Result of FASTA (ccds) for pF1KSDA0755
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA0755, 1032 aa
  1>>>pF1KSDA0755 1032 - 1032 aa - 1032 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.0870+/-0.00133; mu= -9.6520+/- 0.080
 mean_var=653.0228+/-136.114, 0's: 0 Z-trim(114.7): 84  B-trim: 414 in 1/53
 Lambda= 0.050189
 statistics sampled from 15229 (15301) to 15229 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.754), E-opt: 0.2 (0.47), width:  16
 Scan time:  3.740

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS3710.1 SEC24D gene_id:9871|Hs108|chr4          (1032) 7109 530.8 5.6e-150
CCDS7332.1 SEC24C gene_id:9632|Hs108|chr10         (1094) 3887 297.5 9.9e-80
CCDS47124.1 SEC24B gene_id:10427|Hs108|chr4        (1268) 1318 111.6 1.1e-23
CCDS43260.1 SEC24B gene_id:10427|Hs108|chr4        (1233) 1295 109.9 3.4e-23
CCDS75179.1 SEC24B gene_id:10427|Hs108|chr4        (1298) 1288 109.4 4.9e-23
CCDS43363.1 SEC24A gene_id:10802|Hs108|chr5        (1093) 1221 104.5 1.3e-21


>>CCDS3710.1 SEC24D gene_id:9871|Hs108|chr4               (1032 aa)
 initn: 7109 init1: 7109 opt: 7109  Z-score: 2806.0  bits: 530.8 E(32554): 5.6e-150
Smith-Waterman score: 7109; 99.9% identity (99.9% similar) in 1032 aa overlap (1-1032:1-1032)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MSQQGYVATPPYSQPQPGIGLSPPHYGHYGDPSHTASPTGMMKPAGPLGATATRGMLPPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 MSQQGYVATPPYSQPQPGIGLSPPHYGHYGDPSHTASPTGMMKPAGPLGATATRGMLPPG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD PPPPGPHQFGQNGAHATGHPPQRFPGPPPVNNVASSHAPYQPSAQSSYPGPISTSSVTQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 PPPPGPHQFGQNGAHATGHPPQRFPGPPPVNNVASSHAPYQPSAQSSYPGPISTSSVTQL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD GSQLSAMQINSYGSGMAPPSQGPPGPLSATSLQTPPRPPQPSILQPGSQVLPPPPTTLNG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 GSQLSAMQINSYGSGMAPPSQGPPGPLSATSLQTPPRPPQPSILQPGSQVLPPPPTTLNG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD PGASPLPLPMYRPDGLSGPPPPNAQYQPPPLPGQTLGAGYPPQQANSGPQMAGAQLSYPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 PGASPLPLPMYRPDGLSGPPPPNAQYQPPPLPGQTLGAGYPPQQANSGPQMAGAQLSYPG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD GFPGGPAQMAGPPQPQKKLDPDSIPSPIQVIENDRASRGGQVYATNTRGQIPPLVTTDCM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 GFPGGPAQMAGPPQPQKKLDPDSIPSPIQVIENDRASRGGQVYATNTRGQIPPLVTTDCM
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD IQDQGNASPRFIRCTTYCFPCTSDMAKQAQIPLAAVIKPFATIPSNESPLYLVNHGESGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 IQDQGNASPRFIRCTTYCFPCTSDMAKQAQIPLAAVIKPFATIPSNESPLYLVNHGESGP
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD VRCNRCKAYMCPFMQFIEGGRRYQCGFCNCVNDVPPFYFQHLDHIGRRLDHYEKPELSLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 VRCNRCKAYMCPFMQFIEGGRRYQCGFCNCVNDVPPFYFQHLDHIGRRLDHYEKPELSLG
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD SYEYVATLDYCRKSKPPNPPAFIFMIDVSYSNIKNGLVKLICEELKTMLEKIPKEEQEET
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 SYEYVATLDYCRKSKPPNPPAFIFMIDVSYSNIKNGLVKLICEELKTMLEKIPKEEQEET
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD SAIRVGFITYNKVLHFFNVKSNLAQPQMMVVTDVGEVFVPLLDGFLVNYQESQSVIHNLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 SAIRVGFITYNKVLHFFNVKSNLAQPQMMVVTDVGEVFVPLLDGFLVNYQESQSVIHNLL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD DQIPDMFADSNENETVFASVIQAGMEALKAADCPGKLFIFHSSLPTAEAPGKLKNRDDKK
       :::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 DQIPDMFADSNENETVFAPVIQAGMEALKAADCPGKLFIFHSSLPTAEAPGKLKNRDDKK
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD LVNTDKEKILFQPQTNVYDSLAKDCVAHGCSVTLFLFPSQYVDVASLGLVPQLTGGTLYK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 LVNTDKEKILFQPQTNVYDSLAKDCVAHGCSVTLFLFPSQYVDVASLGLVPQLTGGTLYK
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD YNNFQMHLDRQQFLNDLRNDIEKKIGFDAIMRVRTSTGFRATDFFGGILMNNTTDVEMAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 YNNFQMHLDRQQFLNDLRNDIEKKIGFDAIMRVRTSTGFRATDFFGGILMNNTTDVEMAA
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD IDCDKAVTVEFKHDDKLSEDSGALIQCAVLYTTISGQRRLRIHNLGLNCSSQLADLYKSC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 IDCDKAVTVEFKHDDKLSEDSGALIQCAVLYTTISGQRRLRIHNLGLNCSSQLADLYKSC
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD ETDALINFFAKSAFKAVLHQPLKVIREILVNQTAHMLACYRKNCASPSAASQLILPDSMK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 ETDALINFFAKSAFKAVLHQPLKVIREILVNQTAHMLACYRKNCASPSAASQLILPDSMK
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KSD VLPVYMNCLLKNCVLLSRPEISTDERAYQRQLVMTMGVADSQLFFYPQLLPIHTLDVKST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 VLPVYMNCLLKNCVLLSRPEISTDERAYQRQLVMTMGVADSQLFFYPQLLPIHTLDVKST
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KSD MLPAAVRCSESRLSEEGIFLLANGLHMFLWLGVSSPPELIQGIFNVPSFAHINTDMTLLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 MLPAAVRCSESRLSEEGIFLLANGLHMFLWLGVSSPPELIQGIFNVPSFAHINTDMTLLP
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KSD EVGNPYSQQLRMIMGIIQQKRPYSMKLTIVKQREQPEMVFRQFLVEDKGLYGGSSYVDFL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 EVGNPYSQQLRMIMGIIQQKRPYSMKLTIVKQREQPEMVFRQFLVEDKGLYGGSSYVDFL
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030  
pF1KSD CCVHKEICQLLN
       ::::::::::::
CCDS37 CCVHKEICQLLN
             1030  

>>CCDS7332.1 SEC24C gene_id:9632|Hs108|chr10              (1094 aa)
 initn: 3844 init1: 3668 opt: 3887  Z-score: 1544.9  bits: 297.5 E(32554): 9.9e-80
Smith-Waterman score: 3988; 56.5% identity (79.5% similar) in 1063 aa overlap (12-1032:44-1094)

                                  10        20        30        40 
pF1KSD                    MSQQGYVATPPYSQPQPGIGLSPPHYGHYGDPSHTASPTGM
                                     :. : ::   .::.    . ::  : :.. 
CCDS73 GQPQPIYPGYHQSSYGGQSGSTAPAIPYGAYNGPVPGYQQTPPQGMSRAPPSSGAPPAST
            20        30        40        50        60        70   

              50            60               70        80          
pF1KSD MKPAGPLGATAT----RGMLPPGPPP-------PGPHQFGQNGAHATGHPPQRFP-GPPP
        .  .: : .:     .: .  ::         :: . ::.  : . ..::   : ::::
CCDS73 AQ--APCGQAAYGQFGQGDVQNGPSSTVQMQRLPGSQPFGSPLAPVGNQPPVLQPYGPPP
              80        90       100       110       120       130 

      90                 100       110       120       130         
pF1KSD VN----------NVASSHAPYQPSAQSSYPGPISTSSVTQLGSQLSAMQINSYGSGMAPP
       ..          ..... ::  ::.  ..  : : .:..  ::  ..   .:: .:.:::
CCDS73 TSAQVATQLSGMQISGAVAPAPPSSGLGFGPPTSLASAS--GSFPNSGLYGSYPQGQAPP
             140       150       160       170         180         

        140       150         160       170       180          190 
pF1KSD ---SQGPPGPLSATSLQTPPR--PPQPSILQPGSQVLPPPPTTLNGP---GASPLPLPMY
          .:: ::      .::: :  : : : . : ..  :  :. ..::   : :     . 
CCDS73 LSQAQGHPG------IQTPQRSAPSQASSFTPPASGGPRLPS-MTGPLLPGQSFGGPSVS
     190             200       210       220        230       240  

             200            210         220        230       240   
pF1KSD RPDGLSGPP---PPNAQYQPP--PLPGQ--TLGAGYPPQQANS-GPQMAGAQLSYPGGFP
       .:. .:.::   ::..:.  :  ::: .      :: ::: .: ::   : : .: : .:
CCDS73 QPNHVSSPPQALPPGTQMTGPLGPLPPMHSPQQPGYQPQQNGSFGPAR-GPQSNYGGPYP
            250       260       270       280       290        300 

             250         260       270       280       290         
pF1KSD GGPA--QMAGPPQP--QKKLDPDSIPSPIQVIENDRASRGGQVYATNTRGQIPPLVTTDC
       ..:.  .. :::::   :.::::.:::::::::.:: .:: . ..:..:::.::::::. 
CCDS73 AAPTFGSQPGPPQPLPPKRLDPDAIPSPIQVIEDDRNNRGTEPFVTGVRGQVPPLVTTNF
             310       320       330       340       350       360 

     300       310       320       330       340       350         
pF1KSD MIQDQGNASPRFIRCTTYCFPCTSDMAKQAQIPLAAVIKPFATIPSNESPLYLVNHGESG
       ...::::::::.::::.: .:::::::::::.::::::::.: .: .:.  :.:.:::::
CCDS73 LVKDQGNASPRYIRCTSYNIPCTSDMAKQAQVPLAAVIKPLARLPPEEASPYVVDHGESG
             370       380       390       400       410       420 

     360       370       380       390       400       410         
pF1KSD PVRCNRCKAYMCPFMQFIEGGRRYQCGFCNCVNDVPPFYFQHLDHIGRRLDHYEKPELSL
       :.:::::::::::::::::::::.:: ::.:.::::: ::::::: :.:.: :..:::::
CCDS73 PLRCNRCKAYMCPFMQFIEGGRRFQCCFCSCINDVPPQYFQHLDHTGKRVDAYDRPELSL
             430       440       450       460       470       480 

     420       430       440       450       460       470         
pF1KSD GSYEYVATLDYCRKSKPPNPPAFIFMIDVSYSNIKNGLVKLICEELKTMLEKIPKEEQEE
       ::::..::.:::...: :.::::::::::::. :..:::.:.:::::..:. .:.:   :
CCDS73 GSYEFLATVDYCKNNKFPSPPAFIFMIDVSYNAIRTGLVRLLCEELKSLLDFLPREGGAE
             490       500       510       520       530       540 

     480       490       500       510       520       530         
pF1KSD TSAIRVGFITYNKVLHFFNVKSNLAQPQMMVVTDVGEVFVPLLDGFLVNYQESQSVIHNL
        :::::::.::::::::.::::.:::::::::.::...::::::::::: .::..:: .:
CCDS73 ESAIRVGFVTYNKVLHFYNVKSSLAQPQMMVVSDVADMFVPLLDGFLVNVNESRAVITSL
             550       560       570       580       590       600 

     540       550       560       570       580       590         
pF1KSD LDQIPDMFADSNENETVFASVIQAGMEALKAADCPGKLFIFHSSLPTAEAPGKLKNRDDK
       :::::.::::. :.::::. ::::::::::::.: ::::.::.::: ::::::::::::.
CCDS73 LDQIPEMFADTRETETVFVPVIQAGMEALKAAECAGKLFLFHTSLPIAEAPGKLKNRDDR
             610       620       630       640       650       660 

     600       610       620       630       640       650         
pF1KSD KLVNTDKEKILFQPQTNVYDSLAKDCVAHGCSVTLFLFPSQYVDVASLGLVPQLTGGTLY
       ::.:::::: ::::::..:..:::.:::.:: : :::::.::::::.:..:::::::..:
CCDS73 KLINTDKEKTLFQPQTGAYQTLAKECVAQGCCVDLFLFPNQYVDVATLSVVPQLTGGSVY
             670       680       690       700       710       720 

     660       670       680       690       700       710         
pF1KSD KYNNFQMHLDRQQFLNDLRNDIEKKIGFDAIMRVRTSTGFRATDFFGGILMNNTTDVEMA
       :: .::.. :...::.::: :..: .::::.::::::::.::.::::.. :.::::::.:
CCDS73 KYASFQVENDQERFLSDLRRDVQKVVGFDAVMRVRTSTGIRAVDFFGAFYMSNTTDVELA
             730       740       750       760       770       780 

     720       730       740       750       760       770         
pF1KSD AIDCDKAVTVEFKHDDKLSEDSGALIQCAVLYTTISGQRRLRIHNLGLNCSSQLADLYKS
       ..: ::.:::::::::.:.:.::::.:::.:::. .::::::::::.::: .::::::..
CCDS73 GLDGDKTVTVEFKHDDRLNEESGALLQCALLYTSCAGQRRLRIHNLALNCCTQLADLYRN
             790       800       810       820       830       840 

     780       790       800       810       820       830         
pF1KSD CETDALINFFAKSAFKAVLHQPLKVIREILVNQTAHMLACYRKNCASPSAASQLILPDSM
       ::::.:::..:: :...::..:.:..:. :..: :..::::::::::::.:.:::::. :
CCDS73 CETDTLINYMAKFAYRGVLNSPVKAVRDTLITQCAQILACYRKNCASPSSAGQLILPECM
             850       860       870       880       890       900 

     840       850       860       870       880       890         
pF1KSD KVLPVYMNCLLKNCVLLSRPEISTDERAYQRQLVMTMGVADSQLFFYPQLLPIHTLDVKS
       :.::::.::.::. ::    :..::.::: :::: .: :.....::::.:::.    :.:
CCDS73 KLLPVYLNCVLKSDVLQPGAEVTTDDRAYVRQLVTSMDVTETNVFFYPRLLPLTKSPVES
             910       920       930       940       950       960 

     900       910       920       930       940       950         
pF1KSD TMLPAAVRCSESRLSEEGIFLLANGLHMFLWLGVSSPPELIQGIFNVPSFAHINTDMTLL
       :  : ::: :: :::.  :.:: :::..:::.:.:    ..:..:.: ::..:.. ...:
CCDS73 TTEPPAVRASEERLSNGDIYLLENGLNLFLWVGASVQQGVVQSLFSVSSFSQITSGLSVL
             970       980       990      1000      1010      1020 

     960       970       980       990      1000      1010         
pF1KSD PEVGNPYSQQLRMIMGIIQQKRPYSMKLTIVKQREQPEMVFRQFLVEDKGLYGGSSYVDF
       : . :: :...: ..  .. .:   ::::.:::... ::.:..::::::.: ::.:::::
CCDS73 PVLDNPLSKKVRGLIDSLRAQRSRYMKLTVVKQEDKMEMLFKHFLVEDKSLSGGASYVDF
            1030      1040      1050      1060      1070      1080 

    1020      1030  
pF1KSD LCCVHKEICQLLN
       :: .:::: :::.
CCDS73 LCHMHKEIRQLLS
            1090    

>>CCDS47124.1 SEC24B gene_id:10427|Hs108|chr4             (1268 aa)
 initn: 900 init1: 429 opt: 1318  Z-score: 538.8  bits: 111.6 E(32554): 1.1e-23
Smith-Waterman score: 1480; 28.8% identity (59.6% similar) in 1054 aa overlap (3-1029:251-1268)

                                           10        20          30
pF1KSD                             MSQQGYVATPPYSQPQPGIGLSPPHY--GHYG
                                     ::.  .    .  .::.  .  .   .: :
CCDS47 PVKDNSFSGQNTAISHPSPLPPLPSQQHHQQQSLSGYSTLTWSSPGLPSTQDNLIRNHTG
              230       240       250       260       270       280

               40        50        60         70        80         
pF1KSD DPSHTASPTGMMKPAGPLGATATRGMLPPGPPPPGPHQF-GQNGAHATGHPPQRFPGPPP
       . . .:. .  .  :  :.  . ... ::   :     . :..:. .:  ::       :
CCDS47 SLA-VANNNPTITVADSLSCPVMQNVQPPKSSPVVSTVLSGSSGSSSTRTPPTANHPVEP
               290       300       310       320       330         

      90       100       110        120       130       140        
pF1KSD VNNVASSHAPYQPSAQSSYPGPISTSSVT-QLGSQLSAMQINSYGSGMAPPSQGPPGPLS
       :..:.      :::   .  :      :. : .:  . .. .:        ..      :
CCDS47 VTSVT------QPSELLQQKGVQYGEYVNNQASSAPTPLSSTSDDEEEEEEDEEAGVDSS
     340             350       360       370       380       390   

      150       160       170       180       190       200        
pF1KSD ATSLQTPPRPPQPSILQPGSQVLPPPPTTLNGPGASPLPLPMYRPDGLSGPPPPNAQYQP
       .:. .. : : . . :. ::      :  :.. ..:: : :  .::  :.: : .:    
CCDS47 STTSSASPMPNSYDALEGGSY-----PDMLSSSASSPAPDPAPEPDPASAPAPASAPAPV
           400       410            420       430       440        

      210          220           230         240       250         
pF1KSD PPLPGQT---LGAGYP---P-QQANSGPQMAGAQLSYP--GGFPGGPAQMAGPPQPQKKL
        : :..    .: :::   :  :  ..: ..:.: : :  .::   : :. :  : ....
CCDS47 VPQPSKMAKPFGYGYPTLQPGYQNATAPLISGVQPSNPVYSGFQQYPQQYPGVNQLSSSI
      450       460       470       480       490       500        

     260       270       280       290       300         310       
pF1KSD DPDSIPSPIQVIENDRASRGGQVYATNTRGQIPPLVTTDCMIQD--QGNASPRFIRCTTY
          :. :  :  :. :     :    :   . :  . .  .  :  . : ::  .:::  
CCDS47 GGLSLQSSPQP-ESLRPVNLTQ--ERNILPMTPVWAPVPNLNADLKKLNCSPDSFRCTLT
      510        520         530       540       550       560     

       320       330       340       350       360       370       
pF1KSD CFPCTSDMAKQAQIPLAAVIKPFATIPSNESPLYLVNHGESGPVRCNRCKAYMCPFMQFI
        .: :. . ..:..::. ...::  .  .. :.   :      :::  :..:. ::..::
CCDS47 NIPQTQALLNKAKLPLGLLLHPFRDL--TQLPVITSN----TIVRCRSCRTYINPFVSFI
         570       580       590         600           610         

       380       390        400       410       420       430      
pF1KSD EGGRRYQCGFCNCVNDVPP-FYFQHLDHIGRRLDHYEKPELSLGSYEYVATLDYCRKSKP
       .  ::..:..:  :::::  :... : .     . ...::.. .. :..:. ::    .:
CCDS47 DQ-RRWKCNLCYRVNDVPEEFMYNPLTR--SYGEPHKRPEVQNSTVEFIASSDYML--RP
     620        630       640         650       660       670      

        440       450       460       470       480       490      
pF1KSD PNPPAFIFMIDVSYSNIKNGLVKLICEELKTMLEKIPKEEQEETSAIRVGFITYNKVLHF
       :.: ...:..:::.. .. : . ..:. :   :.:.: .     :  :.::.:.....::
CCDS47 PQPAVYLFVLDVSHNAVEAGYLTILCQSLLENLDKLPGD-----SRTRIGFMTFDSTIHF
          680       690       700       710            720         

        500       510       520       530       540       550      
pF1KSD FNVKSNLAQPQMMVVTDVGEVFVPLLDGFLVNYQESQSVIHNLLDQIPDMFADSNENETV
       .:.. .:.::::..:.:. .::.:  :..:::  ::. .:..::. .:.::... :....
CCDS47 YNLQEGLSQPQMLIVSDIDDVFLPTPDSLLVNLYESKELIKDLLNALPNMFTNTRETHSA
     730       740       750       760       770       780         

        560       570       580       590       600       610      
pF1KSD FASVIQAGMEALKAADCPGKLFIFHSSLPTAEAPGKLKNRDDKKLVNTDKEKILFQPQTN
       .. ..::... .. .   :.. .:...::.  : : :..:.: .  .. :    . : :.
CCDS47 LGPALQAAFKLMSPTG--GRVSVFQTQLPSLGA-GLLQSREDPNQRSSTKVVQHLGPATD
     790       800         810       820        830       840      

        620       630       640       650       660        670     
pF1KSD VYDSLAKDCVAHGCSVTLFLFPSQYVDVASLGLVPQLTGGTLYKYNNFQM-HLDRQ--QF
        : .:: :: ..  .: :::. ::: :.:::. . . ..: .: : .:.. :   :  ..
CCDS47 FYKKLALDCSGQQTAVDLFLLSSQYSDLASLACMSKYSAGCIYYYPSFHYTHNPSQAEKL
        850       860       870       880       890       900      

           680       690       700       710       720       730   
pF1KSD LNDLRNDIEKKIGFDAIMRVRTSTGFRATDFFGGILMNNTTDVEMAAIDCDKAVTVEFKH
        .::.  . .::::.:.::.: . :.    : :.... .:  . .: :. : . .:... 
CCDS47 QKDLKRYLTRKIGFEAVMRIRCTKGLSMHTFHGNFFVRSTDLLSLANINPDAGFAVQLSI
        910       920       930       940       950       960      

           740       750       760       770       780       790   
pF1KSD DDKLSEDSGALIQCAVLYTTISGQRRLRIHNLGLNCSSQLADLYKSCETDALINFFAKSA
       ...:.. : . .: :.:::. .:.::.:.:.: :   :.:::.: . ...: : ..:. :
CCDS47 EESLTDTSLVCFQTALLYTSSKGERRIRVHTLCLPVVSSLADVYAGVDVQAAICLLANMA
        970       980       990      1000      1010      1020      

           800       810       820       830       840       850   
pF1KSD FKAVLHQPLKVIREILVNQTAHMLACYRKNCASPSAASQLILPDSMKVLPVYMNCLLKNC
           . . :.  :. ::: ..  :. :  . .:    : :. :.:.:..:.:.  :::. 
CCDS47 VDRSVSSSLSDARDALVNAVVDSLSAY-GSTVSNLQHSALMAPSSLKLFPLYVLALLKQK
       1030      1040      1050       1060      1070      1080     

           860             870       880       890       900       
pF1KSD VLLSRPEISTDERAY------QRQLVMTMGVADSQLFFYPQLLPIHTLDVKSTMLPAAV-
       .. .      :.:.:      .. ::  : .   .:.   .:    .. :.. ..:    
CCDS47 AFRTGTSTRLDDRVYAMCQIKSQPLVHLMKMIHPNLYRIDRLTDEGAVHVNDRIVPQPPL
        1090      1100      1110      1120      1130      1140     

         910       920       930       940       950       960     
pF1KSD -RCSESRLSEEGIFLLANGLHMFLWLGVSSPPELIQGIFNVPSFAHINTDMTLLPEVGNP
        . :  .:..:: ::.  :  ...:.: .   ..:. ...  .:: :   :: :::. . 
CCDS47 QKLSAEKLTREGAFLMDCGSVFYIWVGKGCDNNFIEDVLGYTNFASIPQKMTHLPELDTL
        1150      1160      1170      1180      1190      1200     

         970       980       990      1000      1010      1020     
pF1KSD YSQQLRMIMGIIQQKRPYSMKLTIVKQREQPEMVFRQFLVEDKGLYGGSSYVDFLCCVHK
        :.. : ..  ....:: :  : :::..   .  : : :.::.   .. :: .::  :..
CCDS47 SSERARSFITWLRDSRPLSPILHIVKDESPAKAEFFQHLIEDR-TEAAFSYYEFLLHVQQ
        1210      1220      1230      1240       1250      1260    

        1030  
pF1KSD EICQLLN
       .::.   
CCDS47 QICK   
              

>>CCDS43260.1 SEC24B gene_id:10427|Hs108|chr4             (1233 aa)
 initn: 900 init1: 429 opt: 1295  Z-score: 530.0  bits: 109.9 E(32554): 3.4e-23
Smith-Waterman score: 1483; 29.2% identity (59.1% similar) in 1085 aa overlap (23-1029:177-1233)

                       10        20        30          40        50
pF1KSD         MSQQGYVATPPYSQPQPGIGLSPPHYGHYG--DPSHTASPTGMMKPAGPLGA
                                     :   :::.    :..: :. .  :. : : 
CCDS43 SASQPYSSFVNHYNSPAMYSASSSVASQGFPSTCGHYAMSTVSNAAYPS-VSYPSLPAGD
        150       160       170       180       190        200     

               60            70        80        90       100      
pF1KSD TATRGMLPPGPP---PPGPHQF-GQNGAHATGHPPQRFPGPPPVNNVASSHAPYQPSAQS
       :  . .   . :   :   ..: ::: :   .::    : :   ..  .: . :.  . :
CCDS43 TYGQMFTSQNAPTVRPVKDNSFSGQNTA--ISHPSPLPPLPSQQHHQQQSLSGYSTLTWS
         210       220       230         240       250       260   

        110         120       130                  140             
pF1KSD SYPGPISTSS--VTQLGSQLSAMQINSYGS-----------GMAPPSQGP------PGPL
       : ::  ::..  . .  ..:.. . :   .           .. ::...:       :  
CCDS43 S-PGLPSTQDNLIRNHTGSLAVANNNPTITVADSLSCPVMQNVQPPKSSPVVSTVLSGSS
            270       280       290       300       310       320  

       150          160                       170                  
pF1KSD SATSLQTPP---RPPQP--SILQPG--------------SQVLPPP-----------PTT
       ...: .:::   .: .:  :. ::.              :.. : :           :  
CCDS43 GSSSTRTPPTANHPVEPVTSVTQPSELLQQKGVDSSSTTSSASPMPNSYDALEGGSYPDM
            330       340       350       360       370       380  

       180       190       200       210          220           230
pF1KSD LNGPGASPLPLPMYRPDGLSGPPPPNAQYQPPPLPGQT---LGAGYP---P-QQANSGPQ
       :.. ..:: : :  .::  :.: : .:     : :..    .: :::   :  :  ..: 
CCDS43 LSSSASSPAPDPAPEPDPASAPAPASAPAPVVPQPSKMAKPFGYGYPTLQPGYQNATAPL
            390       400       410       420       430       440  

                240       250       260       270       280        
pF1KSD MAGAQLSYP--GGFPGGPAQMAGPPQPQKKLDPDSIPSPIQVIENDRASRGGQVYATNTR
       ..:.: : :  .::   : :. :  : ....   :. :  :  :. :     :    :  
CCDS43 ISGVQPSNPVYSGFQQYPQQYPGVNQLSSSIGGLSLQSSPQP-ESLRPVNLTQ--ERNIL
            450       460       470       480        490           

      290       300         310       320       330       340      
pF1KSD GQIPPLVTTDCMIQD--QGNASPRFIRCTTYCFPCTSDMAKQAQIPLAAVIKPFATIPSN
        . :  . .  .  :  . : ::  .:::   .: :. . ..:..::. ...::  .  .
CCDS43 PMTPVWAPVPNLNADLKKLNCSPDSFRCTLTNIPQTQALLNKAKLPLGLLLHPFRDL--T
     500       510       520       530       540       550         

        350       360       370       380       390        400     
pF1KSD ESPLYLVNHGESGPVRCNRCKAYMCPFMQFIEGGRRYQCGFCNCVNDVPP-FYFQHLDHI
       . :.   :      :::  :..:. ::..::.  ::..:..:  :::::  :... : . 
CCDS43 QLPVITSNT----IVRCRSCRTYINPFVSFIDQ-RRWKCNLCYRVNDVPEEFMYNPLTR-
       560           570       580        590       600       610  

         410       420       430       440       450       460     
pF1KSD GRRLDHYEKPELSLGSYEYVATLDYCRKSKPPNPPAFIFMIDVSYSNIKNGLVKLICEEL
           . ...::.. .. :..:. ::    .::.: ...:..:::.. .. : . ..:. :
CCDS43 -SYGEPHKRPEVQNSTVEFIASSDYML--RPPQPAVYLFVLDVSHNAVEAGYLTILCQSL
              620       630         640       650       660        

         470       480       490       500       510       520     
pF1KSD KTMLEKIPKEEQEETSAIRVGFITYNKVLHFFNVKSNLAQPQMMVVTDVGEVFVPLLDGF
          :.:.: .     :  :.::.:.....::.:.. .:.::::..:.:. .::.:  :..
CCDS43 LENLDKLPGD-----SRTRIGFMTFDSTIHFYNLQEGLSQPQMLIVSDIDDVFLPTPDSL
      670            680       690       700       710       720   

         530       540       550       560       570       580     
pF1KSD LVNYQESQSVIHNLLDQIPDMFADSNENETVFASVIQAGMEALKAADCPGKLFIFHSSLP
       :::  ::. .:..::. .:.::... :...... ..::... .. .   :.. .:...::
CCDS43 LVNLYESKELIKDLLNALPNMFTNTRETHSALGPALQAAFKLMSPTG--GRVSVFQTQLP
           730       740       750       760       770         780 

         590       600       610       620       630       640     
pF1KSD TAEAPGKLKNRDDKKLVNTDKEKILFQPQTNVYDSLAKDCVAHGCSVTLFLFPSQYVDVA
       .  : : :..:.: .  .. :    . : :. : .:: :: ..  .: :::. ::: :.:
CCDS43 SLGA-GLLQSREDPNQRSSTKVVQHLGPATDFYKKLALDCSGQQTAVDLFLLSSQYSDLA
              790       800       810       820       830       840

         650       660        670         680       690       700  
pF1KSD SLGLVPQLTGGTLYKYNNFQM-HLDRQ--QFLNDLRNDIEKKIGFDAIMRVRTSTGFRAT
       ::. . . ..: .: : .:.. :   :  .. .::.  . .::::.:.::.: . :.   
CCDS43 SLACMSKYSAGCIYYYPSFHYTHNPSQAEKLQKDLKRYLTRKIGFEAVMRIRCTKGLSMH
              850       860       870       880       890       900

            710       720       730       740       750       760  
pF1KSD DFFGGILMNNTTDVEMAAIDCDKAVTVEFKHDDKLSEDSGALIQCAVLYTTISGQRRLRI
        : :.... .:  . .: :. : . .:... ...:.. : . .: :.:::. .:.::.:.
CCDS43 TFHGNFFVRSTDLLSLANINPDAGFAVQLSIEESLTDTSLVCFQTALLYTSSKGERRIRV
              910       920       930       940       950       960

            770       780       790       800       810       820  
pF1KSD HNLGLNCSSQLADLYKSCETDALINFFAKSAFKAVLHQPLKVIREILVNQTAHMLACYRK
       :.: :   :.:::.: . ...: : ..:. :    . . :.  :. ::: ..  :. :  
CCDS43 HTLCLPVVSSLADVYAGVDVQAAICLLANMAVDRSVSSSLSDARDALVNAVVDSLSAY-G
              970       980       990      1000      1010          

            830       840       850       860             870      
pF1KSD NCASPSAASQLILPDSMKVLPVYMNCLLKNCVLLSRPEISTDERAY------QRQLVMTM
       . .:    : :. :.:.:..:.:.  :::. .. .      :.:.:      .. ::  :
CCDS43 STVSNLQHSALMAPSSLKLFPLYVLALLKQKAFRTGTSTRLDDRVYAMCQIKSQPLVHLM
    1020      1030      1040      1050      1060      1070         

        880       890       900         910       920       930    
pF1KSD GVADSQLFFYPQLLPIHTLDVKSTMLPAAV--RCSESRLSEEGIFLLANGLHMFLWLGVS
        .   .:.   .:    .. :.. ..:     . :  .:..:: ::.  :  ...:.: .
CCDS43 KMIHPNLYRIDRLTDEGAVHVNDRIVPQPPLQKLSAEKLTREGAFLMDCGSVFYIWVGKG
    1080      1090      1100      1110      1120      1130         

          940       950       960       970       980       990    
pF1KSD SPPELIQGIFNVPSFAHINTDMTLLPEVGNPYSQQLRMIMGIIQQKRPYSMKLTIVKQRE
          ..:. ...  .:: :   :: :::. .  :.. : ..  ....:: :  : :::.. 
CCDS43 CDNNFIEDVLGYTNFASIPQKMTHLPELDTLSSERARSFITWLRDSRPLSPILHIVKDES
    1140      1150      1160      1170      1180      1190         

         1000      1010      1020      1030  
pF1KSD QPEMVFRQFLVEDKGLYGGSSYVDFLCCVHKEICQLLN
         .  : : :.::.   .. :: .::  :...::.   
CCDS43 PAKAEFFQHLIEDR-TEAAFSYYEFLLHVQQQICK   
    1200      1210       1220      1230      

>>CCDS75179.1 SEC24B gene_id:10427|Hs108|chr4             (1298 aa)
 initn: 937 init1: 429 opt: 1288  Z-score: 527.0  bits: 109.4 E(32554): 4.9e-23
Smith-Waterman score: 1469; 28.8% identity (59.6% similar) in 1054 aa overlap (3-1029:282-1298)

                                           10        20          30
pF1KSD                             MSQQGYVATPPYSQPQPGIGLSPPHY--GHYG
                                     ::.  .    .  .::.  .  .   .: :
CCDS75 PVKDNSFSGQNTAISHPSPLPPLPSQQHHQQQSLSGYSTLTWSSPGLPSTQDNLIRNHTG
             260       270       280       290       300       310 

               40        50        60         70        80         
pF1KSD DPSHTASPTGMMKPAGPLGATATRGMLPPGPPPPGPHQF-GQNGAHATGHPPQRFPGPPP
       . . .:. .  .  :  :.  . ... ::   :     . :..:. .:  ::       :
CCDS75 SLA-VANNNPTITVADSLSCPVMQNVQPPKSSPVVSTVLSGSSGSSSTRTPPTANHPVEP
              320       330       340       350       360       370

      90       100       110        120       130       140        
pF1KSD VNNVASSHAPYQPSAQSSYPGPISTSSVT-QLGSQLSAMQINSYGSGMAPPSQGPPGPLS
       :..:.      :::   .  :      :. : .:  . .. .:        ..      :
CCDS75 VTSVT------QPSELLQQKGVQYGEYVNNQASSAPTPLSSTSDDEEEEEEDEEAGVDSS
                    380       390       400       410       420    

      150       160       170       180       190       200        
pF1KSD ATSLQTPPRPPQPSILQPGSQVLPPPPTTLNGPGASPLPLPMYRPDGLSGPPPPNAQYQP
       .:. .. : : . . :. ::      :  :.. ..:: : :  .::  :.: : .:    
CCDS75 STTSSASPMPNSYDALEGGSY-----PDMLSSSASSPAPDPAPEPDPASAPAPASAPAPV
          430       440            450       460       470         

      210          220           230         240       250         
pF1KSD PPLPGQT---LGAGYP---P-QQANSGPQMAGAQLSYP--GGFPGGPAQMAGPPQPQKKL
        : :..    .: :::   :  :  ..: ..:.: : :  .::   : :. :  : ....
CCDS75 VPQPSKMAKPFGYGYPTLQPGYQNATAPLISGVQPSNPVYSGFQQYP-QYPGVNQLSSSI
     480       490       500       510       520        530        

     260       270       280       290       300         310       
pF1KSD DPDSIPSPIQVIENDRASRGGQVYATNTRGQIPPLVTTDCMIQD--QGNASPRFIRCTTY
          :. :  :  :. :     :    :   . :  . .  .  :  . : ::  .:::  
CCDS75 GGLSLQSSPQP-ESLRPVNLTQ--ERNILPMTPVWAPVPNLNADLKKLNCSPDSFRCTLT
      540        550         560       570       580       590     

       320       330       340       350       360       370       
pF1KSD CFPCTSDMAKQAQIPLAAVIKPFATIPSNESPLYLVNHGESGPVRCNRCKAYMCPFMQFI
        .: :. . ..:..::. ...::  .  .. :.   :      :::  :..:. ::..::
CCDS75 NIPQTQALLNKAKLPLGLLLHPFRDL--TQLPVITSN----TIVRCRSCRTYINPFVSFI
         600       610       620         630           640         

       380       390        400       410       420       430      
pF1KSD EGGRRYQCGFCNCVNDVPP-FYFQHLDHIGRRLDHYEKPELSLGSYEYVATLDYCRKSKP
       .  ::..:..:  :::::  :... : .     . ...::.. .. :..:. ::    .:
CCDS75 DQ-RRWKCNLCYRVNDVPEEFMYNPLTR--SYGEPHKRPEVQNSTVEFIASSDYML--RP
     650        660       670         680       690       700      

        440       450       460       470       480       490      
pF1KSD PNPPAFIFMIDVSYSNIKNGLVKLICEELKTMLEKIPKEEQEETSAIRVGFITYNKVLHF
       :.: ...:..:::.. .. : . ..:. :   :.:.: .     :  :.::.:.....::
CCDS75 PQPAVYLFVLDVSHNAVEAGYLTILCQSLLENLDKLPGD-----SRTRIGFMTFDSTIHF
          710       720       730       740            750         

        500       510       520       530       540       550      
pF1KSD FNVKSNLAQPQMMVVTDVGEVFVPLLDGFLVNYQESQSVIHNLLDQIPDMFADSNENETV
       .:.. .:.::::..:.:. .::.:  :..:::  ::. .:..::. .:.::... :....
CCDS75 YNLQEGLSQPQMLIVSDIDDVFLPTPDSLLVNLYESKELIKDLLNALPNMFTNTRETHSA
     760       770       780       790       800       810         

        560       570       580       590       600       610      
pF1KSD FASVIQAGMEALKAADCPGKLFIFHSSLPTAEAPGKLKNRDDKKLVNTDKEKILFQPQTN
       .. ..::... .. .   :.. .:...::.  : : :..:.: .  .. :    . : :.
CCDS75 LGPALQAAFKLMSPTG--GRVSVFQTQLPSLGA-GLLQSREDPNQRSSTKVVQHLGPATD
     820       830         840       850        860       870      

        620       630       640       650       660        670     
pF1KSD VYDSLAKDCVAHGCSVTLFLFPSQYVDVASLGLVPQLTGGTLYKYNNFQM-HLDRQ--QF
        : .:: :: ..  .: :::. ::: :.:::. . . ..: .: : .:.. :   :  ..
CCDS75 FYKKLALDCSGQQTAVDLFLLSSQYSDLASLACMSKYSAGCIYYYPSFHYTHNPSQAEKL
        880       890       900       910       920       930      

           680       690       700       710       720       730   
pF1KSD LNDLRNDIEKKIGFDAIMRVRTSTGFRATDFFGGILMNNTTDVEMAAIDCDKAVTVEFKH
        .::.  . .::::.:.::.: . :.    : :.... .:  . .: :. : . .:... 
CCDS75 QKDLKRYLTRKIGFEAVMRIRCTKGLSMHTFHGNFFVRSTDLLSLANINPDAGFAVQLSI
        940       950       960       970       980       990      

           740       750       760       770       780       790   
pF1KSD DDKLSEDSGALIQCAVLYTTISGQRRLRIHNLGLNCSSQLADLYKSCETDALINFFAKSA
       ...:.. : . .: :.:::. .:.::.:.:.: :   :.:::.: . ...: : ..:. :
CCDS75 EESLTDTSLVCFQTALLYTSSKGERRIRVHTLCLPVVSSLADVYAGVDVQAAICLLANMA
       1000      1010      1020      1030      1040      1050      

           800       810       820       830       840       850   
pF1KSD FKAVLHQPLKVIREILVNQTAHMLACYRKNCASPSAASQLILPDSMKVLPVYMNCLLKNC
           . . :.  :. ::: ..  :. :  . .:    : :. :.:.:..:.:.  :::. 
CCDS75 VDRSVSSSLSDARDALVNAVVDSLSAY-GSTVSNLQHSALMAPSSLKLFPLYVLALLKQK
       1060      1070      1080       1090      1100      1110     

           860             870       880       890       900       
pF1KSD VLLSRPEISTDERAY------QRQLVMTMGVADSQLFFYPQLLPIHTLDVKSTMLPAAV-
       .. .      :.:.:      .. ::  : .   .:.   .:    .. :.. ..:    
CCDS75 AFRTGTSTRLDDRVYAMCQIKSQPLVHLMKMIHPNLYRIDRLTDEGAVHVNDRIVPQPPL
        1120      1130      1140      1150      1160      1170     

         910       920       930       940       950       960     
pF1KSD -RCSESRLSEEGIFLLANGLHMFLWLGVSSPPELIQGIFNVPSFAHINTDMTLLPEVGNP
        . :  .:..:: ::.  :  ...:.: .   ..:. ...  .:: :   :: :::. . 
CCDS75 QKLSAEKLTREGAFLMDCGSVFYIWVGKGCDNNFIEDVLGYTNFASIPQKMTHLPELDTL
        1180      1190      1200      1210      1220      1230     

         970       980       990      1000      1010      1020     
pF1KSD YSQQLRMIMGIIQQKRPYSMKLTIVKQREQPEMVFRQFLVEDKGLYGGSSYVDFLCCVHK
        :.. : ..  ....:: :  : :::..   .  : : :.::.   .. :: .::  :..
CCDS75 SSERARSFITWLRDSRPLSPILHIVKDESPAKAEFFQHLIEDR-TEAAFSYYEFLLHVQQ
        1240      1250      1260      1270       1280      1290    

        1030  
pF1KSD EICQLLN
       .::.   
CCDS75 QICK   
              

>>CCDS43363.1 SEC24A gene_id:10802|Hs108|chr5             (1093 aa)
 initn: 743 init1: 251 opt: 1221  Z-score: 501.6  bits: 104.5 E(32554): 1.3e-21
Smith-Waterman score: 1384; 27.0% identity (59.4% similar) in 1082 aa overlap (4-1027:48-1091)

                                          10          20         30
pF1KSD                            MSQQGYVATPP--YSQPQPGIGLSP-PHYGHYG
                                     :::    :  : .: :.  :.:    ..::
CCDS43 AQNGAALASGSPYTNGPVQNALLSSQESVSQGYNFQLPGSYPHPIPAKTLNPVSGQSNYG
        20        30        40        50        60        70       

               40        50        60        70        80          
pF1KSD DPSHTASPTGMMKPAGPLGATATRGMLPPGPPPPGPHQFGQNGAHATGHPPQRF-PG---
         .  .:   . .:  :.... .   :  :: :  :   .:: : .:  : . : :    
CCDS43 GSQ--GSGQTLNRP--PVASNPVTPSLHSGPAPRMPLPASQNPA-TTPMPSSSFLPEANL
        80            90       100       110        120       130  

         90       100       110       120       130       140      
pF1KSD PPPVNNVASSHAPYQPSAQSSYPGPISTSSVTQLGSQLSAMQINSYGSGMAPPSQGPPGP
       :::.:   . . :   :  .  :   :  .:.   :  .  :  : :      :    ::
CCDS43 PPPLN--WQYNYPSTASQTNHCPRASSQPTVSGNTSLTTNHQYVSSGYPSLQNSFIKSGP
              140       150       160       170       180       190

        150         160       170            180          190      
pF1KSD LSATSLQTPP--RPPQPSILQPGSQVLPPP-----PTTLNGPGASP---LPLPMYRP---
             ..::   :: :. .:::.   :::     :.    : .:    .: :..     
CCDS43 ------SVPPLVNPPLPTTFQPGAPHGPPPAGGPPPVRALTPLTSSYRDVPQPLFNSAVN
                    200       210       220       230       240    

            200       210       220         230        240         
pF1KSD -DGLSGPPPPNAQYQPPPLPGQTLGAGY--PPQQANSGPQMA-GAQLSYPGGFPGGPAQM
        .:...    :...       .  :.:    :: .:..:.:. ..  :::.  ::   : 
CCDS43 QEGITSNTN-NGSMVVHSSYDEIEGGGLLATPQLTNKNPKMSRSVGYSYPSLPPG--YQN
          250        260       270       280       290         300 

     250           260            270       280               290  
pF1KSD AGPPQ----PQKKLDPDSIP-----SPIQVIENDRASRGGQ--------VYATNTRGQIP
       . ::     : ..:.  : :     .:. . .   .  : .        :   . :...:
CCDS43 TTPPGATGVPPSSLNYPSGPQAFTQTPLGANHLTTSMSGLSLQPEGLRVVNLLQERNMLP
             310       320       330       340       350       360 

               300         310       320       330       340       
pF1KSD --PLVT-TDCMIQD--QGNASPRFIRCTTYCFPCTSDMAKQAQIPLAAVIKPFATIPSNE
         ::   .  . .:  . : .:...:::   .: :. . ..:..::. ...::  .    
CCDS43 STPLKPPVPNLHEDIQKLNCNPELFRCTLTSIPQTQALLNKAKLPLGLLLHPFKDL----
             370       380       390       400       410           

       350       360       370       380       390        400      
pF1KSD SPLYLVNHGESGPVRCNRCKAYMCPFMQFIEGGRRYQCGFCNCVNDVPP-FYFQHLDHIG
         : .:.   :  :::  :..:. ::..:..  ::..:..:  :::::  : .. : .. 
CCDS43 VQLPVVTS--STIVRCRSCRTYINPFVSFLDQ-RRWKCNLCYRVNDVPEEFLYNPLTRV-
       420         430       440        450       460       470    

        410       420       430       440       450       460      
pF1KSD RRLDHYEKPELSLGSYEYVATLDYCRKSKPPNPPAFIFMIDVSYSNIKNGLVKLICEELK
          . ...::.. .. :..:  .:  .  ::.::...:..:::.. ...: .. .:. : 
CCDS43 -YGEPHRRPEVQNATIEFMAPSEYMLR--PPQPPVYLFVFDVSHNAVETGYLNSVCQSLL
            480       490         500       510       520       530

        470       480       490       500       510       520      
pF1KSD TMLEKIPKEEQEETSAIRVGFITYNKVLHFFNVKSNLAQPQMMVVTDVGEVFVPLLDGFL
         :. .: . .      ..::::.....::.... .:.::::..:.:. .::.:. ...:
CCDS43 DNLDLLPGNTRT-----KIGFITFDSTIHFYGLQESLSQPQMLIVSDIEDVFIPMPENLL
              540            550       560       570       580     

        530       540       550       560       570       580      
pF1KSD VNYQESQSVIHNLLDQIPDMFADSNENETVFASVIQAGMEALKAADCPGKLFIFHSSLPT
       :: .::. ....::  .:.::. . :...... ..::... .. .   :.. .:...:::
CCDS43 VNLNESKELVQDLLKTLPQMFTKTLETQSALGPALQAAFKLMSPTG--GRMSVFQTQLPT
         590       600       610       620       630         640   

        590       600       610       620       630       640      
pF1KSD AEAPGKLKNRDDKKLVNTDKEKILFQPQTNVYDSLAKDCVAHGCSVTLFLFPSQYVDVAS
         . : :: :.. .  .. :. : . :.:. : .:: :: ..  .: :::. .:: :.::
CCDS43 LGV-GALKPREEPNHRSSAKD-IHMTPSTDFYKKLALDCSGQQVAVDLFLLSGQYSDLAS
            650       660        670       680       690       700 

        650       660          670       680       690       700   
pF1KSD LGLVPQLTGGTLYKYNNFQMH---LDRQQFLNDLRNDIEKKIGFDAIMRVRTSTGFRATD
       :: . . ..:..: : ... .   .. :.. ..:.  . .::::.:.::.: . :.    
CCDS43 LGCISRYSAGSVYYYPSYHHQHNPVQVQKLQKELQRYLTRKIGFEAVMRIRCTKGLSIHT
             710       720       730       740       750       760 

           710       720       730       740       750       760   
pF1KSD FFGGILMNNTTDVEMAAIDCDKAVTVEFKHDDKLSEDSGALIQCAVLYTTISGQRRLRIH
       : :.... .:  . .  .. : . .:... ...:.. . . .: :.:::. .:.::.:.:
CCDS43 FHGNFFVRSTDLLSLPNVNPDAGYAVQMSVEESLTDTQLVSFQSALLYTSSKGERRIRVH
             770       780       790       800       810       820 

           770       780       790       800       810       820   
pF1KSD NLGLNCSSQLADLYKSCETDALINFFAKSAFKAVLHQPLKVIREILVNQTAHMLACYRKN
       .: :   : : :.. . ...:. ...:. :    .   :.  :. ::: .   :. ::..
CCDS43 TLCLPVVSTLNDVFLGADVQAISGLLANMAVDRSMTASLSDARDALVNAVIDSLSAYRSS
             830       840       850       860       870       880 

           830       840       850       860             870       
pF1KSD CASPSAASQLILPDSMKVLPVYMNCLLKNCVLLSRPEISTDERAY------QRQLVMTMG
         : .    :..: :....:...  :::.  . .  .   ::: .      .. ::. : 
CCDS43 VLS-NQQPGLMVPFSLRLFPLFVLALLKQKSFQTGTNARLDERIFAMCQVKNQPLVYLML
              890       900       910       920       930       940

       880       890       900         910       920       930     
pF1KSD VADSQLFFYPQLLPIHTLDVKSTMLPAA--VRCSESRLSEEGIFLLANGLHMFLWLGVSS
       ..  .:.   .:    .:....  .:    .. :  .::..: ::.  :  ..::.: . 
CCDS43 TTHPSLYRVDNLSDEGALNISDRTIPQPPILQLSVEKLSRDGAFLMDAGSVLMLWVGKNC
              950       960       970       980       990      1000

         940       950       960       970       980       990     
pF1KSD PPELIQGIFNVPSFAHINTDMTLLPEVGNPYSQQLRMIMGIIQQKRPYSMKLTIVKQREQ
         .... ...: ..: :   :: :::. .: : ..  ... ....::.   : .....  
CCDS43 TQNFLSQVLGVQNYASIPQPMTDLPELDTPESARIIAFISWLREQRPFFPILYVIRDESP
             1010      1020      1030      1040      1050      1060

        1000      1010      1020      1030  
pF1KSD PEMVFRQFLVEDKGLYGGSSYVDFLCCVHKEICQLLN
        .  : : ..::.   .. :: .::  .....     
CCDS43 MKANFLQNMIEDR-TESALSYYEFLLHIQQQVNK   
             1070       1080      1090      




1032 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Thu Nov  3 02:55:56 2016 done: Thu Nov  3 02:55:57 2016
 Total Scan time:  3.740 Total Display time:  0.260

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com