FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5485, 338 aa 1>>>pF1KE5485 338 - 338 aa - 338 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8051+/-0.000485; mu= 18.6589+/- 0.030 mean_var=63.5303+/-13.201, 0's: 0 Z-trim(108.2): 62 B-trim: 151 in 1/49 Lambda= 0.160910 statistics sampled from 16177 (16233) to 16177 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.533), E-opt: 0.2 (0.19), width: 16 Scan time: 5.790 The best scores are: opt bits E(85289) NP_795363 (OMIM: 613964) taste receptor type 2 mem ( 323) 1168 280.3 3.8e-75 NP_076408 (OMIM: 604793) taste receptor type 2 mem ( 318) 520 129.9 7.2e-30 NP_076407 (OMIM: 604794) taste receptor type 2 mem ( 309) 501 125.5 1.5e-28 NP_058640 (OMIM: 604869) taste receptor type 2 mem ( 299) 496 124.3 3.3e-28 NP_076406 (OMIM: 604795) taste receptor type 2 mem ( 312) 488 122.5 1.2e-27 NP_076409 (OMIM: 604792) taste receptor type 2 mem ( 303) 476 119.7 8.3e-27 NP_062545 (OMIM: 604796) taste receptor type 2 mem ( 299) 462 116.4 7.8e-26 NP_795364 (OMIM: 613965) taste receptor type 2 mem ( 307) 453 114.3 3.4e-25 NP_076411 (OMIM: 604790) taste receptor type 2 mem ( 317) 453 114.3 3.5e-25 NP_852094 (OMIM: 613966) taste receptor type 2 mem ( 314) 452 114.1 4e-25 NP_058639 (OMIM: 604868) taste receptor type 2 mem ( 316) 448 113.2 7.7e-25 NP_001091112 (OMIM: 613963) taste receptor type 2 ( 319) 436 110.4 5.4e-24 NP_076410 (OMIM: 604791) taste receptor type 2 mem ( 307) 434 109.9 7.2e-24 NP_795368 (OMIM: 612774) taste receptor type 2 mem ( 309) 430 109.0 1.4e-23 NP_803186 (OMIM: 613968) taste receptor type 2 mem ( 318) 428 108.5 1.9e-23 NP_795366 (OMIM: 612669) taste receptor type 2 mem ( 309) 427 108.3 2.2e-23 NP_795365 (OMIM: 612668) taste receptor type 2 mem ( 309) 419 106.4 8.1e-23 NP_789787 (OMIM: 171200,607751) taste receptor typ ( 333) 402 102.5 1.3e-21 XP_003961040 (OMIM: 612668) PREDICTED: taste recep ( 299) 389 99.5 9.9e-21 XP_006726600 (OMIM: 612668) PREDICTED: taste recep ( 299) 389 99.5 9.9e-21 NP_795367 (OMIM: 613967) taste receptor type 2 mem ( 299) 389 99.5 9.9e-21 NP_058641 (OMIM: 103780,604867) taste receptor typ ( 291) 378 96.9 5.7e-20 NP_795370 (OMIM: 613962) taste receptor type 2 mem ( 309) 377 96.7 7e-20 NP_795369 (OMIM: 613961) taste receptor type 2 mem ( 299) 367 94.4 3.4e-19 NP_795371 (OMIM: 609627) taste receptor type 2 mem ( 299) 354 91.3 2.8e-18 NP_061853 (OMIM: 605062) taste receptor type 2 mem ( 299) 307 80.4 5.3e-15 NP_000903 (OMIM: 165196) kappa-type opioid recepto ( 380) 140 41.7 0.003 NP_001305426 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 409) 140 41.8 0.0032 >>NP_795363 (OMIM: 613964) taste receptor type 2 member (323 aa) initn: 1137 init1: 742 opt: 1168 Z-score: 1470.1 bits: 280.3 E(85289): 3.8e-75 Smith-Waterman score: 1168; 57.4% identity (80.1% similar) in 317 aa overlap (23-338:7-323) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MLGRCFPPDTKEKQQLRMTKLCDPAESELSPFLITLILAVLLAEYLIGIIANGFIMAIHA : .....: : .:. :.: : . ::...::: ::.. NP_795 MATVNTDATDKDISKFKVTFTLVVSGIECITGILGSGFITAIYG 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 AEWVQNKAVSTSGRILVFLSVSRIALQSLMMLEITISSTSLSFYSEDAVYYAFKISFIFL :::...:.. :. ::...:: ::. :: :::: .: :....:: ::. .:: NP_795 AEWARGKTLPTGDRIMLMLSFSRLLLQIWMMLENIFSLLFRIVYNQNSVYILFKVITVFL 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 pF1KE5 NFCSLWFAAWLSFFYFVKIANFSYPLFLKLRWRITGLIPWLLWLSVFISFSHSM-FCINI : .:::::::. :: ..::::..:::. .. .: :.:::: :::..:.: :. . .. NP_795 NHSNLWFAAWLKVFYCLRIANFNHPLFFLMKRKIIVLMPWLLRLSVLVSLSFSFPLSRDV 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 CTVYCNNSFPIHSSNSTKKTYLSEINVVGLAFFFNLGIVTPLIMFILTATLLILSLKRHT .:: :.:.:: :::::.: :.:: :.:.:.::.:.:: .:::::::.:::::::::::: NP_795 FNVYVNSSIPIPSSNSTEKKYFSETNMVNLVFFYNMGIFVPLIMFILAATLLILSLKRHT 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 LHMGSNATGSNDPSMEAHMGAIKAISYFLILYIFNAVALFIYLSNMFDINSLWNNLCQII :::::::::: ::::.::.::::: :::::::::::.:::. ::.:: : :: ::.:: NP_795 LHMGSNATGSRDPSMKAHIGAIKATSYFLILYIFNAIALFLSTSNIFDTYSSWNILCKII 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 pF1KE5 MAAYPASHSILLIQDNPGLRRAWKRLQLRLHLYPKEWTL ::::::.::. :: ::::::::::.: .. :: : :: NP_795 MAAYPAGHSVQLILGNPGLRRAWKRFQHQVPLYLKGQTL 290 300 310 320 >>NP_076408 (OMIM: 604793) taste receptor type 2 member (318 aa) initn: 516 init1: 261 opt: 520 Z-score: 657.2 bits: 129.9 E(85289): 7.2e-30 Smith-Waterman score: 520; 33.0% identity (63.4% similar) in 303 aa overlap (35-327:7-306) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 CFPPDTKEKQQLRMTKLCDPAESELSPFLITLILAVLLAEYLIGIIANGFIMAIHAAEWV : .: . ..:. .::..:.:: .. .:: NP_076 MADKVQTTLLFLAVGEFSVGILGNAFIGLVNCMDWV 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 QNKAVSTSGRILVFLSVSRIALQSLMMLEITISSTSLSFYSEDAVYYAFKISFIFLNFCS ... ... ::. :..::: : ...:. : . :. . . . . . : : NP_076 KKRKIASIDLILTSLAISRICLLCVILLDCFILVLYPDVYATGKEMRIIDFFWTLTNHLS 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 LWFAAWLSFFYFVKIANFSYPLFLKLRWRITGLIPWLLW----LSVFISFSHSMFCINIC .:::. ::..:: ::.:: .:::: ..::: .: :.: ::::::. . .: NP_076 IWFATCLSIYYFFKIGNFFHPLFLWMKWRIDRVISWILLGCVVLSVFISLPATE-NLNAD 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 TVYCNNSFPIHSSNSTKKTYLSEINVVGLAFFFNLGIVTPLIMFILTATLLILSLKRHTL .: .. ...: : . ... . .. .:.::. . :. . ... ::::::.:: NP_076 FRFCVKA--KRKTNLTWSCRVNKTQHASTKLFLNLATLLPFCVCLMSFFLLILSLRRHIR 160 170 180 190 200 210 250 260 270 280 290 pF1KE5 HMGSNATGSNDPSMEAHMGAIKAISYFLILYIFNAVALFIYLSNMFDINS-LWNNLCQII .: .::: ::: :::. :.::. ::.:.: ....: :..: .. : . . : NP_076 RMQLSATGCRDPSTEAHVRALKAVISFLLLFIAYYLSFLIATSSYFMPETELAVIFGESI 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 pF1KE5 MAAYPASHSILLIQDNPGLRRA-----WKRLQLRLHLYPKEWTL ::.:::..:: : ::.: :: ... NP_076 ALIYPSSHSFILILGNNKLRHASLKVIWKVMSILKGRKFQQHKQI 280 290 300 310 >>NP_076407 (OMIM: 604794) taste receptor type 2 member (309 aa) initn: 476 init1: 282 opt: 501 Z-score: 633.5 bits: 125.5 E(85289): 1.5e-28 Smith-Waterman score: 501; 30.6% identity (63.0% similar) in 297 aa overlap (36-325:8-299) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 FPPDTKEKQQLRMTKLCDPAESELSPFLITLILAVLLAEYLIGIIANGFIMAIHAAEWVQ ... .. .:...::..::.: .. .:.. NP_076 MFSPADNIFIILITGEFILGILGNGYIALVNWIDWIK 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 NKAVSTSGRILVFLSVSRIALQSLMMLEITISSTSLSFYSEDAVYYAFKISFIFLNFCSL .: .:: ::. : ..:: : :.:... . . . :... .. . : :. .. NP_076 KKKISTVDYILTNLVIARICLISVMVVNGIVIVLNPDVYTKNKQQIVIFTFWTFANYLNM 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 WFAAWLSFFYFVKIANFSYPLFLKLRWRITGLIPWLLWLSVFISFSHSMFCINICTVYCN :... :. :::.:::. :.:::: :.:.: .. :.: ::. :. : .. :. NP_076 WITTCLNVFYFLKIASSSHPLFLWLKWKIDMVVHWILLGCFAISLLVSL--IAAIVLSCD 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 NSFPI---HSSNSTKKTYLSEINVVGLAFFFNLGIVTPLIMFILTATLLILSLKRHTLHM : :. : :. ..:.: .::: ..:.:. ... ::. :: ::: .. NP_076 YRFHAIAKHKRNITEMFHVSKIPYFEPLTLFNLFAIVPFIVSLISFFLLVRSLWRHTKQI 160 170 180 190 200 210 250 260 270 280 290 pF1KE5 GSNATGSNDPSMEAHMGAIKAIS----YFLILYIFNAVALFIYLSNMFDINSLWNNLCQI :::: ::: :.:. :::... .:.. :: . . : :: . . . .... : NP_076 KLYATGSRDPSTEVHVRAIKTMTSFIFFFFLYYISSILMTFSYLMTKYKLAVEFGEIAAI 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 pF1KE5 IMAAYPASHSILLIQDNPGLRRAWKRLQLRLHLYPKEWTL . :: .::..:: : ::... :. NP_076 L---YPLGHSLILIVLNNKLRQTFVRMLTCRKIACMI 280 290 300 >>NP_058640 (OMIM: 604869) taste receptor type 2 member (299 aa) initn: 418 init1: 183 opt: 496 Z-score: 627.4 bits: 124.3 E(85289): 3.3e-28 Smith-Waterman score: 496; 34.4% identity (66.2% similar) in 299 aa overlap (32-325:5-294) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 LGRCFPPDTKEKQQLRMTKLCDPAESELSPFLITLILAVLLAEYLIGIIANGFIMAIHAA : .. :.: .. .. .::: : :: ... NP_058 MLRLFYFSAIIASVILNF-VGIIMNLFITVVNCK 10 20 30 70 80 90 100 110 pF1KE5 EWVQNKAVSTSGRILVFLSVSRIALQSLMMLEITISSTSLSFYSEDAVYYA--FKISFIF ::... .:.: ::: :...:. . .:.... :: .: . .: .:: . : . :.: NP_058 TWVKSHRISSSDRILFSLGITRFLMLGLFLVN-TIYFVSSN--TERSVYLSAFFVLCFMF 40 50 60 70 80 90 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 LNFCSLWFAAWLSFFYFVKIANFSYPLFLKLRWRITGLIPWLLWLSVFISFSHSMFCINI :. :.::.. :...: :::.::.. .:: :. :. :: :: :.:: . :. : NP_058 LDSSSVWFVTLLNILYCVKITNFQHSVFLLLKRNISPKIPRLLLACVLISAFTT--CLYI 100 110 120 130 140 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 CTVYCNNSFP--IHSSNSTKKTYLSEINVVGLAFFFNLGIVTPLIMFILTATLLILSLKR :. . :: . . :.:. .:: ....:. . :. .:. . .:.::: ::.: NP_058 -TLSQASPFPELVTTRNNTS-FNISE-GILSLVVSLVLSSSLQFIINVTSASLLIHSLRR 150 160 170 180 190 200 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 HTLHMGSNATGSNDPSMEAHMGAIKAISYFLILYIFNAVALFI-YLSNMFDINSLWNNLC : .: .:::: .:. :::.::.: . ::::::: .:: .. :: . .. ...: NP_058 HIQKMQKNATGFWNPQTEAHVGAMKLMVYFLILYIPYSVATLVQYLPFYAGMDMGTKSIC 210 220 230 240 250 260 300 310 320 330 pF1KE5 QIIMAAYPASHSILLIQDNPGLRRAWKRLQLRLHLYPKEWTL :. . : .::.:.: .: :. . :.. NP_058 LIFATLYSPGHSVLIIITHPKLKTTAKKILCFKK 270 280 290 >>NP_076406 (OMIM: 604795) taste receptor type 2 member (312 aa) initn: 459 init1: 241 opt: 488 Z-score: 617.2 bits: 122.5 E(85289): 1.2e-27 Smith-Waterman score: 488; 33.4% identity (63.2% similar) in 302 aa overlap (31-329:2-299) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MLGRCFPPDTKEKQQLRMTKLCDPAESELSPFLITLILAVLLA-EYLIGIIANGFIMAIH : : : .:.: : ::: .::::. .. NP_076 MPSAIEAIYIILIAGELTIGIWGNGFIVLVN 10 20 30 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 AAEWVQNKAVSTSGRILVFLSVSRIALQSLMMLEITISSTSLSFYSEDAVYYAFKISFIF .:.. . .: ::. :..::: : .. :. . . :..... .. . : NP_076 CIDWLKRRDISLIDIILISLAISRICLLCVISLDGFFMLLFPGTYGNSVLVSIVNVVWTF 40 50 60 70 80 90 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 LNFCSLWFAAWLSFFYFVKIANFSYPLFLKLRWRITGLIPWLLWLSVFISFSHSMFCINI : ::::.. ::.::..::::.:.:.:. :. .:. .. .: : .::. .. . NP_076 ANNSSLWFTSCLSIFYLLKIANISHPFFFWLKLKINKVMLAILLGSFLISL---IISVPK 100 110 120 130 140 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 CTVYCNNSFPI-HSSNSTKKTYLSEINVVGLAFFFNLGIVTPLIMFILTATLLILSLKRH . . : . : : : : .:.: . . .:::...:.:. ... ::..:: :: NP_076 NDDMWYHLFKVSHEENITWKFKVSKIPGTFKQLTLNLGVMVPFILCLISFFLLLFSLVRH 150 160 170 180 190 200 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 TLHMGSNATGSNDPSMEAHMGAIKAISYFLILYI-FNAVALFIYLSNMFDINSLWNNLCQ : .. .::: ::: :::: ::::. ::.: : . : : . : .. ..: . . NP_076 TKQIRLHATGFRDPSTEAHMRAIKAVIIFLLLLIVYYPVFLVMTSSALIPQGKLVLMIGD 210 220 230 240 250 260 300 310 320 330 pF1KE5 IIMAAYPASHSILLIQDNPGLRRAWKRLQLRLHLYPKEWTL :. . .:.:::..::. : ::.:. .. ::. NP_076 IVTVIFPSSHSFILIMGNSKLREAFLKM-LRFVKCFLRRRKPFVP 270 280 290 300 310 >>NP_076409 (OMIM: 604792) taste receptor type 2 member (303 aa) initn: 470 init1: 262 opt: 476 Z-score: 602.3 bits: 119.7 E(85289): 8.3e-27 Smith-Waterman score: 476; 30.7% identity (66.7% similar) in 300 aa overlap (26-322:2-292) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MLGRCFPPDTKEKQQLRMTKLCDPAESELSPFLITLILAVLLAEYLIGIIANGFIMAIHA :: : : ..:: :..::..:: ..::::. :. NP_076 MESAL-PSIFTL---VIIAEFIIGNLSNGFIVLINC 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 AEWVQNKAVSTSGRILVFLSVSRIALQSLMMLEITISSTSLSFYSEDAVYYAFKISFIFL .::... .:. ..:..:..:::.: ... .. :... . . .:.: NP_076 IDWVSKRELSSVDKLLIILAISRIGLIWEILVSWFLALHYLAIFVSGTGLRIMIFSWIVS 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 NFCSLWFAAWLSFFYFVKIANFSYPLFLKLRWRITGLIPWLLWLSVFISFSHSMFCINIC : .::.:. .:.::..:::.:: : :: :.::.. .: .: :.... . ... ::. NP_076 NHFNLWLATIFSIFYLLKIASFSSPAFLYLKWRVNKVILMIL-LGTLVFLFLNLIQINM- 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 pF1KE5 TVYCNNSFPIHSSNSTKKTYLSEINVVGLAFFFNLGI--VTPLIMFILTATLLILSLKRH . .. . . :.: . .:.... ... :.. . .::. . ... :::.::..: NP_076 --HIKDWLDRYERNTTWNFSMSDFETFSVSVKFTMTMFSLTPFTVAFISFLLLIFSLQKH 160 170 180 190 200 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 TLHMGSNATGSNDPSMEAHMGAIKAISYFLILYI-FNAVALFIYLSNMFDINSLWNNLCQ .: : : :: ..: .:.: . ::..: : .:. ..:.... :.. ::. NP_076 LQKMQLNYKGHRDPRTKVHTNALKIVISFLLFYASFFLCVLISWISELYQ-NTVIYMLCE 210 220 230 240 250 260 300 310 320 330 pF1KE5 IIMAAYPASHSILLIQDNPGLRRAWKRLQLRLHLYPKEWTL : . :.:::.::: : ::.:. NP_076 TIGVFSPSSHSFLLILGNAKLRQAFLLVAAKVWAKR 270 280 290 300 >>NP_062545 (OMIM: 604796) taste receptor type 2 member (299 aa) initn: 422 init1: 201 opt: 462 Z-score: 584.8 bits: 116.4 E(85289): 7.8e-26 Smith-Waterman score: 462; 30.9% identity (65.4% similar) in 301 aa overlap (30-327:4-293) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MLGRCFPPDTKEKQQLRMTKLCDPAESELSPFLITLILAVLLAEYLIGIIANGFIMAIHA : ..: ..:::. ..:.::..::.:..... NP_062 MLESHLIIYFLLAVI--QFLLGIFTNGIIVVVNG 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 AEWVQNKAVSTSGRILVFLSVSRIALQSLMMLEITISSTSLSFYSEDAVYYAFKISFIFL . .... .. .: :.:::: :: :... ... . :. : . : ..:. NP_062 IDLIKHRKMAPLDLLLSCLAVSRIFLQ-LFIFYVNVI---VIFFIEFIMCSANCAILLFI 40 50 60 70 80 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 NFCSLWFAAWLSFFYFVKIANFSYPLFLKLRWRITGLIPWLLWLSVFISFSHSMFCINIC : ::.:.::. :: .:.:. .:::. :. ::. :.::.. :.. ::.:. . NP_062 NELELWLATWLGVFYCAKVASVRHPLFIWLKMRISKLVPWMILGSLLYV---SMICV-FH 90 100 110 120 130 140 190 200 210 220 230 pF1KE5 TVYCNNSFP--IHSSNSTKKTYLSEINVVGLAFFFNLGIVTPLIMFILTATLLILSLKRH . : . : ... : . : .: ... : : . .::..:.... :::.:: :: NP_062 SKYAGFMVPYFLRKFFSQNATIQKEDTLAIQIFSFVAEFSVPLLIFLFAVLLLIFSLGRH 150 160 170 180 190 200 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 TLHMGSNATGSNDPSMEAHMGAIKAISYFLILYIFNAVALFIYLSNM-FDINSLWNNLCQ : .: ....:: :. : ..:. .: ::::: :. . ..::.. : : . . NP_062 TRQMRNTVAGSRVPGRGAPISALLSILSFLILY-FSHCMIKVFLSSLKFHIRRFIFLFFI 210 220 230 240 250 260 300 310 320 330 pF1KE5 IIMAAYPASHSILLIQDNPGLRRAWKRLQLRLHLYPKEWTL .... ::..::..:: :: :.. :.. : NP_062 LVIGIYPSGHSLILILGNPKLKQNAKKFLLHSKCCQ 270 280 290 >>NP_795364 (OMIM: 613965) taste receptor type 2 member (307 aa) initn: 442 init1: 419 opt: 453 Z-score: 573.3 bits: 114.3 E(85289): 3.4e-25 Smith-Waterman score: 453; 33.8% identity (60.8% similar) in 311 aa overlap (26-327:2-299) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MLGRCFPPDTKEKQQLRMTKLCDPAESELSPFLITLILAVLLAEYLIGIIANGFIMAIHA .. :. :.. .: ::. :.:: :::::. . . 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