Result of FASTA (omim) for pF1KA1198
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA1198, 529 aa
  1>>>pF1KA1198 529 - 529 aa - 529 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3001+/-0.000732; mu= 22.8499+/- 0.046
 mean_var=358.1330+/-70.334, 0's: 0 Z-trim(111.7): 2026  B-trim: 121 in 1/56
 Lambda= 0.067772
 statistics sampled from 18103 (20402) to 18103 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.568), E-opt: 0.2 (0.239), width:  16
 Scan time:  7.070

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_001190179 (OMIM: 194557) zinc finger protein 20 ( 529) 1934 204.6 6.1e-52
NP_066966 (OMIM: 194557) zinc finger protein 20 is ( 532) 1934 204.6 6.1e-52
NP_660338 (OMIM: 612248) zinc finger protein 627 i ( 461) 1865 197.7 6.2e-50
XP_006722936 (OMIM: 194543) PREDICTED: zinc finger ( 569) 1833 194.8 5.9e-49
XP_016881628 (OMIM: 606697) PREDICTED: zinc finger ( 685) 1817 193.4 1.9e-48
XP_011525925 (OMIM: 606697) PREDICTED: zinc finger ( 718) 1817 193.4 1.9e-48
NP_005806 (OMIM: 606697) zinc finger protein 443 [ ( 671) 1815 193.2 2.1e-48
XP_016881629 (OMIM: 606697) PREDICTED: zinc finger ( 673) 1815 193.2 2.1e-48
NP_057348 (OMIM: 194542) zinc finger protein 44 is ( 615) 1784 190.1 1.7e-47
XP_011526366 (OMIM: 194542) PREDICTED: zinc finger ( 616) 1784 190.1 1.7e-47
XP_011526364 (OMIM: 194542) PREDICTED: zinc finger ( 653) 1784 190.1 1.7e-47
NP_001157748 (OMIM: 194542) zinc finger protein 44 ( 663) 1784 190.1 1.7e-47
XP_011526082 (OMIM: 612248) PREDICTED: zinc finger ( 429) 1685 180.1 1.2e-44
NP_001277012 (OMIM: 612248) zinc finger protein 62 ( 429) 1685 180.1 1.2e-44
XP_011525924 (OMIM: 606697) PREDICTED: zinc finger ( 639) 1663 178.3 6.2e-44
NP_066358 (OMIM: 194556) zinc finger protein 14 [H ( 642) 1640 176.0 2.9e-43
XP_016882359 (OMIM: 194542) PREDICTED: zinc finger ( 583) 1621 174.1   1e-42
XP_016882732 (OMIM: 604078) PREDICTED: zinc finger ( 474) 1573 169.2 2.5e-41
XP_011526571 (OMIM: 604078) PREDICTED: zinc finger ( 508) 1573 169.3 2.5e-41
NP_003428 (OMIM: 604078) zinc finger protein 136 [ ( 540) 1573 169.3 2.6e-41
XP_011526368 (OMIM: 194542) PREDICTED: zinc finger ( 571) 1565 168.6 4.6e-41
NP_149981 (OMIM: 603983) zinc finger protein 101 i ( 436) 1522 164.1 7.6e-40
NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 616) 1502 162.5 3.3e-39
XP_016882731 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 621) 1502 162.5 3.4e-39
XP_016882730 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 628) 1502 162.5 3.4e-39
XP_016882729 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 658) 1502 162.6 3.4e-39
NP_001276330 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 658) 1502 162.6 3.4e-39
XP_006723426 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1502 162.6 3.5e-39
NP_003427 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 670) 1502 162.6 3.5e-39
XP_005259268 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1502 162.6 3.5e-39
XP_006723425 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1502 162.6 3.5e-39
NP_009065 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 682) 1502 162.6 3.5e-39
NP_940937 (OMIM: 609571) zinc finger protein 699 [ ( 642) 1498 162.2 4.5e-39
XP_016878355 (OMIM: 604752) PREDICTED: zinc finger ( 487) 1479 160.0 1.5e-38
XP_016878354 (OMIM: 604752) PREDICTED: zinc finger ( 711) 1479 160.4 1.7e-38
NP_001252517 (OMIM: 604752) zinc finger protein 26 ( 711) 1463 158.8   5e-38
NP_003405 (OMIM: 604752) zinc finger protein 267 i ( 743) 1463 158.9   5e-38
NP_067040 (OMIM: 194551) zinc finger protein 77 [H ( 545) 1460 158.3 5.5e-38
XP_016882571 (OMIM: 194551) PREDICTED: zinc finger ( 365) 1451 157.0 8.8e-38
XP_016882570 (OMIM: 194551) PREDICTED: zinc finger ( 365) 1451 157.0 8.8e-38
NP_112495 (OMIM: 603975) zinc finger protein 93 [H ( 620) 1450 157.4 1.1e-37
NP_001177720 (OMIM: 613864) zinc finger protein 31 ( 563) 1433 155.7 3.5e-37
NP_001304845 (OMIM: 616290) zinc finger protein 65 (1059) 1433 156.3 4.4e-37
XP_005272572 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 1433 156.3 4.4e-37
NP_149350 (OMIM: 616290) zinc finger protein 658 [ (1059) 1433 156.3 4.4e-37
XP_016870103 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 1433 156.3 4.4e-37
XP_011543981 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 1433 156.3 4.4e-37
NP_001277013 (OMIM: 612248) zinc finger protein 62 ( 351) 1427 154.7 4.4e-37
NP_001277014 (OMIM: 612248) zinc finger protein 62 ( 351) 1427 154.7 4.4e-37
NP_003437 (OMIM: 300024) zinc finger protein 157 [ ( 506) 1427 155.0   5e-37


>>NP_001190179 (OMIM: 194557) zinc finger protein 20 iso  (529 aa)
 initn: 1649 init1: 1649 opt: 1934  Z-score: 1053.5  bits: 204.6 E(85289): 6.1e-52
Smith-Waterman score: 1934; 55.6% identity (77.9% similar) in 475 aa overlap (55-529:2-475)

           30        40        50        60        70        80    
pF1KA1 SSQGRTGTGGSDVLQMQNSEHHGQSIKTQTDSISLEDVAVNFTLEEWALLDPGQRNIYRD
                                     ::...:::::.:: ::::::::.:.:.:::
NP_001                              MDSVAFEDVAVSFTQEEWALLDPSQKNLYRD
                                            10        20        30 

           90       100       110       120       130       140    
pF1KA1 VMRATFKNLACIGEKWKDQDIEDEHKNQGRNLRSPMVEALCENKEDCPCGKSTSQIPDLN
       ::. :::::. .:. :: :.::::.::  ::: : : : :::.::.  ::.: .:: :  
NP_001 VMQETFKNLTSVGKTWKVQNIEDEYKNPRRNL-SLMREKLCESKESHHCGESFNQIADDM
              40        50        60         70        80        90

          150       160       170       180       190       200    
pF1KA1 TNLETPTGLKPCDCSVCGEVFMHQVSLNRHMRSHTEQKPNECHEYGEKPHKCKECGKTFT
        : .:  :. ::. ::::::   . ::: :.:. : .: .: .::::.:.. ::: :.:.
NP_001 LNRKTLPGITPCESSVCGEVGTGHSSLNTHIRADTGHKSSEYQEYGENPYRNKECKKAFS
              100       110       120       130       140       150

          210       220       230       240       250       260    
pF1KA1 RSSSIRTHERIHTGEKPYECKECGKAFAFLFSFRNHIRIHTGETPYECKECGKAFRYLTA
         .:...:..  : ::::. ::: ..:     .. :  .:.:. ::.:: ::::: .:. 
NP_001 YLDSFQSHDKACTKEKPYDGKECTETFISHSCIQRHRVMHSGDGPYKCKFCGKAFYFLNL
              160       170       180       190       200       210

          270       280       290       300       310       320    
pF1KA1 LRRHEKNHTGEKPYKCKQCGKAFIYYQPFLTHERTHTGEKPYECKQCGKAFSCPTYLRSH
          ::. ::: ::::::::::::     . .::::::: .  :::.::.::: :. .: :
NP_001 CLIHERIHTGVKPYKCKQCGKAFTRSTTLPVHERTHTGVNADECKECGNAFSFPSEIRRH
              220       230       240       250       260       270

          330       340       350       360       370       380    
pF1KA1 EKTHTGEKPFVCRECGRAFFSHSSLRKHVKTHTGVQPYTCKKCGEAFKSSSSCEVHERTH
       ...::::::. :..::..:.: ::.. :  :::: .:: ::.::.::. .:  . : :::
NP_001 KRSHTGEKPYECKQCGKVFISFSSIQYHKMTHTGEKPYECKQCGKAFRCGSHLQKHGRTH
              280       290       300       310       320       330

          390       400       410       420       430       440    
pF1KA1 FGEKPYECKQCGKAFNSSSYLQLHERVHTGEKTYECKECGKAFLYSTHFRIHERTHTREK
        :::::::.::::::  .: :: ::..:: .: : ::.:::.:  .....::::::. ::
NP_001 TGEKPYECRQCGKAFRCTSDLQRHEKTHTEDKPYGCKQCGKGFRCASQLQIHERTHSGEK
              340       350       360       370       380       390

          450       460       470       480       490       500    
pF1KA1 PYECKQCGRVFIYFSHLRRHERSHTGVKPCECKQCGKAFTCLNSLKVHKRIHTGERPFQC
       :.:::.::.:: ::: :: :::.::: :: :::::::::  ..::..:.: :::..:..:
NP_001 PHECKECGKVFKYFSSLRIHERTHTGEKPHECKQCGKAFRYFSSLHIHERTHTGDKPYEC
              400       410       420       430       440       450

          510       520                                            
pF1KA1 RQCGKAFSYSKSLHVHERTHSRQKP                                   
       . :::::. :.:.. :::::. .::                                   
NP_001 KVCGKAFTCSSSIRYHERTHTGEKPYECKHCGKAFISNYIRYHERTHTGEKPYQCKQCGK
              460       470       480       490       500       510

>>NP_066966 (OMIM: 194557) zinc finger protein 20 isofor  (532 aa)
 initn: 1649 init1: 1649 opt: 1934  Z-score: 1053.5  bits: 204.6 E(85289): 6.1e-52
Smith-Waterman score: 1934; 55.6% identity (77.9% similar) in 475 aa overlap (55-529:5-478)

           30        40        50        60        70        80    
pF1KA1 SSQGRTGTGGSDVLQMQNSEHHGQSIKTQTDSISLEDVAVNFTLEEWALLDPGQRNIYRD
                                     ::...:::::.:: ::::::::.:.:.:::
NP_066                           MMFQDSVAFEDVAVSFTQEEWALLDPSQKNLYRD
                                         10        20        30    

           90       100       110       120       130       140    
pF1KA1 VMRATFKNLACIGEKWKDQDIEDEHKNQGRNLRSPMVEALCENKEDCPCGKSTSQIPDLN
       ::. :::::. .:. :: :.::::.::  ::: : : : :::.::.  ::.: .:: :  
NP_066 VMQETFKNLTSVGKTWKVQNIEDEYKNPRRNL-SLMREKLCESKESHHCGESFNQIADDM
           40        50        60         70        80        90   

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pF1KA1 TNLETPTGLKPCDCSVCGEVFMHQVSLNRHMRSHTEQKPNECHEYGEKPHKCKECGKTFT
        : .:  :. ::. ::::::   . ::: :.:. : .: .: .::::.:.. ::: :.:.
NP_066 LNRKTLPGITPCESSVCGEVGTGHSSLNTHIRADTGHKSSEYQEYGENPYRNKECKKAFS
           100       110       120       130       140       150   

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pF1KA1 RSSSIRTHERIHTGEKPYECKECGKAFAFLFSFRNHIRIHTGETPYECKECGKAFRYLTA
         .:...:..  : ::::. ::: ..:     .. :  .:.:. ::.:: ::::: .:. 
NP_066 YLDSFQSHDKACTKEKPYDGKECTETFISHSCIQRHRVMHSGDGPYKCKFCGKAFYFLNL
           160       170       180       190       200       210   

          270       280       290       300       310       320    
pF1KA1 LRRHEKNHTGEKPYKCKQCGKAFIYYQPFLTHERTHTGEKPYECKQCGKAFSCPTYLRSH
          ::. ::: ::::::::::::     . .::::::: .  :::.::.::: :. .: :
NP_066 CLIHERIHTGVKPYKCKQCGKAFTRSTTLPVHERTHTGVNADECKECGNAFSFPSEIRRH
           220       230       240       250       260       270   

          330       340       350       360       370       380    
pF1KA1 EKTHTGEKPFVCRECGRAFFSHSSLRKHVKTHTGVQPYTCKKCGEAFKSSSSCEVHERTH
       ...::::::. :..::..:.: ::.. :  :::: .:: ::.::.::. .:  . : :::
NP_066 KRSHTGEKPYECKQCGKVFISFSSIQYHKMTHTGEKPYECKQCGKAFRCGSHLQKHGRTH
           280       290       300       310       320       330   

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pF1KA1 FGEKPYECKQCGKAFNSSSYLQLHERVHTGEKTYECKECGKAFLYSTHFRIHERTHTREK
        :::::::.::::::  .: :: ::..:: .: : ::.:::.:  .....::::::. ::
NP_066 TGEKPYECRQCGKAFRCTSDLQRHEKTHTEDKPYGCKQCGKGFRCASQLQIHERTHSGEK
           340       350       360       370       380       390   

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pF1KA1 PYECKQCGRVFIYFSHLRRHERSHTGVKPCECKQCGKAFTCLNSLKVHKRIHTGERPFQC
       :.:::.::.:: ::: :: :::.::: :: :::::::::  ..::..:.: :::..:..:
NP_066 PHECKECGKVFKYFSSLRIHERTHTGEKPHECKQCGKAFRYFSSLHIHERTHTGDKPYEC
           400       410       420       430       440       450   

          510       520                                            
pF1KA1 RQCGKAFSYSKSLHVHERTHSRQKP                                   
       . :::::. :.:.. :::::. .::                                   
NP_066 KVCGKAFTCSSSIRYHERTHTGEKPYECKHCGKAFISNYIRYHERTHTGEKPYQCKQCGK
           460       470       480       490       500       510   

>>NP_660338 (OMIM: 612248) zinc finger protein 627 isofo  (461 aa)
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pF1KA1 SSQGRTGTGGSDVLQMQNSEHHGQSIKTQTDSISLEDVAVNFTLEEWALLDPGQRNIYRD
                                     ::...:::::::::::::::::.:.:.:::
NP_660                              MDSVAFEDVAVNFTLEEWALLDPSQKNLYRD
                                            10        20        30 

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pF1KA1 VMRATFKNLACIGEKWKDQDIEDEHKNQGRNLRSPMVEALCENKEDCPCGKSTSQIPDLN
       ::: ::.::: .:..:.::.:::  :   ::. : . : :::.::     .. :::::  
NP_660 VMRETFRNLASVGKQWEDQNIEDPFKIPRRNI-SHIPERLCESKEGGQGEETFSQIPDGI
              40        50        60         70        80        90

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pF1KA1 TNLETPTGLKPCDCSVCGEVFMHQVSLNRHMRSHTEQKPNECHEYGEKPHKCKECGKTFT
        : .:: :.:::. :::::: :   :::::.:.:: ..::: .:::.: .  ..::....
NP_660 LNKKTP-GVKPCESSVCGEVGMGPSSLNRHIRDHTGREPNEYQEYGKKSYTRNQCGRALS
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          :. ..:: : : :::.:::::..:  : :.: :.  : : .::.:: ::::: : . 
NP_660 YHRSFPVRERTHPGGKPYDCKECGETFISLVSIRRHMLTHRGGVPYKCKVCGKAFDYPSL
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pF1KA1 LRRHEKNHTGEKPYKCKQCGKAFIYYQPFLTHERTHTGEKPYECKQCGKAFSCPTYLRSH
       .: ::..:::::::.::::::::   . .  :::::::.::::::::::::::  :.: :
NP_660 FRIHERSHTGEKPYECKQCGKAFSCSSYIRIHERTHTGDKPYECKQCGKAFSCSKYIRIH
     210       220       230       240       250       260         

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pF1KA1 EKTHTGEKPFVCRECGRAFFSHSSLRKHVKTHTGVQPYTCKKCGEAFKSSSSCEVHERTH
       :.:::::::. :..::.::   ::.:.: .:::: . . ::.::.:.   .: . :   :
NP_660 ERTHTGEKPYECKQCGKAFRCASSVRSHERTHTGEKLFECKECGKALTCLASVRRHMIKH
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pF1KA1 FGEKPYECKQCGKAFNSSSYLQLHERVHTGEKTYECKECGKAFLYSTHFRIHERTHTREK
        :. ::.:: :::::.  : ...:::.::::: :.::.:::::  :. :: ::: :: ::
NP_660 TGNGPYKCKVCGKAFDFPSSFRIHERTHTGEKPYDCKQCGKAFSCSSSFRKHERIHTGEK
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pF1KA1 PYECKQCGRVFIYFSHLRRHERSHTGVKPCECKQCGKAFTCLNSLKVHKRIHTGERPFQC
       ::.: .::..:   :..: :::.::: :: :::::::::.  . ..::..:::::.:.. 
NP_660 PYKCTKCGKAFSRSSYFRIHERTHTGEKPYECKQCGKAFSRSTYFRVHEKIHTGEKPYEN
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          510       520         
pF1KA1 RQCGKAFSYSKSLHVHERTHSRQKP
                                
NP_660 PNPNASVVPVLS             
     450       460              

>>XP_006722936 (OMIM: 194543) PREDICTED: zinc finger pro  (569 aa)
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pF1KA1 SSQGRTGTGGSDVLQMQNSEHHGQSIKTQTDSISLEDVAVNFTLEEWALLDPGQRNIYRD
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XP_006       MPCCSHRRCREDPGTSESQEMMFQDPVAFDDVAVNFTQEEWALLDISQRKLYKE
                     10        20        30        40        50    

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pF1KA1 VMRATFKNLACIGEKWKDQDIEDEHKNQGRNLRSPMVEALCENKEDCPCGKSTSQIPDLN
       ::  ::.::. .:..::::.:: :..:  ::.:: . . . : :.:  ::.. .:.::  
XP_006 VMLETFRNLTSVGKSWKDQNIEYEYQNPRRNFRSLIEKKVNEIKDDSHCGETFTQVPDDR
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pF1KA1 TNLETPTG---LKPCDCSVCGEVFMHQVSLNRHMRSHTEQKPNECHEYG-----------
        :..   .   .: ::  ::::: . . :.: ..:.   .:  : .:::           
XP_006 LNFQEKKASPEIKSCDSFVCGEVGLGNSSFNMNIRGDIGHKAYEYQEYGPKPCKCQQPKK
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pF1KA1 -----------------EKPHKCKECGKTFTRSSSIRTHERIHTGEKPYECKECGKAFAF
                        :::. ::::::::   :::. :  .:.:. ::.:: :::::  
XP_006 AFRYHPSFRTPQRDHTGEKPYACKECGKTFISHSSIQRHVVMHSGDGPYKCKFCGKAFHC
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pF1KA1 LFSFRNHIRIHTGETPYECKECGKAFRYLTALRRHEKNHTGEKPYKCKQCGKAFIYYQPF
       :  .  : :::::: :::::.:::.: : ..:: ::..:::::::.:.::::::   . .
XP_006 LSLYLIHERIHTGEKPYECKQCGKSFSYSATLRIHERTHTGEKPYECQQCGKAFHSPRCY
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pF1KA1 LTHERTHTGEKPYECKQCGKAFSCPTYLRSHEKTHTGEKPFVCRECGRAFFSHSSLRKHV
         ::: ::::: :.::.:::::.:: :.: ::.::. .::. : .::.:. : .:.. :.
XP_006 RRHERIHTGEKAYQCKECGKAFTCPQYVRIHERTHSRKKPYECTQCGKALSSLTSFQTHI
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pF1KA1 KTHTGVQPYTCKKCGEAFKSSSSCEVHERTHFGEKPYECKQCGKAFNSSSYLQLHERVHT
       . :.: .:: :: ::..: :..: . ::.:: :::::.::::::::  :: :. :::.::
XP_006 RMHSGERPYECKICGKGFCSANSFQRHEKTHSGEKPYKCKQCGKAFIHSSSLRYHERIHT
          360       370       380       390       400       410    

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pF1KA1 GEKTYECKECGKAFLYSTHFRIHERTHTREKPYECKQCGRVFIYFSHLRRHERS------
       ::: ::::.:::::  :.:...: :::: ::::::..::..:  ...:. :::.      
XP_006 GEKPYECKQCGKAFRSSSHLQLHGRTHTGEKPYECQECGKAFRSMKNLQSHERTQTHVRI
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pF1KA1 HTGVKPCECKQCGKAFTCLNSLKVHKRIHTGERPFQCRQCGKAFSYSKSLHVHERTHSRQ
       :.: .: .:: :::.: : .::. :.. ::::. ..:.:::.::: :.:.. :::::.  
XP_006 HSGERPYKCKLCGKGFYCPKSLQRHEKTHTGEKLYECKQCGEAFSSSSSFRYHERTHTGE
          480       490       500       510       520       530    

                                          
pF1KA1 KP                                 
                                          
XP_006 KPYKCKQCGKAFRAASVLRMHGRTHPEDKPYECKQ
          540       550       560         

>>XP_016881628 (OMIM: 606697) PREDICTED: zinc finger pro  (685 aa)
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           20        30        40        50             60         
pF1KA1 LEEQVQSKWSSSQGRTGTGGSDVLQMQNSEHHGQSIKTQTD-----SISLEDVAVNFTLE
                                     ::.:    . .     :..::::::::: :
XP_016 CHVAQTGLKLLSSSDPPASASQNTGIIGVSHHAQPKTLNLEEHCKASVALEDVAVNFTRE
            10        20        30        40        50        60   

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pF1KA1 EWALLDPGQRNIYRDVMRATFKNLACIGEKWKDQDIEDEHKNQGRNLRSPMVEALCENKE
       ::::: : :.:.:.:::. :..:: :.  :::::.:::...   .:::  :.: . :.:.
XP_016 EWALLGPCQKNLYKDVMQETIRNLDCVVMKWKDQNIEDQYRYPRKNLRCRMLERFVESKD
            70        80        90       100       110       120   

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pF1KA1 DCPCGKSTSQIPDLNTNLETPTGLKPCDCSVCGEVFMHQVSLNRHMRSHTEQKPNECHEY
          ::...::: :  .. .:  :. ::. :. ::  : . ::: ..:  . .::.: :: 
XP_016 GTQCGETSSQIQDSIVTKNTLPGVGPCESSMRGEKVMGHSSLNCYIRVGAGHKPHEYHEC
           130       140       150       160       170       180   

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pF1KA1 GEKPHKCKECGKTFTRSSSIRTHERIHTGEKPYECKECGKAFAFLFSFRNHIRIHTGETP
       ::::   :. ::.:.  .:..::::.:::.:::.::::::.:. : ... :. .. :. :
XP_016 GEKPDTHKQRGKAFSYHNSFQTHERLHTGKKPYDCKECGKSFSSLGNLQRHMAVQRGDGP
           190       200       210       220       230       240   

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pF1KA1 YECKECGKAFRYLTALRRHEKNHTGEKPYKCKQCGKAFIYYQPFLTHERTHTGEKPYECK
       :.:: ::::: . . :. ::..:::::::.::::.::: .:. .: ::::::::::::::
XP_016 YKCKLCGKAFFWPSLLHMHERTHTGEKPYECKQCSKAFSFYSSYLRHERTHTGEKPYECK
           250       260       270       280       290       300   

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pF1KA1 QCGKAFSC-PTYLRSHEKTHTGEKPFVCRECGRAFFSHSSLRKHVKTHTGVQPYTCKKCG
       ::.:::    .::: ::.:::::::. :..:..:: . ::   : .:::: .:::::.::
XP_016 QCSKAFPFYSSYLR-HERTHTGEKPYKCKQCSKAFPDSSSCLIHERTHTGEKPYTCKQCG
           310        320       330       340       350       360  

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pF1KA1 EAFKSSSSCEVHERTHFGEKPYECKQCGKAFNSSSYLQLHERVHTGEKTYECKECGKAFL
       .::. :.: . :: :: .:::: :.::::::.  . .: :   :::.  ..:: :::.: 
XP_016 KAFSVSGSLQRHETTHSAEKPYACQQCGKAFHHLGSFQRHMIRHTGNGPHKCKICGKGFD
            370       380       390       400       410       420  

      430       440       450       460       470       480        
pF1KA1 YSTHFRIHERTHTREKPYECKQCGRVFIYFSHLRRHERSHTGVKPCECKQCGKAFTCLNS
         . .. :::::: ::::::::::... . : .: :   :::  : .:: :::::.  . 
XP_016 CPSSLQSHERTHTGEKPYECKQCGKALSHRSSFRSHMIMHTGDGPHKCKVCGKAFVYPSV
            430       440       450       460       470       480  

      490       500       510       520                            
pF1KA1 LKVHKRIHTGERPFQCRQCGKAFSYSKSLHVHERTHSRQKP                   
       .. :.: ::.:.:..:.:::::.  :.::. :: ::. .::                   
XP_016 FQRHERTHTAEKPYKCKQCGKAYRISSSLRRHETTHTGEKPYKCKLGKACIDFCSFQNHK
            490       500       510       520       530       540  

XP_016 TTHTGEKPYECKECGKAFSRFRYLSRHKRTHTGEKPYECKTCRKAFGHYDNLKVHERIHS
            550       560       570       580       590       600  

>--
 initn: 673 init1: 673 opt: 686  Z-score: 393.3  bits: 82.8 E(85289): 3.6e-15
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           170       180       190       200       210       220   
pF1KA1 VFMHQVSLNRHMRSHTEQKPNECHEYGEKPHKCKECGKTFTRSSSIRTHERIHTGEKPYE
                                     .:::  ::.     :...:.  ::::::::
XP_016 KPYKCKQCGKAYRISSSLRRHETTHTGEKPYKCK-LGKACIDFCSFQNHKTTHTGEKPYE
           500       510       520        530       540       550  

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pF1KA1 CKECGKAFAFLFSFRNHIRIHTGETPYECKECGKAFRYLTALRRHEKNHTGEKPYKCKQC
       ::::::::. .  .  : : :::: ::::: : ::: .   :. ::. :.:::::.::.:
XP_016 CKECGKAFSRFRYLSRHKRTHTGEKPYECKTCRKAFGHYDNLKVHERIHSGEKPYECKEC
            560       570       580       590       600       610  

           290       300       310       320       330       340   
pF1KA1 GKAFIYYQPFLTHERTHTGEKPYECKQCGKAFSCPTYLRSHEKTHTGEKPFVCRECGRAF
       :::: .   :: ::: :  :: ::: ::::::.   .:..::::::::.:. :.:::.::
XP_016 GKAFSWLTCFLRHERIHMREKSYECPQCGKAFTHSRFLQGHEKTHTGENPYECKECGKAF
            620       630       640       650       660       670  

           350       360       370       380       390       400   
pF1KA1 FSHSSLRKHVKTHTGVQPYTCKKCGEAFKSSSSCEVHERTHFGEKPYECKQCGKAFNSSS
        : :::..: :::                                               
XP_016 ASLSSLHRHKKTH                                               
            680                                                    

>>XP_011525925 (OMIM: 606697) PREDICTED: zinc finger pro  (718 aa)
 initn: 1810 init1: 1810 opt: 1817  Z-score: 990.8  bits: 193.4 E(85289): 1.9e-48
Smith-Waterman score: 1817; 51.9% identity (75.2% similar) in 491 aa overlap (45-529:34-523)

           20        30        40        50             60         
pF1KA1 LEEQVQSKWSSSQGRTGTGGSDVLQMQNSEHHGQSIKTQTD-----SISLEDVAVNFTLE
                                     ::.:    . .     :..::::::::: :
XP_011 CHVAQTGLKLLSSSDPPASASQNTGIIGVSHHAQPKTLNLEEHCKASVALEDVAVNFTRE
            10        20        30        40        50        60   

      70        80        90       100       110       120         
pF1KA1 EWALLDPGQRNIYRDVMRATFKNLACIGEKWKDQDIEDEHKNQGRNLRSPMVEALCENKE
       ::::: : :.:.:.:::. :..:: :.  :::::.:::...   .:::  :.: . :.:.
XP_011 EWALLGPCQKNLYKDVMQETIRNLDCVVMKWKDQNIEDQYRYPRKNLRCRMLERFVESKD
            70        80        90       100       110       120   

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pF1KA1 DCPCGKSTSQIPDLNTNLETPTGLKPCDCSVCGEVFMHQVSLNRHMRSHTEQKPNECHEY
          ::...::: :  .. .:  :. ::. :. ::  : . ::: ..:  . .::.: :: 
XP_011 GTQCGETSSQIQDSIVTKNTLPGVGPCESSMRGEKVMGHSSLNCYIRVGAGHKPHEYHEC
           130       140       150       160       170       180   

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pF1KA1 GEKPHKCKECGKTFTRSSSIRTHERIHTGEKPYECKECGKAFAFLFSFRNHIRIHTGETP
       ::::   :. ::.:.  .:..::::.:::.:::.::::::.:. : ... :. .. :. :
XP_011 GEKPDTHKQRGKAFSYHNSFQTHERLHTGKKPYDCKECGKSFSSLGNLQRHMAVQRGDGP
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pF1KA1 YECKECGKAFRYLTALRRHEKNHTGEKPYKCKQCGKAFIYYQPFLTHERTHTGEKPYECK
       :.:: ::::: . . :. ::..:::::::.::::.::: .:. .: ::::::::::::::
XP_011 YKCKLCGKAFFWPSLLHMHERTHTGEKPYECKQCSKAFSFYSSYLRHERTHTGEKPYECK
           250       260       270       280       290       300   

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pF1KA1 QCGKAFSC-PTYLRSHEKTHTGEKPFVCRECGRAFFSHSSLRKHVKTHTGVQPYTCKKCG
       ::.:::    .::: ::.:::::::. :..:..:: . ::   : .:::: .:::::.::
XP_011 QCSKAFPFYSSYLR-HERTHTGEKPYKCKQCSKAFPDSSSCLIHERTHTGEKPYTCKQCG
           310        320       330       340       350       360  

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pF1KA1 EAFKSSSSCEVHERTHFGEKPYECKQCGKAFNSSSYLQLHERVHTGEKTYECKECGKAFL
       .::. :.: . :: :: .:::: :.::::::.  . .: :   :::.  ..:: :::.: 
XP_011 KAFSVSGSLQRHETTHSAEKPYACQQCGKAFHHLGSFQRHMIRHTGNGPHKCKICGKGFD
            370       380       390       400       410       420  

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pF1KA1 YSTHFRIHERTHTREKPYECKQCGRVFIYFSHLRRHERSHTGVKPCECKQCGKAFTCLNS
         . .. :::::: ::::::::::... . : .: :   :::  : .:: :::::.  . 
XP_011 CPSSLQSHERTHTGEKPYECKQCGKALSHRSSFRSHMIMHTGDGPHKCKVCGKAFVYPSV
            430       440       450       460       470       480  

      490       500       510       520                            
pF1KA1 LKVHKRIHTGERPFQCRQCGKAFSYSKSLHVHERTHSRQKP                   
       .. :.: ::.:.:..:.:::::.  :.::. :: ::. .::                   
XP_011 FQRHERTHTAEKPYKCKQCGKAYRISSSLRRHETTHTGEKPYKCKLGKACIDFCSFQNHK
            490       500       510       520       530       540  

XP_011 TTHTGEKPYECKECGKAFSRFRYLSRHKRTHTGEKPYECKTCRKAFGHYDNLKVHERIHS
            550       560       570       580       590       600  

>--
 initn: 2517 init1: 673 opt: 783  Z-score: 444.4  bits: 92.3 E(85289): 5.1e-18
Smith-Waterman score: 783; 56.6% identity (73.0% similar) in 196 aa overlap (194-384:524-718)

           170       180       190       200       210       220   
pF1KA1 VFMHQVSLNRHMRSHTEQKPNECHEYGEKPHKCKECGKTFTRSSSIRTHERIHTGEKPYE
                                     .:::  ::.     :...:.  ::::::::
XP_011 KPYKCKQCGKAYRISSSLRRHETTHTGEKPYKCK-LGKACIDFCSFQNHKTTHTGEKPYE
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pF1KA1 CKECGKAFAFLFSFRNHIRIHTGETPYECKECGKAFRYLTALRRHEKNHTGEKPYKCKQC
       ::::::::. .  .  : : :::: ::::: : ::: .   :. ::. :.:::::.::.:
XP_011 CKECGKAFSRFRYLSRHKRTHTGEKPYECKTCRKAFGHYDNLKVHERIHSGEKPYECKEC
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pF1KA1 GKAFIYYQPFLTHERTHTGEKPYECKQCGKAFSCPTYLRSHEKTHTGEKPFVCRECGRAF
       :::: .   :: ::: :  :: ::: ::::::.   .:..::::::::.:. :.:::.::
XP_011 GKAFSWLTCFLRHERIHMREKSYECPQCGKAFTHSRFLQGHEKTHTGENPYECKECGKAF
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pF1KA1 FSHSSLRKHVKTH-----TGVQPYTCKKCGEAFKSSSSCEVHERTHFGEKPYECKQCGKA
        : :::..: :::     :: .:: ::.::.:: : :: . :..::              
XP_011 ASLSSLHRHKKTHWKKTHTGENPYECKECGKAFASLSSLHRHKKTH              
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pF1KA1 FNSSSYLQLHERVHTGEKTYECKECGKAFLYSTHFRIHERTHTREKPYECKQCGRVFIYF

>>NP_005806 (OMIM: 606697) zinc finger protein 443 [Homo  (671 aa)
 initn: 1810 init1: 1810 opt: 1815  Z-score: 989.9  bits: 193.2 E(85289): 2.1e-48
Smith-Waterman score: 1815; 53.1% identity (76.4% similar) in 475 aa overlap (56-529:3-476)

          30        40        50        60        70        80     
pF1KA1 SQGRTGTGGSDVLQMQNSEHHGQSIKTQTDSISLEDVAVNFTLEEWALLDPGQRNIYRDV
                                     :..::::::::: :::::: : :.:.:.::
NP_005                             MASVALEDVAVNFTREEWALLGPCQKNLYKDV
                                           10        20        30  

          90       100       110       120       130       140     
pF1KA1 MRATFKNLACIGEKWKDQDIEDEHKNQGRNLRSPMVEALCENKEDCPCGKSTSQIPDLNT
       :. :..:: :.  :::::.:::...   .:::  :.: . :.:.   ::...::: :  .
NP_005 MQETIRNLDCVVMKWKDQNIEDQYRYPRKNLRCRMLERFVESKDGTQCGETSSQIQDSIV
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pF1KA1 NLETPTGLKPCDCSVCGEVFMHQVSLNRHMRSHTEQKPNECHEYGEKPHKCKECGKTFTR
       . .:  :. ::. :. ::  : . ::: ..:  . .::.: :: ::::   :. ::.:. 
NP_005 TKNTLPGVGPCESSMRGEKVMGHSSLNCYIRVGAGHKPHEYHECGEKPDTHKQRGKAFSY
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pF1KA1 SSSIRTHERIHTGEKPYECKECGKAFAFLFSFRNHIRIHTGETPYECKECGKAFRYLTAL
        .:..::::.:::.:::.::::::.:. : ... :. .. :. ::.:: ::::: . . :
NP_005 HNSFQTHERLHTGKKPYDCKECGKSFSSLGNLQRHMAVQRGDGPYKCKLCGKAFFWPSLL
            160       170       180       190       200       210  

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pF1KA1 RRHEKNHTGEKPYKCKQCGKAFIYYQPFLTHERTHTGEKPYECKQCGKAFSC-PTYLRSH
       . ::..:::::::.::::.::: .:. .: ::::::::::::::::.:::    .::: :
NP_005 HMHERTHTGEKPYECKQCSKAFSFYSSYLRHERTHTGEKPYECKQCSKAFPFYSSYLR-H
            220       230       240       250       260       270  

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pF1KA1 EKTHTGEKPFVCRECGRAFFSHSSLRKHVKTHTGVQPYTCKKCGEAFKSSSSCEVHERTH
       :.:::::::. :..:..:: . ::   : .:::: .:::::.::.::. :.: . :: ::
NP_005 ERTHTGEKPYKCKQCSKAFPDSSSCLIHERTHTGEKPYTCKQCGKAFSVSGSLQRHETTH
             280       290       300       310       320       330 

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pF1KA1 FGEKPYECKQCGKAFNSSSYLQLHERVHTGEKTYECKECGKAFLYSTHFRIHERTHTREK
        .:::: :.::::::.  . .: :   :::.  ..:: :::.:   . .. :::::: ::
NP_005 SAEKPYACQQCGKAFHHLGSFQRHMIRHTGNGPHKCKICGKGFDCPSSLQSHERTHTGEK
             340       350       360       370       380       390 

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pF1KA1 PYECKQCGRVFIYFSHLRRHERSHTGVKPCECKQCGKAFTCLNSLKVHKRIHTGERPFQC
       ::::::::... . : .: :   :::  : .:: :::::.  . .. :.: ::.:.:..:
NP_005 PYECKQCGKALSHRSSFRSHMIMHTGDGPHKCKVCGKAFVYPSVFQRHERTHTAEKPYKC
             400       410       420       430       440       450 

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pF1KA1 RQCGKAFSYSKSLHVHERTHSRQKP                                   
       .:::::.  :.::. :: ::. .::                                   
NP_005 KQCGKAYRISSSLRRHETTHTGEKPYKCKLGKAFIDFCSFQNHKTTHTGEKPYECKECGK
             460       470       480       490       500       510 

>--
 initn: 1950 init1: 683 opt: 793  Z-score: 449.9  bits: 93.3 E(85289): 2.5e-18
Smith-Waterman score: 793; 57.1% identity (73.5% similar) in 196 aa overlap (194-384:477-671)

           170       180       190       200       210       220   
pF1KA1 VFMHQVSLNRHMRSHTEQKPNECHEYGEKPHKCKECGKTFTRSSSIRTHERIHTGEKPYE
                                     .:::  ::.:    :...:.  ::::::::
NP_005 KPYKCKQCGKAYRISSSLRRHETTHTGEKPYKCK-LGKAFIDFCSFQNHKTTHTGEKPYE
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pF1KA1 CKECGKAFAFLFSFRNHIRIHTGETPYECKECGKAFRYLTALRRHEKNHTGEKPYKCKQC
       ::::::::. .  .  : : :::: ::::: : ::: .   :. ::. :.:::::.::.:
NP_005 CKECGKAFSRFRYLSRHKRTHTGEKPYECKTCRKAFGHYDNLKVHERIHSGEKPYECKEC
         510       520       530       540       550       560     

           290       300       310       320       330       340   
pF1KA1 GKAFIYYQPFLTHERTHTGEKPYECKQCGKAFSCPTYLRSHEKTHTGEKPFVCRECGRAF
       :::: .   :: ::: :  :: ::: ::::::.   .:..::::::::.:. :.:::.::
NP_005 GKAFSWLTCFLRHERIHMREKSYECPQCGKAFTHSRFLQGHEKTHTGENPYECKECGKAF
         570       580       590       600       610       620     

           350            360       370       380       390        
pF1KA1 FSHSSLRKHVKTH-----TGVQPYTCKKCGEAFKSSSSCEVHERTHFGEKPYECKQCGKA
        : :::..: :::     :: .:: ::.::.:: : :: . :..::              
NP_005 ASLSSLHRHKKTHWKKTHTGENPYECKECGKAFASLSSLHRHKKTH              
         630       640       650       660       670               

      400       410       420       430       440       450        
pF1KA1 FNSSSYLQLHERVHTGEKTYECKECGKAFLYSTHFRIHERTHTREKPYECKQCGRVFIYF

>>XP_016881629 (OMIM: 606697) PREDICTED: zinc finger pro  (673 aa)
 initn: 1810 init1: 1810 opt: 1815  Z-score: 989.9  bits: 193.2 E(85289): 2.1e-48
Smith-Waterman score: 1815; 53.1% identity (76.4% similar) in 475 aa overlap (56-529:5-478)

          30        40        50        60        70        80     
pF1KA1 SQGRTGTGGSDVLQMQNSEHHGQSIKTQTDSISLEDVAVNFTLEEWALLDPGQRNIYRDV
                                     :..::::::::: :::::: : :.:.:.::
XP_016                           MDQASVALEDVAVNFTREEWALLGPCQKNLYKDV
                                         10        20        30    

          90       100       110       120       130       140     
pF1KA1 MRATFKNLACIGEKWKDQDIEDEHKNQGRNLRSPMVEALCENKEDCPCGKSTSQIPDLNT
       :. :..:: :.  :::::.:::...   .:::  :.: . :.:.   ::...::: :  .
XP_016 MQETIRNLDCVVMKWKDQNIEDQYRYPRKNLRCRMLERFVESKDGTQCGETSSQIQDSIV
           40        50        60        70        80        90    

         150       160       170       180       190       200     
pF1KA1 NLETPTGLKPCDCSVCGEVFMHQVSLNRHMRSHTEQKPNECHEYGEKPHKCKECGKTFTR
       . .:  :. ::. :. ::  : . ::: ..:  . .::.: :: ::::   :. ::.:. 
XP_016 TKNTLPGVGPCESSMRGEKVMGHSSLNCYIRVGAGHKPHEYHECGEKPDTHKQRGKAFSY
          100       110       120       130       140       150    

         210       220       230       240       250       260     
pF1KA1 SSSIRTHERIHTGEKPYECKECGKAFAFLFSFRNHIRIHTGETPYECKECGKAFRYLTAL
        .:..::::.:::.:::.::::::.:. : ... :. .. :. ::.:: ::::: . . :
XP_016 HNSFQTHERLHTGKKPYDCKECGKSFSSLGNLQRHMAVQRGDGPYKCKLCGKAFFWPSLL
          160       170       180       190       200       210    

         270       280       290       300       310        320    
pF1KA1 RRHEKNHTGEKPYKCKQCGKAFIYYQPFLTHERTHTGEKPYECKQCGKAFSC-PTYLRSH
       . ::..:::::::.::::.::: .:. .: ::::::::::::::::.:::    .::: :
XP_016 HMHERTHTGEKPYECKQCSKAFSFYSSYLRHERTHTGEKPYECKQCSKAFPFYSSYLR-H
          220       230       240       250       260       270    

          330       340       350       360       370       380    
pF1KA1 EKTHTGEKPFVCRECGRAFFSHSSLRKHVKTHTGVQPYTCKKCGEAFKSSSSCEVHERTH
       :.:::::::. :..:..:: . ::   : .:::: .:::::.::.::. :.: . :: ::
XP_016 ERTHTGEKPYKCKQCSKAFPDSSSCLIHERTHTGEKPYTCKQCGKAFSVSGSLQRHETTH
           280       290       300       310       320       330   

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pF1KA1 FGEKPYECKQCGKAFNSSSYLQLHERVHTGEKTYECKECGKAFLYSTHFRIHERTHTREK
        .:::: :.::::::.  . .: :   :::.  ..:: :::.:   . .. :::::: ::
XP_016 SAEKPYACQQCGKAFHHLGSFQRHMIRHTGNGPHKCKICGKGFDCPSSLQSHERTHTGEK
           340       350       360       370       380       390   

          450       460       470       480       490       500    
pF1KA1 PYECKQCGRVFIYFSHLRRHERSHTGVKPCECKQCGKAFTCLNSLKVHKRIHTGERPFQC
       ::::::::... . : .: :   :::  : .:: :::::.  . .. :.: ::.:.:..:
XP_016 PYECKQCGKALSHRSSFRSHMIMHTGDGPHKCKVCGKAFVYPSVFQRHERTHTAEKPYKC
           400       410       420       430       440       450   

          510       520                                            
pF1KA1 RQCGKAFSYSKSLHVHERTHSRQKP                                   
       .:::::.  :.::. :: ::. .::                                   
XP_016 KQCGKAYRISSSLRRHETTHTGEKPYKCKLGKACIDFCSFQNHKTTHTGEKPYECKECGK
           460       470       480       490       500       510   

>--
 initn: 2517 init1: 673 opt: 783  Z-score: 444.6  bits: 92.3 E(85289): 5e-18
Smith-Waterman score: 783; 56.6% identity (73.0% similar) in 196 aa overlap (194-384:479-673)

           170       180       190       200       210       220   
pF1KA1 VFMHQVSLNRHMRSHTEQKPNECHEYGEKPHKCKECGKTFTRSSSIRTHERIHTGEKPYE
                                     .:::  ::.     :...:.  ::::::::
XP_016 KPYKCKQCGKAYRISSSLRRHETTHTGEKPYKCK-LGKACIDFCSFQNHKTTHTGEKPYE
      450       460       470       480        490       500       

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pF1KA1 CKECGKAFAFLFSFRNHIRIHTGETPYECKECGKAFRYLTALRRHEKNHTGEKPYKCKQC
       ::::::::. .  .  : : :::: ::::: : ::: .   :. ::. :.:::::.::.:
XP_016 CKECGKAFSRFRYLSRHKRTHTGEKPYECKTCRKAFGHYDNLKVHERIHSGEKPYECKEC
       510       520       530       540       550       560       

           290       300       310       320       330       340   
pF1KA1 GKAFIYYQPFLTHERTHTGEKPYECKQCGKAFSCPTYLRSHEKTHTGEKPFVCRECGRAF
       :::: .   :: ::: :  :: ::: ::::::.   .:..::::::::.:. :.:::.::
XP_016 GKAFSWLTCFLRHERIHMREKSYECPQCGKAFTHSRFLQGHEKTHTGENPYECKECGKAF
       570       580       590       600       610       620       

           350            360       370       380       390        
pF1KA1 FSHSSLRKHVKTH-----TGVQPYTCKKCGEAFKSSSSCEVHERTHFGEKPYECKQCGKA
        : :::..: :::     :: .:: ::.::.:: : :: . :..::              
XP_016 ASLSSLHRHKKTHWKKTHTGENPYECKECGKAFASLSSLHRHKKTH              
       630       640       650       660       670                 

      400       410       420       430       440       450        
pF1KA1 FNSSSYLQLHERVHTGEKTYECKECGKAFLYSTHFRIHERTHTREKPYECKQCGRVFIYF

>>NP_057348 (OMIM: 194542) zinc finger protein 44 isofor  (615 aa)
 initn: 1701 init1: 1701 opt: 1784  Z-score: 973.8  bits: 190.1 E(85289): 1.7e-47
Smith-Waterman score: 1787; 51.4% identity (71.3% similar) in 502 aa overlap (55-528:2-502)

           30        40        50        60        70        80    
pF1KA1 SSQGRTGTGGSDVLQMQNSEHHGQSIKTQTDSISLEDVAVNFTLEEWALLDPGQRNIYRD
                                     ::...:::::::: :::::: :.:.:.:::
NP_057                              MDSVAFEDVAVNFTHEEWALLGPSQKNLYRD
                                            10        20        30 

           90       100       110       120       130       140    
pF1KA1 VMRATFKNLACIGEKWKDQDIEDEHKNQGRNLRSPMVEALCENKEDCPCGKSTSQIPDLN
       ::: :..:: ::: ::..:.:.:.:.:  :: :  .:: . ..:.   ::.. ::: .  
NP_057 VMRETIRNLNCIGMKWENQNIDDQHQNLRRNPRCDVVERFGKSKDGSQCGETLSQIRNSI
              40        50        60        70        80        90 

          150       160       170       180       190       200    
pF1KA1 TNLETPTGLKPCDCSVCGEVFMHQVSLNRHMRSHTEQKPNECHEYGEKPHKCKECGKTFT
       .: .::. .  :  :: :::.: . ::: ..:  : .:  :::::.:: .  :.::: ..
NP_057 VNKNTPARVDACGSSVNGEVIMGHSSLNCYIRVDTGHKHRECHEYAEKSYTHKQCGKGLS
             100       110       120       130       140       150 

          210       220       230                                  
pF1KA1 RSSSIRTHERIHTGEKPYECKECGKAF--------------------------AFLFS--
          :..: :: :::.:::.::::::.:                          ::..   
NP_057 YRHSFQTCERPHTGKKPYDCKECGKTFSSPGNLRRHMVVKGGDGPYKCELCGKAFFWPSL
             160       170       180       190       200       210 

        240       250       260       270       280       290      
pF1KA1 FRNHIRIHTGETPYECKECGKAFRYLTALRRHEKNHTGEKPYKCKQCGKAFIYYQPFLTH
       .: : : :::: :::::.:.:::   ..  :::: :::::::.::::.:::  :. .: :
NP_057 LRMHERTHTGEKPYECKQCSKAFPVYSSYLRHEKIHTGEKPYECKQCSKAFPDYSSYLRH
             220       230       240       250       260       270 

        300       310       320       330       340       350      
pF1KA1 ERTHTGEKPYECKQCGKAFSCPTYLRSHEKTHTGEKPFVCRECGRAFFSHSSLRKHVKTH
       ::::::::::.:::::::::    :: ::. ::::::..:..::.::   .:...:.  :
NP_057 ERTHTGEKPYKCKQCGKAFSVSGSLRVHERIHTGEKPYTCKQCGKAFCHLGSFQRHMIMH
             280       290       300       310       320       330 

        360       370       380       390       400       410      
pF1KA1 TGVQPYTCKKCGEAFKSSSSCEVHERTHFGEKPYECKQCGKAFNSSSYLQLHERVHTGEK
       .:  :. :: ::..:   .: ..:: ::  ::::::::::: ..  : .. :  .:::. 
NP_057 SGDGPHKCKICGKGFDFPGSARIHEGTHTLEKPYECKQCGKLLSHRSSFRRHMMAHTGDG
             340       350       360       370       380       390 

        420       430       440       450       460       470      
pF1KA1 TYECKECGKAFLYSTHFRIHERTHTREKPYECKQCGRVFIYFSHLRRHERSHTGVKPCEC
        ..:  :::::   . :. :::::: ::::::::::..:   : ::.:: .::: .: .:
NP_057 PHKCTVCGKAFDSPSVFQRHERTHTGEKPYECKQCGKAFRTSSSLRKHETTHTGEQPYKC
             400       410       420       430       440       450 

        480       490       500       510       520                
pF1KA1 KQCGKAFTCLNSLKVHKRIHTGERPFQCRQCGKAFSYSKSLHVHERTHSRQKP       
       : :::::. : :.. :.  :. :.:..:..::::::  : .  ::::::..:        
NP_057 K-CGKAFSDLFSFQSHETTHSEEEPYECKECGKAFSSFKYFCRHERTHSEEKSYECQICG
              460       470       480       490       500       510

NP_057 KAFSRFSYLKTHERTHTAEKPYECKQCRKAFFWPSFLLRHERTHTGERPYECKHCGKAFS
              520       530       540       550       560       570

>--
 initn: 1371 init1: 511 opt: 511  Z-score: 301.1  bits: 65.6 E(85289): 4.9e-10
Smith-Waterman score: 511; 61.7% identity (83.2% similar) in 107 aa overlap (250-356:504-610)

     220       230       240       250       260       270         
pF1KA1 KPYECKECGKAFAFLFSFRNHIRIHTGETPYECKECGKAFRYLTALRRHEKNHTGEKPYK
                                     :::. :::::  .. :. ::..::.::::.
NP_057 EPYECKECGKAFSSFKYFCRHERTHSEEKSYECQICGKAFSRFSYLKTHERTHTAEKPYE
           480       490       500       510       520       530   

     280       290       300       310       320       330         
pF1KA1 CKQCGKAFIYYQPFLTHERTHTGEKPYECKQCGKAFSCPTYLRSHEKTHTGEKPFVCREC
       :::: :::.. . .: ::::::::.:::::.::::::  .. : ::.:::::::. :.::
NP_057 CKQCRKAFFWPSFLLRHERTHTGERPYECKHCGKAFSRSSFCREHERTHTGEKPYECKEC
           540       550       560       570       580       590   

     340       350       360       370       380       390         
pF1KA1 GRAFFSHSSLRKHVKTHTGVQPYTCKKCGEAFKSSSSCEVHERTHFGEKPYECKQCGKAF
       :.:: : ::. .: .::                                           
NP_057 GKAFSSLSSFNRHKRTHWKDIL                                      
           600       610                                           

>>XP_011526366 (OMIM: 194542) PREDICTED: zinc finger pro  (616 aa)
 initn: 1701 init1: 1701 opt: 1784  Z-score: 973.8  bits: 190.1 E(85289): 1.7e-47
Smith-Waterman score: 1787; 51.4% identity (71.3% similar) in 502 aa overlap (55-528:3-503)

           30        40        50        60        70        80    
pF1KA1 SSQGRTGTGGSDVLQMQNSEHHGQSIKTQTDSISLEDVAVNFTLEEWALLDPGQRNIYRD
                                     ::...:::::::: :::::: :.:.:.:::
XP_011                             MKDSVAFEDVAVNFTHEEWALLGPSQKNLYRD
                                           10        20        30  

           90       100       110       120       130       140    
pF1KA1 VMRATFKNLACIGEKWKDQDIEDEHKNQGRNLRSPMVEALCENKEDCPCGKSTSQIPDLN
       ::: :..:: ::: ::..:.:.:.:.:  :: :  .:: . ..:.   ::.. ::: .  
XP_011 VMRETIRNLNCIGMKWENQNIDDQHQNLRRNPRCDVVERFGKSKDGSQCGETLSQIRNSI
             40        50        60        70        80        90  

          150       160       170       180       190       200    
pF1KA1 TNLETPTGLKPCDCSVCGEVFMHQVSLNRHMRSHTEQKPNECHEYGEKPHKCKECGKTFT
       .: .::. .  :  :: :::.: . ::: ..:  : .:  :::::.:: .  :.::: ..
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