Result of FASTA (omim) for pF1KSDA0167
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA0167, 836 aa
  1>>>pF1KSDA0167 836 - 836 aa - 836 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.3257+/-0.00046; mu= -3.0632+/- 0.029
 mean_var=291.0192+/-56.933, 0's: 0 Z-trim(120.4): 183  B-trim: 829 in 1/58
 Lambda= 0.075182
 statistics sampled from 35319 (35538) to 35319 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.74), E-opt: 0.2 (0.417), width:  16
 Scan time: 13.590

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_055585 (OMIM: 605476) arf-GAP with GTPase, ANK  ( 836) 5455 606.0 2.3e-172
XP_005268682 (OMIM: 605476) PREDICTED: arf-GAP wit (1172) 5121 569.9 2.4e-161
XP_005268683 (OMIM: 605476) PREDICTED: arf-GAP wit ( 856) 3345 377.1 1.8e-103
NP_001116244 (OMIM: 605476) arf-GAP with GTPase, A (1192) 3011 341.0 1.9e-92
XP_016874261 (OMIM: 605476) PREDICTED: arf-GAP wit (1192) 3011 341.0 1.9e-92
XP_011508850 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit (1098) 2531 288.9 8.3e-77
NP_055729 (OMIM: 608651) arf-GAP with GTPase, ANK  ( 804) 1382 164.2 2.1e-39
XP_005246116 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit ( 808) 1382 164.2 2.2e-39
XP_011508851 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit (1073) 1382 164.3 2.7e-39
NP_001032208 (OMIM: 608651) arf-GAP with GTPase, A ( 857) 1360 161.8 1.2e-38
XP_011508849 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit (1126) 1360 161.9 1.5e-38
XP_005250000 (OMIM: 616813) PREDICTED: arf-GAP wit ( 565) 1312 156.5 3.1e-37
XP_016867221 (OMIM: 616813) PREDICTED: arf-GAP wit ( 630) 1312 156.5 3.4e-37
XP_011514082 (OMIM: 616813) PREDICTED: arf-GAP wit ( 683) 1312 156.5 3.6e-37
NP_114152 (OMIM: 616813) arf-GAP with GTPase, ANK  ( 911) 1312 156.6 4.6e-37
XP_006712298 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit ( 882) 1280 153.2 4.9e-36
XP_006712297 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit ( 886) 1280 153.2   5e-36
XP_016858771 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit (1106) 1280 153.2 5.9e-36
XP_006712300 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit (1147) 1280 153.2   6e-36
XP_006712302 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit (1151) 1280 153.2 6.1e-36
XP_016867224 (OMIM: 616813) PREDICTED: arf-GAP wit ( 462) 1259 150.7 1.4e-35
XP_016867222 (OMIM: 616813) PREDICTED: arf-GAP wit ( 527) 1259 150.7 1.6e-35
NP_001268229 (OMIM: 616813) arf-GAP with GTPase, A ( 580) 1259 150.7 1.7e-35
XP_016867223 (OMIM: 616813) PREDICTED: arf-GAP wit ( 580) 1259 150.7 1.7e-35
NP_001231817 (OMIM: 608651) arf-GAP with GTPase, A ( 405) 1194 143.6 1.7e-33
NP_001036000 (OMIM: 616813) arf-GAP with GTPase, A ( 396) 1085 131.7 6.2e-30
NP_001295234 (OMIM: 616813) arf-GAP with GTPase, A ( 576)  992 121.8   9e-27
NP_001295233 (OMIM: 616813) arf-GAP with GTPase, A ( 343)  938 115.8 3.5e-25
XP_016857178 (OMIM: 616594) PREDICTED: arf-GAP wit ( 774)  423 60.2 4.3e-08
XP_016857177 (OMIM: 616594) PREDICTED: arf-GAP wit ( 793)  423 60.2 4.4e-08
XP_016857176 (OMIM: 616594) PREDICTED: arf-GAP wit ( 883)  423 60.2 4.7e-08
NP_001137250 (OMIM: 616594) arf-GAP with SH3 domai ( 894)  423 60.2 4.8e-08
NP_060177 (OMIM: 616594) arf-GAP with SH3 domain,  ( 903)  423 60.2 4.8e-08
XP_016857175 (OMIM: 616594) PREDICTED: arf-GAP wit ( 905)  423 60.2 4.8e-08
XP_016857174 (OMIM: 616594) PREDICTED: arf-GAP wit ( 924)  423 60.2 4.9e-08
XP_011540057 (OMIM: 616594) PREDICTED: arf-GAP wit ( 926)  423 60.2 4.9e-08
XP_011510908 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 776)  407 58.4 1.4e-07
XP_011510907 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 776)  407 58.4 1.4e-07
XP_011510906 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 776)  407 58.4 1.4e-07
NP_036419 (OMIM: 607766) arf-GAP with coiled-coil, ( 778)  407 58.4 1.4e-07
XP_006713620 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 785)  407 58.4 1.4e-07
XP_016861538 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 806)  407 58.4 1.5e-07
XP_011510905 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 813)  407 58.4 1.5e-07
XP_016861537 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 813)  407 58.4 1.5e-07
XP_011510904 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 820)  407 58.4 1.5e-07
XP_016861536 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 841)  407 58.5 1.5e-07
XP_016861535 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 848)  407 58.5 1.5e-07
XP_016868958 (OMIM: 605953) PREDICTED: arf-GAP wit (1072)  401 57.9 2.9e-07
XP_016868957 (OMIM: 605953) PREDICTED: arf-GAP wit (1073)  401 57.9 2.9e-07
XP_006716629 (OMIM: 605953) PREDICTED: arf-GAP wit (1075)  401 57.9 2.9e-07


>>NP_055585 (OMIM: 605476) arf-GAP with GTPase, ANK repe  (836 aa)
 initn: 5455 init1: 5455 opt: 5455  Z-score: 3215.6  bits: 606.0 E(85289): 2.3e-172
Smith-Waterman score: 5455; 100.0% identity (100.0% similar) in 836 aa overlap (1-836:1-836)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MHAQRQFVVAAVRAEVRRHEVAKQALNRLRKLAERVDDPELQDSIQASLDSIREAVINSQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MHAQRQFVVAAVRAEVRRHEVAKQALNRLRKLAERVDDPELQDSIQASLDSIREAVINSQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD EWTLSRSIPELRLGVLGDARSGKSSLIHRFLTGSYQVLEKTESEQYKKEMLVDGQTHLVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 EWTLSRSIPELRLGVLGDARSGKSSLIHRFLTGSYQVLEKTESEQYKKEMLVDGQTHLVL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD IREEAGAPDAKFSGWADAVIFVFSLEDENSFQAVSRLHGQLSSLRGEGRGGLALALVGTQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 IREEAGAPDAKFSGWADAVIFVFSLEDENSFQAVSRLHGQLSSLRGEGRGGLALALVGTQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD DRISASSPRVVGDARARALCADMKRCSYYETCATYGLNVDRVFQEVAQKVVTLRKQQQLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 DRISASSPRVVGDARARALCADMKRCSYYETCATYGLNVDRVFQEVAQKVVTLRKQQQLL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD AACKSLPSSPSHSAASTPVAGQASNGGHTSDYSSSLPSSPNVGHRELRAEAAAVAGLSTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 AACKSLPSSPSHSAASTPVAGQASNGGHTSDYSSSLPSSPNVGHRELRAEAAAVAGLSTP
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD GSLHRAAKRRTSLFANRRGSDSEKRSLDSRGETTGSGRAIPIKQSFLLKRSGNSLNKEWK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GSLHRAAKRRTSLFANRRGSDSEKRSLDSRGETTGSGRAIPIKQSFLLKRSGNSLNKEWK
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD KKYVTLSSNGFLLYHPSINDYIHSTHGKEMDLLRTTVKVPGKRPPRAISAFGPSASINGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 KKYVTLSSNGFLLYHPSINDYIHSTHGKEMDLLRTTVKVPGKRPPRAISAFGPSASINGL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD VKDMSTVQMGEGLEATTPMPSPSPSPSSLQPPPDQTSKHLLKPDRNLARALSTDCTPSGD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VKDMSTVQMGEGLEATTPMPSPSPSPSSLQPPPDQTSKHLLKPDRNLARALSTDCTPSGD
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD LSPLSREPPPSPMVKKQRRKKLTTPSKTEGSAGQAEEENFEFLIVSSTGQTWHFEAASFE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LSPLSREPPPSPMVKKQRRKKLTTPSKTEGSAGQAEEENFEFLIVSSTGQTWHFEAASFE
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD ERDAWVQAIESQILASLQCCESSKVKLRTDSQSEAVAIQAIRNAKGNSICVDCGAPNPTW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ERDAWVQAIESQILASLQCCESSKVKLRTDSQSEAVAIQAIRNAKGNSICVDCGAPNPTW
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD ASLNLGALICIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPRELTLVLTAIGNDTANRVWESDTR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ASLNLGALICIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPRELTLVLTAIGNDTANRVWESDTR
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD GRAKPSRDSSREERESWIRAKYEQLLFLAPLSTSEEPLGRQLWAAVQAQDVATVLLLLAH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GRAKPSRDSSREERESWIRAKYEQLLFLAPLSTSEEPLGRQLWAAVQAQDVATVLLLLAH
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD ARHGPLDTSVEDPQLRSPLHLAAELAHVVITQLLLWYGADVAARDAQGRTALFYARQAGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ARHGPLDTSVEDPQLRSPLHLAAELAHVVITQLLLWYGADVAARDAQGRTALFYARQAGS
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830      
pF1KSD QLCADILLQHGCPGEGGSAATTPSAATTPSITATPSPRRRSSAASVGRADAPVALV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 QLCADILLQHGCPGEGGSAATTPSAATTPSITATPSPRRRSSAASVGRADAPVALV
              790       800       810       820       830      

>>XP_005268682 (OMIM: 605476) PREDICTED: arf-GAP with GT  (1172 aa)
 initn: 5119 init1: 5119 opt: 5121  Z-score: 3017.7  bits: 569.9 E(85289): 2.4e-161
Smith-Waterman score: 5121; 99.2% identity (99.5% similar) in 790 aa overlap (47-836:383-1172)

         20        30        40        50        60        70      
pF1KSD RRHEVAKQALNRLRKLAERVDDPELQDSIQASLDSIREAVINSQEWTLSRSIPELRLGVL
                                     : : .  .::::::::::::::::::::::
XP_005 TKSTGGPPGSGPLPGPPSLSSGSGSRELLGAELRASPKAVINSQEWTLSRSIPELRLGVL
            360       370       380       390       400       410  

         80        90       100       110       120       130      
pF1KSD GDARSGKSSLIHRFLTGSYQVLEKTESEQYKKEMLVDGQTHLVLIREEAGAPDAKFSGWA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GDARSGKSSLIHRFLTGSYQVLEKTESEQYKKEMLVDGQTHLVLIREEAGAPDAKFSGWA
            420       430       440       450       460       470  

        140       150       160       170       180       190      
pF1KSD DAVIFVFSLEDENSFQAVSRLHGQLSSLRGEGRGGLALALVGTQDRISASSPRVVGDARA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DAVIFVFSLEDENSFQAVSRLHGQLSSLRGEGRGGLALALVGTQDRISASSPRVVGDARA
            480       490       500       510       520       530  

        200       210       220       230       240       250      
pF1KSD RALCADMKRCSYYETCATYGLNVDRVFQEVAQKVVTLRKQQQLLAACKSLPSSPSHSAAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RALCADMKRCSYYETCATYGLNVDRVFQEVAQKVVTLRKQQQLLAACKSLPSSPSHSAAS
            540       550       560       570       580       590  

        260       270       280       290       300       310      
pF1KSD TPVAGQASNGGHTSDYSSSLPSSPNVGHRELRAEAAAVAGLSTPGSLHRAAKRRTSLFAN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TPVAGQASNGGHTSDYSSSLPSSPNVGHRELRAEAAAVAGLSTPGSLHRAAKRRTSLFAN
            600       610       620       630       640       650  

        320       330       340       350       360       370      
pF1KSD RRGSDSEKRSLDSRGETTGSGRAIPIKQSFLLKRSGNSLNKEWKKKYVTLSSNGFLLYHP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RRGSDSEKRSLDSRGETTGSGRAIPIKQSFLLKRSGNSLNKEWKKKYVTLSSNGFLLYHP
            660       670       680       690       700       710  

        380       390       400       410       420       430      
pF1KSD SINDYIHSTHGKEMDLLRTTVKVPGKRPPRAISAFGPSASINGLVKDMSTVQMGEGLEAT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SINDYIHSTHGKEMDLLRTTVKVPGKRPPRAISAFGPSASINGLVKDMSTVQMGEGLEAT
            720       730       740       750       760       770  

        440       450       460       470       480       490      
pF1KSD TPMPSPSPSPSSLQPPPDQTSKHLLKPDRNLARALSTDCTPSGDLSPLSREPPPSPMVKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TPMPSPSPSPSSLQPPPDQTSKHLLKPDRNLARALSTDCTPSGDLSPLSREPPPSPMVKK
            780       790       800       810       820       830  

        500       510       520       530       540       550      
pF1KSD QRRKKLTTPSKTEGSAGQAEEENFEFLIVSSTGQTWHFEAASFEERDAWVQAIESQILAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QRRKKLTTPSKTEGSAGQAEEENFEFLIVSSTGQTWHFEAASFEERDAWVQAIESQILAS
            840       850       860       870       880       890  

        560       570       580       590       600       610      
pF1KSD LQCCESSKVKLRTDSQSEAVAIQAIRNAKGNSICVDCGAPNPTWASLNLGALICIECSGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LQCCESSKVKLRTDSQSEAVAIQAIRNAKGNSICVDCGAPNPTWASLNLGALICIECSGI
            900       910       920       930       940       950  

        620       630       640       650       660       670      
pF1KSD HRNLGTHLSRVRSLDLDDWPRELTLVLTAIGNDTANRVWESDTRGRAKPSRDSSREERES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 HRNLGTHLSRVRSLDLDDWPRELTLVLTAIGNDTANRVWESDTRGRAKPSRDSSREERES
            960       970       980       990      1000      1010  

        680       690       700       710       720       730      
pF1KSD WIRAKYEQLLFLAPLSTSEEPLGRQLWAAVQAQDVATVLLLLAHARHGPLDTSVEDPQLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 WIRAKYEQLLFLAPLSTSEEPLGRQLWAAVQAQDVATVLLLLAHARHGPLDTSVEDPQLR
           1020      1030      1040      1050      1060      1070  

        740       750       760       770       780       790      
pF1KSD SPLHLAAELAHVVITQLLLWYGADVAARDAQGRTALFYARQAGSQLCADILLQHGCPGEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SPLHLAAELAHVVITQLLLWYGADVAARDAQGRTALFYARQAGSQLCADILLQHGCPGEG
           1080      1090      1100      1110      1120      1130  

        800       810       820       830      
pF1KSD GSAATTPSAATTPSITATPSPRRRSSAASVGRADAPVALV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GSAATTPSAATTPSITATPSPRRRSSAASVGRADAPVALV
           1140      1150      1160      1170  

>>XP_005268683 (OMIM: 605476) PREDICTED: arf-GAP with GT  (856 aa)
 initn: 5441 init1: 3345 opt: 3345  Z-score: 1978.6  bits: 377.1 E(85289): 1.8e-103
Smith-Waterman score: 5405; 97.7% identity (97.7% similar) in 856 aa overlap (1-836:1-856)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MHAQRQFVVAAVRAEVRRHEVAKQALNRLRKLAERVDDPELQDSIQASLDSIREAVINSQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MHAQRQFVVAAVRAEVRRHEVAKQALNRLRKLAERVDDPELQDSIQASLDSIREAVINSQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD EWTLSRSIPELRLGVLGDARSGKSSLIHRFLTGSYQVLEKTESEQYKKEMLVDGQTHLVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EWTLSRSIPELRLGVLGDARSGKSSLIHRFLTGSYQVLEKTESEQYKKEMLVDGQTHLVL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD IREEAGAPDAKFSGWADAVIFVFSLEDENSFQAVSRLHGQLSSLRGEGRGGLALALVGTQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 IREEAGAPDAKFSGWADAVIFVFSLEDENSFQAVSRLHGQLSSLRGEGRGGLALALVGTQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD DRISASSPRVVGDARARALCADMKRCSYYETCATYGLNVDRVFQEVAQKVVTLRKQQQLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DRISASSPRVVGDARARALCADMKRCSYYETCATYGLNVDRVFQEVAQKVVTLRKQQQLL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD AACKSLPSSPSHSAASTPVAGQASNGGHTSDYSSSLPSSPNVGHRELRAEAAAVAGLSTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AACKSLPSSPSHSAASTPVAGQASNGGHTSDYSSSLPSSPNVGHRELRAEAAAVAGLSTP
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD GSLHRAAKRRTSLFANRRGSDSEKRSLDSRGETTGSGRAIPIKQSFLLKRSGNSLNKEWK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GSLHRAAKRRTSLFANRRGSDSEKRSLDSRGETTGSGRAIPIKQSFLLKRSGNSLNKEWK
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD KKYVTLSSNGFLLYHPSINDYIHSTHGKEMDLLRTTVKVPGKRPPRAISAFGPSASINGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KKYVTLSSNGFLLYHPSINDYIHSTHGKEMDLLRTTVKVPGKRPPRAISAFGPSASINGL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD VKDMSTVQMGEGLEATTPMPSPSPSPSSLQPPPDQTSKHLLKPDRNLARALSTDCTPSGD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VKDMSTVQMGEGLEATTPMPSPSPSPSSLQPPPDQTSKHLLKPDRNLARALSTDCTPSGD
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510                           520
pF1KSD LSPLSREPPPSPMVKKQRRKKLTTPSKTEGSAGQAE--------------------EENF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::                    ::::
XP_005 LSPLSREPPPSPMVKKQRRKKLTTPSKTEGSAGQAEAKRKMWKLKSFGSLRNIYKAEENF
              490       500       510       520       530       540

              530       540       550       560       570       580
pF1KSD EFLIVSSTGQTWHFEAASFEERDAWVQAIESQILASLQCCESSKVKLRTDSQSEAVAIQA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EFLIVSSTGQTWHFEAASFEERDAWVQAIESQILASLQCCESSKVKLRTDSQSEAVAIQA
              550       560       570       580       590       600

              590       600       610       620       630       640
pF1KSD IRNAKGNSICVDCGAPNPTWASLNLGALICIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPRELT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 IRNAKGNSICVDCGAPNPTWASLNLGALICIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPRELT
              610       620       630       640       650       660

              650       660       670       680       690       700
pF1KSD LVLTAIGNDTANRVWESDTRGRAKPSRDSSREERESWIRAKYEQLLFLAPLSTSEEPLGR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LVLTAIGNDTANRVWESDTRGRAKPSRDSSREERESWIRAKYEQLLFLAPLSTSEEPLGR
              670       680       690       700       710       720

              710       720       730       740       750       760
pF1KSD QLWAAVQAQDVATVLLLLAHARHGPLDTSVEDPQLRSPLHLAAELAHVVITQLLLWYGAD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QLWAAVQAQDVATVLLLLAHARHGPLDTSVEDPQLRSPLHLAAELAHVVITQLLLWYGAD
              730       740       750       760       770       780

              770       780       790       800       810       820
pF1KSD VAARDAQGRTALFYARQAGSQLCADILLQHGCPGEGGSAATTPSAATTPSITATPSPRRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VAARDAQGRTALFYARQAGSQLCADILLQHGCPGEGGSAATTPSAATTPSITATPSPRRR
              790       800       810       820       830       840

              830      
pF1KSD SSAASVGRADAPVALV
       ::::::::::::::::
XP_005 SSAASVGRADAPVALV
              850      

>>NP_001116244 (OMIM: 605476) arf-GAP with GTPase, ANK r  (1192 aa)
 initn: 5105 init1: 3009 opt: 3011  Z-score: 1780.8  bits: 341.0 E(85289): 1.9e-92
Smith-Waterman score: 5071; 96.8% identity (97.0% similar) in 810 aa overlap (47-836:383-1192)

         20        30        40        50        60        70      
pF1KSD RRHEVAKQALNRLRKLAERVDDPELQDSIQASLDSIREAVINSQEWTLSRSIPELRLGVL
                                     : : .  .::::::::::::::::::::::
NP_001 TKSTGGPPGSGPLPGPPSLSSGSGSRELLGAELRASPKAVINSQEWTLSRSIPELRLGVL
            360       370       380       390       400       410  

         80        90       100       110       120       130      
pF1KSD GDARSGKSSLIHRFLTGSYQVLEKTESEQYKKEMLVDGQTHLVLIREEAGAPDAKFSGWA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GDARSGKSSLIHRFLTGSYQVLEKTESEQYKKEMLVDGQTHLVLIREEAGAPDAKFSGWA
            420       430       440       450       460       470  

        140       150       160       170       180       190      
pF1KSD DAVIFVFSLEDENSFQAVSRLHGQLSSLRGEGRGGLALALVGTQDRISASSPRVVGDARA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DAVIFVFSLEDENSFQAVSRLHGQLSSLRGEGRGGLALALVGTQDRISASSPRVVGDARA
            480       490       500       510       520       530  

        200       210       220       230       240       250      
pF1KSD RALCADMKRCSYYETCATYGLNVDRVFQEVAQKVVTLRKQQQLLAACKSLPSSPSHSAAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RALCADMKRCSYYETCATYGLNVDRVFQEVAQKVVTLRKQQQLLAACKSLPSSPSHSAAS
            540       550       560       570       580       590  

        260       270       280       290       300       310      
pF1KSD TPVAGQASNGGHTSDYSSSLPSSPNVGHRELRAEAAAVAGLSTPGSLHRAAKRRTSLFAN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TPVAGQASNGGHTSDYSSSLPSSPNVGHRELRAEAAAVAGLSTPGSLHRAAKRRTSLFAN
            600       610       620       630       640       650  

        320       330       340       350       360       370      
pF1KSD RRGSDSEKRSLDSRGETTGSGRAIPIKQSFLLKRSGNSLNKEWKKKYVTLSSNGFLLYHP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RRGSDSEKRSLDSRGETTGSGRAIPIKQSFLLKRSGNSLNKEWKKKYVTLSSNGFLLYHP
            660       670       680       690       700       710  

        380       390       400       410       420       430      
pF1KSD SINDYIHSTHGKEMDLLRTTVKVPGKRPPRAISAFGPSASINGLVKDMSTVQMGEGLEAT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SINDYIHSTHGKEMDLLRTTVKVPGKRPPRAISAFGPSASINGLVKDMSTVQMGEGLEAT
            720       730       740       750       760       770  

        440       450       460       470       480       490      
pF1KSD TPMPSPSPSPSSLQPPPDQTSKHLLKPDRNLARALSTDCTPSGDLSPLSREPPPSPMVKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TPMPSPSPSPSSLQPPPDQTSKHLLKPDRNLARALSTDCTPSGDLSPLSREPPPSPMVKK
            780       790       800       810       820       830  

        500       510                           520       530      
pF1KSD QRRKKLTTPSKTEGSAGQAE--------------------EENFEFLIVSSTGQTWHFEA
       ::::::::::::::::::::                    ::::::::::::::::::::
NP_001 QRRKKLTTPSKTEGSAGQAEAKRKMWKLKSFGSLRNIYKAEENFEFLIVSSTGQTWHFEA
            840       850       860       870       880       890  

        540       550       560       570       580       590      
pF1KSD ASFEERDAWVQAIESQILASLQCCESSKVKLRTDSQSEAVAIQAIRNAKGNSICVDCGAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ASFEERDAWVQAIESQILASLQCCESSKVKLRTDSQSEAVAIQAIRNAKGNSICVDCGAP
            900       910       920       930       940       950  

        600       610       620       630       640       650      
pF1KSD NPTWASLNLGALICIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPRELTLVLTAIGNDTANRVWE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NPTWASLNLGALICIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPRELTLVLTAIGNDTANRVWE
            960       970       980       990      1000      1010  

        660       670       680       690       700       710      
pF1KSD SDTRGRAKPSRDSSREERESWIRAKYEQLLFLAPLSTSEEPLGRQLWAAVQAQDVATVLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SDTRGRAKPSRDSSREERESWIRAKYEQLLFLAPLSTSEEPLGRQLWAAVQAQDVATVLL
           1020      1030      1040      1050      1060      1070  

        720       730       740       750       760       770      
pF1KSD LLAHARHGPLDTSVEDPQLRSPLHLAAELAHVVITQLLLWYGADVAARDAQGRTALFYAR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LLAHARHGPLDTSVEDPQLRSPLHLAAELAHVVITQLLLWYGADVAARDAQGRTALFYAR
           1080      1090      1100      1110      1120      1130  

        780       790       800       810       820       830      
pF1KSD QAGSQLCADILLQHGCPGEGGSAATTPSAATTPSITATPSPRRRSSAASVGRADAPVALV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QAGSQLCADILLQHGCPGEGGSAATTPSAATTPSITATPSPRRRSSAASVGRADAPVALV
           1140      1150      1160      1170      1180      1190  

>>XP_016874261 (OMIM: 605476) PREDICTED: arf-GAP with GT  (1192 aa)
 initn: 5105 init1: 3009 opt: 3011  Z-score: 1780.8  bits: 341.0 E(85289): 1.9e-92
Smith-Waterman score: 5071; 96.8% identity (97.0% similar) in 810 aa overlap (47-836:383-1192)

         20        30        40        50        60        70      
pF1KSD RRHEVAKQALNRLRKLAERVDDPELQDSIQASLDSIREAVINSQEWTLSRSIPELRLGVL
                                     : : .  .::::::::::::::::::::::
XP_016 TKSTGGPPGSGPLPGPPSLSSGSGSRELLGAELRASPKAVINSQEWTLSRSIPELRLGVL
            360       370       380       390       400       410  

         80        90       100       110       120       130      
pF1KSD GDARSGKSSLIHRFLTGSYQVLEKTESEQYKKEMLVDGQTHLVLIREEAGAPDAKFSGWA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GDARSGKSSLIHRFLTGSYQVLEKTESEQYKKEMLVDGQTHLVLIREEAGAPDAKFSGWA
            420       430       440       450       460       470  

        140       150       160       170       180       190      
pF1KSD DAVIFVFSLEDENSFQAVSRLHGQLSSLRGEGRGGLALALVGTQDRISASSPRVVGDARA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DAVIFVFSLEDENSFQAVSRLHGQLSSLRGEGRGGLALALVGTQDRISASSPRVVGDARA
            480       490       500       510       520       530  

        200       210       220       230       240       250      
pF1KSD RALCADMKRCSYYETCATYGLNVDRVFQEVAQKVVTLRKQQQLLAACKSLPSSPSHSAAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RALCADMKRCSYYETCATYGLNVDRVFQEVAQKVVTLRKQQQLLAACKSLPSSPSHSAAS
            540       550       560       570       580       590  

        260       270       280       290       300       310      
pF1KSD TPVAGQASNGGHTSDYSSSLPSSPNVGHRELRAEAAAVAGLSTPGSLHRAAKRRTSLFAN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TPVAGQASNGGHTSDYSSSLPSSPNVGHRELRAEAAAVAGLSTPGSLHRAAKRRTSLFAN
            600       610       620       630       640       650  

        320       330       340       350       360       370      
pF1KSD RRGSDSEKRSLDSRGETTGSGRAIPIKQSFLLKRSGNSLNKEWKKKYVTLSSNGFLLYHP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RRGSDSEKRSLDSRGETTGSGRAIPIKQSFLLKRSGNSLNKEWKKKYVTLSSNGFLLYHP
            660       670       680       690       700       710  

        380       390       400       410       420       430      
pF1KSD SINDYIHSTHGKEMDLLRTTVKVPGKRPPRAISAFGPSASINGLVKDMSTVQMGEGLEAT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SINDYIHSTHGKEMDLLRTTVKVPGKRPPRAISAFGPSASINGLVKDMSTVQMGEGLEAT
            720       730       740       750       760       770  

        440       450       460       470       480       490      
pF1KSD TPMPSPSPSPSSLQPPPDQTSKHLLKPDRNLARALSTDCTPSGDLSPLSREPPPSPMVKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TPMPSPSPSPSSLQPPPDQTSKHLLKPDRNLARALSTDCTPSGDLSPLSREPPPSPMVKK
            780       790       800       810       820       830  

        500       510                           520       530      
pF1KSD QRRKKLTTPSKTEGSAGQAE--------------------EENFEFLIVSSTGQTWHFEA
       ::::::::::::::::::::                    ::::::::::::::::::::
XP_016 QRRKKLTTPSKTEGSAGQAEAKRKMWKLKSFGSLRNIYKAEENFEFLIVSSTGQTWHFEA
            840       850       860       870       880       890  

        540       550       560       570       580       590      
pF1KSD ASFEERDAWVQAIESQILASLQCCESSKVKLRTDSQSEAVAIQAIRNAKGNSICVDCGAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ASFEERDAWVQAIESQILASLQCCESSKVKLRTDSQSEAVAIQAIRNAKGNSICVDCGAP
            900       910       920       930       940       950  

        600       610       620       630       640       650      
pF1KSD NPTWASLNLGALICIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPRELTLVLTAIGNDTANRVWE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NPTWASLNLGALICIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPRELTLVLTAIGNDTANRVWE
            960       970       980       990      1000      1010  

        660       670       680       690       700       710      
pF1KSD SDTRGRAKPSRDSSREERESWIRAKYEQLLFLAPLSTSEEPLGRQLWAAVQAQDVATVLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SDTRGRAKPSRDSSREERESWIRAKYEQLLFLAPLSTSEEPLGRQLWAAVQAQDVATVLL
           1020      1030      1040      1050      1060      1070  

        720       730       740       750       760       770      
pF1KSD LLAHARHGPLDTSVEDPQLRSPLHLAAELAHVVITQLLLWYGADVAARDAQGRTALFYAR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LLAHARHGPLDTSVEDPQLRSPLHLAAELAHVVITQLLLWYGADVAARDAQGRTALFYAR
           1080      1090      1100      1110      1120      1130  

        780       790       800       810       820       830      
pF1KSD QAGSQLCADILLQHGCPGEGGSAATTPSAATTPSITATPSPRRRSSAASVGRADAPVALV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QAGSQLCADILLQHGCPGEGGSAATTPSAATTPSITATPSPRRRSSAASVGRADAPVALV
           1140      1150      1160      1170      1180      1190  

>>XP_011508850 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP with GT  (1098 aa)
 initn: 2533 init1: 1774 opt: 2531  Z-score: 1499.9  bits: 288.9 E(85289): 8.3e-77
Smith-Waterman score: 2731; 55.7% identity (79.1% similar) in 790 aa overlap (40-804:304-1079)

      10        20        30        40        50          60       
pF1KSD AAVRAEVRRHEVAKQALNRLRKLAERVDDPELQDSIQASLDSI--REAVINSQEWTLSRS
                                     : ..:   :.:.   :.: .::::::::::
XP_011 RRDGGPGGGPSPRSGASRPRGYFSLRRAPAEAHSSSAESIDGSPRRDAFVNSQEWTLSRS
           280       290       300       310       320       330   

        70        80        90       100           110       120   
pF1KSD IPELRLGVLGDARSGKSSLIHRFLTGSYQVLEKTESE----QYKKEMLVDGQTHLVLIRE
       .:::..:..:.  ::::.:.::.:::.:   :. :.     ..:::..::::..:.:::.
XP_011 VPELKVGIVGNLASGKSALVHRYLTGTYVQEESPEDMDAGGRFKKEIVVDGQSYLLLIRD
           340       350       360       370       380       390   

           130       140       150       160       170       180   
pF1KSD EAGAPDAKFSGWADAVIFVFSLEDENSFQAVSRLHGQLSSLRGEGRGGLALALVGTQDRI
       :.: :.:.:. :.:::::::::::: :::.: . ...... :. ..  . :.:::::: :
XP_011 EGGPPEAQFAMWVDAVIFVFSLEDEISFQTVYHYYSRMANYRNTSE--IPLVLVGTQDAI
           400       410       420       430         440       450 

           190       200       210       220       230        240  
pF1KSD SASSPRVVGDARARALCADMKRCSYYETCATYGLNVDRVFQEVAQKVVTLRKQQQL-LAA
       :...:::. ::::: :  :.:::.::::::::::::.::::.::::.:. ::.::: .. 
XP_011 SSANPRVIDDARARKLSNDLKRCTYYETCATYGLNVERVFQDVAQKIVATRKKQQLSIGP
             460       470       480       490       500       510 

            250        260            270       280       290      
pF1KSD CKSLPSSPSHSAA-STPVAG----QASNGGHT-SDYSSSLPSSPNVGHRELRAEAAAVAG
       :::::.:::::.. :. :..    :.:::: . ::::::.::.:.....::: ..  .: 
XP_011 CKSLPNSPSHSSVCSAQVSAVHISQTSNGGGSLSDYSSSVPSTPSTSQKELRIDVPPTA-
             520       530       540       550       560       570 

        300       310       320         330       340       350    
pF1KSD LSTPGSLHRAAKRRTSLFANRRGSD--SEKRSLDSRGETTGSGRAIPIKQSFLLKRSGNS
        .::  ... .:::..::..:.:::  .::..:.::... ::::::::::..::::::.:
XP_011 -NTPTPVRKQSKRRSNLFTSRKGSDPDKEKKGLESRADSIGSGRAIPIKQGMLLKRSGKS
               580       590       600       610       620         

          360       370       380       390       400       410    
pF1KSD LNKEWKKKYVTLSSNGFLLYHPSINDYIHSTHGKEMDLLRTTVKVPGKRPPRAISAFGP-
       :::::::::::: .:: : ::::..::....::::.::::::::::::::::: :: .: 
XP_011 LNKEWKKKYVTLCDNGVLTYHPSLHDYMQNVHGKEIDLLRTTVKVPGKRPPRATSACAPI
     630       640       650       660       670       680         

            420       430            440        450       460      
pF1KSD -SASINGLVKDMSTVQMGE----GL-EATTPMPSPSPSPS-SLQPPPDQTSKHLLKPDRN
        : . ::: ::::.....     :: ...   :: : . : .:.:::   : :  .  ..
XP_011 SSPKTNGLSKDMSSLHISPNSDTGLGDSVCSSPSISSTTSPKLDPPP---SPHANR--KK
     690       700       710       720       730          740      

        470       480       490         500       510       520    
pF1KSD LARALSTDCTPSGDLSPLSREPPPSPMVKK--QRRKKLTTPSKTEGSAGQAEEENFEFLI
         :  ::.   .  ::  ..    .  ...  . :.  .. ..::      .::::::.:
XP_011 HRRKKSTSNFKADGLSGTAEAKRKAWKLNRVGSLRNIYSSSTNTE-----EQEENFEFII
          750       760       770       780            790         

          530       540       550       560       570       580    
pF1KSD VSSTGQTWHFEAASFEERDAWVQAIESQILASLQCCESSKVKLRTDSQSEAVAIQAIRNA
       :: :::::::::...::::::::::::::::::: ::::: : :  :::::.:.:.::: 
XP_011 VSLTGQTWHFEATTYEERDAWVQAIESQILASLQSCESSKNKSRLTSQSEAMALQSIRNM
     800       810       820       830       840       850         

          590       600       610       620       630       640    
pF1KSD KGNSICVDCGAPNPTWASLNLGALICIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPRELTLVLT
       .::: :::: . ::.:::::::::.::::::::::::::::::::::::::: ::  :..
XP_011 RGNSHCVDCETQNPNWASLNLGALMCIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPVELIKVMS
     860       870       880       890       900       910         

          650       660       670       680       690       700    
pF1KSD AIGNDTANRVWESDTRGRAKPSRDSSREERESWIRAKYEQLLFLAPLSTSEEPLGRQLWA
       .:::. :: ::: ...::.::: ::.:::.: :::::::: ::::::  .:  ::..:  
XP_011 SIGNELANSVWEESSQGRTKPSVDSTREEKERWIRAKYEQKLFLAPLPCTELSLGQHLLR
     920       930       940       950       960       970         

          710       720       730       740       750       760    
pF1KSD AVQAQDVATVLLLLAHARHGPLDTSVEDPQLRSPLHLAAELAHVVITQLLLWYGADVAAR
       :.  .:. :..:::::. .  .. .  . . :. :::: . ..::..:::.:::.::.::
XP_011 ATADEDLRTAILLLAHGSRDEVNETCGEGDGRTALHLACRKGNVVLAQLLIWYGVDVTAR
     980       990      1000      1010      1020      1030         

          770       780       790       800       810       820    
pF1KSD DAQGRTALFYARQAGSQLCADILLQHGCPGEGGSAATTPSAATTPSITATPSPRRRSSAA
       ::.: ::: :::::.:: : :.:::.::: :     .::.                    
XP_011 DAHGNTALAYARQASSQECIDVLLQYGCPDERFVLMATPNLSRRNNNRNNSSGRVPTII 
    1040      1050      1060      1070      1080      1090         

          830      
pF1KSD SVGRADAPVALV

>>NP_055729 (OMIM: 608651) arf-GAP with GTPase, ANK repe  (804 aa)
 initn: 2506 init1: 1260 opt: 1382  Z-score: 828.2  bits: 164.2 E(85289): 2.1e-39
Smith-Waterman score: 2889; 56.0% identity (79.5% similar) in 820 aa overlap (1-804:1-785)

                10        20        30        40        50         
pF1KSD MHAQRQFV-VAAVRAEVRRHEVAKQALNRLRKLAERVDDPELQDSIQASLDSIREAVINS
       :. :.:..  ::.:::..: : ..  .  . .: :::..: ::..:.  . .:..: .::
NP_055 MNYQQQLANSAAIRAEIQRFESVHPNIYSIYELLERVEEPVLQNQIREHVIAIEDAFVNS
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KSD QEWTLSRSIPELRLGVLGDARSGKSSLIHRFLTGSYQVLEKTESEQYKKEMLVDGQTHLV
       ::::::::.:::..:..:.  ::::.:.::.:::.:   :. :. ..:::..::::..:.
NP_055 QEWTLSRSVPELKVGIVGNLASGKSALVHRYLTGTYVQEESPEGGRFKKEIVVDGQSYLL
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KSD LIREEAGAPDAKFSGWADAVIFVFSLEDENSFQAVSRLHGQLSSLRGEGRGGLALALVGT
       :::.:.: :.:.:. :.:::::::::::: :::.: . ...... :. ..  . :.::::
NP_055 LIRDEGGPPEAQFAMWVDAVIFVFSLEDEISFQTVYHYYSRMANYRNTSE--IPLVLVGT
              130       140       150       160       170          

     180       190       200       210       220       230         
pF1KSD QDRISASSPRVVGDARARALCADMKRCSYYETCATYGLNVDRVFQEVAQKVVTLRKQQQL
       :: ::...:::. ::::: :  :.:::.::::::::::::.::::.::::.:. ::.:::
NP_055 QDAISSANPRVIDDARARKLSNDLKRCTYYETCATYGLNVERVFQDVAQKIVATRKKQQL
      180       190       200       210       220       230        

      240       250        260            270       280       290  
pF1KSD -LAACKSLPSSPSHSAA-STPVAG----QASNGGHT-SDYSSSLPSSPNVGHRELRAEAA
        .. :::::.:::::.. :. :..    :.:::: . ::::::.::.:.....::: .. 
NP_055 SIGPCKSLPNSPSHSSVCSAQVSAVHISQTSNGGGSLSDYSSSVPSTPSTSQKELRIDVP
      240       250       260       270       280       290        

            300       310       320         330       340       350
pF1KSD AVAGLSTPGSLHRAAKRRTSLFANRRGSD--SEKRSLDSRGETTGSGRAIPIKQSFLLKR
        .:  .::  ... .:::..::..:.:::  .::..:.::... ::::::::::..::::
NP_055 PTA--NTPTPVRKQSKRRSNLFTSRKGSDPDKEKKGLESRADSIGSGRAIPIKQGMLLKR
      300         310       320       330       340       350      

              360       370       380       390       400       410
pF1KSD SGNSLNKEWKKKYVTLSSNGFLLYHPSINDYIHSTHGKEMDLLRTTVKVPGKRPPRAISA
       ::.::::::::::::: .:: : ::::..::....::::.::::::::::::::::: ::
NP_055 SGKSLNKEWKKKYVTLCDNGVLTYHPSLHDYMQNVHGKEIDLLRTTVKVPGKRPPRATSA
        360       370       380       390       400       410      

                420       430       440       450       460        
pF1KSD FGP--SASINGLVKDMSTVQMGEGLEATTPMPSPSPSPSSLQPPPDQTSKHLLKPDRNLA
        .:  : . ::: ::::....               ::.:               : .:.
NP_055 CAPISSPKTNGLSKDMSSLHI---------------SPNS---------------DTGLG
        420       430                      440                     

      470       480       490         500       510         520    
pF1KSD RALSTDCTPSGDLSPLSREPPPSPMV--KKQRRKKLTTPSKTEGSAGQAEE--ENFEFLI
        .. .. . :.  :: . .::::: .  ::.:::: :.  :..: .: :::  :::::.:
NP_055 DSVCSSPSISSTTSP-KLDPPPSPHANRKKHRRKKSTSNFKADGLSGTAEEQEENFEFII
        450       460        470       480       490       500     

          530       540       550       560       570       580    
pF1KSD VSSTGQTWHFEAASFEERDAWVQAIESQILASLQCCESSKVKLRTDSQSEAVAIQAIRNA
       :: :::::::::...::::::::::::::::::: ::::: : :  :::::.:.:.::: 
NP_055 VSLTGQTWHFEATTYEERDAWVQAIESQILASLQSCESSKNKSRLTSQSEAMALQSIRNM
         510       520       530       540       550       560     

          590       600       610       620       630       640    
pF1KSD KGNSICVDCGAPNPTWASLNLGALICIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPRELTLVLT
       .::: :::: . ::.:::::::::.::::::::::::::::::::::::::: ::  :..
NP_055 RGNSHCVDCETQNPNWASLNLGALMCIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPVELIKVMS
         570       580       590       600       610       620     

          650       660       670       680       690       700    
pF1KSD AIGNDTANRVWESDTRGRAKPSRDSSREERESWIRAKYEQLLFLAPLSTSEEPLGRQLWA
       .:::. :: ::: ...::.::: ::.:::.: :::::::: ::::::  .:  ::..:  
NP_055 SIGNELANSVWEESSQGRTKPSVDSTREEKERWIRAKYEQKLFLAPLPCTELSLGQHLLR
         630       640       650       660       670       680     

          710       720       730       740       750       760    
pF1KSD AVQAQDVATVLLLLAHARHGPLDTSVEDPQLRSPLHLAAELAHVVITQLLLWYGADVAAR
       :.  .:. :..:::::. .  .. .  . . :. :::: . ..::..:::.:::.::.::
NP_055 ATADEDLRTAILLLAHGSRDEVNETCGEGDGRTALHLACRKGNVVLAQLLIWYGVDVTAR
         690       700       710       720       730       740     

          770       780       790       800       810       820    
pF1KSD DAQGRTALFYARQAGSQLCADILLQHGCPGEGGSAATTPSAATTPSITATPSPRRRSSAA
       ::.: ::: :::::.:: : :.:::.::: :     .::.                    
NP_055 DAHGNTALAYARQASSQECIDVLLQYGCPDERFVLMATPNLSRRNNNRNNSSGRVPTII 
         750       760       770       780       790       800     

          830      
pF1KSD SVGRADAPVALV

>>XP_005246116 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP with GT  (808 aa)
 initn: 2535 init1: 1260 opt: 1382  Z-score: 828.2  bits: 164.2 E(85289): 2.2e-39
Smith-Waterman score: 2872; 55.7% identity (79.1% similar) in 824 aa overlap (1-804:1-789)

                10        20        30        40        50         
pF1KSD MHAQRQFV-VAAVRAEVRRHEVAKQALNRLRKLAERVDDPELQDSIQASLDSIREAVINS
       :. :.:..  ::.:::..: : ..  .  . .: :::..: ::..:.  . .:..: .::
XP_005 MNYQQQLANSAAIRAEIQRFESVHPNIYSIYELLERVEEPVLQNQIREHVIAIEDAFVNS
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100           110     
pF1KSD QEWTLSRSIPELRLGVLGDARSGKSSLIHRFLTGSYQVLEKTESE----QYKKEMLVDGQ
       ::::::::.:::..:..:.  ::::.:.::.:::.:   :. :.     ..:::..::::
XP_005 QEWTLSRSVPELKVGIVGNLASGKSALVHRYLTGTYVQEESPEDMDAGGRFKKEIVVDGQ
               70        80        90       100       110       120

         120       130       140       150       160       170     
pF1KSD THLVLIREEAGAPDAKFSGWADAVIFVFSLEDENSFQAVSRLHGQLSSLRGEGRGGLALA
       ..:.:::.:.: :.:.:. :.:::::::::::: :::.: . ...... :. ..  . :.
XP_005 SYLLLIRDEGGPPEAQFAMWVDAVIFVFSLEDEISFQTVYHYYSRMANYRNTSE--IPLV
              130       140       150       160       170          

         180       190       200       210       220       230     
pF1KSD LVGTQDRISASSPRVVGDARARALCADMKRCSYYETCATYGLNVDRVFQEVAQKVVTLRK
       :::::: ::...:::. ::::: :  :.:::.::::::::::::.::::.::::.:. ::
XP_005 LVGTQDAISSANPRVIDDARARKLSNDLKRCTYYETCATYGLNVERVFQDVAQKIVATRK
      180       190       200       210       220       230        

          240       250        260            270       280        
pF1KSD QQQL-LAACKSLPSSPSHSAA-STPVAG----QASNGGHT-SDYSSSLPSSPNVGHRELR
       .::: .. :::::.:::::.. :. :..    :.:::: . ::::::.::.:.....:::
XP_005 KQQLSIGPCKSLPNSPSHSSVCSAQVSAVHISQTSNGGGSLSDYSSSVPSTPSTSQKELR
      240       250       260       270       280       290        

      290       300       310       320         330       340      
pF1KSD AEAAAVAGLSTPGSLHRAAKRRTSLFANRRGSD--SEKRSLDSRGETTGSGRAIPIKQSF
        ..  .:  .::  ... .:::..::..:.:::  .::..:.::... ::::::::::..
XP_005 IDVPPTA--NTPTPVRKQSKRRSNLFTSRKGSDPDKEKKGLESRADSIGSGRAIPIKQGM
      300         310       320       330       340       350      

        350       360       370       380       390       400      
pF1KSD LLKRSGNSLNKEWKKKYVTLSSNGFLLYHPSINDYIHSTHGKEMDLLRTTVKVPGKRPPR
       ::::::.::::::::::::: .:: : ::::..::....::::.::::::::::::::::
XP_005 LLKRSGKSLNKEWKKKYVTLCDNGVLTYHPSLHDYMQNVHGKEIDLLRTTVKVPGKRPPR
        360       370       380       390       400       410      

        410         420       430       440       450       460    
pF1KSD AISAFGP--SASINGLVKDMSTVQMGEGLEATTPMPSPSPSPSSLQPPPDQTSKHLLKPD
       : :: .:  : . ::: ::::....               ::.:               :
XP_005 ATSACAPISSPKTNGLSKDMSSLHI---------------SPNS---------------D
        420       430       440                                    

          470       480       490         500       510         520
pF1KSD RNLARALSTDCTPSGDLSPLSREPPPSPMV--KKQRRKKLTTPSKTEGSAGQAEE--ENF
        .:. .. .. . :.  :: . .::::: .  ::.:::: :.  :..: .: :::  :::
XP_005 TGLGDSVCSSPSISSTTSP-KLDPPPSPHANRKKHRRKKSTSNFKADGLSGTAEEQEENF
        450       460        470       480       490       500     

              530       540       550       560       570       580
pF1KSD EFLIVSSTGQTWHFEAASFEERDAWVQAIESQILASLQCCESSKVKLRTDSQSEAVAIQA
       ::.::: :::::::::...::::::::::::::::::: ::::: : :  :::::.:.:.
XP_005 EFIIVSLTGQTWHFEATTYEERDAWVQAIESQILASLQSCESSKNKSRLTSQSEAMALQS
         510       520       530       540       550       560     

              590       600       610       620       630       640
pF1KSD IRNAKGNSICVDCGAPNPTWASLNLGALICIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPRELT
       ::: .::: :::: . ::.:::::::::.::::::::::::::::::::::::::: :: 
XP_005 IRNMRGNSHCVDCETQNPNWASLNLGALMCIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPVELI
         570       580       590       600       610       620     

              650       660       670       680       690       700
pF1KSD LVLTAIGNDTANRVWESDTRGRAKPSRDSSREERESWIRAKYEQLLFLAPLSTSEEPLGR
        :...:::. :: ::: ...::.::: ::.:::.: :::::::: ::::::  .:  ::.
XP_005 KVMSSIGNELANSVWEESSQGRTKPSVDSTREEKERWIRAKYEQKLFLAPLPCTELSLGQ
         630       640       650       660       670       680     

              710       720       730       740       750       760
pF1KSD QLWAAVQAQDVATVLLLLAHARHGPLDTSVEDPQLRSPLHLAAELAHVVITQLLLWYGAD
       .:  :.  .:. :..:::::. .  .. .  . . :. :::: . ..::..:::.:::.:
XP_005 HLLRATADEDLRTAILLLAHGSRDEVNETCGEGDGRTALHLACRKGNVVLAQLLIWYGVD
         690       700       710       720       730       740     

              770       780       790       800       810       820
pF1KSD VAARDAQGRTALFYARQAGSQLCADILLQHGCPGEGGSAATTPSAATTPSITATPSPRRR
       :.::::.: ::: :::::.:: : :.:::.::: :     .::.                
XP_005 VTARDAHGNTALAYARQASSQECIDVLLQYGCPDERFVLMATPNLSRRNNNRNNSSGRVP
         750       760       770       780       790       800     

              830      
pF1KSD SSAASVGRADAPVALV
                       
XP_005 TII             
                       

>>XP_011508851 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP with GT  (1073 aa)
 initn: 2407 init1: 1260 opt: 1382  Z-score: 826.5  bits: 164.3 E(85289): 2.7e-39
Smith-Waterman score: 2775; 56.6% identity (79.1% similar) in 786 aa overlap (40-804:304-1054)

      10        20        30        40        50          60       
pF1KSD AAVRAEVRRHEVAKQALNRLRKLAERVDDPELQDSIQASLDSI--REAVINSQEWTLSRS
                                     : ..:   :.:.   :.: .::::::::::
XP_011 RRDGGPGGGPSPRSGASRPRGYFSLRRAPAEAHSSSAESIDGSPRRDAFVNSQEWTLSRS
           280       290       300       310       320       330   

        70        80        90       100           110       120   
pF1KSD IPELRLGVLGDARSGKSSLIHRFLTGSYQVLEKTESE----QYKKEMLVDGQTHLVLIRE
       .:::..:..:.  ::::.:.::.:::.:   :. :.     ..:::..::::..:.:::.
XP_011 VPELKVGIVGNLASGKSALVHRYLTGTYVQEESPEDMDAGGRFKKEIVVDGQSYLLLIRD
           340       350       360       370       380       390   

           130       140       150       160       170       180   
pF1KSD EAGAPDAKFSGWADAVIFVFSLEDENSFQAVSRLHGQLSSLRGEGRGGLALALVGTQDRI
       :.: :.:.:. :.:::::::::::: :::.: . ...... :. ..  . :.:::::: :
XP_011 EGGPPEAQFAMWVDAVIFVFSLEDEISFQTVYHYYSRMANYRNTSE--IPLVLVGTQDAI
           400       410       420       430         440       450 

           190       200       210       220       230        240  
pF1KSD SASSPRVVGDARARALCADMKRCSYYETCATYGLNVDRVFQEVAQKVVTLRKQQQL-LAA
       :...:::. ::::: :  :.:::.::::::::::::.::::.::::.:. ::.::: .. 
XP_011 SSANPRVIDDARARKLSNDLKRCTYYETCATYGLNVERVFQDVAQKIVATRKKQQLSIGP
             460       470       480       490       500       510 

            250        260            270       280       290      
pF1KSD CKSLPSSPSHSAA-STPVAG----QASNGGHT-SDYSSSLPSSPNVGHRELRAEAAAVAG
       :::::.:::::.. :. :..    :.:::: . ::::::.::.:.....::: ..  .: 
XP_011 CKSLPNSPSHSSVCSAQVSAVHISQTSNGGGSLSDYSSSVPSTPSTSQKELRIDVPPTA-
             520       530       540       550       560       570 

        300       310       320         330       340       350    
pF1KSD LSTPGSLHRAAKRRTSLFANRRGSD--SEKRSLDSRGETTGSGRAIPIKQSFLLKRSGNS
        .::  ... .:::..::..:.:::  .::..:.::... ::::::::::..::::::.:
XP_011 -NTPTPVRKQSKRRSNLFTSRKGSDPDKEKKGLESRADSIGSGRAIPIKQGMLLKRSGKS
               580       590       600       610       620         

          360       370       380       390       400       410    
pF1KSD LNKEWKKKYVTLSSNGFLLYHPSINDYIHSTHGKEMDLLRTTVKVPGKRPPRAISAFGP-
       :::::::::::: .:: : ::::..::....::::.::::::::::::::::: :: .: 
XP_011 LNKEWKKKYVTLCDNGVLTYHPSLHDYMQNVHGKEIDLLRTTVKVPGKRPPRATSACAPI
     630       640       650       660       670       680         

            420       430       440       450       460       470  
pF1KSD -SASINGLVKDMSTVQMGEGLEATTPMPSPSPSPSSLQPPPDQTSKHLLKPDRNLARALS
        : . ::: ::::....               ::.:               : .:. .. 
XP_011 SSPKTNGLSKDMSSLHI---------------SPNS---------------DTGLGDSVC
     690       700                      710                        

            480       490         500       510         520        
pF1KSD TDCTPSGDLSPLSREPPPSPMV--KKQRRKKLTTPSKTEGSAGQAEE--ENFEFLIVSST
       .. . :.  :: . .::::: .  ::.:::: :.  :..: .: :::  :::::.::: :
XP_011 SSPSISSTTSP-KLDPPPSPHANRKKHRRKKSTSNFKADGLSGTAEEQEENFEFIIVSLT
     720       730        740       750       760       770        

      530       540       550       560       570       580        
pF1KSD GQTWHFEAASFEERDAWVQAIESQILASLQCCESSKVKLRTDSQSEAVAIQAIRNAKGNS
       ::::::::...::::::::::::::::::: ::::: : :  :::::.:.:.::: .:::
XP_011 GQTWHFEATTYEERDAWVQAIESQILASLQSCESSKNKSRLTSQSEAMALQSIRNMRGNS
      780       790       800       810       820       830        

      590       600       610       620       630       640        
pF1KSD ICVDCGAPNPTWASLNLGALICIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPRELTLVLTAIGN
        :::: . ::.:::::::::.::::::::::::::::::::::::::: ::  :...:::
XP_011 HCVDCETQNPNWASLNLGALMCIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPVELIKVMSSIGN
      840       850       860       870       880       890        

      650       660       670       680       690       700        
pF1KSD DTANRVWESDTRGRAKPSRDSSREERESWIRAKYEQLLFLAPLSTSEEPLGRQLWAAVQA
       . :: ::: ...::.::: ::.:::.: :::::::: ::::::  .:  ::..:  :.  
XP_011 ELANSVWEESSQGRTKPSVDSTREEKERWIRAKYEQKLFLAPLPCTELSLGQHLLRATAD
      900       910       920       930       940       950        

      710       720       730       740       750       760        
pF1KSD QDVATVLLLLAHARHGPLDTSVEDPQLRSPLHLAAELAHVVITQLLLWYGADVAARDAQG
       .:. :..:::::. .  .. .  . . :. :::: . ..::..:::.:::.::.::::.:
XP_011 EDLRTAILLLAHGSRDEVNETCGEGDGRTALHLACRKGNVVLAQLLIWYGVDVTARDAHG
      960       970       980       990      1000      1010        

      770       780       790       800       810       820        
pF1KSD RTALFYARQAGSQLCADILLQHGCPGEGGSAATTPSAATTPSITATPSPRRRSSAASVGR
        ::: :::::.:: : :.:::.::: :     .::.                        
XP_011 NTALAYARQASSQECIDVLLQYGCPDERFVLMATPNLSRRNNNRNNSSGRVPTII     
     1020      1030      1040      1050      1060      1070        

      830      
pF1KSD ADAPVALV

>>NP_001032208 (OMIM: 608651) arf-GAP with GTPase, ANK r  (857 aa)
 initn: 2655 init1: 1260 opt: 1360  Z-score: 815.0  bits: 161.8 E(85289): 1.2e-38
Smith-Waterman score: 2901; 55.7% identity (79.3% similar) in 840 aa overlap (4-804:4-838)

                10        20        30        40        50         
pF1KSD MHAQRQFV-VAAVRAEVRRHEVAKQALNRLRKLAERVDDPELQDSIQASLDSIREAVINS
          :.:..  ::.:::..: : ..  .  . .: :::..: ::..:.  . .:..: .::
NP_001 MNYQQQLANSAAIRAEIQRFESVHPNIYSIYELLERVEEPVLQNQIREHVIAIEDAFVNS
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KSD QEWTLSRSIPELRLGVLGDARSGKSSLIHRFLTGSYQVLEKTESEQYKKEMLVDGQTHLV
       ::::::::.:::..:..:.  ::::.:.::.:::.:   :. :. ..:::..::::..:.
NP_001 QEWTLSRSVPELKVGIVGNLASGKSALVHRYLTGTYVQEESPEGGRFKKEIVVDGQSYLL
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KSD LIREEAGAPDAKFSGWADAVIFVFSLEDENSFQAVSRLHGQLSSLRGEGRGGLALALVGT
       :::.:.: :.:.:. :.:::::::::::: :::.: . ...... :. ..  . :.::::
NP_001 LIRDEGGPPEAQFAMWVDAVIFVFSLEDEISFQTVYHYYSRMANYRNTSE--IPLVLVGT
              130       140       150       160       170          

     180       190       200       210       220       230         
pF1KSD QDRISASSPRVVGDARARALCADMKRCSYYETCATYGLNVDRVFQEVAQKVVTLRKQQQL
       :: ::...:::. ::::: :  :.:::.::::::::::::.::::.::::.:. ::.:::
NP_001 QDAISSANPRVIDDARARKLSNDLKRCTYYETCATYGLNVERVFQDVAQKIVATRKKQQL
      180       190       200       210       220       230        

      240       250        260            270       280       290  
pF1KSD -LAACKSLPSSPSHSAA-STPVAG----QASNGGHT-SDYSSSLPSSPNVGHRELRAEAA
        .. :::::.:::::.. :. :..    :.:::: . ::::::.::.:.....::: .. 
NP_001 SIGPCKSLPNSPSHSSVCSAQVSAVHISQTSNGGGSLSDYSSSVPSTPSTSQKELRIDVP
      240       250       260       270       280       290        

            300       310       320         330       340       350
pF1KSD AVAGLSTPGSLHRAAKRRTSLFANRRGSD--SEKRSLDSRGETTGSGRAIPIKQSFLLKR
        .:.  ::  ... .:::..::..:.:::  .::..:.::... ::::::::::..::::
NP_001 PTANTPTP--VRKQSKRRSNLFTSRKGSDPDKEKKGLESRADSIGSGRAIPIKQGMLLKR
      300         310       320       330       340       350      

              360       370       380       390       400       410
pF1KSD SGNSLNKEWKKKYVTLSSNGFLLYHPSINDYIHSTHGKEMDLLRTTVKVPGKRPPRAISA
       ::.::::::::::::: .:: : ::::..::....::::.::::::::::::::::: ::
NP_001 SGKSLNKEWKKKYVTLCDNGVLTYHPSLHDYMQNVHGKEIDLLRTTVKVPGKRPPRATSA
        360       370       380       390       400       410      

                420           430       440       450          460 
pF1KSD FGP--SASINGLVKDMSTVQM----GEGLEATTPMPSPSPSPSSLQPPPD---QTSKHLL
        .:  : . ::: ::::....    :.   :.  . . . :  :..  ::   : :  . 
NP_001 CAPISSPKTNGLSKDMSSLHISPNSGNVTSASGSQMASGISLVSFNSRPDGMHQRSYSVS
        420       430       440       450       460       470      

                   470                 480       490         500   
pF1KSD KPDR-----NLAR-ALSTD-------CT-PS--GDLSPLSREPPPSPMV--KKQRRKKLT
       . :.      .:  :.:.:       :. ::  .  :: . .::::: .  ::.:::: :
NP_001 SADQWSEATVIANSAISSDTGLGDSVCSSPSISSTTSP-KLDPPPSPHANRKKHRRKKST
        480       490       500       510        520       530     

           510         520       530       540       550       560 
pF1KSD TPSKTEGSAGQAEE--ENFEFLIVSSTGQTWHFEAASFEERDAWVQAIESQILASLQCCE
       .  :..: .: :::  :::::.::: :::::::::...::::::::::::::::::: ::
NP_001 SNFKADGLSGTAEEQEENFEFIIVSLTGQTWHFEATTYEERDAWVQAIESQILASLQSCE
         540       550       560       570       580       590     

             570       580       590       600       610       620 
pF1KSD SSKVKLRTDSQSEAVAIQAIRNAKGNSICVDCGAPNPTWASLNLGALICIECSGIHRNLG
       ::: : :  :::::.:.:.::: .::: :::: . ::.:::::::::.::::::::::::
NP_001 SSKNKSRLTSQSEAMALQSIRNMRGNSHCVDCETQNPNWASLNLGALMCIECSGIHRNLG
         600       610       620       630       640       650     

             630       640       650       660       670       680 
pF1KSD THLSRVRSLDLDDWPRELTLVLTAIGNDTANRVWESDTRGRAKPSRDSSREERESWIRAK
       ::::::::::::::: ::  :...:::. :: ::: ...::.::: ::.:::.: :::::
NP_001 THLSRVRSLDLDDWPVELIKVMSSIGNELANSVWEESSQGRTKPSVDSTREEKERWIRAK
         660       670       680       690       700       710     

             690       700       710       720       730       740 
pF1KSD YEQLLFLAPLSTSEEPLGRQLWAAVQAQDVATVLLLLAHARHGPLDTSVEDPQLRSPLHL
       ::: ::::::  .:  ::..:  :.  .:. :..:::::. .  .. .  . . :. :::
NP_001 YEQKLFLAPLPCTELSLGQHLLRATADEDLRTAILLLAHGSRDEVNETCGEGDGRTALHL
         720       730       740       750       760       770     

             750       760       770       780       790       800 
pF1KSD AAELAHVVITQLLLWYGADVAARDAQGRTALFYARQAGSQLCADILLQHGCPGEGGSAAT
       : . ..::..:::.:::.::.::::.: ::: :::::.:: : :.:::.::: :     .
NP_001 ACRKGNVVLAQLLIWYGVDVTARDAHGNTALAYARQASSQECIDVLLQYGCPDERFVLMA
         780       790       800       810       820       830     

             810       820       830      
pF1KSD TPSAATTPSITATPSPRRRSSAASVGRADAPVALV
       ::.                                
NP_001 TPNLSRRNNNRNNSSGRVPTII             
         840       850                    




836 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Thu Nov  3 00:23:24 2016 done: Thu Nov  3 00:23:26 2016
 Total Scan time: 13.590 Total Display time:  0.310

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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