seq1 = pF1KA0464.tfa, 972 bp seq2 = pF1KA0464/gi568815597f_161970178.tfa (gi568815597f:161970178_162457184), 487007 bp >pF1KA0464 972 >gi568815597f:161970178_162457184 (Chr1) 1-105 (100001-100105) 100% == 177-270 (317166-317259) 100% -> 271-329 (330471-330529) 100% -> 330-438 (362840-362948) 100% -> 439-580 (373658-373799) 100% -> 581-747 (385010-385176) 100% -> 748-972 (386783-387007) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGCCTAGCAAAACCAAGTACAACCTTGTGGACGATGGGCACGACCTGCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100001 ATGCCTAGCAAAACCAAGTACAACCTTGTGGACGATGGGCACGACCTGCG 50 . : . : . : . : . : 51 GATCCCCTTGCACAACGAGGACGCCTTCCAGCACGGCATCTGCTTTGAGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100051 GATCCCCTTGCACAACGAGGACGCCTTCCAGCACGGCATCTGCTTTGAGG 100 . 101 CCAAG ||||| 100101 CCAAG 0 . : . : . : . : . : 177 GTATGAGTTTAAAGCCAAGAACATCAAGAAGAAGAAAGTGAGCATTATGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 317166 GTATGAGTTTAAAGCCAAGAACATCAAGAAGAAGAAAGTGAGCATTATGG 50 . : . : . : . : . : 227 TTTCAGTGGATGGAGTGAAAGTGATTCTGAAGAAGAAGAAAAAG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>... 317216 TTTCAGTGGATGGAGTGAAAGTGATTCTGAAGAAGAAGAAAAAGGTA... 100 . : . : . : . : . : 271 AAAAAGGAATGGACGTGGGATGAGAGCAAGATGCTGGTGATGCAGGA >>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 330468 CAGAAAAAGGAATGGACGTGGGATGAGAGCAAGATGCTGGTGATGCAGGA 150 . : . : . : . : . : 318 CCCCATCTACAG GATCTTCTATGTCTCTCATGATTCCCAAG ||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||| 330518 CCCCATCTACAGGTA...TAGGATCTTCTATGTCTCTCATGATTCCCAAG 200 . : . : . : . : . : 359 ACTTGAAGATCTTCAGCTATATCGCTCGAGATGGTGCCAGCAATATCTTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 362869 ACTTGAAGATCTTCAGCTATATCGCTCGAGATGGTGCCAGCAATATCTTC 250 . : . : . : . : . : 409 AGGTGTAACGTCTTTAAATCCAAGAAGAAG AGCCAAGCTAT ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||| 362919 AGGTGTAACGTCTTTAAATCCAAGAAGAAGGTA...CAGAGCCAAGCTAT 300 . : . : . : . : . : 450 GAGAATCGTTCGGACGGTGGGGCAGGCCTTTGAGGTCTGCCACAAGCTGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 373669 GAGAATCGTTCGGACGGTGGGGCAGGCCTTTGAGGTCTGCCACAAGCTGA 350 . : . : . : . : . : 500 GCCTGCAGCACACGCAGCAGAATGCAGATGGCCAGGAAGATGGAGAGAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 373719 GCCTGCAGCACACGCAGCAGAATGCAGATGGCCAGGAAGATGGAGAGAGC 400 . : . : . : . : . : 550 GAGAGGAACAGCAACAGCTCAGGAGACCCAG GCCGCCAGCT |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||| 373769 GAGAGGAACAGCAACAGCTCAGGAGACCCAGGTA...CAGGCCGCCAGCT 450 . : . : . : . : . : 591 CACTGGAGCCGAGAGGGCCTCCACGGCCACTGCAGAGGAGACTGACATCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 385020 CACTGGAGCCGAGAGGGCCTCCACGGCCACTGCAGAGGAGACTGACATCG 500 . : . : . : . : . : 641 ATGCGGTGGAGGTCCCACTTCCAGGGAATGATGTCCTGGAATTCAGCCGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 385070 ATGCGGTGGAGGTCCCACTTCCAGGGAATGATGTCCTGGAATTCAGCCGA 550 . : . : . : . : . : 691 GGTGTGACTGATCTAGATGCTGTAGGGAAGGAAGGAGGCTCTCACACAGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 385120 GGTGTGACTGATCTAGATGCTGTAGGGAAGGAAGGAGGCTCTCACACAGG 600 . : . : . : . : . : 741 CTCCAAG GTTTCGCACCCCCAGGAGCCCATGCTGACAGCCT |||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||| 385170 CTCCAAGGTA...CAGGTTTCGCACCCCCAGGAGCCCATGCTGACAGCCT 650 . : . : . : . : . : 782 CACCCAGGATGCTGCTCCCTTCTTCTTCCTCGAAGCCTCCAGGCCTGGGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 386817 CACCCAGGATGCTGCTCCCTTCTTCTTCCTCGAAGCCTCCAGGCCTGGGC 700 . : . : . : . : . : 832 ACAGAGACACCGCTGTCCACTCACCACCAGATGCAGCTCCTCCAGCAGCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 386867 ACAGAGACACCGCTGTCCACTCACCACCAGATGCAGCTCCTCCAGCAGCT 750 . : . : . : . : . : 882 CCTCCAGCAGCAGCAGCAGCAGACACAAGTGGCTGTGGCCCAGGTTCTCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 386917 CCTCCAGCAGCAGCAGCAGCAGACACAAGTGGCTGTGGCCCAGGTTCTCC 800 . : . : . : . : 932 TCAGCCTCCTCCCTACTTCGCAGGCTCCACTCTCATGGGCT ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 386967 TCAGCCTCCTCCCTACTTCGCAGGCTCCACTCTCATGGGCT