Result of FASTA (ccds) for pF1KA0571
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA0571, 638 aa
  1>>>pF1KA0571 638 - 638 aa - 638 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.0799+/-0.000901; mu= -1.8895+/- 0.055
 mean_var=198.1203+/-39.417, 0's: 0 Z-trim(113.2): 19  B-trim: 7 in 1/50
 Lambda= 0.091119
 statistics sampled from 13858 (13871) to 13858 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.742), E-opt: 0.2 (0.426), width:  16
 Scan time:  3.850

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS8260.1 GAB2 gene_id:9846|Hs108|chr11           ( 638) 4292 576.6 3.5e-164
CCDS8259.1 GAB2 gene_id:9846|Hs108|chr11           ( 676) 4292 576.6 3.7e-164
CCDS3759.1 GAB1 gene_id:2549|Hs108|chr4            ( 694) 1061 151.9 2.8e-36
CCDS3760.1 GAB1 gene_id:2549|Hs108|chr4            ( 724)  921 133.5 9.9e-31
CCDS42976.1 GAB4 gene_id:128954|Hs108|chr22        ( 574)  801 117.7 4.5e-26


>>CCDS8260.1 GAB2 gene_id:9846|Hs108|chr11                (638 aa)
 initn: 4292 init1: 4292 opt: 4292  Z-score: 3061.0  bits: 576.6 E(32554): 3.5e-164
Smith-Waterman score: 4292; 100.0% identity (100.0% similar) in 638 aa overlap (1-638:1-638)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MSGDPDVLEYYKNDHSKKPLRIINLNFCEQVDAGLTFNKKELQDSFVFDIKTSERTFYLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MSGDPDVLEYYKNDHSKKPLRIINLNFCEQVDAGLTFNKKELQDSFVFDIKTSERTFYLV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 AETEEDMNKWVQSICQICGFNQAEESTDSLRNVSSAGHGPRSSPAELSSSSQHLLRERKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 AETEEDMNKWVQSICQICGFNQAEESTDSLRNVSSAGHGPRSSPAELSSSSQHLLRERKS
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 SAPSHSSQPTLFTFEPPVSNHMQPTLSTSAPQEYLYLHQCISRRAENARSASFSQGTRAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 SAPSHSSQPTLFTFEPPVSNHMQPTLSTSAPQEYLYLHQCISRRAENARSASFSQGTRAS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 FLMRSDTAVQKLAQGNGHCVNGISGQVHGFYSLPKPSRHNTEFRDSTYDLPRSLASHGHT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 FLMRSDTAVQKLAQGNGHCVNGISGQVHGFYSLPKPSRHNTEFRDSTYDLPRSLASHGHT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 KGSLTGSETDNEDVYTFKTPSNTLCREFGDLLVDNMDVPATPLSAYQIPRTFTLDKNHNA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KGSLTGSETDNEDVYTFKTPSNTLCREFGDLLVDNMDVPATPLSAYQIPRTFTLDKNHNA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 MTVATPGDSAIAPPPRPPKPSQAETPRWGSPQQRPPISENSRSVAATIPRRNTLPAMDNS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MTVATPGDSAIAPPPRPPKPSQAETPRWGSPQQRPPISENSRSVAATIPRRNTLPAMDNS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 RLHRASSCETYEYPQRGGESAGRSAESMSDGVGSFLPGKMIVGRSDSTNSEDNYVPMNPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 RLHRASSCETYEYPQRGGESAGRSAESMSDGVGSFLPGKMIVGRSDSTNSEDNYVPMNPG
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 SSTLLAMERAGDNSQSVYIPMSPGAHHFDSLGYPSTTLPVHRGPSRGSEIQPPPVNRNLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 SSTLLAMERAGDNSQSVYIPMSPGAHHFDSLGYPSTTLPVHRGPSRGSEIQPPPVNRNLK
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 PDRKAKPTPLDLRNNTVIDELPFKSPITKSWSRANHTFNSSSSQYCRPISTQSITSTDSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 PDRKAKPTPLDLRNNTVIDELPFKSPITKSWSRANHTFNSSSSQYCRPISTQSITSTDSG
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA0 DSEENYVPMQNPVSASPVPSGTNSPAPKKSTGSVDYLALDFQPSSPSPHRKPSTSSVTSD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 DSEENYVPMQNPVSASPVPSGTNSPAPKKSTGSVDYLALDFQPSSPSPHRKPSTSSVTSD
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630        
pF1KA0 EKVDYVQVDKEKTQALQNTMQEWTDVRQSSEPSKGAKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 EKVDYVQVDKEKTQALQNTMQEWTDVRQSSEPSKGAKL
              610       620       630        

>>CCDS8259.1 GAB2 gene_id:9846|Hs108|chr11                (676 aa)
 initn: 4292 init1: 4292 opt: 4292  Z-score: 3060.6  bits: 576.6 E(32554): 3.7e-164
Smith-Waterman score: 4292; 100.0% identity (100.0% similar) in 638 aa overlap (1-638:39-676)

                                             10        20        30
pF1KA0                               MSGDPDVLEYYKNDHSKKPLRIINLNFCEQ
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 CTGWLRKSPPEKKLRRYAWKKRWFILRSGRMSGDPDVLEYYKNDHSKKPLRIINLNFCEQ
       10        20        30        40        50        60        

               40        50        60        70        80        90
pF1KA0 VDAGLTFNKKELQDSFVFDIKTSERTFYLVAETEEDMNKWVQSICQICGFNQAEESTDSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 VDAGLTFNKKELQDSFVFDIKTSERTFYLVAETEEDMNKWVQSICQICGFNQAEESTDSL
       70        80        90       100       110       120        

              100       110       120       130       140       150
pF1KA0 RNVSSAGHGPRSSPAELSSSSQHLLRERKSSAPSHSSQPTLFTFEPPVSNHMQPTLSTSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 RNVSSAGHGPRSSPAELSSSSQHLLRERKSSAPSHSSQPTLFTFEPPVSNHMQPTLSTSA
      130       140       150       160       170       180        

              160       170       180       190       200       210
pF1KA0 PQEYLYLHQCISRRAENARSASFSQGTRASFLMRSDTAVQKLAQGNGHCVNGISGQVHGF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 PQEYLYLHQCISRRAENARSASFSQGTRASFLMRSDTAVQKLAQGNGHCVNGISGQVHGF
      190       200       210       220       230       240        

              220       230       240       250       260       270
pF1KA0 YSLPKPSRHNTEFRDSTYDLPRSLASHGHTKGSLTGSETDNEDVYTFKTPSNTLCREFGD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 YSLPKPSRHNTEFRDSTYDLPRSLASHGHTKGSLTGSETDNEDVYTFKTPSNTLCREFGD
      250       260       270       280       290       300        

              280       290       300       310       320       330
pF1KA0 LLVDNMDVPATPLSAYQIPRTFTLDKNHNAMTVATPGDSAIAPPPRPPKPSQAETPRWGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LLVDNMDVPATPLSAYQIPRTFTLDKNHNAMTVATPGDSAIAPPPRPPKPSQAETPRWGS
      310       320       330       340       350       360        

              340       350       360       370       380       390
pF1KA0 PQQRPPISENSRSVAATIPRRNTLPAMDNSRLHRASSCETYEYPQRGGESAGRSAESMSD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 PQQRPPISENSRSVAATIPRRNTLPAMDNSRLHRASSCETYEYPQRGGESAGRSAESMSD
      370       380       390       400       410       420        

              400       410       420       430       440       450
pF1KA0 GVGSFLPGKMIVGRSDSTNSEDNYVPMNPGSSTLLAMERAGDNSQSVYIPMSPGAHHFDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 GVGSFLPGKMIVGRSDSTNSEDNYVPMNPGSSTLLAMERAGDNSQSVYIPMSPGAHHFDS
      430       440       450       460       470       480        

              460       470       480       490       500       510
pF1KA0 LGYPSTTLPVHRGPSRGSEIQPPPVNRNLKPDRKAKPTPLDLRNNTVIDELPFKSPITKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LGYPSTTLPVHRGPSRGSEIQPPPVNRNLKPDRKAKPTPLDLRNNTVIDELPFKSPITKS
      490       500       510       520       530       540        

              520       530       540       550       560       570
pF1KA0 WSRANHTFNSSSSQYCRPISTQSITSTDSGDSEENYVPMQNPVSASPVPSGTNSPAPKKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 WSRANHTFNSSSSQYCRPISTQSITSTDSGDSEENYVPMQNPVSASPVPSGTNSPAPKKS
      550       560       570       580       590       600        

              580       590       600       610       620       630
pF1KA0 TGSVDYLALDFQPSSPSPHRKPSTSSVTSDEKVDYVQVDKEKTQALQNTMQEWTDVRQSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 TGSVDYLALDFQPSSPSPHRKPSTSSVTSDEKVDYVQVDKEKTQALQNTMQEWTDVRQSS
      610       620       630       640       650       660        

               
pF1KA0 EPSKGAKL
       ::::::::
CCDS82 EPSKGAKL
      670      

>>CCDS3759.1 GAB1 gene_id:2549|Hs108|chr4                 (694 aa)
 initn: 979 init1: 458 opt: 1061  Z-score: 764.9  bits: 151.9 E(32554): 2.8e-36
Smith-Waterman score: 1285; 38.5% identity (62.5% similar) in 683 aa overlap (1-637:38-694)

                                             10        20        30
pF1KA0                               MSGDPDVLEYYKNDHSKKPLRIINLNFCEQ
                                     ..:::::::::::::.:::.:::.::.:.:
CCDS37 CSGWLRKSPPEKKLKRYAWKRRWFVLRSGRLTGDPDVLEYYKNDHAKKPIRIIDLNLCQQ
        10        20        30        40        50        60       

               40        50        60        70        80        90
pF1KA0 VDAGLTFNKKELQDSFVFDIKTSERTFYLVAETEEDMNKWVQSICQICGFNQAEESTDSL
       :::::::::::...:..:::.: .: :::::..::.:::::. ::.::::: .::  : .
CCDS37 VDAGLTFNKKEFENSYIFDINTIDRIFYLVADSEEEMNKWVRCICDICGFNPTEE--DPV
        70        80        90       100       110       120       

              100       110       120       130            140     
pF1KA0 RNVSSAGHGPRSSPAELSSSSQHLLRERKSSAPSHSSQPTLFTFEPP-----VSNHMQPT
       .  .:. ..: . :  ..           .. :: ... .  :. ::     :  :..  
CCDS37 KPPGSSLQAPADLPLAIN-----------TAPPSTQADSSSATLPPPYQLINVPPHLETL
         130       140                  150       160       170    

         150       160       170       180       190       200     
pF1KA0 LSTSAPQEYLYLHQCISRRAENARSASFSQGTRASFLMRSDTAVQKLAQGNGHCVNGISG
            ::.:: : .: :.. : .:. . :  . .:    .:.. ..   ....  .:..:
CCDS37 GIQEDPQDYLLLINCQSKKPEPTRTHADSAKSTSSETDCNDNVPSHKNPASSQSKHGMNG
          180       190       200       210       220       230    

           210       220        230       240       250       260  
pF1KA0 --QVHGFYSLPKPSRHNTEFRDST-YDLPRSLASHGHTKGSLTGSETDNEDVYTFKTPSN
         : . .:. : :::  .   ::. :.:::: .     : : ...:.:.: .:.:.:::.
CCDS37 FFQQQMIYDSP-PSRAPSASVDSSLYNLPRSYSHDVLPKVSPSSTEADGE-LYVFNTPSG
          240        250       260       270       280        290  

            270        280       290       300       310       320 
pF1KA0 TLCREFGDLLVD-NMDVPATPLSAYQIPRTFTLDKNHNAMTVATPGDSAIAPPPRPPKPS
       :   :     :. ..:.: :: ..:::::::      ..  . :  :    :::::::: 
CCDS37 TSSVETQMRHVSISYDIPPTPGNTYQIPRTFPEGTLGQTSKLDTIPD---IPPPRPPKPH
            300       310       320       330          340         

               330       340          350        360        370    
pF1KA0 QAE--TPRWGSPQQRPPISENSR---SVAATIPRR-NTLPAMDNSRLHR-ASSCETYEYP
        :.  .:       :   . .:     .:.  : : ::. ..: ..:.. ::: . :. :
CCDS37 PAHDRSPVETCSIPRTASDTDSSYCIPTAGMSPSRSNTISTVDLNKLRKDASSQDCYDIP
     350       360       370       380       390       400         

          380       390       400       410       420       430    
pF1KA0 QRGGESAGRSAESMSDGVGSFLPGKMIVGRSDSTNSEDNYVPMNPGSSTLLAMERAGDNS
       .    . . : :.. .     . . . ::  .: . ..:::::::.:          .  
CCDS37 RAFPSDRSSSLEGFHNHFK--VKNVLTVGSVSSEELDENYVPMNPNSPPRQHSSSFTEPI
     410       420         430       440       450       460       

           440       450       460               470          480  
pF1KA0 QSV-YIPMSPGAHHFDSLGYPSTTLPVHRG--------PSRGSEI---QPPPVNRNLKPD
       : . :.::.::.  :.:.:.     :.: :        : :   .   .::::.::::::
CCDS37 QEANYVPMTPGTFDFSSFGMQVPP-PAHMGFRSSPKTPPRRPVPVADCEPPPVDRNLKPD
       470       480       490        500       510       520      

            490       500         510       520       530          
pF1KA0 RKAKPTPLDLRNNTVIDEL--PFKSPITKSWSRANHTFNSSSSQYCRPISTQSITST-DS
       ::.::.::...     .::  : .::::.:..: .  :  :     :: :..: ::. ::
CCDS37 RKVKPAPLEIKPLPEWEELQAPVRSPITRSFARDSSRFPMSP----RPDSVHSTTSSSDS
        530       540       550       560           570       580  

     540       550       560                570       580       590
pF1KA0 GDSEENYVPMQNPVSASPVPS--GTNS------PAPK-KSTGSVDYLALDFQPSSPSPHR
        ::::::::: ::  .:  :.  :.::      :  : :.  .:.:: ::.. .. .: :
CCDS37 HDSEENYVPM-NPNLSSEDPNLFGSNSLDGGSSPMIKPKGDKQVEYLDLDLDSGKSTPPR
            590        600       610       620       630       640 

                 600       610       620       630           
pF1KA0 KPSTS---SVTSDEKVDYVQVDKEKTQALQNTMQEWTDVRQSSE---PSKGAKL
       : ..:   : ..::.:::: ::..:: ::..: . ::: :::.:   :.:..: 
CCDS37 KQKSSGSGSSVADERVDYVVVDQQKTLALKSTREAWTDGRQSTESETPAKSVK 
             650       660       670       680       690     

>>CCDS3760.1 GAB1 gene_id:2549|Hs108|chr4                 (724 aa)
 initn: 1000 init1: 458 opt: 921  Z-score: 665.2  bits: 133.5 E(32554): 9.9e-31
Smith-Waterman score: 1172; 36.5% identity (59.5% similar) in 696 aa overlap (1-623:38-707)

                                             10        20        30
pF1KA0                               MSGDPDVLEYYKNDHSKKPLRIINLNFCEQ
                                     ..:::::::::::::.:::.:::.::.:.:
CCDS37 CSGWLRKSPPEKKLKRYAWKRRWFVLRSGRLTGDPDVLEYYKNDHAKKPIRIIDLNLCQQ
        10        20        30        40        50        60       

               40        50        60        70        80        90
pF1KA0 VDAGLTFNKKELQDSFVFDIKTSERTFYLVAETEEDMNKWVQSICQICGFNQAEESTDSL
       :::::::::::...:..:::.: .: :::::..::.:::::. ::.::::: .::  : .
CCDS37 VDAGLTFNKKEFENSYIFDINTIDRIFYLVADSEEEMNKWVRCICDICGFNPTEE--DPV
        70        80        90       100       110       120       

              100       110       120       130            140     
pF1KA0 RNVSSAGHGPRSSPAELSSSSQHLLRERKSSAPSHSSQPTLFTFEPP-----VSNHMQPT
       .  .:. ..: . :  ....            :: ... .  :. ::     :  :..  
CCDS37 KPPGSSLQAPADLPLAINTAP-----------PSTQADSSSATLPPPYQLINVPPHLETL
         130       140                  150       160       170    

         150       160       170       180       190       200     
pF1KA0 LSTSAPQEYLYLHQCISRRAENARSASFSQGTRASFLMRSDTAVQKLAQGNGHCVNGISG
            ::.:: : .: :.. : .:. . :  . .:    .:.. ..   ....  .:..:
CCDS37 GIQEDPQDYLLLINCQSKKPEPTRTHADSAKSTSSETDCNDNVPSHKNPASSQSKHGMNG
          180       190       200       210       220       230    

           210       220        230       240       250       260  
pF1KA0 --QVHGFYSLPKPSRHNTEFRDST-YDLPRSLASHGHTKGSLTGSETDNEDVYTFKTPSN
         : . .:. : :::  .   ::. :.:::: .     : : ...:.:.: .:.:.:::.
CCDS37 FFQQQMIYDSP-PSRAPSASVDSSLYNLPRSYSHDVLPKVSPSSTEADGE-LYVFNTPSG
          240        250       260       270       280        290  

            270        280       290       300       310       320 
pF1KA0 TLCREFGDLLVD-NMDVPATPLSAYQIPRTFTLDKNHNAMTVATPGDSAIAPPPRPPKPS
       :   :     :. ..:.: :: ..:::::::      ..  . :  :    :::::::: 
CCDS37 TSSVETQMRHVSISYDIPPTPGNTYQIPRTFPEGTLGQTSKLDTIPD---IPPPRPPKPH
            300       310       320       330          340         

               330       340          350        360        370    
pF1KA0 QAE--TPRWGSPQQRPPISENSR---SVAATIPRR-NTLPAMDNSRLHR-ASSCETYEYP
        :.  .:       :   . .:     .:.  : : ::. ..: ..:.. ::: . :. :
CCDS37 PAHDRSPVETCSIPRTASDTDSSYCIPTAGMSPSRSNTISTVDLNKLRKDASSQDCYDIP
     350       360       370       380       390       400         

          380       390       400       410       420       430    
pF1KA0 QRGGESAGRSAESMSDGVGSFLPGKMIVGRSDSTNSEDNYVPMNPGSSTLLAMERAGDNS
       .    . . : :.. .     . . . ::  .: . ..:::::::.:          .  
CCDS37 RAFPSDRSSSLEGFHNHFK--VKNVLTVGSVSSEELDENYVPMNPNSPPRQHSSSFTEPI
     410       420         430       440       450       460       

           440       450       460               470          480  
pF1KA0 QSV-YIPMSPGAHHFDSLGYPSTTLPVHRG--------PSRGSEI---QPPPVNRNLKPD
       : . :.::.::.  :.:.:.     :.: :        : :   .   .::::.::::::
CCDS37 QEANYVPMTPGTFDFSSFGMQVPP-PAHMGFRSSPKTPPRRPVPVADCEPPPVDRNLKPD
       470       480       490        500       510       520      

                                          490       500         510
pF1KA0 RKA------------------------------KPTPLDLRNNTVIDEL--PFKSPITKS
       ::.                              ::.::...     .::  : .::::.:
CCDS37 RKGQSPKILRLKPHGLERTDSQTIGDFATRRKVKPAPLEIKPLPEWEELQAPVRSPITRS
        530       540       550       560       570       580      

              520       530        540       550       560         
pF1KA0 WSRANHTFNSSSSQYCRPISTQSITST-DSGDSEENYVPMQNPVSASPVPS--GTNS---
       ..: .  :  :     :: :..: ::. :: ::::::::: ::  .:  :.  :.::   
CCDS37 FARDSSRFPMSP----RPDSVHSTTSSSDSHDSEENYVPM-NPNLSSEDPNLFGSNSLDG
        590           600       610       620        630       640 

              570       580       590          600       610       
pF1KA0 ---PAPK-KSTGSVDYLALDFQPSSPSPHRKPSTS---SVTSDEKVDYVQVDKEKTQALQ
          :  : :.  .:.:: ::.. .. .: :: ..:   : ..::.:::: ::..:: ::.
CCDS37 GSSPMIKPKGDKQVEYLDLDLDSGKSTPPRKQKSSGSGSSVADERVDYVVVDQQKTLALK
             650       660       670       680       690       700 

       620       630          
pF1KA0 NTMQEWTDVRQSSEPSKGAKL  
       .: . :                 
CCDS37 STREAWTDGRQSTESETPAKSVK
             710       720    

>>CCDS42976.1 GAB4 gene_id:128954|Hs108|chr22             (574 aa)
 initn: 1782 init1: 577 opt: 801  Z-score: 581.6  bits: 117.7 E(32554): 4.5e-26
Smith-Waterman score: 1746; 51.2% identity (64.6% similar) in 639 aa overlap (2-638:73-574)

                                            10        20        30 
pF1KA0                              MSGDPDVLEYYKNDHSKKPLRIINLNFCEQ-
                                     :.::::::::::: :::::: ::::.::: 
CCDS42 SGWLRKSPPEKKLRLFAWRKRWFILRRGQTSSDPDVLEYYKNDGSKKPLRTINLNLCEQL
             50        60        70        80        90       100  

                40        50        60        70        80         
pF1KA0 -VDAGLTFNKKELQDSFVFDIKTSERTFYLVAETEEDMNKWVQSICQICGFNQAEESTDS
        ::. :.:::::.: ...::::::::::::::::.::::.::::::::::: : ::::  
CCDS42 DVDVTLNFNKKEIQKGYMFDIKTSERTFYLVAETREDMNEWVQSICQICGFRQ-EESTGF
            110       120       130       140       150        160 

      90       100       110       120       130       140         
pF1KA0 LRNVSSAGHGPRSSPAELSSSSQHLLRERKSSAPSHSSQPTLFTFEPPVSNHMQPTLSTS
       : :.:::.::  ::::: : : ::: .:.         .::    :::::. . ::    
CCDS42 LGNISSASHGLCSSPAEPSCSHQHLPQEQ---------EPTS---EPPVSHCVPPTWPIP
             170       180       190                   200         

     150       160       170       180       190       200         
pF1KA0 APQEYLYLHQCISRRAENARSASFSQGTRASFLMRSDTAVQKLAQGNGHCVNGISGQVHG
       ::   :  ::  :.:::.:::::::::..: :.:: .::.:.::: .:. :.:.::..::
CCDS42 APPGCLRSHQHASQRAEHARSASFSQGSEAPFIMRRNTAMQNLAQHSGYSVDGVSGHIHG
     210       220       230       240       250       260         

     210       220       230       240       250       260         
pF1KA0 FYSLPKPSRHNTEFRDSTYDLPRSLASHGHTKGSLTGSETDNEDVYTFKTPSNTLCREFG
       :.:: :::.::.::: ::. .: ::::::::.:::::::.:::                 
CCDS42 FHSLSKPSQHNAEFRGSTHRIPWSLASHGHTRGSLTGSEADNE-----------------
     270       280       290       300       310                   

     270       280       290       300       310       320         
pF1KA0 DLLVDNMDVPATPLSAYQIPRTFTLDKNHNAMTVATPGDSAIAPPPRPPKPSQAETPRWG
                                         :. :                      
CCDS42 ----------------------------------ASSG----------------------
                                                                   

     330       340       350       360       370       380         
pF1KA0 SPQQRPPISENSRSVAATIPRRNTLPAMDNSRLHRASSCETYEYPQRGGESAGRSAESMS
                                                 .: :.:: .:.: :::: 
CCDS42 ------------------------------------------KYTQHGGGNASRPAESMH
                                                  320       330    

     390       400       410       420       430       440         
pF1KA0 DGVGSFLPGKMIVGRSDSTNSEDNYVPMNPGSSTLLAMERAGDNSQSVYIPMSPGAHHFD
       .:: :::::. .:: :::  :: . ::::::: :: :...:::.::.: ::..    .::
CCDS42 EGVCSFLPGRTLVGLSDSIASEGSCVPMNPGSPTLPAVKQAGDDSQGVCIPVGSCLVRFD
          340       350       360       370       380       390    

     450       460       470       480       490       500         
pF1KA0 SLGYPSTTLPVHRGPSRGSEIQPPPVNRNLKPDRKAKPTPLDLRNNTVIDELPFKSPITK
        :: : : : .:.  :.: :.: :::::.:::..::.::: .:::: ::.:: :: :.:.
CCDS42 LLGSPLTELSMHQDLSQGHEVQLPPVNRSLKPNQKANPTPPNLRNNRVINELSFKPPVTE
          400       410       420       430       440       450    

     510       520       530       540       550       560         
pF1KA0 SWSRANHTFNSSSSQYCRPISTQSITSTDSGDSEENYVPMQNPVSASPVPSGTNSPAPKK
        :: ..:::.:::::.  ::::::::.::: :: : :. . ::.:: :: .::.: :: .
CCDS42 PWSGTSHTFDSSSSQH--PISTQSITNTDSEDSGERYL-FPNPASAFPVSGGTSSSAPPR
          460       470         480       490        500       510 

     570       580       590       600       610       620         
pF1KA0 STGSVDYLALDFQPSSPSPHRKPSTSSVTSDEKVDYVQVDKEKTQALQNTMQEWTDVRQS
       :::.. : :::::::      ::: .:::: .:::::::: :::::::.::.:   .:::
CCDS42 STGNIHYAALDFQPS------KPSIGSVTSGKKVDYVQVDLEKTQALQKTMHEQMCLRQS
             520             530       540       550       560     

     630        
pF1KA0 SEPSKGAKL
       ::: .::::
CCDS42 SEPPRGAKL
         570    




638 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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