Result of FASTA (omim) for pF1KA0743
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA0743, 1061 aa
  1>>>pF1KA0743 1061 - 1061 aa - 1061 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9117+/-0.000535; mu= 12.8864+/- 0.033
 mean_var=106.5535+/-20.445, 0's: 0 Z-trim(109.0): 244  B-trim: 6 in 1/54
 Lambda= 0.124248
 statistics sampled from 16862 (17136) to 16862 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.532), E-opt: 0.2 (0.201), width:  16
 Scan time: 13.470

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_004787 (OMIM: 600567) neurexin 3 isoform 1 [Hom (1061) 7080 1281.4       0
XP_011535675 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1446) 7080 1281.5       0
XP_016877296 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1449) 7064 1278.6       0
XP_016877291 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1541) 6444 1167.5       0
XP_016877289 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1553) 6444 1167.5       0
XP_016877288 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1654) 6444 1167.5       0
XP_011535669 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1657) 6444 1167.5       0
XP_016860816 (OMIM: 600565,614325,614332) PREDICTE (1466) 5646 1024.4       0
XP_006712200 (OMIM: 600565,614325,614332) PREDICTE (1481) 5646 1024.4       0
XP_011535679 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1323) 5634 1022.3       0
XP_016877294 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1464) 5634 1022.3       0
XP_016877292 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1468) 5634 1022.3       0
XP_011535674 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1476) 5634 1022.3       0
XP_011535673 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1479) 5634 1022.3       0
NP_001317124 (OMIM: 600567) neurexin 3 isoform 5 [ (1571) 5634 1022.3       0
XP_011535672 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1575) 5634 1022.3       0
XP_011535671 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1583) 5634 1022.3       0
XP_011535670 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1586) 5634 1022.3       0
XP_016877286 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1667) 5634 1022.3       0
XP_016877284 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1675) 5634 1022.3       0
XP_016877283 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1675) 5634 1022.3       0
XP_011535668 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1679) 5634 1022.3       0
XP_006720385 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1683) 5634 1022.3       0
XP_016877281 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1683) 5634 1022.3       0
XP_005268275 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1684) 5634 1022.3       0
XP_016877279 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1687) 5634 1022.3       0
XP_011535666 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1687) 5634 1022.3       0
XP_016877280 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1687) 5634 1022.3       0
XP_011535665 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1687) 5634 1022.3       0
XP_011535667 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1687) 5634 1022.3       0
XP_016860815 (OMIM: 600565,614325,614332) PREDICTE (1471) 5579 1012.4       0
NP_004792 (OMIM: 600565,614325,614332) neurexin-1  (1477) 5579 1012.4       0
XP_011531479 (OMIM: 600565,614325,614332) PREDICTE (1484) 5579 1012.4       0
NP_001317025 (OMIM: 600565,614325,614332) neurexin (1437) 5543 1006.0       0
NP_001317017 (OMIM: 600565,614325,614332) neurexin (1447) 5543 1006.0       0
NP_001317012 (OMIM: 600565,614325,614332) neurexin (1452) 5543 1006.0       0
XP_016860814 (OMIM: 600565,614325,614332) PREDICTE (1472) 5543 1006.0       0
NP_001317016 (OMIM: 600565,614325,614332) neurexin (1440) 5476 994.0       0
NP_001317024 (OMIM: 600565,614325,614332) neurexin (1460) 5476 994.0       0
XP_016860813 (OMIM: 600565,614325,614332) PREDICTE (1475) 5476 994.0       0
XP_016874067 (OMIM: 600566) PREDICTED: neurexin-2- (1488) 5394 979.3       0
XP_016874057 (OMIM: 600566) PREDICTED: neurexin-2- (1682) 4899 890.6       0
XP_016874056 (OMIM: 600566) PREDICTED: neurexin-2- (1685) 4883 887.7       0
XP_011531482 (OMIM: 600565,614325,614332) PREDICTE (1450) 4626 841.6       0
XP_011531477 (OMIM: 600565,614325,614332) PREDICTE (1495) 4626 841.6       0
NP_001317011 (OMIM: 600565,614325,614332) neurexin (1496) 4626 841.6       0
NP_001317006 (OMIM: 600565,614325,614332) neurexin (1499) 4626 841.6       0
NP_001317023 (OMIM: 600565,614325,614332) neurexin (1500) 4626 841.6       0
NP_001317015 (OMIM: 600565,614325,614332) neurexin (1504) 4626 841.6       0
NP_001317022 (OMIM: 600565,614325,614332) neurexin (1506) 4626 841.6       0


>>NP_004787 (OMIM: 600567) neurexin 3 isoform 1 [Homo sa  (1061 aa)
 initn: 7080 init1: 7080 opt: 7080  Z-score: 6862.2  bits: 1281.4 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 7080; 99.9% identity (100.0% similar) in 1061 aa overlap (1-1061:1-1061)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMGCLKEVVYKNNDIRLELSRLARIADTKMKIY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 MLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMGCLKEVVYKNNDIRLELSRLARIADTKMKIY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 GEVVFKCENVATLDPINFETPEAYISLPKWNTKRMGSISFDFRTTEPNGLILFTHGKPQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 GEVVFKCENVATLDPINFETPEAYISLPKWNTKRMGSISFDFRTTEPNGLILFTHGKPQE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 RKDARSQKNTKVDFFAVELLDGNLYLLLDMGSGTIKVKATQKKANDGEWYHVDIQRDGRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 RKDARSQKNTKVDFFAVELLDGNLYLLLDMGSGTIKVKATQKKANDGEWYHVDIQRDGRS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 GTISVNSRRTPFTASGESEILDLEGDMYLGGLPENRAGLILPTELWTAMLNYGYVGCIRD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 GTISVNSRRTPFTASGESEILDLEGDMYLGGLPENRAGLILPTELWTAMLNYGYVGCIRD
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 LFIDGRSKNIRQLAEMQNAAGVKSSCSRMSAKQCDSYPCKNNAVCKDGWNRFICDCTGTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 LFIDGRSKNIRQLAEMQNAAGVKSSCSRMSAKQCDSYPCKNNAVCKDGWNRFICDCTGTG
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 YWGRTCEREASILSYDGSMYMKIIMPMVMHTEAEDVSFRFMSQRAYGLLVATTSRDSADT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 YWGRTCEREASILSYDGSMYMKIIMPMVMHTEAEDVSFRFMSQRAYGLLVATTSRDSADT
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 LRLELDGGRVKLMVNLDCIRINCNSSKGPETLYAGQKLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 LRLELDGGRVKLMVNLDCIRINCNSSKGPETLYAGQKLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVD
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 DDVAEGTMVGDHTRLEFHNIETGIMTEKRYISVVPSSFIGHLQSLMFNGLLYIDLCKNGD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 DDVAEGTMVGDHTRLEFHNIETGIMTEKRYISVVPSSFIGHLQSLMFNGLLYIDLCKNGD
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 IDYCELKARFGLRNIIADPVTFKTKSSYLSLATLQAYTSMHLFFQFKTTSPDGFILFNSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 IDYCELKARFGLRNIIADPVTFKTKSSYLSLATLQAYTSMHLFFQFKTTSPDGFILFNSG
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA0 DGNDFIAVELVKGYIHYVFDLGNGPNVIKGNSDRPLNDNQWHNVVITRDNSNTHSLKVDT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 DGNDFIAVELVKGYIHYVFDLGNGPNVIKGNSDRPLNDNQWHNVVITRDNSNTHSLKVDT
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA0 KVVTQVINGAKNLDLKGDLYMAGLAQGMYSNLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLIN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 KVVTQVINGAKNLDLKGDLYMAGLAQGMYSNLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLIN
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA0 DALHRSGQIKRGCEGPSTTCQEDSCANQGVCMQQWEGFTCDCSMTSYSGNQCNDPGATYI
       :::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 DALHRSGQIERGCEGPSTTCQEDSCANQGVCMQQWEGFTCDCSMTSYSGNQCNDPGATYI
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KA0 FGKSGGLILYTWPANDRPSTRSDRLAVGFSTTVKDGILVRIDSAPGLGDFLQLHIEQGKI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 FGKSGGLILYTWPANDRPSTRSDRLAVGFSTTVKDGILVRIDSAPGLGDFLQLHIEQGKI
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KA0 GVVFNIGTVDISIKEERTPVNDGKYHVVRFTRNGGNATLQVDNWPVNEHYPTGRQLTIFN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 GVVFNIGTVDISIKEERTPVNDGKYHVVRFTRNGGNATLQVDNWPVNEHYPTGRQLTIFN
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KA0 TQAQIAIGGKDKGRLFQGQLSGLYYDGLKVLNMAAENNPNIKINGSVRLVGEVPSILGTT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 TQAQIAIGGKDKGRLFQGQLSGLYYDGLKVLNMAAENNPNIKINGSVRLVGEVPSILGTT
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KA0 QTTSMPPEMSTTVMETTTTMATTTTRKNRSTASIQPTSDDLVSSAECSSDDEDFVECEPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 QTTSMPPEMSTTVMETTTTMATTTTRKNRSTASIQPTSDDLVSSAECSSDDEDFVECEPS
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KA0 TANPTEPGIRRVPGASEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 TANPTEPGIRRVPGASEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQV
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060 
pF1KA0 DETRNYISNSAQSNGTLMKEKQQSSKSGHKKQKNKDREYYV
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 DETRNYISNSAQSNGTLMKEKQQSSKSGHKKQKNKDREYYV
             1030      1040      1050      1060 

>>XP_011535675 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 isof  (1446 aa)
 initn: 7080 init1: 7080 opt: 7080  Z-score: 6860.1  bits: 1281.5 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 7080; 99.9% identity (100.0% similar) in 1061 aa overlap (1-1061:386-1446)

                                             10        20        30
pF1KA0                               MLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMG
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RQHSGIGHAMVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMG
         360       370       380       390       400       410     

               40        50        60        70        80        90
pF1KA0 CLKEVVYKNNDIRLELSRLARIADTKMKIYGEVVFKCENVATLDPINFETPEAYISLPKW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CLKEVVYKNNDIRLELSRLARIADTKMKIYGEVVFKCENVATLDPINFETPEAYISLPKW
         420       430       440       450       460       470     

              100       110       120       130       140       150
pF1KA0 NTKRMGSISFDFRTTEPNGLILFTHGKPQERKDARSQKNTKVDFFAVELLDGNLYLLLDM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NTKRMGSISFDFRTTEPNGLILFTHGKPQERKDARSQKNTKVDFFAVELLDGNLYLLLDM
         480       490       500       510       520       530     

              160       170       180       190       200       210
pF1KA0 GSGTIKVKATQKKANDGEWYHVDIQRDGRSGTISVNSRRTPFTASGESEILDLEGDMYLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GSGTIKVKATQKKANDGEWYHVDIQRDGRSGTISVNSRRTPFTASGESEILDLEGDMYLG
         540       550       560       570       580       590     

              220       230       240       250       260       270
pF1KA0 GLPENRAGLILPTELWTAMLNYGYVGCIRDLFIDGRSKNIRQLAEMQNAAGVKSSCSRMS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GLPENRAGLILPTELWTAMLNYGYVGCIRDLFIDGRSKNIRQLAEMQNAAGVKSSCSRMS
         600       610       620       630       640       650     

              280       290       300       310       320       330
pF1KA0 AKQCDSYPCKNNAVCKDGWNRFICDCTGTGYWGRTCEREASILSYDGSMYMKIIMPMVMH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AKQCDSYPCKNNAVCKDGWNRFICDCTGTGYWGRTCEREASILSYDGSMYMKIIMPMVMH
         660       670       680       690       700       710     

              340       350       360       370       380       390
pF1KA0 TEAEDVSFRFMSQRAYGLLVATTSRDSADTLRLELDGGRVKLMVNLDCIRINCNSSKGPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TEAEDVSFRFMSQRAYGLLVATTSRDSADTLRLELDGGRVKLMVNLDCIRINCNSSKGPE
         720       730       740       750       760       770     

              400       410       420       430       440       450
pF1KA0 TLYAGQKLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDDVAEGTMVGDHTRLEFHNIETGIMTEKRY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TLYAGQKLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDDVAEGTMVGDHTRLEFHNIETGIMTEKRY
         780       790       800       810       820       830     

              460       470       480       490       500       510
pF1KA0 ISVVPSSFIGHLQSLMFNGLLYIDLCKNGDIDYCELKARFGLRNIIADPVTFKTKSSYLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ISVVPSSFIGHLQSLMFNGLLYIDLCKNGDIDYCELKARFGLRNIIADPVTFKTKSSYLS
         840       850       860       870       880       890     

              520       530       540       550       560       570
pF1KA0 LATLQAYTSMHLFFQFKTTSPDGFILFNSGDGNDFIAVELVKGYIHYVFDLGNGPNVIKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LATLQAYTSMHLFFQFKTTSPDGFILFNSGDGNDFIAVELVKGYIHYVFDLGNGPNVIKG
         900       910       920       930       940       950     

              580       590       600       610       620       630
pF1KA0 NSDRPLNDNQWHNVVITRDNSNTHSLKVDTKVVTQVINGAKNLDLKGDLYMAGLAQGMYS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NSDRPLNDNQWHNVVITRDNSNTHSLKVDTKVVTQVINGAKNLDLKGDLYMAGLAQGMYS
         960       970       980       990      1000      1010     

              640       650       660       670       680       690
pF1KA0 NLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLINDALHRSGQIKRGCEGPSTTCQEDSCANQGV
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::
XP_011 NLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLINDALHRSGQIERGCEGPSTTCQEDSCANQGV
        1020      1030      1040      1050      1060      1070     

              700       710       720       730       740       750
pF1KA0 CMQQWEGFTCDCSMTSYSGNQCNDPGATYIFGKSGGLILYTWPANDRPSTRSDRLAVGFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CMQQWEGFTCDCSMTSYSGNQCNDPGATYIFGKSGGLILYTWPANDRPSTRSDRLAVGFS
        1080      1090      1100      1110      1120      1130     

              760       770       780       790       800       810
pF1KA0 TTVKDGILVRIDSAPGLGDFLQLHIEQGKIGVVFNIGTVDISIKEERTPVNDGKYHVVRF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TTVKDGILVRIDSAPGLGDFLQLHIEQGKIGVVFNIGTVDISIKEERTPVNDGKYHVVRF
        1140      1150      1160      1170      1180      1190     

              820       830       840       850       860       870
pF1KA0 TRNGGNATLQVDNWPVNEHYPTGRQLTIFNTQAQIAIGGKDKGRLFQGQLSGLYYDGLKV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TRNGGNATLQVDNWPVNEHYPTGRQLTIFNTQAQIAIGGKDKGRLFQGQLSGLYYDGLKV
        1200      1210      1220      1230      1240      1250     

              880       890       900       910       920       930
pF1KA0 LNMAAENNPNIKINGSVRLVGEVPSILGTTQTTSMPPEMSTTVMETTTTMATTTTRKNRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LNMAAENNPNIKINGSVRLVGEVPSILGTTQTTSMPPEMSTTVMETTTTMATTTTRKNRS
        1260      1270      1280      1290      1300      1310     

              940       950       960       970       980       990
pF1KA0 TASIQPTSDDLVSSAECSSDDEDFVECEPSTANPTEPGIRRVPGASEVIRESSSTTGMVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TASIQPTSDDLVSSAECSSDDEDFVECEPSTANPTEPGIRRVPGASEVIRESSSTTGMVV
        1320      1330      1340      1350      1360      1370     

             1000      1010      1020      1030      1040      1050
pF1KA0 GIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDETRNYISNSAQSNGTLMKEKQQSSKSGHK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDETRNYISNSAQSNGTLMKEKQQSSKSGHK
        1380      1390      1400      1410      1420      1430     

             1060 
pF1KA0 KQKNKDREYYV
       :::::::::::
XP_011 KQKNKDREYYV
        1440      

>--
 initn: 263 init1: 117 opt: 253  Z-score: 246.4  bits: 57.7 E(85289): 5.5e-07
Smith-Waterman score: 358; 25.3% identity (56.2% similar) in 324 aa overlap (516-813:45-354)

         490       500       510       520       530        540    
pF1KA0 LKARFGLRNIIADPVTFKTKSSYLSLATLQAYTSMHLFFQFKTTSPDGFILF-NSGDGND
                                     : :   : :::::.   :..:. ..:   :
XP_011 SILLGSLLGLCLGLEFMGLPNQWARYLRWDASTRSDLSFQFKTNVSTGLLLYLDDGGVCD
           20        30        40        50        60        70    

          550       560       570       580       590       600    
pF1KA0 FIAVELVKGYIHYVFDLGNGPNVIKGNSDRPLNDNQWHNVVITRDNSNTHSLKVDTKVVT
       :. . :: : ..  :..  . ... .:  . .::..:: ....::   :  : .: .  .
XP_011 FLCLSLVDGRVQLRFSMDCAETAVLSN--KQVNDSSWHFLMVSRDRLRT-VLMLDGEGQS
           80        90       100         110       120        130 

          610        620       630         640       650       660 
pF1KA0 QVINGAKN-LDLKGDLYMAGLAQGMYSNLPKL--VASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLIND
         ..  .  .:. .::...:.   .  .   :  : .  ::.: . ..  ..  : :.. 
XP_011 GELQPQRPYMDVVSDLFLGGVPTDIRPSALTLDGVQAMPGFKGLILDLKYGNSEPRLLG-
             140       150       160       170       180       190 

             670       680       690       700       710           
pF1KA0 ALHRSGQIKRGCEGPSTTCQEDSCANQGVCMQQWEGFTCDCSMTSYSGNQCN-----DPG
           :  ..   :::   : :  : : :.:.      ::::: :.:.:. :.     :::
XP_011 ----SRGVQMDAEGP---CGERPCENGGICFLLDGHPTCDCSTTGYGGKLCSEDVSQDPG
                  200          210       220       230       240   

        720                     730        740       750       760 
pF1KA0 ATYIF----GKSG----------GLILYTWPANDRP-STRSDRLAVGFSTTVKDGILVRI
        ....    :.:           :     .  .. : .. ::.....:.:  ..:.... 
XP_011 LSHLMMSEQGRSKAREENVATFRGSEYLCYDLSQNPIQSSSDEITLSFKTWQRNGLILHT
           250       260       270       280       290       300   

             770       780         790       800       810         
pF1KA0 DSAPGLGDFLQLHIEQGKIGVVFNIGT--VDISIKEERTPVNDGKYHVVRFTRNGGNATL
        ..   .:...: ...: ...:.:.:.   .  ..      ::. .: :. :::      
XP_011 GKS---ADYVNLALKDGAVSLVINLGSGAFEAIVEPVNGKFNDNAWHDVKVTRNLRQHSG
              310       320       330       340       350       360

     820       830       840       850       860       870         
pF1KA0 QVDNWPVNEHYPTGRQLTIFNTQAQIAIGGKDKGRLFQGQLSGLYYDGLKVLNMAAENNP
                                                                   
XP_011 IGHAMVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMGCLKEV
              370       380       390       400       410       420

>>XP_016877296 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 isof  (1449 aa)
 initn: 6687 init1: 6452 opt: 7064  Z-score: 6844.6  bits: 1278.6 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 7064; 99.6% identity (99.7% similar) in 1064 aa overlap (1-1061:386-1449)

                                             10        20        30
pF1KA0                               MLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMG
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RQHSGIGHAMVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMG
         360       370       380       390       400       410     

               40        50        60        70        80        90
pF1KA0 CLKEVVYKNNDIRLELSRLARIADTKMKIYGEVVFKCENVATLDPINFETPEAYISLPKW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CLKEVVYKNNDIRLELSRLARIADTKMKIYGEVVFKCENVATLDPINFETPEAYISLPKW
         420       430       440       450       460       470     

              100       110       120       130       140       150
pF1KA0 NTKRMGSISFDFRTTEPNGLILFTHGKPQERKDARSQKNTKVDFFAVELLDGNLYLLLDM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NTKRMGSISFDFRTTEPNGLILFTHGKPQERKDARSQKNTKVDFFAVELLDGNLYLLLDM
         480       490       500       510       520       530     

              160       170       180       190       200       210
pF1KA0 GSGTIKVKATQKKANDGEWYHVDIQRDGRSGTISVNSRRTPFTASGESEILDLEGDMYLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GSGTIKVKATQKKANDGEWYHVDIQRDGRSGTISVNSRRTPFTASGESEILDLEGDMYLG
         540       550       560       570       580       590     

              220       230       240       250       260       270
pF1KA0 GLPENRAGLILPTELWTAMLNYGYVGCIRDLFIDGRSKNIRQLAEMQNAAGVKSSCSRMS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GLPENRAGLILPTELWTAMLNYGYVGCIRDLFIDGRSKNIRQLAEMQNAAGVKSSCSRMS
         600       610       620       630       640       650     

              280       290       300       310       320       330
pF1KA0 AKQCDSYPCKNNAVCKDGWNRFICDCTGTGYWGRTCEREASILSYDGSMYMKIIMPMVMH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AKQCDSYPCKNNAVCKDGWNRFICDCTGTGYWGRTCEREASILSYDGSMYMKIIMPMVMH
         660       670       680       690       700       710     

              340       350       360       370       380       390
pF1KA0 TEAEDVSFRFMSQRAYGLLVATTSRDSADTLRLELDGGRVKLMVNLDCIRINCNSSKGPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TEAEDVSFRFMSQRAYGLLVATTSRDSADTLRLELDGGRVKLMVNLDCIRINCNSSKGPE
         720       730       740       750       760       770     

              400       410       420       430       440       450
pF1KA0 TLYAGQKLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDDVAEGTMVGDHTRLEFHNIETGIMTEKRY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TLYAGQKLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDDVAEGTMVGDHTRLEFHNIETGIMTEKRY
         780       790       800       810       820       830     

              460       470       480       490       500       510
pF1KA0 ISVVPSSFIGHLQSLMFNGLLYIDLCKNGDIDYCELKARFGLRNIIADPVTFKTKSSYLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ISVVPSSFIGHLQSLMFNGLLYIDLCKNGDIDYCELKARFGLRNIIADPVTFKTKSSYLS
         840       850       860       870       880       890     

              520       530       540       550       560       570
pF1KA0 LATLQAYTSMHLFFQFKTTSPDGFILFNSGDGNDFIAVELVKGYIHYVFDLGNGPNVIKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LATLQAYTSMHLFFQFKTTSPDGFILFNSGDGNDFIAVELVKGYIHYVFDLGNGPNVIKG
         900       910       920       930       940       950     

              580       590       600       610       620       630
pF1KA0 NSDRPLNDNQWHNVVITRDNSNTHSLKVDTKVVTQVINGAKNLDLKGDLYMAGLAQGMYS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NSDRPLNDNQWHNVVITRDNSNTHSLKVDTKVVTQVINGAKNLDLKGDLYMAGLAQGMYS
         960       970       980       990      1000      1010     

              640       650       660       670       680       690
pF1KA0 NLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLINDALHRSGQIKRGCEGPSTTCQEDSCANQGV
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::
XP_016 NLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLINDALHRSGQIERGCEGPSTTCQEDSCANQGV
        1020      1030      1040      1050      1060      1070     

              700       710       720       730       740       750
pF1KA0 CMQQWEGFTCDCSMTSYSGNQCNDPGATYIFGKSGGLILYTWPANDRPSTRSDRLAVGFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CMQQWEGFTCDCSMTSYSGNQCNDPGATYIFGKSGGLILYTWPANDRPSTRSDRLAVGFS
        1080      1090      1100      1110      1120      1130     

              760       770       780       790       800       810
pF1KA0 TTVKDGILVRIDSAPGLGDFLQLHIEQGKIGVVFNIGTVDISIKEERTPVNDGKYHVVRF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TTVKDGILVRIDSAPGLGDFLQLHIEQGKIGVVFNIGTVDISIKEERTPVNDGKYHVVRF
        1140      1150      1160      1170      1180      1190     

              820       830       840       850       860       870
pF1KA0 TRNGGNATLQVDNWPVNEHYPTGRQLTIFNTQAQIAIGGKDKGRLFQGQLSGLYYDGLKV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TRNGGNATLQVDNWPVNEHYPTGRQLTIFNTQAQIAIGGKDKGRLFQGQLSGLYYDGLKV
        1200      1210      1220      1230      1240      1250     

              880       890       900       910       920       930
pF1KA0 LNMAAENNPNIKINGSVRLVGEVPSILGTTQTTSMPPEMSTTVMETTTTMATTTTRKNRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LNMAAENNPNIKINGSVRLVGEVPSILGTTQTTSMPPEMSTTVMETTTTMATTTTRKNRS
        1260      1270      1280      1290      1300      1310     

              940       950       960          970       980       
pF1KA0 TASIQPTSDDLVSSAECSSDDEDFVECEPST---ANPTEPGIRRVPGASEVIRESSSTTG
       :::::::::::::::::::::::::::::::   ::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TASIQPTSDDLVSSAECSSDDEDFVECEPSTGRSANPTEPGIRRVPGASEVIRESSSTTG
        1320      1330      1340      1350      1360      1370     

       990      1000      1010      1020      1030      1040       
pF1KA0 MVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDETRNYISNSAQSNGTLMKEKQQSSKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDETRNYISNSAQSNGTLMKEKQQSSKS
        1380      1390      1400      1410      1420      1430     

      1050      1060 
pF1KA0 GHKKQKNKDREYYV
       ::::::::::::::
XP_016 GHKKQKNKDREYYV
        1440         

>--
 initn: 263 init1: 117 opt: 253  Z-score: 246.4  bits: 57.7 E(85289): 5.5e-07
Smith-Waterman score: 358; 25.3% identity (56.2% similar) in 324 aa overlap (516-813:45-354)

         490       500       510       520       530        540    
pF1KA0 LKARFGLRNIIADPVTFKTKSSYLSLATLQAYTSMHLFFQFKTTSPDGFILF-NSGDGND
                                     : :   : :::::.   :..:. ..:   :
XP_016 SILLGSLLGLCLGLEFMGLPNQWARYLRWDASTRSDLSFQFKTNVSTGLLLYLDDGGVCD
           20        30        40        50        60        70    

          550       560       570       580       590       600    
pF1KA0 FIAVELVKGYIHYVFDLGNGPNVIKGNSDRPLNDNQWHNVVITRDNSNTHSLKVDTKVVT
       :. . :: : ..  :..  . ... .:  . .::..:: ....::   :  : .: .  .
XP_016 FLCLSLVDGRVQLRFSMDCAETAVLSN--KQVNDSSWHFLMVSRDRLRT-VLMLDGEGQS
           80        90       100         110       120        130 

          610        620       630         640       650       660 
pF1KA0 QVINGAKN-LDLKGDLYMAGLAQGMYSNLPKL--VASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLIND
         ..  .  .:. .::...:.   .  .   :  : .  ::.: . ..  ..  : :.. 
XP_016 GELQPQRPYMDVVSDLFLGGVPTDIRPSALTLDGVQAMPGFKGLILDLKYGNSEPRLLG-
             140       150       160       170       180       190 

             670       680       690       700       710           
pF1KA0 ALHRSGQIKRGCEGPSTTCQEDSCANQGVCMQQWEGFTCDCSMTSYSGNQCN-----DPG
           :  ..   :::   : :  : : :.:.      ::::: :.:.:. :.     :::
XP_016 ----SRGVQMDAEGP---CGERPCENGGICFLLDGHPTCDCSTTGYGGKLCSEDVSQDPG
                  200          210       220       230       240   

        720                     730        740       750       760 
pF1KA0 ATYIF----GKSG----------GLILYTWPANDRP-STRSDRLAVGFSTTVKDGILVRI
        ....    :.:           :     .  .. : .. ::.....:.:  ..:.... 
XP_016 LSHLMMSEQGRSKAREENVATFRGSEYLCYDLSQNPIQSSSDEITLSFKTWQRNGLILHT
           250       260       270       280       290       300   

             770       780         790       800       810         
pF1KA0 DSAPGLGDFLQLHIEQGKIGVVFNIGT--VDISIKEERTPVNDGKYHVVRFTRNGGNATL
        ..   .:...: ...: ...:.:.:.   .  ..      ::. .: :. :::      
XP_016 GKS---ADYVNLALKDGAVSLVINLGSGAFEAIVEPVNGKFNDNAWHDVKVTRNLRQHSG
              310       320       330       340       350       360

     820       830       840       850       860       870         
pF1KA0 QVDNWPVNEHYPTGRQLTIFNTQAQIAIGGKDKGRLFQGQLSGLYYDGLKVLNMAAENNP
                                                                   
XP_016 IGHAMVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMGCLKEV
              370       380       390       400       410       420

>>XP_016877291 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 isof  (1541 aa)
 initn: 6444 init1: 6444 opt: 6444  Z-score: 6243.6  bits: 1167.5 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 6444; 99.9% identity (100.0% similar) in 961 aa overlap (1-961:374-1334)

                                             10        20        30
pF1KA0                               MLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMG
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DVKVTRNLRQVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMG
           350       360       370       380       390       400   

               40        50        60        70        80        90
pF1KA0 CLKEVVYKNNDIRLELSRLARIADTKMKIYGEVVFKCENVATLDPINFETPEAYISLPKW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CLKEVVYKNNDIRLELSRLARIADTKMKIYGEVVFKCENVATLDPINFETPEAYISLPKW
           410       420       430       440       450       460   

              100       110       120       130       140       150
pF1KA0 NTKRMGSISFDFRTTEPNGLILFTHGKPQERKDARSQKNTKVDFFAVELLDGNLYLLLDM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NTKRMGSISFDFRTTEPNGLILFTHGKPQERKDARSQKNTKVDFFAVELLDGNLYLLLDM
           470       480       490       500       510       520   

              160       170       180       190       200       210
pF1KA0 GSGTIKVKATQKKANDGEWYHVDIQRDGRSGTISVNSRRTPFTASGESEILDLEGDMYLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GSGTIKVKATQKKANDGEWYHVDIQRDGRSGTISVNSRRTPFTASGESEILDLEGDMYLG
           530       540       550       560       570       580   

              220       230       240       250       260       270
pF1KA0 GLPENRAGLILPTELWTAMLNYGYVGCIRDLFIDGRSKNIRQLAEMQNAAGVKSSCSRMS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GLPENRAGLILPTELWTAMLNYGYVGCIRDLFIDGRSKNIRQLAEMQNAAGVKSSCSRMS
           590       600       610       620       630       640   

              280       290       300       310       320       330
pF1KA0 AKQCDSYPCKNNAVCKDGWNRFICDCTGTGYWGRTCEREASILSYDGSMYMKIIMPMVMH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AKQCDSYPCKNNAVCKDGWNRFICDCTGTGYWGRTCEREASILSYDGSMYMKIIMPMVMH
           650       660       670       680       690       700   

              340       350       360       370       380       390
pF1KA0 TEAEDVSFRFMSQRAYGLLVATTSRDSADTLRLELDGGRVKLMVNLDCIRINCNSSKGPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TEAEDVSFRFMSQRAYGLLVATTSRDSADTLRLELDGGRVKLMVNLDCIRINCNSSKGPE
           710       720       730       740       750       760   

              400       410       420       430       440       450
pF1KA0 TLYAGQKLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDDVAEGTMVGDHTRLEFHNIETGIMTEKRY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TLYAGQKLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDDVAEGTMVGDHTRLEFHNIETGIMTEKRY
           770       780       790       800       810       820   

              460       470       480       490       500       510
pF1KA0 ISVVPSSFIGHLQSLMFNGLLYIDLCKNGDIDYCELKARFGLRNIIADPVTFKTKSSYLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ISVVPSSFIGHLQSLMFNGLLYIDLCKNGDIDYCELKARFGLRNIIADPVTFKTKSSYLS
           830       840       850       860       870       880   

              520       530       540       550       560       570
pF1KA0 LATLQAYTSMHLFFQFKTTSPDGFILFNSGDGNDFIAVELVKGYIHYVFDLGNGPNVIKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LATLQAYTSMHLFFQFKTTSPDGFILFNSGDGNDFIAVELVKGYIHYVFDLGNGPNVIKG
           890       900       910       920       930       940   

              580       590       600       610       620       630
pF1KA0 NSDRPLNDNQWHNVVITRDNSNTHSLKVDTKVVTQVINGAKNLDLKGDLYMAGLAQGMYS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NSDRPLNDNQWHNVVITRDNSNTHSLKVDTKVVTQVINGAKNLDLKGDLYMAGLAQGMYS
           950       960       970       980       990      1000   

              640       650       660       670       680       690
pF1KA0 NLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLINDALHRSGQIKRGCEGPSTTCQEDSCANQGV
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::
XP_016 NLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLINDALHRSGQIERGCEGPSTTCQEDSCANQGV
          1010      1020      1030      1040      1050      1060   

              700       710       720       730       740       750
pF1KA0 CMQQWEGFTCDCSMTSYSGNQCNDPGATYIFGKSGGLILYTWPANDRPSTRSDRLAVGFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CMQQWEGFTCDCSMTSYSGNQCNDPGATYIFGKSGGLILYTWPANDRPSTRSDRLAVGFS
          1070      1080      1090      1100      1110      1120   

              760       770       780       790       800       810
pF1KA0 TTVKDGILVRIDSAPGLGDFLQLHIEQGKIGVVFNIGTVDISIKEERTPVNDGKYHVVRF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TTVKDGILVRIDSAPGLGDFLQLHIEQGKIGVVFNIGTVDISIKEERTPVNDGKYHVVRF
          1130      1140      1150      1160      1170      1180   

              820       830       840       850       860       870
pF1KA0 TRNGGNATLQVDNWPVNEHYPTGRQLTIFNTQAQIAIGGKDKGRLFQGQLSGLYYDGLKV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TRNGGNATLQVDNWPVNEHYPTGRQLTIFNTQAQIAIGGKDKGRLFQGQLSGLYYDGLKV
          1190      1200      1210      1220      1230      1240   

              880       890       900       910       920       930
pF1KA0 LNMAAENNPNIKINGSVRLVGEVPSILGTTQTTSMPPEMSTTVMETTTTMATTTTRKNRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LNMAAENNPNIKINGSVRLVGEVPSILGTTQTTSMPPEMSTTVMETTTTMATTTTRKNRS
          1250      1260      1270      1280      1290      1300   

              940       950       960       970       980       990
pF1KA0 TASIQPTSDDLVSSAECSSDDEDFVECEPSTANPTEPGIRRVPGASEVIRESSSTTGMVV
       :::::::::::::::::::::::::::::::                             
XP_016 TASIQPTSDDLVSSAECSSDDEDFVECEPSTDKSLSTSIFEGGYKAHAPKWESKDFRPNK
          1310      1320      1330      1340      1350      1360   

             1000      1010      1020      1030      1040      1050
pF1KA0 GIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDETRNYISNSAQSNGTLMKEKQQSSKSGHK
                                                                   
XP_016 VSETSRTTTTSLSPELIRFTASSSSGMVPKLPAGKMNNRDLKPQPDIVLLPLPTAYELDS
          1370      1380      1390      1400      1410      1420   

>--
 initn: 707 init1: 641 opt: 653  Z-score: 633.5  bits: 129.4 E(85289): 1.5e-28
Smith-Waterman score: 653; 66.3% identity (77.3% similar) in 172 aa overlap (900-1061:1370-1541)

     870       880       890       900       910       920         
pF1KA0 VLNMAAENNPNIKINGSVRLVGEVPSILGTTQTTSMPPEMSTTVMETTTTMATTTTRKNR
                                     : :::. ::.   .  ... :.      . 
XP_016 TSIFEGGYKAHAPKWESKDFRPNKVSETSRTTTTSLSPELIRFTASSSSGMVPKLPAGKM
    1340      1350      1360      1370      1380      1390         

     930           940       950             960       970         
pF1KA0 STASIQPTSD----DLVSSAECSSDD-EDFVECEP-----STANPTEPGIRRVPGASEVI
       .. ...:  :     : .. : .:   .. .   :      :::::::::::::::::::
XP_016 NNRDLKPQPDIVLLPLPTAYELDSTKLKSPLITSPMFRNVPTANPTEPGIRRVPGASEVI
    1400      1410      1420      1430      1440      1450         

     980       990      1000      1010      1020      1030         
pF1KA0 RESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDETRNYISNSAQSNGTLMK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDETRNYISNSAQSNGTLMK
    1460      1470      1480      1490      1500      1510         

    1040      1050      1060 
pF1KA0 EKQQSSKSGHKKQKNKDREYYV
       ::::::::::::::::::::::
XP_016 EKQQSSKSGHKKQKNKDREYYV
    1520      1530      1540 

>--
 initn: 269 init1: 107 opt: 270  Z-score: 262.4  bits: 60.8 E(85289): 7e-08
Smith-Waterman score: 370; 25.5% identity (56.7% similar) in 330 aa overlap (516-822:45-359)

         490       500       510       520       530        540    
pF1KA0 LKARFGLRNIIADPVTFKTKSSYLSLATLQAYTSMHLFFQFKTTSPDGFILF-NSGDGND
                                     : :   : :::::.   :..:. ..:   :
XP_016 SILLGSLLGLCLGLEFMGLPNQWARYLRWDASTRSDLSFQFKTNVSTGLLLYLDDGGVCD
           20        30        40        50        60        70    

          550       560       570       580       590       600    
pF1KA0 FIAVELVKGYIHYVFDLGNGPNVIKGNSDRPLNDNQWHNVVITRDNSNTHSLKVDTKVVT
       :. . :: : ..  :..  . ...   :.. .::..:: ....::   :  : .: .  .
XP_016 FLCLSLVDGRVQLRFSMDCAETAVL--SNKQVNDSSWHFLMVSRDRLRT-VLMLDGEGQS
           80        90         100       110       120        130 

          610        620       630         640       650       660 
pF1KA0 QVINGAKN-LDLKGDLYMAGLAQGMYSNLPKL--VASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLIND
         ..  .  .:. .::...:.   .  .   :  : .  ::.: . ..  ..  : :.. 
XP_016 GELQPQRPYMDVVSDLFLGGVPTDIRPSALTLDGVQAMPGFKGLILDLKYGNSEPRLLG-
             140       150       160       170       180       190 

             670       680       690       700       710           
pF1KA0 ALHRSGQIKRGCEGPSTTCQEDSCANQGVCMQQWEGFTCDCSMTSYSGNQCN-----DPG
           :  ..   :::   : :  : : :.:.      ::::: :.:.:. :.     :::
XP_016 ----SRGVQMDAEGP---CGERPCENGGICFLLDGHPTCDCSTTGYGGKLCSEDVSQDPG
                  200          210       220       230       240   

        720                   730       740       750       760    
pF1KA0 ATYIFG------------KSGGLILYTWPANDRPSTRSDRLAVGFSTTVKDGILVRIDSA
        ....             ...  . :    :   :. ::.....:.:  ..:....  ..
XP_016 LSHLMMSEQAREENVATFRGSEYLCYDLSQNPIQSS-SDEITLSFKTWQRNGLILHTGKS
           250       260       270        280       290       300  

          770       780         790       800       810       820  
pF1KA0 PGLGDFLQLHIEQGKIGVVFNIGT--VDISIKEERTPVNDGKYHVVRFTRNGGNATLQVD
          .:...: ...: ...:.:.:.   .  ..      ::. .: :. :::  ..:..::
XP_016 ---ADYVNLALKDGAVSLVINLGSGAFEAIVEPVNGKFNDNAWHDVKVTRNLRQVTISVD
               310       320       330       340       350         

            830       840       850       860       870       880  
pF1KA0 NWPVNEHYPTGRQLTIFNTQAQIAIGGKDKGRLFQGQLSGLYYDGLKVLNMAAENNPNIK
                                                                   
XP_016 GILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMGCLKEVVYKNNDIRLEL
     360       370       380       390       400       410         

>>XP_016877289 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 isof  (1553 aa)
 initn: 6444 init1: 6444 opt: 6444  Z-score: 6243.5  bits: 1167.5 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 6444; 99.9% identity (100.0% similar) in 961 aa overlap (1-961:386-1346)

                                             10        20        30
pF1KA0                               MLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMG
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RQHSGIGHAMVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMG
         360       370       380       390       400       410     

               40        50        60        70        80        90
pF1KA0 CLKEVVYKNNDIRLELSRLARIADTKMKIYGEVVFKCENVATLDPINFETPEAYISLPKW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CLKEVVYKNNDIRLELSRLARIADTKMKIYGEVVFKCENVATLDPINFETPEAYISLPKW
         420       430       440       450       460       470     

              100       110       120       130       140       150
pF1KA0 NTKRMGSISFDFRTTEPNGLILFTHGKPQERKDARSQKNTKVDFFAVELLDGNLYLLLDM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NTKRMGSISFDFRTTEPNGLILFTHGKPQERKDARSQKNTKVDFFAVELLDGNLYLLLDM
         480       490       500       510       520       530     

              160       170       180       190       200       210
pF1KA0 GSGTIKVKATQKKANDGEWYHVDIQRDGRSGTISVNSRRTPFTASGESEILDLEGDMYLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GSGTIKVKATQKKANDGEWYHVDIQRDGRSGTISVNSRRTPFTASGESEILDLEGDMYLG
         540       550       560       570       580       590     

              220       230       240       250       260       270
pF1KA0 GLPENRAGLILPTELWTAMLNYGYVGCIRDLFIDGRSKNIRQLAEMQNAAGVKSSCSRMS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GLPENRAGLILPTELWTAMLNYGYVGCIRDLFIDGRSKNIRQLAEMQNAAGVKSSCSRMS
         600       610       620       630       640       650     

              280       290       300       310       320       330
pF1KA0 AKQCDSYPCKNNAVCKDGWNRFICDCTGTGYWGRTCEREASILSYDGSMYMKIIMPMVMH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AKQCDSYPCKNNAVCKDGWNRFICDCTGTGYWGRTCEREASILSYDGSMYMKIIMPMVMH
         660       670       680       690       700       710     

              340       350       360       370       380       390
pF1KA0 TEAEDVSFRFMSQRAYGLLVATTSRDSADTLRLELDGGRVKLMVNLDCIRINCNSSKGPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TEAEDVSFRFMSQRAYGLLVATTSRDSADTLRLELDGGRVKLMVNLDCIRINCNSSKGPE
         720       730       740       750       760       770     

              400       410       420       430       440       450
pF1KA0 TLYAGQKLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDDVAEGTMVGDHTRLEFHNIETGIMTEKRY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TLYAGQKLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDDVAEGTMVGDHTRLEFHNIETGIMTEKRY
         780       790       800       810       820       830     

              460       470       480       490       500       510
pF1KA0 ISVVPSSFIGHLQSLMFNGLLYIDLCKNGDIDYCELKARFGLRNIIADPVTFKTKSSYLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ISVVPSSFIGHLQSLMFNGLLYIDLCKNGDIDYCELKARFGLRNIIADPVTFKTKSSYLS
         840       850       860       870       880       890     

              520       530       540       550       560       570
pF1KA0 LATLQAYTSMHLFFQFKTTSPDGFILFNSGDGNDFIAVELVKGYIHYVFDLGNGPNVIKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LATLQAYTSMHLFFQFKTTSPDGFILFNSGDGNDFIAVELVKGYIHYVFDLGNGPNVIKG
         900       910       920       930       940       950     

              580       590       600       610       620       630
pF1KA0 NSDRPLNDNQWHNVVITRDNSNTHSLKVDTKVVTQVINGAKNLDLKGDLYMAGLAQGMYS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NSDRPLNDNQWHNVVITRDNSNTHSLKVDTKVVTQVINGAKNLDLKGDLYMAGLAQGMYS
         960       970       980       990      1000      1010     

              640       650       660       670       680       690
pF1KA0 NLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLINDALHRSGQIKRGCEGPSTTCQEDSCANQGV
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::
XP_016 NLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLINDALHRSGQIERGCEGPSTTCQEDSCANQGV
        1020      1030      1040      1050      1060      1070     

              700       710       720       730       740       750
pF1KA0 CMQQWEGFTCDCSMTSYSGNQCNDPGATYIFGKSGGLILYTWPANDRPSTRSDRLAVGFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CMQQWEGFTCDCSMTSYSGNQCNDPGATYIFGKSGGLILYTWPANDRPSTRSDRLAVGFS
        1080      1090      1100      1110      1120      1130     

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pF1KA0 TTVKDGILVRIDSAPGLGDFLQLHIEQGKIGVVFNIGTVDISIKEERTPVNDGKYHVVRF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TTVKDGILVRIDSAPGLGDFLQLHIEQGKIGVVFNIGTVDISIKEERTPVNDGKYHVVRF
        1140      1150      1160      1170      1180      1190     

              820       830       840       850       860       870
pF1KA0 TRNGGNATLQVDNWPVNEHYPTGRQLTIFNTQAQIAIGGKDKGRLFQGQLSGLYYDGLKV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TRNGGNATLQVDNWPVNEHYPTGRQLTIFNTQAQIAIGGKDKGRLFQGQLSGLYYDGLKV
        1200      1210      1220      1230      1240      1250     

              880       890       900       910       920       930
pF1KA0 LNMAAENNPNIKINGSVRLVGEVPSILGTTQTTSMPPEMSTTVMETTTTMATTTTRKNRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LNMAAENNPNIKINGSVRLVGEVPSILGTTQTTSMPPEMSTTVMETTTTMATTTTRKNRS
        1260      1270      1280      1290      1300      1310     

              940       950       960       970       980       990
pF1KA0 TASIQPTSDDLVSSAECSSDDEDFVECEPSTANPTEPGIRRVPGASEVIRESSSTTGMVV
       :::::::::::::::::::::::::::::::                             
XP_016 TASIQPTSDDLVSSAECSSDDEDFVECEPSTDKSLSTSIFEGGYKAHAPKWESKDFRPNK
        1320      1330      1340      1350      1360      1370     

             1000      1010      1020      1030      1040      1050
pF1KA0 GIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDETRNYISNSAQSNGTLMKEKQQSSKSGHK
                                                                   
XP_016 VSETSRTTTTSLSPELIRFTASSSSGMVPKLPAGKMNNRDLKPQPDIVLLPLPTAYELDS
        1380      1390      1400      1410      1420      1430     

>--
 initn: 707 init1: 641 opt: 653  Z-score: 633.4  bits: 129.4 E(85289): 1.5e-28
Smith-Waterman score: 653; 66.3% identity (77.3% similar) in 172 aa overlap (900-1061:1382-1553)

     870       880       890       900       910       920         
pF1KA0 VLNMAAENNPNIKINGSVRLVGEVPSILGTTQTTSMPPEMSTTVMETTTTMATTTTRKNR
                                     : :::. ::.   .  ... :.      . 
XP_016 TSIFEGGYKAHAPKWESKDFRPNKVSETSRTTTTSLSPELIRFTASSSSGMVPKLPAGKM
            1360      1370      1380      1390      1400      1410 

     930           940       950             960       970         
pF1KA0 STASIQPTSD----DLVSSAECSSDD-EDFVECEP-----STANPTEPGIRRVPGASEVI
       .. ...:  :     : .. : .:   .. .   :      :::::::::::::::::::
XP_016 NNRDLKPQPDIVLLPLPTAYELDSTKLKSPLITSPMFRNVPTANPTEPGIRRVPGASEVI
            1420      1430      1440      1450      1460      1470 

     980       990      1000      1010      1020      1030         
pF1KA0 RESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDETRNYISNSAQSNGTLMK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDETRNYISNSAQSNGTLMK
            1480      1490      1500      1510      1520      1530 

    1040      1050      1060 
pF1KA0 EKQQSSKSGHKKQKNKDREYYV
       ::::::::::::::::::::::
XP_016 EKQQSSKSGHKKQKNKDREYYV
            1540      1550   

>--
 initn: 263 init1: 117 opt: 253  Z-score: 245.9  bits: 57.7 E(85289): 5.8e-07
Smith-Waterman score: 358; 25.3% identity (56.2% similar) in 324 aa overlap (516-813:45-354)

         490       500       510       520       530        540    
pF1KA0 LKARFGLRNIIADPVTFKTKSSYLSLATLQAYTSMHLFFQFKTTSPDGFILF-NSGDGND
                                     : :   : :::::.   :..:. ..:   :
XP_016 SILLGSLLGLCLGLEFMGLPNQWARYLRWDASTRSDLSFQFKTNVSTGLLLYLDDGGVCD
           20        30        40        50        60        70    

          550       560       570       580       590       600    
pF1KA0 FIAVELVKGYIHYVFDLGNGPNVIKGNSDRPLNDNQWHNVVITRDNSNTHSLKVDTKVVT
       :. . :: : ..  :..  . ... .:  . .::..:: ....::   :  : .: .  .
XP_016 FLCLSLVDGRVQLRFSMDCAETAVLSN--KQVNDSSWHFLMVSRDRLRT-VLMLDGEGQS
           80        90       100         110       120        130 

          610        620       630         640       650       660 
pF1KA0 QVINGAKN-LDLKGDLYMAGLAQGMYSNLPKL--VASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLIND
         ..  .  .:. .::...:.   .  .   :  : .  ::.: . ..  ..  : :.. 
XP_016 GELQPQRPYMDVVSDLFLGGVPTDIRPSALTLDGVQAMPGFKGLILDLKYGNSEPRLLG-
             140       150       160       170       180       190 

             670       680       690       700       710           
pF1KA0 ALHRSGQIKRGCEGPSTTCQEDSCANQGVCMQQWEGFTCDCSMTSYSGNQCN-----DPG
           :  ..   :::   : :  : : :.:.      ::::: :.:.:. :.     :::
XP_016 ----SRGVQMDAEGP---CGERPCENGGICFLLDGHPTCDCSTTGYGGKLCSEDVSQDPG
                  200          210       220       230       240   

        720                     730        740       750       760 
pF1KA0 ATYIF----GKSG----------GLILYTWPANDRP-STRSDRLAVGFSTTVKDGILVRI
        ....    :.:           :     .  .. : .. ::.....:.:  ..:.... 
XP_016 LSHLMMSEQGRSKAREENVATFRGSEYLCYDLSQNPIQSSSDEITLSFKTWQRNGLILHT
           250       260       270       280       290       300   

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pF1KA0 DSAPGLGDFLQLHIEQGKIGVVFNIGT--VDISIKEERTPVNDGKYHVVRFTRNGGNATL
        ..   .:...: ...: ...:.:.:.   .  ..      ::. .: :. :::      
XP_016 GKS---ADYVNLALKDGAVSLVINLGSGAFEAIVEPVNGKFNDNAWHDVKVTRNLRQHSG
              310       320       330       340       350       360

     820       830       840       850       860       870         
pF1KA0 QVDNWPVNEHYPTGRQLTIFNTQAQIAIGGKDKGRLFQGQLSGLYYDGLKVLNMAAENNP
                                                                   
XP_016 IGHAMVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMGCLKEV
              370       380       390       400       410       420

>>XP_016877288 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 isof  (1654 aa)
 initn: 6444 init1: 6444 opt: 6444  Z-score: 6243.1  bits: 1167.5 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 6444; 99.9% identity (100.0% similar) in 961 aa overlap (1-961:386-1346)

                                             10        20        30
pF1KA0                               MLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMG
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RQHSGIGHAMVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMG
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               40        50        60        70        80        90
pF1KA0 CLKEVVYKNNDIRLELSRLARIADTKMKIYGEVVFKCENVATLDPINFETPEAYISLPKW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CLKEVVYKNNDIRLELSRLARIADTKMKIYGEVVFKCENVATLDPINFETPEAYISLPKW
         420       430       440       450       460       470     

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pF1KA0 NTKRMGSISFDFRTTEPNGLILFTHGKPQERKDARSQKNTKVDFFAVELLDGNLYLLLDM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NTKRMGSISFDFRTTEPNGLILFTHGKPQERKDARSQKNTKVDFFAVELLDGNLYLLLDM
         480       490       500       510       520       530     

              160       170       180       190       200       210
pF1KA0 GSGTIKVKATQKKANDGEWYHVDIQRDGRSGTISVNSRRTPFTASGESEILDLEGDMYLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GSGTIKVKATQKKANDGEWYHVDIQRDGRSGTISVNSRRTPFTASGESEILDLEGDMYLG
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              220       230       240       250       260       270
pF1KA0 GLPENRAGLILPTELWTAMLNYGYVGCIRDLFIDGRSKNIRQLAEMQNAAGVKSSCSRMS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GLPENRAGLILPTELWTAMLNYGYVGCIRDLFIDGRSKNIRQLAEMQNAAGVKSSCSRMS
         600       610       620       630       640       650     

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pF1KA0 AKQCDSYPCKNNAVCKDGWNRFICDCTGTGYWGRTCEREASILSYDGSMYMKIIMPMVMH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AKQCDSYPCKNNAVCKDGWNRFICDCTGTGYWGRTCEREASILSYDGSMYMKIIMPMVMH
         660       670       680       690       700       710     

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pF1KA0 TEAEDVSFRFMSQRAYGLLVATTSRDSADTLRLELDGGRVKLMVNLDCIRINCNSSKGPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TEAEDVSFRFMSQRAYGLLVATTSRDSADTLRLELDGGRVKLMVNLDCIRINCNSSKGPE
         720       730       740       750       760       770     

              400       410       420       430       440       450
pF1KA0 TLYAGQKLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDDVAEGTMVGDHTRLEFHNIETGIMTEKRY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TLYAGQKLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDDVAEGTMVGDHTRLEFHNIETGIMTEKRY
         780       790       800       810       820       830     

              460       470       480       490       500       510
pF1KA0 ISVVPSSFIGHLQSLMFNGLLYIDLCKNGDIDYCELKARFGLRNIIADPVTFKTKSSYLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ISVVPSSFIGHLQSLMFNGLLYIDLCKNGDIDYCELKARFGLRNIIADPVTFKTKSSYLS
         840       850       860       870       880       890     

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pF1KA0 LATLQAYTSMHLFFQFKTTSPDGFILFNSGDGNDFIAVELVKGYIHYVFDLGNGPNVIKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LATLQAYTSMHLFFQFKTTSPDGFILFNSGDGNDFIAVELVKGYIHYVFDLGNGPNVIKG
         900       910       920       930       940       950     

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pF1KA0 NSDRPLNDNQWHNVVITRDNSNTHSLKVDTKVVTQVINGAKNLDLKGDLYMAGLAQGMYS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NSDRPLNDNQWHNVVITRDNSNTHSLKVDTKVVTQVINGAKNLDLKGDLYMAGLAQGMYS
         960       970       980       990      1000      1010     

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pF1KA0 NLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLINDALHRSGQIKRGCEGPSTTCQEDSCANQGV
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::
XP_016 NLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLINDALHRSGQIERGCEGPSTTCQEDSCANQGV
        1020      1030      1040      1050      1060      1070     

              700       710       720       730       740       750
pF1KA0 CMQQWEGFTCDCSMTSYSGNQCNDPGATYIFGKSGGLILYTWPANDRPSTRSDRLAVGFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CMQQWEGFTCDCSMTSYSGNQCNDPGATYIFGKSGGLILYTWPANDRPSTRSDRLAVGFS
        1080      1090      1100      1110      1120      1130     

              760       770       780       790       800       810
pF1KA0 TTVKDGILVRIDSAPGLGDFLQLHIEQGKIGVVFNIGTVDISIKEERTPVNDGKYHVVRF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TTVKDGILVRIDSAPGLGDFLQLHIEQGKIGVVFNIGTVDISIKEERTPVNDGKYHVVRF
        1140      1150      1160      1170      1180      1190     

              820       830       840       850       860       870
pF1KA0 TRNGGNATLQVDNWPVNEHYPTGRQLTIFNTQAQIAIGGKDKGRLFQGQLSGLYYDGLKV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TRNGGNATLQVDNWPVNEHYPTGRQLTIFNTQAQIAIGGKDKGRLFQGQLSGLYYDGLKV
        1200      1210      1220      1230      1240      1250     

              880       890       900       910       920       930
pF1KA0 LNMAAENNPNIKINGSVRLVGEVPSILGTTQTTSMPPEMSTTVMETTTTMATTTTRKNRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LNMAAENNPNIKINGSVRLVGEVPSILGTTQTTSMPPEMSTTVMETTTTMATTTTRKNRS
        1260      1270      1280      1290      1300      1310     

              940       950       960       970       980       990
pF1KA0 TASIQPTSDDLVSSAECSSDDEDFVECEPSTANPTEPGIRRVPGASEVIRESSSTTGMVV
       :::::::::::::::::::::::::::::::                             
XP_016 TASIQPTSDDLVSSAECSSDDEDFVECEPSTGGELVIPLLVEDPLATPPIATRAPSITLP
        1320      1330      1340      1350      1360      1370     

             1000      1010      1020      1030      1040      1050
pF1KA0 GIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDETRNYISNSAQSNGTLMKEKQQSSKSGHK
                                                                   
XP_016 PTFRPLLTIIETTKDSLSMTSEAGLPCLSDQGSDGCDDDGLVISGYGSGETFDSNLPPTD
        1380      1390      1400      1410      1420      1430     

>--
 initn: 688 init1: 641 opt: 653  Z-score: 633.0  bits: 129.5 E(85289): 1.6e-28
Smith-Waterman score: 653; 66.3% identity (77.3% similar) in 172 aa overlap (900-1061:1483-1654)

     870       880       890       900       910       920         
pF1KA0 VLNMAAENNPNIKINGSVRLVGEVPSILGTTQTTSMPPEMSTTVMETTTTMATTTTRKNR
                                     : :::. ::.   .  ... :.      . 
XP_016 TSIFEGGYKAHAPKWESKDFRPNKVSETSRTTTTSLSPELIRFTASSSSGMVPKLPAGKM
           1460      1470      1480      1490      1500      1510  

     930           940       950             960       970         
pF1KA0 STASIQPTSD----DLVSSAECSSDD-EDFVECEP-----STANPTEPGIRRVPGASEVI
       .. ...:  :     : .. : .:   .. .   :      :::::::::::::::::::
XP_016 NNRDLKPQPDIVLLPLPTAYELDSTKLKSPLITSPMFRNVPTANPTEPGIRRVPGASEVI
           1520      1530      1540      1550      1560      1570  

     980       990      1000      1010      1020      1030         
pF1KA0 RESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDETRNYISNSAQSNGTLMK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDETRNYISNSAQSNGTLMK
           1580      1590      1600      1610      1620      1630  

    1040      1050      1060 
pF1KA0 EKQQSSKSGHKKQKNKDREYYV
       ::::::::::::::::::::::
XP_016 EKQQSSKSGHKKQKNKDREYYV
           1640      1650    

>--
 initn: 263 init1: 117 opt: 253  Z-score: 245.5  bits: 57.8 E(85289): 6.2e-07
Smith-Waterman score: 358; 25.3% identity (56.2% similar) in 324 aa overlap (516-813:45-354)

         490       500       510       520       530        540    
pF1KA0 LKARFGLRNIIADPVTFKTKSSYLSLATLQAYTSMHLFFQFKTTSPDGFILF-NSGDGND
                                     : :   : :::::.   :..:. ..:   :
XP_016 SILLGSLLGLCLGLEFMGLPNQWARYLRWDASTRSDLSFQFKTNVSTGLLLYLDDGGVCD
           20        30        40        50        60        70    

          550       560       570       580       590       600    
pF1KA0 FIAVELVKGYIHYVFDLGNGPNVIKGNSDRPLNDNQWHNVVITRDNSNTHSLKVDTKVVT
       :. . :: : ..  :..  . ... .:  . .::..:: ....::   :  : .: .  .
XP_016 FLCLSLVDGRVQLRFSMDCAETAVLSN--KQVNDSSWHFLMVSRDRLRT-VLMLDGEGQS
           80        90       100         110       120        130 

          610        620       630         640       650       660 
pF1KA0 QVINGAKN-LDLKGDLYMAGLAQGMYSNLPKL--VASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLIND
         ..  .  .:. .::...:.   .  .   :  : .  ::.: . ..  ..  : :.. 
XP_016 GELQPQRPYMDVVSDLFLGGVPTDIRPSALTLDGVQAMPGFKGLILDLKYGNSEPRLLG-
             140       150       160       170       180       190 

             670       680       690       700       710           
pF1KA0 ALHRSGQIKRGCEGPSTTCQEDSCANQGVCMQQWEGFTCDCSMTSYSGNQCN-----DPG
           :  ..   :::   : :  : : :.:.      ::::: :.:.:. :.     :::
XP_016 ----SRGVQMDAEGP---CGERPCENGGICFLLDGHPTCDCSTTGYGGKLCSEDVSQDPG
                  200          210       220       230       240   

        720                     730        740       750       760 
pF1KA0 ATYIF----GKSG----------GLILYTWPANDRP-STRSDRLAVGFSTTVKDGILVRI
        ....    :.:           :     .  .. : .. ::.....:.:  ..:.... 
XP_016 LSHLMMSEQGRSKAREENVATFRGSEYLCYDLSQNPIQSSSDEITLSFKTWQRNGLILHT
           250       260       270       280       290       300   

             770       780         790       800       810         
pF1KA0 DSAPGLGDFLQLHIEQGKIGVVFNIGT--VDISIKEERTPVNDGKYHVVRFTRNGGNATL
        ..   .:...: ...: ...:.:.:.   .  ..      ::. .: :. :::      
XP_016 GKS---ADYVNLALKDGAVSLVINLGSGAFEAIVEPVNGKFNDNAWHDVKVTRNLRQHSG
              310       320       330       340       350       360

     820       830       840       850       860       870         
pF1KA0 QVDNWPVNEHYPTGRQLTIFNTQAQIAIGGKDKGRLFQGQLSGLYYDGLKVLNMAAENNP
                                                                   
XP_016 IGHAMVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMGCLKEV
              370       380       390       400       410       420

>>XP_011535669 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 isof  (1657 aa)
 initn: 6444 init1: 6444 opt: 6444  Z-score: 6243.1  bits: 1167.5 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 6444; 99.9% identity (100.0% similar) in 961 aa overlap (1-961:386-1346)

                                             10        20        30
pF1KA0                               MLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMG
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RQHSGIGHAMVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMG
         360       370       380       390       400       410     

               40        50        60        70        80        90
pF1KA0 CLKEVVYKNNDIRLELSRLARIADTKMKIYGEVVFKCENVATLDPINFETPEAYISLPKW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CLKEVVYKNNDIRLELSRLARIADTKMKIYGEVVFKCENVATLDPINFETPEAYISLPKW
         420       430       440       450       460       470     

              100       110       120       130       140       150
pF1KA0 NTKRMGSISFDFRTTEPNGLILFTHGKPQERKDARSQKNTKVDFFAVELLDGNLYLLLDM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NTKRMGSISFDFRTTEPNGLILFTHGKPQERKDARSQKNTKVDFFAVELLDGNLYLLLDM
         480       490       500       510       520       530     

              160       170       180       190       200       210
pF1KA0 GSGTIKVKATQKKANDGEWYHVDIQRDGRSGTISVNSRRTPFTASGESEILDLEGDMYLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GSGTIKVKATQKKANDGEWYHVDIQRDGRSGTISVNSRRTPFTASGESEILDLEGDMYLG
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              220       230       240       250       260       270
pF1KA0 GLPENRAGLILPTELWTAMLNYGYVGCIRDLFIDGRSKNIRQLAEMQNAAGVKSSCSRMS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GLPENRAGLILPTELWTAMLNYGYVGCIRDLFIDGRSKNIRQLAEMQNAAGVKSSCSRMS
         600       610       620       630       640       650     

              280       290       300       310       320       330
pF1KA0 AKQCDSYPCKNNAVCKDGWNRFICDCTGTGYWGRTCEREASILSYDGSMYMKIIMPMVMH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AKQCDSYPCKNNAVCKDGWNRFICDCTGTGYWGRTCEREASILSYDGSMYMKIIMPMVMH
         660       670       680       690       700       710     

              340       350       360       370       380       390
pF1KA0 TEAEDVSFRFMSQRAYGLLVATTSRDSADTLRLELDGGRVKLMVNLDCIRINCNSSKGPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TEAEDVSFRFMSQRAYGLLVATTSRDSADTLRLELDGGRVKLMVNLDCIRINCNSSKGPE
         720       730       740       750       760       770     

              400       410       420       430       440       450
pF1KA0 TLYAGQKLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDDVAEGTMVGDHTRLEFHNIETGIMTEKRY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TLYAGQKLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDDVAEGTMVGDHTRLEFHNIETGIMTEKRY
         780       790       800       810       820       830     

              460       470       480       490       500       510
pF1KA0 ISVVPSSFIGHLQSLMFNGLLYIDLCKNGDIDYCELKARFGLRNIIADPVTFKTKSSYLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ISVVPSSFIGHLQSLMFNGLLYIDLCKNGDIDYCELKARFGLRNIIADPVTFKTKSSYLS
         840       850       860       870       880       890     

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pF1KA0 LATLQAYTSMHLFFQFKTTSPDGFILFNSGDGNDFIAVELVKGYIHYVFDLGNGPNVIKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LATLQAYTSMHLFFQFKTTSPDGFILFNSGDGNDFIAVELVKGYIHYVFDLGNGPNVIKG
         900       910       920       930       940       950     

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pF1KA0 NSDRPLNDNQWHNVVITRDNSNTHSLKVDTKVVTQVINGAKNLDLKGDLYMAGLAQGMYS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NSDRPLNDNQWHNVVITRDNSNTHSLKVDTKVVTQVINGAKNLDLKGDLYMAGLAQGMYS
         960       970       980       990      1000      1010     

              640       650       660       670       680       690
pF1KA0 NLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLINDALHRSGQIKRGCEGPSTTCQEDSCANQGV
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::
XP_011 NLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLINDALHRSGQIERGCEGPSTTCQEDSCANQGV
        1020      1030      1040      1050      1060      1070     

              700       710       720       730       740       750
pF1KA0 CMQQWEGFTCDCSMTSYSGNQCNDPGATYIFGKSGGLILYTWPANDRPSTRSDRLAVGFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CMQQWEGFTCDCSMTSYSGNQCNDPGATYIFGKSGGLILYTWPANDRPSTRSDRLAVGFS
        1080      1090      1100      1110      1120      1130     

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pF1KA0 TTVKDGILVRIDSAPGLGDFLQLHIEQGKIGVVFNIGTVDISIKEERTPVNDGKYHVVRF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TTVKDGILVRIDSAPGLGDFLQLHIEQGKIGVVFNIGTVDISIKEERTPVNDGKYHVVRF
        1140      1150      1160      1170      1180      1190     

              820       830       840       850       860       870
pF1KA0 TRNGGNATLQVDNWPVNEHYPTGRQLTIFNTQAQIAIGGKDKGRLFQGQLSGLYYDGLKV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TRNGGNATLQVDNWPVNEHYPTGRQLTIFNTQAQIAIGGKDKGRLFQGQLSGLYYDGLKV
        1200      1210      1220      1230      1240      1250     

              880       890       900       910       920       930
pF1KA0 LNMAAENNPNIKINGSVRLVGEVPSILGTTQTTSMPPEMSTTVMETTTTMATTTTRKNRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LNMAAENNPNIKINGSVRLVGEVPSILGTTQTTSMPPEMSTTVMETTTTMATTTTRKNRS
        1260      1270      1280      1290      1300      1310     

              940       950       960       970       980       990
pF1KA0 TASIQPTSDDLVSSAECSSDDEDFVECEPSTANPTEPGIRRVPGASEVIRESSSTTGMVV
       :::::::::::::::::::::::::::::::                             
XP_011 TASIQPTSDDLVSSAECSSDDEDFVECEPSTGRSGGELVIPLLVEDPLATPPIATRAPSI
        1320      1330      1340      1350      1360      1370     

             1000      1010      1020      1030      1040      1050
pF1KA0 GIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDETRNYISNSAQSNGTLMKEKQQSSKSGHK
                                                                   
XP_011 TLPPTFRPLLTIIETTKDSLSMTSEAGLPCLSDQGSDGCDDDGLVISGYGSGETFDSNLP
        1380      1390      1400      1410      1420      1430     

>--
 initn: 691 init1: 641 opt: 653  Z-score: 633.0  bits: 129.5 E(85289): 1.6e-28
Smith-Waterman score: 653; 66.3% identity (77.3% similar) in 172 aa overlap (900-1061:1486-1657)

     870       880       890       900       910       920         
pF1KA0 VLNMAAENNPNIKINGSVRLVGEVPSILGTTQTTSMPPEMSTTVMETTTTMATTTTRKNR
                                     : :::. ::.   .  ... :.      . 
XP_011 TSIFEGGYKAHAPKWESKDFRPNKVSETSRTTTTSLSPELIRFTASSSSGMVPKLPAGKM
        1460      1470      1480      1490      1500      1510     

     930           940       950             960       970         
pF1KA0 STASIQPTSD----DLVSSAECSSDD-EDFVECEP-----STANPTEPGIRRVPGASEVI
       .. ...:  :     : .. : .:   .. .   :      :::::::::::::::::::
XP_011 NNRDLKPQPDIVLLPLPTAYELDSTKLKSPLITSPMFRNVPTANPTEPGIRRVPGASEVI
        1520      1530      1540      1550      1560      1570     

     980       990      1000      1010      1020      1030         
pF1KA0 RESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDETRNYISNSAQSNGTLMK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDETRNYISNSAQSNGTLMK
        1580      1590      1600      1610      1620      1630     

    1040      1050      1060 
pF1KA0 EKQQSSKSGHKKQKNKDREYYV
       ::::::::::::::::::::::
XP_011 EKQQSSKSGHKKQKNKDREYYV
        1640      1650       

>--
 initn: 263 init1: 117 opt: 253  Z-score: 245.5  bits: 57.8 E(85289): 6.2e-07
Smith-Waterman score: 358; 25.3% identity (56.2% similar) in 324 aa overlap (516-813:45-354)

         490       500       510       520       530        540    
pF1KA0 LKARFGLRNIIADPVTFKTKSSYLSLATLQAYTSMHLFFQFKTTSPDGFILF-NSGDGND
                                     : :   : :::::.   :..:. ..:   :
XP_011 SILLGSLLGLCLGLEFMGLPNQWARYLRWDASTRSDLSFQFKTNVSTGLLLYLDDGGVCD
           20        30        40        50        60        70    

          550       560       570       580       590       600    
pF1KA0 FIAVELVKGYIHYVFDLGNGPNVIKGNSDRPLNDNQWHNVVITRDNSNTHSLKVDTKVVT
       :. . :: : ..  :..  . ... .:  . .::..:: ....::   :  : .: .  .
XP_011 FLCLSLVDGRVQLRFSMDCAETAVLSN--KQVNDSSWHFLMVSRDRLRT-VLMLDGEGQS
           80        90       100         110       120        130 

          610        620       630         640       650       660 
pF1KA0 QVINGAKN-LDLKGDLYMAGLAQGMYSNLPKL--VASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLIND
         ..  .  .:. .::...:.   .  .   :  : .  ::.: . ..  ..  : :.. 
XP_011 GELQPQRPYMDVVSDLFLGGVPTDIRPSALTLDGVQAMPGFKGLILDLKYGNSEPRLLG-
             140       150       160       170       180       190 

             670       680       690       700       710           
pF1KA0 ALHRSGQIKRGCEGPSTTCQEDSCANQGVCMQQWEGFTCDCSMTSYSGNQCN-----DPG
           :  ..   :::   : :  : : :.:.      ::::: :.:.:. :.     :::
XP_011 ----SRGVQMDAEGP---CGERPCENGGICFLLDGHPTCDCSTTGYGGKLCSEDVSQDPG
                  200          210       220       230       240   

        720                     730        740       750       760 
pF1KA0 ATYIF----GKSG----------GLILYTWPANDRP-STRSDRLAVGFSTTVKDGILVRI
        ....    :.:           :     .  .. : .. ::.....:.:  ..:.... 
XP_011 LSHLMMSEQGRSKAREENVATFRGSEYLCYDLSQNPIQSSSDEITLSFKTWQRNGLILHT
           250       260       270       280       290       300   

             770       780         790       800       810         
pF1KA0 DSAPGLGDFLQLHIEQGKIGVVFNIGT--VDISIKEERTPVNDGKYHVVRFTRNGGNATL
        ..   .:...: ...: ...:.:.:.   .  ..      ::. .: :. :::      
XP_011 GKS---ADYVNLALKDGAVSLVINLGSGAFEAIVEPVNGKFNDNAWHDVKVTRNLRQHSG
              310       320       330       340       350       360

     820       830       840       850       860       870         
pF1KA0 QVDNWPVNEHYPTGRQLTIFNTQAQIAIGGKDKGRLFQGQLSGLYYDGLKVLNMAAENNP
                                                                   
XP_011 IGHAMVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMGCLKEV
              370       380       390       400       410       420

>>XP_016860816 (OMIM: 600565,614325,614332) PREDICTED: n  (1466 aa)
 initn: 3091 init1: 2591 opt: 5646  Z-score: 5470.8  bits: 1024.4 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 5646; 76.8% identity (92.3% similar) in 1068 aa overlap (1-1061:399-1466)

                                             10        20        30
pF1KA0                               MLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMG
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DVKVTRNLRQVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMG
      370       380       390       400       410       420        

               40        50        60        70        80        90
pF1KA0 CLKEVVYKNNDIRLELSRLARIADTKMKIYGEVVFKCENVATLDPINFETPEAYISLPKW
       :::::::::::.::::::::. .: ::::.: :.::::::::::::.:::::..::::::
XP_016 CLKEVVYKNNDVRLELSRLAKQGDPKMKIHGVVAFKCENVATLDPITFETPESFISLPKW
      430       440       450       460       470       480        

              100       110       120       130       140       150
pF1KA0 NTKRMGSISFDFRTTEPNGLILFTHGKPQERKDARSQKNTKVDFFAVELLDGNLYLLLDM
       :.:. ::::::::::::::::::.::::...:::.  .  ::::::.:.:::.:::::::
XP_016 NAKKTGSISFDFRTTEPNGLILFSHGKPRHQKDAKHPQMIKVDFFAIEMLDGHLYLLLDM
      490       500       510       520       530       540        

              160       170       180       190       200       210
pF1KA0 GSGTIKVKATQKKANDGEWYHVDIQRDGRSGTISVNSRRTPFTASGESEILDLEGDMYLG
       ::::::.::  ::.:::::::::.::::::::::::. :::.:: ::::::::. ..:::
XP_016 GSGTIKIKALLKKVNDGEWYHVDFQRDGRSGTISVNTLRTPYTAPGESEILDLDDELYLG
      550       560       570       580       590       600        

              220       230       240       250       260       270
pF1KA0 GLPENRAGLILPTELWTAMLNYGYVGCIRDLFIDGRSKNIRQLAEMQNAAGVKSSCSRMS
       :::::.:::..:::.:::.::::::::::::::::.::.:::.::.:..:::: :::. .
XP_016 GLPENKAGLVFPTEVWTALLNYGYVGCIRDLFIDGQSKDIRQMAEVQSTAGVKPSCSKET
      610       620       630       640       650       660        

              280       290       300       310       320       330
pF1KA0 AKQCDSYPCKNNAVCKDGWNRFICDCTGTGYWGRTCEREASILSYDGSMYMKIIMPMVMH
       :: : : :::::..:.:::::..:::.:::: ::.:::::..:::::::.::: .:.:::
XP_016 AKPCLSNPCKNNGMCRDGWNRYVCDCSGTGYLGRSCEREATVLSYDGSMFMKIQLPVVMH
      670       680       690       700       710       720        

              340       350       360       370       380       390
pF1KA0 TEAEDVSFRFMSQRAYGLLVATTSRDSADTLRLELDGGRVKLMVNLDCIRINCNSSKGPE
       :::::::.:: ::::::.:.::::::::::::::::.::::: :::::::::::::::::
XP_016 TEAEDVSLRFRSQRAYGILMATTSRDSADTLRLELDAGRVKLTVNLDCIRINCNSSKGPE
      730       740       750       760       770       780        

              400       410       420        430       440         
pF1KA0 TLYAGQKLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDDVA-EGTMVGDHTRLEFHNIETGIMTEKR
       ::.:: .::::::::::::::::::::::::. :  : :.:::::::::::::::.::.:
XP_016 TLFAGYNLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDQQAMTGQMAGDHTRLEFHNIETGIITERR
      790       800       810       820       830       840        

     450       460       470       480       490       500         
pF1KA0 YISVVPSSFIGHLQSLMFNGLLYIDLCKNGDIDYCELKARFGLRNIIADPVTFKTKSSYL
       :.: :::.:::::::: :::. :::::::::::::::.::::.::::::::::::::::.
XP_016 YLSSVPSNFIGHLQSLTFNGMAYIDLCKNGDIDYCELNARFGFRNIIADPVTFKTKSSYV
      850       860       870       880       890       900        

     510       520       530       540       550       560         
pF1KA0 SLATLQAYTSMHLFFQFKTTSPDGFILFNSGDGNDFIAVELVKGYIHYVFDLGNGPNVIK
       .:::::::::::::::::::: ::.::.:::::::::.:::::::.::::::::: :.::
XP_016 ALATLQAYTSMHLFFQFKTTSLDGLILYNSGDGNDFIVVELVKGYLHYVFDLGNGANLIK
      910       920       930       940       950       960        

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pF1KA0 GNSDRPLNDNQWHNVVITRDNSNTHSLKVDTKVVTQVINGAKNLDLKGDLYMAGLAQGMY
       :.:..::::::::::.:.::.:: :..:.:::..::.  ::.:::::.:::..:.:.  :
XP_016 GSSNKPLNDNQWHNVMISRDTSNLHTVKIDTKITTQITAGARNLDLKSDLYIGGVAKETY
      970       980       990      1000      1010      1020        

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pF1KA0 SNLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLINDALHRSGQIKRGCEGPSTTCQEDSCANQG
       ..::::: ...:::::::::::::::::::.:::  .:::.:::::::::::::::.:::
XP_016 KSLPKLVHAKEGFQGCLASVDLNGRLPDLISDALFCNGQIERGCEGPSTTCQEDSCSNQG
     1030      1040      1050      1060      1070      1080        

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pF1KA0 VCMQQWEGFTCDCSMTSYSGNQCNDPGATYIFGKSGGLILYTWPANDRPSTRSDRLAVGF
       ::.:::.::.:::::::.::  :::::.::::.:.:: : : :: :::::::.::::.::
XP_016 VCLQQWDGFSCDCSMTSFSGPLCNDPGTTYIFSKGGGQITYKWPPNDRPSTRADRLAIGF
     1090      1100      1110      1120      1130      1140        

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pF1KA0 STTVKDGILVRIDSAPGLGDFLQLHIEQGKIGVVFNIGTVDISIKEERTPVNDGKYHVVR
       ::. :...:::.::. ::::.:.:::.:::::: ::.:: ::.:.:  . .:::::::::
XP_016 STVQKEAVLVRVDSSSGLGDYLELHIHQGKIGVKFNVGTDDIAIEESNAIINDGKYHVVR
     1150      1160      1170      1180      1190      1200        

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pF1KA0 FTRNGGNATLQVDNWPVNEHYPTGRQLTIFNTQAQIAIGGKDKGRLFQGQLSGLYYDGLK
       :::.:::::::::.::: :.::.::::::::.:: : ::::..:. ::::::::::.:::
XP_016 FTRSGGNATLQVDSWPVIERYPAGRQLTIFNSQATIIIGGKEQGQPFQGQLSGLYYNGLK
     1210      1220      1230      1240      1250      1260        

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pF1KA0 VLNMAAENNPNIKINGSVRLVGEVPSILGTTQT-TSMPPEMSTTVMETTTTMATTTTRKN
       ::::::::. :: : :.::::::::: . : .: :.:  ::::..::::::.::.:.:..
XP_016 VLNMAAENDANIAIVGNVRLVGEVPSSMTTESTATAMQSEMSTSIMETTTTLATSTARRG
     1270      1280      1290      1300      1310      1320        

        930       940        950       960       970        980    
pF1KA0 R--STASIQPTSDD-LVSSAECSSDDEDFVECEPSTANPTEPGIRR-VPGASEVIRESSS
       .  .   :. :.:: ::.:::: :::::.  ::::.::::. : :.  ::..::::::::
XP_016 KPPTKEPISQTTDDILVASAECPSDDEDIDPCEPSSANPTRAGGREPYPGSAEVIRESSS
     1330      1340      1350      1360      1370      1380        

          990      1000      1010      1020      1030      1040    
pF1KA0 TTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDETRNYISNSAQSNGTLMKEKQQS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.::::::::::::...:::: :
XP_016 TTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYHVDESRNYISNSAQSNGAVVKEKQPS
     1390      1400      1410      1420      1430      1440        

          1050      1060 
pF1KA0 S-KSGHKKQKNKDREYYV
       : ::..:..::::.::::
XP_016 SAKSSNKNKKNKDKEYYV
     1450      1460      

>--
 initn: 276 init1: 102 opt: 263  Z-score: 256.0  bits: 59.5 E(85289): 1.6e-07
Smith-Waterman score: 310; 25.9% identity (56.8% similar) in 340 aa overlap (524-822:56-384)

           500       510       520       530       540        550  
pF1KA0 NIIADPVTFKTKSSYLSLATLQAYTSMHLFFQFKTTSPDGFILFNSGDG-NDFIAVELVK
                                     ::.:: :  :..:. . .:  ::. . :..
XP_016 ELGSGLEFPGAEGQWTRFPKWNACCESEMSFQLKTRSARGLVLYFDDEGFCDFLELILTR
          30        40        50        60        70        80     

             560        570       580       590         600        
pF1KA0 G-YIHYVFDLGNG-PNVIKGNSDRPLNDNQWHNVVITRDNSNTHSL--KVDTKVVTQVIN
       :  ..  :..  . : ..   .: :.::. ::.: : :.  ::  .  .:..: : .: .
XP_016 GGRLQLSFSIFCAEPATLL--ADTPVNDGAWHSVRIRRQFRNTTLFIDQVEAKWV-EVKS
          90       100         110       120       130        140  

      610       620       630           640       650       660    
pF1KA0 GAKNLDLKGDLYMAGLAQGMYSNLPKL----VASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLINDALH
         ... . . :...::   . .   ::    :  :. :.: . .: .:.     ..    
XP_016 KRRDMTVFSGLFVGGLPPELRAAALKLTLASVREREPFKGWIRDVRVNSSQVLPVD----
            150       160       170       180       190            

          670           680             690       700       710    
pF1KA0 RSGQIKRGCEGPST----TCQ--EDS----CANQGVCMQQWEGFTCDCSMTSYSGNQC--
        ::..:   : :..     :.  :..    : : :::    .  .:::: :.. :..:  
XP_016 -SGEVKLDDEPPNSGGGSPCEAGEEGEGGVCLNGGVCSVVDDQAVCDCSRTGFRGKDCSQ
       200       210       220       230       240       250       

               720           730                  740       750    
pF1KA0 ---NDPGATYIF----GKSGGLILYT----------WPANDRP-STRSDRLAVGFSTTVK
          :  : ....    ::: :   :           .  .. : .. ::.....:.:  .
XP_016 EDNNVEGLAHLMMGDQGKSKGKEEYIATFKGSEYFCYDLSQNPIQSSSDEITLSFKTLQR
       260       270       280       290       300       310       

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pF1KA0 DGILVRIDSAPGLGDFLQLHIEQGKIGVVFNIGT--VDISIKEERTPVNDGKYHVVRFTR
       .:....  ..   .:...: ...: ...:.:.:.   .  ..      ::. .: :. ::
XP_016 NGLMLHTGKS---ADYVNLALKNGAVSLVINLGSGAFEALVEPVNGKFNDNAWHDVKVTR
       320          330       340       350       360       370    

            820       830       840       850       860       870  
pF1KA0 NGGNATLQVDNWPVNEHYPTGRQLTIFNTQAQIAIGGKDKGRLFQGQLSGLYYDGLKVLN
       :  ..:..::                                                  
XP_016 NLRQVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMGCLKEVV
          380       390       400       410       420       430    

>>XP_006712200 (OMIM: 600565,614325,614332) PREDICTED: n  (1481 aa)
 initn: 3091 init1: 2591 opt: 5646  Z-score: 5470.8  bits: 1024.4 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 5646; 76.8% identity (92.3% similar) in 1068 aa overlap (1-1061:414-1481)

                                             10        20        30
pF1KA0                               MLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMG
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 HAMVNKLHCSVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMG
           390       400       410       420       430       440   

               40        50        60        70        80        90
pF1KA0 CLKEVVYKNNDIRLELSRLARIADTKMKIYGEVVFKCENVATLDPINFETPEAYISLPKW
       :::::::::::.::::::::. .: ::::.: :.::::::::::::.:::::..::::::
XP_006 CLKEVVYKNNDVRLELSRLAKQGDPKMKIHGVVAFKCENVATLDPITFETPESFISLPKW
           450       460       470       480       490       500   

              100       110       120       130       140       150
pF1KA0 NTKRMGSISFDFRTTEPNGLILFTHGKPQERKDARSQKNTKVDFFAVELLDGNLYLLLDM
       :.:. ::::::::::::::::::.::::...:::.  .  ::::::.:.:::.:::::::
XP_006 NAKKTGSISFDFRTTEPNGLILFSHGKPRHQKDAKHPQMIKVDFFAIEMLDGHLYLLLDM
           510       520       530       540       550       560   

              160       170       180       190       200       210
pF1KA0 GSGTIKVKATQKKANDGEWYHVDIQRDGRSGTISVNSRRTPFTASGESEILDLEGDMYLG
       ::::::.::  ::.:::::::::.::::::::::::. :::.:: ::::::::. ..:::
XP_006 GSGTIKIKALLKKVNDGEWYHVDFQRDGRSGTISVNTLRTPYTAPGESEILDLDDELYLG
           570       580       590       600       610       620   

              220       230       240       250       260       270
pF1KA0 GLPENRAGLILPTELWTAMLNYGYVGCIRDLFIDGRSKNIRQLAEMQNAAGVKSSCSRMS
       :::::.:::..:::.:::.::::::::::::::::.::.:::.::.:..:::: :::. .
XP_006 GLPENKAGLVFPTEVWTALLNYGYVGCIRDLFIDGQSKDIRQMAEVQSTAGVKPSCSKET
           630       640       650       660       670       680   

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pF1KA0 AKQCDSYPCKNNAVCKDGWNRFICDCTGTGYWGRTCEREASILSYDGSMYMKIIMPMVMH
       :: : : :::::..:.:::::..:::.:::: ::.:::::..:::::::.::: .:.:::
XP_006 AKPCLSNPCKNNGMCRDGWNRYVCDCSGTGYLGRSCEREATVLSYDGSMFMKIQLPVVMH
           690       700       710       720       730       740   

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pF1KA0 TEAEDVSFRFMSQRAYGLLVATTSRDSADTLRLELDGGRVKLMVNLDCIRINCNSSKGPE
       :::::::.:: ::::::.:.::::::::::::::::.::::: :::::::::::::::::
XP_006 TEAEDVSLRFRSQRAYGILMATTSRDSADTLRLELDAGRVKLTVNLDCIRINCNSSKGPE
           750       760       770       780       790       800   

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pF1KA0 TLYAGQKLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDDVA-EGTMVGDHTRLEFHNIETGIMTEKR
       ::.:: .::::::::::::::::::::::::. :  : :.:::::::::::::::.::.:
XP_006 TLFAGYNLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDQQAMTGQMAGDHTRLEFHNIETGIITERR
           810       820       830       840       850       860   

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pF1KA0 YISVVPSSFIGHLQSLMFNGLLYIDLCKNGDIDYCELKARFGLRNIIADPVTFKTKSSYL
       :.: :::.:::::::: :::. :::::::::::::::.::::.::::::::::::::::.
XP_006 YLSSVPSNFIGHLQSLTFNGMAYIDLCKNGDIDYCELNARFGFRNIIADPVTFKTKSSYV
           870       880       890       900       910       920   

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pF1KA0 SLATLQAYTSMHLFFQFKTTSPDGFILFNSGDGNDFIAVELVKGYIHYVFDLGNGPNVIK
       .:::::::::::::::::::: ::.::.:::::::::.:::::::.::::::::: :.::
XP_006 ALATLQAYTSMHLFFQFKTTSLDGLILYNSGDGNDFIVVELVKGYLHYVFDLGNGANLIK
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pF1KA0 GNSDRPLNDNQWHNVVITRDNSNTHSLKVDTKVVTQVINGAKNLDLKGDLYMAGLAQGMY
       :.:..::::::::::.:.::.:: :..:.:::..::.  ::.:::::.:::..:.:.  :
XP_006 GSSNKPLNDNQWHNVMISRDTSNLHTVKIDTKITTQITAGARNLDLKSDLYIGGVAKETY
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pF1KA0 SNLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLINDALHRSGQIKRGCEGPSTTCQEDSCANQG
       ..::::: ...:::::::::::::::::::.:::  .:::.:::::::::::::::.:::
XP_006 KSLPKLVHAKEGFQGCLASVDLNGRLPDLISDALFCNGQIERGCEGPSTTCQEDSCSNQG
          1050      1060      1070      1080      1090      1100   

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pF1KA0 VCMQQWEGFTCDCSMTSYSGNQCNDPGATYIFGKSGGLILYTWPANDRPSTRSDRLAVGF
       ::.:::.::.:::::::.::  :::::.::::.:.:: : : :: :::::::.::::.::
XP_006 VCLQQWDGFSCDCSMTSFSGPLCNDPGTTYIFSKGGGQITYKWPPNDRPSTRADRLAIGF
          1110      1120      1130      1140      1150      1160   

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pF1KA0 STTVKDGILVRIDSAPGLGDFLQLHIEQGKIGVVFNIGTVDISIKEERTPVNDGKYHVVR
       ::. :...:::.::. ::::.:.:::.:::::: ::.:: ::.:.:  . .:::::::::
XP_006 STVQKEAVLVRVDSSSGLGDYLELHIHQGKIGVKFNVGTDDIAIEESNAIINDGKYHVVR
          1170      1180      1190      1200      1210      1220   

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pF1KA0 FTRNGGNATLQVDNWPVNEHYPTGRQLTIFNTQAQIAIGGKDKGRLFQGQLSGLYYDGLK
       :::.:::::::::.::: :.::.::::::::.:: : ::::..:. ::::::::::.:::
XP_006 FTRSGGNATLQVDSWPVIERYPAGRQLTIFNSQATIIIGGKEQGQPFQGQLSGLYYNGLK
          1230      1240      1250      1260      1270      1280   

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pF1KA0 VLNMAAENNPNIKINGSVRLVGEVPSILGTTQT-TSMPPEMSTTVMETTTTMATTTTRKN
       ::::::::. :: : :.::::::::: . : .: :.:  ::::..::::::.::.:.:..
XP_006 VLNMAAENDANIAIVGNVRLVGEVPSSMTTESTATAMQSEMSTSIMETTTTLATSTARRG
          1290      1300      1310      1320      1330      1340   

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pF1KA0 R--STASIQPTSDD-LVSSAECSSDDEDFVECEPSTANPTEPGIRR-VPGASEVIRESSS
       .  .   :. :.:: ::.:::: :::::.  ::::.::::. : :.  ::..::::::::
XP_006 KPPTKEPISQTTDDILVASAECPSDDEDIDPCEPSSANPTRAGGREPYPGSAEVIRESSS
          1350      1360      1370      1380      1390      1400   

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pF1KA0 TTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDETRNYISNSAQSNGTLMKEKQQS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.::::::::::::...:::: :
XP_006 TTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYHVDESRNYISNSAQSNGAVVKEKQPS
          1410      1420      1430      1440      1450      1460   

          1050      1060 
pF1KA0 S-KSGHKKQKNKDREYYV
       : ::..:..::::.::::
XP_006 SAKSSNKNKKNKDKEYYV
          1470      1480 

>--
 initn: 300 init1: 102 opt: 248  Z-score: 241.4  bits: 56.8 E(85289): 1e-06
Smith-Waterman score: 297; 25.7% identity (56.2% similar) in 331 aa overlap (524-813:56-375)

           500       510       520       530       540        550  
pF1KA0 NIIADPVTFKTKSSYLSLATLQAYTSMHLFFQFKTTSPDGFILFNSGDG-NDFIAVELVK
                                     ::.:: :  :..:. . .:  ::. . :..
XP_006 ELGSGLEFPGAEGQWTRFPKWNACCESEMSFQLKTRSARGLVLYFDDEGFCDFLELILTR
          30        40        50        60        70        80     

             560        570       580       590         600        
pF1KA0 G-YIHYVFDLGNG-PNVIKGNSDRPLNDNQWHNVVITRDNSNTHSL--KVDTKVVTQVIN
       :  ..  :..  . : ..   .: :.::. ::.: : :.  ::  .  .:..: : .: .
XP_006 GGRLQLSFSIFCAEPATLL--ADTPVNDGAWHSVRIRRQFRNTTLFIDQVEAKWV-EVKS
          90       100         110       120       130        140  

      610       620       630           640       650       660    
pF1KA0 GAKNLDLKGDLYMAGLAQGMYSNLPKL----VASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLINDALH
         ... . . :...::   . .   ::    :  :. :.: . .: .:.     ..    
XP_006 KRRDMTVFSGLFVGGLPPELRAAALKLTLASVREREPFKGWIRDVRVNSSQVLPVD----
            150       160       170       180       190            

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pF1KA0 RSGQIKRGCEGPST----TCQ--EDS----CANQGVCMQQWEGFTCDCSMTSYSGNQC--
        ::..:   : :..     :.  :..    : : :::    .  .:::: :.. :..:  
XP_006 -SGEVKLDDEPPNSGGGSPCEAGEEGEGGVCLNGGVCSVVDDQAVCDCSRTGFRGKDCSQ
       200       210       220       230       240       250       

               720           730                  740       750    
pF1KA0 ---NDPGATYIF----GKSGGLILYT----------WPANDRP-STRSDRLAVGFSTTVK
          :  : ....    ::: :   :           .  .. : .. ::.....:.:  .
XP_006 EDNNVEGLAHLMMGDQGKSKGKEEYIATFKGSEYFCYDLSQNPIQSSSDEITLSFKTLQR
       260       270       280       290       300       310       

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pF1KA0 DGILVRIDSAPGLGDFLQLHIEQGKIGVVFNIGT--VDISIKEERTPVNDGKYHVVRFTR
       .:....  ..   .:...: ...: ...:.:.:.   .  ..      ::. .: :. ::
XP_006 NGLMLHTGKS---ADYVNLALKNGAVSLVINLGSGAFEALVEPVNGKFNDNAWHDVKVTR
       320          330       340       350       360       370    

            820       830       840       850       860       870  
pF1KA0 NGGNATLQVDNWPVNEHYPTGRQLTIFNTQAQIAIGGKDKGRLFQGQLSGLYYDGLKVLN
       :                                                           
XP_006 NLRQHSGIGHAMVNKLHCSVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYVGGSPSTADLPG
          380       390       400       410       420       430    

>>XP_011535679 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 isof  (1323 aa)
 initn: 6261 init1: 5634 opt: 5634  Z-score: 5459.9  bits: 1022.3 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 6374; 96.9% identity (97.0% similar) in 991 aa overlap (1-961:22-1012)

                                    10        20        30         
pF1KA0                      MLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMGCLKEVVYKN
                            :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMGCLKEVVYKN
               10        20        30        40        50        60

      40        50        60        70        80        90         
pF1KA0 NDIRLELSRLARIADTKMKIYGEVVFKCENVATLDPINFETPEAYISLPKWNTKRMGSIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NDIRLELSRLARIADTKMKIYGEVVFKCENVATLDPINFETPEAYISLPKWNTKRMGSIS
               70        80        90       100       110       120

     100       110       120       130       140       150         
pF1KA0 FDFRTTEPNGLILFTHGKPQERKDARSQKNTKVDFFAVELLDGNLYLLLDMGSGTIKVKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FDFRTTEPNGLILFTHGKPQERKDARSQKNTKVDFFAVELLDGNLYLLLDMGSGTIKVKA
              130       140       150       160       170       180

     160       170       180       190       200       210         
pF1KA0 TQKKANDGEWYHVDIQRDGRSGTISVNSRRTPFTASGESEILDLEGDMYLGGLPENRAGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TQKKANDGEWYHVDIQRDGRSGTISVNSRRTPFTASGESEILDLEGDMYLGGLPENRAGL
              190       200       210       220       230       240

     220       230       240       250       260       270         
pF1KA0 ILPTELWTAMLNYGYVGCIRDLFIDGRSKNIRQLAEMQNAAGVKSSCSRMSAKQCDSYPC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ILPTELWTAMLNYGYVGCIRDLFIDGRSKNIRQLAEMQNAAGVKSSCSRMSAKQCDSYPC
              250       260       270       280       290       300

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pF1KA0 KNNAVCKDGWNRFICDCTGTGYWGRTCEREASILSYDGSMYMKIIMPMVMHTEAEDVSFR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KNNAVCKDGWNRFICDCTGTGYWGRTCEREASILSYDGSMYMKIIMPMVMHTEAEDVSFR
              310       320       330       340       350       360

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pF1KA0 FMSQRAYGLLVATTSRDSADTLRLELDGGRVKLMVNLDCIRINCNSSKGPETLYAGQKLN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FMSQRAYGLLVATTSRDSADTLRLELDGGRVKLMVNLDCIRINCNSSKGPETLYAGQKLN
              370       380       390       400       410       420

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pF1KA0 DNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDDVAEGTMVGDHTRLEFHNIETGIMTEKRYISVVPSSFI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDDVAEGTMVGDHTRLEFHNIETGIMTEKRYISVVPSSFI
              430       440       450       460       470       480

     460       470       480       490       500       510         
pF1KA0 GHLQSLMFNGLLYIDLCKNGDIDYCELKARFGLRNIIADPVTFKTKSSYLSLATLQAYTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GHLQSLMFNGLLYIDLCKNGDIDYCELKARFGLRNIIADPVTFKTKSSYLSLATLQAYTS
              490       500       510       520       530       540

     520       530       540       550       560       570         
pF1KA0 MHLFFQFKTTSPDGFILFNSGDGNDFIAVELVKGYIHYVFDLGNGPNVIKGNSDRPLNDN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MHLFFQFKTTSPDGFILFNSGDGNDFIAVELVKGYIHYVFDLGNGPNVIKGNSDRPLNDN
              550       560       570       580       590       600

     580       590       600       610       620       630         
pF1KA0 QWHNVVITRDNSNTHSLKVDTKVVTQVINGAKNLDLKGDLYMAGLAQGMYSNLPKLVASR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QWHNVVITRDNSNTHSLKVDTKVVTQVINGAKNLDLKGDLYMAGLAQGMYSNLPKLVASR
              610       620       630       640       650       660

     640       650       660       670       680       690         
pF1KA0 DGFQGCLASVDLNGRLPDLINDALHRSGQIKRGCEGPSTTCQEDSCANQGVCMQQWEGFT
       ::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DGFQGCLASVDLNGRLPDLINDALHRSGQIERGCEGPSTTCQEDSCANQGVCMQQWEGFT
              670       680       690       700       710       720

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pF1KA0 CDCSMTSYSGNQCNDPGATYIFGKSGGLILYTWPANDRPSTRSDRLAVGFSTTVKDGILV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CDCSMTSYSGNQCNDPGATYIFGKSGGLILYTWPANDRPSTRSDRLAVGFSTTVKDGILV
              730       740       750       760       770       780

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pF1KA0 RIDSAPGLGDFLQLHIEQGKIGVVFNIGTVDISIKEERTPVNDGKYHVVRFTRNGGNATL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RIDSAPGLGDFLQLHIEQGKIGVVFNIGTVDISIKEERTPVNDGKYHVVRFTRNGGNATL
              790       800       810       820       830       840

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pF1KA0 QVDNWPVNEHYPTG------------------------------RQLTIFNTQAQIAIGG
       ::::::::::::::                              ::::::::::::::::
XP_011 QVDNWPVNEHYPTGNTDNERFQMVKQKIPFKYNRPVEEWLQEKGRQLTIFNTQAQIAIGG
              850       860       870       880       890       900

     850       860       870       880       890       900         
pF1KA0 KDKGRLFQGQLSGLYYDGLKVLNMAAENNPNIKINGSVRLVGEVPSILGTTQTTSMPPEM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KDKGRLFQGQLSGLYYDGLKVLNMAAENNPNIKINGSVRLVGEVPSILGTTQTTSMPPEM
              910       920       930       940       950       960

     910       920       930       940       950       960         
pF1KA0 STTVMETTTTMATTTTRKNRSTASIQPTSDDLVSSAECSSDDEDFVECEPSTANPTEPGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::        
XP_011 STTVMETTTTMATTTTRKNRSTASIQPTSDDLVSSAECSSDDEDFVECEPSTGRSGGELV
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     970       980       990      1000      1010      1020         
pF1KA0 RRVPGASEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDETRNYISN
                                                                   
XP_011 IPLLVEDPLATPPIATRAPSITLPPTFRPLLTIIETTKDSLSMTSEAGLPCLSDQGSDGC
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

>--
 initn: 691 init1: 641 opt: 653  Z-score: 634.5  bits: 129.4 E(85289): 1.3e-28
Smith-Waterman score: 653; 66.3% identity (77.3% similar) in 172 aa overlap (900-1061:1152-1323)

     870       880       890       900       910       920         
pF1KA0 VLNMAAENNPNIKINGSVRLVGEVPSILGTTQTTSMPPEMSTTVMETTTTMATTTTRKNR
                                     : :::. ::.   .  ... :.      . 
XP_011 TSIFEGGYKAHAPKWESKDFRPNKVSETSRTTTTSLSPELIRFTASSSSGMVPKLPAGKM
            1130      1140      1150      1160      1170      1180 

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pF1KA0 STASIQPTSD----DLVSSAECSSDD-EDFVECEP-----STANPTEPGIRRVPGASEVI
       .. ...:  :     : .. : .:   .. .   :      :::::::::::::::::::
XP_011 NNRDLKPQPDIVLLPLPTAYELDSTKLKSPLITSPMFRNVPTANPTEPGIRRVPGASEVI
            1190      1200      1210      1220      1230      1240 

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pF1KA0 RESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDETRNYISNSAQSNGTLMK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDETRNYISNSAQSNGTLMK
            1250      1260      1270      1280      1290      1300 

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pF1KA0 EKQQSSKSGHKKQKNKDREYYV
       ::::::::::::::::::::::
XP_011 EKQQSSKSGHKKQKNKDREYYV
            1310      1320   




1061 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Wed Nov  2 19:39:04 2016 done: Wed Nov  2 19:39:06 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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