Result of FASTA (ccds) for pF1KSDA0048
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA0048, 606 aa
  1>>>pF1KSDA0048 606 - 606 aa - 606 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.1279+/-0.00113; mu= -12.0590+/- 0.067
 mean_var=405.9031+/-86.521, 0's: 0 Z-trim(114.4): 709  B-trim: 0 in 0/52
 Lambda= 0.063659
 statistics sampled from 14170 (14982) to 14170 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.752), E-opt: 0.2 (0.46), width:  16
 Scan time:  3.730

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS11521.2 SP2 gene_id:6668|Hs108|chr17           ( 613) 3975 379.5  7e-105
CCDS44898.1 SP1 gene_id:6667|Hs108|chr12           ( 778)  844 92.0 3.1e-18
CCDS8857.1 SP1 gene_id:6667|Hs108|chr12            ( 785)  844 92.0 3.1e-18
CCDS5373.1 SP4 gene_id:6671|Hs108|chr7             ( 784)  780 86.1 1.8e-16
CCDS46452.1 SP3 gene_id:6670|Hs108|chr2            ( 713)  756 83.9 7.8e-16
CCDS2254.1 SP3 gene_id:6670|Hs108|chr2             ( 781)  756 83.9 8.4e-16
CCDS33322.1 SP5 gene_id:389058|Hs108|chr2          ( 398)  569 66.5 7.4e-11


>>CCDS11521.2 SP2 gene_id:6668|Hs108|chr17                (613 aa)
 initn: 3975 init1: 3975 opt: 3975  Z-score: 1996.4  bits: 379.5 E(32554): 7e-105
Smith-Waterman score: 3975; 100.0% identity (100.0% similar) in 606 aa overlap (1-606:8-613)

                      10        20        30        40        50   
pF1KSD        MAATAAVSPSDYLQPAASTTQDSQPSPLALLAATCSKIGPPAVEAAVTPPAPP
              :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MSDPQTSMAATAAVSPSDYLQPAASTTQDSQPSPLALLAATCSKIGPPAVEAAVTPPAPP
               10        20        30        40        50        60

            60        70        80        90       100       110   
pF1KSD QPTPRKLVPIKPAPLPLSPGKNSFGILSSKGNILQIQGSQLSASYPGGQLVFAIQNPTMI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QPTPRKLVPIKPAPLPLSPGKNSFGILSSKGNILQIQGSQLSASYPGGQLVFAIQNPTMI
               70        80        90       100       110       120

           120       130       140       150       160       170   
pF1KSD NKGTRSNANIQYQAVPQIQASNSQTIQVQPNLTNQIQIIPGTNQAIITPSPSSHKPVPIK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NKGTRSNANIQYQAVPQIQASNSQTIQVQPNLTNQIQIIPGTNQAIITPSPSSHKPVPIK
              130       140       150       160       170       180

           180       190       200       210       220       230   
pF1KSD PAPIQKSSTTTTPVQSGANVVKLTGGGGNVTLTLPVNNLVNASDTGAPTQLLTESPPTPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PAPIQKSSTTTTPVQSGANVVKLTGGGGNVTLTLPVNNLVNASDTGAPTQLLTESPPTPL
              190       200       210       220       230       240

           240       250       260       270       280       290   
pF1KSD SKTNKKARKKSLPASQPPVAVAEQVETVLIETTADNIIQAGNNLLIVQSPGGGQPAVVQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SKTNKKARKKSLPASQPPVAVAEQVETVLIETTADNIIQAGNNLLIVQSPGGGQPAVVQQ
              250       260       270       280       290       300

           300       310       320       330       340       350   
pF1KSD VQVVPPKAEQQQVVQIPQQALRVVQAASATLPTVPQKPSQNFQIQAAEPTPTQVYIRTPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VQVVPPKAEQQQVVQIPQQALRVVQAASATLPTVPQKPSQNFQIQAAEPTPTQVYIRTPS
              310       320       330       340       350       360

           360       370       380       390       400       410   
pF1KSD GEVQTVLVQDSPPATAAATSNTTCSSPASRAPHLSGTSKKHSAAILRKERPLPKIAPAGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GEVQTVLVQDSPPATAAATSNTTCSSPASRAPHLSGTSKKHSAAILRKERPLPKIAPAGS
              370       380       390       400       410       420

           420       430       440       450       460       470   
pF1KSD IISLNAAQLAAAAQAMQTININGVQVQGVPVTITNTGGQQQLTVQNVSGNNLTISGLSPT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 IISLNAAQLAAAAQAMQTININGVQVQGVPVTITNTGGQQQLTVQNVSGNNLTISGLSPT
              430       440       450       460       470       480

           480       490       500       510       520       530   
pF1KSD QIQLQMEQALAGETQPGEKRRRMACTCPNCKDGEKRSGEQGKKKHVCHIPDCGKTFRKTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QIQLQMEQALAGETQPGEKRRRMACTCPNCKDGEKRSGEQGKKKHVCHIPDCGKTFRKTS
              490       500       510       520       530       540

           540       550       560       570       580       590   
pF1KSD LLRAHVRLHTGERPFVCNWFFCGKRFTRSDELQRHARTHTGDKRFECAQCQKRFMRSDHL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LLRAHVRLHTGERPFVCNWFFCGKRFTRSDELQRHARTHTGDKRFECAQCQKRFMRSDHL
              550       560       570       580       590       600

           600      
pF1KSD TKHYKTHLVTKNL
       :::::::::::::
CCDS11 TKHYKTHLVTKNL
              610   

>>CCDS44898.1 SP1 gene_id:6667|Hs108|chr12                (778 aa)
 initn: 758 init1: 493 opt: 844  Z-score: 440.9  bits: 92.0 E(32554): 3.1e-18
Smith-Waterman score: 933; 35.4% identity (58.2% similar) in 632 aa overlap (70-600:93-701)

      40        50        60        70        80            90     
pF1KSD PPAVEAAVTPPAPPQPTPRKLVPIKPAPLPLSPGKNSFGILSSKGNIL----QIQGSQLS
                                     :: : :.. :.::...      . .::. .
CCDS44 RIESPNENSNNSQGPSQSGGTGELDLTATQLSQGANGWQIISSSSGATPTSKEQSGSSTN
             70        80        90       100       110       120  

                   100           110       120       130       140 
pF1KSD AS----------YPGGQLVFA----IQNPTMINKGTRSNANIQYQAVPQIQASNSQTIQ-
       .:            ::: : :    .::  ...       :::::..::.:. ..: .: 
CCDS44 GSNGSESSKNRTVSGGQYVVAAAPNLQNQQVLTGLPGVMPNIQYQVIPQFQTVDGQQLQF
            130       140       150       160       170       180  

                    150       160       170       180       190    
pF1KSD ------VQPNLTNQIQIIPGTNQAIITPSPSSHKPVPIKPAPIQKSSTTTTPVQSGANVV
             :: . ..:::::::.:: :::   :. . .   :  .:..    .:.:. :: :
CCDS44 AATGAQVQQDGSGQIQIIPGANQQIITNRGSGGNIIAAMPNLLQQA----VPLQGLANNV
            190       200       210       220           230        

                     200       210       220              230      
pF1KSD KLTGG-----------GGNVTLTLPVNNLVNASDTGAPTQLLT-------ESPPTPLSKT
        :.:            .::.:: ::::. :.:.     .: .:       ::   :.. .
CCDS44 -LSGQTQYVTNVPVALNGNITL-LPVNS-VSAATLTPSSQAVTISSSGSQESGSQPVT-S
       240       250        260        270       280       290     

        240       250        260       270                         
pF1KSD NKKARKKSLPASQPPVA-VAEQVETVLIETTADNI-------------------------
       .    . :: .::   .    ....    ::..:.                         
CCDS44 GTTISSASLVSSQASSSSFFTNANSYSTTTTTSNMGIMNFTTSGSSGTNSQGQTPQRVSG
          300       310       320       330       340       350    

              280         290       300       310            320   
pF1KSD IQAGNNLLIVQ--SPGGGQPAVVQQVQVVPPKAEQQQVVQIPQ-----QALRVVQAA---
       .:... : : :  . ::.  :  :.      ...:::..  ::     :::...:::   
CCDS44 LQGSDALNIQQNQTSGGSLQAGQQKEGEQNQQTQQQQILIQPQLVQGGQALQALQAAPLS
          360       370       380       390       400       410    

                330       340       350             360       370  
pF1KSD --SATLPTVPQKPSQNFQIQAAEPTPTQVYIRTPS----GEV--QTVLVQDSPPATAAAT
         . :  .. :.  ::.:.::. :.   . ::::.    :.:  ::. .:.    .  : 
CCDS44 GQTFTTQAISQETLQNLQLQAV-PNSGPIIIRTPTVGPNGQVSWQTLQLQNLQVQNPQAQ
          420       430        440       450       460       470   

            380       390       400         410       420       430
pF1KSD SNTTCSSPASRAPHLSGTSKKHSAAILRKERPLPKIA--PAGSIISLNAAQLAAAAQAMQ
       . :        :: ..:.:  ....      :. . :  :::.. ..:::::..   ..:
CCDS44 TITL-------AP-MQGVSLGQTSSSNTTLTPIASAASIPAGTV-TVNAAQLSSMP-GLQ
                   480       490       500        510       520    

                      440       450         460       470       480
pF1KSD TININ-----GVQV---QGVPVTITNTGGQQ--QLTVQNVSGNNLTISGLSPTQIQLQME
       :::..     :.::   ::.:..:.:. :..  :: .....:...     . :    . :
CCDS44 TINLSALGTSGIQVHPIQGLPLAIANAPGDHGAQLGLHGAGGDGIH----DDTAGGEEGE
           530       540       550       560           570         

              490       500        510        520       530        
pF1KSD QALAGETQPGEKRRRMACTCPNCKDGEKR-SGEQGKKK-HVCHIPDCGKTFRKTSLLRAH
       ..  .. : :.. :: ::::: :::.: : ::. :::: :.:::  :::.. ::: ::::
CCDS44 NSPDAQPQAGRRTRREACTCPYCKDSEGRGSGDPGKKKQHICHIQGCGKVYGKTSHLRAH
     580       590       600       610       620       630         

      540       550       560       570       580       590        
pF1KSD VRLHTGERPFVCNWFFCGKRFTRSDELQRHARTHTGDKRFECAQCQKRFMRSDHLTKHYK
       .: :::::::.:.: .:::::::::::::: :::::.:.: : .: :::::::::.:: :
CCDS44 LRWHTGERPFMCTWSYCGKRFTRSDELQRHKRTHTGEKKFACPECPKRFMRSDHLSKHIK
     640       650       660       670       680       690         

      600                                                          
pF1KSD THLVTKNL                                                    
       ::                                                          
CCDS44 THQNKKGGPGVALSVGTLPLDSGAGSEGSGTATPSALITTNMVAMEAICPEGIARLANSG
     700       710       720       730       740       750         

>>CCDS8857.1 SP1 gene_id:6667|Hs108|chr12                 (785 aa)
 initn: 758 init1: 493 opt: 844  Z-score: 440.8  bits: 92.0 E(32554): 3.1e-18
Smith-Waterman score: 933; 35.4% identity (58.2% similar) in 632 aa overlap (70-600:100-708)

      40        50        60        70        80            90     
pF1KSD PPAVEAAVTPPAPPQPTPRKLVPIKPAPLPLSPGKNSFGILSSKGNIL----QIQGSQLS
                                     :: : :.. :.::...      . .::. .
CCDS88 RIESPNENSNNSQGPSQSGGTGELDLTATQLSQGANGWQIISSSSGATPTSKEQSGSSTN
      70        80        90       100       110       120         

                   100           110       120       130       140 
pF1KSD AS----------YPGGQLVFA----IQNPTMINKGTRSNANIQYQAVPQIQASNSQTIQ-
       .:            ::: : :    .::  ...       :::::..::.:. ..: .: 
CCDS88 GSNGSESSKNRTVSGGQYVVAAAPNLQNQQVLTGLPGVMPNIQYQVIPQFQTVDGQQLQF
     130       140       150       160       170       180         

                    150       160       170       180       190    
pF1KSD ------VQPNLTNQIQIIPGTNQAIITPSPSSHKPVPIKPAPIQKSSTTTTPVQSGANVV
             :: . ..:::::::.:: :::   :. . .   :  .:..    .:.:. :: :
CCDS88 AATGAQVQQDGSGQIQIIPGANQQIITNRGSGGNIIAAMPNLLQQA----VPLQGLANNV
     190       200       210       220       230           240     

                     200       210       220              230      
pF1KSD KLTGG-----------GGNVTLTLPVNNLVNASDTGAPTQLLT-------ESPPTPLSKT
        :.:            .::.:: ::::. :.:.     .: .:       ::   :.. .
CCDS88 -LSGQTQYVTNVPVALNGNITL-LPVNS-VSAATLTPSSQAVTISSSGSQESGSQPVT-S
          250       260        270        280       290       300  

        240       250        260       270                         
pF1KSD NKKARKKSLPASQPPVA-VAEQVETVLIETTADNI-------------------------
       .    . :: .::   .    ....    ::..:.                         
CCDS88 GTTISSASLVSSQASSSSFFTNANSYSTTTTTSNMGIMNFTTSGSSGTNSQGQTPQRVSG
             310       320       330       340       350       360 

              280         290       300       310            320   
pF1KSD IQAGNNLLIVQ--SPGGGQPAVVQQVQVVPPKAEQQQVVQIPQ-----QALRVVQAA---
       .:... : : :  . ::.  :  :.      ...:::..  ::     :::...:::   
CCDS88 LQGSDALNIQQNQTSGGSLQAGQQKEGEQNQQTQQQQILIQPQLVQGGQALQALQAAPLS
             370       380       390       400       410       420 

                330       340       350             360       370  
pF1KSD --SATLPTVPQKPSQNFQIQAAEPTPTQVYIRTPS----GEV--QTVLVQDSPPATAAAT
         . :  .. :.  ::.:.::. :.   . ::::.    :.:  ::. .:.    .  : 
CCDS88 GQTFTTQAISQETLQNLQLQAV-PNSGPIIIRTPTVGPNGQVSWQTLQLQNLQVQNPQAQ
             430       440        450       460       470       480

            380       390       400         410       420       430
pF1KSD SNTTCSSPASRAPHLSGTSKKHSAAILRKERPLPKIA--PAGSIISLNAAQLAAAAQAMQ
       . :        :: ..:.:  ....      :. . :  :::.. ..:::::..   ..:
CCDS88 TITL-------AP-MQGVSLGQTSSSNTTLTPIASAASIPAGTV-TVNAAQLSSMP-GLQ
                      490       500       510        520        530

                      440       450         460       470       480
pF1KSD TININ-----GVQV---QGVPVTITNTGGQQ--QLTVQNVSGNNLTISGLSPTQIQLQME
       :::..     :.::   ::.:..:.:. :..  :: .....:...     . :    . :
CCDS88 TINLSALGTSGIQVHPIQGLPLAIANAPGDHGAQLGLHGAGGDGIH----DDTAGGEEGE
              540       550       560       570           580      

              490       500        510        520       530        
pF1KSD QALAGETQPGEKRRRMACTCPNCKDGEKR-SGEQGKKK-HVCHIPDCGKTFRKTSLLRAH
       ..  .. : :.. :: ::::: :::.: : ::. :::: :.:::  :::.. ::: ::::
CCDS88 NSPDAQPQAGRRTRREACTCPYCKDSEGRGSGDPGKKKQHICHIQGCGKVYGKTSHLRAH
        590       600       610       620       630       640      

      540       550       560       570       580       590        
pF1KSD VRLHTGERPFVCNWFFCGKRFTRSDELQRHARTHTGDKRFECAQCQKRFMRSDHLTKHYK
       .: :::::::.:.: .:::::::::::::: :::::.:.: : .: :::::::::.:: :
CCDS88 LRWHTGERPFMCTWSYCGKRFTRSDELQRHKRTHTGEKKFACPECPKRFMRSDHLSKHIK
        650       660       670       680       690       700      

      600                                                          
pF1KSD THLVTKNL                                                    
       ::                                                          
CCDS88 THQNKKGGPGVALSVGTLPLDSGAGSEGSGTATPSALITTNMVAMEAICPEGIARLANSG
        710       720       730       740       750       760      

>>CCDS5373.1 SP4 gene_id:6671|Hs108|chr7                  (784 aa)
 initn: 922 init1: 521 opt: 780  Z-score: 409.1  bits: 86.1 E(32554): 1.8e-16
Smith-Waterman score: 1102; 37.6% identity (60.3% similar) in 663 aa overlap (46-600:106-729)

          20        30        40        50        60        70     
pF1KSD AASTTQDSQPSPLALLAATCSKIGPPAVEAAVTPPAPPQPTPRKLVPIKPAPLPLSPGKN
                                     : ::::  . .  .         : : ...
CCDS53 PSQGLVQLQNQPQQLELVTTQLAGNAWQLVASTPPASKENNVSQ---------PASSSSS
          80        90       100       110                120      

          80        90       100       110       120       130     
pF1KSD SFGILSSKGNILQIQGSQLSASYPGGQLVFAIQNPTMINKGTRSNANIQYQAVPQIQASN
       : .  :..:.    . .. ..: ::   :. .:::.         ...:::..::.:. .
CCDS53 SSS--SNNGSASPTKTKSGNSSTPGQFQVIQVQNPS---------GSVQYQVIPQLQTVE
          130       140       150       160                170     

         140              150        160                    170    
pF1KSD SQTIQVQP-------NLTNQIQIIP-GTNQAIITPSPSSHK-------------PVPIKP
       .: ::..:       .: .:::.:  :.::::.: .  . .             :: :.:
CCDS53 GQQIQINPTSSSSLQDLQGQIQLISAGNNQAILTAANRTASGNILAQNLANQTVPVQIRP
         180       190       200       210       220       230     

             180               190              200                
pF1KSD A---PIQKSS--------TTTTPVQSGANVVKL-------TGGG----------------
       .   :.: ..        .:: :.. :. .. :       .:::                
CCDS53 GVSIPLQLQTLPGTQAQVVTTLPINIGGVTLALPVINNVAAGGGTGQVGQPAATADSGTS
         240       250       260       270       280       290     

               210                   220            230        240 
pF1KSD -GNVTLTLPVNNLVNASD------------TGAPTQL-----LTESPPT-PLSKTNKKAR
        ::  .. :.:. ..::             : : :.:     :. :  :   ..:. .. 
CCDS53 NGNQLVSTPTNTTTSASTMPESPSSSTTCTTTASTSLTSSDTLVSSADTGQYASTSASSS
         300       310       320       330       340       350     

             250       260         270       280       290         
pF1KSD KKSLPASQPPVAVAEQVETV--LIETTADNIIQAGNNLLIVQSPGGGQPAVVQQVQVVPP
       ....  :: :.:.  ....   :  .  .:  . .:.:  ::  :  :: ..::.:.  :
CCDS53 ERTIEESQTPAATESEAQSSSQLQPNGMQNAQDQSNSLQQVQIVG--QP-ILQQIQIQQP
         360       370       380       390       400          410  

     300        310       320       330       340       350        
pF1KSD KAEQQQVVQ-IPQQALRVVQAASATLPTVPQKPSQNFQIQAAEPTPTQVYIR----TPSG
          :::..: :: :....   .. :. :. :.: :: :.::..::  :: ::    ::::
CCDS53 ---QQQIIQAIPPQSFQL--QSGQTIQTIQQQPLQNVQLQAVNPT--QVLIRAPTLTPSG
               420         430       440       450         460     

            360       370       380       390       400       410  
pF1KSD EV--QTVLVQDSPPATAAATSNTTCSSPASRAPHLSGTSKKHSAAILRKERPLPKIAPAG
       ..  ::: ::.    .   ..:.  :.  . .: .:...    : :     :   .: ::
CCDS53 QISWQTVQVQNIQSLSNLQVQNAGLSQQLTITP-VSSSGGTTLAQIA----P---VAVAG
         470       480       490        500       510              

            420       430            440       450                 
pF1KSD SIISLNAAQLAAAAQAMQTININ-----GVQVQGVPVTITNTGGQQQ----LTVQN----
       . :.::.::::.. . .::...      ::::::::::::...::::    . ::.    
CCDS53 APITLNTAQLASVPN-LQTVSVANLGAAGVQVQGVPVTITSVAGQQQGQDGVKVQQATIA
       520       530        540       550       560       570      

          460        470          480        490       500         
pF1KSD -----VSG-NNLTISGLSP---TQIQLQMEQALAG-ETQPGEKRRRMACTCPNCKDGEKR
            :.:  : ::...::   ::..::. :  .  :.:::.. ::.::.::::..:: :
CCDS53 PVTVAVGGIANATIGAVSPDQLTQVHLQQGQQTSDQEVQPGKRLRRVACSCPNCREGEGR
        580       590       600       610       620       630      

      510        520       530       540       550       560       
pF1KSD -SGEQGKKK-HVCHIPDCGKTFRKTSLLRAHVRLHTGERPFVCNWFFCGKRFTRSDELQR
        :.: :::: :.:::  :::.. ::: ::::.: :::::::.:::.::::::::::::::
CCDS53 GSNEPGKKKQHICHIEGCGKVYGKTSHLRAHLRWHTGERPFICNWMFCGKRFTRSDELQR
        640       650       660       670       680       690      

       570       580       590       600                           
pF1KSD HARTHTGDKRFECAQCQKRFMRSDHLTKHYKTHLVTKNL                     
       : :::::.::::: .:.:::::::::.:: :::                           
CCDS53 HRRTHTGEKRFECPECSKRFMRSDHLSKHVKTHQNKKGGGTALAIVTSGELDSSVTEVLG
        700       710       720       730       740       750      

CCDS53 SPRIVTVAAISQDSNPATPNVSTNMEEF
        760       770       780    

>>CCDS46452.1 SP3 gene_id:6670|Hs108|chr2                 (713 aa)
 initn: 711 init1: 511 opt: 756  Z-score: 397.7  bits: 83.9 E(32554): 7.8e-16
Smith-Waterman score: 840; 31.3% identity (55.5% similar) in 670 aa overlap (25-606:4-641)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MAATAAVSPSDYLQPAASTTQDSQPSPLALLAATCSKIGPPAVEAAVTPPAPPQPTPRKL
                               :::      . .  : ::. .:.   :  :      
CCDS46                      MGPPSPGDDEEEAAAAAGAPAAAGATGDLASAQLGG---
                                    10        20        30         

               70        80        90       100       110          
pF1KSD VPIKPAPLPLSPGKNSFGILSSKGNILQIQGSQLSASYPGGQLVFAIQNPTM-----INK
       .: .   :  .:      : .  ::..::     ::.  .:: :. .::        .  
CCDS46 APNRWEVLSATPTT----IKDEAGNLVQIP----SAATSSGQYVLPLQNLQNQQIFSVAP
         40        50            60            70        80        

         120           130       140                 150       160 
pF1KSD GTRSN----ANIQYQAVPQIQASNSQTIQV-----QPN-----LTNQIQIIPGTNQAII-
       :. :.    ...:::..::::....: .:.     . :      ..:::::::.::... 
CCDS46 GSDSSNGTVSSVQYQVIPQIQSADGQQVQIGFTGSSDNGGINQESSQIQIIPGSNQTLLA
       90       100       110       120       130       140        

                170             180                         190    
pF1KSD --TPSPSSHKPVP------IKPAPIQKSS------------------TTTTPVQSGANVV
         ::: . .. .:      .. . :  ::                   : .:..: ... 
CCDS46 SGTPSANIQNLIPQTGQVQVQGVAIGGSSFPGQTQVVANVPLGLPGNITFVPINS-VDLD
      150       160       170       180       190       200        

          200       210             220         230       240      
pF1KSD KLTGGGGNVTLTLPVN---NLVN---ASDTGAPTQLLTE--SPPTPLSKTNKKARKKSLP
       .:  .:.. :.:  .:   .:.:   : :..  ..   :  ::    ..:.      .  
CCDS46 SLGLSGSSQTMTAGINADGHLINTGQAMDSSDNSERTGERVSPDINETNTDTDLFVPTSS
       210       220       230       240       250       260       

        250           260       270       280                   290
pF1KSD ASQPPVAVAE----QVETVLIETTADNIIQAGNNLLIVQSP------------GGGQPAV
       .:: ::..      : .:  . :.. .. ..  .   .:::            . .:: :
CCDS46 SSQLPVTIDSTGILQQNTNSLTTSSGQVHSSDLQGNYIQSPVSEETQAQNIQVSTAQP-V
       270       280       290       300       310       320       

              300          310       320       330       340       
pF1KSD VQQVQVVPPK--AEQQQVVQ-IPQQALRVVQAASATLPTVPQKPSQNFQIQAAEPTPT-Q
       ::..:.   .  . : :.:: :  :... :::..    .. :.  ::.:.:    :   :
CCDS46 VQHLQLQESQQPTSQAQIVQGITPQTIHGVQASG---QNISQQALQNLQLQLNPGTFLIQ
        330       340       350       360          370       380   

        350         360       370       380       390       400    
pF1KSD VYIRTPSGEV--QTVLVQDSPPATAAATSNTTCSSPASRAPHLSGTSKKHSAAILRKERP
       .   ::::.:  ::  ::          .::. ..  . .:  . :              
CCDS46 AQTVTPSGQVTWQTFQVQGVQNLQNLQIQNTA-AQQITLTPVQTLT--------------
           390       400       410        420                      

          410       420       430       440        450             
pF1KSD LPKIAPAGSIISLNAAQLAAAAQAMQTININGVQVQGVPVTI-TNTGGQQQLTVQN----
       : ..: .:.. :  ..  ..    .::...:...  :. .    :. .  .. ...    
CCDS46 LGQVAAGGAFTSTPVSLSTGQLPNLQTVTVNSIDSAGIQLHPGENADSPADIRIKEEEPD
      430       440       450       460       470       480        

          460        470       480       490       500       510   
pF1KSD -----VSGNN-LTISGLSPTQIQLQMEQALAGETQPGEKRRRMACTCPNCKDGEKRSGEQ
            .::.. :. . :.  ..:.  :..   . : :.. ::.::::::::.:  :. . 
CCDS46 PEEWQLSGDSTLNTNDLTHLRVQVVDEEG-DQQHQEGKRLRRVACTCPNCKEGGGRGTNL
      490       500       510        520       530       540       

            520       530       540       550       560       570  
pF1KSD GKKK-HVCHIPDCGKTFRKTSLLRAHVRLHTGERPFVCNWFFCGKRFTRSDELQRHARTH
       :::: :.:::: :::.. ::: ::::.: :.:::::::::..:::::::::::::: :::
CCDS46 GKKKQHICHIPGCGKVYGKTSHLRAHLRWHSGERPFVCNWMYCGKRFTRSDELQRHRRTH
       550       560       570       580       590       600       

            580       590       600                                
pF1KSD TGDKRFECAQCQKRFMRSDHLTKHYKTHLVTKNL                          
       ::.:.: : .:.:::::::::.:: :::   :..                          
CCDS46 TGEKKFVCPECSKRFMRSDHLAKHIKTHQNKKGIHSSSTVLASVEAARDDTLITAGGTTL
       610       620       630       640       650       660       

CCDS46 ILANIQQGSVSGIGTVNTSATSNQDILTNTEIPLQLVTVSGNETME
       670       680       690       700       710   

>>CCDS2254.1 SP3 gene_id:6670|Hs108|chr2                  (781 aa)
 initn: 807 init1: 511 opt: 756  Z-score: 397.2  bits: 83.9 E(32554): 8.4e-16
Smith-Waterman score: 840; 31.3% identity (55.5% similar) in 670 aa overlap (25-606:72-709)

                     10        20        30        40        50    
pF1KSD       MAATAAVSPSDYLQPAASTTQDSQPSPLALLAATCSKIGPPAVEAAVTPPAPPQ
                                     :::      . .  : ::. .:.   :  :
CCDS22 NGAVAAAAAAQDTQPSPLALLAATCSKIGPPSPGDDEEEAAAAAGAPAAAGATGDLASAQ
              50        60        70        80        90       100 

           60        70        80        90       100       110    
pF1KSD PTPRKLVPIKPAPLPLSPGKNSFGILSSKGNILQIQGSQLSASYPGGQLVFAIQNPTM--
             .: .   :  .:      : .  ::..::     ::.  .:: :. .::     
CCDS22 LGG---APNRWEVLSATPTT----IKDEAGNLVQIP----SAATSSGQYVLPLQNLQNQQ
                110           120       130           140       150

               120           130       140                 150     
pF1KSD ---INKGTRSN----ANIQYQAVPQIQASNSQTIQV-----QPN-----LTNQIQIIPGT
          .  :. :.    ...:::..::::....: .:.     . :      ..:::::::.
CCDS22 IFSVAPGSDSSNGTVSSVQYQVIPQIQSADGQQVQIGFTGSSDNGGINQESSQIQIIPGS
              160       170       180       190       200       210

         160          170             180                          
pF1KSD NQAII---TPSPSSHKPVP------IKPAPIQKSS------------------TTTTPVQ
       ::...   ::: . .. .:      .. . :  ::                   : .:..
CCDS22 NQTLLASGTPSANIQNLIPQTGQVQVQGVAIGGSSFPGQTQVVANVPLGLPGNITFVPIN
              220       230       240       250       260       270

      190       200       210             220         230       240
pF1KSD SGANVVKLTGGGGNVTLTLPVN---NLVN---ASDTGAPTQLLTE--SPPTPLSKTNKKA
       : ... .:  .:.. :.:  .:   .:.:   : :..  ..   :  ::    ..:.   
CCDS22 S-VDLDSLGLSGSSQTMTAGINADGHLINTGQAMDSSDNSERTGERVSPDINETNTDTDL
               280       290       300       310       320         

              250           260       270       280                
pF1KSD RKKSLPASQPPVAVAE----QVETVLIETTADNIIQAGNNLLIVQSP------------G
          .  .:: ::..      : .:  . :.. .. ..  .   .:::            .
CCDS22 FVPTSSSSQLPVTIDSTGILQQNTNSLTTSSGQVHSSDLQGNYIQSPVSEETQAQNIQVS
     330       340       350       360       370       380         

          290       300          310       320       330       340 
pF1KSD GGQPAVVQQVQVVPPK--AEQQQVVQ-IPQQALRVVQAASATLPTVPQKPSQNFQIQAAE
        .:: :::..:.   .  . : :.:: :  :... :::..    .. :.  ::.:.:   
CCDS22 TAQP-VVQHLQLQESQQPTSQAQIVQGITPQTIHGVQASG---QNISQQALQNLQLQLNP
     390        400       410       420          430       440     

              350         360       370       380       390        
pF1KSD PTPT-QVYIRTPSGEV--QTVLVQDSPPATAAATSNTTCSSPASRAPHLSGTSKKHSAAI
        :   :.   ::::.:  ::  ::          .::. ..  . .:  . :        
CCDS22 GTFLIQAQTVTPSGQVTWQTFQVQGVQNLQNLQIQNTA-AQQITLTPVQTLT--------
         450       460       470       480        490              

      400       410       420       430       440        450       
pF1KSD LRKERPLPKIAPAGSIISLNAAQLAAAAQAMQTININGVQVQGVPVTI-TNTGGQQQLTV
             : ..: .:.. :  ..  ..    .::...:...  :. .    :. .  .. .
CCDS22 ------LGQVAAGGAFTSTPVSLSTGQLPNLQTVTVNSIDSAGIQLHPGENADSPADIRI
              500       510       520       530       540       550

                460        470       480       490       500       
pF1KSD QN---------VSGNN-LTISGLSPTQIQLQMEQALAGETQPGEKRRRMACTCPNCKDGE
       ..         .::.. :. . :.  ..:.  :..   . : :.. ::.::::::::.: 
CCDS22 KEEEPDPEEWQLSGDSTLNTNDLTHLRVQVVDEEG-DQQHQEGKRLRRVACTCPNCKEGG
              560       570       580        590       600         

       510        520       530       540       550       560      
pF1KSD KRSGEQGKKK-HVCHIPDCGKTFRKTSLLRAHVRLHTGERPFVCNWFFCGKRFTRSDELQ
        :. . :::: :.:::: :::.. ::: ::::.: :.:::::::::..::::::::::::
CCDS22 GRGTNLGKKKQHICHIPGCGKVYGKTSHLRAHLRWHSGERPFVCNWMYCGKRFTRSDELQ
     610       620       630       640       650       660         

        570       580       590       600                          
pF1KSD RHARTHTGDKRFECAQCQKRFMRSDHLTKHYKTHLVTKNL                    
       :: :::::.:.: : .:.:::::::::.:: :::   :..                    
CCDS22 RHRRTHTGEKKFVCPECSKRFMRSDHLAKHIKTHQNKKGIHSSSTVLASVEAARDDTLIT
     670       680       690       700       710       720         

CCDS22 AGGTTLILANIQQGSVSGIGTVNTSATSNQDILTNTEIPLQLVTVSGNETME
     730       740       750       760       770       780 

>>CCDS33322.1 SP5 gene_id:389058|Hs108|chr2               (398 aa)
 initn: 721 init1: 523 opt: 569  Z-score: 308.4  bits: 66.5 E(32554): 7.4e-11
Smith-Waterman score: 594; 35.7% identity (55.6% similar) in 342 aa overlap (280-600:43-378)

     250       260       270       280       290            300    
pF1KSD PPVAVAEQVETVLIETTADNIIQAGNNLLIVQSPGGGQPAVVQQVQV-----VPPKAEQQ
                                     . .::.. :    ::        : .  . 
CCDS33 QAFLQDRTPSASPDLGKHSPLALLAATCSRIGQPGAAAPPDFLQVPYDPALGSPSRLFHP
             20        30        40        50        60        70  

          310       320       330       340       350       360    
pF1KSD QVVQIPQQALRVVQAASATLPTVPQKPSQNFQIQAAEPTPTQVYIRTPSGEVQTVLVQDS
        ....: ..  ..     .:  .:::   . .. ::.  :       ::   .   :.  
CCDS33 WTADMPAHSPGALPPPHPSLGLTPQKTHLQPSFGAAHELPLTPPA-DPSYPYEFSPVKML
             80        90       100       110        120       130 

          370       380       390       400       410       420    
pF1KSD PPATAAATSNTTCSSPASRAPHLSGTSKKHSAAILRKERPLPKIAPAGSIISLNAAQ---
       : . ::  .  .:. ::  .:. . ..   . . :    : :   :.   .: : :    
CCDS33 PSSMAALPA--SCA-PA-YVPYAAQAALPPGYSNLLPPPPPPPPPPTCRQLSPNPAPDDL
             140           150       160       170       180       

              430       440       450       460          470       
pF1KSD -LAAAAQAMQTININGVQVQGVPVTITNTGGQQQLTVQNVSGNNLTIS---GL--SPT--
          .  ::    . .::  .:.  . ...    .. .. ...   . .   ::  .:.  
CCDS33 PWWSIPQAGAGPGASGVPGSGLSGACAGAPHAPRFPASAAAAAAAAAALQRGLVLGPSDF
       190       200       210       220       230       240       

            480         490       500        510        520        
pF1KSD -QIQLQMEQALAGETQP--GEKRRRMACTCPNCKD-GEKRSGEQGKKK-HVCHIPDCGKT
        : : :.  ::     :  .  ::   : ::::.  :    .: :::: ::::.: :::.
CCDS33 AQYQSQIA-ALLQTKAPLAATARRCRRCRCPNCQAAGGAPEAEPGKKKQHVCHVPGCGKV
       250        260       270       280       290       300      

      530       540       550       560       570       580        
pF1KSD FRKTSLLRAHVRLHTGERPFVCNWFFCGKRFTRSDELQRHARTHTGDKRFECAQCQKRFM
       . ::: :.::.: :::::::::::.:::: :::::::::: :::::.::: : .: ::::
CCDS33 YGKTSHLKAHLRWHTGERPFVCNWLFCGKSFTRSDELQRHLRTHTGEKRFACPECGKRFM
        310       320       330       340       350       360      

      590       600                    
pF1KSD RSDHLTKHYKTHLVTKNL              
       :::::.:: :::                    
CCDS33 RSDHLAKHVKTHQNKKLKVAEAGVKREDARDL
        370       380       390        




606 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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 start: Wed Nov  2 23:37:24 2016 done: Wed Nov  2 23:37:24 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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