Result of FASTA (omim) for pF1KSDA0813
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA0813, 1534 aa
  1>>>pF1KSDA0813 1534 - 1534 aa - 1534 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.4982+/-0.000741; mu= 8.3011+/- 0.045
 mean_var=340.0353+/-68.024, 0's: 0 Z-trim(113.8): 704  B-trim: 893 in 2/50
 Lambda= 0.069552
 statistics sampled from 22411 (23308) to 22411 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.614), E-opt: 0.2 (0.273), width:  16
 Scan time: 12.030

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_003052 (OMIM: 603742) slit homolog 1 protein pr (1534) 10855 1106.0       0
NP_004778 (OMIM: 603746) slit homolog 2 protein is (1529) 7433 762.6       0
XP_005248268 (OMIM: 603746) PREDICTED: slit homolo (1533) 7426 761.9 8.7e-219
NP_001276064 (OMIM: 603746) slit homolog 2 protein (1525) 7345 753.8 2.4e-216
XP_016864334 (OMIM: 603746) PREDICTED: slit homolo (1495) 7231 742.3 6.6e-213
XP_011512211 (OMIM: 603746) PREDICTED: slit homolo (1499) 7224 741.6 1.1e-212
NP_001258875 (OMIM: 603745) slit homolog 3 protein (1530) 6694 688.5 1.1e-196
NP_001276065 (OMIM: 603746) slit homolog 2 protein (1521) 6094 628.3 1.5e-178
NP_003053 (OMIM: 603745) slit homolog 3 protein is (1523) 5521 570.8  3e-161
XP_016865268 (OMIM: 603745) PREDICTED: slit homolo (1460) 5519 570.5 3.4e-161
XP_011512212 (OMIM: 603746) PREDICTED: slit homolo (1159) 5426 561.1 1.9e-158
XP_006714049 (OMIM: 603746) PREDICTED: slit homolo (1509) 3735 391.6 2.7e-107
XP_016883196 (OMIM: 118450,187500,601920) PREDICTE (1059)  844 101.3 4.6e-20
NP_000205 (OMIM: 118450,187500,601920) protein jag (1218)  844 101.3   5e-20
NP_004548 (OMIM: 164951) neurogenic locus notch ho (2003)  822 99.4 3.1e-19
NP_005609 (OMIM: 606582) delta-like protein 1 prec ( 723)  809 97.5 4.2e-19
XP_005259981 (OMIM: 125310,130720,600276,615293) P (2269)  788 96.1 3.5e-18
NP_000426 (OMIM: 125310,130720,600276,615293) neur (2321)  788 96.1 3.6e-18
NP_001186930 (OMIM: 102500,600275,610205) neurogen (1235)  774 94.3 6.5e-18
NP_060087 (OMIM: 109730,190198,616028) neurogenic  (2555)  776 94.9 8.7e-18
XP_011539822 (OMIM: 102500,600275,610205) PREDICTE (2432)  774 94.7 9.8e-18
XP_005270958 (OMIM: 102500,600275,610205) PREDICTE (2432)  774 94.7 9.8e-18
XP_016856862 (OMIM: 102500,600275,610205) PREDICTE (2432)  774 94.7 9.8e-18
XP_016856861 (OMIM: 102500,600275,610205) PREDICTE (2455)  774 94.7 9.8e-18
XP_011539821 (OMIM: 102500,600275,610205) PREDICTE (2467)  774 94.7 9.8e-18
NP_077719 (OMIM: 102500,600275,610205) neurogenic  (2471)  774 94.7 9.8e-18
NP_699197 (OMIM: 611691) sushi, von Willebrand fac (3571)  777 95.2 9.9e-18
XP_005266991 (OMIM: 606582) PREDICTED: delta-like  ( 524)  664 82.8 8.3e-15
NP_660142 (OMIM: 602570) protein jagged-2 isoform  (1200)  631 80.0 1.3e-13
NP_002217 (OMIM: 602570) protein jagged-2 isoform  (1238)  631 80.0 1.4e-13
NP_056356 (OMIM: 608868) leucine-rich repeats and  (1093)  615 78.3 3.9e-13
NP_982353 (OMIM: 277300,602768) delta-like protein ( 587)  606 77.0   5e-13
NP_058637 (OMIM: 277300,602768) delta-like protein ( 618)  606 77.1 5.2e-13
XP_016859265 (OMIM: 616634) PREDICTED: sushi, nido (1420)  610 77.9 6.4e-13
XP_011509239 (OMIM: 616634) PREDICTED: sushi, nido ( 905)  603 77.0   8e-13
XP_016859268 (OMIM: 616634) PREDICTED: sushi, nido (1309)  603 77.2 9.9e-13
XP_016859267 (OMIM: 616634) PREDICTED: sushi, nido (1309)  603 77.2 9.9e-13
XP_016859269 (OMIM: 616634) PREDICTED: sushi, nido (1309)  603 77.2 9.9e-13
XP_016859270 (OMIM: 616634) PREDICTED: sushi, nido (1309)  603 77.2 9.9e-13
XP_011509236 (OMIM: 616634) PREDICTED: sushi, nido (1315)  603 77.2 9.9e-13
XP_011509235 (OMIM: 616634) PREDICTED: sushi, nido (1351)  603 77.2   1e-12
XP_011509234 (OMIM: 616634) PREDICTED: sushi, nido (1404)  603 77.2   1e-12
NP_001073906 (OMIM: 616634) sushi, nidogen and EGF (1413)  603 77.2   1e-12
XP_016859264 (OMIM: 616634) PREDICTED: sushi, nido (1425)  603 77.2   1e-12
XP_016859263 (OMIM: 616634) PREDICTED: sushi, nido (1434)  603 77.2   1e-12
XP_011509233 (OMIM: 616634) PREDICTED: sushi, nido (1437)  603 77.3   1e-12
XP_016859262 (OMIM: 616634) PREDICTED: sushi, nido (1458)  603 77.3 1.1e-12
NP_061947 (OMIM: 605185,616589) delta-like protein ( 685)  587 75.2 2.1e-12
NP_001136272 (OMIM: 602772,612424) protein eyes sh (3144)  571 74.5 1.5e-11
NP_001278938 (OMIM: 602772,612424) protein eyes sh (3165)  571 74.5 1.5e-11


>>NP_003052 (OMIM: 603742) slit homolog 1 protein precur  (1534 aa)
 initn: 10855 init1: 10855 opt: 10855  Z-score: 5908.5  bits: 1106.0 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 10855; 99.9% identity (100.0% similar) in 1534 aa overlap (1-1534:1-1534)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MALTPGWGSSAGPVRPELWLLLWAAAWRLGASACPALCTCTGTTVDCHGTGLQAIPKNIP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 MALTPGWGSSAGPVRPELWLLLWAAAWRLGASACPALCTCTGTTVDCHGTGLQAIPKNIP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD RNTERLELNGNNITRIHKNDFAGLKQLRVLQLMENQIGVVERGAFDDMKELERLRLNRNQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
NP_003 RNTERLELNGNNITRIHKNDFAGLKQLRVLQLMENQIGAVERGAFDDMKELERLRLNRNQ
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD LHMLPELLFQNNQALSRLDLSENAIQAIPRKAFRGATDLKNLQLDKNQISCIEEGAFRAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 LHMLPELLFQNNQALSRLDLSENAIQAIPRKAFRGATDLKNLQLDKNQISCIEEGAFRAL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD RGLEVLTLNNNNITTIPVSSFNHMPKLRTFRLHSNHLFCDCHLAWLSQWLRQRPTIGLFT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 RGLEVLTLNNNNITTIPVSSFNHMPKLRTFRLHSNHLFCDCHLAWLSQWLRQRPTIGLFT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD QCSGPASLRGLNVAEVQKSEFSCSGQGEAGRVPTCTLSSGSCPAMCTCSNGIVDCRGKGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 QCSGPASLRGLNVAEVQKSEFSCSGQGEAGRVPTCTLSSGSCPAMCTCSNGIVDCRGKGL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD TAIPANLPETMTEIRLELNGIKSIPPGAFSPYRKLRRIDLSNNQIAEIAPDAFQGLRSLN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 TAIPANLPETMTEIRLELNGIKSIPPGAFSPYRKLRRIDLSNNQIAEIAPDAFQGLRSLN
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD SLVLYGNKITDLPRGVFGGLYTLQLLLLNANKINCIRPDAFQDLQNLSLLSLYDNKIQSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 SLVLYGNKITDLPRGVFGGLYTLQLLLLNANKINCIRPDAFQDLQNLSLLSLYDNKIQSL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD AKGTFTSLRAIQTLHLAQNPFICDCNLKWLADFLRTNPIETSGARCASPRRLANKRIGQI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 AKGTFTSLRAIQTLHLAQNPFICDCNLKWLADFLRTNPIETSGARCASPRRLANKRIGQI
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD KSKKFRCSAKEQYFIPGTEDYQLNSECNSDVVCPHKCRCEANVVECSSLKLTKIPERIPQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 KSKKFRCSAKEQYFIPGTEDYQLNSECNSDVVCPHKCRCEANVVECSSLKLTKIPERIPQ
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD STAELRLNNNEISILEATGMFKKLTHLKKINLSNNKVSEIEDGAFEGAASVSELHLTANQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 STAELRLNNNEISILEATGMFKKLTHLKKINLSNNKVSEIEDGAFEGAASVSELHLTANQ
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD LESIRSGMFRGLDGLRTLMLRNNRISCIHNDSFTGLRNVRLLSLYDNQITTVSPGAFDTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 LESIRSGMFRGLDGLRTLMLRNNRISCIHNDSFTGLRNVRLLSLYDNQITTVSPGAFDTL
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD QSLSTLNLLANPFNCNCQLAWLGGWLRKRKIVTGNPRCQNPDFLRQIPLQDVAFPDFRCE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 QSLSTLNLLANPFNCNCQLAWLGGWLRKRKIVTGNPRCQNPDFLRQIPLQDVAFPDFRCE
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD EGQEEGGCLPRPQCPQECACLDTVVRCSNKHLRALPKGIPKNVTELYLDGNQFTLVPGQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 EGQEEGGCLPRPQCPQECACLDTVVRCSNKHLRALPKGIPKNVTELYLDGNQFTLVPGQL
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD STFKYLQLVDLSNNKISSLSNSSFTNMSQLTTLILSYNALQCIPPLAFQGLRSLRLLSLH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 STFKYLQLVDLSNNKISSLSNSSFTNMSQLTTLILSYNALQCIPPLAFQGLRSLRLLSLH
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KSD GNDISTLQEGIFADVTSLSHLAIGANPLYCDCHLRWLSSWVKTGYKEPGIARCAGPQDME
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 GNDISTLQEGIFADVTSLSHLAIGANPLYCDCHLRWLSSWVKTGYKEPGIARCAGPQDME
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KSD GKLLLTTPAKKFECQGPPTLAVQAKCDLCLSSPCQNQGTCHNDPLEVYRCACPSGYKGRD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 GKLLLTTPAKKFECQGPPTLAVQAKCDLCLSSPCQNQGTCHNDPLEVYRCACPSGYKGRD
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KSD CEVSLDSCSSGPCENGGTCHAQEGEDAPFTCSCPTGFEGPTCGVNTDDCVDHACANGGVC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 CEVSLDSCSSGPCENGGTCHAQEGEDAPFTCSCPTGFEGPTCGVNTDDCVDHACANGGVC
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KSD VDGVGNYTCQCPLQYEGKACEQLVDLCSPDLNPCQHEAQCVGTPDGPRCECMPGYAGDNC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 VDGVGNYTCQCPLQYEGKACEQLVDLCSPDLNPCQHEAQCVGTPDGPRCECMPGYAGDNC
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KSD SENQDDCRDHRCQNGAQCMDEVNSYSCLCAEGYSGQLCEIPPHLPAPKSPCEGTECQNGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 SENQDDCRDHRCQNGAQCMDEVNSYSCLCAEGYSGQLCEIPPHLPAPKSPCEGTECQNGA
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KSD NCVDQGNRPVCQCLPGFGGPECEKLLSVNFVDRDTYLQFTDLQNWPRANITLQVSTAEDN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 NCVDQGNRPVCQCLPGFGGPECEKLLSVNFVDRDTYLQFTDLQNWPRANITLQVSTAEDN
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KSD GILLYNGDNDHIAVELYQGHVRVSYDPGSYPSSAIYSAETINDGQFHTVELVAFDQMVNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 GILLYNGDNDHIAVELYQGHVRVSYDPGSYPSSAIYSAETINDGQFHTVELVAFDQMVNL
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

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pF1KSD SIDGGSPMTMDNFGKHYTLNSEAPLYVGGMPVDVNSAAFRLWQILNGTGFHGCIRNLYIN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 SIDGGSPMTMDNFGKHYTLNSEAPLYVGGMPVDVNSAAFRLWQILNGTGFHGCIRNLYIN
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

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pF1KSD NELQDFTKTQMKPGVVPGCEPCRKLYCLHGICQPNATPGPMCHCEAGWVGLHCDQPADGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 NELQDFTKTQMKPGVVPGCEPCRKLYCLHGICQPNATPGPMCHCEAGWVGLHCDQPADGP
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pF1KSD CHGHKCVHGQCVPLDALSYSCQCQDGYSGALCNQAGALAEPCRGLQCLHGHCQASGTKGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 CHGHKCVHGQCVPLDALSYSCQCQDGYSGALCNQAGALAEPCRGLQCLHGHCQASGTKGA
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pF1KSD HCVCDPGFSGELCEQESECRGDPVRDFHQVQRGYAICQTTRPLSWVECRGSCPGQGCCQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 HCVCDPGFSGELCEQESECRGDPVRDFHQVQRGYAICQTTRPLSWVECRGSCPGQGCCQG
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pF1KSD LRLKRRKFTFECSDGTSFAEEVEKPTKCGCALCA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 LRLKRRKFTFECSDGTSFAEEVEKPTKCGCALCA
             1510      1520      1530    

>>NP_004778 (OMIM: 603746) slit homolog 2 protein isofor  (1529 aa)
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NP_004       MRGVGWQMLSLSLGLVLAILNKVAPQACPAQCSCSGSTVDCHGLALRSVPRNIP
                     10        20        30        40        50    

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pF1KSD RNTERLELNGNNITRIHKNDFAGLKQLRVLQLMENQIGVVERGAFDDMKELERLRLNRNQ
       ::::::.::::::::: :.:::::..:::::::::.:...:::::.:.:::::::::::.
NP_004 RNTERLDLNGNNITRITKTDFAGLRHLRVLQLMENKISTIERGAFQDLKELERLRLNRNH
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pF1KSD LHMLPELLFQNNQALSRLDLSENAIQAIPRKAFRGATDLKNLQLDKNQISCIEEGAFRAL
       :...::::: ..  : ::::::: ::::::::::::.:.:::::: :::::::.::::::
NP_004 LQLFPELLFLGTAKLYRLDLSENQIQAIPRKAFRGAVDIKNLQLDYNQISCIEDGAFRAL
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pF1KSD RGLEVLTLNNNNITTIPVSSFNHMPKLRTFRLHSNHLFCDCHLAWLSQWLRQRPTIGLFT
       : :::::::::::: . :.::::::::::::::::.:.:::::::::.:::::: .::.:
NP_004 RDLEVLTLNNNNITRLSVASFNHMPKLRTFRLHSNNLYCDCHLAWLSDWLRQRPRVGLYT
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pF1KSD QCSGPASLRGLNVAEVQKSEFSCSGQGEAGRVPTCTLSSGSCPAMCTCSNGIVDCRGKGL
       :: ::. ::: ::::::: :: :::. ..  .:.:..    ::: :::::.:::::::::
NP_004 QCMGPSHLRGHNVAEVQKREFVCSGH-QSFMAPSCSVLH--CPAACTCSNNIVDCRGKGL
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pF1KSD TAIPANLPETMTEIRLELNGIKSIPPGAFSPYRKLRRIDLSNNQIAEIAPDAFQGLRSLN
       : ::.:::::.:::::: : :: :::::::::.::::::::::::.:.::::::::::::
NP_004 TEIPTNLPETITEIRLEQNTIKVIPPGAFSPYKKLRRIDLSNNQISELAPDAFQGLRSLN
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pF1KSD SLVLYGNKITDLPRGVFGGLYTLQLLLLNANKINCIRPDAFQDLQNLSLLSLYDNKIQSL
       ::::::::::.::...: ::..:::::::::::::.: ::::::.::.::::::::.:..
NP_004 SLVLYGNKITELPKSLFEGLFSLQLLLLNANKINCLRVDAFQDLHNLNLLSLYDNKLQTI
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pF1KSD AKGTFTSLRAIQTLHLAQNPFICDCNLKWLADFLRTNPIETSGARCASPRRLANKRIGQI
       :::::. ::::::.:::::::::::.::::::.:.:::::::::::.:::::::::::::
NP_004 AKGTFSPLRAIQTMHLAQNPFICDCHLKWLADYLHTNPIETSGARCTSPRRLANKRIGQI
             420       430       440       450       460       470 

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pF1KSD KSKKFRCSAKEQYFIPGTEDY--QLNSECNSDVVCPHKCRCEANVVECSSLKLTKIPERI
       :::::::::::::::::::::  .:...: .:..::.:::::...:.::. ::.::::.:
NP_004 KSKKFRCSAKEQYFIPGTEDYRSKLSGDCFADLACPEKCRCEGTTVDCSNQKLNKIPEHI
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pF1KSD PQSTAELRLNNNEISILEATGMFKKLTHLKKINLSNNKVSEIEDGAFEGAASVSELHLTA
       :: ::::::::::...:::::.:::: .:.:::.::::...::.::::::..:.:. ::.
NP_004 PQYTAELRLNNNEFTVLEATGIFKKLPQLRKINFSNNKITDIEEGAFEGASGVNEILLTS
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pF1KSD NQLESIRSGMFRGLDGLRTLMLRNNRISCIHNDSFTGLRNVRLLSLYDNQITTVSPGAFD
       :.::...  ::.::..:.:::::.:::.:. :::: :: .::::::::::::::.:::::
NP_004 NRLENVQHKMFKGLESLKTLMLRSNRITCVGNDSFIGLSSVRLLSLYDNQITTVAPGAFD
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pF1KSD TLQSLSTLNLLANPFNCNCQLAWLGGWLRKRKIVTGNPRCQNPDFLRQIPLQDVAFPDFR
       ::.:::::::::::::::: ::::: ::::..:::::::::.: ::..::.::::. :: 
NP_004 TLHSLSTLNLLANPFNCNCYLAWLGEWLRKKRIVTGNPRCQKPYFLKEIPIQDVAIQDFT
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pF1KSD CEEGQEEGGCLPRPQCPQECACLDTVVRCSNKHLRALPKGIPKNVTELYLDGNQFTLVPG
       :..:.....: :  .:: ::.::::::::::: :..::::::..::::::::::::::: 
NP_004 CDDGNDDNSCSPLSRCPTECTCLDTVVRCSNKGLKVLPKGIPRDVTELYLDGNQFTLVPK
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pF1KSD QLSTFKYLQLVDLSNNKISSLSNSSFTNMSQLTTLILSYNALQCIPPLAFQGLRSLRLLS
       .::..:.: :.:::::.::.:::.::.::.:: ::::::: :.:::: .:.::.::::::
NP_004 ELSNYKHLTLIDLSNNRISTLSNQSFSNMTQLLTLILSYNRLRCIPPRTFDGLKSLRLLS
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pF1KSD LHGNDISTLQEGIFADVTSLSHLAIGANPLYCDCHLRWLSSWVKTGYKEPGIARCAGPQD
       :::::::.. :: : :...:::::::::::::::...:::.:::. :::::::::::: .
NP_004 LHGNDISVVPEGAFNDLSALSHLAIGANPLYCDCNMQWLSDWVKSEYKEPGIARCAGPGE
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pF1KSD MEGKLLLTTPAKKFECQGPPTLAVQAKCDLCLSSPCQNQGTCHNDPLEVYRCACPSGYKG
       :  :::::::.::: ::::  . . :::. :::.::.:.:::..::.. :::.:: :.::
NP_004 MADKLLLTTPSKKFTCQGPVDVNILAKCNPCLSNPCKNDGTCNSDPVDFYRCTCPYGFKG
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pF1KSD RDCEVSLDSCSSGPCENGGTCHAQEGEDAPFTCSCPTGFEGPTCGVNTDDCVDHACANGG
       .::.: . .: :.::..::::: .:::.  : : :  :::: .: ::.::: :. : :..
NP_004 QDCDVPIHACISNPCKHGGTCHLKEGEEDGFWCICADGFEGENCEVNVDDCEDNDCENNS
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pF1KSD VCVDGVGNYTCQCPLQYEGKACEQLVDLCSPDLNPCQHEAQCVGTPDGPRCECMPGYAGD
       .::::..:::: :: .: :. ::. .:.:. :::::::...:. :: : .:.: :::.:.
NP_004 TCVDGINNYTCLCPPEYTGELCEEKLDFCAQDLNPCQHDSKCILTPKGFKCDCTPGYVGE
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pF1KSD NCSENQDDCRDHRCQNGAQCMDEVNSYSCLCAEGYSGQLCEIPPHLPAPK-SPCEGTECQ
       .:. . :::.:..:.:::.: : ::.:.:.: ::::: .::. : .  :. :::.. .::
NP_004 HCDIDFDDCQDNKCKNGAHCTDAVNGYTCICPEGYSGLFCEFSPPMVLPRTSPCDNFDCQ
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pF1KSD NGANCVDQGNRPVCQCLPGFGGPECEKLLSVNFVDRDTYLQFTDLQNWPRANITLQVSTA
       :::.:. . :.:.::::::. : .::::.::::.....:::. . .  :..:::::..: 
NP_004 NGAQCIVRINEPICQCLPGYQGEKCEKLVSVNFINKESYLQIPSAKVRPQTNITLQIATD
            1140      1150      1160      1170      1180      1190 

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pF1KSD EDNGILLYNGDNDHIAVELYQGHVRVSYDPGSYPSSAIYSAETINDGQFHTVELVAFDQM
       ::.:::::.::.::::::::.:.::.::: ::.:.:::::.::::::.:: :::.:.:: 
NP_004 EDSGILLYKGDKDHIAVELYRGRVRASYDTGSHPASAIYSVETINDGNFHIVELLALDQS
            1200      1210      1220      1230      1240      1250 

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pF1KSD VNLSIDGGSPMTMDNFGKHYTLNSEAPLYVGGMPVDVNSAAFRLWQILNGTGFHGCIRNL
       ..::.:::.:  . :..:. ::: ..::::::::   : :..:     :::.::::::::
NP_004 LSLSVDGGNPKIITNLSKQSTLNFDSPLYVGGMPGKSNVASLRQAPGQNGTSFHGCIRNL
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      1320      1330      1340      1350      1360      1370       
pF1KSD YINNELQDFTKTQMKPGVVPGCEPCRKLYCLHGICQPNATPGPMCHCEAGWVGLHCDQPA
       :::.::::: :. :. :..::::::.:  : :: :::..  :  :.:. ::.:  ::: .
NP_004 YINSELQDFQKVPMQTGILPGCEPCHKKVCAHGTCQPSSQAGFTCECQEGWMGPLCDQRT
            1320      1330      1340      1350      1360      1370 

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pF1KSD DGPCHGHKCVHGQCVPLDALSYSCQCQDGYSGALCNQAGALAEPCRGLQCLHGHCQASGT
       . :: :.::::: :.:..:.::::.: .:..:.::..   : .::....: ::.:. :: 
NP_004 NDPCLGNKCVHGTCLPINAFSYSCKCLEGHGGVLCDEEEDLFNPCQAIKCKHGKCRLSGL
            1380      1390      1400      1410      1420      1430 

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pF1KSD KGAHCVCDPGFSGELCEQESECRGDPVRDFHQVQRGYAICQTTRPLSWVECRGSCPGQGC
          .: :. :..:. :..:  :::. .::..: :.::: ::::. .: .::::.: :  :
NP_004 GQPYCECSSGYTGDSCDREISCRGERIRDYYQKQQGYAACQTTKKVSRLECRGGCAGGQC
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pF1KSD CQGLRLKRRKFTFECSDGTSFAEEVEKPTKCGCALCA 
       :  :: ::::..:::.::.::..:::: .::::. :  
NP_004 CGPLRSKRRKYSFECTDGSSFVDEVEKVVKCGCTRCVS
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>>XP_005248268 (OMIM: 603746) PREDICTED: slit homolog 2   (1533 aa)
 initn: 7640 init1: 3063 opt: 7426  Z-score: 4048.9  bits: 761.9 E(85289): 8.7e-219
Smith-Waterman score: 7426; 66.0% identity (87.3% similar) in 1519 aa overlap (21-1533:15-1531)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MALTPGWGSSAGPVRPELWLLLWAAAWRLGASACPALCTCTGTTVDCHGTGLQAIPKNIP
                           :. :   ... .:::: :.:.:.:::::: .:...:.:::
XP_005       MRGVGWQMLSLSLGLVLAILNKVAPQACPAQCSCSGSTVDCHGLALRSVPRNIP
                     10        20        30        40        50    

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD RNTERLELNGNNITRIHKNDFAGLKQLRVLQLMENQIGVVERGAFDDMKELERLRLNRNQ
       ::::::.::::::::: :.:::::..:::::::::.:...:::::.:.:::::::::::.
XP_005 RNTERLDLNGNNITRITKTDFAGLRHLRVLQLMENKISTIERGAFQDLKELERLRLNRNH
           60        70        80        90       100       110    

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD LHMLPELLFQNNQALSRLDLSENAIQAIPRKAFRGATDLKNLQLDKNQISCIEEGAFRAL
       :...::::: ..  : ::::::: ::::::::::::.:.:::::: :::::::.::::::
XP_005 LQLFPELLFLGTAKLYRLDLSENQIQAIPRKAFRGAVDIKNLQLDYNQISCIEDGAFRAL
          120       130       140       150       160       170    

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD RGLEVLTLNNNNITTIPVSSFNHMPKLRTFRLHSNHLFCDCHLAWLSQWLRQRPTIGLFT
       : :::::::::::: . :.::::::::::::::::.:.:::::::::.:::::: .::.:
XP_005 RDLEVLTLNNNNITRLSVASFNHMPKLRTFRLHSNNLYCDCHLAWLSDWLRQRPRVGLYT
          180       190       200       210       220       230    

              250       260       270          280       290       
pF1KSD QCSGPASLRGLNVAEVQKSEFSCSGQGEAGR---VPTCTLSSGSCPAMCTCSNGIVDCRG
       :: ::. ::: ::::::: :: :: . :. .   .:.:..    ::: :::::.::::::
XP_005 QCMGPSHLRGHNVAEVQKREFVCSDEEEGHQSFMAPSCSVLH--CPAACTCSNNIVDCRG
          240       250       260       270         280       290  

       300       310       320       330       340       350       
pF1KSD KGLTAIPANLPETMTEIRLELNGIKSIPPGAFSPYRKLRRIDLSNNQIAEIAPDAFQGLR
       :::: ::.:::::.:::::: : :: :::::::::.::::::::::::.:.:::::::::
XP_005 KGLTEIPTNLPETITEIRLEQNTIKVIPPGAFSPYKKLRRIDLSNNQISELAPDAFQGLR
            300       310       320       330       340       350  

       360       370       380       390       400       410       
pF1KSD SLNSLVLYGNKITDLPRGVFGGLYTLQLLLLNANKINCIRPDAFQDLQNLSLLSLYDNKI
       :::::::::::::.::...: ::..:::::::::::::.: ::::::.::.::::::::.
XP_005 SLNSLVLYGNKITELPKSLFEGLFSLQLLLLNANKINCLRVDAFQDLHNLNLLSLYDNKL
            360       370       380       390       400       410  

       420       430       440       450       460       470       
pF1KSD QSLAKGTFTSLRAIQTLHLAQNPFICDCNLKWLADFLRTNPIETSGARCASPRRLANKRI
       :..:::::. ::::::.:::::::::::.::::::.:.:::::::::::.::::::::::
XP_005 QTIAKGTFSPLRAIQTMHLAQNPFICDCHLKWLADYLHTNPIETSGARCTSPRRLANKRI
            420       430       440       450       460       470  

       480       490       500         510       520       530     
pF1KSD GQIKSKKFRCSAKEQYFIPGTEDY--QLNSECNSDVVCPHKCRCEANVVECSSLKLTKIP
       ::::::::::::::::::::::::  .:...: .:..::.:::::...:.::. ::.:::
XP_005 GQIKSKKFRCSAKEQYFIPGTEDYRSKLSGDCFADLACPEKCRCEGTTVDCSNQKLNKIP
            480       490       500       510       520       530  

         540       550       560       570       580       590     
pF1KSD ERIPQSTAELRLNNNEISILEATGMFKKLTHLKKINLSNNKVSEIEDGAFEGAASVSELH
       :.::: ::::::::::...:::::.:::: .:.:::.::::...::.::::::..:.:. 
XP_005 EHIPQYTAELRLNNNEFTVLEATGIFKKLPQLRKINFSNNKITDIEEGAFEGASGVNEIL
            540       550       560       570       580       590  

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pF1KSD LTANQLESIRSGMFRGLDGLRTLMLRNNRISCIHNDSFTGLRNVRLLSLYDNQITTVSPG
       ::.:.::...  ::.::..:.:::::.:::.:. :::: :: .::::::::::::::.::
XP_005 LTSNRLENVQHKMFKGLESLKTLMLRSNRITCVGNDSFIGLSSVRLLSLYDNQITTVAPG
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pF1KSD AFDTLQSLSTLNLLANPFNCNCQLAWLGGWLRKRKIVTGNPRCQNPDFLRQIPLQDVAFP
       :::::.:::::::::::::::: ::::: ::::..:::::::::.: ::..::.::::. 
XP_005 AFDTLHSLSTLNLLANPFNCNCYLAWLGEWLRKKRIVTGNPRCQKPYFLKEIPIQDVAIQ
            660       670       680       690       700       710  

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pF1KSD DFRCEEGQEEGGCLPRPQCPQECACLDTVVRCSNKHLRALPKGIPKNVTELYLDGNQFTL
       :: :..:.....: :  .:: ::.::::::::::: :..::::::..:::::::::::::
XP_005 DFTCDDGNDDNSCSPLSRCPTECTCLDTVVRCSNKGLKVLPKGIPRDVTELYLDGNQFTL
            720       730       740       750       760       770  

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pF1KSD VPGQLSTFKYLQLVDLSNNKISSLSNSSFTNMSQLTTLILSYNALQCIPPLAFQGLRSLR
       :: .::..:.: :.:::::.::.:::.::.::.:: ::::::: :.:::: .:.::.:::
XP_005 VPKELSNYKHLTLIDLSNNRISTLSNQSFSNMTQLLTLILSYNRLRCIPPRTFDGLKSLR
            780       790       800       810       820       830  

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pF1KSD LLSLHGNDISTLQEGIFADVTSLSHLAIGANPLYCDCHLRWLSSWVKTGYKEPGIARCAG
       ::::::::::.. :: : :...:::::::::::::::...:::.:::. :::::::::::
XP_005 LLSLHGNDISVVPEGAFNDLSALSHLAIGANPLYCDCNMQWLSDWVKSEYKEPGIARCAG
            840       850       860       870       880       890  

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pF1KSD PQDMEGKLLLTTPAKKFECQGPPTLAVQAKCDLCLSSPCQNQGTCHNDPLEVYRCACPSG
       : .:  :::::::.::: ::::  . . :::. :::.::.:.:::..::.. :::.:: :
XP_005 PGEMADKLLLTTPSKKFTCQGPVDVNILAKCNPCLSNPCKNDGTCNSDPVDFYRCTCPYG
            900       910       920       930       940       950  

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pF1KSD YKGRDCEVSLDSCSSGPCENGGTCHAQEGEDAPFTCSCPTGFEGPTCGVNTDDCVDHACA
       .::.::.: . .: :.::..::::: .:::.  : : :  :::: .: ::.::: :. : 
XP_005 FKGQDCDVPIHACISNPCKHGGTCHLKEGEEDGFWCICADGFEGENCEVNVDDCEDNDCE
            960       970       980       990      1000      1010  

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pF1KSD NGGVCVDGVGNYTCQCPLQYEGKACEQLVDLCSPDLNPCQHEAQCVGTPDGPRCECMPGY
       :...::::..:::: :: .: :. ::. .:.:. :::::::...:. :: : .:.: :::
XP_005 NNSTCVDGINNYTCLCPPEYTGELCEEKLDFCAQDLNPCQHDSKCILTPKGFKCDCTPGY
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pF1KSD AGDNCSENQDDCRDHRCQNGAQCMDEVNSYSCLCAEGYSGQLCEIPPHLPAPK-SPCEGT
       .:..:. . :::.:..:.:::.: : ::.:.:.: ::::: .::. : .  :. :::.. 
XP_005 VGEHCDIDFDDCQDNKCKNGAHCTDAVNGYTCICPEGYSGLFCEFSPPMVLPRTSPCDNF
           1080      1090      1100      1110      1120      1130  

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pF1KSD ECQNGANCVDQGNRPVCQCLPGFGGPECEKLLSVNFVDRDTYLQFTDLQNWPRANITLQV
       .:::::.:. . :.:.::::::. : .::::.::::.....:::. . .  :..:::::.
XP_005 DCQNGAQCIVRINEPICQCLPGYQGEKCEKLVSVNFINKESYLQIPSAKVRPQTNITLQI
           1140      1150      1160      1170      1180      1190  

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pF1KSD STAEDNGILLYNGDNDHIAVELYQGHVRVSYDPGSYPSSAIYSAETINDGQFHTVELVAF
       .: ::.:::::.::.::::::::.:.::.::: ::.:.:::::.::::::.:: :::.:.
XP_005 ATDEDSGILLYKGDKDHIAVELYRGRVRASYDTGSHPASAIYSVETINDGNFHIVELLAL
           1200      1210      1220      1230      1240      1250  

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pF1KSD DQMVNLSIDGGSPMTMDNFGKHYTLNSEAPLYVGGMPVDVNSAAFRLWQILNGTGFHGCI
       :: ..::.:::.:  . :..:. ::: ..::::::::   : :..:     :::.:::::
XP_005 DQSLSLSVDGGNPKIITNLSKQSTLNFDSPLYVGGMPGKSNVASLRQAPGQNGTSFHGCI
           1260      1270      1280      1290      1300      1310  

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pF1KSD RNLYINNELQDFTKTQMKPGVVPGCEPCRKLYCLHGICQPNATPGPMCHCEAGWVGLHCD
       ::::::.::::: :. :. :..::::::.:  : :: :::..  :  :.:. ::.:  ::
XP_005 RNLYINSELQDFQKVPMQTGILPGCEPCHKKVCAHGTCQPSSQAGFTCECQEGWMGPLCD
           1320      1330      1340      1350      1360      1370  

         1380      1390      1400      1410      1420      1430    
pF1KSD QPADGPCHGHKCVHGQCVPLDALSYSCQCQDGYSGALCNQAGALAEPCRGLQCLHGHCQA
       : .. :: :.::::: :.:..:.::::.: .:..:.::..   : .::....: ::.:. 
XP_005 QRTNDPCLGNKCVHGTCLPINAFSYSCKCLEGHGGVLCDEEEDLFNPCQAIKCKHGKCRL
           1380      1390      1400      1410      1420      1430  

         1440      1450      1460      1470      1480      1490    
pF1KSD SGTKGAHCVCDPGFSGELCEQESECRGDPVRDFHQVQRGYAICQTTRPLSWVECRGSCPG
       ::    .: :. :..:. :..:  :::. .::..: :.::: ::::. .: .::::.: :
XP_005 SGLGQPYCECSSGYTGDSCDREISCRGERIRDYYQKQQGYAACQTTKKVSRLECRGGCAG
           1440      1450      1460      1470      1480      1490  

         1500      1510      1520      1530     
pF1KSD QGCCQGLRLKRRKFTFECSDGTSFAEEVEKPTKCGCALCA 
         ::  :: ::::..:::.::.::..:::: .::::. :  
XP_005 GQCCGPLRSKRRKYSFECTDGSSFVDEVEKVVKCGCTRCVS
           1500      1510      1520      1530   

>>NP_001276064 (OMIM: 603746) slit homolog 2 protein iso  (1525 aa)
 initn: 7565 init1: 3063 opt: 7345  Z-score: 4005.0  bits: 753.8 E(85289): 2.4e-216
Smith-Waterman score: 7345; 65.4% identity (86.8% similar) in 1519 aa overlap (21-1533:15-1523)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MALTPGWGSSAGPVRPELWLLLWAAAWRLGASACPALCTCTGTTVDCHGTGLQAIPKNIP
                           :. :   ... .:::: :.:.:.:::::: .:...:.:::
NP_001       MRGVGWQMLSLSLGLVLAILNKVAPQACPAQCSCSGSTVDCHGLALRSVPRNIP
                     10        20        30        40        50    

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD RNTERLELNGNNITRIHKNDFAGLKQLRVLQLMENQIGVVERGAFDDMKELERLRLNRNQ
       ::::::.::::::::: :.:::::..:::::::::.:...:::::.:.:::::::::::.
NP_001 RNTERLDLNGNNITRITKTDFAGLRHLRVLQLMENKISTIERGAFQDLKELERLRLNRNH
           60        70        80        90       100       110    

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD LHMLPELLFQNNQALSRLDLSENAIQAIPRKAFRGATDLKNLQLDKNQISCIEEGAFRAL
       :...::::: ..  : ::::::: ::::::::::::.:.:::::: :::::::.::::::
NP_001 LQLFPELLFLGTAKLYRLDLSENQIQAIPRKAFRGAVDIKNLQLDYNQISCIEDGAFRAL
          120       130       140       150       160       170    

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD RGLEVLTLNNNNITTIPVSSFNHMPKLRTFRLHSNHLFCDCHLAWLSQWLRQRPTIGLFT
       : :::::::::::: . :.::::::::::::::::.:.:::::::::.:::::: .::.:
NP_001 RDLEVLTLNNNNITRLSVASFNHMPKLRTFRLHSNNLYCDCHLAWLSDWLRQRPRVGLYT
          180       190       200       210       220       230    

              250       260       270          280       290       
pF1KSD QCSGPASLRGLNVAEVQKSEFSCSGQGEAGR---VPTCTLSSGSCPAMCTCSNGIVDCRG
       :: ::. ::: ::::::: :: :: . :. .   .:.:..    ::: :::::.::::::
NP_001 QCMGPSHLRGHNVAEVQKREFVCSDEEEGHQSFMAPSCSVLH--CPAACTCSNNIVDCRG
          240       250       260       270         280       290  

       300       310       320       330       340       350       
pF1KSD KGLTAIPANLPETMTEIRLELNGIKSIPPGAFSPYRKLRRIDLSNNQIAEIAPDAFQGLR
       :::: ::.:::::.:::::: : :: :::::::::.::::::::::::.:.:::::::::
NP_001 KGLTEIPTNLPETITEIRLEQNTIKVIPPGAFSPYKKLRRIDLSNNQISELAPDAFQGLR
            300       310       320       330       340       350  

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pF1KSD SLNSLVLYGNKITDLPRGVFGGLYTLQLLLLNANKINCIRPDAFQDLQNLSLLSLYDNKI
       :::::::::::::.::...: ::..:::::::::::::.: ::::::.::.::::::::.
NP_001 SLNSLVLYGNKITELPKSLFEGLFSLQLLLLNANKINCLRVDAFQDLHNLNLLSLYDNKL
            360       370       380       390       400       410  

       420       430       440       450       460       470       
pF1KSD QSLAKGTFTSLRAIQTLHLAQNPFICDCNLKWLADFLRTNPIETSGARCASPRRLANKRI
       :..:::::. ::::::.:::::::::::.::::::.:.:::::::::::.::::::::::
NP_001 QTIAKGTFSPLRAIQTMHLAQNPFICDCHLKWLADYLHTNPIETSGARCTSPRRLANKRI
            420       430       440       450       460       470  

       480       490       500         510       520       530     
pF1KSD GQIKSKKFRCSAKEQYFIPGTEDY--QLNSECNSDVVCPHKCRCEANVVECSSLKLTKIP
       :::::::::::        :::::  .:...: .:..::.:::::...:.::. ::.:::
NP_001 GQIKSKKFRCS--------GTEDYRSKLSGDCFADLACPEKCRCEGTTVDCSNQKLNKIP
            480               490       500       510       520    

         540       550       560       570       580       590     
pF1KSD ERIPQSTAELRLNNNEISILEATGMFKKLTHLKKINLSNNKVSEIEDGAFEGAASVSELH
       :.::: ::::::::::...:::::.:::: .:.:::.::::...::.::::::..:.:. 
NP_001 EHIPQYTAELRLNNNEFTVLEATGIFKKLPQLRKINFSNNKITDIEEGAFEGASGVNEIL
          530       540       550       560       570       580    

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pF1KSD LTANQLESIRSGMFRGLDGLRTLMLRNNRISCIHNDSFTGLRNVRLLSLYDNQITTVSPG
       ::.:.::...  ::.::..:.:::::.:::.:. :::: :: .::::::::::::::.::
NP_001 LTSNRLENVQHKMFKGLESLKTLMLRSNRITCVGNDSFIGLSSVRLLSLYDNQITTVAPG
          590       600       610       620       630       640    

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pF1KSD AFDTLQSLSTLNLLANPFNCNCQLAWLGGWLRKRKIVTGNPRCQNPDFLRQIPLQDVAFP
       :::::.:::::::::::::::: ::::: ::::..:::::::::.: ::..::.::::. 
NP_001 AFDTLHSLSTLNLLANPFNCNCYLAWLGEWLRKKRIVTGNPRCQKPYFLKEIPIQDVAIQ
          650       660       670       680       690       700    

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pF1KSD DFRCEEGQEEGGCLPRPQCPQECACLDTVVRCSNKHLRALPKGIPKNVTELYLDGNQFTL
       :: :..:.....: :  .:: ::.::::::::::: :..::::::..:::::::::::::
NP_001 DFTCDDGNDDNSCSPLSRCPTECTCLDTVVRCSNKGLKVLPKGIPRDVTELYLDGNQFTL
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pF1KSD VPGQLSTFKYLQLVDLSNNKISSLSNSSFTNMSQLTTLILSYNALQCIPPLAFQGLRSLR
       :: .::..:.: :.:::::.::.:::.::.::.:: ::::::: :.:::: .:.::.:::
NP_001 VPKELSNYKHLTLIDLSNNRISTLSNQSFSNMTQLLTLILSYNRLRCIPPRTFDGLKSLR
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pF1KSD LLSLHGNDISTLQEGIFADVTSLSHLAIGANPLYCDCHLRWLSSWVKTGYKEPGIARCAG
       ::::::::::.. :: : :...:::::::::::::::...:::.:::. :::::::::::
NP_001 LLSLHGNDISVVPEGAFNDLSALSHLAIGANPLYCDCNMQWLSDWVKSEYKEPGIARCAG
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pF1KSD PQDMEGKLLLTTPAKKFECQGPPTLAVQAKCDLCLSSPCQNQGTCHNDPLEVYRCACPSG
       : .:  :::::::.::: ::::  . . :::. :::.::.:.:::..::.. :::.:: :
NP_001 PGEMADKLLLTTPSKKFTCQGPVDVNILAKCNPCLSNPCKNDGTCNSDPVDFYRCTCPYG
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pF1KSD YKGRDCEVSLDSCSSGPCENGGTCHAQEGEDAPFTCSCPTGFEGPTCGVNTDDCVDHACA
       .::.::.: . .: :.::..::::: .:::.  : : :  :::: .: ::.::: :. : 
NP_001 FKGQDCDVPIHACISNPCKHGGTCHLKEGEEDGFWCICADGFEGENCEVNVDDCEDNDCE
          950       960       970       980       990      1000    

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pF1KSD NGGVCVDGVGNYTCQCPLQYEGKACEQLVDLCSPDLNPCQHEAQCVGTPDGPRCECMPGY
       :...::::..:::: :: .: :. ::. .:.:. :::::::...:. :: : .:.: :::
NP_001 NNSTCVDGINNYTCLCPPEYTGELCEEKLDFCAQDLNPCQHDSKCILTPKGFKCDCTPGY
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pF1KSD AGDNCSENQDDCRDHRCQNGAQCMDEVNSYSCLCAEGYSGQLCEIPPHLPAPK-SPCEGT
       .:..:. . :::.:..:.:::.: : ::.:.:.: ::::: .::. : .  :. :::.. 
NP_001 VGEHCDIDFDDCQDNKCKNGAHCTDAVNGYTCICPEGYSGLFCEFSPPMVLPRTSPCDNF
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pF1KSD ECQNGANCVDQGNRPVCQCLPGFGGPECEKLLSVNFVDRDTYLQFTDLQNWPRANITLQV
       .:::::.:. . :.:.::::::. : .::::.::::.....:::. . .  :..:::::.
NP_001 DCQNGAQCIVRINEPICQCLPGYQGEKCEKLVSVNFINKESYLQIPSAKVRPQTNITLQI
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pF1KSD STAEDNGILLYNGDNDHIAVELYQGHVRVSYDPGSYPSSAIYSAETINDGQFHTVELVAF
       .: ::.:::::.::.::::::::.:.::.::: ::.:.:::::.::::::.:: :::.:.
NP_001 ATDEDSGILLYKGDKDHIAVELYRGRVRASYDTGSHPASAIYSVETINDGNFHIVELLAL
         1190      1200      1210      1220      1230      1240    

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pF1KSD DQMVNLSIDGGSPMTMDNFGKHYTLNSEAPLYVGGMPVDVNSAAFRLWQILNGTGFHGCI
       :: ..::.:::.:  . :..:. ::: ..::::::::   : :..:     :::.:::::
NP_001 DQSLSLSVDGGNPKIITNLSKQSTLNFDSPLYVGGMPGKSNVASLRQAPGQNGTSFHGCI
         1250      1260      1270      1280      1290      1300    

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pF1KSD RNLYINNELQDFTKTQMKPGVVPGCEPCRKLYCLHGICQPNATPGPMCHCEAGWVGLHCD
       ::::::.::::: :. :. :..::::::.:  : :: :::..  :  :.:. ::.:  ::
NP_001 RNLYINSELQDFQKVPMQTGILPGCEPCHKKVCAHGTCQPSSQAGFTCECQEGWMGPLCD
         1310      1320      1330      1340      1350      1360    

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pF1KSD QPADGPCHGHKCVHGQCVPLDALSYSCQCQDGYSGALCNQAGALAEPCRGLQCLHGHCQA
       : .. :: :.::::: :.:..:.::::.: .:..:.::..   : .::....: ::.:. 
NP_001 QRTNDPCLGNKCVHGTCLPINAFSYSCKCLEGHGGVLCDEEEDLFNPCQAIKCKHGKCRL
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pF1KSD SGTKGAHCVCDPGFSGELCEQESECRGDPVRDFHQVQRGYAICQTTRPLSWVECRGSCPG
       ::    .: :. :..:. :..:  :::. .::..: :.::: ::::. .: .::::.: :
NP_001 SGLGQPYCECSSGYTGDSCDREISCRGERIRDYYQKQQGYAACQTTKKVSRLECRGGCAG
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pF1KSD QGCCQGLRLKRRKFTFECSDGTSFAEEVEKPTKCGCALCA 
         ::  :: ::::..:::.::.::..:::: .::::. :  
NP_001 GQCCGPLRSKRRKYSFECTDGSSFVDEVEKVVKCGCTRCVS
         1490      1500      1510      1520     

>>XP_016864334 (OMIM: 603746) PREDICTED: slit homolog 2   (1495 aa)
 initn: 6388 init1: 3063 opt: 7231  Z-score: 3943.3  bits: 742.3 E(85289): 6.6e-213
Smith-Waterman score: 7231; 66.1% identity (87.1% similar) in 1485 aa overlap (56-1533:12-1493)

          30        40        50        60            70        80 
pF1KSD AWRLGASACPALCTCTGTTVDCHGTGLQAIPKNIPRNTERL----ELNGNNITRIHKNDF
                                     :..:   : ::    .::::::::: :.::
XP_016                    MPGASETPLCSPESINGVTLRLPASRDLNGNNITRITKTDF
                                  10        20        30        40 

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pF1KSD AGLKQLRVLQLMENQIGVVERGAFDDMKELERLRLNRNQLHMLPELLFQNNQALSRLDLS
       :::..:::::::::.:...:::::.:.:::::::::::.:...::::: ..  : :::::
XP_016 AGLRHLRVLQLMENKISTIERGAFQDLKELERLRLNRNHLQLFPELLFLGTAKLYRLDLS
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pF1KSD ENAIQAIPRKAFRGATDLKNLQLDKNQISCIEEGAFRALRGLEVLTLNNNNITTIPVSSF
       :: ::::::::::::.:.:::::: :::::::.::::::: :::::::::::: . :.::
XP_016 ENQIQAIPRKAFRGAVDIKNLQLDYNQISCIEDGAFRALRDLEVLTLNNNNITRLSVASF
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pF1KSD NHMPKLRTFRLHSNHLFCDCHLAWLSQWLRQRPTIGLFTQCSGPASLRGLNVAEVQKSEF
       ::::::::::::::.:.:::::::::.:::::: .::.::: ::. ::: ::::::: ::
XP_016 NHMPKLRTFRLHSNNLYCDCHLAWLSDWLRQRPRVGLYTQCMGPSHLRGHNVAEVQKREF
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pF1KSD SCSGQGEAGRVPTCTLSSGSCPAMCTCSNGIVDCRGKGLTAIPANLPETMTEIRLELNGI
        :::. ..  .:.:..    ::: :::::.:::::::::: ::.:::::.:::::: : :
XP_016 VCSGH-QSFMAPSCSVLH--CPAACTCSNNIVDCRGKGLTEIPTNLPETITEIRLEQNTI
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pF1KSD KSIPPGAFSPYRKLRRIDLSNNQIAEIAPDAFQGLRSLNSLVLYGNKITDLPRGVFGGLY
       : :::::::::.::::::::::::.:.::::::::::::::::::::::.::...: ::.
XP_016 KVIPPGAFSPYKKLRRIDLSNNQISELAPDAFQGLRSLNSLVLYGNKITELPKSLFEGLF
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pF1KSD TLQLLLLNANKINCIRPDAFQDLQNLSLLSLYDNKIQSLAKGTFTSLRAIQTLHLAQNPF
       .:::::::::::::.: ::::::.::.::::::::.:..:::::. ::::::.:::::::
XP_016 SLQLLLLNANKINCLRVDAFQDLHNLNLLSLYDNKLQTIAKGTFSPLRAIQTMHLAQNPF
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pF1KSD ICDCNLKWLADFLRTNPIETSGARCASPRRLANKRIGQIKSKKFRCSAKEQYFIPGTEDY
       ::::.::::::.:.:::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ICDCHLKWLADYLHTNPIETSGARCTSPRRLANKRIGQIKSKKFRCSAKEQYFIPGTEDY
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pF1KSD --QLNSECNSDVVCPHKCRCEANVVECSSLKLTKIPERIPQSTAELRLNNNEISILEATG
         .:...: .:..::.:::::...:.::. ::.::::.::: ::::::::::...:::::
XP_016 RSKLSGDCFADLACPEKCRCEGTTVDCSNQKLNKIPEHIPQYTAELRLNNNEFTVLEATG
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pF1KSD MFKKLTHLKKINLSNNKVSEIEDGAFEGAASVSELHLTANQLESIRSGMFRGLDGLRTLM
       .:::: .:.:::.::::...::.::::::..:.:. ::.:.::...  ::.::..:.:::
XP_016 IFKKLPQLRKINFSNNKITDIEEGAFEGASGVNEILLTSNRLENVQHKMFKGLESLKTLM
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       ::.:::.:. :::: :: .::::::::::::::.:::::::.:::::::::::::::: :
XP_016 LRSNRITCVGNDSFIGLSSVRLLSLYDNQITTVAPGAFDTLHSLSTLNLLANPFNCNCYL
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pF1KSD AWLGGWLRKRKIVTGNPRCQNPDFLRQIPLQDVAFPDFRCEEGQEEGGCLPRPQCPQECA
       :::: ::::..:::::::::.: ::..::.::::. :: :..:.....: :  .:: ::.
XP_016 AWLGEWLRKKRIVTGNPRCQKPYFLKEIPIQDVAIQDFTCDDGNDDNSCSPLSRCPTECT
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pF1KSD CLDTVVRCSNKHLRALPKGIPKNVTELYLDGNQFTLVPGQLSTFKYLQLVDLSNNKISSL
       ::::::::::: :..::::::..::::::::::::::: .::..:.: :.:::::.::.:
XP_016 CLDTVVRCSNKGLKVLPKGIPRDVTELYLDGNQFTLVPKELSNYKHLTLIDLSNNRISTL
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pF1KSD SNSSFTNMSQLTTLILSYNALQCIPPLAFQGLRSLRLLSLHGNDISTLQEGIFADVTSLS
       ::.::.::.:: ::::::: :.:::: .:.::.:::::::::::::.. :: : :...::
XP_016 SNQSFSNMTQLLTLILSYNRLRCIPPRTFDGLKSLRLLSLHGNDISVVPEGAFNDLSALS
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     860       870       880       890       900       910         
pF1KSD HLAIGANPLYCDCHLRWLSSWVKTGYKEPGIARCAGPQDMEGKLLLTTPAKKFECQGPPT
       :::::::::::::...:::.:::. :::::::::::: .:  :::::::.::: ::::  
XP_016 HLAIGANPLYCDCNMQWLSDWVKSEYKEPGIARCAGPGEMADKLLLTTPSKKFTCQGPVD
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pF1KSD LAVQAKCDLCLSSPCQNQGTCHNDPLEVYRCACPSGYKGRDCEVSLDSCSSGPCENGGTC
       . . :::. :::.::.:.:::..::.. :::.:: :.::.::.: . .: :.::..::::
XP_016 VNILAKCNPCLSNPCKNDGTCNSDPVDFYRCTCPYGFKGQDCDVPIHACISNPCKHGGTC
      880       890       900       910       920       930        

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pF1KSD HAQEGEDAPFTCSCPTGFEGPTCGVNTDDCVDHACANGGVCVDGVGNYTCQCPLQYEGKA
       : .:::.  : : :  :::: .: ::.::: :. : :...::::..:::: :: .: :. 
XP_016 HLKEGEEDGFWCICADGFEGENCEVNVDDCEDNDCENNSTCVDGINNYTCLCPPEYTGEL
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pF1KSD CEQLVDLCSPDLNPCQHEAQCVGTPDGPRCECMPGYAGDNCSENQDDCRDHRCQNGAQCM
       ::. .:.:. :::::::...:. :: : .:.: :::.:..:. . :::.:..:.:::.: 
XP_016 CEEKLDFCAQDLNPCQHDSKCILTPKGFKCDCTPGYVGEHCDIDFDDCQDNKCKNGAHCT
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pF1KSD DEVNSYSCLCAEGYSGQLCEIPPHLPAPK-SPCEGTECQNGANCVDQGNRPVCQCLPGFG
       : ::.:.:.: ::::: .::. : .  :. :::.. .:::::.:. . :.:.::::::. 
XP_016 DAVNGYTCICPEGYSGLFCEFSPPMVLPRTSPCDNFDCQNGAQCIVRINEPICQCLPGYQ
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pF1KSD GPECEKLLSVNFVDRDTYLQFTDLQNWPRANITLQVSTAEDNGILLYNGDNDHIAVELYQ
       : .::::.::::.....:::. . .  :..:::::..: ::.:::::.::.::::::::.
XP_016 GEKCEKLVSVNFINKESYLQIPSAKVRPQTNITLQIATDEDSGILLYKGDKDHIAVELYR
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pF1KSD GHVRVSYDPGSYPSSAIYSAETINDGQFHTVELVAFDQMVNLSIDGGSPMTMDNFGKHYT
       :.::.::: ::.:.:::::.::::::.:: :::.:.:: ..::.:::.:  . :..:. :
XP_016 GRVRASYDTGSHPASAIYSVETINDGNFHIVELLALDQSLSLSVDGGNPKIITNLSKQST
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pF1KSD LNSEAPLYVGGMPVDVNSAAFRLWQILNGTGFHGCIRNLYINNELQDFTKTQMKPGVVPG
       :: ..::::::::   : :..:     :::.:::::::::::.::::: :. :. :..::
XP_016 LNFDSPLYVGGMPGKSNVASLRQAPGQNGTSFHGCIRNLYINSELQDFQKVPMQTGILPG
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pF1KSD CEPCRKLYCLHGICQPNATPGPMCHCEAGWVGLHCDQPADGPCHGHKCVHGQCVPLDALS
       ::::.:  : :: :::..  :  :.:. ::.:  ::: .. :: :.::::: :.:..:.:
XP_016 CEPCHKKVCAHGTCQPSSQAGFTCECQEGWMGPLCDQRTNDPCLGNKCVHGTCLPINAFS
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pF1KSD YSCQCQDGYSGALCNQAGALAEPCRGLQCLHGHCQASGTKGAHCVCDPGFSGELCEQESE
       :::.: .:..:.::..   : .::....: ::.:. ::    .: :. :..:. :..:  
XP_016 YSCKCLEGHGGVLCDEEEDLFNPCQAIKCKHGKCRLSGLGQPYCECSSGYTGDSCDREIS
     1360      1370      1380      1390      1400      1410        

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pF1KSD CRGDPVRDFHQVQRGYAICQTTRPLSWVECRGSCPGQGCCQGLRLKRRKFTFECSDGTSF
       :::. .::..: :.::: ::::. .: .::::.: :  ::  :: ::::..:::.::.::
XP_016 CRGERIRDYYQKQQGYAACQTTKKVSRLECRGGCAGGQCCGPLRSKRRKYSFECTDGSSF
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     1520      1530     
pF1KSD AEEVEKPTKCGCALCA 
       ..:::: .::::. :  
XP_016 VDEVEKVVKCGCTRCVS
     1480      1490     

>>XP_011512211 (OMIM: 603746) PREDICTED: slit homolog 2   (1499 aa)
 initn: 7435 init1: 3063 opt: 7224  Z-score: 3939.5  bits: 741.6 E(85289): 1.1e-212
Smith-Waterman score: 7224; 65.9% identity (87.0% similar) in 1488 aa overlap (56-1533:12-1497)

          30        40        50        60            70        80 
pF1KSD AWRLGASACPALCTCTGTTVDCHGTGLQAIPKNIPRNTERL----ELNGNNITRIHKNDF
                                     :..:   : ::    .::::::::: :.::
XP_011                    MPGASETPLCSPESINGVTLRLPASRDLNGNNITRITKTDF
                                  10        20        30        40 

              90       100       110       120       130       140 
pF1KSD AGLKQLRVLQLMENQIGVVERGAFDDMKELERLRLNRNQLHMLPELLFQNNQALSRLDLS
       :::..:::::::::.:...:::::.:.:::::::::::.:...::::: ..  : :::::
XP_011 AGLRHLRVLQLMENKISTIERGAFQDLKELERLRLNRNHLQLFPELLFLGTAKLYRLDLS
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pF1KSD ENAIQAIPRKAFRGATDLKNLQLDKNQISCIEEGAFRALRGLEVLTLNNNNITTIPVSSF
       :: ::::::::::::.:.:::::: :::::::.::::::: :::::::::::: . :.::
XP_011 ENQIQAIPRKAFRGAVDIKNLQLDYNQISCIEDGAFRALRDLEVLTLNNNNITRLSVASF
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pF1KSD NHMPKLRTFRLHSNHLFCDCHLAWLSQWLRQRPTIGLFTQCSGPASLRGLNVAEVQKSEF
       ::::::::::::::.:.:::::::::.:::::: .::.::: ::. ::: ::::::: ::
XP_011 NHMPKLRTFRLHSNNLYCDCHLAWLSDWLRQRPRVGLYTQCMGPSHLRGHNVAEVQKREF
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pF1KSD SCSGQGEAGR---VPTCTLSSGSCPAMCTCSNGIVDCRGKGLTAIPANLPETMTEIRLEL
        :: . :. .   .:.:..    ::: :::::.:::::::::: ::.:::::.:::::: 
XP_011 VCSDEEEGHQSFMAPSCSVLH--CPAACTCSNNIVDCRGKGLTEIPTNLPETITEIRLEQ
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pF1KSD NGIKSIPPGAFSPYRKLRRIDLSNNQIAEIAPDAFQGLRSLNSLVLYGNKITDLPRGVFG
       : :: :::::::::.::::::::::::.:.::::::::::::::::::::::.::...: 
XP_011 NTIKVIPPGAFSPYKKLRRIDLSNNQISELAPDAFQGLRSLNSLVLYGNKITELPKSLFE
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pF1KSD GLYTLQLLLLNANKINCIRPDAFQDLQNLSLLSLYDNKIQSLAKGTFTSLRAIQTLHLAQ
       ::..:::::::::::::.: ::::::.::.::::::::.:..:::::. ::::::.::::
XP_011 GLFSLQLLLLNANKINCLRVDAFQDLHNLNLLSLYDNKLQTIAKGTFSPLRAIQTMHLAQ
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pF1KSD NPFICDCNLKWLADFLRTNPIETSGARCASPRRLANKRIGQIKSKKFRCSAKEQYFIPGT
       :::::::.::::::.:.:::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NPFICDCHLKWLADYLHTNPIETSGARCTSPRRLANKRIGQIKSKKFRCSAKEQYFIPGT
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pF1KSD EDY--QLNSECNSDVVCPHKCRCEANVVECSSLKLTKIPERIPQSTAELRLNNNEISILE
       :::  .:...: .:..::.:::::...:.::. ::.::::.::: ::::::::::...::
XP_011 EDYRSKLSGDCFADLACPEKCRCEGTTVDCSNQKLNKIPEHIPQYTAELRLNNNEFTVLE
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pF1KSD ATGMFKKLTHLKKINLSNNKVSEIEDGAFEGAASVSELHLTANQLESIRSGMFRGLDGLR
       :::.:::: .:.:::.::::...::.::::::..:.:. ::.:.::...  ::.::..:.
XP_011 ATGIFKKLPQLRKINFSNNKITDIEEGAFEGASGVNEILLTSNRLENVQHKMFKGLESLK
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pF1KSD TLMLRNNRISCIHNDSFTGLRNVRLLSLYDNQITTVSPGAFDTLQSLSTLNLLANPFNCN
       :::::.:::.:. :::: :: .::::::::::::::.:::::::.:::::::::::::::
XP_011 TLMLRSNRITCVGNDSFIGLSSVRLLSLYDNQITTVAPGAFDTLHSLSTLNLLANPFNCN
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pF1KSD CQLAWLGGWLRKRKIVTGNPRCQNPDFLRQIPLQDVAFPDFRCEEGQEEGGCLPRPQCPQ
       : ::::: ::::..:::::::::.: ::..::.::::. :: :..:.....: :  .:: 
XP_011 CYLAWLGEWLRKKRIVTGNPRCQKPYFLKEIPIQDVAIQDFTCDDGNDDNSCSPLSRCPT
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pF1KSD ECACLDTVVRCSNKHLRALPKGIPKNVTELYLDGNQFTLVPGQLSTFKYLQLVDLSNNKI
       ::.::::::::::: :..::::::..::::::::::::::: .::..:.: :.:::::.:
XP_011 ECTCLDTVVRCSNKGLKVLPKGIPRDVTELYLDGNQFTLVPKELSNYKHLTLIDLSNNRI
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pF1KSD SSLSNSSFTNMSQLTTLILSYNALQCIPPLAFQGLRSLRLLSLHGNDISTLQEGIFADVT
       :.:::.::.::.:: ::::::: :.:::: .:.::.:::::::::::::.. :: : :..
XP_011 STLSNQSFSNMTQLLTLILSYNRLRCIPPRTFDGLKSLRLLSLHGNDISVVPEGAFNDLS
     760       770       780       790       800       810         

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pF1KSD SLSHLAIGANPLYCDCHLRWLSSWVKTGYKEPGIARCAGPQDMEGKLLLTTPAKKFECQG
       .:::::::::::::::...:::.:::. :::::::::::: .:  :::::::.::: :::
XP_011 ALSHLAIGANPLYCDCNMQWLSDWVKSEYKEPGIARCAGPGEMADKLLLTTPSKKFTCQG
     820       830       840       850       860       870         

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pF1KSD PPTLAVQAKCDLCLSSPCQNQGTCHNDPLEVYRCACPSGYKGRDCEVSLDSCSSGPCENG
       :  . . :::. :::.::.:.:::..::.. :::.:: :.::.::.: . .: :.::..:
XP_011 PVDVNILAKCNPCLSNPCKNDGTCNSDPVDFYRCTCPYGFKGQDCDVPIHACISNPCKHG
     880       890       900       910       920       930         

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pF1KSD GTCHAQEGEDAPFTCSCPTGFEGPTCGVNTDDCVDHACANGGVCVDGVGNYTCQCPLQYE
       :::: .:::.  : : :  :::: .: ::.::: :. : :...::::..:::: :: .: 
XP_011 GTCHLKEGEEDGFWCICADGFEGENCEVNVDDCEDNDCENNSTCVDGINNYTCLCPPEYT
     940       950       960       970       980       990         

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pF1KSD GKACEQLVDLCSPDLNPCQHEAQCVGTPDGPRCECMPGYAGDNCSENQDDCRDHRCQNGA
       :. ::. .:.:. :::::::...:. :: : .:.: :::.:..:. . :::.:..:.:::
XP_011 GELCEEKLDFCAQDLNPCQHDSKCILTPKGFKCDCTPGYVGEHCDIDFDDCQDNKCKNGA
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pF1KSD QCMDEVNSYSCLCAEGYSGQLCEIPPHLPAPK-SPCEGTECQNGANCVDQGNRPVCQCLP
       .: : ::.:.:.: ::::: .::. : .  :. :::.. .:::::.:. . :.:.:::::
XP_011 HCTDAVNGYTCICPEGYSGLFCEFSPPMVLPRTSPCDNFDCQNGAQCIVRINEPICQCLP
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pF1KSD GFGGPECEKLLSVNFVDRDTYLQFTDLQNWPRANITLQVSTAEDNGILLYNGDNDHIAVE
       :. : .::::.::::.....:::. . .  :..:::::..: ::.:::::.::.::::::
XP_011 GYQGEKCEKLVSVNFINKESYLQIPSAKVRPQTNITLQIATDEDSGILLYKGDKDHIAVE
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pF1KSD LYQGHVRVSYDPGSYPSSAIYSAETINDGQFHTVELVAFDQMVNLSIDGGSPMTMDNFGK
       ::.:.::.::: ::.:.:::::.::::::.:: :::.:.:: ..::.:::.:  . :..:
XP_011 LYRGRVRASYDTGSHPASAIYSVETINDGNFHIVELLALDQSLSLSVDGGNPKIITNLSK
    1180      1190      1200      1210      1220      1230         

        1280      1290      1300      1310      1320      1330     
pF1KSD HYTLNSEAPLYVGGMPVDVNSAAFRLWQILNGTGFHGCIRNLYINNELQDFTKTQMKPGV
       . ::: ..::::::::   : :..:     :::.:::::::::::.::::: :. :. :.
XP_011 QSTLNFDSPLYVGGMPGKSNVASLRQAPGQNGTSFHGCIRNLYINSELQDFQKVPMQTGI
    1240      1250      1260      1270      1280      1290         

        1340      1350      1360      1370      1380      1390     
pF1KSD VPGCEPCRKLYCLHGICQPNATPGPMCHCEAGWVGLHCDQPADGPCHGHKCVHGQCVPLD
       .::::::.:  : :: :::..  :  :.:. ::.:  ::: .. :: :.::::: :.:..
XP_011 LPGCEPCHKKVCAHGTCQPSSQAGFTCECQEGWMGPLCDQRTNDPCLGNKCVHGTCLPIN
    1300      1310      1320      1330      1340      1350         

        1400      1410      1420      1430      1440      1450     
pF1KSD ALSYSCQCQDGYSGALCNQAGALAEPCRGLQCLHGHCQASGTKGAHCVCDPGFSGELCEQ
       :.::::.: .:..:.::..   : .::....: ::.:. ::    .: :. :..:. :..
XP_011 AFSYSCKCLEGHGGVLCDEEEDLFNPCQAIKCKHGKCRLSGLGQPYCECSSGYTGDSCDR
    1360      1370      1380      1390      1400      1410         

        1460      1470      1480      1490      1500      1510     
pF1KSD ESECRGDPVRDFHQVQRGYAICQTTRPLSWVECRGSCPGQGCCQGLRLKRRKFTFECSDG
       :  :::. .::..: :.::: ::::. .: .::::.: :  ::  :: ::::..:::.::
XP_011 EISCRGERIRDYYQKQQGYAACQTTKKVSRLECRGGCAGGQCCGPLRSKRRKYSFECTDG
    1420      1430      1440      1450      1460      1470         

        1520      1530     
pF1KSD TSFAEEVEKPTKCGCALCA 
       .::..:::: .::::. :  
XP_011 SSFVDEVEKVVKCGCTRCVS
    1480      1490         

>>NP_001258875 (OMIM: 603745) slit homolog 3 protein iso  (1530 aa)
 initn: 3611 init1: 1617 opt: 6694  Z-score: 3652.0  bits: 688.5 E(85289): 1.1e-196
Smith-Waterman score: 6694; 59.2% identity (82.8% similar) in 1545 aa overlap (3-1534:1-1530)

               10        20        30          40        50        
pF1KSD MALTPGWGSSAGPVRPELWLLLWAAAWRLG--ASACPALCTCTGTTVDCHGTGLQAIPKN
         ..:::.. .. :: .: : :  :.   :  : :::. :::....::::: ::.:.:..
NP_001   MAPGWAGVGAAVRARLALALALASVLSGPPAVACPTKCTCSAASVDCHGLGLRAVPRG
                 10        20        30        40        50        

       60        70        80        90       100       110        
pF1KSD IPRNTERLELNGNNITRIHKNDFAGLKQLRVLQLMENQIGVVERGAFDDMKELERLRLNR
       ::::.:::.:. :::::: : ::::::.::::.: .::..:.:::::.:.:.:::::::.
NP_001 IPRNAERLDLDRNNITRITKMDFAGLKNLRVLHLEDNQVSVIERGAFQDLKQLERLRLNK
       60        70        80        90       100       110        

      120       130       140       150       160       170        
pF1KSD NQLHMLPELLFQNNQALSRLDLSENAIQAIPRKAFRGATDLKNLQLDKNQISCIEEGAFR
       :.:..:::::::..  :.::::::: ::.:::::::: ::.::::::.:.:::::.::::
NP_001 NKLQVLPELLFQSTPKLTRLDLSENQIQGIPRKAFRGITDVKNLQLDNNHISCIEDGAFR
      120       130       140       150       160       170        

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pF1KSD ALRGLEVLTLNNNNITTIPVSSFNHMPKLRTFRLHSNHLFCDCHLAWLSQWLRQRPTIGL
       ::: ::.::::::::. : :.:::::::.::.:::::::.:::::::::.::::: :.: 
NP_001 ALRDLEILTLNNNNISRILVTSFNHMPKIRTLRLHSNHLYCDCHLAWLSDWLRQRRTVGQ
      180       190       200       210       220       230        

      240       250       260       270       280       290        
pF1KSD FTQCSGPASLRGLNVAEVQKSEFSCSGQGEAGRVPTCTLSSGSCPAMCTCSNGIVDCRGK
       :: : .:. :::.:::.:::.:. : .    .. :.:. .: :::. :::::.:::::::
NP_001 FTLCMAPVHLRGFNVADVQKKEYVCPAP--HSEPPSCNANSISCPSPCTCSNNIVDCRGK
      240       250       260         270       280       290      

      300       310       320       330       340       350        
pF1KSD GLTAIPANLPETMTEIRLELNGIKSIPPGAFSPYRKLRRIDLSNNQIAEIAPDAFQGLRS
       ::  ::::::: ..::::: :.::.:: :::. :.::.:::.:.:::..:::::::::.:
NP_001 GLMEIPANLPEGIVEIRLEQNSIKAIPAGAFTQYKKLKRIDISKNQISDIAPDAFQGLKS
        300       310       320       330       340       350      

      360       370       380       390       400       410        
pF1KSD LNSLVLYGNKITDLPRGVFGGLYTLQLLLLNANKINCIRPDAFQDLQNLSLLSLYDNKIQ
       :.::::::::::.. .:.: :: .:::::::::::::.: ..:::::::.::::::::.:
NP_001 LTSLVLYGNKITEIAKGLFDGLVSLQLLLLNANKINCLRVNTFQDLQNLNLLSLYDNKLQ
        360       370       380       390       400       410      

      420       430       440       450       460       470        
pF1KSD SLAKGTFTSLRAIQTLHLAQNPFICDCNLKWLADFLRTNPIETSGARCASPRRLANKRIG
       ...:: :. :..:::::::::::.:::.::::::.:. ::::::::::.::::::::::.
NP_001 TISKGLFAPLQSIQTLHLAQNPFVCDCHLKWLADYLQDNPIETSGARCSSPRRLANKRIS
        420       430       440       450       460       470      

      480       490       500         510       520       530      
pF1KSD QIKSKKFRCSAKEQYFIPGTEDYQ--LNSECNSDVVCPHKCRCEANVVECSSLKLTKIPE
       ::::::::::        :.:::.  ..:::  :.:::.:::::...:.::. ::..:: 
NP_001 QIKSKKFRCS--------GSEDYRSRFSSECFMDLVCPEKCRCEGTIVDCSNQKLVRIPS
        480               490       500       510       520        

        540       550       560       570       580       590      
pF1KSD RIPQSTAELRLNNNEISILEATGMFKKLTHLKKINLSNNKVSEIEDGAFEGAASVSELHL
       ..:. ...::::.::.:.:::::.:::: .:.::::::::..:...:::.:::::.:: :
NP_001 HLPEYVTDLRLNDNEVSVLEATGIFKKLPNLRKINLSNNKIKEVREGAFDGAASVQELML
      530       540       550       560       570       580        

        600       610       620       630       640       650      
pF1KSD TANQLESIRSGMFRGLDGLRTLMLRNNRISCIHNDSFTGLRNVRLLSLYDNQITTVSPGA
       :.::::.... .::::.::.:::::.: :.:. ::.:.:: .:::::::::.:::..:::
NP_001 TGNQLETVHGRVFRGLSGLKTLMLRSNLIGCVSNDTFAGLSSVRLLSLYDNRITTITPGA
      590       600       610       620       630       640        

        660       670       680       690       700       710      
pF1KSD FDTLQSLSTLNLLANPFNCNCQLAWLGGWLRKRKIVTGNPRCQNPDFLRQIPLQDVAFPD
       : :: ::::.:::.:::::::.::::: :::::.::.::::::.: ::..::.::::. :
NP_001 FTTLVSLSTINLLSNPFNCNCHLAWLGKWLRKRRIVSGNPRCQKPFFLKEIPIQDVAIQD
      650       660       670       680       690       700        

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pF1KSD FRCEEGQEEGGCLPRPQCPQECACLDTVVRCSNKHLRALPKGIPKNVTELYLDGNQFTLV
       : :. :.::..:   :.::..:.:..:::::::: :::::.:.::.::::::.::..: :
NP_001 FTCD-GNEESSCQLSPRCPEQCTCMETVVRCSNKGLRALPRGMPKDVTELYLEGNHLTAV
      710        720       730       740       750       760       

        780       790       800       810       820       830      
pF1KSD PGQLSTFKYLQLVDLSNNKISSLSNSSFTNMSQLTTLILSYNALQCIPPLAFQGLRSLRL
       : .::....: :.:::::.:: :.: .:.:::.:.::::::: :.:::  ::.::::::.
NP_001 PRELSALRHLTLIDLSNNSISMLTNYTFSNMSHLSTLILSYNRLRCIPVHAFNGLRSLRV
       770       780       790       800       810       820       

        840       850       860       870       880       890      
pF1KSD LSLHGNDISTLQEGIFADVTSLSHLAIGANPLYCDCHLRWLSSWVKTGYKEPGIARCAGP
       :.:::::::.. :: : :.:::::::.:.:::.::: ::::: :::.::::::::::..:
NP_001 LTLHGNDISSVPEGSFNDLTSLSHLALGTNPLHCDCSLRWLSEWVKAGYKEPGIARCSSP
       830       840       850       860       870       880       

        900       910              920       930       940         
pF1KSD QDMEGKLLLTTPAKKFECQ-------GPPTLAVQAKCDLCLSSPCQNQGTCHNDPLEVYR
       . :  .::::::...:.:.       ::  . . :::. ::::::.:.::: .::.:.::
NP_001 EPMADRLLLTTPTHRFQCKVLWFCCPGPVDINIVAKCNACLSSPCKNNGTCTQDPVELYR
       890       900       910       920       930       940       

     950       960       970       980       990      1000         
pF1KSD CACPSGYKGRDCEVSLDSCSSGPCENGGTCHAQEGEDAPFTCSCPTGFEGPTCGVNTDDC
       :::: .:::.:: : ...: ..::..::::: ....   :.:::: ::::  : .: :::
NP_001 CACPYSYKGKDCTVPINTCIQNPCQHGGTCHLSDSHKDGFSCSCPLGFEGQRCEINPDDC
       950       960       970       980       990      1000       

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pF1KSD VDHACANGGVCVDGVGNYTCQCPLQYEGKACEQLVDLCSPDLNPCQHEAQCVGTPDGPRC
        :. : :...::::..::.: :: .: :. :....: : :.:: :::::.:.    :  :
NP_001 EDNDCENNATCVDGINNYVCICPPNYTGELCDEVIDHCVPELNLCQHEAKCIPLDKGFSC
      1010      1020      1030      1040      1050      1060       

    1070      1080      1090      1100      1110      1120         
pF1KSD ECMPGYAGDNCSENQDDCRDHRCQNGAQCMDEVNSYSCLCAEGYSGQLCEIPPHLPAPK-
       ::.:::.:  :  ..:::  :.:..::::.: .:.:.: : .:.:: .:: :: .   . 
NP_001 ECVPGYSGKLCETDNDDCVAHKCRHGAQCVDTINGYTCTCPQGFSGPFCEHPPPMVLLQT
      1070      1080      1090      1100      1110      1120       

     1130      1140      1150      1160      1170      1180        
pF1KSD SPCEGTECQNGANCVDQGNRPVCQCLPGFGGPECEKLLSVNFVDRDTYLQFTDLQNWPRA
       :::.  ::::::.:.   ..:.:.: :::.::.::::..:::: .:.:..... .  :.:
NP_001 SPCDQYECQNGAQCIVVQQEPTCRCPPGFAGPRCEKLITVNFVGKDSYVELASAKVRPQA
      1130      1140      1150      1160      1170      1180       

     1190      1200      1210      1220      1230      1240        
pF1KSD NITLQVSTAEDNGILLYNGDNDHIAVELYQGHVRVSYDPGSYPSSAIYSAETINDGQFHT
       ::.:::.: .:::::::.:::: .:.::::::::. ::  : : ...::.::.::::::.
NP_001 NISLQVATDKDNGILLYKGDNDPLALELYQGHVRLVYDSLSSPPTTVYSVETVNDGQFHS
      1190      1200      1210      1220      1230      1240       

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pF1KSD VELVAFDQMVNLSIDGGSPMTMDNFGKHYTLNSEAPLYVGGMPVDVNSAAFRLWQILNGT
       ::::...: .:: .: :.: .. .. :. ... ..:::.::.:.... .:.:        
NP_001 VELVTLNQTLNLVVDKGTPKSLGKLQKQPAVGINSPLYLGGIPTSTGLSALRQGTDRPLG
      1250      1260      1270      1280      1290      1300       

     1310      1320      1330       1340      1350      1360       
pF1KSD GFHGCIRNLYINNELQDFTKTQMKP-GVVPGCEPCRKLYCLHGICQPNATPGPMCHCEAG
       ::::::... ::::::::     .  :: :::. :    : ::.:.     . .:.:. :
NP_001 GFHGCIHEVRINNELQDFKALPPQSLGVSPGCKSCT--VCKHGLCRSVEKDSVVCECRPG
      1310      1320      1330      1340        1350      1360     

      1370      1380      1390      1400      1410      1420       
pF1KSD WVGLHCDQPADGPCHGHKCVHGQCVPLDALSYSCQCQDGYSGALCNQAGALAEPCRGLQC
       :.:  ::: :  :: ::.: ::.::   . :: :.: .::.: ::.. .  :. : ...:
NP_001 WTGPLCDQEARDPCLGHRCHHGKCVATGT-SYMCKCAEGYGGDLCDNKNDSANACSAFKC
        1370      1380      1390       1400      1410      1420    

      1430      1440      1450      1460      1470      1480       
pF1KSD LHGHCQASGTKGAHCVCDPGFSGELCEQESECRGDPVRDFHQVQRGYAICQTTRPLSWVE
        ::.:. :     .:.:.:::::: :.::. : :. ::.  . :.::: : :.  .  .:
NP_001 HHGQCHISDQGEPYCLCQPGFSGEHCQQENPCLGQVVREVIRRQKGYASCATASKVPIME
         1430      1440      1450      1460      1470      1480    

      1490      1500      1510      1520      1530    
pF1KSD CRGSCPGQGCCQGLRLKRRKFTFECSDGTSFAEEVEKPTKCGCALCA
       :::.: :  :::  : ::::..:.:.::.::.::::.  .:::  :.
NP_001 CRGGC-GPQCCQPTRSKRRKYVFQCTDGSSFVEEVERHLECGCLACS
          1490      1500      1510      1520      1530

>>NP_001276065 (OMIM: 603746) slit homolog 2 protein iso  (1521 aa)
 initn: 7570 init1: 3063 opt: 6094  Z-score: 3326.6  bits: 628.3 E(85289): 1.5e-178
Smith-Waterman score: 7352; 65.6% identity (86.9% similar) in 1516 aa overlap (21-1533:15-1519)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MALTPGWGSSAGPVRPELWLLLWAAAWRLGASACPALCTCTGTTVDCHGTGLQAIPKNIP
                           :. :   ... .:::: :.:.:.:::::: .:...:.:::
NP_001       MRGVGWQMLSLSLGLVLAILNKVAPQACPAQCSCSGSTVDCHGLALRSVPRNIP
                     10        20        30        40        50    

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD RNTERLELNGNNITRIHKNDFAGLKQLRVLQLMENQIGVVERGAFDDMKELERLRLNRNQ
       ::::::.::::::::: :.:::::..:::::::::.:...:::::.:.:::::::::::.
NP_001 RNTERLDLNGNNITRITKTDFAGLRHLRVLQLMENKISTIERGAFQDLKELERLRLNRNH
           60        70        80        90       100       110    

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD LHMLPELLFQNNQALSRLDLSENAIQAIPRKAFRGATDLKNLQLDKNQISCIEEGAFRAL
       :...::::: ..  : ::::::: ::::::::::::.:.:::::: :::::::.::::::
NP_001 LQLFPELLFLGTAKLYRLDLSENQIQAIPRKAFRGAVDIKNLQLDYNQISCIEDGAFRAL
          120       130       140       150       160       170    

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD RGLEVLTLNNNNITTIPVSSFNHMPKLRTFRLHSNHLFCDCHLAWLSQWLRQRPTIGLFT
       : :::::::::::: . :.::::::::::::::::.:.:::::::::.:::::: .::.:
NP_001 RDLEVLTLNNNNITRLSVASFNHMPKLRTFRLHSNNLYCDCHLAWLSDWLRQRPRVGLYT
          180       190       200       210       220       230    

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD QCSGPASLRGLNVAEVQKSEFSCSGQGEAGRVPTCTLSSGSCPAMCTCSNGIVDCRGKGL
       :: ::. ::: ::::::: :: :::. ..  .:.:..    ::: :::::.:::::::::
NP_001 QCMGPSHLRGHNVAEVQKREFVCSGH-QSFMAPSCSVLH--CPAACTCSNNIVDCRGKGL
          240       250       260        270         280       290 

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pF1KSD TAIPANLPETMTEIRLELNGIKSIPPGAFSPYRKLRRIDLSNNQIAEIAPDAFQGLRSLN
       : ::.:::::.:::::: : :: :::::::::.::::::::::::.:.::::::::::::
NP_001 TEIPTNLPETITEIRLEQNTIKVIPPGAFSPYKKLRRIDLSNNQISELAPDAFQGLRSLN
             300       310       320       330       340       350 

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pF1KSD SLVLYGNKITDLPRGVFGGLYTLQLLLLNANKINCIRPDAFQDLQNLSLLSLYDNKIQSL
       ::::::::::.::...: ::..:::::::::::::.: ::::::.::.::::::::.:..
NP_001 SLVLYGNKITELPKSLFEGLFSLQLLLLNANKINCLRVDAFQDLHNLNLLSLYDNKLQTI
             360       370       380       390       400       410 

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pF1KSD AKGTFTSLRAIQTLHLAQNPFICDCNLKWLADFLRTNPIETSGARCASPRRLANKRIGQI
       :::::. ::::::.:::::::::::.::::::.:.:::::::::::.:::::::::::::
NP_001 AKGTFSPLRAIQTMHLAQNPFICDCHLKWLADYLHTNPIETSGARCTSPRRLANKRIGQI
             420       430       440       450       460       470 

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pF1KSD KSKKFRCSAKEQYFIPGTEDY--QLNSECNSDVVCPHKCRCEANVVECSSLKLTKIPERI
       ::::::::        :::::  .:...: .:..::.:::::...:.::. ::.::::.:
NP_001 KSKKFRCS--------GTEDYRSKLSGDCFADLACPEKCRCEGTTVDCSNQKLNKIPEHI
                     480       490       500       510       520   

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pF1KSD PQSTAELRLNNNEISILEATGMFKKLTHLKKINLSNNKVSEIEDGAFEGAASVSELHLTA
       :: ::::::::::...:::::.:::: .:.:::.::::...::.::::::..:.:. ::.
NP_001 PQYTAELRLNNNEFTVLEATGIFKKLPQLRKINFSNNKITDIEEGAFEGASGVNEILLTS
           530       540       550       560       570       580   

      600       610       620       630       640       650        
pF1KSD NQLESIRSGMFRGLDGLRTLMLRNNRISCIHNDSFTGLRNVRLLSLYDNQITTVSPGAFD
       :.::...  ::.::..:.:::::.:::.:. :::: :: .::::::::::::::.:::::
NP_001 NRLENVQHKMFKGLESLKTLMLRSNRITCVGNDSFIGLSSVRLLSLYDNQITTVAPGAFD
           590       600       610       620       630       640   

      660       670       680       690       700       710        
pF1KSD TLQSLSTLNLLANPFNCNCQLAWLGGWLRKRKIVTGNPRCQNPDFLRQIPLQDVAFPDFR
       ::.:::::::::::::::: ::::: ::::..:::::::::.: ::..::.::::. :: 
NP_001 TLHSLSTLNLLANPFNCNCYLAWLGEWLRKKRIVTGNPRCQKPYFLKEIPIQDVAIQDFT
           650       660       670       680       690       700   

      720       730       740       750       760       770        
pF1KSD CEEGQEEGGCLPRPQCPQECACLDTVVRCSNKHLRALPKGIPKNVTELYLDGNQFTLVPG
       :..:.....: :  .:: ::.::::::::::: :..::::::..::::::::::::::: 
NP_001 CDDGNDDNSCSPLSRCPTECTCLDTVVRCSNKGLKVLPKGIPRDVTELYLDGNQFTLVPK
           710       720       730       740       750       760   

      780       790       800       810       820       830        
pF1KSD QLSTFKYLQLVDLSNNKISSLSNSSFTNMSQLTTLILSYNALQCIPPLAFQGLRSLRLLS
       .::..:.: :.:::::.::.:::.::.::.:: ::::::: :.:::: .:.::.::::::
NP_001 ELSNYKHLTLIDLSNNRISTLSNQSFSNMTQLLTLILSYNRLRCIPPRTFDGLKSLRLLS
           770       780       790       800       810       820   

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pF1KSD LHGNDISTLQEGIFADVTSLSHLAIGANPLYCDCHLRWLSSWVKTGYKEPGIARCAGPQD
       :::::::.. :: : :...:::::::::::::::...:::.:::. :::::::::::: .
NP_001 LHGNDISVVPEGAFNDLSALSHLAIGANPLYCDCNMQWLSDWVKSEYKEPGIARCAGPGE
           830       840       850       860       870       880   

      900       910       920       930       940       950        
pF1KSD MEGKLLLTTPAKKFECQGPPTLAVQAKCDLCLSSPCQNQGTCHNDPLEVYRCACPSGYKG
       :  :::::::.::: ::::  . . :::. :::.::.:.:::..::.. :::.:: :.::
NP_001 MADKLLLTTPSKKFTCQGPVDVNILAKCNPCLSNPCKNDGTCNSDPVDFYRCTCPYGFKG
           890       900       910       920       930       940   

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pF1KSD RDCEVSLDSCSSGPCENGGTCHAQEGEDAPFTCSCPTGFEGPTCGVNTDDCVDHACANGG
       .::.: . .: :.::..::::: .:::.  : : :  :::: .: ::.::: :. : :..
NP_001 QDCDVPIHACISNPCKHGGTCHLKEGEEDGFWCICADGFEGENCEVNVDDCEDNDCENNS
           950       960       970       980       990      1000   

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pF1KSD VCVDGVGNYTCQCPLQYEGKACEQLVDLCSPDLNPCQHEAQCVGTPDGPRCECMPGYAGD
       .::::..:::: :: .: :. ::. .:.:. :::::::...:. :: : .:.: :::.:.
NP_001 TCVDGINNYTCLCPPEYTGELCEEKLDFCAQDLNPCQHDSKCILTPKGFKCDCTPGYVGE
          1010      1020      1030      1040      1050      1060   

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pF1KSD NCSENQDDCRDHRCQNGAQCMDEVNSYSCLCAEGYSGQLCEIPPHLPAPK-SPCEGTECQ
       .:. . :::.:..:.:::.: : ::.:.:.: ::::: .::. : .  :. :::.. .::
NP_001 HCDIDFDDCQDNKCKNGAHCTDAVNGYTCICPEGYSGLFCEFSPPMVLPRTSPCDNFDCQ
          1070      1080      1090      1100      1110      1120   

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pF1KSD NGANCVDQGNRPVCQCLPGFGGPECEKLLSVNFVDRDTYLQFTDLQNWPRANITLQVSTA
       :::.:. . :.:.::::::. : .::::.::::.....:::. . .  :..:::::..: 
NP_001 NGAQCIVRINEPICQCLPGYQGEKCEKLVSVNFINKESYLQIPSAKVRPQTNITLQIATD
          1130      1140      1150      1160      1170      1180   

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pF1KSD EDNGILLYNGDNDHIAVELYQGHVRVSYDPGSYPSSAIYSAETINDGQFHTVELVAFDQM
       ::.:::::.::.::::::::.:.::.::: ::.:.:::::.::::::.:: :::.:.:: 
NP_001 EDSGILLYKGDKDHIAVELYRGRVRASYDTGSHPASAIYSVETINDGNFHIVELLALDQS
          1190      1200      1210      1220      1230      1240   

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pF1KSD VNLSIDGGSPMTMDNFGKHYTLNSEAPLYVGGMPVDVNSAAFRLWQILNGTGFHGCIRNL
       ..::.:::.:  . :..:. ::: ..::::::::   : :..:     :::.::::::::
NP_001 LSLSVDGGNPKIITNLSKQSTLNFDSPLYVGGMPGKSNVASLRQAPGQNGTSFHGCIRNL
          1250      1260      1270      1280      1290      1300   

      1320      1330      1340      1350      1360      1370       
pF1KSD YINNELQDFTKTQMKPGVVPGCEPCRKLYCLHGICQPNATPGPMCHCEAGWVGLHCDQPA
       :::.::::: :. :. :..::::::.:  : :: :::..  :  :.:. ::.:  ::: .
NP_001 YINSELQDFQKVPMQTGILPGCEPCHKKVCAHGTCQPSSQAGFTCECQEGWMGPLCDQRT
          1310      1320      1330      1340      1350      1360   

      1380      1390      1400      1410      1420      1430       
pF1KSD DGPCHGHKCVHGQCVPLDALSYSCQCQDGYSGALCNQAGALAEPCRGLQCLHGHCQASGT
       . :: :.::::: :.:..:.::::.: .:..:.::..   : .::....: ::.:. :: 
NP_001 NDPCLGNKCVHGTCLPINAFSYSCKCLEGHGGVLCDEEEDLFNPCQAIKCKHGKCRLSGL
          1370      1380      1390      1400      1410      1420   

      1440      1450      1460      1470      1480      1490       
pF1KSD KGAHCVCDPGFSGELCEQESECRGDPVRDFHQVQRGYAICQTTRPLSWVECRGSCPGQGC
          .: :. :..:. :..:  :::. .::..: :.::: ::::. .: .::::.: :  :
NP_001 GQPYCECSSGYTGDSCDREISCRGERIRDYYQKQQGYAACQTTKKVSRLECRGGCAGGQC
          1430      1440      1450      1460      1470      1480   

      1500      1510      1520      1530     
pF1KSD CQGLRLKRRKFTFECSDGTSFAEEVEKPTKCGCALCA 
       :  :: ::::..:::.::.::..:::: .::::. :  
NP_001 CGPLRSKRRKYSFECTDGSSFVDEVEKVVKCGCTRCVS
          1490      1500      1510      1520 

>>NP_003053 (OMIM: 603745) slit homolog 3 protein isofor  (1523 aa)
 initn: 4537 init1: 1903 opt: 5521  Z-score: 3015.9  bits: 570.8 E(85289): 3e-161
Smith-Waterman score: 6718; 59.4% identity (83.2% similar) in 1538 aa overlap (3-1534:1-1523)

               10        20        30          40        50        
pF1KSD MALTPGWGSSAGPVRPELWLLLWAAAWRLG--ASACPALCTCTGTTVDCHGTGLQAIPKN
         ..:::.. .. :: .: : :  :.   :  : :::. :::....::::: ::.:.:..
NP_003   MAPGWAGVGAAVRARLALALALASVLSGPPAVACPTKCTCSAASVDCHGLGLRAVPRG
                 10        20        30        40        50        

       60        70        80        90       100       110        
pF1KSD IPRNTERLELNGNNITRIHKNDFAGLKQLRVLQLMENQIGVVERGAFDDMKELERLRLNR
       ::::.:::.:. :::::: : ::::::.::::.: .::..:.:::::.:.:.:::::::.
NP_003 IPRNAERLDLDRNNITRITKMDFAGLKNLRVLHLEDNQVSVIERGAFQDLKQLERLRLNK
       60        70        80        90       100       110        

      120       130       140       150       160       170        
pF1KSD NQLHMLPELLFQNNQALSRLDLSENAIQAIPRKAFRGATDLKNLQLDKNQISCIEEGAFR
       :.:..:::::::..  :.::::::: ::.:::::::: ::.::::::.:.:::::.::::
NP_003 NKLQVLPELLFQSTPKLTRLDLSENQIQGIPRKAFRGITDVKNLQLDNNHISCIEDGAFR
      120       130       140       150       160       170        

      180       190       200       210       220       230        
pF1KSD ALRGLEVLTLNNNNITTIPVSSFNHMPKLRTFRLHSNHLFCDCHLAWLSQWLRQRPTIGL
       ::: ::.::::::::. : :.:::::::.::.:::::::.:::::::::.::::: :.: 
NP_003 ALRDLEILTLNNNNISRILVTSFNHMPKIRTLRLHSNHLYCDCHLAWLSDWLRQRRTVGQ
      180       190       200       210       220       230        

      240       250       260       270       280       290        
pF1KSD FTQCSGPASLRGLNVAEVQKSEFSCSGQGEAGRVPTCTLSSGSCPAMCTCSNGIVDCRGK
       :: : .:. :::.:::.:::.:. : .    .. :.:. .: :::. :::::.:::::::
NP_003 FTLCMAPVHLRGFNVADVQKKEYVCPAP--HSEPPSCNANSISCPSPCTCSNNIVDCRGK
      240       250       260         270       280       290      

      300       310       320       330       340       350        
pF1KSD GLTAIPANLPETMTEIRLELNGIKSIPPGAFSPYRKLRRIDLSNNQIAEIAPDAFQGLRS
       ::  ::::::: ..::::: :.::.:: :::. :.::.:::.:.:::..:::::::::.:
NP_003 GLMEIPANLPEGIVEIRLEQNSIKAIPAGAFTQYKKLKRIDISKNQISDIAPDAFQGLKS
        300       310       320       330       340       350      

      360       370       380       390       400       410        
pF1KSD LNSLVLYGNKITDLPRGVFGGLYTLQLLLLNANKINCIRPDAFQDLQNLSLLSLYDNKIQ
       :.::::::::::.. .:.: :: .:::::::::::::.: ..:::::::.::::::::.:
NP_003 LTSLVLYGNKITEIAKGLFDGLVSLQLLLLNANKINCLRVNTFQDLQNLNLLSLYDNKLQ
        360       370       380       390       400       410      

      420       430       440       450       460       470        
pF1KSD SLAKGTFTSLRAIQTLHLAQNPFICDCNLKWLADFLRTNPIETSGARCASPRRLANKRIG
       ...:: :. :..:::::::::::.:::.::::::.:. ::::::::::.::::::::::.
NP_003 TISKGLFAPLQSIQTLHLAQNPFVCDCHLKWLADYLQDNPIETSGARCSSPRRLANKRIS
        420       430       440       450       460       470      

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pF1KSD QIKSKKFRCSAKEQYFIPGTEDYQ--LNSECNSDVVCPHKCRCEANVVECSSLKLTKIPE
       ::::::::::        :.:::.  ..:::  :.:::.:::::...:.::. ::..:: 
NP_003 QIKSKKFRCS--------GSEDYRSRFSSECFMDLVCPEKCRCEGTIVDCSNQKLVRIPS
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pF1KSD RIPQSTAELRLNNNEISILEATGMFKKLTHLKKINLSNNKVSEIEDGAFEGAASVSELHL
       ..:. ...::::.::.:.:::::.:::: .:.::::::::..:...:::.:::::.:: :
NP_003 HLPEYVTDLRLNDNEVSVLEATGIFKKLPNLRKINLSNNKIKEVREGAFDGAASVQELML
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pF1KSD TANQLESIRSGMFRGLDGLRTLMLRNNRISCIHNDSFTGLRNVRLLSLYDNQITTVSPGA
       :.::::.... .::::.::.:::::.: :.:. ::.:.:: .:::::::::.:::..:::
NP_003 TGNQLETVHGRVFRGLSGLKTLMLRSNLIGCVSNDTFAGLSSVRLLSLYDNRITTITPGA
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pF1KSD FDTLQSLSTLNLLANPFNCNCQLAWLGGWLRKRKIVTGNPRCQNPDFLRQIPLQDVAFPD
       : :: ::::.:::.:::::::.::::: :::::.::.::::::.: ::..::.::::. :
NP_003 FTTLVSLSTINLLSNPFNCNCHLAWLGKWLRKRRIVSGNPRCQKPFFLKEIPIQDVAIQD
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pF1KSD FRCEEGQEEGGCLPRPQCPQECACLDTVVRCSNKHLRALPKGIPKNVTELYLDGNQFTLV
       : :. :.::..:   :.::..:.:..:::::::: :::::.:.::.::::::.::..: :
NP_003 FTCD-GNEESSCQLSPRCPEQCTCMETVVRCSNKGLRALPRGMPKDVTELYLEGNHLTAV
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pF1KSD PGQLSTFKYLQLVDLSNNKISSLSNSSFTNMSQLTTLILSYNALQCIPPLAFQGLRSLRL
       : .::....: :.:::::.:: :.: .:.:::.:.::::::: :.:::  ::.::::::.
NP_003 PRELSALRHLTLIDLSNNSISMLTNYTFSNMSHLSTLILSYNRLRCIPVHAFNGLRSLRV
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       :.:::::::.. :: : :.:::::::.:.:::.::: ::::: :::.::::::::::..:
NP_003 LTLHGNDISSVPEGSFNDLTSLSHLALGTNPLHCDCSLRWLSEWVKAGYKEPGIARCSSP
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       . :  .::::::...:.:.::  . . :::. ::::::.:.::: .::.:.:::::: .:
NP_003 EPMADRLLLTTPTHRFQCKGPVDINIVAKCNACLSSPCKNNGTCTQDPVELYRCACPYSY
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pF1KSD KGRDCEVSLDSCSSGPCENGGTCHAQEGEDAPFTCSCPTGFEGPTCGVNTDDCVDHACAN
       ::.:: : ...: ..::..::::: ....   :.:::: ::::  : .: ::: :. : :
NP_003 KGKDCTVPINTCIQNPCQHGGTCHLSDSHKDGFSCSCPLGFEGQRCEINPDDCEDNDCEN
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pF1KSD GGVCVDGVGNYTCQCPLQYEGKACEQLVDLCSPDLNPCQHEAQCVGTPDGPRCECMPGYA
       ...::::..::.: :: .: :. :....: : :.:: :::::.:.    :  :::.:::.
NP_003 NATCVDGINNYVCICPPNYTGELCDEVIDHCVPELNLCQHEAKCIPLDKGFSCECVPGYS
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pF1KSD GDNCSENQDDCRDHRCQNGAQCMDEVNSYSCLCAEGYSGQLCEIPPHLPAPK-SPCEGTE
       :  :  ..:::  :.:..::::.: .:.:.: : .:.:: .:: :: .   . :::.  :
NP_003 GKLCETDNDDCVAHKCRHGAQCVDTINGYTCTCPQGFSGPFCEHPPPMVLLQTSPCDQYE
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pF1KSD CQNGANCVDQGNRPVCQCLPGFGGPECEKLLSVNFVDRDTYLQFTDLQNWPRANITLQVS
       :::::.:.   ..:.:.: :::.::.::::..:::: .:.:..... .  :.:::.:::.
NP_003 CQNGAQCIVVQQEPTCRCPPGFAGPRCEKLITVNFVGKDSYVELASAKVRPQANISLQVA
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pF1KSD TAEDNGILLYNGDNDHIAVELYQGHVRVSYDPGSYPSSAIYSAETINDGQFHTVELVAFD
       : .:::::::.:::: .:.::::::::. ::  : : ...::.::.::::::.::::...
NP_003 TDKDNGILLYKGDNDPLALELYQGHVRLVYDSLSSPPTTVYSVETVNDGQFHSVELVTLN
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pF1KSD QMVNLSIDGGSPMTMDNFGKHYTLNSEAPLYVGGMPVDVNSAAFRLWQILNGTGFHGCIR
       : .:: .: :.: .. .. :. ... ..:::.::.:.... .:.:        ::::::.
NP_003 QTLNLVVDKGTPKSLGKLQKQPAVGINSPLYLGGIPTSTGLSALRQGTDRPLGGFHGCIH
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pF1KSD NLYINNELQDFTKTQMKP-GVVPGCEPCRKLYCLHGICQPNATPGPMCHCEAGWVGLHCD
       .. ::::::::     .  :: :::. :    : ::.:.     . .:.:. ::.:  ::
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       : :  :: ::.: ::.::   . :: :.: .::.: ::.. .  :. : ...: ::.:. 
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       :     .:.:.:::::: :.::. : :. ::.  . :.::: : :.  .  .::::.: :
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         :::  : ::::..:.:.::.::.::::.  .:::  :.
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>>XP_016865268 (OMIM: 603745) PREDICTED: slit homolog 3   (1460 aa)
 initn: 4346 init1: 1903 opt: 5519  Z-score: 3015.0  bits: 570.5 E(85289): 3.4e-161
Smith-Waterman score: 6487; 59.9% identity (83.5% similar) in 1472 aa overlap (67-1534:4-1460)

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XP_016                            MMGDLDRNNITRITKMDFAGLKNLRVLHLEDNQ
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       ..:.:::::.:.:.:::::::.:.:..:::::::..  :.::::::: ::.:::::::: 
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       ::.::::::.:.:::::.::::::: ::.::::::::. : :.:::::::.::.::::::
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       :.:::::::::.::::: :.: :: : .:. :::.:::.:::.:. : .    .. :.:.
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        .: :::. :::::.:::::::::  ::::::: ..::::: :.::.:: :::. :.::.
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       :::.:.:::..:::::::::.::.::::::::::.. .:.: :: .:::::::::::::.
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       : ..:::::::.::::::::.:...:: :. :..:::::::::::.:::.::::::.:. 
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       ::::::::::.::::::::::.::::::::::        :.:::.  ..:::  :.:::
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pF1KSD HKCRCEANVVECSSLKLTKIPERIPQSTAELRLNNNEISILEATGMFKKLTHLKKINLSN
       .:::::...:.::. ::..:: ..:. ...::::.::.:.:::::.:::: .:.::::::
XP_016 EKCRCEGTIVDCSNQKLVRIPSHLPEYVTDLRLNDNEVSVLEATGIFKKLPNLRKINLSN
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pF1KSD NKVSEIEDGAFEGAASVSELHLTANQLESIRSGMFRGLDGLRTLMLRNNRISCIHNDSFT
       ::..:...:::.:::::.:: ::.::::.... .::::.::.:::::.: :.:. ::.:.
XP_016 NKIKEVREGAFDGAASVQELMLTGNQLETVHGRVFRGLSGLKTLMLRSNLIGCVSNDTFA
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       :: .:::::::::.:::..:::: :: ::::.:::.:::::::.::::: :::::.::.:
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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