Result of FASTA (omim) for pF1KB5499
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5499, 1609 aa
  1>>>pF1KB5499 1609 - 1609 aa - 1609 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.2118+/-0.000699; mu= -4.1852+/- 0.043
 mean_var=523.7049+/-106.700, 0's: 0 Z-trim(115.8): 347  B-trim: 0 in 0/55
 Lambda= 0.056044
 statistics sampled from 26120 (26470) to 26120 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.641), E-opt: 0.2 (0.31), width:  16
 Scan time: 12.820

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_002284 (OMIM: 150290) laminin subunit gamma-1 p (1609) 11174 920.9       0
XP_011516423 (OMIM: 604349,614115) PREDICTED: lami (1581) 4745 401.1 3.9e-110
NP_006050 (OMIM: 604349,614115) laminin subunit ga (1575) 4558 386.0 1.4e-105
XP_006716984 (OMIM: 604349,614115) PREDICTED: lami (1259) 4520 382.8  1e-104
XP_016856762 (OMIM: 150292,226650,226700) PREDICTE ( 742) 2508 219.8 6.8e-56
NP_061486 (OMIM: 150292,226650,226700) laminin sub (1111) 2508 220.1 8.7e-56
NP_005553 (OMIM: 150292,226650,226700) laminin sub (1193) 2508 220.1 9.1e-56
XP_006721658 (OMIM: 601614) PREDICTED: netrin-1 is ( 604) 1548 142.1 1.4e-32
NP_004813 (OMIM: 601614) netrin-1 precursor [Homo  ( 604) 1548 142.1 1.4e-32
NP_002282 (OMIM: 150240,615191) laminin subunit be (1786) 1209 115.3 4.9e-24
XP_016867690 (OMIM: 150240,615191) PREDICTED: lami (1810) 1209 115.3 4.9e-24
XP_011523958 (OMIM: 150320,615960) PREDICTED: lami (2561) 1211 115.6 5.5e-24
NP_031382 (OMIM: 616380) laminin subunit beta-4 is (1761) 1186 113.4 1.7e-23
NP_001304975 (OMIM: 616380) laminin subunit beta-4 (1761) 1186 113.4 1.7e-23
XP_011514280 (OMIM: 616380) PREDICTED: laminin sub (1723) 1166 111.8 5.3e-23
XP_016867368 (OMIM: 616380) PREDICTED: laminin sub (1753) 1166 111.8 5.4e-23
XP_011514277 (OMIM: 616380) PREDICTED: laminin sub (1772) 1166 111.8 5.4e-23
XP_011514281 (OMIM: 616380) PREDICTED: laminin sub (1703) 1158 111.1 8.2e-23
XP_011514282 (OMIM: 616380) PREDICTED: laminin sub (1564) 1114 107.5 9.2e-22
XP_016867369 (OMIM: 616380) PREDICTED: laminin sub (1567) 1114 107.5 9.2e-22
XP_005265184 (OMIM: 150325,609049,614199) PREDICTE (1798) 1103 106.7 1.9e-21
NP_002283 (OMIM: 150325,609049,614199) laminin sub (1798) 1103 106.7 1.9e-21
NP_006172 (OMIM: 602349) netrin-3 precursor [Homo  ( 580) 1055 102.2 1.3e-20
XP_016881232 (OMIM: 226650,226700,245660,600805) P (2626) 1030 101.0 1.4e-19
XP_016866341 (OMIM: 156225,607855) PREDICTED: lami (2587) 1013 99.6 3.6e-19
XP_011523959 (OMIM: 150320,615960) PREDICTED: lami (2489)  925 92.5 4.9e-17
NP_005550 (OMIM: 150320,615960) laminin subunit al (3075)  925 92.6 5.6e-17
XP_011523957 (OMIM: 150320,615960) PREDICTED: lami (3085)  925 92.6 5.6e-17
XP_016867691 (OMIM: 150240,615191) PREDICTED: lami (1212)  909 90.8 7.6e-17
XP_011527120 (OMIM: 601033) PREDICTED: laminin sub (3654)  853 86.9 3.5e-15
NP_005520 (OMIM: 142461,224410,255800) basement me (4391)  840 85.9 8.2e-15
NP_001278789 (OMIM: 142461,224410,255800) basement (4392)  840 85.9 8.2e-15
XP_016856611 (OMIM: 142461,224410,255800) PREDICTE (4438)  840 85.9 8.3e-15
XP_016856610 (OMIM: 142461,224410,255800) PREDICTE (4439)  840 85.9 8.3e-15
XP_016856609 (OMIM: 142461,224410,255800) PREDICTE (4456)  840 85.9 8.3e-15
XP_011539620 (OMIM: 142461,224410,255800) PREDICTE (4574)  840 85.9 8.4e-15
XP_011527121 (OMIM: 601033) PREDICTED: laminin sub (3609)  836 85.5 9.1e-15
XP_006723861 (OMIM: 601033) PREDICTED: laminin sub (2300)  808 83.0 3.3e-14
NP_005551 (OMIM: 601033) laminin subunit alpha-5 p (3695)  808 83.2 4.4e-14
XP_006723859 (OMIM: 601033) PREDICTED: laminin sub (3700)  808 83.2 4.4e-14
NP_001304976 (OMIM: 616380) laminin subunit beta-4 (1101)  763 79.0 2.6e-13
NP_001289925 (OMIM: 226650,226700,245660,600805) l ( 488)  703 73.7 4.5e-12
NP_001121113 (OMIM: 104530,150310,226650,226700) l (1172)  668 71.3 5.5e-11
NP_001017402 (OMIM: 104530,150310,226650,226700) l (1172)  668 71.3 5.5e-11
NP_000219 (OMIM: 104530,150310,226650,226700) lami (1172)  668 71.3 5.5e-11
XP_005273181 (OMIM: 104530,150310,226650,226700) P (1172)  668 71.3 5.5e-11
NP_009054 (OMIM: 276901,608400,613809) usherin iso (1546)  642 69.4 2.8e-10
NP_996816 (OMIM: 276901,608400,613809) usherin iso (5202)  642 70.0   6e-10
XP_016881233 (OMIM: 226650,226700,245660,600805) P (1856)  608 66.7 2.1e-09
XP_011524284 (OMIM: 226650,226700,245660,600805) P (3243)  602 66.5 4.2e-09


>>NP_002284 (OMIM: 150290) laminin subunit gamma-1 precu  (1609 aa)
 initn: 11174 init1: 11174 opt: 11174  Z-score: 4907.5  bits: 920.9 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 11174; 99.9% identity (99.9% similar) in 1609 aa overlap (1-1609:1-1609)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MRGSHRAAPALRPRGRLWPVLAVLAAAAAAGCAQAAMDECTDEGGRPQRCMPEFVNAAFN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 MRGSHRAAPALRPRGRLWPVLAVLAAAAAAGCAQAAMDECTDEGGRPQRCMPEFVNAAFN
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 VTVVATNTCGTPPEEYCVQTGVTGVTKSCHLCDAGQPHLQHGAAFLTDYNNQADTTWWQS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 VTVVATNTCGTPPEEYCVQTGVTGVTKSCHLCDAGQPHLQHGAAFLTDYNNQADTTWWQS
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 QTMLAGVQYPSSINLTLHLGKAFDITYVRLKFHTSRPESFAIYKRTREDGPWIPYQYYSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 QTMLAGVQYPSSINLTLHLGKAFDITYVRLKFHTSRPESFAIYKRTREDGPWIPYQYYSG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 SCENTYSKANRGFIRTGGDEQQALCTDEFSDISPLTGGNVAFSTLEGRPSAYNFDNSPVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 SCENTYSKANRGFIRTGGDEQQALCTDEFSDISPLTGGNVAFSTLEGRPSAYNFDNSPVL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 QEWVTATDIRVTLNRLNTFGDEVFNDPKVLKSYYYAISDFAVGGRCKCNGHASECMKNEF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 QEWVTATDIRVTLNRLNTFGDEVFNDPKVLKSYYYAISDFAVGGRCKCNGHASECMKNEF
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 DKLVCNCKHNTYGVDCEKCLPFFNDRPWRRATAESASECLPCDCNGRSQECYFDPELYRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 DKLVCNCKHNTYGVDCEKCLPFFNDRPWRRATAESASECLPCDCNGRSQECYFDPELYRS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 TGHGGHCTNCQDNTDGAHCERCRENFFRLGNNEACSSCHCSPVGSLSTQCDSYGRCSCKP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 TGHGGHCTNCQDNTDGAHCERCRENFFRLGNNEACSSCHCSPVGSLSTQCDSYGRCSCKP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 GVMGDKCDRCQPGFHSLTEAGCRPCSCDPSGSIDECNVETGRCVCKDNVEGFNCERCKPG
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::
NP_002 GVMGDKCDRCQPGFHSLTEAGCRPCSCDPSGSIDECNIETGRCVCKDNVEGFNCERCKPG
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB5 FFNLESSNPRGCTPCFCFGHSSVCTNAVGYSVYSISSTFQIDEDGWRAEQRDGSEASLEW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 FFNLESSNPRGCTPCFCFGHSSVCTNAVGYSVYSISSTFQIDEDGWRAEQRDGSEASLEW
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB5 SSERQDIAVISDSYFPRYFIAPAKFLGKQVLSYGQNLSFSFRVDRRDTRLSAEDLVLEGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 SSERQDIAVISDSYFPRYFIAPAKFLGKQVLSYGQNLSFSFRVDRRDTRLSAEDLVLEGA
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB5 GLRVSVPLIAQGNSYPSETTVKYVFRLHEATDYPWRPALTPFEFQKLLNNLTSIKIRGTY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 GLRVSVPLIAQGNSYPSETTVKYVFRLHEATDYPWRPALTPFEFQKLLNNLTSIKIRGTY
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB5 SERSAGYLDDVTLASARPGPGVPATWVESCTCPVGYGGQFCEMCLSGYRRETPNLGPYSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 SERSAGYLDDVTLASARPGPGVPATWVESCTCPVGYGGQFCEMCLSGYRRETPNLGPYSP
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB5 CVLCACNGHSETCDPETGVCNCRDNTAGPHCEKCSDGYYGDSTAGTSSDCQPCPCPGGSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 CVLCACNGHSETCDPETGVCNCRDNTAGPHCEKCSDGYYGDSTAGTSSDCQPCPCPGGSS
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB5 CAVVPKTKEVVCTNCPTGTTGKRCELCDDGYFGDPLGRNGPVRLCRLCQCSDNIDPNAVG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 CAVVPKTKEVVCTNCPTGTTGKRCELCDDGYFGDPLGRNGPVRLCRLCQCSDNIDPNAVG
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB5 NCNRLTGECLKCIYNTAGFYCDRCKDGFFGNPLAPNPADKCKACNCNPYGTMKQQSSCNP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::
NP_002 NCNRLTGECLKCIYNTAGFYCDRCKDGFFGNPLAPNPADKCKACNCNLYGTMKQQSSCNP
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB5 VTGQCECLPHVTGQDCGACDPGFYNLQSGQGCERCDCHALGSTNGQCDIRTGQCECQPGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 VTGQCECLPHVTGQDCGACDPGFYNLQSGQGCERCDCHALGSTNGQCDIRTGQCECQPGI
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KB5 TGQHCERCEVNHFGFGPEGCKPCDCHPEGSLSLQCKDDGRCECREGFVGNRCDQCEENYF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 TGQHCERCEVNHFGFGPEGCKPCDCHPEGSLSLQCKDDGRCECREGFVGNRCDQCEENYF
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KB5 YNRSWPGCQECPACYRLVKDKVADHRVKLQELESLIANLGTGDEMVTDQAFEDRLKEAER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 YNRSWPGCQECPACYRLVKDKVADHRVKLQELESLIANLGTGDEMVTDQAFEDRLKEAER
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KB5 EVMDLLREAQDVKDVDQNLMDRLQRVNNTLSSQISRLQNIRNTIEETGNLAEQARAHVEN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 EVMDLLREAQDVKDVDQNLMDRLQRVNNTLSSQISRLQNIRNTIEETGNLAEQARAHVEN
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KB5 TERLIEIASRELEKAKVAAANVSVTQPESTGDPNNMTLLAEEARKLAERHKQEADDIVRV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 TERLIEIASRELEKAKVAAANVSVTQPESTGDPNNMTLLAEEARKLAERHKQEADDIVRV
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KB5 AKTANDTSTEAYNLLLRTLAGENQTAFEIEELNRKYEQAKNISQDLEKQAARVHEEAKRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 AKTANDTSTEAYNLLLRTLAGENQTAFEIEELNRKYEQAKNISQDLEKQAARVHEEAKRA
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KB5 GDKAVEIYASVAQLSPLDSETLENEANNIKMEAENLEQLIDQKLKDYEDLREDMRGKELE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 GDKAVEIYASVAQLSPLDSETLENEANNIKMEAENLEQLIDQKLKDYEDLREDMRGKELE
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KB5 VKNLLEKGKTEQQTADQLLARADAAKALAEEAAKKGRDTLQEANDILNNLKDFDRRVNDN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 VKNLLEKGKTEQQTADQLLARADAAKALAEEAAKKGRDTLQEANDILNNLKDFDRRVNDN
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KB5 KTAAEEALRKIPAINQTITEANEKTREAQQALGSAAADATEAKNKAHEAERIASAVQKNA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 KTAAEEALRKIPAINQTITEANEKTREAQQALGSAAADATEAKNKAHEAERIASAVQKNA
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KB5 TSTKAEAERTFAEVTDLDNEVNNMLKQLQEAEKELKRKQDDADQDMMMAGMASQAAQEAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 TSTKAEAERTFAEVTDLDNEVNNMLKQLQEAEKELKRKQDDADQDMMMAGMASQAAQEAE
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1510      1520      1530      1540      1550      1560
pF1KB5 INARKAKNSVTSLLSIINDLLEQLGQLDTVDLNKLNEIEGTLNKAKDEMKVSDLDRKVSD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 INARKAKNSVTSLLSIINDLLEQLGQLDTVDLNKLNEIEGTLNKAKDEMKVSDLDRKVSD
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

             1570      1580      1590      1600         
pF1KB5 LENEAKKQEAAIMDYNRDIEEIMKDIRNLEDIRKTLPSGCFNTPSIEKP
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 LENEAKKQEAAIMDYNRDIEEIMKDIRNLEDIRKTLPSGCFNTPSIEKP
             1570      1580      1590      1600         

>>XP_011516423 (OMIM: 604349,614115) PREDICTED: laminin   (1581 aa)
 initn: 4385 init1: 2442 opt: 4745  Z-score: 2098.3  bits: 401.1 E(85289): 3.9e-110
Smith-Waterman score: 4887; 44.1% identity (71.9% similar) in 1602 aa overlap (21-1600:10-1577)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MRGSHRAAPALRPRGRLWPVLAVLAAAAAAGCAQAAMDECTDEGGRPQRCMPEFVNAAFN
                           ::.::  ::.    :.:  : : .::::::.: : ::::.
XP_011            MAAAALLLGLALLAPRAAG----AGMGACYDGAGRPQRCLPVFENAAFG
                          10            20        30        40     

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 VTVVATNTCGTPPEEYCVQTGVTGVTKSCHLCDAGQPHLQHGAAFLTDYNNQADTTWWQS
         . :..:::.:::..: ..:..:.   :. :::..:. .:.:..:::...: ..:::::
XP_011 RLAQASHTCGSPPEDFCPHVGAAGAGAHCQRCDAADPQRHHNASYLTDFHSQDESTWWQS
          50        60        70        80        90       100     

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 QTMLAGVQYPSSINLTLHLGKAFDITYVRLKFHTSRPESFAIYKRTREDGPWIPYQYYSG
        .:  :::::.:.:.::.::::..:::::::::::::::::::::.: :::: :::.::.
XP_011 PSMAFGVQYPTSVNITLRLGKAYEITYVRLKFHTSRPESFAIYKRSRADGPWEPYQFYSA
         110       120       130       140       150       160     

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 SCENTYSKANRGFIRTGGDEQQALCTDEFSDISPLTGGNVAFSTLEGRPSAYNFDNSPVL
       ::..::.. .  ..: : ::. :.::.::::::::.::::::::::::::::::..:: :
XP_011 SCQKTYGRPEGQYLRPGEDERVAFCTSEFSDISPLSGGNVAFSTLEGRPSAYNFEESPGL
         170       180       190       200       210       220     

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 QEWVTATDIRVTLNRLNTFGDEVFNDPKVLKSYYYAISDFAVGGRCKCNGHASECMKNEF
       :::::.:.. ..:.:::::::..:.:::::.:::::.:::.::::::::::::::  .  
XP_011 QEWVTSTELLISLDRLNTFGDDIFKDPKVLQSYYYAVSDFSVGGRCKCNGHASECGPDVA
         230       240       250       260       270       280     

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 DKLVCNCKHNTYGVDCEKCLPFFNDRPWRRATAESASECLPCDCNGRSQECYFDPELYRS
        .:.: :.::: :.:::.:::::.:::: :.:::.: :::::.:.:::.:: :: ::.::
XP_011 GQLACRCQHNTTGTDCERCLPFFQDRPWARGTAEAAHECLPCNCSGRSEECTFDRELFRS
         290       300       310       320       330       340     

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 TGHGGHCTNCQDNTDGAHCERCRENFFRLGNNEACSSCHCSPVGSLSTQCDSYGRCSCKP
       :::::.: .:.:.: : :::::.:::..      :. : :. .:::  :::. : :.:::
XP_011 TGHGGRCHHCRDHTAGPHCERCQENFYHWDPRMPCQPCDCQSAGSLHLQCDDTGTCACKP
         350       360       370       380       390       400     

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 GVMGDKCDRCQPGFHSLTEAGCRPCSCDPSGSIDECNVETGRCVCKDNVEGFNCERCKPG
        : : ::::: ::::::.:.:::::.:.:.::.: :. ..::: ::.::::  :.::.::
XP_011 TVTGWKCDRCLPGFHSLSEGGCRPCTCNPAGSLDTCDPRSGRCPCKENVEGNLCDRCRPG
         410       420       430       440       450       460     

              490       500       510       520       530       540
pF1KB5 FFNLESSNPRGCTPCFCFGHSSVCTNAVGYSVYSISSTFQIDEDGWRAEQRDGSEASLEW
        :::.  :: ::. :::.:::.::.... ..:. : : :.   .:: :..  :::   .:
XP_011 TFNLQPHNPAGCSSCFCYGHSKVCASTAQFQVHHILSDFHQGAEGWWARSVGGSEHPPQW
         470       480       490       500       510       520     

              550       560       570       580       590       600
pF1KB5 SSERQDIAVISDSYFPRYFIAPAKFLGKQVLSYGQNLSFSFRVDRRDTRLSAEDLVLEGA
       : .    .:. .    . . :: :::: : .:::: : ..:::   :. : .. : :::.
XP_011 SPN----GVLLSPEDEEELTAPEKFLGDQRFSYGQPLILTFRVPPGDSPLPVQ-LRLEGT
             530       540       550       560       570        580

              610           620       630       640       650      
pF1KB5 GLRVSVPLIA----QGNSYPSETTVKYVFRLHEATDYPWRPALTPFEFQKLLNNLTSIKI
       :: .:.   .    :  ..: :. ..  :.:.:...    : : ::.::.:: ::::...
XP_011 GLALSLRHSSLSGPQDAGHPREVELR--FHLQETSE-DVAPPLPPFHFQRLLANLTSLRL
              590       600         610        620       630       

        660         670       680       690       700       710    
pF1KB5 RGTYSERSAG--YLDDVTLASARPGPGVPATWVESCTCPVGYGGQFCEMCLSGYRRETPN
       : . .   ::  .: .: :.::::: . ::.::: :.::.:: ::::: :  ::.:: :.
XP_011 RVSPGPSPAGPVFLTEVRLTSARPGLSPPASWVEICSCPTGYTGQFCESCAPGYKREMPQ
       640       650       660       670       680       690       

          720       730       740       750       760       770    
pF1KB5 LGPYSPCVLCACNGHSETCDPETGVCNCRDNTAGPHCEKCSDGYYGDSTAGTSSDCQPCP
        :::. :: :.:: :. ::::.::.: :  .: :: ::.:  :.::.  :: ..::::::
XP_011 GGPYASCVPCTCNQHG-TCDPNTGICVCSHHTEGPSCERCLPGFYGNPFAGQADDCQPCP
       700       710        720       730       740       750      

          780       790       800       810       820       830    
pF1KB5 CPGGSSCAVVPKTKEVVCTNCPTGTTGKRCELCDDGYFGDPLGRNGPVRLCRLCQCSDNI
       ::: :.:...:...:::::.:: :  :.:::.::::.::::::  :  . :. :::: :.
XP_011 CPGQSACTTIPESREVVCTHCPPGQRGRRCEVCDDGFFGDPLGLFGHPQPCHQCQCSGNV
        760       770       780       790       800       810      

          840       850       860       870       880       890    
pF1KB5 DPNAVGNCNRLTGECLKCIYNTAGFYCDRCKDGFFGNPLAPNPADKCKACNCNPYGTMKQ
       ::::::::. :.:.::.:..::.: .:..:..::.:. ::: :::::  :.:.: :....
XP_011 DPNAVGNCDPLSGHCLRCLHNTTGDHCEHCQEGFYGSALAPRPADKCMPCSCHPQGSVSE
        820       830       840       850       860       870      

          900       910       920       930       940       950    
pF1KB5 QSSCNPVTGQCECLPHVTGQDCGACDPGFYNLQSGQGCERCDCHALGSTNGQCDIRTGQC
       :  :.:::::: ::::::..::. : :::..:: :.::. : :: ::: . ::  .::::
XP_011 QMPCDPVTGQCSCLPHVTARDCSRCYPGFFDLQPGRGCRSCKCHPLGSQEDQCHPKTGQC
        880       890       900       910       920       930      

          960       970       980       990      1000      1010    
pF1KB5 ECQPGITGQHCERCEVNHFGFGPEGCKPCDCHPEGSLSLQCKDDGRCECREGFVGNRCDQ
        :.::.::: :.::... :::. .::. : : : :. : ::...: : :: :: : .::.
XP_011 TCRPGVTGQACDRCQLGFFGFSIKGCRACRCSPLGAASAQCHENGTCVCRPGFEGYKCDR
        940       950       960       970       980       990      

         1020      1030      1040      1050      1060      1070    
pF1KB5 CEENYFYNRSWPGCQECPACYRLVKDKVADHRVKLQELESLIANLGTGDEMVTDQAFEDR
       :..:.: . .   ::.::.:: :::...:  ...:   :. . .   :.       ..  
XP_011 CHDNFFLTADGTHCQQCPSCYALVKEEAAKLKARLTLTEGWLQGSDCGSPW---GPLDIL
       1000      1010      1020      1030      1040         1050   

         1080      1090      1100      1110      1120      1130    
pF1KB5 LKEAEREVMDLLREAQDVKDVDQNLMDRLQRVNNTLSSQISRLQNIRNTIEETGNLAEQA
       : :: :   :. .  . .  . . ...... .......   .:: . .  . .   ....
XP_011 LGEAPRG--DVYQGHHLLPGAREAFLEQMMSLEGAVKAAREQLQRLNKGARCAQAGSQKT
          1060        1070      1080      1090      1100      1110 

         1140      1150      1160      1170      1180      1190    
pF1KB5 RAHVENTERLIEIASRELEKAKVAAANVSVTQPESTGDPNNMTLLAEEARKLAERHKQEA
        ... . : ..: . .:. .: .  :.. . : :. ..:.. . :: ::: ::. :.. :
XP_011 CTQLADLEAVLESSEEEILHAAAILASLEIPQ-EGPSQPTKWSHLATEARALARSHRDTA
            1120      1130      1140       1150      1160      1170

         1200      1210      1220      1230       1240      1250   
pF1KB5 DDIVRVAKTANDTSTEAYNLLLRTLAGENQTAFEIE-ELNRKYEQAKNISQDLEKQAARV
         :. .:  :  .:. .: ::   : :  ..:.: . .:. .:....  .. :.  .:.:
XP_011 TKIAATAWRALLASNTSYALLWNLLEG--RVALETQRDLEDRYQEVQAAQKALRTAVAEV
             1180      1190        1200      1210      1220        

          1260      1270       1280         1290      1300         
pF1KB5 HEEAKRAGDKAVEIYASVAQ-LSPLDSE---TLENEANNIKMEAENLEQLIDQKLKDYED
         ::. .   . .. :..:  :. : :      ...:... ..:. ::. .     ... 
XP_011 LPEAESVLATVQQVGADTAPYLALLASPGALPQKSRAEDLGLKAKALEKTV----ASWQH
     1230      1240      1250      1260      1270          1280    

    1310       1320      1330      1340      1350      1360        
pF1KB5 L-REDMRGKELEVKNLLEKGKTEQQTADQLLARADAAKALAEEAAKKGRDTLQEANDILN
       .  :  :  .  ..  :.  .::  :  .:  .: :: . :  ... .  :.. :  .: 
XP_011 MATEAARTLQTAAQATLR--QTEPLT--KLHQEARAALTQASSSVQAATVTVMGARTLLA
         1290      1300          1310      1320      1330      1340

     1370          1380       1390       1400      1410      1420  
pF1KB5 NLK---DF-DRRVNDNKTAAEEAL-RKIPAI-NQTITEANEKTREAQQALGSAAADATEA
       .:.    :   ...  .   . :: ::  .. .. .... .::..:.. ::.::  .. :
XP_011 DLEASAGFAGMKLQFPRPKDQAALQRKADSVSDRLLADTRKKTKQAERMLGNAAPLSSSA
             1350      1360      1370      1380      1390      1400

           1430      1440      1450      1460       1470      1480 
pF1KB5 KNKAHEAERIASAVQKNATSTKAEAERTFAEVTDLDNEVNNMLKQL-QEAEKELKRKQDD
       :.:..::: .:.   : : .   : ...  ... : ....  :.:  :..     :.:. 
XP_011 KKKGREAEVLAKDSAKLAKALLRERKQAHRRASRLTSQTQATLQQASQQVLASEARRQEL
             1410      1420      1430      1440      1450      1460

            1490      1500      1510      1520        1530         
pF1KB5 ADQDMMMAGMASQAAQEAEINARKAKNSVTSLLSIINDLLEQLGQLDT--VDLNKLNEIE
        . . . ::..     : : . :... :. . .  ...:: .::.:::  .  . ::: .
XP_011 EEAERVGAGLS-----EMEQQIRESRISLEKDIETLSELLARLGSLDTHQAPAQALNETQ
             1470           1480      1490      1500      1510     

    1540       1550      1560      1570      1580      1590        
pF1KB5 GTLNKAKDEM-KVSDLDRKVSDLENEAKKQEAAIMDYNRDIEEIMKDIRNLEDIRKTLPS
        .:.. . .. . ..:.::.: ::.:...::  :. .. :. ::  : .::: : ..:: 
XP_011 WALERLRLQLGSPGSLQRKLSLLEQESQQQELQIQGFESDLAEIRADKQNLEAILHSLPE
        1520      1530      1540      1550      1560      1570     

     1600         
pF1KB5 GCFNTPSIEKP
       .:         
XP_011 NCASWQ     
        1580      

>>NP_006050 (OMIM: 604349,614115) laminin subunit gamma-  (1575 aa)
 initn: 4385 init1: 2442 opt: 4558  Z-score: 2016.6  bits: 386.0 E(85289): 1.4e-105
Smith-Waterman score: 4898; 44.2% identity (72.0% similar) in 1598 aa overlap (21-1600:10-1571)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MRGSHRAAPALRPRGRLWPVLAVLAAAAAAGCAQAAMDECTDEGGRPQRCMPEFVNAAFN
                           ::.::  ::.    :.:  : : .::::::.: : ::::.
NP_006            MAAAALLLGLALLAPRAAG----AGMGACYDGAGRPQRCLPVFENAAFG
                          10            20        30        40     

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 VTVVATNTCGTPPEEYCVQTGVTGVTKSCHLCDAGQPHLQHGAAFLTDYNNQADTTWWQS
         . :..:::.:::..: ..:..:.   :. :::..:. .:.:..:::...: ..:::::
NP_006 RLAQASHTCGSPPEDFCPHVGAAGAGAHCQRCDAADPQRHHNASYLTDFHSQDESTWWQS
          50        60        70        80        90       100     

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 QTMLAGVQYPSSINLTLHLGKAFDITYVRLKFHTSRPESFAIYKRTREDGPWIPYQYYSG
        .:  :::::.:.:.::.::::..:::::::::::::::::::::.: :::: :::.::.
NP_006 PSMAFGVQYPTSVNITLRLGKAYEITYVRLKFHTSRPESFAIYKRSRADGPWEPYQFYSA
         110       120       130       140       150       160     

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 SCENTYSKANRGFIRTGGDEQQALCTDEFSDISPLTGGNVAFSTLEGRPSAYNFDNSPVL
       ::..::.. .  ..: : ::. :.::.::::::::.::::::::::::::::::..:: :
NP_006 SCQKTYGRPEGQYLRPGEDERVAFCTSEFSDISPLSGGNVAFSTLEGRPSAYNFEESPGL
         170       180       190       200       210       220     

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 QEWVTATDIRVTLNRLNTFGDEVFNDPKVLKSYYYAISDFAVGGRCKCNGHASECMKNEF
       :::::.:.. ..:.:::::::..:.:::::.:::::.:::.::::::::::::::  .  
NP_006 QEWVTSTELLISLDRLNTFGDDIFKDPKVLQSYYYAVSDFSVGGRCKCNGHASECGPDVA
         230       240       250       260       270       280     

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 DKLVCNCKHNTYGVDCEKCLPFFNDRPWRRATAESASECLPCDCNGRSQECYFDPELYRS
        .:.: :.::: :.:::.:::::.:::: :.:::.: :::::.:.:::.:: :: ::.::
NP_006 GQLACRCQHNTTGTDCERCLPFFQDRPWARGTAEAAHECLPCNCSGRSEECTFDRELFRS
         290       300       310       320       330       340     

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 TGHGGHCTNCQDNTDGAHCERCRENFFRLGNNEACSSCHCSPVGSLSTQCDSYGRCSCKP
       :::::.: .:.:.: : :::::.:::..      :. : :. .:::  :::. : :.:::
NP_006 TGHGGRCHHCRDHTAGPHCERCQENFYHWDPRMPCQPCDCQSAGSLHLQCDDTGTCACKP
         350       360       370       380       390       400     

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 GVMGDKCDRCQPGFHSLTEAGCRPCSCDPSGSIDECNVETGRCVCKDNVEGFNCERCKPG
        : : ::::: ::::::.:.:::::.:.:.::.: :. ..::: ::.::::  :.::.::
NP_006 TVTGWKCDRCLPGFHSLSEGGCRPCTCNPAGSLDTCDPRSGRCPCKENVEGNLCDRCRPG
         410       420       430       440       450       460     

              490       500       510       520       530       540
pF1KB5 FFNLESSNPRGCTPCFCFGHSSVCTNAVGYSVYSISSTFQIDEDGWRAEQRDGSEASLEW
        :::.  :: ::. :::.:::.::.... ..:. : : :.   .:: :..  :::   .:
NP_006 TFNLQPHNPAGCSSCFCYGHSKVCASTAQFQVHHILSDFHQGAEGWWARSVGGSEHPPQW
         470       480       490       500       510       520     

              550       560       570       580       590       600
pF1KB5 SSERQDIAVISDSYFPRYFIAPAKFLGKQVLSYGQNLSFSFRVDRRDTRLSAEDLVLEGA
       : .    .:. .    . . :: :::: : .:::: : ..:::   :. : .. : :::.
NP_006 SPN----GVLLSPEDEEELTAPEKFLGDQRFSYGQPLILTFRVPPGDSPLPVQ-LRLEGT
             530       540       550       560       570        580

              610           620       630       640       650      
pF1KB5 GLRVSVPLIA----QGNSYPSETTVKYVFRLHEATDYPWRPALTPFEFQKLLNNLTSIKI
       :: .:.   .    :  ..: :. ..  :.:.:...    : : ::.::.:: ::::...
NP_006 GLALSLRHSSLSGPQDAGHPREVELR--FHLQETSE-DVAPPLPPFHFQRLLANLTSLRL
              590       600         610        620       630       

        660         670       680       690       700       710    
pF1KB5 RGTYSERSAG--YLDDVTLASARPGPGVPATWVESCTCPVGYGGQFCEMCLSGYRRETPN
       : . .   ::  .: .: :.::::: . ::.::: :.::.:: ::::: :  ::.:: :.
NP_006 RVSPGPSPAGPVFLTEVRLTSARPGLSPPASWVEICSCPTGYTGQFCESCAPGYKREMPQ
       640       650       660       670       680       690       

          720       730       740       750       760       770    
pF1KB5 LGPYSPCVLCACNGHSETCDPETGVCNCRDNTAGPHCEKCSDGYYGDSTAGTSSDCQPCP
        :::. :: :.:: :. ::::.::.: :  .: :: ::.:  :.::.  :: ..::::::
NP_006 GGPYASCVPCTCNQHG-TCDPNTGICVCSHHTEGPSCERCLPGFYGNPFAGQADDCQPCP
       700       710        720       730       740       750      

          780       790       800       810       820       830    
pF1KB5 CPGGSSCAVVPKTKEVVCTNCPTGTTGKRCELCDDGYFGDPLGRNGPVRLCRLCQCSDNI
       ::: :.:...:...:::::.:: :  :.:::.::::.::::::  :  . :. :::: :.
NP_006 CPGQSACTTIPESREVVCTHCPPGQRGRRCEVCDDGFFGDPLGLFGHPQPCHQCQCSGNV
        760       770       780       790       800       810      

          840       850       860       870       880       890    
pF1KB5 DPNAVGNCNRLTGECLKCIYNTAGFYCDRCKDGFFGNPLAPNPADKCKACNCNPYGTMKQ
       ::::::::. :.:.::.:..::.: .:..:..::.:. ::: :::::  :.:.: :....
NP_006 DPNAVGNCDPLSGHCLRCLHNTTGDHCEHCQEGFYGSALAPRPADKCMPCSCHPQGSVSE
        820       830       840       850       860       870      

          900       910       920       930       940       950    
pF1KB5 QSSCNPVTGQCECLPHVTGQDCGACDPGFYNLQSGQGCERCDCHALGSTNGQCDIRTGQC
       :  :.:::::: ::::::..::. : :::..:: :.::. : :: ::: . ::  .::::
NP_006 QMPCDPVTGQCSCLPHVTARDCSRCYPGFFDLQPGRGCRSCKCHPLGSQEDQCHPKTGQC
        880       890       900       910       920       930      

          960       970       980       990      1000      1010    
pF1KB5 ECQPGITGQHCERCEVNHFGFGPEGCKPCDCHPEGSLSLQCKDDGRCECREGFVGNRCDQ
        :.::.::: :.::... :::. .::. : : : :. : ::...: : :: :: : .::.
NP_006 TCRPGVTGQACDRCQLGFFGFSIKGCRACRCSPLGAASAQCHENGTCVCRPGFEGYKCDR
        940       950       960       970       980       990      

         1020      1030      1040      1050      1060      1070    
pF1KB5 CEENYFYNRSWPGCQECPACYRLVKDKVADHRVKLQELESLIANLGTGDEMVTDQAFEDR
       :..:.: . .   ::.::.:: :::...:  ...:   :. . .   :.       ..  
NP_006 CHDNFFLTADGTHCQQCPSCYALVKEEAAKLKARLTLTEGWLQGSDCGSPW---GPLDIL
       1000      1010      1020      1030      1040         1050   

         1080      1090      1100      1110      1120      1130    
pF1KB5 LKEAEREVMDLLREAQDVKDVDQNLMDRLQRVNNTLSSQISRLQNIRNTIEETGNLAEQA
       : :: :   :. .  . .  . . ...... .......   .:: . .  . .   ....
NP_006 LGEAPRG--DVYQGHHLLPGAREAFLEQMMSLEGAVKAAREQLQRLNKGARCAQAGSQKT
          1060        1070      1080      1090      1100      1110 

         1140      1150      1160      1170      1180      1190    
pF1KB5 RAHVENTERLIEIASRELEKAKVAAANVSVTQPESTGDPNNMTLLAEEARKLAERHKQEA
        ... . : ..: . .:. .: .  :.. . : :. ..:.. . :: ::: ::. :.. :
NP_006 CTQLADLEAVLESSEEEILHAAAILASLEIPQ-EGPSQPTKWSHLATEARALARSHRDTA
            1120      1130      1140       1150      1160      1170

         1200      1210      1220      1230       1240      1250   
pF1KB5 DDIVRVAKTANDTSTEAYNLLLRTLAGENQTAFEIE-ELNRKYEQAKNISQDLEKQAARV
         :. .:  :  .:. .: ::   : :  ..:.: . .:. .:....  .. :.  .:.:
NP_006 TKIAATAWRALLASNTSYALLWNLLEG--RVALETQRDLEDRYQEVQAAQKALRTAVAEV
             1180      1190        1200      1210      1220        

          1260      1270       1280         1290      1300         
pF1KB5 HEEAKRAGDKAVEIYASVAQ-LSPLDSE---TLENEANNIKMEAENLEQLIDQKLKDYED
         ::. .   . .. :..:  :. : :      ...:... ..:. ::. .     ... 
NP_006 LPEAESVLATVQQVGADTAPYLALLASPGALPQKSRAEDLGLKAKALEKTV----ASWQH
     1230      1240      1250      1260      1270          1280    

    1310       1320      1330      1340      1350      1360        
pF1KB5 L-REDMRGKELEVKNLLEKGKTEQQTADQLLARADAAKALAEEAAKKGRDTLQEANDILN
       .  :  :  .  ..  :.  .::  :  .:  .: :: . :  ... .  :.. :  .: 
NP_006 MATEAARTLQTAAQATLR--QTEPLT--KLHQEARAALTQASSSVQAATVTVMGARTLLA
         1290      1300          1310      1320      1330      1340

     1370      1380       1390       1400      1410      1420      
pF1KB5 NLKDFDRRVNDNKTAAEEAL-RKIPAI-NQTITEANEKTREAQQALGSAAADATEAKNKA
       .:. .  .    :  :  :: ::  .. .. .... .::..:.. ::.::  .. ::.:.
NP_006 DLEGMKLQFPRPKDQA--ALQRKADSVSDRLLADTRKKTKQAERMLGNAAPLSSSAKKKG
             1350        1360      1370      1380      1390        

       1430      1440      1450      1460       1470      1480     
pF1KB5 HEAERIASAVQKNATSTKAEAERTFAEVTDLDNEVNNMLKQL-QEAEKELKRKQDDADQD
       .::: .:.   : : .   : ...  ... : ....  :.:  :..     :.:.  . .
NP_006 REAEVLAKDSAKLAKALLRERKQAHRRASRLTSQTQATLQQASQQVLASEARRQELEEAE
     1400      1410      1420      1430      1440      1450        

        1490      1500      1510      1520        1530      1540   
pF1KB5 MMMAGMASQAAQEAEINARKAKNSVTSLLSIINDLLEQLGQLDT--VDLNKLNEIEGTLN
        . ::..     : : . :... :. . .  ...:: .::.:::  .  . ::: . .:.
NP_006 RVGAGLS-----EMEQQIRESRISLEKDIETLSELLARLGSLDTHQAPAQALNETQWALE
     1460           1470      1480      1490      1500      1510   

           1550      1560      1570      1580      1590      1600  
pF1KB5 KAKDEM-KVSDLDRKVSDLENEAKKQEAAIMDYNRDIEEIMKDIRNLEDIRKTLPSGCFN
       . . .. . ..:.::.: ::.:...::  :. .. :. ::  : .::: : ..:: .:  
NP_006 RLRLQLGSPGSLQRKLSLLEQESQQQELQIQGFESDLAEIRADKQNLEAILHSLPENCAS
          1520      1530      1540      1550      1560      1570   

              
pF1KB5 TPSIEKP
              
NP_006 WQ     
              

>>XP_006716984 (OMIM: 604349,614115) PREDICTED: laminin   (1259 aa)
 initn: 4385 init1: 2442 opt: 4520  Z-score: 2001.1  bits: 382.8 E(85289): 1e-104
Smith-Waterman score: 4612; 49.1% identity (75.1% similar) in 1259 aa overlap (21-1272:10-1247)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MRGSHRAAPALRPRGRLWPVLAVLAAAAAAGCAQAAMDECTDEGGRPQRCMPEFVNAAFN
                           ::.::  ::.    :.:  : : .::::::.: : ::::.
XP_006            MAAAALLLGLALLAPRAAG----AGMGACYDGAGRPQRCLPVFENAAFG
                          10            20        30        40     

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 VTVVATNTCGTPPEEYCVQTGVTGVTKSCHLCDAGQPHLQHGAAFLTDYNNQADTTWWQS
         . :..:::.:::..: ..:..:.   :. :::..:. .:.:..:::...: ..:::::
XP_006 RLAQASHTCGSPPEDFCPHVGAAGAGAHCQRCDAADPQRHHNASYLTDFHSQDESTWWQS
          50        60        70        80        90       100     

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 QTMLAGVQYPSSINLTLHLGKAFDITYVRLKFHTSRPESFAIYKRTREDGPWIPYQYYSG
        .:  :::::.:.:.::.::::..:::::::::::::::::::::.: :::: :::.::.
XP_006 PSMAFGVQYPTSVNITLRLGKAYEITYVRLKFHTSRPESFAIYKRSRADGPWEPYQFYSA
         110       120       130       140       150       160     

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 SCENTYSKANRGFIRTGGDEQQALCTDEFSDISPLTGGNVAFSTLEGRPSAYNFDNSPVL
       ::..::.. .  ..: : ::. :.::.::::::::.::::::::::::::::::..:: :
XP_006 SCQKTYGRPEGQYLRPGEDERVAFCTSEFSDISPLSGGNVAFSTLEGRPSAYNFEESPGL
         170       180       190       200       210       220     

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 QEWVTATDIRVTLNRLNTFGDEVFNDPKVLKSYYYAISDFAVGGRCKCNGHASECMKNEF
       :::::.:.. ..:.:::::::..:.:::::.:::::.:::.::::::::::::::  .  
XP_006 QEWVTSTELLISLDRLNTFGDDIFKDPKVLQSYYYAVSDFSVGGRCKCNGHASECGPDVA
         230       240       250       260       270       280     

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 DKLVCNCKHNTYGVDCEKCLPFFNDRPWRRATAESASECLPCDCNGRSQECYFDPELYRS
        .:.: :.::: :.:::.:::::.:::: :.:::.: :::::.:.:::.:: :: ::.::
XP_006 GQLACRCQHNTTGTDCERCLPFFQDRPWARGTAEAAHECLPCNCSGRSEECTFDRELFRS
         290       300       310       320       330       340     

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 TGHGGHCTNCQDNTDGAHCERCRENFFRLGNNEACSSCHCSPVGSLSTQCDSYGRCSCKP
       :::::.: .:.:.: : :::::.:::..      :. : :. .:::  :::. : :.:::
XP_006 TGHGGRCHHCRDHTAGPHCERCQENFYHWDPRMPCQPCDCQSAGSLHLQCDDTGTCACKP
         350       360       370       380       390       400     

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 GVMGDKCDRCQPGFHSLTEAGCRPCSCDPSGSIDECNVETGRCVCKDNVEGFNCERCKPG
        : : ::::: ::::::.:.:::::.:.:.::.: :. ..::: ::.::::  :.::.::
XP_006 TVTGWKCDRCLPGFHSLSEGGCRPCTCNPAGSLDTCDPRSGRCPCKENVEGNLCDRCRPG
         410       420       430       440       450       460     

              490       500       510       520       530       540
pF1KB5 FFNLESSNPRGCTPCFCFGHSSVCTNAVGYSVYSISSTFQIDEDGWRAEQRDGSEASLEW
        :::.  :: ::. :::.:::.::.... ..:. : : :.   .:: :..  :::   .:
XP_006 TFNLQPHNPAGCSSCFCYGHSKVCASTAQFQVHHILSDFHQGAEGWWARSVGGSEHPPQW
         470       480       490       500       510       520     

              550       560       570       580       590       600
pF1KB5 SSERQDIAVISDSYFPRYFIAPAKFLGKQVLSYGQNLSFSFRVDRRDTRLSAEDLVLEGA
       : .    .:. .    . . :: :::: : .:::: : ..:::   :. : .. : :::.
XP_006 SPN----GVLLSPEDEEELTAPEKFLGDQRFSYGQPLILTFRVPPGDSPLPVQ-LRLEGT
             530       540       550       560       570        580

              610           620       630       640       650      
pF1KB5 GLRVSVPLIA----QGNSYPSETTVKYVFRLHEATDYPWRPALTPFEFQKLLNNLTSIKI
       :: .:.   .    :  ..: :. ..  :.:.:...    : : ::.::.:: ::::...
XP_006 GLALSLRHSSLSGPQDAGHPREVELR--FHLQETSE-DVAPPLPPFHFQRLLANLTSLRL
              590       600         610        620       630       

        660         670       680       690       700       710    
pF1KB5 RGTYSERSAG--YLDDVTLASARPGPGVPATWVESCTCPVGYGGQFCEMCLSGYRRETPN
       : . .   ::  .: .: :.::::: . ::.::: :.::.:: ::::: :  ::.:: :.
XP_006 RVSPGPSPAGPVFLTEVRLTSARPGLSPPASWVEICSCPTGYTGQFCESCAPGYKREMPQ
       640       650       660       670       680       690       

          720       730       740       750       760       770    
pF1KB5 LGPYSPCVLCACNGHSETCDPETGVCNCRDNTAGPHCEKCSDGYYGDSTAGTSSDCQPCP
        :::. :: :.:: :. ::::.::.: :  .: :: ::.:  :.::.  :: ..::::::
XP_006 GGPYASCVPCTCNQHG-TCDPNTGICVCSHHTEGPSCERCLPGFYGNPFAGQADDCQPCP
       700       710        720       730       740       750      

          780       790       800       810       820       830    
pF1KB5 CPGGSSCAVVPKTKEVVCTNCPTGTTGKRCELCDDGYFGDPLGRNGPVRLCRLCQCSDNI
       ::: :.:...:...:::::.:: :  :.:::.::::.::::::  :  . :. :::: :.
XP_006 CPGQSACTTIPESREVVCTHCPPGQRGRRCEVCDDGFFGDPLGLFGHPQPCHQCQCSGNV
        760       770       780       790       800       810      

          840       850       860       870       880       890    
pF1KB5 DPNAVGNCNRLTGECLKCIYNTAGFYCDRCKDGFFGNPLAPNPADKCKACNCNPYGTMKQ
       ::::::::. :.:.::.:..::.: .:..:..::.:. ::: :::::  :.:.: :....
XP_006 DPNAVGNCDPLSGHCLRCLHNTTGDHCEHCQEGFYGSALAPRPADKCMPCSCHPQGSVSE
        820       830       840       850       860       870      

          900       910       920       930       940       950    
pF1KB5 QSSCNPVTGQCECLPHVTGQDCGACDPGFYNLQSGQGCERCDCHALGSTNGQCDIRTGQC
       :  :.:::::: ::::::..::. : :::..:: :.::. : :: ::: . ::  .::::
XP_006 QMPCDPVTGQCSCLPHVTARDCSRCYPGFFDLQPGRGCRSCKCHPLGSQEDQCHPKTGQC
        880       890       900       910       920       930      

          960       970       980       990      1000      1010    
pF1KB5 ECQPGITGQHCERCEVNHFGFGPEGCKPCDCHPEGSLSLQCKDDGRCECREGFVGNRCDQ
        :.::.::: :.::... :::. .::. : : : :. : ::...: : :: :: : .::.
XP_006 TCRPGVTGQACDRCQLGFFGFSIKGCRACRCSPLGAASAQCHENGTCVCRPGFEGYKCDR
        940       950       960       970       980       990      

         1020      1030      1040      1050      1060      1070    
pF1KB5 CEENYFYNRSWPGCQECPACYRLVKDKVADHRVKLQELESLIANLGTGDEMVTDQAFEDR
       :..:.: . .   ::.::.:: :::...:  ...:   :. . .   :.       ..  
XP_006 CHDNFFLTADGTHCQQCPSCYALVKEEAAKLKARLTLTEGWLQGSDCGSPW---GPLDIL
       1000      1010      1020      1030      1040         1050   

         1080      1090      1100      1110      1120      1130    
pF1KB5 LKEAEREVMDLLREAQDVKDVDQNLMDRLQRVNNTLSSQISRLQNIRNTIEETGNLAEQA
       : :: :   :. .  . .  . . ...... .......   .:: . .  . .   ....
XP_006 LGEAPR--GDVYQGHHLLPGAREAFLEQMMSLEGAVKAAREQLQRLNKGARCAQAGSQKT
            1060      1070      1080      1090      1100      1110 

         1140      1150      1160      1170      1180      1190    
pF1KB5 RAHVENTERLIEIASRELEKAKVAAANVSVTQPESTGDPNNMTLLAEEARKLAERHKQEA
        ... . : ..: . .:. .: .  :.. . : :. ..:.. . :: ::: ::. :.. :
XP_006 CTQLADLEAVLESSEEEILHAAAILASLEIPQ-EGPSQPTKWSHLATEARALARSHRDTA
            1120      1130      1140       1150      1160      1170

         1200      1210      1220      1230       1240      1250   
pF1KB5 DDIVRVAKTANDTSTEAYNLLLRTLAGENQTAFEIE-ELNRKYEQAKNISQDLEKQAARV
         :. .:  :  .:. .: ::   : :  ..:.: . .:. .:....  .. :.  .:.:
XP_006 TKIAATAWRALLASNTSYALLWNLLEG--RVALETQRDLEDRYQEVQAAQKALRTAVAEV
             1180      1190        1200      1210      1220        

          1260      1270      1280      1290      1300      1310   
pF1KB5 HEEAKRAGDKAVEIYASVAQLSPLDSETLENEANNIKMEAENLEQLIDQKLKDYEDLRED
         ::. .   . .. :..:                                         
XP_006 LPEAESVLATVQQVGADTAPYLALLASPGAL                             
     1230      1240      1250                                      

>>XP_016856762 (OMIM: 150292,226650,226700) PREDICTED: l  (742 aa)
 initn: 2571 init1: 1100 opt: 2508  Z-score: 1124.5  bits: 219.8 E(85289): 6.8e-56
Smith-Waterman score: 2569; 44.3% identity (66.0% similar) in 851 aa overlap (319-1161:9-739)

      290       300       310       320       330       340        
pF1KB5 NGHASECMKNEFDKLVCNCKHNTYGVDCEKCLPFFNDRPWRRATAESASECLPCDCNGRS
                                     :: :    :  :::..       :::::.:
XP_016                       MPALWLGCCLCFSLLLPAARATSRREV----CDCNGKS
                                     10        20            30    

      350       360       370       380       390       400        
pF1KB5 QECYFDPELYRSTGHGGHCTNCQDNTDGAHCERCRENFFRLGNNEACSSCHCSPVGSLST
       ..: :: ::.:.::.: .: ::.::::: :::.:...:.:  . . :  :.:.  ::::.
XP_016 RQCIFDRELHRQTGNGFRCLNCNDNTDGIHCEKCKNGFYRHRERDRCLPCNCNSKGSLSA
           40        50        60        70        80        90    

      410       420       430       440               450       460
pF1KB5 QCDSYGRCSCKPGVMGDKCDRCQPGFHSLTEAGCRP--------CSCDPSGSIDECNVET
       .::. ::::::::: : .:::: :::: ::.:::          :.:::.:    :..  
XP_016 RCDNSGRCSCKPGVTGARCDRCLPGFHMLTDAGCTQDQRLLDSKCDCDPAGIAGPCDA--
          100       110       120       130       140       150    

              470       480       490       500       510       520
pF1KB5 GRCVCKDNVEGFNCERCKPGFFNLESSNPRGCTPCFCFGHSSVCTNAVGYSVYSISSTFQ
       ::::::  : :  :.::. :..::...::.::: :::.:::. : ... :::..:.:::.
XP_016 GRCVCKPAVTGERCDRCRSGYYNLDGGNPEGCTQCFCYGHSASCRSSAEYSVHKITSTFH
            160       170       180       190       200       210  

              530       540       550       560       570       580
pF1KB5 IDEDGWRAEQRDGSEASLEWSSERQDIAVISDSYFPRYFIAPAKFLGKQVLSYGQNLSFS
        : :::.: ::.:: :.:.::...::.   ..   : ::.:::::::.: .::::.:::.
XP_016 QDVDGWKAVQRNGSPAKLQWSQRHQDVFSSAQRLDPVYFVAPAKFLGNQQVSYGQSLSFD
            220       230       240       250       260       270  

              590       600       610       620       630       640
pF1KB5 FRVDRRDTRLSAEDLVLEGAGLRVSVPLIAQGNSYPSETTVKYVFRLHEATDYPWRPALT
       .::::   . ::.:..:::::::...::.  :.. :   :  :.:::.:  .  : : :.
XP_016 YRVDRGGRHPSAHDVILEGAGLRITAPLMPLGKTLPCGLTKTYTFRLNEHPSNNWSPQLS
            280       290       300       310       320       330  

              650       660       670       680       690       700
pF1KB5 PFEFQKLLNNLTSIKIRGTYSERSAGYLDDVTLASARPGPGVPATWVESCTCPVGYGGQF
        ::...:: :::...::.::.: :.::.:.::: ::::  :.:: :::.: ::::: :::
XP_016 YFEYRRLLRNLTALRIRATYGEYSTGYIDNVTLISARPVSGAPAPWVEQCICPVGYKGQF
            340       350       360       370       380       390  

              710       720       730       740       750       760
pF1KB5 CEMCLSGYRRETPNLGPYSPCVLCACNGHSETCDPETGVCNCRDNTAGPHCEKCSDGYYG
       :. : :::.:..  :::.. :. : :.: . .:::.:: :   :..   .:  :  :.:.
XP_016 CQDCASGYKRDSARLGPFGTCIPCNCQGGG-ACDPDTGDCYSGDENPDIECADCPIGFYN
            400       410       420        430       440       450 

              770       780       790       800       810       820
pF1KB5 DSTAGTSSDCQPCPCPGGSSCAVVPKTKEVVCTNCPTGTTGKRCELCDDGYFGDPLGRNG
       :     :  :.:::: .: ::.:.:.:.::::.::: :.:: ::::: :::::::.:..:
XP_016 DPHDPRS--CKPCPCHNGFSCSVMPETEEVVCNNCPPGVTGARCELCADGYFGDPFGEHG
               460       470       480       490       500         

              830       840       850       860       870       880
pF1KB5 PVRLCRLCQCSDNIDPNAVGNCNRLTGECLKCIYNTAGFYCDRCKDGFFGNPLAPNPADK
       ::: :. :::..:.::.: :::.::::.:::::.::::.:::.:: :.::.:::::::::
XP_016 PVRPCQPCQCNNNVDPSASGNCDRLTGRCLKCIHNTAGIYCDQCKAGYFGDPLAPNPADK
     510       520       530       540       550       560         

              890       900       910       920       930       940
pF1KB5 CKACNCNPYGTMKQQSSCNPVTGQCECLPHVTGQDCGACDPGFYNLQSGQGCERCDCHAL
       :.::::::.:.       .::                             :: : :    
XP_016 CRACNCNPMGS-------EPV-----------------------------GC-RSD----
     570       580                                                 

              950       960       970       980       990      1000
pF1KB5 GSTNGQCDIRTGQCECQPGITGQHCERCEVNHFGFGPEGCKPCDCHPEGSLSLQCKDDGR
                  : : :.::. : .::.                     :..:        
XP_016 -----------GTCVCKPGFGGPNCEH---------------------GAFS--------
                 590       600                                     

             1010      1020      1030      1040      1050      1060
pF1KB5 CECREGFVGNRCDQCEENYFYNRSWPGCQECPACYRLVKDKVADHRVKLQELESLIANLG
                                     :::::  :: .. .   .::..:.::..  
XP_016 ------------------------------CPACYNQVKIQMDQFMQQLQRMEALISKAQ
                                    610       620       630        

             1070      1080      1090      1100      1110      1120
pF1KB5 TGDEMVTDQAFEDRLKEAEREVMDLLREAQDVKDVDQNLMDRLQRVNNTLSSQISRLQNI
        :: .: :  .: :...::. ..:.::.::  . ....:  .: .: .  .:  :::...
XP_016 GGDGVVPDTELEGRMQQAEQALQDILRDAQISEGASRSLGLQLAKVRSQENSYQSRLDDL
      640       650       660       670       680       690        

             1130      1140      1150      1160      1170      1180
pF1KB5 RNTIEETGNLAEQARAHVENTERLIEIASRELEKAKVAAANVSVTQPESTGDPNNMTLLA
       . :.:..  :. : . .:..:.:::   .  : ..... .:                   
XP_016 KMTVERVRALGSQYQNRVRDTHRLITQMQLSLAESEASLGNTPR                
      700       710       720       730       740                  

             1190      1200      1210      1220      1230      1240
pF1KB5 EEARKLAERHKQEADDIVRVAKTANDTSTEAYNLLLRTLAGENQTAFEIEELNRKYEQAK

>>NP_061486 (OMIM: 150292,226650,226700) laminin subunit  (1111 aa)
 initn: 3151 init1: 1100 opt: 2508  Z-score: 1122.5  bits: 220.1 E(85289): 8.7e-56
Smith-Waterman score: 3204; 40.2% identity (68.2% similar) in 1222 aa overlap (319-1525:9-1110)

      290       300       310       320       330       340        
pF1KB5 NGHASECMKNEFDKLVCNCKHNTYGVDCEKCLPFFNDRPWRRATAESASECLPCDCNGRS
                                     :: :    :  :::  :  :   :::::.:
NP_061                       MPALWLGCCLCFSLLLPAARAT--SRREV--CDCNGKS
                                     10        20            30    

      350       360       370       380       390       400        
pF1KB5 QECYFDPELYRSTGHGGHCTNCQDNTDGAHCERCRENFFRLGNNEACSSCHCSPVGSLST
       ..: :: ::.:.::.: .: ::.::::: :::.:...:.:  . . :  :.:.  ::::.
NP_061 RQCIFDRELHRQTGNGFRCLNCNDNTDGIHCEKCKNGFYRHRERDRCLPCNCNSKGSLSA
           40        50        60        70        80        90    

      410       420       430       440               450       460
pF1KB5 QCDSYGRCSCKPGVMGDKCDRCQPGFHSLTEAGCRP--------CSCDPSGSIDECNVET
       .::. ::::::::: : .:::: :::: ::.:::          :.:::.:    :..  
NP_061 RCDNSGRCSCKPGVTGARCDRCLPGFHMLTDAGCTQDQRLLDSKCDCDPAGIAGPCDA--
          100       110       120       130       140       150    

              470       480       490       500       510       520
pF1KB5 GRCVCKDNVEGFNCERCKPGFFNLESSNPRGCTPCFCFGHSSVCTNAVGYSVYSISSTFQ
       ::::::  : :  :.::. :..::...::.::: :::.:::. : ... :::..:.:::.
NP_061 GRCVCKPAVTGERCDRCRSGYYNLDGGNPEGCTQCFCYGHSASCRSSAEYSVHKITSTFH
            160       170       180       190       200       210  

              530       540       550       560       570       580
pF1KB5 IDEDGWRAEQRDGSEASLEWSSERQDIAVISDSYFPRYFIAPAKFLGKQVLSYGQNLSFS
        : :::.: ::.:: :.:.::...::.   ..   : ::.:::::::.: .::::.:::.
NP_061 QDVDGWKAVQRNGSPAKLQWSQRHQDVFSSAQRLDPVYFVAPAKFLGNQQVSYGQSLSFD
            220       230       240       250       260       270  

              590       600       610       620       630       640
pF1KB5 FRVDRRDTRLSAEDLVLEGAGLRVSVPLIAQGNSYPSETTVKYVFRLHEATDYPWRPALT
       .::::   . ::.:..:::::::...::.  :.. :   :  :.:::.:  .  : : :.
NP_061 YRVDRGGRHPSAHDVILEGAGLRITAPLMPLGKTLPCGLTKTYTFRLNEHPSNNWSPQLS
            280       290       300       310       320       330  

              650       660       670       680       690       700
pF1KB5 PFEFQKLLNNLTSIKIRGTYSERSAGYLDDVTLASARPGPGVPATWVESCTCPVGYGGQF
        ::...:: :::...::.::.: :.::.:.::: ::::  :.:: :::.: ::::: :::
NP_061 YFEYRRLLRNLTALRIRATYGEYSTGYIDNVTLISARPVSGAPAPWVEQCICPVGYKGQF
            340       350       360       370       380       390  

              710       720       730       740       750       760
pF1KB5 CEMCLSGYRRETPNLGPYSPCVLCACNGHSETCDPETGVCNCRDNTAGPHCEKCSDGYYG
       :. : :::.:..  :::.. :. : :.: . .:::.:: :   :..   .:  :  :.:.
NP_061 CQDCASGYKRDSARLGPFGTCIPCNCQGGG-ACDPDTGDCYSGDENPDIECADCPIGFYN
            400       410       420        430       440       450 

              770       780       790       800       810       820
pF1KB5 DSTAGTSSDCQPCPCPGGSSCAVVPKTKEVVCTNCPTGTTGKRCELCDDGYFGDPLGRNG
       :     :  :.:::: .: ::.:.:.:.::::.::: :.:: ::::: :::::::.:..:
NP_061 DPHDPRS--CKPCPCHNGFSCSVMPETEEVVCNNCPPGVTGARCELCADGYFGDPFGEHG
               460       470       480       490       500         

              830       840       850       860       870       880
pF1KB5 PVRLCRLCQCSDNIDPNAVGNCNRLTGECLKCIYNTAGFYCDRCKDGFFGNPLAPNPADK
       ::: :. :::..:.::.: :::.::::.:::::.::::.:::.:: :.::.:::::::::
NP_061 PVRPCQPCQCNNNVDPSASGNCDRLTGRCLKCIHNTAGIYCDQCKAGYFGDPLAPNPADK
     510       520       530       540       550       560         

              890       900       910       920       930       940
pF1KB5 CKACNCNPYGTMKQQSSCNPVTGQCECLPHVTGQDCGACDPGFYNLQSGQGCERCDCHAL
       :.::::::.:.       .::                             :: : :    
NP_061 CRACNCNPMGS-------EPV-----------------------------GC-RSD----
     570       580                                                 

              950       960       970       980       990      1000
pF1KB5 GSTNGQCDIRTGQCECQPGITGQHCERCEVNHFGFGPEGCKPCDCHPEGSLSLQCKDDGR
                  : : :.::. : .::.                     :..:        
NP_061 -----------GTCVCKPGFGGPNCEH---------------------GAFS--------
                 590       600                                     

             1010      1020      1030      1040      1050      1060
pF1KB5 CECREGFVGNRCDQCEENYFYNRSWPGCQECPACYRLVKDKVADHRVKLQELESLIANLG
                                     :::::  :: .. .   .::..:.::..  
NP_061 ------------------------------CPACYNQVKIQMDQFMQQLQRMEALISKAQ
                                    610       620       630        

             1070      1080      1090      1100      1110      1120
pF1KB5 TGDEMVTDQAFEDRLKEAEREVMDLLREAQDVKDVDQNLMDRLQRVNNTLSSQISRLQNI
        :: .: :  .: :...::. ..:.::.::  . ....:  .: .: .  .:  :::...
NP_061 GGDGVVPDTELEGRMQQAEQALQDILRDAQISEGASRSLGLQLAKVRSQENSYQSRLDDL
      640       650       660       670       680       690        

             1130      1140      1150      1160      1170      1180
pF1KB5 RNTIEETGNLAEQARAHVENTERLIEIASRELEKAKVAAANVSVTQPESTGDPNNMTLLA
       . :.:..  :. : . .:..:.:::   .  : ..... .:...   .    ::..  ::
NP_061 KMTVERVRALGSQYQNRVRDTHRLITQMQLSLAESEASLGNTNIPASDHYVGPNGFKSLA
      700       710       720       730       740       750        

             1190      1200      1210         1220         1230    
pF1KB5 EEARKLAERHKQEADDIVRVAKTANDTSTEAYNLLLRTL---AGENQTAFE---IEELNR
       .:: .::: : . :... .... ..: : .: .:. ..:   .: .. . .   .. : .
NP_061 QEATRLAESHVESASNMEQLTRETEDYSKQALSLVRKALHEGVGSGSGSPDGAVVQGLVE
      760       770       780       790       800       810        

         1240      1250      1260      1270      1280       1290   
pF1KB5 KYEQAKNISQDLEKQAARVHEEAKRAGDKAVEIYASVAQLSPLDSETLE-NEANNIKMEA
       : :..:...:.: ..:.... :: :. ......  ::..:. ....... .::. ::..:
NP_061 KLEKTKSLAQQLTREATQAEIEADRSYQHSLRLLDSVSRLQGVSDQSFQVEEAKRIKQKA
      820       830       840       850       860       870        

          1300      1310      1320      1330      1340      1350   
pF1KB5 ENLEQLIDQKLKDYEDLREDMRGKELEVKNLLEKGKTEQQTADQLLARADAAKALAEEAA
       ..: .:. ... ...  .... . . :...::..::. .. .::::.::. ::. :.:: 
NP_061 DSLSSLVTRHMDEFKRTQKNLGNWKEEAQQLLQNGKSGREKSDQLLSRANLAKSRAQEAL
      880       890       900       910       920       930        

          1360      1370      1380      1390      1400      1410   
pF1KB5 KKGRDTLQEANDILNNLKDFDRRVNDNKTAAEEALRKIPAINQTITEANEKTREAQQALG
       . :  :. :...::.::..:: .:.. :. ::::....  :.: ...:..::..:..:::
NP_061 SMGNATFYEVESILKNLREFDLQVDNRKAEAEEAMKRLSYISQKVSDASDKTQQAERALG
      940       950       960       970       980       990        

          1420      1430      1440      1450      1460      1470   
pF1KB5 SAAADATEAKNKAHEAERIASAVQKNATSTKAEAERTFAEVTDLDNEVNNMLKQLQEAEK
       :::::: .::: : :: .:.: ....  : . ::. :   .  ... . .. ....:.: 
NP_061 SAAADAQRAKNGAGEALEISSEIEQEIGSLNLEANVTADGALAMEKGLASLKSEMREVEG
     1000      1010      1020      1030      1040      1050        

          1480      1490      1500      1510      1520      1530   
pF1KB5 ELKRKQDDADQDMMMAGMASQAAQEAEINARKAKNSVTSLLSIINDLLEQLGQLDTVDLN
       ::.::. . : .:  . :.   ::...  :..:  .. . :. .. ::. .:        
NP_061 ELERKELEFDTNMDAVQMVITEAQKVDTRAKNAGVTIQDTLNTLDGLLHLMGM       
     1060      1070      1080      1090      1100      1110        

          1540      1550      1560      1570      1580      1590   
pF1KB5 KLNEIEGTLNKAKDEMKVSDLDRKVSDLENEAKKQEAAIMDYNRDIEEIMKDIRNLEDIR

>>NP_005553 (OMIM: 150292,226650,226700) laminin subunit  (1193 aa)
 initn: 3178 init1: 1100 opt: 2508  Z-score: 1122.2  bits: 220.1 E(85289): 9.1e-56
Smith-Waterman score: 3369; 39.9% identity (68.4% similar) in 1305 aa overlap (319-1608:9-1192)

      290       300       310       320       330       340        
pF1KB5 NGHASECMKNEFDKLVCNCKHNTYGVDCEKCLPFFNDRPWRRATAESASECLPCDCNGRS
                                     :: :    :  :::  :  :   :::::.:
NP_005                       MPALWLGCCLCFSLLLPAARAT--SRREV--CDCNGKS
                                     10        20            30    

      350       360       370       380       390       400        
pF1KB5 QECYFDPELYRSTGHGGHCTNCQDNTDGAHCERCRENFFRLGNNEACSSCHCSPVGSLST
       ..: :: ::.:.::.: .: ::.::::: :::.:...:.:  . . :  :.:.  ::::.
NP_005 RQCIFDRELHRQTGNGFRCLNCNDNTDGIHCEKCKNGFYRHRERDRCLPCNCNSKGSLSA
           40        50        60        70        80        90    

      410       420       430       440               450       460
pF1KB5 QCDSYGRCSCKPGVMGDKCDRCQPGFHSLTEAGCRP--------CSCDPSGSIDECNVET
       .::. ::::::::: : .:::: :::: ::.:::          :.:::.:    :..  
NP_005 RCDNSGRCSCKPGVTGARCDRCLPGFHMLTDAGCTQDQRLLDSKCDCDPAGIAGPCDA--
          100       110       120       130       140       150    

              470       480       490       500       510       520
pF1KB5 GRCVCKDNVEGFNCERCKPGFFNLESSNPRGCTPCFCFGHSSVCTNAVGYSVYSISSTFQ
       ::::::  : :  :.::. :..::...::.::: :::.:::. : ... :::..:.:::.
NP_005 GRCVCKPAVTGERCDRCRSGYYNLDGGNPEGCTQCFCYGHSASCRSSAEYSVHKITSTFH
            160       170       180       190       200       210  

              530       540       550       560       570       580
pF1KB5 IDEDGWRAEQRDGSEASLEWSSERQDIAVISDSYFPRYFIAPAKFLGKQVLSYGQNLSFS
        : :::.: ::.:: :.:.::...::.   ..   : ::.:::::::.: .::::.:::.
NP_005 QDVDGWKAVQRNGSPAKLQWSQRHQDVFSSAQRLDPVYFVAPAKFLGNQQVSYGQSLSFD
            220       230       240       250       260       270  

              590       600       610       620       630       640
pF1KB5 FRVDRRDTRLSAEDLVLEGAGLRVSVPLIAQGNSYPSETTVKYVFRLHEATDYPWRPALT
       .::::   . ::.:..:::::::...::.  :.. :   :  :.:::.:  .  : : :.
NP_005 YRVDRGGRHPSAHDVILEGAGLRITAPLMPLGKTLPCGLTKTYTFRLNEHPSNNWSPQLS
            280       290       300       310       320       330  

              650       660       670       680       690       700
pF1KB5 PFEFQKLLNNLTSIKIRGTYSERSAGYLDDVTLASARPGPGVPATWVESCTCPVGYGGQF
        ::...:: :::...::.::.: :.::.:.::: ::::  :.:: :::.: ::::: :::
NP_005 YFEYRRLLRNLTALRIRATYGEYSTGYIDNVTLISARPVSGAPAPWVEQCICPVGYKGQF
            340       350       360       370       380       390  

              710       720       730       740       750       760
pF1KB5 CEMCLSGYRRETPNLGPYSPCVLCACNGHSETCDPETGVCNCRDNTAGPHCEKCSDGYYG
       :. : :::.:..  :::.. :. : :.: . .:::.:: :   :..   .:  :  :.:.
NP_005 CQDCASGYKRDSARLGPFGTCIPCNCQGGG-ACDPDTGDCYSGDENPDIECADCPIGFYN
            400       410       420        430       440       450 

              770       780       790       800       810       820
pF1KB5 DSTAGTSSDCQPCPCPGGSSCAVVPKTKEVVCTNCPTGTTGKRCELCDDGYFGDPLGRNG
       :     :  :.:::: .: ::.:.:.:.::::.::: :.:: ::::: :::::::.:..:
NP_005 DPHDPRS--CKPCPCHNGFSCSVMPETEEVVCNNCPPGVTGARCELCADGYFGDPFGEHG
               460       470       480       490       500         

              830       840       850       860       870       880
pF1KB5 PVRLCRLCQCSDNIDPNAVGNCNRLTGECLKCIYNTAGFYCDRCKDGFFGNPLAPNPADK
       ::: :. :::..:.::.: :::.::::.:::::.::::.:::.:: :.::.:::::::::
NP_005 PVRPCQPCQCNNNVDPSASGNCDRLTGRCLKCIHNTAGIYCDQCKAGYFGDPLAPNPADK
     510       520       530       540       550       560         

              890       900       910       920       930       940
pF1KB5 CKACNCNPYGTMKQQSSCNPVTGQCECLPHVTGQDCGACDPGFYNLQSGQGCERCDCHAL
       :.::::::.:.       .::                             :: : :    
NP_005 CRACNCNPMGS-------EPV-----------------------------GC-RSD----
     570       580                                                 

              950       960       970       980       990      1000
pF1KB5 GSTNGQCDIRTGQCECQPGITGQHCERCEVNHFGFGPEGCKPCDCHPEGSLSLQCKDDGR
                  : : :.::. : .::     :                :..:        
NP_005 -----------GTCVCKPGFGGPNCE-----H----------------GAFS--------
                 590       600                                     

             1010      1020      1030      1040      1050      1060
pF1KB5 CECREGFVGNRCDQCEENYFYNRSWPGCQECPACYRLVKDKVADHRVKLQELESLIANLG
                                     :::::  :: .. .   .::..:.::..  
NP_005 ------------------------------CPACYNQVKIQMDQFMQQLQRMEALISKAQ
                                    610       620       630        

             1070      1080      1090      1100      1110      1120
pF1KB5 TGDEMVTDQAFEDRLKEAEREVMDLLREAQDVKDVDQNLMDRLQRVNNTLSSQISRLQNI
        :: .: :  .: :...::. ..:.::.::  . ....:  .: .: .  .:  :::...
NP_005 GGDGVVPDTELEGRMQQAEQALQDILRDAQISEGASRSLGLQLAKVRSQENSYQSRLDDL
      640       650       660       670       680       690        

             1130      1140      1150      1160      1170      1180
pF1KB5 RNTIEETGNLAEQARAHVENTERLIEIASRELEKAKVAAANVSVTQPESTGDPNNMTLLA
       . :.:..  :. : . .:..:.:::   .  : ..... .:...   .    ::..  ::
NP_005 KMTVERVRALGSQYQNRVRDTHRLITQMQLSLAESEASLGNTNIPASDHYVGPNGFKSLA
      700       710       720       730       740       750        

             1190      1200      1210         1220         1230    
pF1KB5 EEARKLAERHKQEADDIVRVAKTANDTSTEAYNLLLRTL---AGENQTAFE---IEELNR
       .:: .::: : . :... .... ..: : .: .:. ..:   .: .. . .   .. : .
NP_005 QEATRLAESHVESASNMEQLTRETEDYSKQALSLVRKALHEGVGSGSGSPDGAVVQGLVE
      760       770       780       790       800       810        

         1240      1250      1260      1270      1280       1290   
pF1KB5 KYEQAKNISQDLEKQAARVHEEAKRAGDKAVEIYASVAQLSPLDSETLE-NEANNIKMEA
       : :..:...:.: ..:.... :: :. ......  ::..:. ....... .::. ::..:
NP_005 KLEKTKSLAQQLTREATQAEIEADRSYQHSLRLLDSVSRLQGVSDQSFQVEEAKRIKQKA
      820       830       840       850       860       870        

          1300      1310      1320      1330      1340      1350   
pF1KB5 ENLEQLIDQKLKDYEDLREDMRGKELEVKNLLEKGKTEQQTADQLLARADAAKALAEEAA
       ..: .:. ... ...  .... . . :...::..::. .. .::::.::. ::. :.:: 
NP_005 DSLSSLVTRHMDEFKRTQKNLGNWKEEAQQLLQNGKSGREKSDQLLSRANLAKSRAQEAL
      880       890       900       910       920       930        

          1360      1370      1380      1390      1400      1410   
pF1KB5 KKGRDTLQEANDILNNLKDFDRRVNDNKTAAEEALRKIPAINQTITEANEKTREAQQALG
       . :  :. :...::.::..:: .:.. :. ::::....  :.: ...:..::..:..:::
NP_005 SMGNATFYEVESILKNLREFDLQVDNRKAEAEEAMKRLSYISQKVSDASDKTQQAERALG
      940       950       960       970       980       990        

          1420      1430      1440      1450      1460      1470   
pF1KB5 SAAADATEAKNKAHEAERIASAVQKNATSTKAEAERTFAEVTDLDNEVNNMLKQLQEAEK
       :::::: .::: : :: .:.: ....  : . ::. :   .  ... . .. ....:.: 
NP_005 SAAADAQRAKNGAGEALEISSEIEQEIGSLNLEANVTADGALAMEKGLASLKSEMREVEG
     1000      1010      1020      1030      1040      1050        

          1480      1490      1500      1510      1520      1530   
pF1KB5 ELKRKQDDADQDMMMAGMASQAAQEAEINARKAKNSVTSLLSIINDLLEQLGQLDTVDLN
       ::.::. . : .:  . :.   ::...  :..:  .. . :. .. ::. . :  .:: .
NP_005 ELERKELEFDTNMDAVQMVITEAQKVDTRAKNAGVTIQDTLNTLDGLLHLMDQPLSVDEE
     1060      1070      1080      1090      1100      1110        

          1540      1550      1560      1570      1580      1590   
pF1KB5 KLNEIEGTLNKAKDEMKVSDLDRKVSDLENEAKKQEAAIMDYNRDIEEIMKDIRNLEDIR
        :  .:  :..:: ... :.:   .:.::..:..:.. .   . .:. :. :..:::.::
NP_005 GLVLLEQKLSRAKTQIN-SQLRPMMSELEERARQQRGHLHLLETSIDGILADVKNLENIR
     1120      1130       1140      1150      1160      1170       

          1600         
pF1KB5 KTLPSGCFNTPSIEKP
        .:: ::.:: ..:. 
NP_005 DNLPPGCYNTQALEQQ
      1180      1190   

>>XP_006721658 (OMIM: 601614) PREDICTED: netrin-1 isofor  (604 aa)
 initn: 1008 init1: 564 opt: 1548  Z-score: 706.0  bits: 142.1 E(85289): 1.4e-32
Smith-Waterman score: 1555; 48.6% identity (74.6% similar) in 453 aa overlap (17-445:5-451)

               10        20         30                    40       
pF1KB5 MRGSHRAAPALRPRGRLWPVLAVLAAAAA-AGCA-----------QAAM-DECTDEGGRP
                       .: .::.:::.:  .: .           :::. : :.::.:.:
XP_006             MMRAVWEALAALAAVACLVGAVRGGPGLSMFAGQAAQPDPCSDENGHP
                           10        20        30        40        

        50        60        70          80        90       100     
pF1KB5 QRCMPEFVNAAFNVTVVATNTCGTPPEEYCV--QTGVTGVTKSCHLCDAGQPHLQHGAAF
       .::.:.::::::.  : ...::: :: .:::  . :   . .:::::.:..:.  :  ::
XP_006 RRCIPDFVNAAFGKDVRVSSTCGRPPARYCVVSERGEERL-RSCHLCNASDPKKAHPPAF
       50        60        70        80         90       100       

         110       120       130       140       150       160     
pF1KB5 LTDYNNQADTTWWQSQTMLAGVQYPSSINLTLHLGKAFDITYVRLKFHTSRPESFAIYKR
       ::: ::  . : :::...:   :.: ...::: ::: :..::: :.: . ::::.:::: 
XP_006 LTDLNNPHNLTCWQSENYL---QFPHNVTLTLSLGKKFEVTYVSLQFCSPRPESMAIYKS
       110       120          130       140       150       160    

         170       180       190       200       210       220     
pF1KB5 TREDGPWIPYQYYSGSCENTYSKANRGFIRTGGDEQQALCTDEFSDISPLTGGNVAFSTL
             :.:.:.:: .:.. :.. .:. : :  .::.:.:::  .:. ::.:: .:::::
XP_006 MDYGRTWVPFQFYSTQCRKMYNRPHRAPI-TKQNEQEAVCTDSHTDMRPLSGGLIAFSTL
          170       180       190        200       210       220   

         230       240       250       260       270        280    
pF1KB5 EGRPSAYNFDNSPVLQEWVTATDIRVTLNRLNTFGDEVFNDPKVLK-SYYYAISDFAVGG
       .:::::..::::::::.:::::::::...::.:::::  .: .. . ::.::.::. :::
XP_006 DGRPSAHDFDNSPVLQDWVTATDIRVAFSRLHTFGDENEDDSELARDSYFYAVSDLQVGG
           230       240       250       260       270       280   

          290       300       310       320       330       340    
pF1KB5 RCKCNGHASECMKNEFDKLVCNCKHNTYGVDCEKCLPFFNDRPWRRATAESASECLPCDC
       ::::::::..:.... :.:::.:.::: : .:..: ::  ::::.::::. :.::. :.:
XP_006 RCKCNGHAARCVRDRDDSLVCDCRHNTAGPECDRCKPFHYDRPWQRATAREANECVACNC
           290       300       310       320       330       340   

          350       360         370       380        390           
pF1KB5 NGRSQECYFDPELYRSTGH--GGHCTNCQDNTDGAHCERCRENFFR-LG----NNEACSS
       : ....: :. :::. .:.  :: : ::. :: : ::. :.:...: .:    . .::..
XP_006 NLHARRCRFNMELYKLSGRKSGGVCLNCRHNTAGRHCHYCKEGYYRDMGKPITHRKACKA
           350       360       370       380       390       400   

       400       410        420       430       440       450      
pF1KB5 CHCSPVGSLSTQCD-SYGRCSCKPGVMGDKCDRCQPGFHSLTEAGCRPCSCDPSGSIDEC
       : : :::. .  :. . :.: :: :: :  :.::  :... ...   ::           
XP_006 CDCHPVGAAGKTCNQTTGQCPCKDGVTGITCNRCAKGYQQ-SRSPIAPCIKIPVAPPTTA
           410       420       430       440        450       460  

        460       470       480       490       500       510      
pF1KB5 NVETGRCVCKDNVEGFNCERCKPGFFNLESSNPRGCTPCFCFGHSSVCTNAVGYSVYSIS
                                                                   
XP_006 ASSVEEPEDCDSYCKASKGKLKINMKKYCKKDYAVQIHILKADKAGDWWKFTVNIISVYK
            470       480       490       500       510       520  

>>NP_004813 (OMIM: 601614) netrin-1 precursor [Homo sapi  (604 aa)
 initn: 1008 init1: 564 opt: 1548  Z-score: 706.0  bits: 142.1 E(85289): 1.4e-32
Smith-Waterman score: 1555; 48.6% identity (74.6% similar) in 453 aa overlap (17-445:5-451)

               10        20         30                    40       
pF1KB5 MRGSHRAAPALRPRGRLWPVLAVLAAAAA-AGCA-----------QAAM-DECTDEGGRP
                       .: .::.:::.:  .: .           :::. : :.::.:.:
NP_004             MMRAVWEALAALAAVACLVGAVRGGPGLSMFAGQAAQPDPCSDENGHP
                           10        20        30        40        

        50        60        70          80        90       100     
pF1KB5 QRCMPEFVNAAFNVTVVATNTCGTPPEEYCV--QTGVTGVTKSCHLCDAGQPHLQHGAAF
       .::.:.::::::.  : ...::: :: .:::  . :   . .:::::.:..:.  :  ::
NP_004 RRCIPDFVNAAFGKDVRVSSTCGRPPARYCVVSERGEERL-RSCHLCNASDPKKAHPPAF
       50        60        70        80         90       100       

         110       120       130       140       150       160     
pF1KB5 LTDYNNQADTTWWQSQTMLAGVQYPSSINLTLHLGKAFDITYVRLKFHTSRPESFAIYKR
       ::: ::  . : :::...:   :.: ...::: ::: :..::: :.: . ::::.:::: 
NP_004 LTDLNNPHNLTCWQSENYL---QFPHNVTLTLSLGKKFEVTYVSLQFCSPRPESMAIYKS
       110       120          130       140       150       160    

         170       180       190       200       210       220     
pF1KB5 TREDGPWIPYQYYSGSCENTYSKANRGFIRTGGDEQQALCTDEFSDISPLTGGNVAFSTL
             :.:.:.:: .:.. :.. .:. : :  .::.:.:::  .:. ::.:: .:::::
NP_004 MDYGRTWVPFQFYSTQCRKMYNRPHRAPI-TKQNEQEAVCTDSHTDMRPLSGGLIAFSTL
          170       180       190        200       210       220   

         230       240       250       260       270        280    
pF1KB5 EGRPSAYNFDNSPVLQEWVTATDIRVTLNRLNTFGDEVFNDPKVLK-SYYYAISDFAVGG
       .:::::..::::::::.:::::::::...::.:::::  .: .. . ::.::.::. :::
NP_004 DGRPSAHDFDNSPVLQDWVTATDIRVAFSRLHTFGDENEDDSELARDSYFYAVSDLQVGG
           230       240       250       260       270       280   

          290       300       310       320       330       340    
pF1KB5 RCKCNGHASECMKNEFDKLVCNCKHNTYGVDCEKCLPFFNDRPWRRATAESASECLPCDC
       ::::::::..:.... :.:::.:.::: : .:..: ::  ::::.::::. :.::. :.:
NP_004 RCKCNGHAARCVRDRDDSLVCDCRHNTAGPECDRCKPFHYDRPWQRATAREANECVACNC
           290       300       310       320       330       340   

          350       360         370       380        390           
pF1KB5 NGRSQECYFDPELYRSTGH--GGHCTNCQDNTDGAHCERCRENFFR-LG----NNEACSS
       : ....: :. :::. .:.  :: : ::. :: : ::. :.:...: .:    . .::..
NP_004 NLHARRCRFNMELYKLSGRKSGGVCLNCRHNTAGRHCHYCKEGYYRDMGKPITHRKACKA
           350       360       370       380       390       400   

       400       410        420       430       440       450      
pF1KB5 CHCSPVGSLSTQCD-SYGRCSCKPGVMGDKCDRCQPGFHSLTEAGCRPCSCDPSGSIDEC
       : : :::. .  :. . :.: :: :: :  :.::  :... ...   ::           
NP_004 CDCHPVGAAGKTCNQTTGQCPCKDGVTGITCNRCAKGYQQ-SRSPIAPCIKIPVAPPTTA
           410       420       430       440        450       460  

        460       470       480       490       500       510      
pF1KB5 NVETGRCVCKDNVEGFNCERCKPGFFNLESSNPRGCTPCFCFGHSSVCTNAVGYSVYSIS
                                                                   
NP_004 ASSVEEPEDCDSYCKASKGKLKINMKKYCKKDYAVQIHILKADKAGDWWKFTVNIISVYK
            470       480       490       500       510       520  

>>NP_002282 (OMIM: 150240,615191) laminin subunit beta-1  (1786 aa)
 initn: 1222 init1: 363 opt: 1209  Z-score: 552.6  bits: 115.3 E(85289): 4.9e-24
Smith-Waterman score: 2018; 27.6% identity (53.7% similar) in 1701 aa overlap (132-1596:120-1761)

             110       120       130       140       150       160 
pF1KB5 GAAFLTDYNNQADTTWWQSQTMLAGVQYPSSINLTLHLGKAFDITYVRLKFHTSRPESFA
                                     .... : :   : .:.. . :.: :: .. 
NP_002 NPDSHLIENVVTTFAPNRLKIWWQSENGVENVTIQLDLEAEFHFTHLIMTFKTFRPAAML
      90       100       110       120       130       140         

             170       180       190       200       210       220 
pF1KB5 IYKRTREDGPWIPYQYYSGSCENTYSKANRGFIRTGGDEQQALCTDEFSDISPLTGGNVA
       : . .     :  :.:.. .:: ..   . : ..   :    .: ...::: : : :.: 
NP_002 IERSSDFGKTWGVYRYFAYDCEASFPGISTGPMKKVDD---IICDSRYSDIEPSTEGEVI
     150       160       170       180          190       200      

             230         240       250       260        270        
pF1KB5 FSTLEGRPSAYNFDN--SPVLQEWVTATDIRVTLNRLNTFGDEVFNDP-KVLKSYYYAIS
       : .:.  : :.....  :: .:. .  :..:. . .:.:.::.....  .. ..::::. 
NP_002 FRALD--P-AFKIEDPYSPRIQNLLKITNLRIKFVKLHTLGDNLLDSRMEIREKYYYAVY
        210          220       230       240       250       260   

      280       290            300          310       320       330
pF1KB5 DFAVGGRCKCNGHASEC-----MKNEFDKLV---CNCKHNTYGVDCEKCLPFFNDRPWRR
       :..: : : : ::::::     ...: . .:   : :.::: :..:: :. :..: ::: 
NP_002 DMVVRGNCFCYGHASECAPVDGFNEEVEGMVHGHCMCRHNTKGLNCELCMDFYHDLPWRP
           270       280       290       300       310       320   

              340       350       360         370       380        
pF1KB5 ATAESASECLPCDCNGRSQECYFDPELYRSTGH--GGHCTNCQDNTDGAHCERCRENFFR
       : ..... :  :.:: .:  :.::  .: .::.  :: : .:: :: : .::.:.  ...
NP_002 AEGRNSNACKKCNCNEHSISCHFDMAVYLATGNVSGGVCDDCQHNTMGRNCEQCKPFYYQ
           330       340       350       360       370       380   

           390       400        410                420       430   
pF1KB5 -----LGNNEACSSCHCSPVGSLSTQ-CDSY---------GRCSCKPGVMGDKCDRCQPG
            . . . :  : :.:.:: .   ::::         :.: :: .: :..:: :. :
NP_002 HPERDIRDPNFCERCTCDPAGSQNEGICDSYTDFSTGLIAGQCRCKLNVEGEHCDVCKEG
           390       400       410       420       430       440   

           440          450          460       470       480       
pF1KB5 FHSLTEA---GCRPCSCDPSGSI---DECNVETGRCVCKDNVEGFNCERCKPGFFNLESS
       :..:.     ::. :.:.: :.:   . :. :::.: ::  : : .:..: :  ..: :.
NP_002 FYDLSSEDPFGCKSCACNPLGTIPGGNPCDSETGHCYCKRLVTGQHCDQCLPEHWGL-SN
           450       460       470       480       490       500   

       490                 500          510       520          530 
pF1KB5 NPRGCTPC----------FCFGHSSVCT---NAVGYSVYSISSTFQ---IDEDGWRAEQR
       .  :: ::           ::..:. :.   . .: .   .   .    .:.  ..::. 
NP_002 DLDGCRPCDCDLGGALNNSCFAESGQCSCRPHMIGRQCNEVEPGYYFATLDHYLYEAEEA
            510       520       530       540       550       560  

              540       550       560       570       580          
pF1KB5 D-GSEASLEWSSERQDIAVISDSYFPRYFIAPAKFLGKQVLSYGQNLSFSFRVD---RRD
       . :  .:.    ::: :     :.    :.   .  :  .  . .:. .:.. :   : .
NP_002 NLGPGVSI---VERQYIQDRIPSWTGAGFVRVPE--GAYLEFFIDNIPYSMEYDILIRYE
            570          580       590         600       610       

       590       600           610                                 
pF1KB5 TRLSAEDLVLEGAGLRVS----VPLIAQ-GNSYPS-----------------------ET
        .:  .    : : . :.    .:  .. ::. :.                       : 
NP_002 PQLPDH---WEKAVITVQRPGRIPTSSRCGNTIPDDDNQVVSLSPGSRYVVLPRPVCFEK
       620          630       640       650       660       670    

     620           630                      640                    
pF1KB5 TVKYVFRL----HEATD---------------YPWRPALTPFE----------------F
        ..:. ::    . ..:               .:.  .:  :                 :
NP_002 GTNYTVRLELPQYTSSDSDVESPYTLIDSLVLMPYCKSLDIFTVGGSGDGVVTNSAWETF
          680       690       700       710       720       730    

             650       660                           670           
pF1KB5 QK---LLNNLTSIKIRGTYSERSA--------------------GYLDDV----------
       :.   : :. . .:   :   :.                     : :..:          
NP_002 QRYRCLENSRSVVKTPMTDVCRNIIFSISALLHQTGLACECDPQGSLSSVCDPNGGQCQC
          740       750       760       770       780       790    

                    680        690        700              710     
pF1KB5 -------TLASARPGP-GVPATWVESCTCPV-GYGGQFCE------MCLSG-YRRETPNL
              :     ::  :   .  . : : . :  . ::.       :..: : :.    
NP_002 RPNVVGRTCNRCAPGTFGFGPSGCKPCECHLQGSVNAFCNPVTGQCHCFQGVYARQCDRC
          800       810       820       830       840       850    

             720       730       740        750       760       770
pF1KB5 GP----YSPCVLCACNGHSETCDPETGVC-NCRDNTAGPHCEKCSDGYYGDSTAGTSSDC
        :    .  :  : ::::.. ::: :: : ::.: : : .::.:  :::::   :... :
NP_002 LPGHWGFPSCQPCQCNGHADDCDPVTGECLNCQDYTMGHNCERCLAGYYGDPIIGSGDHC
          860       870       880       890       900       910    

                      780       790       800       810       820  
pF1KB5 QPCPCPGGS--------SCAVVPKTKEVVCTNCPTGTTGKRCELCDDGYFGDPLGRNGPV
       .::::: :         ::   : : ...:. :  :  :.::. : .::::.:   .:  
NP_002 RPCPCPDGPDSGRQFARSCYQDPVTLQLACV-CDPGYIGSRCDDCASGYFGNPSEVGGS-
          920       930       940        950       960       970   

            830       840       850       860       870       880  
pF1KB5 RLCRLCQCSDNIDPNAVGNCNRLTGECLKCIYNTAGFYCDRCKDGFFGNPLAPNPADKCK
         :. ::: .::: .    :.. ::.::::.:.: : .:. :. :..:. :  .    :.
NP_002 --CQPCQCHNNIDTTDPEACDKETGRCLKCLYHTEGEHCQFCRFGYYGDALQQD----CR
              980       990      1000      1010      1020          

            890            900       910       920       930       
pF1KB5 ACNCNPYGTMKQQSS-----CNPVTGQCECLPHVTGQDCGACDPGFYNLQSGQGCERCDC
        : ::  ::.... .     :. .:::: :::.: ::.:  : :. ..: :: ::. :.:
NP_002 KCVCNYLGTVQEHCNGSDCQCDKATGQCLCLPNVIGQNCDRCAPNTWQLASGTGCDPCNC
       1030      1040      1050      1060      1070      1080      

       940       950       960       970       980       990       
pF1KB5 HALGSTNGQCDIRTGQCECQPGITGQHCERCEVNHFGFGPEGCKPCDCHPEGSLSLQC-K
       .:  : . .:.  ::::.:.::. :. : .:.   .:     :. ::: :.:  . :: .
NP_002 NAAHSFGPSCNEFTGQCQCMPGFGGRTCSECQELFWGDPDVECRACDCDPRGIETPQCDQ
       1090      1100      1110      1120      1130      1140      

       1000      1010      1020      1030      1040           1050 
pF1KB5 DDGRCECREGFVGNRCDQCEENYFYNRSWPGCQECPACYRLVKDKVAD-----HRVKLQE
       . :.: : ::  : :::.: ..  :.  .: :  :  :. :    .:.     ::  :..
NP_002 STGQCVCVEGVEGPRCDKCTRG--YSGVFPDCTPCHQCFALWDVIIAELTNRTHRF-LEK
       1150      1160        1170      1180      1190      1200    

            1060      1070                  1080      1090         
pF1KB5 LESLIANLGTGDEMVTDQAFEDRLKE----------AE--REVMDLLREAQD-VKDVDQ-
        ..:  .   :    : .. : ...:          ::  ... .:..::.  .::: . 
NP_002 AKALKISGVIGPYRETVDSVERKVSEIKDILAQSPAAEPLKNIGNLFEEAEKLIKDVTEM
          1210      1220      1230      1240      1250      1260   

            1100         1110      1120      1130      1140        
pF1KB5 ------NLMDRLQRVNNT---LSSQISRLQNIRNTIEETGNLAEQARAHVENTE-R-LIE
             .: :  .. :.:   :.:  .. ... ::..:   :::: .  ..:.. :  ..
NP_002 MAQVEVKLSDTTSQSNSTAKELDSLQTEAESLDNTVKE---LAEQLE-FIKNSDIRGALD
          1270      1280      1290      1300          1310         

       1150        1160      1170            1180      1190        
pF1KB5 IASRELEKAKVAA--ANVSVTQPESTGDPNNMT------LLAEEARKLAERHKQEADDIV
         .. .. .  :   .:.:.:.:.:: . . .       .. :.  .. :.....:  . 
NP_002 SITKYFQMSLEAEERVNASTTEPNSTVEQSALMRDRVEDVMMERESQFKEKQEEQARLLD
    1320      1330      1340      1350      1360      1370         

     1200       1210      1220      1230        1240      1250     
pF1KB5 RVA-KTANDTSTEAYNLLLRTLAGENQTAFEIEELNRKYEQA--KNISQDLEKQAARVHE
       ..: :  .   . : ..   :  : . .  :    : . ...  :  .      .. .:.
NP_002 ELAGKLQSLDLSAAAEMTCGTPPGASCSETECGGPNCRTDEGERKCGGPGCGGLVTVAHN
    1380      1390      1400      1410      1420      1430         

        1260      1270      1280      1290      1300      1310     
pF1KB5 EAKRAGDKAVEIYASVAQLSPLDSETLENEANNIKMEAENLEQLIDQKLKDYEDLREDMR
         ..: :   .. ...:..     : : . ... :..:.. .:  .. :   .  .: : 
NP_002 AWQKAMDLDQDVLSALAEV-----EQLSKMVSEAKLRADEAKQSAEDILLKTNATKEKMD
    1440      1450           1460      1470      1480      1490    

        1320      1330        1340      1350      1360      1370   
pF1KB5 GKELEVKNLLEKGKT--EQQTADQLLARADAAKALAEEAAKKGRDTLQEANDILNNL-KD
        .. :..::... ..   :..::      :. .:.:.:. :     .  . . :.:: .:
NP_002 KSNEELRNLIKQIRNFLTQDSADL-----DSIEAVANEVLKM---EMPSTPQQLQNLTED
         1500      1510           1520      1530         1540      

           1380      1390      1400      1410         1420         
pF1KB5 FDRRVNDNKTAAEEALRKIPAINQTITEANEKTREAQQALGSAA---ADATEAKNKAHEA
       . .:: .. . .:  :..  :    :..:.   .::..:  ::.   . :  .:.  .::
NP_002 IRERV-ESLSQVEVILQHSAA---DIARAEMLLEEAKRASKSATDVKVTADMVKEALEEA
       1550       1560         1570      1580      1590      1600  

    1430      1440      1450      1460      1470      1480         
pF1KB5 ERIASAVQKNATSTKAEAERTFAEVTDLDNEVNNMLKQLQEAEKELKRKQDDADQDMMMA
       :.   :..:   ..  . . :   .:....:.    . : .: ..... . ....   . 
NP_002 EKAQVAAEKAIKQADEDIQGTQNLLTSIESETAASEETLFNASQRISELERNVEE---LK
           1610      1620      1630      1640      1650            

    1490      1500      1510      1520      1530      1540         
pF1KB5 GMASQAAQEAEINARKAKNSVTSLLSIINDLLEQLGQLDTVDLNKLNEIEGTLNKAKDEM
         :.: . :::   .:.  .: .    ..  :.  :.::    .: ...:. . :  .: 
NP_002 RKAAQNSGEAEY-IEKVVYTVKQSAEDVKKTLD--GELD----EKYKKVENLIAKKTEE-
    1660      1670       1680      1690            1700      1710  

    1550      1560         1570      1580       1590      1600     
pF1KB5 KVSDLDRKVSDLENEAKK---QEAAIMDYNRDIEEIMKDI-RNLEDIRKTLPSGCFNTPS
         .:  ::.  :.::::    :  . ..  .:.:. ..:  : :::  . :         
NP_002 -SADARRKAEMLQNEAKTLLAQANSKLQLLKDLERKYEDNQRYLEDKAQELARLEGEVRS
             1720      1730      1740      1750      1760      1770

                       
pF1KB5 IEKP            
                       
NP_002 LLKDISQKVAVYSTCL
             1780      




1609 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Wed Nov  2 22:59:21 2016 done: Wed Nov  2 22:59:23 2016
 Total Scan time: 12.820 Total Display time:  0.510

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com