Result of FASTA (omim) for
pF1KB8005
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8005, 748 aa
1>>>pF1KB8005 748 - 748 aa - 748 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1592+/-0.00049; mu= 10.2220+/- 0.030
mean_var=161.9559+/-35.727, 0's: 0 Z-trim(113.9): 357 B-trim: 334 in 1/53
Lambda= 0.100780
statistics sampled from 23044 (23519) to 23044 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.643), E-opt: 0.2 (0.276), width: 16
Scan time: 7.920
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_073576 (OMIM: 605532) E3 ubiquitin-protein liga ( 748) 5172 765.4 0
XP_011523430 (OMIM: 605532) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 750) 5055 748.4 2.5e-215
XP_005257642 (OMIM: 605532) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 735) 4963 735.0 2.6e-211
XP_016867946 (OMIM: 605568) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 754) 3555 530.3 1.1e-149
NP_065162 (OMIM: 605568) E3 ubiquitin-protein liga ( 757) 3539 528.0 5.6e-149
NP_001186776 (OMIM: 605568) E3 ubiquitin-protein l ( 728) 2935 440.1 1.5e-122
NP_851994 (OMIM: 605568) E3 ubiquitin-protein liga ( 731) 2919 437.8 7.5e-122
XP_006722493 (OMIM: 606384) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 872) 1616 248.4 9.1e-65
XP_006722484 (OMIM: 606384) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 940) 1616 248.5 9.6e-65
XP_005266715 (OMIM: 606384) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 960) 1616 248.5 9.8e-65
XP_016881167 (OMIM: 606384) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 973) 1616 248.5 9.9e-65
XP_006722491 (OMIM: 606384) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 993) 1616 248.5 1e-64
XP_011524189 (OMIM: 606384) PREDICTED: E3 ubiquiti (1011) 1616 248.5 1e-64
XP_006722489 (OMIM: 606384) PREDICTED: E3 ubiquiti (1019) 1616 248.5 1e-64
XP_016881165 (OMIM: 606384) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 856) 1610 247.6 1.6e-64
XP_006722487 (OMIM: 606384) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 790) 1533 236.3 3.6e-61
NP_001138443 (OMIM: 606384) E3 ubiquitin-protein l ( 834) 1466 226.6 3.2e-58
NP_001138442 (OMIM: 606384) E3 ubiquitin-protein l ( 834) 1466 226.6 3.2e-58
NP_001138438 (OMIM: 606384) E3 ubiquitin-protein l ( 854) 1466 226.6 3.3e-58
NP_001138437 (OMIM: 606384) E3 ubiquitin-protein l ( 854) 1466 226.6 3.3e-58
NP_001138436 (OMIM: 606384) E3 ubiquitin-protein l ( 854) 1466 226.6 3.3e-58
XP_016881168 (OMIM: 606384) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 854) 1466 226.6 3.3e-58
XP_005266720 (OMIM: 606384) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 922) 1466 226.6 3.5e-58
XP_005266717 (OMIM: 606384) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 942) 1466 226.7 3.5e-58
NP_001138441 (OMIM: 606384) E3 ubiquitin-protein l ( 947) 1466 226.7 3.6e-58
NP_056092 (OMIM: 606384) E3 ubiquitin-protein liga ( 955) 1466 226.7 3.6e-58
NP_001138440 (OMIM: 606384) E3 ubiquitin-protein l ( 967) 1466 226.7 3.6e-58
NP_001138439 (OMIM: 606384) E3 ubiquitin-protein l ( 975) 1466 226.7 3.6e-58
XP_016881170 (OMIM: 606384) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 684) 1417 219.4 3.9e-56
XP_016881169 (OMIM: 606384) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 750) 1417 219.4 4.2e-56
XP_006722488 (OMIM: 606384) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 772) 1417 219.4 4.3e-56
XP_016881166 (OMIM: 606384) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 838) 1417 219.5 4.5e-56
NP_001230889 (OMIM: 606384) E3 ubiquitin-protein l ( 911) 1417 219.5 4.8e-56
XP_005260627 (OMIM: 606409,613385) PREDICTED: E3 u ( 692) 1401 217.1 2e-55
XP_011527381 (OMIM: 606409,613385) PREDICTED: E3 u ( 692) 1401 217.1 2e-55
NP_001244067 (OMIM: 606409,613385) E3 ubiquitin-pr ( 752) 1401 217.1 2.1e-55
XP_016883580 (OMIM: 606409,613385) PREDICTED: E3 u ( 752) 1401 217.1 2.1e-55
NP_001311127 (OMIM: 606409,613385) E3 ubiquitin-pr ( 862) 1401 217.2 2.3e-55
NP_113671 (OMIM: 606409,613385) E3 ubiquitin-prote ( 862) 1401 217.2 2.3e-55
XP_016883579 (OMIM: 606409,613385) PREDICTED: E3 u ( 900) 1401 217.2 2.4e-55
NP_001244066 (OMIM: 606409,613385) E3 ubiquitin-pr ( 903) 1401 217.2 2.4e-55
XP_016883578 (OMIM: 606409,613385) PREDICTED: E3 u ( 903) 1401 217.2 2.4e-55
NP_001311126 (OMIM: 606409,613385) E3 ubiquitin-pr ( 903) 1401 217.2 2.4e-55
NP_001316141 (OMIM: 602278) E3 ubiquitin-protein l ( 753) 1395 216.2 3.9e-55
XP_011519929 (OMIM: 602278) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 827) 1395 216.3 4.1e-55
XP_011519928 (OMIM: 602278) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 849) 1395 216.3 4.2e-55
XP_011519927 (OMIM: 602278) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 849) 1395 216.3 4.2e-55
XP_011519926 (OMIM: 602278) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 875) 1395 216.3 4.3e-55
NP_006145 (OMIM: 602278) E3 ubiquitin-protein liga ( 900) 1395 216.3 4.4e-55
NP_940682 (OMIM: 602278) E3 ubiquitin-protein liga (1247) 1395 216.4 5.6e-55
>>NP_073576 (OMIM: 605532) E3 ubiquitin-protein ligase S (748 aa)
initn: 5172 init1: 5172 opt: 5172 Z-score: 4078.8 bits: 765.4 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5172; 100.0% identity (100.0% similar) in 748 aa overlap (1-748:1-748)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSNPGGRRNGPVKLRLTVLCAKNLVKKDFFRLPDPFAKVVVDGSGQCHSTDTVKNTLDPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_073 MSNPGGRRNGPVKLRLTVLCAKNLVKKDFFRLPDPFAKVVVDGSGQCHSTDTVKNTLDPK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 WNQHYDLYIGKSDSVTISVWNHKKIHKKQGAGFLGCVRLLSNAINRLKDTGYQRLDLCKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_073 WNQHYDLYIGKSDSVTISVWNHKKIHKKQGAGFLGCVRLLSNAINRLKDTGYQRLDLCKL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 GPNDNDTVRGQIVVSLQSRDRIGTGGQVVDCSRLFDNDLPDGWEERRTASGRIQYLNHIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_073 GPNDNDTVRGQIVVSLQSRDRIGTGGQVVDCSRLFDNDLPDGWEERRTASGRIQYLNHIT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 RTTQWERPTRPASEYSSPGRPLSCFVDENTPISGTNGATCGQSSDPRLAERRVRSQRHRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_073 RTTQWERPTRPASEYSSPGRPLSCFVDENTPISGTNGATCGQSSDPRLAERRVRSQRHRN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 YMSRTHLHTPPDLPEGYEQRTTQQGQVYFLHTQTGVSTWHDPRVPRDLSNINCEELGPLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_073 YMSRTHLHTPPDLPEGYEQRTTQQGQVYFLHTQTGVSTWHDPRVPRDLSNINCEELGPLP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 PGWEIRNTATGRVYFVDHNNRTTQFTDPRLSANLHLVLNRQNQLKDQQQQQVVSLCPDDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_073 PGWEIRNTATGRVYFVDHNNRTTQFTDPRLSANLHLVLNRQNQLKDQQQQQVVSLCPDDT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 ECLTVPRYKRDLVQKLKILRQELSQQQPQAGHCRIEVSREEIFEESYRQVMKMRPKDLWK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_073 ECLTVPRYKRDLVQKLKILRQELSQQQPQAGHCRIEVSREEIFEESYRQVMKMRPKDLWK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 RLMIKFRGEEGLDYGGVAREWLYLLSHEMLNPYYGLFQYSRDDIYTLQINPDSAVNPEHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_073 RLMIKFRGEEGLDYGGVAREWLYLLSHEMLNPYYGLFQYSRDDIYTLQINPDSAVNPEHL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 SYFHFVGRIMGMAVFHGHYIDGGFTLPFYKQLLGKSITLDDMELVDPDLHNSLVWILEND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_073 SYFHFVGRIMGMAVFHGHYIDGGFTLPFYKQLLGKSITLDDMELVDPDLHNSLVWILEND
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 ITGVLDHTFCVEHNAYGEIIQHELKPNGKSIPVNEENKKEYVRLYVNWRFLRGIEAQFLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_073 ITGVLDHTFCVEHNAYGEIIQHELKPNGKSIPVNEENKKEYVRLYVNWRFLRGIEAQFLA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 LQKGFNEVIPQHLLKTFDEKELELIICGLGKIDVNDWKVNTRLKHCTPDSNIVKWFWKAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_073 LQKGFNEVIPQHLLKTFDEKELELIICGLGKIDVNDWKVNTRLKHCTPDSNIVKWFWKAV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 EFFDEERRARLLQFVTGSSRVPLQGFKALQGAAGPRLFTIHQIDACTNNLPKAHTCFNRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_073 EFFDEERRARLLQFVTGSSRVPLQGFKALQGAAGPRLFTIHQIDACTNNLPKAHTCFNRI
670 680 690 700 710 720
730 740
pF1KB8 DIPPYESYEKLYEKLLTAIEETCGFAVE
::::::::::::::::::::::::::::
NP_073 DIPPYESYEKLYEKLLTAIEETCGFAVE
730 740
>>XP_011523430 (OMIM: 605532) PREDICTED: E3 ubiquitin-pr (750 aa)
initn: 5055 init1: 5055 opt: 5055 Z-score: 3986.9 bits: 748.4 E(85289): 2.5e-215
Smith-Waterman score: 5055; 100.0% identity (100.0% similar) in 731 aa overlap (18-748:20-750)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MSNPGGRRNGPVKLRLTVLCAKNLVKKDFFRLPDPFAKVVVDGSGQCHSTDTVKNTLD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MGLSSCRKTSSGLPLILHYVLCAKNLVKKDFFRLPDPFAKVVVDGSGQCHSTDTVKNTLD
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 PKWNQHYDLYIGKSDSVTISVWNHKKIHKKQGAGFLGCVRLLSNAINRLKDTGYQRLDLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PKWNQHYDLYIGKSDSVTISVWNHKKIHKKQGAGFLGCVRLLSNAINRLKDTGYQRLDLC
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 KLGPNDNDTVRGQIVVSLQSRDRIGTGGQVVDCSRLFDNDLPDGWEERRTASGRIQYLNH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KLGPNDNDTVRGQIVVSLQSRDRIGTGGQVVDCSRLFDNDLPDGWEERRTASGRIQYLNH
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 ITRTTQWERPTRPASEYSSPGRPLSCFVDENTPISGTNGATCGQSSDPRLAERRVRSQRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ITRTTQWERPTRPASEYSSPGRPLSCFVDENTPISGTNGATCGQSSDPRLAERRVRSQRH
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 RNYMSRTHLHTPPDLPEGYEQRTTQQGQVYFLHTQTGVSTWHDPRVPRDLSNINCEELGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RNYMSRTHLHTPPDLPEGYEQRTTQQGQVYFLHTQTGVSTWHDPRVPRDLSNINCEELGP
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 LPPGWEIRNTATGRVYFVDHNNRTTQFTDPRLSANLHLVLNRQNQLKDQQQQQVVSLCPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LPPGWEIRNTATGRVYFVDHNNRTTQFTDPRLSANLHLVLNRQNQLKDQQQQQVVSLCPD
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 DTECLTVPRYKRDLVQKLKILRQELSQQQPQAGHCRIEVSREEIFEESYRQVMKMRPKDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DTECLTVPRYKRDLVQKLKILRQELSQQQPQAGHCRIEVSREEIFEESYRQVMKMRPKDL
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 WKRLMIKFRGEEGLDYGGVAREWLYLLSHEMLNPYYGLFQYSRDDIYTLQINPDSAVNPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 WKRLMIKFRGEEGLDYGGVAREWLYLLSHEMLNPYYGLFQYSRDDIYTLQINPDSAVNPE
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KB8 HLSYFHFVGRIMGMAVFHGHYIDGGFTLPFYKQLLGKSITLDDMELVDPDLHNSLVWILE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HLSYFHFVGRIMGMAVFHGHYIDGGFTLPFYKQLLGKSITLDDMELVDPDLHNSLVWILE
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KB8 NDITGVLDHTFCVEHNAYGEIIQHELKPNGKSIPVNEENKKEYVRLYVNWRFLRGIEAQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NDITGVLDHTFCVEHNAYGEIIQHELKPNGKSIPVNEENKKEYVRLYVNWRFLRGIEAQF
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KB8 LALQKGFNEVIPQHLLKTFDEKELELIICGLGKIDVNDWKVNTRLKHCTPDSNIVKWFWK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LALQKGFNEVIPQHLLKTFDEKELELIICGLGKIDVNDWKVNTRLKHCTPDSNIVKWFWK
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KB8 AVEFFDEERRARLLQFVTGSSRVPLQGFKALQGAAGPRLFTIHQIDACTNNLPKAHTCFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AVEFFDEERRARLLQFVTGSSRVPLQGFKALQGAAGPRLFTIHQIDACTNNLPKAHTCFN
670 680 690 700 710 720
720 730 740
pF1KB8 RIDIPPYESYEKLYEKLLTAIEETCGFAVE
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RIDIPPYESYEKLYEKLLTAIEETCGFAVE
730 740 750
>>XP_005257642 (OMIM: 605532) PREDICTED: E3 ubiquitin-pr (735 aa)
initn: 4963 init1: 4963 opt: 4963 Z-score: 3914.7 bits: 735.0 E(85289): 2.6e-211
Smith-Waterman score: 5039; 98.1% identity (98.1% similar) in 748 aa overlap (1-748:1-735)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSNPGGRRNGPVKLRLTVLCAKNLVKKDFFRLPDPFAKVVVDGSGQCHSTDTVKNTLDPK
::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MSNPGGRRNGPVKLRLT-------------GLPDPFAKVVVDGSGQCHSTDTVKNTLDPK
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 WNQHYDLYIGKSDSVTISVWNHKKIHKKQGAGFLGCVRLLSNAINRLKDTGYQRLDLCKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 WNQHYDLYIGKSDSVTISVWNHKKIHKKQGAGFLGCVRLLSNAINRLKDTGYQRLDLCKL
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 GPNDNDTVRGQIVVSLQSRDRIGTGGQVVDCSRLFDNDLPDGWEERRTASGRIQYLNHIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GPNDNDTVRGQIVVSLQSRDRIGTGGQVVDCSRLFDNDLPDGWEERRTASGRIQYLNHIT
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 RTTQWERPTRPASEYSSPGRPLSCFVDENTPISGTNGATCGQSSDPRLAERRVRSQRHRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RTTQWERPTRPASEYSSPGRPLSCFVDENTPISGTNGATCGQSSDPRLAERRVRSQRHRN
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 YMSRTHLHTPPDLPEGYEQRTTQQGQVYFLHTQTGVSTWHDPRVPRDLSNINCEELGPLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 YMSRTHLHTPPDLPEGYEQRTTQQGQVYFLHTQTGVSTWHDPRVPRDLSNINCEELGPLP
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 PGWEIRNTATGRVYFVDHNNRTTQFTDPRLSANLHLVLNRQNQLKDQQQQQVVSLCPDDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PGWEIRNTATGRVYFVDHNNRTTQFTDPRLSANLHLVLNRQNQLKDQQQQQVVSLCPDDT
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 ECLTVPRYKRDLVQKLKILRQELSQQQPQAGHCRIEVSREEIFEESYRQVMKMRPKDLWK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ECLTVPRYKRDLVQKLKILRQELSQQQPQAGHCRIEVSREEIFEESYRQVMKMRPKDLWK
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 RLMIKFRGEEGLDYGGVAREWLYLLSHEMLNPYYGLFQYSRDDIYTLQINPDSAVNPEHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RLMIKFRGEEGLDYGGVAREWLYLLSHEMLNPYYGLFQYSRDDIYTLQINPDSAVNPEHL
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 SYFHFVGRIMGMAVFHGHYIDGGFTLPFYKQLLGKSITLDDMELVDPDLHNSLVWILEND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SYFHFVGRIMGMAVFHGHYIDGGFTLPFYKQLLGKSITLDDMELVDPDLHNSLVWILEND
470 480 490 500 510 520
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pF1KB8 ITGVLDHTFCVEHNAYGEIIQHELKPNGKSIPVNEENKKEYVRLYVNWRFLRGIEAQFLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ITGVLDHTFCVEHNAYGEIIQHELKPNGKSIPVNEENKKEYVRLYVNWRFLRGIEAQFLA
530 540 550 560 570 580
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 LQKGFNEVIPQHLLKTFDEKELELIICGLGKIDVNDWKVNTRLKHCTPDSNIVKWFWKAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LQKGFNEVIPQHLLKTFDEKELELIICGLGKIDVNDWKVNTRLKHCTPDSNIVKWFWKAV
590 600 610 620 630 640
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 EFFDEERRARLLQFVTGSSRVPLQGFKALQGAAGPRLFTIHQIDACTNNLPKAHTCFNRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EFFDEERRARLLQFVTGSSRVPLQGFKALQGAAGPRLFTIHQIDACTNNLPKAHTCFNRI
650 660 670 680 690 700
730 740
pF1KB8 DIPPYESYEKLYEKLLTAIEETCGFAVE
::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DIPPYESYEKLYEKLLTAIEETCGFAVE
710 720 730
>>XP_016867946 (OMIM: 605568) PREDICTED: E3 ubiquitin-pr (754 aa)
initn: 3931 init1: 2334 opt: 3555 Z-score: 2808.2 bits: 530.3 E(85289): 1.1e-149
Smith-Waterman score: 3829; 72.6% identity (83.4% similar) in 789 aa overlap (1-748:1-754)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MSNPGGRRNGP-VKLRLTVLCAKNLVKKDFFRLPDPFAKVVVDGSGQCHSTDTVKNTLDP
::::: :::: .:.::::::::::.:::::::::::::.::::::::::::::::::::
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pF1KB8 KWNQHYDLYIGKSDSVTISVWNHKKIHKKQGAGFLGCVRLLSNAINRLKDTGYQRLDLCK
:::::::::.::.::.:::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
XP_016 KWNQHYDLYVGKTDSITISVWNHKKIHKKQGAGFLGCVRLLSNAISRLKDTGYQRLDLCK
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pF1KB8 LGPNDNDTVRGQIVVSLQSRDRIGTGGQVVDCSRLFDNDLPDGWEERRTASGRIQYLNHI
:.:.:.:.::::::::::.::::::::.:::: :..:. : .
XP_016 LNPSDTDAVRGQIVVSLQTRDRIGTGGSVVDCRGLLENE------------GTVY-----
130 140 150 160
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pF1KB8 TRTTQWERPTRPASEYSSPGRPLSCFVDENTPISGTNGATCG---------QSSDPRLAE
: :.::::::::..: .: . ..::. : :.: ::
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.:.:. :. . .: : : :.:::::::::: ::::::::::::::::::::.:
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210 220 230 240 250 260
290 300 310 320
pF1KB8 -------------------------RDLSNINCEELGPLPPGWEIRNTATGRVYFVDHNN
:::...::.::::::::::.:.:..::.:::::::
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pF1KB8 RTTQFTDPRLSANLHLVLNRQNQLKDQQQQ-QVVSLCPDDTECLTVPRYKRDLVQKLKIL
:::::::::: : ..:.: :::. .: . : . : : . ::.::::::::.:
XP_016 RTTQFTDPRL----HHIMNHQCQLKEPSQPLPLPSEGSLEDEELPAQRYERDLVQKLKVL
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:.::: ::::::::::::::::::::::::.:::::::: ::::.:::::::::::::::
XP_016 RHELSLQQPQAGHCRIEVSREEIFEESYRQIMKMRPKDLKKRLMVKFRGEEGLDYGGVAR
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pF1KB8 EWLYLLSHEMLNPYYGLFQYSRDDIYTLQINPDSAVNPEHLSYFHFVGRIMGMAVFHGHY
:::::: :::::::::::::: :.:: :::::::..::.:::::::::::::.:::::::
XP_016 EWLYLLCHEMLNPYYGLFQYSTDNIYMLQINPDSSINPDHLSYFHFVGRIMGLAVFHGHY
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pF1KB8 IDGGFTLPFYKQLLGKSITLDDMELVDPDLHNSLVWILENDITGVLDHTFCVEHNAYGEI
:.::::.::::::::: : :.:.: :::.::.::::::::::: ::::::::::::.:.:
XP_016 INGGFTVPFYKQLLGKPIQLSDLESVDPELHKSLVWILENDITPVLDHTFCVEHNAFGRI
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pF1KB8 IQHELKPNGKSIPVNEENKKEYVRLYVNWRFLRGIEAQFLALQKGFNEVIPQHLLKTFDE
.::::::::...::.::::::::::::::::.::::::::::::::::.::::::: ::.
XP_016 LQHELKPNGRNVPVTEENKKEYVRLYVNWRFMRGIEAQFLALQKGFNELIPQHLLKPFDQ
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pF1KB8 KELELIICGLGKIDVNDWKVNTRLKHCTPDSNIVKWFWKAVEFFDEERRARLLQFVTGSS
::::::: :: :::.:::: :::::::. :::::.:::.::: ::::::::::::::::.
XP_016 KELELIIGGLDKIDLNDWKSNTRLKHCVADSNIVRWFWQAVETFDEERRARLLQFVTGST
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pF1KB8 RVPLQGFKALQGAAGPRLFTIHQIDACTNNLPKAHTCFNRIDIPPYESYEKLYEKLLTAI
:::::::::::::::::::::: ::: :.::::::::::::::::::::::::::::::.
XP_016 RVPLQGFKALQGAAGPRLFTIHLIDANTDNLPKAHTCFNRIDIPPYESYEKLYEKLLTAV
690 700 710 720 730 740
740
pF1KB8 EETCGFAVE
:::::::::
XP_016 EETCGFAVE
750
>>NP_065162 (OMIM: 605568) E3 ubiquitin-protein ligase S (757 aa)
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Smith-Waterman score: 3813; 72.3% identity (83.1% similar) in 792 aa overlap (1-748:1-757)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MSNPGGRRNGP-VKLRLTVLCAKNLVKKDFFRLPDPFAKVVVDGSGQCHSTDTVKNTLDP
::::: :::: .:.::::::::::.:::::::::::::.::::::::::::::::::::
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pF1KB8 KWNQHYDLYIGKSDSVTISVWNHKKIHKKQGAGFLGCVRLLSNAINRLKDTGYQRLDLCK
:::::::::.::.::.:::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
NP_065 KWNQHYDLYVGKTDSITISVWNHKKIHKKQGAGFLGCVRLLSNAISRLKDTGYQRLDLCK
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120 130 140 150 160 170
pF1KB8 LGPNDNDTVRGQIVVSLQSRDRIGTGGQVVDCSRLFDNDLPDGWEERRTASGRIQYLNHI
:.:.:.:.::::::::::.::::::::.:::: :..:. : .
NP_065 LNPSDTDAVRGQIVVSLQTRDRIGTGGSVVDCRGLLENE------------GTVY-----
130 140 150 160
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pF1KB8 TRTTQWERPTRPASEYSSPGRPLSCFVDENTPISGTNGATCG---------QSSDPRLAE
: :.::::::::..: .: . ..::. : :.: ::
NP_065 --------------EDSGPGRPLSCFMEEPAPYTDSTGAAAGGGNCRFVESPSQDQRLQA
170 180 190 200
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pF1KB8 RRVRSQRHRNYM----SRTHLHTPPDLPEGYEQRTTQQGQVYFLHTQTGVSTWHDPRVP-
.:.:. :. . .: : : :.:::::::::: ::::::::::::::::::::.:
NP_065 QRLRNPDVRGSLQTPQNRPHGHQSPELPEGYEQRTTVQGQVYFLHTQTGVSTWHDPRIPS
210 220 230 240 250 260
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pF1KB8 -------------------------RDLSNINCEELGPLPPGWEIRNTATGRVYFVDHNN
:::...::.::::::::::.:.:..::.:::::::
NP_065 PSGTIPGGDAAFLYEFLLQGHTSEPRDLNSVNCDELGPLPPGWEVRSTVSGRIYFVDHNN
270 280 290 300 310 320
330 340 350 360 370
pF1KB8 RTTQFTDPRLSANLHLVLNRQNQLKDQQQQ-QVVSLCPDDTECLTVPRYKRDLVQKLKIL
:::::::::: : ..:.: :::. .: . : . : : . ::.::::::::.:
NP_065 RTTQFTDPRL----HHIMNHQCQLKEPSQPLPLPSEGSLEDEELPAQRYERDLVQKLKVL
330 340 350 360 370 380
380 390 400 410 420 430
pF1KB8 RQELSQQQPQAGHCRIEVSREEIFEESYRQVMKMRPKDLWKRLMIKFRGEEGLDYGGVAR
:.::: ::::::::::::::::::::::::.:::::::: ::::.:::::::::::::::
NP_065 RHELSLQQPQAGHCRIEVSREEIFEESYRQIMKMRPKDLKKRLMVKFRGEEGLDYGGVAR
390 400 410 420 430 440
440 450 460 470 480 490
pF1KB8 EWLYLLSHEMLNPYYGLFQYSRDDIYTLQINPDSAVNPEHLSYFHFVGRIMGMAVFHGHY
:::::: :::::::::::::: :.:: :::::::..::.:::::::::::::.:::::::
NP_065 EWLYLLCHEMLNPYYGLFQYSTDNIYMLQINPDSSINPDHLSYFHFVGRIMGLAVFHGHY
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pF1KB8 IDGGFTLPFYKQLLGKSITLDDMELVDPDLHNSLVWILENDITGVLDHTFCVEHNAYGEI
:.::::.::::::::: : :.:.: :::.::.::::::::::: ::::::::::::.:.:
NP_065 INGGFTVPFYKQLLGKPIQLSDLESVDPELHKSLVWILENDITPVLDHTFCVEHNAFGRI
510 520 530 540 550 560
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pF1KB8 IQHELKPNGKSIPVNEENKKEYVRLYVNWRFLRGIEAQFLALQKGFNEVIPQHLLKTFDE
.::::::::...::.::::::::::::::::.::::::::::::::::.::::::: ::.
NP_065 LQHELKPNGRNVPVTEENKKEYVRLYVNWRFMRGIEAQFLALQKGFNELIPQHLLKPFDQ
570 580 590 600 610 620
620 630 640 650 660 670
pF1KB8 KELELIICGLGKIDVNDWKVNTRLKHCTPDSNIVKWFWKAVEFFDEERRARLLQFVTGSS
::::::: :: :::.:::: :::::::. :::::.:::.::: ::::::::::::::::.
NP_065 KELELIIGGLDKIDLNDWKSNTRLKHCVADSNIVRWFWQAVETFDEERRARLLQFVTGST
630 640 650 660 670 680
680 690 700 710 720 730
pF1KB8 RVPLQGFKALQG---AAGPRLFTIHQIDACTNNLPKAHTCFNRIDIPPYESYEKLYEKLL
:::::::::::: :::::::::: ::: :.::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 RVPLQGFKALQGSTGAAGPRLFTIHLIDANTDNLPKAHTCFNRIDIPPYESYEKLYEKLL
690 700 710 720 730 740
740
pF1KB8 TAIEETCGFAVE
::.:::::::::
NP_065 TAVEETCGFAVE
750
>>NP_001186776 (OMIM: 605568) E3 ubiquitin-protein ligas (728 aa)
initn: 3903 init1: 2334 opt: 2935 Z-score: 2321.2 bits: 440.1 E(85289): 1.5e-122
Smith-Waterman score: 3891; 75.1% identity (86.2% similar) in 763 aa overlap (1-748:1-728)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MSNPGGRRNGP-VKLRLTVLCAKNLVKKDFFRLPDPFAKVVVDGSGQCHSTDTVKNTLDP
::::: :::: .:.::::::::::.:::::::::::::.::::::::::::::::::::
NP_001 MSNPGTRRNGSSIKIRLTVLCAKNLAKKDFFRLPDPFAKIVVDGSGQCHSTDTVKNTLDP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 KWNQHYDLYIGKSDSVTISVWNHKKIHKKQGAGFLGCVRLLSNAINRLKDTGYQRLDLCK
:::::::::.::.::.:::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
NP_001 KWNQHYDLYVGKTDSITISVWNHKKIHKKQGAGFLGCVRLLSNAISRLKDTGYQRLDLCK
70 80 90 100 110 120
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pF1KB8 LGPNDNDTVRGQIVVSLQSRDRIGTGGQVVDCSRLFDNDLPDGWEERRTASGRIQYLNHI
:.:.:.:.::::::::::.::::::::.:::: :..:. : .
NP_001 LNPSDTDAVRGQIVVSLQTRDRIGTGGSVVDCRGLLENE------------GTVY-----
130 140 150 160
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pF1KB8 TRTTQWERPTRPASEYSSPGRPLSCFVDENTPISGTNGATCG---------QSSDPRLAE
: :.::::::::..: .: . ..::. : :.: ::
NP_001 --------------EDSGPGRPLSCFMEEPAPYTDSTGAAAGGGNCRFVESPSQDQRLQA
170 180 190 200
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pF1KB8 RRVRSQRHRNYM----SRTHLHTPPDLPEGYEQRTTQQGQVYFLHTQTGVSTWHDPRVPR
.:.:. :. . .: : : :.:::::::::: ::::::::::::::::::::.::
NP_001 QRLRNPDVRGSLQTPQNRPHGHQSPELPEGYEQRTTVQGQVYFLHTQTGVSTWHDPRIPR
210 220 230 240 250 260
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pF1KB8 DLSNINCEELGPLPPGWEIRNTATGRVYFVDHNNRTTQFTDPRLSANLHLVLNRQNQLKD
::...::.::::::::::.:.:..::.::::::::::::::::: : ..:.: :::.
NP_001 DLNSVNCDELGPLPPGWEVRSTVSGRIYFVDHNNRTTQFTDPRL----HHIMNHQCQLKE
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pF1KB8 QQQQ-QVVSLCPDDTECLTVPRYKRDLVQKLKILRQELSQQQPQAGHCRIEVSREEIFEE
.: . : . : : . ::.::::::::.::.::: ::::::::::::::::::::
NP_001 PSQPLPLPSEGSLEDEELPAQRYERDLVQKLKVLRHELSLQQPQAGHCRIEVSREEIFEE
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pF1KB8 SYRQVMKMRPKDLWKRLMIKFRGEEGLDYGGVAREWLYLLSHEMLNPYYGLFQYSRDDIY
::::.:::::::: ::::.::::::::::::::::::::: :::::::::::::: :.::
NP_001 SYRQIMKMRPKDLKKRLMVKFRGEEGLDYGGVAREWLYLLCHEMLNPYYGLFQYSTDNIY
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pF1KB8 TLQINPDSAVNPEHLSYFHFVGRIMGMAVFHGHYIDGGFTLPFYKQLLGKSITLDDMELV
:::::::..::.:::::::::::::.::::::::.::::.::::::::: : :.:.: :
NP_001 MLQINPDSSINPDHLSYFHFVGRIMGLAVFHGHYINGGFTVPFYKQLLGKPIQLSDLESV
450 460 470 480 490 500
530 540 550 560 570 580
pF1KB8 DPDLHNSLVWILENDITGVLDHTFCVEHNAYGEIIQHELKPNGKSIPVNEENKKEYVRLY
::.::.::::::::::: ::::::::::::.:.:.::::::::...::.:::::::::::
NP_001 DPELHKSLVWILENDITPVLDHTFCVEHNAFGRILQHELKPNGRNVPVTEENKKEYVRLY
510 520 530 540 550 560
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pF1KB8 VNWRFLRGIEAQFLALQKGFNEVIPQHLLKTFDEKELELIICGLGKIDVNDWKVNTRLKH
:::::.::::::::::::::::.::::::: ::.::::::: :: :::.:::: ::::::
NP_001 VNWRFMRGIEAQFLALQKGFNELIPQHLLKPFDQKELELIIGGLDKIDLNDWKSNTRLKH
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pF1KB8 CTPDSNIVKWFWKAVEFFDEERRARLLQFVTGSSRVPLQGFKALQGAAGPRLFTIHQIDA
:. :::::.:::.::: ::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::: :::
NP_001 CVADSNIVRWFWQAVETFDEERRARLLQFVTGSTRVPLQGFKALQGAAGPRLFTIHLIDA
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pF1KB8 CTNNLPKAHTCFNRIDIPPYESYEKLYEKLLTAIEETCGFAVE
:.::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::
NP_001 NTDNLPKAHTCFNRIDIPPYESYEKLYEKLLTAVEETCGFAVE
690 700 710 720
>>NP_851994 (OMIM: 605568) E3 ubiquitin-protein ligase S (731 aa)
initn: 3552 init1: 1983 opt: 2919 Z-score: 2308.6 bits: 437.8 E(85289): 7.5e-122
Smith-Waterman score: 3875; 74.8% identity (85.9% similar) in 766 aa overlap (1-748:1-731)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MSNPGGRRNGP-VKLRLTVLCAKNLVKKDFFRLPDPFAKVVVDGSGQCHSTDTVKNTLDP
::::: :::: .:.::::::::::.:::::::::::::.::::::::::::::::::::
NP_851 MSNPGTRRNGSSIKIRLTVLCAKNLAKKDFFRLPDPFAKIVVDGSGQCHSTDTVKNTLDP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 KWNQHYDLYIGKSDSVTISVWNHKKIHKKQGAGFLGCVRLLSNAINRLKDTGYQRLDLCK
:::::::::.::.::.:::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
NP_851 KWNQHYDLYVGKTDSITISVWNHKKIHKKQGAGFLGCVRLLSNAISRLKDTGYQRLDLCK
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 LGPNDNDTVRGQIVVSLQSRDRIGTGGQVVDCSRLFDNDLPDGWEERRTASGRIQYLNHI
:.:.:.:.::::::::::.::::::::.:::: :..:. : .
NP_851 LNPSDTDAVRGQIVVSLQTRDRIGTGGSVVDCRGLLENE------------GTVY-----
130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 TRTTQWERPTRPASEYSSPGRPLSCFVDENTPISGTNGATCG---------QSSDPRLAE
: :.::::::::..: .: . ..::. : :.: ::
NP_851 --------------EDSGPGRPLSCFMEEPAPYTDSTGAAAGGGNCRFVESPSQDQRLQA
170 180 190 200
240 250 260 270 280
pF1KB8 RRVRSQRHRNYM----SRTHLHTPPDLPEGYEQRTTQQGQVYFLHTQTGVSTWHDPRVPR
.:.:. :. . .: : : :.:::::::::: ::::::::::::::::::::.::
NP_851 QRLRNPDVRGSLQTPQNRPHGHQSPELPEGYEQRTTVQGQVYFLHTQTGVSTWHDPRIPR
210 220 230 240 250 260
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 DLSNINCEELGPLPPGWEIRNTATGRVYFVDHNNRTTQFTDPRLSANLHLVLNRQNQLKD
::...::.::::::::::.:.:..::.::::::::::::::::: : ..:.: :::.
NP_851 DLNSVNCDELGPLPPGWEVRSTVSGRIYFVDHNNRTTQFTDPRL----HHIMNHQCQLKE
270 280 290 300 310 320
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pF1KB8 QQQQ-QVVSLCPDDTECLTVPRYKRDLVQKLKILRQELSQQQPQAGHCRIEVSREEIFEE
.: . : . : : . ::.::::::::.::.::: ::::::::::::::::::::
NP_851 PSQPLPLPSEGSLEDEELPAQRYERDLVQKLKVLRHELSLQQPQAGHCRIEVSREEIFEE
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pF1KB8 SYRQVMKMRPKDLWKRLMIKFRGEEGLDYGGVAREWLYLLSHEMLNPYYGLFQYSRDDIY
::::.:::::::: ::::.::::::::::::::::::::: :::::::::::::: :.::
NP_851 SYRQIMKMRPKDLKKRLMVKFRGEEGLDYGGVAREWLYLLCHEMLNPYYGLFQYSTDNIY
390 400 410 420 430 440
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pF1KB8 TLQINPDSAVNPEHLSYFHFVGRIMGMAVFHGHYIDGGFTLPFYKQLLGKSITLDDMELV
:::::::..::.:::::::::::::.::::::::.::::.::::::::: : :.:.: :
NP_851 MLQINPDSSINPDHLSYFHFVGRIMGLAVFHGHYINGGFTVPFYKQLLGKPIQLSDLESV
450 460 470 480 490 500
530 540 550 560 570 580
pF1KB8 DPDLHNSLVWILENDITGVLDHTFCVEHNAYGEIIQHELKPNGKSIPVNEENKKEYVRLY
::.::.::::::::::: ::::::::::::.:.:.::::::::...::.:::::::::::
NP_851 DPELHKSLVWILENDITPVLDHTFCVEHNAFGRILQHELKPNGRNVPVTEENKKEYVRLY
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NP_851 CVADSNIVRWFWQAVETFDEERRARLLQFVTGSTRVPLQGFKALQGSTGAAGPRLFTIHL
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NP_851 IDANTDNLPKAHTCFNRIDIPPYESYEKLYEKLLTAVEETCGFAVE
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.: .. : :: : : ..:. :.. . .. :..
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:. ...: ..::::::::: : ::....::.... .: : :. . .. .:
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.: . :. . : .:: :.:.. :: .:..:.. .. .... :..:::
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: :: . .::: :::::: : :: ::.... .:. : .:::::. : :..:::.::.
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.: . :. . : .:: :.:.. :: .:..:.. .. .... :..:::
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pF1KB8 ELVDPDLHNSLVWILENDITGVLDHTFCVEHNAYGEIIQHELKPNGKSIPVNEENKKEYV
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130 140 150 160 170 180
pF1KB8 RGQIVVSLQSRDRIGTGGQVVDCSRLFDNDLPDGWEERRTASGRIQYLNHITRTTQWERP
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330 340 350 360 370 380
190 200 210 220 230
pF1KB8 TRPASEYSSPG---------------RPLSC---FVDENTPISGTNGATCGQSSDPRLAE
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XP_005 IMQLAEDGASGSATNSNNHLIEPQIRRPRSLSSPTVTLSAPLEGAKDSPVRRAVKDTLSN
390 400 410 420 430 440
240 250 260 270 280
pF1KB8 RRVRSQRHRNYMSRTHLHTPPDLPEGYEQRTTQQGQVYFLHTQTGVSTWHDPRV--P---
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XP_005 PQSPQPSPYNSPKPQHKVTQSFLPPGWEMRIAPNGRPFFIDHNTKTTTWEDPRLKFPVHM
450 460 470 480 490 500
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 RDLSNINCEELGPLPPGWEIRNTATGRVYFVDHNNRTT-QFTDPRLSANLHLVLNRQNQL
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XP_005 RSKTSLNPNDLGPLPPGWEERIHLDGRTFYIDHSSQVLCGENDTRESVPSY--DSKITQW
510 520 530 540 550 560
350 360 370 380 390 400
pF1KB8 KDQQQQQVVSLCPDDTECLTVPRYKRDLVQKLKILRQELSQQQPQAGHCRIEVSREEIFE
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XP_005 EDPRLQNPAITGP------AVP-YSREFKQKYDYFRKKLKKPADIPNRFEMKLHRNNIFE
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410 420 430 440 450 460
pF1KB8 ESYRQVMKM-RPKDLWKRLMIKFRGEEGLDYGGVAREWLYLLSHEMLNPYYGLFQYSRDD
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XP_005 ESYRRIMSVKRPDVLKARLWIEFESEKGLDYGGVAREWFFLLSKEMFNPYYGLFEYSATD
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470 480 490 500 510 520
pF1KB8 IYTLQINPDSAV-NPEHLSYFHFVGRIMGMAVFHGHYIDGGFTLPFYKQLLGKSITLDDM
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XP_005 NYTLQINPNSGLCNEDHLSYFTFIGRVAGLAVFHGKLLDGFFIRPFYKMMLGKQITLNDM
680 690 700 710 720 730
530 540 550 560 570 580
pF1KB8 ELVDPDLHNSLVWILENDITGVLDHTFCVEHNAYGEIIQHELKPNGKSIPVNEENKKEYV
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XP_005 ESVDSEYYNSLKWILENDPTE-LDLMFCIDEENFGQTYQVDLKPNGSEIMVTNENKREYI
740 750 760 770 780 790
590 600 610 620 630 640
pF1KB8 RLYVNWRFLRGIEAQFLALQKGFNEVIPQHLLKTFDEKELELIICGLGKIDVNDWKVNTR
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XP_005 DLVIQWRFVNRVQKQMNAFLEGFTELLPIDLIKIFDENELELLMCGLGDVDVNDWRQHSI
800 810 820 830 840 850
650 660 670 680 690 700
pF1KB8 LK--HCTPDSNIVKWFWKAVEFFDEERRARLLQFVTGSSRVPLQGFKALQGAAGPRLFTI
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XP_005 YKNGYC-PNHPVIQWFWKAVLLMDAEKRIRLLQFVTGTSRVPMNGFAELYGSNGPQLFTI
860 870 880 890 900 910
710 720 730 740
pF1KB8 HQIDACTNNLPKAHTCFNRIDIPPYESYEKLYEKLLTAIEETCGFAVE
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XP_005 EQWGS-PEKLPRAHTCFNRLDLPPYETFEDLREKLLMAVENAQGFEGVD
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748 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]