Result of FASTA (omim) for pF1KSDA0046
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA0046, 869 aa
  1>>>pF1KSDA0046 869 - 869 aa - 869 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.7883+/-0.000461; mu= 24.2564+/- 0.029
 mean_var=72.4019+/-14.703, 0's: 0 Z-trim(110.9): 50  B-trim: 245 in 1/50
 Lambda= 0.150730
 statistics sampled from 19304 (19354) to 19304 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.583), E-opt: 0.2 (0.227), width:  16
 Scan time:  7.910

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_001277 (OMIM: 602726) chloride transport protei ( 869) 5815 1274.7       0
NP_001243888 (OMIM: 602726) chloride transport pro ( 847) 5298 1162.3       0
XP_011520656 (OMIM: 166600,602727,611490) PREDICTE ( 747) 1146 259.3 4.8e-68
NP_001107803 (OMIM: 166600,602727,611490) H(+)/Cl( ( 781) 1146 259.3 4.9e-68
NP_001278 (OMIM: 166600,602727,611490) H(+)/Cl(-)  ( 805) 1146 259.4   5e-68
NP_000074 (OMIM: 118425,160800,255700) chloride ch ( 988)  357 87.9 2.6e-16
XP_011510703 (OMIM: 600570,607628,615651) PREDICTE ( 835)  305 76.5 5.8e-13
XP_006713552 (OMIM: 600570,607628,615651) PREDICTE ( 863)  305 76.5   6e-13
NP_001164560 (OMIM: 600570,607628,615651) chloride ( 869)  305 76.5   6e-13
NP_001164558 (OMIM: 600570,607628,615651) chloride ( 881)  305 76.5 6.1e-13
NP_004357 (OMIM: 600570,607628,615651) chloride ch ( 898)  305 76.5 6.2e-13
NP_001164559 (OMIM: 600570,607628,615651) chloride ( 854)  296 74.5 2.3e-12
XP_006713553 (OMIM: 600570,607628,615651) PREDICTE ( 512)  261 66.7 3.1e-10
XP_011514084 (OMIM: 118425,160800,255700) PREDICTE ( 570)  242 62.6 5.9e-09
XP_016867229 (OMIM: 118425,160800,255700) PREDICTE ( 838)  242 62.8 7.8e-09
XP_016867228 (OMIM: 118425,160800,255700) PREDICTE ( 846)  242 62.8 7.9e-09
NP_001230301 (OMIM: 600580) H(+)/Cl(-) exchange tr ( 791)  240 62.3   1e-08
NP_001159417 (OMIM: 602023,607364,613090) chloride ( 517)  219 57.6 1.8e-07
NP_000076 (OMIM: 602023,607364,613090) chloride ch ( 687)  219 57.7 2.2e-07
NP_001244068 (OMIM: 602024,613090) chloride channe ( 644)  218 57.5 2.4e-07
NP_001036169 (OMIM: 602024,613090) chloride channe ( 686)  218 57.5 2.5e-07
NP_004061 (OMIM: 602024,613090) chloride channel p ( 687)  218 57.5 2.5e-07
NP_001230303 (OMIM: 600580) H(+)/Cl(-) exchange tr ( 791)  213 56.5 5.9e-07
NP_001820 (OMIM: 600580) H(+)/Cl(-) exchange trans ( 818)  213 56.5 6.1e-07
XP_011529888 (OMIM: 600580) PREDICTED: H(+)/Cl(-)  ( 831)  213 56.5 6.1e-07
XP_005262783 (OMIM: 600580) PREDICTED: H(+)/Cl(-)  ( 839)  213 56.5 6.2e-07
NP_776297 (OMIM: 600580) H(+)/Cl(-) exchange trans ( 866)  213 56.5 6.3e-07
NP_000075 (OMIM: 300008,300009,300554,308990,31046 ( 746)  203 54.3 2.6e-06
NP_001269092 (OMIM: 300008,300009,300554,308990,31 ( 766)  203 54.3 2.6e-06
NP_001121371 (OMIM: 300008,300009,300554,308990,31 ( 816)  203 54.3 2.7e-06
NP_001121370 (OMIM: 300008,300009,300554,308990,31 ( 816)  203 54.3 2.7e-06
XP_016884746 (OMIM: 300008,300009,300554,308990,31 ( 820)  203 54.3 2.7e-06
XP_016884747 (OMIM: 300008,300009,300554,308990,31 ( 820)  203 54.3 2.7e-06
NP_001243873 (OMIM: 300114,302910) H(+)/Cl(-) exch ( 666)  200 53.6 3.7e-06
NP_001821 (OMIM: 300114,302910) H(+)/Cl(-) exchang ( 760)  200 53.6 4.1e-06


>>NP_001277 (OMIM: 602726) chloride transport protein 6   (869 aa)
 initn: 5815 init1: 5815 opt: 5815  Z-score: 6829.0  bits: 1274.7 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 5815; 100.0% identity (100.0% similar) in 869 aa overlap (1-869:1-869)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MAGCRGSLCCCCRWCCCCGERETRTPEELTILGETQEEEDEILPRKDYESLDYDRCINDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MAGCRGSLCCCCRWCCCCGERETRTPEELTILGETQEEEDEILPRKDYESLDYDRCINDP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD YLEVLETMDNKKGRRYEAVKWMVVFAIGVCTGLVGLFVDFFVRLFTQLKFGVVQTSVEEC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YLEVLETMDNKKGRRYEAVKWMVVFAIGVCTGLVGLFVDFFVRLFTQLKFGVVQTSVEEC
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD SQKGCLALSLLELLGFNLTFVFLASLLVLIEPVAAGSGIPEVKCYLNGVKVPGIVRLRTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SQKGCLALSLLELLGFNLTFVFLASLLVLIEPVAAGSGIPEVKCYLNGVKVPGIVRLRTL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD LCKVLGVLFSVAGGLFVGKEGPMIHSGSVVGAGLPQFQSISLRKIQFNFPYFRSDRDKRD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LCKVLGVLFSVAGGLFVGKEGPMIHSGSVVGAGLPQFQSISLRKIQFNFPYFRSDRDKRD
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD FVSAGAAAGVAAAFGAPIGGTLFSLEEGSSFWNQGLTWKVLFCSMSATFTLNFFRSGIQF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FVSAGAAAGVAAAFGAPIGGTLFSLEEGSSFWNQGLTWKVLFCSMSATFTLNFFRSGIQF
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD GSWGSFQLPGLLNFGEFKCSDSDKKCHLWTAMDLGFFVVMGVIGGLLGATFNCLNKRLAK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GSWGSFQLPGLLNFGEFKCSDSDKKCHLWTAMDLGFFVVMGVIGGLLGATFNCLNKRLAK
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD YRMRNVHPKPKLVRVLESLLVSLVTTVVVFVASMVLGECRQMSSSSQIGNDSFQLQVTED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YRMRNVHPKPKLVRVLESLLVSLVTTVVVFVASMVLGECRQMSSSSQIGNDSFQLQVTED
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD VNSSIKTFFCPNDTYNDMATLFFNPQESAILQLFHQDGTFSPVTLALFFVLYFLLACWTY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VNSSIKTFFCPNDTYNDMATLFFNPQESAILQLFHQDGTFSPVTLALFFVLYFLLACWTY
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD GISVPSGLFVPSLLCGAAFGRLVANVLKSYIGLGHIYSGTFALIGAAAFLGGVVRMTISL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GISVPSGLFVPSLLCGAAFGRLVANVLKSYIGLGHIYSGTFALIGAAAFLGGVVRMTISL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD TVILIESTNEITYGLPIMVTLMVAKWTGDFFNKGIYDIHVGLRGVPLLEWETEVEMDKLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TVILIESTNEITYGLPIMVTLMVAKWTGDFFNKGIYDIHVGLRGVPLLEWETEVEMDKLR
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD ASDIMEPNLTYVYPHTRIQSLVSILRTTVHHAFPVVTENRGNEKEFMKGNQLISNNIKFK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ASDIMEPNLTYVYPHTRIQSLVSILRTTVHHAFPVVTENRGNEKEFMKGNQLISNNIKFK
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD KSSILTRAGEQRKRSQSMKSYPSSELRNMCDEHIASEEPAEKEDLLQQMLERRYTPYPNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KSSILTRAGEQRKRSQSMKSYPSSELRNMCDEHIASEEPAEKEDLLQQMLERRYTPYPNL
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD YPDQSPSEDWTMEERFRPLTFHGLILRSQLVTLLVRGVCYSESQSSASQPRLSYAEMAED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YPDQSPSEDWTMEERFRPLTFHGLILRSQLVTLLVRGVCYSESQSSASQPRLSYAEMAED
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD YPRYPDIHDLDLTLLNPRMIVDVTPYMNPSPFTVSPNTHVSQVFNLFRTMGLRHLPVVNA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YPRYPDIHDLDLTLLNPRMIVDVTPYMNPSPFTVSPNTHVSQVFNLFRTMGLRHLPVVNA
              790       800       810       820       830       840

              850       860         
pF1KSD VGEIVGIITRHNLTYEFLQARLRQHYQTI
       :::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VGEIVGIITRHNLTYEFLQARLRQHYQTI
              850       860         

>>NP_001243888 (OMIM: 602726) chloride transport protein  (847 aa)
 initn: 5298 init1: 5298 opt: 5298  Z-score: 6221.5  bits: 1162.3 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 5609; 97.5% identity (97.5% similar) in 869 aa overlap (1-869:1-847)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MAGCRGSLCCCCRWCCCCGERETRTPEELTILGETQEEEDEILPRKDYESLDYDRCINDP
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::           
NP_001 MAGCRGSLCCCCRWCCCCGERETRTPEELTILGETQEEEDEILPRKDYE-----------
               10        20        30        40                    

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD YLEVLETMDNKKGRRYEAVKWMVVFAIGVCTGLVGLFVDFFVRLFTQLKFGVVQTSVEEC
                  :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 -----------KGRRYEAVKWMVVFAIGVCTGLVGLFVDFFVRLFTQLKFGVVQTSVEEC
                 50        60        70        80        90        

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD SQKGCLALSLLELLGFNLTFVFLASLLVLIEPVAAGSGIPEVKCYLNGVKVPGIVRLRTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SQKGCLALSLLELLGFNLTFVFLASLLVLIEPVAAGSGIPEVKCYLNGVKVPGIVRLRTL
      100       110       120       130       140       150        

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD LCKVLGVLFSVAGGLFVGKEGPMIHSGSVVGAGLPQFQSISLRKIQFNFPYFRSDRDKRD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LCKVLGVLFSVAGGLFVGKEGPMIHSGSVVGAGLPQFQSISLRKIQFNFPYFRSDRDKRD
      160       170       180       190       200       210        

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD FVSAGAAAGVAAAFGAPIGGTLFSLEEGSSFWNQGLTWKVLFCSMSATFTLNFFRSGIQF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FVSAGAAAGVAAAFGAPIGGTLFSLEEGSSFWNQGLTWKVLFCSMSATFTLNFFRSGIQF
      220       230       240       250       260       270        

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD GSWGSFQLPGLLNFGEFKCSDSDKKCHLWTAMDLGFFVVMGVIGGLLGATFNCLNKRLAK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GSWGSFQLPGLLNFGEFKCSDSDKKCHLWTAMDLGFFVVMGVIGGLLGATFNCLNKRLAK
      280       290       300       310       320       330        

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD YRMRNVHPKPKLVRVLESLLVSLVTTVVVFVASMVLGECRQMSSSSQIGNDSFQLQVTED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YRMRNVHPKPKLVRVLESLLVSLVTTVVVFVASMVLGECRQMSSSSQIGNDSFQLQVTED
      340       350       360       370       380       390        

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD VNSSIKTFFCPNDTYNDMATLFFNPQESAILQLFHQDGTFSPVTLALFFVLYFLLACWTY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VNSSIKTFFCPNDTYNDMATLFFNPQESAILQLFHQDGTFSPVTLALFFVLYFLLACWTY
      400       410       420       430       440       450        

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD GISVPSGLFVPSLLCGAAFGRLVANVLKSYIGLGHIYSGTFALIGAAAFLGGVVRMTISL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GISVPSGLFVPSLLCGAAFGRLVANVLKSYIGLGHIYSGTFALIGAAAFLGGVVRMTISL
      460       470       480       490       500       510        

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD TVILIESTNEITYGLPIMVTLMVAKWTGDFFNKGIYDIHVGLRGVPLLEWETEVEMDKLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TVILIESTNEITYGLPIMVTLMVAKWTGDFFNKGIYDIHVGLRGVPLLEWETEVEMDKLR
      520       530       540       550       560       570        

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pF1KSD ASDIMEPNLTYVYPHTRIQSLVSILRTTVHHAFPVVTENRGNEKEFMKGNQLISNNIKFK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ASDIMEPNLTYVYPHTRIQSLVSILRTTVHHAFPVVTENRGNEKEFMKGNQLISNNIKFK
      580       590       600       610       620       630        

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pF1KSD KSSILTRAGEQRKRSQSMKSYPSSELRNMCDEHIASEEPAEKEDLLQQMLERRYTPYPNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KSSILTRAGEQRKRSQSMKSYPSSELRNMCDEHIASEEPAEKEDLLQQMLERRYTPYPNL
      640       650       660       670       680       690        

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pF1KSD YPDQSPSEDWTMEERFRPLTFHGLILRSQLVTLLVRGVCYSESQSSASQPRLSYAEMAED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YPDQSPSEDWTMEERFRPLTFHGLILRSQLVTLLVRGVCYSESQSSASQPRLSYAEMAED
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pF1KSD YPRYPDIHDLDLTLLNPRMIVDVTPYMNPSPFTVSPNTHVSQVFNLFRTMGLRHLPVVNA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YPRYPDIHDLDLTLLNPRMIVDVTPYMNPSPFTVSPNTHVSQVFNLFRTMGLRHLPVVNA
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              850       860         
pF1KSD VGEIVGIITRHNLTYEFLQARLRQHYQTI
       :::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VGEIVGIITRHNLTYEFLQARLRQHYQTI
      820       830       840       

>>XP_011520656 (OMIM: 166600,602727,611490) PREDICTED: H  (747 aa)
 initn: 1701 init1: 704 opt: 1146  Z-score: 1342.6  bits: 259.3 E(85289): 4.8e-68
Smith-Waterman score: 1890; 41.4% identity (65.9% similar) in 828 aa overlap (40-861:28-737)

      10        20        30        40        50        60         
pF1KSD CCCRWCCCCGERETRTPEELTILGETQEEEDEILPRKDYESLDYDRCINDPYLEVLETMD
                                     .: :    :::::::   :. .::  . ..
XP_011    MSSVELDDELLDPDMDPPHPFPKEIPHNEKLLSLKYESLDYDNSENQLFLEEERRIN
                  10        20        30        40        50       

      70        80        90       100       110       120         
pF1KSD NKKGRRYEAVKWMVVFAIGVCTGLVGLFVDFFVRLFTQLKFGVVQTSVEECSQKGCLALS
       .   :  :  .:..   ::. ::::. :.:. :. .. ::. :.. .... ..:: :..:
XP_011 HTAFRTVEIKRWVICALIGILTGLVACFIDIVVENLAGLKYRVIKGNIDKFTEKGGLSFS
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pF1KSD LLELLGFNLTFVFLASLLV-LIEPVAAGSGIPEVKCYLNGVKVPGIVRLRTLLCKVLGVL
       ::    .: .::...:..: .:::::::::::..::.:::::.: .:::.::. :: ::.
XP_011 LLLWATLNAAFVLVGSVIVAFIEPVAAGSGIPQIKCFLNGVKIPHVVRLKTLVIKVSGVI
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pF1KSD FSVAGGLFVGKEGPMIHSGSVVGAGLPQFQSISLRKIQFNFPYFRSDRDKRDFVSAGAAA
       .::.::: :::::::::::::..::. : .: ::..    : ::: : .:::::::::::
XP_011 LSVVGGLAVGKEGPMIHSGSVIAAGISQGRSTSLKRDFKIFEYFRRDTEKRDFVSAGAAA
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pF1KSD GVAAAFGAPIGGTLFSLEEGSSFWNQGLTWKVLFCSMSATFTLNFFRSGIQFGSWGSFQL
       ::.::::::.::.:::::::.::::: :::...: :: .::::::  : :  :.  ... 
XP_011 GVSAAFGAPVGGVLFSLEEGASFWNQFLTWRIFFASMISTFTLNFVLS-IYHGNMWDLSS
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pF1KSD PGLLNFGEFKCSDSDKKCHLWTAMDLGFFVVMGVIGGLLGATFNCLNKRLAKYRMRNVHP
       :::.:::.:   ::.:  .  :  ..  :..:::.::.:::.:: ::  :. .:.: .: 
XP_011 PGLINFGRF---DSEKMAY--TIHEIPVFIAMGVVGGVLGAVFNALNYWLTMFRIRYIH-
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pF1KSD KPKLVRVLESLLVSLVTTVVVFVASMVLGECRQMSSSSQIGNDSFQLQVTEDVNSSIKTF
       .: : .:.:..::. ::..:.::  .   .:. .    : :. :. ::.           
XP_011 RPCL-QVIEAVLVAAVTATVAFVLIYSSRDCQPL----QGGSMSYPLQL-----------
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pF1KSD FCPNDTYNDMATLFFNPQESAILQLFHQD-GTFSPVTLALFFVLYFLLACWTYGISVPSG
       :: .  ::.::. :::  :.....:::.  :...:.::.:: ..::.:::::::..: .:
XP_011 FCADGEYNSMAAAFFNTPEKSVVSLFHDPPGSYNPLTLGLFTLVYFFLACWTYGLTVSAG
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pF1KSD LFVPSLLCGAAFGRLVANVLKSYIGLGHIYS--GTFALIGAAAFLGGVVRMTISLTVILI
       .:.:::: :::.::: .  : ::.  . :..  : .::.:::: :::.::::.:::::..
XP_011 VFIPSLLIGAAWGRLFGISL-SYLTGAAIWADPGKYALMGAAAQLGGIVRMTLSLTVIMM
          460       470        480       490       500       510   

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pF1KSD ESTNEITYGLPIMVTLMVAKWTGDFFNKGIYDIHVGLRGVPLLEWETEVEMDKLRASDIM
       :.:...:::.:::..::.:: .:: : .:.::.:. :..::.:.::. :   .: : ..:
XP_011 EATSNVTYGFPIMLVLMTAKIVGDVFIEGLYDMHIQLQSVPFLHWEAPVTSHSLTAREVM
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pF1KSD EPNLTYVYPHTRIQSLVSILRTTV--HHAFPVVTENRGNEKEFMKGNQLISNNIKFKKSS
          .: .  . ..  .:..:  :.  :..::::                           
XP_011 STPVTCLRRREKVGVIVDVLSDTASNHNGFPVV---------------------------
           580       590       600                                 

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pF1KSD ILTRAGEQRKRSQSMKSYPSSELRNMCDEHIASEEPAEKEDLLQQMLERRYTPYPNLYPD
                                   ::  . .::.    ::                
XP_011 ----------------------------EHADDTQPAR----LQ----------------
                                    610                            

           730       740       750       760       770       780   
pF1KSD QSPSEDWTMEERFRPLTFHGLILRSQLVTLLVRGVCYSESQSSASQPRLSYAEMAEDYPR
                          ::::::::..:: . :   .:. .  : ::   .. . :::
XP_011 -------------------GLILRSQLIVLLKHKVFVERSNLGLVQRRLRLKDFRDAYPR
                         620       630       640       650         

           790       800       810       820       830       840   
pF1KSD YPDIHDLDLTLLNPRMIVDVTPYMNPSPFTVSPNTHVSQVFNLFRTMGLRHLPVVNAVGE
       .: :... ..  . .  .:.. .:::::.::  .. . .::.:::..::::: ::.  ..
XP_011 FPPIQSIHVSQDERECTMDLSEFMNPSPYTVPQEASLPRVFKLFRALGLRHLVVVDNRNQ
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           850       860           
pF1KSD IVGIITRHNLTYEFLQARLRQHYQTI  
       .::..::..:.   :  :          
XP_011 VVGLVTRKDLARYRLGKRGLEELSLAQT
     720       730       740       

>>NP_001107803 (OMIM: 166600,602727,611490) H(+)/Cl(-) e  (781 aa)
 initn: 1701 init1: 704 opt: 1146  Z-score: 1342.4  bits: 259.3 E(85289): 4.9e-68
Smith-Waterman score: 1890; 41.4% identity (65.9% similar) in 828 aa overlap (40-861:62-771)

      10        20        30        40        50        60         
pF1KSD CCCRWCCCCGERETRTPEELTILGETQEEEDEILPRKDYESLDYDRCINDPYLEVLETMD
                                     .: :    :::::::   :. .::  . ..
NP_001 GGTPLLNGAGPGAARQDMDPPHPFPKEIPHNEKLLSLKYESLDYDNSENQLFLEEERRIN
              40        50        60        70        80        90 

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pF1KSD NKKGRRYEAVKWMVVFAIGVCTGLVGLFVDFFVRLFTQLKFGVVQTSVEECSQKGCLALS
       .   :  :  .:..   ::. ::::. :.:. :. .. ::. :.. .... ..:: :..:
NP_001 HTAFRTVEIKRWVICALIGILTGLVACFIDIVVENLAGLKYRVIKGNIDKFTEKGGLSFS
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pF1KSD LLELLGFNLTFVFLASLLV-LIEPVAAGSGIPEVKCYLNGVKVPGIVRLRTLLCKVLGVL
       ::    .: .::...:..: .:::::::::::..::.:::::.: .:::.::. :: ::.
NP_001 LLLWATLNAAFVLVGSVIVAFIEPVAAGSGIPQIKCFLNGVKIPHVVRLKTLVIKVSGVI
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pF1KSD FSVAGGLFVGKEGPMIHSGSVVGAGLPQFQSISLRKIQFNFPYFRSDRDKRDFVSAGAAA
       .::.::: :::::::::::::..::. : .: ::..    : ::: : .:::::::::::
NP_001 LSVVGGLAVGKEGPMIHSGSVIAAGISQGRSTSLKRDFKIFEYFRRDTEKRDFVSAGAAA
             220       230       240       250       260       270 

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pF1KSD GVAAAFGAPIGGTLFSLEEGSSFWNQGLTWKVLFCSMSATFTLNFFRSGIQFGSWGSFQL
       ::.::::::.::.:::::::.::::: :::...: :: .::::::  : :  :.  ... 
NP_001 GVSAAFGAPVGGVLFSLEEGASFWNQFLTWRIFFASMISTFTLNFVLS-IYHGNMWDLSS
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      310       320       330       340       350       360        
pF1KSD PGLLNFGEFKCSDSDKKCHLWTAMDLGFFVVMGVIGGLLGATFNCLNKRLAKYRMRNVHP
       :::.:::.:   ::.:  .  :  ..  :..:::.::.:::.:: ::  :. .:.: .: 
NP_001 PGLINFGRF---DSEKMAY--TIHEIPVFIAMGVVGGVLGAVFNALNYWLTMFRIRYIH-
                 340         350       360       370       380     

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pF1KSD KPKLVRVLESLLVSLVTTVVVFVASMVLGECRQMSSSSQIGNDSFQLQVTEDVNSSIKTF
       .: : .:.:..::. ::..:.::  .   .:. .    : :. :. ::.           
NP_001 RPCL-QVIEAVLVAAVTATVAFVLIYSSRDCQPL----QGGSMSYPLQL-----------
           390       400       410           420                   

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pF1KSD FCPNDTYNDMATLFFNPQESAILQLFHQD-GTFSPVTLALFFVLYFLLACWTYGISVPSG
       :: .  ::.::. :::  :.....:::.  :...:.::.:: ..::.:::::::..: .:
NP_001 FCADGEYNSMAAAFFNTPEKSVVSLFHDPPGSYNPLTLGLFTLVYFFLACWTYGLTVSAG
      430       440       450       460       470       480        

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pF1KSD LFVPSLLCGAAFGRLVANVLKSYIGLGHIYS--GTFALIGAAAFLGGVVRMTISLTVILI
       .:.:::: :::.::: .  : ::.  . :..  : .::.:::: :::.::::.:::::..
NP_001 VFIPSLLIGAAWGRLFGISL-SYLTGAAIWADPGKYALMGAAAQLGGIVRMTLSLTVIMM
      490       500        510       520       530       540       

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pF1KSD ESTNEITYGLPIMVTLMVAKWTGDFFNKGIYDIHVGLRGVPLLEWETEVEMDKLRASDIM
       :.:...:::.:::..::.:: .:: : .:.::.:. :..::.:.::. :   .: : ..:
NP_001 EATSNVTYGFPIMLVLMTAKIVGDVFIEGLYDMHIQLQSVPFLHWEAPVTSHSLTAREVM
       550       560       570       580       590       600       

         610       620         630       640       650       660   
pF1KSD EPNLTYVYPHTRIQSLVSILRTTV--HHAFPVVTENRGNEKEFMKGNQLISNNIKFKKSS
          .: .  . ..  .:..:  :.  :..::::                           
NP_001 STPVTCLRRREKVGVIVDVLSDTASNHNGFPVV---------------------------
       610       620       630       640                           

           670       680       690       700       710       720   
pF1KSD ILTRAGEQRKRSQSMKSYPSSELRNMCDEHIASEEPAEKEDLLQQMLERRYTPYPNLYPD
                                   ::  . .::.    ::                
NP_001 ----------------------------EHADDTQPAR----LQ----------------
                                          650                      

           730       740       750       760       770       780   
pF1KSD QSPSEDWTMEERFRPLTFHGLILRSQLVTLLVRGVCYSESQSSASQPRLSYAEMAEDYPR
                          ::::::::..:: . :   .:. .  : ::   .. . :::
NP_001 -------------------GLILRSQLIVLLKHKVFVERSNLGLVQRRLRLKDFRDAYPR
                               660       670       680       690   

           790       800       810       820       830       840   
pF1KSD YPDIHDLDLTLLNPRMIVDVTPYMNPSPFTVSPNTHVSQVFNLFRTMGLRHLPVVNAVGE
       .: :... ..  . .  .:.. .:::::.::  .. . .::.:::..::::: ::.  ..
NP_001 FPPIQSIHVSQDERECTMDLSEFMNPSPYTVPQEASLPRVFKLFRALGLRHLVVVDNRNQ
           700       710       720       730       740       750   

           850       860           
pF1KSD IVGIITRHNLTYEFLQARLRQHYQTI  
       .::..::..:.   :  :          
NP_001 VVGLVTRKDLARYRLGKRGLEELSLAQT
           760       770       780 

>>NP_001278 (OMIM: 166600,602727,611490) H(+)/Cl(-) exch  (805 aa)
 initn: 1701 init1: 704 opt: 1146  Z-score: 1342.2  bits: 259.4 E(85289): 5e-68
Smith-Waterman score: 1890; 41.4% identity (65.9% similar) in 828 aa overlap (40-861:86-795)

      10        20        30        40        50        60         
pF1KSD CCCRWCCCCGERETRTPEELTILGETQEEEDEILPRKDYESLDYDRCINDPYLEVLETMD
                                     .: :    :::::::   :. .::  . ..
NP_001 VGHMSSVELDDELLDPDMDPPHPFPKEIPHNEKLLSLKYESLDYDNSENQLFLEEERRIN
          60        70        80        90       100       110     

      70        80        90       100       110       120         
pF1KSD NKKGRRYEAVKWMVVFAIGVCTGLVGLFVDFFVRLFTQLKFGVVQTSVEECSQKGCLALS
       .   :  :  .:..   ::. ::::. :.:. :. .. ::. :.. .... ..:: :..:
NP_001 HTAFRTVEIKRWVICALIGILTGLVACFIDIVVENLAGLKYRVIKGNIDKFTEKGGLSFS
         120       130       140       150       160       170     

     130       140        150       160       170       180        
pF1KSD LLELLGFNLTFVFLASLLV-LIEPVAAGSGIPEVKCYLNGVKVPGIVRLRTLLCKVLGVL
       ::    .: .::...:..: .:::::::::::..::.:::::.: .:::.::. :: ::.
NP_001 LLLWATLNAAFVLVGSVIVAFIEPVAAGSGIPQIKCFLNGVKIPHVVRLKTLVIKVSGVI
         180       190       200       210       220       230     

      190       200       210       220       230       240        
pF1KSD FSVAGGLFVGKEGPMIHSGSVVGAGLPQFQSISLRKIQFNFPYFRSDRDKRDFVSAGAAA
       .::.::: :::::::::::::..::. : .: ::..    : ::: : .:::::::::::
NP_001 LSVVGGLAVGKEGPMIHSGSVIAAGISQGRSTSLKRDFKIFEYFRRDTEKRDFVSAGAAA
         240       250       260       270       280       290     

      250       260       270       280       290       300        
pF1KSD GVAAAFGAPIGGTLFSLEEGSSFWNQGLTWKVLFCSMSATFTLNFFRSGIQFGSWGSFQL
       ::.::::::.::.:::::::.::::: :::...: :: .::::::  : :  :.  ... 
NP_001 GVSAAFGAPVGGVLFSLEEGASFWNQFLTWRIFFASMISTFTLNFVLS-IYHGNMWDLSS
         300       310       320       330       340        350    

      310       320       330       340       350       360        
pF1KSD PGLLNFGEFKCSDSDKKCHLWTAMDLGFFVVMGVIGGLLGATFNCLNKRLAKYRMRNVHP
       :::.:::.:   ::.:  .  :  ..  :..:::.::.:::.:: ::  :. .:.: .: 
NP_001 PGLINFGRF---DSEKMAY--TIHEIPVFIAMGVVGGVLGAVFNALNYWLTMFRIRYIH-
          360          370         380       390       400         

      370       380       390       400       410       420        
pF1KSD KPKLVRVLESLLVSLVTTVVVFVASMVLGECRQMSSSSQIGNDSFQLQVTEDVNSSIKTF
       .: : .:.:..::. ::..:.::  .   .:. .    : :. :. ::.           
NP_001 RPCL-QVIEAVLVAAVTATVAFVLIYSSRDCQPL----QGGSMSYPLQL-----------
      410        420       430       440           450             

      430       440       450        460       470       480       
pF1KSD FCPNDTYNDMATLFFNPQESAILQLFHQD-GTFSPVTLALFFVLYFLLACWTYGISVPSG
       :: .  ::.::. :::  :.....:::.  :...:.::.:: ..::.:::::::..: .:
NP_001 FCADGEYNSMAAAFFNTPEKSVVSLFHDPPGSYNPLTLGLFTLVYFFLACWTYGLTVSAG
            460       470       480       490       500       510  

       490       500       510         520       530       540     
pF1KSD LFVPSLLCGAAFGRLVANVLKSYIGLGHIYS--GTFALIGAAAFLGGVVRMTISLTVILI
       .:.:::: :::.::: .  : ::.  . :..  : .::.:::: :::.::::.:::::..
NP_001 VFIPSLLIGAAWGRLFGISL-SYLTGAAIWADPGKYALMGAAAQLGGIVRMTLSLTVIMM
            520       530        540       550       560       570 

         550       560       570       580       590       600     
pF1KSD ESTNEITYGLPIMVTLMVAKWTGDFFNKGIYDIHVGLRGVPLLEWETEVEMDKLRASDIM
       :.:...:::.:::..::.:: .:: : .:.::.:. :..::.:.::. :   .: : ..:
NP_001 EATSNVTYGFPIMLVLMTAKIVGDVFIEGLYDMHIQLQSVPFLHWEAPVTSHSLTAREVM
             580       590       600       610       620       630 

         610       620         630       640       650       660   
pF1KSD EPNLTYVYPHTRIQSLVSILRTTV--HHAFPVVTENRGNEKEFMKGNQLISNNIKFKKSS
          .: .  . ..  .:..:  :.  :..::::                           
NP_001 STPVTCLRRREKVGVIVDVLSDTASNHNGFPVV---------------------------
             640       650       660                               

           670       680       690       700       710       720   
pF1KSD ILTRAGEQRKRSQSMKSYPSSELRNMCDEHIASEEPAEKEDLLQQMLERRYTPYPNLYPD
                                   ::  . .::.    ::                
NP_001 ----------------------------EHADDTQPAR----LQ----------------
                                      670                          

           730       740       750       760       770       780   
pF1KSD QSPSEDWTMEERFRPLTFHGLILRSQLVTLLVRGVCYSESQSSASQPRLSYAEMAEDYPR
                          ::::::::..:: . :   .:. .  : ::   .. . :::
NP_001 -------------------GLILRSQLIVLLKHKVFVERSNLGLVQRRLRLKDFRDAYPR
                           680       690       700       710       

           790       800       810       820       830       840   
pF1KSD YPDIHDLDLTLLNPRMIVDVTPYMNPSPFTVSPNTHVSQVFNLFRTMGLRHLPVVNAVGE
       .: :... ..  . .  .:.. .:::::.::  .. . .::.:::..::::: ::.  ..
NP_001 FPPIQSIHVSQDERECTMDLSEFMNPSPYTVPQEASLPRVFKLFRALGLRHLVVVDNRNQ
       720       730       740       750       760       770       

           850       860           
pF1KSD IVGIITRHNLTYEFLQARLRQHYQTI  
       .::..::..:.   :  :          
NP_001 VVGLVTRKDLARYRLGKRGLEELSLAQT
       780       790       800     

>>NP_000074 (OMIM: 118425,160800,255700) chloride channe  (988 aa)
 initn: 494 init1: 187 opt: 357  Z-score: 413.8  bits: 87.9 E(85289): 2.6e-16
Smith-Waterman score: 645; 24.6% identity (54.6% similar) in 897 aa overlap (19-868:51-876)

                           10        20        30             40   
pF1KSD             MAGCRGSLCCCCRWCCCCGERETRTPEELTILGETQE-----EEDEIL
                                     : :..  : .  : :. .:     :.:  .
NP_000 QYQYMPFEHCTSYGLPSENGGLQHRLRKDAGPRHNVHPTQ--IYGHHKEQFSDREQDIGM
               30        40        50        60          70        

            50        60        70           80        90       100
pF1KSD PRKDYESLDYDRCINDPYLEVLETMDNKKG---RRYEAVKWMVVFAIGVCTGLVGLFVDF
       :.:   :   :   .: : .  . . .. :   ::  .  :. .  .:.  .::.  .:.
NP_000 PKKTGSSSTVDSKDEDHYSKCQDCI-HRLGQVVRRKLGEDWIFLVLLGLLMALVSWSMDY
       80        90       100        110       120       130       

               110       120       130       140        150        
pF1KSD F-VRLFTQLKFGVVQTSVEECSQKGCLALSLLELLGFNLTFVFLASLLV-LIEPVAAGSG
         .. .   :.. .:       ..  : :..:  . : :.......:.  :: : :.:::
NP_000 VSAKSLQAYKWSYAQ-------MQPSLPLQFLVWVTFPLVLILFSALFCHLISPQAVGSG
       140       150              160       170       180       190

      160       170       180       190       200       210        
pF1KSD IPEVKCYLNGVKVPGIVRLRTLLCKVLGVLFSVAGGLFVGKEGPMIHSGSVVGAGLPQFQ
       :::.:  : :: .   . ..... ::...  ....:. ::::::..: .:. .: : .:.
NP_000 IPEMKTILRGVVLKEYLTMKAFVAKVVALTAGLGSGIPVGKEGPFVHIASICAAVLSKFM
              200       210       220       230       240       250

      220       230       240       250       260       270        
pF1KSD SISLRKIQFNFPYFRSDRDKRDFVSAGAAAGVAAAFGAPIGGTLFSLEEGSSFWNQGLTW
       :.      .. ::. ::     ....: :.::.  ::.:.::.:::.:  :...     :
NP_000 SVFCGV--YEQPYYYSD-----ILTVGCAVGVGCCFGTPLGGVLFSIEVTSTYFAVRNYW
                260            270       280       290       300   

      280       290       300       310       320        330       
pF1KSD KVLFCSMSATFTLNFFRSGIQFGSWGSFQLPGLLNFGEFKCS-DSDKKCHLWTAMDLGFF
       . .:   .:::.   ::    .. :..    ..   . :. .   :    :    .:  :
NP_000 RGFF---AATFSAFVFRV---LAVWNK---DAVTITALFRTNFRMDFPFDL---KELPAF
              310          320          330       340          350 

       340       350       360       370       380       390       
pF1KSD VVMGVIGGLLGATFNCLNKRLAKYRMRNVHPKPKLVRVLESLLVSLVTTVVVFV-ASMVL
       ...:.  :::::.:  :....    : .:. .  : . : .  . :   .:.:: ::...
NP_000 AAIGICCGLLGAVFVYLHRQV----MLGVRKHKALSQFLAKHRL-LYPGIVTFVIASFTF
             360       370           380       390        400      

        400        410       420       430       440       450     
pF1KSD GECR-QMSSSSQIGNDSFQLQVTEDVNSSIKTFFCPNDTYNDMATLFFNPQESAILQLFH
            :. ..  .  ..  ...  : :. .:    :..    .......:. .... .: 
NP_000 PPGMGQFMAGELMPREA--ISTLFDNNTWVKHAGDPESL--GQSAVWIHPRVNVVIIIF-
        410       420         430       440         450       460  

         460       470       480       490       500       510     
pF1KSD QDGTFSPVTLALFFVLYFLLACWTYGISVPSGLFVPSLLCGAAFGRLVANVLKSYIGLG-
                  ::::. : ..  .  . .: : :.: .. ::::::::....   .  : 
NP_000 -----------LFFVMKFWMSIVATTMPIPCGGFMPVFVLGAAFGRLVGEIMAMLFPDGI
                        470       480       490       500       510

                 520       530       540       550       560       
pF1KSD -------HIYSGTFALIGAAAFLGGVVRMTISLTVILIESTNEITYGLPIMVTLMVAKWT
              .:  : .:.::::: : :.:  :.: .:: .: :..:.. ::.::....:. .
NP_000 LFDDIIYKILPGGYAVIGAAA-LTGAVSHTVSTAVICFELTGQIAHILPMMVAVILANMV
              520       530        540       550       560         

       570       580          590       600       610       620    
pF1KSD GDFFNKGIYDIHVGLRGVPLLE---WETEVEMDKLRASDIMEPNLTYVYPHTRIQSLVSI
       .. .. ..::  . .. .: :    :. ..    . . :::  .. .:        : ..
NP_000 AQSLQPSLYDSIIQVKKLPYLPDLGWN-QLSKYTIFVEDIMVRDVKFVSASYTYGELRTL
     570       580       590        600       610       620        

          630                 640       650            660         
pF1KSD LRTTVHHAFPVV----------TENRGNEKEFMKGN-----QLISNNIKFKKSSILTRAG
       :.::. ...:.:          . .:.. . ... .     .: . .   .: : :   :
NP_000 LQTTTVKTLPLVDSKDSMILLGSVERSELQALLQRHLCPERRLRAAQEMARKLSELPYDG
      630       640       650       660       670       680        

     670       680       690       700        710       720        
pF1KSD EQRKRSQSMKSYPSSELRNMCDEHIASEEPAEKEDLL-QQMLERRYTPYPNLYPDQSPSE
       . :  .... . : ..      : .:  .  : :::  .. :    . .:.     :: :
NP_000 KARLAGEGLPGAPPGR-----PESFAFVDEDEDEDLSGKSELPPSLALHPSTTAPLSPEE
      690       700            710       720       730       740   

             730       740       750       760       770       780 
pF1KSD D-------WTMEERFRPLTFHGLILRSQLVTLLVRGVCYSESQSSASQPRLSYAEMAEDY
                 . :  .:   .  :..: :  :: :.     ......:   . .    : 
NP_000 PNGPLPGHKQQPEAPEPAGQRPSIFQSLLHCLLGRA---RPTKKKTTQDSTDLV----DN
           750       760       770          780       790          

             790       800       810       820       830       840 
pF1KSD PRYPDIHDLDLTLLNPRMIVDVTPYMNPSPFTVSPNTHVSQVFNLFRTMGLRHLPVVNAV
           .:.  .   :.  .  : .  .. ::: .  .: . .. .::  .:: ::  :...
NP_000 MSPEEIEAWEQEQLSQPVCFD-SCCIDQSPFQLVEQTTLHKTHTLFSLLGL-HLAYVTSM
        800       810        820       830       840        850    

             850       860                                         
pF1KSD GEIVGIITRHNLTYEFLQARLRQHYQTI                                
       :.. :.     :. : ::  .. : ..                                 
NP_000 GKLRGV-----LALEELQKAIEGHTKSGVQLRPPLASFRNTTSTRKSTGAPPSSAENWNL
          860            870       880       890       900         

>>XP_011510703 (OMIM: 600570,607628,615651) PREDICTED: c  (835 aa)
 initn: 348 init1: 175 opt: 305  Z-score: 353.6  bits: 76.5 E(85289): 5.8e-13
Smith-Waterman score: 569; 25.2% identity (57.3% similar) in 634 aa overlap (81-692:91-663)

               60        70        80        90       100       110
pF1KSD LDYDRCINDPYLEVLETMDNKKGRRYEAVKWMVVFAIGVCTGLVGLFVDFFVRLFTQLKF
                                     :. .  .:.  .::.  .:. .    :   
XP_011 LLEYGRSRCARCRVCSVRCHKFLVSRVGEDWIFLVLLGLLMALVSWVMDYAIAACLQ---
               70        80        90       100       110          

              120       130       140        150       160         
pF1KSD GVVQTSVEECSQKGCLALSLLELLGFNLTFV-FLASLLVLIEPVAAGSGIPEVKCYLNGV
         .:  . .  . . : :. :  . . .... : :..  .. : :.::::::.:  : ::
XP_011 --AQQWMSRGLNTSIL-LQYLAWVTYPVVLITFSAGFTQILAPQAVGSGIPEMKTILRGV
         120       130        140       150       160       170    

     170       180       190       200       210       220         
pF1KSD KVPGIVRLRTLLCKVLGVLFSVAGGLFVGKEGPMIHSGSVVGAGLPQFQSISLRKIQFNF
        .   . :.:.. ::.:.  ....:. .:::::..: .:. .: : .: :.      :. 
XP_011 VLKEYLTLKTFIAKVIGLTCALGSGMPLGKEGPFVHIASMCAALLSKFLSL------FGG
          180       190       200       210       220              

     230       240       250       260       270       280         
pF1KSD PYFRSDRDKRDFVSAGAAAGVAAAFGAPIGGTLFSLEEGSSFWNQGLTWKVLFCSMSATF
        :   .:.  ....:. :.::.  :.:::::.:::.:  :.:.     :. .:   .:::
XP_011 IYENESRNT-EMLAAACAVGVGCCFAAPIGGVLFSIEVTSTFFAVRNYWRGFF---AATF
      230        240       250       260       270       280       

     290       300       310        320       330       340        
pF1KSD TLNFFRSGIQFGSWGSFQLPGLLNFG-EFKCSDSDKKCHLWTAMDLGFFVVMGVIGGLLG
       .  .::    .. :.  .      :  .:.    :    :   ..:  :.:.:. .:. :
XP_011 SAFIFRV---LAVWNRDEETITALFKTRFRL---DFPFDL---QELPAFAVIGIASGFGG
          290          300       310             320       330     

      350       360       370          380       390          400  
pF1KSD ATFNCLNKRLAKYRMRNVHPKPKLV---RVLESLLVSLVTTVVVF---VASMVLGECRQM
       : :  ::.....  ::. .   ...   :.:   ::.:. ....:    .... :.  : 
XP_011 ALFVYLNRKIVQV-MRKQKTINRFLMRKRLLFPALVTLLISTLTFPPGFGQFMAGQLSQK
         340        350       360       370       380       390    

            410       420       430       440       450       460  
pF1KSD SSSSQIGNDSFQLQVTEDVNSSIKTFFCPNDTYNDMATLFFNPQESAILQLFHQDGTFSP
        .   . ..         : ...   . : .:     .  .:: .. ..           
XP_011 ETLVTLFDNRTW------VRQGLVEELEPPST-----SQAWNPPRANVF-----------
          400             410       420            430             

            470       480       490       500       510            
pF1KSD VTLALFFVLYFLLACWTYGISVPSGLFVPSLLCGAAFGRLVANVLKSYIGLG-H------
       .::..:... : ..  .  : :: : :.: .. ::::::::.. . ...  : :      
XP_011 LTLVIFILMKFWMSALATTIPVPCGAFMPVFVIGAAFGRLVGESMAAWFPDGIHTDSSTY
            440       450       460       470       480       490  

          520       530       540       550       560       570    
pF1KSD -IYSGTFALIGAAAFLGGVVRMTISLTVILIESTNEITYGLPIMVTLMVAKWTGDFFNKG
        :  : .:..:::: :.:.:  :.: .::..: :..:.. ::.:.....:. ... .. .
XP_011 RIVPGGYAVVGAAA-LAGAVTHTVSTAVIVFELTGQIAHILPVMIAVILANAVAQSLQPS
            500        510       520       530       540       550 

          580          590       600       610       620       630 
pF1KSD IYDIHVGLRGVPLLE---WETEVEMDKLRASDIMEPNLTYVYPHTRIQSLVSILRTTVHH
       .::  . .. .: :    :  . .. ..:. :::  ..    ::. ..     :: ..:.
XP_011 LYDSIIRIKKLPYLPELGWGRHQQY-RVRVEDIMVRDV----PHVALSCTFRDLRLALHR
             560       570        580           590       600      

             640       650       660       670          680        
pF1KSD AFPVVTENRGNEKEFMKGNQLISNNIKFKKSSILTRAGEQ---RKRSQSMKSYPSSELRN
       .       .:    .... . .    ....:....  : :    .: : :.   ...   
XP_011 T-------KGRMLALVESPESMILLGSIERSQVVALLGAQLSPARRRQHMQERRATQTSP
               610       620       630       640       650         

      690       700       710       720       730       740        
pF1KSD MCDEHIASEEPAEKEDLLQQMLERRYTPYPNLYPDQSPSEDWTMEERFRPLTFHGLILRS
       . :.                                                        
XP_011 LSDQEGPPTPEASVCFQVNTEDSAFPAARGETHKPLKPALKRGPSVTRNLGESPTGSAES
     660       670       680       690       700       710         

>>XP_006713552 (OMIM: 600570,607628,615651) PREDICTED: c  (863 aa)
 initn: 348 init1: 175 opt: 305  Z-score: 353.5  bits: 76.5 E(85289): 6e-13
Smith-Waterman score: 570; 23.8% identity (54.6% similar) in 795 aa overlap (81-853:91-800)

               60        70        80        90       100       110
pF1KSD LDYDRCINDPYLEVLETMDNKKGRRYEAVKWMVVFAIGVCTGLVGLFVDFFVRLFTQLKF
                                     :. .  .:.  .::.  .:. .    :   
XP_006 LLEYGRSRCARCRVCSVRCHKFLVSRVGEDWIFLVLLGLLMALVSWVMDYAIAACLQ---
               70        80        90       100       110          

              120       130       140        150       160         
pF1KSD GVVQTSVEECSQKGCLALSLLELLGFNLTFV-FLASLLVLIEPVAAGSGIPEVKCYLNGV
         .:  . .  . . : :. :  . . .... : :..  .. : :.::::::.:  : ::
XP_006 --AQQWMSRGLNTSIL-LQYLAWVTYPVVLITFSAGFTQILAPQAVGSGIPEMKTILRGV
         120       130        140       150       160       170    

     170       180       190       200       210       220         
pF1KSD KVPGIVRLRTLLCKVLGVLFSVAGGLFVGKEGPMIHSGSVVGAGLPQFQSISLRKIQFNF
        .   . :.:.. ::.:.  ....:. .:::::..: .:. .: : .: :.      :. 
XP_006 VLKEYLTLKTFIAKVIGLTCALGSGMPLGKEGPFVHIASMCAALLSKFLSL------FGG
          180       190       200       210       220              

     230       240       250       260       270       280         
pF1KSD PYFRSDRDKRDFVSAGAAAGVAAAFGAPIGGTLFSLEEGSSFWNQGLTWKVLFCSMSATF
        :   .:.  ....:. :.::.  :.:::::.:::.:  :.:.     :. .:   .:::
XP_006 IYENESRNT-EMLAAACAVGVGCCFAAPIGGVLFSIEVTSTFFAVRNYWRGFF---AATF
      230        240       250       260       270       280       

     290       300       310        320       330       340        
pF1KSD TLNFFRSGIQFGSWGSFQLPGLLNFG-EFKCSDSDKKCHLWTAMDLGFFVVMGVIGGLLG
       .  .::    .. :.  .      :  .:.    :    :   ..:  :.:.:. .:. :
XP_006 SAFIFRV---LAVWNRDEETITALFKTRFRL---DFPFDL---QELPAFAVIGIASGFGG
          290          300       310             320       330     

      350       360       370          380       390          400  
pF1KSD ATFNCLNKRLAKYRMRNVHPKPKLV---RVLESLLVSLVTTVVVF---VASMVLGECRQM
       : :  ::.....  ::. .   ...   :.:   ::.:. ....:    .... :.  : 
XP_006 ALFVYLNRKIVQV-MRKQKTINRFLMRKRLLFPALVTLLISTLTFPPGFGQFMAGQLSQK
         340        350       360       370       380       390    

            410       420       430       440       450       460  
pF1KSD SSSSQIGNDSFQLQVTEDVNSSIKTFFCPNDTYNDMATLFFNPQESAILQLFHQDGTFSP
        .   . ..  .  : . .   ..    : .:     .  .:: .. ..           
XP_006 ETLVTLFDN--RTWVRQGLVEELE----PPST-----SQAWNPPRANVF-----------
          400         410           420            430             

            470       480       490       500       510            
pF1KSD VTLALFFVLYFLLACWTYGISVPSGLFVPSLLCGAAFGRLVANVLKSYIGLG-H------
       .::..:... : ..  .  : :: : :.: .. ::::::::.. . ...  : :      
XP_006 LTLVIFILMKFWMSALATTIPVPCGAFMPVFVIGAAFGRLVGESMAAWFPDGIHTDSSTY
            440       450       460       470       480       490  

          520       530       540       550       560       570    
pF1KSD -IYSGTFALIGAAAFLGGVVRMTISLTVILIESTNEITYGLPIMVTLMVAKWTGDFFNKG
        :  : .:..:::: :.:.:  :.: .::..: :..:.. ::.:.....:. ... .. .
XP_006 RIVPGGYAVVGAAA-LAGAVTHTVSTAVIVFELTGQIAHILPVMIAVILANAVAQSLQPS
            500        510       520       530       540       550 

          580          590       600       610       620       630 
pF1KSD IYDIHVGLRGVPLLE---WETEVEMDKLRASDIMEPNLTYVYPHTRIQSLVSILRTTVHH
       .::  . .. .: :    :  . .. ..:. :::  ..    ::. ..     :: ..:.
XP_006 LYDSIIRIKKLPYLPELGWGRH-QQYRVRVEDIMVRDV----PHVALSCTFRDLRLALHR
             560       570        580           590       600      

             640       650       660       670          680        
pF1KSD AFPVVTENRGNEKEFMKGNQLISNNIKFKKSSILTRAGEQ---RKRSQSMKSYPSSELRN
       .       .:    .... . .    ....:....  : :    .: : :.   ...   
XP_006 T-------KGRMLALVESPESMILLGSIERSQVVALLGAQLSPARRRQHMQERRATQTSP
               610       620       630       640       650         

      690       700       710       720       730       740        
pF1KSD MCDEHIASEEPAEKEDLLQQMLERRYTPYPNLYPDQSPSEDWTMEERFRPLTFHGLILRS
       . :.    : :   :  .  ... . . .:            .  :  .::  .  . :.
XP_006 LSDQ----EGPPTPEASVCFQVNTEDSAFPA-----------ARGETHKPL--KPALKRG
     660           670       680                  690         700  

      750       760       770       780       790       800        
pF1KSD QLVTLLVRGVCYSESQSSASQPRLSYAEMAEDYPRYPDIHDLDLTLLNPRMIVDVTPYMN
         ::   :..  : . :. :      . .  . :  :.  .  :   . : .  :   . 
XP_006 PSVT---RNLGESPTGSAESAGIALRSLFCGSPP--PEAASEKLESCEKRKLKRVRISLA
               710       720       730         740       750       

      810       820       830       840       850       860        
pF1KSD PSPFTVSPNTHVSQVFNLFRTMGLRHLPVVNAVGEIVGIITRHNLTYEFLQARLRQHYQT
        :   .  .    .. ..:  .:. :   :...:...::.: ..:               
XP_006 -SDADLEGEMSPEETHTIFSLLGVDH-AYVTSIGRLIGIVTLKELRKAIEGSVTAQGVKV
        760       770       780        790       800       810     

                                                       
pF1KSD I                                               
                                                       
XP_006 RPPLASFRDSATSSSDTETTEVHALWGPHSRHGLPREGSPSDSDDKCQ
         820       830       840       850       860   

>>NP_001164560 (OMIM: 600570,607628,615651) chloride cha  (869 aa)
 initn: 348 init1: 175 opt: 305  Z-score: 353.4  bits: 76.5 E(85289): 6e-13
Smith-Waterman score: 569; 25.2% identity (57.3% similar) in 634 aa overlap (81-692:91-663)

               60        70        80        90       100       110
pF1KSD LDYDRCINDPYLEVLETMDNKKGRRYEAVKWMVVFAIGVCTGLVGLFVDFFVRLFTQLKF
                                     :. .  .:.  .::.  .:. .    :   
NP_001 LLEYGRSRCARCRVCSVRCHKFLVSRVGEDWIFLVLLGLLMALVSWVMDYAIAACLQ---
               70        80        90       100       110          

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pF1KSD GVVQTSVEECSQKGCLALSLLELLGFNLTFV-FLASLLVLIEPVAAGSGIPEVKCYLNGV
         .:  . .  . . : :. :  . . .... : :..  .. : :.::::::.:  : ::
NP_001 --AQQWMSRGLNTSIL-LQYLAWVTYPVVLITFSAGFTQILAPQAVGSGIPEMKTILRGV
         120       130        140       150       160       170    

     170       180       190       200       210       220         
pF1KSD KVPGIVRLRTLLCKVLGVLFSVAGGLFVGKEGPMIHSGSVVGAGLPQFQSISLRKIQFNF
        .   . :.:.. ::.:.  ....:. .:::::..: .:. .: : .: :.      :. 
NP_001 VLKEYLTLKTFIAKVIGLTCALGSGMPLGKEGPFVHIASMCAALLSKFLSL------FGG
          180       190       200       210       220              

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pF1KSD PYFRSDRDKRDFVSAGAAAGVAAAFGAPIGGTLFSLEEGSSFWNQGLTWKVLFCSMSATF
        :   .:.  ....:. :.::.  :.:::::.:::.:  :.:.     :. .:   .:::
NP_001 IYENESRNT-EMLAAACAVGVGCCFAAPIGGVLFSIEVTSTFFAVRNYWRGFF---AATF
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pF1KSD TLNFFRSGIQFGSWGSFQLPGLLNFG-EFKCSDSDKKCHLWTAMDLGFFVVMGVIGGLLG
       .  .::    .. :.  .      :  .:.    :    :   ..:  :.:.:. .:. :
NP_001 SAFIFRV---LAVWNRDEETITALFKTRFRL---DFPFDL---QELPAFAVIGIASGFGG
          290          300       310             320       330     

      350       360       370          380       390          400  
pF1KSD ATFNCLNKRLAKYRMRNVHPKPKLV---RVLESLLVSLVTTVVVF---VASMVLGECRQM
       : :  ::.....  ::. .   ...   :.:   ::.:. ....:    .... :.  : 
NP_001 ALFVYLNRKIVQV-MRKQKTINRFLMRKRLLFPALVTLLISTLTFPPGFGQFMAGQLSQK
         340        350       360       370       380       390    

            410       420       430       440       450       460  
pF1KSD SSSSQIGNDSFQLQVTEDVNSSIKTFFCPNDTYNDMATLFFNPQESAILQLFHQDGTFSP
        .   . ..         : ...   . : .:     .  .:: .. ..           
NP_001 ETLVTLFDNRTW------VRQGLVEELEPPST-----SQAWNPPRANVF-----------
          400             410       420            430             

            470       480       490       500       510            
pF1KSD VTLALFFVLYFLLACWTYGISVPSGLFVPSLLCGAAFGRLVANVLKSYIGLG-H------
       .::..:... : ..  .  : :: : :.: .. ::::::::.. . ...  : :      
NP_001 LTLVIFILMKFWMSALATTIPVPCGAFMPVFVIGAAFGRLVGESMAAWFPDGIHTDSSTY
            440       450       460       470       480       490  

          520       530       540       550       560       570    
pF1KSD -IYSGTFALIGAAAFLGGVVRMTISLTVILIESTNEITYGLPIMVTLMVAKWTGDFFNKG
        :  : .:..:::: :.:.:  :.: .::..: :..:.. ::.:.....:. ... .. .
NP_001 RIVPGGYAVVGAAA-LAGAVTHTVSTAVIVFELTGQIAHILPVMIAVILANAVAQSLQPS
            500        510       520       530       540       550 

          580          590       600       610       620       630 
pF1KSD IYDIHVGLRGVPLLE---WETEVEMDKLRASDIMEPNLTYVYPHTRIQSLVSILRTTVHH
       .::  . .. .: :    :  . .. ..:. :::  ..    ::. ..     :: ..:.
NP_001 LYDSIIRIKKLPYLPELGWGRHQQY-RVRVEDIMVRDV----PHVALSCTFRDLRLALHR
             560       570        580           590       600      

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pF1KSD AFPVVTENRGNEKEFMKGNQLISNNIKFKKSSILTRAGEQ---RKRSQSMKSYPSSELRN
       .       .:    .... . .    ....:....  : :    .: : :.   ...   
NP_001 T-------KGRMLALVESPESMILLGSIERSQVVALLGAQLSPARRRQHMQERRATQTSP
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      690       700       710       720       730       740        
pF1KSD MCDEHIASEEPAEKEDLLQQMLERRYTPYPNLYPDQSPSEDWTMEERFRPLTFHGLILRS
       . :.                                                        
NP_001 LSDQEGPPTPEASVCFQVNTEDSAFPAARGETHKPLKPALKRGPSVTRNLGESPTGSAES
     660       670       680       690       700       710         

>>NP_001164558 (OMIM: 600570,607628,615651) chloride cha  (881 aa)
 initn: 338 init1: 175 opt: 305  Z-score: 353.3  bits: 76.5 E(85289): 6.1e-13
Smith-Waterman score: 552; 23.3% identity (53.5% similar) in 811 aa overlap (81-853:91-818)

               60        70        80        90       100       110
pF1KSD LDYDRCINDPYLEVLETMDNKKGRRYEAVKWMVVFAIGVCTGLVGLFVDFFVRLFTQLKF
                                     :. .  .:.  .::.  .:. .    :   
NP_001 LLEYGRSRCARCRVCSVRCHKFLVSRVGEDWIFLVLLGLLMALVSWVMDYAIAACLQ---
               70        80        90       100       110          

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pF1KSD GVVQTSVEECSQKGCLALSLLELLGFNLTFV-FLASLLVLIEPVAAGSGIPEVKCYLNGV
         .:  . .  . . : :. :  . . .... : :..  .. : :.::::::.:  : ::
NP_001 --AQQWMSRGLNTSIL-LQYLAWVTYPVVLITFSAGFTQILAPQAVGSGIPEMKTILRGV
         120       130        140       150       160       170    

     170       180       190       200       210       220         
pF1KSD KVPGIVRLRTLLCKVLGVLFSVAGGLFVGKEGPMIHSGSVVGAGLPQFQSISLRKIQFNF
        .   . :.:.. ::.:.  ....:. .:::::..: .:. .: : .: :.      :. 
NP_001 VLKEYLTLKTFIAKVIGLTCALGSGMPLGKEGPFVHIASMCAALLSKFLSL------FGG
          180       190       200       210       220              

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pF1KSD PYFRSDRDKRDFVSAGAAAGVAAAFGAPIGGTLFSLEEGSSFWNQGLTWKVLFCSMSATF
        :   .:.  ....:. :.::.  :.:::::.:::.:  :.:.     :. .:   .:::
NP_001 IYENESRNT-EMLAAACAVGVGCCFAAPIGGVLFSIEVTSTFFAVRNYWRGFF---AATF
      230        240       250       260       270       280       

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pF1KSD TLNFFRSGIQFGSWGSFQLPGLLNFG-EFKCSDSDKKCHLWTAMDLGFFVVMGVIGGLLG
       .  .::    .. :.  .      :  .:.    :    :   ..:  :.:.:. .:. :
NP_001 SAFIFRV---LAVWNRDEETITALFKTRFRL---DFPFDL---QELPAFAVIGIASGFGG
          290          300       310             320       330     

      350       360       370          380       390          400  
pF1KSD ATFNCLNKRLAKYRMRNVHPKPKLV---RVLESLLVSLVTTVVVF---VASMVLGECRQM
       : :  ::.....  ::. .   ...   :.:   ::.:. ....:    .... :.  : 
NP_001 ALFVYLNRKIVQV-MRKQKTINRFLMRKRLLFPALVTLLISTLTFPPGFGQFMAGQLSQK
         340        350       360       370       380       390    

            410       420       430       440       450       460  
pF1KSD SSSSQIGNDSFQLQVTEDVNSSIKTFFCPNDTYNDMATLFFNPQESAILQLFHQDGTFSP
        .   . ..  .  : . .   ..    : .:     .  .:: .. ..           
NP_001 ETLVTLFDN--RTWVRQGLVEELE----PPST-----SQAWNPPRANVF-----------
          400         410           420            430             

            470       480       490       500       510       520  
pF1KSD VTLALFFVLYFLLACWTYGISVPSGLFVPSLLCGAAFGRLVANVLKSYIGLGHIYSGTFA
       .::..:... : ..  .  : :: : :.: .         : . ...  .  .:  : .:
NP_001 LTLVIFILMKFWMSALATTIPVPCGAFMPVF---------VIDGIHTDSSTYRIVPGGYA
            440       450       460                470       480   

            530       540       550       560       570       580  
pF1KSD LIGAAAFLGGVVRMTISLTVILIESTNEITYGLPIMVTLMVAKWTGDFFNKGIYDIHVGL
       ..:::: :.:.:  :.: .::..: :..:.. ::.:.....:. ... .. ..::  . .
NP_001 VVGAAA-LAGAVTHTVSTAVIVFELTGQIAHILPVMIAVILANAVAQSLQPSLYDSIIRI
            490       500       510       520       530       540  

               590       600       610       620       630         
pF1KSD RGVPLLE---WETEVEMDKLRASDIMEPNLTYVYPHTRIQSLVSILRTTVHHAFPVVTEN
       . .: :    :  . .. ..:. :::  ..    ::. ..     :: ..:..       
NP_001 KKLPYLPELGWGRH-QQYRVRVEDIMVRDV----PHVALSCTFRDLRLALHRT-------
            550        560       570           580       590       

     640       650       660       670          680       690      
pF1KSD RGNEKEFMKGNQLISNNIKFKKSSILTRAGEQ---RKRSQSMKSYPSSELRNMCDEHIAS
       .:    .... . .    ....:....  : :    .: : :.   ...   . :.    
NP_001 KGRMLALVESPESMILLGSIERSQVVALLGAQLSPARRRQHMQERRATQTSPLSDQ----
              600       610       620       630       640          

        700       710               720         730       740      
pF1KSD EEPAEKEDLLQQMLERRYTPYPN--------LYP--DQSPSEDWTMEERFRPLTFH-GLI
       : :   :  .  ... . . .:         : :   ..::   .. :     .   :. 
NP_001 EGPPTPEASVCFQVNTEDSAFPAARGETHKPLKPALKRGPSVTRNLGESPTGSAESAGIA
        650       660       670       680       690       700      

         750       760       770       780       790        800    
pF1KSD LRSQLVTLLVRGVCYSESQSSASQPRLSYAEMAEDYPRYPDIHDLDLT-LLNPRMIVDVT
       ::: .        : :    .::.   :  .      :     : ::   ..:. :..  
NP_001 LRSLF--------CGSPPPEAASEKLESCEKRKLKRVRISLASDADLEGEMSPEEILEWE
        710               720       730       740       750        

                      810       820       830       840       850  
pF1KSD ------PY------MNPSPFTVSPNTHVSQVFNLFRTMGLRHLPVVNAVGEIVGIITRHN
             :       ..:.:: .   : . .. ..:  .:. :   :...:...::.: ..
NP_001 EQQLDEPVNFSDCKIDPAPFQLVERTSLHKTHTIFSLLGVDH-AYVTSIGRLIGIVTLKE
      760       770       780       790       800        810       

            860                                                    
pF1KSD LTYEFLQARLRQHYQTI                                           
       :                                                           
NP_001 LRKAIEGSVTAQGVKVRPPLASFRDSATSSSDTETTEVHALWGPHSRHGLPREGSPSDSD
       820       830       840       850       860       870       




869 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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