FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6084, 324 aa 1>>>pF1KE6084 324 - 324 aa - 324 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9891+/-0.000516; mu= 17.4492+/- 0.032 mean_var=104.9519+/-29.069, 0's: 0 Z-trim(108.4): 345 B-trim: 1941 in 2/45 Lambda= 0.125193 statistics sampled from 15942 (16453) to 15942 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.541), E-opt: 0.2 (0.193), width: 16 Scan time: 6.400 The best scores are: opt bits E(85289) NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 928 179.1 1e-44 NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 903 174.6 2.4e-43 XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 897 173.5 5.1e-43 NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 897 173.5 5.1e-43 XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 897 173.5 5.1e-43 NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 894 173.0 7.4e-43 XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 887 171.7 1.7e-42 NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 875 169.5 7.9e-42 NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 871 168.8 1.3e-41 XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 867 168.1 2.2e-41 NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 867 168.1 2.2e-41 XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 867 168.1 2.2e-41 NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 854 165.7 1.1e-40 NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 852 165.4 1.4e-40 NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 844 163.9 3.8e-40 NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 825 160.5 4.1e-39 NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 810 157.8 2.7e-38 NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 803 156.5 6.5e-38 NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 784 153.1 7.2e-37 NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 704 138.7 1.6e-32 NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 510 103.6 5.6e-22 NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 500 101.8 2e-21 NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 216 50.6 5.6e-06 XP_016882097 (OMIM: 600551) PREDICTED: G-protein c ( 362) 207 49.0 1.8e-05 XP_016882096 (OMIM: 600551) PREDICTED: G-protein c ( 362) 207 49.0 1.8e-05 NP_005273 (OMIM: 600551) G-protein coupled recepto ( 362) 207 49.0 1.8e-05 NP_001718 (OMIM: 300107) bombesin receptor subtype ( 399) 207 49.0 1.9e-05 NP_005949 (OMIM: 600665) melatonin receptor type 1 ( 350) 206 48.8 2e-05 NP_000903 (OMIM: 165196) kappa-type opioid recepto ( 380) 206 48.8 2.1e-05 NP_001305426 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 409) 206 48.9 2.2e-05 NP_003599 (OMIM: 604620) psychosine receptor [Homo ( 337) 203 48.2 2.9e-05 XP_005246154 (OMIM: 610376) PREDICTED: atypical ch ( 362) 199 47.5 4.9e-05 XP_016860005 (OMIM: 610376) PREDICTED: atypical ch ( 362) 199 47.5 4.9e-05 NP_064707 (OMIM: 610376) atypical chemokine recept ( 362) 199 47.5 4.9e-05 XP_005246155 (OMIM: 610376) PREDICTED: atypical ch ( 362) 199 47.5 4.9e-05 XP_011535972 (OMIM: 605108) PREDICTED: neuromedin- ( 321) 198 47.3 5.2e-05 NP_064552 (OMIM: 605108) neuromedin-U receptor 2 [ ( 415) 198 47.4 6.1e-05 NP_848566 (OMIM: 300513) glucose-dependent insulin ( 335) 191 46.0 0.00013 NP_000907 (OMIM: 167055) oxytocin receptor [Homo s ( 389) 190 45.9 0.00016 XP_011532064 (OMIM: 167055) PREDICTED: oxytocin re ( 389) 190 45.9 0.00016 NP_003958 (OMIM: 607405) trace amine-associated re ( 337) 189 45.7 0.00016 NP_778227 (OMIM: 608282) trace amine-associated re ( 348) 183 44.6 0.00036 NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 182 44.4 0.00039 NP_001699 (OMIM: 190900,613522) short-wave-sensiti ( 348) 181 44.3 0.00046 NP_001278840 (OMIM: 202200,607397) adrenocorticotr ( 297) 180 44.0 0.00047 NP_000520 (OMIM: 202200,607397) adrenocorticotropi ( 297) 180 44.0 0.00047 XP_016881270 (OMIM: 202200,607397) PREDICTED: adre ( 297) 180 44.0 0.00047 NP_055441 (OMIM: 604849) trace amine-associated re ( 306) 180 44.0 0.00048 NP_001028252 (OMIM: 604849) trace amine-associated ( 351) 180 44.1 0.00052 NP_002502 (OMIM: 162341) neuromedin-B receptor iso ( 390) 180 44.1 0.00056 >>NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [Homo (312 aa) initn: 919 init1: 899 opt: 928 Z-score: 923.7 bits: 179.1 E(85289): 1e-44 Smith-Waterman score: 928; 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NP_036 TCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKG 240 250 260 270 280 290 310 320 pF1KE6 ALRKVLGRCGSSQSIRVATVIRKG : .:.: . :. . ..:: NP_036 AWQKLLWKF-SGLTSKLAT 300 310 >>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa) initn: 931 init1: 884 opt: 897 Z-score: 893.3 bits: 173.5 E(85289): 5.1e-43 Smith-Waterman score: 897; 43.0% identity (77.3% similar) in 309 aa overlap (11-319:10-317) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MGMEGLLQNSTNFVLTGLITHPAFPGLLFAIVFSIFVVAITANLVMILLIHMDSRLHTPM ..:.: :: . ::.. . ..::.. .: ...:::..:::::::: XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPM 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 YFLLSQLSIMDTIYICITVPKMLQDLLSKDKTISFLGCAVQIFLYLTLIGGEFFLLGLMA ::.:..::..:. : .::..: .:.. :.: : .::.:.:. :.: : :: ::..:: XP_011 YFFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMA 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 YDRYVAVCNPLRYPLLMNRRVCLFMVVGSWVGGSLDGFMLTPVTMSFPFCRSREINHFFC ::::::::. ::: .:. .: ... :::.: ... . : .:...:.::.. :.:. : XP_011 YDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISC 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 EIPAVLKLSCTDTSLYETLMYACCVLMLLIPLSVISVSYTHILLTVHRMNSAEGRRKAFA :. ::..:.:.::: :. ... ...:. :. .. .:: .:. :. ...: :::.::: XP_011 ELLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFH 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 TCSSHIMVVSVFYGAAFYTNVLPHSYHTPEKDKVVSAFYTILTPMLNPLIYSLRNKDVAA ::.::. ::.. ::.:..: . ::: . ..:. :.::.::::::::.:::::::.: . XP_011 TCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKG 240 250 260 270 280 290 310 320 pF1KE6 ALRKVLGRCGSSQSIRVATVIRKG : .:.: . :. . ..:: XP_011 AWQKLLWKF-SGLTSKLAT 300 310 >>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa) initn: 857 init1: 857 opt: 894 Z-score: 890.5 bits: 173.0 E(85289): 7.4e-43 Smith-Waterman score: 894; 43.2% identity (76.0% similar) in 296 aa overlap (11-306:12-307) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MGMEGLLQNSTNFVLTGLITHPAFPGLLFAIVFSIFVVAITANLVMILLIHMDSRLHTP :.:.: :. :.: . .:: . ...... . .:. ..:::..: .:.:: NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 MYFLLSQLSIMDTIYICITVPKMLQDLLSKDKTISFLGCAVQIFLYLTLIGGEFFLLGLM :::.::.::..: :. ::::: ..::..:.::. :::.:.... :. : :.:. : NP_006 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 AYDRYVAVCNPLRYPLLMNRRVCLFMVVGSWVGGSLDGFMLTPVTMSFPFCRSREINHFF :::::::.:::: : ..:.: .:. ..: :..::...... : .. . .: . ::::: NP_006 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 CEIPAVLKLSCTDTSLYETLMYACCVLMLLIPLSVISVSYTHILLTVHRMNSAEGRRKAF :..: .::::::::.. : :. . . .: . .: .:: :::.: .. : ::.:.: NP_006 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 ATCSSHIMVVSVFYGAAFYTNVLPHSYHTPEKDKVVSAFYTILTPMLNPLIYSLRNKDVA .::.::. :... :. .. : ..:. ::..:.::::. :.::::::::::::: NP_006 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVK 250 260 270 280 290 300 300 310 320 pF1KE6 AALRKVLGRCGSSQSIRVATVIRKG : .::: NP_006 DAAEKVLRSKVDSS 310 >>XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory recep (300 aa) initn: 883 init1: 863 opt: 887 Z-score: 883.8 bits: 171.7 E(85289): 1.7e-42 Smith-Waterman score: 887; 45.0% identity (75.9% similar) in 291 aa overlap (8-297:4-294) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MGMEGLLQNST-NFVLTGLITHPAFPGLLFAIVFSIFVVAITANLVMILLIHMDSRLHTP :.:: .:.: :. ::.. ::..:.. .......: ..::: .: .::.: XP_011 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 MYFLLSQLSIMDTIYICITVPKMLQDLLSKDKTISFLGCAVQIFLYLTLIGGEFFLLGLM :::.::.::..: . ::.:: .: . :::::: :.::::..:.: : .:: .: XP_011 MYFFLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVM 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 AYDRYVAVCNPLRYPLLMNRRVCLFMVVGSWVGGSLDGFMLTPVTMSFPFCRSREINHFF :.:::::::.::.: ... :.: .. .:: : ... . :: :. .::: .:... : XP_011 AFDRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFV 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 CEIPAVLKLSCTDTSLYETLMYACCVLMLLIPLSVISVSYTHILLTVHRMNSAEGRRKAF ::.::...::: ::: : . . :..:..:::.: ::: : .: :.:::.:::::: XP_011 CEVPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAF 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 ATCSSHIMVVSVFYGAAFYTNVLPHSYHTPEKDKVVSAFYTILTPMLNPLIYSLRNKDVA .:::::. ::..::.... . . :.. .. :. : . ::.. :: ::::::.::::. XP_011 GTCSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEQK 240 250 260 270 280 290 300 310 320 pF1KE6 AALRKVLGRCGSSQSIRVATVIRKG XP_011 RRGS 300 >>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa) initn: 912 init1: 869 opt: 875 Z-score: 871.9 bits: 169.5 E(85289): 7.9e-42 Smith-Waterman score: 875; 45.4% identity (75.2% similar) in 302 aa overlap (11-312:10-311) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MGMEGLLQNSTNFVLTGLITHPAFPGLLFAIVFSIFVVAITANLVMILLIHMDSRLHTPM :.::: :: . .:: . . :..... .:: :::::..::.::::: NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPM 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 YFLLSQLSIMDTIYICITVPKMLQDLLSKDKTISFLGCAVQIFLYLTLIGGEFFLLGLMA ::.:..::..:. .:::: ::::. ::::: :: .:......: : .:.:::: NP_003 YFFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMA 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 YDRYVAVCNPLRYPLLMNRRVCLFMVVGSWVGGSLDGFMLTPVTMSFPFCRSREINHFFC ::::.:.: :: : :.:.: : : :..:....: :. .. : . :. :: : :.:::: NP_003 YDRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFC 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 EIPAVLKLSCTDTSLYETLMYACCVLMLLIPLSVISVSYTHILLTVHRMNSAEGRRKAFA . : ..::::.:: : :.. . .. : :: ::...:... :.:.:::..::. NP_003 DSPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFS 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 TCSSHIMVVSVFYGAAFYTNVLPHSYHTPEKDKVVSAFYTILTPMLNPLIYSLRNKDVAA ::.::. .. .::.. .:: . : : .. ..:::.:.:::.. :::::::::::.:.: NP_003 TCASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKK 240 250 260 270 280 290 310 320 pF1KE6 ALRKVLGRCGSSQSIRVATVIRKG :: .:..: .: NP_003 ALANVISRKRTSSFL 300 310 >>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa) initn: 905 init1: 859 opt: 871 Z-score: 868.0 bits: 168.8 E(85289): 1.3e-41 Smith-Waterman score: 871; 43.5% identity (74.9% similar) in 299 aa overlap (11-308:10-308) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MGMEGLLQNSTNFVLTGLITHPA-FPGLLFAIVFSIFVVAITANLVMILLIHMDSRLHTP ..:.: .. . :. . .::: ..:..:.. .: ..::. : ::.: NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 MYFLLSQLSIMDTIYICITVPKMLQDLLSKDKTISFLGCAVQIFLYLTLIGGEFFLLGLM :::.: .::... . . ::::: ::..: ::::::::.:..... . .: :::. : NP_835 MYFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATM 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 AYDRYVAVCNPLRYPLLMNRRVCLFMVVGSWVGGSLDGFMLTPVTMSFPFCRSREINHFF :::::::.:.::.::..::.:. ....:: : . . : .::::: . ..:::: NP_835 AYDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFF 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 CEIPAVLKLSCTDTSLYETLMYACCVLMLLIPLSVISVSYTHILLTVHRMNSAEGRRKAF :. : :::: :.::.:.: . .:...:: .: :::.: .. .. ::.:..::: NP_835 CDSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAF 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 ATCSSHIMVVSVFYGAAFYTNVLPHSYHTPEKDKVVSAFYTILTPMLNPLIYSLRNKDVA .:::::..:::.:: .. : :.: ..::. :..: ::..::::::.::::::..: NP_835 STCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVK 240 250 260 270 280 290 300 310 320 pF1KE6 AALRKVLGRCGSSQSIRVATVIRKG :: ... . NP_835 NALSRTFHKVLALRNCIP 300 310 >>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa) initn: 857 init1: 857 opt: 867 Z-score: 864.1 bits: 168.1 E(85289): 2.2e-41 Smith-Waterman score: 867; 42.7% identity (74.6% similar) in 307 aa overlap (3-308:1-307) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MGMEGLLQNS-TNFVLTGLITHPAFPGLLFAIVFSIFVVAITANLVMILLIHMDSRLHTP : : :.: ..:.: :: .: :::.. .:...... .::..:: . .:: :::: XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 MYFLLSQLSIMDTIYICITVPKMLQDLLSKDKTISFLGCAVQIFLYLTLIGGEFFLLGLM :::.::.::..: . :::::: . . . .:::: :: .:... . .. . :::..: XP_011 MYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVM 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 AYDRYVAVCNPLRYPLLMNRRVCLFMVVGSWVGGSLDGFMLTPVTMSFPFCRSREINHFF :::..::::.::.: :....: ..:.: :: ..:. .. : . . :: . :.::: XP_011 AYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFF 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 CEIPAVLKLSCTDTSLYETLMYACCVLMLLIPLSVISVSYTHILLTVHRMNSAEGRRKAF :.. .:::::.:: : :... . .:... :. : .:: :: :: .. :..:: ::: XP_011 CDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAF 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 ATCSSHIMVVSVFYGAAFYTNVLPHSYHTPEKDKVVSAFYTILTPMLNPLIYSLRNKDVA .::.::. :: .::.. . . : : :. ::: .....::..::::::.::::::. . XP_011 STCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLK 240 250 260 270 280 290 300 310 320 pF1KE6 AALRKVLGRCGSSQSIRVATVIRKG .::.::.:: XP_011 GALKKVVGRVVFSV 300 310 324 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 09:21:35 2016 done: Tue Nov 8 09:21:36 2016 Total Scan time: 6.400 Total Display time: 0.030 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]