seq1 = pF1KA0424.tfa, 1548 bp
seq2 = pF1KA0424/gi568815575r_63538031.tfa (gi568815575r:63538031_63824712), 286682 bp

>pF1KA0424 1548
>gi568815575r:63538031_63824712 (ChrX)

(complement)

9-189  (100001-100181)   100% ->
190-381  (118264-118455)   100% ->
382-561  (127409-127588)   100% ->
562-794  (146141-146373)   100% ->
795-924  (150546-150675)   100% ->
925-1056  (158696-158827)   100% ->
1057-1300  (168976-169219)   100% ->
1301-1369  (180665-180733)   100% ->
1370-1548  (186504-186682)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      9 GCTGATCACTGGAGATTCCATCGTTAGTGCTGAGGCAGTATGGGATCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 GCTGATCACTGGAGATTCCATCGTTAGTGCTGAGGCAGTATGGGATCACG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     59 TCACCATGGCCAACCGGGAGTTGGCATTTAAAGCTGGCGACGTCATCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCACCATGGCCAACCGGGAGTTGGCATTTAAAGCTGGCGACGTCATCAAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    109 GTCTTGGATGCTTCCAACAAGGATTGGTGGTGGGGCCAGATCGACGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GTCTTGGATGCTTCCAACAAGGATTGGTGGTGGGGCCAGATCGACGATGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    159 GGAGGGATGGTTTCCTGCCAGCTTTGTGAGG         CTCTGGGTGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 100151 GGAGGGATGGTTTCCTGCCAGCTTTGTGAGGGTG...CAGCTCTGGGTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    200 ACCAGGAGGATGAGGTGGAGGAGGGGCCCAGCGATGTGCAGAACGGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118274 ACCAGGAGGATGAGGTGGAGGAGGGGCCCAGCGATGTGCAGAACGGACAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    250 CTGGACCCCAATTCAGACTGCCTCTGTCTGGGGCGGCCACTACAGAACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118324 CTGGACCCCAATTCAGACTGCCTCTGTCTGGGGCGGCCACTACAGAACCG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    300 GGACCAGATGCGGGCCAATGTCATCAATGAGATAATGAGCACTGAGCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118374 GGACCAGATGCGGGCCAATGTCATCAATGAGATAATGAGCACTGAGCGTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    350 ACTACATCAAGCACCTCAAGGATATTTGTGAG         GGCTATCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 118424 ACTACATCAAGCACCTCAAGGATATTTGTGAGGTA...CAGGGCTATCTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    391 AAGCAGTGCCGGAAGAGAAGGGACATGTTCAGTGACGAGCAACTGAAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127418 AAGCAGTGCCGGAAGAGAAGGGACATGTTCAGTGACGAGCAACTGAAGGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    441 AATCTTTGGGAACATTGAAGATATCTACAGATTTCAGATGGGCTTTGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127468 AATCTTTGGGAACATTGAAGATATCTACAGATTTCAGATGGGCTTTGTGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    491 GAGACCTGGAGAAACAGTATAACAATGATGACCCCCACCTCAGCGAGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127518 GAGACCTGGAGAAACAGTATAACAATGATGACCCCCACCTCAGCGAGATA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    541 GGACCCTGCTTCCTAGAGCAC         CAAGATGGATTCTGGATATA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 127568 GGACCCTGCTTCCTAGAGCACGTA...CAGCAAGATGGATTCTGGATATA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    582 CTCTGAGTATTGTAACAACCACCTGGATGCTTGCATGGAGCTCTCCAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146161 CTCTGAGTATTGTAACAACCACCTGGATGCTTGCATGGAGCTCTCCAAAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    632 TGATGAAGGACAGCCGCTACCAGCACTTCTTTGAGGCCTGTCGCCTCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146211 TGATGAAGGACAGCCGCTACCAGCACTTCTTTGAGGCCTGTCGCCTCTTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    682 CAGCAGATGATTGACATTGCTATCGATGGTTTCCTTTTGACTCCAGTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146261 CAGCAGATGATTGACATTGCTATCGATGGTTTCCTTTTGACTCCAGTGCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    732 GAAGATCTGCAAGTATCCCTTACAGTTGGCTGAGCTCCTAAAGTATACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146311 GAAGATCTGCAAGTATCCCTTACAGTTGGCTGAGCTCCTAAAGTATACTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    782 CCCAAGACCACAG         TGACTACAGGTATGTGGCAGCTGCTTTG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 146361 CCCAAGACCACAGGTA...CAGTGACTACAGGTATGTGGCAGCTGCTTTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    823 GCTGTCATGAGAAATGTGACTCAGCAGATCAACGAACGCAAGCGACGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150574 GCTGTCATGAGAAATGTGACTCAGCAGATCAACGAACGCAAGCGACGTTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    873 AGAGAATATTGACAAGATTGCTCAGTGGCAGGCTTCTGTCCTAGACTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150624 AGAGAATATTGACAAGATTGCTCAGTGGCAGGCTTCTGTCCTAGACTGGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    923 AG         GGCGAGGACATCCTAGACAGGAGCTCGGAGCTGATCTAC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150674 AGGTA...CAGGGCGAGGACATCCTAGACAGGAGCTCGGAGCTGATCTAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    964 ACTGGGGAGATGGCCTGGATCTACCAGCCCTACGGCCGCAACCAGCAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158735 ACTGGGGAGATGGCCTGGATCTACCAGCCCTACGGCCGCAACCAGCAGCG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1014 GGTCTTCTTCCTGTTTGACCACCAGATGGTCCTCTGCAAGAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 158785 GGTCTTCTTCCTGTTTGACCACCAGATGGTCCTCTGCAAGAAGGTA...T

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1057   GACCTAATCCGGAGAGACATCCTGTACTACAAAGGCCGCATTGACATG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168974 AGGACCTAATCCGGAGAGACATCCTGTACTACAAAGGCCGCATTGACATG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1105 GATAAATATGAGGTAGTTGACATTGAGGATGGCAGAGATGATGACTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169024 GATAAATATGAGGTAGTTGACATTGAGGATGGCAGAGATGATGACTTCAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1155 TGTCAGCATGAAGAATGCCTTTAAGCTTCACAACAAGGAGACTGAGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169074 TGTCAGCATGAAGAATGCCTTTAAGCTTCACAACAAGGAGACTGAGGAGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1205 TACATCTGTTCTTTGCCAAGAAGCTGGAGGAAAAAATACGCTGGCTCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169124 TACATCTGTTCTTTGCCAAGAAGCTGGAGGAAAAAATACGCTGGCTCAGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1255 GCTTTCAGAGAAGAGAGGAAAATGGTACAGGAAGATGAAAAAATTG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 169174 GCTTTCAGAGAAGAGAGGAAAATGGTACAGGAAGATGAAAAAATTGGTA.

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301      GCTTTGAAATTTCTGAAAACCAGAAGAGGCAGGCTGCAATGACTG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169224 ..TAGGCTTTGAAATTTCTGAAAACCAGAAGAGGCAGGCTGCAATGACTG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1346 TGAGAAAAGTCCCTAAGCAAAAAG         GTGTCAACTCTGCCCGC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 180710 TGAGAAAAGTCCCTAAGCAAAAAGGTA...TAGGTGTCAACTCTGCCCGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1387 TCAGTTCCTCCTTCCTACCCACCACCGCAGGACCCGTTAAACCACGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186521 TCAGTTCCTCCTTCCTACCCACCACCGCAGGACCCGTTAAACCACGGCCA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1437 GTACCTGGTCCCCGACGGCATCGCTCAGTCGCAGGTCTTTGAGTTCACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186571 GTACCTGGTCCCCGACGGCATCGCTCAGTCGCAGGTCTTTGAGTTCACCG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1487 AACCCAAGCGCAGCCAGTCACCATTCTGGCAAAACTTCAGCAGGTTAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186621 AACCCAAGCGCAGCCAGTCACCATTCTGGCAAAACTTCAGCAGGTTAACC

   1600     .    :
   1537 CCCTTCAAAAAA
        ||||||||||||
 186671 CCCTTCAAAAAA