FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB5724, 729 aa 1>>>pF1KB5724 729 - 729 aa - 729 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.6979+/-0.00174; mu= -1.9775+/- 0.098 mean_var=403.3736+/-99.676, 0's: 0 Z-trim(103.3): 393 B-trim: 96 in 1/50 Lambda= 0.063859 statistics sampled from 6945 (7351) to 6945 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.562), E-opt: 0.2 (0.226), width: 16 Scan time: 2.880 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS8968.1 TBK1 gene_id:29110|Hs108|chr12 ( 729) 4799 458.4 1.7e-128 CCDS30996.1 IKBKE gene_id:9641|Hs108|chr1 ( 716) 1981 198.8 2.4e-50 CCDS73019.1 IKBKE gene_id:9641|Hs108|chr1 ( 657) 1951 196.0 1.6e-49 CCDS53464.1 IKBKE gene_id:9641|Hs108|chr1 ( 631) 1600 163.6 8.3e-40 >>CCDS8968.1 TBK1 gene_id:29110|Hs108|chr12 (729 aa) initn: 4799 init1: 4799 opt: 4799 Z-score: 2420.2 bits: 458.4 E(32554): 1.7e-128 Smith-Waterman score: 4799; 100.0% identity (100.0% similar) in 729 aa overlap (1-729:1-729) 10 20 30 40 50 60 pF1KB5 MQSTSNHLWLLSDILGQGATANVFRGRHKKTGDLFAIKVFNNISFLRPVDVQMREFEVLK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS89 MQSTSNHLWLLSDILGQGATANVFRGRHKKTGDLFAIKVFNNISFLRPVDVQMREFEVLK 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB5 KLNHKNIVKLFAIEEETTTRHKVLIMEFCPCGSLYTVLEEPSNAYGLPESEFLIVLRDVV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS89 KLNHKNIVKLFAIEEETTTRHKVLIMEFCPCGSLYTVLEEPSNAYGLPESEFLIVLRDVV 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB5 GGMNHLRENGIVHRDIKPGNIMRVIGEDGQSVYKLTDFGAARELEDDEQFVSLYGTEEYL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS89 GGMNHLRENGIVHRDIKPGNIMRVIGEDGQSVYKLTDFGAARELEDDEQFVSLYGTEEYL 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB5 HPDMYERAVLRKDHQKKYGATVDLWSIGVTFYHAATGSLPFRPFEGPRRNKEVMYKIITG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS89 HPDMYERAVLRKDHQKKYGATVDLWSIGVTFYHAATGSLPFRPFEGPRRNKEVMYKIITG 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB5 KPSGAISGVQKAENGPIDWSGDMPVSCSLSRGLQVLLTPVLANILEADQEKCWGFDQFFA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS89 KPSGAISGVQKAENGPIDWSGDMPVSCSLSRGLQVLLTPVLANILEADQEKCWGFDQFFA 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB5 ETSDILHRMVIHVFSLQQMTAHKIYIHSYNTATIFHELVYKQTKIISSNQELIYEGRRLV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS89 ETSDILHRMVIHVFSLQQMTAHKIYIHSYNTATIFHELVYKQTKIISSNQELIYEGRRLV 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KB5 LEPGRLAQHFPKTTEENPIFVVSREPLNTIGLIYEKISLPKVHPRYDLDGDASMAKAITG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS89 LEPGRLAQHFPKTTEENPIFVVSREPLNTIGLIYEKISLPKVHPRYDLDGDASMAKAITG 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KB5 VVCYACRIASTLLLYQELMRKGIRWLIELIKDDYNETVHKKTEVVITLDFCIRNIEKTVK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS89 VVCYACRIASTLLLYQELMRKGIRWLIELIKDDYNETVHKKTEVVITLDFCIRNIEKTVK 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KB5 VYEKLMKINLEAAELGEISDIHTKLLRLSSSQGTIETSLQDIDSRLSPGGSLADAWAHQE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS89 VYEKLMKINLEAAELGEISDIHTKLLRLSSSQGTIETSLQDIDSRLSPGGSLADAWAHQE 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KB5 GTHPKDRNVEKLQVLLNCMTEIYYQFKKDKAERRLAYNEEQIHKFDKQKLYYHATKAMTH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS89 GTHPKDRNVEKLQVLLNCMTEIYYQFKKDKAERRLAYNEEQIHKFDKQKLYYHATKAMTH 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KB5 FTDECVKKYEAFLNKSEEWIRKMLHLRKQLLSLTNQCFDIEEEVSKYQEYTNELQETLPQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS89 FTDECVKKYEAFLNKSEEWIRKMLHLRKQLLSLTNQCFDIEEEVSKYQEYTNELQETLPQ 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KB5 KMFTASSGIKHTMTPIYPSSNTLVEMTLGMKKLKEEMEGVVKELAENNHILERFGSLTMD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS89 KMFTASSGIKHTMTPIYPSSNTLVEMTLGMKKLKEEMEGVVKELAENNHILERFGSLTMD 670 680 690 700 710 720 pF1KB5 GGLRNVDCL ::::::::: CCDS89 GGLRNVDCL >>CCDS30996.1 IKBKE gene_id:9641|Hs108|chr1 (716 aa) initn: 2148 init1: 1951 opt: 1981 Z-score: 1017.2 bits: 198.8 E(32554): 2.4e-50 Smith-Waterman score: 2222; 49.3% identity (74.9% similar) in 718 aa overlap (1-714:1-707) 10 20 30 40 50 60 pF1KB5 MQSTSNHLWLLSDILGQGATANVFRGRHKKTGDLFAIKVFNNISFLRPVDVQMREFEVLK ::::.:.:: .:.:::::::.:...:.::.:.: :.::::. :.::: .::.::::::. 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