seq1 = pF1KSDA0215.tfa, 2469 bp
seq2 = pF1KSDA0215/gi89161218f_46629240.tfa (gi89161218f:46629240_46903420), 274181 bp
>pF1KSDA0215 2469
>gi89161218f:46629240_46903420 (ChrX)
1-46 (100001-100046) 100% ->
47-126 (100819-100898) 100% ->
127-284 (113227-113384) 100% ->
285-475 (139831-140021) 100% ->
476-687 (142999-143210) 100% ->
688-855 (148728-148895) 100% ->
856-972 (154056-154172) 100% ->
973-1443 (169265-169735) 100% ->
1444-1561 (171189-171306) 100% ->
1562-2469 (173274-174181) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGAAACGCCATAGGCCTGTCAGCAGCAGTGACAGTTCAGACGAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
100001 ATGAAACGCCATAGGCCTGTCAGCAGCAGTGACAGTTCAGACGAAAGTG.
50 . : . : . : . : . :
47 GTCCTTCCACTTCCTTTACTTCTGGCTCAATGTATAGGATCAAGT
..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 ..CAGGTCCTTCCACTTCCTTTACTTCTGGCTCAATGTATAGGATCAAGT
100 . : . : . : . : . :
92 CAAAAATTCCAAATGAACACAAGAAACCTGCTGAG GTATTC
|||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
100864 CAAAAATTCCAAATGAACACAAGAAACCTGCTGAGGTG...CAGGTATTC
150 . : . : . : . : . :
133 CGGAAGGACCTCATCAGTGCCATGAAACTTCCAGATTCTCACCACATTAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113233 CGGAAGGACCTCATCAGTGCCATGAAACTTCCAGATTCTCACCACATTAA
200 . : . : . : . : . :
183 TCCTGATAGCTATTACCTCTTTGCTGATACATGGAAGGAAGAATGGGAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113283 TCCTGATAGCTATTACCTCTTTGCTGATACATGGAAGGAAGAATGGGAAA
250 . : . : . : . : . :
233 AGGGAGTCCAGGTACCAGCCAGTCCAGACACCGTTCCACAGCCTTCTCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113333 AGGGAGTCCAGGTACCAGCCAGTCCAGACACCGTTCCACAGCCTTCTCTC
300 . : . : . : . : . :
283 AG GATTATAGCTGAGAAGGTAAAGGACGTTCTGTTTATCCG
||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113383 AGGTA...TAGGATTATAGCTGAGAAGGTAAAGGACGTTCTGTTTATCCG
350 . : . : . : . : . :
324 ACCCCGGAAGTATATTCACTGCTCCAGCCCAGACACCACAGAGCCTGGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
139870 ACCCCGGAAGTATATTCACTGCTCCAGCCCAGACACCACAGAGCCTGGCT
400 . : . : . : . : . :
374 ACATCAACATCATGGAGTTGGCAGCATCTGTTTGCCGCTATGACCTAGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
139920 ACATCAACATCATGGAGTTGGCAGCATCTGTTTGCCGCTATGACCTAGAT
450 . : . : . : . : . :
424 GACATGGACATCTTCTGGCTTCAGGAACTCAATGAAGACCTTGCAGAAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
139970 GACATGGACATCTTCTGGCTTCAGGAACTCAATGAAGACCTTGCAGAAAT
500 . : . : . : . : . :
474 GG GTTGTGGGCCAGTTGATGAGAATCTTATGGAAAAGACAG
||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
140020 GGGTA...CAGGTTGTGGGCCAGTTGATGAGAATCTTATGGAAAAGACAG
550 . : . : . : . : . :
515 TAGAAGTCCTGGAACGCCATTGCCATGAAAATATGAACCATGCTATTGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
143038 TAGAAGTCCTGGAACGCCATTGCCATGAAAATATGAACCATGCTATTGAG
600 . : . : . : . : . :
565 ACAGAGGAAGGGCTAGGCATAGAGTATGATGAAGATGTGATCTGTGATGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
143088 ACAGAGGAAGGGCTAGGCATAGAGTATGATGAAGATGTGATCTGTGATGT
650 . : . : . : . : . :
615 GTGCCGGTCTCCAGACAGTGAAGAAGGGAATGATATGGTGTTCTGTGATA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
143138 GTGCCGGTCTCCAGACAGTGAAGAAGGGAATGATATGGTGTTCTGTGATA
700 . : . : . : . : . :
665 AGTGTAACGTCTGTGTGCATCAG GCCTGCTATGGCATCCTC
|||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
143188 AGTGTAACGTCTGTGTGCATCAGGTT...CAGGCCTGCTATGGCATCCTC
750 . : . : . : . : . :
706 AAGGTCCCAGAAGGCAGCTGGCTGTGTCGCTCCTGTGTCCTGGGCATTTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
148746 AAGGTCCCAGAAGGCAGCTGGCTGTGTCGCTCCTGTGTCCTGGGCATTTA
800 . : . : . : . : . :
756 TCCGCAATGTGTGTTATGTCCAAAGAAAGGTGGAGCCCTGAAGACCACCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
148796 TCCGCAATGTGTGTTATGTCCAAAGAAAGGTGGAGCCCTGAAGACCACCA
850 . : . : . : . : . :
806 AGACAGGGACTAAATGGGCTCATGTCAGCTGTGCCCTGTGGATCCCAGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
148846 AGACAGGGACTAAATGGGCTCATGTCAGCTGTGCCCTGTGGATCCCAGAG
900 . : . : . : . : . :
856 GTCAGCATTGCTTGTCCTGAGAGGATGGAACCGATCACGAA
>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
148896 GTA...TAGGTCAGCATTGCTTGTCCTGAGAGGATGGAACCGATCACGAA
950 . : . : . : . : . :
897 GATCTCCCACATCCCACCCAGTCGGTGGGCCTTAGTCTGCAACTTGTGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
154097 GATCTCCCACATCCCACCCAGTCGGTGGGCCTTAGTCTGCAACTTGTGCA
1000 . : . : . : . : . :
947 AGTTGAAGACGGGGGCTTGTATTCAG TGCTCTATAAAAAGC
||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
154147 AGTTGAAGACGGGGGCTTGTATTCAGGTA...CAGTGCTCTATAAAAAGC
1050 . : . : . : . : . :
988 TGCATCACTGCCTTCCACGTCACCTGTGCCTTTGAGCACGGCCTAGAGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
169280 TGCATCACTGCCTTCCACGTCACCTGTGCCTTTGAGCACGGCCTAGAGAT
1100 . : . : . : . : . :
1038 GAAGACCATCCTAGATGAGGGAGACGAAGTGAAGTTCAAGTCATATTGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
169330 GAAGACCATCCTAGATGAGGGAGACGAAGTGAAGTTCAAGTCATATTGCC
1150 . : . : . : . : . :
1088 TCAAGCATAGCCAAAACAGGCAGAAACTTGGAGAAGCTGAGTACCCCCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
169380 TCAAGCATAGCCAAAACAGGCAGAAACTTGGAGAAGCTGAGTACCCCCAC
1200 . : . : . : . : . :
1138 CACAGGGCTAAAGAGCAGAGCCAGGCCAAAAGTGAGAAAACCAGCCTGCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
169430 CACAGGGCTAAAGAGCAGAGCCAGGCCAAAAGTGAGAAAACCAGCCTGCG
1250 . : . : . : . : . :
1188 GGCACAGAAGCTTCGGGAGCTGGAGGAGGAGTTCTATTCCTTGGTACGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
169480 GGCACAGAAGCTTCGGGAGCTGGAGGAGGAGTTCTATTCCTTGGTACGAG
1300 . : . : . : . : . :
1238 TGGAAGATGTGGCCGCAGAGCTGGGTATGCCCACGCTAGCTGTGGACTTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
169530 TGGAAGATGTGGCCGCAGAGCTGGGTATGCCCACGCTAGCTGTGGACTTT
1350 . : . : . : . : . :
1288 ATCTATAACTACTGGAAACTGAAGCGGAAAAGTAACTTCAATAAGCCATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
169580 ATCTATAACTACTGGAAACTGAAGCGGAAAAGTAACTTCAATAAGCCATT
1400 . : . : . : . : . :
1338 ATTTCCTCCAAAGGAGGATGAAGAAAATGGGCTGGTGCAGCCAAAAGAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
169630 ATTTCCTCCAAAGGAGGATGAAGAAAATGGGCTGGTGCAGCCAAAAGAGG
1450 . : . : . : . : . :
1388 AAAGCATTCACACTCGAATGAGAATGTTTATGCATCTACGCCAGGACCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
169680 AAAGCATTCACACTCGAATGAGAATGTTTATGCATCTACGCCAGGACCTG
1500 . : . : . : . : . :
1438 GAGAGG GTCCGAAATCTGTGCTATATGATAAGCAGACGAGA
||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
169730 GAGAGGGTA...CAGGTCCGAAATCTGTGCTATATGATAAGCAGACGAGA
1550 . : . : . : . : . :
1479 GAAGCTGAAGCTGTCACACAACAAAATACAGGAACAGATCTTCGGTTTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
171224 GAAGCTGAAGCTGTCACACAACAAAATACAGGAACAGATCTTCGGTTTGC
1600 . : . : . : . : . :
1529 AAGTCCAGCTTCTTAACCAAGAAATTGATGCAG GGCTTCCT
|||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
171274 AAGTCCAGCTTCTTAACCAAGAAATTGATGCAGGTA...CAGGGCTTCCT
1650 . : . : . : . : . :
1570 TTGACAAATGCACTTGAAAACTCACTGTTTTACCCACCACCAAGAATTAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
173282 TTGACAAATGCACTTGAAAACTCACTGTTTTACCCACCACCAAGAATTAC
1700 . : . : . : . : . :
1620 CTTGAAGTTAAAAATGCCCAAATCAACCCCAGAAGACCACAGAAACAGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
173332 CTTGAAGTTAAAAATGCCCAAATCAACCCCAGAAGACCACAGAAACAGCT
1750 . : . : . : . : . :
1670 CCACAGAAACCGATCAGCAGCCCCACTCTCCTGACAGCAGCTCATCTGTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
173382 CCACAGAAACCGATCAGCAGCCCCACTCTCCTGACAGCAGCTCATCTGTT
1800 . : . : . : . : . :
1720 CACAGTATAAGGAACATGCAGGTGCCTCAGGAGTCACTAGAAATGAGAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
173432 CACAGTATAAGGAACATGCAGGTGCCTCAGGAGTCACTAGAAATGAGAAC
1850 . : . : . : . : . :
1770 AAAATCGTATCCGAGATACCCACTAGAGAGCAAGAATAACCGTTTGCTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
173482 AAAATCGTATCCGAGATACCCACTAGAGAGCAAGAATAACCGTTTGCTGG
1900 . : . : . : . : . :
1820 CCAGTCTCAGCCATTCTAGGAGTGAAGCAAAGGAGTCCAGTCCTGCTTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
173532 CCAGTCTCAGCCATTCTAGGAGTGAAGCAAAGGAGTCCAGTCCTGCTTGG
1950 . : . : . : . : . :
1870 AGAACCCCGTCCTCGGAGTGCTATCATGGGCAGTCACTGGGAAAGCCTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
173582 AGAACCCCGTCCTCGGAGTGCTATCATGGGCAGTCACTGGGAAAGCCTCT
2000 . : . : . : . : . :
1920 GGTCCTTCAGGCTGCCCTCCATGGACAGTCTTCCATTGGGAATGGGAAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
173632 GGTCCTTCAGGCTGCCCTCCATGGACAGTCTTCCATTGGGAATGGGAAAA
2050 . : . : . : . : . :
1970 GTCAGCCTAACTCCAAGTTTGCCAAATCCAATGGCCTGGAGGGCAGCTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
173682 GTCAGCCTAACTCCAAGTTTGCCAAATCCAATGGCCTGGAGGGCAGCTGG
2100 . : . : . : . : . :
2020 TCTGGGAATGTCACCCAAAAAGACAGCTCGAGTGAGATGTTCTGTGACCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
173732 TCTGGGAATGTCACCCAAAAAGACAGCTCGAGTGAGATGTTCTGTGACCA
2150 . : . : . : . : . :
2070 GGAGCCTGTGTTCAGCCCCCACTTGGTCAGTCAGGGCAGCTTTAGAAAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
173782 GGAGCCTGTGTTCAGCCCCCACTTGGTCAGTCAGGGCAGCTTTAGAAAAT
2200 . : . : . : . : . :
2120 CCACTGTAGAACACTTTAGTAGGTCCTTTAAAGAGACCACCAATAGGTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
173832 CCACTGTAGAACACTTTAGTAGGTCCTTTAAAGAGACCACCAATAGGTGG
2250 . : . : . : . : . :
2170 GTGAAGAACACAGAGGACCTCCAGTGCTATGTGAAGCCAACCAAGAATAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
173882 GTGAAGAACACAGAGGACCTCCAGTGCTATGTGAAGCCAACCAAGAATAT
2300 . : . : . : . : . :
2220 GAGCCCCAAGGAGCAGTTCTGGGGTAGACAGGTTCTCAGGCGGTCTGCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
173932 GAGCCCCAAGGAGCAGTTCTGGGGTAGACAGGTTCTCAGGCGGTCTGCAG
2350 . : . : . : . : . :
2270 GGAGAGCTCCATATCAGGAAAATGATGGCTATTGCCCAGATTTGGAGCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
173982 GGAGAGCTCCATATCAGGAAAATGATGGCTATTGCCCAGATTTGGAGCTG
2400 . : . : . : . : . :
2320 AGTGATTCAGAGGCAGAAAGTGATGGGAATAAAGAAAAAGTCAGGGTAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
174032 AGTGATTCAGAGGCAGAAAGTGATGGGAATAAAGAAAAAGTCAGGGTAAG
2450 . : . : . : . : . :
2370 GAAAGATAGCTCAGACAGGGAAAATCCTCCCCATGACTCTAGACGGGATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
174082 GAAAGATAGCTCAGACAGGGAAAATCCTCCCCATGACTCTAGACGGGATT
2500 . : . : . : . : . :
2420 GCCATGGTAAAAGCAAGACACATCCCCTTTCCCACAGTTCAATGCAAAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
174132 GCCATGGTAAAAGCAAGACACATCCCCTTTCCCACAGTTCAATGCAAAGG