Result of FASTA (ccds) for pFN21AE6050
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE6050, 318 aa
  1>>>pF1KE6050 318 - 318 aa - 318 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7243+/-0.00123; mu= 13.7495+/- 0.072
 mean_var=213.1091+/-76.585, 0's: 0 Z-trim(102.8): 440  B-trim: 387 in 1/48
 Lambda= 0.087856
 statistics sampled from 6538 (7102) to 6538 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.558), E-opt: 0.2 (0.218), width:  16
 Scan time:  1.730

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS31117.1 OR2T3 gene_id:343173|Hs108|chr1        ( 318) 2034 271.5   6e-73
CCDS31120.1 OR2T34 gene_id:127068|Hs108|chr1       ( 318) 2024 270.3 1.4e-72
CCDS55695.1 OR2T29 gene_id:343563|Hs108|chr1       ( 315) 1374 187.9   9e-48
CCDS31118.1 OR2T5 gene_id:401993|Hs108|chr1        ( 315) 1373 187.8 9.9e-48
CCDS31113.1 OR2T4 gene_id:127074|Hs108|chr1        ( 348) 1360 186.2 3.3e-47
CCDS31121.1 OR2T10 gene_id:127069|Hs108|chr1       ( 312) 1268 174.4   1e-43
CCDS31116.1 OR2T2 gene_id:401992|Hs108|chr1        ( 324) 1246 171.7   7e-43
CCDS31123.1 OR2T35 gene_id:403244|Hs108|chr1       ( 323) 1234 170.2   2e-42
CCDS31124.1 OR2T27 gene_id:403239|Hs108|chr1       ( 317) 1191 164.7 8.7e-41
CCDS31115.1 OR2T1 gene_id:26696|Hs108|chr1         ( 369) 1143 158.7 6.4e-39
CCDS31114.1 OR2T6 gene_id:254879|Hs108|chr1        ( 308) 1078 150.3 1.8e-36
CCDS31109.1 OR2T33 gene_id:391195|Hs108|chr1       ( 320) 1066 148.9 5.1e-36
CCDS31106.1 OR2M2 gene_id:391194|Hs108|chr1        ( 347) 1051 147.0   2e-35
CCDS31100.1 OR2T8 gene_id:343172|Hs108|chr1        ( 312) 1043 145.9 3.8e-35
CCDS31108.1 OR2M4 gene_id:26245|Hs108|chr1         ( 311) 1042 145.8 4.2e-35
CCDS4461.1 OR2V2 gene_id:285659|Hs108|chr5         ( 315) 1036 145.0 7.1e-35
CCDS31110.1 OR2T12 gene_id:127064|Hs108|chr1       ( 320) 1029 144.2 1.3e-34
CCDS31111.1 OR2M7 gene_id:391196|Hs108|chr1        ( 312) 1024 143.5   2e-34
CCDS58992.1 OR2V1 gene_id:26693|Hs108|chr5         ( 315) 1023 143.4 2.2e-34
CCDS31107.1 OR2M3 gene_id:127062|Hs108|chr1        ( 312) 1018 142.7 3.4e-34
CCDS31105.1 OR2M5 gene_id:127059|Hs108|chr1        ( 312) 1015 142.4 4.5e-34
CCDS31413.1 OR2AG2 gene_id:338755|Hs108|chr11      ( 316)  954 134.6 9.6e-32
CCDS34696.1 OR2AE1 gene_id:81392|Hs108|chr7        ( 323)  951 134.3 1.3e-31
CCDS31102.1 OR2AK2 gene_id:391191|Hs108|chr1       ( 335)  941 133.0 3.1e-31
CCDS31103.1 OR2L2 gene_id:26246|Hs108|chr1         ( 312)  937 132.5 4.2e-31
CCDS58068.1 OR2L5 gene_id:81466|Hs108|chr1         ( 312)  925 131.0 1.2e-30
CCDS31414.1 OR2AG1 gene_id:144125|Hs108|chr11      ( 316)  925 131.0 1.2e-30
CCDS31104.1 OR2L3 gene_id:391192|Hs108|chr1        ( 312)  919 130.2 2.1e-30
CCDS32895.1 OR2Z1 gene_id:284383|Hs108|chr19       ( 314)  905 128.4 7.1e-30
CCDS1637.1 OR2L13 gene_id:284521|Hs108|chr1        ( 312)  881 125.4 5.8e-29
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6       ( 312)  863 123.1 2.8e-28
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6          ( 321)  848 121.2 1.1e-27
CCDS34365.1 OR2H2 gene_id:7932|Hs108|chr6          ( 312)  845 120.8 1.4e-27
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1         ( 309)  825 118.3 7.9e-27
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6          ( 357)  822 118.0 1.1e-26
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11      ( 316)  819 117.5 1.4e-26
CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1       ( 335)  819 117.6 1.4e-26
CCDS4660.1 OR2H1 gene_id:26716|Hs108|chr6          ( 316)  813 116.8 2.3e-26
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11       ( 327)  810 116.4   3e-26
CCDS34323.1 OR2Y1 gene_id:134083|Hs108|chr5        ( 311)  809 116.3 3.2e-26
CCDS31547.1 OR10Q1 gene_id:219960|Hs108|chr11      ( 319)  809 116.3 3.3e-26
CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1        ( 316)  808 116.1 3.6e-26
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7       ( 310)  804 115.6   5e-26
CCDS35088.1 OR13C4 gene_id:138804|Hs108|chr9       ( 318)  803 115.5 5.6e-26
CCDS31814.1 OR9K2 gene_id:441639|Hs108|chr12       ( 335)  803 115.5 5.7e-26
CCDS31099.1 OR2W3 gene_id:343171|Hs108|chr1        ( 314)  800 115.1 7.2e-26
CCDS6844.1 OR1N1 gene_id:138883|Hs108|chr9         ( 311)  799 115.0 7.8e-26
CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6        ( 311)  797 114.7 9.3e-26
CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11       ( 317)  796 114.6   1e-25
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11      ( 309)  795 114.5 1.1e-25


>>CCDS31117.1 OR2T3 gene_id:343173|Hs108|chr1             (318 aa)
 initn: 2034 init1: 2034 opt: 2034  Z-score: 1423.2  bits: 271.5 E(32554): 6e-73
Smith-Waterman score: 2034; 98.1% identity (98.7% similar) in 318 aa overlap (1-318:1-318)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MCSGNQTSQNQTASTDFTLTGLFAESKHAALLYTVTFLLFLMALTGNALLILLIHSEPRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MCSGNQTSQNQTASTDFTLTGLFAESKHAALLYTVTFLLFLMALTGNALLILLIHSEPRL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE6 HTPMYFFISQLALMDLMYLCVTVPKMLVGQVTGDDTISPSGCGIQMFFYLTLAGAEVFLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 HTPMYFFISQLALMDLMYLCVTVPKMLVGQVTGDDTISPSGCGIQMFFYLTLAGAEVFLL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE6 AAMAYDRYAAVYRPLHYPLLMNQRVCQLLVSACWALGMVDGLLLTPITMSFPFCQSRKIL
       ::::::::::: ::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS31 AAMAYDRYAAVCRPLHYPLLMNQRVCQLLVSACWVLGMVDGLLLTPITMSFPFCQSRKIL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE6 SFFCETPALLKLSCSDVSLYKMLTYLCCILMLLTPIMVISSSYTLILHLIHRMNSAAGHR
       ::::::::::::::::::::: : :::::::::.::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SFFCETPALLKLSCSDVSLYKTLMYLCCILMLLAPIMVISSSYTLILHLIHRMNSAAGHR
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE6 KALATCSSHMIIVLLLFGASFYTYMLPSSYHTAEQDMMVSAFYTIFTPVLNPLIYSLCNK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::
CCDS31 KALATCSSHMIIVLLLFGASFYTYMLPSSYHTAEQDMMVSAFYTIFTPVLNPLIYSLRNK
              250       260       270       280       290       300

              310        
pF1KE6 DVTRALRSMMQSRMNQEK
       ::::::::::::::::::
CCDS31 DVTRALRSMMQSRMNQEK
              310        

>>CCDS31120.1 OR2T34 gene_id:127068|Hs108|chr1            (318 aa)
 initn: 2024 init1: 2024 opt: 2024  Z-score: 1416.3  bits: 270.3 E(32554): 1.4e-72
Smith-Waterman score: 2024; 98.1% identity (99.1% similar) in 318 aa overlap (1-318:1-318)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MCSGNQTSQNQTASTDFTLTGLFAESKHAALLYTVTFLLFLMALTGNALLILLIHSEPRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MCSGNQTSQNQTASTDFTLTGLFAESKHAALLYTVTFLLFLMALTGNALLILLIHSEPRL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE6 HTPMYFFISQLALMDLMYLCVTVPKMLVGQVTGDDTISPSGCGIQMFFYLTLAGAEVFLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS31 HTPMYFFISQLALMDLMYLCVTVPKMLVGQVTGDDTISPSGCGIQMFFHLTLAGAEVFLL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE6 AAMAYDRYAAVYRPLHYPLLMNQRVCQLLVSACWALGMVDGLLLTPITMSFPFCQSRKIL
       ::::::::::: ::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS31 AAMAYDRYAAVCRPLHYPLLMNQRVCQLLVSACWVLGMVDGLLLTPITMSFPFCQSRKIL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE6 SFFCETPALLKLSCSDVSLYKMLTYLCCILMLLTPIMVISSSYTLILHLIHRMNSAAGHR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS31 SFFCETPALLKLSCSDVSLYKMLTYLCCILMLLTPIMVISSSYTLILHLIHRMNSAAGRR
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE6 KALATCSSHMIIVLLLFGASFYTYMLPSSYHTAEQDMMVSAFYTIFTPVLNPLIYSLCNK
       :::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::: ::
CCDS31 KALATCSSHMIIVLLLFGASFYTYMLRSSYHTAEQDMMVSAFYTIFTPVLNPLIYSLRNK
              250       260       270       280       290       300

              310        
pF1KE6 DVTRALRSMMQSRMNQEK
       ::::::::::::::::::
CCDS31 DVTRALRSMMQSRMNQEK
              310        

>>CCDS55695.1 OR2T29 gene_id:343563|Hs108|chr1            (315 aa)
 initn: 1387 init1: 1363 opt: 1374  Z-score: 971.1  bits: 187.9 E(32554): 9e-48
Smith-Waterman score: 1374; 66.1% identity (84.9% similar) in 304 aa overlap (10-313:9-312)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MCSGNQTSQNQTASTDFTLTGLFAESKHAALLYTVTFLLFLMALTGNALLILLIHSEPRL
                :.:.  :: : ::: .::: ::: .: :..:: ::.:::.:::::: . .:
CCDS55  MANITRMANHTGRLDFILMGLFRQSKHPALLSVVIFVVFLKALSGNAVLILLIHCDAHL
                10        20        30        40        50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KE6 HTPMYFFISQLALMDLMYLCVTVPKMLVGQVTGDDTISPSGCGIQMFFYLTLAGAEVFLL
       :.:::::::::.:::. :. :::::::. :: : . .:   ::.:::.::::::.: :::
CCDS55 HSPMYFFISQLSLMDMAYISVTVPKMLLDQVMGVNKVSAPECGMQMFLYLTLAGSEFFLL
      60        70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KE6 AAMAYDRYAAVYRPLHYPLLMNQRVCQLLVSACWALGMVDGLLLTPITMSFPFCQSRKIL
       :.::::::.:. .::.::.:::.::: .:.:.:: :: :::..:::::::::::.: .: 
CCDS55 ATMAYDRYVAICHPLRYPVLMNHRVCLFLASGCWFLGSVDGFMLTPITMSFPFCRSWEIH
     120       130       140       150       160       170         

              190       200       210       220       230       240
pF1KE6 SFFCETPALLKLSCSDVSLYKMLTYLCCILMLLTPIMVISSSYTLILHLIHRMNSAAGHR
        ::::.::.  :::::.:::. : ::::.:::: :. .::::: :::  .:::::: :..
CCDS55 HFFCEVPAVTILSCSDTSLYETLMYLCCVLMLLIPVTIISSSYLLILLTVHRMNSAEGRK
     180       190       200       210       220       230         

              250       260       270       280       290       300
pF1KE6 KALATCSSHMIIVLLLFGASFYTYMLPSSYHTAEQDMMVSAFYTIFTPVLNPLIYSLCNK
       ::.::::::. .:.:..::. ::::::::::: :.:::::.::::.::::::::::: ::
CCDS55 KAFATCSSHLTVVILFYGAAVYTYMLPSSYHTPEKDMMVSVFYTILTPVLNPLIYSLRNK
     240       250       260       270       280       290         

              310        
pF1KE6 DVTRALRSMMQSRMNQEK
       ::  ::..:.  :     
CCDS55 DVMGALKKMLTVRFVL  
     300       310       

>>CCDS31118.1 OR2T5 gene_id:401993|Hs108|chr1             (315 aa)
 initn: 1385 init1: 1361 opt: 1373  Z-score: 970.4  bits: 187.8 E(32554): 9.9e-48
Smith-Waterman score: 1373; 66.1% identity (85.2% similar) in 304 aa overlap (10-313:9-312)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MCSGNQTSQNQTASTDFTLTGLFAESKHAALLYTVTFLLFLMALTGNALLILLIHSEPRL
                :.:.. :: : ::: .::: ::: .: :..:: ::.:::.:::::: . .:
CCDS31  MANITRMANHTGKLDFILMGLFRRSKHPALLSVVIFVVFLKALSGNAVLILLIHCDAHL
                10        20        30        40        50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KE6 HTPMYFFISQLALMDLMYLCVTVPKMLVGQVTGDDTISPSGCGIQMFFYLTLAGAEVFLL
       :.:::::::::.:::. :. :::::::. :: : . .:   ::.:::.::::::.: :::
CCDS31 HSPMYFFISQLSLMDMAYISVTVPKMLLDQVMGVNKVSAPECGMQMFLYLTLAGSEFFLL
      60        70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KE6 AAMAYDRYAAVYRPLHYPLLMNQRVCQLLVSACWALGMVDGLLLTPITMSFPFCQSRKIL
       :.::::::.:. .::.::.:::.::: .:.:.:: :: :::..:::::::::::.: .: 
CCDS31 ATMAYDRYVAICHPLRYPVLMNHRVCLFLASGCWFLGSVDGFMLTPITMSFPFCRSWEIH
     120       130       140       150       160       170         

              190       200       210       220       230       240
pF1KE6 SFFCETPALLKLSCSDVSLYKMLTYLCCILMLLTPIMVISSSYTLILHLIHRMNSAAGHR
        ::::.::.  :::::.:::. : ::::.:::: :. .::::: :::  .:::::: :..
CCDS31 HFFCEVPAVTILSCSDTSLYETLMYLCCVLMLLIPVTIISSSYLLILLTVHRMNSAEGRK
     180       190       200       210       220       230         

              250       260       270       280       290       300
pF1KE6 KALATCSSHMIIVLLLFGASFYTYMLPSSYHTAEQDMMVSAFYTIFTPVLNPLIYSLCNK
       ::.::::::. .:.:..::. ::::::::::: :.:::::.::::.::::::::::: ::
CCDS31 KAFATCSSHLTVVILFYGAAVYTYMLPSSYHTPEKDMMVSVFYTILTPVLNPLIYSLRNK
     240       250       260       270       280       290         

              310        
pF1KE6 DVTRALRSMMQSRMNQEK
       ::  ::..:.  :     
CCDS31 DVMGALKKMLTVRFVL  
     300       310       

>>CCDS31113.1 OR2T4 gene_id:127074|Hs108|chr1             (348 aa)
 initn: 1454 init1: 1349 opt: 1360  Z-score: 961.1  bits: 186.2 E(32554): 3.3e-47
Smith-Waterman score: 1360; 66.4% identity (86.4% similar) in 301 aa overlap (10-310:37-337)

                                    10        20        30         
pF1KE6                      MCSGNQTSQNQTASTDFTLTGLFAESKHAALLYTVTFLL
                                     :.:. .:: : ::: .::: ::: .: :..
CCDS31 MASHTGWSDFILMGLFRQSKHPMANITWMANHTGWSDFILLGLFRQSKHPALLCVVIFVV
         10        20        30        40        50        60      

      40        50        60        70        80        90         
pF1KE6 FLMALTGNALLILLIHSEPRLHTPMYFFISQLALMDLMYLCVTVPKMLVGQVTGDDTISP
       :::::.:::.:::::: . .::::::::::::.:::. :. :::::::. :: : . :: 
CCDS31 FLMALSGNAVLILLIHCDAHLHTPMYFFISQLSLMDMAYISVTVPKMLLDQVMGVNKISA
         70        80        90       100       110       120      

     100       110       120       130       140       150         
pF1KE6 SGCGIQMFFYLTLAGAEVFLLAAMAYDRYAAVYRPLHYPLLMNQRVCQLLVSACWALGMV
         ::.:::::.::::.: ::::.::::::.:. .::.::.:::.::: .: :.:: :: :
CCDS31 PECGMQMFFYVTLAGSEFFLLATMAYDRYVAICHPLRYPVLMNHRVCLFLSSGCWFLGSV
        130       140       150       160       170       180      

     160       170       180       190       200       210         
pF1KE6 DGLLLTPITMSFPFCQSRKILSFFCETPALLKLSCSDVSLYKMLTYLCCILMLLTPIMVI
       ::. .:::::.:::  ::.:  ::::.::.:.:::::.:::... ::::.:::: :...:
CCDS31 DGFTFTPITMTFPFRGSREIHHFFCEVPAVLNLSCSDTSLYEIFMYLCCVLMLLIPVVII
        190       200       210       220       230       240      

     220       230       240       250       260       270         
pF1KE6 SSSYTLILHLIHRMNSAAGHRKALATCSSHMIIVLLLFGASFYTYMLPSSYHTAEQDMMV
       :::: :::  :: :::: :..::.::::::. .:.:..::..::::::::::: :.::::
CCDS31 SSSYLLILLTIHGMNSAEGRKKAFATCSSHLTVVILFYGAAIYTYMLPSSYHTPEKDMMV
        250       260       270       280       290       300      

     280       290       300       310           
pF1KE6 SAFYTIFTPVLNPLIYSLCNKDVTRALRSMMQSRMNQEK   
       :.::::.:::.::::::: ::::  ::..:.           
CCDS31 SVFYTILTPVVNPLIYSLRNKDVMGALKKMLTVEPAFQKAME
        310       320       330       340        

>>CCDS31121.1 OR2T10 gene_id:127069|Hs108|chr1            (312 aa)
 initn: 1341 init1: 1268 opt: 1268  Z-score: 898.5  bits: 174.4 E(32554): 1e-43
Smith-Waterman score: 1268; 61.8% identity (83.7% similar) in 301 aa overlap (10-310:5-305)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MCSGNQTSQNQTASTDFTLTGLFAESKHAALLYTVTFLLFLMALTGNALLILLIHSEPRL
                ::: . :: : :.:.. .: . :  . : .::::.. :  :::::: .  :
CCDS31      MRLANQTLGGDFFLLGIFSQISHPGRLCLLIFSIFLMAVSWNITLILLIHIDSSL
                    10        20        30        40        50     

               70        80        90       100       110       120
pF1KE6 HTPMYFFISQLALMDLMYLCVTVPKMLVGQVTGDDTISPSGCGIQMFFYLTLAGAEVFLL
       ::::::::.::.:.:: :. ::::::::.:.. : :::  ::: ::.::: :.:::  ::
CCDS31 HTPMYFFINQLSLIDLTYISVTVPKMLVNQLAKDKTISVLGCGTQMYFYLQLGGAECCLL
          60        70        80        90       100       110     

              130       140       150       160       170       180
pF1KE6 AAMAYDRYAAVYRPLHYPLLMNQRVCQLLVSACWALGMVDGLLLTPITMSFPFCQSRKIL
       ::::::::.:. .::.: .::..::: ::.:.:: .: :::..::::.::::::.:..: 
CCDS31 AAMAYDRYVAICHPLRYSVLMSHRVCLLLASGCWFVGSVDGFMLTPIAMSFPFCRSHEIQ
         120       130       140       150       160       170     

              190       200       210       220       230       240
pF1KE6 SFFCETPALLKLSCSDVSLYKMLTYLCCILMLLTPIMVISSSYTLILHLIHRMNSAAGHR
        ::::.::.:::::::.::::.. ::::..::: :. ::: ::  :.  ::.:::. :..
CCDS31 HFFCEVPAVLKLSCSDTSLYKIFMYLCCVIMLLIPVTVISVSYYYIILTIHKMNSVEGRK
         180       190       200       210       220       230     

              250       260       270       280       290       300
pF1KE6 KALATCSSHMIIVLLLFGASFYTYMLPSSYHTAEQDMMVSAFYTIFTPVLNPLIYSLCNK
       ::..:::::. .: :..::..:.:::::::.: :.::: : ::::.::::::.:::. ::
CCDS31 KAFTTCSSHITVVSLFYGAAIYNYMLPSSYQTPEKDMMSSFFYTILTPVLNPIIYSFRNK
         240       250       260       270       280       290     

              310        
pF1KE6 DVTRALRSMMQSRMNQEK
       ::::::..:.        
CCDS31 DVTRALKKMLSVQKPPY 
         300       310   

>>CCDS31116.1 OR2T2 gene_id:401992|Hs108|chr1             (324 aa)
 initn: 1266 init1: 1246 opt: 1246  Z-score: 883.3  bits: 171.7 E(32554): 7e-43
Smith-Waterman score: 1246; 60.6% identity (84.5% similar) in 297 aa overlap (14-310:10-306)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MCSGNQTSQNQTASTDFTLTGLFAESKHAALLYTVTFLLFLMALTGNALLILLIHSEPRL
                    ::.:.::::...    .::....: .:..:.:.: ..::::: . ::
CCDS31     MGMEGLLQNSTNFVLTGLITHPAFPGLLFAIVFSIFVVAITANLVMILLIHMDSRL
                   10        20        30        40        50      

               70        80        90       100       110       120
pF1KE6 HTPMYFFISQLALMDLMYLCVTVPKMLVGQVTGDDTISPSGCGIQMFFYLTLAGAEVFLL
       ::::::..:::..:: .:.:.::::::   .. : :::  ::..:.:.:::: :.: :::
CCDS31 HTPMYFLLSQLSIMDTIYICITVPKMLQDLLSKDKTISFLGCAVQIFLYLTLIGGEFFLL
         60        70        80        90       100       110      

              130       140       150       160       170       180
pF1KE6 AAMAYDRYAAVYRPLHYPLLMNQRVCQLLVSACWALGMVDGLLLTPITMSFPFCQSRKIL
       . ::::::.::  ::.::::::.::: ..: . :. : .::..:::.:::::::.::.: 
CCDS31 GLMAYDRYVAVCNPLRYPLLMNRRVCLFMVVGSWVGGSLDGFMLTPVTMSFPFCRSREIN
        120       130       140       150       160       170      

              190       200       210       220       230       240
pF1KE6 SFFCETPALLKLSCSDVSLYKMLTYLCCILMLLTPIMVISSSYTLILHLIHRMNSAAGHR
        :::: ::.:::::.:.:::. : : ::.:::: :. ::: ::: ::  .:::::: :.:
CCDS31 HFFCEIPAVLKLSCTDTSLYETLMYACCVLMLLIPLSVISVSYTHILLTVHRMNSAEGRR
        180       190       200       210       220       230      

              250       260       270       280       290       300
pF1KE6 KALATCSSHMIIVLLLFGASFYTYMLPSSYHTAEQDMMVSAFYTIFTPVLNPLIYSLCNK
       ::.::::::...: ...::.::: .:: :::: :.: .:::::::.::.:::::::: ::
CCDS31 KAFATCSSHIMVVSVFYGAAFYTNVLPHSYHTPEKDKVVSAFYTILTPMLNPLIYSLRNK
        240       250       260       270       280       290      

              310                  
pF1KE6 DVTRALRSMMQSRMNQEK          
       ::. :::...                  
CCDS31 DVAAALRKVLGRCGSSQSIRVATVIRKG
        300       310       320    

>>CCDS31123.1 OR2T35 gene_id:403244|Hs108|chr1            (323 aa)
 initn: 1271 init1: 913 opt: 1234  Z-score: 875.1  bits: 170.2 E(32554): 2e-42
Smith-Waterman score: 1234; 60.9% identity (84.2% similar) in 297 aa overlap (14-310:10-305)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MCSGNQTSQNQTASTDFTLTGLFAESKHAALLYTVTFLLFLMALTGNALLILLIHSEPRL
                    ::.:.::::...    .::..:.: .:..:.:.: ..::::: . ::
CCDS31     MGMEGLLQNSTNFVLTGLITHPAFPGLLFAVVFSIFVVAITANLVMILLIHMDSRL
                   10        20        30        40        50      

               70        80        90       100       110       120
pF1KE6 HTPMYFFISQLALMDLMYLCVTVPKMLVGQVTGDDTISPSGCGIQMFFYLTLAGAEVFLL
       ::::::..:::..:: .:.:.::::::   .. : :::  ::..:.: :::: :.: :::
CCDS31 HTPMYFLLSQLSIMDTIYICITVPKMLQDLLSKDKTISFLGCAVQIF-YLTLIGGEFFLL
         60        70        80        90       100        110     

              130       140       150       160       170       180
pF1KE6 AAMAYDRYAAVYRPLHYPLLMNQRVCQLLVSACWALGMVDGLLLTPITMSFPFCQSRKIL
       . ::::::.::  ::.::::::.::: ..: . :. : .::..:::.:::::::.::.: 
CCDS31 GLMAYDRYVAVCNPLRYPLLMNRRVCLFMVVGSWVGGSLDGFMLTPVTMSFPFCRSREIN
         120       130       140       150       160       170     

              190       200       210       220       230       240
pF1KE6 SFFCETPALLKLSCSDVSLYKMLTYLCCILMLLTPIMVISSSYTLILHLIHRMNSAAGHR
        :::: ::.:::::.:.:::. : : ::.:::: :. ::: ::: ::  .:::::: :.:
CCDS31 HFFCEIPAVLKLSCTDTSLYETLMYACCVLMLLIPLSVISVSYTHILLTVHRMNSAEGRR
         180       190       200       210       220       230     

              250       260       270       280       290       300
pF1KE6 KALATCSSHMIIVLLLFGASFYTYMLPSSYHTAEQDMMVSAFYTIFTPVLNPLIYSLCNK
       ::.::::::...: ...::.::: .:: :::: :.: .:::::::.::.:::::::: ::
CCDS31 KAFATCSSHIMVVSVFYGAAFYTNVLPHSYHTPEKDKVVSAFYTILTPMLNPLIYSLRNK
         240       250       260       270       280       290     

              310                  
pF1KE6 DVTRALRSMMQSRMNQEK          
       ::. :::...                  
CCDS31 DVAAALRKVLGRCGSSQSIRVATVIRKG
         300       310       320   

>>CCDS31124.1 OR2T27 gene_id:403239|Hs108|chr1            (317 aa)
 initn: 1205 init1: 1185 opt: 1191  Z-score: 845.7  bits: 164.7 E(32554): 8.7e-41
Smith-Waterman score: 1191; 57.8% identity (82.4% similar) in 301 aa overlap (10-310:5-305)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MCSGNQTSQNQTASTDFTLTGLFAESKHAALLYTVTFLLFLMALTGNALLILLIHSEPRL
                : .. .:: : :::....   ::... .:.:: ....:.. :.::: . ::
CCDS31      MEQSNYSVYADFILLGLFSNARFPWLLFALILLVFLTSIASNVVKIILIHIDSRL
                    10        20        30        40        50     

               70        80        90       100       110       120
pF1KE6 HTPMYFFISQLALMDLMYLCVTVPKMLVGQVTGDDTISPSGCGIQMFFYLTLAGAEVFLL
       ::::::..:::.: :..:. . :::::: :: .. .:: .::  : :.:::::::: :::
CCDS31 HTPMYFLLSQLSLRDILYISTIVPKMLVDQVMSQRAISFAGCTAQHFLYLTLAGAEFFLL
          60        70        80        90       100       110     

              130       140       150       160       170       180
pF1KE6 AAMAYDRYAAVYRPLHYPLLMNQRVCQLLVSACWALGMVDGLLLTPITMSFPFCQSRKIL
       . :.::::.:.  :::::.::....: :.:.: :  : .::.::::.::.:::: ::.: 
CCDS31 GLMSYDRYVAICNPLHYPVLMSRKICWLIVAAAWLGGSIDGFLLTPVTMQFPFCASREIN
         120       130       140       150       160       170     

              190       200       210       220       230       240
pF1KE6 SFFCETPALLKLSCSDVSLYKMLTYLCCILMLLTPIMVISSSYTLILHLIHRMNSAAGHR
        ::::.::::::::.:.: :.   :.:::.::: :. :::.::: ::  ..::. : :. 
CCDS31 HFFCEVPALLKLSCTDTSAYETAMYVCCIMMLLIPFSVISGSYTRILITVYRMSEAEGRG
         180       190       200       210       220       230     

              250       260       270       280       290       300
pF1KE6 KALATCSSHMIIVLLLFGASFYTYMLPSSYHTAEQDMMVSAFYTIFTPVLNPLIYSLCNK
       ::.:::::::..: :..::..:::.:: :::: :::  :::::::.::.:::::::: ::
CCDS31 KAVATCSSHMVVVSLFYGAAMYTYVLPHSYHTPEQDKAVSAFYTILTPMLNPLIYSLRNK
         240       250       260       270       280       290     

              310            
pF1KE6 DVTRALRSMMQSRMNQEK    
       ::: ::....            
CCDS31 DVTGALQKVVGRCVSSGKVTTF
         300       310       

>>CCDS31115.1 OR2T1 gene_id:26696|Hs108|chr1              (369 aa)
 initn: 1157 init1: 1136 opt: 1143  Z-score: 812.2  bits: 158.7 E(32554): 6.4e-39
Smith-Waterman score: 1143; 54.1% identity (82.1% similar) in 307 aa overlap (4-310:50-355)

                                          10        20        30   
pF1KE6                            MCSGNQTSQNQTASTDFTLTGLFAESKHAALLY
                                     :..   : :.:::::. ::: ... ..:..
CCDS31 LTINSHVVILLPWECYHLIWKILPYIGTTVGSMEEYN-TSSTDFTFMGLFNRKETSGLIF
      20        30        40        50         60        70        

            40        50        60        70        80        90   
pF1KE6 TVTFLLFLMALTGNALLILLIHSEPRLHTPMYFFISQLALMDLMYLCVTVPKMLVGQVTG
       ..  ..:. :: .:...:.::... ::::::::..:.:.:.:.::. . ::::::. .  
CCDS31 AIISIIFFTALMANGVMIFLIQTDLRLHTPMYFLLSHLSLIDMMYISTIVPKMLVNYLLD
       80        90       100       110       120       130        

           100       110       120       130       140       150   
pF1KE6 DDTISPSGCGIQMFFYLTLAGAEVFLLAAMAYDRYAAVYRPLHYPLLMNQRVCQLLVSAC
       . :::  ::  : :.::::.::: :::. ::::::.:.  ::.::.::..::: ..... 
CCDS31 QRTISFVGCTAQHFLYLTLVGAEFFLLGLMAYDRYVAICNPLRYPVLMSRRVCWMIIAGS
      140       150       160       170       180       190        

           160       170       180       190       200       210   
pF1KE6 WALGMVDGLLLTPITMSFPFCQSRKILSFFCETPALLKLSCSDVSLYKMLTYLCCILMLL
       :  : .::.::::::::::::.::.:  ::::.::.:::.:.:..::. . :.::.::::
CCDS31 WFGGSLDGFLLTPITMSFPFCNSREINHFFCEAPAVLKLACADTALYETVMYVCCVLMLL
      200       210       220       230       240       250        

           220       230       240       250       260       270   
pF1KE6 TPIMVISSSYTLILHLIHRMNSAAGHRKALATCSSHMIIVLLLFGASFYTYMLPSSYHTA
        :. :. .::. ::  .. :.:. :..::.::::::: .: :..::..:::::: :::  
CCDS31 IPFSVVLASYARILTTVQCMSSVEGRKKAFATCSSHMTVVSLFYGAAMYTYMLPHSYHKP
      260       270       280       290       300       310        

           280       290       300       310              
pF1KE6 EQDMMVSAFYTIFTPVLNPLIYSLCNKDVTRALRSMMQSRMNQEK      
        :: ..:.::::.::.:::::::: ::::: ::.  .              
CCDS31 AQDKVLSVFYTILTPMLNPLIYSLRNKDVTGALKRALGRFKGPQRVSGGVF
      320       330       340       350       360         




318 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Tue Nov  8 09:03:27 2016 done: Tue Nov  8 09:03:27 2016
 Total Scan time:  1.730 Total Display time:  0.010

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com