Result of FASTA (ccds) for pFN21AB5724
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5724, 729 aa
  1>>>pF1KB5724 729 - 729 aa - 729 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.6979+/-0.00174; mu= -1.9775+/- 0.098
 mean_var=403.3736+/-99.676, 0's: 0 Z-trim(103.3): 393  B-trim: 96 in 1/50
 Lambda= 0.063859
 statistics sampled from 6945 (7351) to 6945 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.562), E-opt: 0.2 (0.226), width:  16
 Scan time:  2.880

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS8968.1 TBK1 gene_id:29110|Hs108|chr12          ( 729) 4799 458.4 1.7e-128
CCDS30996.1 IKBKE gene_id:9641|Hs108|chr1          ( 716) 1981 198.8 2.4e-50
CCDS73019.1 IKBKE gene_id:9641|Hs108|chr1          ( 657) 1951 196.0 1.6e-49
CCDS53464.1 IKBKE gene_id:9641|Hs108|chr1          ( 631) 1600 163.6 8.3e-40


>>CCDS8968.1 TBK1 gene_id:29110|Hs108|chr12               (729 aa)
 initn: 4799 init1: 4799 opt: 4799  Z-score: 2420.2  bits: 458.4 E(32554): 1.7e-128
Smith-Waterman score: 4799; 100.0% identity (100.0% similar) in 729 aa overlap (1-729:1-729)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MQSTSNHLWLLSDILGQGATANVFRGRHKKTGDLFAIKVFNNISFLRPVDVQMREFEVLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 MQSTSNHLWLLSDILGQGATANVFRGRHKKTGDLFAIKVFNNISFLRPVDVQMREFEVLK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 KLNHKNIVKLFAIEEETTTRHKVLIMEFCPCGSLYTVLEEPSNAYGLPESEFLIVLRDVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 KLNHKNIVKLFAIEEETTTRHKVLIMEFCPCGSLYTVLEEPSNAYGLPESEFLIVLRDVV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 GGMNHLRENGIVHRDIKPGNIMRVIGEDGQSVYKLTDFGAARELEDDEQFVSLYGTEEYL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 GGMNHLRENGIVHRDIKPGNIMRVIGEDGQSVYKLTDFGAARELEDDEQFVSLYGTEEYL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 HPDMYERAVLRKDHQKKYGATVDLWSIGVTFYHAATGSLPFRPFEGPRRNKEVMYKIITG
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CCDS89 HPDMYERAVLRKDHQKKYGATVDLWSIGVTFYHAATGSLPFRPFEGPRRNKEVMYKIITG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 KPSGAISGVQKAENGPIDWSGDMPVSCSLSRGLQVLLTPVLANILEADQEKCWGFDQFFA
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CCDS89 KPSGAISGVQKAENGPIDWSGDMPVSCSLSRGLQVLLTPVLANILEADQEKCWGFDQFFA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 ETSDILHRMVIHVFSLQQMTAHKIYIHSYNTATIFHELVYKQTKIISSNQELIYEGRRLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 ETSDILHRMVIHVFSLQQMTAHKIYIHSYNTATIFHELVYKQTKIISSNQELIYEGRRLV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 LEPGRLAQHFPKTTEENPIFVVSREPLNTIGLIYEKISLPKVHPRYDLDGDASMAKAITG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 LEPGRLAQHFPKTTEENPIFVVSREPLNTIGLIYEKISLPKVHPRYDLDGDASMAKAITG
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 VVCYACRIASTLLLYQELMRKGIRWLIELIKDDYNETVHKKTEVVITLDFCIRNIEKTVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 VVCYACRIASTLLLYQELMRKGIRWLIELIKDDYNETVHKKTEVVITLDFCIRNIEKTVK
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB5 VYEKLMKINLEAAELGEISDIHTKLLRLSSSQGTIETSLQDIDSRLSPGGSLADAWAHQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 VYEKLMKINLEAAELGEISDIHTKLLRLSSSQGTIETSLQDIDSRLSPGGSLADAWAHQE
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB5 GTHPKDRNVEKLQVLLNCMTEIYYQFKKDKAERRLAYNEEQIHKFDKQKLYYHATKAMTH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 GTHPKDRNVEKLQVLLNCMTEIYYQFKKDKAERRLAYNEEQIHKFDKQKLYYHATKAMTH
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB5 FTDECVKKYEAFLNKSEEWIRKMLHLRKQLLSLTNQCFDIEEEVSKYQEYTNELQETLPQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 FTDECVKKYEAFLNKSEEWIRKMLHLRKQLLSLTNQCFDIEEEVSKYQEYTNELQETLPQ
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB5 KMFTASSGIKHTMTPIYPSSNTLVEMTLGMKKLKEEMEGVVKELAENNHILERFGSLTMD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 KMFTASSGIKHTMTPIYPSSNTLVEMTLGMKKLKEEMEGVVKELAENNHILERFGSLTMD
              670       680       690       700       710       720

                
pF1KB5 GGLRNVDCL
       :::::::::
CCDS89 GGLRNVDCL
                

>>CCDS30996.1 IKBKE gene_id:9641|Hs108|chr1               (716 aa)
 initn: 2148 init1: 1951 opt: 1981  Z-score: 1017.2  bits: 198.8 E(32554): 2.4e-50
Smith-Waterman score: 2222; 49.3% identity (74.9% similar) in 718 aa overlap (1-714:1-707)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MQSTSNHLWLLSDILGQGATANVFRGRHKKTGDLFAIKVFNNISFLRPVDVQMREFEVLK
       ::::.:.::  .:.:::::::.:...:.::.:.: :.::::. :.::: .::.::::::.
CCDS30 MQSTANYLWHTDDLLGQGATASVYKARNKKSGELVAVKVFNTTSYLRPREVQVREFEVLR
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 KLNHKNIVKLFAIEEETTTRHKVLIMEFCPCGSLYTVLEEPSNAYGLPESEFLIVLRDVV
       ::::.:::::::.::   .:.:::.::.:  ::: .::: : ::.::::.:::.::: ::
CCDS30 KLNHQNIVKLFAVEETGGSRQKVLVMEYCSSGSLLSVLESPENAFGLPEDEFLVVLRCVV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 GGMNHLRENGIVHRDIKPGNIMRVIGEDGQSVYKLTDFGAARELEDDEQFVSLYGTEEYL
       .::::::::::::::::::::::..::.:::.::::::::::::.:::.:::.:::::::
CCDS30 AGMNHLRENGIVHRDIKPGNIMRLVGEEGQSIYKLTDFGAARELDDDEKFVSVYGTEEYL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 HPDMYERAVLRKDHQKKYGATVDLWSIGVTFYHAATGSLPFRPFEGPRRNKEVMYKIITG
       :::::::::::: .:: .:.::::::::::.:::::::::: :: :::::::.::.: : 
CCDS30 HPDMYERAVLRKPQQKAFGVTVDLWSIGVTLYHAATGSLPFIPFGGPRRNKEIMYRITTE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 KPSGAISGVQKAENGPIDWSGDMPVSCSLSRGLQVLLTPVLANILEADQEKCWGFDQFFA
       ::.:::.:.:. ::::..::  .:..:.:: :::  :.:.::::::..: ::::::::::
CCDS30 KPAGAIAGAQRRENGPLEWSYTLPITCQLSLGLQSQLVPILANILEVEQAKCWGFDQFFA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 ETSDILHRMVIHVFSLQQMTAHKIYIHSYNTATIFHELVYKQTKIISSNQELIYEGRRLV
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CCDS30 ETSDILQRVVVHVFSLSQAVLHHIYIHAHNTIAIFQEAVHKQTSVAPRHQEYLFEGHLCV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 LEPGRLAQHFPKTTEENPIFVVSREPLNTIGLIYEKISLPKVHPRYDLDGDASMAKAITG
       :::.  :::. .::  .:. . :    . ...    ...::  :. ::..: . ::.. :
CCDS30 LEPSVSAQHIAHTTASSPLTLFSTAIPKGLAFRDPALDVPKFVPKVDLQADYNTAKGVLG
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 VVCYACRIASTLLLYQELMRKGIRWLIELIKDDYNETVHKKTEVVITLDFCIRNIEKTVK
       .   : :.: .::  :::: .:..:..:...     : ..  ::. :  . . .   :  
CCDS30 AGYQALRLARALLDGQELMFRGLHWVMEVLQ----ATCRRTLEVARTSLLYLSSSLGT--
              430       440       450           460       470      

                490       500       510       520       530        
pF1KB5 VYEKLMKI--NLEAAELGEISDIHTKLLRLSSSQGTIETSLQDIDSRLSPGGSLADAWAH
         :.. ..  . :  ::   ......:  :.   .    .. . .  ::   ::    ..
CCDS30 --ERFSSVAGTPEIQELKAAAELRSRLRTLAEVLSRCSQNITETQESLS---SLNRELVK
            480       490       500       510       520            

      540       550       560       570       580       590        
pF1KB5 QEGTHPKDRNVEKLQVLLNCMTEIYYQFKKDKAERRLAYNEEQIHKFDKQKLYYHATKAM
       ..    .::.....:  :. :. :: ::::.. .  :.::::::::.:: .. . : . .
CCDS30 SRDQVHEDRSIQQIQCCLDKMNFIYKQFKKSRMRPGLGYNEEQIHKLDKVNFSHLAKRLL
     530       540       550       560       570       580         

      600       610       620       630       640       650        
pF1KB5 THFTDECVKKYEAFLNKSEEWIRKMLHLRKQLLSLTNQCFDIEEEVSKYQEYTNELQETL
         : .:::.::.: :    . .: . . :..:  .  .    . :..  ::  ..: : :
CCDS30 QVFQEECVQKYQASLVTHGKRMRVVHETRNHLRLVGCSVAACNTEAQGVQESLSKLLEEL
     590       600       610       620       630       640         

      660        670        680       690       700       710      
pF1KB5 PQKMFTA-SSGIKHTMTPIYP-SSNTLVEMTLGMKKLKEEMEGVVKELAENNHILERFGS
        ....   ..: . .  :: :  : :  .. : :..: : :. ....: .::.:.::.  
CCDS30 SHQLLQDRAKGAQASPPPIAPYPSPTRKDLLLHMQELCEGMKLLASDLLDNNRIIERLNR
     650       660       670       680       690       700         

        720         
pF1KB5 LTMDGGLRNVDCL
                    
CCDS30 VPAPPDV      
     710            

>>CCDS73019.1 IKBKE gene_id:9641|Hs108|chr1               (657 aa)
 initn: 2148 init1: 1951 opt: 1951  Z-score: 1002.7  bits: 196.0 E(32554): 1.6e-49
Smith-Waterman score: 2134; 52.4% identity (77.1% similar) in 632 aa overlap (1-630:1-621)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MQSTSNHLWLLSDILGQGATANVFRGRHKKTGDLFAIKVFNNISFLRPVDVQMREFEVLK
       ::::.:.::  .:.:::::::.:...:.::.:.: :.::::. :.::: .::.::::::.
CCDS73 MQSTANYLWHTDDLLGQGATASVYKARNKKSGELVAVKVFNTTSYLRPREVQVREFEVLR
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 KLNHKNIVKLFAIEEETTTRHKVLIMEFCPCGSLYTVLEEPSNAYGLPESEFLIVLRDVV
       ::::.:::::::.::   .:.:::.::.:  ::: .::: : ::.::::.:::.::: ::
CCDS73 KLNHQNIVKLFAVEETGGSRQKVLVMEYCSSGSLLSVLESPENAFGLPEDEFLVVLRCVV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 GGMNHLRENGIVHRDIKPGNIMRVIGEDGQSVYKLTDFGAARELEDDEQFVSLYGTEEYL
       .::::::::::::::::::::::..::.:::.::::::::::::.:::.:::.:::::::
CCDS73 AGMNHLRENGIVHRDIKPGNIMRLVGEEGQSIYKLTDFGAARELDDDEKFVSVYGTEEYL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 HPDMYERAVLRKDHQKKYGATVDLWSIGVTFYHAATGSLPFRPFEGPRRNKEVMYKIITG
       :::::::::::: .:: .:.::::::::::.:::::::::: :: :::::::.::.: : 
CCDS73 HPDMYERAVLRKPQQKAFGVTVDLWSIGVTLYHAATGSLPFIPFGGPRRNKEIMYRITTE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 KPSGAISGVQKAENGPIDWSGDMPVSCSLSRGLQVLLTPVLANILEADQEKCWGFDQFFA
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CCDS73 --ERFSSVAGTPEIQELKAAAELRSRLRTLAEVLSRCSQNITETQESLS---SLNRELVK
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