FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5987, 313 aa 1>>>pF1KE5987 313 - 313 aa - 313 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9609+/-0.0014; mu= 11.8938+/- 0.082 mean_var=167.2372+/-58.461, 0's: 0 Z-trim(101.4): 392 B-trim: 789 in 2/44 Lambda= 0.099176 statistics sampled from 5999 (6505) to 5999 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.532), E-opt: 0.2 (0.2), width: 16 Scan time: 2.110 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS31367.1 OR51A4 gene_id:401666|Hs108|chr11 ( 313) 2005 300.0 1.6e-81 CCDS31368.1 OR51A2 gene_id:401667|Hs108|chr11 ( 313) 1945 291.4 6e-79 CCDS31364.1 OR51A7 gene_id:119687|Hs108|chr11 ( 312) 1549 234.8 6.8e-62 CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11 ( 314) 1221 187.8 9.1e-48 CCDS31369.1 OR51L1 gene_id:119682|Hs108|chr11 ( 315) 1180 182.0 5.3e-46 CCDS31381.1 OR51Q1 gene_id:390061|Hs108|chr11 ( 317) 1107 171.5 7.5e-43 CCDS31361.1 OR51F2 gene_id:119694|Hs108|chr11 ( 342) 1091 169.3 3.8e-42 CCDS31375.1 OR51V1 gene_id:283111|Hs108|chr11 ( 321) 1082 168.0 9e-42 CCDS31358.2 OR51E1 gene_id:143503|Hs108|chr11 ( 318) 1077 167.2 1.5e-41 CCDS7751.1 OR51E2 gene_id:81285|Hs108|chr11 ( 320) 1077 167.2 1.5e-41 CCDS31383.1 OR51I2 gene_id:390064|Hs108|chr11 ( 312) 1073 166.7 2.2e-41 CCDS31382.1 OR51I1 gene_id:390063|Hs108|chr11 ( 314) 1047 162.9 2.9e-40 CCDS31351.1 OR52K2 gene_id:119774|Hs108|chr11 ( 314) 1028 160.2 1.9e-39 CCDS53596.1 OR51M1 gene_id:390059|Hs108|chr11 ( 326) 1027 160.1 2.1e-39 CCDS31357.1 OR51D1 gene_id:390038|Hs108|chr11 ( 324) 1020 159.1 4.2e-39 CCDS31352.1 OR52K1 gene_id:390036|Hs108|chr11 ( 314) 1014 158.2 7.5e-39 CCDS31378.1 OR51B5 gene_id:282763|Hs108|chr11 ( 312) 1005 156.9 1.8e-38 CCDS31379.1 OR51B6 gene_id:390058|Hs108|chr11 ( 312) 1002 156.5 2.5e-38 CCDS31401.1 OR52E4 gene_id:390081|Hs108|chr11 ( 312) 1002 156.5 2.5e-38 CCDS31353.1 OR52M1 gene_id:119772|Hs108|chr11 ( 317) 989 154.6 9e-38 CCDS31363.1 OR51T1 gene_id:401665|Hs108|chr11 ( 354) 976 152.9 3.5e-37 CCDS31370.1 OR52J3 gene_id:119679|Hs108|chr11 ( 311) 959 150.3 1.7e-36 CCDS31384.1 OR52D1 gene_id:390066|Hs108|chr11 ( 318) 953 149.5 3.2e-36 CCDS31386.1 OR52H1 gene_id:390067|Hs108|chr11 ( 320) 953 149.5 3.2e-36 CCDS44528.1 OR52N4 gene_id:390072|Hs108|chr11 ( 321) 949 148.9 4.8e-36 CCDS31399.1 OR52N2 gene_id:390077|Hs108|chr11 ( 321) 941 147.8 1.1e-35 CCDS31400.1 OR52E8 gene_id:390079|Hs108|chr11 ( 317) 936 147.1 1.7e-35 CCDS31397.1 OR52N5 gene_id:390075|Hs108|chr11 ( 324) 935 146.9 1.9e-35 CCDS53598.1 OR52B2 gene_id:255725|Hs108|chr11 ( 323) 928 145.9 3.9e-35 CCDS31398.1 OR52N1 gene_id:79473|Hs108|chr11 ( 320) 924 145.4 5.7e-35 CCDS31371.1 OR52E2 gene_id:119678|Hs108|chr11 ( 325) 921 144.9 7.8e-35 CCDS44529.1 OR52L1 gene_id:338751|Hs108|chr11 ( 329) 917 144.4 1.2e-34 CCDS31373.1 OR52A5 gene_id:390054|Hs108|chr11 ( 316) 896 141.3 9.1e-34 CCDS7757.1 OR51B4 gene_id:79339|Hs108|chr11 ( 310) 887 140.0 2.2e-33 CCDS31374.1 OR52A1 gene_id:23538|Hs108|chr11 ( 312) 878 138.8 5.4e-33 CCDS31362.1 OR51S1 gene_id:119692|Hs108|chr11 ( 323) 874 138.2 8.2e-33 CCDS53597.1 OR52E6 gene_id:390078|Hs108|chr11 ( 313) 873 138.0 8.9e-33 CCDS41611.1 OR52B6 gene_id:340980|Hs108|chr11 ( 335) 831 132.1 6e-31 CCDS31355.1 OR52I2 gene_id:143502|Hs108|chr11 ( 350) 768 123.1 3.2e-28 CCDS31395.1 OR56B1 gene_id:387748|Hs108|chr11 ( 324) 739 118.9 5.4e-27 CCDS59223.1 OR52I1 gene_id:390037|Hs108|chr11 ( 324) 730 117.6 1.3e-26 CCDS31407.1 OR52W1 gene_id:120787|Hs108|chr11 ( 320) 727 117.2 1.7e-26 CCDS31405.1 OR56A1 gene_id:120796|Hs108|chr11 ( 318) 721 116.3 3.2e-26 CCDS73248.1 OR56A5 gene_id:390084|Hs108|chr11 ( 313) 717 115.7 4.7e-26 CCDS31404.1 OR56A4 gene_id:120793|Hs108|chr11 ( 365) 713 115.2 7.6e-26 CCDS31406.1 OR56B4 gene_id:196335|Hs108|chr11 ( 319) 689 111.7 7.6e-25 CCDS41614.1 OR56A3 gene_id:390083|Hs108|chr11 ( 315) 682 110.7 1.5e-24 CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 581 96.3 3.3e-20 CCDS30904.1 OR6K6 gene_id:128371|Hs108|chr1 ( 343) 556 92.7 4.2e-19 CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 ( 314) 546 91.3 1.1e-18 >>CCDS31367.1 OR51A4 gene_id:401666|Hs108|chr11 (313 aa) initn: 2005 init1: 2005 opt: 2005 Z-score: 1577.3 bits: 300.0 E(32554): 1.6e-81 Smith-Waterman score: 2005; 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CCDS31 MSQVTNTTQEGIYFILTDIPGFEASHIWISIPVCCLYTISIMGNTTILTVIRTEPSVHQR 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 MYYFLSMLAMSDLGLSLSSLPTVLSIFLFNAPEISSNACFAQEFFIHGFSVLESSVLLIM :: ::::::..::::.:..::::.... ::. .:::.::::: ::.:::: .:::::: : CCDS31 MYLFLSMLALTDLGLTLTTLPTVMQLLWFNVRRISSEACFAQFFFLHGFSFMESSVLLAM 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 SFDRFLAIHNPLRYTSILTTVRVAQIGIVFSFKSMLLVLPFPFTLRNLRYCKKNQLSHSY : : ..:: ::.:.::::. ... :... .: ::: : :. : .:... ::.:: CCDS31 SVDCYVAICCPLHYASILTNEVIGRTGLAIICCCVLAVLPSLFLLKRLPFCHSHLLSRSY 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 CLHQDVMKLACSDNRIDVIYGF-FGALCLMVDFILIAVSYTLILKTVLGIASKKEQLKAL :::::...:.:.: :.. ::: .. : ..:: .::..:::::::..:: :. :.:.:: CCDS31 CLHQDMIRLVCADIRLNSWYGFALALLIIIVDPLLIVISYTLILKNILGTATWAERLRAL 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 NTCVSHICAVIIFYLPIINLAVVHRFARHVSPLINVLMANVLLLVPPLMNPIVYCVKTKQ :.:.::: ::...:.:.......::::.:.:::..:.:::. ::.::.::::.: ::.:: CCDS31 NNCLSHILAVLVLYIPMVGVSMTHRFAKHASPLVHVIMANIYLLAPPVMNPIIYSVKNKQ 250 260 270 280 290 300 300 310 pF1KE5 IRVRVVAKLCQRKI :. CCDS31 IQWGMLNFLSLKNMHSR 310 >>CCDS31361.1 OR51F2 gene_id:119694|Hs108|chr11 (342 aa) initn: 1076 init1: 746 opt: 1091 Z-score: 870.1 bits: 169.3 E(32554): 3.8e-42 Smith-Waterman score: 1091; 50.3% identity (80.4% similar) in 312 aa overlap (1-311:13-324) 10 20 30 40 pF1KE5 MSIINTSYVEITTFFLVGMPGLEYAHIWISIPICSMYLIAILGNCTIL ::..:.. .: :.:.:.:::. .. :::::.: .:..:. :: :: CCDS31 MTETSLSSQCFPMSVLNNTIAEPLIFLLMGIPGLKATQYWISIPFCLLYVVAVSGNSMIL 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE5 FIIKTEPSLHEPMYYFLSMLAMSDLGLSLSSLPTVLSIFLFNAPEISSNACFAQEFFIHG :.. : :::.:::::::::. .::.::: .: :.:..: :.: ::. :::.:: ::.:: CCDS31 FVVLCERSLHKPMYYFLSMLSATDLSLSLCTLSTTLGVFWFEAREINLNACIAQMFFLHG 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE5 FSVLESSVLLIMSFDRFLAIHNPLRYTSILTTVRVAQIGIVFSFKSMLLVLPFPFTLRNL :. .::.::: :.::::.:: :::::.:::..:.:.::. . .... ..:: . .. : CCDS31 FTFMESGVLLAMAFDRFVAICYPLRYTTILTNARIAKIGMSMLIRNVAVMLPVMLFVKRL 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE5 RYCKKNQLSHSYCLHQDVMKLACSDNRIDVIYGFFGALCLM-VDFILIAVSYTLILKTVL .:.. :::::: : :...:.:.::::. : :.:. : : : .:: ::...:: CCDS31 SFCSSMVLSHSYCYHVDLIQLSCTDNRINSILGLFALLSTTGFDCPCILLSYILIIRSVL 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KE5 GIASKKEQLKALNTCVSHICAVIIFYLPIINLAVVHRFARHVSPLINVLMANVLLLVPPL .:::..:. ::.:::.::: :: :::::.:.:..:::... . :.....::::.::.::. 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CCDS31 LNPIIYSVKIKQIQKAIIKVLIQKHSKSNHQLFLIRDKAIYE 310 320 330 340 >>CCDS31375.1 OR51V1 gene_id:283111|Hs108|chr11 (321 aa) initn: 1014 init1: 637 opt: 1082 Z-score: 863.4 bits: 168.0 E(32554): 9e-42 Smith-Waterman score: 1082; 50.3% identity (82.4% similar) in 306 aa overlap (1-305:8-313) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MSIINTSYVEITTFFLVGMPGLEYAHIWISIPICSMYLIAILGNCTILFIIKT .. .. : ..:.:.:. :.: . :.:::. :.: ...:::: .: .: : CCDS31 MFLSSRMITSVSPSTSTNSSFLLTGFSGMEQQYPWLSIPFSSIYAMVLLGNCMVLHVIWT 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 EPSLHEPMYYFLSMLAMSDLGLSLSSLPTVLSIFLFNAPEISSNACFAQEFFIHGFSVLE :::::.::.:::::::..:: ..::.. :::.:. ::: ..:.:: .::::.: .: CCDS31 EPSLHQPMFYFLSMLALTDLCMGLSTVYTVLGILWGIIREISLDSCIAQSYFIHGLSFME 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 SSVLLIMSFDRFLAIHNPLRYTSILTTVRVAQIGIVFSFKSMLLVLPFPFTLRNLRYCKK ::::: :.:::..:: :::::.::::. :. .::... .:.... : . :. . ::. CCDS31 SSVLLTMAFDRYIAICNPLRYSSILTNSRIIKIGLTIIGRSFFFITPPIICLKFFNYCHF 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 NQLSHSYCLHQDVMKLACSDNRIDVIYGFFGALC-LMVDFILIAVSYTLILKTVLGIASK . ::::.:::::...::::: :.. :... ..: :..: ::: :: ::::.::..::. CCDS31 HILSHSFCLHQDLLRLACSDIRFNSYYALMLVICILLLDAILILFSYILILKSVLAVASQ 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 KEQLKALNTCVSHICAVIIFYLPIINLAVVHRFARHVSPLINVLMANVLLLVPPLMNPIV .:. : ..::.::::::..::.:::.:..::::..:.::. .::..:. .: :::::::. CCDS31 EERHKLFQTCISHICAVLVFYIPIISLTMVHRFGKHLSPVAHVLIGNIYILFPPLMNPII 250 260 270 280 290 300 300 310 pF1KE5 YCVKTKQIRVRVVAKLCQRKI : :::.::..:.. CCDS31 YSVKTQQIHTRMLRLFSLKRY 310 320 >>CCDS31358.2 OR51E1 gene_id:143503|Hs108|chr11 (318 aa) initn: 1055 init1: 969 opt: 1077 Z-score: 859.6 bits: 167.2 E(32554): 1.5e-41 Smith-Waterman score: 1077; 53.7% identity (82.4% similar) in 296 aa overlap (12-305:13-306) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MSIINTSYVEITTFFLVGMPGLEYAHIWISIPICSMYLIAILGNCTILFIIKTEPSLHE : :.:.:.:::: :..:...:.::.::::.::: ::..:..:: :::: CCDS31 MMVDPNGNESSATYFILIGLPGLEEAQFWLAFPLCSLYLIAVLGNLTIIYIVRTEHSLHE 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 PMYYFLSMLAMSDLGLSLSSLPTVLSIFLFNAPEISSNACFAQEFFIHGFSVLESSVLLI ::: :: ::. :. .: ::.: .:.:: ::. :. .::. : : ::..: .::.::: CCDS31 PMYIFLCMLSGIDILISTSSMPKMLAIFWFNSTTIQFDACLLQMFAIHSLSGMESTVLLA 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 MSFDRFLAIHNPLRYTSILTTVRVAQIGIVFSFKSMLLVLPFPFTLRNLRYCKKNQLSHS :.:::..:: .:::....:: ::..::.. .. :. :.: ...: .:..: :::: CCDS31 MAFDRYVAICHPLRHATVLTLPRVTKIGVAAVVRGAALMAPLPVFIKQLPFCRSNILSHS 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 YCLHQDVMKLACSDNRIDVIYGFFGALCLM-VDFILIAVSYTLILKTVLGIASKKEQLKA ::::::::::::.: :..:.::.. . . .: .::. :: ::::::::. ... : :: CCDS31 YCLHQDVMKLACDDIRVNVVYGLIVIISAIGLDSLLISFSYLLILKTVLGL-TREAQAKA 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 LNTCVSHICAVIIFYLPIINLAVVHRFA-RHVSPLINVLMANVLLLVPPLMNPIVYCVKT ..:::::.:::.:::.:.:.:..::::. :. ::: :..::. :::::..::::: ::: CCDS31 FGTCVSHVCAVFIFYVPFIGLSMVHRFSKRRDSPL-PVILANIYLLVPPVLNPIVYGVKT 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 KQIRVRVVAKLCQRKI :.:: :.. CCDS31 KEIRQRILRLFHVATHASEP 300 310 >>CCDS7751.1 OR51E2 gene_id:81285|Hs108|chr11 (320 aa) initn: 1075 init1: 728 opt: 1077 Z-score: 859.6 bits: 167.2 E(32554): 1.5e-41 Smith-Waterman score: 1077; 51.5% identity (83.7% similar) in 295 aa overlap (13-306:10-304) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MSIINTSYVEITTFFLVGMPGLEYAHIWISIPICSMYLIAILGNCTILFIIKTEPSLHEP :: :.:.:::: ::.:...:. :::..:..::: ..::..:: ::: : CCDS77 MSSCNFTHATFVLIGIPGLEKAHFWVGFPLLSMYVVAMFGNCIVVFIVRTERSLHAP 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 MYYFLSMLAMSDLGLSLSSLPTVLSIFLFNAPEISSNACFAQEFFIHGFSVLESSVLLIM :: :: ::: ::.:: :..: .:..: :.. ::: .::..: ::::..:..::..:: : CCDS77 MYLFLCMLAAIDLALSTSTMPKILALFWFDSREISFEACLTQMFFIHALSAIESTILLAM 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 SFDRFLAIHNPLRYTSILTTVRVAQIGIVFSFKSMLLVLPFPFTLRNLRYCKKNQLSHSY .:::..:: .:::....:... .:::::: .. :. .:.:. .. : .:..: ::::: CCDS77 AFDRYVAICHPLRHAAVLNNTVTAQIGIVAVVRGSLFFFPLPLLIKRLAFCHSNVLSHSY 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KE5 CLHQDVMKLACSDNRIDVIYGFFGALCLM-VDFILIAVSYTLILKTVLGIASKKEQLKAL :.:::::::: .:. .:.::. . : .: :: ..:..:: ::..::: . ::.:. ::. 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