Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB8518
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8518, 869 aa
1>>>pF1KB8518 869 - 869 aa - 869 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.1006+/-0.00151; mu= -23.4542+/- 0.086
mean_var=664.7971+/-154.980, 0's: 0 Z-trim(107.4): 330 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.049743
statistics sampled from 9262 (9576) to 9262 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.647), E-opt: 0.2 (0.294), width: 16
Scan time: 4.090
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS48005.1 MUSK gene_id:4593|Hs108|chr9 ( 869) 5836 435.8 1.6e-121
CCDS75874.1 MUSK gene_id:4593|Hs108|chr9 ( 783) 3336 256.3 1.5e-67
CCDS626.1 ROR1 gene_id:4919|Hs108|chr1 ( 937) 930 83.7 1.6e-15
CCDS6691.1 ROR2 gene_id:4920|Hs108|chr9 ( 943) 876 79.9 2.4e-14
CCDS58399.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15 ( 817) 814 75.3 4.8e-13
CCDS10340.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15 ( 825) 814 75.4 4.8e-13
CCDS4411.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5 ( 762) 798 74.2 1e-12
CCDS4410.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5 ( 802) 798 74.2 1.1e-12
CCDS78096.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5 ( 734) 776 72.6 3e-12
CCDS4690.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6 ( 876) 776 72.7 3.3e-12
CCDS56411.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6 ( 894) 776 72.7 3.4e-12
CCDS34385.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6 ( 913) 776 72.7 3.4e-12
CCDS53525.1 RET gene_id:5979|Hs108|chr10 (1072) 773 72.5 4.5e-12
CCDS7200.1 RET gene_id:5979|Hs108|chr10 (1114) 773 72.5 4.6e-12
CCDS55221.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 812) 758 71.3 7.8e-12
CCDS55222.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 820) 758 71.3 7.8e-12
CCDS81514.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 593) 749 70.5 9.7e-12
CCDS44488.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 680) 749 70.6 1.1e-11
CCDS43731.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 731) 750 70.7 1.1e-11
CCDS43730.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 733) 750 70.7 1.1e-11
CCDS44485.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 704) 749 70.6 1.1e-11
CCDS44487.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 705) 749 70.6 1.1e-11
CCDS53584.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 707) 749 70.6 1.1e-11
CCDS44486.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 709) 749 70.6 1.1e-11
CCDS73210.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 732) 749 70.6 1.1e-11
CCDS3354.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 ( 694) 748 70.5 1.1e-11
CCDS43732.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 820) 750 70.8 1.2e-11
CCDS6107.2 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 822) 750 70.8 1.2e-11
CCDS44489.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 769) 749 70.7 1.2e-11
CCDS55223.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 853) 750 70.8 1.2e-11
CCDS81515.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 819) 749 70.7 1.2e-11
CCDS31298.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 821) 749 70.7 1.2e-11
CCDS7620.2 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 822) 749 70.7 1.2e-11
CCDS3353.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 ( 806) 748 70.6 1.3e-11
CCDS54706.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 ( 808) 748 70.6 1.3e-11
CCDS75419.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6 ( 767) 741 70.1 1.7e-11
CCDS47396.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6 ( 919) 719 68.6 5.9e-11
>>CCDS48005.1 MUSK gene_id:4593|Hs108|chr9 (869 aa)
initn: 5836 init1: 5836 opt: 5836 Z-score: 2295.1 bits: 435.8 E(32554): 1.6e-121
Smith-Waterman score: 5836; 100.0% identity (100.0% similar) in 869 aa overlap (1-869:1-869)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MRELVNIPLVHILTLVAFSGTEKLPKAPVITTPLETVDALVEEVATFMCAVESYPQPEIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 MRELVNIPLVHILTLVAFSGTEKLPKAPVITTPLETVDALVEEVATFMCAVESYPQPEIS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 WTRNKILIKLFDTRYSIRENGQLLTILSVEDSDDGIYCCTANNGVGGAVESCGALQVKMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 WTRNKILIKLFDTRYSIRENGQLLTILSVEDSDDGIYCCTANNGVGGAVESCGALQVKMK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 PKITRPPINVKIIEGLKAVLPCTTMGNPKPSVSWIKGDSPLRENSRIAVLESGSLRIHNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 PKITRPPINVKIIEGLKAVLPCTTMGNPKPSVSWIKGDSPLRENSRIAVLESGSLRIHNV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 QKEDAGQYRCVAKNSLGTAYSKVVKLEVEVFARILRAPESHNVTFGSFVTLHCTATGIPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 QKEDAGQYRCVAKNSLGTAYSKVVKLEVEVFARILRAPESHNVTFGSFVTLHCTATGIPV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 PTITWIENGNAVSSGSIQESVKDRVIDSRLQLFITKPGLYTCIATNKHGEKFSTAKAAAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 PTITWIENGNAVSSGSIQESVKDRVIDSRLQLFITKPGLYTCIATNKHGEKFSTAKAAAT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 ISIAEWSKPQKDNKGYCAQYRGEVCNAVLAKDALVFLNTSYADPEEAQELLVHTAWNELK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 ISIAEWSKPQKDNKGYCAQYRGEVCNAVLAKDALVFLNTSYADPEEAQELLVHTAWNELK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 VVSPVCRPAAEALLCNHIFQECSPGVVPTPIPICREYCLAVKELFCAKEWLVMEEKTHRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 VVSPVCRPAAEALLCNHIFQECSPGVVPTPIPICREYCLAVKELFCAKEWLVMEEKTHRG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 LYRSEMHLLSVPECSKLPSMHWDPTACARLPHLDYNKENLKTFPPMTSSKPSVDIPNLPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 LYRSEMHLLSVPECSKLPSMHWDPTACARLPHLDYNKENLKTFPPMTSSKPSVDIPNLPS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 SSSSSFSVSPTYSMTVIISIMSSFAIFVLLTITTLYCCRRRKQWKNKKRESAAVTLTTLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 SSSSSFSVSPTYSMTVIISIMSSFAIFVLLTITTLYCCRRRKQWKNKKRESAAVTLTTLP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 SELLLDRLHPNPMYQRMPLLLNPKLLSLEYPRNNIEYVRDIGEGAFGRVFQARAPGLLPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 SELLLDRLHPNPMYQRMPLLLNPKLLSLEYPRNNIEYVRDIGEGAFGRVFQARAPGLLPY
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 EPFTMVAVKMLKEEASADMQADFQREAALMAEFDNPNIVKLLGVCAVGKPMCLLFEYMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 EPFTMVAVKMLKEEASADMQADFQREAALMAEFDNPNIVKLLGVCAVGKPMCLLFEYMAY
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 GDLNEFLRSMSPHTVCSLSHSDLSMRAQVSSPGPPPLSCAEQLCIARQVAAGMAYLSERK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 GDLNEFLRSMSPHTVCSLSHSDLSMRAQVSSPGPPPLSCAEQLCIARQVAAGMAYLSERK
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 FVHRDLATRNCLVGENMVVKIADFGLSRNIYSADYYKANENDAIPIRWMPPESIFYNRYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 FVHRDLATRNCLVGENMVVKIADFGLSRNIYSADYYKANENDAIPIRWMPPESIFYNRYT
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB8 TESDVWAYGVVLWEIFSYGLQPYYGMAHEEVIYYVRDGNILSCPENCPVELYNLMRLCWS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 TESDVWAYGVVLWEIFSYGLQPYYGMAHEEVIYYVRDGNILSCPENCPVELYNLMRLCWS
790 800 810 820 830 840
850 860
pF1KB8 KLPADRPSFTSIHRILERMCERAEGTVSV
:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 KLPADRPSFTSIHRILERMCERAEGTVSV
850 860
>>CCDS75874.1 MUSK gene_id:4593|Hs108|chr9 (783 aa)
initn: 4094 init1: 2749 opt: 3336 Z-score: 1326.0 bits: 256.3 E(32554): 1.5e-67
Smith-Waterman score: 4921; 87.8% identity (87.9% similar) in 879 aa overlap (1-869:1-783)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MRELVNIPLVHILTLVAFSGTEKLPKAPVITTPLETVDALVEEVATFMCAVESYPQPEIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MRELVNIPLVHILTLVAFSGTEKLPKAPVITTPLETVDALVEEVATFMCAVESYPQPEIS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 WTRNKILIKLFDTRYSIRENGQLLTILSVEDSDDGIYCCTANNGVGGAVESCGALQVKMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 WTRNKILIKLFDTRYSIRENGQLLTILSVEDSDDGIYCCTANNGVGGAVESCGALQVKMK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 PKITRPPINVKIIEGLKAVLPCTTMGNPKPSVSWIKGDSPLRENSRIAVLESGSLRIHNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 PKITRPPINVKIIEGLKAVLPCTTMGNPKPSVSWIKGDSPLRENSRIAVLESGSLRIHNV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KB8 QKEDAGQYRCVAKNSLGTAYSKVVKLEVE----------VFARILRAPESHNVTFGSFVT
::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::
CCDS75 QKEDAGQYRCVAKNSLGTAYSKVVKLEVEEESEPEQDTKVFARILRAPESHNVTFGSFVT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 LHCTATGIPVPTITWIENGNAVSSGSIQESVKDRVIDSRLQLFITKPGLYTCIATNKHGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LHCTATGIPVPTITWIENGNAVSSGSIQESVKDRVIDSRLQLFITKPGLYTCIATNKHGE
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 KFSTAKAAATISIAEWSKPQKDNKGYCAQYRGEVCNAVLAKDALVFLNTSYADPEEAQEL
::::::::::::::::
CCDS75 KFSTAKAAATISIAEW--------------------------------------------
310
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 LVHTAWNELKVVSPVCRPAAEALLCNHIFQECSPGVVPTPIPICREYCLAVKELFCAKEW
::::::::::::::::
CCDS75 --------------------------------------------REYCLAVKELFCAKEW
320 330
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 LVMEEKTHRGLYRSEMHLLSVPECSKLPSMHWDPTACARLPHLDYNKENLKTFPPMTSSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: .::::::::
CCDS75 LVMEEKTHRGLYRSEMHLLSVPECSKLPSMHWDPTACARLPHL--------AFPPMTSSK
340 350 360 370 380
480 490 500 510 520 530
pF1KB8 PSVDIPNLPSSSSSSFSVSPTYSMTVIISIMSSFAIFVLLTITTLYCCRRRKQWKNKKRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 PSVDIPNLPSSSSSSFSVSPTYSMTVIISIMSSFAIFVLLTITTLYCCRRRKQWKNKKRE
390 400 410 420 430 440
540 550 560 570 580 590
pF1KB8 SAAVTLTTLPSELLLDRLHPNPMYQRMPLLLNPKLLSLEYPRNNIEYVRDIGEGAFGRVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SAAVTLTTLPSELLLDRLHPNPMYQRMPLLLNPKLLSLEYPRNNIEYVRDIGEGAFGRVF
450 460 470 480 490 500
600 610 620 630 640 650
pF1KB8 QARAPGLLPYEPFTMVAVKMLKEEASADMQADFQREAALMAEFDNPNIVKLLGVCAVGKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 QARAPGLLPYEPFTMVAVKMLKEEASADMQADFQREAALMAEFDNPNIVKLLGVCAVGKP
510 520 530 540 550 560
660 670 680 690 700 710
pF1KB8 MCLLFEYMAYGDLNEFLRSMSPHTVCSLSHSDLSMRAQVSSPGPPPLSCAEQLCIARQVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MCLLFEYMAYGDLNEFLRSMSPHTVCSLSHSDLSMRAQVSSPGPPPLSCAEQLCIARQVA
570 580 590 600 610 620
720 730 740 750 760 770
pF1KB8 AGMAYLSERKFVHRDLATRNCLVGENMVVKIADFGLSRNIYSADYYKANENDAIPIRWMP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 AGMAYLSERKFVHRDLATRNCLVGENMVVKIADFGLSRNIYSADYYKANENDAIPIRWMP
630 640 650 660 670 680
780 790 800 810 820 830
pF1KB8 PESIFYNRYTTESDVWAYGVVLWEIFSYGLQPYYGMAHEEVIYYVRDGNILSCPENCPVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 PESIFYNRYTTESDVWAYGVVLWEIFSYGLQPYYGMAHEEVIYYVRDGNILSCPENCPVE
690 700 710 720 730 740
840 850 860
pF1KB8 LYNLMRLCWSKLPADRPSFTSIHRILERMCERAEGTVSV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LYNLMRLCWSKLPADRPSFTSIHRILERMCERAEGTVSV
750 760 770 780
>>CCDS626.1 ROR1 gene_id:4919|Hs108|chr1 (937 aa)
initn: 821 init1: 670 opt: 930 Z-score: 391.9 bits: 83.7 E(32554): 1.6e-15
Smith-Waterman score: 1133; 32.3% identity (59.4% similar) in 711 aa overlap (221-853:65-743)
200 210 220 230 240
pF1KB8 VAKNSLGTAYSKVVKLEVEVFARILRAPESHNVT--FGSFVTLHCTATGIPVPTITWIEN
.:.: .:. . ::: ..: : ::: :..:
CCDS62 SVSAELVPTSSWNISSELNKDSYLTLDEPMNNITTSLGQTAELHCKVSGNPPPTIRWFKN
40 50 60 70 80 90
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 GNAVSSGSIQESVKDRVIDSRLQ---LFITKPGLYTCIATNKHGEKFSTAKAAATISIAE
: . . : .. . :::. : : : . :.::: . ::. . ..
CCDS62 DAPVVQEPRRLSFRSTIYGSRLRIRNLDTTDTGYFQCVATNGKEVVSSTGVLFVKFGPPP
100 110 120 130 140 150
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 WSKP----QKDNKGYCAQYRGEVCNAVLAKDALVFLNTSYADPE-EAQELLVHTAWNELK
..: . .. :.: ::: .: : . . :.... . . : : : . : . .
CCDS62 TASPGYSDEYEEDGFCQPYRGIAC-ARFIGNRTVYMESLHMQGEIENQITAAFTMIGTSS
160 170 180 190 200 210
370 380 390 400 410
pF1KB8 VVSPVCRPAAEALLCNHIFQECSP-GVVPTPIPICREYCLAVKELFCAKEWLVMEEKTHR
.: : : ::.. : :. . :: : .::. : .....: :. .. ...
CCDS62 HLSDKCSQFAIPSLCHYAFPYCDETSSVPKPRDLCRDECEILENVLCQTEY-IFARSNPM
220 230 240 250 260 270
420 430 440 450 460
pF1KB8 GLYRSEMHLLSVPECSKLPSMHWDPTA--CARL--PHLDYNKENLKTF------------
:.: :..:.: ::. . .: : : :. : : ..: : .
CCDS62 ILMR-----LKLPNCEDLPQPE-SPEAANCIRIGIPMADPINKNHKCYNSTGVDYRGTVS
280 290 300 310 320
470 480 490
pF1KB8 --------PPMTSSKP------SVDIPNL---------PSSSSSS---FSVSPTYS----
: .:. : .. .:.: :.... . :... ...
CCDS62 VTKSGRQCQPWNSQYPHTHTFTALRFPELNGGHSYCRNPGNQKEAPWCFTLDENFKSDLC
330 340 350 360 370 380
500 510 520 530
pF1KB8 ---------------MTVIISIMSSFAIFVLLTITTLYCCRRRKQWKNKKRESAAVTLTT
: .. .. : :: . ... .. : :. :.: :: :
CCDS62 DIPACDSKDSKEKNKMEILYILVPSVAIPLAIALLFFFICVCRN---NQKSSSAPV--QR
390 400 410 420 430 440
540 550 560 570 580 590
pF1KB8 LPSELLLDRLHPNPMYQRMPLL--LNPKLLSLEYPRNNIEYVRDIGEGAFGRVFQARA--
:. : . .: .: .:: . : : . .......:: :::......
CCDS62 QPK-------HVRGQNVEMSMLNAYKPKSKAKELPLSAVRFMEELGECAFGKIYKGHLYL
450 460 470 480 490
600 610 620 630 640 650
pF1KB8 PGLLPYEPFTMVAVKMLKEEASADMQADFQREAALMAEFDNPNIVKLLGVCAVGKPMCLL
::. . .::.: ::. . .. ..::.::.::::. .:::: :::. . .:.:.:
CCDS62 PGM---DHAQLVAIKTLKDYNNPQQWTEFQQEASLMAELHHPNIVCLLGAVTQEQPVCML
500 510 520 530 540 550
660 670 680 690 700 710
pF1KB8 FEYMAYGDLNEFLRSMSPHTV--CSLSHSDLSMRAQVSSPGPPPLSCAEQLCIARQVAAG
:::. :::.::: :::. :: : : ..... :. .. : :: :.:::
CCDS62 FEYINQGDLHEFLIMRSPHSDVGCS-SDEDGTVKSS--------LDHGDFLHIAIQIAAG
560 570 580 590 600
720 730 740 750 760 770
pF1KB8 MAYLSERKFVHRDLATRNCLVGENMVVKIADFGLSRNIYSADYYKANENDAIPIRWMPPE
: ::: . :::.:::.:: :.::.. :::.:.::::.:::::::... .. .::::::::
CCDS62 MEYLSSHFFVHKDLAARNILIGEQLHVKISDLGLSREIYSADYYRVQSKSLLPIRWMPPE
610 620 630 640 650 660
780 790 800 810 820 830
pF1KB8 SIFYNRYTTESDVWAYGVVLWEIFSYGLQPYYGMAHEEVIYYVRDGNILSCPENCPVELY
.:.:......::.:..:::::::::.:::::::....::: .:: ..: : :.:: ..:
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.:: ::...:. :: : .::
CCDS62 SLMTECWNEIPSRRPRFKDIHVRLRSWEGLSSHTSSTTPSGGNATTQTTSLSASPVSNLS
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: . . .. :::. : : : : :.::: : : :: .. . ..
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: :: : : .. .. :.:: .:. . : : :: ::.. ::..
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:.. .: .: . .:::. . : .: : . .......:: ::.:.... :
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: : ::.: ::..: . .. .:..:: : :....::.: :::: . .:. ..:
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: ..:::.::: :::. . . .: .... . :: . . .. :.:::: ::
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: .. ::.:::::: :: ... :::.:.:: :..:.::::: :. .::::: ::.:.:
CCDS66 SSHHVVHKDLATRNVLVYDKLNVKISDLGLFREVYAADYYKLLGNSLLPIRWMAPEAIMY
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.... .::.:.:::::::.:::::::: :.....:. ..:. ..: ::..::. .: ::
CCDS66 GKFSIDSDIWSYGVVLWEVFSYGLQPYCGYSNQDVVEMIRNRQVLPCPDDCPAWVYALMI
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::...:. :: : .:: : :: :..:
CCDS66 ECWNEFPSRRPRFKDIHSRL-----RAWGNLSNYNSSAQTSGASNTTQTSSLSTSPVSNV
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CCDS66 SNARYVGPKQKAPPFPQPQFIPMKGQIRPMVPPPQLYVPVNGYQPVPAYGAYLPNFYPVQ
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CCDS10 SQMLHIASQIASGMVYLASQHFVHRDLATRNCLVGANLLVKIGDFGMSRDVYSTDYYRVG
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pF1KB8 ENDAIPIRWMPPESIFYNRYTTESDVWAYGVVLWEIFSYGLQPYYGMAHEEVIYYVRDGN
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CCDS44 -HIQWLKHIVING-SSFGADGFPYVQVLK--TADINSSEVEVLYLRNVSAED---AGEYT
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. .. :.: :.: ::. .:.::: .. : ...:
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.... .: :.::.. : : . .. .:: . .: ...:
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CCDS44 GNPTPTIRWLKDGQAFHGENRIGGIRLRHQHWSLVMESVVPSDRGTYTCLVENAVG----
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. . ... : : :.. . : :. .::...: . .: :.: ::
CCDS44 SIRYNYLLDVLERS-PHRPILQAGLPAN-----TTAVVGSD-VELLCKVYSD---AQP--
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CCDS44 -HIQWLKHIVING-SSFGADGFPYVQVLK--TADINSSEVEVLYLRNVSAED---AGEYT
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. .. :: . : .:: ::: : :. :. .. . . .
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. . ... . : :: . .: : . ... . .. :...
CCDS44 VLLLLAGLYRGQALHGRHPRPPATV--QKLSRFPLARQFSLES------GSSGKSSSSLV
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CCDS44 AEAFGMDPARPDQASTVAVKMLKDNASDKDLADLVSEMEVMKLIGRHKNIINLLGVCTQE
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]