Result of FASTA (ccds) for pF1KSDA0813
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA0813, 1534 aa
  1>>>pF1KSDA0813 1534 - 1534 aa - 1534 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1312+/-0.00177; mu= 16.8761+/- 0.106
 mean_var=322.6122+/-62.781, 0's: 0 Z-trim(106.7): 305  B-trim: 5 in 1/50
 Lambda= 0.071406
 statistics sampled from 8783 (9111) to 8783 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.625), E-opt: 0.2 (0.28), width:  16
 Scan time:  4.990

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS7453.1 SLIT1 gene_id:6585|Hs108|chr10          (1534) 10855 1135.0       0
CCDS3426.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4           (1529) 7433 782.4       0
CCDS75110.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4          (1525) 7345 773.4       0
CCDS64311.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5          (1530) 6692 706.1 2.1e-202
CCDS75111.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4          (1521) 6094 644.5 7.4e-184
CCDS4369.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5           (1523) 5519 585.3  5e-166
CCDS13112.1 JAG1 gene_id:182|Hs108|chr20           (1218)  844 103.5 4.3e-21
CCDS34420.1 NOTCH4 gene_id:4855|Hs108|chr6         (2003)  822 101.6 2.6e-20
CCDS5313.1 DLL1 gene_id:28514|Hs108|chr6           ( 723)  809 99.5   4e-20
CCDS12326.1 NOTCH3 gene_id:4854|Hs108|chr19        (2321)  788 98.2 3.2e-19
CCDS43905.1 NOTCH1 gene_id:4851|Hs108|chr9         (2555)  776 97.0   8e-19
CCDS48004.1 SVEP1 gene_id:79987|Hs108|chr9         (3571)  777 97.4 8.8e-19
CCDS908.1 NOTCH2 gene_id:4853|Hs108|chr1           (2471)  774 96.8 9.1e-19
CCDS9999.1 JAG2 gene_id:3714|Hs108|chr14           (1200)  631 81.5 1.7e-14
CCDS9998.1 JAG2 gene_id:3714|Hs108|chr14           (1238)  631 81.6 1.7e-14
CCDS33783.1 LRIG1 gene_id:26018|Hs108|chr3         (1093)  615 79.8 5.1e-14
CCDS12537.1 DLL3 gene_id:10683|Hs108|chr19         ( 587)  606 78.5 7.1e-14
CCDS12538.1 DLL3 gene_id:10683|Hs108|chr19         ( 618)  606 78.5 7.3e-14
CCDS46562.1 SNED1 gene_id:25992|Hs108|chr2         (1413)  603 78.8 1.4e-13
CCDS45232.1 DLL4 gene_id:54567|Hs108|chr15         ( 685)  587 76.6   3e-13
CCDS47445.1 EYS gene_id:346007|Hs108|chr6          (3144)  571 76.0   2e-12
CCDS78156.1 EYS gene_id:346007|Hs108|chr6          (3165)  571 76.0   2e-12
CCDS33390.1 DNER gene_id:92737|Hs108|chr2          ( 737)  542 72.0 7.7e-12
CCDS58052.1 CRB1 gene_id:23418|Hs108|chr1          ( 870)  527 70.6 2.4e-11
CCDS1390.1 CRB1 gene_id:23418|Hs108|chr1           (1406)  527 70.9 3.1e-11


>>CCDS7453.1 SLIT1 gene_id:6585|Hs108|chr10               (1534 aa)
 initn: 10855 init1: 10855 opt: 10855  Z-score: 6064.9  bits: 1135.0 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 10855; 99.9% identity (100.0% similar) in 1534 aa overlap (1-1534:1-1534)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MALTPGWGSSAGPVRPELWLLLWAAAWRLGASACPALCTCTGTTVDCHGTGLQAIPKNIP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 MALTPGWGSSAGPVRPELWLLLWAAAWRLGASACPALCTCTGTTVDCHGTGLQAIPKNIP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD RNTERLELNGNNITRIHKNDFAGLKQLRVLQLMENQIGVVERGAFDDMKELERLRLNRNQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
CCDS74 RNTERLELNGNNITRIHKNDFAGLKQLRVLQLMENQIGAVERGAFDDMKELERLRLNRNQ
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD LHMLPELLFQNNQALSRLDLSENAIQAIPRKAFRGATDLKNLQLDKNQISCIEEGAFRAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LHMLPELLFQNNQALSRLDLSENAIQAIPRKAFRGATDLKNLQLDKNQISCIEEGAFRAL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD RGLEVLTLNNNNITTIPVSSFNHMPKLRTFRLHSNHLFCDCHLAWLSQWLRQRPTIGLFT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 RGLEVLTLNNNNITTIPVSSFNHMPKLRTFRLHSNHLFCDCHLAWLSQWLRQRPTIGLFT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD QCSGPASLRGLNVAEVQKSEFSCSGQGEAGRVPTCTLSSGSCPAMCTCSNGIVDCRGKGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 QCSGPASLRGLNVAEVQKSEFSCSGQGEAGRVPTCTLSSGSCPAMCTCSNGIVDCRGKGL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD TAIPANLPETMTEIRLELNGIKSIPPGAFSPYRKLRRIDLSNNQIAEIAPDAFQGLRSLN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 TAIPANLPETMTEIRLELNGIKSIPPGAFSPYRKLRRIDLSNNQIAEIAPDAFQGLRSLN
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD SLVLYGNKITDLPRGVFGGLYTLQLLLLNANKINCIRPDAFQDLQNLSLLSLYDNKIQSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 SLVLYGNKITDLPRGVFGGLYTLQLLLLNANKINCIRPDAFQDLQNLSLLSLYDNKIQSL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD AKGTFTSLRAIQTLHLAQNPFICDCNLKWLADFLRTNPIETSGARCASPRRLANKRIGQI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 AKGTFTSLRAIQTLHLAQNPFICDCNLKWLADFLRTNPIETSGARCASPRRLANKRIGQI
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD KSKKFRCSAKEQYFIPGTEDYQLNSECNSDVVCPHKCRCEANVVECSSLKLTKIPERIPQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 KSKKFRCSAKEQYFIPGTEDYQLNSECNSDVVCPHKCRCEANVVECSSLKLTKIPERIPQ
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD STAELRLNNNEISILEATGMFKKLTHLKKINLSNNKVSEIEDGAFEGAASVSELHLTANQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 STAELRLNNNEISILEATGMFKKLTHLKKINLSNNKVSEIEDGAFEGAASVSELHLTANQ
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD LESIRSGMFRGLDGLRTLMLRNNRISCIHNDSFTGLRNVRLLSLYDNQITTVSPGAFDTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LESIRSGMFRGLDGLRTLMLRNNRISCIHNDSFTGLRNVRLLSLYDNQITTVSPGAFDTL
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD QSLSTLNLLANPFNCNCQLAWLGGWLRKRKIVTGNPRCQNPDFLRQIPLQDVAFPDFRCE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 QSLSTLNLLANPFNCNCQLAWLGGWLRKRKIVTGNPRCQNPDFLRQIPLQDVAFPDFRCE
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD EGQEEGGCLPRPQCPQECACLDTVVRCSNKHLRALPKGIPKNVTELYLDGNQFTLVPGQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 EGQEEGGCLPRPQCPQECACLDTVVRCSNKHLRALPKGIPKNVTELYLDGNQFTLVPGQL
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD STFKYLQLVDLSNNKISSLSNSSFTNMSQLTTLILSYNALQCIPPLAFQGLRSLRLLSLH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 STFKYLQLVDLSNNKISSLSNSSFTNMSQLTTLILSYNALQCIPPLAFQGLRSLRLLSLH
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KSD GNDISTLQEGIFADVTSLSHLAIGANPLYCDCHLRWLSSWVKTGYKEPGIARCAGPQDME
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 GNDISTLQEGIFADVTSLSHLAIGANPLYCDCHLRWLSSWVKTGYKEPGIARCAGPQDME
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KSD GKLLLTTPAKKFECQGPPTLAVQAKCDLCLSSPCQNQGTCHNDPLEVYRCACPSGYKGRD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 GKLLLTTPAKKFECQGPPTLAVQAKCDLCLSSPCQNQGTCHNDPLEVYRCACPSGYKGRD
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KSD CEVSLDSCSSGPCENGGTCHAQEGEDAPFTCSCPTGFEGPTCGVNTDDCVDHACANGGVC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 CEVSLDSCSSGPCENGGTCHAQEGEDAPFTCSCPTGFEGPTCGVNTDDCVDHACANGGVC
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KSD VDGVGNYTCQCPLQYEGKACEQLVDLCSPDLNPCQHEAQCVGTPDGPRCECMPGYAGDNC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 VDGVGNYTCQCPLQYEGKACEQLVDLCSPDLNPCQHEAQCVGTPDGPRCECMPGYAGDNC
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KSD SENQDDCRDHRCQNGAQCMDEVNSYSCLCAEGYSGQLCEIPPHLPAPKSPCEGTECQNGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 SENQDDCRDHRCQNGAQCMDEVNSYSCLCAEGYSGQLCEIPPHLPAPKSPCEGTECQNGA
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KSD NCVDQGNRPVCQCLPGFGGPECEKLLSVNFVDRDTYLQFTDLQNWPRANITLQVSTAEDN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 NCVDQGNRPVCQCLPGFGGPECEKLLSVNFVDRDTYLQFTDLQNWPRANITLQVSTAEDN
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KSD GILLYNGDNDHIAVELYQGHVRVSYDPGSYPSSAIYSAETINDGQFHTVELVAFDQMVNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 GILLYNGDNDHIAVELYQGHVRVSYDPGSYPSSAIYSAETINDGQFHTVELVAFDQMVNL
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KSD SIDGGSPMTMDNFGKHYTLNSEAPLYVGGMPVDVNSAAFRLWQILNGTGFHGCIRNLYIN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 SIDGGSPMTMDNFGKHYTLNSEAPLYVGGMPVDVNSAAFRLWQILNGTGFHGCIRNLYIN
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KSD NELQDFTKTQMKPGVVPGCEPCRKLYCLHGICQPNATPGPMCHCEAGWVGLHCDQPADGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 NELQDFTKTQMKPGVVPGCEPCRKLYCLHGICQPNATPGPMCHCEAGWVGLHCDQPADGP
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KSD CHGHKCVHGQCVPLDALSYSCQCQDGYSGALCNQAGALAEPCRGLQCLHGHCQASGTKGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 CHGHKCVHGQCVPLDALSYSCQCQDGYSGALCNQAGALAEPCRGLQCLHGHCQASGTKGA
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KSD HCVCDPGFSGELCEQESECRGDPVRDFHQVQRGYAICQTTRPLSWVECRGSCPGQGCCQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 HCVCDPGFSGELCEQESECRGDPVRDFHQVQRGYAICQTTRPLSWVECRGSCPGQGCCQG
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1510      1520      1530    
pF1KSD LRLKRRKFTFECSDGTSFAEEVEKPTKCGCALCA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LRLKRRKFTFECSDGTSFAEEVEKPTKCGCALCA
             1510      1520      1530    

>>CCDS3426.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4                (1529 aa)
 initn: 6576 init1: 3063 opt: 7433  Z-score: 4159.7  bits: 782.4 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 7433; 66.1% identity (87.5% similar) in 1516 aa overlap (21-1533:15-1527)

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       ::::::.::::::::: :.:::::..:::::::::.:...:::::.:.:::::::::::.
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       :...::::: ..  : ::::::: ::::::::::::.:.:::::: :::::::.::::::
CCDS34 LQLFPELLFLGTAKLYRLDLSENQIQAIPRKAFRGAVDIKNLQLDYNQISCIEDGAFRAL
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CCDS34 RDLEVLTLNNNNITRLSVASFNHMPKLRTFRLHSNNLYCDCHLAWLSDWLRQRPRVGLYT
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       :: ::. ::: ::::::: :: :::. ..  .:.:..    ::: :::::.:::::::::
CCDS34 QCMGPSHLRGHNVAEVQKREFVCSGH-QSFMAPSCSVLH--CPAACTCSNNIVDCRGKGL
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CCDS34 TEIPTNLPETITEIRLEQNTIKVIPPGAFSPYKKLRRIDLSNNQISELAPDAFQGLRSLN
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       ::::::::::.::...: ::..:::::::::::::.: ::::::.::.::::::::.:..
CCDS34 SLVLYGNKITELPKSLFEGLFSLQLLLLNANKINCLRVDAFQDLHNLNLLSLYDNKLQTI
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CCDS34 AKGTFSPLRAIQTMHLAQNPFICDCHLKWLADYLHTNPIETSGARCTSPRRLANKRIGQI
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CCDS34 KSKKFRCSAKEQYFIPGTEDYRSKLSGDCFADLACPEKCRCEGTTVDCSNQKLNKIPEHI
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       :: ::::::::::...:::::.:::: .:.:::.::::...::.::::::..:.:. ::.
CCDS34 PQYTAELRLNNNEFTVLEATGIFKKLPQLRKINFSNNKITDIEEGAFEGASGVNEILLTS
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CCDS34 NRLENVQHKMFKGLESLKTLMLRSNRITCVGNDSFIGLSSVRLLSLYDNQITTVAPGAFD
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       ::.:::::::::::::::: ::::: ::::..:::::::::.: ::..::.::::. :: 
CCDS34 TLHSLSTLNLLANPFNCNCYLAWLGEWLRKKRIVTGNPRCQKPYFLKEIPIQDVAIQDFT
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pF1KSD CEEGQEEGGCLPRPQCPQECACLDTVVRCSNKHLRALPKGIPKNVTELYLDGNQFTLVPG
       :..:.....: :  .:: ::.::::::::::: :..::::::..::::::::::::::: 
CCDS34 CDDGNDDNSCSPLSRCPTECTCLDTVVRCSNKGLKVLPKGIPRDVTELYLDGNQFTLVPK
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CCDS34 ELSNYKHLTLIDLSNNRISTLSNQSFSNMTQLLTLILSYNRLRCIPPRTFDGLKSLRLLS
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       :::::::.. :: : :...:::::::::::::::...:::.:::. :::::::::::: .
CCDS34 LHGNDISVVPEGAFNDLSALSHLAIGANPLYCDCNMQWLSDWVKSEYKEPGIARCAGPGE
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       :  :::::::.::: ::::  . . :::. :::.::.:.:::..::.. :::.:: :.::
CCDS34 MADKLLLTTPSKKFTCQGPVDVNILAKCNPCLSNPCKNDGTCNSDPVDFYRCTCPYGFKG
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       .::.: . .: :.::..::::: .:::.  : : :  :::: .: ::.::: :. : :..
CCDS34 QDCDVPIHACISNPCKHGGTCHLKEGEEDGFWCICADGFEGENCEVNVDDCEDNDCENNS
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CCDS34 TCVDGINNYTCLCPPEYTGELCEEKLDFCAQDLNPCQHDSKCILTPKGFKCDCTPGYVGE
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CCDS34 HCDIDFDDCQDNKCKNGAHCTDAVNGYTCICPEGYSGLFCEFSPPMVLPRTSPCDNFDCQ
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CCDS34 NGAQCIVRINEPICQCLPGYQGEKCEKLVSVNFINKESYLQIPSAKVRPQTNITLQIATD
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CCDS34 EDSGILLYKGDKDHIAVELYRGRVRASYDTGSHPASAIYSVETINDGNFHIVELLALDQS
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       ..::.:::.:  . :..:. ::: ..::::::::   : :..:     :::.::::::::
CCDS34 LSLSVDGGNPKIITNLSKQSTLNFDSPLYVGGMPGKSNVASLRQAPGQNGTSFHGCIRNL
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CCDS34 YINSELQDFQKVPMQTGILPGCEPCHKKVCAHGTCQPSSQAGFTCECQEGWMGPLCDQRT
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       . :: :.::::: :.:..:.::::.: .:..:.::..   : .::....: ::.:. :: 
CCDS34 NDPCLGNKCVHGTCLPINAFSYSCKCLEGHGGVLCDEEEDLFNPCQAIKCKHGKCRLSGL
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CCDS34 GQPYCECSSGYTGDSCDREISCRGERIRDYYQKQQGYAACQTTKKVSRLECRGGCAGGQC
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CCDS34 CGPLRSKRRKYSFECTDGSSFVDEVEKVVKCGCTRCVS
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CCDS75 LQLFPELLFLGTAKLYRLDLSENQIQAIPRKAFRGAVDIKNLQLDYNQISCIEDGAFRAL
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CCDS75 RDLEVLTLNNNNITRLSVASFNHMPKLRTFRLHSNNLYCDCHLAWLSDWLRQRPRVGLYT
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pF1KSD SLNSLVLYGNKITDLPRGVFGGLYTLQLLLLNANKINCIRPDAFQDLQNLSLLSLYDNKI
       :::::::::::::.::...: ::..:::::::::::::.: ::::::.::.::::::::.
CCDS75 SLNSLVLYGNKITELPKSLFEGLFSLQLLLLNANKINCLRVDAFQDLHNLNLLSLYDNKL
            360       370       380       390       400       410  

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pF1KSD QSLAKGTFTSLRAIQTLHLAQNPFICDCNLKWLADFLRTNPIETSGARCASPRRLANKRI
       :..:::::. ::::::.:::::::::::.::::::.:.:::::::::::.::::::::::
CCDS75 QTIAKGTFSPLRAIQTMHLAQNPFICDCHLKWLADYLHTNPIETSGARCTSPRRLANKRI
            420       430       440       450       460       470  

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pF1KSD GQIKSKKFRCSAKEQYFIPGTEDY--QLNSECNSDVVCPHKCRCEANVVECSSLKLTKIP
       :::::::::::        :::::  .:...: .:..::.:::::...:.::. ::.:::
CCDS75 GQIKSKKFRCS--------GTEDYRSKLSGDCFADLACPEKCRCEGTTVDCSNQKLNKIP
            480               490       500       510       520    

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pF1KSD ERIPQSTAELRLNNNEISILEATGMFKKLTHLKKINLSNNKVSEIEDGAFEGAASVSELH
       :.::: ::::::::::...:::::.:::: .:.:::.::::...::.::::::..:.:. 
CCDS75 EHIPQYTAELRLNNNEFTVLEATGIFKKLPQLRKINFSNNKITDIEEGAFEGASGVNEIL
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pF1KSD LTANQLESIRSGMFRGLDGLRTLMLRNNRISCIHNDSFTGLRNVRLLSLYDNQITTVSPG
       ::.:.::...  ::.::..:.:::::.:::.:. :::: :: .::::::::::::::.::
CCDS75 LTSNRLENVQHKMFKGLESLKTLMLRSNRITCVGNDSFIGLSSVRLLSLYDNQITTVAPG
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pF1KSD AFDTLQSLSTLNLLANPFNCNCQLAWLGGWLRKRKIVTGNPRCQNPDFLRQIPLQDVAFP
       :::::.:::::::::::::::: ::::: ::::..:::::::::.: ::..::.::::. 
CCDS75 AFDTLHSLSTLNLLANPFNCNCYLAWLGEWLRKKRIVTGNPRCQKPYFLKEIPIQDVAIQ
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pF1KSD DFRCEEGQEEGGCLPRPQCPQECACLDTVVRCSNKHLRALPKGIPKNVTELYLDGNQFTL
       :: :..:.....: :  .:: ::.::::::::::: :..::::::..:::::::::::::
CCDS75 DFTCDDGNDDNSCSPLSRCPTECTCLDTVVRCSNKGLKVLPKGIPRDVTELYLDGNQFTL
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pF1KSD VPGQLSTFKYLQLVDLSNNKISSLSNSSFTNMSQLTTLILSYNALQCIPPLAFQGLRSLR
       :: .::..:.: :.:::::.::.:::.::.::.:: ::::::: :.:::: .:.::.:::
CCDS75 VPKELSNYKHLTLIDLSNNRISTLSNQSFSNMTQLLTLILSYNRLRCIPPRTFDGLKSLR
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pF1KSD LLSLHGNDISTLQEGIFADVTSLSHLAIGANPLYCDCHLRWLSSWVKTGYKEPGIARCAG
       ::::::::::.. :: : :...:::::::::::::::...:::.:::. :::::::::::
CCDS75 LLSLHGNDISVVPEGAFNDLSALSHLAIGANPLYCDCNMQWLSDWVKSEYKEPGIARCAG
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pF1KSD PQDMEGKLLLTTPAKKFECQGPPTLAVQAKCDLCLSSPCQNQGTCHNDPLEVYRCACPSG
       : .:  :::::::.::: ::::  . . :::. :::.::.:.:::..::.. :::.:: :
CCDS75 PGEMADKLLLTTPSKKFTCQGPVDVNILAKCNPCLSNPCKNDGTCNSDPVDFYRCTCPYG
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pF1KSD YKGRDCEVSLDSCSSGPCENGGTCHAQEGEDAPFTCSCPTGFEGPTCGVNTDDCVDHACA
       .::.::.: . .: :.::..::::: .:::.  : : :  :::: .: ::.::: :. : 
CCDS75 FKGQDCDVPIHACISNPCKHGGTCHLKEGEEDGFWCICADGFEGENCEVNVDDCEDNDCE
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pF1KSD NGGVCVDGVGNYTCQCPLQYEGKACEQLVDLCSPDLNPCQHEAQCVGTPDGPRCECMPGY
       :...::::..:::: :: .: :. ::. .:.:. :::::::...:. :: : .:.: :::
CCDS75 NNSTCVDGINNYTCLCPPEYTGELCEEKLDFCAQDLNPCQHDSKCILTPKGFKCDCTPGY
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pF1KSD AGDNCSENQDDCRDHRCQNGAQCMDEVNSYSCLCAEGYSGQLCEIPPHLPAPK-SPCEGT
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CCDS75 VGEHCDIDFDDCQDNKCKNGAHCTDAVNGYTCICPEGYSGLFCEFSPPMVLPRTSPCDNF
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pF1KSD ECQNGANCVDQGNRPVCQCLPGFGGPECEKLLSVNFVDRDTYLQFTDLQNWPRANITLQV
       .:::::.:. . :.:.::::::. : .::::.::::.....:::. . .  :..:::::.
CCDS75 DCQNGAQCIVRINEPICQCLPGYQGEKCEKLVSVNFINKESYLQIPSAKVRPQTNITLQI
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pF1KSD STAEDNGILLYNGDNDHIAVELYQGHVRVSYDPGSYPSSAIYSAETINDGQFHTVELVAF
       .: ::.:::::.::.::::::::.:.::.::: ::.:.:::::.::::::.:: :::.:.
CCDS75 ATDEDSGILLYKGDKDHIAVELYRGRVRASYDTGSHPASAIYSVETINDGNFHIVELLAL
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pF1KSD DQMVNLSIDGGSPMTMDNFGKHYTLNSEAPLYVGGMPVDVNSAAFRLWQILNGTGFHGCI
       :: ..::.:::.:  . :..:. ::: ..::::::::   : :..:     :::.:::::
CCDS75 DQSLSLSVDGGNPKIITNLSKQSTLNFDSPLYVGGMPGKSNVASLRQAPGQNGTSFHGCI
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pF1KSD RNLYINNELQDFTKTQMKPGVVPGCEPCRKLYCLHGICQPNATPGPMCHCEAGWVGLHCD
       ::::::.::::: :. :. :..::::::.:  : :: :::..  :  :.:. ::.:  ::
CCDS75 RNLYINSELQDFQKVPMQTGILPGCEPCHKKVCAHGTCQPSSQAGFTCECQEGWMGPLCD
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pF1KSD QPADGPCHGHKCVHGQCVPLDALSYSCQCQDGYSGALCNQAGALAEPCRGLQCLHGHCQA
       : .. :: :.::::: :.:..:.::::.: .:..:.::..   : .::....: ::.:. 
CCDS75 QRTNDPCLGNKCVHGTCLPINAFSYSCKCLEGHGGVLCDEEEDLFNPCQAIKCKHGKCRL
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pF1KSD SGTKGAHCVCDPGFSGELCEQESECRGDPVRDFHQVQRGYAICQTTRPLSWVECRGSCPG
       ::    .: :. :..:. :..:  :::. .::..: :.::: ::::. .: .::::.: :
CCDS75 SGLGQPYCECSSGYTGDSCDREISCRGERIRDYYQKQQGYAACQTTKKVSRLECRGGCAG
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CCDS75 GQCCGPLRSKRRKYSFECTDGSSFVDEVEKVVKCGCTRCVS
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>>CCDS64311.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5               (1530 aa)
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         ..:::.. .. :: .: : :  :.   :  : :::. :::....::::: ::.:.:..
CCDS64   MAPGWAGVGAAVRARLALALALASVLSGPPAVACPTKCTCSAASVDCHGLGLRAVPRG
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pF1KSD IPRNTERLELNGNNITRIHKNDFAGLKQLRVLQLMENQIGVVERGAFDDMKELERLRLNR
       ::::.:::.:. :::::: : ::::::.::::.: .::..:.:::::.:.:.:::::::.
CCDS64 IPRNAERLDLDRNNITRITKMDFAGLKNLRVLHLEDNQVSVIERGAFQDLKQLERLRLNK
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pF1KSD NQLHMLPELLFQNNQALSRLDLSENAIQAIPRKAFRGATDLKNLQLDKNQISCIEEGAFR
       :.:..:::::::..  :.::::::: ::.:::::::: ::.::::::.:.:::::.::::
CCDS64 NKLQVLPELLFQSTPKLTRLDLSENQIQGIPRKAFRGITDVKNLQLDNNHISCIEDGAFR
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pF1KSD ALRGLEVLTLNNNNITTIPVSSFNHMPKLRTFRLHSNHLFCDCHLAWLSQWLRQRPTIGL
       ::: ::.::::::::. : :.:::::::.::.:::::::.:::::::::.::::: :.: 
CCDS64 ALRDLEILTLNNNNISRILVTSFNHMPKIRTLRLHSNHLYCDCHLAWLSDWLRQRRTVGQ
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pF1KSD FTQCSGPASLRGLNVAEVQKSEFSCSGQGEAGRVPTCTLSSGSCPAMCTCSNGIVDCRGK
       :: : .:. :::.:::.:::.:. : .    .. :.:. .: :::. :::::.:::::::
CCDS64 FTLCMAPVHLRGFNVADVQKKEYVCPAP--HSEPPSCNANSISCPSPCTCSNNIVDCRGK
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       ::  ::::::: ..::::: :.::.:: :::. :.::.:::.:.:::..:::::::::.:
CCDS64 GLMEIPANLPEGIVEIRLEQNSIKAIPAGAFTQYKKLKRIDISKNQISDIAPDAFQGLKS
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pF1KSD LNSLVLYGNKITDLPRGVFGGLYTLQLLLLNANKINCIRPDAFQDLQNLSLLSLYDNKIQ
       :.::::::::::.. .:.: :: .:::::::::::::.: ..:::::::.::::::::.:
CCDS64 LTSLVLYGNKITEIVKGLFDGLVSLQLLLLNANKINCLRVNTFQDLQNLNLLSLYDNKLQ
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pF1KSD SLAKGTFTSLRAIQTLHLAQNPFICDCNLKWLADFLRTNPIETSGARCASPRRLANKRIG
       ...:: :. :..:::::::::::.:::.::::::.:. ::::::::::.::::::::::.
CCDS64 TISKGLFAPLQSIQTLHLAQNPFVCDCHLKWLADYLQDNPIETSGARCSSPRRLANKRIS
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pF1KSD QIKSKKFRCSAKEQYFIPGTEDYQ--LNSECNSDVVCPHKCRCEANVVECSSLKLTKIPE
       ::::::::::        :.:::.  ..:::  :.:::.:::::...:.::. ::..:: 
CCDS64 QIKSKKFRCS--------GSEDYRSRFSSECFMDLVCPEKCRCEGTIVDCSNQKLVRIPS
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pF1KSD RIPQSTAELRLNNNEISILEATGMFKKLTHLKKINLSNNKVSEIEDGAFEGAASVSELHL
       ..:. ...::::.::.:.:::::.:::: .:.::::::::..:...:::.:::::.:: :
CCDS64 HLPEYVTDLRLNDNEVSVLEATGIFKKLPNLRKINLSNNKIKEVREGAFDGAASVQELML
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pF1KSD TANQLESIRSGMFRGLDGLRTLMLRNNRISCIHNDSFTGLRNVRLLSLYDNQITTVSPGA
       :.::::.... .::::.::.:::::.: :.:. ::.:.:: .:::::::::.:::..:::
CCDS64 TGNQLETVHGRVFRGLSGLKTLMLRSNLIGCVSNDTFAGLSSVRLLSLYDNRITTITPGA
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pF1KSD FDTLQSLSTLNLLANPFNCNCQLAWLGGWLRKRKIVTGNPRCQNPDFLRQIPLQDVAFPD
       : :: ::::.:::.:::::::.::::: :::::.::.::::::.: ::..::.::::. :
CCDS64 FTTLVSLSTINLLSNPFNCNCHLAWLGKWLRKRRIVSGNPRCQKPFFLKEIPIQDVAIQD
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pF1KSD FRCEEGQEEGGCLPRPQCPQECACLDTVVRCSNKHLRALPKGIPKNVTELYLDGNQFTLV
       : :. :.::..:   :.::..:.:..:::::::: :::::.:.::.::::::.::..: :
CCDS64 FTCD-GNEESSCQLSPRCPEQCTCMETVVRCSNKGLRALPRGMPKDVTELYLEGNHLTAV
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pF1KSD PGQLSTFKYLQLVDLSNNKISSLSNSSFTNMSQLTTLILSYNALQCIPPLAFQGLRSLRL
       : .::....: :.:::::.:: :.: .:.:::.:.::::::: :.:::  ::.::::::.
CCDS64 PRELSALRHLTLIDLSNNSISMLTNYTFSNMSHLSTLILSYNRLRCIPVHAFNGLRSLRV
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       :.:::::::.. :: : :.:::::::.:.:::.::: ::::: :::.::::::::::..:
CCDS64 LTLHGNDISSVPEGSFNDLTSLSHLALGTNPLHCDCSLRWLSEWVKAGYKEPGIARCSSP
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       . :  .::::::...:.:.       ::  . . :::. ::::::.:.::: .::.:.::
CCDS64 EPMADRLLLTTPTHRFQCKVLWFCCPGPVDINIVAKCNACLSSPCKNNGTCTQDPVELYR
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pF1KSD CACPSGYKGRDCEVSLDSCSSGPCENGGTCHAQEGEDAPFTCSCPTGFEGPTCGVNTDDC
       :::: .:::.:: : ...: ..::..::::: ....   :.:::: ::::  : .: :::
CCDS64 CACPYSYKGKDCTVPINTCIQNPCQHGGTCHLSDSHKDGFSCSCPLGFEGQRCEINPDDC
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        :. : :...::::..::.: :: .: :. :....: : :.:: :::::.:.    :  :
CCDS64 EDNDCENNATCVDGINNYVCICPPNYTGELCDEVIDHCVPELNLCQHEAKCIPLDKGFSC
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       ::.:::.:  :  ..:::  :.:..::::.: .:.:.: : .:.:: .:: :: .   . 
CCDS64 ECVPGYSGKLCETDNDDCVAHKCRHGAQCVDTINGYTCTCPQGFSGPFCEHPPPMVLLQT
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       :::.  ::::::.:.   ..:.:.: :::.::.::::..:::: .:.:..... .  :.:
CCDS64 SPCDQYECQNGAQCIVVQQEPTCRCPPGFAGPRCEKLITVNFVGKDSYVELASAKVRPQA
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       ::.:::.: .:::::::.:::: .:.::::::::. ::  : : ...::.::.::::::.
CCDS64 NISLQVATDKDNGILLYKGDNDPLALELYQGHVRLVYDSLSSPPTTVYSVETVNDGQFHS
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pF1KSD VELVAFDQMVNLSIDGGSPMTMDNFGKHYTLNSEAPLYVGGMPVDVNSAAFRLWQILNGT
       ::::...: .:: .: :.: .. .. :. ... ..:::.::.:.... .:.:        
CCDS64 VELVTLNQTLNLVVDKGTPKSLGKLQKQPAVGINSPLYLGGIPTSTGLSALRQGTDRPLG
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pF1KSD GFHGCIRNLYINNELQDFTKTQMKP-GVVPGCEPCRKLYCLHGICQPNATPGPMCHCEAG
       ::::::... ::::::::     .  :: :::. :    : ::.:.     . .:.:. :
CCDS64 GFHGCIHEVRINNELQDFKALPPQSLGVSPGCKSCT--VCKHGLCRSVEKDSVVCECRPG
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pF1KSD WVGLHCDQPADGPCHGHKCVHGQCVPLDALSYSCQCQDGYSGALCNQAGALAEPCRGLQC
       :.:  ::: :  :: ::.: ::.::   . :: :.: .::.: ::.. .  :. : ...:
CCDS64 WTGPLCDQEARDPCLGHRCHHGKCVATGT-SYMCKCAEGYGGDLCDNKNDSANACSAFKC
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        ::.:. :     .:.:.:::::: :.::. : :. ::.  . :.::: : :.  .  .:
CCDS64 HHGQCHISDQGEPYCLCQPGFSGEHCQQENPCLGQVVREVIRRQKGYASCATASKVPIME
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       :::.: :  :::  : ::::..:.:.::.::.::::.  .:::  :.
CCDS64 CRGGC-GPQCCQPTRSKRRKYVFQCTDGSSFVEEVERHLECGCLACS
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       ::::::.::::::::: :.:::::..:::::::::.:...:::::.:.:::::::::::.
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       :...::::: ..  : ::::::: ::::::::::::.:.:::::: :::::::.::::::
CCDS75 LQLFPELLFLGTAKLYRLDLSENQIQAIPRKAFRGAVDIKNLQLDYNQISCIEDGAFRAL
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       : :::::::::::: . :.::::::::::::::::.:.:::::::::.:::::: .::.:
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       :: ::. ::: ::::::: :: :::. ..  .:.:..    ::: :::::.:::::::::
CCDS75 QCMGPSHLRGHNVAEVQKREFVCSGH-QSFMAPSCSVLH--CPAACTCSNNIVDCRGKGL
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       : ::.:::::.:::::: : :: :::::::::.::::::::::::.:.::::::::::::
CCDS75 TEIPTNLPETITEIRLEQNTIKVIPPGAFSPYKKLRRIDLSNNQISELAPDAFQGLRSLN
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       ::::::::::.::...: ::..:::::::::::::.: ::::::.::.::::::::.:..
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       :::::. ::::::.:::::::::::.::::::.:.:::::::::::.:::::::::::::
CCDS75 AKGTFSPLRAIQTMHLAQNPFICDCHLKWLADYLHTNPIETSGARCTSPRRLANKRIGQI
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CCDS75 KSKKFRCS--------GTEDYRSKLSGDCFADLACPEKCRCEGTTVDCSNQKLNKIPEHI
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       :: ::::::::::...:::::.:::: .:.:::.::::...::.::::::..:.:. ::.
CCDS75 PQYTAELRLNNNEFTVLEATGIFKKLPQLRKINFSNNKITDIEEGAFEGASGVNEILLTS
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CCDS75 NRLENVQHKMFKGLESLKTLMLRSNRITCVGNDSFIGLSSVRLLSLYDNQITTVAPGAFD
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       ::.:::::::::::::::: ::::: ::::..:::::::::.: ::..::.::::. :: 
CCDS75 TLHSLSTLNLLANPFNCNCYLAWLGEWLRKKRIVTGNPRCQKPYFLKEIPIQDVAIQDFT
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CCDS75 ELSNYKHLTLIDLSNNRISTLSNQSFSNMTQLLTLILSYNRLRCIPPRTFDGLKSLRLLS
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       :::::::.. :: : :...:::::::::::::::...:::.:::. :::::::::::: .
CCDS75 LHGNDISVVPEGAFNDLSALSHLAIGANPLYCDCNMQWLSDWVKSEYKEPGIARCAGPGE
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CCDS75 MADKLLLTTPSKKFTCQGPVDVNILAKCNPCLSNPCKNDGTCNSDPVDFYRCTCPYGFKG
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CCDS75 QDCDVPIHACISNPCKHGGTCHLKEGEEDGFWCICADGFEGENCEVNVDDCEDNDCENNS
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pF1KSD VCVDGVGNYTCQCPLQYEGKACEQLVDLCSPDLNPCQHEAQCVGTPDGPRCECMPGYAGD
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CCDS75 TCVDGINNYTCLCPPEYTGELCEEKLDFCAQDLNPCQHDSKCILTPKGFKCDCTPGYVGE
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pF1KSD NCSENQDDCRDHRCQNGAQCMDEVNSYSCLCAEGYSGQLCEIPPHLPAPK-SPCEGTECQ
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CCDS75 HCDIDFDDCQDNKCKNGAHCTDAVNGYTCICPEGYSGLFCEFSPPMVLPRTSPCDNFDCQ
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pF1KSD NGANCVDQGNRPVCQCLPGFGGPECEKLLSVNFVDRDTYLQFTDLQNWPRANITLQVSTA
       :::.:. . :.:.::::::. : .::::.::::.....:::. . .  :..:::::..: 
CCDS75 NGAQCIVRINEPICQCLPGYQGEKCEKLVSVNFINKESYLQIPSAKVRPQTNITLQIATD
          1130      1140      1150      1160      1170      1180   

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pF1KSD EDNGILLYNGDNDHIAVELYQGHVRVSYDPGSYPSSAIYSAETINDGQFHTVELVAFDQM
       ::.:::::.::.::::::::.:.::.::: ::.:.:::::.::::::.:: :::.:.:: 
CCDS75 EDSGILLYKGDKDHIAVELYRGRVRASYDTGSHPASAIYSVETINDGNFHIVELLALDQS
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pF1KSD VNLSIDGGSPMTMDNFGKHYTLNSEAPLYVGGMPVDVNSAAFRLWQILNGTGFHGCIRNL
       ..::.:::.:  . :..:. ::: ..::::::::   : :..:     :::.::::::::
CCDS75 LSLSVDGGNPKIITNLSKQSTLNFDSPLYVGGMPGKSNVASLRQAPGQNGTSFHGCIRNL
          1250      1260      1270      1280      1290      1300   

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pF1KSD YINNELQDFTKTQMKPGVVPGCEPCRKLYCLHGICQPNATPGPMCHCEAGWVGLHCDQPA
       :::.::::: :. :. :..::::::.:  : :: :::..  :  :.:. ::.:  ::: .
CCDS75 YINSELQDFQKVPMQTGILPGCEPCHKKVCAHGTCQPSSQAGFTCECQEGWMGPLCDQRT
          1310      1320      1330      1340      1350      1360   

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pF1KSD DGPCHGHKCVHGQCVPLDALSYSCQCQDGYSGALCNQAGALAEPCRGLQCLHGHCQASGT
       . :: :.::::: :.:..:.::::.: .:..:.::..   : .::....: ::.:. :: 
CCDS75 NDPCLGNKCVHGTCLPINAFSYSCKCLEGHGGVLCDEEEDLFNPCQAIKCKHGKCRLSGL
          1370      1380      1390      1400      1410      1420   

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pF1KSD KGAHCVCDPGFSGELCEQESECRGDPVRDFHQVQRGYAICQTTRPLSWVECRGSCPGQGC
          .: :. :..:. :..:  :::. .::..: :.::: ::::. .: .::::.: :  :
CCDS75 GQPYCECSSGYTGDSCDREISCRGERIRDYYQKQQGYAACQTTKKVSRLECRGGCAGGQC
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pF1KSD CQGLRLKRRKFTFECSDGTSFAEEVEKPTKCGCALCA 
       :  :: ::::..:::.::.::..:::: .::::. :  
CCDS75 CGPLRSKRRKYSFECTDGSSFVDEVEKVVKCGCTRCVS
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>>CCDS4369.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5                (1523 aa)
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pF1KSD MALTPGWGSSAGPVRPELWLLLWAAAWRLG--ASACPALCTCTGTTVDCHGTGLQAIPKN
         ..:::.. .. :: .: : :  :.   :  : :::. :::....::::: ::.:.:..
CCDS43   MAPGWAGVGAAVRARLALALALASVLSGPPAVACPTKCTCSAASVDCHGLGLRAVPRG
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pF1KSD IPRNTERLELNGNNITRIHKNDFAGLKQLRVLQLMENQIGVVERGAFDDMKELERLRLNR
       ::::.:::.:. :::::: : ::::::.::::.: .::..:.:::::.:.:.:::::::.
CCDS43 IPRNAERLDLDRNNITRITKMDFAGLKNLRVLHLEDNQVSVIERGAFQDLKQLERLRLNK
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pF1KSD NQLHMLPELLFQNNQALSRLDLSENAIQAIPRKAFRGATDLKNLQLDKNQISCIEEGAFR
       :.:..:::::::..  :.::::::: ::.:::::::: ::.::::::.:.:::::.::::
CCDS43 NKLQVLPELLFQSTPKLTRLDLSENQIQGIPRKAFRGITDVKNLQLDNNHISCIEDGAFR
      120       130       140       150       160       170        

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pF1KSD ALRGLEVLTLNNNNITTIPVSSFNHMPKLRTFRLHSNHLFCDCHLAWLSQWLRQRPTIGL
       ::: ::.::::::::. : :.:::::::.::.:::::::.:::::::::.::::: :.: 
CCDS43 ALRDLEILTLNNNNISRILVTSFNHMPKIRTLRLHSNHLYCDCHLAWLSDWLRQRRTVGQ
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pF1KSD FTQCSGPASLRGLNVAEVQKSEFSCSGQGEAGRVPTCTLSSGSCPAMCTCSNGIVDCRGK
       :: : .:. :::.:::.:::.:. : .    .. :.:. .: :::. :::::.:::::::
CCDS43 FTLCMAPVHLRGFNVADVQKKEYVCPAP--HSEPPSCNANSISCPSPCTCSNNIVDCRGK
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pF1KSD GLTAIPANLPETMTEIRLELNGIKSIPPGAFSPYRKLRRIDLSNNQIAEIAPDAFQGLRS
       ::  ::::::: ..::::: :.::.:: :::. :.::.:::.:.:::..:::::::::.:
CCDS43 GLMEIPANLPEGIVEIRLEQNSIKAIPAGAFTQYKKLKRIDISKNQISDIAPDAFQGLKS
        300       310       320       330       340       350      

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pF1KSD LNSLVLYGNKITDLPRGVFGGLYTLQLLLLNANKINCIRPDAFQDLQNLSLLSLYDNKIQ
       :.::::::::::.. .:.: :: .:::::::::::::.: ..:::::::.::::::::.:
CCDS43 LTSLVLYGNKITEIVKGLFDGLVSLQLLLLNANKINCLRVNTFQDLQNLNLLSLYDNKLQ
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pF1KSD SLAKGTFTSLRAIQTLHLAQNPFICDCNLKWLADFLRTNPIETSGARCASPRRLANKRIG
       ...:: :. :..:::::::::::.:::.::::::.:. ::::::::::.::::::::::.
CCDS43 TISKGLFAPLQSIQTLHLAQNPFVCDCHLKWLADYLQDNPIETSGARCSSPRRLANKRIS
        420       430       440       450       460       470      

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pF1KSD QIKSKKFRCSAKEQYFIPGTEDYQ--LNSECNSDVVCPHKCRCEANVVECSSLKLTKIPE
       ::::::::::        :.:::.  ..:::  :.:::.:::::...:.::. ::..:: 
CCDS43 QIKSKKFRCS--------GSEDYRSRFSSECFMDLVCPEKCRCEGTIVDCSNQKLVRIPS
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pF1KSD RIPQSTAELRLNNNEISILEATGMFKKLTHLKKINLSNNKVSEIEDGAFEGAASVSELHL
       ..:. ...::::.::.:.:::::.:::: .:.::::::::..:...:::.:::::.:: :
CCDS43 HLPEYVTDLRLNDNEVSVLEATGIFKKLPNLRKINLSNNKIKEVREGAFDGAASVQELML
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pF1KSD TANQLESIRSGMFRGLDGLRTLMLRNNRISCIHNDSFTGLRNVRLLSLYDNQITTVSPGA
       :.::::.... .::::.::.:::::.: :.:. ::.:.:: .:::::::::.:::..:::
CCDS43 TGNQLETVHGRVFRGLSGLKTLMLRSNLIGCVSNDTFAGLSSVRLLSLYDNRITTITPGA
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       : :: ::::.:::.:::::::.::::: :::::.::.::::::.: ::..::.::::. :
CCDS43 FTTLVSLSTINLLSNPFNCNCHLAWLGKWLRKRRIVSGNPRCQKPFFLKEIPIQDVAIQD
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pF1KSD FRCEEGQEEGGCLPRPQCPQECACLDTVVRCSNKHLRALPKGIPKNVTELYLDGNQFTLV
       : :. :.::..:   :.::..:.:..:::::::: :::::.:.::.::::::.::..: :
CCDS43 FTCD-GNEESSCQLSPRCPEQCTCMETVVRCSNKGLRALPRGMPKDVTELYLEGNHLTAV
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pF1KSD PGQLSTFKYLQLVDLSNNKISSLSNSSFTNMSQLTTLILSYNALQCIPPLAFQGLRSLRL
       : .::....: :.:::::.:: :.: .:.:::.:.::::::: :.:::  ::.::::::.
CCDS43 PRELSALRHLTLIDLSNNSISMLTNYTFSNMSHLSTLILSYNRLRCIPVHAFNGLRSLRV
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pF1KSD LSLHGNDISTLQEGIFADVTSLSHLAIGANPLYCDCHLRWLSSWVKTGYKEPGIARCAGP
       :.:::::::.. :: : :.:::::::.:.:::.::: ::::: :::.::::::::::..:
CCDS43 LTLHGNDISSVPEGSFNDLTSLSHLALGTNPLHCDCSLRWLSEWVKAGYKEPGIARCSSP
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pF1KSD QDMEGKLLLTTPAKKFECQGPPTLAVQAKCDLCLSSPCQNQGTCHNDPLEVYRCACPSGY
       . :  .::::::...:.:.::  . . :::. ::::::.:.::: .::.:.:::::: .:
CCDS43 EPMADRLLLTTPTHRFQCKGPVDINIVAKCNACLSSPCKNNGTCTQDPVELYRCACPYSY
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pF1KSD KGRDCEVSLDSCSSGPCENGGTCHAQEGEDAPFTCSCPTGFEGPTCGVNTDDCVDHACAN
       ::.:: : ...: ..::..::::: ....   :.:::: ::::  : .: ::: :. : :
CCDS43 KGKDCTVPINTCIQNPCQHGGTCHLSDSHKDGFSCSCPLGFEGQRCEINPDDCEDNDCEN
       950       960       970       980       990      1000       

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pF1KSD GGVCVDGVGNYTCQCPLQYEGKACEQLVDLCSPDLNPCQHEAQCVGTPDGPRCECMPGYA
       ...::::..::.: :: .: :. :....: : :.:: :::::.:.    :  :::.:::.
CCDS43 NATCVDGINNYVCICPPNYTGELCDEVIDHCVPELNLCQHEAKCIPLDKGFSCECVPGYS
      1010      1020      1030      1040      1050      1060       

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pF1KSD GDNCSENQDDCRDHRCQNGAQCMDEVNSYSCLCAEGYSGQLCEIPPHLPAPK-SPCEGTE
       :  :  ..:::  :.:..::::.: .:.:.: : .:.:: .:: :: .   . :::.  :
CCDS43 GKLCETDNDDCVAHKCRHGAQCVDTINGYTCTCPQGFSGPFCEHPPPMVLLQTSPCDQYE
      1070      1080      1090      1100      1110      1120       

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       :::::.:.   ..:.:.: :::.::.::::..:::: .:.:..... .  :.:::.:::.
CCDS43 CQNGAQCIVVQQEPTCRCPPGFAGPRCEKLITVNFVGKDSYVELASAKVRPQANISLQVA
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pF1KSD TAEDNGILLYNGDNDHIAVELYQGHVRVSYDPGSYPSSAIYSAETINDGQFHTVELVAFD
       : .:::::::.:::: .:.::::::::. ::  : : ...::.::.::::::.::::...
CCDS43 TDKDNGILLYKGDNDPLALELYQGHVRLVYDSLSSPPTTVYSVETVNDGQFHSVELVTLN
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pF1KSD QMVNLSIDGGSPMTMDNFGKHYTLNSEAPLYVGGMPVDVNSAAFRLWQILNGTGFHGCIR
       : .:: .: :.: .. .. :. ... ..:::.::.:.... .:.:        ::::::.
CCDS43 QTLNLVVDKGTPKSLGKLQKQPAVGINSPLYLGGIPTSTGLSALRQGTDRPLGGFHGCIH
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pF1KSD NLYINNELQDFTKTQMKP-GVVPGCEPCRKLYCLHGICQPNATPGPMCHCEAGWVGLHCD
       .. ::::::::     .  :: :::. :    : ::.:.     . .:.:. ::.:  ::
CCDS43 EVRINNELQDFKALPPQSLGVSPGCKSCT--VCKHGLCRSVEKDSVVCECRPGWTGPLCD
      1310      1320      1330        1340      1350      1360     

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pF1KSD QPADGPCHGHKCVHGQCVPLDALSYSCQCQDGYSGALCNQAGALAEPCRGLQCLHGHCQA
       : :  :: ::.: ::.::   . :: :.: .::.: ::.. .  :. : ...: ::.:. 
CCDS43 QEARDPCLGHRCHHGKCVATGT-SYMCKCAEGYGGDLCDNKNDSANACSAFKCHHGQCHI
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pF1KSD SGTKGAHCVCDPGFSGELCEQESECRGDPVRDFHQVQRGYAICQTTRPLSWVECRGSCPG
       :     .:.:.:::::: :.::. : :. ::.  . :.::: : :.  .  .::::.: :
CCDS43 SDQGEPYCLCQPGFSGEHCQQENPCLGQVVREVIRRQKGYASCATASKVPIMECRGGC-G
         1430      1440      1450      1460      1470      1480    

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pF1KSD QGCCQGLRLKRRKFTFECSDGTSFAEEVEKPTKCGCALCA
         :::  : ::::..:.:.::.::.::::.  .:::  :.
CCDS43 PQCCQPTRSKRRKYVFQCTDGSSFVEEVERHLECGCLACS
          1490      1500      1510      1520   

>>CCDS13112.1 JAG1 gene_id:182|Hs108|chr20                (1218 aa)
 initn: 881 init1: 282 opt: 844  Z-score: 492.2  bits: 103.5 E(32554): 4.3e-21
Smith-Waterman score: 902; 28.9% identity (51.8% similar) in 629 aa overlap (867-1463:248-828)

        840       850       860       870       880       890      
pF1KSD LSLHGNDISTLQEGIFADVTSLSHLAIGANPLYCDCHLRWLSSWVKTGYKEPGIARCAGP
                                     :  : :.  : . .      .::   :   
CCDS13 KTCMEGWMGPECNRAICRQGCSPKHGSCKLPGDCRCQYGWQGLYCDKCIPHPG---C---
       220       230       240       250       260       270       

        900       910       920           930        940       950 
pF1KSD QDMEGKLLLTTPAKKFECQGPPTLAVQAKCD----LCLS-SPCQNQGTCHNDPLEVYRCA
         ..:  . . :   ..:    . . :  ::     : . .:: : ::: :   . :.:.
CCDS13 --VHG--ICNEP---WQCLCETNWGGQL-CDKDLNYCGTHQPCLNGGTCSNTGPDKYQCS
                    280       290        300       310       320   

             960       970       980       990      1000      1010 
pF1KSD CPSGYKGRDCEVSLDSCSSGPCENGGTCHAQEGEDAPFTCSCPTGFEGPTCGVNTDDCVD
       :: ::.: .::..  .: : ::.: :.:.     .  : : :  :. ::::..: :::  
CCDS13 CPEGYSGPNCEIAEHACLSDPCHNRGSCKET---SLGFECECSPGWTGPTCSTNIDDCSP
           330       340       350          360       370       380

            1020      1030      1040      1050      1060      1070 
pF1KSD HACANGGVCVDGVGNYTCQCPLQYEGKACEQLVDLCSPDLNPCQHEAQCVGTPDGPRCEC
       . :..::.: : :... : :: :. ::.:.  .. :  . .:: .  .: .   .  :.:
CCDS13 NNCSHGGTCQDLVNGFKCVCPPQWTGKTCQLDANEC--EAKPCVNAKSCKNLIASYYCDC
              390       400       410         420       430        

            1080      1090      1100      1110      1120      1130 
pF1KSD MPGYAGDNCSENQDDCRDHRCQNGAQCMDEVNSYSCLCAEGYSGQLCEIPPHLPAPKSPC
       .::. :.::. : .::  . ::: :.: : ::.: :.:  ::.:. ::         . :
CCDS13 LPGWMGQNCDININDCLGQ-CQNDASCRDLVNGYRCICPPGYAGDHCE------RDIDEC
      440       450        460       470       480             490 

            1140      1150      1160      1170      1180      1190 
pF1KSD EGTECQNGANCVDQGNRPVCQCLPGFGGPECEKLLSVNFVDRDTYLQFTDLQNWPRANIT
        .. : ::..: .. ::  : :  ::.:  :.  :.... . .   .    : . ::.  
CCDS13 ASNPCLNGGHCQNEINRFQCLCPTGFSGNLCQ--LDIDYCEPNPCQN--GAQCYNRASDY
             500       510       520         530         540       

            1200       1210      1220      1230      1240      1250
pF1KSD LQVSTAEDNGILLYNGDN-DHIAVELYQGHVRVSYDPGSYPSSAIYSAETINDGQFHTVE
       .  .  ::     :.: : .:.     . : :..        .. ....   .:  .   
CCDS13 F-CKCPED-----YEGKNCSHL-----KDHCRTTPCEVIDSCTVAMASNDTPEGVRYISS
        550            560            570       580       590      

             1260      1270            1280        1290       1300 
pF1KSD LVAFDQMVNLSIDGGSPMTMD-NFG-----KHYTLNS--EAPLYVGGMPVD-VNSAAFRL
        :   .    : .::. .: : : :      : ..:.    :   ::  .: :::     
CCDS13 NVCGPHGKCKSQSGGK-FTCDCNKGFTGTYCHENINDCESNPCRNGGTCIDGVNSYKCIC
        600       610        620       630       640       650     

                1310      1320           1330      1340      1350  
pF1KSD ---WQ-ILNGTGFHGCIRNLYIN-----NELQDFTKTQMKPGVVPGCEPCRKLYCLHGIC
          :.     :... : .:   :     . ..::   . : :        :   : .. :
CCDS13 SDGWEGAYCETNINDCSQNPCHNGGTCRDLVNDFY-CDCKNGWKGKTCHSRDSQCDEATC
         660       670       680       690        700       710    

              1360        1370      1380       1390      1400      
pF1KSD QPNAT---PGPM--CHCEAGWVGLHCDQPADGPCHGHKCVHG-QCVPLDALSYSCQCQDG
       . ..:    :    : : .:: :  :.   .. :  . : .:  :: ... :..: :..:
CCDS13 NNGGTCYDEGDAFKCMCPGGWEGTTCNIARNSSCLPNPCHNGGTCV-VNGESFTCVCKEG
          720       730       740       750       760        770   

       1410      1420       1430      1440      1450       1460    
pF1KSD YSGALCNQAGALAEPCRGLQCLH-GHCQASGTKGAHCVCDPGFSGELCEQE-SECRGDPV
       . : .: :    .. :    : . : : ..: .  .: : :::.:  :. . .::...: 
CCDS13 WEGPICAQN---TNDCSPHPCYNSGTC-VDGDNWYRCECAPGFAGPDCRININECQSSPC
           780          790        800       810       820         

         1470      1480      1490      1500      1510      1520    
pF1KSD RDFHQVQRGYAICQTTRPLSWVECRGSCPGQGCCQGLRLKRRKFTFECSDGTSFAEEVEK
                                                                   
CCDS13 AFGATCVDEINGYRCVCPPGHSGAKCQEVSGRPCITMGSVIPDGAKWDDDCNTCQCLNGR
     830       840       850       860       870       880         

>>CCDS34420.1 NOTCH4 gene_id:4855|Hs108|chr6              (2003 aa)
 initn: 753 init1: 262 opt: 822  Z-score: 478.0  bits: 101.6 E(32554): 2.6e-20
Smith-Waterman score: 963; 27.8% identity (48.1% similar) in 899 aa overlap (694-1530:47-832)

           670       680       690        700       710       720  
pF1KSD STLNLLANPFNCNCQLAWLGGWLRKRKIVTGNPRCQ-NPDFLRQIPLQDVAFPDFRCEEG
                                     :.  ::  : :: .       :::  :...
CCDS34 CVSVVRPRGLLCGSFPEPCANGGTCLSLSLGQGTCQCAPGFLGET----CQFPD-PCQNA
         20        30        40        50        60             70 

                  730                 740         750       760    
pF1KSD Q--EEGG-C---LPRP----QCPQE------CACLD--TVVRCSNKHLRALPKGIPKNVT
       :  ..:: :   :: :    . :.       :.::   :  ::. :     : .. ..  
CCDS34 QLCQNGGSCQALLPAPLGLPSSPSPLTPSFLCTCLPGFTGERCQAKLEDPCPPSFCSKRG
              80        90       100       110       120       130 

          770          780       790       800       810       820 
pF1KSD ELYLDGN---QFTLVPGQLSTFKYLQLVDLSNNKISSLSNSSFTNMSQLTTLILSYNALQ
       . .....   : . .::   : .  :: :. .      .:   ..   :.:    :  .:
CCDS34 RCHIQASGRPQCSCMPGW--TGEQCQLRDFCS------ANPCVNGGVCLAT----YPQIQ
             140         150       160             170             

             830       840       850       860       870       880 
pF1KSD CIPPLAFQGLRSLRLLSLHGNDISTLQEGIFADVTSLSHLAIGANPLYCDCHLRWLSSWV
       :  : .:.:    : ..   .: .   .:     ::  : ..:.  . : : .       
CCDS34 CHCPPGFEGHACERDVNECFQDPGPCPKG-----TS-CHNTLGS--FQCLCPV-------
     180       190       200            210          220           

             890          900             910        920           
pF1KSD KTGYKEPGIARC---AGPQDMEGK------LLLTTPAKKFE-CQGPPTLAVQAKC----D
         : . :   ::   :::   .:        :.    . :. :  :: . .   :    :
CCDS34 --GQEGP---RCELRAGPCPPRGCSNGGTCQLMPEKDSTFHLCLCPPGF-IGPDCEVNPD
               230       240       250       260        270        

       930       940       950       960        970         980    
pF1KSD LCLSSPCQNQGTCHNDPLEVYRCACPSGYKGRDCEVSLDSC-SSGP--CENGGTCHAQEG
        :.:  ::: :::. : :..: : ::  . : ::  ..: : ..::  :.:::::. . :
CCDS34 NCVSHQCQNGGTCQ-DGLDTYTCLCPETWTGWDCSEDVDECETQGPPHCRNGGTCQNSAG
      280       290        300       310       320       330       

          990      1000      1010      1020      1030      1040    
pF1KSD EDAPFTCSCPTGFEGPTCGVNTDDCVDHACANGGVCVDGVGNYTCQCPLQYEGKACEQLV
           : : : .:. : .:  : :::.  .:: :..:.: ::...: ::    :  : .: 
CCDS34 S---FHCVCVSGWGGTSCEENLDDCIAATCAPGSTCIDRVGSFSCLCPPGRTGLLC-HLE
          340       350       360       370       380       390    

         1050      1060        1070      1080      1090            
pF1KSD DLCSPDLNPCQHEAQCVGTP-DGPR-CECMPGYAGDNCSENQDDCRDHR-----CQNGAQ
       :.:    .::. .:::  .:  :   : :.:::.: .: .. :.:   .     :..:..
CCDS34 DMCLS--QPCHGDAQCSTNPLTGSTLCLCQPGYSGPTCHQDLDECLMAQQGPSPCEHGGS
             400       410       420       430       440       450 

      1100      1110      1120      1130      1140      1150       
pF1KSD CMDEVNSYSCLCAEGYSGQLCEIPPHLPAPKSPCEGTECQNGANCVDQGNRPVCQCLPGF
       :..  .:..:::  ::.:. ::      : .. : .  :. :..:.:      : : ::.
CCDS34 CLNTPGSFNCLCPPGYTGSRCE------ADHNECLSQPCHPGSTCLDLLATFHCLCPPGL
             460       470             480       490       500     

      1160      1170      1180      1190      1200      1210       
pF1KSD GGPECEKLLSVNFVDRDTYLQFTDLQNWPRANITLQVSTAEDNGILLYNGDNDHIAVELY
        :  ::  . .:       :. .: ..                   : ::  . : .  .
CCDS34 EGQLCE--VETNECASAPCLNHADCHD-------------------LLNG-FQCICLPGF
         510         520       530                           540   

      1220      1230      1240        1250      1260      1270     
pF1KSD QGHVRVSYDPGSYPSSAIYSAETIND--GQFHTVELVAFDQMVNLSIDGGSPMTMDNFGK
       .: .:   :     ::   ..   .:  : ::   : .:.          .:  . .  .
CCDS34 SG-TRCEEDIDECRSSPCANGGQCQDQPGAFHCKCLPGFE----------GPRCQTEVDE
            550       560       570       580                 590  

        1280      1290      1300      1310             1320        
pF1KSD HYTLNSEAPLYVGGMPVDVNSAAFRLWQILNGTGFHG-------CIRNLYINNELQDFTK
          :..  :  ::.  .:. .: :     :  .:: :       :  ::   ...    :
CCDS34 --CLSDPCP--VGASCLDLPGAFF----CLCPSGFTGQLCEVPLCAPNLCQPKQICKDQK
                600       610           620       630       640    

     1330         1340       1350      1360      1370      1380    
pF1KSD TQ---MKPGVVPGCEPCR-KLYCLHGICQPNATPGPMCHCEAGWVGLHCDQPADGPCHGH
        .   . :   ::: : . .  : :: :: ..     : :..::.: .:.    : : . 
CCDS34 DKANCLCPDGSPGCAPPEDNCTCHHGHCQRSS-----CVCDVGWTGPECEAELGG-CISA
          650       660       670            680       690         

          1390      1400      1410      1420      1430      1440   
pF1KSD KCVHG-QCVPLDALSYSCQCQDGYSGALCNQAGALAEPCRGLQCLHGHCQASGTKGAHCV
        :.::  : :  . .:.: :  ::.:  :..       :..  ::.:     .  : .:.
CCDS34 PCAHGGTCYPQPS-GYNCTCPTGYTGPTCSEE---MTACHSGPCLNGGSCNPSPGGYYCT
      700       710        720          730       740       750    

          1450       1460      1470      1480      1490       1500 
pF1KSD CDPGFSGELCEQESE-CRGDPVRDFHQVQRGYAICQTTRPLSWVECRGSCPGQGC-CQGL
       : :. .:  :.  .. : . :   :.      . : ..:: ..  :  .   ::  :.: 
CCDS34 CPPSHTGPQCQTSTDYCVSAPC--FNG-----GTC-VNRPGTF-SCLCAMGFQGPRCEG-
          760       770              780         790       800     

            1510      1520      1530                               
pF1KSD RLKRRKFTFECSDGTSFAEEVEKPTKCGCALCA                           
       .:.       : . ..  .  . : .: :                               
CCDS34 KLRPSCADSPCRNRATCQDSPQGP-RCLCPTGYTGGSCQTLMDLCAQKPCPRNSHCLQTG
          810       820        830       840       850       860   

>>CCDS5313.1 DLL1 gene_id:28514|Hs108|chr6                (723 aa)
 initn: 648 init1: 261 opt: 809  Z-score: 474.8  bits: 99.5 E(32554): 4e-20
Smith-Waterman score: 828; 37.4% identity (58.4% similar) in 305 aa overlap (867-1166:240-520)

        840       850       860       870       880       890      
pF1KSD LSLHGNDISTLQEGIFADVTSLSHLAIGANPLYCDCHLRWLSSWVKTGYKEPGI--ARCA
                                     :  : :.. : . .     . ::   . : 
CCDS53 KVCNPGWKGPYCTEPICLPGCDEQHGFCDKPGECKCRVGWQGRYCDECIRYPGCLHGTCQ
     210       220       230       240       250       260         

          900       910        920       930        940       950  
pF1KSD GPQDMEGKLLLTTPAKKFECQ-GPPTLAVQAKCDLCLS-SPCQNQGTCHNDPLEVYRCAC
        :              . .:: :   :  .   . :   .::.: .:: :     : :.:
CCDS53 QPW-------------QCNCQEGWGGLFCNQDLNYCTHHKPCKNGATCTNTGQGSYTCSC
     270                    280       290       300       310      

            960       970       980       990      1000      1010  
pF1KSD PSGYKGRDCEVSLDSCSSGPCENGGTCHAQEGEDAPFTCSCPTGFEGPTCGVNTDDCVDH
         :: :  ::...: :. .::.:::.:   :.    ..:.:: :: :  : ...  :.: 
CCDS53 RPGYTGATCELGIDECDPSPCKNGGSCTDLEN---SYSCTCPPGFYGKICELSAMTCADG
        320       330       340          350       360       370   

           1020       1030      1040      1050      1060      1070 
pF1KSD ACANGGVCVDGV-GNYTCQCPLQYEGKACEQLVDLCSPDLNPCQHEAQCVGTPDGPRCEC
        : ::: : :.  :.:.:.::. : :  ::. .: ::   .::.. :.::   :.  :.:
CCDS53 PCFNGGRCSDSPDGGYSCRCPVGYSGFNCEKKIDYCSS--SPCSNGAKCVDLGDAYLCRC
           380       390       400       410         420       430 

            1080      1090      1100      1110      1120      1130 
pF1KSD MPGYAGDNCSENQDDCRDHRCQNGAQCMDEVNSYSCLCAEGYSGQLCEIPPHLPAPKSPC
       . :..: .:..: ::: .  : ::. : : ::..:: :  ::.:. :       :: : :
CCDS53 QAGFSGRHCDDNVDDCASSPCANGGTCRDGVNDFSCTCPPGYTGRNCS------APVSRC
             440       450       460       470             480     

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pF1KSD EGTECQNGANCVDQGNRPVCQCLPGFGGPECEKLLSVNFVDRDTYLQFTDLQNWPRANIT
       : . :.:::.: ..:.: ::.:  :.:::.:. ::                         
CCDS53 EHAPCHNGATCHERGHRYVCECARGYGGPNCQFLLPELPPGPAVVDLTEKLEGQGGPFPW
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pF1KSD LQVSTAEDNGILLYNGDNDHIAVELYQGHVRVSYDPGSYPSSAIYSAETINDGQFHTVEL
                                                                   
CCDS53 VAVCAGVILVLMLLLGCAAVVVCVRLRLQKHRPPADPCRGETETMNNLANCQREKDISVS
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                                     : .. :.  . : :           :.. :
CCDS12 CLCPPGWVGERCQLEDPCHSGPCAGRGVCQSSVVAGTARFSCRC---------PRGFRGP
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pF1KSD GIAR---CAGPQDMEGKLLLTTPAKKFECQGPPTL---AVQAKCDLC-LSSPCQNQGTCH
         .    : .    .:    . :  .: :. ::     . ..  : : .. ::.. ::: 
CCDS12 DCSLPDPCLSSPCAHGARCSVGPDGRFLCSCPPGYQGRSCRSDVDECRVGEPCRHGGTCL
         120       130       140       150       160       170     

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pF1KSD NDPLEVYRCACPSGYKGRDCEVSLDSCSSGPCENGGTCHAQEGEDAPFTCSCPTGFEGPT
       : :   .:: ::.:: :  ::     :. .::.:::::. : : :  . :.:  :::: .
CCDS12 NTP-GSFRCQCPAGYTGPLCENPAVPCAPSPCRNGGTCR-QSG-DLTYDCACLPGFEGQN
          180       190       200       210         220       230  

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pF1KSD CGVNTDDCVDHACANGGVCVDGVGNYTCQCPLQYEGKACEQLVDLCSPDLNPCQHEAQCV
       : ::.:::  : : :::.:::::..:.:::: .. :. : . :: :. . : :.. . : 
CCDS12 CEVNVDDCPGHRCLNGGTCVDGVNTYNCQCPPEWTGQFCTEDVDECQLQPNACHNGGTCF
            240       250       260       270       280       290  

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pF1KSD GTPDGPRCECMPGYAGDNCSENQDDCRDHRCQNGAQCMDEVNSYSCLCAEGYSGQLCEIP
       .:  :  : :. :..:..::.: :::    : .:: : :.: :. : :  : .: ::   
CCDS12 NTLGGHSCVCVNGWTGESCSQNIDDCATAVCFHGATCHDRVASFYCACPMGKTGLLC---
            300       310       320       330       340            

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pF1KSD PHLPAPKSPCEGTECQNGANCVDQ--GNRPVCQCLPGFGGPECEKLLSVNFVDRDTYLQF
        ::    . : .. :.. : :  .  ..: .: : ::: :  :..       : :     
CCDS12 -HLD---DACVSNPCHEDAICDTNPVNGRAICTCPPGFTGGACDQ-------DVDE----
      350          360       370       380       390               

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pF1KSD TDLQNWPRANITLQVSTAEDNGILLYNGDNDHIAVELYQGHVRVSYDPGSYPSSAIYSAE
        ..   :  ..   :.:  ....:   : .       : :  :   : .   :.   .  
CCDS12 CSIGANPCEHLGRCVNT--QGSFLCQCGRG-------YTGP-RCETDVNECLSGPCRNQA
          400       410         420               430       440    

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pF1KSD TIND--GQFHTVELVAFD-QMVNLSID--GGSPMTMDNFGKHYT--LNSEAPLYVGGMPV
       :  :  :::  . ...:   . ...::   .:: .  .  :  .  ..   :   .:   
CCDS12 TCLDRIGQFTCICMAGFTGTYCEVDIDECQSSPCVNGGVCKDRVNGFSCTCPSGFSGSTC
          450       460       470       480       490       500    

           1300      1310        1320      1330        1340        
pF1KSD DVNSAAFRLWQILNGTGFHGCIR--NLYINNELQDFTKTQMKPGVVPGC--EPCRKLYCL
       ...          ::.    :.   . :     . :  : .    :  :  .::..  :.
CCDS12 QLDVDECASTPCRNGA---KCVDQPDGYECRCAEGFEGT-LCDRNVDDCSPDPCHHGRCV
          510       520          530       540        550       560

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pF1KSD HGICQPNATPGPMCHCEAGWVGLHCDQPADGPCHGHKCVHG-QCVPLDALSYSCQCQDGY
        :: . .      : :  :..: .:.. .:  :... : :: .:. : . .: :.: .: 
CCDS12 DGIASFS------CACAPGYTGTRCESQVD-ECRSQPCRHGGKCLDL-VDKYLCRCPSGT
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pF1KSD SGALCNQAGALAEPCRGLQCLHGHCQASGTKGAHCVCDPGFSGELCEQE-SECRGDPVRD
       .:. :.      . : .  :  : :. .: .   :::.:::.: ::. : .:: ..:   
CCDS12 TGVNCEVN---IDDCASNPCTFGVCR-DGINRYDCVCQPGFTGPLCNVEINECASSPCGE
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       1470      1480      1490      1500      1510      1520      
pF1KSD FHQVQRGYAICQTTRPLSWVECRGSCPGQGCCQGLRLKRRKFTFECSDGTSFAEEVEKPT
                                                                   
CCDS12 GGSCVDGENGFRCLCPPGSLPPLCLPPSHPCAHEPCSHGICYDAPGGFRCVCEPGWSGPR
      670       680       690       700       710       720        

>--
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pF1KSD KEPGIARCAGPQDMEGKLLLTTPAKKFECQGPPTLAVQAKCDLCLSSPCQNQGTCHNDPL
                                     ::      :. : : :.::.  ::: .: .
CCDS12 SHPCAHEPCSHGICYDAPGGFRCVCEPGWSGPRCSQSLAR-DACESQPCRAGGTCSSDGM
         700       710       720       730        740       750    

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pF1KSD EVYRCACPSGYKGRDCEVSLDSCSSGPCENGGTCHAQEGEDAPFTCSCPTGFEGPTCGVN
         ..:.:: : .::.::. :. :. .:::.:: :..  :.  : .:::: :..:: :  .
CCDS12 G-FHCTCPPGVQGRQCEL-LSPCTPNPCEHGGRCESAPGQ-LP-VCSCPQGWQGPRCQQD
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pF1KSD TDDCVDHA-CANGGVCVDGVGNYTCQCPLQYEGKACEQLVDLCSPDLNPCQHEAQCVGTP
       .:.:.  : :.  :.:.. .:...: :   : : .:.: .. :.:  ::: . ..:    
CCDS12 VDECAGPAPCGPHGICTNLAGSFSCTCHGGYTGPSCDQDINDCDP--NPCLNGGSCQDGV
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         1070      1080      1090      1100      1110      1120    
pF1KSD DGPRCECMPGYAGDNCSENQDDCRDHRCQNGAQCMDEVNSYSCLCAEGYSGQLCEIPPHL
        .  : :.::.::  :... :.: .. :  :. : :.: :..: :  ::.:  ::    :
CCDS12 GSFSCSCLPGFAGPRCARDVDECLSNPCGPGT-CTDHVASFTCTCPPGYGGFHCE--QDL
      870       880       890       900        910       920       

         1130      1140      1150      1160      1170      1180    
pF1KSD PAPKSPCEGTECQNGANCVDQGNRPVCQCLPGFGGPECEKLLSVNFVDRDTYLQFTDLQN
       :     :  . : ::..:::  :   : : ::. : .:..       . :  :.      
CCDS12 P----DCSPSSCFNGGTCVDGVNSFSCLCRPGYTGAHCQH-------EADPCLS------
             930       940       950       960                     

         1190      1200      1210      1220      1230      1240    
pF1KSD WPRANITLQVSTAEDNGILLYNGDNDHIAVELYQGHVRVSYDPGSYPSSAIYSAETINDG
         :  .   : .:   :.           .: . :       :         : .  ..:
CCDS12 --RPCLHGGVCSAAHPGFRC-------TCLESFTG-------PQCQTLVDWCSRQPCQNG
        970       980              990             1000      1010  

         1250      1260      1270      1280      1290      1300    
pF1KSD QFHTVELVAFDQMVNLSIDGGSPMTMDNFGKHYTLNSEAPLYVGGMPVDVNSAAFRLWQI
         . :.  :.     :   : :       :.   . :  :   ..  . :     :: :.
CCDS12 G-RCVQTGAY----CLCPPGWS-------GRLCDIRS-LPCREAAAQIGV-----RLEQL
            1020                 1030       1040           1050    

         1310      1320      1330        1340          1350        
pF1KSD LNGTGFHGCIRNLYINNELQDFTKTQMKPGVVPG--CE----PCRKLYCLHGICQPNATP
        .. :   :.         .: ..  . :    :  ::    ::    : ::    .   
CCDS12 CQAGG--QCVD--------EDSSHYCVCPEGRTGSHCEQEVDPCLAQPCQHGGTCRGYMG
           1060              1070      1080      1090      1100    

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pF1KSD GPMCHCEAGWVGLHCDQPADGPCHGHKCVHG-QCVPLDALSYSCQCQDGYSGALC----N
       : ::.:  :. : .:.. .:  : .. : :: .:. : :  : :.:  :  :.::    .
CCDS12 GYMCECLPGYNGDNCEDDVD-ECASQPCQHGGSCIDLVA-RYLCSCPPGTLGVLCEINED
         1110      1120       1130      1140       1150      1160  

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pF1KSD QAGALAEPCRGLQCLH-GHCQASGTKGAHCVCDPGFSGELCEQE-SECRGDP-----VRD
       . :       : .::: : : .. . : .:.: ::..:  :: . .:::.       .::
CCDS12 DCGPGPPLDSGPRCLHNGTC-VDLVGGFRCTCPPGYTGLRCEADINECRSGACHAAHTRD
           1170      1180       1190      1200      1210      1220 

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pF1KSD FHQVQRGYAICQTTRPLSWVECR---GSCPGQGCCQGLRLKRRKFTFECSDGTSFAEEVE
         :   :   :     .:  .:.   . : .: : .:                       
CCDS12 CLQDPGGGFRCLCHAGFSGPRCQTVLSPCESQPCQHGGQCRPSPGPGGGLTFTCHCAQPF
            1230      1240      1250      1260      1270      1280 

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pF1KSD KPTKCGCALCA                                                 
                                                                   
CCDS12 WGPRCERVARSCRELQCPVGVPCQQTPRGPRCACPPGLSGPSCRSFPGSPPGASNASCAA
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1534 residues in 1 query   sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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