Result of FASTA (ccds) for pFN21AE2040
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE2040, 651 aa
  1>>>pF1KE2040 651 - 651 aa - 651 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4733+/-0.000872; mu= 9.8352+/- 0.053
 mean_var=117.8506+/-23.312, 0's: 0 Z-trim(110.1): 14  B-trim: 0 in 0/52
 Lambda= 0.118143
 statistics sampled from 11333 (11345) to 11333 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.701), E-opt: 0.2 (0.348), width:  16
 Scan time:  4.250

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS45290.1 PIAS1 gene_id:8554|Hs108|chr15         ( 651) 4330 749.1 4.2e-216
CCDS81902.1 PIAS1 gene_id:8554|Hs108|chr15         ( 653) 4291 742.5 4.2e-214
CCDS72866.1 PIAS3 gene_id:10401|Hs108|chr1         ( 628) 2303 403.6 4.1e-112
CCDS32824.1 PIAS2 gene_id:9063|Hs108|chr18         ( 621) 1842 325.1 1.8e-88
CCDS32825.1 PIAS2 gene_id:9063|Hs108|chr18         ( 572) 1802 318.2 1.9e-86
CCDS12118.1 PIAS4 gene_id:51588|Hs108|chr19        ( 510) 1217 218.5 1.8e-56


>>CCDS45290.1 PIAS1 gene_id:8554|Hs108|chr15              (651 aa)
 initn: 4330 init1: 4330 opt: 4330  Z-score: 3993.2  bits: 749.1 E(32554): 4.2e-216
Smith-Waterman score: 4330; 100.0% identity (100.0% similar) in 651 aa overlap (1-651:1-651)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MADSAELKQMVMSLRVSELQVLLGYAGRNKHGRKHELLTKALHLLKAGCSPAVQMKIKEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MADSAELKQMVMSLRVSELQVLLGYAGRNKHGRKHELLTKALHLLKAGCSPAVQMKIKEL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 YRRRFPQKIMTPADLSIPNVHSSPMPATLSPSTIPQLTYDGHPASSPLLPVSLLGPKHEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 YRRRFPQKIMTPADLSIPNVHSSPMPATLSPSTIPQLTYDGHPASSPLLPVSLLGPKHEL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 ELPHLTSALHPVHPDIKLQKLPFYDLLDELIKPTSLASDNSQRFRETCFAFALTPQQVQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ELPHLTSALHPVHPDIKLQKLPFYDLLDELIKPTSLASDNSQRFRETCFAFALTPQQVQQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 ISSSMDISGTKCDFTVQVQLRFCLSETSCPQEDHFPPNLCVKVNTKPCSLPGYLPPTKNG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ISSSMDISGTKCDFTVQVQLRFCLSETSCPQEDHFPPNLCVKVNTKPCSLPGYLPPTKNG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 VEPKRPSRPINITSLVRLSTTVPNTIVVSWTAEIGRNYSMAVYLVKQLSSTVLLQRLRAK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VEPKRPSRPINITSLVRLSTTVPNTIVVSWTAEIGRNYSMAVYLVKQLSSTVLLQRLRAK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 GIRNPDHSRALIKEKLTADPDSEIATTSLRVSLLCPLGKMRLTIPCRALTCSHLQCFDAT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GIRNPDHSRALIKEKLTADPDSEIATTSLRVSLLCPLGKMRLTIPCRALTCSHLQCFDAT
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE2 LYIQMNEKKPTWVCPVCDKKAPYEHLIIDGLFMEILKYCTDCDEIQFKEDGTWAPMRSKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LYIQMNEKKPTWVCPVCDKKAPYEHLIIDGLFMEILKYCTDCDEIQFKEDGTWAPMRSKK
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE2 EVQEVSASYNGVDGCLSSTLEHQVASHHQSSNKNKKVEVIDLTIDSSSDEEEEEPSAKRT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EVQEVSASYNGVDGCLSSTLEHQVASHHQSSNKNKKVEVIDLTIDSSSDEEEEEPSAKRT
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE2 CPSLSPTSPLNNKGILSLPHQASPVSRTPSLPAVDTSYINTSLIQDYRHPFHMTPMPYDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 CPSLSPTSPLNNKGILSLPHQASPVSRTPSLPAVDTSYINTSLIQDYRHPFHMTPMPYDL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE2 QGLDFFPFLSGDNQHYNTSLLAAAAAAVSDDQDLLHSSRFFPYTSSQMFLDQLSAGGSTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QGLDFFPFLSGDNQHYNTSLLAAAAAAVSDDQDLLHSSRFFPYTSSQMFLDQLSAGGSTS
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650 
pF1KE2 LPTTNGSSSGSNSSLVSSNSLRESHSHTVTNRSSTDTASIFGIIPDIISLD
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LPTTNGSSSGSNSSLVSSNSLRESHSHTVTNRSSTDTASIFGIIPDIISLD
              610       620       630       640       650 

>>CCDS81902.1 PIAS1 gene_id:8554|Hs108|chr15              (653 aa)
 initn: 4290 init1: 4290 opt: 4291  Z-score: 3957.2  bits: 742.5 E(32554): 4.2e-214
Smith-Waterman score: 4291; 99.2% identity (99.5% similar) in 651 aa overlap (1-651:4-653)

                  10        20        30        40        50       
pF1KE2    MADSAELKQMVMSLRVSELQVLLGYAGRNKHGRKHELLTKALHLLKAGCSPAVQMKI
          . ::  .::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MFTLQDSY-VKQMVMSLRVSELQVLLGYAGRNKHGRKHELLTKALHLLKAGCSPAVQMKI
                10        20        30        40        50         

        60        70        80        90       100       110       
pF1KE2 KELYRRRFPQKIMTPADLSIPNVHSSPMPATLSPSTIPQLTYDGHPASSPLLPVSLLGPK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 KELYRRRFPQKIMTPADLSIPNVHSSPMPATLSPSTIPQLTYDGHPASSPLLPVSLLGPK
      60        70        80        90       100       110         

       120       130       140       150       160       170       
pF1KE2 HELELPHLTSALHPVHPDIKLQKLPFYDLLDELIKPTSLASDNSQRFRETCFAFALTPQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 HELELPHLTSALHPVHPDIKLQKLPFYDLLDELIKPTSLASDNSQRFRETCFAFALTPQQ
     120       130       140       150       160       170         

       180       190       200       210       220       230       
pF1KE2 VQQISSSMDISGTKCDFTVQVQLRFCLSETSCPQEDHFPPNLCVKVNTKPCSLPGYLPPT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 VQQISSSMDISGTKCDFTVQVQLRFCLSETSCPQEDHFPPNLCVKVNTKPCSLPGYLPPT
     180       190       200       210       220       230         

       240       250       260       270       280       290       
pF1KE2 KNGVEPKRPSRPINITSLVRLSTTVPNTIVVSWTAEIGRNYSMAVYLVKQLSSTVLLQRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 KNGVEPKRPSRPINITSLVRLSTTVPNTIVVSWTAEIGRNYSMAVYLVKQLSSTVLLQRL
     240       250       260       270       280       290         

       300       310       320       330       340       350       
pF1KE2 RAKGIRNPDHSRALIKEKLTADPDSEIATTSLRVSLLCPLGKMRLTIPCRALTCSHLQCF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 RAKGIRNPDHSRALIKEKLTADPDSEIATTSLRVSLLCPLGKMRLTIPCRALTCSHLQCF
     300       310       320       330       340       350         

       360       370       380       390       400       410       
pF1KE2 DATLYIQMNEKKPTWVCPVCDKKAPYEHLIIDGLFMEILKYCTDCDEIQFKEDGTWAPMR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 DATLYIQMNEKKPTWVCPVCDKKAPYEHLIIDGLFMEILKYCTDCDEIQFKEDGTWAPMR
     360       370       380       390       400       410         

       420       430       440       450       460       470       
pF1KE2 SKKEVQEVSASYNGVDGCLSSTLEHQVASHHQSSNKNKKVEVIDLTIDSSSDEEEEEPSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SKKEVQEVSASYNGVDGCLSSTLEHQVASHHQSSNKNKKVEVIDLTIDSSSDEEEEEPSA
     420       430       440       450       460       470         

       480       490       500       510       520       530       
pF1KE2 KRTCPSLSPTSPLNNKGILSLPHQASPVSRTPSLPAVDTSYINTSLIQDYRHPFHMTPMP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 KRTCPSLSPTSPLNNKGILSLPHQASPVSRTPSLPAVDTSYINTSLIQDYRHPFHMTPMP
     480       490       500       510       520       530         

       540       550       560       570       580       590       
pF1KE2 YDLQGLDFFPFLSGDNQHYNTSLLAAAAAAVSDDQDLLHSSRFFPYTSSQMFLDQLSAGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 YDLQGLDFFPFLSGDNQHYNTSLLAAAAAAVSDDQDLLHSSRFFPYTSSQMFLDQLSAGG
     540       550       560       570       580       590         

       600       610       620       630       640       650 
pF1KE2 STSLPTTNGSSSGSNSSLVSSNSLRESHSHTVTNRSSTDTASIFGIIPDIISLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 STSLPTTNGSSSGSNSSLVSSNSLRESHSHTVTNRSSTDTASIFGIIPDIISLD
     600       610       620       630       640       650   

>>CCDS72866.1 PIAS3 gene_id:10401|Hs108|chr1              (628 aa)
 initn: 1958 init1: 1388 opt: 2303  Z-score: 2126.2  bits: 403.6 E(32554): 4.1e-112
Smith-Waterman score: 2375; 57.9% identity (78.4% similar) in 663 aa overlap (1-651:1-628)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MADSAELKQMVMSLRVSELQVLLGYAGRNKHGRKHELLTKALHLLKAGCSPAVQMKIKEL
       ::. .:::.::::.::::::::::.::::: :::::::.:::::::..:.:.::::::::
CCDS72 MAELGELKHMVMSFRVSELQVLLGFAGRNKSGRKHELLAKALHLLKSSCAPSVQMKIKEL
               10        20        30        40        50        60

               70        80            90       100       110      
pF1KE2 YRRRFPQKIMTPADLSIPNVH--SSPM--PATLSPSTIPQLTYDGHPASSPLLPVSLLGP
       ::::::.: . :.:::. ..   .::.  :. :.:  ::       :  . : : .::::
CCDS72 YRRRFPRKTLGPSDLSLLSLPPGTSPVGSPGPLAP--IP-------P--TLLAPGTLLGP
               70        80        90                  100         

        120        130       140       150       160       170     
pF1KE2 KHELEL-PHLTSALHPVHPDIKLQKLPFYDLLDELIKPTSLASDNSQRFRETCFAFALTP
       :.:... : :    .:::::. .. ::::..  :::.::.::: .::::.:. :.:::::
CCDS72 KREVDMHPPLP---QPVHPDVTMKPLPFYEVYGELIRPTTLASTSSQRFEEAHFTFALTP
     110       120          130       140       150       160      

         180        190       200       210       220       230    
pF1KE2 QQVQQISSSMDI-SGTKCDFTVQVQLRFCLSETSCPQEDHFPPNLCVKVNTKPCSLPGYL
       :::::: .: ..  :.:::.:.:::::::: ::::::::.::::: :::: : : :::::
CCDS72 QQVQQILTSREVLPGAKCDYTIQVQLRFCLCETSCPQEDYFPPNLFVKVNGKLCPLPGYL
        170       180       190       200       210       220      

          240       250       260       270       280       290    
pF1KE2 PPTKNGVEPKRPSRPINITSLVRLSTTVPNTIVVSWTAEIGRNYSMAVYLVKQLSSTVLL
       ::::::.:::::::::::: :.:::.::::::::.:..:.:::::..::::.::.. .::
CCDS72 PPTKNGAEPKRPSRPINITPLARLSATVPNTIVVNWSSEFGRNYSLSVYLVRQLTAGTLL
        230       240       250       260       270       280      

          300       310       320       330       340       350    
pF1KE2 QRLRAKGIRNPDHSRALIKEKLTADPDSEIATTSLRVSLLCPLGKMRLTIPCRALTCSHL
       :.:::::::::::::::::::::::::::.:::::::::.:::::::::.:::::::.::
CCDS72 QKLRAKGIRNPDHSRALIKEKLTADPDSEVATTSLRVSLMCPLGKMRLTVPCRALTCAHL
        290       300       310       320       330       340      

          360       370       380       390       400       410    
pF1KE2 QCFDATLYIQMNEKKPTWVCPVCDKKAPYEHLIIDGLFMEILKYCTDCDEIQFKEDGTWA
       : :::.::.:::::::::.::::::::::: :::::::::::. :.::::::: :::.: 
CCDS72 QSFDAALYLQMNEKKPTWTCPVCDKKAPYESLIIDGLFMEILSSCSDCDEIQFMEDGSWC
        350       360       370       380       390       400      

          420       430        440       450       460       470   
pF1KE2 PMRSKKEVQEVSASYN-GVDGCLSSTLEHQVASHHQSSNKNKKVEVIDLTIDSSSDEEEE
       ::. :::..::    . :.::     :... ..  . :...::::::::::.::::::. 
CCDS72 PMKPKKEASEVCPPPGYGLDG-----LQYSPVQGGDPSENKKKVEVIDLTIESSSDEEDL
        410       420            430       440       450       460 

           480       490         500       510       520       530 
pF1KE2 EPSAKRTCPSLSPTSPL--NNKGILSLPHQASPVSRTPSLPAVDTSYINTSLIQDYRHPF
        :. :. :   : . :   ..::.:.  :: : : :.:.. ..  .....  ...:   :
CCDS72 PPT-KKHCSVTSAAIPALPGSKGVLTSGHQPSSVLRSPAMGTLGGDFLSSLPLHEYPPAF
              470       480       490       500       510       520

             540       550       560       570       580        590
pF1KE2 HMTPMPYDLQGLDFFPFLSGDNQHYNTSLLAAAAAAVSDDQDLLHSSRFFPYTSS-QMFL
          :.  :.::::.: ::. ..:::. :....      :.:: :  ..:: : .. . ::
CCDS72 ---PLGADIQGLDLFSFLQTESQHYGPSVITSL-----DEQDAL--GHFFQYRGTPSHFL
                 530       540       550              560       570

               600       610        620       630       640        
pF1KE2 DQLSAG-GSTSLPTTNGSSSGSNSSLVS-SNSLRESHSHTVTNRSSTDTASIFGIIPDII
         :.   ::.   .: .   :  ::.:. ...:::.:.  . .       :. :   :::
CCDS72 GPLAPTLGSSHCSATPAPPPGRVSSIVAPGGALREGHGGPLPS-----GPSLTGCRSDII
              580       590       600       610            620     

      650 
pF1KE2 SLD
       :::
CCDS72 SLD
          

>>CCDS32824.1 PIAS2 gene_id:9063|Hs108|chr18              (621 aa)
 initn: 2150 init1: 1304 opt: 1842  Z-score: 1701.7  bits: 325.1 E(32554): 1.8e-88
Smith-Waterman score: 2198; 55.3% identity (73.2% similar) in 665 aa overlap (1-651:1-621)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MADSAELKQMVMSLRVSELQVLLGYAGRNKHGRKHELLTKALHLLKAGCSPAVQMKIKEL
       :::  ::..:: :.::::::::::.::::: ::::.:: .::::::.:::::::.::.::
CCDS32 MADFEELRNMVSSFRVSELQVLLGFAGRNKSGRKHDLLMRALHLLKSGCSPAVQIKIREL
               10        20        30        40        50        60

               70        80               90          100       110
pF1KE2 YRRRFPQKIMTPADLSIPNVH-------SSPMPATLSPS---TIPQLTYDGHPASSPLLP
       ::::.:. .   .:::  .         :::.   :. .   ..:. .   :  :::.  
CCDS32 YRRRYPRTLEGLSDLSTIKSSVFSLDGGSSPVEPDLAVAGIHSLPSTSVTPHSPSSPVGS
               70        80        90       100       110       120

              120       130       140       150       160       170
pF1KE2 VSLLGPKHELELPHLTSALHPVHPDIKLQKLPFYDLLDELIKPTSLASDNSQRFRETCFA
       : :   :  .:. . .  . :::::..:..:::::.:: :::::::.... :::.:  : 
CCDS32 VLLQDTKPTFEMQQPSPPIPPVHPDVQLKNLPFYDVLDVLIKPTSLVQSSIQRFQEKFFI
              130       140       150       160       170       180

              180        190       200       210       220         
pF1KE2 FALTPQQVQQISSSMD-ISGTKCDFTVQVQLRFCLSETSCPQEDHFPPNLCVKVNTKPCS
       ::::::::..:  : : . : . :.:::::::.::.::::::::..: .::.::: :   
CCDS32 FALTPQQVREICISRDFLPGGRRDYTVQVQLRLCLAETSCPQEDNYPNSLCIKVNGKLFP
              190       200       210       220       230       240

     230       240       250       260       270       280         
pF1KE2 LPGYLPPTKNGVEPKRPSRPINITSLVRLSTTVPNTIVVSWTAEIGRNYSMAVYLVKQLS
       :::: :: :::.: :::.::.:::::::::..::: : .::..:::.::::.::::.::.
CCDS32 LPGYAPPPKNGIEQKRPGRPLNITSLVRLSSAVPNQISISWASEIGKNYSMSVYLVRQLT
              250       260       270       280       290       300

     290       300       310       320       330       340         
pF1KE2 STVLLQRLRAKGIRNPDHSRALIKEKLTADPDSEIATTSLRVSLLCPLGKMRLTIPCRAL
       :..:::::. ::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::.
CCDS32 SAMLLQRLKMKGIRNPDHSRALIKEKLTADPDSEIATTSLRVSLMCPLGKMRLTIPCRAV
              310       320       330       340       350       360

     350       360       370       380       390       400         
pF1KE2 TCSHLQCFDATLYIQMNEKKPTWVCPVCDKKAPYEHLIIDGLFMEILKYCTDCDEIQFKE
       ::.:::::::.::.:::::::::.:::::::: :: ::.::::::::. :.: :::.:.:
CCDS32 TCTHLQCFDAALYLQMNEKKPTWICPVCDKKAAYESLILDGLFMEILNDCSDVDEIKFQE
              370       380       390       400       410       420

     410       420       430       440       450       460         
pF1KE2 DGTWAPMRSKKEVQEVSASYNGVDGCLSSTLEHQVASHHQSSNKNKKVEVIDLTIDSSSD
       ::.: ::: :::...:: :   .    ::.: .  .    :  ..:::.::::::.::::
CCDS32 DGSWCPMRPKKEAMKVS-SQPCTKIESSSVLSKPCSVTVASEASKKKVDVIDLTIESSSD
              430        440       450       460       470         

     470       480       490       500       510       520         
pF1KE2 EEEEEPSAKRTCPSLSPTSPLNNKGILSLPHQASPVSRTPSLPAVDTSYINTSLIQDYRH
       :::. : ::: :  .: :.   .::.:   .: : : :.::. .:: . :  ::  ::  
CCDS32 EEED-PPAKRKCIFMSETQSSPTKGVLM--YQPSSV-RVPSVTSVDPAAIPPSLT-DYSV
     480        490       500         510        520       530     

     530          540       550       560       570       580      
pF1KE2 PFHMTP---MPYDLQGLDFFPFLSGDNQHYNTSLLAAAAAAVSDDQDLLHSSRFFPYTSS
       ::: ::   :  :: ::::. ..  : :                         . :    
CCDS32 PFHHTPISSMSSDLPGLDFLSLIPVDPQ-------------------------YCP----
          540       550       560                                  

        590       600       610       620       630       640      
pF1KE2 QMFLDQLSAGGSTSLPTTNGSSSGSNSSLVSSNSLRESHSHTVTNRSSTDTASIFGIIPD
        ::::.:..  ..:  ... .::  .:. :::.: : :.. ..:. .:.        :::
CCDS32 PMFLDSLTSPLTASSTSVTTTSSHESSTHVSSSSSR-SETGVITSSGSN--------IPD
         570       580       590       600        610              

        650 
pF1KE2 IISLD
       :::::
CCDS32 IISLD
        620 

>>CCDS32825.1 PIAS2 gene_id:9063|Hs108|chr18              (572 aa)
 initn: 2079 init1: 1304 opt: 1802  Z-score: 1665.4  bits: 318.2 E(32554): 1.9e-86
Smith-Waterman score: 2129; 60.6% identity (77.9% similar) in 556 aa overlap (1-542:1-550)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MADSAELKQMVMSLRVSELQVLLGYAGRNKHGRKHELLTKALHLLKAGCSPAVQMKIKEL
       :::  ::..:: :.::::::::::.::::: ::::.:: .::::::.:::::::.::.::
CCDS32 MADFEELRNMVSSFRVSELQVLLGFAGRNKSGRKHDLLMRALHLLKSGCSPAVQIKIREL
               10        20        30        40        50        60

               70        80               90          100       110
pF1KE2 YRRRFPQKIMTPADLSIPNVH-------SSPMPATLSPS---TIPQLTYDGHPASSPLLP
       ::::.:. .   .:::  .         :::.   :. .   ..:. .   :  :::.  
CCDS32 YRRRYPRTLEGLSDLSTIKSSVFSLDGGSSPVEPDLAVAGIHSLPSTSVTPHSPSSPVGS
               70        80        90       100       110       120

              120       130       140       150       160       170
pF1KE2 VSLLGPKHELELPHLTSALHPVHPDIKLQKLPFYDLLDELIKPTSLASDNSQRFRETCFA
       : :   :  .:. . .  . :::::..:..:::::.:: :::::::.... :::.:  : 
CCDS32 VLLQDTKPTFEMQQPSPPIPPVHPDVQLKNLPFYDVLDVLIKPTSLVQSSIQRFQEKFFI
              130       140       150       160       170       180

              180        190       200       210       220         
pF1KE2 FALTPQQVQQISSSMD-ISGTKCDFTVQVQLRFCLSETSCPQEDHFPPNLCVKVNTKPCS
       ::::::::..:  : : . : . :.:::::::.::.::::::::..: .::.::: :   
CCDS32 FALTPQQVREICISRDFLPGGRRDYTVQVQLRLCLAETSCPQEDNYPNSLCIKVNGKLFP
              190       200       210       220       230       240

     230       240       250       260       270       280         
pF1KE2 LPGYLPPTKNGVEPKRPSRPINITSLVRLSTTVPNTIVVSWTAEIGRNYSMAVYLVKQLS
       :::: :: :::.: :::.::.:::::::::..::: : .::..:::.::::.::::.::.
CCDS32 LPGYAPPPKNGIEQKRPGRPLNITSLVRLSSAVPNQISISWASEIGKNYSMSVYLVRQLT
              250       260       270       280       290       300

     290       300       310       320       330       340         
pF1KE2 STVLLQRLRAKGIRNPDHSRALIKEKLTADPDSEIATTSLRVSLLCPLGKMRLTIPCRAL
       :..:::::. ::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::.
CCDS32 SAMLLQRLKMKGIRNPDHSRALIKEKLTADPDSEIATTSLRVSLMCPLGKMRLTIPCRAV
              310       320       330       340       350       360

     350       360       370       380       390       400         
pF1KE2 TCSHLQCFDATLYIQMNEKKPTWVCPVCDKKAPYEHLIIDGLFMEILKYCTDCDEIQFKE
       ::.:::::::.::.:::::::::.:::::::: :: ::.::::::::. :.: :::.:.:
CCDS32 TCTHLQCFDAALYLQMNEKKPTWICPVCDKKAAYESLILDGLFMEILNDCSDVDEIKFQE
              370       380       390       400       410       420

     410       420       430       440       450       460         
pF1KE2 DGTWAPMRSKKEVQEVSASYNGVDGCLSSTLEHQVASHHQSSNKNKKVEVIDLTIDSSSD
       ::.: ::: :::...:: :   .    ::.: .  .    :  ..:::.::::::.::::
CCDS32 DGSWCPMRPKKEAMKVS-SQPCTKIESSSVLSKPCSVTVASEASKKKVDVIDLTIESSSD
              430        440       450       460       470         

     470       480       490       500       510       520         
pF1KE2 EEEEEPSAKRTCPSLSPTSPLNNKGILSLPHQASPVSRTPSLPAVDTSYINTSLIQDYRH
       :::. : ::: :  .: :.   .::.:   .: : : :.::. .:: . :  ::  ::  
CCDS32 EEED-PPAKRKCIFMSETQSSPTKGVLM--YQPSSV-RVPSVTSVDPAAIPPSLT-DYSV
     480        490       500         510        520       530     

     530          540       550       560       570       580      
pF1KE2 PFHMTP---MPYDLQGLDFFPFLSGDNQHYNTSLLAAAAAAVSDDQDLLHSSRFFPYTSS
       ::: ::   :  :: :                                            
CCDS32 PFHHTPISSMSSDLPGEQRRNDINNELKLGTSSDTVQQ                      
          540       550       560       570                        

>>CCDS12118.1 PIAS4 gene_id:51588|Hs108|chr19             (510 aa)
 initn: 1478 init1: 713 opt: 1217  Z-score: 1127.3  bits: 218.5 E(32554): 1.8e-56
Smith-Waterman score: 1487; 48.4% identity (72.3% similar) in 512 aa overlap (2-482:3-501)

                10        20        30        40        50         
pF1KE2  MADSAELKQMVMSLRVSELQVLLGYAGRNKHGRKHELLTKALHLLKAGCSPAVQMKIKE
         :. .: :.::::.:::.::.:::..::.: : ::::.:.::.:..  ::: .  ::::
CCDS12 MAAELVEAKNMVMSFRVSDLQMLLGFVGRSKSGLKHELVTRALQLVQFDCSPELFKKIKE
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KE2 LYRRRFPQKIMTPADLSIPNVHSSPMPATLSPSTIPQLTYDGHPASSPLLPVSLLGPKHE
       ::. :. .:   ::    :. :    : :.  .     .    : ..: .   .:  :. 
CCDS12 LYETRYAKKNSEPA----PQPHRPLDPLTMHSTYDRAGAVPRTPLAGPNIDYPVLYGKYL
               70            80        90       100       110      

     120       130       140       150       160       170         
pF1KE2 LELPHLTSALHPVHPDIKLQKLPFYDLLDELIKPTSLASDNSQRFRETCFAFALTPQQVQ
         : .: .  . ..:...: ::::...::::.::: :. .:.....:.   :::::.::.
CCDS12 NGLGRLPA--KTLKPEVRLVKLPFFNMLDELLKPTELVPQNNEKLQESPCIFALTPRQVE
        120         130       140       150       160       170    

     180        190       200       210       220       230        
pF1KE2 QISSSMDIS-GTKCDFTVQVQLRFCLSETSCPQEDHFPPNLCVKVNTKPCSLPGYLPPTK
        : .: ... :.:   .::: ::.: :.:::::::..:::. :::: . ::.::: : .:
CCDS12 LIRNSRELQPGVK---AVQVVLRICYSDTSCPQEDQYPPNIAVKVNHSYCSVPGYYPSNK
          180          190       200       210       220       230 

      240       250       260       270       280       290        
pF1KE2 NGVEPKRPSRPINITSLVRLSTTVPNTIVVSWTAEIGRNYSMAVYLVKQLSSTVLLQRLR
        ::::::: ::::.: :. ::... : :.:.: .. :..::.:.:::.::.:. :::::.
CCDS12 PGVEPKRPCRPINLTHLMYLSSAT-NRITVTW-GNYGKSYSVALYLVRQLTSSELLQRLK
             240       250        260        270       280         

      300       310       320       330       340       350        
pF1KE2 AKGIRNPDHSRALIKEKLTADPDSEIATTSLRVSLLCPLGKMRLTIPCRALTCSHLQCFD
       . :...:.  .::.::::  :::::::::..::::.::: ::::..:::: ::.::::::
CCDS12 TIGVKHPELCKALVKEKLRLDPDSEIATTGVRVSLICPLVKMRLSVPCRAETCAHLQCFD
     290       300       310       320       330       340         

      360       370       380       390       400       410        
pF1KE2 ATLYIQMNEKKPTWVCPVCDKKAPYEHLIIDGLFMEILKYCTDCDEIQFKEDGTWAPMRS
       :..:.:::::::::.:::::: :::..::::::. .::. : : :::..  ::.: :.:.
CCDS12 AVFYLQMNEKKPTWMCPVCDKPAPYDQLIIDGLLSKILSECEDADEIEYLVDGSWCPIRA
     350       360       370       380       390       400         

      420                430             440       450         460 
pF1KE2 KKE--------VQEVSAS-YNG------VDGCLSSTLEHQVASHHQSSNKNKK--VEVID
       .::        .  .. :  ::      :.:  :..:    ..   .: .: :  ..:.:
CCDS12 EKERSCSPQGAILVLGPSDANGLLPAPSVNG--SGALGSTGGGGPVGSMENGKPGADVVD
     410       420       430       440         450       460       

                470                 480       490       500        
pF1KE2 LTIDSSS---DEEEEE----------PSAKRTCPSLSPTSPLNNKGILSLPHQASPVSRT
       ::.::::   ::::::          :  :: ::                          
CCDS12 LTLDSSSSSEDEEEEEEEEEDEDEEGPRPKRRCPFQKGLVPAC                 
       470       480       490       500       510                 

      510       520       530       540       550       560        
pF1KE2 PSLPAVDTSYINTSLIQDYRHPFHMTPMPYDLQGLDFFPFLSGDNQHYNTSLLAAAAAAV




651 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Sun Nov  6 10:40:42 2016 done: Sun Nov  6 10:40:43 2016
 Total Scan time:  4.250 Total Display time:  0.110

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com