Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6014
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6014, 314 aa
1>>>pF1KE6014 314 - 314 aa - 314 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5451+/-0.00123; mu= 14.3126+/- 0.072
mean_var=154.0057+/-49.849, 0's: 0 Z-trim(101.5): 442 B-trim: 361 in 1/48
Lambda= 0.103349
statistics sampled from 6026 (6548) to 6026 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.542), E-opt: 0.2 (0.201), width: 16
Scan time: 1.630
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS43661.1 OR9A4 gene_id:130075|Hs108|chr7 ( 314) 2093 324.9 5e-89
CCDS34767.1 OR9A2 gene_id:135924|Hs108|chr7 ( 310) 1628 255.6 3.7e-68
CCDS31696.1 OR6M1 gene_id:390261|Hs108|chr11 ( 313) 951 154.6 9e-38
CCDS32038.1 OR6S1 gene_id:341799|Hs108|chr14 ( 331) 935 152.3 4.8e-37
CCDS31824.1 OR6C2 gene_id:341416|Hs108|chr12 ( 312) 920 150.0 2.2e-36
CCDS47728.1 OR6V1 gene_id:346517|Hs108|chr7 ( 313) 916 149.4 3.3e-36
CCDS31700.1 OR6T1 gene_id:219874|Hs108|chr11 ( 323) 916 149.4 3.4e-36
CCDS31819.1 OR6C3 gene_id:254786|Hs108|chr12 ( 311) 906 147.9 9.4e-36
CCDS31827.1 OR6C4 gene_id:341418|Hs108|chr12 ( 309) 896 146.4 2.6e-35
CCDS31816.1 OR6C74 gene_id:254783|Hs108|chr12 ( 312) 887 145.1 6.7e-35
CCDS31820.1 OR6C75 gene_id:390323|Hs108|chr12 ( 312) 871 142.7 3.5e-34
CCDS31098.1 OR11L1 gene_id:391189|Hs108|chr1 ( 322) 870 142.6 3.9e-34
CCDS58241.1 OR2AP1 gene_id:121129|Hs108|chr12 ( 309) 868 142.3 4.7e-34
CCDS31818.1 OR6C1 gene_id:390321|Hs108|chr12 ( 312) 868 142.3 4.8e-34
CCDS31823.1 OR6C76 gene_id:390326|Hs108|chr12 ( 312) 857 140.6 1.5e-33
CCDS31095.1 OR6F1 gene_id:343169|Hs108|chr1 ( 308) 855 140.3 1.8e-33
CCDS31821.1 OR6C65 gene_id:403282|Hs108|chr12 ( 312) 855 140.3 1.8e-33
CCDS31541.1 OR6Q1 gene_id:219952|Hs108|chr11 ( 317) 854 140.2 2e-33
CCDS31695.1 OR6X1 gene_id:390260|Hs108|chr11 ( 312) 848 139.3 3.8e-33
CCDS31825.1 OR6C70 gene_id:390327|Hs108|chr12 ( 312) 846 139.0 4.6e-33
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 846 139.0 4.7e-33
CCDS31817.1 OR6C6 gene_id:283365|Hs108|chr12 ( 314) 837 137.6 1.2e-32
CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs108|chr9 ( 316) 831 136.8 2.2e-32
CCDS7772.1 OR6A2 gene_id:8590|Hs108|chr11 ( 327) 830 136.6 2.5e-32
CCDS31826.2 OR6C68 gene_id:403284|Hs108|chr12 ( 312) 826 136.0 3.7e-32
CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 ( 335) 823 135.6 5.2e-32
CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1 ( 325) 816 134.5 1.1e-31
CCDS43667.1 OR6B1 gene_id:135946|Hs108|chr7 ( 311) 812 133.9 1.6e-31
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 811 133.8 1.7e-31
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 810 133.6 1.9e-31
CCDS53391.1 OR6P1 gene_id:128366|Hs108|chr1 ( 317) 810 133.6 1.9e-31
CCDS30901.1 OR10Z1 gene_id:128368|Hs108|chr1 ( 313) 809 133.5 2.1e-31
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 807 133.2 2.6e-31
CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 ( 311) 805 132.9 3.2e-31
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 804 132.7 3.6e-31
CCDS35092.1 OR13C2 gene_id:392376|Hs108|chr9 ( 318) 804 132.7 3.6e-31
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 803 132.6 3.9e-31
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 801 132.3 4.8e-31
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 800 132.1 5.4e-31
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 799 132.0 6e-31
CCDS35093.1 OR13C9 gene_id:286362|Hs108|chr9 ( 318) 796 131.5 8.2e-31
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 795 131.4 9e-31
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 794 131.2 1e-30
CCDS35127.2 OR1L1 gene_id:26737|Hs108|chr9 ( 310) 791 130.8 1.4e-30
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 789 130.5 1.7e-30
CCDS32033.1 OR11H6 gene_id:122748|Hs108|chr14 ( 330) 788 130.4 1.9e-30
CCDS30910.1 OR10J5 gene_id:127385|Hs108|chr1 ( 309) 787 130.2 2e-30
CCDS35121.1 OR1J2 gene_id:26740|Hs108|chr9 ( 313) 787 130.2 2.1e-30
CCDS32032.1 OR11G2 gene_id:390439|Hs108|chr14 ( 345) 787 130.2 2.2e-30
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 785 129.9 2.5e-30
>>CCDS43661.1 OR9A4 gene_id:130075|Hs108|chr7 (314 aa)
initn: 2093 init1: 2093 opt: 2093 Z-score: 1711.8 bits: 324.9 E(32554): 5e-89
Smith-Waterman score: 2093; 100.0% identity (100.0% similar) in 314 aa overlap (1-314:1-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MLMNYSSATEFYLLGFPGSEELHHILFAIFFFFYLVTLMGNTVIIMIVCVDKRLQSPMYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MLMNYSSATEFYLLGFPGSEELHHILFAIFFFFYLVTLMGNTVIIMIVCVDKRLQSPMYF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FLGHLSALEILVTTIIVPVMLWGLLLPGMQTIYLSACVVQLFLYLAVGTTEFALLGAMAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 FLGHLSALEILVTTIIVPVMLWGLLLPGMQTIYLSACVVQLFLYLAVGTTEFALLGAMAV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYVAVCNPLRYNIIMNRHTCNFVVLVSWVFGFLFQIWPVYVMFQLTYCKSNVVNNFFCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DRYVAVCNPLRYNIIMNRHTCNFVVLVSWVFGFLFQIWPVYVMFQLTYCKSNVVNNFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 RGQLLKLSCNNTLFTEFILFLMAVFVLFGSLIPTIVSNAYIISTILKIPSSSGRRKSFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RGQLLKLSCNNTLFTEFILFLMAVFVLFGSLIPTIVSNAYIISTILKIPSSSGRRKSFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CASHFTCVVIGYGSCLFLYVKPKQTQAADYNWVVSLMVSVVTPFLNPFIFTLRNDKVIEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 CASHFTCVVIGYGSCLFLYVKPKQTQAADYNWVVSLMVSVVTPFLNPFIFTLRNDKVIEA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 LRDGVKRCCQLFRN
::::::::::::::
CCDS43 LRDGVKRCCQLFRN
310
>>CCDS34767.1 OR9A2 gene_id:135924|Hs108|chr7 (310 aa)
initn: 1641 init1: 1137 opt: 1628 Z-score: 1337.2 bits: 255.6 E(32554): 3.7e-68
Smith-Waterman score: 1628; 78.3% identity (92.4% similar) in 314 aa overlap (1-314:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MLMNYSSATEFYLLGFPGSEELHHILFAIFFFFYLVTLMGNTVIIMIVCVDKRLQSPMYF
:. :.::::::.:::::::. ::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
CCDS34 MMDNHSSATEFHLLGFPGSQGLHHILFAIFFFFYLVTLMGNTVIIVIVCVDKRLQSPMYF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FLGHLSALEILVTTIIVPVMLWGLLLPGMQTIYLSACVVQLFLYLAVGTTEFALLGAMAV
::.:::.:::::::::::.::::::. : . ::: ... : .. :: ::::::.:::
CCDS34 FLSHLSTLEILVTTIIVPMMLWGLLFLGCRQ-YLS---LHVSLNFSCGTMEFALLGVMAV
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYVAVCNPLRYNIIMNRHTCNFVVLVSWVFGFLFQIWPVYVMFQLTYCKSNVVNNFFCD
::::::::::::::::: :: .::.:::::::: .:::.:. ::.:. ::: ...:.::
CCDS34 DRYVAVCNPLRYNIIMNSSTCIWVVIVSWVFGFLSEIWPIYATFQFTFRKSNSLDHFYCD
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 RGQLLKLSCNNTLFTEFILFLMAVFVLFGSLIPTIVSNAYIISTILKIPSSSGRRKSFST
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CCDS34 RGQLLKLSCDNTLLTEFILFLMAVFILIGSLIPTIVSYTYIISTILKIPSASGRRKAFST
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CASHFTCVVIGYGSCLFLYVKPKQTQAADYNWVVSLMVSVVTPFLNPFIFTLRNDKVIEA
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CCDS34 FASHFTCVVIGYGSCLFLYVKPKQTQGVEYNKIVSLLVSVLTPFLNPFIFTLRNDKVKEA
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 LRDGVKRCCQLFRN
::::.::::::...
CCDS34 LRDGMKRCCQLLKD
300 310
>>CCDS31696.1 OR6M1 gene_id:390261|Hs108|chr11 (313 aa)
initn: 944 init1: 464 opt: 951 Z-score: 791.6 bits: 154.6 E(32554): 9e-38
Smith-Waterman score: 951; 46.8% identity (80.6% similar) in 310 aa overlap (4-313:3-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MLMNYSSATEFYLLGFPGSEELHHILFAIFFFFYLVTLMGNTVIIMIVCVDKRLQSPMYF
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CCDS31 MGNWSTVTEITLIAFPALLEIRISLFVVLVVTYTLTATGNITIISLIWIDHRLQTPMYF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FLGHLSALEILVTTIIVPVMLWGLLLPGMQTIYLSACVVQLFLYLAVGTTEFALLGAMAV
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CCDS31 FLSNLSFLDILYTTVITPKLL-ACLLGEEKTISFAGCMIQTYFYFFLGTVEFILLAVMSF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYVAVCNPLRYNIIMNRHTCNFVVLVSWVFGFLFQIWPVYVMFQLTYCKSNVVNNFFCD
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CCDS31 DRYMAICDPLHYTVIMNSRACLLLVLGCWVGAFLSVLFPTIVVTRLPYCRKEI-NHFFCD
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 RGQLLKLSCNNTLFTEFILFLMAVFVLFGSLIPTIVSNAYIISTILKIPSSSGRRKSFST
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CCDS31 IAPLLQVACINTHLIEKINFLLSALVILSSLAFTTGSYVYIISTILRIPSTQGRQKAFST
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CASHFTCVVIGYGSCLFLYVKPKQTQAADYNWVVSLMVSVVTPFLNPFIFTLRNDKVIEA
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CCDS31 CASHITVVSIAHGSNIFVYVRPNQNSSLDYDKVAAVLITVVTPLLNPFIYSLRNEKVQEV
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 LRDGVKRCCQLFRN
::. :.: :..
CCDS31 LRETVNRIMTLIQRKT
300 310
>>CCDS32038.1 OR6S1 gene_id:341799|Hs108|chr14 (331 aa)
initn: 854 init1: 617 opt: 935 Z-score: 778.5 bits: 152.3 E(32554): 4.8e-37
Smith-Waterman score: 935; 46.1% identity (79.4% similar) in 306 aa overlap (4-307:6-310)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MLMNYSS-ATEFYLLGFPGSEELHHILFAIFFFFYLVTLMGNTVIIMIVCVDKRLQSP
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CCDS32 MSPDGNHSSDPTEFVLAGLPNLNSARVELFSVFLLVYLLNLTGNVLIVGVVRADTRLQTP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 MYFFLGHLSALEILVTTIIVPVMLWGLLLPGMQTIYLSACVVQLFLYLAVGTTEFALLGA
::::::.:: ::::.:..:.: :: ..: ..:: ..::..:...:. .:..:: ::..
CCDS32 MYFFLGNLSCLEILLTSVIIPKMLSNFL-SRQHTISFAACITQFYFYFFLGASEFLLLAV
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 MAVDRYVAVCNPLRYNIIMNRHTCNFVVLVSWVFGFLFQIWPVYVMFQLTYCKSN-VVNN
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CCDS32 MSADRYLAICHPLRYPLLMSGAVCFRVALACWVGGLVPVLGPTVAVALLPFCKQGAVVQH
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 FFCDRGQLLKLSCNNTLFTEFILFLMAVFVLFGSLIPTIVSNAYIISTILKIPSSSGRRK
:::: : ::.:.:.:: : :..: .:. .::. : :: . :. ..:.:::.:::.:
CCDS32 FFCDSGPLLRLACTNTKKLEETDFVLASLVIVSSLLITAVSYGLIVLAVLSIPSASGRQK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 SFSTCASHFTCVVIGYGSCLFLYVKPKQTQAADYNWVVSLMVSVVTPFLNPFIFTLRNDK
.::::.::. :.. ::: .::::.:.:. ..: ::.:..... :::.:::::..:::..
CCDS32 AFSTCTSHLIVVTLFYGSAIFLYVRPSQSGSVDTNWAVTVITTFVTPLLNPFIYALRNEQ
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE6 VIEALRDGVKRCCQLFRN
: :::.: ..
CCDS32 VKEALKDMFRKVVAGVLGNLLLDKCLSEKAVK
300 310 320 330
>>CCDS31824.1 OR6C2 gene_id:341416|Hs108|chr12 (312 aa)
initn: 720 init1: 720 opt: 920 Z-score: 766.7 bits: 150.0 E(32554): 2.2e-36
Smith-Waterman score: 920; 44.1% identity (76.8% similar) in 306 aa overlap (2-307:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MLMNYSSATEFYLLGFPGSEELHHILFAIFFFFYLVTLMGNTVIIMIVCVDKRLQSPMYF
. :.. : :::. :. .:. .:: ..:. :.... :: .:: .. ::..:..::::
CCDS31 MKNHTVIRTFILLGLTGDPHLQVLLFIFLFLTYMLSVTGNLTIITLTLVDHHLKTPMYF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FLGHLSALEILVTTIIVPVMLWGLLLPGMQTIYLSACVVQLFLYLAVGTTEFALLGAMAV
:: ..: ::. ::. .: .:... . : .:: .::. :.:. . :.::: ::.::.
CCDS31 FLRNFSFLEVSFTTVCIPRFLYNISM-GDNTITYNACASQIFFVILFGATEFFLLAAMSY
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYVAVCNPLRYNIIMNRHTCNFVVLVSWVFGFLFQIWPVYVMFQLTYCKSNVVNNFFCD
:::::.:.::.: .::: ..:...:: :: :... . :. . .:: .: ::....: ::
CCDS31 DRYVAICKPLHYVVIMNNRVCTLLVLCCWVAGLMIIVPPLSLGLQLEFCDSNAIDHFSCD
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 RGQLLKLSCNNTLFTEFILFLMAVFVLFGSLIPTIVSNAYIISTILKIPSSSGRRKSFST
: :::.::..: : ...:::::.:. .:. .:.: ::. ::::.:: . :.:.:::
CCDS31 AGPLLKISCSDTWVIEQMVILMAVFALIITLVCVILSYLYIVRTILKFPSVQQRKKAFST
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CASHFTCVVIGYGSCLFLYVKPKQTQAADYNWVVSLMVSVVTPFLNPFIFTLRNDKVIEA
:.::. : :.::::.:.:.::. . . : ::.... :.:.:::::.:::: .: .:
CCDS31 CSSHMIVVSIAYGSCIFIYIKPSAKDEVAINKGVSVLTTSVAPLLNPFIYTLRNKQVKQA
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 LRDGVKRCCQLFRN
. :..::
CCDS31 FSDSIKRIAFLSKK
300 310
>>CCDS47728.1 OR6V1 gene_id:346517|Hs108|chr7 (313 aa)
initn: 938 init1: 655 opt: 916 Z-score: 763.4 bits: 149.4 E(32554): 3.3e-36
Smith-Waterman score: 916; 45.1% identity (78.4% similar) in 306 aa overlap (2-307:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MLMNYSSATEFYLLGFPGSEELHHILFAIFFFFYLVTLMGNTVIIMIVCVDKRLQSPMYF
. : :. .:: :::: . ::. .:.. :...::...::::.::..: .: .:..::::
CCDS47 MANLSQPSEFVLLGFSSFGELQALLYGPFLMLYLLAFMGNTIIIVMVIADTHLHTPMYF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FLGHLSALEILVTTIIVPVMLWGLLLPGMQTIYLSACVVQLFLYLAVGTTEFALLGAMAV
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CCDS31 FKNVVHKVVFYANQ
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]