FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5975, 312 aa 1>>>pF1KE5975 312 - 312 aa - 312 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8497+/-0.00045; mu= 18.9192+/- 0.028 mean_var=99.2948+/-25.131, 0's: 0 Z-trim(110.6): 303 B-trim: 1190 in 1/50 Lambda= 0.128710 statistics sampled from 18618 (19040) to 18618 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.575), E-opt: 0.2 (0.223), width: 16 Scan time: 7.480 The best scores are: opt bits E(85289) NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 1057 207.2 3.7e-53 NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 982 193.2 5.6e-49 NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 931 183.8 4e-46 NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 919 181.6 1.9e-45 NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 912 180.2 4.6e-45 XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 910 179.8 5.8e-45 NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 901 178.2 1.9e-44 XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 901 178.2 1.9e-44 XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 901 178.2 1.9e-44 XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 892 176.5 6.1e-44 XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 892 176.5 6.1e-44 NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 892 176.5 6.1e-44 NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 889 176.0 8.9e-44 NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 881 174.5 2.5e-43 NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 868 172.1 1.3e-42 NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 856 169.8 6.3e-42 NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 849 168.5 1.5e-41 NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 846 168.0 2.3e-41 NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 832 165.4 1.4e-40 NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 824 163.9 3.8e-40 NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 509 105.4 1.6e-22 NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 497 103.2 7.4e-22 NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 213 50.5 5.7e-06 NP_000016 (OMIM: 109691,601665) beta-3 adrenergic ( 408) 210 50.0 9.5e-06 NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 199 47.8 3.3e-05 NP_000672 (OMIM: 104210) alpha-2A adrenergic recep ( 465) 198 47.9 4.8e-05 NP_005904 (OMIM: 600042) melanocortin receptor 5 [ ( 325) 191 46.4 9.5e-05 NP_001265429 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 187 45.8 0.00018 NP_000666 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a [H ( 412) 187 45.8 0.00018 NP_001265426 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 187 45.8 0.00018 NP_001265427 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 187 45.8 0.00018 NP_001265428 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 187 45.8 0.00018 XP_011521963 (OMIM: 600446) PREDICTED: adenosine r ( 116) 180 43.8 0.00021 NP_000612 (OMIM: 103780,164230,181500,182135,60678 ( 471) 186 45.6 0.00023 NP_000862 (OMIM: 601109) 5-hydroxytryptamine recep ( 440) 179 44.3 0.00054 NP_000674 (OMIM: 104250) alpha-2C adrenergic recep ( 462) 179 44.3 0.00055 NP_000530 (OMIM: 136880,180380,610445,613731) rhod ( 348) 177 43.8 0.0006 XP_011542714 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 308) 176 43.6 0.00063 NP_000901 (OMIM: 162642) neuropeptide Y receptor t ( 381) 177 43.9 0.00064 XP_005263090 (OMIM: 162642) PREDICTED: neuropeptid ( 381) 177 43.9 0.00064 XP_005263091 (OMIM: 162642) PREDICTED: neuropeptid ( 381) 177 43.9 0.00064 XP_016868585 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 317) 176 43.6 0.00065 XP_011542713 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 324) 176 43.6 0.00065 NP_001309433 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 342) 176 43.6 0.00068 NP_001309432 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 370) 176 43.7 0.00071 NP_001309431 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 372) 176 43.7 0.00071 NP_000669 (OMIM: 104219) alpha-1D adrenergic recep ( 572) 178 44.3 0.00072 XP_006716356 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 429) 176 43.7 0.00078 NP_150645 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic recep ( 429) 176 43.7 0.00078 NP_150647 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic recep ( 455) 176 43.8 0.00081 >>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa) initn: 1072 init1: 1007 opt: 1057 Z-score: 1075.4 bits: 207.2 E(85289): 3.7e-53 Smith-Waterman score: 1057; 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NP_009 RYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVCEV 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 QPVLQLVCGDTSLNELQIILATALLILCPFGLILGSYGRILVTIFRIPSVAGRRKAFSTC ...: : ::: ::.:. .:...... :..::: ::: : ...:: :. ::::::.:: NP_009 PALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFGTC 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 SSHLIMVSLFYGTALFIYIRPKASYDPATDPLVSLFYAVVTPILNPIIYSLRNTEVKAAL :::: .:.:::.... .:..:: : . .::::: :: :::.::.::: :: :. NP_009 SSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEVTRAF 240 250 260 270 280 290 310 pF1KE5 KRTIQKTVPMEI .: . : . . NP_009 RRLLGKEMGLTQS 300 310 >>NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [Homo (327 aa) initn: 922 init1: 718 opt: 919 Z-score: 936.8 bits: 181.6 E(85289): 1.9e-45 Smith-Waterman score: 919; 46.7% identity (75.8% similar) in 306 aa overlap (4-305:6-311) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MSANTSMVTEFLLLGFSHLADLQGLLFSVFLTIYLLTVAGNFLIVVLVSTDAALQSPM ... :.::.:::: : :: :::...: :.:... : ::.. . . ..:..:: NP_003 MEWRNHSGRVSEFVLLGFPAPAPLQVLLFALLLLAYVLVLTENTLIIMAIRNHSTLHKPM 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 YFFLRTLSALEIGYTSVTVPLLLHHLLTGRR-H---ISRSGCALQMFFFLFFGATECCLL :::: ..: ::: :..::.: .: .. ... : :: :: :..::: .: ::: :: NP_003 YFFLANMSFLEIWYVTVTIPKMLAGFVGSKQDHGQLISFEGCMTQLYFFLGLGCTECVLL 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 AAMAYDRYAAICEPLRYPLLLSHRVCLQLAGSAWACGVLVGLGHTPFIFSLPFCGPNTIP :.:::::: ::: ::.::...: :.:.:.:...:: : ... .. .: .: .:::: : NP_003 AVMAYDRYMAICYPLHYPVIVSGRLCVQMAAGSWAGGFGISMVKVFLISGLSYCGPNIIN 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 QFFCEIQPVLQLVCGDTSLNELQIILATALLILCPFGLILGSYGRILVTIFRIPSVAGRR .:::...:.:.: : : : :: .. . ...: :... .:: : ....:::.::: NP_003 HFFCDVSPLLNLSCTDMSTAELTDFILAIFILLGPLSVTGASYVAITGAVMHIPSAAGRY 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 KAFSTCSSHLIMVSLFYGTALFIYIRPKASYDPATDPLVSLFYAVVTPILNPIIYSLRNT ::::::.::: .: .::....::: :::: :. :::..:::..:.:::::: ::: NP_003 KAFSTCASHLTVVIIFYAASIFIYARPKALSAFDTNKLVSVLYAVIVPLLNPIIYCLRNQ 250 260 270 280 290 300 300 310 pF1KE5 EVKAALKRTIQKTVPMEI ::: :: :.. NP_003 EVKRALCCTLHLYQHQDPDPKKASRNV 310 320 >>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa) initn: 913 init1: 888 opt: 912 Z-score: 930.0 bits: 180.2 E(85289): 4.6e-45 Smith-Waterman score: 912; 45.4% identity (73.2% similar) in 306 aa overlap (4-308:7-311) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MSANTSMVTEFLLLGFSHLADLQGLLFSVFLTIYLLTVAGNFLIVVLVSTDAALQSP : ..::::.:::: .:: .:: .:::.: . . ::. ...:. : ::.: NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 MYFFLRTLSALEIGYTSVTVPLLLHHLLTGRRHISRSGCALQMFFFLFFGATECCLLAAM ::::: .:: ... : : :: .: ..:. . :: :::::..:: :. :: .:::: NP_006 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 AYDRYAAICEPLRYPLLLSHRVCLQLAGSAWACGVLVGLGHTPFIFSLPFCGPNTIPQFF :::::.:::.:: : ...:. .:..: .. : . .: :: : : : .: :.: .:: NP_006 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 CEIQPVLQLVCGDTSLNE-LQIILATALLILCPFGLILGSYGRILVTIFRIPSVAGRRKA :.. :.:.: : ::..:: : .... :.: : .:. :: ::.....: : .::.:. NP_006 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIIC-FIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKT 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 FSTCSSHLIMVSLFYGTALFIYIRPKASYDPATDPLVSLFYAVVTPILNPIIYSLRNTEV ::::.::: :... :: :::: ::. :.: :: ..:.::.. :.:::.:::::: .: NP_006 FSTCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDV 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 KAALKRTIQKTVPMEI : : ...... : NP_006 KDAAEKVLRSKVDSS 300 310 >>XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory recep (300 aa) initn: 933 init1: 905 opt: 910 Z-score: 928.2 bits: 179.8 E(85289): 5.8e-45 Smith-Waterman score: 910; 46.9% identity (73.1% similar) in 294 aa overlap (4-297:3-296) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MSANTSMVTEFLLLGFSHLADLQGLLFSVFLTIYLLTVAGNFLIVVLVSTDAALQSPMYF : : . :::::::. :. :: : :: ::::..:: ::..: . : :.::::: XP_011 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSPMYF 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 FLRTLSALEIGYTSVTVPLLLHHLLTGRRHISRSGCALQMFFFLFFGATECCLLAAMAYD :: .:: :.. .:. :: .: .: .. :: :..:.:.:: .:.::: ::..::.: XP_011 FLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVMAFD 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 RYAAICEPLRYPLLLSHRVCLQLAGSAWACGVLVGLGHTPFIFSLPFCGPNTIPQFFCEI ::.:.:.::.: .. :.: :::. ::. :.. .. .:: . :::: . .: ::. XP_011 RYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVCEV 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 QPVLQLVCGDTSLNELQIILATALLILCPFGLILGSYGRILVTIFRIPSVAGRRKAFSTC ...: : ::: ::.:. .:...... :..::: ::: : ...:: :. ::::::.:: XP_011 PALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFGTC 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 SSHLIMVSLFYGTALFIYIRPKASYDPATDPLVSLFYAVVTPILNPIIYSLRNTEVKAAL :::: .:.:::.... .:..:: : . .::::: :: :::.::.::: : : XP_011 SSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEQKRRG 240 250 260 270 280 290 310 pF1KE5 KRTIQKTVPMEI XP_011 S 300 >>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa) initn: 908 init1: 885 opt: 901 Z-score: 918.9 bits: 178.2 E(85289): 1.9e-44 Smith-Waterman score: 901; 45.2% identity (74.1% similar) in 305 aa overlap (4-308:5-309) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MSANTSMVTEFLLLGFSHLADLQGLLFSVFLTIYLLTVAGNFLIVVLVSTDAALQSPMY : : :.::::::.:. . : ::: ::..:: :: ::.::.. :: :. :..::: NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 FFLRTLSALEIGYTSVTVPLLLHHLLTGRRHISRSGCALQMFFFLFFGATECCLLAAMAY ::: .:: ..: .. .::: .: . . . :: :: ::.: ..: . :::.::: NP_036 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 DRYAAICEPLRYPLLLSHRVCLQLAGSAWACGVLVGLGHTPFIFSLPFCGPNTIPQFFCE :...:.:.::.: ..:..: :... :. . : : :: .. : ::. :.: .:::. 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XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 IQPVLQLVCGDTSLNELQIILATALLILCPFGLILGSYGRILVTIFRIPSVAGRRKAFST . :.:.: :.:: :::. :. ::... :: ::.:: .: :....::. :: ::::: XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 CSSHLIMVSLFYGTALFIYIRPKASYDPATDPLVSLFYAVVTPILNPIIYSLRNTEVKAA :.::: .: :::.: . .:. : .:.. : .....:.::::.:::.:::::: .:.: XP_011 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA 250 260 270 280 290 300 300 310 pF1KE5 LKRTIQKTVPMEI ::... ..: XP_011 LKKVVGRVVFSV 310 >>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa) initn: 908 init1: 885 opt: 901 Z-score: 918.8 bits: 178.2 E(85289): 1.9e-44 Smith-Waterman score: 901; 45.2% identity (74.1% similar) in 305 aa overlap (4-308:15-319) 10 20 30 40 pF1KE5 MSANTSMVTEFLLLGFSHLADLQGLLFSVFLTIYLLTVAGNFLIVVLVS : : :.::::::.:. . : ::: ::..:: :: ::.::.. :: XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE5 TDAALQSPMYFFLRTLSALEIGYTSVTVPLLLHHLLTGRRHISRSGCALQMFFFLFFGAT :. :..:::::: .:: ..: .. .::: .: . . . :: :: ::.: ..: XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE5 ECCLLAAMAYDRYAAICEPLRYPLLLSHRVCLQLAGSAWACGVLVGLGHTPFIFSLPFCG . :::.::::...:.:.::.: ..:..: :... :. . : : :: .. : ::. 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