Result of FASTA (omim) for pF1KA1677
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA1677, 604 aa
  1>>>pF1KA1677 604 - 604 aa - 604 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2003+/-0.000484; mu= 19.9421+/- 0.030
 mean_var=95.4004+/-20.792, 0's: 0 Z-trim(109.3): 353  B-trim: 1579 in 2/54
 Lambda= 0.131310
 statistics sampled from 17008 (17464) to 17008 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.563), E-opt: 0.2 (0.205), width:  16
 Scan time:  7.910

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
XP_006724581 (OMIM: 300980,300982) PREDICTED: kelc ( 604) 4119 791.8       0
NP_085127 (OMIM: 300980,300982) kelch-like protein ( 604) 4119 791.8       0
NP_001161775 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13  ( 613)  907 183.3   2e-45
NP_001161773 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13  ( 639)  907 183.4 2.1e-45
NP_001161774 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13  ( 639)  907 183.4 2.1e-45
XP_016885439 (OMIM: 300655) PREDICTED: kelch-like  ( 639)  907 183.4 2.1e-45
NP_001161772 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13  ( 649)  907 183.4 2.1e-45
NP_277030 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 iso ( 655)  907 183.4 2.1e-45
XP_011529713 (OMIM: 300655) PREDICTED: kelch-like  ( 655)  907 183.4 2.1e-45
NP_001161771 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13  ( 658)  907 183.4 2.1e-45
XP_011529711 (OMIM: 300655) PREDICTED: kelch-like  ( 661)  907 183.4 2.1e-45
XP_011529712 (OMIM: 300655) PREDICTED: kelch-like  ( 661)  907 183.4 2.1e-45
NP_061335 (OMIM: 611201) kelch-like protein 9 [Hom ( 617)  898 181.6 6.7e-45
XP_016866347 (OMIM: 610749) PREDICTED: kelch-like  ( 634)  684 141.1 1.1e-32
XP_005249164 (OMIM: 610749) PREDICTED: kelch-like  ( 634)  684 141.1 1.1e-32
NP_001003760 (OMIM: 610749) kelch-like protein 31  ( 634)  684 141.1 1.1e-32
NP_689680 (OMIM: 608778,615081) kelch-like protein ( 608)  573 120.1 2.3e-26
NP_001316524 (OMIM: 608778,615081) kelch-like prot ( 608)  573 120.1 2.3e-26
NP_065856 (OMIM: 613772) kelch-like protein 14 [Ho ( 628)  551 115.9 4.1e-25
NP_569713 (OMIM: 614214) kelch-like protein 6 [Hom ( 621)  538 113.4 2.3e-24
XP_016857484 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like  ( 471)  525 110.9   1e-23
XP_011508138 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like  ( 526)  525 110.9 1.1e-23
NP_067646 (OMIM: 614522) kelch-like protein 12 iso ( 568)  525 110.9 1.2e-23
NP_001289980 (OMIM: 614522) kelch-like protein 12  ( 606)  525 111.0 1.2e-23
XP_011508137 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like  ( 623)  525 111.0 1.3e-23
NP_001165125 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 i ( 568)  524 110.8 1.3e-23
NP_001007076 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 i ( 709)  524 110.9 1.6e-23
NP_057074 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 isof ( 755)  524 110.9 1.6e-23
XP_011512003 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like  ( 788)  524 110.9 1.7e-23
XP_016863765 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like  ( 788)  524 110.9 1.7e-23
XP_016863764 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like  ( 788)  524 110.9 1.7e-23
XP_011512002 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like  ( 788)  524 110.9 1.7e-23
XP_005262712 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like  ( 789)  524 110.9 1.7e-23
XP_016863763 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like  ( 804)  524 110.9 1.7e-23
XP_016863762 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like  ( 804)  524 110.9 1.7e-23
XP_011512001 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like  ( 804)  524 110.9 1.7e-23
NP_009177 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 isof ( 593)  522 110.4 1.8e-23
NP_001154993 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 i ( 597)  522 110.4 1.8e-23
XP_016876167 (OMIM: 605332) PREDICTED: kelch-like  ( 575)  520 110.0 2.3e-23
XP_011529874 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like  ( 633)  520 110.0 2.4e-23
NP_065917 (OMIM: 605332) kelch-like protein 1 isof ( 748)  520 110.1 2.7e-23
XP_016863163 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like  ( 555)  516 109.2 3.8e-23
NP_059111 (OMIM: 605775,614495) kelch-like protein ( 587)  510 108.1 8.6e-23
XP_016856699 (OMIM: 147485) PREDICTED: actin-bindi ( 531)  508 107.7   1e-22
NP_001138821 (OMIM: 147485) actin-binding protein  ( 582)  508 107.7 1.1e-22
NP_005888 (OMIM: 147485) actin-binding protein IPP ( 584)  508 107.7 1.1e-22
NP_001244123 (OMIM: 605775,614495) kelch-like prot ( 555)  506 107.3 1.4e-22
NP_001273654 (OMIM: 605332) kelch-like protein 1 i ( 687)  500 106.3 3.6e-22
NP_065854 (OMIM: 611967) kelch-like protein 8 isof ( 620)  497 105.7 4.9e-22
NP_001278932 (OMIM: 611967) kelch-like protein 8 i ( 620)  497 105.7 4.9e-22


>>XP_006724581 (OMIM: 300980,300982) PREDICTED: kelch-li  (604 aa)
 initn: 4119 init1: 4119 opt: 4119  Z-score: 4225.0  bits: 791.8 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 4119; 100.0% identity (100.0% similar) in 604 aa overlap (1-604:1-604)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MAGDVEGFCSSIHDTSVSAGFRALYEEGLLLDVTLVIEDHQFQAHKALLATQSDYFRIMF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 MAGDVEGFCSSIHDTSVSAGFRALYEEGLLLDVTLVIEDHQFQAHKALLATQSDYFRIMF
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 TADMRERDQDKIHLKGLTATGFSHVLQFMYYGTIELSMNTVHEILQAAMYVQLIEVVKFC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 TADMRERDQDKIHLKGLTATGFSHVLQFMYYGTIELSMNTVHEILQAAMYVQLIEVVKFC
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA1 CSFLLAKICLENCAEIMRLLDDFGVNIEGVREKLDTFLLDNFVPLMSRPDFLSYLSFEKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 CSFLLAKICLENCAEIMRLLDDFGVNIEGVREKLDTFLLDNFVPLMSRPDFLSYLSFEKL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA1 MSYLDNDHLSRFPEIELYEAVQSWLRHDRRRWRHTDTIIQNIRFCLMTPTSVFEKVKTSE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 MSYLDNDHLSRFPEIELYEAVQSWLRHDRRRWRHTDTIIQNIRFCLMTPTSVFEKVKTSE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA1 FYRYSRQLRYEVDQALNYFQNVHQQPLLDMKSSRIRSAKPQTTVFRGMIGHSMVNSKILL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 FYRYSRQLRYEVDQALNYFQNVHQQPLLDMKSSRIRSAKPQTTVFRGMIGHSMVNSKILL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA1 LKKPRVWWELEGPQVPLRPDCLAIVNNFVFLLGGEELGPDGEFHASSKVFRYDPRQNSWL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LKKPRVWWELEGPQVPLRPDCLAIVNNFVFLLGGEELGPDGEFHASSKVFRYDPRQNSWL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA1 QMADMSVPRSEFAVGVIGKFIYAVAGRTRDETFYSTERYDITNDKWEFVDPYPVNKYGHE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 QMADMSVPRSEFAVGVIGKFIYAVAGRTRDETFYSTERYDITNDKWEFVDPYPVNKYGHE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA1 GTVLNNKLFITGGITSSSTSKQVCVFDPSKEGTIEQRTRRTQVVTNCWENKSKMNYARCF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 GTVLNNKLFITGGITSSSTSKQVCVFDPSKEGTIEQRTRRTQVVTNCWENKSKMNYARCF
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA1 HKMISYNGKLYVFGGVCVILRASFESQGCPSTEVYNPETDQWTILASMPIGRSGHGVTVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 HKMISYNGKLYVFGGVCVILRASFESQGCPSTEVYNPETDQWTILASMPIGRSGHGVTVL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA1 DKQIMVLGGLCYNGHYSDSILTFDPDENKWKEDEYPRMPCKLDGLQVCNLHFPDYVLDEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 DKQIMVLGGLCYNGHYSDSILTFDPDENKWKEDEYPRMPCKLDGLQVCNLHFPDYVLDEV
              550       560       570       580       590       600

           
pF1KA1 RRCN
       ::::
XP_006 RRCN
           

>>NP_085127 (OMIM: 300980,300982) kelch-like protein 15   (604 aa)
 initn: 4119 init1: 4119 opt: 4119  Z-score: 4225.0  bits: 791.8 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 4119; 100.0% identity (100.0% similar) in 604 aa overlap (1-604:1-604)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MAGDVEGFCSSIHDTSVSAGFRALYEEGLLLDVTLVIEDHQFQAHKALLATQSDYFRIMF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_085 MAGDVEGFCSSIHDTSVSAGFRALYEEGLLLDVTLVIEDHQFQAHKALLATQSDYFRIMF
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 TADMRERDQDKIHLKGLTATGFSHVLQFMYYGTIELSMNTVHEILQAAMYVQLIEVVKFC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_085 TADMRERDQDKIHLKGLTATGFSHVLQFMYYGTIELSMNTVHEILQAAMYVQLIEVVKFC
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA1 CSFLLAKICLENCAEIMRLLDDFGVNIEGVREKLDTFLLDNFVPLMSRPDFLSYLSFEKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_085 CSFLLAKICLENCAEIMRLLDDFGVNIEGVREKLDTFLLDNFVPLMSRPDFLSYLSFEKL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA1 MSYLDNDHLSRFPEIELYEAVQSWLRHDRRRWRHTDTIIQNIRFCLMTPTSVFEKVKTSE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_085 MSYLDNDHLSRFPEIELYEAVQSWLRHDRRRWRHTDTIIQNIRFCLMTPTSVFEKVKTSE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA1 FYRYSRQLRYEVDQALNYFQNVHQQPLLDMKSSRIRSAKPQTTVFRGMIGHSMVNSKILL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_085 FYRYSRQLRYEVDQALNYFQNVHQQPLLDMKSSRIRSAKPQTTVFRGMIGHSMVNSKILL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA1 LKKPRVWWELEGPQVPLRPDCLAIVNNFVFLLGGEELGPDGEFHASSKVFRYDPRQNSWL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_085 LKKPRVWWELEGPQVPLRPDCLAIVNNFVFLLGGEELGPDGEFHASSKVFRYDPRQNSWL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA1 QMADMSVPRSEFAVGVIGKFIYAVAGRTRDETFYSTERYDITNDKWEFVDPYPVNKYGHE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_085 QMADMSVPRSEFAVGVIGKFIYAVAGRTRDETFYSTERYDITNDKWEFVDPYPVNKYGHE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA1 GTVLNNKLFITGGITSSSTSKQVCVFDPSKEGTIEQRTRRTQVVTNCWENKSKMNYARCF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_085 GTVLNNKLFITGGITSSSTSKQVCVFDPSKEGTIEQRTRRTQVVTNCWENKSKMNYARCF
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA1 HKMISYNGKLYVFGGVCVILRASFESQGCPSTEVYNPETDQWTILASMPIGRSGHGVTVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_085 HKMISYNGKLYVFGGVCVILRASFESQGCPSTEVYNPETDQWTILASMPIGRSGHGVTVL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA1 DKQIMVLGGLCYNGHYSDSILTFDPDENKWKEDEYPRMPCKLDGLQVCNLHFPDYVLDEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_085 DKQIMVLGGLCYNGHYSDSILTFDPDENKWKEDEYPRMPCKLDGLQVCNLHFPDYVLDEV
              550       560       570       580       590       600

           
pF1KA1 RRCN
       ::::
NP_085 RRCN
           

>>NP_001161775 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 isof  (613 aa)
 initn: 987 init1: 285 opt: 907  Z-score: 936.4  bits: 183.3 E(85289): 2e-45
Smith-Waterman score: 1109; 32.2% identity (65.3% similar) in 599 aa overlap (2-593:21-596)

                                  10        20        30           
pF1KA1                    MAGDVEGFCSSIHDTSVSAGFRALYEEGLLLDVTLVI--ED
                           :: .. : :. :.. :  ::  :  :::: ::::.    :
NP_001 MKLSLGGSEMGLSSHLQSSKAGPTRIFTSNTHSSVVLQGFDQLRLEGLLCDVTLMPGDTD
               10        20        30        40        50        60

      40        50        60        70        80        90         
pF1KA1 HQFQAHKALLATQSDYFRIMFTADMRERDQDKIHLKGLTATGFSHVLQFMYYGTIELSMN
         : .:....:. ::::. :::. :.:.:   :.:.:.. .:. ....:.: . . :.:.
NP_001 DAFPVHRVMMASASDYFKAMFTGGMKEQDLMCIKLHGVSKVGLRKIIDFIYTAKLSLNMD
               70        80        90       100       110       120

     100       110       120       130       140       150         
pF1KA1 TVHEILQAAMYVQLIEVVKFCCSFLLAKICLENCAEIMRLLDDFGVNIEGVREKLDTFLL
       .... :.:: ..:.. :. ::  ::.. . :.::.:. :. . .  :.  : . ...:.:
NP_001 NLQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVTLDNCVEVGRIANTY--NLTEVDKYVNSFVL
              130       140       150       160         170        

     160       170       180       190       200       210         
pF1KA1 DNFVPLMSRPDFLSYLSFEKLMSYLDNDHLSRFPEIELYEAVQSWLRHDRRRWRHTDTII
        ::  :.:  .::. : ::.:   :... :..  :.::..:.  ::: .. :   .  ..
NP_001 KNFPALLSTGEFLK-LPFERLAFVLSSNSLKHCTELELFKATCRWLRLEEPRMDFAAKLM
      180       190        200       210       220       230       

     220       230       240       250       260       270         
pF1KA1 QNIRFCLMTPTSVFEKVKTSEFYRYSRQLRYEVDQALNYFQNVHQQPLLDMKSSRIRSAK
       .:::: ::::  ... :.: .:.: .      . .: :: .  ..::...   . :::  
NP_001 KNIRFPLMTPQELINYVQTVDFMRTDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQPVMQSDRTAIRSDT
       240       250       260       270       280       290       

     280       290       300         310       320       330       
pF1KA1 PQTTVFRGMIGHSMVNSKILLL--KKPRVWWELEGPQVPLRPDCLAIVNNFVFLLGGE-E
        . ... :.. ...: :: : .  .: . :  :   ..:     .:...::....::. .
NP_001 THLVTLGGVLRQQLVVSKELRMYDEKAHEWKSLAPMDAPRYQHGIAVIGNFLYVVGGQSN
       300       310       320       330       340       350       

        340       350       360       370       380       390      
pF1KA1 LGPDGEFHASSKVFRYDPRQNSWLQMADMSVPRSEFAVGVIGKFIYAVAGRTRDETFYST
           :.  : . :::.::: :.:.:.:...  :. : ....  ..:::.::.    . ..
NP_001 YDTKGKT-AVDTVFRFDPRYNKWMQVASLNEKRTFFHLSALKGYLYAVGGRNAAGELPTV
       360        370       380       390       400       410      

        400       410       420       430       440       450      
pF1KA1 ERYDITNDKWEFVDPYPVNKYGHEGTVLNNKLFITGGITSSSTSKQVCVFDPSKEGTIEQ
       : :.  ...: .:  .   .::: ::: .. ..:.:::: .. .:..  :::.       
NP_001 ECYNPRTNEWTYVAKMSEPHYGHAGTVYGGVMYISGGITHDTFQKELMCFDPD-------
        420       430       440       450       460                

        460       470       480       490       500       510      
pF1KA1 RTRRTQVVTNCWENKSKMNYARCFHKMISYNGKLYVFGGVCVILRASFESQGCPSTEVYN
               :. : .:. :. .: .: : . . .:::.::    .:.. . .   : : :.
NP_001 --------TDKWIQKAPMTTVRGLHCMCTVGERLYVIGGNH--FRGTSDYDDVLSCEYYS
             470       480       490       500         510         

        520       530       540       550        560       570     
pF1KA1 PETDQWTILASMPIGRSGHGVTVLDKQIMVLGGLCYNGH-YSDSILTFDPDENKWKEDEY
       :  :::: .:.:  :.:  ::.:....:.:.::  .:.. . . .  .:::...:..   
NP_001 PILDQWTPIAAMLRGQSDVGVAVFENKIYVVGGYSWNNRCMVEIVQKYDPDKDEWHK--V
     520       530       540       550       560       570         

         580       590        600          
pF1KA1 PRMPCKLDGLQVCNLH-FPDYVLDEVRRCN      
         .: .: :...:.:  ::                 
NP_001 FDLPESLGGIRACTLTVFPPEETTPSPSRESPLSAP
       580       590       600       610   

>>NP_001161773 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 isof  (639 aa)
 initn: 987 init1: 285 opt: 907  Z-score: 936.2  bits: 183.4 E(85289): 2.1e-45
Smith-Waterman score: 1109; 32.2% identity (65.3% similar) in 599 aa overlap (2-593:47-622)

                                            10        20        30 
pF1KA1                              MAGDVEGFCSSIHDTSVSAGFRALYEEGLLL
                                     :: .. : :. :.. :  ::  :  :::: 
NP_001 RSLVEEEDQHMKLSLGGSEMGLSSHLQSSKAGPTRIFTSNTHSSVVLQGFDQLRLEGLLC
         20        30        40        50        60        70      

                40        50        60        70        80         
pF1KA1 DVTLVI--EDHQFQAHKALLATQSDYFRIMFTADMRERDQDKIHLKGLTATGFSHVLQFM
       ::::.    :  : .:....:. ::::. :::. :.:.:   :.:.:.. .:. ....:.
NP_001 DVTLMPGDTDDAFPVHRVMMASASDYFKAMFTGGMKEQDLMCIKLHGVSKVGLRKIIDFI
         80        90       100       110       120       130      

      90       100       110       120       130       140         
pF1KA1 YYGTIELSMNTVHEILQAAMYVQLIEVVKFCCSFLLAKICLENCAEIMRLLDDFGVNIEG
       : . . :.:..... :.:: ..:.. :. ::  ::.. . :.::.:. :. . .  :.  
NP_001 YTAKLSLNMDNLQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVTLDNCVEVGRIANTY--NLTE
        140       150       160       170       180       190      

     150       160       170       180       190       200         
pF1KA1 VREKLDTFLLDNFVPLMSRPDFLSYLSFEKLMSYLDNDHLSRFPEIELYEAVQSWLRHDR
       : . ...:.: ::  :.:  .::. : ::.:   :... :..  :.::..:.  ::: ..
NP_001 VDKYVNSFVLKNFPALLSTGEFLK-LPFERLAFVLSSNSLKHCTELELFKATCRWLRLEE
          200       210        220       230       240       250   

     210       220       230       240       250       260         
pF1KA1 RRWRHTDTIIQNIRFCLMTPTSVFEKVKTSEFYRYSRQLRYEVDQALNYFQNVHQQPLLD
        :   .  ...:::: ::::  ... :.: .:.: .      . .: :: .  ..::...
NP_001 PRMDFAAKLMKNIRFPLMTPQELINYVQTVDFMRTDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQPVMQ
           260       270       280       290       300       310   

     270       280       290       300         310       320       
pF1KA1 MKSSRIRSAKPQTTVFRGMIGHSMVNSKILLL--KKPRVWWELEGPQVPLRPDCLAIVNN
          . :::   . ... :.. ...: :: : .  .: . :  :   ..:     .:...:
NP_001 SDRTAIRSDTTHLVTLGGVLRQQLVVSKELRMYDEKAHEWKSLAPMDAPRYQHGIAVIGN
           320       330       340       350       360       370   

       330        340       350       360       370       380      
pF1KA1 FVFLLGGE-ELGPDGEFHASSKVFRYDPRQNSWLQMADMSVPRSEFAVGVIGKFIYAVAG
       :....::. .    :.  : . :::.::: :.:.:.:...  :. : ....  ..:::.:
NP_001 FLYVVGGQSNYDTKGKT-AVDTVFRFDPRYNKWMQVASLNEKRTFFHLSALKGYLYAVGG
           380       390        400       410       420       430  

        390       400       410       420       430       440      
pF1KA1 RTRDETFYSTERYDITNDKWEFVDPYPVNKYGHEGTVLNNKLFITGGITSSSTSKQVCVF
       :.    . ..: :.  ...: .:  .   .::: ::: .. ..:.:::: .. .:..  :
NP_001 RNAAGELPTVECYNPRTNEWTYVAKMSEPHYGHAGTVYGGVMYISGGITHDTFQKELMCF
            440       450       460       470       480       490  

        450       460       470       480       490       500      
pF1KA1 DPSKEGTIEQRTRRTQVVTNCWENKSKMNYARCFHKMISYNGKLYVFGGVCVILRASFES
       ::.               :. : .:. :. .: .: : . . .:::.::    .:.. . 
NP_001 DPD---------------TDKWIQKAPMTTVRGLHCMCTVGERLYVIGGNH--FRGTSDY
                           500       510       520         530     

        510       520       530       540       550        560     
pF1KA1 QGCPSTEVYNPETDQWTILASMPIGRSGHGVTVLDKQIMVLGGLCYNGH-YSDSILTFDP
       .   : : :.:  :::: .:.:  :.:  ::.:....:.:.::  .:.. . . .  .::
NP_001 DDVLSCEYYSPILDQWTPIAAMLRGQSDVGVAVFENKIYVVGGYSWNNRCMVEIVQKYDP
         540       550       560       570       580       590     

         570       580       590        600          
pF1KA1 DENKWKEDEYPRMPCKLDGLQVCNLH-FPDYVLDEVRRCN      
       :...:..     .: .: :...:.:  ::                 
NP_001 DKDEWHK--VFDLPESLGGIRACTLTVFPPEETTPSPSRESPLSAP
         600         610       620       630         

>>NP_001161774 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 isof  (639 aa)
 initn: 987 init1: 285 opt: 907  Z-score: 936.2  bits: 183.4 E(85289): 2.1e-45
Smith-Waterman score: 1109; 32.2% identity (65.3% similar) in 599 aa overlap (2-593:47-622)

                                            10        20        30 
pF1KA1                              MAGDVEGFCSSIHDTSVSAGFRALYEEGLLL
                                     :: .. : :. :.. :  ::  :  :::: 
NP_001 RSLVEEEDQHMKLSLGGSEMGLSSHLQSSKAGPTRIFTSNTHSSVVLQGFDQLRLEGLLC
         20        30        40        50        60        70      

                40        50        60        70        80         
pF1KA1 DVTLVI--EDHQFQAHKALLATQSDYFRIMFTADMRERDQDKIHLKGLTATGFSHVLQFM
       ::::.    :  : .:....:. ::::. :::. :.:.:   :.:.:.. .:. ....:.
NP_001 DVTLMPGDTDDAFPVHRVMMASASDYFKAMFTGGMKEQDLMCIKLHGVSKVGLRKIIDFI
         80        90       100       110       120       130      

      90       100       110       120       130       140         
pF1KA1 YYGTIELSMNTVHEILQAAMYVQLIEVVKFCCSFLLAKICLENCAEIMRLLDDFGVNIEG
       : . . :.:..... :.:: ..:.. :. ::  ::.. . :.::.:. :. . .  :.  
NP_001 YTAKLSLNMDNLQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVTLDNCVEVGRIANTY--NLTE
        140       150       160       170       180       190      

     150       160       170       180       190       200         
pF1KA1 VREKLDTFLLDNFVPLMSRPDFLSYLSFEKLMSYLDNDHLSRFPEIELYEAVQSWLRHDR
       : . ...:.: ::  :.:  .::. : ::.:   :... :..  :.::..:.  ::: ..
NP_001 VDKYVNSFVLKNFPALLSTGEFLK-LPFERLAFVLSSNSLKHCTELELFKATCRWLRLEE
          200       210        220       230       240       250   

     210       220       230       240       250       260         
pF1KA1 RRWRHTDTIIQNIRFCLMTPTSVFEKVKTSEFYRYSRQLRYEVDQALNYFQNVHQQPLLD
        :   .  ...:::: ::::  ... :.: .:.: .      . .: :: .  ..::...
NP_001 PRMDFAAKLMKNIRFPLMTPQELINYVQTVDFMRTDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQPVMQ
           260       270       280       290       300       310   

     270       280       290       300         310       320       
pF1KA1 MKSSRIRSAKPQTTVFRGMIGHSMVNSKILLL--KKPRVWWELEGPQVPLRPDCLAIVNN
          . :::   . ... :.. ...: :: : .  .: . :  :   ..:     .:...:
NP_001 SDRTAIRSDTTHLVTLGGVLRQQLVVSKELRMYDEKAHEWKSLAPMDAPRYQHGIAVIGN
           320       330       340       350       360       370   

       330        340       350       360       370       380      
pF1KA1 FVFLLGGE-ELGPDGEFHASSKVFRYDPRQNSWLQMADMSVPRSEFAVGVIGKFIYAVAG
       :....::. .    :.  : . :::.::: :.:.:.:...  :. : ....  ..:::.:
NP_001 FLYVVGGQSNYDTKGKT-AVDTVFRFDPRYNKWMQVASLNEKRTFFHLSALKGYLYAVGG
           380       390        400       410       420       430  

        390       400       410       420       430       440      
pF1KA1 RTRDETFYSTERYDITNDKWEFVDPYPVNKYGHEGTVLNNKLFITGGITSSSTSKQVCVF
       :.    . ..: :.  ...: .:  .   .::: ::: .. ..:.:::: .. .:..  :
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pF1KA1 DPSKEGTIEQRTRRTQVVTNCWENKSKMNYARCFHKMISYNGKLYVFGGVCVILRASFES
       ::.               :. : .:. :. .: .: : . . .:::.::    .:.. . 
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       .   : : :.:  :::: .:.:  :.:  ::.:....:.:.::  .:.. . . .  .::
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       :...:..     .: .: :...:.:  ::                 
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          . :::   . ... :.. ...: :: : .  .: . :  :   ..:     .:...:
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pF1KA1 DENKWKEDEYPRMPCKLDGLQVCNLH-FPDYVLDEVRRCN      
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>>NP_001161772 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 isof  (649 aa)
 initn: 987 init1: 285 opt: 907  Z-score: 936.1  bits: 183.4 E(85289): 2.1e-45
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pF1KA1                              MAGDVEGFCSSIHDTSVSAGFRALYEEGLLL
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pF1KA1 YYGTIELSMNTVHEILQAAMYVQLIEVVKFCCSFLLAKICLENCAEIMRLLDDFGVNIEG
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     210       220       230       240       250       260         
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          . :::   . ... :.. ...: :: : .  .: . :  :   ..:     .:...:
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pF1KA1 FVFLLGGE-ELGPDGEFHASSKVFRYDPRQNSWLQMADMSVPRSEFAVGVIGKFIYAVAG
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pF1KA1 RTRDETFYSTERYDITNDKWEFVDPYPVNKYGHEGTVLNNKLFITGGITSSSTSKQVCVF
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NP_001 RNAAGELPTVECYNPRTNEWTYVAKMSEPHYGHAGTVYGGVMYISGGITHDTFQKELMCF
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pF1KA1 DPSKEGTIEQRTRRTQVVTNCWENKSKMNYARCFHKMISYNGKLYVFGGVCVILRASFES
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NP_001 DPD---------------TDKWIQKAPMTTVRGLHCMCTVGERLYVIGGNH--FRGTSDY
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pF1KA1 QGCPSTEVYNPETDQWTILASMPIGRSGHGVTVLDKQIMVLGGLCYNGH-YSDSILTFDP
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pF1KA1 DENKWKEDEYPRMPCKLDGLQVCNLH-FPDYVLDEVRRCN      
       :...:..     .: .: :...:.:  ::                 
NP_001 DKDEWHK--VFDLPESLGGIRACTLTVFPPEETTPSPSRESPLSAP
         610         620       630       640         

>>NP_277030 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 isoform  (655 aa)
 initn: 987 init1: 285 opt: 907  Z-score: 936.0  bits: 183.4 E(85289): 2.1e-45
Smith-Waterman score: 1109; 32.2% identity (65.3% similar) in 599 aa overlap (2-593:63-638)

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pF1KA1                              MAGDVEGFCSSIHDTSVSAGFRALYEEGLLL
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NP_277 ISLVEEEDQHMKLSLGGSEMGLSSHLQSSKAGPTRIFTSNTHSSVVLQGFDQLRLEGLLC
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pF1KA1 DVTLVI--EDHQFQAHKALLATQSDYFRIMFTADMRERDQDKIHLKGLTATGFSHVLQFM
       ::::.    :  : .:....:. ::::. :::. :.:.:   :.:.:.. .:. ....:.
NP_277 DVTLMPGDTDDAFPVHRVMMASASDYFKAMFTGGMKEQDLMCIKLHGVSKVGLRKIIDFI
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pF1KA1 YYGTIELSMNTVHEILQAAMYVQLIEVVKFCCSFLLAKICLENCAEIMRLLDDFGVNIEG
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NP_277 YTAKLSLNMDNLQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVTLDNCVEVGRIANTY--NLTE
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pF1KA1 VREKLDTFLLDNFVPLMSRPDFLSYLSFEKLMSYLDNDHLSRFPEIELYEAVQSWLRHDR
       : . ...:.: ::  :.:  .::. : ::.:   :... :..  :.::..:.  ::: ..
NP_277 VDKYVNSFVLKNFPALLSTGEFLK-LPFERLAFVLSSNSLKHCTELELFKATCRWLRLEE
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pF1KA1 RRWRHTDTIIQNIRFCLMTPTSVFEKVKTSEFYRYSRQLRYEVDQALNYFQNVHQQPLLD
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NP_277 PRMDFAAKLMKNIRFPLMTPQELINYVQTVDFMRTDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQPVMQ
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NP_001 DKDEWHK--VFDLPESLGGIRACTLTVFPPEETTPSPSRESPLSAP
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604 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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