FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2040, 651 aa 1>>>pF1KE2040 651 - 651 aa - 651 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4733+/-0.000872; mu= 9.8352+/- 0.053 mean_var=117.8506+/-23.312, 0's: 0 Z-trim(110.1): 14 B-trim: 0 in 0/52 Lambda= 0.118143 statistics sampled from 11333 (11345) to 11333 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.701), E-opt: 0.2 (0.348), width: 16 Scan time: 4.250 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS45290.1 PIAS1 gene_id:8554|Hs108|chr15 ( 651) 4330 749.1 4.2e-216 CCDS81902.1 PIAS1 gene_id:8554|Hs108|chr15 ( 653) 4291 742.5 4.2e-214 CCDS72866.1 PIAS3 gene_id:10401|Hs108|chr1 ( 628) 2303 403.6 4.1e-112 CCDS32824.1 PIAS2 gene_id:9063|Hs108|chr18 ( 621) 1842 325.1 1.8e-88 CCDS32825.1 PIAS2 gene_id:9063|Hs108|chr18 ( 572) 1802 318.2 1.9e-86 CCDS12118.1 PIAS4 gene_id:51588|Hs108|chr19 ( 510) 1217 218.5 1.8e-56 >>CCDS45290.1 PIAS1 gene_id:8554|Hs108|chr15 (651 aa) initn: 4330 init1: 4330 opt: 4330 Z-score: 3993.2 bits: 749.1 E(32554): 4.2e-216 Smith-Waterman score: 4330; 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CCDS72 PMKPKKEASEVCPPPGYGLDG-----LQYSPVQGGDPSENKKKVEVIDLTIESSSDEEDL 410 420 430 440 450 460 480 490 500 510 520 530 pF1KE2 EPSAKRTCPSLSPTSPL--NNKGILSLPHQASPVSRTPSLPAVDTSYINTSLIQDYRHPF :. :. : : . : ..::.:. :: : : :.:.. .. ..... ...: : CCDS72 PPT-KKHCSVTSAAIPALPGSKGVLTSGHQPSSVLRSPAMGTLGGDFLSSLPLHEYPPAF 470 480 490 500 510 520 540 550 560 570 580 590 pF1KE2 HMTPMPYDLQGLDFFPFLSGDNQHYNTSLLAAAAAAVSDDQDLLHSSRFFPYTSS-QMFL :. :.::::.: ::. ..:::. :.... :.:: : ..:: : .. . :: CCDS72 ---PLGADIQGLDLFSFLQTESQHYGPSVITSL-----DEQDAL--GHFFQYRGTPSHFL 530 540 550 560 570 600 610 620 630 640 pF1KE2 DQLSAG-GSTSLPTTNGSSSGSNSSLVS-SNSLRESHSHTVTNRSSTDTASIFGIIPDII :. ::. .: . : ::.:. ...:::.:. . . :. : ::: CCDS72 GPLAPTLGSSHCSATPAPPPGRVSSIVAPGGALREGHGGPLPS-----GPSLTGCRSDII 580 590 600 610 620 650 pF1KE2 SLD ::: CCDS72 SLD >>CCDS32824.1 PIAS2 gene_id:9063|Hs108|chr18 (621 aa) initn: 2150 init1: 1304 opt: 1842 Z-score: 1701.7 bits: 325.1 E(32554): 1.8e-88 Smith-Waterman score: 2198; 55.3% identity (73.2% similar) in 665 aa overlap (1-651:1-621) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MADSAELKQMVMSLRVSELQVLLGYAGRNKHGRKHELLTKALHLLKAGCSPAVQMKIKEL ::: ::..:: :.::::::::::.::::: ::::.:: .::::::.:::::::.::.:: CCDS32 MADFEELRNMVSSFRVSELQVLLGFAGRNKSGRKHDLLMRALHLLKSGCSPAVQIKIREL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 YRRRFPQKIMTPADLSIPNVH-------SSPMPATLSPS---TIPQLTYDGHPASSPLLP ::::.:. . .::: . :::. :. . ..:. . : :::. CCDS32 YRRRYPRTLEGLSDLSTIKSSVFSLDGGSSPVEPDLAVAGIHSLPSTSVTPHSPSSPVGS 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 VSLLGPKHELELPHLTSALHPVHPDIKLQKLPFYDLLDELIKPTSLASDNSQRFRETCFA : : : .:. . . . :::::..:..:::::.:: :::::::.... :::.: : CCDS32 VLLQDTKPTFEMQQPSPPIPPVHPDVQLKNLPFYDVLDVLIKPTSLVQSSIQRFQEKFFI 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 pF1KE2 FALTPQQVQQISSSMD-ISGTKCDFTVQVQLRFCLSETSCPQEDHFPPNLCVKVNTKPCS ::::::::..: : : . : . :.:::::::.::.::::::::..: .::.::: : CCDS32 FALTPQQVREICISRDFLPGGRRDYTVQVQLRLCLAETSCPQEDNYPNSLCIKVNGKLFP 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KE2 LPGYLPPTKNGVEPKRPSRPINITSLVRLSTTVPNTIVVSWTAEIGRNYSMAVYLVKQLS :::: :: :::.: :::.::.:::::::::..::: : .::..:::.::::.::::.::. CCDS32 LPGYAPPPKNGIEQKRPGRPLNITSLVRLSSAVPNQISISWASEIGKNYSMSVYLVRQLT 250 260 270 280 290 300 290 300 310 320 330 340 pF1KE2 STVLLQRLRAKGIRNPDHSRALIKEKLTADPDSEIATTSLRVSLLCPLGKMRLTIPCRAL :..:::::. ::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::. 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CCDS32 YRRRYPRTLEGLSDLSTIKSSVFSLDGGSSPVEPDLAVAGIHSLPSTSVTPHSPSSPVGS 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 VSLLGPKHELELPHLTSALHPVHPDIKLQKLPFYDLLDELIKPTSLASDNSQRFRETCFA : : : .:. . . . :::::..:..:::::.:: :::::::.... :::.: : CCDS32 VLLQDTKPTFEMQQPSPPIPPVHPDVQLKNLPFYDVLDVLIKPTSLVQSSIQRFQEKFFI 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 pF1KE2 FALTPQQVQQISSSMD-ISGTKCDFTVQVQLRFCLSETSCPQEDHFPPNLCVKVNTKPCS ::::::::..: : : . : . :.:::::::.::.::::::::..: .::.::: : CCDS32 FALTPQQVREICISRDFLPGGRRDYTVQVQLRLCLAETSCPQEDNYPNSLCIKVNGKLFP 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KE2 LPGYLPPTKNGVEPKRPSRPINITSLVRLSTTVPNTIVVSWTAEIGRNYSMAVYLVKQLS :::: :: :::.: :::.::.:::::::::..::: : .::..:::.::::.::::.::. CCDS32 LPGYAPPPKNGIEQKRPGRPLNITSLVRLSSAVPNQISISWASEIGKNYSMSVYLVRQLT 250 260 270 280 290 300 290 300 310 320 330 340 pF1KE2 STVLLQRLRAKGIRNPDHSRALIKEKLTADPDSEIATTSLRVSLLCPLGKMRLTIPCRAL :..:::::. ::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::. 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