330       340       350      
pF1KSD QVMAGATLNQMLWCRLRELKDQGPPPSFLELMKVIREEEEEEASFENESIEEPEERDGYG
       :... : :.. :   ::.:.  :  :::::.. ..:: :  :::.      . .:  :  
CCDS14 QMLTRAHLTEPLDEALRKLRMAGRSPSFLEMLGLVRESEAWEASLARSVRAQTQEGAGAR
       290       300       310       320       330       340       

        360                                                
pF1KSD RWNHEGDD                                            
                                                           
CCDS14 AGAQAVARASTKVEAVPGGPGREPEGLLQAGGQEAEELLQEGLKPVLEECDN
       350       360       370       380       390         

>>CCDS65304.1 ZCCHC18 gene_id:644353|Hs108|chrX           (403 aa)
 initn: 478 init1: 421 opt: 509  Z-score: 561.3  bits: 112.6 E(32554): 6.1e-25
Smith-Waterman score: 509; 41.5% identity (73.2% similar) in 205 aa overlap (143-341:22-226)

            120       130       140       150        160       170 
pF1KSD EGQTVSGMFRALGQEGVSPATVPCISPELLAHLLGQAMAHAPQPLL-PMRYRKLRVFSGS
                                     :: . ......  ::.  :  :....::: 
CCDS65          MASITACVGNSRQQNAPLPPWAHSMLRSLGRSLCPLVVKMAERNMKLFSGR
                        10        20        30        40        50 

             180       190       200       210       220       230 
pF1KSD AVPAPEEESFEVWLEQATEIVKEWPVTEAEKKRWLAESLRGPALDLMHIVQADNPSISVE
       .:::  .:.:: :: :..:.. .: ..: :: . : ..::::: ..:...:: ::..:: 
CCDS65 VVPAQGKETFENWLIQVNEVLPDWSMSEEEKLKRLMKTLRGPAREVMRLLQAANPNLSVA
              60        70        80        90       100       110 

             240       250       260       270       280       290 
pF1KSD ECLEAFKQVFGSLESRRTAQVRYLKTYQEEGEKVSAYVLRLETLLRRAVEKRAIPRRIAD
       . :.:.: :::  ::  ::. ....: : .:::.: ::.:::. :. :..   . .. :.
CCDS65 DFLRAMKLVFGESESSVTAHGKFFNTLQAQGEKASLYVIRLEVQLQNAIQAGILAEKDAN
             120       130       140       150       160       170 

             300       310            320       330       340      
pF1KSD QVRLEQVMAGATLNQMLWCRLREL-----KDQGPPPSFLELMKVIREEEEEEASFENESI
       :.::.:.. :: ::. :  ::..:     . :   :.::::.:.:::::. . .:     
CCDS65 QTRLQQLLLGAELNRDLRFRLKHLLRMYANKQERLPNFLELIKMIREEEDWDDAFIKRKR
             180       190       200       210       220       230 

        350       360                                              
pF1KSD EEPEERDGYGRWNHEGDD                                          
                                                                   
CCDS65 PKRSEPIMERAASPVAFQGAQPIAISSADCNCNVIEIDDTLDDSDEDVILVVSLYPSLTP
             240       250       260       270       280       290 

>>CCDS14574.1 ZCCHC12 gene_id:170261|Hs108|chrX           (402 aa)
 initn: 459 init1: 406 opt: 492  Z-score: 542.7  bits: 109.1 E(32554): 6.6e-24
Smith-Waterman score: 492; 38.5% identity (73.2% similar) in 205 aa overlap (143-341:22-226)

            120       130       140       150        160       170 
pF1KSD EGQTVSGMFRALGQEGVSPATVPCISPELLAHLLGQAMAHAPQPLLP-MRYRKLRVFSGS
                                     :: . ......  :..  :  :....::: 
CCDS14          MASIIARVGNSRRLNAPLPPWAHSMLRSLGRSLGPIMASMADRNMKLFSGR
                        10        20        30        40        50 

             180       190       200       210       220       230 
pF1KSD AVPAPEEESFEVWLEQATEIVKEWPVTEAEKKRWLAESLRGPALDLMHIVQADNPSISVE
       .:::  ::.:: :: :.. .. .: ..: :: . : ..::::: ..:...:: ::..:: 
CCDS14 VVPAQGEETFENWLTQVNGVLPDWNMSEEEKLKRLMKTLRGPAREVMRVLQATNPNLSVA
              60        70        80        90       100       110 

             240       250       260       270       280       290 
pF1KSD ECLEAFKQVFGSLESRRTAQVRYLKTYQEEGEKVSAYVLRLETLLRRAVEKRAIPRRIAD
       . :.:.: :::  ::  ::. ....: : .:::.: ::.:::. :. :..   : .. :.
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       ..::.:.. :. :.. :  ::...     ..:   :.::::....::::. . .:     
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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