Result of FASTA (ccds) for pF1KSDA0712
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA0712, 1738 aa
  1>>>pF1KSDA0712 1738 - 1738 aa - 1738 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.0731+/-0.000996; mu= 2.3805+/- 0.060
 mean_var=244.3570+/-50.381, 0's: 0 Z-trim(111.8): 130  B-trim: 5 in 1/52
 Lambda= 0.082047
 statistics sampled from 12564 (12694) to 12564 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.705), E-opt: 0.2 (0.39), width:  16
 Scan time:  5.790

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS31718.1 ARHGAP32 gene_id:9743|Hs108|chr11      (1738) 11732 1403.2       0
CCDS44769.1 ARHGAP32 gene_id:9743|Hs108|chr11      (2087) 11732 1403.3       0
CCDS54254.1 ARHGAP33 gene_id:115703|Hs108|chr19    (1123) 1333 172.2 9.1e-42
CCDS12477.1 ARHGAP33 gene_id:115703|Hs108|chr19    (1126) 1235 160.6 2.8e-38
CCDS43135.1 ARHGAP31 gene_id:57514|Hs108|chr3      (1444) 1156 151.3 2.3e-35
CCDS1215.1 ARHGAP30 gene_id:257106|Hs108|chr1      ( 890) 1032 136.5   4e-31
CCDS30918.1 ARHGAP30 gene_id:257106|Hs108|chr1     (1101) 1027 136.0 7.2e-31


>>CCDS31718.1 ARHGAP32 gene_id:9743|Hs108|chr11           (1738 aa)
 initn: 11732 init1: 11732 opt: 11732  Z-score: 7512.9  bits: 1403.2 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 11732; 100.0% identity (100.0% similar) in 1738 aa overlap (1-1738:1-1738)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MKSRPTKQKLKQRGILKERVFGCDLGEHLLNSGFEVPQVLQSCTAFIERYGIVDGIYRLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MKSRPTKQKLKQRGILKERVFGCDLGEHLLNSGFEVPQVLQSCTAFIERYGIVDGIYRLS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD GVASNIQRLRHEFDSEHVPDLTKEPYVQDIHSVGSLCKLYFRELPNPLLTYQLYEKFSDA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GVASNIQRLRHEFDSEHVPDLTKEPYVQDIHSVGSLCKLYFRELPNPLLTYQLYEKFSDA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD VSAATDEERLIKIHDVIQQLPPPHYRTLEFLMRHLSLLADYCSITNMHAKNLAIVWAPNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VSAATDEERLIKIHDVIQQLPPPHYRTLEFLMRHLSLLADYCSITNMHAKNLAIVWAPNL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD LRSKQIESACFSGTAAFMEVRIQSVVVEFILNHVDVLFSGRISMAMQEGAASLSRPKSLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LRSKQIESACFSGTAAFMEVRIQSVVVEFILNHVDVLFSGRISMAMQEGAASLSRPKSLL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD VSSPSTKLLTLEEAQARTQAQVNSPIVTENKYIEVGEGPAALQGKFHTIIEFPLERKRPQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VSSPSTKLLTLEEAQARTQAQVNSPIVTENKYIEVGEGPAALQGKFHTIIEFPLERKRPQ
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD NKMKKSPVGSWRSFFNLGKSSSVSKRKLQRNESEPSEMKAMALKGGRAEGTLRSAKSEES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NKMKKSPVGSWRSFFNLGKSSSVSKRKLQRNESEPSEMKAMALKGGRAEGTLRSAKSEES
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD LTSLHAVDGDSKLFRPRRPRSSSDALSASFNGEMLGNRCNSYDNLPHDNESEEEGGLLHI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LTSLHAVDGDSKLFRPRRPRSSSDALSASFNGEMLGNRCNSYDNLPHDNESEEEGGLLHI
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD PALMSPHSAEDVDLSPPDIGVASLDFDPMSFQCSPPKAESECLESGASFLDSPGYSKDKP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PALMSPHSAEDVDLSPPDIGVASLDFDPMSFQCSPPKAESECLESGASFLDSPGYSKDKP
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD SANKKDAETGSSQCQTPGSTASSEPVSPLQEKLSPFFTLDLSPTEDKSSKPSSFTEKVVY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SANKKDAETGSSQCQTPGSTASSEPVSPLQEKLSPFFTLDLSPTEDKSSKPSSFTEKVVY
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD AFSPKIGRKLSKSPSMSISEPISVTLPPRVSEVIGTVSNTTAQNASSSTWDKCVEERDAT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 AFSPKIGRKLSKSPSMSISEPISVTLPPRVSEVIGTVSNTTAQNASSSTWDKCVEERDAT
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD NRSPTQIVKMKTNETVAQEAYESEVQPLDQVAAEEVELPGKEDQSVSSSQSKAVASGQTQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NRSPTQIVKMKTNETVAQEAYESEVQPLDQVAAEEVELPGKEDQSVSSSQSKAVASGQTQ
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD TGAVTHDPPQDSVPVSSVSLIPPPPPPKNVARMLALALAESAQQASTQSLKRPGTSQAGY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TGAVTHDPPQDSVPVSSVSLIPPPPPPKNVARMLALALAESAQQASTQSLKRPGTSQAGY
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD TNYGDIAVATTEDNLSSSYSAVALDKAYFQTDRPAEQFHLQNNAPGNCDHPLPETTATGD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TNYGDIAVATTEDNLSSSYSAVALDKAYFQTDRPAEQFHLQNNAPGNCDHPLPETTATGD
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD PTHSNTTESGEQHHQVDLTGNQPHQAYLSGDPEKARITSVPLDSEKSDDHVSFPEDQSGK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PTHSNTTESGEQHHQVDLTGNQPHQAYLSGDPEKARITSVPLDSEKSDDHVSFPEDQSGK
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KSD NSMPTVSFLDQDQSPPRFYSGDQPPSYLGASVDKLHHPLEFADKSPTPPNLPSDKIYPPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NSMPTVSFLDQDQSPPRFYSGDQPPSYLGASVDKLHHPLEFADKSPTPPNLPSDKIYPPS
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KSD GSPEENTSTATMTYMTTTPATAQMSTKEASWDVAEQPTTADFAAATLQRTHRTNRPLPPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GSPEENTSTATMTYMTTTPATAQMSTKEASWDVAEQPTTADFAAATLQRTHRTNRPLPPP
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KSD PSQRSAEQPPVVGQVQAATNIGLNNSHKVQGVVPVPERPPEPRAMDDPASAFISDSGAAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PSQRSAEQPPVVGQVQAATNIGLNNSHKVQGVVPVPERPPEPRAMDDPASAFISDSGAAA
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KSD AQCPMATAVQPGLPEKVRDGARVPLLHLRAESVPAHPCGFPAPLPPTRMMESKMIAAIHS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 AQCPMATAVQPGLPEKVRDGARVPLLHLRAESVPAHPCGFPAPLPPTRMMESKMIAAIHS
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KSD SSADATSSSNYHSFVTASSTSVDDALPLPLPVPQPKHASQKTVYSSFARPDVTTEPFGPD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SSADATSSSNYHSFVTASSTSVDDALPLPLPVPQPKHASQKTVYSSFARPDVTTEPFGPD
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KSD NCLHFNMTPNCQYRPQSVPPHHNKLEQHQVYGARSEPPASMGLRYNTYVAPGRNASGHHS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NCLHFNMTPNCQYRPQSVPPHHNKLEQHQVYGARSEPPASMGLRYNTYVAPGRNASGHHS
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KSD KPCSRVEYVSSLSSSVRNTCYPEDIPPYPTIRRVQSLHAPPSSMIRSVPISRTEVPPDDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KPCSRVEYVSSLSSSVRNTCYPEDIPPYPTIRRVQSLHAPPSSMIRSVPISRTEVPPDDE
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KSD PAYCPRPLYQYKPYQSSQARSDYHVTQLQPYFENGRVHYRYSPYSSSSSSYYSPDGALCD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PAYCPRPLYQYKPYQSSQARSDYHVTQLQPYFENGRVHYRYSPYSSSSSSYYSPDGALCD
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KSD VDAYGTVQLRPLHRLPNRDFAFYNPRLQGKSLYSYAGLAPRPRANVTGYFSPNDHNVVSM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VDAYGTVQLRPLHRLPNRDFAFYNPRLQGKSLYSYAGLAPRPRANVTGYFSPNDHNVVSM
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KSD PPAADVKHTYTSWDLEDMEKYRMQSIRRESRARQKVKGPVMSQYDNMTPAVQDDLGGIYV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PPAADVKHTYTSWDLEDMEKYRMQSIRRESRARQKVKGPVMSQYDNMTPAVQDDLGGIYV
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KSD IHLRSKSDPGKTGLLSVAEGKESRHAAKAISPEGEDRFYRRHPEAEMDRAHHHGGHGSTQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IHLRSKSDPGKTGLLSVAEGKESRHAAKAISPEGEDRFYRRHPEAEMDRAHHHGGHGSTQ
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1510      1520      1530      1540      1550      1560
pF1KSD PEKPSLPQKQSSLRSRKLPDMGCSLPEHRAHQEASHRQFCESKNGPPYPQGAGQLDYGSK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PEKPSLPQKQSSLRSRKLPDMGCSLPEHRAHQEASHRQFCESKNGPPYPQGAGQLDYGSK
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

             1570      1580      1590      1600      1610      1620
pF1KSD GIPDTSEPVSYHNSGVKYAASGQESLRLNHKEVRLSKEMERPWVRQPSAPEKHSRDCYKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GIPDTSEPVSYHNSGVKYAASGQESLRLNHKEVRLSKEMERPWVRQPSAPEKHSRDCYKE
             1570      1580      1590      1600      1610      1620

             1630      1640      1650      1660      1670      1680
pF1KSD EEHLTQSIVPPPKPERSHSLKLHHTQNVERDPSVLYQYQPHGKRQSSVTVVSQYDNLEDY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 EEHLTQSIVPPPKPERSHSLKLHHTQNVERDPSVLYQYQPHGKRQSSVTVVSQYDNLEDY
             1630      1640      1650      1660      1670      1680

             1690      1700      1710      1720      1730        
pF1KSD HSLPQHQRGVFGGGGMGTYVPPGFPHPQSRTYATALGQGAFLPAELSLQHPETQIHAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 HSLPQHQRGVFGGGGMGTYVPPGFPHPQSRTYATALGQGAFLPAELSLQHPETQIHAE
             1690      1700      1710      1720      1730        

>>CCDS44769.1 ARHGAP32 gene_id:9743|Hs108|chr11           (2087 aa)
 initn: 11732 init1: 11732 opt: 11732  Z-score: 7511.7  bits: 1403.3 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 11732; 100.0% identity (100.0% similar) in 1738 aa overlap (1-1738:350-2087)

                                             10        20        30
pF1KSD                               MKSRPTKQKLKQRGILKERVFGCDLGEHLL
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 NQKVPQSVTNSVPKPVSKKHGKLITFLRTFMKSRPTKQKLKQRGILKERVFGCDLGEHLL
     320       330       340       350       360       370         

               40        50        60        70        80        90
pF1KSD NSGFEVPQVLQSCTAFIERYGIVDGIYRLSGVASNIQRLRHEFDSEHVPDLTKEPYVQDI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 NSGFEVPQVLQSCTAFIERYGIVDGIYRLSGVASNIQRLRHEFDSEHVPDLTKEPYVQDI
     380       390       400       410       420       430         

              100       110       120       130       140       150
pF1KSD HSVGSLCKLYFRELPNPLLTYQLYEKFSDAVSAATDEERLIKIHDVIQQLPPPHYRTLEF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 HSVGSLCKLYFRELPNPLLTYQLYEKFSDAVSAATDEERLIKIHDVIQQLPPPHYRTLEF
     440       450       460       470       480       490         

              160       170       180       190       200       210
pF1KSD LMRHLSLLADYCSITNMHAKNLAIVWAPNLLRSKQIESACFSGTAAFMEVRIQSVVVEFI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LMRHLSLLADYCSITNMHAKNLAIVWAPNLLRSKQIESACFSGTAAFMEVRIQSVVVEFI
     500       510       520       530       540       550         

              220       230       240       250       260       270
pF1KSD LNHVDVLFSGRISMAMQEGAASLSRPKSLLVSSPSTKLLTLEEAQARTQAQVNSPIVTEN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LNHVDVLFSGRISMAMQEGAASLSRPKSLLVSSPSTKLLTLEEAQARTQAQVNSPIVTEN
     560       570       580       590       600       610         

              280       290       300       310       320       330
pF1KSD KYIEVGEGPAALQGKFHTIIEFPLERKRPQNKMKKSPVGSWRSFFNLGKSSSVSKRKLQR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KYIEVGEGPAALQGKFHTIIEFPLERKRPQNKMKKSPVGSWRSFFNLGKSSSVSKRKLQR
     620       630       640       650       660       670         

              340       350       360       370       380       390
pF1KSD NESEPSEMKAMALKGGRAEGTLRSAKSEESLTSLHAVDGDSKLFRPRRPRSSSDALSASF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 NESEPSEMKAMALKGGRAEGTLRSAKSEESLTSLHAVDGDSKLFRPRRPRSSSDALSASF
     680       690       700       710       720       730         

              400       410       420       430       440       450
pF1KSD NGEMLGNRCNSYDNLPHDNESEEEGGLLHIPALMSPHSAEDVDLSPPDIGVASLDFDPMS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 NGEMLGNRCNSYDNLPHDNESEEEGGLLHIPALMSPHSAEDVDLSPPDIGVASLDFDPMS
     740       750       760       770       780       790         

              460       470       480       490       500       510
pF1KSD FQCSPPKAESECLESGASFLDSPGYSKDKPSANKKDAETGSSQCQTPGSTASSEPVSPLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 FQCSPPKAESECLESGASFLDSPGYSKDKPSANKKDAETGSSQCQTPGSTASSEPVSPLQ
     800       810       820       830       840       850         

              520       530       540       550       560       570
pF1KSD EKLSPFFTLDLSPTEDKSSKPSSFTEKVVYAFSPKIGRKLSKSPSMSISEPISVTLPPRV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EKLSPFFTLDLSPTEDKSSKPSSFTEKVVYAFSPKIGRKLSKSPSMSISEPISVTLPPRV
     860       870       880       890       900       910         

              580       590       600       610       620       630
pF1KSD SEVIGTVSNTTAQNASSSTWDKCVEERDATNRSPTQIVKMKTNETVAQEAYESEVQPLDQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SEVIGTVSNTTAQNASSSTWDKCVEERDATNRSPTQIVKMKTNETVAQEAYESEVQPLDQ
     920       930       940       950       960       970         

              640       650       660       670       680       690
pF1KSD VAAEEVELPGKEDQSVSSSQSKAVASGQTQTGAVTHDPPQDSVPVSSVSLIPPPPPPKNV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VAAEEVELPGKEDQSVSSSQSKAVASGQTQTGAVTHDPPQDSVPVSSVSLIPPPPPPKNV
     980       990      1000      1010      1020      1030         

              700       710       720       730       740       750
pF1KSD ARMLALALAESAQQASTQSLKRPGTSQAGYTNYGDIAVATTEDNLSSSYSAVALDKAYFQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ARMLALALAESAQQASTQSLKRPGTSQAGYTNYGDIAVATTEDNLSSSYSAVALDKAYFQ
    1040      1050      1060      1070      1080      1090         

              760       770       780       790       800       810
pF1KSD TDRPAEQFHLQNNAPGNCDHPLPETTATGDPTHSNTTESGEQHHQVDLTGNQPHQAYLSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TDRPAEQFHLQNNAPGNCDHPLPETTATGDPTHSNTTESGEQHHQVDLTGNQPHQAYLSG
    1100      1110      1120      1130      1140      1150         

              820       830       840       850       860       870
pF1KSD DPEKARITSVPLDSEKSDDHVSFPEDQSGKNSMPTVSFLDQDQSPPRFYSGDQPPSYLGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DPEKARITSVPLDSEKSDDHVSFPEDQSGKNSMPTVSFLDQDQSPPRFYSGDQPPSYLGA
    1160      1170      1180      1190      1200      1210         

              880       890       900       910       920       930
pF1KSD SVDKLHHPLEFADKSPTPPNLPSDKIYPPSGSPEENTSTATMTYMTTTPATAQMSTKEAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SVDKLHHPLEFADKSPTPPNLPSDKIYPPSGSPEENTSTATMTYMTTTPATAQMSTKEAS
    1220      1230      1240      1250      1260      1270         

              940       950       960       970       980       990
pF1KSD WDVAEQPTTADFAAATLQRTHRTNRPLPPPPSQRSAEQPPVVGQVQAATNIGLNNSHKVQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 WDVAEQPTTADFAAATLQRTHRTNRPLPPPPSQRSAEQPPVVGQVQAATNIGLNNSHKVQ
    1280      1290      1300      1310      1320      1330         

             1000      1010      1020      1030      1040      1050
pF1KSD GVVPVPERPPEPRAMDDPASAFISDSGAAAAQCPMATAVQPGLPEKVRDGARVPLLHLRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GVVPVPERPPEPRAMDDPASAFISDSGAAAAQCPMATAVQPGLPEKVRDGARVPLLHLRA
    1340      1350      1360      1370      1380      1390         

             1060      1070      1080      1090      1100      1110
pF1KSD ESVPAHPCGFPAPLPPTRMMESKMIAAIHSSSADATSSSNYHSFVTASSTSVDDALPLPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ESVPAHPCGFPAPLPPTRMMESKMIAAIHSSSADATSSSNYHSFVTASSTSVDDALPLPL
    1400      1410      1420      1430      1440      1450         

             1120      1130      1140      1150      1160      1170
pF1KSD PVPQPKHASQKTVYSSFARPDVTTEPFGPDNCLHFNMTPNCQYRPQSVPPHHNKLEQHQV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PVPQPKHASQKTVYSSFARPDVTTEPFGPDNCLHFNMTPNCQYRPQSVPPHHNKLEQHQV
    1460      1470      1480      1490      1500      1510         

             1180      1190      1200      1210      1220      1230
pF1KSD YGARSEPPASMGLRYNTYVAPGRNASGHHSKPCSRVEYVSSLSSSVRNTCYPEDIPPYPT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 YGARSEPPASMGLRYNTYVAPGRNASGHHSKPCSRVEYVSSLSSSVRNTCYPEDIPPYPT
    1520      1530      1540      1550      1560      1570         

             1240      1250      1260      1270      1280      1290
pF1KSD IRRVQSLHAPPSSMIRSVPISRTEVPPDDEPAYCPRPLYQYKPYQSSQARSDYHVTQLQP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 IRRVQSLHAPPSSMIRSVPISRTEVPPDDEPAYCPRPLYQYKPYQSSQARSDYHVTQLQP
    1580      1590      1600      1610      1620      1630         

             1300      1310      1320      1330      1340      1350
pF1KSD YFENGRVHYRYSPYSSSSSSYYSPDGALCDVDAYGTVQLRPLHRLPNRDFAFYNPRLQGK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 YFENGRVHYRYSPYSSSSSSYYSPDGALCDVDAYGTVQLRPLHRLPNRDFAFYNPRLQGK
    1640      1650      1660      1670      1680      1690         

             1360      1370      1380      1390      1400      1410
pF1KSD SLYSYAGLAPRPRANVTGYFSPNDHNVVSMPPAADVKHTYTSWDLEDMEKYRMQSIRRES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SLYSYAGLAPRPRANVTGYFSPNDHNVVSMPPAADVKHTYTSWDLEDMEKYRMQSIRRES
    1700      1710      1720      1730      1740      1750         

             1420      1430      1440      1450      1460      1470
pF1KSD RARQKVKGPVMSQYDNMTPAVQDDLGGIYVIHLRSKSDPGKTGLLSVAEGKESRHAAKAI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RARQKVKGPVMSQYDNMTPAVQDDLGGIYVIHLRSKSDPGKTGLLSVAEGKESRHAAKAI
    1760      1770      1780      1790      1800      1810         

             1480      1490      1500      1510      1520      1530
pF1KSD SPEGEDRFYRRHPEAEMDRAHHHGGHGSTQPEKPSLPQKQSSLRSRKLPDMGCSLPEHRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SPEGEDRFYRRHPEAEMDRAHHHGGHGSTQPEKPSLPQKQSSLRSRKLPDMGCSLPEHRA
    1820      1830      1840      1850      1860      1870         

             1540      1550      1560      1570      1580      1590
pF1KSD HQEASHRQFCESKNGPPYPQGAGQLDYGSKGIPDTSEPVSYHNSGVKYAASGQESLRLNH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 HQEASHRQFCESKNGPPYPQGAGQLDYGSKGIPDTSEPVSYHNSGVKYAASGQESLRLNH
    1880      1890      1900      1910      1920      1930         

             1600      1610      1620      1630      1640      1650
pF1KSD KEVRLSKEMERPWVRQPSAPEKHSRDCYKEEEHLTQSIVPPPKPERSHSLKLHHTQNVER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KEVRLSKEMERPWVRQPSAPEKHSRDCYKEEEHLTQSIVPPPKPERSHSLKLHHTQNVER
    1940      1950      1960      1970      1980      1990         

             1660      1670      1680      1690      1700      1710
pF1KSD DPSVLYQYQPHGKRQSSVTVVSQYDNLEDYHSLPQHQRGVFGGGGMGTYVPPGFPHPQSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DPSVLYQYQPHGKRQSSVTVVSQYDNLEDYHSLPQHQRGVFGGGGMGTYVPPGFPHPQSR
    2000      2010      2020      2030      2040      2050         

             1720      1730        
pF1KSD TYATALGQGAFLPAELSLQHPETQIHAE
       ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TYATALGQGAFLPAELSLQHPETQIHAE
    2060      2070      2080       

>>CCDS54254.1 ARHGAP33 gene_id:115703|Hs108|chr19         (1123 aa)
 initn: 1443 init1: 1117 opt: 1333  Z-score: 863.3  bits: 172.2 E(32554): 9.1e-42
Smith-Waterman score: 1604; 36.4% identity (57.2% similar) in 1059 aa overlap (1-1002:157-1067)

                                             10        20        30
pF1KSD                               MKSRPTKQKLKQRGILKERVFGCDLGEHLL
                                     :.:::..:.:.:::::..::::::::::: 
CCDS54 CGIPAPQGISSLTSAVPRPRGKLAGLLRTFMRSRPSRQRLRQRGILRQRVFGCDLGEHLS
        130       140       150       160       170       180      

               40        50        60        70        80        90
pF1KSD NSGFEVPQVLQSCTAFIERYGIVDGIYRLSGVASNIQRLRHEFDSEHVPDLTKEPYVQDI
       ::: .:::::. :. ::: .:.::::::::::.:::::::::::::..:.:.   ..:::
CCDS54 NSGQDVPQVLRCCSEFIEAHGVVDGIYRLSGVSSNIQRLRHEFDSERIPELSGPAFLQDI
        190       200       210       220       230       240      

              100       110       120       130       140       150
pF1KSD HSVGSLCKLYFRELPNPLLTYQLYEKFSDAVSAATDEERLIKIHDVIQQLPPPHYRTLEF
       :::.:::::::::::::::::::: :::.:.:.  .::::...::::::::::::::::.
CCDS54 HSVSSLCKLYFRELPNPLLTYQLYGKFSEAMSVPGEEERLVRVHDVIQQLPPPHYRTLEY
        250       260       270       280       290       300      

              160       170       180       190       200       210
pF1KSD LMRHLSLLADYCSITNMHAKNLAIVWAPNLLRSKQIESACFSGTAAFMEVRIQSVVVEFI
       :.:::. .: . . :.:::.::::::::::::: ..::. ..:.::: :::.:::::::.
CCDS54 LLRHLARMARHSANTSMHARNLAIVWAPNLLRSMELESVGMGGAAAFREVRVQSVVVEFL
        310       320       330       340       350       360      

              220       230         240       250       260        
pF1KSD LNHVDVLFSGRISMAMQEGAAS--LSRPKSLLVSSPSTKLLTLEEAQARTQAQVNSPIVT
       :.:::::::  .. :  . :.   : :::::  : :::.::::::::::::.....:  :
CCDS54 LTHVDVLFSDTFTSAGLDPAGRCLLPRPKSLAGSCPSTRLLTLEEAQARTQGRLGTP--T
        370       380       390       400       410       420      

      270       280       290       300        310        320      
pF1KSD ENKYIEVGEGPAALQGKFHTIIEFPLERKRPQNKMK-KSPVGS-WRSFFNLGKSSSVSKR
       :     . ..::.           : ::.. .   : ..: :: :..:: ::.. :: ..
CCDS54 EP---TTPKAPAS-----------PAERRKGERGEKQRKPGGSSWKTFFALGRGPSVPRK
             430                  440       450       460       470

            330       340       350        360       370       380 
pF1KSD K----LQRNESEPSEMKAMALKGGRAEG-TLRSAKSEESLTSLHAVDGDSKLFRPRRPRS
       :    :  ... :.       .:.: .  :::::::::::.:  .  : ..: : :::.:
CCDS54 KPLPWLGGTRAPPQP------SGSRPDTVTLRSAKSEESLSSQASGAGLQRLHRLRRPHS
              480             490       500       510       520    

                 390       400       410       420                 
pF1KSD SSDAL----SASFNGEMLGNRCNSYDNLPHDNESEEEGGLLHIPALM-SP-H--SA----
       ::::.    . . . : :..  .: ..  ... :  :..   . ::  :: :  ::    
CCDS54 SSDAFPVGPAPAGSCESLSSSSSSESSSSESSSSSSESSAAGLGALSGSPSHRTSAWLDD
          530       540       550       560       570       580    

      430         440       450       460       470       480      
pF1KSD -EDVDLSPPDI--GVASLDFDPMSFQCSPPKAESECLESGASFLDSPGYSKDKPSANKKD
        ...:.:::    :. .:::::..:.:: :                              
CCDS54 GDELDFSPPRCLEGLRGLDFDPLTFRCSSP------------------------------
          590       600       610                                  

        490       500       510       520       530       540      
pF1KSD AETGSSQCQTPGSTASSEPVSPLQEKLSPFFTLDLSPTEDKSSKPSSFTEKVVYAFSPKI
                :::. :   :.::             .:    :. :   : .   :.::. 
CCDS54 ---------TPGDPAP--PASP-------------APPAPASAFPPRVTPQ---AISPR-
                   620                      630       640          

        550        560       570       580       590       600     
pF1KSD GRKLSKSPS-MSISEPISVTLPPRVSEVIGTVSNTTAQNASSSTWDKCVEERDATNRSPT
       :     ::. ..::::..:..:: : :..:      : .: .:.             .::
CCDS54 GPTSPASPAALDISEPLAVSVPPAVLELLG------AGGAPASA-------------TPT
        650       660       670             680                    

         610       620       630       640       650       660     
pF1KSD QIVKMKTNETVAQEAYESEVQPLDQVAAEEVELPGKEDQSVSSSQSKAVASGQTQTGAVT
         ..         .. . .. ::         : : :   ... :..  .. .   : . 
CCDS54 PALS-------PGRSLRPHLIPL--------LLRGAEAPLTDACQQEMCSKLRGAQGPLG
       690              700               710       720       730  

         670       680           690       700       710           
pF1KSD HDPPQDSVPVSSVSLI-P---PPPPPKNVARMLALALAESAQQASTQSLKRP--GTSQAG
        :  .. .:   .::. :   ::::::: ::..:::::: :::.. :. ..   ::  :.
CCDS54 PDM-ESPLPPPPLSLLRPGGAPPPPPKNPARLMALALAERAQQVAEQQSQQECGGTPPAS
             740       750       760       770       780       790 

     720        730       740       750       760       770        
pF1KSD YTNYG-DIAVATTEDNLSSSYSAVALDKAYFQTDRPAEQFHLQNNAPGNCDHPLPETTAT
        . .  .... .  . :..: :.            :    :    .::   . ::.  . 
CCDS54 QSPFHRSLSLEVGGEPLGTSGSG----------PPPNSLAHPGAWVPGPPPY-LPRQQSD
             800       810                 820       830        840

      780       790       800       810       820       830        
pF1KSD GDPTHSNTTESGEQHHQVDLTGNQPHQAYLSGDPEKARITSVPLDSEKSDDHVSFPEDQS
       :.  .:.    : ... .   .. :  ...:  :..     .:         .. :  . 
CCDS54 GSLLRSQRPM-GTSRRGLRGPAQVPTPGFFSPAPREC----LP-------PFLGVP--KP
              850        860       870                  880        

      840       850        860       870       880                 
pF1KSD GKNSMPTVSFLDQDQSP-PRFYSGDQPPSYLGASVDKLHHPLEFADKSP-TPP-------
       :   .   ::  : .:: : . :.  ::. :  . ..:.. .  .. :: . :       
CCDS54 GLYPLGPPSF--QPSSPAPVWRSSLGPPAPLDRG-ENLYYEIGASEGSPYSGPTRSWSPF
        890         900       910        920       930       940   

      890       900           910       920         930       940  
pF1KSD -NLPSDKIYPPSG----SPEENTSTATMTYMTTTPAT--AQMSTKEASWDVAEQPTTADF
        ..: :..    :    ::  . :   .  .  .:.    .     :    :..::  . 
CCDS54 RSMPPDRLNASYGMLGQSPPLHRSPDFLLSYPPAPSCFPPDHLGYSAPQHPARRPTPPEP
           950       960       970       980       990      1000   

            950            960         970         980       990   
pF1KSD AAATLQRTHRTNRPLP-----PP--PSQRSAEQPPV--VGQVQAATNIGLNNSHKVQGVV
         ..:    :   :       ::  : .::   :::  . : : :   :  . :.: :  
CCDS54 LYVNLALGPRGPSPASSSSSSPPAHPRSRSDPGPPVPRLPQKQRAP-WGPRTPHRVPG--
          1010      1020      1030      1040       1050      1060  

          1000      1010      1020      1030      1040      1050   
pF1KSD PVPERPPEPRAMDDPASAFISDSGAAAAQCPMATAVQPGLPEKVRDGARVPLLHLRAESV
         :  ::::                                                   
CCDS54 --PWGPPEPLLLYRAAPPAYGRGGELHRGSLYRNGGQRGEGAGPPPPYPTPSWSLHSEGQ
               1070      1080      1090      1100      1110        

>>CCDS12477.1 ARHGAP33 gene_id:115703|Hs108|chr19         (1126 aa)
 initn: 1422 init1: 1117 opt: 1235  Z-score: 800.6  bits: 160.6 E(32554): 2.8e-38
Smith-Waterman score: 1330; 43.4% identity (66.2% similar) in 588 aa overlap (1-565:293-828)

                                             10        20        30
pF1KSD                               MKSRPTKQKLKQRGILKERVFGCDLGEHLL
                                     :.:::..:.:.:::::..::::::::::: 
CCDS12 CGIPAPQGISSLTSAVPRPRGKLAGLLRTFMRSRPSRQRLRQRGILRQRVFGCDLGEHLS
            270       280       290       300       310       320  

               40        50        60        70        80        90
pF1KSD NSGFEVPQVLQSCTAFIERYGIVDGIYRLSGVASNIQRLRHEFDSEHVPDLTKEPYVQDI
       ::: .:::::. :. ::: .:.::::::::::.:::::::::::::..:.:.   ..:::
CCDS12 NSGQDVPQVLRCCSEFIEAHGVVDGIYRLSGVSSNIQRLRHEFDSERIPELSGPAFLQDI
            330       340       350       360       370       380  

              100       110       120       130       140       150
pF1KSD HSVGSLCKLYFRELPNPLLTYQLYEKFSDAVSAATDEERLIKIHDVIQQLPPPHYRTLEF
       :::.:::::::::::::::::::: :::.:.:.  .::::...::::::::::::::::.
CCDS12 HSVSSLCKLYFRELPNPLLTYQLYGKFSEAMSVPGEEERLVRVHDVIQQLPPPHYRTLEY
            390       400       410       420       430       440  

              160       170       180       190       200       210
pF1KSD LMRHLSLLADYCSITNMHAKNLAIVWAPNLLRSKQIESACFSGTAAFMEVRIQSVVVEFI
       :.:::. .: . . :.:::.::::::::::::: ..::. ..:.::: :::.:::::::.
CCDS12 LLRHLARMARHSANTSMHARNLAIVWAPNLLRSMELESVGMGGAAAFREVRVQSVVVEFL
            450       460       470       480       490       500  

              220       230         240       250       260        
pF1KSD LNHVDVLFSGRISMAMQEGAAS--LSRPKSLLVSSPSTKLLTLEEAQARTQAQVNSPIVT
       :.:::::::  .. :  . :.   : :::::  : :::.::::::::::::.....:  :
CCDS12 LTHVDVLFSDTFTSAGLDPAGRCLLPRPKSLAGSCPSTRLLTLEEAQARTQGRLGTP--T
            510       520       530       540       550         560

      270       280       290       300        310        320      
pF1KSD ENKYIEVGEGPAALQGKFHTIIEFPLERKRPQNKMK-KSPVGS-WRSFFNLGKSSSVSKR
       :     . ..::.           : ::.. .   : ..: :: :..:: ::.. :: ..
CCDS12 EPT---TPKAPAS-----------PAERRKGERGEKQRKPGGSSWKTFFALGRGPSVPRK
                 570                  580       590       600      

            330       340       350        360             370     
pF1KSD K----LQRNESEPSEMKAMALKGGRAEG-TLRSAKSEESLTS------LHAVDGDSKLFR
       :    :  ... :.       .:.: .  :::::::::::.:      : .. :      
CCDS12 KPLPWLGGTRAPPQP------SGSRPDTVTLRSAKSEESLSSQASGAELLGAGGAPASAT
        610       620             630       640       650       660

         380       390        400       410       420        430   
pF1KSD PRRPRSSSDALSASFNGEML-GNRCNSYDNLPHDNESEEEGGLLHI-PALMSPHSAEDVD
       :    : . .:   .   .: : .    :   ..  :. .:.   . : . ::       
CCDS12 PTPALSPGRSLRPHLIPLLLRGAEAPLTDACQQEMCSKLRGAQGPLGPDMESP-------
              670       680       690       700       710          

           440       450       460       470       480       490   
pF1KSD LSPPDIGVASLDFDPMSFQCSPPKAESECLESGASFLDSPGYSKDKPSANKKDAETGSSQ
       : :: ...    . : .    :::  .. .  . .        . .  :...      ::
CCDS12 LPPPPLSL----LRPGGAPPPPPKNPARLMALALA-------ERAQQVAEQQ------SQ
           720           730       740              750            

           500       510             520       530       540       
pF1KSD CQTPGSTASSEPVSPLQEKLS------PFFTLDLSPTEDKSSKPSSFTEKVVYAFSPKIG
        .  :.  .:.  ::....::      :. :   .:  .. ..:...    : .  : . 
CCDS12 QECGGTPPASQ--SPFHRSLSLEVGGEPLGTSGSGPPPNSLAHPGAW----VPGPPPYLP
        760         770       780       790       800           810

       550       560       570       580       590       600       
pF1KSD RKLSKSPSMSISEPISVTLPPRVSEVIGTVSNTTAQNASSSTWDKCVEERDATNRSPTQI
       :. : .  .  ..:....                                          
CCDS12 RQQSDGSLLRSQRPMGTSRRGLRGPAQVSAQLRAGGGGRDAPEAAAQSPCSVPSQVPTPG
              820       830       840       850       860       870

>>CCDS43135.1 ARHGAP31 gene_id:57514|Hs108|chr3           (1444 aa)
 initn: 1166 init1: 964 opt: 1156  Z-score: 748.5  bits: 151.3 E(32554): 2.3e-35
Smith-Waterman score: 1339; 28.6% identity (52.6% similar) in 1480 aa overlap (1-1386:1-1366)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MKSRPTKQKLKQRGILKERVFGCDLGEHLLNSGFEVPQVLQSCTAFIERYGIVDGIYRLS
       ::.. .:::::..:     .::::: :.: .:: .:: ::.::. ::: .::::::::::
CCDS43 MKNKGAKQKLKRKGA--ASAFGCDLTEYLESSGQDVPYVLKSCAEFIETHGIVDGIYRLS
               10          20        30        40        50        

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD GVASNIQRLRHEFDSEHVPDLTKEPYVQDIHSVGSLCKLYFRELPNPLLTYQLYEKFSDA
       ::.:::::::.:: :.. ::::.: :.:::: :::::::::::::::::::.:::::..:
CCDS43 GVTSNIQRLRQEFGSDQCPDLTREVYLQDIHCVGSLCKLYFRELPNPLLTYELYEKFTEA
       60        70        80        90       100       110        

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD VSAATDEERLIKIHDVIQQLPPPHYRTLEFLMRHLSLLADYCSITNMHAKNLAIVWAPNL
       ::   .: .: .:..:::.::: ::::::.:.:::. .:.. : :::::.:::.::::::
CCDS43 VSHCPEEGQLARIQNVIQELPPSHYRTLEYLIRHLAHIASFSSKTNMHARNLALVWAPNL
      120       130       140       150       160       170        

              190       200       210       220       230          
pF1KSD LRSKQIESACFSGTAAFMEVRIQSVVVEFILNHVDVLFSGRISMAMQEGAASLSRP--KS
       ::::.::..  .: :::. ::.:.::.:::::::: .:..    ....     .::  ::
CCDS43 LRSKEIEATGCNGDAAFLAVRVQQVVIEFILNHVDQIFNNGAPGSLENDE---NRPIMKS
      180       190       200       210       220          230     

      240         250       260       270       280       290      
pF1KSD LLVSSPST--KLLTLEEAQARTQAQVNSPIVTENKYIEVGEGPAALQGKFHTIIEFPLER
       : . . :   ::..:::::::. : .: :   : .   . :    .   :::..:.: ..
CCDS43 LTLPALSLPMKLVSLEEAQARSLA-TNHPARKERRENSLPEIVPPMGTLFHTVLELPDNK
         240       250        260       270       280       290    

        300       310       320       330       340       350      
pF1KSD KRPQNKMKKSPVGSWRSFFNLGKSSSVSKRKLQRNESEPSEMKAMALKGGRAEGTLRSAK
       .. ..: ::     :.:.::::.:.: :: ::.:: :   . . ....    ..:.: ::
CCDS43 RKLSSKSKK-----WKSIFNLGRSGSDSKSKLSRNGSVFVRGQRLSVE----KATIRPAK
          300            310       320       330           340     

        360       370       380        390       400       410     
pF1KSD SEESLTSLHAVDGDSKLFRPRRPRSSSDALSAS-FNGEMLGNRCNSYDNLPHDNESEEEG
       : .:: :. .   ..:    :   ...  . :. ...   :. :   :   ...:  .::
CCDS43 SMDSLCSVPVEGKETKGNFNRTVTTGGFFIPATKMHSTGTGSSC---DLTKQEGEWGQEG
         350       360       370       380          390       400  

         420       430         440       450       460       470   
pF1KSD GLLHIPALMSPHSAEDVDLSPP--DIGVASLDFDPMSFQCSPPKAESECLESGASFLDSP
               : : .    :.:     .  :.    : ...   :  . :  ... ..:   
CCDS43 --------MPPGAEGGFDVSSDRSHLQGAQARPPPEQLKVFRPVEDPESEQTAPKMLGMF
                    410       420       430       440       450    

           480       490       500                510       520    
pF1KSD GYSKDKPSANKKDAETGSSQCQTPGSTAS------SEPVS---PLQEKLSPFFTLDLSPT
         :.:.::   :.. :.:   . :.   .      ::: .   ::  ..:  .. . .: 
CCDS43 YTSNDSPS---KSVFTSSLFQMEPSPRNQRKALNISEPFAVSVPL--RVSAVISTNSTPC
          460          470       480       490         500         

          530       540              550        560       570      
pF1KSD EDKSSKPSSFTEKVVYAFS-------PKIGRKL-SKSPSMSISEPISVTLPPRVSEVIGT
       .   .. .:..    ..:        :.  . : ... . :. .  ..     : :. ::
CCDS43 RTPPKELQSLSSLEEFSFHGSESGGWPEEEKPLGAETSAASVPKKAGLEDAKAVPEAPGT
     510       520       530       540       550       560         

          580       590       600       610       620              
pF1KSD V--SNTTAQNASSSTWDKCVEERDATNRSPTQIVKMKTNETVAQEAYE------SEVQPL
       :  :.  .:. ..   .: . : . ...  ... :  . : :..:. :      : .:  
CCDS43 VECSKGLSQEPGAHLEEKKTPESSLSSQHLNELEKRPNPEKVVEEGREAGEMESSTLQES
     570       580       590       600       610       620         

      630       640               650       660           670      
pF1KSD DQVAAEEVELPGKEDQSVSSS--------QSKAVASGQTQTG----AVTHDPPQDSVPVS
        .. :: : :   ........        . : . : .  ..    :.  .: :  .  :
CCDS43 PRARAEAVLLHEMDEDDLANALIWPEIQQELKIIESEEELSSLPPPALKTSPIQPILESS
     630       640       650       660       670       680         

        680               690       700       710       720        
pF1KSD SVSLIPPPPP--------PKNVARMLALALAESAQQASTQSLKRPGTSQAGYTNYGDIAV
          .::  ::        :  :.  : .   . :.: :::     :.: :.  .  .   
CCDS43 LGPFIPSEPPGSLPCGSFPAPVSTPLEVWTRDPANQ-STQ-----GASTAASREKPE---
     690       700       710       720             730       740   

      730       740        750       760       770       780       
pF1KSD ATTEDNLSSSYSAVA-LDKAYFQTDRPAEQFHLQNNAPGNCDHPLPETTATGDPTHSNTT
          :..:  . ...: :. . :.   :  :  .. ..::: . ::: .     : . .: 
CCDS43 --PEQGLHPDLASLAPLEIVPFEKASP--QATVEVGGPGNLSPPLPPAPPPPTPLEESTP
                750       760         770       780       790      

       790       800       810       820       830       840       
pF1KSD ESGEQHHQVDLTGNQPHQAYLSGDPEKARITSVPLDSEKSDDHVSFPEDQSGKNSMPTVS
               : :. . :..     :  .   :.. .:. ::.:              : .:
CCDS43 --------VLLSKGGPERE----DSSRKLRTDLYIDQLKSQDS-------------PEIS
                800           810       820                    830 

       850        860       870          880       890       900   
pF1KSD FLDQ-DQSPPRFYSGDQPPSYLGASVDK---LHHPLEFADKSPTPPNLPSDKIYPPSGSP
        : : ... ::   .:.  :  .::  :   .  : . ..      .  . ..  ::   
CCDS43 SLCQGEEATPRH--SDKQNSKNAASEGKGCGFPSPTREVEIVSQEEEDVTHSVQEPSDCD
             840         850       860       870       880         

             910       920       930         940         950       
pF1KSD EENTST--ATMTYMTTTPATAQMSTKEASWDVA--EQPTTADFAAATLQ--RTHRTNRPL
       :..: :  :      . :       .: .: ..  ..::  :   : .:  . :. .. :
CCDS43 EDDTVTDIAQHGLEMVEPW------EEPQWVTSPLHSPTLKDAHKAQVQGLQGHQLEKRL
     890       900             910       920       930       940   

       960           970         980       990      1000           
pF1KSD PPPPSQRSAE----QPPVVGQ--VQAATNIGLNNSHKVQGVVPVPERPP--EPRAMDDPA
          :: :...    .: : .:  ... .. .  : .  ..  :.  . :  :  . :. :
CCDS43 SHRPSLRQSHSLDSKPTVKSQWTLEVPSSSSCANLETERNSDPLQPQAPRREITGWDEKA
           950       960       970       980       990      1000   

     1010      1020          1030          1040      1050      1060
pF1KSD -SAFISDSGAAAAQCPMA----TAVQPG----LPEKVRDGARVPLLHLRAESVPAHPCGF
         .:   ::  .:. :      ..:::.     : .. .: ..   ::   :   .  : 
CCDS43 LRSFREFSGLKGAEAPPNQKGPSGVQPNPAETSPISLAEGKELGT-HLGHSSPQIRQGGV
          1010      1020      1030      1040       1050      1060  

             1070      1080      1090      1100              1110  
pF1KSD PAPLPPTRMMESKMIAAIHSSSADATSSSNYHSFVTASSTSVD--------DALPLPLPV
       :.:       ::.  ..   :  :.:: ... . .  .::           ..: :   .
CCDS43 PGP-------ESSKESS--PSVQDSTSPGEHPAKLQLKSTECGPPKGKNRPSSLNLDPAI
                  1070        1080      1090      1100      1110   

           1120      1130       1140      1150         1160        
pF1KSD PQPKHASQKTVYSSFARPDV-TTEPFGPDNCLHFNMTPNCQYRPQSV---PPHHNKLEQH
       :       ..: .::. : . ..::  :   . .  .  :.  :  :    :.   .  :
CCDS43 PIADLFWFENV-ASFSSPGMQVSEPGDPK--VTWMTSSYCKADPWRVYSQDPQDLDIVAH
          1120       1130      1140        1150      1160      1170

     1170      1180      1190      1200      1210      1220        
pF1KSD QVYGARSEPPASMGLRYNTYVAPGRNASGHHSKPCSRVEYVSSLSSSVRNTCYPEDIPPY
        . : :.  :.:..   .....          : : ... :  .  ... :  :. .:  
CCDS43 ALTGRRNSAPVSVSAVRTSFMV----------KMC-QARAVPVIPPKIQYTQIPQPLPSQ
             1180      1190                 1200      1210         

     1230       1240      1250      1260      1270      1280       
pF1KSD PTIRR-VQSLHAPPSSMIRSVPISRTEVPPDDEPAYCPRPLYQYKPYQSSQARSDYHVTQ
        . .  :: :.   :.   :   . :. :  :.     .   . :: :.  : ..  :  
CCDS43 SSGENGVQPLER--SQEGPSSTSGTTQKPAKDDSPSSLESSKEEKPKQDPGAIKSSPVDA
    1220      1230        1240      1250      1260      1270       

      1290      1300      1310      1320      1330      1340       
pF1KSD LQPYFENGRVHYRYSPYSSSSSSYYSPDGALCDVDAYGTVQLRPLHRLPNRDFAFYNPRL
         : . .: .    ::  .::.        :   ::    . :  .  :. :  . . .:
CCDS43 TAPCMCEGPT---LSPEPGSSN-------LLSTQDAVVQCRKRMSETEPSGD-NLLSSKL
      1280         1290             1300      1310       1320      

      1350      1360       1370      1380      1390      1400      
pF1KSD QGKSLYSYAGLAPRP-RANVTGYFSPNDHNVVSMPPAADVKHTYTSWDLEDMEKYRMQSI
       .  :  :      :: : .    :::    .  .::.. :                    
CCDS43 ERPSGGSKPFHRSRPGRPQSLILFSPPFPIMDHLPPSSTVTDSKVLLSPIRSPTQTVSPG
       1330      1340      1350      1360      1370      1380      

       1410      1420      1430      1440      1450      1460      
pF1KSD RRESRARQKVKGPVMSQYDNMTPAVQDDLGGIYVIHLRSKSDPGKTGLLSVAEGKESRHA
                                                                   
CCDS43 LLCGELAENTWVTPEGVTLRNKMTIPKNGQRLETSTSCFYQPQRRSVILDGRSGRQIE  
       1390      1400      1410      1420      1430      1440      

>>CCDS1215.1 ARHGAP30 gene_id:257106|Hs108|chr1           (890 aa)
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Smith-Waterman score: 1203; 36.9% identity (60.3% similar) in 731 aa overlap (1-690:1-687)

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pF1KSD MKSRPTKQKLKQRGILKERVFGCDLGEHLLNSGFEVPQVLQSCTAFIERYGIVDGIYRLS
       ::::   :: :..:  ::::::::: ::: .:: ::::::.::. :.:.::.::::::::
CCDS12 MKSR---QKGKKKGSAKERVFGCDLQEHLQHSGQEVPQVLKSCAEFVEEYGVVDGIYRLS
                  10        20        30        40        50       

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pF1KSD GVASNIQRLRHEFDSEHVPDLTKEPYVQDIHSVGSLCKLYFRELPNPLLTYQLYEKFSDA
       ::.::::.::.::.::. ::: .. :.:::: :.:::: ::::::.:::::.::.::..:
CCDS12 GVSSNIQKLRQEFESERKPDLRRDVYLQDIHCVSSLCKAYFRELPDPLLTYRLYDKFAEA
        60        70        80        90       100       110       

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pF1KSD VSAATDEERLIKIHDVIQQLPPPHYRTLEFLMRHLSLLADYCSITNMHAKNLAIVWAPNL
       :..  . :::.:: .:...:: :.:::::::::::  .:.. . :::::.::::::::::
CCDS12 VGVQLEPERLVKILEVLRELPVPNYRTLEFLMRHLVHMASFSAQTNMHARNLAIVWAPNL
       120       130       140       150       160       170       

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD LRSKQIESACFSGTAAFMEVRIQSVVVEFILNHVDVLFSGRISMAMQEGAASLSRPKSLL
       ::::.::.. :.:::::::::.::.::::::.::: ::.:    :   :.   :  .:: 
CCDS12 LRSKDIEASGFNGTAAFMEVRVQSIVVEFILTHVDQLFGG----AALSGGEVESGWRSL-
       180       190       200       210           220       230   

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD VSSPSTKLLTLEEAQARTQAQVNSPIVTENKYIEVGEGPAALQGKFHTIIEFPLERKRPQ
          :.:.     :         . : .     ...:.::  ..  .:::::.  .... .
CCDS12 ---PGTRASGSPEDLMPRPLPYHLPSI-----LQAGDGPPQMR-PYHTIIEIAEHKRKGS
               240       250            260        270       280   

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD NKMKKSPVGSWRSFFNLGKSSSVSKRKLQRNESEPSEMKAMALKGGRAEGTLRSAKSEES
        :..:     :::.::::.:.  .:::: :. .:  : :.        .:::: ::: .:
CCDS12 LKVRK-----WRSIFNLGRSGHETKRKLPRG-AEDREDKS-------NKGTLRPAKSMDS
                290       300        310              320       330

               370       380               390            400      
pF1KSD LTSLH-AVDGDSKLFRPRRPRSS--------SDALSASFN-----GEMLGNRCNSYDNLP
       :..   : :    :  :  :: :        .:.. :. .     .: ::.  ::  . :
CCDS12 LSAAAGASDEPEGLVGPSSPRPSPLLPESLENDSIEAAEGEQEPEAEALGGT-NSEPGTP
              340       350       360       370       380          

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pF1KSD HDNESE-EEGGL--------LHI--PALMS-PHSAEDVDLSPPDI-GVASLDFDPMSFQC
       . ..:  . ::         .::  :  .. :    ..   ::.: . .::     ...:
CCDS12 RAGRSAIRAGGSSRAERCAGVHISDPYNVNLPLHITSILSVPPNIISNVSLARLTRGLEC
     390       400       410       420       430       440         

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pF1KSD SPPKAESECLESGASFLDSPGYSKDKPSANKKDAETGSSQCQTPGSTASSEPVSP-LQEK
        :   .     :: .   .:: .   :     : .  .:  ..: . .. . ..: :...
CCDS12 -PALQHRPSPASGPG--PGPGLGPGPP-----DEKLEASPASSPLADSGPDDLAPALEDS
      450       460         470            480       490       500 

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pF1KSD LSPFFTLDLSPTEDKSSKPSSFT--EKVVYAFSPKIGRKLSKS---PSMSISEPISVTLP
       ::     ..:  ::.::.   ..  :    : .   :  .: .   :.:.  : . . . 
CCDS12 LSQEVQDSFSFLEDSSSSEPEWVGAEDGEVAQAEAAGAAFSPGEDDPGMGYLEEL-LGVG
             510       520       530       540       550        560

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pF1KSD PRVSE--VIGTVSNTTAQNASSSTWDKCVEERDATNRSPTQIVKMKTNETVAQEAYESEV
       :.: :  :   ... . ..:.     .:    .:   .:   :. ...: :   ::. ..
CCDS12 PQVEEFSVEPPLDDLSLDEAQFVLAPSCCSLDSA---GPRPEVEEENGEEVFLSAYD-DL
              570       580       590          600       610       

         630       640       650       660       670       680     
pF1KSD QPLDQVAAEEVELPGKEDQSVSSSQSKAVASGQTQTGAVTHDPPQDSVPVSSVSL-----
       .::        .  :. .  ...   .:...:  . .       ... : . ...     
CCDS12 SPLLGPKPPIWKGSGSLEGEAAGCGRQALGQGGEEQACWEVGEDKQAEPGGRLDIREEAE
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       ::::.::.. :.:::::::::.::.::::::.::: ::.:    :   :.   :  .:: 
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          :.:.     :         . : .     ...:.::  ..  .:::::.  .... .
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        :..:     :::.::::.:.  .:::: :. .:  : :.        .:::: ::: .:
CCDS30 LKVRK-----WRSIFNLGRSGHETKRKLPRG-AEDREDKS-------NKGTLRPAKSMDS
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       :..   : :    :  :  :: :        .:.. :. .     .: ::.  ::  . :
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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