Result of FASTA (ccds) for pFN21AE5390
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE5390, 308 aa
  1>>>pF1KE5390 308 - 308 aa - 308 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9186+/-0.0013; mu= 12.2716+/- 0.076
 mean_var=183.9983+/-63.453, 0's: 0 Z-trim(101.8): 392  B-trim: 412 in 1/49
 Lambda= 0.094551
 statistics sampled from 6185 (6668) to 6185 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.539), E-opt: 0.2 (0.205), width:  16
 Scan time:  1.870

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS31114.1 OR2T6 gene_id:254879|Hs108|chr1        ( 308) 2081 297.2   1e-80
CCDS31115.1 OR2T1 gene_id:26696|Hs108|chr1         ( 369) 1533 222.6 3.7e-58
CCDS31124.1 OR2T27 gene_id:403239|Hs108|chr1       ( 317) 1415 206.4 2.4e-53
CCDS31116.1 OR2T2 gene_id:401992|Hs108|chr1        ( 324) 1369 200.1 1.8e-51
CCDS31123.1 OR2T35 gene_id:403244|Hs108|chr1       ( 323) 1353 197.9 8.4e-51
CCDS55695.1 OR2T29 gene_id:343563|Hs108|chr1       ( 315) 1249 183.7 1.5e-46
CCDS31118.1 OR2T5 gene_id:401993|Hs108|chr1        ( 315) 1248 183.6 1.7e-46
CCDS31113.1 OR2T4 gene_id:127074|Hs108|chr1        ( 348) 1219 179.7 2.8e-45
CCDS31121.1 OR2T10 gene_id:127069|Hs108|chr1       ( 312) 1168 172.7 3.2e-43
CCDS4461.1 OR2V2 gene_id:285659|Hs108|chr5         ( 315) 1146 169.7 2.6e-42
CCDS31100.1 OR2T8 gene_id:343172|Hs108|chr1        ( 312) 1122 166.4 2.5e-41
CCDS31117.1 OR2T3 gene_id:343173|Hs108|chr1        ( 318) 1121 166.3 2.8e-41
CCDS31109.1 OR2T33 gene_id:391195|Hs108|chr1       ( 320) 1117 165.7 4.1e-41
CCDS31110.1 OR2T12 gene_id:127064|Hs108|chr1       ( 320) 1102 163.7 1.7e-40
CCDS31120.1 OR2T34 gene_id:127068|Hs108|chr1       ( 318) 1095 162.7 3.3e-40
CCDS58992.1 OR2V1 gene_id:26693|Hs108|chr5         ( 315) 1091 162.2 4.7e-40
CCDS31106.1 OR2M2 gene_id:391194|Hs108|chr1        ( 347) 1077 160.3 1.9e-39
CCDS31105.1 OR2M5 gene_id:127059|Hs108|chr1        ( 312) 1073 159.7 2.6e-39
CCDS31103.1 OR2L2 gene_id:26246|Hs108|chr1         ( 312) 1065 158.6 5.5e-39
CCDS31107.1 OR2M3 gene_id:127062|Hs108|chr1        ( 312) 1063 158.4 6.7e-39
CCDS31111.1 OR2M7 gene_id:391196|Hs108|chr1        ( 312) 1057 157.5 1.2e-38
CCDS31104.1 OR2L3 gene_id:391192|Hs108|chr1        ( 312) 1049 156.5 2.5e-38
CCDS31108.1 OR2M4 gene_id:26245|Hs108|chr1         ( 311) 1045 155.9 3.6e-38
CCDS58068.1 OR2L5 gene_id:81466|Hs108|chr1         ( 312) 1045 155.9 3.6e-38
CCDS31413.1 OR2AG2 gene_id:338755|Hs108|chr11      ( 316) 1041 155.4 5.4e-38
CCDS31102.1 OR2AK2 gene_id:391191|Hs108|chr1       ( 335) 1035 154.6 9.8e-38
CCDS31414.1 OR2AG1 gene_id:144125|Hs108|chr11      ( 316) 1003 150.2 1.9e-36
CCDS34696.1 OR2AE1 gene_id:81392|Hs108|chr7        ( 323)  991 148.6 6.1e-36
CCDS32895.1 OR2Z1 gene_id:284383|Hs108|chr19       ( 314)  981 147.2 1.6e-35
CCDS1637.1 OR2L13 gene_id:284521|Hs108|chr1        ( 312)  976 146.5 2.5e-35
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7        ( 310)  944 142.1 5.1e-34
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7       ( 310)  944 142.1 5.1e-34
CCDS43672.1 OR2A14 gene_id:135941|Hs108|chr7       ( 310)  940 141.6 7.4e-34
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7        ( 311)  932 140.5 1.6e-33
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7       ( 310)  909 137.4 1.4e-32
CCDS43671.1 OR2A2 gene_id:442361|Hs108|chr7        ( 318)  901 136.3   3e-32
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11      ( 316)  896 135.6 4.8e-32
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6          ( 321)  888 134.5   1e-31
CCDS35089.1 OR13C3 gene_id:138803|Hs108|chr9       ( 347)  883 133.9 1.7e-31
CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1        ( 325)  882 133.7 1.8e-31
CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11       ( 308)  880 133.4 2.2e-31
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12      ( 316)  879 133.3 2.4e-31
CCDS35092.1 OR13C2 gene_id:392376|Hs108|chr9       ( 318)  879 133.3 2.4e-31
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11       ( 330)  879 133.3 2.5e-31
CCDS35093.1 OR13C9 gene_id:286362|Hs108|chr9       ( 318)  878 133.1 2.7e-31
CCDS34365.1 OR2H2 gene_id:7932|Hs108|chr6          ( 312)  877 133.0 2.9e-31
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11       ( 324)  877 133.0 2.9e-31
CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1       ( 335)  874 132.6   4e-31
CCDS31514.1 OR10AG1 gene_id:282770|Hs108|chr11     ( 301)  870 132.0 5.5e-31
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6       ( 312)  869 131.9 6.2e-31


>>CCDS31114.1 OR2T6 gene_id:254879|Hs108|chr1             (308 aa)
 initn: 2081 init1: 2081 opt: 2081  Z-score: 1562.5  bits: 297.2 E(32554): 1e-80
Smith-Waterman score: 2081; 100.0% identity (100.0% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-308)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MNENNETLTRGFTLMGLFTHNKCSGFFFGVICAVFFMAMIANGVMIFLINIDPHLHTPMY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MNENNETLTRGFTLMGLFTHNKCSGFFFGVICAVFFMAMIANGVMIFLINIDPHLHTPMY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 FLLSHLSVIDTLYISTIVPKMLVDYLMGEGTISFIACTAQCFLYMGFMGAEFFLLGLMAY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FLLSHLSVIDTLYISTIVPKMLVDYLMGEGTISFIACTAQCFLYMGFMGAEFFLLGLMAY
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 DRYVAICNPLRYPVLISWRVCWMILASSWFGGALDSFLLTPITMSLPFCASHQINHFFCE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DRYVAICNPLRYPVLISWRVCWMILASSWFGGALDSFLLTPITMSLPFCASHQINHFFCE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 APTMLRLACGDKTTYETVMYVCCVAMLLIPFSVVTASYTRILITVHQMTSAEGRKKAFAT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 APTMLRLACGDKTTYETVMYVCCVAMLLIPFSVVTASYTRILITVHQMTSAEGRKKAFAT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE5 CSSHMMVVTLFYGAALYTYTLPQSYHTPIKDKVFSAFYTILTPLLNPLIYSLRNRDVMGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CSSHMMVVTLFYGAALYTYTLPQSYHTPIKDKVFSAFYTILTPLLNPLIYSLRNRDVMGA
              250       260       270       280       290       300

               
pF1KE5 LKRVVARC
       ::::::::
CCDS31 LKRVVARC
               

>>CCDS31115.1 OR2T1 gene_id:26696|Hs108|chr1              (369 aa)
 initn: 1569 init1: 1525 opt: 1533  Z-score: 1157.7  bits: 222.6 E(32554): 3.7e-58
Smith-Waterman score: 1533; 73.0% identity (90.6% similar) in 307 aa overlap (1-307:52-357)

                                             10        20        30
pF1KE5                               MNENNETLTRGFTLMGLFTHNKCSGFFFGV
                                     :.: : . :  ::.::::.... ::..:..
CCDS31 INSHVVILLPWECYHLIWKILPYIGTTVGSMEEYNTSST-DFTFMGLFNRKETSGLIFAI
              30        40        50        60         70        80

               40        50        60        70        80        90
pF1KE5 ICAVFFMAMIANGVMIFLINIDPHLHTPMYFLLSHLSVIDTLYISTIVPKMLVDYLMGEG
       :  .:: :..:::::::::. : .:::::::::::::.:: .:::::::::::.::. . 
CCDS31 ISIIFFTALMANGVMIFLIQTDLRLHTPMYFLLSHLSLIDMMYISTIVPKMLVNYLLDQR
               90       100       110       120       130       140

              100       110       120       130       140       150
pF1KE5 TISFIACTAQCFLYMGFMGAEFFLLGLMAYDRYVAICNPLRYPVLISWRVCWMILASSWF
       ::::..:::: :::. ..:::::::::::::::::::::::::::.: ::::::.:.:::
CCDS31 TISFVGCTAQHFLYLTLVGAEFFLLGLMAYDRYVAICNPLRYPVLMSRRVCWMIIAGSWF
              150       160       170       180       190       200

              160       170       180       190       200       210
pF1KE5 GGALDSFLLTPITMSLPFCASHQINHFFCEAPTMLRLACGDKTTYETVMYVCCVAMLLIP
       ::.::.:::::::::.::: :..:::::::::..:.:::.: . :::::::::: :::::
CCDS31 GGSLDGFLLTPITMSFPFCNSREINHFFCEAPAVLKLACADTALYETVMYVCCVLMLLIP
              210       220       230       240       250       260

              220       230       240       250       260       270
pF1KE5 FSVVTASYTRILITVHQMTSAEGRKKAFATCSSHMMVVTLFYGAALYTYTLPQSYHTPIK
       :::: :::.::: ::. :.:.:::::::::::::: ::.::::::.::: ::.::: : .
CCDS31 FSVVLASYARILTTVQCMSSVEGRKKAFATCSSHMTVVSLFYGAAMYTYMLPHSYHKPAQ
              270       280       290       300       310       320

              280       290       300                   
pF1KE5 DKVFSAFYTILTPLLNPLIYSLRNRDVMGALKRVVARC           
       :::.:.:::::::.::::::::::.:: :::::...:            
CCDS31 DKVLSVFYTILTPMLNPLIYSLRNKDVTGALKRALGRFKGPQRVSGGVF
              330       340       350       360         

>>CCDS31124.1 OR2T27 gene_id:403239|Hs108|chr1            (317 aa)
 initn: 1402 init1: 1402 opt: 1415  Z-score: 1071.3  bits: 206.4 E(32554): 2.4e-53
Smith-Waterman score: 1415; 64.9% identity (89.0% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-308)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MNENNETLTRGFTLMGLFTHNKCSGFFFGVICAVFFMAMIANGVMIFLINIDPHLHTPMY
       :...: ..   : :.:::.. .   ..:..:  ::. .. .: : :.::.:: .::::::
CCDS31 MEQSNYSVYADFILLGLFSNARFPWLLFALILLVFLTSIASNVVKIILIHIDSRLHTPMY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 FLLSHLSVIDTLYISTIVPKMLVDYLMGEGTISFIACTAQCFLYMGFMGAEFFLLGLMAY
       ::::.::. : ::::::::::::: .:.. .::: .:::: :::. . ::::::::::.:
CCDS31 FLLSQLSLRDILYISTIVPKMLVDQVMSQRAISFAGCTAQHFLYLTLAGAEFFLLGLMSY
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 DRYVAICNPLRYPVLISWRVCWMILASSWFGGALDSFLLTPITMSLPFCASHQINHFFCE
       ::::::::::.::::.: ..::.:.:..:.::..:.:::::.::..:::::..:::::::
CCDS31 DRYVAICNPLHYPVLMSRKICWLIVAAAWLGGSIDGFLLTPVTMQFPFCASREINHFFCE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 APTMLRLACGDKTTYETVMYVCCVAMLLIPFSVVTASYTRILITVHQMTSAEGRKKAFAT
       .:..:.:.: : ..:::.:::::. ::::::::...:::::::::..:. :::: :: ::
CCDS31 VPALLKLSCTDTSAYETAMYVCCIMMLLIPFSVISGSYTRILITVYRMSEAEGRGKAVAT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE5 CSSHMMVVTLFYGAALYTYTLPQSYHTPIKDKVFSAFYTILTPLLNPLIYSLRNRDVMGA
       :::::.::.::::::.:::.::.::::: .::. :::::::::.::::::::::.:: ::
CCDS31 CSSHMVVVSLFYGAAMYTYVLPHSYHTPEQDKAVSAFYTILTPMLNPLIYSLRNKDVTGA
              250       260       270       280       290       300

                        
pF1KE5 LKRVVARC         
       :..::.::         
CCDS31 LQKVVGRCVSSGKVTTF
              310       

>>CCDS31116.1 OR2T2 gene_id:401992|Hs108|chr1             (324 aa)
 initn: 1369 init1: 1369 opt: 1369  Z-score: 1037.3  bits: 200.1 E(32554): 1.8e-51
Smith-Waterman score: 1369; 63.7% identity (88.7% similar) in 300 aa overlap (9-308:10-309)

                10        20        30        40        50         
pF1KE5  MNENNETLTRGFTLMGLFTHNKCSGFFFGVICAVFFMAMIANGVMIFLINIDPHLHTPM
                . .:.: ::.::    :..:... ..: .:. :: :::.::..: .:::::
CCDS31 MGMEGLLQNSTNFVLTGLITHPAFPGLLFAIVFSIFVVAITANLVMILLIHMDSRLHTPM
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KE5 YFLLSHLSVIDTLYISTIVPKMLVDYLMGEGTISFIACTAQCFLYMGFMGAEFFLLGLMA
       :::::.::..::.::   ::::: : :  . ::::..:..: :::. ..:.:::::::::
CCDS31 YFLLSQLSIMDTIYICITVPKMLQDLLSKDKTISFLGCAVQIFLYLTLIGGEFFLLGLMA
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KE5 YDRYVAICNPLRYPVLISWRVCWMILASSWFGGALDSFLLTPITMSLPFCASHQINHFFC
       ::::::.:::::::.:.. ::: .....:: ::.::.:.:::.:::.::: :..::::::
CCDS31 YDRYVAVCNPLRYPLLMNRRVCLFMVVGSWVGGSLDGFMLTPVTMSFPFCRSREINHFFC
              130       140       150       160       170       180

     180       190       200       210       220       230         
pF1KE5 EAPTMLRLACGDKTTYETVMYVCCVAMLLIPFSVVTASYTRILITVHQMTSAEGRKKAFA
       : :..:.:.: : . :::.::.::: :::::.::...:::.::.:::.:.:::::.::::
CCDS31 EIPAVLKLSCTDTSLYETLMYACCVLMLLIPLSVISVSYTHILLTVHRMNSAEGRRKAFA
              190       200       210       220       230       240

     240       250       260       270       280       290         
pF1KE5 TCSSHMMVVTLFYGAALYTYTLPQSYHTPIKDKVFSAFYTILTPLLNPLIYSLRNRDVMG
       :::::.:::..:::::.:: .::.::::: :::: :::::::::.::::::::::.:: .
CCDS31 TCSSHIMVVSVFYGAAFYTNVLPHSYHTPEKDKVVSAFYTILTPMLNPLIYSLRNKDVAA
              250       260       270       280       290       300

     300                       
pF1KE5 ALKRVVARC               
       ::..:..::               
CCDS31 ALRKVLGRCGSSQSIRVATVIRKG
              310       320    

>>CCDS31123.1 OR2T35 gene_id:403244|Hs108|chr1            (323 aa)
 initn: 1042 init1: 1042 opt: 1353  Z-score: 1025.6  bits: 197.9 E(32554): 8.4e-51
Smith-Waterman score: 1353; 63.7% identity (88.3% similar) in 300 aa overlap (9-308:10-308)

                10        20        30        40        50         
pF1KE5  MNENNETLTRGFTLMGLFTHNKCSGFFFGVICAVFFMAMIANGVMIFLINIDPHLHTPM
                . .:.: ::.::    :..:.:. ..: .:. :: :::.::..: .:::::
CCDS31 MGMEGLLQNSTNFVLTGLITHPAFPGLLFAVVFSIFVVAITANLVMILLIHMDSRLHTPM
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KE5 YFLLSHLSVIDTLYISTIVPKMLVDYLMGEGTISFIACTAQCFLYMGFMGAEFFLLGLMA
       :::::.::..::.::   ::::: : :  . ::::..:..: : :. ..:.:::::::::
CCDS31 YFLLSQLSIMDTIYICITVPKMLQDLLSKDKTISFLGCAVQIF-YLTLIGGEFFLLGLMA
               70        80        90       100        110         

     120       130       140       150       160       170         
pF1KE5 YDRYVAICNPLRYPVLISWRVCWMILASSWFGGALDSFLLTPITMSLPFCASHQINHFFC
       ::::::.:::::::.:.. ::: .....:: ::.::.:.:::.:::.::: :..::::::
CCDS31 YDRYVAVCNPLRYPLLMNRRVCLFMVVGSWVGGSLDGFMLTPVTMSFPFCRSREINHFFC
     120       130       140       150       160       170         

     180       190       200       210       220       230         
pF1KE5 EAPTMLRLACGDKTTYETVMYVCCVAMLLIPFSVVTASYTRILITVHQMTSAEGRKKAFA
       : :..:.:.: : . :::.::.::: :::::.::...:::.::.:::.:.:::::.::::
CCDS31 EIPAVLKLSCTDTSLYETLMYACCVLMLLIPLSVISVSYTHILLTVHRMNSAEGRRKAFA
     180       190       200       210       220       230         

     240       250       260       270       280       290         
pF1KE5 TCSSHMMVVTLFYGAALYTYTLPQSYHTPIKDKVFSAFYTILTPLLNPLIYSLRNRDVMG
       :::::.:::..:::::.:: .::.::::: :::: :::::::::.::::::::::.:: .
CCDS31 TCSSHIMVVSVFYGAAFYTNVLPHSYHTPEKDKVVSAFYTILTPMLNPLIYSLRNKDVAA
     240       250       260       270       280       290         

     300                       
pF1KE5 ALKRVVARC               
       ::..:..::               
CCDS31 ALRKVLGRCGSSQSIRVATVIRKG
     300       310       320   

>>CCDS55695.1 OR2T29 gene_id:343563|Hs108|chr1            (315 aa)
 initn: 1291 init1: 1239 opt: 1249  Z-score: 949.0  bits: 183.7 E(32554): 1.5e-46
Smith-Waterman score: 1249; 60.1% identity (83.1% similar) in 301 aa overlap (5-305:9-309)

                   10        20        30        40        50      
pF1KE5     MNENNETLTRGFTLMGLFTHNKCSGFFFGVICAVFFMAMIANGVMIFLINIDPHLH
               :.:    : ::::: ..:  ...  :: .::. :. .:.:.:.::. : :::
CCDS55 MANITRMANHTGRLDFILMGLFRQSKHPALLSVVIFVVFLKALSGNAVLILLIHCDAHLH
               10        20        30        40        50        60

         60        70        80        90       100       110      
pF1KE5 TPMYFLLSHLSVIDTLYISTIVPKMLVDYLMGEGTISFIACTAQCFLYMGFMGAEFFLLG
       .::::..:.::..:  :::. :::::.: .:: . .:   :  : :::. . :.:::::.
CCDS55 SPMYFFISQLSLMDMAYISVTVPKMLLDQVMGVNKVSAPECGMQMFLYLTLAGSEFFLLA
               70        80        90       100       110       120

        120       130       140       150       160       170      
pF1KE5 LMAYDRYVAICNPLRYPVLISWRVCWMILASSWFGGALDSFLLTPITMSLPFCASHQINH
        ::::::::::.:::::::.. ::: .. .. :: :..:.:.:::::::.::: : .:.:
CCDS55 TMAYDRYVAICHPLRYPVLMNHRVCLFLASGCWFLGSVDGFMLTPITMSFPFCRSWEIHH
              130       140       150       160       170       180

        180       190       200       210       220       230      
pF1KE5 FFCEAPTMLRLACGDKTTYETVMYVCCVAMLLIPFSVVTASYTRILITVHQMTSAEGRKK
       ::::.:..  :.:.: . :::.::.::: ::::: .....::  ::.:::.:.:::::::
CCDS55 FFCEVPAVTILSCSDTSLYETLMYLCCVLMLLIPVTIISSSYLLILLTVHRMNSAEGRKK
              190       200       210       220       230       240

        240       250       260       270       280       290      
pF1KE5 AFATCSSHMMVVTLFYGAALYTYTLPQSYHTPIKDKVFSAFYTILTPLLNPLIYSLRNRD
       ::::::::. :: ::::::.::: ::.::::: :: . :.:::::::.::::::::::.:
CCDS55 AFATCSSHLTVVILFYGAAVYTYMLPSSYHTPEKDMMVSVFYTILTPVLNPLIYSLRNKD
              250       260       270       280       290       300

        300           
pF1KE5 VMGALKRVVARC   
       ::::::...      
CCDS55 VMGALKKMLTVRFVL
              310     

>>CCDS31118.1 OR2T5 gene_id:401993|Hs108|chr1             (315 aa)
 initn: 1290 init1: 1238 opt: 1248  Z-score: 948.3  bits: 183.6 E(32554): 1.7e-46
Smith-Waterman score: 1248; 60.1% identity (83.1% similar) in 301 aa overlap (5-305:9-309)

                   10        20        30        40        50      
pF1KE5     MNENNETLTRGFTLMGLFTHNKCSGFFFGVICAVFFMAMIANGVMIFLINIDPHLH
               :.:    : ::::: ..:  ...  :: .::. :. .:.:.:.::. : :::
CCDS31 MANITRMANHTGKLDFILMGLFRRSKHPALLSVVIFVVFLKALSGNAVLILLIHCDAHLH
               10        20        30        40        50        60

         60        70        80        90       100       110      
pF1KE5 TPMYFLLSHLSVIDTLYISTIVPKMLVDYLMGEGTISFIACTAQCFLYMGFMGAEFFLLG
       .::::..:.::..:  :::. :::::.: .:: . .:   :  : :::. . :.:::::.
CCDS31 SPMYFFISQLSLMDMAYISVTVPKMLLDQVMGVNKVSAPECGMQMFLYLTLAGSEFFLLA
               70        80        90       100       110       120

        120       130       140       150       160       170      
pF1KE5 LMAYDRYVAICNPLRYPVLISWRVCWMILASSWFGGALDSFLLTPITMSLPFCASHQINH
        ::::::::::.:::::::.. ::: .. .. :: :..:.:.:::::::.::: : .:.:
CCDS31 TMAYDRYVAICHPLRYPVLMNHRVCLFLASGCWFLGSVDGFMLTPITMSFPFCRSWEIHH
              130       140       150       160       170       180

        180       190       200       210       220       230      
pF1KE5 FFCEAPTMLRLACGDKTTYETVMYVCCVAMLLIPFSVVTASYTRILITVHQMTSAEGRKK
       ::::.:..  :.:.: . :::.::.::: ::::: .....::  ::.:::.:.:::::::
CCDS31 FFCEVPAVTILSCSDTSLYETLMYLCCVLMLLIPVTIISSSYLLILLTVHRMNSAEGRKK
              190       200       210       220       230       240

        240       250       260       270       280       290      
pF1KE5 AFATCSSHMMVVTLFYGAALYTYTLPQSYHTPIKDKVFSAFYTILTPLLNPLIYSLRNRD
       ::::::::. :: ::::::.::: ::.::::: :: . :.:::::::.::::::::::.:
CCDS31 AFATCSSHLTVVILFYGAAVYTYMLPSSYHTPEKDMMVSVFYTILTPVLNPLIYSLRNKD
              250       260       270       280       290       300

        300           
pF1KE5 VMGALKRVVARC   
       ::::::...      
CCDS31 VMGALKKMLTVRFVL
              310     

>>CCDS31113.1 OR2T4 gene_id:127074|Hs108|chr1             (348 aa)
 initn: 1278 init1: 1201 opt: 1219  Z-score: 926.4  bits: 179.7 E(32554): 2.8e-45
Smith-Waterman score: 1219; 58.8% identity (82.4% similar) in 301 aa overlap (5-305:37-337)

                                         10        20        30    
pF1KE5                           MNENNETLTRGFTLMGLFTHNKCSGFFFGVICAV
                                     :.:    : :.::: ..:  ...  :: .:
CCDS31 MASHTGWSDFILMGLFRQSKHPMANITWMANHTGWSDFILLGLFRQSKHPALLCVVIFVV
         10        20        30        40        50        60      

           40        50        60        70        80        90    
pF1KE5 FFMAMIANGVMIFLINIDPHLHTPMYFLLSHLSVIDTLYISTIVPKMLVDYLMGEGTISF
       :.::. .:.:.:.::. : ::::::::..:.::..:  :::. :::::.: .:: . :: 
CCDS31 FLMALSGNAVLILLIHCDAHLHTPMYFFISQLSLMDMAYISVTVPKMLLDQVMGVNKISA
         70        80        90       100       110       120      

          100       110       120       130       140       150    
pF1KE5 IACTAQCFLYMGFMGAEFFLLGLMAYDRYVAICNPLRYPVLISWRVCWMILASSWFGGAL
         :  : :.:. . :.:::::. ::::::::::.:::::::.. ::: .. .. :: :..
CCDS31 PECGMQMFFYVTLAGSEFFLLATMAYDRYVAICHPLRYPVLMNHRVCLFLSSGCWFLGSV
        130       140       150       160       170       180      

          160       170       180       190       200       210    
pF1KE5 DSFLLTPITMSLPFCASHQINHFFCEAPTMLRLACGDKTTYETVMYVCCVAMLLIPFSVV
       :.: .:::::..:: .:..:.:::::.:..: :.:.: . ::  ::.::: :::::  ..
CCDS31 DGFTFTPITMTFPFRGSREIHHFFCEVPAVLNLSCSDTSLYEIFMYLCCVLMLLIPVVII
        190       200       210       220       230       240      

          220       230       240       250       260       270    
pF1KE5 TASYTRILITVHQMTSAEGRKKAFATCSSHMMVVTLFYGAALYTYTLPQSYHTPIKDKVF
       ..::  ::.:.: :.:::::::::::::::. :: ::::::.::: ::.::::: :: . 
CCDS31 SSSYLLILLTIHGMNSAEGRKKAFATCSSHLTVVILFYGAAIYTYMLPSSYHTPEKDMMV
        250       260       270       280       290       300      

          280       290       300                
pF1KE5 SAFYTILTPLLNPLIYSLRNRDVMGALKRVVARC        
       :.:::::::..:::::::::.:::::::...           
CCDS31 SVFYTILTPVVNPLIYSLRNKDVMGALKKMLTVEPAFQKAME
        310       320       330       340        

>>CCDS31121.1 OR2T10 gene_id:127069|Hs108|chr1            (312 aa)
 initn: 1150 init1: 1107 opt: 1168  Z-score: 889.3  bits: 172.7 E(32554): 3.2e-43
Smith-Waterman score: 1168; 54.9% identity (81.4% similar) in 306 aa overlap (1-306:1-306)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MNENNETLTRGFTLMGLFTHNKCSGFFFGVICAVFFMAMIANGVMIFLINIDPHLHTPMY
       :   :.::   : :.:.:.. .  : .  .: ..:.::.  : ..:.::.::  ::::::
CCDS31 MRLANQTLGGDFFLLGIFSQISHPGRLCLLIFSIFLMAVSWNITLILLIHIDSSLHTPMY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 FLLSHLSVIDTLYISTIVPKMLVDYLMGEGTISFIACTAQCFLYMGFMGAEFFLLGLMAY
       :....::.::  :::. ::::::. :  . ::: ..: .: ..:. . :::  ::. :::
CCDS31 FFINQLSLIDLTYISVTVPKMLVNQLAKDKTISVLGCGTQMYFYLQLGGAECCLLAAMAY
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 DRYVAICNPLRYPVLISWRVCWMILASSWFGGALDSFLLTPITMSLPFCASHQINHFFCE
       :::::::.:::: ::.: ::: .. .. :: :..:.:.::::.::.::: ::.:.:::::
CCDS31 DRYVAICHPLRYSVLMSHRVCLLLASGCWFVGSVDGFMLTPIAMSFPFCRSHEIQHFFCE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 APTMLRLACGDKTTYETVMYVCCVAMLLIPFSVVTASYTRILITVHQMTSAEGRKKAFAT
       .:..:.:.:.: . :.  ::.::: ::::: .:...::  :..:.:.:.:.:::::::.:
CCDS31 VPAVLKLSCSDTSLYKIFMYLCCVIMLLIPVTVISVSYYYIILTIHKMNSVEGRKKAFTT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE5 CSSHMMVVTLFYGAALYTYTLPQSYHTPIKDKVFSAFYTILTPLLNPLIYSLRNRDVMGA
       ::::. ::.::::::.:.: ::.::.:: :: . : :::::::.:::.:::.::.::  :
CCDS31 CSSHITVVSLFYGAAIYNYMLPSSYQTPEKDMMSSFFYTILTPVLNPIIYSFRNKDVTRA
              250       260       270       280       290       300

                   
pF1KE5 LKRVVARC    
       ::....      
CCDS31 LKKMLSVQKPPY
              310  

>>CCDS4461.1 OR2V2 gene_id:285659|Hs108|chr5              (315 aa)
 initn: 1146 init1: 1146 opt: 1146  Z-score: 873.1  bits: 169.7 E(32554): 2.6e-42
Smith-Waterman score: 1146; 53.0% identity (81.2% similar) in 304 aa overlap (5-308:6-309)

                10        20        30        40        50         
pF1KE5  MNENNETLTRGFTLMGLFTHNKCSGFFFGVICAVFFMAMIANGVMIFLINIDPHLHTPM
            :.. : :: :.:.:.:.  .  .:.:. ::: .:. .: ..:::: .::::::::
CCDS44 METWVNQSYTDGFFLLGIFSHSTADLVLFSVVMAVFTVALCGNVLLIFLIYMDPHLHTPM
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KE5 YFLLSHLSVIDTLYISTIVPKMLVDYLMGEGTISFIACTAQCFLYMGFMGAEFFLLGLMA
       ::.::.::..: . . : :::: ...: :. .:::..:  :  :.. ..:.: .::::::
CCDS44 YFFLSQLSLMDLMLVCTNVPKMAANFLSGRKSISFVGCGIQIGLFVCLVGSEGLLLGLMA
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KE5 YDRYVAICNPLRYPVLISWRVCWMILASSWFGGALDSFLLTPITMSLPFCASHQINHFFC
       ::::::: .::.::.:.. ::: .: .:::  : .:...   ..:..:.:. ...:::::
CCDS44 YDRYVAISHPLHYPILMNQRVCLQITGSSWAFGIIDGLIQMVVVMNFPYCGLRKVNHFFC
              130       140       150       160       170       180

     180       190       200       210       220       230         
pF1KE5 EAPTMLRLACGDKTTYETVMYVCCVAMLLIPFSVVTASYTRILITVHQMTSAEGRKKAFA
       :  ..:.::: : . .: :...::: :::.:::...:::..:: :: :: ::.. :::.:
CCDS44 EMLSLLKLACVDTSLFEKVIFACCVFMLLFPFSIIVASYAHILGTVLQMHSAQAWKKALA
              190       200       210       220       230       240

     240       250       260       270       280       290         
pF1KE5 TCSSHMMVVTLFYGAALYTYTLPQSYHTPIKDKVFSAFYTILTPLLNPLIYSLRNRDVMG
       :::::. .::::::::.. :  :. :..: .::: : :::.:::.:::::::::::.:::
CCDS44 TCSSHLTAVTLFYGAAMFIYLRPRHYRAPSHDKVASIFYTVLTPMLNPLIYSLRNREVMG
              250       260       270       280       290       300

     300              
pF1KE5 ALKRVVARC      
       ::.. . ::      
CCDS44 ALRKGLDRCRIGSQH
              310     




308 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Tue Nov  8 00:18:31 2016 done: Tue Nov  8 00:18:32 2016
 Total Scan time:  1.870 Total Display time:  0.040

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com