Result of FASTA (omim) for pF1KA1256
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA1256, 1670 aa
  1>>>pF1KA1256 1670 - 1670 aa - 1670 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 16.4825+/-0.000708; mu= -25.5424+/- 0.044
 mean_var=945.4675+/-197.216, 0's: 0 Z-trim(119.6): 200  B-trim: 0 in 0/58
 Lambda= 0.041711
 statistics sampled from 33718 (33920) to 33718 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.693), E-opt: 0.2 (0.398), width:  16
 Scan time: 12.900

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_062541 (OMIM: 604464) intersectin-2 isoform 3 [ (1670) 11010 680.3 3.9e-194
NP_006268 (OMIM: 604464) intersectin-2 isoform 1 [ (1697) 7225 452.5 1.4e-125
XP_016883922 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1650) 5078 323.3 1.1e-86
XP_016883924 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1613) 5071 322.9 1.5e-86
XP_016883923 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1645) 5015 319.5 1.5e-85
XP_016883925 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1608) 5000 318.6 2.8e-85
NP_671494 (OMIM: 604464) intersectin-2 isoform 2 [ (1249) 4127 266.0 1.5e-69
XP_016883919 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1679) 3835 248.5 3.7e-64
NP_001317939 (OMIM: 602442) intersectin-1 isoform  (1716) 3835 248.5 3.7e-64
XP_016883918 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1684) 3802 246.5 1.5e-63
NP_003015 (OMIM: 602442) intersectin-1 isoform ITS (1721) 3802 246.6 1.5e-63
XP_016883917 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1721) 3802 246.6 1.5e-63
XP_016883926 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1185) 3700 240.2   8e-62
XP_016883921 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1660) 2069 142.3 3.6e-32
XP_016883920 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1665) 2036 140.3 1.4e-31
NP_001317937 (OMIM: 602442) intersectin-1 isoform  (1149) 1640 116.3 1.6e-24
XP_016883929 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1112) 1633 115.8 2.1e-24
NP_001317940 (OMIM: 602442) intersectin-1 isoform  (1144) 1615 114.8 4.6e-24
XP_011527994 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1107) 1608 114.3   6e-24
XP_011527995 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1020) 1386 100.9   6e-20
XP_016883930 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1025) 1386 100.9   6e-20
NP_001317938 (OMIM: 602442) intersectin-1 isoform  (1215) 1386 101.0 6.8e-20
NP_001001132 (OMIM: 602442) intersectin-1 isoform  (1220) 1386 101.0 6.8e-20
NP_001317941 (OMIM: 602442) intersectin-1 isoform  (1178) 1379 100.6 8.9e-20
XP_016883927 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1183) 1379 100.6 8.9e-20
NP_009044 (OMIM: 190370) trichohyalin [Homo sapien (1943)  455 45.2  0.0068
XP_016872911 (OMIM: 604763) PREDICTED: rho guanine (1401)  442 44.3  0.0094
XP_016872910 (OMIM: 604763) PREDICTED: rho guanine (1441)  442 44.3  0.0096
XP_011541022 (OMIM: 604763) PREDICTED: rho guanine (1441)  442 44.3  0.0096
NP_001288013 (OMIM: 604763) rho guanine nucleotide (1441)  442 44.3  0.0096
XP_016872909 (OMIM: 604763) PREDICTED: rho guanine (1485)  442 44.3  0.0098
XP_006718868 (OMIM: 604763) PREDICTED: rho guanine (1519)  442 44.3  0.0099
NP_001185594 (OMIM: 604763) rho guanine nucleotide (1525)  442 44.3    0.01


>>NP_062541 (OMIM: 604464) intersectin-2 isoform 3 [Homo  (1670 aa)
 initn: 11010 init1: 11010 opt: 11010  Z-score: 3606.4  bits: 680.3 E(85289): 3.9e-194
Smith-Waterman score: 11010; 99.9% identity (100.0% similar) in 1670 aa overlap (1-1670:1-1670)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MMAQFPTAMNGGPNMWAITSEERTKHDRQFDNLKPSGGYITGDQARNFFLQSGLPAPVLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 MMAQFPTAMNGGPNMWAITSEERTKHDRQFDNLKPSGGYITGDQARNFFLQSGLPAPVLA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 EIWALSDLNKDGKMDQQEFSIAMKLIKLKLQGQQLPVVLPPIMKQPPMFSPLISARFGMG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 EIWALSDLNKDGKMDQQEFSIAMKLIKLKLQGQQLPVVLPPIMKQPPMFSPLISARFGMG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA1 SMPNLSIPQPLPPAAPITSLSSATSGTNLPPLMMPTPLVPSVSTSSLPNGTASLIQPLPI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 SMPNLSIPQPLPPAAPITSLSSATSGTNLPPLMMPTPLVPSVSTSSLPNGTASLIQPLPI
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA1 PYSSSTLPHGSSYSLMMGGFGGASIQKAQSLIDLGSSSSTSSTASLSGNSPKTGTSEWAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 PYSSSTLPHGSSYSLMMGGFGGASIQKAQSLIDLGSSSSTSSTASLSGNSPKTGTSEWAV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA1 PQPTRLKYRQKFNTLDKSMSGYLSGFQARNALLQSNLSQTQLATIWTLADVDGDGQLKAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 PQPTRLKYRQKFNTLDKSMSGYLSGFQARNALLQSNLSQTQLATIWTLADVDGDGQLKAE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA1 EFILAMHLTDMAKAGQPLPLTLPPELVPPSFRGGKQIDSINGTLPSYQKMQEEEPQKKLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 EFILAMHLTDMAKAGQPLPLTLPPELVPPSFRGGKQIDSINGTLPSYQKMQEEEPQKKLP
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA1 VTFEDKRKANYERGNMELEKRRQALMEQQQREAERKAQKEKEEWERKQRELQEQEWKKQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 VTFEDKRKANYERGNMELEKRRQALMEQQQREAERKAQKEKEEWERKQRELQEQEWKKQL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA1 ELEKRLEKQRELERQREEERRKDIERREAAKQELERQRRLEWERIRRQELLNQKNREQEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 ELEKRLEKQRELERQREEERRKDIERREAAKQELERQRRLEWERIRRQELLNQKNREQEE
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA1 IVRLNSKKKNLHLELEALNGKHQQISGRLQDVRLKKQTQKTELEVLDKQCDLEIMEIKQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 IVRLNSKKKNLHLELEALNGKHQQISGRLQDVRLKKQTQKTELEVLDKQCDLEIMEIKQL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA1 QQELQEYQNKLIYLVPEKQLLNERIKNMQFSNTPDSGVSLLHKKSLEKEELCQRLKEQLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 QQELQEYQNKLIYLVPEKQLLNERIKNMQFSNTPDSGVSLLHKKSLEKEELCQRLKEQLD
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA1 ALEKETASKLSEMDSFNNQLKELRETYNTQQLALEQLYKIKRDKLKEIERKRLELMQKKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 ALEKETASKLSEMDSFNNQLKELRETYNTQQLALEQLYKIKRDKLKEIERKRLELMQKKK
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA1 LEDEAARKAKQGKENLWKENLRKEEEEKQKRLQEEKTQEKIQEEERKAEEKQRKDKDTLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 LEDEAARKAKQGKENLWKENLRKEEEEKQKRLQEEKTQEKIQEEERKAEEKQRKDKDTLK
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KA1 AEEKKRETASVLVNYRALYPFEARNHDEMSFNSGDIIQVDEKTVGEPGWLYGSFQGNFGW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 AEEKKRETASVLVNYRALYPFEARNHDEMSFNSGDIIQVDEKTVGEPGWLYGSFQGNFGW
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KA1 FPCNYVEKMPSSENEKAVSPKKALLPPTVSLSATSTSSEPLSSNQPASVTDYQNVSFSNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 FPCNYVEKMPSSENEKAVSPKKALLPPTVSLSATSTSSEPLSSNQPASVTDYQNVSFSNL
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KA1 TVNTSWQKKSAFTRTVSPGSVSPIHGQGQVVENLKAQALCSWTAKKDNHLNFSKHDIITV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 TVNTSWQKKSAFTRTVSPGSVSPIHGQGQVVENLKAQALCSWTAKKDNHLNFSKHDIITV
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KA1 LEQQENWWFGEVHGGRGWFPKSYVKIIPGSEVKREEPEALYAAVNKKPTSAAYSVGEEYI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 LEQQENWWFGEVHGGRGWFPKSYVKIIPGSEVKREEPEALYAAVNKKPTSAAYSVGEEYI
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KA1 ALYPYSSVEPGDLTFTEGEEILVTQKDGEWWTGSIGDRSGIFPSNYVKPKDQESFGSASK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 ALYPYSSVEPGDLTFTEGEEILVTQKDGEWWTGSIGDRSGIFPSNYVKPKDQESFGSASK
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KA1 SGASNKKPEIAQVTSAYVASGSEQLSLAPGQLILILKKNTSGWWQGELQARGKKRQKGWF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 SGASNKKPEIAQVTSAYVASGSEQLSLAPGQLILILKKNTSGWWQGELQARGKKRQKGWF
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KA1 PASHVKLLGPSSERATPAFHPVCQVIAMYDYAANNEDELSFSKGQLINVMNKDDPDWWQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 PASHVKLLGPSSERATPAFHPVCQVIAMYDYAANNEDELSFSKGQLINVMNKDDPDWWQG
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KA1 EINGVTGLFPSNYVKMTTDSDPSQQWCADLQTLDTMQPIERKRQGYIHELIQTEERYMAD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 EINGVTGLFPSNYVKMTTDSDPSQQWCADLQTLDTMQPIERKRQGYIHELIQTEERYMAD
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KA1 LQLVVEVFQKRMAESGFLTEGEMALIFVNWKELIMSNTKLLKALRVRKKTGGEKMPVQMI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 LQLVVEVFQKRMAESGFLTEGEMALIFVNWKELIMSNTKLLKALRVRKKTGGEKMPVQMI
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KA1 GDILAAELSHMQAYIRFCSCQLNGAALLQQKTDEDTDFKEFLKKLASDPRCKGMPLSSFL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 GDILAAELSHMQAYIRFCSCQLNGAALLQQKTDEDTDFKEFLKKLASDPRCKGMPLSSFL
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KA1 LKPMQRITRYPLLIRSILENTPESHADHSSLKLALERAEELCSQVNEGVREKENSDRLEW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 LKPMQRITRYPLLIRSILENTPESHADHSSLKLALERAEELCSQVNEGVREKENSDRLEW
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KA1 IQAHVQCEGLAEQLIFNSLTNCLGPRKLLHSGKLYKTKSNKELHGFLFNDFLLLTYMVKQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 IQAHVQCEGLAEQLIFNSLTNCLGPRKLLHSGKLYKTKSNKELHGFLFNDFLLLTYMVKQ
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KA1 FAVSSGSEKLFSSKSNAQFKMYKTPIFLNEVLVKLPTDPSSDEPVFHISHIDRVYTLRTD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 FAVSSGSEKLFSSKSNAQFKMYKTPIFLNEVLVKLPTDPSSDEPVFHISHIDRVYTLRTD
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

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pF1KA1 NINERTAWVQKIKAASEQYIDTEKKQREKAYQARSQKTSGIGRLMVHVIEATELKACKPN
       :::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 NINERTAWVQKIKAASEQYIDTEKKKREKAYQARSQKTSGIGRLMVHVIEATELKACKPN
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 GKSNPYCEISMGSQSYTTRTIQDTLNPKWNFNCQFFIKDLYQDVLCLTLFDRDQFSPDDF
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 LGRTEIPVAKIRTEQESKGPMTRRLLLHEVPTGEVWVRFDLQLFEQKTLL
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KA1 ALEKETASKLSEMDSFNNQLK---------------------------ELRETYNTQQLA
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pF1KA1 LEQLYKIKRDKLKEIERKRLELMQKKKLEDEAARKAKQGKENLWKENLRKEEEEKQKRLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 LEQLYKIKRDKLKEIERKRLELMQKKKLEDEAARKAKQGKENLWKENLRKEEEEKQKRLQ
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pF1KA1 EEKTQEKIQEEERKAEEKQRKDKDTLKAEEKKRETASVLVNYRALYPFEARNHDEMSFNS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 EEKTQEKIQEEERKAEEKQRKDKDTLKAEEKKRETASVLVNYRALYPFEARNHDEMSFNS
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NP_006 GDIIQVDEKTVGEPGWLYGSFQGNFGWFPCNYVEKMPSSENEKAVSPKKALLPPTVSLSA
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pF1KA1 TSTSSEPLSSNQPASVTDYQNVSFSNLTVNTSWQKKSAFTRTVSPGSVSPIHGQGQVVEN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 TSTSSEPLSSNQPASVTDYQNVSFSNLTVNTSWQKKSAFTRTVSPGSVSPIHGQGQVVEN
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pF1KA1 LKAQALCSWTAKKDNHLNFSKHDIITVLEQQENWWFGEVHGGRGWFPKSYVKIIPGSEVK
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NP_006 LKAQALCSWTAKKDNHLNFSKHDIITVLEQQENWWFGEVHGGRGWFPKSYVKIIPGSEVK
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NP_006 REEPEALYAAVNKKPTSAAYSVGEEYIALYPYSSVEPGDLTFTEGEEILVTQKDGEWWTG
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NP_006 LILKKNTSGWWQGELQARGKKRQKGWFPASHVKLLGPSSERATPAFHPVCQVIAMYDYAA
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NP_006 NNEDELSFSKGQLINVMNKDDPDWWQGEINGVTGLFPSNYVKMTTDSDPSQQWCADLQTL
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NP_006 DTMQPIERKRQGYIHELIQTEERYMADLQLVVEVFQKRMAESGFLTEGEMALIFVNWKEL
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NP_006 IMSNTKLLKALRVRKKTGGEKMPVQMIGDILAAELSHMQAYIRFCSCQLNGAALLQQKTD
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 ALERAEELCSQVNEGVREKENSDRLEWIQAHVQCEGLAEQLIFNSLTNCLGPRKLLHSGK
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 LYKTKSNKELHGFLFNDFLLLTYMVKQFAVSSGSEKLFSSKSNAQFKMYKTPIFLNEVLV
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::
NP_006 KLPTDPSSDEPVFHISHIDRVYTLRTDNINERTAWVQKIKAASEQYIDTEKKKREKAYQA
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pF1KA1 RSQKTSGIGRLMVHVIEATELKACKPNGKSNPYCEISMGSQSYTTRTIQDTLNPKWNFNC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 RSQKTSGIGRLMVHVIEATELKACKPNGKSNPYCEISMGSQSYTTRTIQDTLNPKWNFNC
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pF1KA1 QFFIKDLYQDVLCLTLFDRDQFSPDDFLGRTEIPVAKIRTEQESKGPMTRRLLLHEVPTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 QFFIKDLYQDVLCLTLFDRDQFSPDDFLGRTEIPVAKIRTEQESKGPMTRRLLLHEVPTG
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pF1KA1 EVWVRFDLQLFEQKTLL
       :::::::::::::::::
NP_006 EVWVRFDLQLFEQKTLL
             1690       

>>XP_016883922 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin-1 i  (1650 aa)
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pF1KA1 MMAQFPTAMNGGPNMWAITSEERTKHDRQFDNLKPSGGYITGDQARNFFLQSGLPAPVLA
        :::::: ..:. ..:::: :::.:::.:: .::: .:.::::::::::.::::: ::::
XP_016  MAQFPTPFGGSLDIWAITVEERAKHDQQFHSLKPISGFITGDQARNFFFQSGLPQPVLA
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               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 EIWALSDLNKDGKMDQQEFSIAMKLIKLKLQGQQLPVVLPPIMKQPPMFSPLISARFGMG
       .::::.:.:.::.::: ::::::::::::::: ::: .:::.::: :.      : ::::
XP_016 QIWALADMNNDGRMDQVEFSIAMKLIKLKLQGYQLPSALPPVMKQQPVAISSAPA-FGMG
      60        70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170          
pF1KA1 SMPNLSIPQPLPPAAPITSLSSATSGTNLPPLMMPTPLVPSVSTSSLPNGTASLIQPLP-
       ..   :.: ::  .::.   :  . :  . : .. .  ::....  : ::.  .::::: 
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pF1KA1 IPYSSSTLPHGSSYSLMMGGFG-GASIQKAQSLIDLGSSSSTSSTASLSGNSPKTGTSEW
       . . ..:::..::.:    :   ....:::::. :..:              :   ..::
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pF1KA1 AVPQPTRLKYRQKFNTLDKSMSGYLSGFQARNALLQSNLSQTQLATIWTLADVDGDGQLK
       :::: .:::::: ::. ::.:::.:.: :::. :.::.: :.:::.::.:.:.: ::.: 
XP_016 AVPQSSRLKYRQLFNSHDKTMSGHLTGPQARTILMQSSLPQAQLASIWNLSDIDQDGKLT
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pF1KA1 AEEFILAMHLTDMAKAGQPLPLTLPPELVPPSFR---GGKQIDSINGT-----LPSYQKM
       :::::::::: :.: .::::: .:::: .:::::   .:. :. :..:     ::    .
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pF1KA1 QEEEPQ--KKLPVTFEDKRKANYERGNMELEKRRQALMEQQQREAERKAQKEKEEWERKQ
       ..:. :  ::::::::::.. :.::::.:::::::::.:::..: :: :: :. : :::.
XP_016 EDEQQQLEKKLPVTFEDKKRENFERGNLELEKRRQALLEQQRKEQERLAQLERAEQERKE
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pF1KA1 RELQEQEWKKQLELEKRLEKQRELERQREEERRKDIERREAAKQELERQRRLEWERIRRQ
       :: :::: :.::::::.:::::::::::::::::.::::::::.::::::.::::: :::
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       :::::.:.:::.:: :..:::.:..:::::: :..:. :.:::.: .  ::. :.:  .:
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pF1KA1 QCDLEIMEIKQLQQELQEYQNKLIYLVPEKQLLNERIKNMQFSNTP-DSGVSLLHKKSLE
       . .:.: :: .:::.::: :. :  :.::::.::...:..: ..   :: :.:  :..::
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pF1KA1 KEELC-QRLKEQLDALEKETASKLSEMDSFNNQLKELRETYNTQQLALEQLYKIKRDKLK
        .::  :.:..::: .:::: :::.:.: :::::::::: .: :::  .. .. .: : :
XP_016 AKELARQHLRDQLDEVEKETRSKLQEIDIFNNQLKELREIHNKQQLQKQKSMEAERLKQK
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pF1KA1 EIERKRLELMQKKKLEDEAARKAKQGKENLWKENLRKEEE-EKQKRLQEE---KTQEKIQ
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pF1KA1 E---EERKAEEKQRK-----------DKDTLKAE----EKKRETASV-----LVNYRALY
       .   ::.  .: : :            : ...:     ::   : :.     .: :::::
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pF1KA1 PFEARNHDEMSFNSGDIIQV-----DEKTVGEPGWLYGSFQGNFGWFPCNYVEKMPSSE-
       :::.:.:::.... :::..:     ::. .:::::: : ..:. :::: ::.::.: .: 
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pF1KA1 ---------NEKAVSPKKAL--LPPTVSLSATSTSSEP-----LSSNQPASV-----TDY
                . .: .:: ::   :  ......  :. :     .::. :.:.     :: 
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pF1KA1 QNV--SFSNLTVNTSWQ--KKSAFTRTVSPGSV-SPIHGQGQVVENLKAQALCSWTAKKD
        ..  .  .::: .. :  ..:::: ... ::  ::. :::. ::.:.::::  : ::::
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pF1KA1 NHLNFSKHDIITVLEQQENWWFGEVHGGRGWFPKSYVKIIPGSEVKREEPEALYAAVNKK
       :::::.:.:.:::::::. ::::::.: .:::::::::.: :       :        .:
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pF1KA1 PTSAAYSVGEEYIALYPYSSVEPGDLTFTEGEEILVTQKDGEWWTGSIGDRSGIFPSNYV
        ::           .   ::  :..:                              .  .
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       .:        :.:  .:..  ::::: ..:.:.: :::.::::::::: ::: .:::.::
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       ::::::::: :::::..::::.:.. . ::.  :       :::::.::::.:.:.:::.
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       :.:::.:::.::.:::::.::.:: .:::::::::.::: :::::::.::. :: . : :
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       ::::::::::: ::: :. :::::.:.::: . :: .::: :.:.:::::::::: : ::
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       ::::::::: .::::::.::::::.:.: ::: :::::: :::::::.::::::  ::::
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       :.:.:: ::::::::::::.::::::.:::::.:..:::::::.: ::: :: :::.:::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:::.::::::::.::::::::.:::
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       :::.::::::::::: ..: .. :::..:.:: ::: :.:::::::::::::::::::::
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       .:::.:::::::::::::...:::::::::::::::: ::.::::.::::: .:::...:
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       ::::::.:.:. ::: :. .::::::::..:::: . :.::::::::::: ::::::.::
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        :.:::.:.:.::::::::::::::: :: :. .: ::::.:. ::::::::::. ::.:
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       ::::..    
XP_016 LQLFDEP   
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>>XP_016883924 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin-1 i  (1613 aa)
 initn: 5244 init1: 1864 opt: 5071  Z-score: 1675.1  bits: 322.9 E(85289): 1.5e-86
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       .::::.:.:.::.::: ::::::::::::::: ::: .:::.::: :.            
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pF1KA1 AEEFILAMHLTDMAKAGQPLPLTLPPELVPPSFR---GGKQIDSINGT-----LPSYQKM
       :::::::::: :.: .::::: .:::: .:::::   .:. :. :..:     ::    .
XP_016 AEEFILAMHLIDVAMSGQPLPPVLPPEYIPPSFRRVRSGSGISVISSTSVDQRLPEEPVL
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pF1KA1 QEEEPQ--KKLPVTFEDKRKANYERGNMELEKRRQALMEQQQREAERKAQKEKEEWERKQ
       ..:. :  ::::::::::.. :.::::.:::::::::.:::..: :: :: :. : :::.
XP_016 EDEQQQLEKKLPVTFEDKKRENFERGNLELEKRRQALLEQQRKEQERLAQLERAEQERKE
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pF1KA1 RELQEQEWKKQLELEKRLEKQRELERQREEERRKDIERREAAKQELERQRRLEWERIRRQ
       :: :::: :.::::::.:::::::::::::::::.::::::::.::::::.::::: :::
XP_016 RERQEQERKRQLELEKQLEKQRELERQREEERRKEIERREAAKRELERQRQLEWERNRRQ
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pF1KA1 ELLNQKNREQEEIVRLNSKKKNLHLELEALNGKHQQISGRLQDVRLKKQTQKTELEVLDK
       :::::.:.:::.:: :..:::.:..:::::: :..:. :.:::.: .  ::. :.:  .:
XP_016 ELLNQRNKEQEDIVVLKAKKKTLEFELEALNDKKHQLEGKLQDIRCRLTTQRQEIESTNK
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pF1KA1 QCDLEIMEIKQLQQELQEYQNKLIYLVPEKQLLNERIKNMQFSNTP-DSGVSLLHKKSLE
       . .:.: :: .:::.::: :. :  :.::::.::...:..: ..   :: :.:  :..::
XP_016 SRELRIAEITHLQQQLQESQQMLGRLIPEKQILNDQLKQVQQNSLHRDSLVTL--KRALE
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pF1KA1 KEELC-QRLKEQLDALEKETASKLSEMDSFNNQLKELRETYNTQQLALEQLYKIKRDKLK
        .::  :.:..::: .:::: :::.:.: :::::::::: .: :::  .. .. .: : :
XP_016 AKELARQHLRDQLDEVEKETRSKLQEIDIFNNQLKELREIHNKQQLQKQKSMEAERLKQK
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pF1KA1 EIERKRLELMQKKKLEDEAARKAKQGKENLWKENLRKEEE-EKQKRLQEE---KTQEKIQ
       : ::: .:: ..:   .:: :.: : ... : :....:.: .. ..:.::   : .:...
XP_016 EQERKIIELEKQK---EEAQRRA-QERDKQWLEHVQQEDEHQRPRKLHEEEKLKREESVK
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pF1KA1 E---EERKAEEKQRK-----------DKDTLKAE----EKKRETASV-----LVNYRALY
       .   ::.  .: : :            : ...:     ::   : :.     .: :::::
XP_016 KKDGEEKGKQEAQDKLGRLFHQHQEPAKPAVQAPWSTAEKGPLTISAQENVKVVYYRALY
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pF1KA1 PFEARNHDEMSFNSGDIIQV-----DEKTVGEPGWLYGSFQGNFGWFPCNYVEKMPSSE-
       :::.:.:::.... :::..:     ::. .:::::: : ..:. :::: ::.::.: .: 
XP_016 PFESRSHDEITIQPGDIVMVKGEWVDESQTGEPGWLGGELKGKTGWFPANYAEKIPENEV
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pF1KA1 ---------NEKAVSPKKAL--LPPTVSLSATSTSSEP-----LSSNQPASV-----TDY
                . .: .:: ::   :  ......  :. :     .::. :.:.     :: 
XP_016 PAPVKPVTDSTSAPAPKLALRETPAPLAVTSSEPSTTPNNWADFSSTWPTSTNEKPETDN
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pF1KA1 QNV--SFSNLTVNTSWQ--KKSAFTRTVSPGSV-SPIHGQGQVVENLKAQALCSWTAKKD
        ..  .  .::: .. :  ..:::: ... ::  ::. :::. ::.:.::::  : ::::
XP_016 WDAWAAQPSLTVPSAGQLRQRSAFTPATATGSSPSPVLGQGEKVEGLQAQALYPWRAKKD
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pF1KA1 NHLNFSKHDIITVLEQQENWWFGEVHGGRGWFPKSYVKIIPGSEVKREEPEALYAAVNKK
       :::::.:.:.:::::::. ::::::.: .:::::::::.: :       :        .:
XP_016 NHLNFNKNDVITVLEQQDMWWFGEVQGQKGWFPKSYVKLISG-------P-------IRK
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pF1KA1 PTSAAYSVGEEYIALYPYSSVEPGDLTFTEGEEILVTQKDGEWWTGSIGDRSGIFPSNYV
        ::           .   ::  :..:                              .  .
XP_016 STS-----------MDSGSSESPASL------------------------------KRVA
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       .:        :.:  .:..  ::::: ..:.:.: :::.::::::::: ::: .:::.::
XP_016 SP--------AAKPVVSGE--EIAQVIASYTATGPEQLTLAPGQLILIRKKNPGGWWEGE
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pF1KA1 LQARGKKRQKGWFPASHVKLLGPSSERATPAFHP-------VCQVIAMYDYAANNEDELS
       ::::::::: :::::..::::.:.. . ::.  :       :::::.::::.:.:.:::.
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pF1KA1 FSKGQLINVMNKDDPDWWQGEINGVTGLFPSNYVKMTTDSDPSQQWCADLQTLDTMQPIE
       :.:::.:::.::.:::::.::.:: .:::::::::.::: :::::::.::. :: . : :
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       ::::::::::: ::: :. :::::.:.::: . :: .::: :.:.:::::::::: : ::
XP_016 RKRQGYIHELIVTEENYVNDLQLVTEIFQKPLMESELLTEKEVAMIFVNWKELIMCNIKL
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       :.:.:: ::::::::::::.::::::.:::::.:..:::::::.: ::: :: :::.:::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:::.::::::::.::::::::.:::
XP_016 LCSQVNEGVREKENSDRLEWIQAHVQCEGLSEQLVFNSVTNCLGPRKFLHSGKLYKAKSN
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pF1KA1 KELHGFLFNDFLLLTYMVKQFAVSSGSEKLFSSKSNAQFKMYKTPIFLNEVLVKLPTDPS
       :::.::::::::::: ..: .. :::..:.:: ::: :.:::::::::::::::::::::
XP_016 KELYGFLFNDFLLLTQITKPLG-SSGTDKVFSPKSNLQYKMYKTPIFLNEVLVKLPTDPS
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pF1KA1 SDEPVFHISHIDRVYTLRTDNINERTAWVQKIKAASEQYIDTEKKQREKAYQARSQKTSG
       .:::.:::::::::::::...:::::::::::::::: ::.::::.::::: .:::...:
XP_016 GDEPIFHISHIDRVYTLRAESINERTAWVQKIKAASELYIETEKKKREKAYLVRSQRATG
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       ::::::.:.:. ::: :. .::::::::..:::: . :.::::::::::: ::::::.::
XP_016 IGRLMVNVVEGIELKPCRSHGKSNPYCEVTMGSQCHITKTIQDTLNPKWNSNCQFFIRDL
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pF1KA1 YQDVLCLTLFDRDQFSPDDFLGRTEIPVAKIRTEQESKGPMTRRLLLHEVPTGEVWVRFD
        :.:::.:.:.::::::::::::::: :: :. .: ::::.:. ::::::::::. ::.:
XP_016 EQEVLCITVFERDQFSPDDFLGRTEIRVADIKKDQGSKGPVTKCLLLHEVPTGEIVVRLD
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pF1KA1 LQLFEQKTLL
       ::::..    
XP_016 LQLFDEP   
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>>XP_016883923 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin-1 i  (1645 aa)
 initn: 5367 init1: 1864 opt: 5015  Z-score: 1656.8  bits: 319.5 E(85289): 1.5e-85
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        :::::: ..:. ..:::: :::.:::.:: .::: .:.::::::::::.::::: ::::
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       .::::.:.:.::.::: ::::::::::::::: ::: .:::.::: :.      : ::::
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pF1KA1 IPYSSSTLPHGSSYSLMMGGFG-GASIQKAQSLIDLGSSSSTSSTASLSGNSPKTGTSEW
       . . ..:::..::.:    :   ....:::::. :..:              :   ..::
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       :: :::: :.::::::.:::::::::::::::::.::::::::.::::::.::::: :::
XP_016 RERQEQERKRQLELEKQLEKQRELERQREEERRKEIERREAAKRELERQRQLEWERNRRQ
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pF1KA1 ELLNQKNREQEEIVRLNSKKKNLHLELEALNGKHQQISGRLQDVRLKKQTQKTELEVLDK
       :::::.:.:::.:: :..:::.:..:::::: :..:. :.:::.: .  ::. :.:  .:
XP_016 ELLNQRNKEQEDIVVLKAKKKTLEFELEALNDKKHQLEGKLQDIRCRLTTQRQEIESTNK
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pF1KA1 QCDLEIMEIKQLQQELQEYQNKLIYLVPEKQLLNERIKNMQFSNTP-DSGVSLLHKKSLE
       . .:.: :: .:::.::: :. :  :.::::.::...:..: ..   :: :.:  :..::
XP_016 SRELRIAEITHLQQQLQESQQMLGRLIPEKQILNDQLKQVQQNSLHRDSLVTL--KRALE
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pF1KA1 KEELC-QRLKEQLDALEKETASKLSEMDSFNNQLKELRETYNTQQLALEQLYKIKRDKLK
        .::  :.:..::: .:::: :::.:.: :::::::::: .: :::  .. .. .: : :
XP_016 AKELARQHLRDQLDEVEKETRSKLQEIDIFNNQLKELREIHNKQQLQKQKSMEAERLKQK
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pF1KA1 EIERKRLELMQKKKLEDEAARKAKQGKENLWKENLRKEEE-EKQKRLQEE---KTQEKIQ
       : ::: .:: ..:   .:: :.: : ... : :....:.: .. ..:.::   : .:...
XP_016 EQERKIIELEKQK---EEAQRRA-QERDKQWLEHVQQEDEHQRPRKLHEEEKLKREESVK
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pF1KA1 E---EERKAEEKQRK-----------DKDTLKAE----EKKRETASV-----LVNYRALY
       .   ::.  .: : :            : ...:     ::   : :.     .: :::::
XP_016 KKDGEEKGKQEAQDKLGRLFHQHQEPAKPAVQAPWSTAEKGPLTISAQENVKVVYYRALY
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pF1KA1 PFEARNHDEMSFNSGDIIQVDEKTVGEPGWLYGSFQGNFGWFPCNYVEKMPSSE------
       :::.:.:::.... :::..:::. .:::::: : ..:. :::: ::.::.: .:      
XP_016 PFESRSHDEITIQPGDIVMVDESQTGEPGWLGGELKGKTGWFPANYAEKIPENEVPAPVK
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pF1KA1 ----NEKAVSPKKAL--LPPTVSLSATSTSSEP-----LSSNQPASV-----TDYQNV--
           . .: .:: ::   :  ......  :. :     .::. :.:.     ::  ..  
XP_016 PVTDSTSAPAPKLALRETPAPLAVTSSEPSTTPNNWADFSSTWPTSTNEKPETDNWDAWA
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pF1KA1 SFSNLTVNTSWQ--KKSAFTRTVSPGSV-SPIHGQGQVVENLKAQALCSWTAKKDNHLNF
       .  .::: .. :  ..:::: ... ::  ::. :::. ::.:.::::  : :::::::::
XP_016 AQPSLTVPSAGQLRQRSAFTPATATGSSPSPVLGQGEKVEGLQAQALYPWRAKKDNHLNF
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pF1KA1 SKHDIITVLEQQENWWFGEVHGGRGWFPKSYVKIIPGSEVKREEPEALYAAVNKKPTSAA
       .:.:.:::::::. ::::::.: .:::::::::.: :       :        .: ::  
XP_016 NKNDVITVLEQQDMWWFGEVQGQKGWFPKSYVKLISG-------P-------IRKSTS--
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                .   ::  :..:                              .  ..:   
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            :.:  .:..  ::::: ..:.:.: :::.::::::::: ::: .:::.:::::::
XP_016 -----AAKPVVSGE--EIAQVIASYTATGPEQLTLAPGQLILIRKKNPGGWWEGELQARG
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pF1KA1 KKRQKGWFPASHVKLLGPSSERATPAFHP-------VCQVIAMYDYAANNEDELSFSKGQ
       :::: :::::..::::.:.. . ::.  :       :::::.::::.:.:.:::.:.:::
XP_016 KKRQIGWFPANYVKLLSPGTSKITPTEPPKSTALAAVCQVIGMYDYTAQNDDELAFNKGQ
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       .:::.::.:::::.::.:: .:::::::::.::: :::::::.::. :: . : ::::::
XP_016 IINVLNKEDPDWWKGEVNGQVGLFPSNYVKLTTDMDPSQQWCSDLHLLDMLTPTERKRQG
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       :::::: ::: :. :::::.:.::: . :: .::: :.:.:::::::::: : :::::::
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       :::: .::::::.::::::.:.: ::: :::::: :::::::.::::::  :::::.:.:
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       : ::::::::::::.::::::.:::::.:..:::::::.: ::: :: :::.::::::::
XP_016 AMDPRCKGMPLSSFILKPMQRVTRYPLIIKNILENTPENHPDHSHLKHALEKAEELCSQV
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       :::::::::::::::::::::::::.:::.:::.::::::::.::::::::.::::::.:
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       :::::::::: ..: .. :::..:.:: ::: :.:::::::::::::::::::::.:::.
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       :::::::::::::...:::::::::::::::: ::.::::.::::: .:::...::::::
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pF1KA1 VHVIEATELKACKPNGKSNPYCEISMGSQSYTTRTIQDTLNPKWNFNCQFFIKDLYQDVL
       :.:.:. ::: :. .::::::::..:::: . :.::::::::::: ::::::.:: :.::
XP_016 VNVVEGIELKPCRSHGKSNPYCEVTMGSQCHITKTIQDTLNPKWNSNCQFFIRDLEQEVL
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pF1KA1 CLTLFDRDQFSPDDFLGRTEIPVAKIRTEQESKGPMTRRLLLHEVPTGEVWVRFDLQLFE
       :.:.:.::::::::::::::: :: :. .: ::::.:. ::::::::::. ::.:::::.
XP_016 CITVFERDQFSPDDFLGRTEIRVADIKKDQGSKGPVTKCLLLHEVPTGEIVVRLDLQLFD
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pF1KA1 QKTLL
       .    
XP_016 EP   
            

>>XP_016883925 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin-1 i  (1608 aa)
 initn: 5367 init1: 1864 opt: 5000  Z-score: 1652.0  bits: 318.6 E(85289): 2.8e-85
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        :::::: ..:. ..:::: :::.:::.:: .::: .:.::::::::::.::::: ::::
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       .::::.:.:.::.::: ::::::::::::::: ::: .:::.::: :.            
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       . . ..:::..::.:    :   ....:::::. :..:              :   ..::
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       :::: .:::::: ::. ::.:::.:.: :::. :.::.: :.:::.::.:.:.: ::.: 
XP_016 AVPQSSRLKYRQLFNSHDKTMSGHLTGPQARTILMQSSLPQAQLASIWNLSDIDQDGKLT
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       :::::::::: :.: .::::: .:::: .:::::   .:. :. :..:     ::    .
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       ..:. :  ::::::::::.. :.::::.:::::::::.:::..: :: :: :. : :::.
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pF1KA1 KEELC-QRLKEQLDALEKETASKLSEMDSFNNQLKELRETYNTQQLALEQLYKIKRDKLK
        .::  :.:..::: .:::: :::.:.: :::::::::: .: :::  .. .. .: : :
XP_016 AKELARQHLRDQLDEVEKETRSKLQEIDIFNNQLKELREIHNKQQLQKQKSMEAERLKQK
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pF1KA1 EIERKRLELMQKKKLEDEAARKAKQGKENLWKENLRKEEE-EKQKRLQEE---KTQEKIQ
       : ::: .:: ..:   .:: :.: : ... : :....:.: .. ..:.::   : .:...
XP_016 EQERKIIELEKQK---EEAQRRA-QERDKQWLEHVQQEDEHQRPRKLHEEEKLKREESVK
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pF1KA1 E---EERKAEEKQRK-----------DKDTLKAE----EKKRETASV-----LVNYRALY
       .   ::.  .: : :            : ...:     ::   : :.     .: :::::
XP_016 KKDGEEKGKQEAQDKLGRLFHQHQEPAKPAVQAPWSTAEKGPLTISAQENVKVVYYRALY
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pF1KA1 PFEARNHDEMSFNSGDIIQVDEKTVGEPGWLYGSFQGNFGWFPCNYVEKMPSSE------
       :::.:.:::.... :::..:::. .:::::: : ..:. :::: ::.::.: .:      
XP_016 PFESRSHDEITIQPGDIVMVDESQTGEPGWLGGELKGKTGWFPANYAEKIPENEVPAPVK
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pF1KA1 ----NEKAVSPKKAL--LPPTVSLSATSTSSEP-----LSSNQPASV-----TDYQNV--
           . .: .:: ::   :  ......  :. :     .::. :.:.     ::  ..  
XP_016 PVTDSTSAPAPKLALRETPAPLAVTSSEPSTTPNNWADFSSTWPTSTNEKPETDNWDAWA
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pF1KA1 SFSNLTVNTSWQ--KKSAFTRTVSPGSV-SPIHGQGQVVENLKAQALCSWTAKKDNHLNF
       .  .::: .. :  ..:::: ... ::  ::. :::. ::.:.::::  : :::::::::
XP_016 AQPSLTVPSAGQLRQRSAFTPATATGSSPSPVLGQGEKVEGLQAQALYPWRAKKDNHLNF
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pF1KA1 SKHDIITVLEQQENWWFGEVHGGRGWFPKSYVKIIPGSEVKREEPEALYAAVNKKPTSAA
       .:.:.:::::::. ::::::.: .:::::::::.: :       :        .: ::  
XP_016 NKNDVITVLEQQDMWWFGEVQGQKGWFPKSYVKLISG-------P-------IRKSTS--
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pF1KA1 YSVGEEYIALYPYSSVEPGDLTFTEGEEILVTQKDGEWWTGSIGDRSGIFPSNYVKPKDQ
                .   ::  :..:                              .  ..:   
XP_016 ---------MDSGSSESPASL------------------------------KRVASP---
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pF1KA1 ESFGSASKSGASNKKPEIAQVTSAYVASGSEQLSLAPGQLILILKKNTSGWWQGELQARG
            :.:  .:..  ::::: ..:.:.: :::.::::::::: ::: .:::.:::::::
XP_016 -----AAKPVVSGE--EIAQVIASYTATGPEQLTLAPGQLILIRKKNPGGWWEGELQARG
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pF1KA1 KKRQKGWFPASHVKLLGPSSERATPAFHP-------VCQVIAMYDYAANNEDELSFSKGQ
       :::: :::::..::::.:.. . ::.  :       :::::.::::.:.:.:::.:.:::
XP_016 KKRQIGWFPANYVKLLSPGTSKITPTEPPKSTALAAVCQVIGMYDYTAQNDDELAFNKGQ
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pF1KA1 LINVMNKDDPDWWQGEINGVTGLFPSNYVKMTTDSDPSQQWCADLQTLDTMQPIERKRQG
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XP_016 IINVLNKEDPDWWKGEVNGQVGLFPSNYVKLTTDMDPSQQWCSDLHLLDMLTPTERKRQG
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pF1KA1 YIHELIQTEERYMADLQLVVEVFQKRMAESGFLTEGEMALIFVNWKELIMSNTKLLKALR
       :::::: ::: :. :::::.:.::: . :: .::: :.:.:::::::::: : :::::::
XP_016 YIHELIVTEENYVNDLQLVTEIFQKPLMESELLTEKEVAMIFVNWKELIMCNIKLLKALR
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pF1KA1 VRKKTGGEKMPVQMIGDILAAELSHMQAYIRFCSCQLNGAALLQQKTDEDTDFKEFLKKL
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XP_016 VRKKMSGEKMPVKMIGDILSAQLPHMQPYIRFCSRQLNGAALIQQKTDEAPDFKEFVKRL
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pF1KA1 ASDPRCKGMPLSSFLLKPMQRITRYPLLIRSILENTPESHADHSSLKLALERAEELCSQV
       : ::::::::::::.::::::.:::::.:..:::::::.: ::: :: :::.::::::::
XP_016 AMDPRCKGMPLSSFILKPMQRVTRYPLIIKNILENTPENHPDHSHLKHALEKAEELCSQV
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pF1KA1 NEGVREKENSDRLEWIQAHVQCEGLAEQLIFNSLTNCLGPRKLLHSGKLYKTKSNKELHG
       :::::::::::::::::::::::::.:::.:::.::::::::.::::::::.::::::.:
XP_016 NEGVREKENSDRLEWIQAHVQCEGLSEQLVFNSVTNCLGPRKFLHSGKLYKAKSNKELYG
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pF1KA1 FLFNDFLLLTYMVKQFAVSSGSEKLFSSKSNAQFKMYKTPIFLNEVLVKLPTDPSSDEPV
       :::::::::: ..: .. :::..:.:: ::: :.:::::::::::::::::::::.:::.
XP_016 FLFNDFLLLTQITKPLG-SSGTDKVFSPKSNLQYKMYKTPIFLNEVLVKLPTDPSGDEPI
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pF1KA1 FHISHIDRVYTLRTDNINERTAWVQKIKAASEQYIDTEKKQREKAYQARSQKTSGIGRLM
       :::::::::::::...:::::::::::::::: ::.::::.::::: .:::...::::::
XP_016 FHISHIDRVYTLRAESINERTAWVQKIKAASELYIETEKKKREKAYLVRSQRATGIGRLM
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pF1KA1 VHVIEATELKACKPNGKSNPYCEISMGSQSYTTRTIQDTLNPKWNFNCQFFIKDLYQDVL
       :.:.:. ::: :. .::::::::..:::: . :.::::::::::: ::::::.:: :.::
XP_016 VNVVEGIELKPCRSHGKSNPYCEVTMGSQCHITKTIQDTLNPKWNSNCQFFIRDLEQEVL
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pF1KA1 CLTLFDRDQFSPDDFLGRTEIPVAKIRTEQESKGPMTRRLLLHEVPTGEVWVRFDLQLFE
       :.:.:.::::::::::::::: :: :. .: ::::.:. ::::::::::. ::.:::::.
XP_016 CITVFERDQFSPDDFLGRTEIRVADIKKDQGSKGPVTKCLLLHEVPTGEIVVRLDLQLFD
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        1670
pF1KA1 QKTLL
       .    
XP_016 EP   
            

>>NP_671494 (OMIM: 604464) intersectin-2 isoform 2 [Homo  (1249 aa)
 initn: 4139 init1: 4055 opt: 4127  Z-score: 1369.5  bits: 266.0 E(85289): 1.5e-69
Smith-Waterman score: 7900; 97.3% identity (97.5% similar) in 1242 aa overlap (1-1215:1-1242)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MMAQFPTAMNGGPNMWAITSEERTKHDRQFDNLKPSGGYITGDQARNFFLQSGLPAPVLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_671 MMAQFPTAMNGGPNMWAITSEERTKHDRQFDNLKPSGGYITGDQARNFFLQSGLPAPVLA
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pF1KA1 EIWALSDLNKDGKMDQQEFSIAMKLIKLKLQGQQLPVVLPPIMKQPPMFSPLISARFGMG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_671 EIWALSDLNKDGKMDQQEFSIAMKLIKLKLQGQQLPVVLPPIMKQPPMFSPLISARFGMG
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pF1KA1 SMPNLSIPQPLPPAAPITSLSSATSGTNLPPLMMPTPLVPSVSTSSLPNGTASLIQPLPI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_671 SMPNLSIPQPLPPAAPITSLSSATSGTNLPPLMMPTPLVPSVSTSSLPNGTASLIQPLPI
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pF1KA1 PYSSSTLPHGSSYSLMMGGFGGASIQKAQSLIDLGSSSSTSSTASLSGNSPKTGTSEWAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_671 PYSSSTLPHGSSYSLMMGGFGGASIQKAQSLIDLGSSSSTSSTASLSGNSPKTGTSEWAV
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pF1KA1 PQPTRLKYRQKFNTLDKSMSGYLSGFQARNALLQSNLSQTQLATIWTLADVDGDGQLKAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_671 PQPTRLKYRQKFNTLDKSMSGYLSGFQARNALLQSNLSQTQLATIWTLADVDGDGQLKAE
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pF1KA1 EFILAMHLTDMAKAGQPLPLTLPPELVPPSFRGGKQIDSINGTLPSYQKMQEEEPQKKLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_671 EFILAMHLTDMAKAGQPLPLTLPPELVPPSFRGGKQIDSINGTLPSYQKMQEEEPQKKLP
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pF1KA1 VTFEDKRKANYERGNMELEKRRQALMEQQQREAERKAQKEKEEWERKQRELQEQEWKKQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_671 VTFEDKRKANYERGNMELEKRRQALMEQQQREAERKAQKEKEEWERKQRELQEQEWKKQL
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pF1KA1 ELEKRLEKQRELERQREEERRKDIERREAAKQELERQRRLEWERIRRQELLNQKNREQEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_671 ELEKRLEKQRELERQREEERRKDIERREAAKQELERQRRLEWERIRRQELLNQKNREQEE
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pF1KA1 IVRLNSKKKNLHLELEALNGKHQQISGRLQDVRLKKQTQKTELEVLDKQCDLEIMEIKQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_671 IVRLNSKKKNLHLELEALNGKHQQISGRLQDVRLKKQTQKTELEVLDKQCDLEIMEIKQL
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_671 QQELQEYQNKLIYLVPEKQLLNERIKNMQFSNTPDSGVSLLHKKSLEKEELCQRLKEQLD
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pF1KA1 ALEKETASKLSEMDSFNNQLK---------------------------ELRETYNTQQLA
       :::::::::::::::::::::                           ::::::::::::
NP_671 ALEKETASKLSEMDSFNNQLKCGNMDDSVLQCLLSLLSCLNNLFLLLKELRETYNTQQLA
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pF1KA1 LEQLYKIKRDKLKEIERKRLELMQKKKLEDEAARKAKQGKENLWKENLRKEEEEKQKRLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_671 LEQLYKIKRDKLKEIERKRLELMQKKKLEDEAARKAKQGKENLWKENLRKEEEEKQKRLQ
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pF1KA1 EEKTQEKIQEEERKAEEKQRKDKDTLKAEEKKRETASVLVNYRALYPFEARNHDEMSFNS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_671 EEKTQEKIQEEERKAEEKQRKDKDTLKAEEKKRETASVLVNYRALYPFEARNHDEMSFNS
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pF1KA1 GDIIQVDEKTVGEPGWLYGSFQGNFGWFPCNYVEKMPSSENEKAVSPKKALLPPTVSLSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_671 GDIIQVDEKTVGEPGWLYGSFQGNFGWFPCNYVEKMPSSENEKAVSPKKALLPPTVSLSA
              790       800       810       820       830       840

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pF1KA1 TSTSSEPLSSNQPASVTDYQNVSFSNLTVNTSWQKKSAFTRTVSPGSVSPIHGQGQVVEN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_671 TSTSSEPLSSNQPASVTDYQNVSFSNLTVNTSWQKKSAFTRTVSPGSVSPIHGQGQVVEN
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pF1KA1 LKAQALCSWTAKKDNHLNFSKHDIITVLEQQENWWFGEVHGGRGWFPKSYVKIIPGSEVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_671 LKAQALCSWTAKKDNHLNFSKHDIITVLEQQENWWFGEVHGGRGWFPKSYVKIIPGSEVK
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_671 REEPEALYAAVNKKPTSAAYSVGEEYIALYPYSSVEPGDLTFTEGEEILVTQKDGEWWTG
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_671 SIGDRSGIFPSNYVKPKDQESFGSASKSGASNKKPEIAQVTSAYVASGSEQLSLAPGQLI
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pF1KA1 LILKKNTSGWWQGELQARGKKRQKGWFPASHVKLLGPSSERATPAFHPVCQVIAMYDYAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_671 LILKKNTSGWWQGELQARGKKRQKGWFPASHVKLLGPSSERATPAFHPVCQVIAMYDYAA
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pF1KA1 NNEDELSFSKGQLINVMNKDDPDWWQGEINGVTGLFPSNYVKMTTDSDPSQQWCADLQTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_671 NNEDELSFSKGQLINVMNKDDPDWWQGEINGVTGLFPSNYVKMTTDSDPSQQWCADLQTL
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       :::::::::::::::::::::::::::::::::: .  .: :                  
NP_671 DTMQPIERKRQGYIHELIQTEERYMADLQLVVEVRRLLLASSRGICCLS           
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pF1KA1 IMSNTKLLKALRVRKKTGGEKMPVQMIGDILAAELSHMQAYIRFCSCQLNGAALLQQKTD

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       . . ..:::..::.:    :   ....:::::. :..:              :   ..::
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pF1KA1 AEEFILAMHLTDMAKAGQPLPLTLPPELVPPSFR---GGKQIDSINGT-----LPSYQKM
       :::::::::: :.: .::::: .:::: .:::::   .:. :. :..:     ::    .
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pF1KA1 KEELC-QRLKEQLDALEKETASKLSEMDSFNNQLKELRETYNTQQLALEQLYKIKRDKLK
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XP_016 AKELARQHLRDQLDEVEKETRSKLQEIDIFNNQLKELREIHNKQQLQKQKSMEAERLKQK
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XP_016 EQERKIIELEKQK---EEAQRRA-QERDKQWLEHVQQEDEHQRPRKLHEEEKLKREESVK
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pF1KA1 E---EERKAEEKQRK-----------DKDTLKAE----EKKRETASV-----LVNYRALY
       .   ::.  .: : :            : ...:     ::   : :.     .: :::::
XP_016 KKDGEEKGKQEAQDKLGRLFHQHQEPAKPAVQAPWSTAEKGPLTISAQENVKVVYYRALY
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pF1KA1 PFEARNHDEMSFNSGDIIQVDEKTVGEPGWLYGSFQGNFGWFPCNYVEKMPSSE------
       :::.:.:::.... :::..:::. .:::::: : ..:. :::: ::.::.: .:      
XP_016 PFESRSHDEITIQPGDIVMVDESQTGEPGWLGGELKGKTGWFPANYAEKIPENEVPAPVK
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pF1KA1 ----NEKAVSPKKAL--LPPTVSLSATSTSSEP-----LSSNQPASV-----TDYQNV--
           . .: .:: ::   :  ......  :. :     .::. :.:.     ::  ..  
XP_016 PVTDSTSAPAPKLALRETPAPLAVTSSEPSTTPNNWADFSSTWPTSTNEKPETDNWDAWA
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pF1KA1 SFSNLTVNTSWQ--KKSAFTRTVSPGSV-SPIHGQGQVVENLKAQALCSWTAKKDNHLNF
       .  .::: .. :  ..:::: ... ::  ::. :::. ::.:.::::  : :::::::::
XP_016 AQPSLTVPSAGQLRQRSAFTPATATGSSPSPVLGQGEKVEGLQAQALYPWRAKKDNHLNF
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pF1KA1 SKHDIITVLEQQENWWFGEVHGGRGWFPKSYVKIIPGSEVKR--------EEPEALYAAV
       .:.:.:::::::. ::::::.: .:::::::::.: :   :         : : .:  ..
XP_016 NKNDVITVLEQQDMWWFGEVQGQKGWFPKSYVKLISGPIRKSTSMDSGSSESPASLKRVA
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       .  :..     :::.::.: : : : ::::: .:. ::::.:::.::::..::..:.:::
XP_016 S--PAAKPVVSGEEFIAMYTYESSEQGDLTFQQGDVILVTKKDGDWWTGTVGDKAGVFPS
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pF1KA1 NYVKPKDQESFGSASKSGASNKKPEIAQVTSAYVASGSEQLSLAPGQLILILKKNTSGWW
       :::. ::.:. :.:.:.:. .:::::::: ..:.:.: :::.::::::::: ::: .:::
XP_016 NYVRLKDSEGSGTAGKTGSLGKKPEIAQVIASYTATGPEQLTLAPGQLILIRKKNPGGWW
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pF1KA1 QGELQARGKKRQKGWFPASHVKLLGPSSERATPAFHP-------VCQVIAMYDYAANNED
       .::::::::::: :::::..::::.:.. . ::.  :       :::::.::::.:.:.:
XP_016 EGELQARGKKRQIGWFPANYVKLLSPGTSKITPTEPPKSTALAAVCQVIGMYDYTAQNDD
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pF1KA1 ELSFSKGQLINVMNKDDPDWWQGEINGVTGLFPSNYVKMTTDSDPSQQWCADLQTLDTMQ
       ::.:.:::.:::.::.:::::.::.:: .:::::::::.::: :::::::.::. :: . 
XP_016 ELAFNKGQIINVLNKEDPDWWKGEVNGQVGLFPSNYVKLTTDMDPSQQWCSDLHLLDMLT
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       ::::.:.:: ::::::::::::.::::::.:::::.:..:::::::.: ::: :: :::.
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       :::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:::.::::::::.::::::::.
XP_016 AEELCSQVNEGVREKENSDRLEWIQAHVQCEGLSEQLVFNSVTNCLGPRKFLHSGKLYKA
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pF1KA1 KSNKELHGFLFNDFLLLTYMVKQFAVSSGSEKLFSSKSNAQFKMYKTPIFLNEVLVKLPT
       ::::::.::::::::::: ..: .. :::..:.:: ::: :.::::::::::::::::::
XP_016 KSNKELYGFLFNDFLLLTQITKPLG-SSGTDKVFSPKSNLQYKMYKTPIFLNEVLVKLPT
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pF1KA1 DPSSDEPVFHISHIDRVYTLRTDNINERTAWVQKIKAASEQYIDTEKKQREKAYQARSQK
       :::.:::.:::::::::::::...:::::::::::::::: ::.::::.::::: .:::.
XP_016 DPSGDEPIFHISHIDRVYTLRAESINERTAWVQKIKAASELYIETEKKKREKAYLVRSQR
    1490      1500      1510      1520      1530      1540         

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pF1KA1 TSGIGRLMVHVIEATELKACKPNGKSNPYCEISMGSQSYTTRTIQDTLNPKWNFNCQFFI
       ..:::::::.:.:. ::: :. .::::::::..:::: . :.::::::::::: ::::::
XP_016 ATGIGRLMVNVVEGIELKPCRSHGKSNPYCEVTMGSQCHITKTIQDTLNPKWNSNCQFFI
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pF1KA1 KDLYQDVLCLTLFDRDQFSPDDFLGRTEIPVAKIRTEQESKGPMTRRLLLHEVPTGEVWV
       .:: :.:::.:.:.::::::::::::::: :: :. .: ::::.:. ::::::::::. :
XP_016 RDLEQEVLCITVFERDQFSPDDFLGRTEIRVADIKKDQGSKGPVTKCLLLHEVPTGEIVV
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       :.:::::..    
XP_016 RLDLQLFDEP   
    1670            

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       . . ..:::..::.:    :   ....:::::. :..:              :   ..::
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       :::: .:::::: ::. ::.:::.:.: :::. :.::.: :.:::.::.:.:.: ::.: 
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       :::::::::: :.: .::::: .:::: .:::::   .:. :. :..:     ::    .
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       ..:. :  ::::::::::.. :.::::.:::::::::.:::..: :: :: :. : :::.
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NP_001 ELLNQRNKEQEDIVVLKAKKKTLEFELEALNDKKHQLEGKLQDIRCRLTTQRQEIESTNK
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NP_001 AKELARQHLRDQLDEVEKETRSKLQEIDIFNNQLKELREIHNKQQLQKQKSMEAERLKQK
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pF1KA1 EIERKRLELMQKKKLEDEAARKAKQGKENLWKENLRKEEE-EKQKRLQEE---KTQEKIQ
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NP_001 EQERKIIELEKQK---EEAQRRAQE-RDKQWLEHVQQEDEHQRPRKLHEEEKLKREESVK
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pF1KA1 E---EERKAEEKQRK-----------DKDTLKAE----EKKRETASV-----LVNYRALY
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NP_001 KKDGEEKGKQEAQDKLGRLFHQHQEPAKPAVQAPWSTAEKGPLTISAQENVKVVYYRALY
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pF1KA1 PFEARNHDEMSFNSGDIIQVDEKTVGEPGWLYGSFQGNFGWFPCNYVEKMPSSE------
       :::.:.:::.... :::..:::. .:::::: : ..:. :::: ::.::.: .:      
NP_001 PFESRSHDEITIQPGDIVMVDESQTGEPGWLGGELKGKTGWFPANYAEKIPENEVPAPVK
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pF1KA1 ----NEKAVSPKKAL--LPPTVSLSATSTSSEP-----LSSNQPASV-----TDYQNV--
           . .: .:: ::   :  ......  :. :     .::. :.:.     ::  ..  
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       .  .::: .. :  ..:::: ... ::  ::. :::. ::.:.::::  : :::::::::
NP_001 AQPSLTVPSAGQLRQRSAFTPATATGSSPSPVLGQGEKVEGLQAQALYPWRAKKDNHLNF
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pF1KA1 SKHDIITVLEQQENWWFGEVHGGRGWFPKSYVKIIPGSEVKR--------EEPEALYAAV
       .:.:.:::::::. ::::::.: .:::::::::.: :   :         : : .:  ..
NP_001 NKNDVITVLEQQDMWWFGEVQGQKGWFPKSYVKLISGPIRKSTSMDSGSSESPASLKRVA
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pF1KA1 NKKPTSAAYSVGEEYIALYPYSSVEPGDLTFTEGEEILVTQKDGEWWTGSIGDRSGIFPS
       .  :..     :::.::.: : : : ::::: .:. ::::.:::.::::..::..:.:::
NP_001 S--PAAKPVVSGEEFIAMYTYESSEQGDLTFQQGDVILVTKKDGDWWTGTVGDKAGVFPS
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pF1KA1 NYVKPKDQESFGSASKSGASNKKPEIAQVTSAYVASGSEQLSLAPGQLILILKKNTSGWW
       :::. ::.:. :.:.:.:. .:::::::: ..:.:.: :::.::::::::: ::: .:::
NP_001 NYVRLKDSEGSGTAGKTGSLGKKPEIAQVIASYTATGPEQLTLAPGQLILIRKKNPGGWW
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pF1KA1 QGELQARGKKRQKGWFPASHVKLLGPSSERATPAFHP-------VCQVIAMYDYAANNED
       .::::::::::: :::::..::::.:.. . ::.  :       :::::.::::.:.:.:
NP_001 EGELQARGKKRQIGWFPANYVKLLSPGTSKITPTEPPKSTALAAVCQVIGMYDYTAQNDD
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       ::.:.:::.:::.::.:::::.::.:: .:::::::::.::: :::::::.::. :: . 
NP_001 ELAFNKGQIINVLNKEDPDWWKGEVNGQVGLFPSNYVKLTTDMDPSQQWCSDLHLLDMLT
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       ::::.:.:: ::::::::::::.::::::.:::::.:..:::::::.: ::: :: :::.
NP_001 FKEFVKRLAMDPRCKGMPLSSFILKPMQRVTRYPLIIKNILENTPENHPDHSHLKHALEK
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       :::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:::.::::::::.::::::::.
NP_001 AEELCSQVNEGVREKENSDRLEWIQAHVQCEGLSEQLVFNSVTNCLGPRKFLHSGKLYKA
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pF1KA1 KSNKELHGFLFNDFLLLTYMVKQFAVSSGSEKLFSSKSNAQFKMYKTPIFLNEVLVKLPT
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NP_001 KSNKELYGFLFNDFLLLTQITKPLG-SSGTDKVFSPKSNLQYKMYKTPIFLNEVLVKLPT
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pF1KA1 DPSSDEPVFHISHIDRVYTLRTDNINERTAWVQKIKAASEQYIDTEKKQREKAYQARSQK
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NP_001 DPSGDEPIFHISHIDRVYTLRAESINERTAWVQKIKAASELYIETEKKKREKAYLVRSQR
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pF1KA1 TSGIGRLMVHVIEATELKACKPNGKSNPYCEISMGSQSYTTRTIQDTLNPKWNFNCQFFI
       ..:::::::.:.:. ::: :. .::::::::..:::: . :.::::::::::: ::::::
NP_001 ATGIGRLMVNVVEGIELKPCRSHGKSNPYCEVTMGSQCHITKTIQDTLNPKWNSNCQFFI
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1670 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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