FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6028, 316 aa 1>>>pF1KE6028 316 - 316 aa - 316 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2280+/-0.0014; mu= 10.5270+/- 0.081 mean_var=174.3876+/-59.740, 0's: 0 Z-trim(99.9): 373 B-trim: 338 in 1/47 Lambda= 0.097122 statistics sampled from 5475 (5904) to 5475 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.508), E-opt: 0.2 (0.181), width: 16 Scan time: 2.210 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 2018 296.2 2.3e-80 CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 1810 267.0 1.4e-71 CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 1191 180.3 1.7e-45 CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 ( 307) 1180 178.7 5e-45 CCDS31528.1 OR8K1 gene_id:390157|Hs108|chr11 ( 319) 1130 171.7 6.5e-43 CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 1071 163.5 2e-40 CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 1068 163.1 2.7e-40 CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 1053 160.9 1.1e-39 CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 1053 160.9 1.1e-39 CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 1051 160.6 1.4e-39 CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 1051 160.7 1.4e-39 CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 1047 160.1 2e-39 CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 1047 160.1 2.1e-39 CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 1046 160.0 2.2e-39 CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 1042 159.4 3.4e-39 CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 1040 159.1 4e-39 CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 1040 159.1 4.1e-39 CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 1034 158.3 7.3e-39 CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 ( 311) 1033 158.1 8e-39 CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 1033 158.1 8e-39 CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 1032 158.0 8.8e-39 CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 1027 157.4 1.5e-38 CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 1026 157.2 1.6e-38 CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 1010 154.9 7.4e-38 CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 1007 154.5 1e-37 CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 1005 154.2 1.2e-37 CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 993 152.5 3.9e-37 CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 989 152.0 5.7e-37 CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 987 151.7 6.9e-37 CCDS31512.1 OR5D16 gene_id:390144|Hs108|chr11 ( 328) 987 151.7 7.2e-37 CCDS31814.1 OR9K2 gene_id:441639|Hs108|chr12 ( 335) 981 150.9 1.3e-36 CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 ( 311) 979 150.6 1.5e-36 CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 979 150.6 1.5e-36 CCDS31548.1 OR5B17 gene_id:219965|Hs108|chr11 ( 314) 974 149.9 2.5e-36 CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 973 149.7 2.7e-36 CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 971 149.5 3.3e-36 CCDS31532.1 OR5M3 gene_id:219482|Hs108|chr11 ( 307) 969 149.2 4e-36 CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 ( 315) 966 148.8 5.4e-36 CCDS33801.1 OR5H2 gene_id:79310|Hs108|chr3 ( 314) 958 147.6 1.2e-35 CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 957 147.5 1.3e-35 CCDS31531.1 OR5M9 gene_id:390162|Hs108|chr11 ( 310) 953 146.9 1.9e-35 CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 951 146.7 2.5e-35 CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 950 146.5 2.5e-35 CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 944 145.7 4.6e-35 CCDS35127.2 OR1L1 gene_id:26737|Hs108|chr9 ( 310) 942 145.4 5.5e-35 CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 941 145.3 6.2e-35 CCDS31710.1 OR8B4 gene_id:283162|Hs108|chr11 ( 309) 939 145.0 7.3e-35 CCDS31508.1 OR5D14 gene_id:219436|Hs108|chr11 ( 314) 937 144.7 9e-35 CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 936 144.6 1e-34 CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11 ( 312) 934 144.3 1.2e-34 >>CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 (316 aa) initn: 2018 init1: 2018 opt: 2018 Z-score: 1556.3 bits: 296.2 E(32554): 2.3e-80 Smith-Waterman score: 2018; 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CCDS31 AFKKTVGKAKASIGFIF 300 310 >>CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 (324 aa) initn: 952 init1: 905 opt: 1068 Z-score: 836.8 bits: 163.1 E(32554): 2.7e-40 Smith-Waterman score: 1068; 49.7% identity (81.4% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-311) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MAPENFTRVTEFILTGVSSCPELQIPLFLVFLVLYGLTMAGNLGIITLTSVDSRLQTPMY : :.: :::...: .. :.. ::::::..: :::.::. .: :....: :: ::: CCDS31 MLESNYTMPTEFLFVGFTDYLPLRVTLFLVFLLVYTLTMVGNILLIILVNINSSLQIPMY 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 FFLQHLALINLGNSTVIAPKMLINFLVKKKTTSFYECATQLGGFLFFIVSEVIMLALMAY .::..:...... ::.:.:::: :::...:. : : :: :. : : .: ..:: ::: CCDS31 YFLSNLSFLDISCSTAITPKMLANFLASRKSISPYGCALQMFFFASFADAECLILAAMAY 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 DRYVAICNPLLYMVVVSRRLCLLLVSLTYLYGFSTAIVVSSYVFSVSYCSSNIINHFYCD :::.:::::::: ...:::.:. .. :.:. : .:..: .: .:.:.:::.:::.:: CCDS31 DRYAAICNPLLYTTLMSRRVCVCFIVLAYFSGSTTSLVHVCLTFRLSFCGSNIVNHFFCD 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 NVPLLALSCSDTYLPETVVFISAATNVVGSLIIVLVSYFNIVLSILKICSSEGRKKAFST :::::::.:: . . ..: . .........::: :....:.: :: ::.:.::: CCDS31 IPPLLALSCTDTQINQLLLFALCSFIQTSTFVVIFISYFCILITVLSIKSSGGRSKTFST 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 CASHMMAVTIFYGTLLFMYVQPRSNHSLDTDDKMASVFYTLVIPMLNPLIYSLRNKDVKT ::::..:::.:::.:::::.:: ...::::: :...::::.:.::.::.:::.::::::. 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