Result of FASTA (ccds) for pF1KSDA0046
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA0046, 869 aa
  1>>>pF1KSDA0046 869 - 869 aa - 869 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0203+/-0.00106; mu= 22.9368+/- 0.064
 mean_var=76.5291+/-15.140, 0's: 0 Z-trim(104.7): 35  B-trim: 0 in 0/48
 Lambda= 0.146609
 statistics sampled from 7995 (8024) to 7995 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.605), E-opt: 0.2 (0.246), width:  16
 Scan time:  3.990

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS138.1 CLCN6 gene_id:1185|Hs108|chr1            ( 869) 5804 1238.0       0
CCDS57972.1 CLCN6 gene_id:1185|Hs108|chr1          ( 847) 5287 1128.6       0
CCDS45378.1 CLCN7 gene_id:1186|Hs108|chr16         ( 781) 1146 252.7 1.9e-66
CCDS32361.1 CLCN7 gene_id:1186|Hs108|chr16         ( 805) 1146 252.7 1.9e-66
CCDS5881.1 CLCN1 gene_id:1180|Hs108|chr7           ( 988)  339 82.1 5.4e-15
CCDS54692.1 CLCN2 gene_id:1181|Hs108|chr3          ( 869)  305 74.9 7.2e-13
CCDS54691.1 CLCN2 gene_id:1181|Hs108|chr3          ( 881)  305 74.9 7.3e-13
CCDS3263.1 CLCN2 gene_id:1181|Hs108|chr3           ( 898)  305 74.9 7.4e-13
CCDS54690.1 CLCN2 gene_id:1181|Hs108|chr3          ( 854)  296 72.9 2.7e-12


>>CCDS138.1 CLCN6 gene_id:1185|Hs108|chr1                 (869 aa)
 initn: 5804 init1: 5804 opt: 5804  Z-score: 6630.5  bits: 1238.0 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5804; 99.9% identity (99.9% similar) in 869 aa overlap (1-869:1-869)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MAGCRGSLCCCCRWCCCCGERETRTPEELTILGETQEEEDEILPRKDYESLDYDRCINDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MAGCRGSLCCCCRWCCCCGERETRTPEELTILGETQEEEDEILPRKDYESLDYDRCINDP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD YLEVLETMDNKKGRRYEAVKWMVVFAIGVCTGLVGLFVDFFVRLFTQLKFGVVQTSVEEC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YLEVLETMDNKKGRRYEAVKWMVVFAIGVCTGLVGLFVDFFVRLFTQLKFGVVQTSVEEC
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD SQKGCLALSLLELLGFNLTFVFLASLLVLIEPVAAGSGIPEVKCYLNGVKVPGIVRLRTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SQKGCLALSLLELLGFNLTFVFLASLLVLIEPVAAGSGIPEVKCYLNGVKVPGIVRLRTL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD LCKVLGVLFSVAGGLFVGKEGPMIHSGSVVGAGLPQFQSISLRKIQFNFPYFRSDRDKRD
       ::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LCKVLGVLFSVAGGLFVEKEGPMIHSGSVVGAGLPQFQSISLRKIQFNFPYFRSDRDKRD
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD FVSAGAAAGVAAAFGAPIGGTLFSLEEGSSFWNQGLTWKVLFCSMSATFTLNFFRSGIQF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 FVSAGAAAGVAAAFGAPIGGTLFSLEEGSSFWNQGLTWKVLFCSMSATFTLNFFRSGIQF
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD GSWGSFQLPGLLNFGEFKCSDSDKKCHLWTAMDLGFFVVMGVIGGLLGATFNCLNKRLAK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GSWGSFQLPGLLNFGEFKCSDSDKKCHLWTAMDLGFFVVMGVIGGLLGATFNCLNKRLAK
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD YRMRNVHPKPKLVRVLESLLVSLVTTVVVFVASMVLGECRQMSSSSQIGNDSFQLQVTED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YRMRNVHPKPKLVRVLESLLVSLVTTVVVFVASMVLGECRQMSSSSQIGNDSFQLQVTED
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD VNSSIKTFFCPNDTYNDMATLFFNPQESAILQLFHQDGTFSPVTLALFFVLYFLLACWTY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VNSSIKTFFCPNDTYNDMATLFFNPQESAILQLFHQDGTFSPVTLALFFVLYFLLACWTY
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD GISVPSGLFVPSLLCGAAFGRLVANVLKSYIGLGHIYSGTFALIGAAAFLGGVVRMTISL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GISVPSGLFVPSLLCGAAFGRLVANVLKSYIGLGHIYSGTFALIGAAAFLGGVVRMTISL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD TVILIESTNEITYGLPIMVTLMVAKWTGDFFNKGIYDIHVGLRGVPLLEWETEVEMDKLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TVILIESTNEITYGLPIMVTLMVAKWTGDFFNKGIYDIHVGLRGVPLLEWETEVEMDKLR
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD ASDIMEPNLTYVYPHTRIQSLVSILRTTVHHAFPVVTENRGNEKEFMKGNQLISNNIKFK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ASDIMEPNLTYVYPHTRIQSLVSILRTTVHHAFPVVTENRGNEKEFMKGNQLISNNIKFK
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD KSSILTRAGEQRKRSQSMKSYPSSELRNMCDEHIASEEPAEKEDLLQQMLERRYTPYPNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KSSILTRAGEQRKRSQSMKSYPSSELRNMCDEHIASEEPAEKEDLLQQMLERRYTPYPNL
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD YPDQSPSEDWTMEERFRPLTFHGLILRSQLVTLLVRGVCYSESQSSASQPRLSYAEMAED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YPDQSPSEDWTMEERFRPLTFHGLILRSQLVTLLVRGVCYSESQSSASQPRLSYAEMAED
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD YPRYPDIHDLDLTLLNPRMIVDVTPYMNPSPFTVSPNTHVSQVFNLFRTMGLRHLPVVNA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YPRYPDIHDLDLTLLNPRMIVDVTPYMNPSPFTVSPNTHVSQVFNLFRTMGLRHLPVVNA
              790       800       810       820       830       840

              850       860         
pF1KSD VGEIVGIITRHNLTYEFLQARLRQHYQTI
       :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VGEIVGIITRHNLTYEFLQARLRQHYQTI
              850       860         

>>CCDS57972.1 CLCN6 gene_id:1185|Hs108|chr1               (847 aa)
 initn: 5287 init1: 5287 opt: 5287  Z-score: 6039.6  bits: 1128.6 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5598; 97.4% identity (97.4% similar) in 869 aa overlap (1-869:1-847)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MAGCRGSLCCCCRWCCCCGERETRTPEELTILGETQEEEDEILPRKDYESLDYDRCINDP
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::           
CCDS57 MAGCRGSLCCCCRWCCCCGERETRTPEELTILGETQEEEDEILPRKDYE-----------
               10        20        30        40                    

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD YLEVLETMDNKKGRRYEAVKWMVVFAIGVCTGLVGLFVDFFVRLFTQLKFGVVQTSVEEC
                  :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 -----------KGRRYEAVKWMVVFAIGVCTGLVGLFVDFFVRLFTQLKFGVVQTSVEEC
                 50        60        70        80        90        

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD SQKGCLALSLLELLGFNLTFVFLASLLVLIEPVAAGSGIPEVKCYLNGVKVPGIVRLRTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 SQKGCLALSLLELLGFNLTFVFLASLLVLIEPVAAGSGIPEVKCYLNGVKVPGIVRLRTL
      100       110       120       130       140       150        

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD LCKVLGVLFSVAGGLFVGKEGPMIHSGSVVGAGLPQFQSISLRKIQFNFPYFRSDRDKRD
       ::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 LCKVLGVLFSVAGGLFVEKEGPMIHSGSVVGAGLPQFQSISLRKIQFNFPYFRSDRDKRD
      160       170       180       190       200       210        

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD FVSAGAAAGVAAAFGAPIGGTLFSLEEGSSFWNQGLTWKVLFCSMSATFTLNFFRSGIQF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 FVSAGAAAGVAAAFGAPIGGTLFSLEEGSSFWNQGLTWKVLFCSMSATFTLNFFRSGIQF
      220       230       240       250       260       270        

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD GSWGSFQLPGLLNFGEFKCSDSDKKCHLWTAMDLGFFVVMGVIGGLLGATFNCLNKRLAK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 GSWGSFQLPGLLNFGEFKCSDSDKKCHLWTAMDLGFFVVMGVIGGLLGATFNCLNKRLAK
      280       290       300       310       320       330        

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD YRMRNVHPKPKLVRVLESLLVSLVTTVVVFVASMVLGECRQMSSSSQIGNDSFQLQVTED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 YRMRNVHPKPKLVRVLESLLVSLVTTVVVFVASMVLGECRQMSSSSQIGNDSFQLQVTED
      340       350       360       370       380       390        

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD VNSSIKTFFCPNDTYNDMATLFFNPQESAILQLFHQDGTFSPVTLALFFVLYFLLACWTY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 VNSSIKTFFCPNDTYNDMATLFFNPQESAILQLFHQDGTFSPVTLALFFVLYFLLACWTY
      400       410       420       430       440       450        

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD GISVPSGLFVPSLLCGAAFGRLVANVLKSYIGLGHIYSGTFALIGAAAFLGGVVRMTISL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 GISVPSGLFVPSLLCGAAFGRLVANVLKSYIGLGHIYSGTFALIGAAAFLGGVVRMTISL
      460       470       480       490       500       510        

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD TVILIESTNEITYGLPIMVTLMVAKWTGDFFNKGIYDIHVGLRGVPLLEWETEVEMDKLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 TVILIESTNEITYGLPIMVTLMVAKWTGDFFNKGIYDIHVGLRGVPLLEWETEVEMDKLR
      520       530       540       550       560       570        

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD ASDIMEPNLTYVYPHTRIQSLVSILRTTVHHAFPVVTENRGNEKEFMKGNQLISNNIKFK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 ASDIMEPNLTYVYPHTRIQSLVSILRTTVHHAFPVVTENRGNEKEFMKGNQLISNNIKFK
      580       590       600       610       620       630        

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD KSSILTRAGEQRKRSQSMKSYPSSELRNMCDEHIASEEPAEKEDLLQQMLERRYTPYPNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 KSSILTRAGEQRKRSQSMKSYPSSELRNMCDEHIASEEPAEKEDLLQQMLERRYTPYPNL
      640       650       660       670       680       690        

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD YPDQSPSEDWTMEERFRPLTFHGLILRSQLVTLLVRGVCYSESQSSASQPRLSYAEMAED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 YPDQSPSEDWTMEERFRPLTFHGLILRSQLVTLLVRGVCYSESQSSASQPRLSYAEMAED
      700       710       720       730       740       750        

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD YPRYPDIHDLDLTLLNPRMIVDVTPYMNPSPFTVSPNTHVSQVFNLFRTMGLRHLPVVNA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 YPRYPDIHDLDLTLLNPRMIVDVTPYMNPSPFTVSPNTHVSQVFNLFRTMGLRHLPVVNA
      760       770       780       790       800       810        

              850       860         
pF1KSD VGEIVGIITRHNLTYEFLQARLRQHYQTI
       :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 VGEIVGIITRHNLTYEFLQARLRQHYQTI
      820       830       840       

>>CCDS45378.1 CLCN7 gene_id:1186|Hs108|chr16              (781 aa)
 initn: 1701 init1: 704 opt: 1146  Z-score: 1306.5  bits: 252.7 E(32554): 1.9e-66
Smith-Waterman score: 1890; 41.4% identity (65.9% similar) in 828 aa overlap (40-861:62-771)

      10        20        30        40        50        60         
pF1KSD CCCRWCCCCGERETRTPEELTILGETQEEEDEILPRKDYESLDYDRCINDPYLEVLETMD
                                     .: :    :::::::   :. .::  . ..
CCDS45 GGTPLLNGAGPGAARQDMDPPHPFPKEIPHNEKLLSLKYESLDYDNSENQLFLEEERRIN
              40        50        60        70        80        90 

      70        80        90       100       110       120         
pF1KSD NKKGRRYEAVKWMVVFAIGVCTGLVGLFVDFFVRLFTQLKFGVVQTSVEECSQKGCLALS
       .   :  :  .:..   ::. ::::. :.:. :. .. ::. :.. .... ..:: :..:
CCDS45 HTAFRTVEIKRWVICALIGILTGLVACFIDIVVENLAGLKYRVIKGNIDKFTEKGGLSFS
             100       110       120       130       140       150 

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pF1KSD LLELLGFNLTFVFLASLLV-LIEPVAAGSGIPEVKCYLNGVKVPGIVRLRTLLCKVLGVL
       ::    .: .::...:..: .:::::::::::..::.:::::.: .:::.::. :: ::.
CCDS45 LLLWATLNAAFVLVGSVIVAFIEPVAAGSGIPQIKCFLNGVKIPHVVRLKTLVIKVSGVI
             160       170       180       190       200       210 

      190       200       210       220       230       240        
pF1KSD FSVAGGLFVGKEGPMIHSGSVVGAGLPQFQSISLRKIQFNFPYFRSDRDKRDFVSAGAAA
       .::.::: :::::::::::::..::. : .: ::..    : ::: : .:::::::::::
CCDS45 LSVVGGLAVGKEGPMIHSGSVIAAGISQGRSTSLKRDFKIFEYFRRDTEKRDFVSAGAAA
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       ::.::::::.::.:::::::.::::: :::...: :: .::::::  : :  :.  ... 
CCDS45 GVSAAFGAPVGGVLFSLEEGASFWNQFLTWRIFFASMISTFTLNFVLS-IYHGNMWDLSS
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pF1KSD PGLLNFGEFKCSDSDKKCHLWTAMDLGFFVVMGVIGGLLGATFNCLNKRLAKYRMRNVHP
       :::.:::.:   ::.:  .  :  ..  :..:::.::.:::.:: ::  :. .:.: .: 
CCDS45 PGLINFGRF---DSEKMAY--TIHEIPVFIAMGVVGGVLGAVFNALNYWLTMFRIRYIH-
                 340         350       360       370       380     

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pF1KSD KPKLVRVLESLLVSLVTTVVVFVASMVLGECRQMSSSSQIGNDSFQLQVTEDVNSSIKTF
       .: : .:.:..::. ::..:.::  .   .:. .    : :. :. ::.           
CCDS45 RPCL-QVIEAVLVAAVTATVAFVLIYSSRDCQPL----QGGSMSYPLQL-----------
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pF1KSD FCPNDTYNDMATLFFNPQESAILQLFHQD-GTFSPVTLALFFVLYFLLACWTYGISVPSG
       :: .  ::.::. :::  :.....:::.  :...:.::.:: ..::.:::::::..: .:
CCDS45 FCADGEYNSMAAAFFNTPEKSVVSLFHDPPGSYNPLTLGLFTLVYFFLACWTYGLTVSAG
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pF1KSD LFVPSLLCGAAFGRLVANVLKSYIGLGHIYS--GTFALIGAAAFLGGVVRMTISLTVILI
       .:.:::: :::.::: .  : ::.  . :..  : .::.:::: :::.::::.:::::..
CCDS45 VFIPSLLIGAAWGRLFGISL-SYLTGAAIWADPGKYALMGAAAQLGGIVRMTLSLTVIMM
      490       500        510       520       530       540       

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pF1KSD ESTNEITYGLPIMVTLMVAKWTGDFFNKGIYDIHVGLRGVPLLEWETEVEMDKLRASDIM
       :.:...:::.:::..::.:: .:: : .:.::.:. :..::.:.::. :   .: : ..:
CCDS45 EATSNVTYGFPIMLVLMTAKIVGDVFIEGLYDMHIQLQSVPFLHWEAPVTSHSLTAREVM
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pF1KSD EPNLTYVYPHTRIQSLVSILRTTV--HHAFPVVTENRGNEKEFMKGNQLISNNIKFKKSS
          .: .  . ..  .:..:  :.  :..::::                           
CCDS45 STPVTCLRRREKVGVIVDVLSDTASNHNGFPVV---------------------------
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pF1KSD ILTRAGEQRKRSQSMKSYPSSELRNMCDEHIASEEPAEKEDLLQQMLERRYTPYPNLYPD
                                   ::  . .::.    ::                
CCDS45 ----------------------------EHADDTQPAR----LQ----------------
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pF1KSD QSPSEDWTMEERFRPLTFHGLILRSQLVTLLVRGVCYSESQSSASQPRLSYAEMAEDYPR
                          ::::::::..:: . :   .:. .  : ::   .. . :::
CCDS45 -------------------GLILRSQLIVLLKHKVFVERSNLGLVQRRLRLKDFRDAYPR
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pF1KSD YPDIHDLDLTLLNPRMIVDVTPYMNPSPFTVSPNTHVSQVFNLFRTMGLRHLPVVNAVGE
       .: :... ..  . .  .:.. .:::::.::  .. . .::.:::..::::: ::.  ..
CCDS45 FPPIQSIHVSQDERECTMDLSEFMNPSPYTVPQEASLPRVFKLFRALGLRHLVVVDNRNQ
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pF1KSD IVGIITRHNLTYEFLQARLRQHYQTI  
       .::..::..:.   :  :          
CCDS45 VVGLVTRKDLARYRLGKRGLEELSLAQT
           760       770       780 

>>CCDS32361.1 CLCN7 gene_id:1186|Hs108|chr16              (805 aa)
 initn: 1701 init1: 704 opt: 1146  Z-score: 1306.3  bits: 252.7 E(32554): 1.9e-66
Smith-Waterman score: 1890; 41.4% identity (65.9% similar) in 828 aa overlap (40-861:86-795)

      10        20        30        40        50        60         
pF1KSD CCCRWCCCCGERETRTPEELTILGETQEEEDEILPRKDYESLDYDRCINDPYLEVLETMD
                                     .: :    :::::::   :. .::  . ..
CCDS32 VGHMSSVELDDELLDPDMDPPHPFPKEIPHNEKLLSLKYESLDYDNSENQLFLEEERRIN
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       .   :  :  .:..   ::. ::::. :.:. :. .. ::. :.. .... ..:: :..:
CCDS32 HTAFRTVEIKRWVICALIGILTGLVACFIDIVVENLAGLKYRVIKGNIDKFTEKGGLSFS
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       ::    .: .::...:..: .:::::::::::..::.:::::.: .:::.::. :: ::.
CCDS32 LLLWATLNAAFVLVGSVIVAFIEPVAAGSGIPQIKCFLNGVKIPHVVRLKTLVIKVSGVI
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       .::.::: :::::::::::::..::. : .: ::..    : ::: : .:::::::::::
CCDS32 LSVVGGLAVGKEGPMIHSGSVIAAGISQGRSTSLKRDFKIFEYFRRDTEKRDFVSAGAAA
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       ::.::::::.::.:::::::.::::: :::...: :: .::::::  : :  :.  ... 
CCDS32 GVSAAFGAPVGGVLFSLEEGASFWNQFLTWRIFFASMISTFTLNFVLS-IYHGNMWDLSS
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pF1KSD PGLLNFGEFKCSDSDKKCHLWTAMDLGFFVVMGVIGGLLGATFNCLNKRLAKYRMRNVHP
       :::.:::.:   ::.:  .  :  ..  :..:::.::.:::.:: ::  :. .:.: .: 
CCDS32 PGLINFGRF---DSEKMAY--TIHEIPVFIAMGVVGGVLGAVFNALNYWLTMFRIRYIH-
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pF1KSD KPKLVRVLESLLVSLVTTVVVFVASMVLGECRQMSSSSQIGNDSFQLQVTEDVNSSIKTF
       .: : .:.:..::. ::..:.::  .   .:. .    : :. :. ::.           
CCDS32 RPCL-QVIEAVLVAAVTATVAFVLIYSSRDCQPL----QGGSMSYPLQL-----------
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pF1KSD FCPNDTYNDMATLFFNPQESAILQLFHQD-GTFSPVTLALFFVLYFLLACWTYGISVPSG
       :: .  ::.::. :::  :.....:::.  :...:.::.:: ..::.:::::::..: .:
CCDS32 FCADGEYNSMAAAFFNTPEKSVVSLFHDPPGSYNPLTLGLFTLVYFFLACWTYGLTVSAG
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pF1KSD LFVPSLLCGAAFGRLVANVLKSYIGLGHIYS--GTFALIGAAAFLGGVVRMTISLTVILI
       .:.:::: :::.::: .  : ::.  . :..  : .::.:::: :::.::::.:::::..
CCDS32 VFIPSLLIGAAWGRLFGISL-SYLTGAAIWADPGKYALMGAAAQLGGIVRMTLSLTVIMM
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CCDS32 EATSNVTYGFPIMLVLMTAKIVGDVFIEGLYDMHIQLQSVPFLHWEAPVTSHSLTAREVM
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pF1KSD EPNLTYVYPHTRIQSLVSILRTTV--HHAFPVVTENRGNEKEFMKGNQLISNNIKFKKSS
          .: .  . ..  .:..:  :.  :..::::                           
CCDS32 STPVTCLRRREKVGVIVDVLSDTASNHNGFPVV---------------------------
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pF1KSD ILTRAGEQRKRSQSMKSYPSSELRNMCDEHIASEEPAEKEDLLQQMLERRYTPYPNLYPD
                                   ::  . .::.    ::                
CCDS32 ----------------------------EHADDTQPAR----LQ----------------
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pF1KSD QSPSEDWTMEERFRPLTFHGLILRSQLVTLLVRGVCYSESQSSASQPRLSYAEMAEDYPR
                          ::::::::..:: . :   .:. .  : ::   .. . :::
CCDS32 -------------------GLILRSQLIVLLKHKVFVERSNLGLVQRRLRLKDFRDAYPR
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pF1KSD YPDIHDLDLTLLNPRMIVDVTPYMNPSPFTVSPNTHVSQVFNLFRTMGLRHLPVVNAVGE
       .: :... ..  . .  .:.. .:::::.::  .. . .::.:::..::::: ::.  ..
CCDS32 FPPIQSIHVSQDERECTMDLSEFMNPSPYTVPQEASLPRVFKLFRALGLRHLVVVDNRNQ
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pF1KSD IVGIITRHNLTYEFLQARLRQHYQTI  
       .::..::..:.   :  :          
CCDS32 VVGLVTRKDLARYRLGKRGLEELSLAQT
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>>CCDS5881.1 CLCN1 gene_id:1180|Hs108|chr7                (988 aa)
 initn: 494 init1: 187 opt: 339  Z-score: 382.6  bits: 82.1 E(32554): 5.4e-15
Smith-Waterman score: 627; 24.5% identity (54.5% similar) in 897 aa overlap (19-868:51-876)

                           10        20        30             40   
pF1KSD             MAGCRGSLCCCCRWCCCCGERETRTPEELTILGETQE-----EEDEIL
                                     : :..  : .  : :. .:     :.:  .
CCDS58 QYQYMPFEHCTSYGLPSENGGLQHRLRKDAGPRHNVHPTQ--IYGHHKEQFSDREQDIGM
               30        40        50        60          70        

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pF1KSD PRKDYESLDYDRCINDPYLEVLETMDNKKG---RRYEAVKWMVVFAIGVCTGLVGLFVDF
       :.:   :   :   .: : .  . . .. :   ::  .   . .  .:.  .::.  .:.
CCDS58 PKKTGSSSTVDSKDEDHYSKCQDCI-HRLGQVVRRKLGEDGIFLVLLGLLMALVSWSMDY
       80        90       100        110       120       130       

               110       120       130       140        150        
pF1KSD F-VRLFTQLKFGVVQTSVEECSQKGCLALSLLELLGFNLTFVFLASLLV-LIEPVAAGSG
         .. .   :.. .:       ..  : :..:  . : :.......:.  :: : :.:::
CCDS58 VSAKSLQAYKWSYAQ-------MQPSLPLQFLVWVTFPLVLILFSALFCHLISPQAVGSG
       140       150              160       170       180       190

      160       170       180       190       200       210        
pF1KSD IPEVKCYLNGVKVPGIVRLRTLLCKVLGVLFSVAGGLFVGKEGPMIHSGSVVGAGLPQFQ
       :::.:  : :: .   . ..... ::...  ....:. ::::::..: .:. .: : .:.
CCDS58 IPEMKTILRGVVLKEYLTMKAFVAKVVALTAGLGSGIPVGKEGPFVHIASICAAVLSKFM
              200       210       220       230       240       250

      220       230       240       250       260       270        
pF1KSD SISLRKIQFNFPYFRSDRDKRDFVSAGAAAGVAAAFGAPIGGTLFSLEEGSSFWNQGLTW
       :.      .. ::. ::     ....: :.::.  ::.:.::.:::.:  :...     :
CCDS58 SVFCGV--YEQPYYYSD-----ILTVGCAVGVGCCFGTPLGGVLFSIEVTSTYFAVRNYW
                260            270       280       290       300   

      280       290       300       310       320        330       
pF1KSD KVLFCSMSATFTLNFFRSGIQFGSWGSFQLPGLLNFGEFKCS-DSDKKCHLWTAMDLGFF
       . .:   .:::.   ::    .. :..    ..   . :. .   :    :    .:  :
CCDS58 RGFF---AATFSAFVFRV---LAVWNK---DAVTITALFRTNFRMDFPFDL---KELPAF
              310          320          330       340          350 

       340       350       360       370       380       390       
pF1KSD VVMGVIGGLLGATFNCLNKRLAKYRMRNVHPKPKLVRVLESLLVSLVTTVVVFV-ASMVL
       ...:.  :::::.:  :....    : .:. .  : . : .  . :   .:.:: ::...
CCDS58 AAIGICCGLLGAVFVYLHRQV----MLGVRKHKALSQFLAKHRL-LYPGIVTFVIASFTF
             360       370           380       390        400      

        400        410       420       430       440       450     
pF1KSD GECR-QMSSSSQIGNDSFQLQVTEDVNSSIKTFFCPNDTYNDMATLFFNPQESAILQLFH
            :. ..  .  ..  ...  : :. .:    :..    .......:. .... .: 
CCDS58 PPGMGQFMAGELMPREA--ISTLFDNNTWVKHAGDPESL--GQSAVWIHPRVNVVIIIF-
        410       420         430       440         450       460  

         460       470       480       490       500       510     
pF1KSD QDGTFSPVTLALFFVLYFLLACWTYGISVPSGLFVPSLLCGAAFGRLVANVLKSYIGLG-
                  ::::. : ..  .  . .: : :.: .. ::::::::....   .  : 
CCDS58 -----------LFFVMKFWMSIVATTMPIPCGGFMPVFVLGAAFGRLVGEIMAMLFPDGI
                        470       480       490       500       510

                 520       530       540       550       560       
pF1KSD -------HIYSGTFALIGAAAFLGGVVRMTISLTVILIESTNEITYGLPIMVTLMVAKWT
              .:  : .:.::::: : :.:  :.: .:: .: :..:.. ::.::....:. .
CCDS58 LFDDIIYKILPGGYAVIGAAA-LTGAVSHTVSTAVICFELTGQIAHILPMMVAVILANMV
              520       530        540       550       560         

       570       580          590       600       610       620    
pF1KSD GDFFNKGIYDIHVGLRGVPLLE---WETEVEMDKLRASDIMEPNLTYVYPHTRIQSLVSI
       .. .. ..::  . .. .: :    :. ..    . . :::  .. .:        : ..
CCDS58 AQSLQPSLYDSIIQVKKLPYLPDLGWN-QLSKYTIFVEDIMVRDVKFVSASYTYGELRTL
     570       580       590        600       610       620        

          630                 640       650            660         
pF1KSD LRTTVHHAFPVV----------TENRGNEKEFMKGN-----QLISNNIKFKKSSILTRAG
       :.::. ...:.:          . .:.. . ... .     .: . .   .: : :   :
CCDS58 LQTTTVKTLPLVDSKDSMILLGSVERSELQALLQRHLCPERRLRAAQEMARKLSELPYDG
      630       640       650       660       670       680        

     670       680       690       700        710       720        
pF1KSD EQRKRSQSMKSYPSSELRNMCDEHIASEEPAEKEDLL-QQMLERRYTPYPNLYPDQSPSE
       . :  .... . : ..      : .:  .  : :::  .. :    . .:.     :: :
CCDS58 KARLAGEGLPGAPPGR-----PESFAFVDEDEDEDLSGKSELPPSLALHPSTTAPLSPEE
      690       700            710       720       730       740   

             730       740       750       760       770       780 
pF1KSD D-------WTMEERFRPLTFHGLILRSQLVTLLVRGVCYSESQSSASQPRLSYAEMAEDY
                 . :  .:   .  :..: :  :: :.     ......:   . .    : 
CCDS58 PNGPLPGHKQQPEAPEPAGQRPSIFQSLLHCLLGRA---RPTKKKTTQDSTDLV----DN
           750       760       770          780       790          

             790       800       810       820       830       840 
pF1KSD PRYPDIHDLDLTLLNPRMIVDVTPYMNPSPFTVSPNTHVSQVFNLFRTMGLRHLPVVNAV
           .:.  .   :.  .  : .  .. ::: .  .: . .. .::  .:: ::  :...
CCDS58 MSPEEIEAWEQEQLSQPVCFD-SCCIDQSPFQLVEQTTLHKTHTLFSLLGL-HLAYVTSM
        800       810        820       830       840        850    

             850       860                                         
pF1KSD GEIVGIITRHNLTYEFLQARLRQHYQTI                                
       :.. :.     :. : ::  .. : ..                                 
CCDS58 GKLRGV-----LALEELQKAIEGHTKSGVQLRPPLASFRNTTSTRKSTGAPPSSAENWNL
          860            870       880       890       900         

>>CCDS54692.1 CLCN2 gene_id:1181|Hs108|chr3               (869 aa)
 initn: 348 init1: 175 opt: 305  Z-score: 344.5  bits: 74.9 E(32554): 7.2e-13
Smith-Waterman score: 569; 25.2% identity (57.3% similar) in 634 aa overlap (81-692:91-663)

               60        70        80        90       100       110
pF1KSD LDYDRCINDPYLEVLETMDNKKGRRYEAVKWMVVFAIGVCTGLVGLFVDFFVRLFTQLKF
                                     :. .  .:.  .::.  .:. .    :   
CCDS54 LLEYGRSRCARCRVCSVRCHKFLVSRVGEDWIFLVLLGLLMALVSWVMDYAIAACLQ---
               70        80        90       100       110          

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pF1KSD GVVQTSVEECSQKGCLALSLLELLGFNLTFV-FLASLLVLIEPVAAGSGIPEVKCYLNGV
         .:  . .  . . : :. :  . . .... : :..  .. : :.::::::.:  : ::
CCDS54 --AQQWMSRGLNTSIL-LQYLAWVTYPVVLITFSAGFTQILAPQAVGSGIPEMKTILRGV
         120       130        140       150       160       170    

     170       180       190       200       210       220         
pF1KSD KVPGIVRLRTLLCKVLGVLFSVAGGLFVGKEGPMIHSGSVVGAGLPQFQSISLRKIQFNF
        .   . :.:.. ::.:.  ....:. .:::::..: .:. .: : .: :.      :. 
CCDS54 VLKEYLTLKTFIAKVIGLTCALGSGMPLGKEGPFVHIASMCAALLSKFLSL------FGG
          180       190       200       210       220              

     230       240       250       260       270       280         
pF1KSD PYFRSDRDKRDFVSAGAAAGVAAAFGAPIGGTLFSLEEGSSFWNQGLTWKVLFCSMSATF
        :   .:.  ....:. :.::.  :.:::::.:::.:  :.:.     :. .:   .:::
CCDS54 IYENESRNT-EMLAAACAVGVGCCFAAPIGGVLFSIEVTSTFFAVRNYWRGFF---AATF
      230        240       250       260       270       280       

     290       300       310        320       330       340        
pF1KSD TLNFFRSGIQFGSWGSFQLPGLLNFG-EFKCSDSDKKCHLWTAMDLGFFVVMGVIGGLLG
       .  .::    .. :.  .      :  .:.    :    :   ..:  :.:.:. .:. :
CCDS54 SAFIFRV---LAVWNRDEETITALFKTRFRL---DFPFDL---QELPAFAVIGIASGFGG
          290          300       310             320       330     

      350       360       370          380       390          400  
pF1KSD ATFNCLNKRLAKYRMRNVHPKPKLV---RVLESLLVSLVTTVVVF---VASMVLGECRQM
       : :  ::.....  ::. .   ...   :.:   ::.:. ....:    .... :.  : 
CCDS54 ALFVYLNRKIVQV-MRKQKTINRFLMRKRLLFPALVTLLISTLTFPPGFGQFMAGQLSQK
         340        350       360       370       380       390    

            410       420       430       440       450       460  
pF1KSD SSSSQIGNDSFQLQVTEDVNSSIKTFFCPNDTYNDMATLFFNPQESAILQLFHQDGTFSP
        .   . ..         : ...   . : .:     .  .:: .. ..           
CCDS54 ETLVTLFDNRTW------VRQGLVEELEPPST-----SQAWNPPRANVF-----------
          400             410       420            430             

            470       480       490       500       510            
pF1KSD VTLALFFVLYFLLACWTYGISVPSGLFVPSLLCGAAFGRLVANVLKSYIGLG-H------
       .::..:... : ..  .  : :: : :.: .. ::::::::.. . ...  : :      
CCDS54 LTLVIFILMKFWMSALATTIPVPCGAFMPVFVIGAAFGRLVGESMAAWFPDGIHTDSSTY
            440       450       460       470       480       490  

          520       530       540       550       560       570    
pF1KSD -IYSGTFALIGAAAFLGGVVRMTISLTVILIESTNEITYGLPIMVTLMVAKWTGDFFNKG
        :  : .:..:::: :.:.:  :.: .::..: :..:.. ::.:.....:. ... .. .
CCDS54 RIVPGGYAVVGAAA-LAGAVTHTVSTAVIVFELTGQIAHILPVMIAVILANAVAQSLQPS
            500        510       520       530       540       550 

          580          590       600       610       620       630 
pF1KSD IYDIHVGLRGVPLLE---WETEVEMDKLRASDIMEPNLTYVYPHTRIQSLVSILRTTVHH
       .::  . .. .: :    :  . .. ..:. :::  ..    ::. ..     :: ..:.
CCDS54 LYDSIIRIKKLPYLPELGWGRHQQY-RVRVEDIMVRDV----PHVALSCTFRDLRLALHR
             560       570        580           590       600      

             640       650       660       670          680        
pF1KSD AFPVVTENRGNEKEFMKGNQLISNNIKFKKSSILTRAGEQ---RKRSQSMKSYPSSELRN
       .       .:    .... . .    ....:....  : :    .: : :.   ...   
CCDS54 T-------KGRMLALVESPESMILLGSIERSQVVALLGAQLSPARRRQHMQERRATQTSP
               610       620       630       640       650         

      690       700       710       720       730       740        
pF1KSD MCDEHIASEEPAEKEDLLQQMLERRYTPYPNLYPDQSPSEDWTMEERFRPLTFHGLILRS
       . :.                                                        
CCDS54 LSDQEGPPTPEASVCFQVNTEDSAFPAARGETHKPLKPALKRGPSVTRNLGESPTGSAES
     660       670       680       690       700       710         

>>CCDS54691.1 CLCN2 gene_id:1181|Hs108|chr3               (881 aa)
 initn: 338 init1: 175 opt: 305  Z-score: 344.4  bits: 74.9 E(32554): 7.3e-13
Smith-Waterman score: 552; 23.3% identity (53.5% similar) in 811 aa overlap (81-853:91-818)

               60        70        80        90       100       110
pF1KSD LDYDRCINDPYLEVLETMDNKKGRRYEAVKWMVVFAIGVCTGLVGLFVDFFVRLFTQLKF
                                     :. .  .:.  .::.  .:. .    :   
CCDS54 LLEYGRSRCARCRVCSVRCHKFLVSRVGEDWIFLVLLGLLMALVSWVMDYAIAACLQ---
               70        80        90       100       110          

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pF1KSD GVVQTSVEECSQKGCLALSLLELLGFNLTFV-FLASLLVLIEPVAAGSGIPEVKCYLNGV
         .:  . .  . . : :. :  . . .... : :..  .. : :.::::::.:  : ::
CCDS54 --AQQWMSRGLNTSIL-LQYLAWVTYPVVLITFSAGFTQILAPQAVGSGIPEMKTILRGV
         120       130        140       150       160       170    

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pF1KSD KVPGIVRLRTLLCKVLGVLFSVAGGLFVGKEGPMIHSGSVVGAGLPQFQSISLRKIQFNF
        .   . :.:.. ::.:.  ....:. .:::::..: .:. .: : .: :.      :. 
CCDS54 VLKEYLTLKTFIAKVIGLTCALGSGMPLGKEGPFVHIASMCAALLSKFLSL------FGG
          180       190       200       210       220              

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pF1KSD PYFRSDRDKRDFVSAGAAAGVAAAFGAPIGGTLFSLEEGSSFWNQGLTWKVLFCSMSATF
        :   .:.  ....:. :.::.  :.:::::.:::.:  :.:.     :. .:   .:::
CCDS54 IYENESRNT-EMLAAACAVGVGCCFAAPIGGVLFSIEVTSTFFAVRNYWRGFF---AATF
      230        240       250       260       270       280       

     290       300       310        320       330       340        
pF1KSD TLNFFRSGIQFGSWGSFQLPGLLNFG-EFKCSDSDKKCHLWTAMDLGFFVVMGVIGGLLG
       .  .::    .. :.  .      :  .:.    :    :   ..:  :.:.:. .:. :
CCDS54 SAFIFRV---LAVWNRDEETITALFKTRFRL---DFPFDL---QELPAFAVIGIASGFGG
          290          300       310             320       330     

      350       360       370          380       390          400  
pF1KSD ATFNCLNKRLAKYRMRNVHPKPKLV---RVLESLLVSLVTTVVVF---VASMVLGECRQM
       : :  ::.....  ::. .   ...   :.:   ::.:. ....:    .... :.  : 
CCDS54 ALFVYLNRKIVQV-MRKQKTINRFLMRKRLLFPALVTLLISTLTFPPGFGQFMAGQLSQK
         340        350       360       370       380       390    

            410       420       430       440       450       460  
pF1KSD SSSSQIGNDSFQLQVTEDVNSSIKTFFCPNDTYNDMATLFFNPQESAILQLFHQDGTFSP
        .   . ..  .  : . .   ..    : .:     .  .:: .. ..           
CCDS54 ETLVTLFDN--RTWVRQGLVEELE----PPST-----SQAWNPPRANVF-----------
          400         410           420            430             

            470       480       490       500       510       520  
pF1KSD VTLALFFVLYFLLACWTYGISVPSGLFVPSLLCGAAFGRLVANVLKSYIGLGHIYSGTFA
       .::..:... : ..  .  : :: : :.: .         : . ...  .  .:  : .:
CCDS54 LTLVIFILMKFWMSALATTIPVPCGAFMPVF---------VIDGIHTDSSTYRIVPGGYA
            440       450       460                470       480   

            530       540       550       560       570       580  
pF1KSD LIGAAAFLGGVVRMTISLTVILIESTNEITYGLPIMVTLMVAKWTGDFFNKGIYDIHVGL
       ..:::: :.:.:  :.: .::..: :..:.. ::.:.....:. ... .. ..::  . .
CCDS54 VVGAAA-LAGAVTHTVSTAVIVFELTGQIAHILPVMIAVILANAVAQSLQPSLYDSIIRI
            490       500       510       520       530       540  

               590       600       610       620       630         
pF1KSD RGVPLLE---WETEVEMDKLRASDIMEPNLTYVYPHTRIQSLVSILRTTVHHAFPVVTEN
       . .: :    :  . .. ..:. :::  ..    ::. ..     :: ..:..       
CCDS54 KKLPYLPELGWGRH-QQYRVRVEDIMVRDV----PHVALSCTFRDLRLALHRT-------
            550        560       570           580       590       

     640       650       660       670          680       690      
pF1KSD RGNEKEFMKGNQLISNNIKFKKSSILTRAGEQ---RKRSQSMKSYPSSELRNMCDEHIAS
       .:    .... . .    ....:....  : :    .: : :.   ...   . :.    
CCDS54 KGRMLALVESPESMILLGSIERSQVVALLGAQLSPARRRQHMQERRATQTSPLSDQ----
              600       610       620       630       640          

        700       710               720         730       740      
pF1KSD EEPAEKEDLLQQMLERRYTPYPN--------LYP--DQSPSEDWTMEERFRPLTFH-GLI
       : :   :  .  ... . . .:         : :   ..::   .. :     .   :. 
CCDS54 EGPPTPEASVCFQVNTEDSAFPAARGETHKPLKPALKRGPSVTRNLGESPTGSAESAGIA
        650       660       670       680       690       700      

         750       760       770       780       790        800    
pF1KSD LRSQLVTLLVRGVCYSESQSSASQPRLSYAEMAEDYPRYPDIHDLDLT-LLNPRMIVDVT
       ::: .        : :    .::.   :  .      :     : ::   ..:. :..  
CCDS54 LRSLF--------CGSPPPEAASEKLESCEKRKLKRVRISLASDADLEGEMSPEEILEWE
        710               720       730       740       750        

                      810       820       830       840       850  
pF1KSD ------PY------MNPSPFTVSPNTHVSQVFNLFRTMGLRHLPVVNAVGEIVGIITRHN
             :       ..:.:: .   : . .. ..:  .:. :   :...:...::.: ..
CCDS54 EQQLDEPVNFSDCKIDPAPFQLVERTSLHKTHTIFSLLGVDH-AYVTSIGRLIGIVTLKE
      760       770       780       790       800        810       

            860                                                    
pF1KSD LTYEFLQARLRQHYQTI                                           
       :                                                           
CCDS54 LRKAIEGSVTAQGVKVRPPLASFRDSATSSSDTETTEVHALWGPHSRHGLPREGSPSDSD
       820       830       840       850       860       870       

>>CCDS3263.1 CLCN2 gene_id:1181|Hs108|chr3                (898 aa)
 initn: 348 init1: 175 opt: 305  Z-score: 344.3  bits: 74.9 E(32554): 7.4e-13
Smith-Waterman score: 613; 24.2% identity (54.2% similar) in 819 aa overlap (81-853:91-835)

               60        70        80        90       100       110
pF1KSD LDYDRCINDPYLEVLETMDNKKGRRYEAVKWMVVFAIGVCTGLVGLFVDFFVRLFTQLKF
                                     :. .  .:.  .::.  .:. .    :   
CCDS32 LLEYGRSRCARCRVCSVRCHKFLVSRVGEDWIFLVLLGLLMALVSWVMDYAIAACLQ---
               70        80        90       100       110          

              120       130       140        150       160         
pF1KSD GVVQTSVEECSQKGCLALSLLELLGFNLTFV-FLASLLVLIEPVAAGSGIPEVKCYLNGV
         .:  . .  . . : :. :  . . .... : :..  .. : :.::::::.:  : ::
CCDS32 --AQQWMSRGLNTSIL-LQYLAWVTYPVVLITFSAGFTQILAPQAVGSGIPEMKTILRGV
         120       130        140       150       160       170    

     170       180       190       200       210       220         
pF1KSD KVPGIVRLRTLLCKVLGVLFSVAGGLFVGKEGPMIHSGSVVGAGLPQFQSISLRKIQFNF
        .   . :.:.. ::.:.  ....:. .:::::..: .:. .: : .: :.      :. 
CCDS32 VLKEYLTLKTFIAKVIGLTCALGSGMPLGKEGPFVHIASMCAALLSKFLSL------FGG
          180       190       200       210       220              

     230       240       250       260       270       280         
pF1KSD PYFRSDRDKRDFVSAGAAAGVAAAFGAPIGGTLFSLEEGSSFWNQGLTWKVLFCSMSATF
        :   .:.  ....:. :.::.  :.:::::.:::.:  :.:.     :. .:   .:::
CCDS32 IYENESRNT-EMLAAACAVGVGCCFAAPIGGVLFSIEVTSTFFAVRNYWRGFF---AATF
      230        240       250       260       270       280       

     290       300       310        320       330       340        
pF1KSD TLNFFRSGIQFGSWGSFQLPGLLNFG-EFKCSDSDKKCHLWTAMDLGFFVVMGVIGGLLG
       .  .::    .. :.  .      :  .:.    :    :   ..:  :.:.:. .:. :
CCDS32 SAFIFRV---LAVWNRDEETITALFKTRFRL---DFPFDL---QELPAFAVIGIASGFGG
          290          300       310             320       330     

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pF1KSD ATFNCLNKRLAKYRMRNVHPKPKLV---RVLESLLVSLVTTVVVF---VASMVLGECRQM
       : :  ::.....  ::. .   ...   :.:   ::.:. ....:    .... :.  : 
CCDS32 ALFVYLNRKIVQV-MRKQKTINRFLMRKRLLFPALVTLLISTLTFPPGFGQFMAGQLSQK
         340        350       360       370       380       390    

            410       420       430       440       450       460  
pF1KSD SSSSQIGNDSFQLQVTEDVNSSIKTFFCPNDTYNDMATLFFNPQESAILQLFHQDGTFSP
        .   . ..  .  : . .   ..    : .:     .  .:: .. ..           
CCDS32 ETLVTLFDN--RTWVRQGLVEELE----PPST-----SQAWNPPRANVF-----------
          400         410           420            430             

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pF1KSD VTLALFFVLYFLLACWTYGISVPSGLFVPSLLCGAAFGRLVANVLKSYIGLG-H------
       .::..:... : ..  .  : :: : :.: .. ::::::::.. . ...  : :      
CCDS32 LTLVIFILMKFWMSALATTIPVPCGAFMPVFVIGAAFGRLVGESMAAWFPDGIHTDSSTY
            440       450       460       470       480       490  

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pF1KSD -IYSGTFALIGAAAFLGGVVRMTISLTVILIESTNEITYGLPIMVTLMVAKWTGDFFNKG
        :  : .:..:::: :.:.:  :.: .::..: :..:.. ::.:.....:. ... .. .
CCDS32 RIVPGGYAVVGAAA-LAGAVTHTVSTAVIVFELTGQIAHILPVMIAVILANAVAQSLQPS
            500        510       520       530       540       550 

          580          590       600       610       620       630 
pF1KSD IYDIHVGLRGVPLLE---WETEVEMDKLRASDIMEPNLTYVYPHTRIQSLVSILRTTVHH
       .::  . .. .: :    :  . .. ..:. :::  ..    ::. ..     :: ..:.
CCDS32 LYDSIIRIKKLPYLPELGWGRH-QQYRVRVEDIMVRDV----PHVALSCTFRDLRLALHR
             560       570        580           590       600      

             640       650       660       670          680        
pF1KSD AFPVVTENRGNEKEFMKGNQLISNNIKFKKSSILTRAGEQ---RKRSQSMKSYPSSELRN
       .       .:    .... . .    ....:....  : :    .: : :.   ...   
CCDS32 T-------KGRMLALVESPESMILLGSIERSQVVALLGAQLSPARRRQHMQERRATQTSP
               610       620       630       640       650         

      690       700       710               720         730        
pF1KSD MCDEHIASEEPAEKEDLLQQMLERRYTPYPN--------LYP--DQSPSEDWTMEERFRP
       . :.    : :   :  .  ... . . .:         : :   ..::   .. :    
CCDS32 LSDQ----EGPPTPEASVCFQVNTEDSAFPAARGETHKPLKPALKRGPSVTRNLGESPTG
     660           670       680       690       700       710     

      740        750       760       770       780       790       
pF1KSD LTFH-GLILRSQLVTLLVRGVCYSESQSSASQPRLSYAEMAEDYPRYPDIHDLDLT-LLN
        .   :. ::: .        : :    .::.   :  .      :     : ::   ..
CCDS32 SAESAGIALRSLF--------CGSPPPEAASEKLESCEKRKLKRVRISLASDADLEGEMS
         720               730       740       750       760       

        800                   810       820       830       840    
pF1KSD PRMIVDVT------PY------MNPSPFTVSPNTHVSQVFNLFRTMGLRHLPVVNAVGEI
       :. :..        :       ..:.:: .   : . .. ..:  .:. :   :...:..
CCDS32 PEEILEWEEQQLDEPVNFSDCKIDPAPFQLVERTSLHKTHTIFSLLGVDH-AYVTSIGRL
       770       780       790       800       810        820      

          850       860                                            
pF1KSD VGIITRHNLTYEFLQARLRQHYQTI                                   
       .::.: ..:                                                   
CCDS32 IGIVTLKELRKAIEGSVTAQGVKVRPPLASFRDSATSSSDTETTEVHALWGPHSRHGLPR
        830       840       850       860       870       880      

>>CCDS54690.1 CLCN2 gene_id:1181|Hs108|chr3               (854 aa)
 initn: 348 init1: 175 opt: 296  Z-score: 334.3  bits: 72.9 E(32554): 2.7e-12
Smith-Waterman score: 604; 24.6% identity (54.7% similar) in 772 aa overlap (128-853:88-791)

       100       110       120       130       140        150      
pF1KSD VDFFVRLFTQLKFGVVQTSVEECSQKGCLALSLLELLGFNLTFV-FLASLLVLIEPVAAG
                                     :. :  . . .... : :..  .. : :.:
CCDS54 APELLEYGRSRCARCRAQQWMSRGLNTSILLQYLAWVTYPVVLITFSAGFTQILAPQAVG
        60        70        80        90       100       110       

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pF1KSD SGIPEVKCYLNGVKVPGIVRLRTLLCKVLGVLFSVAGGLFVGKEGPMIHSGSVVGAGLPQ
       :::::.:  : :: .   . :.:.. ::.:.  ....:. .:::::..: .:. .: : .
CCDS54 SGIPEMKTILRGVVLKEYLTLKTFIAKVIGLTCALGSGMPLGKEGPFVHIASMCAALLSK
       120       130       140       150       160       170       

        220       230       240       250       260       270      
pF1KSD FQSISLRKIQFNFPYFRSDRDKRDFVSAGAAAGVAAAFGAPIGGTLFSLEEGSSFWNQGL
       : :.      :.  :   .:.  ....:. :.::.  :.:::::.:::.:  :.:.    
CCDS54 FLSL------FGGIYENESRNT-EMLAAACAVGVGCCFAAPIGGVLFSIEVTSTFFAVRN
       180             190        200       210       220       230

        280       290       300       310        320       330     
pF1KSD TWKVLFCSMSATFTLNFFRSGIQFGSWGSFQLPGLLNFG-EFKCSDSDKKCHLWTAMDLG
        :. .:   .:::.  .::    .. :.  .      :  .:.    :    :   ..: 
CCDS54 YWRGFF---AATFSAFIFRV---LAVWNRDEETITALFKTRFRL---DFPFDL---QELP
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        :.:.:. .:. :: :  ::.....  ::. .   ...   :.:   ::.:. ....:  
CCDS54 AFAVIGIASGFGGALFVYLNRKIVQV-MRKQKTINRFLMRKRLLFPALVTLLISTLTFPP
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pF1KSD -VASMVLGECRQMSSSSQIGNDSFQLQVTEDVNSSIKTFFCPNDTYNDMATLFFNPQESA
         .... :.  :  .   . ..  .  : . .   ..    : .:     .  .:: .. 
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pF1KSD ILQLFHQDGTFSPVTLALFFVLYFLLACWTYGISVPSGLFVPSLLCGAAFGRLVANVLKS
       ..           .::..:... : ..  .  : :: : :.: .. ::::::::.. . .
CCDS54 VF-----------LTLVIFILMKFWMSALATTIPVPCGAFMPVFVIGAAFGRLVGESMAA
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       ..  : :       :  : .:..:::: :.:.:  :.: .::..: :..:.. ::.:...
CCDS54 WFPDGIHTDSSTYRIVPGGYAVVGAAA-LAGAVTHTVSTAVIVFELTGQIAHILPVMIAV
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pF1KSD MVAKWTGDFFNKGIYDIHVGLRGVPLLE---WETEVEMDKLRASDIMEPNLTYVYPHTRI
       ..:. ... .. ..::  . .. .: :    :  . .. ..:. :::  ..    ::. .
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pF1KSD QSLVSILRTTVHHAFPVVTENRGNEKEFMKGNQLISNNIKFKKSSILTRAGEQ---RKRS
       .     :: ..:..       .:    .... . .    ....:....  : :    .: 
CCDS54 SCTFRDLRLALHRT-------KGRMLALVESPESMILLGSIERSQVVALLGAQLSPARRR
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pF1KSD QSMKSYPSSELRNMCDEHIASEEPAEKEDLLQQMLERRYTPYPN--------LYP--DQS
       : :.   ...   . :.    : :   :  .  ... . . .:         : :   ..
CCDS54 QHMQERRATQTSPLSDQ----EGPPTPEASVCFQVNTEDSAFPAARGETHKPLKPALKRG
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pF1KSD PSEDWTMEERFRPLTFH-GLILRSQLVTLLVRGVCYSESQSSASQPRLSYAEMAEDYPRY
       ::   .. :     .   :. ::: .        : :    .::.   :  .      : 
CCDS54 PSVTRNLGESPTGSAESAGIALRSLF--------CGSPPPEAASEKLESCEKRKLKRVRI
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pF1KSD PDIHDLDLT-LLNPRMIVDVT------PY------MNPSPFTVSPNTHVSQVFNLFRTMG
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CCDS54 SLASDADLEGEMSPEEILEWEEQQLDEPVNFSDCKIDPAPFQLVERTSLHKTHTIFSLLG
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pF1KSD LRHLPVVNAVGEIVGIITRHNLTYEFLQARLRQHYQTI                      
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CCDS54 VDH-AYVTSIGRLIGIVTLKELRKAIEGSVTAQGVKVRPPLASFRDSATSSSDTETTEVH
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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