Result of FASTA (ccds) for pF1KA1975
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA1975, 550 aa
  1>>>pF1KA1975 550 - 550 aa - 550 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4484+/-0.00103; mu= 8.2690+/- 0.062
 mean_var=144.0034+/-29.022, 0's: 0 Z-trim(108.3): 100  B-trim: 96 in 2/48
 Lambda= 0.106878
 statistics sampled from 10021 (10128) to 10021 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.674), E-opt: 0.2 (0.311), width:  16
 Scan time:  3.160

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS2514.1 AGAP1 gene_id:116987|Hs108|chr2         ( 804) 2814 446.2 6.8e-125
CCDS33408.1 AGAP1 gene_id:116987|Hs108|chr2        ( 857) 1962 314.9 2.5e-85
CCDS44439.1 AGAP5 gene_id:729092|Hs108|chr10       ( 686) 1796 289.2 1.1e-77
CCDS7215.1 AGAP4 gene_id:119016|Hs108|chr10        ( 663) 1784 287.3 3.8e-77
CCDS44397.1 AGAP6 gene_id:414189|Hs108|chr10       ( 686) 1759 283.5 5.6e-76
CCDS73125.1 AGAP9 gene_id:642517|Hs108|chr10       ( 658) 1464 238.0 2.7e-62
CCDS43681.1 AGAP3 gene_id:116988|Hs108|chr7        ( 911) 1407 229.3 1.5e-59
CCDS64802.1 AGAP3 gene_id:116988|Hs108|chr7        ( 580) 1277 209.1 1.2e-53
CCDS8951.1 AGAP2 gene_id:116986|Hs108|chr12        ( 836) 1208 198.6 2.5e-50
CCDS44932.1 AGAP2 gene_id:116986|Hs108|chr12       (1192) 1155 190.5 9.5e-48
CCDS58756.1 AGAP1 gene_id:116987|Hs108|chr2        ( 405)  437 79.5 8.5e-15
CCDS19.2 ACAP3 gene_id:116983|Hs108|chr1           ( 834)  438 79.9 1.4e-14
CCDS75788.1 ASAP1 gene_id:50807|Hs108|chr8         (1122)  435 79.5 2.4e-14
CCDS6362.1 ASAP1 gene_id:50807|Hs108|chr8          (1129)  435 79.5 2.4e-14
CCDS33924.1 ACAP2 gene_id:23527|Hs108|chr3         ( 778)  414 76.1 1.7e-13
CCDS11101.1 ACAP1 gene_id:9744|Hs108|chr17         ( 740)  402 74.3 5.8e-13
CCDS46224.1 ASAP2 gene_id:8853|Hs108|chr2          ( 961)  379 70.8 8.3e-12
CCDS1661.1 ASAP2 gene_id:8853|Hs108|chr2           (1006)  379 70.8 8.7e-12
CCDS44087.1 ASAP3 gene_id:55616|Hs108|chr1         ( 894)  377 70.5 9.8e-12
CCDS235.1 ASAP3 gene_id:55616|Hs108|chr1           ( 903)  377 70.5 9.8e-12


>>CCDS2514.1 AGAP1 gene_id:116987|Hs108|chr2              (804 aa)
 initn: 2151 init1: 1676 opt: 2814  Z-score: 2355.7  bits: 446.2 E(32554): 6.8e-125
Smith-Waterman score: 2814; 82.6% identity (93.2% similar) in 516 aa overlap (36-548:261-776)

          10        20        30        40        50        60     
pF1KA1 VTLEIHHHITERDADRSLTILDEQLYSFAFSTVHITKKRNGGGSLNNYSSSIPLTPSTSQ
                                     :.:::..  ::::::..::::.: ::::::
CCDS25 ATRKKQQLSIGPCKSLPNSPSHSSVCSAQVSAVHISQTSNGGGSLSDYSSSVPSTPSTSQ
              240       250       260       270       280       290

          70        80        90       100       110       120     
pF1KA1 EDLYFSVPPTANTPTPVCKQSMGWSNLFTSEKGSDPDKGRKALESHADTIGSGRAIPIKQ
       ..: ..::::::::::: :::   ::::::.::::::: .:.:::.::.:::::::::::
CCDS25 KELRIDVPPTANTPTPVRKQSKRRSNLFTSRKGSDPDKEKKGLESRADSIGSGRAIPIKQ
              300       310       320       330       340       350

         130        140       150       160       170       180    
pF1KA1 GMLLKRSGKWL-KTWKKKYVTLCSNGVLTYYSSLGDYMKNIHKKEIDLRTSTIKVPGKWP
       ::::::::: : : :::::::::.::::::. :: :::.:.: :::::  .:.::::: :
CCDS25 GMLLKRSGKSLNKEWKKKYVTLCDNGVLTYHPSLHDYMQNVHGKEIDLLRTTVKVPGKRP
              360       370       380       390       400       410

          190       200       210       220       230       240    
pF1KA1 SLATSACAPISSSKSNGLSKDMEALHMSANSDIGLGDSICFSPSISSTTSPKLNLPPSPH
         :::::::::: :.::::::: .::.: ::: :::::.: ::::::::::::. :::::
CCDS25 PRATSACAPISSPKTNGLSKDMSSLHISPNSDTGLGDSVCSSPSISSTTSPKLDPPPSPH
              420       430       440       450       460       470

          250       260       270         280       290       300  
pF1KA1 ANKKKHLKKKSTNNLKDDGLSSTAEEEEE--KFMIVSVTGQTCHFKATTYEERDAWVQAI
       ::.::: .::::.:.: ::::.::::.::  .:.:::.:::: ::.::::::::::::::
CCDS25 ANRKKHRRKKSTSNFKADGLSGTAEEQEENFEFIIVSLTGQTWHFEATTYEERDAWVQAI
              480       490       500       510       520       530

            310       320       330       340       350       360  
pF1KA1 QSQILASLQSCESSKSKSQLTSQSEAMALQSIQNMRGNSHCVDCETQNPKWASLNLGVLM
       .::::::::::::::.::.:::::::::::::.::::::::::::::::.:::::::.::
CCDS25 ESQILASLQSCESSKNKSRLTSQSEAMALQSIRNMRGNSHCVDCETQNPNWASLNLGALM
              540       550       560       570       580       590

            370       380       390       400       410       420  
pF1KA1 CIECSGIHRSLGTRLSRVRSLELDDWPVELRKVMSSIGNDLANSIWEGSSQGQTKPSIES
       :::::::::.:::.:::::::.:::::::: ::::::::.::::.:: ::::.::::..:
CCDS25 CIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPVELIKVMSSIGNELANSVWEESSQGRTKPSVDS
              600       610       620       630       640       650

            430       440       450       460       470       480  
pF1KA1 TREEKERWIRSKYEHKLFLAPLPCTELSLGQHLLRATADEDLRTAILLLAHGSREEVNET
       ::::::::::.:::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::
CCDS25 TREEKERWIRAKYEQKLFLAPLPCTELSLGQHLLRATADEDLRTAILLLAHGSRDEVNET
              660       670       680       690       700       710

            490       500       510       520       530       540  
pF1KA1 CGEGDGCTALHLACRKGNVVLAQLLIWYGVDVMARDAHGNTALTYARQASSQECINVLLQ
       :::::: ::::::::::::::::::::::::: ::::::::::.:::::::::::.::::
CCDS25 CGEGDGRTALHLACRKGNVVLAQLLIWYGVDVTARDAHGNTALAYARQASSQECIDVLLQ
              720       730       740       750       760       770

            550                          
pF1KA1 YGCPDECV                          
       ::::::                            
CCDS25 YGCPDERFVLMATPNLSRRNNNRNNSSGRVPTII
              780       790       800    

>>CCDS33408.1 AGAP1 gene_id:116987|Hs108|chr2             (857 aa)
 initn: 2151 init1: 1676 opt: 1962  Z-score: 1645.3  bits: 314.9 E(32554): 2.5e-85
Smith-Waterman score: 2698; 74.9% identity (84.5% similar) in 569 aa overlap (36-548:261-829)

          10        20        30        40        50        60     
pF1KA1 VTLEIHHHITERDADRSLTILDEQLYSFAFSTVHITKKRNGGGSLNNYSSSIPLTPSTSQ
                                     :.:::..  ::::::..::::.: ::::::
CCDS33 ATRKKQQLSIGPCKSLPNSPSHSSVCSAQVSAVHISQTSNGGGSLSDYSSSVPSTPSTSQ
              240       250       260       270       280       290

          70        80        90       100       110       120     
pF1KA1 EDLYFSVPPTANTPTPVCKQSMGWSNLFTSEKGSDPDKGRKALESHADTIGSGRAIPIKQ
       ..: ..::::::::::: :::   ::::::.::::::: .:.:::.::.:::::::::::
CCDS33 KELRIDVPPTANTPTPVRKQSKRRSNLFTSRKGSDPDKEKKGLESRADSIGSGRAIPIKQ
              300       310       320       330       340       350

         130        140       150       160       170       180    
pF1KA1 GMLLKRSGKWL-KTWKKKYVTLCSNGVLTYYSSLGDYMKNIHKKEIDLRTSTIKVPGKWP
       ::::::::: : : :::::::::.::::::. :: :::.:.: :::::  .:.::::: :
CCDS33 GMLLKRSGKSLNKEWKKKYVTLCDNGVLTYHPSLHDYMQNVHGKEIDLLRTTVKVPGKRP
              360       370       380       390       400       410

          190       200       210                                  
pF1KA1 SLATSACAPISSSKSNGLSKDMEALHMSANS-----------------------------
         :::::::::: :.::::::: .::.: ::                             
CCDS33 PRATSACAPISSPKTNGLSKDMSSLHISPNSGNVTSASGSQMASGISLVSFNSRPDGMHQ
              420       430       440       450       460       470

                                 220       230       240       250 
pF1KA1 ------------------------DIGLGDSICFSPSISSTTSPKLNLPPSPHANKKKHL
                               : :::::.: ::::::::::::. :::::::.::: 
CCDS33 RSYSVSSADQWSEATVIANSAISSDTGLGDSVCSSPSISSTTSPKLDPPPSPHANRKKHR
              480       490       500       510       520       530

             260       270         280       290       300         
pF1KA1 KKKSTNNLKDDGLSSTAEEEEE--KFMIVSVTGQTCHFKATTYEERDAWVQAIQSQILAS
       .::::.:.: ::::.::::.::  .:.:::.:::: ::.::::::::::::::.::::::
CCDS33 RKKSTSNFKADGLSGTAEEQEENFEFIIVSLTGQTWHFEATTYEERDAWVQAIESQILAS
              540       550       560       570       580       590

     310       320       330       340       350       360         
pF1KA1 LQSCESSKSKSQLTSQSEAMALQSIQNMRGNSHCVDCETQNPKWASLNLGVLMCIECSGI
       ::::::::.::.:::::::::::::.::::::::::::::::.:::::::.:::::::::
CCDS33 LQSCESSKNKSRLTSQSEAMALQSIRNMRGNSHCVDCETQNPNWASLNLGALMCIECSGI
              600       610       620       630       640       650

     370       380       390       400       410       420         
pF1KA1 HRSLGTRLSRVRSLELDDWPVELRKVMSSIGNDLANSIWEGSSQGQTKPSIESTREEKER
       ::.:::.:::::::.:::::::: ::::::::.::::.:: ::::.::::..::::::::
CCDS33 HRNLGTHLSRVRSLDLDDWPVELIKVMSSIGNELANSVWEESSQGRTKPSVDSTREEKER
              660       670       680       690       700       710

     430       440       450       460       470       480         
pF1KA1 WIRSKYEHKLFLAPLPCTELSLGQHLLRATADEDLRTAILLLAHGSREEVNETCGEGDGC
       :::.:::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::: 
CCDS33 WIRAKYEQKLFLAPLPCTELSLGQHLLRATADEDLRTAILLLAHGSRDEVNETCGEGDGR
              720       730       740       750       760       770

     490       500       510       520       530       540         
pF1KA1 TALHLACRKGNVVLAQLLIWYGVDVMARDAHGNTALTYARQASSQECINVLLQYGCPDEC
       ::::::::::::::::::::::::: ::::::::::.:::::::::::.:::::::::: 
CCDS33 TALHLACRKGNVVLAQLLIWYGVDVTARDAHGNTALAYARQASSQECIDVLLQYGCPDER
              780       790       800       810       820       830

     550                          
pF1KA1 V                          
                                  
CCDS33 FVLMATPNLSRRNNNRNNSSGRVPTII
              840       850       

>>CCDS44439.1 AGAP5 gene_id:729092|Hs108|chr10            (686 aa)
 initn: 3030 init1: 1782 opt: 1796  Z-score: 1508.3  bits: 289.2 E(32554): 1.1e-77
Smith-Waterman score: 3219; 90.5% identity (92.9% similar) in 550 aa overlap (1-550:162-686)

                                             10        20        30
pF1KA1                               MTIISVTLEIHHHITERDADRSLTILDEQL
                                     :::::::::: ::::.:::::::.: ::::
CCDS44 HVSTERFSQQYSSCSTIFLDDSTASQHYLTMTIISVTLEIPHHITQRDADRSLSIPDEQL
             140       150       160       170       180       190 

               40        50        60        70        80        90
pF1KA1 YSFAFSTVHITKKRNGGGSLNNYSSSIPLTPSTSQEDLYFSVPPTANTPTPVCKQSMGWS
       .::: :::::::.::::::::::::::: ::::::::  :::::::::::::::.:: ::
CCDS44 HSFAVSTVHITKNRNGGGSLNNYSSSIPSTPSTSQEDPQFSVPPTANTPTPVCKRSMRWS
             200       210       220       230       240       250 

              100       110       120       130       140       150
pF1KA1 NLFTSEKGSDPDKGRKALESHADTIGSGRAIPIKQGMLLKRSGKWLKTWKKKYVTLCSNG
       ::::::::: ::: ::: :.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 NLFTSEKGSHPDKERKAPENHADTIGSGRAIPIKQGMLLKRSGKWLKTWKKKYVTLCSNG
             260       270       280       290       300       310 

              160       170       180       190       200       210
pF1KA1 VLTYYSSLGDYMKNIHKKEIDLRTSTIKVPGKWPSLATSACAPISSSKSNGLSKDMEALH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::    
CCDS44 VLTYYSSLGDYMKNIHKKEIDLRTSTIKVPGKWPSLATSACAPISSSKSNGLSKDM----
             320       330       340       350       360           

              220       230       240       250       260       270
pF1KA1 MSANSDIGLGDSICFSPSISSTTSPKLNLPPSPHANKKKHLKKKSTNNLKDDGLSSTAEE
            : ::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::            
CCDS44 -----DTGLGDSICFSPSISSTTSPKLNPPPSPHANKKKHLKKKSTNN------------
            370       380       390       400       410            

              280       290       300       310       320       330
pF1KA1 EEEKFMIVSVTGQTCHFKATTYEERDAWVQAIQSQILASLQSCESSKSKSQLTSQSEAMA
           :::::.:::: ::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ----FMIVSATGQTWHFEATTYEERDAWVQAIQSQILASLQSCESSKSKSQLTSQSEAMA
                  420       430       440       450       460      

              340       350       360       370       380       390
pF1KA1 LQSIQNMRGNSHCVDCETQNPKWASLNLGVLMCIECSGIHRSLGTRLSRVRSLELDDWPV
       ::::::::::.:::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LQSIQNMRGNAHCVDYETQNPKWASLNLGVLMCIECSGIHRSLGTRLSRVRSLELDDWPV
        470       480       490       500       510       520      

              400       410       420       430       440       450
pF1KA1 ELRKVMSSIGNDLANSIWEGSSQGQTKPSIESTREEKERWIRSKYEHKLFLAPLPCTELS
       :::::::::::::::::::::::::::::..:::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS44 ELRKVMSSIGNDLANSIWEGSSQGQTKPSVKSTREEKERWIRSKYEEKLFLAPLPCTELS
        530       540       550       560       570       580      

              460       470       480       490       500       510
pF1KA1 LGQHLLRATADEDLRTAILLLAHGSREEVNETCGEGDGCTALHLACRKGNVVLAQLLIWY
       ::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LGQHLLRATADEDLQTAILLLAHGSREEVNETCGEGDGCTALHLACRKGNVVLAQLLIWY
        590       600       610       620       630       640      

              520       530       540       550
pF1KA1 GVDVMARDAHGNTALTYARQASSQECINVLLQYGCPDECV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GVDVMARDAHGNTALTYARQASSQECINVLLQYGCPDECV
        650       660       670       680      

>>CCDS7215.1 AGAP4 gene_id:119016|Hs108|chr10             (663 aa)
 initn: 3014 init1: 1771 opt: 1784  Z-score: 1498.5  bits: 287.3 E(32554): 3.8e-77
Smith-Waterman score: 3203; 89.8% identity (92.9% similar) in 550 aa overlap (1-550:139-663)

                                             10        20        30
pF1KA1                               MTIISVTLEIHHHITERDADRSLTILDEQL
                                     :::::::::: ::::.:::::::.: ::::
CCDS72 HVSTVRFSQQYSLCSTIFLDDSTAIQHYLTMTIISVTLEIPHHITQRDADRSLSIPDEQL
      110       120       130       140       150       160        

               40        50        60        70        80        90
pF1KA1 YSFAFSTVHITKKRNGGGSLNNYSSSIPLTPSTSQEDLYFSVPPTANTPTPVCKQSMGWS
       .::: ::::: ::::::::::::::::: ::::::::  :::::::::::::::.:: ::
CCDS72 HSFAVSTVHIMKKRNGGGSLNNYSSSIPSTPSTSQEDPQFSVPPTANTPTPVCKRSMRWS
      170       180       190       200       210       220        

              100       110       120       130       140       150
pF1KA1 NLFTSEKGSDPDKGRKALESHADTIGSGRAIPIKQGMLLKRSGKWLKTWKKKYVTLCSNG
       ::::::::::::: ::: :.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 NLFTSEKGSDPDKERKAPENHADTIGSGRAIPIKQGMLLKRSGKWLKTWKKKYVTLCSNG
      230       240       250       260       270       280        

              160       170       180       190       200       210
pF1KA1 VLTYYSSLGDYMKNIHKKEIDLRTSTIKVPGKWPSLATSACAPISSSKSNGLSKDMEALH
       ::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::.:::.::::::::::    
CCDS72 VLTYYSSLGDYMKNIHKKEIDLQTSTIKVPGKWPSLATSACTPISTSKSNGLSKDM----
      290       300       310       320       330       340        

              220       230       240       250       260       270
pF1KA1 MSANSDIGLGDSICFSPSISSTTSPKLNLPPSPHANKKKHLKKKSTNNLKDDGLSSTAEE
            : ::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::            
CCDS72 -----DTGLGDSICFSPSISSTTSPKLNPPPSPHANKKKHLKKKSTNN------------
               350       360       370       380                   

              280       290       300       310       320       330
pF1KA1 EEEKFMIVSVTGQTCHFKATTYEERDAWVQAIQSQILASLQSCESSKSKSQLTSQSEAMA
           :::::.:::: ::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS72 ----FMIVSATGQTWHFEATTYEERDAWVQAIQSQILASLQSCESSKSKSQLTSQSKAMA
           390       400       410       420       430       440   

              340       350       360       370       380       390
pF1KA1 LQSIQNMRGNSHCVDCETQNPKWASLNLGVLMCIECSGIHRSLGTRLSRVRSLELDDWPV
       ::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 LQSIQNMRGNAHCVDCETQNPKWASLNLGVLMCIECSGIHRSLGTRLSRVRSLELDDWPV
           450       460       470       480       490       500   

              400       410       420       430       440       450
pF1KA1 ELRKVMSSIGNDLANSIWEGSSQGQTKPSIESTREEKERWIRSKYEHKLFLAPLPCTELS
       ::::::::::::::::::::::::::::: .:::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS72 ELRKVMSSIGNDLANSIWEGSSQGQTKPSEKSTREEKERWIRSKYEEKLFLAPLPCTELS
           510       520       530       540       550       560   

              460       470       480       490       500       510
pF1KA1 LGQHLLRATADEDLRTAILLLAHGSREEVNETCGEGDGCTALHLACRKGNVVLAQLLIWY
       :::.::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 LGQQLLRATADEDLQTAILLLAHGSREEVNETCGEGDGCTALHLACRKGNVVLAQLLIWY
           570       580       590       600       610       620   

              520       530       540       550
pF1KA1 GVDVMARDAHGNTALTYARQASSQECINVLLQYGCPDECV
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::
CCDS72 GVDVMARDAHGNTALTYARQASSQECINVLLQYGCPDKCV
           630       640       650       660   

>>CCDS44397.1 AGAP6 gene_id:414189|Hs108|chr10            (686 aa)
 initn: 2984 init1: 1745 opt: 1759  Z-score: 1477.5  bits: 283.5 E(32554): 5.6e-76
Smith-Waterman score: 3173; 89.3% identity (92.4% similar) in 550 aa overlap (1-550:162-686)

                                             10        20        30
pF1KA1                               MTIISVTLEIHHHITERDADRSLTILDEQL
                                     :::::::::: ::::.:::::.:.: ::::
CCDS44 HVSAVRFSQQYSLCSTIFLDDSTAIQHYLTMTIISVTLEIPHHITQRDADRTLSIPDEQL
             140       150       160       170       180       190 

               40        50        60        70        80        90
pF1KA1 YSFAFSTVHITKKRNGGGSLNNYSSSIPLTPSTSQEDLYFSVPPTANTPTPVCKQSMGWS
       .::: ::::: ::::::::::::::::: ::::::::  :::::::::::::::.:: ::
CCDS44 HSFAVSTVHIMKKRNGGGSLNNYSSSIPSTPSTSQEDPQFSVPPTANTPTPVCKRSMRWS
             200       210       220       230       240       250 

              100       110       120       130       140       150
pF1KA1 NLFTSEKGSDPDKGRKALESHADTIGSGRAIPIKQGMLLKRSGKWLKTWKKKYVTLCSNG
       ::::::::::::: ::: :.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 NLFTSEKGSDPDKERKAPENHADTIGSGRAIPIKQGMLLKRSGKWLKTWKKKYVTLCSNG
             260       270       280       290       300       310 

              160       170       180       190       200       210
pF1KA1 VLTYYSSLGDYMKNIHKKEIDLRTSTIKVPGKWPSLATSACAPISSSKSNGLSKDMEALH
       .:::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::.::::::::::::::    
CCDS44 MLTYYSSLGDYMKNIHKKEIDLQTSTIKVPGKWPSLATSACTPISSSKSNGLSKDM----
             320       330       340       350       360           

              220       230       240       250       260       270
pF1KA1 MSANSDIGLGDSICFSPSISSTTSPKLNLPPSPHANKKKHLKKKSTNNLKDDGLSSTAEE
            : ::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::            
CCDS44 -----DTGLGDSICFSPSISSTTSPKLNPPPSPHANKKKHLKKKSTNN------------
            370       380       390       400       410            

              280       290       300       310       320       330
pF1KA1 EEEKFMIVSVTGQTCHFKATTYEERDAWVQAIQSQILASLQSCESSKSKSQLTSQSEAMA
           :::::.:::: ::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ----FMIVSATGQTWHFEATTYEERDAWVQAIQSQILASLQSCESSKSKSQLTSQSEAMA
                  420       430       440       450       460      

              340       350       360       370       380       390
pF1KA1 LQSIQNMRGNSHCVDCETQNPKWASLNLGVLMCIECSGIHRSLGTRLSRVRSLELDDWPV
       ::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::: .::::::::::::::
CCDS44 LQSIQNMRGNAHCVDCETQNPKWASLNLGVLMCIECSGIHRSLGPHLSRVRSLELDDWPV
        470       480       490       500       510       520      

              400       410       420       430       440       450
pF1KA1 ELRKVMSSIGNDLANSIWEGSSQGQTKPSIESTREEKERWIRSKYEHKLFLAPLPCTELS
       ::::::::: ::::::::::::::::::: .:::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS44 ELRKVMSSIVNDLANSIWEGSSQGQTKPSEKSTREEKERWIRSKYEEKLFLAPLPCTELS
        530       540       550       560       570       580      

              460       470       480       490       500       510
pF1KA1 LGQHLLRATADEDLRTAILLLAHGSREEVNETCGEGDGCTALHLACRKGNVVLAQLLIWY
       :::.::::::::::.:::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LGQQLLRATADEDLQTAILLLAHGSCEEVNETCGEGDGCTALHLACRKGNVVLAQLLIWY
        590       600       610       620       630       640      

              520       530       540       550
pF1KA1 GVDVMARDAHGNTALTYARQASSQECINVLLQYGCPDECV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GVDVMARDAHGNTALTYARQASSQECINVLLQYGCPDECV
        650       660       670       680      

>>CCDS73125.1 AGAP9 gene_id:642517|Hs108|chr10            (658 aa)
 initn: 2706 init1: 1450 opt: 1464  Z-score: 1231.9  bits: 238.0 E(32554): 2.7e-62
Smith-Waterman score: 2892; 88.4% identity (91.8% similar) in 510 aa overlap (1-509:162-646)

                                             10        20        30
pF1KA1                               MTIISVTLEIHHHITERDADRSLTILDEQL
                                     :::::::::: ::::.:::::::.: ::::
CCDS73 HVSTERFSQQYSSCSTIFLDDSTAIQHYLTMTIISVTLEIPHHITQRDADRSLSIPDEQL
             140       150       160       170       180       190 

               40        50        60        70        80        90
pF1KA1 YSFAFSTVHITKKRNGGGSLNNYSSSIPLTPSTSQEDLYFSVPPTANTPTPVCKQSMGWS
       .::: ::::: ::::::::::::::::: ::::::::  :::::::::::::::.:: ::
CCDS73 HSFAVSTVHIMKKRNGGGSLNNYSSSIPPTPSTSQEDPQFSVPPTANTPTPVCKRSMRWS
             200       210       220       230       240       250 

              100       110       120       130       140       150
pF1KA1 NLFTSEKGSDPDKGRKALESHADTIGSGRAIPIKQGMLLKRSGKWLKTWKKKYVTLCSNG
       ::::::::::::: ::: :.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 NLFTSEKGSDPDKERKAPENHADTIGSGRAIPIKQGMLLKRSGKWLKTWKKKYVTLCSNG
             260       270       280       290       300       310 

              160       170       180       190       200       210
pF1KA1 VLTYYSSLGDYMKNIHKKEIDLRTSTIKVPGKWPSLATSACAPISSSKSNGLSKDMEALH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::    
CCDS73 VLTYYSSLGDYMKNIHKKEIDLRTSTIKVPGKWPSLATSACAPISSSKSNGLSKDM----
             320       330       340       350       360           

              220       230       240       250       260       270
pF1KA1 MSANSDIGLGDSICFSPSISSTTSPKLNLPPSPHANKKKHLKKKSTNNLKDDGLSSTAEE
            : ::::::::::.:::::::::: :::::::::::::::::::            
CCDS73 -----DTGLGDSICFSPGISSTTSPKLNPPPSPHANKKKHLKKKSTNN------------
            370       380       390       400       410            

              280       290       300       310       320       330
pF1KA1 EEEKFMIVSVTGQTCHFKATTYEERDAWVQAIQSQILASLQSCESSKSKSQLTSQSEAMA
           :::::.:::: ::.:::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::
CCDS73 ----FMIVSATGQTWHFEATTYEERDAWVQAIQSQILASLQSCKSSKSKSQLTSQSEAMA
                  420       430       440       450       460      

              340       350       360       370       380       390
pF1KA1 LQSIQNMRGNSHCVDCETQNPKWASLNLGVLMCIECSGIHRSLGTRLSRVRSLELDDWPV
       ::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::
CCDS73 LQSIQNMRGNAHCVDCETQNPKWASLNLGVLMCIECSGIHRSFGTRLSRVRSLELDDWPV
        470       480       490       500       510       520      

              400       410       420       430       440       450
pF1KA1 ELRKVMSSIGNDLANSIWEGSSQGQTKPSIESTREEKERWIRSKYEHKLFLAPLPCTELS
       :::::::::::.::::::::::::::::::.::::::: :::::::.:::::::::::::
CCDS73 ELRKVMSSIGNELANSIWEGSSQGQTKPSIKSTREEKEWWIRSKYEEKLFLAPLPCTELS
        530       540       550       560       570       580      

              460       470       480       490       500          
pF1KA1 LGQHLLRATADEDLRTAILLLAHGSREEVNETCGEGDGCTALHLACRKGNVVLAQLLI-W
       :::.:::::.::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::  :
CCDS73 LGQQLLRATTDEDLQTAILLLAHGSREEVNETCGEGDGCTALHLACRKGNVVLEQLLTGW
        590       600       610       620       630       640      

     510       520       530       540       550
pF1KA1 YGVDVMARDAHGNTALTYARQASSQECINVLLQYGCPDECV
                                                
CCDS73 TSWPEMPTGTQR                             
        650                                     

>>CCDS43681.1 AGAP3 gene_id:116988|Hs108|chr7             (911 aa)
 initn: 1803 init1: 1255 opt: 1407  Z-score: 1182.4  bits: 229.3 E(32554): 1.5e-59
Smith-Waterman score: 1946; 55.1% identity (76.3% similar) in 566 aa overlap (38-549:319-884)

        10        20        30        40         50        60      
pF1KA1 LEIHHHITERDADRSLTILDEQLYSFAFSTVHITKKRNGGGS-LNNYSSSIPLTPSTSQE
                                     :::..  ::::: ...::::.: ::: ::.
CCDS43 RKKQQLAIGPCKSLPNSPSHSAVSAASIPAVHINQATNGGGSAFSDYSSSVPSTPSISQR
      290       300       310       320       330       340        

         70        80        90       100       110       120      
pF1KA1 DLYFSVPPTANTPTPVCKQSMGWSNLFTSEKGSDPDKGRKALESHADTIGSGRAIPIKQG
       .: . .  ...::::. :::   ::.:::.::.: :. .:: : ..:.::::::::::::
CCDS43 ELRIETIAASSTPTPIRKQSKRRSNIFTSRKGADLDREKKAAECKVDSIGSGRAIPIKQG
      350       360       370       380       390       400        

        130        140       150       160       170       180     
pF1KA1 MLLKRSGKWL-KTWKKKYVTLCSNGVLTYYSSLGDYMKNIHKKEIDLRTSTIKVPGKWPS
       .::::::: : : :::::::::.::.:::. :: :::.::: :::::  .:.:::::   
CCDS43 ILLKRSGKSLNKEWKKKYVTLCDNGLLTYHPSLHDYMQNIHGKEIDLLRTTVKVPGKRLP
      410       420       430       440       450       460        

         190       200       210                    220            
pF1KA1 LATSACAPISSSKSNGLSKDMEALHM-------------SANSDIGLGDSICFSP-----
        :: : :: .: ..:::: .    ..             : .:.  :..:   .:     
CCDS43 RATPATAPGTSPRANGLSVERSNTQLGGGTGAPHSASSASLHSERPLSSSAWAGPRPEGL
      470       480       490       500       510       520        

            230                                 240       250      
pF1KA1 -----SISS--------------------------TTSPKLNLPPSPHANKKKHLKKKST
            :.::                          ..::::. :::::.:.::: .::::
CCDS43 HQRSCSVSSADQWSEATTSLPPGMQHPASGPAEVLSSSPKLDPPPSPHSNRKKHRRKKST
      530       540       550       560       570       580        

        260       270         280       290       300       310    
pF1KA1 NNLKDDGLSSTAEEEEE--KFMIVSVTGQTCHFKATTYEERDAWVQAIQSQILASLQSCE
       .. . :: ::..:: ::  .:..::.:::: ::.:.: :::. :::..:.:::::::.:.
CCDS43 GTPRPDGPSSATEEAEESFEFVVVSLTGQTWHFEASTAEERELWVQSVQAQILASLQGCR
      590       600       610       620       630       640        

          320       330       340       350       360       370    
pF1KA1 SSKSKSQLTSQSEAMALQSIQNMRGNSHCVDCETQNPKWASLNLGVLMCIECSGIHRSLG
       :.:.:..: .:. :.:.:.....:::: :.::.. :: :::::::.::::::::::: ::
CCDS43 SAKDKTRLGNQNAALAVQAVRTVRGNSFCIDCDAPNPDWASLNLGALMCIECSGIHRHLG
      650       660       670       680       690       700        

          380       390       400       410       420       430    
pF1KA1 TRLSRVRSLELDDWPVELRKVMSSIGNDLANSIWEGSSQGQTKPSIESTREEKERWIRSK
       ..:::::::.::::: ::  ::...:: ::::.:::.  : .::. .. :::::::::.:
CCDS43 AHLSRVRSLDLDDWPPELLAVMTAMGNALANSVWEGALGGYSKPGPDACREEKERWIRAK
      710       720       730       740       750       760        

          440       450       460       470       480       490    
pF1KA1 YEHKLFLAPLPCTELSLGQHLLRATADEDLRTAILLLAHGSREEVNETCGEGDGCTALHL
       ::.:::::::: ... :::.::::....:::  ..::::::.:::::: :.::: :::::
CCDS43 YEQKLFLAPLPSSDVPLGQQLLRAVVEDDLRLLVMLLAHGSKEEVNETYGDGDGRTALHL
      770       780       790       800       810       820        

          500       510       520       530       540        550   
pF1KA1 ACRKGNVVLAQLLIWYGVDVMARDAHGNTALTYARQASSQECINVLLQYGCPDE-CV   
       .   .:::..:::::::::: .:::.: : :.:::.:.:::: ..:.:.::: : :    
CCDS43 SSAMANVVFTQLLIWYGVDVRSRDARGLTPLAYARRAGSQECADILIQHGCPGEGCGLAP
      830       840       850       860       870       880        

CCDS43 TPNREPANGTNPSAELHRSPSLL
      890       900       910 

>>CCDS64802.1 AGAP3 gene_id:116988|Hs108|chr7             (580 aa)
 initn: 1630 init1: 1255 opt: 1277  Z-score: 1076.9  bits: 209.1 E(32554): 1.2e-53
Smith-Waterman score: 1793; 55.3% identity (75.7% similar) in 515 aa overlap (38-549:91-553)

        10        20        30        40         50        60      
pF1KA1 LEIHHHITERDADRSLTILDEQLYSFAFSTVHITKKRNGGGS-LNNYSSSIPLTPSTSQE
                                     :::..  ::::: ...::::.: ::: ::.
CCDS64 RKKQQLAIGPCKSLPNSPSHSAVSAASIPAVHINQATNGGGSAFSDYSSSVPSTPSISQR
               70        80        90       100       110       120

         70        80        90       100       110       120      
pF1KA1 DLYFSVPPTANTPTPVCKQSMGWSNLFTSEKGSDPDKGRKALESHADTIGSGRAIPIKQG
       .: . .  ...::::. :::   ::.:::.::.: :. .:: : ..:.::::::::::::
CCDS64 ELRIETIAASSTPTPIRKQSKRRSNIFTSRKGADLDREKKAAECKVDSIGSGRAIPIKQG
              130       140       150       160       170       180

        130        140       150       160       170       180     
pF1KA1 MLLKRSGKWL-KTWKKKYVTLCSNGVLTYYSSLGDYMKNIHKKEIDLRTSTIKVPGKWPS
       .::::::: : : :::::::::.::.:::. :: :::.::: :::::  .:.:::::   
CCDS64 ILLKRSGKSLNKEWKKKYVTLCDNGLLTYHPSLHDYMQNIHGKEIDLLRTTVKVPGKRLP
              190       200       210       220       230       240

         190       200       210       220       230       240     
pF1KA1 LATSACAPISSSKSNGLSKDMEALHMSANSDIGLGDSICFSPSISSTTSPKLNLPPSPHA
        :: : :: .: ..:::: .       .:...: :                         
CCDS64 RATPATAPGTSPRANGLSVE------RSNTQLGGG-------------------------
              250       260                                        

         250       260       270       280       290       300     
pF1KA1 NKKKHLKKKSTNNLKDDGLSSTAEEEEEKFMIVSVTGQTCHFKATTYEERDAWVQAIQSQ
                            :  ::  .:..::.:::: ::.:.: :::. :::..:.:
CCDS64 ---------------------TEAEESFEFVVVSLTGQTWHFEASTAEERELWVQSVQAQ
                          270       280       290       300        

         310       320       330       340       350       360     
pF1KA1 ILASLQSCESSKSKSQLTSQSEAMALQSIQNMRGNSHCVDCETQNPKWASLNLGVLMCIE
       ::::::.:.:.:.:..: .:. :.:.:.....:::: :.::.. :: :::::::.:::::
CCDS64 ILASLQGCRSAKDKTRLGNQNAALAVQAVRTVRGNSFCIDCDAPNPDWASLNLGALMCIE
      310       320       330       340       350       360        

         370       380       390       400       410       420     
pF1KA1 CSGIHRSLGTRLSRVRSLELDDWPVELRKVMSSIGNDLANSIWEGSSQGQTKPSIESTRE
       :::::: ::..:::::::.::::: ::  ::...:: ::::.:::.  : .::. .. ::
CCDS64 CSGIHRHLGAHLSRVRSLDLDDWPPELLAVMTAMGNALANSVWEGALGGYSKPGPDACRE
      370       380       390       400       410       420        

         430       440       450       460       470       480     
pF1KA1 EKERWIRSKYEHKLFLAPLPCTELSLGQHLLRATADEDLRTAILLLAHGSREEVNETCGE
       :::::::.:::.:::::::: ... :::.::::....:::  ..::::::.:::::: :.
CCDS64 EKERWIRAKYEQKLFLAPLPSSDVPLGQQLLRAVVEDDLRLLVMLLAHGSKEEVNETYGD
      430       440       450       460       470       480        

         490       500       510       520       530       540     
pF1KA1 GDGCTALHLACRKGNVVLAQLLIWYGVDVMARDAHGNTALTYARQASSQECINVLLQYGC
       ::: :::::.   .:::..:::::::::: .:::.: : :.:::.:.:::: ..:.:.::
CCDS64 GDGRTALHLSSAMANVVFTQLLIWYGVDVRSRDARGLTPLAYARRAGSQECADILIQHGC
      490       500       510       520       530       540        

          550                          
pF1KA1 PDE-CV                          
       : : :                           
CCDS64 PGEGCGLAPTPNREPANGTNPSAELHRSPSLL
      550       560       570       580

>>CCDS8951.1 AGAP2 gene_id:116986|Hs108|chr12             (836 aa)
 initn: 1461 init1: 1176 opt: 1208  Z-score: 1017.1  bits: 198.6 E(32554): 2.5e-50
Smith-Waterman score: 1603; 48.5% identity (73.1% similar) in 551 aa overlap (32-548:251-795)

              10        20        30        40        50        60 
pF1KA1 TIISVTLEIHHHITERDADRSLTILDEQLYSFAFSTVHITKKRNGGGSLNNYSSSIPLTP
                                     : . ... .. . ..::  ..::::.: .:
CCDS89 RVFQEVAQKVVTLRKQQQLLAACKSLPSSPSHSAASTPVAGQASNGGHTSDYSSSLPSSP
              230       240       250       260       270       280

              70        80          90       100       110         
pF1KA1 STSQEDLYFSVPPTANTPTP--VCKQSMGWSNLFTSEKGSDPDKGRKALESHADTIGSGR
       ......:   .  .:.  ::  . . .   ..::....::: .:  ..:.:...: ::::
CCDS89 NVGHRELRAEAAAVAGLSTPGSLHRAAKRRTSLFANRRGSDSEK--RSLDSRGETTGSGR
              290       300       310       320         330        

     120       130        140       150       160       170        
pF1KA1 AIPIKQGMLLKRSGKWL-KTWKKKYVTLCSNGVLTYYSSLGDYMKNIHKKEIDLRTSTIK
       ::::::..::::::. : : :::::::: ::: : :. :..::... : ::.::  .:.:
CCDS89 AIPIKQSFLLKRSGNSLNKEWKKKYVTLSSNGFLLYHPSINDYIHSTHGKEMDLLRTTVK
      340       350       360       370       380       390        

      180       190       200       210       220                  
pF1KA1 VPGKWPSLATSACAPISSSKSNGLSKDMEALHMSANSDIGLG-DSICFSPS---------
       :::: :  : :: .:  :.. ::: ::: ...:. . .      :   :::         
CCDS89 VPGKRPPRAISAFGP--SASINGLVKDMSTVQMGEGLEATTPMPSPSPSPSSLQPPPDQT
      400       410         420       430       440       450      

                    230              240       250       260       
pF1KA1 --------------ISSTTSPKLNL-------PPSPHANKKKHLKKKSTNNLKDDGLSST
                     .:.  .:. .:       :::: ..:..  .:: :.  : .: .. 
CCDS89 SKHLLKPDRNLARALSTDCTPSGDLSPLSREPPPSPMVKKQR--RKKLTTPSKTEGSAGQ
        460       470       480       490         500       510    

       270       280       290       300       310       320       
pF1KA1 AEEEEEKFMIVSVTGQTCHFKATTYEERDAWVQAIQSQILASLQSCESSKSKSQLTSQSE
       ::::. .:.::: :::: ::.:...::::::::::.:::::::: ::::: : .  ::::
CCDS89 AEEENFEFLIVSSTGQTWHFEAASFEERDAWVQAIESQILASLQCCESSKVKLRTDSQSE
          520       530       540       550       560       570    

       330       340       350       360       370       380       
pF1KA1 AMALQSIQNMRGNSHCVDCETQNPKWASLNLGVLMCIECSGIHRSLGTRLSRVRSLELDD
       :.:.:.:.: .::: :::: . :: :::::::.:.:::::::::.:::.:::::::.:::
CCDS89 AVAIQAIRNAKGNSICVDCGAPNPTWASLNLGALICIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDD
          580       590       600       610       620       630    

       390       400       410       420       430       440       
pF1KA1 WPVELRKVMSSIGNDLANSIWEGSSQGQTKPSIESTREEKERWIRSKYEHKLFLAPLPCT
       :: ::  :...:::: :: .::....:..::: .:.:::.: :::.:::. ::::::  .
CCDS89 WPRELTLVLTAIGNDTANRVWESDTRGRAKPSRDSSREERESWIRAKYEQLLFLAPLSTS
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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