FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2053, 688 aa 1>>>pF1KE2053 688 - 688 aa - 688 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2165+/-0.000509; mu= 14.6804+/- 0.031 mean_var=143.6913+/-29.381, 0's: 0 Z-trim(113.5): 438 B-trim: 4 in 1/51 Lambda= 0.106994 statistics sampled from 22259 (22805) to 22259 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.626), E-opt: 0.2 (0.267), width: 16 Scan time: 10.880 The best scores are: opt bits E(85289) NP_958850 (OMIM: 120580,613783) complement C1s sub ( 688) 4868 764.5 0 NP_001725 (OMIM: 120580,613783) complement C1s sub ( 688) 4868 764.5 0 XP_005253817 (OMIM: 120580,613783) PREDICTED: comp ( 688) 4868 764.5 0 NP_006601 (OMIM: 605102,613791) mannan-binding lec ( 686) 1656 268.7 5.3e-71 NP_001870 (OMIM: 257920,600521) mannan-binding lec ( 699) 1466 239.4 3.6e-62 XP_011511292 (OMIM: 257920,600521) PREDICTED: mann ( 706) 1466 239.4 3.7e-62 NP_624302 (OMIM: 257920,600521) mannan-binding lec ( 728) 1280 210.7 1.6e-53 XP_011511291 (OMIM: 257920,600521) PREDICTED: mann ( 735) 1280 210.7 1.7e-53 XP_016862358 (OMIM: 257920,600521) PREDICTED: mann ( 702) 1277 210.2 2.2e-53 XP_016862359 (OMIM: 257920,600521) PREDICTED: mann ( 668) 1257 207.1 1.8e-52 XP_016862360 (OMIM: 257920,600521) PREDICTED: mann ( 660) 1198 198.0 9.9e-50 XP_016862361 (OMIM: 257920,600521) PREDICTED: mann ( 615) 1034 172.6 4e-42 NP_001027019 (OMIM: 257920,600521) mannan-binding ( 380) 996 166.5 1.7e-40 XP_011511293 (OMIM: 257920,600521) PREDICTED: mann ( 387) 996 166.5 1.7e-40 XP_006713764 (OMIM: 257920,600521) PREDICTED: mann ( 354) 993 166.0 2.2e-40 XP_016855586 (OMIM: 605102,613791) PREDICTED: mann ( 332) 804 136.8 1.3e-31 NP_631947 (OMIM: 605102,613791) mannan-binding lec ( 185) 479 86.4 1.1e-16 NP_005134 (OMIM: 140100,614081) haptoglobin isofor ( 406) 480 86.9 1.7e-16 NP_001119574 (OMIM: 140100,614081) haptoglobin iso ( 347) 476 86.2 2.3e-16 NP_001305067 (OMIM: 140100,614081) haptoglobin iso ( 347) 475 86.0 2.6e-16 XP_006723244 (OMIM: 142440) PREDICTED: serine prot ( 417) 476 86.3 2.6e-16 NP_002142 (OMIM: 142440) serine protease hepsin pr ( 417) 476 86.3 2.6e-16 XP_016882220 (OMIM: 142440) PREDICTED: serine prot ( 417) 476 86.3 2.6e-16 NP_892028 (OMIM: 142440) serine protease hepsin pr ( 417) 476 86.3 2.6e-16 XP_005258895 (OMIM: 142440) PREDICTED: serine prot ( 417) 476 86.3 2.6e-16 XP_016882221 (OMIM: 142440) PREDICTED: serine prot ( 393) 471 85.5 4.3e-16 NP_066275 (OMIM: 140210) haptoglobin-related prote ( 348) 460 83.7 1.3e-15 NP_001298186 (OMIM: 176930,188050,601367,613679,61 ( 606) 456 83.4 2.8e-15 NP_000497 (OMIM: 176930,188050,601367,613679,61439 ( 622) 456 83.4 2.9e-15 NP_000303 (OMIM: 176860,612283,612304) vitamin K-d ( 461) 451 82.5 4e-15 XP_005263774 (OMIM: 176860,612283,612304) PREDICTE ( 482) 451 82.5 4.1e-15 XP_016859995 (OMIM: 176860,612283,612304) PREDICTE ( 495) 451 82.5 4.2e-15 XP_016859994 (OMIM: 176860,612283,612304) PREDICTE ( 542) 451 82.6 4.5e-15 NP_062562 (OMIM: 227500,608446,613878) coagulation ( 444) 425 78.4 6.3e-14 NP_000122 (OMIM: 227500,608446,613878) coagulation ( 466) 425 78.5 6.5e-14 NP_001254483 (OMIM: 227500,608446,613878) coagulat ( 382) 422 77.9 7.9e-14 XP_011535777 (OMIM: 227500,608446,613878) PREDICTE ( 433) 422 78.0 8.6e-14 NP_009203 (OMIM: 167800,601405) chymotrypsin-C pre ( 268) 419 77.3 8.6e-14 XP_011535776 (OMIM: 227500,608446,613878) PREDICTE ( 495) 419 77.6 1.3e-13 XP_011535778 (OMIM: 227500,608446,613878) PREDICTE ( 364) 415 76.8 1.6e-13 XP_006720026 (OMIM: 227500,608446,613878) PREDICTE ( 412) 410 76.1 3e-13 NP_036597 (OMIM: 606743) tolloid-like protein 2 pr (1015) 414 77.1 3.6e-13 XP_006716449 (OMIM: 112264,614856) PREDICTED: bone ( 813) 402 75.2 1.1e-12 XP_016869227 (OMIM: 112264,614856) PREDICTED: bone ( 717) 400 74.8 1.3e-12 NP_001190 (OMIM: 112264,614856) bone morphogenetic ( 730) 400 74.8 1.3e-12 NP_006120 (OMIM: 112264,614856) bone morphogenetic ( 986) 400 75.0 1.6e-12 NP_002764 (OMIM: 600823) prostasin preproprotein [ ( 343) 387 72.5 3.1e-12 NP_114154 (OMIM: 608018) serine protease 27 isofor ( 290) 383 71.8 4.3e-12 NP_077078 (OMIM: 191081) tryptase beta-2 prepropro ( 275) 381 71.4 5.1e-12 NP_001306118 (OMIM: 173370,612348) tissue-type pla ( 473) 383 72.0 5.9e-12 >>NP_958850 (OMIM: 120580,613783) complement C1s subcomp (688 aa) initn: 4868 init1: 4868 opt: 4868 Z-score: 4075.2 bits: 764.5 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 4868; 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NP_006 DYSNEKPFTGFEAFYAAEDIDECQVAPGEAPTCDHHCHNHLGGFYCSCRAGYVLHRNKRT 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 CGVNCSGDVFTALIGEIASPNYPKPYPENSRCEYQIRLEKGFQVVVTLRREDFDVEAADS :.. :::.::: ::..::.::.:::. : : :.: ::.::.:.. . :.::::. NP_006 CSALCSGQVFTQRSGELSSPEYPRPYPKLSSCTYSISLEEGFSVILDFV-ESFDVETHPE 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE2 AGNCLDSLVFVAGDRQ-FGPYCGHGFPGPLNIETKSNALDIIFQTDLTGQKKGWKLRYHG . : ... . ::. ::.::. .: ::::::.. : : :: .:.. :::..: . NP_006 TL-CPYDFLKIQTDREEHGPFCGKTLPH--RIETKSNTVTITFVTDESGDHTGWKIHYTS 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE2 DPMPCPKE-DTPNSVWEPAKAKYVFRDVVQITCLDGFEVVEGRVGATSFYSTCQSNGKWS .::: ::. :..:::...: .: : :.:...:.. :: ..::..:.:. NP_006 TAQPCPYPMAPPNGHVSPVQAKYILKDSFSIFCETGYELLQGHLPLKSFTAVCQKDGSWD 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KE2 NSKLKCQPVDCGIPESIENGKVE---DPESTLFGSVIRYTCEEPYYYMENGGGGEYHCAG :. :::: :... .:.:: : : . .::.:.::: .: :. . : .: : . NP_006 RPMPACSIVDCGPPDDLPSGRVEYITGPGVTTYKAVIQYSCEETFYTMKVNDG-KYVCEA 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KE2 NGSWVNEVLGPELPKCVPVCGVPREPFEEKQRIIGGSDADIKNFPWQVF-FDNPWAGGAL .: :.. :: : ::::. . :: ::. : .:::::. . . :.::: NP_006 DGFWTSSKGEKSLPVCEPVCGLSAR--TTGGRIYGGQKAKPGDFPWQVLILGGTTAAGAL 420 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 pF1KE2 INEYWVLTAAHVVEGNREPTMYVGSTSVQTSRLAKSKMLTP-------EHVFIHPGWKLL . . :::::::.: ... ..:. :.. : :.: : :::: :. NP_006 LYDNWVLTAAHAVYEQKH------DASALDIRMGTLKRLSPHYTQAWSEAVFIHEGY--- 480 490 500 510 520 520 530 540 550 560 570 pF1KE2 EVPEGRTNFDNDIALVRLKDPVKMGPTVSPICLPGTSSDYNLMDGDLGLISGWGRTEKRD ..:::::::..:.. : .. ...::::: .. . :.: :::: :.. NP_006 ---THDAGFDNDIALIKLNNKVVINSNITPICLPRKEAESFMRTDDIGTASGWGLTQRGF 530 540 550 560 570 580 580 590 600 610 620 630 pF1KE2 RAVRLKAARLPVAPLRKCKEVKVEKPTADAEAYVFTPNMICAGGEKG-MDSCKGDSGGAF : : . .:.. .:: . ::: . : ::.::: :.: :::.::::::. NP_006 LARNLMYVDIPIVDHQKCT-AAYEKPPYPRGSV--TANMLCAGLESGGKDSCRGDSGGAL 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 pF1KE2 AVQDPNDKTKFYAAGLVSWGPQ-CGT---YGLYTRVKNYVDWIMKTMQENSTPRED . : .. .....:.:::: . :: ::.::.: ::. :: . ... NP_006 VFLD-SETERWFVGGIVSWGSMNCGEAGQYGVYTKVINYIPWIENIISDF 640 650 660 670 680 >>NP_001870 (OMIM: 257920,600521) mannan-binding lectin (699 aa) initn: 836 init1: 424 opt: 1466 Z-score: 1237.1 bits: 239.4 E(85289): 3.6e-62 Smith-Waterman score: 1599; 36.8% identity (64.4% similar) in 699 aa overlap (3-677:11-693) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MWCIVLFSLLAWVYAEPTMYGEILSPNYPQAYPSEVEKSWDIEVPEGYGIHL :. : . : . .:.:.: ::.::..:::. : .:.: ::.:. :.: NP_001 MRWLLLYYALCFSLSKASAHTVELNNMFGQIQSPGYPDSYPSDSEVTWNITVPDGFRIKL 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 YFTHLDIELSENCAYDSVQIISGDTEEGRLCGQRSSNNPHSPIVEEFQVPYNKLQVIFKS :: :...: : : :: :.. . : . .::...... ..: : : . ... :.: NP_001 YFMHFNLESSYLCEYDYVKVETEDQVLATFCGRETTDTEQTPGQEVVLSPGSFMSITFRS 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 DFSNEERFTGFAAYYVATDINECTDFVD--VPCSHFCNNFIGGYFCSCPPEYFLHDDMKN ::::::::::: :.:.:.:..:: . : . :.:.:.:.::::.::: :.:: : .. NP_001 DFSNEERFTGFDAHYMAVDVDECKEREDEELSCDHYCHNYIGGYYCSCRFGYILHTDNRT 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 pF1KE2 CGVNCSGDVFTALIGEIASPNYPKPYPENSRCEYQIRLEKGFQVVVTLRRED-FDVEAAD : :.:: ..:: : :.::..:.:::..:.: : :.::.:: .:.:. :: ::.: NP_001 CRVECSDNLFTQRTGVITSPDFPNPYPKSSECLYTIELEEGF--MVNLQFEDIFDIEDHP 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE2 SAGNCLDSLVFVAGDRQFGPYCGHGFPGPLNIETKSNALDIIFQTDLTGQKKGWKLRYHG . : . . .: . .::.::. : : : :.:... :.:..: .:...::.: :.. NP_001 EVPCPYDYIKIKVGPKVLGPFCGEKAPEP--ISTQSHSVLILFHSDNSGENRGWRLSYRA 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE2 DPMPCPKEDTP-NSVWEPAKAKYVFRDVVQITCLDGFEVVEGRVGATSFYSTCQSNGKWS ::. . : .. ::..::: :.: : ..: :..:.. : .: : ..: :: NP_001 AGNECPELQPPVHGKIEPSQAKYFFKDQVLVSCDTGYKVLKDNVEMDTFQIECLKDGTWS 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KE2 NSKLKCQPVDCGIPESIENGKVE---DPESTLFGSVIRYTCEEPYYYMENGGGGEYHCAG :. :. ::: : .:.: . . : . : :.:.:.:::: : :.. : : :.. NP_001 NKIPTCKIVDCRAPGELEHGLITFSTRNNLTTYKSEIKYSCQEPYYKMLNNNTGIYTCSA 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KE2 NGSWVNEVLGPELPKCVPVCGVPREPFEEKQRIIGGSDADIKNFPWQVFFDN----PWAG .: :.:.::: :: :.::::.:. . ::..: :. . :: ..... :. : NP_001 QGVWMNKVLGRSLPTCLPVCGLPKFSRKLMARIFNGRPAQKGTTPWIAMLSHLNGQPFCG 420 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 pF1KE2 GALINEYWVLTAAHVVEGN---REPTMY---VGSTSVQTSRLAKSKMLTPEHVFIHPGWK :.:.. :..:::: .. . ..::. . : : :.: : .. : : : NP_001 GSLLGSSWIVTAAHCLHQSLDPEDPTLRDSDLLSPSDFKIILGKHWRLRSDENEQHLGVK 480 490 500 510 520 530 520 530 540 550 560 570 pF1KE2 LLEV-PEGRTN-FDNDIALVRL-KDPVKMGPTVSPICLPGTSSDYNLMDGDLGLISGWGR . :. : :.::.:::.: ..:: .. : ::::: . ..: . ..::::. NP_001 HTTLHPQYDPNTFENDVALVELLESPV-LNAFVMPICLP----EGPQQEGAMVIVSGWGK 540 550 560 570 580 590 580 590 600 610 620 630 pF1KE2 TEKRDRAVRLKAARLPVAPLRKCKEVKVEKPTADAEAYVFTPNMICAG-GEKGMDSCKGD . : ..:.. :. : : . : : .::::: : : :.: :: NP_001 QFLQRFPETLMEIEIPIVDHSTCQ-----KAYAPLKKKV-TRDMICAGEKEGGKDACAGD 600 610 620 630 640 640 650 660 670 680 pF1KE2 SGGAFAVQDPNDKTKFYAAGLVSWGPQCGT---YGLYTRVKNYVDWIMKTMQENSTPRED ::: ... . .. ..: .: :::: .:: ::.:. ... :::.. NP_001 SGGPMVTLN-RERGQWYLVGTVSWGDDCGKKDRYGVYSYIHHNKDWIQRVTGVRN 650 660 670 680 690 >>XP_011511292 (OMIM: 257920,600521) PREDICTED: mannan-b (706 aa) initn: 836 init1: 424 opt: 1466 Z-score: 1237.0 bits: 239.4 E(85289): 3.7e-62 Smith-Waterman score: 1599; 36.8% identity (64.4% similar) in 699 aa overlap (3-677:18-700) 10 20 30 40 pF1KE2 MWCIVLFSLLAWVYAEPTMYGEILSPNYPQAYPSEVEKSWDIEVP :. : . : . .:.:.: ::.::..:::. : .:.: :: XP_011 MRPTFMSFRWLLLYYALCFSLSKASAHTVELNNMFGQIQSPGYPDSYPSDSEVTWNITVP 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE2 EGYGIHLYFTHLDIELSENCAYDSVQIISGDTEEGRLCGQRSSNNPHSPIVEEFQVPYNK .:. :.::: :...: : : :: :.. . : . .::...... ..: : : . XP_011 DGFRIKLYFMHFNLESSYLCEYDYVKVETEDQVLATFCGRETTDTEQTPGQEVVLSPGSF 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 LQVIFKSDFSNEERFTGFAAYYVATDINECTDFVD--VPCSHFCNNFIGGYFCSCPPEYF ... :.:::::::::::: :.:.:.:..:: . : . :.:.:.:.::::.::: :. 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XP_011 LKDGTWSNKIPTCKIVDCRAPGELEHGLITFSTRNNLTTYKSEIKYSCQEPYYKMLNNNT 360 370 380 390 400 410 400 410 420 430 440 450 pF1KE2 GEYHCAGNGSWVNEVLGPELPKCVPVCGVPREPFEEKQRIIGGSDADIKNFPWQVFFDN- : : :...: :.:.::: :: :.::::.:. . ::..: :. . :: ..... XP_011 GIYTCSAQGVWMNKVLGRSLPTCLPVCGLPKFSRKLMARIFNGRPAQKGTTPWIAMLSHL 420 430 440 450 460 470 460 470 480 490 500 pF1KE2 ---PWAGGALINEYWVLTAAHVVEGN---REPTMY---VGSTSVQTSRLAKSKMLTPEHV :. ::.:.. :..:::: .. . ..::. . : : :.: : .. XP_011 NGQPFCGGSLLGSSWIVTAAHCLHQSLDPEDPTLRDSDLLSPSDFKIILGKHWRLRSDEN 480 490 500 510 520 530 510 520 530 540 550 560 pF1KE2 FIHPGWKLLEV-PEGRTN-FDNDIALVRL-KDPVKMGPTVSPICLPGTSSDYNLMDGDLG : : : . :. : :.::.:::.: ..:: .. : ::::: . ..: . XP_011 EQHLGVKHTTLHPQYDPNTFENDVALVELLESPV-LNAFVMPICLP----EGPQQEGAMV 540 550 560 570 580 590 570 580 590 600 610 620 pF1KE2 LISGWGRTEKRDRAVRLKAARLPVAPLRKCKEVKVEKPTADAEAYVFTPNMICAG-GEKG ..::::. . : ..:.. :. : : . : : .::::: : : XP_011 IVSGWGKQFLQRFPETLMEIEIPIVDHSTCQ-----KAYAPLKKKV-TRDMICAGEKEGG 600 610 620 630 640 630 640 650 660 670 680 pF1KE2 MDSCKGDSGGAFAVQDPNDKTKFYAAGLVSWGPQCGT---YGLYTRVKNYVDWIMKTMQE :.: ::::: ... . .. ..: .: :::: .:: ::.:. ... :::.. XP_011 KDACAGDSGGPMVTLN-RERGQWYLVGTVSWGDDCGKKDRYGVYSYIHHNKDWIQRVTGV 650 660 670 680 690 700 pF1KE2 NSTPRED XP_011 RN >>NP_624302 (OMIM: 257920,600521) mannan-binding lectin (728 aa) initn: 908 init1: 424 opt: 1280 Z-score: 1081.7 bits: 210.7 E(85289): 1.6e-53 Smith-Waterman score: 1711; 38.1% identity (65.3% similar) in 724 aa overlap (3-679:11-715) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MWCIVLFSLLAWVYAEPTMYGEILSPNYPQAYPSEVEKSWDIEVPEGYGIHL :. : . : . .:.:.: ::.::..:::. : .:.: ::.:. :.: NP_624 MRWLLLYYALCFSLSKASAHTVELNNMFGQIQSPGYPDSYPSDSEVTWNITVPDGFRIKL 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 YFTHLDIELSENCAYDSVQIISGDTEEGRLCGQRSSNNPHSPIVEEFQVPYNKLQVIFKS :: :...: : : :: :.. . : . .::...... ..: : : . ... :.: NP_624 YFMHFNLESSYLCEYDYVKVETEDQVLATFCGRETTDTEQTPGQEVVLSPGSFMSITFRS 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 DFSNEERFTGFAAYYVATDINECTDFVD--VPCSHFCNNFIGGYFCSCPPEYFLHDDMKN ::::::::::: :.:.:.:..:: . : . :.:.:.:.::::.::: :.:: : .. 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XP_011 -GPAPHMLGLVAGWGISNPNVTVDEIISSGTRTLSDVLQYVKLPVVPHAECK-TSYESRS 590 600 610 620 630 640 610 620 630 640 650 660 pF1KE2 ADAEAYVFTPNMICAGG-EKGMDSCKGDSGGAFAVQDPNDKTKFYAAGLVSWG-PQ-CGT .. : : ::.::: : : :.: :::::::.. : . . .. . :::::: :. ::. 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